View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4607_1D_low_32 (Length: 225)

Name: NF4607_1D_low_32
Description: NF4607_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4607_1D_low_32
NF4607_1D_low_32
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (1-209)||(150615-150823)
scaffold0009 (1-214)||(245566-245784)
scaffold0009 (1-214)||(153628-153842)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (1-214)||(8653872-8654085)
chr1 (1-204)||(49379402-49379604)
chr1 (1-204)||(8648996-8649199)
chr1 (1-204)||(28206115-28206319)
chr1 (16-214)||(22659828-22660026)
chr1 (1-214)||(4028425-4028637)
chr1 (6-209)||(17986683-17986884)
chr1 (1-214)||(13250856-13251068)
chr1 (1-214)||(18885159-18885371)
chr1 (1-204)||(26134288-26134491)
chr1 (1-204)||(44538364-44538567)
chr1 (1-214)||(8953249-8953462)
chr1 (1-209)||(2386353-2386560)
chr1 (1-214)||(36850114-36850325)
chr1 (1-204)||(17716878-17717079)
chr1 (40-214)||(16365097-16365270)
chr1 (1-206)||(3985384-3985588)
chr1 (1-206)||(3990663-3990867)
chr1 (1-206)||(16485405-16485609)
chr1 (1-214)||(27911087-27911299)
chr1 (1-206)||(38045463-38045667)
chr1 (1-214)||(46143299-46143511)
chr1 (1-204)||(39286388-39286591)
chr1 (1-206)||(27041812-27042016)
chr1 (1-206)||(27047566-27047770)
chr1 (1-214)||(20231624-20231838)
chr1 (1-214)||(19879851-19880062)
chr1 (1-214)||(41461846-41462057)
chr1 (1-202)||(41802405-41802605)
chr1 (1-204)||(16431677-16431879)
chr1 (1-209)||(25727075-25727281)
chr1 (1-209)||(25735483-25735689)
chr1 (28-214)||(17093873-17094060)
chr1 (28-214)||(20399721-20399908)
chr1 (28-214)||(22841819-22842006)
chr1 (1-214)||(19599677-19599891)
chr1 (1-214)||(20238190-20238404)
chr1 (1-214)||(20393699-20393913)
chr1 (1-188)||(12060255-12060440)
chr1 (28-214)||(17101709-17101896)
chr1 (28-214)||(21797936-21798123)
chr1 (28-214)||(21804644-21804831)
chr1 (1-214)||(19771958-19772171)
chr1 (1-188)||(48256445-48256630)
chr1 (1-214)||(2395048-2395262)
chr1 (1-214)||(19874893-19875105)
chr1 (1-214)||(23501556-23501770)
chr1 (7-204)||(28208015-28208210)
chr1 (18-214)||(41309276-41309466)
chr1 (1-214)||(18816477-18816689)
chr1 (1-202)||(19788039-19788239)
chr1 (1-176)||(19364789-19364963)
chr1 (1-202)||(21783975-21784177)
chr1 (1-201)||(21792101-21792302)
chr1 (1-130)||(41224623-41224752)
chr1 (1-161)||(22635475-22635635)
chr1 (40-122)||(52235711-52235793)
chr1 (1-161)||(20412425-20412584)
chr1 (96-188)||(52755199-52755290)
chr1 (1-214)||(28763630-28763843)
chr1 (83-204)||(13799276-13799395)
chr1 (83-188)||(52169138-52169242)
chr1 (83-214)||(22411229-22411359)
chr1 (58-209)||(16148260-16148411)
chr1 (115-214)||(24680265-24680361)
chr1 (163-214)||(52235791-52235842)
chr1 (83-209)||(15346686-15346810)
chr1 (83-209)||(16384793-16384916)
chr1 (113-214)||(21924782-21924881)
chr1 (96-209)||(26194362-26194473)
chr1 (136-203)||(30818957-30819022)
chr1 (135-209)||(25404968-25405041)
chr1 (137-209)||(12059671-12059742)
chr1 (83-203)||(15421231-15421349)
chr1 (124-204)||(16354211-16354290)
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (1-204)||(20282176-20282378)
chr2 (1-203)||(23014246-23014448)
chr2 (1-203)||(23018360-23018562)
chr2 (1-203)||(18994218-18994420)
chr2 (1-214)||(40916567-40916780)
chr2 (1-204)||(42767124-42767328)
chr2 (1-204)||(5499539-5499742)
chr2 (1-214)||(21468205-21468417)
chr2 (1-214)||(23798172-23798384)
chr2 (1-214)||(25370092-25370307)
chr2 (1-209)||(25803554-25803761)
chr2 (1-209)||(28496451-28496658)
chr2 (1-206)||(25358264-25358468)
chr2 (1-214)||(29563311-29563524)
chr2 (8-206)||(20172580-20172777)
chr2 (1-206)||(10904-11108)
chr2 (1-202)||(24507436-24507635)
chr2 (1-214)||(18446507-18446721)
chr2 (1-204)||(19929508-19929723)
chr2 (1-209)||(36684421-36684629)
chr2 (1-214)||(39870336-39870550)
chr2 (1-214)||(27745185-27745396)
chr2 (1-214)||(21201013-21201227)
chr2 (1-214)||(23644704-23644918)
chr2 (1-214)||(111605-111819)
chr2 (1-214)||(27615534-27615748)
chr2 (1-214)||(27632230-27632444)
chr2 (18-214)||(118277-118474)
chr2 (1-206)||(35080722-35080926)
chr2 (28-214)||(17583334-17583521)
chr2 (28-214)||(17591140-17591327)
chr2 (28-214)||(22043933-22044120)
chr2 (28-214)||(22288313-22288500)
chr2 (28-214)||(22665817-22666004)
chr2 (1-214)||(23158651-23158865)
chr2 (1-214)||(23163221-23163435)
chr2 (1-214)||(23569908-23570122)
chr2 (1-214)||(23574478-23574692)
chr2 (1-214)||(20708020-20708232)
chr2 (1-209)||(27768083-27768292)
chr2 (28-214)||(16769744-16769931)
chr2 (28-214)||(16776406-16776593)
chr2 (1-204)||(23340696-23340897)
chr2 (28-214)||(24794560-24794747)
chr2 (28-214)||(24801269-24801456)
chr2 (28-214)||(24877622-24877809)
chr2 (28-214)||(27628326-27628513)
chr2 (1-214)||(19278546-19278760)
chr2 (1-214)||(32140090-32140302)
chr2 (28-214)||(27621681-27621868)
chr2 (1-204)||(24824736-24824940)
chr2 (1-214)||(33181797-33182009)
chr2 (1-204)||(25144014-25144216)
chr2 (1-188)||(32441123-32441307)
chr2 (1-214)||(11317949-11318161)
chr2 (1-204)||(24820351-24820555)
chr2 (4-204)||(25481506-25481705)
chr2 (4-204)||(25489112-25489311)
chr2 (1-204)||(23139772-23139958)
chr2 (1-204)||(23551562-23551748)
chr2 (29-209)||(24172119-24172298)
chr2 (1-204)||(16133955-16134157)
chr2 (1-188)||(11391255-11391436)
chr2 (1-188)||(11407916-11408097)
chr2 (7-125)||(23634131-23634249)
chr2 (1-214)||(45706328-45706545)
chr2 (1-125)||(25198600-25198724)
chr2 (1-214)||(20635781-20635994)
chr2 (9-204)||(539326-539520)
chr2 (1-159)||(23633909-23634067)
chr2 (1-84)||(25038694-25038777)
chr2 (1-123)||(17637323-17637445)
chr2 (96-214)||(29577197-29577314)
chr2 (99-188)||(23704425-23704513)
chr2 (90-214)||(23698653-23698776)
chr2 (140-214)||(25043007-25043080)
chr2 (1-102)||(23613900-23614000)
chr2 (83-187)||(21344321-21344423)
chr2 (96-209)||(24609919-24610031)
chr2 (83-188)||(25858426-25858530)
chr2 (136-214)||(24177568-24177645)
chr2 (96-209)||(21261-21373)
chr2 (83-188)||(24366142-24366246)
chr2 (89-188)||(15583983-15584081)
chr2 (58-204)||(19124141-19124286)
chr2 (83-214)||(41653450-41653580)
chr2 (89-214)||(30949100-30949224)
chr2 (113-209)||(24371307-24371401)
chr2 (137-204)||(22328622-22328688)
chr2 (113-214)||(36129967-36130066)
chr2 (113-209)||(20852253-20852347)
chr2 (1-41)||(23084642-23084682)
chr2 (96-204)||(23256868-23256973)
chr2 (159-214)||(23648797-23648853)
chr2 (150-185)||(25198569-25198604)
chr2 (135-209)||(22578215-22578286)
chr2 (113-214)||(13004608-13004707)
chr2 (161-214)||(23614006-23614059)
chr2 (85-214)||(31590354-31590480)
[»] chr7 (144 HSPs)
chr7 (1-214)||(48801008-48801222)
chr7 (1-214)||(21507097-21507310)
chr7 (1-204)||(33612032-33612235)
chr7 (1-214)||(37100123-37100334)
chr7 (1-204)||(9004745-9004948)
chr7 (1-204)||(648549-648752)
chr7 (1-204)||(4313340-4313543)
chr7 (1-214)||(5397844-5398058)
chr7 (1-203)||(41722825-41723026)
chr7 (1-204)||(2325601-2325802)
chr7 (1-209)||(3210483-3210692)
chr7 (1-214)||(16330647-16330859)
chr7 (1-204)||(48340365-48340569)
chr7 (1-204)||(35963989-35964190)
chr7 (1-214)||(23293457-23293671)
chr7 (1-214)||(12199293-12199504)
chr7 (1-203)||(4307977-4308179)
chr7 (6-214)||(15205832-15206041)
chr7 (1-206)||(14456-14660)
chr7 (1-214)||(826371-826583)
chr7 (1-214)||(828382-828594)
chr7 (1-206)||(4466419-4466623)
chr7 (1-206)||(8713114-8713318)
chr7 (1-206)||(8718618-8718822)
chr7 (1-214)||(12548070-12548282)
chr7 (1-206)||(14229713-14229917)
chr7 (1-214)||(15916055-15916267)
chr7 (1-214)||(15924364-15924576)
chr7 (1-206)||(18389785-18389989)
chr7 (1-206)||(19014404-19014608)
chr7 (1-204)||(13731914-13732117)
chr7 (1-204)||(9009730-9009932)
chr7 (1-204)||(17946843-17947045)
chr7 (9-206)||(538030-538226)
chr7 (1-206)||(544896-545100)
chr7 (1-214)||(821358-821570)
chr7 (1-209)||(3201443-3201652)
chr7 (1-206)||(4158437-4158641)
chr7 (1-202)||(5840800-5841000)
chr7 (1-206)||(9577980-9578184)
chr7 (1-206)||(15061379-15061583)
chr7 (1-206)||(15066468-15066672)
chr7 (1-214)||(20109135-20109348)
chr7 (1-206)||(23203916-23204120)
chr7 (1-206)||(23510043-23510247)
chr7 (1-206)||(23515825-23516029)
chr7 (1-204)||(4030137-4030338)
chr7 (1-214)||(9258391-9258600)
chr7 (1-214)||(9311653-9311862)
chr7 (1-204)||(10204845-10205048)
chr7 (1-214)||(13652100-13652314)
chr7 (1-214)||(18072214-18072428)
chr7 (1-214)||(35953795-35954009)
chr7 (1-204)||(15173651-15173855)
chr7 (1-188)||(9192649-9192836)
chr7 (1-214)||(13658623-13658837)
chr7 (1-214)||(16119095-16119309)
chr7 (1-214)||(16154734-16154948)
chr7 (1-214)||(30257469-30257683)
chr7 (1-214)||(45407560-45407774)
chr7 (1-214)||(19364516-19364728)
chr7 (1-214)||(16076580-16076794)
chr7 (1-214)||(18274120-18274334)
chr7 (1-214)||(18288335-18288549)
chr7 (1-178)||(8521916-8522091)
chr7 (28-214)||(13674611-13674798)
chr7 (28-214)||(14752874-14753061)
chr7 (28-214)||(15176390-15176577)
chr7 (1-204)||(13434996-13435199)
chr7 (1-214)||(16464883-16465097)
chr7 (1-214)||(18589003-18589217)
chr7 (1-214)||(18592597-18592811)
chr7 (1-214)||(18599228-18599442)
chr7 (1-214)||(23077026-23077240)
chr7 (1-214)||(14551786-14551998)
chr7 (18-214)||(14582022-14582219)
chr7 (1-209)||(16487496-16487702)
chr7 (1-204)||(48355323-48355527)
chr7 (28-214)||(13667933-13668120)
chr7 (1-195)||(319766-319960)
chr7 (1-214)||(16471409-16471623)
chr7 (1-214)||(27292054-27292268)
chr7 (1-214)||(39387906-39388120)
chr7 (1-214)||(14545546-14545758)
chr7 (1-188)||(3376271-3376456)
chr7 (28-214)||(18618873-18619060)
chr7 (1-214)||(16532800-16533014)
chr7 (1-214)||(16632648-16632862)
chr7 (1-214)||(24057792-24058006)
chr7 (1-214)||(34390743-34390955)
chr7 (1-204)||(782528-782732)
chr7 (1-214)||(12562060-12562272)
chr7 (1-214)||(22578747-22578959)
chr7 (1-214)||(39271278-39271489)
chr7 (1-125)||(16097268-16097392)
chr7 (1-202)||(12575927-12576129)
chr7 (1-204)||(12567765-12567969)
chr7 (1-201)||(48713581-48713779)
chr7 (1-204)||(4294727-4294929)
chr7 (1-204)||(15707004-15707206)
chr7 (1-204)||(38387910-38388112)
chr7 (1-130)||(9725873-9726002)
chr7 (1-204)||(20624733-20624934)
chr7 (1-204)||(20627052-20627254)
chr7 (1-204)||(20630943-20631145)
chr7 (1-204)||(20635551-20635753)
chr7 (1-204)||(20637423-20637625)
chr7 (1-100)||(25180929-25181028)
chr7 (2-204)||(14941495-14941695)
chr7 (2-204)||(15369088-15369288)
chr7 (1-125)||(12661747-12661871)
chr7 (1-100)||(11954001-11954100)
chr7 (1-111)||(16525736-16525846)
chr7 (96-214)||(1614093-1614210)
chr7 (106-214)||(16497873-16497982)
chr7 (83-204)||(21005362-21005482)
chr7 (1-188)||(8780203-8780389)
chr7 (1-204)||(8787042-8787244)
chr7 (134-209)||(4790779-4790855)
chr7 (134-206)||(9585406-9585477)
chr7 (70-204)||(6257348-6257482)
chr7 (85-214)||(368229-368357)
chr7 (83-188)||(33609871-33609975)
chr7 (1-204)||(9193772-9193974)
chr7 (1-204)||(9562066-9562267)
chr7 (96-204)||(16897112-16897220)
chr7 (121-204)||(9264240-9264323)
chr7 (124-214)||(39388855-39388944)
chr7 (113-214)||(6712311-6712410)
chr7 (83-214)||(4090821-4090951)
chr7 (58-214)||(4256427-4256583)
chr7 (135-204)||(4460651-4460719)
chr7 (1-50)||(23292499-23292548)
chr7 (113-204)||(17206262-17206351)
chr7 (96-214)||(46274225-46274335)
chr7 (99-161)||(1462720-1462782)
chr7 (113-203)||(17911717-17911806)
chr7 (113-209)||(38877532-38877626)
chr7 (135-214)||(4316873-4316950)
chr7 (113-204)||(4983015-4983104)
chr7 (159-202)||(13411402-13411445)
chr7 (123-214)||(19515237-19515327)
chr7 (83-209)||(30063799-30063922)
chr7 (113-209)||(15523155-15523249)
[»] chr8 (106 HSPs)
chr8 (1-214)||(20263533-20263746)
chr8 (1-214)||(21050162-21050375)
chr8 (1-209)||(18230403-18230611)
chr8 (1-204)||(18264149-18264351)
chr8 (1-214)||(45466812-45467026)
chr8 (1-214)||(33632545-33632759)
chr8 (1-214)||(22831261-22831474)
chr8 (1-209)||(23879942-23880150)
chr8 (6-209)||(24034791-24034992)
chr8 (33-204)||(39730493-39730664)
chr8 (1-203)||(14878053-14878253)
chr8 (1-214)||(26826612-26826826)
chr8 (1-214)||(38349671-38349885)
chr8 (1-214)||(19997504-19997716)
chr8 (1-214)||(17126956-17127167)
chr8 (1-214)||(21842789-21843003)
chr8 (1-206)||(21103393-21103597)
chr8 (1-206)||(22370676-22370880)
chr8 (1-214)||(25751464-25751676)
chr8 (1-206)||(35996212-35996416)
chr8 (7-214)||(18399393-18399601)
chr8 (1-204)||(20043891-20044093)
chr8 (1-214)||(19768261-19768475)
chr8 (1-214)||(21858600-21858814)
chr8 (1-206)||(1685783-1685987)
chr8 (1-206)||(21105435-21105639)
chr8 (1-214)||(21945176-21945388)
chr8 (1-214)||(22818358-22818569)
chr8 (1-204)||(14351402-14351611)
chr8 (13-209)||(22285101-22285296)
chr8 (1-204)||(20038236-20038438)
chr8 (28-214)||(23779549-23779736)
chr8 (1-204)||(29325431-29325633)
chr8 (40-214)||(6570376-6570548)
chr8 (1-214)||(21821470-21821684)
chr8 (1-214)||(23912197-23912411)
chr8 (1-214)||(27537567-27537781)
chr8 (1-214)||(21939241-21939453)
chr8 (1-214)||(21098039-21098253)
chr8 (1-214)||(23904342-23904556)
chr8 (1-214)||(25228748-25228962)
chr8 (1-206)||(11351280-11351484)
chr8 (52-204)||(18273213-18273364)
chr8 (1-204)||(15759690-15759892)
chr8 (1-204)||(17613310-17613513)
chr8 (1-204)||(17621492-17621695)
chr8 (8-200)||(18162127-18162321)
chr8 (1-214)||(20836211-20836425)
chr8 (1-214)||(21831752-21831966)
chr8 (1-214)||(22098922-22099136)
chr8 (7-204)||(9317967-9318163)
chr8 (1-214)||(20002860-20003072)
chr8 (1-209)||(21956037-21956246)
chr8 (1-214)||(42418275-42418487)
chr8 (28-214)||(8328785-8328972)
chr8 (1-188)||(20713218-20713405)
chr8 (1-214)||(18821588-18821802)
chr8 (1-214)||(19360013-19360227)
chr8 (28-214)||(8308574-8308761)
chr8 (28-214)||(8322119-8322306)
chr8 (28-214)||(21382847-21383034)
chr8 (1-214)||(21950230-21950444)
chr8 (1-214)||(22032822-22033036)
chr8 (1-214)||(40952009-40952223)
chr8 (32-214)||(8315222-8315405)
chr8 (1-214)||(22039424-22039638)
chr8 (1-214)||(22093338-22093552)
chr8 (1-214)||(22103127-22103341)
chr8 (1-188)||(25397078-25397264)
chr8 (1-214)||(16418192-16418406)
chr8 (1-214)||(43836052-43836247)
chr8 (6-204)||(23503265-23503461)
chr8 (1-214)||(14821307-14821519)
chr8 (29-214)||(37652930-37653114)
chr8 (1-204)||(17515560-17515765)
chr8 (1-184)||(6279899-6280081)
chr8 (1-204)||(17503945-17504147)
chr8 (68-206)||(11346308-11346445)
chr8 (1-125)||(21037797-21037921)
chr8 (60-204)||(26013103-26013246)
chr8 (18-214)||(1302069-1302266)
chr8 (97-214)||(1693244-1693362)
chr8 (135-214)||(22854127-22854206)
chr8 (1-92)||(22364280-22364371)
chr8 (116-214)||(24039258-24039357)
chr8 (96-214)||(23455703-23455820)
chr8 (134-214)||(22029862-22029943)
chr8 (8-204)||(23193702-23193898)
chr8 (1-213)||(1990245-1990456)
chr8 (83-204)||(14161973-14162092)
chr8 (83-214)||(21319544-21319674)
chr8 (1-214)||(21139788-21140000)
chr8 (36-188)||(23221300-23221453)
chr8 (58-204)||(19792041-19792185)
chr8 (1-51)||(21328470-21328520)
chr8 (83-209)||(24342185-24342310)
chr8 (83-204)||(24967385-24967505)
chr8 (137-214)||(29003753-29003829)
chr8 (113-209)||(15634430-15634523)
chr8 (143-214)||(5579188-5579258)
chr8 (136-209)||(18008262-18008334)
chr8 (136-214)||(26854188-26854267)
chr8 (113-209)||(15636203-15636296)
chr8 (83-183)||(22904748-22904846)
chr8 (135-203)||(31469553-31469619)
chr8 (95-204)||(18572164-18572271)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (1-214)||(17484168-17484381)
chr4 (1-214)||(25146362-25146576)
chr4 (1-204)||(16952023-16952226)
chr4 (1-204)||(3355381-3355585)
chr4 (1-214)||(16392791-16393004)
chr4 (1-204)||(18287113-18287317)
chr4 (1-204)||(14653243-14653445)
chr4 (1-214)||(9945059-9945271)
chr4 (1-214)||(16217587-16217801)
chr4 (1-206)||(3392070-3392274)
chr4 (1-214)||(18242314-18242528)
chr4 (1-214)||(3371737-3371949)
chr4 (1-206)||(10631494-10631698)
chr4 (1-214)||(39043246-39043458)
chr4 (1-204)||(12845034-12845238)
chr4 (1-214)||(18984130-18984344)
chr4 (1-214)||(3419175-3419387)
chr4 (1-206)||(5717514-5717718)
chr4 (1-214)||(7197342-7197554)
chr4 (1-206)||(18078806-18079010)
chr4 (1-206)||(18080712-18080916)
chr4 (1-206)||(26811250-26811454)
chr4 (1-204)||(7897278-7897482)
chr4 (1-204)||(13622421-13622622)
chr4 (1-214)||(56579810-56580024)
chr4 (18-214)||(10559019-10559216)
chr4 (1-206)||(36654113-36654317)
chr4 (1-204)||(6518500-6518702)
chr4 (1-204)||(14690592-14690794)
chr4 (1-214)||(15123996-15124210)
chr4 (1-214)||(16683479-16683691)
chr4 (1-214)||(55798454-55798667)
chr4 (1-204)||(11888741-11888942)
chr4 (1-214)||(7439-7653)
chr4 (1-214)||(10732873-10733087)
chr4 (1-214)||(10946642-10946856)
chr4 (1-214)||(15248435-15248649)
chr4 (1-214)||(18563559-18563773)
chr4 (18-214)||(10637730-10637927)
chr4 (18-214)||(10651121-10651318)
chr4 (18-214)||(21420692-21420889)
chr4 (1-214)||(42708986-42709199)
chr4 (1-204)||(15305363-15305567)
chr4 (28-214)||(3080-3267)
chr4 (28-214)||(10684759-10684946)
chr4 (28-214)||(10898399-10898586)
chr4 (28-214)||(11495886-11496073)
chr4 (28-214)||(13823669-13823856)
chr4 (28-214)||(40844886-40845073)
chr4 (1-188)||(41400627-41400814)
chr4 (1-204)||(15255072-15255276)
chr4 (28-214)||(22105057-22105244)
chr4 (28-214)||(26293349-26293536)
chr4 (1-214)||(8091659-8091869)
chr4 (1-214)||(15259376-15259590)
chr4 (1-214)||(15265998-15266212)
chr4 (1-214)||(15302123-15302337)
chr4 (1-204)||(24124988-24125190)
chr4 (1-214)||(11504741-11504955)
chr4 (60-214)||(48641805-48641959)
chr4 (1-214)||(16227160-16227372)
chr4 (1-153)||(40560353-40560506)
chr4 (1-204)||(21275383-21275585)
chr4 (49-214)||(7870969-7871135)
chr4 (1-204)||(43701330-43701532)
chr4 (1-104)||(11048537-11048640)
chr4 (1-214)||(17996254-17996467)
chr4 (29-214)||(15866255-15866439)
chr4 (1-186)||(20058923-20059107)
chr4 (1-188)||(31594033-31594218)
chr4 (96-214)||(9857328-9857445)
chr4 (96-188)||(10731285-10731376)
chr4 (96-188)||(10945054-10945145)
chr4 (96-204)||(11902475-11902582)
chr4 (1-97)||(15410068-15410164)
chr4 (108-214)||(16953772-16953877)
chr4 (148-214)||(40563741-40563807)
chr4 (83-214)||(12808020-12808150)
chr4 (142-204)||(21102124-21102187)
chr4 (88-214)||(39579-39704)
chr4 (83-204)||(23793449-23793567)
chr4 (113-209)||(12347498-12347592)
chr4 (113-215)||(13883336-13883436)
chr4 (83-203)||(5675599-5675716)
chr4 (1-43)||(48641964-48642006)
chr4 (85-209)||(12345796-12345917)
[»] chr3 (153 HSPs)
chr3 (1-214)||(17388598-17388810)
chr3 (1-214)||(43841821-43842033)
chr3 (1-214)||(14071472-14071683)
chr3 (1-204)||(14494581-14494785)
chr3 (1-204)||(34053368-34053571)
chr3 (1-214)||(21264836-21265049)
chr3 (1-204)||(14976065-14976269)
chr3 (1-214)||(15429975-15430187)
chr3 (1-214)||(17480591-17480803)
chr3 (7-214)||(19566758-19566964)
chr3 (1-214)||(12775799-12776013)
chr3 (1-206)||(2781373-2781577)
chr3 (1-206)||(3338504-3338708)
chr3 (1-214)||(4830172-4830384)
chr3 (1-214)||(5687802-5688013)
chr3 (1-206)||(6710171-6710375)
chr3 (1-206)||(6809792-6809996)
chr3 (1-206)||(6815614-6815818)
chr3 (1-206)||(13093721-13093925)
chr3 (1-206)||(15854334-15854538)
chr3 (1-214)||(22164477-22164689)
chr3 (1-214)||(22169781-22169993)
chr3 (1-206)||(24696984-24697188)
chr3 (1-206)||(41473050-41473254)
chr3 (1-204)||(2722066-2722267)
chr3 (1-204)||(4768771-4768973)
chr3 (1-204)||(5226252-5226455)
chr3 (1-204)||(53354559-53354761)
chr3 (1-214)||(15947322-15947536)
chr3 (1-206)||(4365974-4366178)
chr3 (1-206)||(4383503-4383707)
chr3 (1-206)||(9365755-9365959)
chr3 (1-214)||(14866819-14867031)
chr3 (1-206)||(15424925-15425129)
chr3 (1-206)||(16385212-16385416)
chr3 (1-214)||(7785730-7785944)
chr3 (1-214)||(11948120-11948334)
chr3 (1-214)||(13194703-13194917)
chr3 (1-214)||(15944651-15944865)
chr3 (1-204)||(25765591-25765794)
chr3 (1-214)||(50908671-50908885)
chr3 (1-214)||(53160295-53160509)
chr3 (1-214)||(2006073-2006284)
chr3 (1-206)||(9360238-9360442)
chr3 (1-206)||(12246931-12247135)
chr3 (1-206)||(13087648-13087852)
chr3 (1-214)||(5211950-5212164)
chr3 (1-214)||(10559597-10559811)
chr3 (1-214)||(13325936-13326150)
chr3 (1-214)||(13665226-13665440)
chr3 (1-214)||(15951906-15952120)
chr3 (1-214)||(3279957-3280168)
chr3 (1-214)||(6829420-6829632)
chr3 (1-206)||(13098438-13098642)
chr3 (1-214)||(16377534-16377747)
chr3 (18-214)||(30026635-30026832)
chr3 (28-214)||(16372842-16373029)
chr3 (1-204)||(25055149-25055351)
chr3 (1-214)||(8991534-8991748)
chr3 (1-214)||(10546213-10546427)
chr3 (1-214)||(13204295-13204509)
chr3 (1-203)||(16034208-16034407)
chr3 (1-214)||(20154156-20154370)
chr3 (1-214)||(20155782-20155996)
chr3 (1-214)||(42281060-42281274)
chr3 (1-204)||(47974956-47975159)
chr3 (1-206)||(20556187-20556390)
chr3 (1-201)||(3249880-3250080)
chr3 (1-132)||(1991022-1991153)
chr3 (28-214)||(7601110-7601297)
chr3 (28-214)||(10159461-10159648)
chr3 (28-214)||(10166122-10166309)
chr3 (28-214)||(11880275-11880462)
chr3 (28-214)||(13000675-13000862)
chr3 (28-214)||(13193336-13193523)
chr3 (28-214)||(14815745-14815932)
chr3 (28-214)||(15556214-15556401)
chr3 (28-214)||(15564065-15564252)
chr3 (28-214)||(18214123-18214310)
chr3 (1-214)||(10601726-10601940)
chr3 (1-214)||(11940343-11940557)
chr3 (1-214)||(13135479-13135693)
chr3 (1-214)||(13142087-13142301)
chr3 (1-204)||(14660566-14660752)
chr3 (1-214)||(15573174-15573388)
chr3 (28-206)||(16334192-16334369)
chr3 (1-214)||(17733000-17733214)
chr3 (1-214)||(10249031-10249244)
chr3 (28-214)||(10147751-10147938)
chr3 (1-204)||(11399011-11399213)
chr3 (28-214)||(12186354-12186541)
chr3 (28-214)||(12192768-12192955)
chr3 (28-214)||(12199409-12199596)
chr3 (28-214)||(13186705-13186892)
chr3 (28-214)||(16705736-16705923)
chr3 (28-214)||(37935289-37935476)
chr3 (28-214)||(37943134-37943321)
chr3 (1-188)||(43496346-43496532)
chr3 (1-214)||(18128719-18128933)
chr3 (6-214)||(37978068-37978277)
chr3 (28-214)||(10141145-10141332)
chr3 (1-214)||(10608038-10608252)
chr3 (1-214)||(13504147-13504361)
chr3 (1-163)||(17766535-17766697)
chr3 (1-163)||(19067855-19068017)
chr3 (1-214)||(32403628-32403842)
chr3 (39-214)||(4651425-4651601)
chr3 (1-214)||(1811-2028)
chr3 (1-214)||(15634820-15635034)
chr3 (1-214)||(14347837-14348048)
chr3 (1-204)||(19655856-19656060)
chr3 (1-188)||(3244833-3245020)
chr3 (1-151)||(3212640-3212790)
chr3 (1-188)||(13605188-13605372)
chr3 (1-204)||(14445004-14445206)
chr3 (1-214)||(14457051-14457263)
chr3 (1-204)||(20155096-20155292)
chr3 (1-204)||(20150642-20150839)
chr3 (18-204)||(13068919-13069104)
chr3 (75-204)||(36076326-36076454)
chr3 (1-157)||(55514936-55515092)
chr3 (70-214)||(14137558-14137700)
chr3 (79-214)||(15639179-15639315)
chr3 (79-214)||(15645755-15645891)
chr3 (107-214)||(27407337-27407443)
chr3 (112-209)||(11827277-11827373)
chr3 (3-202)||(20224989-20225187)
chr3 (58-188)||(17023399-17023529)
chr3 (1-63)||(14953554-14953616)
chr3 (83-188)||(22038991-22039095)
chr3 (83-204)||(42244387-42244506)
chr3 (3-214)||(10850477-10850687)
chr3 (136-214)||(13418508-13418585)
chr3 (1-58)||(15234065-15234122)
chr3 (135-204)||(17041851-17041919)
chr3 (85-204)||(17050864-17050982)
chr3 (124-214)||(1993572-1993661)
chr3 (152-214)||(11868791-11868852)
chr3 (1-75)||(36079323-36079397)
chr3 (1-52)||(14137509-14137560)
chr3 (124-214)||(1998731-1998820)
chr3 (28-63)||(15639314-15639349)
chr3 (28-63)||(15645890-15645925)
chr3 (83-209)||(8685683-8685807)
chr3 (83-161)||(17209757-17209835)
chr3 (135-188)||(8532040-8532092)
chr3 (161-209)||(5666663-5666711)
chr3 (83-203)||(11577587-11577704)
chr3 (1-42)||(4654768-4654809)
chr3 (85-214)||(17577036-17577163)
chr3 (83-204)||(27992547-27992666)
chr3 (124-188)||(6237000-6237063)
chr3 (135-203)||(11869728-11869794)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (6-204)||(34102-34300)
[»] chr6 (121 HSPs)
chr6 (1-214)||(20993524-20993737)
chr6 (1-203)||(18854755-18854958)
chr6 (1-214)||(5671832-5672045)
chr6 (1-214)||(15158257-15158470)
chr6 (1-214)||(19560660-19560873)
chr6 (1-188)||(18844592-18844779)
chr6 (1-204)||(18184159-18184363)
chr6 (1-204)||(23603049-23603253)
chr6 (1-214)||(15153799-15154012)
chr6 (1-214)||(12442629-12442844)
chr6 (1-214)||(14077099-14077313)
chr6 (1-209)||(22737963-22738169)
chr6 (1-206)||(4188269-4188473)
chr6 (1-214)||(8603620-8603832)
chr6 (1-206)||(15700310-15700514)
chr6 (1-214)||(18732463-18732675)
chr6 (1-206)||(19075102-19075306)
chr6 (1-214)||(26474071-26474282)
chr6 (1-214)||(18006435-18006649)
chr6 (1-199)||(25786121-25786317)
chr6 (1-206)||(22060770-22060974)
chr6 (1-206)||(22071851-22072055)
chr6 (1-209)||(22005890-22006097)
chr6 (1-214)||(12474299-12474511)
chr6 (9-214)||(25775158-25775362)
chr6 (1-206)||(27565603-27565807)
chr6 (1-204)||(17283807-17284009)
chr6 (1-209)||(29360442-29360644)
chr6 (1-214)||(11607486-11607700)
chr6 (1-187)||(17119647-17119832)
chr6 (1-214)||(29596430-29596648)
chr6 (28-214)||(6479313-6479500)
chr6 (28-214)||(6490734-6490921)
chr6 (13-204)||(19614962-19615152)
chr6 (28-214)||(20022068-20022255)
chr6 (28-214)||(20164286-20164473)
chr6 (28-214)||(22164821-22165008)
chr6 (28-214)||(22244568-22244755)
chr6 (28-214)||(22773077-22773264)
chr6 (1-214)||(17934524-17934738)
chr6 (1-214)||(18107289-18107503)
chr6 (1-214)||(19828863-19829077)
chr6 (1-214)||(22766367-22766581)
chr6 (1-209)||(22786946-22787155)
chr6 (1-214)||(30671038-30671250)
chr6 (1-214)||(12657080-12657288)
chr6 (1-200)||(35271295-35271495)
chr6 (28-214)||(20015903-20016090)
chr6 (28-214)||(20170983-20171170)
chr6 (1-204)||(24218850-24219056)
chr6 (1-214)||(16738849-16739063)
chr6 (1-214)||(27322829-27323043)
chr6 (1-204)||(6795071-6795272)
chr6 (28-214)||(24854519-24854706)
chr6 (28-214)||(24861178-24861365)
chr6 (1-204)||(25964046-25964247)
chr6 (1-204)||(25968693-25968894)
chr6 (1-214)||(25615389-25615603)
chr6 (1-204)||(209892-210096)
chr6 (1-140)||(18195333-18195472)
chr6 (1-209)||(18233591-18233782)
chr6 (1-214)||(19966405-19966617)
chr6 (1-214)||(1626270-1626483)
chr6 (1-214)||(25402213-25402427)
chr6 (1-214)||(5152384-5152596)
chr6 (1-120)||(24511780-24511899)
chr6 (1-188)||(25949468-25949653)
chr6 (1-204)||(17743633-17743818)
chr6 (1-214)||(16470095-16470306)
chr6 (1-119)||(32544764-32544882)
chr6 (1-204)||(21559868-21560070)
chr6 (1-123)||(19569931-19570053)
chr6 (1-214)||(18448895-18449107)
chr6 (1-204)||(21573636-21573838)
chr6 (1-204)||(23297172-23297374)
chr6 (92-214)||(29563413-29563540)
chr6 (87-214)||(23616209-23616337)
chr6 (1-95)||(23540726-23540820)
chr6 (1-83)||(25656217-25656299)
chr6 (120-214)||(19563714-19563808)
chr6 (1-150)||(5949447-5949597)
chr6 (83-214)||(20218311-20218441)
chr6 (83-214)||(22112336-22112466)
chr6 (96-214)||(22601202-22601319)
chr6 (96-204)||(5399359-5399466)
chr6 (83-214)||(25923222-25923352)
chr6 (83-204)||(26138792-26138912)
chr6 (107-188)||(30245348-30245427)
chr6 (96-204)||(14992124-14992231)
chr6 (83-214)||(4741104-4741235)
chr6 (96-204)||(29093673-29093782)
chr6 (83-204)||(25507720-25507840)
chr6 (83-204)||(26018089-26018209)
chr6 (83-204)||(26157462-26157582)
chr6 (115-204)||(32543369-32543457)
chr6 (83-214)||(20105465-20105595)
chr6 (135-209)||(17793865-17793938)
chr6 (58-214)||(18627547-18627706)
chr6 (83-209)||(25339073-25339198)
chr6 (113-214)||(13168496-13168595)
chr6 (108-209)||(18396360-18396460)
chr6 (58-214)||(25031028-25031184)
chr6 (58-214)||(26821975-26822131)
chr6 (1-49)||(22344244-22344292)
chr6 (58-209)||(28733949-28734100)
chr6 (58-204)||(12660253-12660397)
chr6 (83-214)||(19612574-19612703)
chr6 (83-209)||(19993722-19993847)
chr6 (83-209)||(20221315-20221437)
chr6 (83-209)||(22115299-22115421)
chr6 (113-214)||(17522219-17522317)
chr6 (83-188)||(23523783-23523887)
chr6 (1-41)||(19563661-19563701)
chr6 (147-214)||(9414505-9414570)
chr6 (135-214)||(23517231-23517309)
chr6 (84-187)||(29254131-29254233)
chr6 (135-209)||(13217236-13217309)
chr6 (83-209)||(20464503-20464626)
chr6 (137-214)||(24545504-24545580)
chr6 (83-204)||(31965350-31965468)
chr6 (113-209)||(29682734-29682828)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (6-214)||(13941-14149)
[»] scaffold0916 (1 HSPs)
scaffold0916 (1-204)||(3646-3847)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-204)||(13356-13559)
[»] chr5 (109 HSPs)
chr5 (1-214)||(18483457-18483671)
chr5 (1-214)||(3388144-3388358)
chr5 (1-214)||(20245676-20245889)
chr5 (1-204)||(23343305-23343509)
chr5 (1-204)||(24220499-24220703)
chr5 (1-214)||(6406384-6406598)
chr5 (1-214)||(23435444-23435656)
chr5 (1-214)||(23446811-23447023)
chr5 (1-214)||(42789592-42789804)
chr5 (1-214)||(20571205-20571419)
chr5 (1-206)||(7760872-7761076)
chr5 (1-206)||(15732068-15732272)
chr5 (1-206)||(15736287-15736491)
chr5 (1-206)||(20595087-20595291)
chr5 (1-206)||(20789980-20790184)
chr5 (1-206)||(20795761-20795965)
chr5 (1-214)||(21734374-21734586)
chr5 (1-206)||(21812017-21812221)
chr5 (1-206)||(23618233-23618437)
chr5 (1-206)||(23684977-23685181)
chr5 (1-206)||(23849630-23849834)
chr5 (1-206)||(34780436-34780640)
chr5 (1-204)||(24214876-24215080)
chr5 (1-214)||(23599902-23600116)
chr5 (1-206)||(18067358-18067562)
chr5 (1-206)||(18073653-18073857)
chr5 (1-206)||(20601373-20601577)
chr5 (1-206)||(20607664-20607868)
chr5 (1-206)||(20614001-20614205)
chr5 (1-206)||(23972967-23973171)
chr5 (1-204)||(31057471-31057675)
chr5 (1-214)||(20449587-20449801)
chr5 (1-214)||(22323364-22323578)
chr5 (1-214)||(25891112-25891326)
chr5 (1-214)||(14482501-14482713)
chr5 (1-206)||(24935598-24935802)
chr5 (1-206)||(24941290-24941494)
chr5 (1-214)||(41765544-41765756)
chr5 (1-204)||(20915712-20915915)
chr5 (1-204)||(22143137-22143341)
chr5 (1-214)||(13910130-13910344)
chr5 (1-202)||(20444105-20444307)
chr5 (1-214)||(33701612-33701826)
chr5 (1-209)||(23267815-23268024)
chr5 (1-214)||(25577409-25577622)
chr5 (1-214)||(26848390-26848602)
chr5 (1-206)||(28834665-28834869)
chr5 (1-209)||(30729966-30730173)
chr5 (1-214)||(20802243-20802457)
chr5 (1-204)||(20832227-20832431)
chr5 (1-214)||(22316757-22316971)
chr5 (1-214)||(22856278-22856492)
chr5 (1-214)||(25006075-25006289)
chr5 (1-214)||(12322455-12322665)
chr5 (1-202)||(23771055-23771255)
chr5 (1-193)||(18613045-18613236)
chr5 (28-214)||(16104028-16104215)
chr5 (28-214)||(18772139-18772326)
chr5 (28-214)||(20616444-20616631)
chr5 (28-214)||(21729951-21730138)
chr5 (1-214)||(5077963-5078177)
chr5 (1-214)||(25115070-25115284)
chr5 (1-214)||(25174162-25174376)
chr5 (1-214)||(30758930-30759144)
chr5 (1-214)||(30769035-30769249)
chr5 (28-214)||(18610975-18611162)
chr5 (28-214)||(24952467-24952654)
chr5 (28-214)||(24969132-24969319)
chr5 (28-214)||(25202015-25202202)
chr5 (28-214)||(25266170-25266357)
chr5 (1-214)||(29052780-29052993)
chr5 (1-209)||(9728657-9728866)
chr5 (1-214)||(21382398-21382610)
chr5 (28-204)||(21273778-21273952)
chr5 (1-187)||(23626602-23626790)
chr5 (1-214)||(21389791-21390002)
chr5 (40-214)||(28621767-28621942)
chr5 (1-214)||(26780669-26780883)
chr5 (1-214)||(25741805-25742017)
chr5 (1-214)||(26842934-26843146)
chr5 (1-204)||(20169230-20169431)
chr5 (1-204)||(35307403-35307605)
chr5 (1-204)||(20967869-20968071)
chr5 (1-183)||(21833078-21833259)
chr5 (28-214)||(25122078-25122253)
chr5 (28-214)||(25181169-25181344)
chr5 (73-214)||(23756875-23757014)
chr5 (73-214)||(23822331-23822470)
chr5 (79-214)||(21400807-21400943)
chr5 (17-214)||(23582761-23582961)
chr5 (6-157)||(23743363-23743514)
chr5 (83-214)||(31757954-31758084)
chr5 (96-204)||(22948701-22948808)
chr5 (96-204)||(22942491-22942598)
chr5 (96-214)||(20724698-20724815)
chr5 (83-204)||(24165383-24165503)
chr5 (58-204)||(12410655-12410801)
chr5 (40-202)||(20103721-20103884)
chr5 (1-54)||(22000241-22000294)
chr5 (83-214)||(2953372-2953502)
chr5 (99-177)||(17408585-17408662)
chr5 (117-214)||(34222992-34223088)
chr5 (135-203)||(15059739-15059806)
chr5 (83-214)||(20738474-20738604)
chr5 (83-214)||(23114379-23114508)
chr5 (83-209)||(16677202-16677327)
chr5 (83-209)||(22170910-22171035)
chr5 (113-214)||(24166384-24166483)
chr5 (141-214)||(31414739-31414811)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-204)||(18692-18895)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (1-204)||(23383-23585)
scaffold0031 (1-204)||(77960-78162)
scaffold0031 (1-161)||(18380-18540)
scaffold0031 (1-172)||(100568-100742)
scaffold0031 (167-204)||(308-345)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (1-214)||(5505-5719)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (1-209)||(6239-6448)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-204)||(163676-163881)
scaffold0011 (1-214)||(162598-162812)
scaffold0011 (58-214)||(172860-173016)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-204)||(8610-8812)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-204)||(424779-424983)
scaffold0001 (1-214)||(159189-159401)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (1-204)||(2972-3174)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-204)||(48914-49117)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (1-214)||(32051-32263)
scaffold0071 (1-206)||(37109-37313)
[»] scaffold1323 (2 HSPs)
scaffold1323 (8-188)||(463-643)
scaffold1323 (157-204)||(1814-1862)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (8-214)||(56449-56656)
scaffold0042 (77-214)||(71998-72136)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (1-214)||(110675-110888)
scaffold0022 (1-204)||(33139-33341)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-204)||(17406-17608)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (1-214)||(5846-6060)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (1-214)||(1088-1300)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-206)||(8864-9068)
scaffold0230 (1-206)||(16390-16594)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (1-214)||(34802-35014)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (1-214)||(13171-13383)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (1-206)||(14336-14540)
scaffold0035 (1-206)||(49784-49988)
scaffold0035 (147-209)||(30985-31045)
scaffold0035 (147-209)||(31756-31816)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-214)||(117891-118103)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-206)||(369268-369472)
scaffold0004 (108-214)||(24174-24281)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-204)||(13848-14052)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-214)||(2173-2387)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-214)||(299919-300133)
[»] scaffold0489 (1 HSPs)
scaffold0489 (1-206)||(798-1002)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-214)||(19554-19766)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (1-214)||(13921-14135)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-214)||(12298-12510)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-202)||(38200-38400)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (1-204)||(1907-2109)
[»] scaffold0506 (2 HSPs)
scaffold0506 (1-214)||(7591-7805)
scaffold0506 (106-209)||(1659-1763)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-214)||(712-926)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-214)||(24597-24811)
scaffold0078 (1-214)||(30667-30881)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-214)||(186362-186576)
scaffold0012 (122-204)||(50012-50094)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (1-214)||(2105-2318)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (1-214)||(3340-3552)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-214)||(117873-118085)
scaffold0029 (1-214)||(124117-124329)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (1-204)||(21451-21655)
scaffold0142 (112-204)||(26709-26802)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (1-202)||(10533-10736)
scaffold0346 (1-209)||(2176-2385)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (28-214)||(5395-5582)
[»] scaffold0760 (1 HSPs)
scaffold0760 (1-214)||(5979-6193)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-214)||(2801-3015)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (1-214)||(15225-15439)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (1-214)||(12094-12306)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (1-214)||(1802-2016)
[»] scaffold0624 (1 HSPs)
scaffold0624 (1-214)||(4799-4995)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (65-209)||(60665-60809)
scaffold0072 (69-102)||(60613-60646)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (28-214)||(1772-1959)
scaffold0404 (28-214)||(4064-4251)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (6-200)||(121689-121884)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (38-203)||(9638-9802)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-170)||(42867-43035)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-214)||(14370-14582)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-204)||(9576-9778)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (1-204)||(6542-6744)
scaffold0447 (1-204)||(11156-11358)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-204)||(9151-9353)
[»] scaffold1092 (1 HSPs)
scaffold1092 (1-214)||(1438-1649)
[»] scaffold1058 (1 HSPs)
scaffold1058 (1-214)||(2815-3026)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-204)||(27503-27707)
scaffold0138 (1-204)||(39499-39703)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (1-214)||(413-628)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (1-204)||(21423-21625)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (18-214)||(1512-1707)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (1-204)||(8583-8784)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (18-204)||(48528-48715)
scaffold0037 (1-214)||(83998-84210)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-119)||(70383-70501)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (1-164)||(1979-2146)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (41-214)||(17170-17344)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (8-209)||(1243-1442)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (1-214)||(5558-5770)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (40-204)||(37742-37907)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-204)||(18517-18721)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (1-214)||(130-342)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (95-214)||(17730-17849)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-187)||(4926-5112)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (1-204)||(19495-19697)
scaffold0150 (58-214)||(25343-25500)
scaffold0150 (1-204)||(26324-26526)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-204)||(23281-23483)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (102-214)||(19797-19909)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (40-206)||(61976-62142)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-214)||(1545-1758)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (15-204)||(18984-19173)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (87-214)||(3444-3572)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-125)||(104950-105074)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (106-214)||(2-109)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-204)||(169111-169312)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (106-214)||(33802-33911)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-204)||(44066-44251)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (35-206)||(6790-6970)
scaffold0099 (28-214)||(47829-48026)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-120)||(74174-74293)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (37-99)||(8915-8977)
scaffold0371 (134-200)||(8977-9043)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-72)||(22533-22604)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (142-209)||(3972-4040)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (83-204)||(6543-6663)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (83-204)||(9058-9178)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (83-204)||(22261-22381)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (83-209)||(49820-49945)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (98-209)||(38664-38773)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (113-214)||(1772-1871)
[»] scaffold0855 (1 HSPs)
scaffold0855 (113-209)||(3596-3690)
[»] scaffold0847 (1 HSPs)
scaffold0847 (113-209)||(3761-3855)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (140-204)||(21308-21371)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (135-185)||(21748-21797)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (142-204)||(4658-4719)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (135-209)||(14218-14291)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (159-214)||(6785-6841)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (159-214)||(5210-5266)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (168-214)||(11753-11799)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (161-214)||(33768-33822)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (161-214)||(21443-21496)


Alignment Details
Target: scaffold0009 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 150615 - 150823
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150615 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 150714  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  150715 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 150814  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  150815 cactcatgt 150823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 245566 - 245784
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataatta---tcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaattta 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  245566 aattgatatttgagatgatggattaacaattattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaattta 245665  T
Q  98 gattagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  245666 gattagagattagggttacataagattaaggtttaaaagcttgttttgattaggattatgccatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagt 245765  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  245766 ctactcactcatgttcatc 245784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 153628 - 153842
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  153628 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 153727  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  153728 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 153827  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  153828 tcactcatgttcatc 153842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8654085 - 8653872
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654085 aattgatatttaagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 8653986  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8653985 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 8653886  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    | || |||| ||||    
T  8653885 cgctcatgttcatc 8653872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 49379402 - 49379604
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49379402 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 49379501  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49379502 tagagattaggattacataagattagggttaaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 49379600  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  49379601 cact 49379604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8649199 - 8648996
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8649199 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttatat 8649100  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8649099 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 8649001  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  8649000 tcact 8648996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 28206115 - 28206319
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28206115 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagtggtgaatttagat 28206214  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28206215 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 28206314  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  28206315 tcact 28206319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 22659828 - 22660026
Alignment:
Q  16 tgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggtta 115  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22659828 tgattgattaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggtta 22659927  T
Q  116 cataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  22659928 cataagattagggtcaatagcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtctactcacttatgttcatc 22660026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4028637 - 4028425
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4028637 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttacacagtt-gataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 4028539  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  4028538 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttagtttgattaggattatgtcattaagacttatccagcaatcccaagacaagagaagtctact 4028439  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    | || |||| ||||    
T  4028438 cgctcatgttcatc 4028425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17986884 - 17986683
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17986884 atatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaa 17986785  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17986784 attagggttacataagattagggttaa-aacttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcacta 17986687  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  17986686 atgt 17986683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13251068 - 13250856
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13251068 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 13250969  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13250968 tagagattacggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 13250870  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  13250869 cactaatgttcatc 13250856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18885159 - 18885371
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18885159 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 18885258  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18885259 tatagattagggttacataggattaaggtttaaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagaca--agaagtctac 18885356  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18885357 tcactcatgttcatc 18885371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 26134288 - 26134491
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26134288 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccccccactttcgtttccacagtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 26134387  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26134388 tagaaattagggttacataagattaaggtttaaaacttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 26134487  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  26134488 cact 26134491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44538567 - 44538364
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44538567 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 44538468  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44538467 tagaaattagggttacataagattaaggtttaaagtttggtttgattagaattatgtcatttactcgtatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 44538368  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  44538367 cact 44538364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8953249 - 8953462
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8953249 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccttccattttcttttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 8953348  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8953349 tagagattagagttacataagactagggtcaatagcttggtttgattatgattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttact 8953448  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  8953449 cactcatgttcatc 8953462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2386560 - 2386353
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2386560 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 2386461  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2386460 tagagattagggttacataagattaatgtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 2386362  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  2386361 cactaatgt 2386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36850114 - 36850325
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36850114 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttaataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagat 36850213  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36850214 tagaaactagggttacataagattagggttaa-aacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 36850311  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  36850312 cactcatgttcatc 36850325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17717079 - 17716878
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17717079 aattgatattttagatgatggattaacaattatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 17716980  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||    
T  17716979 tagaaactagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaaccatcccaagacaagagaagcatact 17716882  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  17716881 cact 17716878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 16365097 - 16365270
Alignment:
Q  40 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttg 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16365097 ctccactttcgtttccacggtttgataatcgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttg 16365196  T
Q  140 gtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  16365197 gtttgattaggattatgtca-ttagacttatctaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatc 16365270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3985588 - 3985384
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  3985588 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 3985489  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3985488 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3985390  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  3985389 cactga 3985384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3990867 - 3990663
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  3990867 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 3990768  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3990767 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3990669  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  3990668 cactga 3990663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16485609 - 16485405
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16485609 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 16485510  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16485509 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 16485411  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  16485410 cactga 16485405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27911087 - 27911299
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  27911087 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 27911186  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27911187 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 27911285  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  27911286 cactaatgttcatc 27911299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38045667 - 38045463
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  38045667 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 38045568  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38045567 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 38045469  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  38045468 cactga 38045463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 46143299 - 46143511
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46143299 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctaaagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 46143398  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46143399 tagaaactagggttacataagattagggtgtaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtatact 46143497  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  46143498 cactcatgttcatc 46143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 39286388 - 39286591
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39286388 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaacccttcgctttcgttttcacagtttaataatggttaattcattttaaaacggtgaatttagat 39286487  T
Q  101 tagagattagggttacataaga-ttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39286488 tagaaattagggttacataagatttagggttaatagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 39286586  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  39286587 tcact 39286591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27042016 - 27041812
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  27042016 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 27041917  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27041916 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttagtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 27041818  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  27041817 cactga 27041812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27047770 - 27047566
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  27047770 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 27047671  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27047670 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 27047572  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  27047571 cactga 27047566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20231838 - 20231624
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  20231838 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 20231739  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaat-agaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20231738 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctac 20231639  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20231638 tcactcatgttcatc 20231624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19879851 - 19880062
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19879851 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttacaacggtgaatttagat 19879950  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19879951 tagaaactagggttacgtaagattagggtttaaggcttggtttgatt-ggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 19880048  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  19880049 cactcatgttcatc 19880062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41462057 - 41461846
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  41462057 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccttcaactttcgtttctacagtttgataatggttaattcaagttaaaatagtgaatttagat 41461958  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  41461957 tagaaattcgggttacataagattagggttaa-aacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaaacccaagacaagagaagtatact 41461860  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  41461859 cactcatgttcatc 41461846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41802605 - 41802405
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41802605 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacactttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagat 41802506  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | || |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41802505 tagaaactaaggttacataagattagtgtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 41802407  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  41802406 ca 41802405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16431879 - 16431677
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16431879 aattgatatttgagatgatggattaacaattattaaaccctccattttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 16431780  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |  ||||||||    
T  16431779 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacgattccaagacaagaagagtctact 16431681  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  16431680 cact 16431677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25727281 - 25727075
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25727281 aattgatatttgagatgatgaattaacaattattaa-ccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25727183  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  25727182 tagaaattagggttacataaaattaggggttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 25727084  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  25727083 cactcatgt 25727075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25735689 - 25735483
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25735689 aattgatatttgagatgatgaattaacaattattaa-ccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25735591  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  25735590 tagaaattagggttacataaaattaggggttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 25735492  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  25735491 cactcatgt 25735483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 17093873 - 17094060
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  17093873 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattacg 17093972  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17093973 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 17094060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20399908 - 20399721
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  20399908 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20399809  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20399808 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 20399721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22842006 - 22841819
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22842006 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22841907  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22841906 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22841819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19599677 - 19599891
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19599677 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 19599776  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  19599777 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagctttgcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 19599876  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19599877 tcactcatgttcatc 19599891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20238404 - 20238190
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  20238404 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 20238305  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaat-agaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20238304 aagaaattagggttacataagattaaggcatagagcttggtttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctac 20238205  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20238204 tcactcatgttcatc 20238190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20393913 - 20393699
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20393913 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20393814  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20393813 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatctcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 20393714  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
     |||| |||| ||||    
T  20393713 gcactcatgttcatc 20393699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 12060255 - 12060440
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060255 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataacggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 12060354  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12060355 tagaaactagggttacataatattagagttaa-agcttggttggattaagattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaaaacaa 12060440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 17101709 - 17101896
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  17101709 aattatcaaaccctccactgtcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattacg 17101808  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17101809 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 17101896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 21797936 - 21798123
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  21797936 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 21798035  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21798036 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 21798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 21804644 - 21804831
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  21804644 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 21804743  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21804744 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 21804831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19771958 - 19772171
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataat-ggttaattcatgttaaaacggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19771958 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcataccctccactttcgcttctacaggttgataattggttaattcatgttgaaacggtgaatttaga 19772057  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||||    
T  19772058 ttagaaattagggttatataagattagggtttaaagctttgtttgattaggattatgtca-ttagacttatacgacaatcccaagacaagaagagtctac 19772156  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19772157 tcactcatgttcatc 19772171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 48256630 - 48256445
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48256630 aattgatatttgagatgatagattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttatat 48256531  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| ||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  48256530 tagaaattaatgttacataaaattaggtttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatcccaagacaa 48256445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2395048 - 2395262
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||    
T  2395048 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaatccagat 2395147  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2395148 aagaaattagggttacataagattaaggcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttgtccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 2395247  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  2395248 tcactcatgttcatc 2395262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19874893 - 19875105
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19874893 aattgatatttgatatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcacttttacaggttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 19874992  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  19874993 tagaaactagggttacataagattagggtttaagtcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccaaagacaagaagagtctact 19875091  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  19875092 cactcatgttcatc 19875105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23501556 - 23501770
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||    
T  23501556 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagcttgataatggttgatccatgttaagacagtgaattcagat 23501655  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  23501656 aagaaattagagttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaaggagaagtctac 23501755  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23501756 tcactcatgttcatc 23501770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28208210 - 28208015
Alignment:
Q  7 tatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaga 106  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  28208210 tatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaa 28208112  T
Q  107 ttagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  28208111 ctagggttacataagattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaagaatccgaagacaagaagagtctactcact 28208015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 41309276 - 41309466
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  41309276 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaattcagataagaaattaaggttaca 41309375  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||    
T  41309376 taagattag-------agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaaatctactcactcatgttcatc 41309466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18816689 - 18816477
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18816689 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 18816590  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |   ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  18816589 gagaaactagggttacataatattaaggtttaagtcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 18816491  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  18816490 cactcatgttcatc 18816477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19788039 - 19788239
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19788039 aattgatatttgagattatggattagcaattatcaaaccctatactttcgcttctatagtttgataatggttaattcatgttgaaacagtgaatttagat 19788138  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19788139 tacaaattagggttatataaaattagggtttaaaacttggtttgattaggattatgtca-ttagacatatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 19788237  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  19788238 ca 19788239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19364963 - 19364789
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364963 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccaatttcaattaaaaagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 19364864  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaaca 176  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  19364863 tagaaactagggttacacaagattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-atagacttatccaaca 19364789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 21783975 - 21784177
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21783975 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 21784074  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||  ||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  21784075 gagaaactagggttacataatattaaagtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctac 21784174  T
Q  200 tca 202  Q
    |||    
T  21784175 tca 21784177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21792101 - 21792302
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  21792101 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaactctccactttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacgttgaatttagaa 21792200  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21792201 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 21792300  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  21792301 tc 21792302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 41224752 - 41224623
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41224752 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccttccattttcttttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 41224653  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggtt 130  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  41224652 tagaaattagggttatataagattaaggtt 41224623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 22635475 - 22635635
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22635475 aattaatatttgggataatggattaacgaccatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 22635574  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatt 161  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22635575 gagaaattagggttacataaaattagagtttaaggcttggcttgattaggattatatcatt 22635635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Original strand, 52235711 - 52235793
Alignment:
Q  40 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataaga 122  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52235711 ctccactttcgtttccacaacttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataaga 52235793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20412584 - 20412425
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   |||||| || | ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  20412584 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttcatgagtttggtatttgttaattcattatgaaaacggtgaatttaga 20412486  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatt 161  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20412485 ttagaaattagggttacataaaattagggttaa-ggcttggtttgattaggattatgtcatt 20412425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 52755199 - 52755290
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52755199 tagattagaaattagggttacataaagttaggggttaaaacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaa 52755290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 28763630 - 28763843
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa-aacggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |  ||||||||||||| ||    ||||||||| | ||||||||||  | | ||| ||||| |||||    
T  28763630 aattgatatttgagatgatgaattaacaaatattag-ccctccactttcgctttatgagtttgatatttgttaattcattatgataacagtgaaattaga 28763728  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    ||||| | ||   ||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||    
T  28763729 ttagaaagtatatttatataaaattagggttcaaggcttggtttgattagggttatgtcatttagacttaccctacaatcccaagacaagaagagtctac 28763828  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  28763829 tcactcatgttcatc 28763843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 13799276 - 13799395
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  13799276 aaaacggtgaaattagattagaaattagatttacataaaattagggttcgatgcttggtttgatcaggattaggtca-ttagactcatccaacaatccaa 13799374  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  13799375 agacaa-agaagtctactcact 13799395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52169242 - 52169138
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| | ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  52169242 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatgcaacaatccca 52169144  T
Q  183 agacaa 188  Q
    ||||||    
T  52169143 agacaa 52169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22411359 - 22411229
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||    
T  22411359 aaaacgttgaaattagattagaaagtaggtttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaataattcca 22411261  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  22411260 agacaagaagagtctactcactcatgttcatc 22411229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Original strand, 16148260 - 16148411
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |    
T  16148260 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattagg 16148359  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||| ||||||| ||| |||||| | ||||||| |  ||| |||||||| ||||    
T  16148360 tca-ttagactcatccaacaattcaaagacaagaagagtttactcactcatgt 16148411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24680361 - 24680265
Alignment:
Q  115 acataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  24680361 acataaaattagggttataggcttggtttgataag-attatgtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtttactcactcatgttcatc 24680265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 52235791 - 52235842
Alignment:
Q  163 agacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  52235791 agacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcacttatgttcatc 52235842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 15346686 - 15346810
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||    ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15346686 aaaacggtgagattagattagaaaatagggttacataaaattagagttttaggcttgctttgaataagattaggtca-ttagactcatctaacaatccca 15346784  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  15346785 agataa-agaagtctacttactcatgt 15346810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 16384793 - 16384916
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  16384793 aaaacggtgaaat-agattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattatgtca-ttagactcatccaacaatccca 16384890  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||| || |||||||| |||||| ||||    
T  16384891 agagaa-agaagtctgctcactcatgt 16384916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21924881 - 21924782
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||    
T  21924881 ttacataaaattagggttttaggcttggtttgaataggattaagtcatt-agactcatctaacaatcccaagacaa-aaaagactactcactcatgttca 21924784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26194473 - 26194362
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    | ||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26194473 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggtttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagt 26194376  T
Q  196 ctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||| ||||    
T  26194375 ctactcactcatgt 26194362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 203
Target Start/End: Original strand, 30818957 - 30819022
Alignment:
Q  136 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30818957 cttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcac 30819022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 25404968 - 25405041
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||    
T  25404968 gcttggtttgattaggattaggtca-ttagacttatacatcaatcccaagacaaaaagagtttactcactcatgt 25405041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 209
Target Start/End: Original strand, 12059671 - 12059742
Alignment:
Q  137 ttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  12059671 ttggtttgattatgatcaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactaatgt 12059742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15421349 - 15421231
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||    |||| |||| ||  |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  15421349 aaaacgatgaaattagattagaaaatagatttaaataagattagggttctaggcttagtttcatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 15421251  T
Q  183 agacaatagaagtctactcac 203  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  15421250 agacaa-agaaatctactcac 15421231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16354290 - 16354211
Alignment:
Q  124 tagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||||| || | ||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16354290 tagggtttatggtttggttaaattaagattacgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 16354211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20282378 - 20282176
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20282378 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagat 20282279  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20282278 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaatagaagtctact 20282180  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20282179 cact 20282176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 23014246 - 23014448
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23014246 aattactatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagat 23014345  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23014346 tagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatcgaacaatcccaagacaagagaagtctact 23014445  T
Q  201 cac 203  Q
    |||    
T  23014446 cac 23014448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 23018360 - 23018562
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23018360 aattactatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagat 23018459  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23018460 tagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatcgaacaatcccaagacaagagaagtctact 23018559  T
Q  201 cac 203  Q
    |||    
T  23018560 cac 23018562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18994218 - 18994420
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18994218 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatagttaattcatgttaaaacgatgaatttagat 18994317  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18994318 tagagattagtgttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaactctact 18994417  T
Q  201 cac 203  Q
    |||    
T  18994418 cac 18994420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 40916567 - 40916780
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40916567 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagat 40916666  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  40916667 tagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccgagacaaaaaaagtctact 40916766  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  40916767 cactcatgttcatc 40916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 42767124 - 42767328
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42767124 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 42767223  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  42767224 tagagattagggttacataagattaatgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaagaagaagtctac 42767323  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  42767324 tcact 42767328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5499539 - 5499742
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5499539 aattgatatttgagatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 5499638  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5499639 tagagattaaggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 5499738  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  5499739 cact 5499742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21468205 - 21468417
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21468205 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 21468304  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21468305 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21468403  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21468404 cactaatgttcatc 21468417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23798172 - 23798384
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23798172 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaactgtgaatttagat 23798271  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  23798272 tagaaactagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctccagacaaaagaagtctact 23798370  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  23798371 cactcatgttcatc 23798384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25370092 - 25370307
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaa----ttcatgttaaaacggtgaattt 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  25370092 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccagagtctgataatggttaattaattcatgttaaaacggtgaattt 25370191  T
Q  97 agattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  25370192 agattagagattagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagta 25370289  T
Q  197 tactcactgatgtccatc 214  Q
    || ||||| |||| ||||    
T  25370290 tattcactcatgttcatc 25370307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25803554 - 25803761
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803554 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25803653  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25803654 tagaaactaggattacataagattggggttaaaagcttggtttgattaggattatatca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 25803752  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  25803753 cactcatgt 25803761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 28496451 - 28496658
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496451 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 28496550  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  28496551 tagaaattagggttatataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 28496649  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  28496650 cactcatgt 28496658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25358468 - 25358264
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25358468 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 25358369  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25358368 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 25358270  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  25358269 cactga 25358264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29563524 - 29563311
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  29563524 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttacaatggtaaatttagat 29563425  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29563424 taaaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttgattaggattgtgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 29563325  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  29563324 cactcatgttcatc 29563311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 206
Target Start/End: Original strand, 20172580 - 20172777
Alignment:
Q  8 atttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagat 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  20172580 atttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaat 20172679  T
Q  108 tagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20172680 tagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactga 20172777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 10904 - 11108
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10904 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 11003  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11004 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcgcaagacaagagaagtctact 11102  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  11103 cactga 11108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24507635 - 24507436
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24507635 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaactctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttggat 24507536  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  24507535 tagaaactagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 24507438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18446507 - 18446721
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18446507 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 18446606  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18446607 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatctaacaatcccaagacaaggagaagtctac 18446706  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18446707 tcactcatgttcatc 18446721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19929723 - 19929508
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19929723 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgattaattcatgttaaaatggtgaatttagat 19929624  T
Q  101 tag------------agattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||            | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19929623 taggattaaggttacatattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaa 19929524  T
Q  189 tagaagtctactcact 204  Q
     |||||||||||||||    
T  19929523 gagaagtctactcact 19929508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36684629 - 36684421
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaa-ttcatgttaaaacgg-tgaatttag 98  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36684629 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaatttcatgttaaaacggttgaatttag 36684530  T
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtcta 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36684529 attagaaactagggttacataagattagggttaa-aacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtcta 36684432  T
Q  199 ctcactgatgt 209  Q
    |||||| ||||    
T  36684431 ctcactcatgt 36684421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 39870336 - 39870550
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39870336 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttgataatggtttattcatgttaaaacggtgaatttagat 39870435  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||    
T  39870436 aagaaattagggttacataagattaaggcttagaacttggtttgattaggattatgtcatttaggcttatccaacaatcccaagacaaggagaagtttac 39870535  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  39870536 tcactcatgttcatc 39870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27745396 - 27745185
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27745396 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcttgttaaaacggtgaatttagat 27745297  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||    
T  27745296 tagaaaatagggttacataagattagggttaa-aacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccaaaaacaagagaagtttact 27745199  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  27745198 cactcatgttcatc 27745185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21201227 - 21201013
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21201227 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21201128  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||||||||| || || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21201127 aagaaattagggttacataagactaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 21201028  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21201027 tcactcatgttcatc 21201013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23644918 - 23644704
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23644918 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23644819  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23644818 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23644719  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23644718 tcactcatgttcatc 23644704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 111819 - 111605
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  111819 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 111720  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  111719 aagaaattagggttacgtaagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaggagaagtctac 111620  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  111619 tcactcatgttcatc 111605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27615748 - 27615534
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  27615748 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 27615649  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27615648 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 27615549  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27615548 tcactcatgttcatc 27615534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27632444 - 27632230
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  27632444 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 27632345  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27632344 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 27632245  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27632244 tcactcatgttcatc 27632230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 118474 - 118277
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  118474 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagataagaaattagggttacg 118375  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||    
T  118374 taagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtttactcactcatgttcatc 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35080926 - 35080722
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  35080926 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 35080827  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  35080826 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctact 35080728  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  35080727 cactga 35080722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17583521 - 17583334
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  17583521 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 17583422  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17583421 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 17583334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17591327 - 17591140
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  17591327 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 17591228  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17591227 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 17591140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 22043933 - 22044120
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22043933 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22044032  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22044033 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22044120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22288500 - 22288313
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22288500 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22288401  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22288400 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22288313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22666004 - 22665817
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22666004 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22665905  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22665904 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22665817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23158651 - 23158865
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  23158651 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 23158750  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23158751 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcgtggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23158850  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23158851 tcactcatgttcatc 23158865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23163221 - 23163435
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  23163221 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 23163320  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23163321 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23163420  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23163421 tcactcatgttcatc 23163435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23569908 - 23570122
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  23569908 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 23570007  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23570008 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcgtggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23570107  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23570108 tcactcatgttcatc 23570122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23574478 - 23574692
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  23574478 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 23574577  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23574578 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23574677  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23574678 tcactcatgttcatc 23574692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20708020 - 20708232
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20708020 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaaaagtgaatttagat 20708119  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| |   |||||||    
T  20708120 tagaaactaggattacataagattagggtttaaagcttggtttgatttggattttgcca-ttagacttatccaataatcccaagacaagaagtgtctact 20708218  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  20708219 cactcatgttcatc 20708232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27768083 - 27768292
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  27768083 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 27768182  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27768183 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttggttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 27768282  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  27768283 tcactcatgt 27768292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16769931 - 16769744
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  16769931 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 16769832  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  16769831 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 16769744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16776593 - 16776406
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  16776593 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 16776494  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  16776493 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 16776406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23340897 - 23340696
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23340897 aattgatatttgagatgatgaattaataatta-ctaaccctccactttcgattatacaatttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 23340799  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23340798 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 23340700  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  23340699 cact 23340696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 24794560 - 24794747
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  24794560 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24794659  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24794660 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 24794747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 24801269 - 24801456
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  24801269 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24801368  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24801369 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 24801456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24877809 - 24877622
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  24877809 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24877710  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24877709 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 24877622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27628513 - 27628326
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  27628513 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 27628414  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  27628413 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 27628326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19278546 - 19278760
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19278546 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 19278645  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  19278646 aagaaactagggttacataaaattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagagaaggagaaatctac 19278745  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19278746 tcactcatgttcatc 19278760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32140302 - 32140090
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32140302 aattgatattttagatgatggattaacaattatcaaaccctccattttcgcttctatagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagat 32140203  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  32140202 tagaaactagggttacataagattcggattgaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttctccaacaatcccatgacaaaagaagtctatt 32140104  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  32140103 cactcatgttcatc 32140090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27621868 - 27621681
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||      
T  27621868 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaaa 27621769  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  27621768 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 27621681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 24824736 - 24824940
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  24824736 aattaacatttggaataatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacagtgaatttagaa 24824835  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24824836 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 24824935  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  24824936 tcact 24824940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33182009 - 33181797
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    ||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33182009 aattaatatttgttataatggattaacgattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 33181910  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33181909 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgtcttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 33181811  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  33181810 cactcatgttcatc 33181797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25144014 - 25144216
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25144014 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 25144113  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  25144114 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 25144212  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  25144213 cact 25144216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 32441123 - 32441307
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32441123 aattgatatttgagatgaagaattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacaatttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagat 32441222  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  32441223 tagaaactagggttacataagatta-ggttaa-agcttggtttgattatgattatgtca-ttagacttatccgacaatcctaagacaa 32441307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 11317949 - 11318161
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11317949 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 11318048  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  11318049 gagaaaatagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacctatccaacaatcccaagacataagaaatctact 11318147  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  11318148 cactcatgttcatc 11318161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 24820351 - 24820555
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  24820351 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccattttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgtgaaaacggtgaatttagaa 24820450  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||  |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24820451 gagaaactagggttacataatattgaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 24820550  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  24820551 tcact 24820555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25481705 - 25481506
Alignment:
Q  4 taatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattag 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |     
T  25481705 taatatttgggataatggattaaagattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagaa 25481606  T
Q  104 agattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    | | ||||||||||||| |||| |||| |  | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25481605 aaactagggttacataatattaaggtttaaggattggcttgattaggattatatca-ttagacttaaccaacaatcccaagacaagagaagtctactcac 25481507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25489311 - 25489112
Alignment:
Q  4 taatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattag 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |     
T  25489311 taatatttgggataatggattaaagattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagaa 25489212  T
Q  104 agattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    | | ||||||||||||| |||| |||| |  | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25489211 aaactagggttacataatattaaggtttaaggattggcttgattaggattatatca-ttagacttaaccaacaatcccaagacaagagaagtctactcac 25489113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23139772 - 23139958
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139772 aattgatatttaagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 23139871  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||   |||             || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23139872 tagaaattagggtt---taa-------------agattggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaaagagtctact 23139954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23551562 - 23551748
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23551562 aattgatatttaagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 23551661  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||   |||             || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23551662 tagaaattagggtt---taa-------------agattggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaaagagtctact 23551744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24172298 - 24172119
Alignment:
Q  29 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaggg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  24172298 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataacatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaagg 24172199  T
Q  129 ttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    || |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  24172198 tttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaacacataagaagtctactcactcatgt 24172119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16133955 - 16134157
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  16133955 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaatggtgaatttagaa 16134054  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||| |||||||||  |||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  16134055 gagaaactagagttacataaagttagggtttaaggcttggcttgattaggattatatca-ttagacttacccaacaatcacaagacaaaagaagtatact 16134153  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  16134154 cact 16134157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11391436 - 11391255
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11391436 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacaatttgataattattaattcatgttaaaacggtgaatttagat 11391338  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||    |||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  11391337 taga----agggttacataaaattaggggttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttggacttatccaacaatcccaagacaa 11391255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11408097 - 11407916
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11408097 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacaatttgataattattaattcatgttaaaacggtgaatttagat 11407999  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||    |||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  11407998 taga----agggttacataaaattaggggttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttggacttatccaacaatcccaagacaa 11407916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23634249 - 23634131
Alignment:
Q  7 tatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaga 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23634249 tatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcatttccacggtttgataatagttaattcatgttaaagcagtgaatttagattagaga 23634150  T
Q  107 ttagggttacataagatta 125  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  23634149 ttagtgttacataagatta 23634131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45706545 - 45706328
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  45706545 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttggtccatgttaaaacggtgaatttagat 45706446  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggtta-atagcttggtttgattag-gattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtc 196  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||      || ||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  45706445 aagaaattagggttacataagattaaggcttagataagaaatttagataagaaattatgtcatttagtcttatccaacaatcccaagacaaagagaagtc 45706346  T
Q  197 tactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  45706345 tactcactcatgttcatc 45706328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25198724 - 25198600
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25198724 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 25198625  T
Q  101 tagagattagggttacataagatta 125  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  25198624 aagaaattagggttacataagatta 25198600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20635994 - 20635781
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20635994 aattaacatttggaataatggattaatgattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgatgatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 20635895  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | || |||||||||| ||| ||| || |  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  20635894 gagaaactaaggttacataatattaaggttttaaggcttgacctgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagatataagaagtctac 20635796  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20635795 tcacttatgttcatc 20635781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 539520 - 539326
Alignment:
Q  9 tttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagatt 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |    
T  539520 tttgagatgatgaattaacaatta-ctagccctccactttcgcttctacagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacagtgaatttagattagaaagt 539422  T
Q  109 agggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||  ||| |||| ||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  539421 agatttatataaaattagggttcaagacttggtttgattagggttatgtcatttaaacttacccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 539326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23634067 - 23633909
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||   ||||||||||||    
T  23634067 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatataaaagaagtgaatttagat 23633968  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca 159  Q
     ||  |||||||||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23633967 aaggaattagggttacataagatttaggcttagagcttggcttgattaggattatgtca 23633909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 25038694 - 25038777
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa 84  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25038694 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa 25038777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 17637323 - 17637445
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||    
T  17637323 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttacgacggtgaattcagat 17637422  T
Q  101 tagagattagggttacataagat 123  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  17637423 aagaaattagggttacataagat 17637445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 29577197 - 29577314
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||    
T  29577197 tagattagaaatcaaggttacataaaattagggattaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagaagagt 29577295  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  29577296 ctactcactcatgttcatc 29577314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23704513 - 23704425
Alignment:
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23704513 attagaaattagggttacataaaattagggtttagagcttggtttgattagtattatgtca-ttagacttatccaacaatcctaagacaa 23704425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 214
Target Start/End: Original strand, 23698653 - 23698776
Alignment:
Q  90 tgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaat 189  Q
    |||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23698653 tgaaattagattagaaaatagatttatataaaattagggtttatagtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaag 23698751  T
Q  190 agaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||    
T  23698752 aagagtctactcactcatgttcatc 23698776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 25043007 - 25043080
Alignment:
Q  140 gtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25043007 gtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatc 25043080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 23613900 - 23614000
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23613900 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttcatgagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagat 23613998  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  23613999 ta 23614000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 187
Target Start/End: Original strand, 21344321 - 21344423
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  21344321 aaaacggtgaaat-agattagaaattagggttacctaaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatctca 21344418  T
Q  183 agaca 187  Q
    |||||    
T  21344419 agaca 21344423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Original strand, 24609919 - 24610031
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| | |||  |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| |  |||    
T  24609919 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattaggtca-ttggacttatccaacaatcccaagacaagaagagt 24610017  T
Q  196 ctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||| ||||    
T  24610018 ctactcactcatgt 24610031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 25858426 - 25858530
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25858426 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataatattagggtttatggtttgatttgattaggattacgtca-ttagacttatcgaacaatccca 25858524  T
Q  183 agacaa 188  Q
    ||||||    
T  25858525 agacaa 25858530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Original strand, 24177568 - 24177645
Alignment:
Q  136 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  24177568 cttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccatcaatcccaagacaagaagagtctactcacttatgttcatc 24177645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Original strand, 21261 - 21373
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||    
T  21261 tagattagaaattaaggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattagcattacgtta-ttagacttatccaacaatctcaagacaagaagagt 21359  T
Q  196 ctactcactgatgt 209  Q
    ||| ||||| ||||    
T  21360 ctattcactcatgt 21373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 24366142 - 24366246
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | |||  ||| |||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24366142 aaaacggtgaaattatattagaaagtagatttatataaaattaaggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatccca 24366240  T
Q  183 agacaa 188  Q
    ||||||    
T  24366241 agacaa 24366246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15584081 - 15583983
Alignment:
Q  89 gtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  15584081 gtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaatctcaagacaa 15583983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Original strand, 19124141 - 19124286
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| | ||   |||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||| |    
T  19124141 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtggaattagattagaaaataaatttacataaaattagggttcgagacttggtttgattaggattagg 19124240  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19124241 tca-ttagactcattcaacaatcccaagacaa-agaagtctactcact 19124286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 41653450 - 41653580
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||| | | |||  ||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41653450 aaaacggtgaaattagattacaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacatca-ttagacttatccaacaatccca 41653548  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||| || |  | |||||||||| |||| ||||    
T  41653549 agataagaagaatctactcactcatgttcatc 41653580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 214
Target Start/End: Original strand, 30949100 - 30949224
Alignment:
Q  89 gtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||| |||||||||| | |||  ||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  30949100 gtgaaattagattagaaagtagatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaataattccaagacaa 30949198  T
Q  189 tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
     |  |||||||||||| |||| ||||    
T  30949199 gaagagtctactcactcatgttcatc 30949224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Original strand, 24371307 - 24371401
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||||||| ||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24371307 ttacataagattaaggttctaggcttggtttgatagggattacgtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 24371401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22328688 - 22328622
Alignment:
Q  137 ttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22328688 ttggtttgattaggataacgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 22328622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 36129967 - 36130066
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  36129967 ttacataaaattagggtttttggcttggtttgataggaattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaaatctactcactcatgttca 36130064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20852347 - 20852253
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  20852347 ttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaattctactcactcatgt 20852253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 23084642 - 23084682
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccct 41  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23084642 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccct 23084682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Original strand, 23256868 - 23256973
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23256868 tagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttgggttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagt 23256964  T
Q  196 ctactcact 204  Q
    |||||||||    
T  23256965 ctactcact 23256973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23648853 - 23648797
Alignment:
Q  159 atttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  23648853 atttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 23648797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25198604 - 25198569
Alignment:
Q  150 gattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25198604 gattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaga 25198569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 22578215 - 22578286
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22578215 gcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaattctactcactcatgt 22578286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13004707 - 13004608
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  13004707 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgataggaattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaaatctactcactcatgttca 13004610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Original strand, 23614006 - 23614059
Alignment:
Q  161 ttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  23614006 ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatc 23614059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Original strand, 31590354 - 31590480
Alignment:
Q  85 aacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaag 184  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||   ||||||| |||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31590354 aacggtgagattagattagaaaatagatctacataaaattagggttctaggcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaag 31590451  T
Q  185 acaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||| ||||    
T  31590452 acaa-agaaatctgctcactcatgttcatc 31590480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 144)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 48801008 - 48801222
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48801008 aattgatatttgagatgatggattaccaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 48801107  T
Q  101 tagagattagggttacataaga-ttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48801108 tagagattagggttacataagatttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtccac 48801207  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  48801208 tcactcatgttcatc 48801222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21507310 - 21507097
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21507310 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatttatgttaaaacggtgaatttagat 21507211  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21507210 tagagattagggttacataagattagggttaataacctggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21507111  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21507110 cactcatgttcatc 21507097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 33612032 - 33612235
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33612032 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 33612131  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33612132 tagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 33612231  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  33612232 cact 33612235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37100123 - 37100334
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37100123 aattgatatttgagatgatggattaacgattatcaaaccctccaccttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 37100222  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37100223 tagagattagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtatact 37100320  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  37100321 cactcatgttcatc 37100334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9004948 - 9004745
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9004948 aattgataattgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccactgtctgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 9004849  T
Q  101 tagagattagggttacataaga-ttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9004848 tagagattagggttacataagatttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 9004750  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  9004749 tcact 9004745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 648549 - 648752
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  648549 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtatgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 648648  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  648649 tagaaattagggttacataaaattaaggtttaaaacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 648748  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  648749 cact 648752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4313543 - 4313340
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4313543 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagat 4313444  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  4313443 tagaaattagggttacataagattagggttaaaagcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 4313344  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  4313343 cact 4313340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5398058 - 5397844
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5398058 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 5397959  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5397958 tagaaattagggttacataagattaaggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagactcatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 5397859  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5397858 tcactaatgttcatc 5397844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41723026 - 41722825
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723026 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 41722927  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41722926 tagagatcagggttacataagattatggttaataacttagtttgattaggattatgtca-ttagacttatgcaacaatcccaagacaagagaagtctact 41722828  T
Q  201 cac 203  Q
    |||    
T  41722827 cac 41722825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 2325601 - 2325802
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325601 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 2325700  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2325701 tagaaattagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtc-gttagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctact 2325798  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  2325799 cact 2325802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3210483 - 3210692
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3210483 aattgatatttgcgatgattgattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacgatttgataatggttaattcatgttaaaacggttaatttagat 3210582  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3210583 tagagattagtgttacataagattgagggttaatagcttagtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 3210682  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  3210683 tcactcatgt 3210692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16330647 - 16330859
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16330647 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 16330746  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16330747 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 16330845  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  16330846 cactaatgttcatc 16330859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 48340365 - 48340569
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48340365 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 48340464  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48340465 tagagatgagggttacataagattaaagtttaaagcttggtttgattaggattatgttatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 48340564  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  48340565 tcact 48340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 35963989 - 35964190
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35963989 aattgatatttgtgatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaattcagat 35964088  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35964089 tagagattagggttacataagattagagttaa-agcttggtttgattaggattatctca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 35964186  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  35964187 cact 35964190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23293457 - 23293671
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23293457 aattgatatttgagatgatggattaacaatcatcaaaccctccactttcatatccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 23293556  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23293557 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagattggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 23293656  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23293657 tcactcatgttcatc 23293671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12199504 - 12199293
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12199504 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttaataatagttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 12199405  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12199404 tagaaattagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattatgattatgtca-ttatacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 12199307  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12199306 cactcatgttcatc 12199293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4308179 - 4307977
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308179 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatattaaaacggtgaatttagat 4308080  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| || |  ||||||||    
T  4308079 tagaaattagggttacataagattagggttaaaagtttggtttgattaggattatgtcatttatacttatccaataatccccagaaaagaagagtctact 4307980  T
Q  201 cac 203  Q
    |||    
T  4307979 cac 4307977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 15205832 - 15206041
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||     
T  15205832 atatttgagatgatggataaaaaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacagtgaatttagataagaa 15205931  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15205932 attagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaatagaagtctactcact 15206031  T
Q  205 gatgtccatc 214  Q
     |||| ||||    
T  15206032 catgttcatc 15206041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14456 - 14660
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  14456 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 14555  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14556 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcattt-gacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14654  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  14655 cactga 14660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 826583 - 826371
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  826583 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 826484  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  826483 aagaaattagggttacacaagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 826385  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  826384 cactaatgttcatc 826371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 828594 - 828382
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  828594 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 828495  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  828494 aagaaattagggttacacaagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 828396  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  828395 cactaatgttcatc 828382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 4466419 - 4466623
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4466419 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 4466518  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4466519 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4466617  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  4466618 cactga 4466623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8713318 - 8713114
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  8713318 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 8713219  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8713218 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 8713120  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  8713119 cactga 8713114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8718822 - 8718618
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  8718822 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 8718723  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8718722 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 8718624  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  8718623 cactga 8718618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12548070 - 12548282
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12548070 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 12548169  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12548170 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 12548268  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12548269 cactaatgttcatc 12548282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14229713 - 14229917
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  14229713 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 14229812  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14229813 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14229911  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  14229912 cactga 14229917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15916055 - 15916267
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15916055 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15916154  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15916155 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15916253  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  15916254 cactaatgttcatc 15916267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15924364 - 15924576
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15924364 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15924463  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15924464 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15924562  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  15924563 cactaatgttcatc 15924576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18389989 - 18389785
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  18389989 aattgatatttgagatgatggataaaaaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 18389890  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18389889 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 18389791  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  18389790 cactga 18389785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 19014404 - 19014608
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19014404 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 19014503  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19014504 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 19014602  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  19014603 cactga 19014608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13732117 - 13731914
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13732117 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgatcatggttaattcattttaaaacgatgaatttagat 13732018  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||||    
T  13732017 tagagattagggttacataagattatggttaatagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaaatccaagaaaaggagaagtctac 13731919  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  13731918 tcact 13731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9009932 - 9009730
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9009932 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 9009833  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9009832 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 9009734  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  9009733 cact 9009730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17947045 - 17946843
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17947045 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcatttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 17946946  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  17946945 tagaaattagggttacataaaattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaatcccaagacaagaagagtctact 17946847  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  17946846 cact 17946843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Original strand, 538030 - 538226
Alignment:
Q  9 tttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagatt 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  538030 tttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaatt 538129  T
Q  109 agggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  538130 agggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacgagagaagtctactcactga 538226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 544896 - 545100
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  544896 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 544995  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  544996 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacgagagaagtctact 545094  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  545095 cactga 545100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 821570 - 821358
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  821570 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 821471  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  821470 aagaaattagggttacacaagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctatt 821372  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  821371 cactaatgttcatc 821358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3201443 - 3201652
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  3201443 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 3201542  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3201543 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 3201642  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  3201643 tcactcatgt 3201652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 4158437 - 4158641
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4158437 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 4158536  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4158537 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4158635  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  4158636 cactga 4158641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5841000 - 5840800
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||    
T  5841000 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttggat 5840901  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5840900 tagagattagggttacataagattaatgtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaaatctact 5840802  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  5840801 ca 5840800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9578184 - 9577980
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9578184 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 9578085  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  9578084 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctact 9577986  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  9577985 cactga 9577980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15061583 - 15061379
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15061583 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15061484  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15061483 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaaacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15061385  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  15061384 cactga 15061379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15066672 - 15066468
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15066672 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15066573  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15066572 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15066474  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  15066473 cactga 15066468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20109348 - 20109135
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20109348 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacaacgaatttagat 20109249  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20109248 tagagattatagttacataagactagggtcaatagcttgggttgattaggattattttattaagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctact 20109149  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  20109148 cactcatgttcatc 20109135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23204120 - 23203916
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23204120 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23204021  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23204020 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23203922  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  23203921 cactga 23203916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23510247 - 23510043
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23510247 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23510148  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23510147 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23510049  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  23510048 cactga 23510043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23516029 - 23515825
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23516029 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23515930  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23515929 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattagtattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23515831  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  23515830 cactga 23515825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4030338 - 4030137
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4030338 aattgatatttgagatgatggatgaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagat 4030239  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  4030238 tagaaattagggttacataagattagggttca-agcttggtttgattaggattatgtca-ctagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 4030141  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  4030140 cact 4030137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9258391 - 9258600
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9258391 aattgatatttgag--gatggattaacaattatcaaaccctccactttcatttccatagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagct 9258488  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9258489 tatagattagggttacctaagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtctact 9258586  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  9258587 cactcatgttcatc 9258600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9311862 - 9311653
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9311862 aattgatatttgag--gatggattaacaattatcaaaccctccactttcatttccatagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagct 9311765  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9311764 tatagattagggttacctaagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtctact 9311667  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  9311666 cactcatgttcatc 9311653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10205048 - 10204845
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10205048 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccttccactttcgtttttatagtttgataatggttaattcatgttaaatcggtgaatttagat 10204949  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaataga--agtcta 198  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10204948 tagaaactagggttacataagattagggttaa-agcttggtttcattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaatagaagagtcta 10204851  T
Q  199 ctcact 204  Q
    ||||||    
T  10204850 ctcact 10204845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13652314 - 13652100
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  13652314 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 13652215  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13652214 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 13652115  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13652114 tcactcatgttcatc 13652100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18072214 - 18072428
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18072214 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18072313  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     | | |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  18072314 aataaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 18072413  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18072414 tcactcatgttcatc 18072428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35954009 - 35953795
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35954009 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 35953910  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  |||||| |||    
T  35953909 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagagaagaagaagtatac 35953810  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  35953809 tcactaatgttcatc 35953795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15173651 - 15173855
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15173651 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15173750  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     |||  ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15173751 aagaatttagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgccatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 15173850  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  15173851 tcact 15173855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9192836 - 9192649
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9192836 aattgatatttgagatgatggattaacagttatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggtcaattcatgttaaaacgatgaatttagat 9192737  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9192736 tagaaattagggttacgtaagattaatgtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaa 9192649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13658837 - 13658623
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  13658837 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 13658738  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13658737 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 13658638  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13658637 tcactcatgttcatc 13658623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16119095 - 16119309
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  16119095 aattgatatttggaatgatggatgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 16119194  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16119195 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 16119294  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16119295 tcactcatgttcatc 16119309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16154734 - 16154948
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  16154734 aattgatatttggaatgatggatgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 16154833  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16154834 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 16154933  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16154934 tcactcatgttcatc 16154948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30257683 - 30257469
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30257683 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 30257584  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30257583 aagaaattagggttacataagattaaggcttaaagcttggtttgattagaattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 30257484  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  30257483 tcactcatgttcatc 30257469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 45407560 - 45407774
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  45407560 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatggttgatctatgttaaagcggtgaatttagat 45407659  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  45407660 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagaagaagtctac 45407759  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  45407760 tcactaatgttcatc 45407774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19364728 - 19364516
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19364728 aattgatatttgagacgatggataaataattatcaaacccaccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 19364629  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19364628 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 19364530  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
     ||| |||| ||||    
T  19364529 tactaatgttcatc 19364516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16076580 - 16076794
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  16076580 aattaatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaggcggtgaatttagat 16076679  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16076680 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggcttaattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 16076779  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16076780 tcactcatgttcatc 16076794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18274334 - 18274120
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  18274334 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 18274235  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18274234 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 18274135  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18274134 tcactcatgttcatc 18274120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18288549 - 18288335
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  18288549 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 18288450  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18288449 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 18288350  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18288349 tcactcatgttcatc 18288335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 8521916 - 8522091
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521916 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 8522015  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaat 178  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8522016 tagaaactagggttacataaaattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaat 8522091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13674798 - 13674611
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  13674798 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13674699  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13674698 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 13674611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14753061 - 14752874
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  14753061 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 14752962  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  14752961 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 14752874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15176577 - 15176390
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  15176577 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15176478  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  15176477 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 15176390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13435199 - 13434996
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435199 aattgatatttgagatgattgattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctatagtttgatagtggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 13435100  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaataga--agtcta 198  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||  ||||||    
T  13435099 tagaaactagggttacataagattagggttaa-agattggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatctcaagacaagagaagagtcta 13435002  T
Q  199 ctcact 204  Q
    ||||||    
T  13435001 ctcact 13434996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16464883 - 16465097
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  16464883 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagat 16464982  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16464983 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacagtcccaagacaaggagaagtctac 16465082  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16465083 tcactcatgttcatc 16465097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18589003 - 18589217
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18589003 aattgatatttgaaataatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagat 18589102  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18589103 aagaaattagggttacataaggttaaggcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 18589202  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18589203 tcactcatgttcatc 18589217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18592597 - 18592811
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18592597 aattgatatttgaaataatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagat 18592696  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18592697 aagaaattagggttacataaggttaaggcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 18592796  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18592797 tcactcatgttcatc 18592811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18599228 - 18599442
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18599228 aattgatatttgaaataatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagat 18599327  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18599328 aagaaattagggttacataaggttaaggcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 18599427  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18599428 tcactcatgttcatc 18599442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23077026 - 23077240
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  23077026 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 23077125  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23077126 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23077225  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23077226 tcactcatgttcatc 23077240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14551998 - 14551786
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  14551998 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 14551899  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14551898 aagaaattagggttacatgagattaaggtttaaagcttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14551800  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14551799 cactaatgttcatc 14551786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14582219 - 14582022
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14582219 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttaca 14582120  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  14582119 taagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 14582022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16487702 - 16487496
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16487702 aattgatatttgagat-atggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgtaaaaacggtaaatttagat 16487604  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16487603 tagaaactagggttatgtaagattagggttgaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatcccacaatcccaagacaagagaattctact 16487505  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  16487504 cactcatgt 16487496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 48355323 - 48355527
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  48355323 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacagtgaatttagaa 48355422  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48355423 gagaaaatagggttacataagattaaggtttaaagtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 48355522  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  48355523 tcact 48355527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13668120 - 13667933
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  13668120 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13668021  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
      | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13668020 acttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 13667933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 319960 - 319766
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  319960 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 319861  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  319860 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagt 319766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16471409 - 16471623
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  16471409 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagat 16471508  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca-atagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||    
T  16471509 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacagtcccaagacatggagaagtctac 16471608  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16471609 tcactcatgttcatc 16471623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27292268 - 27292054
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  27292268 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaagccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 27292169  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27292168 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 27292069  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27292068 tcactcatgttcatc 27292054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39388120 - 39387906
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||||    
T  39388120 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgacttcagat 39388021  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39388020 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 39387921  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  39387920 tcactcatgttcatc 39387906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14545758 - 14545546
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  14545758 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 14545659  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14545658 aagaaattagggttacatgagattaaggtttaaagcttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcacaagacaagagaagtctact 14545560  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14545559 cactaatgttcatc 14545546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 3376271 - 3376456
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3376271 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 3376369  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3376370 tagaaaatagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaa 3376456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18619060 - 18618873
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |    
T  18619060 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataaggttaag 18618961  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18618960 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 18618873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16533014 - 16532800
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||    
T  16533014 aattgatatttggaatcatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttaaat 16532915  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16532914 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 16532815  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16532814 tcactcatgttcatc 16532800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16632648 - 16632862
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||    
T  16632648 aattgatatttggaatcatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttaaat 16632747  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16632748 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 16632847  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16632848 tcactcatgttcatc 16632862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24058006 - 24057792
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24058006 aattgatatttgggataatggactaacgattatcaaaccctccactttcgcttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 24057907  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24057906 gagaaactagggttacattagattaaggtttaaagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 24057807  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24057806 tcactcatgttcatc 24057792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34390955 - 34390743
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  34390955 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 34390856  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34390855 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttggcttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 34390757  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  34390756 cactcatgttcatc 34390743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 782528 - 782732
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  782528 aattaacatttggaataatggattaacgattaccaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 782627  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  782628 gagaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 782727  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  782728 tcact 782732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12562272 - 12562060
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  12562272 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtaaatttagaa 12562173  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12562172 gagaaactagggttacataatattatggtttaaggctttgcttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 12562074  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12562073 cactcatgttcatc 12562060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22578959 - 22578747
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22578959 aattaacatttggaatgatggattaatgattatcaaaccctccacttttgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 22578860  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22578859 gagaaactagggttacataatattaaggtttaagacttggcttgattagaattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 22578761  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  22578760 cactcatgttcatc 22578747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39271489 - 39271278
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39271489 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttcatgagtttgataattgttaattcatgttgaaacggtgaatttagat 39271391  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||    
T  39271390 aagaaattagggttacataagattagagtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaccaatcccaagacaagaagagtctact 39271292  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  39271291 cactcatgttcatc 39271278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 16097268 - 16097392
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16097268 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccgcagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtaaatttagat 16097367  T
Q  101 tagagattagggttacataagatta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16097368 tagagattagggttacataagatta 16097392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12576129 - 12575927
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  12576129 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaatcccacaactttcgtttctacagtttgataatggttgttccatgttaaaacagtgaatttagat 12576030  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12576029 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaaggagaagtctac 12575930  T
Q  200 tca 202  Q
    |||    
T  12575929 tca 12575927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12567969 - 12567765
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12567969 aattaacatttggaataatggattaacgattctcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 12567870  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  12567869 gagaaactagggttacataatattaaggttgaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaagataagtctac 12567770  T
Q  200 tcact 204  Q
     ||||    
T  12567769 ccact 12567765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48713779 - 48713581
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||   ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48713779 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccattttcgcttcatgagtgtggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagat 48713681  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  48713680 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattacgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaaagagtctact 48713582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4294929 - 4294727
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4294929 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 4294830  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | |||||||| |||| | || |||| |  ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4294829 gagaaactagggttatataatactaaggtttaaggcttaacttgattaggattatgtca-ttagacttatccgacaatcccaagacataagaagtctact 4294731  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  4294730 cact 4294727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15707004 - 15707206
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15707004 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaacccttcactttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 15707103  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| |   ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  15707104 gagaaactagggttacataaaattagggtttaagacttggcttgattaagattatatca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctact 15707202  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  15707203 cact 15707206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 38387910 - 38388112
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  38387910 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaactgtgaatttagaa 38388009  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | || |||||||||| |||| |||| |  |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  38388010 gagaaactatggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattatgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 38388108  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  38388109 cact 38388112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9726002 - 9725873
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9726002 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 9725903  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggtt 130  Q
     ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  9725902 aaggaattagggttacataagattaaggtt 9725873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20624934 - 20624733
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20624934 aattaacatttggaatgacggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 20624835  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| | || | || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20624834 gagaaactagggttacataatattaagattta-aggttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccaaagacataagaagtctact 20624737  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20624736 cact 20624733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20627254 - 20627052
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20627254 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaa 20627155  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     | | | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20627154 aataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctact 20627056  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20627055 cact 20627052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20631145 - 20630943
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20631145 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaa 20631046  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     | | | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20631045 aataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctact 20630947  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20630946 cact 20630943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20635753 - 20635551
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20635753 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaa 20635654  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     | | | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20635653 aataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctact 20635555  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20635554 cact 20635551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20637625 - 20637423
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20637625 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgataatatttaatccaagttaaaacggtgaatttagaa 20637526  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     | | | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20637525 aataaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagatttatccaacaatccaaagacataagaagtctact 20637427  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20637426 cact 20637423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 25180929 - 25181028
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25180929 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25181028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 14941495 - 14941695
Alignment:
Q  2 attaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagatt 101  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  14941495 attaatatttgggataatggattagcgattatcaaaccctctactttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaa-ttagaag 14941593  T
Q  102 agagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactc 201  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14941594 agaaactagggttacataaagttagggtttaaggcttggcttgatttagattatatca-ttagacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctactc 14941692  T
Q  202 act 204  Q
    |||    
T  14941693 act 14941695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 15369088 - 15369288
Alignment:
Q  2 attaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagatt 101  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  15369088 attaatatttgggataatggattagcgattatcaaaccctctactttcgtttccacaatttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaa-ttagaag 15369186  T
Q  102 agagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactc 201  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||| |  |||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15369187 agaaactagggttacataaagttagggtttaaggcttggcttgattttgattatatca-ttagacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctactc 15369285  T
Q  202 act 204  Q
    |||    
T  15369286 act 15369288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12661871 - 12661747
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12661871 aattgatatttgaaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtgaaagcggtgaatttagat 12661772  T
Q  101 tagagattagggttacataagatta 125  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  12661771 aagaaattagggttacataagatta 12661747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 11954001 - 11954100
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  11954001 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 11954100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16525846 - 16525736
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||    
T  16525846 aattgatatttggaatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatacatgttaaagcggtgaatttaaat 16525747  T
Q  101 tagagattagg 111  Q
     ||| ||||||    
T  16525746 aagaaattagg 16525736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1614210 - 1614093
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||    
T  1614210 tagattagaaagtaaggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaattccaagacaagaagagt 1614112  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  1614111 ctactcactcatgttcatc 1614093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16497982 - 16497873
Alignment:
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  16497982 attagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaggagaaatctactcact 16497883  T
Q  205 gatgtccatc 214  Q
     |||| ||||    
T  16497882 catgttcatc 16497873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 21005362 - 21005482
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21005362 aaaacggggaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcatggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccca 21005460  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  21005461 agacaagaagagtctactcact 21005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 8780203 - 8780389
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaa-acggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| | |||| |||   |||||| |||| ||||||||||  |||| | |||||| |||||    
T  8780203 aattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctccgcgttcgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaatatggtgaaattaga 8780301  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8780302 ttagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaa 8780389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8787042 - 8787244
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||| |||| |||   |||||| |||| ||||||||||  ||||| ||| ||| |||||    
T  8787042 aatttatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccgtccacattcgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaacggagaaattaga 8787140  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    ||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||    
T  8787141 ttagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcccaatacaagaagagtctac 8787239  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  8787240 tcact 8787244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Original strand, 4790779 - 4790855
Alignment:
Q  134 agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  4790779 agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaaaaagaagtctactcactcatgt 4790855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9585477 - 9585406
Alignment:
Q  134 agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9585477 agcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaataatcccaagacaagagaagtctactcactga 9585406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Original strand, 6257348 - 6257482
Alignment:
Q  70 gttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagactt 168  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  6257348 gttaattcattttaaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggatttcgtca-ttagactt 6257446  T
Q  169 atcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  6257447 atccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 6257482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 368357 - 368229
Alignment:
Q  85 aacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaag 184  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||    
T  368357 aacggtgaatttagaagagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttatacttattcaacaattccaag 368259  T
Q  185 acaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  368258 acataagaagtctactcactcatgttcatc 368229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33609975 - 33609871
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| || ||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33609975 aaaacggtgaaatttgattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccca 33609877  T
Q  183 agacaa 188  Q
    ||||||    
T  33609876 agacaa 33609871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 9193772 - 9193974
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| | |||| |||   |||||| |||| ||||||||||  ||||| || |||| |||||    
T  9193772 aattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctccgcgttcgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaacgatgaaattaga 9193870  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    ||||| | ||   ||| |||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||    
T  9193871 ttagaaagtatatttatataaaattagagtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt-agacttacccaacaatcccaagacaagaagagtctac 9193969  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  9193970 tcact 9193974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9562267 - 9562066
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaac-ggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| | |||| |||   |||||| |||| ||||||||||  |||||  |||||| |||||    
T  9562267 aattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctccgcgttcgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaatggtgaaattaga 9562169  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    ||||| | |||  ||  |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||    
T  9562168 ttagaaagtagatttt-ataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcacaagacaagaagagtctac 9562071  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  9562070 tcact 9562066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Original strand, 16897112 - 16897220
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttgg-tttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaag 194  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||    
T  16897112 tagattaaaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggttttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatccaaagacaagaagag 16897210  T
Q  195 tctactcact 204  Q
    ||||||||||    
T  16897211 tctactcact 16897220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Original strand, 9264240 - 9264323
Alignment:
Q  121 gattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcact 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  9264240 gattagggttaatagcttggtttgatgtggattatgtca-ttagacttatccaacaatcctaagataaggagaagtctactcact 9264323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39388944 - 39388855
Alignment:
Q  124 tagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  39388944 tagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatc 39388855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 6712311 - 6712410
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  6712311 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgaataggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttca 6712408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4090951 - 4090821
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||   ||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  4090951 aaaacggtgaaattagattataaagtacatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccaacaatccaa 4090853  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  4090852 agacaagaagagtctactcactcatgttcatc 4090821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Original strand, 4256427 - 4256583
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaac-ggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| | | |  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |    
T  4256427 agtttgatacttgttaattcattataaaaatggtgaaattagattagaaagtggatttacataaaattagggtttgaggcttggtttgattaggattagg 4256526  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  4256527 ttatt-agactcatccaacaatcccaaaacaagaagagtctactcactcatgttcatc 4256583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 4460651 - 4460719
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4460651 gcttggtttgattaggattaggtcatt-agactcatgcaacaatcccaagacaagaaaagtctactcact 4460719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 23292499 - 23292548
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcg 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23292499 aattgatatttgagatgatggattaacaatcatcaaaccctccactttcg 23292548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 17206262 - 17206351
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17206262 ttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattatgtca-ttagactcatccaacaatcccaagataa-agaagtctactcact 17206351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46274335 - 46274225
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttgg-tttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaag 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||         ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||    
T  46274335 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggttttgattagga---------ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagag 46274245  T
Q  195 tctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  46274244 tctactcactcatgttcatc 46274225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1462782 - 1462720
Alignment:
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatt 161  Q
    |||||| |||||| | |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1462782 attagaaattaggttgacataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattatgtcatt 1462720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17911806 - 17911717
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  17911806 ttacataaaattagggttcgaagcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcac 17911717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38877626 - 38877532
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38877626 ttacataagattagggttcgagtcttggtttgatagggattaggtca-ttagactcatccaacaatctcaagacaa-agaagtctactcactcatgt 38877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Original strand, 4316873 - 4316950
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||    
T  4316873 gcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaaacaaagtctactcactcatgttcatc 4316950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 4983015 - 4983104
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4983015 ttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-ataagtctactcact 4983104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13411445 - 13411402
Alignment:
Q  159 atttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactca 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13411445 atttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactca 13411402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Original strand, 19515237 - 19515327
Alignment:
Q  123 ttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| || |  |||||||| ||| |||| ||||    
T  19515237 ttagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaagaatcccaagagaagaagagtctactaactcatgttcatc 19515327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 30063799 - 30063922
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||  ||||||||||||||||||    |||||| |||||  |||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  30063799 aaaacggtgaaat-agattagaaaatagatttacataagattagggttcgaggcttggcttgatagggattaggtca-ttagactcattcaacaatccca 30063896  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  30063897 agacaa-agaagtcaactcactcatgt 30063922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15523249 - 15523155
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||||||| ||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  15523249 ttacataagattacggttctaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agacgcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctacttactcatgt 15523155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 106)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20263746 - 20263533
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20263746 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgattcatgttaaaacggtaaatttagat 20263647  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20263646 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20263547  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  20263546 cactcatgttcatc 20263533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21050375 - 21050162
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21050375 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcttttccacagtttgataatggttgattcatgttaaaacggtaaatttagat 21050276  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21050275 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21050176  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21050175 cactcatgttcatc 21050162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18230403 - 18230611
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18230403 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagat 18230502  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18230503 tagagattagggttacataagattagggtcaataacttggttttattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 18230602  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  18230603 cactcatgt 18230611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18264149 - 18264351
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18264149 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcgaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 18264248  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18264249 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctgct 18264347  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  18264348 cact 18264351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45467026 - 45466812
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45467026 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccactgtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 45466927  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45466926 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 45466827  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  45466826 tcactcatgttcatc 45466812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33632759 - 33632545
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33632759 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 33632660  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33632659 tagaaattagggttatataagattaaggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 33632560  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  33632559 tcactgatgttcatc 33632545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22831474 - 22831261
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831474 aattgataattgagatgatggattaacaattatcaaaccctccatattcgtttccacggtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 22831375  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22831374 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaactatcccaagacaagagaagtctact 22831275  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  22831274 cactcatgttcatc 22831261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23880150 - 23879942
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23880150 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacaatgaatttagat 23880051  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23880050 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttaattaggataatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23879951  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  23879950 cactcatgt 23879942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24034992 - 24034791
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034992 atatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcatttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 24034893  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24034892 attagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatggca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactc 24034795  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  24034794 atgt 24034791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Original strand, 39730493 - 39730664
Alignment:
Q  33 tcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaa 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39730493 tcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggtcaa 39730592  T
Q  133 tagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39730593 tagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcact 39730664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 14878053 - 14878253
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14878053 aattgatatttgagatgatggattaacaattattaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 14878152  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  14878153 tagaaattatggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtccact 14878250  T
Q  201 cac 203  Q
    |||    
T  14878251 cac 14878253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26826826 - 26826612
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26826826 aattgatatttgagatgatgaattaacaatcatcaaaccctccaatttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 26826727  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26826726 tagaaattagggttacataagattaaggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctac 26826627  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  26826626 tcactaatgttcatc 26826612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 38349671 - 38349885
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38349671 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgattaattcatgttaaagcggtgaatttagat 38349770  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  38349771 tagagattagggttacataagattaaggtttaaaatttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaagaagaagtctac 38349870  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  38349871 tcactcatgttcatc 38349885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19997716 - 19997504
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19997716 aattgatatttgagatgatggacgaacaagtatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 19997617  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19997616 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 19997518  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  19997517 cactaatgttcatc 19997504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17127167 - 17126956
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17127167 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgcttcaacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 17127068  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17127067 tagaaaccagggttacataagattatggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 17126970  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  17126969 cactcatgttcatc 17126956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21842789 - 21843003
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21842789 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21842888  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21842889 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagtagaagtctac 21842988  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21842989 tcactaatgttcatc 21843003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21103393 - 21103597
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21103393 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21103492  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21103493 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21103591  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  21103592 cactga 21103597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22370880 - 22370676
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22370880 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22370781  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22370780 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 22370682  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  22370681 cactga 22370676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25751464 - 25751676
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25751464 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 25751563  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25751564 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 25751662  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  25751663 cactaatgttcatc 25751676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35996416 - 35996212
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  35996416 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 35996317  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35996316 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 35996218  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  35996217 cactga 35996212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18399601 - 18399393
Alignment:
Q  7 tatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaga 106  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18399601 tatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagattagaga 18399502  T
Q  107 ttagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcactg 205  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||     
T  18399501 ttagagttacataagattaaggtttaaagctttgtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaaagagaagtctactcactc 18399402  T
Q  206 atgtccatc 214  Q
    |||| ||||    
T  18399401 atgttcatc 18399393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20043891 - 20044093
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20043891 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20043990  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20043991 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20044089  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20044090 cact 20044093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19768475 - 19768261
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19768475 aattgatatttgagatgatggataaataattatcaaaccctctactatcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagat 19768376  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19768375 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcttttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 19768276  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19768275 tcactaatgttcatc 19768261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21858600 - 21858814
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21858600 aattgatatttgagatgatggataaacagttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21858699  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21858700 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 21858799  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21858800 tcactaatgttcatc 21858814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1685987 - 1685783
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  1685987 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataattgtttatccatgttaaagcggtgaatttagat 1685888  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1685887 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 1685789  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  1685788 cactga 1685783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21105435 - 21105639
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21105435 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21105534  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21105535 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21105633  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  21105634 cactga 21105639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21945176 - 21945388
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21945176 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21945275  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21945276 aaggaattagggttacataagattaaggttgaaagcctagtttgattaggattatgtca-ttagacttatcaaacaatcccaagacaagagaagtctact 21945374  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21945375 cactaatgttcatc 21945388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22818569 - 22818358
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22818569 aattgatatttgagatgatggattaacaattattaaaccctccactttcgttttcacagtttgataattgttaattcatgttaaaacaatgaatttagat 22818470  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  22818469 tagaaattagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattatgattatgtca-ttagatttatccaacaatcccaagacaagagaagtctaca 22818372  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  22818371 cactcatgttcatc 22818358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14351402 - 14351611
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaattta--- 97  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||       
T  14351402 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaatcagtgaatttagat 14351501  T
Q  98 ----gattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaa 193  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14351502 tttagattagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaa 14351600  T
Q  194 gtctactcact 204  Q
    |||||||||||    
T  14351601 gtctactcact 14351611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22285296 - 22285101
Alignment:
Q  13 agatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattaggg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22285296 agatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagattagaaattaggg 22285197  T
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  22285196 ttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgt 22285101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20038236 - 20038438
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  20038236 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcgatgaatttagat 20038335  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20038336 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20038434  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20038435 cact 20038438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23779736 - 23779549
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23779736 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaggcggtgaatttagattagagattagggttacataagattaag 23779637  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  23779636 gtttaaagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatc 23779549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29325633 - 29325431
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||    
T  29325633 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaagtcagat 29325534  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29325533 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 29325435  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  29325434 cact 29325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 6570376 - 6570548
Alignment:
Q  40 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6570376 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggttaa-agcttg 6570474  T
Q  140 gtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6570475 gtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatc 6570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21821684 - 21821470
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21821684 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 21821585  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21821584 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 21821485  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21821484 tcactcatgttcatc 21821470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23912411 - 23912197
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23912411 aattgatatttggaatgatggacaaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagat 23912312  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23912311 aagaaattagggttacataagattagggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23912212  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23912211 tcactcatgttcatc 23912197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27537781 - 27537567
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27537781 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 27537682  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27537681 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 27537582  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27537581 tcactcatgttcatc 27537567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21939241 - 21939453
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21939241 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgttaaagcggtgaatttagat 21939340  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21939341 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcctggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21939439  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21939440 cactaatgttcatc 21939453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21098039 - 21098253
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  21098039 aattgatatttggaatgatggacaaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagat 21098138  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21098139 aagaaattagggttacacaagattagggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 21098238  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21098239 tcactcatgttcatc 21098253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23904556 - 23904342
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23904556 aattgatatttggaatgatggacaaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagat 23904457  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23904456 aagaaattagggttacacaagattagggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23904357  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23904356 tcactcatgttcatc 23904342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25228962 - 25228748
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  25228962 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagat 25228863  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25228862 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 25228763  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25228762 tcactcatgttcatc 25228748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 11351280 - 11351484
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||    
T  11351280 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcagtgaattttgat 11351379  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11351380 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttcattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 11351478  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  11351479 cactga 11351484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Original strand, 18273213 - 18273364
Alignment:
Q  52 ttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattagga 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273213 ttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattagga 18273312  T
Q  152 ttatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18273313 ttacgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctgctcact 18273364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15759892 - 15759690
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15759892 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccattttcgcttctacagttcgataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagat 15759793  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  15759792 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttagccaacaatcccaagacaagaagagtctact 15759694  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  15759693 cact 15759690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17613513 - 17613310
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  17613513 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 17613414  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  17613413 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggttcaattaggattatgtcatttaaacttatccagcaatcccaagacaagagaagtctact 17613314  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  17613313 cact 17613310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17621695 - 17621492
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  17621695 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 17621596  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  | | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  17621595 aagaaattagggttacataagattaaagcttagattttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccagcaatcccaagacaagataagtctact 17621496  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  17621495 cact 17621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18162321 - 18162127
Alignment:
Q  8 atttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt--aaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |  || |||||||||||||     
T  18162321 atttgagaagatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatataggaatatcgtaaatttagattagaa 18162222  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18162221 attagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 18162127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20836425 - 20836211
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20836425 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20836326  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20836325 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 20836226  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20836225 tcactcatgttcatc 20836211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21831966 - 21831752
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21831966 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 21831867  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  21831866 aagaaattagggttacgtaagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaaggagaagtctac 21831767  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21831766 tcactcatgttcatc 21831752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22098922 - 22099136
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  22098922 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgataaaacggtgaatttagat 22099021  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22099022 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggatcatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 22099121  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22099122 tcactcatgttcatc 22099136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9318163 - 9317967
Alignment:
Q  7 tatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaga 106  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9318163 tatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaa 9318064  T
Q  107 ttagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
     ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||    
T  9318063 ctagggttacataagattaggggttaaatcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaatataagaagagtctactcact 9317967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20003072 - 20002860
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||    
T  20003072 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagttcgataatggttgatctatgttaaagcgatgaatttagat 20002973  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20002972 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttaaacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20002874  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  20002873 cactaatgttcatc 20002860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21956246 - 21956037
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  21956246 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagat 21956147  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21956146 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 21956047  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  21956046 tcactcatgt 21956037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 42418275 - 42418487
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42418275 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 42418374  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  42418375 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaaacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaaccccaagacaagaagagtctact 42418473  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  42418474 cacttatgttcatc 42418487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 8328785 - 8328972
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8328785 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 8328884  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  8328885 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 8328972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20713405 - 20713218
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20713405 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20713306  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20713305 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaa 20713218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18821588 - 18821802
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  18821588 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggcgaattcagat 18821687  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18821688 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaaggagaagtctac 18821787  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18821788 tcactcatgttcatc 18821802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19360227 - 19360013
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19360227 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 19360128  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||| ||||| |||| || | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19360127 aagaaactagggttgcataaaattaaggcttagaacttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 19360028  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19360027 tcactcatgttcatc 19360013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8308761 - 8308574
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  8308761 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 8308662  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  8308661 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 8308574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 8322119 - 8322306
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8322119 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 8322218  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  8322219 gcttagggcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 8322306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21383034 - 21382847
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  21383034 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 21382935  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21382934 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 21382847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21950444 - 21950230
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  21950444 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagat 21950345  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||| |||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21950344 aagaaatttgggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 21950245  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21950244 tcactcatgttcatc 21950230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22032822 - 22033036
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  22032822 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaacctccactttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgtttaagcggtgaatttagat 22032921  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22032922 aagaaattagggttacataagattaaggctgagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 22033021  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22033022 tcactcatgttcatc 22033036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 40952009 - 40952223
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||    
T  40952009 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcgacgaatttagat 40952108  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  40952109 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaaggagaagtctac 40952208  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  40952209 tcactcatgttcatc 40952223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8315405 - 8315222
Alignment:
Q  32 atcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggtta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| || |     
T  8315405 atcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaaggctt 8315306  T
Q  132 atagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  8315305 agggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 8315222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22039424 - 22039638
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  22039424 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 22039523  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22039524 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattagcattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 22039623  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22039624 tcactcatgttcatc 22039638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22093552 - 22093338
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  22093552 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggcgaattcagat 22093453  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||    
T  22093452 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggactatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaattctac 22093353  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22093352 tcactcatgttcatc 22093338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22103341 - 22103127
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  22103341 aattgatatttggaataatggataaacaatgatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggcgaattcagat 22103242  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22103241 aagaaattagagttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 22103142  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22103141 tcactcatgttcatc 22103127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25397264 - 25397078
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25397264 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttttgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagat 25397165  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||    
T  25397164 tagaaattagggttagataaaattagggtttaaaacttcgtttgattaggattatgtca-ttagacatatccaaaaatctcaagacaa 25397078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16418192 - 16418406
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16418192 aattgatatttgagatcatggataaacaattatcaaatcctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 16418291  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| || | | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16418292 aagaaactagggttacataaaattaaggcttagagattggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 16418391  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16418392 tcactcatgttcatc 16418406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43836052 - 43836247
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43836052 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 43836151  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||| | |||                 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43836152 tagaaattggagtt-----------------aaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 43836233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23503461 - 23503265
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  23503461 atatctgagatgatgaattaacaattatcaaaccttccattttcgcttctacagtttgataatg-ttaattcatgttaaaacaatgaatttagattagaa 23503363  T
Q  106 attagggttacataagatta-gggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23503362 attagggttaaataaaattaagggttaa-agtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 23503265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14821519 - 14821307
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14821519 aattaacatttggaataatggattaacgattgtcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 14821420  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  14821419 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 14821321  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14821320 cactcatgttcatc 14821307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37653114 - 37652930
Alignment:
Q  29 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaggg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  37653114 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttaaaagagaaattagggttacataatattaagg 37653015  T
Q  129 ttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    || |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  37653014 tttaatgcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaattccaagacataagaagtctactcactcatgttcatc 37652930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17515560 - 17515765
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17515560 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccacttttgttttcacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 17515659  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtcta 198  Q
     ||| | ||||| |||||||||||| |||| |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17515660 gagaaactagggctacataagattaaggtttaaggttaggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtcta 17515759  T
Q  199 ctcact 204  Q
    ||||||    
T  17515760 ctcact 17515765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6280081 - 6279899
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6280081 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctatagtttggtaattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 6279983  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaag 184  Q
    |||| | ||   ||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6279982 tagaaagtaaatttatataaaattagggttcaaggcttggtttgattagggttatgtcatttagacttacccaacaatcccaag 6279899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17503945 - 17504147
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17503945 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 17504044  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  ||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  17504045 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaagattatg-caattagacttgtccaacaatcccaagacataagaagtctact 17504143  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  17504144 cact 17504147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 206
Target Start/End: Original strand, 11346308 - 11346445
Alignment:
Q  68 tggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagact 167  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11346308 tggttgatccatgttaaagcagtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttcattaggattatgtca-ttagact 11346406  T
Q  168 tatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11346407 tatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactga 11346445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21037921 - 21037797
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  21037921 aatttatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 21037822  T
Q  101 tagagattagggttacataagatta 125  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  21037821 aagaaattagggttacataagatta 21037797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26013246 - 26013103
Alignment:
Q  60 tttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca 159  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |   |||  |||||||||||||||||||    
T  26013246 tttggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataaaattagggtttaagacttcatttgattaggattatgtca 26013147  T
Q  160 tttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26013146 -ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 26013103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 1302069 - 1302266
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattc--atgttaaaacggtgaatttagattagagattagggtta 115  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |  ||||| |||| |||||||||||  ||| | ||||||||    
T  1302069 atggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacattttgatgatatttaatccaaatgttgaaacagtgaatttagaagagaaactagggtta 1302168  T
Q  116 cataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| |||| |  |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  1302169 cataatattaaggtttaaggcttgacttgattaagattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatc 1302266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1693362 - 1693244
Alignment:
Q  97 agattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagt 195  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  1693362 agataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagt 1693263  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  1693262 ctactcactcatgttcatc 1693244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22854206 - 22854127
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22854206 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactgatgttcatc 22854127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22364371 - 22364280
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtga 92  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  22364371 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtga 22364280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 214
Target Start/End: Original strand, 24039258 - 24039357
Alignment:
Q  116 cataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24039258 cataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 24039357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23455820 - 23455703
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||    
T  23455820 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagctcggtttgactaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcctaagacaagaagagt 23455722  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  23455721 ctactcactcatgttcatc 23455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 22029862 - 22029943
Alignment:
Q  134 agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22029862 agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatc 22029943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 204
Target Start/End: Original strand, 23193702 - 23193898
Alignment:
Q  8 atttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa-aacggtgaatttagattagaga 106  Q
    ||||||||||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  23193702 atttgagatgatgaattaacaaata-ctaaccctccactttcgcttcatgagtttgatatttgttaattcattataacaacggtgaaattagattagaaa 23193800  T
Q  107 ttagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
     |||  ||| |||| |||| |||| |  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  23193801 gtagatttatataaaattaaggttcaaggcttgatttgattaaggttatgtcatttagacttacccaacaatcccgagacaagaagagtctactcact 23193898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 1990245 - 1990456
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||   |||| |||   |||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  1990245 aattgatatttgagatgatgaattaacaattactaaaccctccgtgttcgcttctt-agtttggtaattgttaattcattataaaaacggtgaaattaga 1990343  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    ||||| | ||   ||| |||| |||| |||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||    
T  1990344 ttagaaagtatatttatataaaattaaggtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccaataatcccaagacaagaagagtctac 1990442  T
Q  200 tcactgatgtccat 213  Q
    ||||| | ||||||    
T  1990443 tcactaacgtccat 1990456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 14161973 - 14162092
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  14161973 aaaacggtgaaattagattagaaattagatttacataaaattagggttcgatgcttggtttgatcaggattaggtca-ttagactcatccaacaatccaa 14162071  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  14162072 agacaa-agaagtctactcact 14162092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21319674 - 21319544
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  21319674 aaaacggtgaatttagagtagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaagtca-ttagacttgtccaagaatccca 21319576  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  21319575 agacaagaagagtctactcactcatgttcatc 21319544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21140000 - 21139788
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttaga 99  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | |||| ||    |||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  21140000 aattgatattttagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccgcattcgctttatgagtttggtaattgttaattcattataaaaacggtgaaattaga 21139902  T
Q  100 ttagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    ||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||| |  |||||||    
T  21139901 ttagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttagtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaaaaatctcaagacaagaagagtctac 21139803  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21139802 tcactcatgttcatc 21139788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 188
Target Start/End: Original strand, 23221300 - 23221453
Alignment:
Q  36 aaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaata 134  Q
    ||||||||||||||| ||    ||||||||| | ||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||| |||||  | | |||| | ||||||| |      
T  23221300 aaccctccactttcgctttatgagtttgatatttgttaattcattataacatcggtgaaattagattagaaattagattcatataaaactagggttcaag 23221399  T
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  23221400 gcttggtttgattagggttatgtcatttagacttacccagcaatcccaagacaa 23221453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Original strand, 19792041 - 19792185
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaac-ggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| | |||  |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |    
T  19792041 agtttgatacttgttaattcattataaaaatggtgaaattagattagaaagtagttttacataaaattagggttcaatgcttagtttgattaggattagg 19792140  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||| ||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19792141 tca-ttagattcatccaacaatcccaagaca--agaagtctactcact 19792185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 21328470 - 21328520
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgt 51  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21328470 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgt 21328520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24342310 - 24342185
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | |||  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  24342310 aaaacggtgaaattaaattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaggtca-ttaaacttatccaacaattcca 24342212  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  24342211 agacaagaagagtctactcacttatgt 24342185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24967505 - 24967385
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  24967505 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattgcgtca-ttagacttatccaacaatctca 24967407  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  24967406 agacaagaagagtctactcact 24967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29003829 - 29003753
Alignment:
Q  137 ttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| |||| ||||    
T  29003829 ttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatcccaagataagaagagtctactcactcatgttcatc 29003753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15634523 - 15634430
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15634523 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatcaaataatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 15634430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5579258 - 5579188
Alignment:
Q  143 tgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  5579258 tgattaggattatgtcatt-agatttatccaacaatcctaagacatgagaagtctactcactcatgttcatc 5579188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18008334 - 18008262
Alignment:
Q  136 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  18008334 cttggtttgattaggattaggtca-ttagacttatacaacaatcccaaaacaagaagagtctactcactcatgt 18008262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26854267 - 26854188
Alignment:
Q  136 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaataga--agtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||| ||||    
T  26854267 cttggtttgattaggattaggtca-ttagactcatccaacaatcccaagacacaagaagagtctactcactcatgttcatc 26854188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15636296 - 15636203
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15636296 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaataatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 15636203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22904846 - 22904748
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||| | |||||| | |||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  22904846 aaaacggtgaatt-atattagaaaatagatttacataagattagggttcaaggcttggtttgatagggattaggtca-ttagactcatccaacaatccca 22904749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 203
Target Start/End: Original strand, 31469553 - 31469619
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31469553 gcttggtttgaataggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctagtcac 31469619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 204
Target Start/End: Original strand, 18572164 - 18572271
Alignment:
Q  95 ttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaag 194  Q
    |||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| || || |||||||||||||||||| |||||      
T  18572164 ttagattagaaaatagatttacacaagattagggttctatgcttggtttgatagggattaggtcatt-aggctcatcaaacaatcccaagac-atagaga 18572261  T
Q  195 tctactcact 204  Q
    ||||||||||    
T  18572262 tctactcact 18572271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17484168 - 17484381
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17484168 aattgatatttgggatgatggatcaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagaa 17484267  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17484268 tagagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 17484367  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  17484368 cactcatgttcatc 17484381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25146576 - 25146362
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25146576 aattgatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggtttattcatgttaaagcggtgaatttagat 25146477  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25146476 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 25146377  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25146376 tcactcatgttcatc 25146362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16952226 - 16952023
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16952226 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 16952127  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16952126 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaacaagagaagtctact 16952027  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  16952026 cact 16952023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3355585 - 3355381
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3355585 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 3355486  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  3355485 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaagaagaagtctac 3355386  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  3355385 tcact 3355381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16393004 - 16392791
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16393004 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaaattagat 16392905  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  16392904 tagagattagggttacataagactagggttaataacttgatttgattaggattatgtcattaaaacttatccaacaatcccaagagaaaagaagtctact 16392805  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  16392804 cactcatgttcatc 16392791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18287317 - 18287113
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18287317 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagttagataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttaaat 18287218  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18287217 tagagattatggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 18287118  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  18287117 tcact 18287113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14653243 - 14653445
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14653243 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 14653342  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14653343 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14653441  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  14653442 cact 14653445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9945271 - 9945059
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9945271 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaatcctccactttcatttccacggtttgataatgattaattcatgttgaaacggtgaatttagat 9945172  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9945171 tagaaattagggttacataagattagggcttagagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaatagaagtctact 9945073  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  9945072 cactcatgttcatc 9945059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16217587 - 16217801
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16217587 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 16217686  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16217687 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagattggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 16217786  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16217787 tcactcatgttcatc 16217801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3392274 - 3392070
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3392274 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 3392175  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3392174 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcctggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3392076  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  3392075 cactga 3392070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18242528 - 18242314
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18242528 aattgatattttagatgatggacgaacaattataaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 18242429  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  18242428 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaggcaaagagaagtctac 18242329  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18242328 tcactcatgttcatc 18242314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3371949 - 3371737
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  3371949 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 3371850  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3371849 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3371751  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  3371750 cactaatgttcatc 3371737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10631698 - 10631494
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10631698 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 10631599  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10631598 aagaaattagggttacataaaattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 10631500  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  10631499 cactga 10631494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 39043246 - 39043458
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39043246 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaatccctccactttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 39043345  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    || | | ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39043346 tataaactagggttacgtaagattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccaaagacaagagaagtctact 39043444  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  39043445 cactcatgttcatc 39043458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12845238 - 12845034
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12845238 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 12845139  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  12845138 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 12845039  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  12845038 tcact 12845034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18984344 - 18984130
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18984344 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18984245  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  18984244 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 18984145  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18984144 tcactcatgttcatc 18984130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3419387 - 3419175
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  3419387 aattgatatttgggatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatctatgttaaagcggtgaatttagat 3419288  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3419287 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3419189  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  3419188 cactaatgttcatc 3419175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5717718 - 5717514
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  5717718 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 5717619  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5717618 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 5717520  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  5717519 cactga 5717514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7197554 - 7197342
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7197554 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttcaaacggtgaatttagat 7197455  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  7197454 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattaagtca-ttagaattatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 7197356  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  7197355 cactcatgttcatc 7197342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18079010 - 18078806
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18079010 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18078911  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18078910 aaggaattagggttagataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 18078812  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  18078811 cactga 18078806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18080712 - 18080916
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18080712 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18080811  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     |   ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18080812 aacgaattagggttacataagattagggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 18080910  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  18080911 cactga 18080916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26811454 - 26811250
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  26811454 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 26811355  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26811354 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 26811256  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  26811255 cactga 26811250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7897278 - 7897482
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  7897278 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 7897377  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7897378 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaagaagaagtctac 7897477  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  7897478 tcact 7897482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13622622 - 13622421
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13622622 aattgatatttgagatgatgatttaacaattatcaaaccttcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgttgaatttagat 13622523  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13622522 tagaaattagggttacataagattaaggttaa-ggcttggtttgattaggattttgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 13622425  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  13622424 cact 13622421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 56579810 - 56580024
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  56579810 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatgattgatccatgttaaagcggtgaatttagat 56579909  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  56579910 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 56580009  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  56580010 tcactcatgttcatc 56580024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10559216 - 10559019
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10559216 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacagtgaatttagataagaaattagggttaca 10559117  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10559116 taagattaaggcttatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 10559019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 36654113 - 36654317
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  36654113 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 36654212  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36654213 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcatggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 36654311  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  36654312 cactga 36654317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6518702 - 6518500
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  6518702 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaggggtgaatttagat 6518603  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6518602 aagaaattagggttatatgagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 6518504  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  6518503 cact 6518500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14690592 - 14690794
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  14690592 aattgatatttaagatgatggacgaacagttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttagtccatgttaaagcggtgaatttagat 14690691  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14690692 tagagatcagggttacaaaagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14690790  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  14690791 cact 14690794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15123996 - 15124210
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15123996 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttacacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15124095  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  15124096 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggaaaagtctac 15124195  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15124196 tcactcatgttcatc 15124210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16683691 - 16683479
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16683691 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 16683592  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16683591 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 16683493  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  16683492 cactaatgttcatc 16683479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 55798667 - 55798454
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  55798667 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 55798568  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  55798567 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 55798468  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  55798467 cactaatgttcatc 55798454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11888741 - 11888942
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11888741 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccattgtcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaa-ttagat 11888839  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11888840 tagaaattaggattacataagaacagggttaaaggcttggcttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 11888938  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  11888939 cact 11888942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7439 - 7653
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  7439 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 7538  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7539 aagaaattagggttgcataagattaaggcttagagcttggattgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 7638  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7639 tcactcatgttcatc 7653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10733087 - 10732873
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10733087 aattgatatttggaatgatggataaacaattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 10732988  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10732987 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 10732888  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10732887 tcactcatgttcatc 10732873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10946856 - 10946642
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10946856 aattgatatttggaatgatggataaacaattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 10946757  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10946756 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 10946657  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10946656 tcactcatgttcatc 10946642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15248649 - 15248435
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  15248649 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 15248550  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15248549 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 15248450  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15248449 tcactcatgttcatc 15248435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18563773 - 18563559
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  18563773 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 18563674  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18563673 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatctaacaatcccaagacaaggagaagtctac 18563574  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18563573 tcactcatgttcatc 18563559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10637927 - 10637730
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10637927 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataacggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttaca 10637828  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10637827 taagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 10637730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10651318 - 10651121
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10651318 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataacggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttaca 10651219  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10651218 taagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 10651121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21420889 - 21420692
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  21420889 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttaca 21420790  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21420789 taagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 21420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 42708986 - 42709199
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  42708986 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 42709085  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42709086 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttgccttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 42709185  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  42709186 cactaatgttcatc 42709199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15305567 - 15305363
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  15305567 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaattcagat 15305468  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15305467 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 15305368  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  15305367 tcact 15305363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 3080 - 3267
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  3080 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 3179  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  3180 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10684946 - 10684759
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10684946 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10684847  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10684846 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 10684759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10898586 - 10898399
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10898586 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10898487  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10898486 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 10898399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 11495886 - 11496073
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  11495886 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 11495985  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11495986 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 11496073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13823856 - 13823669
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  13823856 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13823757  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13823756 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 13823669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 40844886 - 40845073
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  40844886 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 40844985  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  40844986 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 40845073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41400814 - 41400627
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41400814 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccattttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagat 41400715  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41400714 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttagcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaa 41400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15255276 - 15255072
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  15255276 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagatggtgaattcagat 15255177  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  15255176 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 15255077  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  15255076 tcact 15255072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22105244 - 22105057
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  22105244 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 22105145  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22105144 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22105057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26293536 - 26293349
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  26293536 aattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 26293437  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  26293436 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 26293349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8091659 - 8091869
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||    |||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8091659 aattgatatttgagatgaaaacttaacaattatcaaaccatcctctttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 8091758  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8091759 tagaaactagggttatataagattaggttta--agcttggtttgattaggattttgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtatact 8091855  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  8091856 cactcatgttcatc 8091869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15259376 - 15259590
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  15259376 aatttatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccgcagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 15259475  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  15259476 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtaatttagacttatccaataatcccaagacaaggagaagtctac 15259575  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15259576 tcactcatgttcatc 15259590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15265998 - 15266212
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  15265998 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 15266097  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  15266098 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtaatttagacttatccaataatcccaagacaaggagaagtctac 15266197  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15266198 tcactcatgttcatc 15266212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15302337 - 15302123
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15302337 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttagaacggtgaattcagat 15302238  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15302237 aagaaattagggttatataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 15302138  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15302137 tcactcatgttcatc 15302123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 24124988 - 24125190
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24124988 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctctactttcgtttcttcagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 24125087  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24125088 gagaaactagggttacataaaattagggtttaaagcttggcttgattaggattatatca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 24125186  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  24125187 cact 24125190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 11504741 - 11504955
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  11504741 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttgatcgatgtttaagcggtgaatttagat 11504840  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  11504841 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagatgtctac 11504940  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  11504941 tcactcatgttcatc 11504955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48641959 - 48641805
Alignment:
Q  60 tttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  48641959 tttgataatggttaatttatgttaaaacggtgaatttagattagaaattagggttacataagattaaggtttaaatattggtttgattaggattatgtca 48641860  T
Q  160 tttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  48641859 tttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatc 48641805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16227372 - 16227160
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  16227372 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgttaaaacagtgaatttagaa 16227273  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16227272 gagaaactagggttacataaaattaaggtttaaggcttggcttgattaggattatctca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 16227174  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  16227173 cactcatgttcatc 16227160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 40560353 - 40560506
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40560353 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttacttcatgttaaagcggtgaatttagat 40560452  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggatt 153  Q
    || | |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40560453 taaaaattagggttatataagattaaggtttaagagcttggtttgattaggatt 40560506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21275585 - 21275383
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21275585 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 21275486  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | || |||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21275485 gagaaactaaggttacataaaattaaggtttaaggcttggcttgattaggattatatca-ttagacttaacaaacaatcccaagacaagagaagtctact 21275387  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  21275386 cact 21275383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7871135 - 7870969
Alignment:
Q  49 cgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgatta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||    
T  7871135 cgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaaggcttagggcttggtttgatta 7871036  T
Q  149 ggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca-atagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||    
T  7871035 ggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggaagaagtctactcactcatgttcatc 7870969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 43701330 - 43701532
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43701330 aattaatatttgagatgataaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttggtaattgttaatacatgttaaaacggtgaatttagat 43701428  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | |||  ||| |||| ||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  43701429 tagaaagtagatttatataaaattagggctcaatgcttggtttgattagggttatgtcatttagacttacccaacaatcccaagacaagaagagtctact 43701528  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  43701529 cact 43701532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11048640 - 11048537
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11048640 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagat 11048541  T
Q  101 taga 104  Q
    ||||    
T  11048540 taga 11048537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17996467 - 17996254
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17996467 aattaacatttggaataatggattaatgattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgatgatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 17996368  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | || |||||||||| ||| ||| || |  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  17996367 gagaaactaaggttacataatattaaggttttaaggcttgacctgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagatataagaagtctac 17996269  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  17996268 tcacttatgttcatc 17996254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15866439 - 15866255
Alignment:
Q  29 attatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattaggg 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||| |     
T  15866439 attatcaaaccctccaatttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataatattaagc 15866340  T
Q  129 ttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    || |  ||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||    
T  15866339 tttaaggcttaacttgattaggattatgtca-ttagatttatccaacaatcccaagacataataagtctactcactcatgttcatc 15866255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 20058923 - 20059107
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20058923 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacgatgaatttagat 20059021  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac 186  Q
    |||| | |||  ||| |||| ||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  20059022 tagaaagtagatttatataaaatttgggttcaatgcttggtttgattagggttatgtcatttagatttacccaacaatcccaagac 20059107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31594218 - 31594033
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31594218 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttttacagtttggtaattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttatat 31594120  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| | | |  ||| |||| ||| ||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  31594119 tagaaaat-gatttatataaaattggggttcaaggcttgatttgattagggttatgtcatttagacttacccaacaatctcaagacaa 31594033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9857445 - 9857328
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||    
T  9857445 tagattagaaattagggttacgtaaaattagggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagt 9857347  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  9857346 ctactcactcatgttcatc 9857328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10731376 - 10731285
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10731376 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaa 10731285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10945145 - 10945054
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10945145 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaa 10945054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Original strand, 11902475 - 11902582
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||    
T  11902475 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatatca-ttagacttatccaacaatcccaaggcaagaagagt 11902573  T
Q  196 ctactcact 204  Q
    |||||||||    
T  11902574 ctactcact 11902582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15410164 - 15410068
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaattta 97  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15410164 aattaatatttgggataatggattaaagattatcaaacccttcactttcatttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacgctgaattta 15410068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Original strand, 16953772 - 16953877
Alignment:
Q  108 tagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgat 207  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  16953772 taggattacataaaattagggtttaaagcttagtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaactatcccaagacaagaagagtctactcactcat 16953870  T
Q  208 gtccatc 214  Q
    || ||||    
T  16953871 gttcatc 16953877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Original strand, 40563741 - 40563807
Alignment:
Q  148 aggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40563741 aggattatgtcatttagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctactcactgatgttcatc 40563807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 12808020 - 12808150
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12808020 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatccca 12808118  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  ||| |||||||| |||| ||||    
T  12808119 agacaagaagagtatactcactcatgttcatc 12808150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 204
Target Start/End: Original strand, 21102124 - 21102187
Alignment:
Q  142 ttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21102124 ttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcact 21102187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Original strand, 39579 - 39704
Alignment:
Q  88 ggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca 187  Q
    |||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | || ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  39579 ggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttcgtttgattaggattacgtca-ttagacctatccaacaatcccaagaca 39677  T
Q  188 atagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | |  |||||||||||| |||| ||||    
T  39678 agaagagtctactcactcatgttcatc 39704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 23793449 - 23793567
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||    |||||| |||||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23793449 aaaacggtgaatt-agattagaaaatagatttacataagattagggttcgaggcttggattgatagggattaggtca-ttagactcatccaacaatccca 23793546  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  23793547 agacaa-agaagtctactcact 23793567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12347592 - 12347498
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12347592 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgaataggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 12347498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Original strand, 13883336 - 13883436
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  13883336 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgaataggattaggtca-ttagactcatccaacaatctcaagacaa-agaagtctactcactcatgttca 13883433  T
Q  213 tct 215  Q
    |||    
T  13883434 tct 13883436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5675716 - 5675599
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  5675716 aaaacggtgaat--agattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 5675620  T
Q  183 agacaatagaagtctactcac 203  Q
    |||||| |  |||||||||||    
T  5675619 agacaagaagagtctactcac 5675599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 48642006 - 48641964
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctcc 43  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48642006 aattgatatttgagatgatggatttacaattatcaaaccctcc 48641964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 209
Target Start/End: Original strand, 12345796 - 12345917
Alignment:
Q  85 aacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaag 184  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||||||| ||   ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  12345796 aacggtgaatt-agattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttaatagcgattaggtcatt-agactcatctaacaatcccaag 12345893  T
Q  185 acaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    | || ||||||||||||||| ||||    
T  12345894 a-aaaagaagtctactcactcatgt 12345917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 153)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17388810 - 17388598
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17388810 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 17388711  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17388710 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctact 17388612  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  17388611 cactcatgttcatc 17388598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43841821 - 43842033
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841821 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 43841920  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43841921 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 43842019  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  43842020 cactaatgttcatc 43842033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14071472 - 14071683
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14071472 aattaatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 14071571  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14071572 tagaaattagggttacataagattagggttaa-aacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14071669  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14071670 cactcatgttcatc 14071683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14494581 - 14494785
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14494581 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 14494680  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  14494681 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctag 14494780  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  14494781 tcact 14494785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 34053368 - 34053571
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34053368 aattgatatttgagatgatggattaacaagtatcaaaccctccactttcgtttccacagtctgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 34053467  T
Q  101 tagagattagggttacataaga-ttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34053468 tagagattagggttacataagatttagggttaatagcttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 34053566  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  34053567 tcact 34053571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21264836 - 21265049
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21264836 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttaataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 21264935  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21264936 tagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttaggcttatccaacaattccaagacaaaagaagtctact 21265035  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21265036 cactcatgttcatc 21265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14976065 - 14976269
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14976065 aattaatatttgagatgatggattaacaattattaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaagcgatgaatttagat 14976164  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14976165 tagagattagggttacataatattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 14976264  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  14976265 tcact 14976269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15430187 - 15429975
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15430187 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 15430088  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15430087 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15429989  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  15429988 cactaatgttcatc 15429975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17480803 - 17480591
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17480803 aattgatatttgagatgattgattaacaatttttaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 17480704  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17480703 tagaaattagggttacataagattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttggacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctact 17480605  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  17480604 cactcatgttcatc 17480591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 19566758 - 19566964
Alignment:
Q  7 tatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaga 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19566758 tatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctctactttcgtttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaa 19566857  T
Q  107 ttagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
     ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  19566858 ctagggttacataagattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgt-aattagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctacccactca 19566956  T
Q  207 tgtccatc 214  Q
    ||| ||||    
T  19566957 tgttcatc 19566964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12775799 - 12776013
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12775799 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 12775898  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12775899 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 12775998  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  12775999 tcactaatgttcatc 12776013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2781577 - 2781373
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  2781577 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 2781478  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2781477 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 2781379  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  2781378 cactga 2781373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 3338504 - 3338708
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  3338504 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 3338603  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3338604 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3338702  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  3338703 cactga 3338708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4830384 - 4830172
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4830384 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 4830285  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4830284 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4830186  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  4830185 cactaatgttcatc 4830172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5688013 - 5687802
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5688013 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 5687914  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  5687913 tagaaattagggttacataagattgggcttaa-agcttgatttgattaggattatgtca-ttagaattatccaataatcccaagacaagagaagtctact 5687816  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  5687815 cactcatgttcatc 5687802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6710375 - 6710171
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  6710375 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 6710276  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6710275 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 6710177  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  6710176 cactga 6710171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6809996 - 6809792
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  6809996 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 6809897  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6809896 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 6809798  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  6809797 cactga 6809792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6815818 - 6815614
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  6815818 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 6815719  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6815718 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 6815620  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  6815619 cactga 6815614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13093721 - 13093925
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  13093721 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 13093820  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13093821 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 13093919  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  13093920 cactga 13093925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15854538 - 15854334
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15854538 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15854439  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15854438 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15854340  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  15854339 cactga 15854334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22164477 - 22164689
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22164477 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22164576  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22164577 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 22164675  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  22164676 cactaatgttcatc 22164689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22169781 - 22169993
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22169781 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22169880  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22169881 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 22169979  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  22169980 cactaatgttcatc 22169993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24697188 - 24696984
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24697188 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 24697089  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24697088 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 24696990  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  24696989 cactga 24696984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41473254 - 41473050
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  41473254 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 41473155  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41473154 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 41473056  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  41473055 cactga 41473050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2722267 - 2722066
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2722267 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccccccactttcgtttccacagtttgataatgattaattcatgttaaaacagtgaatttagat 2722168  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2722167 tagaaattaaggttgcataagattagggttca-agcttggtttgattaggattatgtca-atagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 2722070  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  2722069 cact 2722066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 4768771 - 4768973
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4768771 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 4768870  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4768871 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4768969  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  4768970 cact 4768973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5226252 - 5226455
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  5226252 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgttgccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 5226351  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5226352 aaggaattaaggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 5226451  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  5226452 cact 5226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 53354559 - 53354761
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||    
T  53354559 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgattttagat 53354658  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  53354659 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 53354757  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  53354758 cact 53354761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15947536 - 15947322
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15947536 aattgatatttgggataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 15947437  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15947436 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 15947337  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15947336 tcactcatgttcatc 15947322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4366178 - 4365974
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4366178 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 4366079  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     |   ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4366078 aacgaattagggttacataagattagggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4365980  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  4365979 cactga 4365974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4383707 - 4383503
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4383707 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 4383608  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     |   ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4383607 aacgaattagggttacataagattagggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4383509  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  4383508 cactga 4383503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9365755 - 9365959
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  9365755 aattaatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaggcggtgaatttagat 9365854  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9365855 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatacaacaatcccaagacaagagaagtctact 9365953  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  9365954 cactga 9365959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14866819 - 14867031
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  14866819 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 14866918  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  14866919 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaaaaatcccaagacaagagaagtctact 14867017  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14867018 cactaatgttcatc 14867031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 15424925 - 15425129
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  15424925 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatctatgttaaagcggtgaatttagat 15425024  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15425025 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15425123  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  15425124 cactga 15425129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 16385212 - 16385416
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16385212 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 16385311  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16385312 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 16385410  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  16385411 cactga 16385416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7785730 - 7785944
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7785730 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagat 7785829  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  7785830 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 7785929  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7785930 tcactcatgttcatc 7785944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11948334 - 11948120
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11948334 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 11948235  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11948234 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 11948135  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  11948134 tcactcatgttcatc 11948120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13194703 - 13194917
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13194703 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 13194802  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13194803 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttcgcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatccgaagacaaggagaagtctac 13194902  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13194903 tcactcatgttcatc 13194917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15944865 - 15944651
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15944865 aattgatatttgggataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 15944766  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15944765 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 15944666  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15944665 tcactcatgttcatc 15944651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25765591 - 25765794
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765591 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacaatttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25765690  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaataga--agtcta 198  Q
    | || | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  25765691 tcgaaactacggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagagtcta 25765788  T
Q  199 ctcact 204  Q
    ||||||    
T  25765789 ctcact 25765794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 50908671 - 50908885
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  50908671 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 50908770  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  50908771 aagaaattagagttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 50908870  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  50908871 tcactcatgttcatc 50908885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 53160295 - 53160509
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  53160295 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 53160394  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  53160395 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 53160494  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  53160495 tcactcatgttcatc 53160509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2006284 - 2006073
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  2006284 aattgatatttgaaatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaatttatgttaagacggtgaatttatat 2006185  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2006184 tagaaactagggttacatgagattagggttaa-agcttggtttgattatgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 2006087  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  2006086 cactcatgttcatc 2006073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9360238 - 9360442
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  9360238 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaggcggtgaatttagat 9360337  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9360338 aaggaattagggttacataagattaaagtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 9360436  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  9360437 cactga 9360442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12247135 - 12246931
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12247135 aattgatatttgagattatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 12247036  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  12247035 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagaccagagaagtctact 12246937  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  12246936 cactga 12246931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13087852 - 13087648
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||    
T  13087852 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttggat 13087753  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  13087752 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctact 13087654  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  13087653 cactga 13087648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5211950 - 5212164
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||    
T  5211950 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcatat 5212049  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  5212050 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaaggagaagtctac 5212149  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5212150 tcactcatgttcatc 5212164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10559597 - 10559811
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10559597 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 10559696  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||  |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10559697 aagcaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 10559796  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10559797 tcactcatgttcatc 10559811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13326150 - 13325936
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13326150 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 13326051  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  13326050 tagagattatggttacataggattaaggtataaaacttgctttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaaatctac 13325951  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13325950 tcactcatgttcatc 13325936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13665440 - 13665226
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  13665440 aattgatatttgagatgatggataaacatttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 13665341  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  13665340 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattagtattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 13665241  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13665240 tcactcatgttcatc 13665226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15951906 - 15952120
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15951906 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcagaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15952005  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15952006 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 15952105  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15952106 tcactcatgttcatc 15952120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3280168 - 3279957
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3280168 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccttccactttcgcttatacattttgataatggttaattcatgttaaaatggtgagtttagat 3280069  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  3280068 tagaaactagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctacg 3279971  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  3279970 cactcatgttcatc 3279957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6829420 - 6829632
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||    
T  6829420 aattgatatttgagatgatggataaactattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcagtgaatttagat 6829519  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6829520 aagaaattagggttacacaagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattgtgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 6829618  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  6829619 cactaatgttcatc 6829632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13098642 - 13098438
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||    
T  13098642 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttggat 13098543  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13098542 aaggaattaggtttacataagattaaggtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 13098444  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  13098443 cactga 13098438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16377534 - 16377747
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  16377534 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 16377633  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16377634 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 16377733  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  16377734 cactaatgttcatc 16377747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 30026635 - 30026832
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30026635 atggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcagataagagattagggttaca 30026734  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  30026735 taagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 30026832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 16372842 - 16373029
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16372842 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16372941  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  16372942 gtttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 16373029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25055351 - 25055149
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25055351 aattgatatttgagatgattgattaacaattatcaaaccctccactttcgcttatacagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagat 25055252  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||    
T  25055251 tagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagaaaagaagagtctact 25055153  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  25055152 cact 25055149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8991748 - 8991534
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  8991748 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 8991649  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||| ||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8991648 aagaaattaggattacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaaggagaagtctac 8991549  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  8991548 tcactcatgttcatc 8991534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10546213 - 10546427
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10546213 aattgatatttgagatgatggataaactattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 10546312  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaat-agaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  | | | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10546313 aagaaattagggttacataagattaacgcttagagcttagcttgattagtattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctac 10546412  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10546413 tcactcatgttcatc 10546427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13204295 - 13204509
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  13204295 aattgatatttaagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 13204394  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||| ||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13204395 aagaaattaaggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatccgaagacaaggagaagtctac 13204494  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13204495 tcactcatgttcatc 13204509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16034407 - 16034208
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16034407 aattgatatttgagatgatggattcacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataattgttaattcttgttaaaacggtgaattt-gat 16034309  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||    
T  16034308 tagaaattagggttacataagattagggttaa-aattttgtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaggagaagtccact 16034211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20154370 - 20154156
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  20154370 aattgatatttggaatgatggataaacaattatcaaaccctccacttccgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 20154271  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  20154270 aagaaattagggttacataagattagggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccgacaatcccaagacaaggagaagtctac 20154171  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20154170 tcactcatgttcatc 20154156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20155782 - 20155996
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  20155782 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttgatccattttaaagcggtgaatttagat 20155881  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||    
T  20155882 tagaaattagggttacataagattaaggcttaaagcttggcttgattaggattacgtcatttagacttatccaaaaatctcaagacaaagagaagtctac 20155981  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20155982 tcactcatgttcatc 20155996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42281274 - 42281060
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||     
T  42281274 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttagagcggtgaatttagac 42281175  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  42281174 aagaaattagggttacataagattaaggcttagaacttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 42281075  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  42281074 tcactcatgttcatc 42281060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47975159 - 47974956
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975159 aattgatatttgacattatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagat 47975060  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaataga--agtcta 198  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  47975059 tagaaactagggttacataagattatggttaa-agcttggtttgattaggattatatca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagagtcta 47974962  T
Q  199 ctcact 204  Q
    ||||||    
T  47974961 ctcact 47974956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20556390 - 20556187
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20556390 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20556291  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||    
T  20556290 aaggaattagggttacataggattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatcccaagacaagag-agtctact 20556193  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  20556192 cactga 20556187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3249880 - 3250080
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  3249880 aattgatatttgagatggtggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccacgttaaagcggtgaatttagat 3249979  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  3249980 tagaaattagggttacataagattaaggcttaaagcttggcttgattaggattatgtcaattagacttatccgacaatcccaagacaagaagagtctact 3250079  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  3250080 c 3250080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1991153 - 1991022
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991153 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 1991054  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991053 tagagattagggttacataagattagggttaa 1991022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7601297 - 7601110
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  7601297 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 7601198  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  7601197 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 7601110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 10159461 - 10159648
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10159461 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10159560  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10159561 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 10159648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 10166122 - 10166309
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10166122 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10166221  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10166222 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 10166309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 11880275 - 11880462
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  11880275 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 11880374  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11880375 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 11880462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 13000675 - 13000862
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  13000675 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaag 13000774  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13000775 gcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 13000862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 13193336 - 13193523
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  13193336 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13193435  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13193436 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 13193523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14815932 - 14815745
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  14815932 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 14815833  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  14815832 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 14815745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 15556214 - 15556401
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  15556214 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15556313  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  15556314 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcacttatgttcatc 15556401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 15564065 - 15564252
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  15564065 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 15564164  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  15564165 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 15564252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 18214123 - 18214310
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18214123 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18214222  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18214223 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 18214310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10601726 - 10601940
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  10601726 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 10601825  T
Q  101 tagagattaggg-ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10601826 aagaaattaggggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 10601925  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10601926 tcactaatgttcatc 10601940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11940557 - 11940343
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11940557 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcatttcaacagtttgataatggttgatccatgttaaaacggtgaatttagat 11940458  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11940457 aagaaattaggtttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 11940358  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  11940357 tcactcatgttcatc 11940343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13135479 - 13135693
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  13135479 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 13135578  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13135579 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 13135678  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13135679 tcactcatgttcatc 13135693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13142087 - 13142301
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  13142087 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 13142186  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13142187 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 13142286  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13142287 tcactcatgttcatc 13142301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14660566 - 14660752
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660566 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 14660665  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  14660666 tag----------------agattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaaaaatcccaagacaagagaagtctact 14660748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15573174 - 15573388
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  15573174 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 15573273  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     |||  ||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15573274 aagaagttagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 15573373  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15573374 tcactcatgttcatc 15573388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16334369 - 16334192
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |    
T  16334369 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaag 16334270  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16334269 gtttaaagcttggtttgattagggttatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactga 16334192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17733000 - 17733214
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  17733000 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 17733099  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17733100 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagaattatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 17733199  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  17733200 tcactcatgttcatc 17733214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10249244 - 10249031
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  10249244 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttggtccatgttaaagcggtgaatttagat 10249145  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||| ||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  10249144 aagaaattatggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagataagtctact 10249045  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  10249044 cactaatgttcatc 10249031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10147938 - 10147751
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10147938 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10147839  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca-atagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10147838 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggaagaagtctactcactcatgttcatc 10147751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11399213 - 11399011
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11399213 aattgatatttgagatgatgaattaactattatcaagccctccactttcgcttctatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtaaatttagat 11399114  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  11399113 tagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaacacaagaagagtctact 11399015  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  11399014 cact 11399011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 12186354 - 12186541
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  12186354 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggtttcataagattaag 12186453  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  12186454 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 12186541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 12192768 - 12192955
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  12192768 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggtttcataagattaag 12192867  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  12192868 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 12192955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 12199409 - 12199596
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12199409 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 12199508  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||    
T  12199509 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaactctactcactcatgttcatc 12199596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 13186705 - 13186892
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  13186705 aattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 13186804  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13186805 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 13186892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16705923 - 16705736
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  16705923 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 16705824  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  16705823 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 16705736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37935476 - 37935289
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  37935476 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 37935377  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  37935376 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 37935289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37943321 - 37943134
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  37943321 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 37943222  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  37943221 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 37943134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43496532 - 43496346
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  43496532 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaatttagat 43496433  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43496432 aagaaattagggttacataagattaatgtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaa 43496346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18128719 - 18128933
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  18128719 aattgatatttgagatgatggataaacaattgtcaacccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtaaatttagat 18128818  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     | | |||||||||| ||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  18128819 aataaattagggttatataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaaatctac 18128918  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18128919 tcactcatgttcatc 18128933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 37978068 - 37978277
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
T  37978068 atatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgcttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaa 37978167  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcact 204  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37978168 actagggttacatgagattaaggtttaaagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcact 37978267  T
Q  205 gatgtccatc 214  Q
     |||| ||||    
T  37978268 catgttcatc 37978277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10141332 - 10141145
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10141332 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 10141233  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca-atagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||    
T  10141232 gcttagggcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggaagaagtctactcactcatgttcatc 10141145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10608038 - 10608252
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  10608038 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 10608137  T
Q  101 tagagatta-gggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| |||| |||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10608138 aagaaattaggggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattattttatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 10608237  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10608238 tcactaatgttcatc 10608252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13504147 - 13504361
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||    
T  13504147 aattgatatttggaataatggataaacaattaccaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattcggat 13504246  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13504247 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtctgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 13504346  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13504347 tcactcatgttcatc 13504361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17766697 - 17766535
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||    
T  17766697 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatattaaagtgatgaatttagat 17766598  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcattta 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17766597 tagagattagcgttacataagattaaggtttaaaggttggtttgattaggattatgtcattta 17766535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19068017 - 19067855
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||    
T  19068017 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatattaaagtgatgaatttagat 19067918  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcattta 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19067917 tagagattagcgttacataagattaaggtttaaaggttggtttgattaggattatgtcattta 19067855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32403628 - 32403842
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  32403628 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctcgactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 32403727  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||    
T  32403728 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattagaattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtttac 32403827  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  32403828 tcactcatgttcatc 32403842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4651601 - 4651425
Alignment:
Q  39 cctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagctt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||    
T  4651601 cctccactttcgtttccacagttagataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagctt 4651502  T
Q  139 ggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  4651501 ggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactaatgttcatc 4651425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1811 - 2028
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaat---tta 97  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||   |||    
T  1811 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaataattta 1910  T
Q  98 gattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtc 196  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  1911 gataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaaagagaagtc 2010  T
Q  197 tactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  2011 tactcactcatgttcatc 2028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15634820 - 15635034
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  15634820 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctgcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 15634919  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     |||  |||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15634920 aagaagttagggttacataagattaatgcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatccgaagacaaggagaagtctac 15635019  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15635020 tcactcatgttcatc 15635034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14347837 - 14348048
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14347837 aattgatatttgagatgatgaattaccaatta-ctaaccctccactttcgattctacagtttgataattgttaatttattttaaaacggtgaatttagat 14347935  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14347936 tagaaactagggttacataaaattagggtttaagacttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14348034  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14348035 cactcatgttcatc 14348048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19655856 - 19656060
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  19655856 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaatggtgaatttagaa 19655955  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  19655956 gagaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaaaagtctac 19656055  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  19656056 tcact 19656060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 3244833 - 3245020
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||    
T  3244833 aattgatatttgagatggtgaattaacaattatcaaacctttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccacgttaaagcggtgaatttatat 3244932  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3244933 tagaaattagggttacataagattaaggcttaaagcttggcttgattaggattatgtcaattacacttatccaacaatcccaagacaa 3245020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3212790 - 3212640
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212790 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 3212691  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattagga 151  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  3212690 tagaaactagggttacaaaagattagggtttaaggcttggtttgattagga 3212640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13605372 - 13605188
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13605372 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctactgtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttcgat 13605274  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13605273 tagaaattagggttacataaaattaggtttaa-ggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaattccaagacaa 13605188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14445004 - 14445206
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14445004 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 14445103  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  14445104 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 14445202  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  14445203 cact 14445206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14457051 - 14457263
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14457051 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 14457150  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | || |||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14457151 gagaaactaaggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtttact 14457249  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14457250 cactcatgttcatc 14457263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20155292 - 20155096
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  20155292 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatcttaaaacggtgaatttagaa 20155193  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20155192 gagaaactagggttacataatattaaggt-------ttggtttgaataggattatgtcatttagacttatccaacgatcccaagacaagagaagtctact 20155100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20150839 - 20150642
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||      |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20150839 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactt------ccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 20150746  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  20150745 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacgatcccaagataagagaagtctact 20150646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13069104 - 13068919
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||    
T  13069104 atggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacactttgataatatttaatccatgttaaaacggggaatttagaagagaaactagggttaca 13069005  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||| |||| |||| |  | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13069004 taatattaaggtttaagggttgacttgattaggactatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcact 13068919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36076454 - 36076326
Alignment:
Q  75 ttcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  36076454 ttcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggctacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttaaacttatccaa 36076356  T
Q  175 caatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36076355 caatcccaagacaagagaagtctactcact 36076326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55515092 - 55514936
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  55515092 aattgatagttgagatgatggataaacaattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatacatgttaaagcggtgaatttagat 55514993  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgt 157  Q
     ||| ||||||  ||| |||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  55514992 aagaaattaggtatacgtaagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgt 55514936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Original strand, 14137558 - 14137700
Alignment:
Q  70 gttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagactta 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14137558 gttaattcatgttaaaatggtgaatttaaattagaaactagggttacataa-attagagtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagactta 14137655  T
Q  170 tcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  14137656 tacaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatc 14137700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15639315 - 15639179
Alignment:
Q  79 tgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaat 178  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15639315 tgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaaggcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaat 15639216  T
Q  179 cccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  15639215 cccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 15639179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15645891 - 15645755
Alignment:
Q  79 tgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaat 178  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15645891 tgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaaggcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaat 15645792  T
Q  179 cccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  15645791 cccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 15645755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27407443 - 27407337
Alignment:
Q  107 ttagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |    
T  27407443 ttagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattacgtca-ttagaattatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactca 27407345  T
Q  207 tgtccatc 214  Q
    ||| ||||    
T  27407344 tgttcatc 27407337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 11827277 - 11827373
Alignment:
Q  112 gttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  11827277 gttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgt 11827373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 20224989 - 20225187
Alignment:
Q  3 ttaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattca-tgttaaaacggtgaatttagatt 101  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || || | |||||||||||||||  |    ||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20224989 ttaatatttgtgatgatgaattaacaagta-ctaaccctccactttcgcattatgagtttgatacttgttaattcactataaaaacggtgaatttagatt 20225087  T
Q  102 agagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactc 201  Q
    ||| | |||  |||||||  |||||||||    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20225088 agaaaatagatttacatagaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaagtca-ttagacttgtccaacaatcccaagacaagaagagtctactc 20225186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17023529 - 17023399
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |    
T  17023529 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattagg 17023430  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17023429 tcatt-agacttatccaacaatcccaagacaa 17023399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14953616 - 14953554
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 63  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14953616 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 14953554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22039095 - 22038991
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22039095 aaaacggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaggtcatt-agacttatccaacaatccca 22038997  T
Q  183 agacaa 188  Q
    ||||||    
T  22038996 agacaa 22038991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 42244387 - 42244506
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  42244387 aaaacggtgaaattagattagaaattaaatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatcaggattaggtca-ttagactcatccaacaatccca 42244485  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  42244486 agacaa-agaagtctactcact 42244506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 10850477 - 10850687
Alignment:
Q  3 ttaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagatt 101  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||   || ||  |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||| |||    
T  10850477 ttaatatttgtgatgatgaattaaaaattactaaaccctccacgttcgcttctt-agattagtaattgctaattcattataaaaacggtgaaattaaatt 10850575  T
Q  102 agagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactc 201  Q
    ||| | |||  ||| |||| | ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||    
T  10850576 agaaagtagatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattatgtca-ttagaattatccaacaatcccaagacaagaagagtctactc 10850674  T
Q  202 actgatgtccatc 214  Q
    ||| |||| ||||    
T  10850675 actcatgttcatc 10850687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13418585 - 13418508
Alignment:
Q  136 cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13418585 cttggtttgattaggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatc 13418508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 15234065 - 15234122
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccaca 58  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234065 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccaca 15234122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17041919 - 17041851
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17041919 gcttggtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcact 17041851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17050982 - 17050864
Alignment:
Q  85 aacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaag 184  Q
    ||||||||| |||||||||| | | |  ||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  17050982 aacggtgaaattagattagaaagttgatttatataaaattaaggtttatggcttggtttgattaggattatgtca-ttagatttatccaacaatcccaaa 17050884  T
Q  185 acaatagaagtctactcact 204  Q
    |||| |  ||||||||||||    
T  17050883 acaaaaagagtctactcact 17050864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1993661 - 1993572
Alignment:
Q  124 tagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  1993661 tagggtttatattttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatc 1993572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11868852 - 11868791
Alignment:
Q  152 ttatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  11868852 ttatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-ggaagtctactcactcatgttcatc 11868791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 36079397 - 36079323
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaat 75  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  36079397 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccatccactttcgcttctccagtttgataatgattaat 36079323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 14137509 - 14137560
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtt 52  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14137509 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtt 14137560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1998820 - 1998731
Alignment:
Q  124 tagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  1998820 tagggtttatattttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccaataatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatc 1998731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15639349 - 15639314
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15639349 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 15639314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15645925 - 15645890
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645925 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttg 15645890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 8685683 - 8685807
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  8685683 aaaacggtgaaat-agattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 8685780  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  8685781 agacaagaagagtctactcactcatgt 8685807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17209835 - 17209757
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatt 161  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  17209835 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt 17209757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8532092 - 8532040
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8532092 gcttggtttgatttggattaggtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaa 8532040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5666711 - 5666663
Alignment:
Q  161 ttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5666711 ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctagtcactcatgt 5666663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Original strand, 11577587 - 11577704
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  11577587 aaaacggtgaatt-agattagaaaatagatttacataaaattagggtttgaggcttggtttgatagggattaggtcgtt-agactcatccaacaatccca 11577684  T
Q  183 agacaatagaagtctactcac 203  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  11577685 agacaa-agaagtttactcac 11577704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 4654809 - 4654768
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctc 42  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4654809 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctc 4654768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Original strand, 17577036 - 17577163
Alignment:
Q  85 aacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaag 184  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||  |||||||| ||| | |||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  17577036 aacggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaatttgagttttaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaag 17577134  T
Q  185 acaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| | |||||||| |||| ||||    
T  17577135 acaa-agaaatttactcactcatgttcatc 17577163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 27992547 - 27992666
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  27992547 aaaacgatgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttctaggcttggtttgataggaattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 27992645  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    | |||| |||| ||||||||||    
T  27992646 atacaa-agaaatctactcact 27992666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6237063 - 6237000
Alignment:
Q  124 tagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6237063 tagggtttatggtttggtttgattaggtttacgttatt-agacttatccaacaatcccaagacaa 6237000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 203
Target Start/End: Original strand, 11869728 - 11869794
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11869728 gcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtatactcac 11869794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34300 - 34102
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34300 atatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatattaaaacggtgaatttagattagaa 34201  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34200 attagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcact 34102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 121)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20993524 - 20993737
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20993524 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaaaggtgaatttagat 20993623  T
Q  101 tagagattagggttacataaga-ttagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20993624 tagagattagggttacataagatttagggttaatagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 20993722  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20993723 tcactcatgttcatc 20993737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18854958 - 18854755
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18854958 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatttatgttaaaacggtgaatttagat 18854859  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  18854858 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 18854759  T
Q  200 tcac 203  Q
    ||||    
T  18854758 tcac 18854755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5671832 - 5672045
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5671832 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 5671931  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||    
T  5671932 tagagattagagttacataagattagggtcaatatcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcctaatacaagagaagtctact 5672031  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  5672032 cactcatgttcatc 5672045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15158470 - 15158257
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158470 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 15158371  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15158370 tagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttgattacgattatgtcattaagacttttccaactatcccaagacaagagaagtctact 15158271  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  15158270 cactcatgttcatc 15158257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19560660 - 19560873
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19560660 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcaattttcgtttccagagtttgataatggttaattcatgttaaaacgatgaatttagat 19560759  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19560760 tagagattagggttacataagattacggtcaataacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 19560859  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  19560860 cactcatgttcatc 19560873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18844779 - 18844592
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18844779 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 18844680  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18844679 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaa 18844592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18184159 - 18184363
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18184159 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 18184258  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18184259 tagagattaaggttacataagattatggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcgcaagacaagaagaagtctac 18184358  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  18184359 tcact 18184363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23603049 - 23603253
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23603049 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtaaatttagat 23603148  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  23603149 tagaaattagggttacataagattaaggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctac 23603248  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  23603249 tcact 23603253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15154012 - 15153799
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154012 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaacatccaatttcatttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 15153913  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15153912 tagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttgattacgattatgtcattaagacttttccaactatcccaagacaagagaagtctact 15153813  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  15153812 cactcatgttcatc 15153799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12442844 - 12442629
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12442844 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttaattcatgtcaaagcggtgaatttagat 12442745  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtcta 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  12442744 tagaaattagggttacataagattaaggtttaagagtttgatttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtcta 12442645  T
Q  199 ctcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||| ||||    
T  12442644 ctcactgatgttcatc 12442629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14077099 - 14077313
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14077099 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaacctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 14077198  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  14077199 tagaaattagggttacataagattaaggttttaagcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaaagagaagtctac 14077298  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  14077299 tcactcatgttcatc 14077313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22738169 - 22737963
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22738169 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaa-ccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcctgttaaaacggtgaatttagat 22738071  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738070 tagaaattagggttacataaaattagggtttcaagcttggtttgattaggattatgtta-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 22737972  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  22737971 cactcatgt 22737963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4188473 - 4188269
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4188473 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 4188374  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4188373 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4188275  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  4188274 cactga 4188269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8603832 - 8603620
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8603832 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgcttcaacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 8603733  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  8603732 tagaaaatagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagaaaagagaagtctact 8603634  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  8603633 cactcatgttcatc 8603620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15700514 - 15700310
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15700514 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15700415  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15700414 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15700316  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  15700315 cactga 15700310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18732675 - 18732463
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18732675 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgattcattataaaacggtgaatttagat 18732576  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  18732575 tagagattagagttacataagattagggtcaatatcttgatttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatccaaagacaagagaag-ctact 18732477  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  18732476 cactcatgttcatc 18732463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 19075102 - 19075306
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19075102 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 19075201  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19075202 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 19075300  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  19075301 cactga 19075306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26474282 - 26474071
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26474282 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccattttcgcttctatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 26474183  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26474182 tagaaattagggttacataagattagggttta-agctttgtttgattaggattatatca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 26474085  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  26474084 cactcatgttcatc 26474071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18006649 - 18006435
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18006649 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18006550  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  18006549 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 18006450  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18006449 tcactcatgttcatc 18006435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 25786121 - 25786317
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25786121 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaaaggtgaatttagat 25786220  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25786221 tagaaactagggttacataagaataaggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 25786317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22060770 - 22060974
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22060770 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22060869  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22060870 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctact 22060968  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  22060969 cactga 22060974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22071851 - 22072055
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22071851 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22071950  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22071951 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctact 22072049  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  22072050 cactga 22072055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22006097 - 22005890
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||    
T  22006097 aattcatatttgagatgatggataaacacttatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgattttagat 22005998  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22005997 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 22005899  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22005898 cactgatgt 22005890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12474299 - 12474511
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12474299 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 12474398  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12474399 aaggaattagggttacataaaattaaggtttaaagcttggtttgattagaattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 12474497  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12474498 cactaatgttcatc 12474511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25775362 - 25775158
Alignment:
Q  9 tttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagatt 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25775362 tttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaaatcatgttaaaacggtgaatttagattagaaact 25775263  T
Q  109 agggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatg 208  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25775262 agggttaaataagattaggatttaagggttgctttgattaggattatgt-aattagacttatctaacaatcccaagacaaaagaagtctactcactcatg 25775164  T
Q  209 tccatc 214  Q
    | ||||    
T  25775163 ttcatc 25775158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27565603 - 27565807
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  27565603 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgttaaagcggtgaatttagat 27565702  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27565703 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagaattatccaacaatcccaagacaagagaagtctagt 27565801  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  27565802 cactga 27565807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17283807 - 17284009
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17283807 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagttttataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagat 17283906  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  17283907 tagaaattagggttacataaaattaggatttaaagcttggtttgattaggattatggca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagaagagtctact 17284005  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  17284006 cact 17284009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29360644 - 29360442
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29360644 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccttcc----tcgtttccacagtttgataatggttaattcatattaaaacggtgaatttagat 29360549  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29360548 tagaaaatagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgaca-ttagacttatccaacaaccccaagacaagagaagtctact 29360451  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  29360450 cactcatgt 29360442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11607700 - 11607486
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  11607700 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 11607601  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11607600 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 11607501  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  11607500 tcactcatgttcatc 11607486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17119832 - 17119647
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17119832 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttctactgtttgata-tggttaatgcatgttaaagcggtgaatttagat 17119734  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17119733 tagagattaaggttacataagattaagatttaaagcttagtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagaca 17119647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29596648 - 29596430
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29596648 aattgatatttgagatgatggacggacaattatcaaatcctccactttcatttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 29596549  T
Q  101 tagagattagggttacata---agatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagt 195  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||    
T  29596548 tagagattagggttacataattagattaaggtttaatagcttggtttgattatgattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagataagt 29596449  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  29596448 ctactcactcatgttcatc 29596430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6479500 - 6479313
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  6479500 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 6479401  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6479400 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 6479313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6490921 - 6490734
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  6490921 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 6490822  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6490821 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 6490734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 19614962 - 19615152
Alignment:
Q  13 agatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattaggg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  19614962 agatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctaccgtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactaggg 19615061  T
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  19615062 ttacataagattaaggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccgaagacaagagaagtctacgcact 19615152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 20022068 - 20022255
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  20022068 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20022167  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20022168 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 20022255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20164473 - 20164286
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  20164473 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20164374  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20164373 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 20164286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 22164821 - 22165008
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22164821 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22164920  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22164921 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22165008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22244755 - 22244568
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22244755 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22244656  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22244655 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22244568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 22773077 - 22773264
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22773077 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 22773176  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22773177 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 22773264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17934738 - 17934524
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  17934738 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 17934639  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17934638 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 17934539  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  17934538 tcactcatgttcatc 17934524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18107503 - 18107289
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  18107503 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 18107404  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18107403 aagaaattagggttacataagattaaggcttatagcttggcttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 18107304  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18107303 tcactcatgttcatc 18107289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19828863 - 19829077
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  19828863 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 19828962  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
      || |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19828963 acgaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 19829062  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19829063 tcactcatgttcatc 19829077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22766367 - 22766581
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  22766367 aattgatatttggaataatggatgaacaattatcaaaccctccactttcgttcccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagat 22766466  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22766467 aagaaattagggttacataagattaaggcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 22766566  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22766567 tcactcatgttcatc 22766581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22786946 - 22787155
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22786946 aattgatatttgagataatggataaaaaattatcaaatccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22787045  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||    
T  22787046 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaaatctac 22787145  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  22787146 tcactcatgt 22787155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 30671038 - 30671250
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671038 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaactcttcactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 30671137  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  30671138 tagaaattaggattacataaaattaaggtttaaatcttggtttgatttggattatgt-aattagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 30671236  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  30671237 cactcatgttcatc 30671250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12657080 - 12657288
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12657080 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatc----cctccactttcgtttccactgtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 12657175  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  12657176 tagagattagggttacataagattaaggtttaaaacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaaacctaagacaagagaagtctact 12657274  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12657275 cactaatgttcatc 12657288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35271495 - 35271295
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  35271495 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctcgactttcgtttccacattttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 35271396  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||  || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  35271395 aagaaattagggttacataagattgaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 35271296  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  35271295 t 35271295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 20015903 - 20016090
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  20015903 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20016002  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20016003 gcttagggtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 20016090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20171170 - 20170983
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  20171170 aattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20171071  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20171070 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 20170983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24219056 - 24218850
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtga--atttag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  || ||     
T  24219056 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccaaagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatatatat 24218957  T
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtct 197  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  24218956 ataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtct 24218857  T
Q  198 actcact 204  Q
    |||||||    
T  24218856 actcact 24218850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16739063 - 16738849
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  16739063 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 16738964  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16738963 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattttgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 16738864  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16738863 tcactcatgttcatc 16738849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27322829 - 27323043
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  27322829 aattgatatttggaatgatagataaacaattatcaaaccctccactttcatttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 27322928  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca-atagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  27322929 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacatggagaagtctac 27323028  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27323029 tcactcatgttcatc 27323043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6795272 - 6795071
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6795272 aattgatatttgatatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatattaaaacggtgaatttagat 6795174  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  6795173 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtcattt-gacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 6795075  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  6795074 cact 6795071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 24854519 - 24854706
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  24854519 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24854618  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24854619 gcttagggcttggtttgattaggattacgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 24854706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 24861178 - 24861365
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  24861178 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24861277  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24861278 gcttagggcttggtttgattaggattacgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 24861365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25964247 - 25964046
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25964247 aattaatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25964149  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  25964148 tagaaattatggttacataaaattatggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaatacaagaagagtctact 25964050  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  25964049 cact 25964046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25968894 - 25968693
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25968894 aattaatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 25968796  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  25968795 tagaaattatggttacataaaattatggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaatacaagaagagtctact 25968697  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  25968696 cact 25968693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25615603 - 25615389
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| | ||    
T  25615603 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatcttaaagcggtgaattcatat 25615504  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaaga-caatagaagtctac 199  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| || | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  25615503 aagaaattagagttacataagattaaggcttagagcatggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaagagaagtctac 25615404  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25615403 tcactcatgttcatc 25615389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 209892 - 210096
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  209892 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaacccctcacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaacttagat 209991  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  209992 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttcatttgattaggattatatcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 210091  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  210092 tcact 210096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 18195333 - 18195472
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18195333 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 18195432  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttgg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  18195433 tagagattaaggttacataagattaaggtttaaagcttgg 18195472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18233591 - 18233782
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18233591 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagttggataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 18233690  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18233691 tag----------------agattagggttaatagcttggtttgattatgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 18233773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19966405 - 19966617
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  19966405 aattaacatttgaaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtaaatttagaa 19966504  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19966505 gagaaactagggttacataatattatggtttaaggctttgcttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 19966603  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  19966604 cactcatgttcatc 19966617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1626483 - 1626270
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1626483 aattgatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccgctttcgcttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 1626384  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaag-acaatagaagtctac 199  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  1626383 tagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggcttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagaaaaaaagaagtctac 1626285  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  1626284 tcactcatgttcatc 1626270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25402213 - 25402427
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  25402213 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtaaatttagaa 25402312  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25402313 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatctcaagacaaaagaagtctac 25402412  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25402413 tcactcatgttcatc 25402427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5152384 - 5152596
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5152384 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 5152483  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |   ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5152484 gagaaactagggttacataatattaaggtttaagccttggcttgattagaatcatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 5152582  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  5152583 cactcatgttcatc 5152596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 24511899 - 24511780
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24511899 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 24511800  T
Q  101 tagagattagggttacataa 120  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  24511799 tagaaattagggttacataa 24511780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25949653 - 25949468
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25949653 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttctacagtttgataattgttaattgatgttaaaacggtgaatttagag 25949555  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25949554 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttgctttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcctaagacaa 25949468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17743818 - 17743633
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17743818 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctctacttacgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 17743719  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||                 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17743718 tagaaattagggtt-----------------aaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 17743637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16470306 - 16470095
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16470306 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttcatgagtttgataattgttaattcatgtgaaaacggtgaatttagat 16470208  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||    
T  16470207 tagaaattagggttacacaaaattaaggtttaaggcttggtttgattaagattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagattctact 16470109  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  16470108 cactcatgttcatc 16470095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32544882 - 32544764
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32544882 aattgatatttgaggtgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttgaaacggtgaatttagat 32544783  T
Q  101 tagagattagggttacata 119  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  32544782 tagaaattagggttacata 32544764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21559868 - 21560070
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  21559868 aattaacatttggaatgatggattaatgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttaataatatttaatccatgttaaaacgatgaatttagaa 21559967  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | |||||||| |||| | || |||| |  |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  21559968 gagaaactagggttatataatactaaggtttaaggcttgacttgatcaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 21560066  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  21560067 cact 21560070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 19569931 - 19570053
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19569931 aattgatatttaagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagat 19570030  T
Q  101 tagagattagggttacataagat 123  Q
    |||| | |||| |||||||||||    
T  19570031 tagaaactaggattacataagat 19570053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18449107 - 18448895
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||| |     
T  18449107 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccaatttcatttccacagtttgataatatttaatccatgttataacggagaatttataa 18449008  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18449007 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggattgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 18448909  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  18448908 cactaatgttcatc 18448895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21573636 - 21573838
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  21573636 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacgatgaatttagaa 21573735  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | |||||||| | || | || |||| |  |||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  21573736 gagaaactagggttatacaatactaaggtttaaggcttgacttggtcaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 21573834  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  21573835 cact 21573838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23297172 - 23297374
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  23297172 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaatccctctactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttataa 23297271  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | |||| ||| | || | || |||| |  |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  23297272 gagaaactaggtttatacaatactaaggtttaaggcttgacttgattacgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 23297370  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  23297371 cact 23297374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29563540 - 29563413
Alignment:
Q  92 aatttagattagagattagggttacataa---gattagggtt-aatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac- 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  29563540 aatttagattagagattagggttacataattagattaaggtttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaaca 29563441  T
Q  187 aatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  29563440 aagagaagtctactcactcatgttcatc 29563413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Original strand, 23616209 - 23616337
Alignment:
Q  87 cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac 186  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23616209 cggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagat 23616308  T
Q  187 a-atagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  23616309 agagagaagtctactcactcatgttcatc 23616337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 23540726 - 23540820
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatt 95  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  23540726 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatt 23540820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 25656217 - 25656299
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtta 83  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25656217 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatggttaactcatgtta 25656299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Original strand, 19563714 - 19563808
Alignment:
Q  120 agattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  19563714 agatcagggtcaataacttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgttcatc 19563808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 5949447 - 5949597
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataat--ggttaattcatgttaaaacggtgaatttag 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||   |  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5949447 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctaca-taagaagctagggttaattcatgttcaaacggtgaatttag 5949545  T
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattagg 150  Q
    |||||| | |||||||| |||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  5949546 attagaaactagggttatataatattagggtttaaggcttgatttgattagg 5949597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 20218311 - 20218441
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  20218311 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggcttggtttgattaggattatgtca-ttagactcatccaacaatccca 20218409  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  20218410 agacaagaagagtctactcactcatgttcatc 20218441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 22112336 - 22112466
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  22112336 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggcttggtttgattaggattatgtca-ttagactcatccaacaatccca 22112434  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  22112435 agacaagaagagtctactcactcatgttcatc 22112466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 22601202 - 22601319
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||    
T  22601202 tagattagaaagtagggttacataaaattagggtttaaagtttggtttgattatgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagt 22601300  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  22601301 ctactcactcatgttcatc 22601319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5399466 - 5399359
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||    
T  5399466 tagattagaaaataggtttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagt 5399368  T
Q  196 ctactcact 204  Q
    |||||||||    
T  5399367 ctactcact 5399359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 25923222 - 25923352
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  25923222 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggaatatgtcatt-agactcatccaacaatccca 25923320  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  25923321 agacaagaaaagtctactcactcatgttcatc 25923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26138912 - 26138792
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26138912 aaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccaacaatccca 26138814  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  26138813 agacaagaagagtctactcact 26138792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30245427 - 30245348
Alignment:
Q  107 ttagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30245427 ttagggttacataagattagggttaa-aacttggtttgactatgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaa 30245348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Original strand, 14992124 - 14992231
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |   ||    
T  14992124 tagattagaaattaggtttatataaaattagggtttaaagcttgatttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacattcccaagacaagaagtgt 14992222  T
Q  196 ctactcact 204  Q
    |||||||||    
T  14992223 ctactcact 14992231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4741235 - 4741104
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4741235 aaaacagtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatccca 4741137  T
Q  183 agacaataga--agtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||    
T  4741136 agacaa-agaagagtctactcactaatgttcatc 4741104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29093782 - 29093673
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattaggg-ttaatagcttgg-tttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaa 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||| |  |    
T  29093782 tagattagaaattagggttacataaaattagggtttaaaggcttggttttgattaggattacgt-aattagacttatccaataatcccaagacaagaaga 29093684  T
Q  194 gtctactcact 204  Q
    |||||||||||    
T  29093683 gtctactcact 29093673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25507840 - 25507720
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  ||| |||| ||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  25507840 aaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtgtatggtttggtttgattaggattacgtcattaa-acttatccaacaatccca 25507742  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  25507741 agacaagaagagtctactcact 25507720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26018209 - 26018089
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  ||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  26018209 aaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacatcact-agacttatccaacaatccca 26018111  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  26018110 agacaagaagagtctactcact 26018089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26157582 - 26157462
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  ||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  26157582 aaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacatcact-agacttatccaacaatccca 26157484  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  26157483 agacaagaagagtctactcact 26157462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32543457 - 32543369
Alignment:
Q  115 acataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32543457 acataaaattagagtttaaagtttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaccaatcccaagacaagaagagtctactcact 32543369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 20105465 - 20105595
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||   ||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  20105465 aaaacagtgaaattagattagaaaataaatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcattaa-acttatccaacaatccca 20105563  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  20105564 agacaagaagagtctactcactcatgttcatc 20105595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 17793865 - 17793938
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  17793865 gcttggtttgatagggattatgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgt 17793938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18627706 - 18627547
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgtta-aaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgatta---ggatt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||  || |||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| |||||||||    ||||||||||||||   |||||    
T  18627706 agtttgatacttgttaattcattatataaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcgaggcttggtttgattattaggatt 18627607  T
Q  154 atgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  18627606 aggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatc 18627547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 25339073 - 25339198
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||| |||||| || ||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  25339073 aaaatggtgaaattcgattagaaagtagatttatataaaattagggttcaagacttggtttgattaggattatgtca-ttaaacttatccaacaatctca 25339171  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  25339172 agacaagaagagtctactcactcatgt 25339198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13168595 - 13168496
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||    
T  13168595 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgaataggattaggtca-ttagactcatccaacaatcccaagataa-agaagtctactcactaatgttca 13168498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Original strand, 18396360 - 18396460
Alignment:
Q  108 tagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgat 207  Q
    |||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  18396360 taggtttacataaaattagggatcaaggcttggtttgattaggattaaatcatt-agacttgtccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcat 18396458  T
Q  208 gt 209  Q
    ||    
T  18396459 gt 18396460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Original strand, 25031028 - 25031184
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  25031028 agtttgatatttgttaattcattataaaaacagtgaaattagattagaaattagatttatataaaattaaggttcgaggcttgatttgattatgattatg 25031127  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| |||| ||||    
T  25031128 tcatt-agactcatccaacaatcccaagataagaagagtctactcactcatgttcatc 25031184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26822131 - 26821975
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaac-ggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||| |||||||||||||| |    
T  26822131 agtttgatacttgttaattcattataaaaatggtgaaattagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttgatttgattaggattagg 26822032  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||| ||||||| ||  ||||||||||||| || |  |||||||||||| |||| ||||    
T  26822031 tca-ttagactcatacaacaatcccaagataagaagagtctactcacttatgttcatc 26821975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22344292 - 22344244
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttc 49  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22344292 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttc 22344244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Original strand, 28733949 - 28734100
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||| ||||    ||||| |||||| ||||||| |    
T  28733949 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttacataaaattaaggttcgaggcttgatttgatcaggattagg 28734048  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||    
T  28734049 tcatt-agactcatccaacaatcccaagataagaagagtctactcactcatgt 28734100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Original strand, 12660253 - 12660397
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||| ||| ||| |||||    ||||||||||||  ||||||      
T  12660253 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaattagatttac-taaaatttgggttcgaggcttggtttgatagggattaga 12660351  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12660352 tcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcact 12660397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 19612574 - 19612703
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  19612574 aaaacggtgaaattagattagaaagtaga-ttatataaaattagggttcgaagcttggcttgactaggattaggtcgtt-agactcatccaacaatccca 19612671  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  19612672 agacaagaagagtctactcacttatgttcatc 19612703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19993847 - 19993722
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||| | | |||  ||| |||| |||||||||    | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  19993847 aaaacggtgaaattagattaaaaagtagatttatataaaattagggttcgaggtttggtttgattaggattagttcatt-agactcatccaacaatccca 19993749  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  19993748 agacaagaagagtctactcactcatgt 19993722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20221437 - 20221315
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||   ||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20221437 aaaacggtgaatt-agattagaaaatacatttacataagattagggttcgaggcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 20221341  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||    
T  20221340 agacaa-agaagtttattcactcatgt 20221315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22115421 - 22115299
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||   ||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  22115421 aaaacggtgaatt-agattagaaaatacatttacataagattagggttcgaggcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 22115325  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||    
T  22115324 agacaa-agaagtttattcactcatgt 22115299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 17522219 - 17522317
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  17522219 ttacataaaattagggttctaggcttggtttgat-aggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctacttactcatgttca 17522315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 23523783 - 23523887
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||  ||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23523783 aaaacagtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaagtca-ttagactcatccaacaatccca 23523881  T
Q  183 agacaa 188  Q
    | ||||    
T  23523882 aaacaa 23523887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 19563661 - 19563701
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccct 41  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19563661 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccct 19563701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9414570 - 9414505
Alignment:
Q  147 taggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  9414570 taggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgttcatc 9414505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Original strand, 23517231 - 23517309
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |  | |||||||||| |||| ||||    
T  23517231 gcttggtttgattaggattaggtca-ttagactcatccaataatcccaagacaagaagaatctactcactcatgttcatc 23517309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29254233 - 29254131
Alignment:
Q  84 aaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaa 183  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||   ||| |||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||    
T  29254233 aaacggtgaaattagattagaaagtatatttatatataattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagatttatccaacaatctcaa 29254135  T
Q  184 gaca 187  Q
    ||||    
T  29254134 gaca 29254131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 13217236 - 13217309
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||    
T  13217236 gcttggtttgattaggattaggtca-ttcgacttatccaacaatcccgaaacaagaagagtctactcactcatgt 13217309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20464626 - 20464503
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||||| | |||||| | |||  |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||    
T  20464626 aaaacggtgaattaa-attagaaaatagatttacataaaattagggtttaacgcttggtttgatagggattaggtca-ttagactcatccaacaatctca 20464529  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  20464528 agagaa-agatgtctactcactcatgt 20464503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 24545504 - 24545580
Alignment:
Q  137 ttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  24545504 ttggtttgattaggattacgttatt-agacttatccaacaatctcaatacaagaagagtctactcactcatgttcatc 24545580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 31965350 - 31965468
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||  ||||||||||| ||||||     |||||||||||   ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  31965350 aaaacggtgaaat-agattagaaaatagatttacataagatcagggttcgagacttggtttgatagagattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 31965447  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  31965448 agacaa-agaagtctactcact 31965468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29682828 - 29682734
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29682828 ttacataagattagggttcgatgcttggtttgatagggattaggtca-ttagactcatccaacaatctcatgacaa-agaggtctactcactcatgt 29682734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 13941 - 14149
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13941 atatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaacttgataatggttaattcatgttaaaatagtgaatttagattagag 14040  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  14041 attatggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaacaagagaagtctactcactc 14140  T
Q  206 atgtccatc 214  Q
    |||| ||||    
T  14141 atgttcatc 14149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3847 - 3646
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3847 aattgatattagagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 3748  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3747 tagaaattagggttacataagattagggttaa-agcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 3650  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  3649 cact 3646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13559 - 13356
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13559 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataaaggttaattcatgttaagacggtgaatttagat 13460  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13459 tagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagagttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 13360  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  13359 cact 13356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 109)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18483457 - 18483671
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18483457 aattgatatttgagatgatgaattaacaactatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 18483556  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18483557 tagaaattagggttacataagattaaggtttaagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 18483656  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18483657 tcactaatgttcatc 18483671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3388358 - 3388144
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3388358 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttatat 3388259  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  3388258 tagaaattagggttacataagattaaggtttaagagcttagtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaattctac 3388159  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  3388158 tcactgatgttcatc 3388144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20245889 - 20245676
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20245889 aattgatatttgagatgatggattaacaattatccaaccctccacttttgtttccacagtttgataatagttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 20245790  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20245789 tacgaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 20245690  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  20245689 cactcatgttcatc 20245676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23343305 - 23343509
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23343305 aattgatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccgcagtttgataatggttaattcatgttaaagcgatgaatttagat 23343404  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||    
T  23343405 tagagattagggttacataagattaaggtttaaaggttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaattctac 23343504  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  23343505 tcact 23343509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24220703 - 24220499
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24220703 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 24220604  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    | || |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24220603 tggaaattagggttacatatgattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 24220504  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  24220503 tcact 24220499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6406598 - 6406384
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6406598 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 6406499  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  6406498 tagagattaggattacataagattaagatttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 6406399  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  6406398 tcactcatgttcatc 6406384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23435656 - 23435444
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23435656 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 23435557  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23435556 tagaaactagggttacataagattagcgtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttact 23435458  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  23435457 cactcatgttcatc 23435444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23447023 - 23446811
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23447023 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 23446924  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23446923 tagaaactagggttacataagattagcgtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttact 23446825  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  23446824 cactcatgttcatc 23446811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 42789592 - 42789804
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42789592 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 42789691  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  42789692 tagagattagggttacataagatcaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccagcaatcccaagacaagagaagtctact 42789790  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  42789791 cactaatgttcatc 42789804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20571205 - 20571419
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20571205 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgataatcgttcattcatgttaaaacggtgaatttagat 20571304  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  20571305 tagaaattagggttacataagattaaggtttaaaggttggtttgattaggatcatgtcatttagacttatccaaccatcccaagacaagaagaagtctac 20571404  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20571405 tcactcatgttcatc 20571419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 7760872 - 7761076
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  7760872 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 7760971  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7760972 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 7761070  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  7761071 cactga 7761076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15732272 - 15732068
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15732272 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15732173  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15732172 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15732074  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  15732073 cactga 15732068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15736491 - 15736287
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15736491 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15736392  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15736391 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 15736293  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  15736292 cactga 15736287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20595087 - 20595291
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20595087 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20595186  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20595187 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20595285  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  20595286 cactga 20595291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20789980 - 20790184
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20789980 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20790079  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20790080 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20790178  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  20790179 cactga 20790184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20795761 - 20795965
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20795761 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20795860  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20795861 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20795959  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  20795960 cactga 20795965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21734374 - 21734586
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21734374 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21734473  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21734474 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21734572  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21734573 cactaatgttcatc 21734586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21812017 - 21812221
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  21812017 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 21812116  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21812117 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 21812215  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  21812216 cactga 21812221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 23618233 - 23618437
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23618233 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23618332  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23618333 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23618431  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  23618432 cactga 23618437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23685181 - 23684977
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23685181 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23685082  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23685081 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23684983  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  23684982 cactga 23684977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 23849630 - 23849834
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23849630 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23849729  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23849730 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23849828  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  23849829 cactga 23849834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34780640 - 34780436
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  34780640 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 34780541  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34780540 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 34780442  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  34780441 cactga 34780436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24215080 - 24214876
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24215080 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagtgatgaatttagat 24214981  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24214980 tggagattagggttacatatgattaaggtttaaaacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 24214881  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  24214880 tcact 24214876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23599902 - 23600116
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  23599902 aattgatatttggaatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 23600001  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23600002 aagaaattagggttacataagattagggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 23600101  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23600102 tcactcatgttcatc 23600116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18067562 - 18067358
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18067562 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18067463  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18067462 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctact 18067364  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  18067363 cactga 18067358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18073857 - 18073653
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18073857 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18073758  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18073757 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatcccaagacaagagaagtctact 18073659  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  18073658 cactga 18073653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20601373 - 20601577
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20601373 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20601472  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20601473 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 20601571  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  20601572 cactga 20601577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20607664 - 20607868
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20607664 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20607763  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20607764 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 20607862  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  20607863 cactga 20607868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20614001 - 20614205
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20614001 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20614100  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20614101 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 20614199  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  20614200 cactga 20614205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 23972967 - 23973171
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  23972967 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatatagat 23973066  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23973067 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23973165  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  23973166 cactga 23973171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 31057471 - 31057675
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  31057471 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 31057570  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  31057571 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 31057670  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  31057671 tcact 31057675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20449587 - 20449801
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20449587 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20449686  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20449687 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttcgtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 20449786  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20449787 tcactaatgttcatc 20449801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22323364 - 22323578
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  22323364 aattgatatttgagatgatggatgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 22323463  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22323464 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattaggtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 22323563  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22323564 tcactcatgttcatc 22323578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25891112 - 25891326
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25891112 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 25891211  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  25891212 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 25891311  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25891312 tcactcatgttcatc 25891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14482713 - 14482501
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14482713 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 14482614  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  14482613 aaggaattagggttacacaagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaaaaatcccaagacaagagaagtctact 14482515  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14482514 cactaatgttcatc 14482501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24935802 - 24935598
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  24935802 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatattaaagcggtgaatttagat 24935703  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24935702 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttact 24935604  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  24935603 cactga 24935598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24941494 - 24941290
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  24941494 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatattaaagcggtgaatttagat 24941395  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24941394 aaggaattagggttacataagattaagatttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 24941296  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  24941295 cactga 24941290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41765544 - 41765756
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  41765544 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatctagat 41765643  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41765644 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 41765742  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  41765743 cactaatgttcatc 41765756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20915712 - 20915915
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20915712 aattgatatttgagatgatggtttaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttacat 20915811  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20915812 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattttgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 20915910  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  20915911 tcact 20915915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22143341 - 22143137
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22143341 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22143242  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  22143241 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 22143142  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  22143141 tcact 22143137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13910344 - 13910130
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  13910344 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtcaatttagat 13910245  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  13910244 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 13910145  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13910144 tcactcatgttcatc 13910130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 20444105 - 20444307
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20444105 aattgatatttgagatgatgaataaacaattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 20444204  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20444205 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 20444304  T
Q  200 tca 202  Q
    |||    
T  20444305 tca 20444307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33701826 - 33701612
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  33701826 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 33701727  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  33701726 aagaaattagggttacataagattaacgcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 33701627  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  33701626 tcactcatgttcatc 33701612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23268024 - 23267815
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23268024 aattgatatttgagatgatgtataaacaattgtcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23267925  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  23267924 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 23267825  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  23267824 tcactcatgt 23267815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25577409 - 25577622
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25577409 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 25577508  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  25577509 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaggagaagtctact 25577608  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  25577609 cactaatgttcatc 25577622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26848602 - 26848390
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  26848602 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattaagat 26848503  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26848502 aaggaattaggattacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 26848404  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  26848403 cactaatgttcatc 26848390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 28834665 - 28834869
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  28834665 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttctacagtttgataatggttgatccatgttaaagcgatgaatttagat 28834764  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28834765 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaagattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 28834863  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  28834864 cactga 28834869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30730173 - 30729966
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30730173 aattgatatttaagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 30730074  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30730073 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagctttgtttgattaggattatgtca-ttaggcttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 30729975  T
Q  201 cactgatgt 209  Q
    |||| ||||    
T  30729974 cactaatgt 30729966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20802457 - 20802243
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  20802457 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagat 20802358  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaat-agaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20802357 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttcgtttgattagaattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaatgagaagtctac 20802258  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20802257 tcactcatgttcatc 20802243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20832227 - 20832431
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattat--caaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20832227 aattgatatttgagatgatggataaacaattatatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttag 20832326  T
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtcta 198  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20832327 ataagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagggaagtcta 20832425  T
Q  199 ctcact 204  Q
    ||||||    
T  20832426 ctcact 20832431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22316757 - 22316971
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  22316757 aattgatatttgagatgatggatgaaaaattatcaaaccctccatttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 22316856  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22316857 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattaggtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 22316956  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22316957 tcactcatgttcatc 22316971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22856492 - 22856278
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22856492 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 22856393  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22856392 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 22856293  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22856292 tcactcatgttcatc 22856278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25006075 - 25006289
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  25006075 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 25006174  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25006175 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 25006274  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25006275 tcactcatgttcatc 25006289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12322665 - 12322455
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12322665 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaatcctccactttcgcttctacagtttgataatgattaattcatgttaaaacggtgaatttagat 12322566  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12322565 tagaaacta-ggttacataagattagggttaa-agcctggtttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaatcccaagacaaaagaagtctatt 12322469  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12322468 cactcatgttcatc 12322455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23771255 - 23771055
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23771255 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 23771156  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  23771155 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccccagacaagaaaagtcttct 23771057  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  23771056 ca 23771055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18613045 - 18613236
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18613045 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 18613144  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaa 193  Q
      || |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18613145 aggaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaa 18613236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 16104028 - 16104215
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16104028 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 16104127  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  16104128 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 16104215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 18772139 - 18772326
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18772139 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18772238  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18772239 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 18772326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20616631 - 20616444
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  20616631 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 20616532  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20616531 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 20616444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21730138 - 21729951
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  21730138 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 21730039  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21730038 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 21729951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5077963 - 5078177
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  5077963 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatggtttatccatgttaaagcggtgaacttagat 5078062  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaaga-caatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  5078063 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagataaagagaagtctac 5078162  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5078163 tcactcatgttcatc 5078177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25115070 - 25115284
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  25115070 aattgatatttggaataatggataaaaaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 25115169  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25115170 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 25115269  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25115270 tcactcatgttcatc 25115284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25174162 - 25174376
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  25174162 aattgatatttggaataatggataaaaaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagat 25174261  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25174262 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 25174361  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  25174362 tcactcatgttcatc 25174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 30758930 - 30759144
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30758930 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 30759029  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30759030 gagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatttcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 30759129  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  30759130 tcactcatgttcatc 30759144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 30769035 - 30769249
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30769035 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 30769134  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30769135 gagaaattagggttacataagattaaggcttagagattggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 30769234  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  30769235 tcactcatgttcatc 30769249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 18610975 - 18611162
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18610975 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 18611074  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18611075 gcttaggacttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 18611162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 24952467 - 24952654
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  24952467 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24952566  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24952567 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 24952654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 24969132 - 24969319
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  24969132 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 24969231  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  24969232 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 24969319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25202202 - 25202015
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  25202202 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 25202103  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25202102 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 25202015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25266357 - 25266170
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  25266357 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 25266258  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25266257 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 25266170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 29052780 - 29052993
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  29052780 aattgatatttgagatgatggataaacaattat-aaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 29052878  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  29052879 aagaaattagggttacatatgattaaggcttagagcttgacttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaaacaaagagaagtctac 29052978  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  29052979 tcactcatgttcatc 29052993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 9728657 - 9728866
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9728657 aattgatatttgagatgatggataaacaattattaaatcttccactttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagat 9728756  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || || |||||| |||    
T  9728757 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagtttggtttgattaggattatatcatttagacttatccaacaatctcaatacaaagagaagtttac 9728856  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  9728857 tcactcatgt 9728866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21382610 - 21382398
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382610 aattgatatttgagatgatgaattaataattactaacccttccacttttgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 21382511  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  21382510 tagaaactagggttacataagattacggtttaaggcttagtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaattccaagataagagaagtctact 21382412  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21382411 cactcatgttcatc 21382398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21273952 - 21273778
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21273952 aattatcaaacactccacttttgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttatataagattagg 21273853  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21273852 gttaa-agcttggtttgattaggattatgtc-gctagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtttactcact 21273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 23626602 - 23626790
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  23626602 aattgatatttggaatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 23626701  T
Q  101 tagagattagggttaca-taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca-tttagacttatcaaacaatcccaagaca 187  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23626702 aagaaattagggttacattaagattagggcttaaagcttggtttgattaggattatgtcattttagacttatccaacattcccaagaca 23626790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21390002 - 21389791
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21390002 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccaatttcgcttctacagtttgataattgttaattcatgttaaaagggtgaatttatat 21389904  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21389903 tagatactagggttacataagattaggatttaaggcttggtttgattaggattatatca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 21389805  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  21389804 cactcatgttcatc 21389791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 28621767 - 28621942
Alignment:
Q  40 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || | |  | |||    
T  28621767 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaaggcttagggtttg 28621866  T
Q  140 gtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  28621867 gtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 28621942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26780883 - 26780669
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26780883 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttcaacaatttgataatggttgatcaatgttaaagcggtgaatttagat 26780784  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  26780783 aagaaattagggttacataagattaaggcttagaacttggattgattaggattatgtcatttagacttatccaacaataccaagacaaggagaagtctac 26780684  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  26780683 tcactcatgttcatc 26780669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25742017 - 25741805
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25742017 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 25741918  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  25741917 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 25741819  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  25741818 cactcatgttcatc 25741805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26843146 - 26842934
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26843146 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatattaaagcggtgaattaagat 26843047  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26843046 aaggaattaggattacataagattaagatttaaagattggtttgattaggattatgtca-ttatacttatccaacaattcaaagacaagagaagtctact 26842948  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
     ||| |||| ||||    
T  26842947 tactaatgttcatc 26842934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20169230 - 20169431
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| || |||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20169230 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccccccgctttcgcttctacaattttataattgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 20169328  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  20169329 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccgaagacaagaatagtctact 20169427  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20169428 cact 20169431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 35307403 - 35307605
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  35307403 aattaacatttgaaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 35307502  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||    
T  35307503 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaataatcccaagacacaggaagtctact 35307601  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  35307602 cact 35307605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20968071 - 20967869
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  20968071 aattaacatttgaaataatggattaacgattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttataa 20967972  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20967971 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttggcttgataaggattatatca-ttagacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctact 20967873  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  20967872 cact 20967869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21833259 - 21833078
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  21833259 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccgttcattttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgtaaagacggtaaattcagat 21833160  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaa 183  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21833159 tagaaactagggttacataagattggggtttaaggcttgattttattaggaatatgtca-ttagacttatccaacaatcccaa 21833078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 25122078 - 25122253
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  25122078 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta-- 25122175  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25122176 ----------aggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 25122253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 25181169 - 25181344
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  25181169 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgtttaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagatta-- 25181266  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25181267 ----------aggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 25181344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23757014 - 23756875
Alignment:
Q  73 aattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatca 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23757014 aattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtt-atgacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatcc 23756917  T
Q  173 aacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  23756916 aacaattccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatc 23756875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23822470 - 23822331
Alignment:
Q  73 aattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatca 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23822470 aattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaactagggttacataagattagggtt-atgacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatcc 23822373  T
Q  173 aacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  23822372 aacaattccaagacaaaagaagtctactcactcatgttcatc 23822331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 214
Target Start/End: Original strand, 21400807 - 21400943
Alignment:
Q  79 tgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaat 178  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21400807 tgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttaaagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaat 21400906  T
Q  179 cccaagac-aatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21400907 cccaagacaaagagaagtctactcactaatgttcatc 21400943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 23582761 - 23582961
Alignment:
Q  17 gatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaattt-agattagagattagggtta 115  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||| |||  |||||||||    
T  23582761 gatggattaacagttatcaaaccctccatatttgttttcacagtatgataatggttgatacatgttaagacggggaatttcagataagaagttagggtta 23582860  T
Q  116 cataagattagggttaatagcttggtttgattagg-attatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccat 213  Q
    ||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  23582861 cattagataggggcttagagcttggtttgattaggaataatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcat 23582960  T
Q  214 c 214  Q
    |    
T  23582961 c 23582961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23743514 - 23743363
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||| ||      
T  23743514 atatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccacttttctttccccagtttgataatggttgatccctgttaaagcggggaatttagataagga 23743415  T
Q  106 attagggttacat-aagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgt 157  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  23743414 attagggttacataaaaattaaggttaa-agtctggtttgattaggattatgt 23743363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 31757954 - 31758084
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31757954 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaatccca 31758052  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  31758053 agacaagaagagtctactcactcatgttcatc 31758084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22948808 - 22948701
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  22948808 tagattagaaattagggttacataaaatttgggtttaaagcttggtttgaataggattatgtca-ttagacttatccgacaatcccaagacaagaagagt 22948710  T
Q  196 ctactcact 204  Q
    |||||||||    
T  22948709 ctactcact 22948701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22942598 - 22942491
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  22942598 tagattagaaattagggttgcataaaattagggtttaaagtttggtttgactaggattatgtca-ttagacttatccgacaatcccaagacaagaagagt 22942500  T
Q  196 ctactcact 204  Q
    |||||||||    
T  22942499 ctactcact 22942491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 20724698 - 20724815
Alignment:
Q  96 tagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagt 195  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |  |||    
T  20724698 tagattagaaagtagggttacataaaattagggtttaaaacttggtttgattaggataatgtca-ttagacttatccaacaatcacaagataagaagagt 20724796  T
Q  196 ctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  20724797 ctactcactcatgttcatc 20724815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24165503 - 24165383
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24165503 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaactagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatccca 24165405  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  24165404 agacaagaagagtctactcact 24165383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12410801 - 12410655
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |    
T  12410801 agtttgatacttgttaattcattataaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattagg 12410702  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  12410701 tca-ttagactcatccaacaatcccatgacaagaagagtctactcact 12410655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 202
Target Start/End: Original strand, 20103721 - 20103884
Alignment:
Q  40 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaa-aacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagctt 138  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| | ||   ||| |||| ||||||||| |  ||||    
T  20103721 ctccactttcgcttcatgagtttgatatttgttaattcattataataacggtgaaattagattagaaagtaaatttatataaaattagggttcaatgctt 20103820  T
Q  139 ggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactca 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |  ||||||||||    
T  20103821 ggtttgattagggttatgtcatttagacttacccaacaatctcaatacaagaagagtctactca 20103884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 22000241 - 22000294
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttc 54  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22000241 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttc 22000294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 2953372 - 2953502
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||    
T  2953372 aaaatggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggttcaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagactcatccaacaatcaca 2953470  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  |||||||| ||| |||| ||||    
T  2953471 agacaagaagagtctactgactcatgttcatc 2953502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 177
Target Start/End: Original strand, 17408585 - 17408662
Alignment:
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaa 177  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17408585 attagaaattaaggttacataaaattagggtttaaagctgggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaa 17408662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Original strand, 34222992 - 34223088
Alignment:
Q  117 ataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||| ||||    
T  34222992 ataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtccactcactcatgttcatc 34223088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15059806 - 15059739
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15059806 gcttggcttgattaggattatatcatt-agacttacccaacaatcccaagacaagagaagtctactcac 15059739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20738604 - 20738474
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  |||  ||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  20738604 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatgtaaaattagggttcgaggcttggtttgattaggattaggtca-ttagactcatccaacaatccca 20738506  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |  | |||||||||| |||| ||||    
T  20738505 agacaagaagaatctactcacttatgttcatc 20738474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23114508 - 23114379
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||||| |||| |||||||||| | ||   |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  23114508 aaaacgatgaaattagattagaaaatatatttacataaaattagggttctaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatccca 23114410  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  23114409 aaacaa-agaagtctactcactcatgttcatc 23114379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16677327 - 16677202
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||| |||||| ||| |||||| | |||  |||||||| |||||||| |   ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  16677327 aaaatggtgaagttatattagaaaatagatttacataaaattagggtaagatgcttggtttgatagggattatatcatt-agactcatccaacaatccca 16677229  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  16677228 agacaagaagagtctactcactcatgt 16677202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22171035 - 22170910
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||||||  ||| ||||||| ||| || ||| |||    
T  22171035 aaaacggtgaatttagattagaaaatagatttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaattca-ttagactcatccaaaaattcca 22170937  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  22170936 agacaagaagagtctactcactcatgt 22170910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24166483 - 24166384
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||| |||| || |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  24166483 ttacataagattagggttccaggcttggtttgatagggattaggtca-ttcgactcatccaacaatcctaagacaa-agaagtctactcactcatgttca 24166386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31414811 - 31414739
Alignment:
Q  141 tttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  31414811 tttgattaggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgttcatc 31414739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18692 - 18895
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18692 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 18791  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18792 tagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattagaattatgtcatttcgacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 18891  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  18892 cact 18895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23585 - 23383
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23585 aattgatatttgcgatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgttttcatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 23486  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23485 tagagattagggttacataagattagggctaatagcttggtttgattaggattatttca-ttatacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 23387  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  23386 cact 23383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 78162 - 77960
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78162 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaattcagat 78063  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  78062 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 77964  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  77963 cact 77960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18540 - 18380
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18540 aattaatatttgcgatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgttttcacagtttgataatggttagttcatgttaaaacggtgaatttagat 18441  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18440 tagagattagggttacataagattagggttaatatcttggtttgattaggattatttcatt 18380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 100742 - 100568
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaac--ggtgaatttag 98  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  100742 aattaatatttgggataatggatcaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaactatgtgaatttag 100643  T
Q  99 attagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatca 172  Q
    |  ||| | ||| ||||||||| |||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  100642 aagagaaactagagttacataatattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatca 100568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 308
Alignment:
Q  167 ttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  345 ttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcact 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5719 - 5505
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5719 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaatggtgaatttagat 5620  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5619 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtaatttaaacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 5520  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5519 tcactcatgttcatc 5505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 6239 - 6448
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6239 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccagagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 6338  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6339 tagagattagggttacataagataaaggtttaaagcttggtttaattaggattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 6438  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  6439 tcactcatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 163676 - 163881
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  163676 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaacctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaagcggtgaatttagat 163775  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtcta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |    
T  163776 tagagattagggttacataagattaaggtttaaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtcaa 163875  T
Q  199 ctcact 204  Q
    ||||||    
T  163876 ctcact 163881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 162812 - 162598
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  162812 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaacccatgttaaaacggtgaatttagat 162713  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  162712 tagaaatcagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 162613  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  162612 tcactcatgttcatc 162598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 173016 - 172860
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgtt-aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatg 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| ||||  ||||||||    || |||||||||||| |||| |    
T  173016 agtttgatacttgttaattcattatgaaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaatttagggttcgaggcatggtttgattagaattagg 172917  T
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |  |||||||||||| |||| ||||    
T  172916 tcatt-agactcatccaacattcccaatacaagaacagtctactcactcatgttcatc 172860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8610 - 8812
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8610 aattgatatttgagatgatggattaccaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaattggtgaatttagat 8709  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8710 tagagattagggttacataagattagggttaa-aacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatcaaacaatcccaagacaaggagaagtctac 8807  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  8808 tcact 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 424779 - 424983
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  424779 aattgatatttgagatgatggattaaccattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtaaatttagat 424878  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  424879 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttgatttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaaggagtctac 424978  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  424979 tcact 424983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 159401 - 159189
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||     
T  159401 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacaatctgataatatttaacccatgttaaaacagtgaatttagaa 159302  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
      || | ||| ||||||||| |||| |||| |  ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  159301 gtgaaactagagttacataatattaaggtttaaggctttacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaggacataagaagtctact 159203  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  159202 cactcatgttcatc 159189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 2972 - 3174
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2972 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaaacggtgaatttagat 3071  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3072 tagagattagggatacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3170  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  3171 cact 3174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49117 - 48914
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49117 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcataccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaccggtgaatttagat 49018  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  49017 tagaaattaggattacataagattaaggtttaaagcttggtttgaataggattatgtcatttagacttatctaacaatcccaaggcaagagaagtctact 48918  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  48917 cact 48914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32051 - 32263
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32051 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 32150  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32151 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 32249  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  32250 cactaatgttcatc 32263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37313 - 37109
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  37313 aattgatatttgagatgatggataaattattatcaaaccttctactttcgtttccacagtttgataatggttgatctatgttaaagcggtgaatttagat 37214  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  37213 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacgagagaagtctact 37115  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  37114 cactga 37109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold1323
Description:

Target: scaffold1323; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 463 - 643
Alignment:
Q  8 atttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagat 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463 atttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttacttcatgttaaaacggtgaatttagattagagat 562  T
Q  108 tagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  563 tagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattagcattatgtcatttaaacttatccaacaatcccaagacaa 643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Original strand, 1814 - 1862
Alignment:
Q  157 tcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcact 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1814 tcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcact 1862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 56449 - 56656
Alignment:
Q  8 atttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagat 107  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  56449 atttgatatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagaaat 56548  T
Q  108 tagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactga 206  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  56549 taggtttatataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactca 56648  T
Q  207 tgtccatc 214  Q
    ||| ||||    
T  56649 tgttcatc 56656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 214
Target Start/End: Original strand, 71998 - 72136
Alignment:
Q  77 catgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaaca 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  71998 catgttaaagcggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaaca 72097  T
Q  177 atcccaagac-aatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  72098 atcccaagacaaagagaagtctactcactcatgttcatc 72136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 110888 - 110675
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  110888 aatttatatttgtgatgatggattaacaattatcaaaccctccacttttgttttcatagtttgataatgtttttttcatgttaatacggtgaatttagat 110789  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  110788 tagagattagggttacataagactagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 110689  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  110688 cactcatgttcatc 110675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 33139 - 33341
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  33139 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 33238  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33239 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 33337  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  33338 cact 33341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17406 - 17608
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17406 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 17505  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17506 tagagattagggttacataagattaatgtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatctcaagacaagagaagtctact 17604  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  17605 cact 17608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6060 - 5846
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6060 aattgatatttgagataatggattaacaattatcaaaccctcccctttcgttttcacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttaggt 5961  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5960 tagaaattagagttacataagattaaggtttaaagcttggtttaattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 5861  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5860 tcactcatgttcatc 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1088 - 1300
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1088 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaactctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 1187  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||    
T  1188 tagagattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagatgtatact 1286  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  1287 cactaatgttcatc 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9068 - 8864
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9068 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 8969  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8968 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 8870  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  8869 cactga 8864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16594 - 16390
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16594 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 16495  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16494 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 16396  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  16395 cactga 16390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 34802 - 35014
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  34802 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 34901  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34902 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 35000  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  35001 cactaatgttcatc 35014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13383 - 13171
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13383 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatgttttattcatgttaaaacggtgaatttagat 13284  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13283 tagagattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttggttaggattatttca-ttagacttatcaaataatcccaagacaagagaagtctact 13185  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    | || |||| ||||    
T  13184 cgctcatgttcatc 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14336 - 14540
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  14336 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 14435  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14436 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 14534  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  14535 cactga 14540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 49784 - 49988
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  49784 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 49883  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49884 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 49982  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  49983 cactga 49988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 30985 - 31045
Alignment:
Q  147 taggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30985 taggattaggtcattt-gacttatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 31045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 31756 - 31816
Alignment:
Q  147 taggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31756 taggattaggtcattt-gactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 31816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 118103 - 117891
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  118103 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaagccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaaagcggtgaatttagat 118004  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  118003 tagagattagggttatataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcctaagacaagagaagtctact 117905  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  117904 cactaatgttcatc 117891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 369268 - 369472
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  369268 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 369367  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  369368 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 369466  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  369467 cactga 369472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Original strand, 24174 - 24281
Alignment:
Q  108 tagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcactga 206  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  24174 tagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcactca 24273  T
Q  207 tgtccatc 214  Q
    ||| ||||    
T  24274 tgttcatc 24281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14052 - 13848
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  14052 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 13953  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  13952 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 13853  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  13852 tcact 13848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2173 - 2387
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  2173 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaatcctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 2272  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2273 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 2372  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  2373 tcactaatgttcatc 2387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 299919 - 300133
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  299919 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 300018  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  300019 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 300118  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  300119 tcactaatgttcatc 300133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1002 - 798
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  1002 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 903  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  902 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 804  T
Q  201 cactga 206  Q
    ||||||    
T  803 cactga 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19766 - 19554
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19766 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttaatcaatgttaaagcggttaatttagat 19667  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19666 tagatattagggttacataagattaatgtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaaatctact 19568  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  19567 cactaatgttcatc 19554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13921 - 14135
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  13921 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacaatttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 14020  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  14021 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 14120  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  14121 tcactcatgttcatc 14135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12298 - 12510
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12298 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgcttctacagattgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 12397  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||     
T  12398 tagaaactagggttacataagattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatctaacaatgccatgacaagagaaatctacg 12496  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12497 cactcatgttcatc 12510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38200
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  38400 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttgcacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 38301  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38300 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 38202  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  38201 ca 38200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 1907
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  2109 aattgatatttgagatgatggacgaacaattatcaaaccctcgattttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttatagcggtgaatttagat 2010  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  2009 tagagattagggttacataagattaaggttgaaagcttagtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaaaaagtctact 1911  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  1910 cact 1907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7591 - 7805
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  7591 aattgatatttgagataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 7690  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| || ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  7691 aagaaatcagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 7790  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7791 tcactcatgttcatc 7805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 1659 - 1763
Alignment:
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||| || | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1659 attagggttacataagattaaggcttagcgcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcact 1758  T
Q  205 gatgt 209  Q
     ||||    
T  1759 catgt 1763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 712 - 926
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  712 aattgatatttgagatgatgcataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 811  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  812 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagaaaagtctac 911  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  912 tcactcatgttcatc 926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24811 - 24597
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24811 aattgatatttggaatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 24712  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24711 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 24612  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24611 tcactcatgttcatc 24597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30881 - 30667
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  30881 aattgatatttggaatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattgagat 30782  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30781 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctac 30682  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  30681 tcactcatgttcatc 30667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 186576 - 186362
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  186576 aattgatatttgagattatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 186477  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  186476 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccatgacaaagagaagtctac 186377  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  186376 tcactcatgttcatc 186362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50094 - 50012
Alignment:
Q  122 attagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagac-ttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  50094 attagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagactttatccaacaatcccaagataagaagagtctactcact 50012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2105 - 2318
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  2105 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagat 2204  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2205 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 2304  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  2305 cactaatgttcatc 2318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3552 - 3340
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||    
T  3552 aattgatatttgagatggtggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcagtgaatttagat 3453  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| | || | || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3452 aagaaattagggttacataagattaagttttaaagtttgatttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 3354  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  3353 cactaatgttcatc 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 118085 - 117873
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  118085 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagatggtgaattcagat 117986  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  117985 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 117887  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  117886 cactaatgttcatc 117873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 124329 - 124117
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  124329 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaagatggtgaattcagat 124230  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  124229 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 124131  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  124130 cactaatgttcatc 124117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21451 - 21655
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||    
T  21451 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccatagtttgataatggttgatccatgttaaaccggtgactttagat 21550  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21551 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcattcagaattatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 21650  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  21651 tcact 21655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Original strand, 26709 - 26802
Alignment:
Q  112 gttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26709 gttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctactcact 26802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10533 - 10736
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10533 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgattcatgttaaagcggtgaatttagat 10632  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtca-tttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtcta 198  Q
     ||| | |||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  10633 aagaaactagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattacgtcattttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtcta 10732  T
Q  199 ctca 202  Q
    ||||    
T  10733 ctca 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2176 - 2385
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  2176 aattgatatttgcgttgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgttttcgtagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaatttagat 2275  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  2276 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgttatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctac 2375  T
Q  200 tcactgatgt 209  Q
    ||||| ||||    
T  2376 tcactcatgt 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5582 - 5395
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5582 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaag 5483  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  5482 gcttagggcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 5395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0760 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0760
Description:

Target: scaffold0760; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5979 - 6193
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  5979 aattgatatttgaaataatggataaacaattatcaaaccctccacattcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 6078  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6079 aagaaattagggttgcataagattaaagtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatctagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 6178  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  6179 tcactaatgttcatc 6193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2801 - 3015
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||| ||  | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  2801 aattgatatttgagatggtgcgtaaacagttatcaaaccctcaactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagtggtgaatttagat 2900  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2901 aagaaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctac 3000  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  3001 tcactaatgttcatc 3015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15439 - 15225
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15439 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 15340  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  15339 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaaaaatcccaagacaaggagaagtctac 15240  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15239 tcactcatgttcatc 15225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12094 - 12306
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12094 aattgatatttgagatgatgaattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaaaagtgaatttagat 12193  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| |   |||||||    
T  12194 tagaaactaggattacataagattagggtttaaagcttggtttgatttggattttgcca-ttagacttatccaataatcccaagacaagaagtgtctact 12292  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  12293 cactcatgttcatc 12306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2016 - 1802
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  2016 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 1917  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctac 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  1916 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttacccaacaatcccaagacaaggagaagtctgc 1817  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  1816 tcactcatgttcatc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0624 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0624
Description:

Target: scaffold0624; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4995 - 4799
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4995 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacagtgaatttagat 4896  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4895 tagagattagg----------------gttaatagcttggtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 4813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Original strand, 60665 - 60809
Alignment:
Q  65 taatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  60665 taatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagaataaggtaaatagcttggtttgattaggattatgtcattaag 60764  T
Q  165 acttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  60765 acttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactcatgt 60809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 60646 - 60613
Alignment:
Q  69 ggttaattcatgttaaaacggtgaatttagatta 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60646 ggttaattcatgttaaaatggtgaatttagatta 60613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1959 - 1772
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  1959 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 1860  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  1859 gcttagggcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 1772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4251 - 4064
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  4251 aattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttacataagattaag 4152  T
Q  128 gttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    | | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  4151 gcttagggcttggtttgattaagattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagaagaagtctactcactcatgttcatc 4064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 121884 - 121689
Alignment:
Q  6 atatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagag 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||     
T  121884 atatttgagatgatggataaacaattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaatcggtgaatttagataagaa 121785  T
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctact 200  Q
    ||||||||||||||| |||| || | | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  121784 attagggttacataaaattaaggcttagagcttgacttgattaggattatgttatttagacttatccaacaatcccaagacaaagagaagtctact 121689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9802 - 9638
Alignment:
Q  38 ccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagct 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  9802 ccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagataaggaattagggttacataagattaaggtttaaagct 9703  T
Q  138 tggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9702 tggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcac 9638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43035 - 42867
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  43035 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaatttagat 42936  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttat 170  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42935 aaggaattagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttat 42867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14370 - 14582
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  14370 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccgtacattttcgcttctacagtttgataatggttaattcatgtaaagacggtgaattcagat 14469  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | || |||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14470 tagaaactaaggttacataagattggggtttaaggcttggttttattaggaatatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctact 14568  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  14569 cactcatgttcatc 14582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 9576 - 9778
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  9576 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctctactttcgtttcttcagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 9675  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9676 gagaaactagggttacataaaattagggtttaaagcttggcttgattaggattatatca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 9774  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  9775 cact 9778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6744 - 6542
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6744 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 6645  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6644 gagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggcttgattaggattatatca-ttggacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 6546  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  6545 cact 6542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11358 - 11156
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11358 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 11259  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11258 gagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggcttgattaggattatatca-ttggacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 11160  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  11159 cact 11156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9353 - 9151
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  9353 aattaatatttgggataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccaaagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 9254  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9253 gagaaactagggttacataaaattagggtttaaggcttggcttgattaggattatatca-ttggacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctact 9155  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  9154 cact 9151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1092
Description:

Target: scaffold1092; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1438 - 1649
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1438 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccattttcgcttctacagtttgattattgttaattcatgttataacaatgaatttagat 1536  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1537 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctagt 1635  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  1636 cactcatgttcatc 1649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1058 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1058
Description:

Target: scaffold1058; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2815 - 3026
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  2815 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccattttcgcttctacagtttgattattgttaattcatgttataacaatgaatttagat 2913  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2914 tagaaattagggttacataaaattagggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaaaagaagtctagt 3012  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  3013 cactcatgttcatc 3026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27707 - 27503
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27707 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 27608  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
      || | |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27607 gggaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattttgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 27508  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  27507 tcact 27503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39703 - 39499
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  39703 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 39604  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
      || | |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39603 gggaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttggtttgatttaggattttgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 39504  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  39503 tcact 39499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 413
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||    
T  628 aattgatatttggaataatggataaacaattatcaaacccttcactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatggtaaagaggtgaatttagat 529  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggt-ttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtcta 198  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  528 aagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtcatgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtcta 429  T
Q  199 ctcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |||| ||||    
T  428 ctcactcatgttcatc 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21423 - 21625
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21423 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 21522  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  21523 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 21621  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  21622 cact 21625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1707 - 1512
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  1707 atggattaatgattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttaca 1608  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  1607 taatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctactcactcatgttcatc 1512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8583 - 8784
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8583 aattgatatttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttttacagtttgataattgttaattcatgttaaaatggtgaatttagat 8681  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||| | || |||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  8682 tagaaactatggttacataaaattagggtttaagacttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 8780  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  8781 cact 8784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 48715 - 48528
Alignment:
Q  18 atggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttaca 117  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  48715 atggattaacgattatcaaagcctacactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttaca 48616  T
Q  118 taagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||| ||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48615 taagcttaaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcact 48528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 83998 - 84210
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |     
T  83998 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggttaatttataa 84097  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||  ||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  84098 gagaaagtagggttacataatattaacgtttaaggcttggcttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagataaaagaagtctact 84196  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  84197 cactcatgttcatc 84210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 70383 - 70501
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70383 aattgatatttgagatgatggattaacaattatcaaaccctccactttcgttttcatagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 70482  T
Q  101 tagagattagggttacata 119  Q
    ||||||||||||||| |||    
T  70483 tagagattagggttanata 70501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2146
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaa----ttcatgttaaaacggtgaattt 96  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| |||||||    
T  1979 aattgatatttgaaataatggattaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgttaatggttaattaattcatgttaaaacgatgaattt 2078  T
Q  97 agattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttag 164  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2079 agattagaaattagagttacataaaattagggtttaaaacttggttcgattaggattatgtcatttag 2146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17344 - 17170
Alignment:
Q  41 tccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||    
T  17344 tccactttcgtttccacagtttgataatggttgatccatgttaaagcggtgaattttgataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttgg 17245  T
Q  141 tttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca-atagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17244 cttgattaggattatgtcatttagacttattcaacaatcctaagacatagagaagtctactcactcatgttcatc 17170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1442 - 1243
Alignment:
Q  8 atttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagat 107  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  1442 atttgagatgatgaattaacaatta-ctaaccctccactttcgcttcatgagtttgataattgttaattcatgtgaaaatggtgaatttagattagaaat 1344  T
Q  108 tagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgat 207  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  1343 tagggttacataatattaaggtttaaggcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcat 1245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5558
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5770 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccttccactttcgtttccacagtttgaaaatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 5671  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  5670 gagaaactagggttacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 5572  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  5571 cactcatgttcatc 5558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Original strand, 37742 - 37907
Alignment:
Q  40 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||| |  | |||    
T  37742 ctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaactgtgaatttagaagagaaactagggttacataagattaaggtttaatgtttg 37841  T
Q  140 gtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37842 gtttgatttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaaaacaagagaagtctactcact 37907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18517 - 18721
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  18517 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccattttcgtttccacggtttgataatatttaatccatgtgaaaacggtgaatttagaa 18616  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | ||||||||||||| |||  |||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18617 gagaaactagggttacataatattgaggtttaaggtttggtttgatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctac 18716  T
Q  200 tcact 204  Q
    |||||    
T  18717 tcact 18721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 130 - 342
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    ||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  130 aattaatatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccagagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 229  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | ||||||||||||| |||| | || |  |||||  || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  230 gagaaactagggttacataatattaagattgaaggcttgactttattatgattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacataagaagtctact 328  T
Q  201 cactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||| ||||    
T  329 cactcatgttcatc 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 214
Target Start/End: Original strand, 17730 - 17849
Alignment:
Q  95 ttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaag 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17730 ttagattagagattagtgttacataagattagggtcaatagcttggtttgattaggattatgtcattaagacttatccaacaatcccaagacaagagaag 17829  T
Q  195 tctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  17830 tctactcactcatgttcatc 17849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5112 - 4926
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    ||||||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5112 aattaatatttggaattatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 5013  T
Q  101 tagagatta-gggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagaca 187  Q
     ||| | || ||||||||||| |||| ||||    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5012 gagaaactaggggttacataatattaaggtttgaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagaca 4926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19697 - 19495
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19697 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttaaaa 19598  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  | |||||||| |||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||    
T  19597 gagtaactagggttatataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaatcccaagacataaaaagtctact 19499  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  19498 cact 19495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Original strand, 25343 - 25500
Alignment:
Q  58 agtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgt 157  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |    
T  25343 agtttgataatggttgatccatgttaagacggtgaattcagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattattt 25442  T
Q  158 catttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||    
T  25443 catttagacttatccaacaatcccaagacaaggaaaagtctactcactcatgttcatc 25500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26526 - 26324
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  26526 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctctactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttaaaa 26427  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||  | |||||||| |||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||    
T  26426 gagtaactagggttatataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttattcaacaatcccaagacataaaaagtctact 26328  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  26327 cact 26324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23483 - 23281
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23483 aattaacatttggaatgatggattaacgattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 23384  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | |||||||| |||| | || |||| |  |||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  23383 gagaaactagggttatataatactaaggtttaaggcttgacttaattaggattatgtca-ttagacttatccaacaaccccaagacataagaagcctact 23285  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  23284 cact 23281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19909 - 19797
Alignment:
Q  102 agagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19909 agagattagggttacataagattagggtcaatagcttggtttgattagtattatgtcatttagacttatccaacaattccaagacaaaagaagtctactc 19810  T
Q  202 actgatgtccatc 214  Q
    ||| |||| ||||    
T  19809 actcatgttcatc 19797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 62142 - 61976
Alignment:
Q  40 ctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttg 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||| |  | |||    
T  62142 ctccagtttcgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaagagaaactagggttacataagattaaggtttaaggtttg 62043  T
Q  140 gtttga-ttaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactga 206  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  62042 gttcaatttaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaga-aagagaagtctactcactga 61976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1545 - 1758
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1545 aattaacatttggaataatggattaatgattatcaaaccctccactttcgtttccacggtttgatgatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 1644  T
Q  101 tagagattagggttacataagatt-agggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctac 199  Q
     ||| | || |||||||||| ||| ||| || |  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1645 gagaaactaaggttacataatattaaggttttaaggcttgacctgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagatataagaagtctac 1743  T
Q  200 tcactgatgtccatc 214  Q
    ||||| |||| ||||    
T  1744 tcacttatgttcatc 1758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19173 - 18984
Alignment:
Q  15 atgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgtt-aaaacggtgaatttagattagagattagggt 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||| | ||||||    
T  19173 atgatggattaacgattatcaaactctccactttcgtttccacagttagataatatttaatccatgttaaaaacgatgaatttagaagagaaactagggt 19074  T
Q  114 tacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    ||||||| |||| |||| |  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  19073 tacataatattaaggtttaaggcttgacttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatccaaagacataagaagtctactcact 18984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3572 - 3444
Alignment:
Q  87 cggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac 186  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3572 cggtgaatttagataagaaattagggttacataagattaaggcttagagcttggcttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagac 3473  T
Q  187 aa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  3472 aaggagaagtctactcactcatgttcatc 3444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 104950 - 105074
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||  |||||||||||||    
T  104950 aattgatatttgagatgatggataaacaattatcaaaccatccactttcgtttccacagtttgatactgattgatccatgttaaagtggtgaatttagat 105049  T
Q  101 tagagattagggttacataagatta 125  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  105050 aagaaattagggttacataagatta 105074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Original strand, 2 - 109
Alignment:
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactg 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  2 attagggttacataagattaaggtttaaagcttggtttgattaggattatgtca-ttagacttatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcacta 100  T
Q  206 atgtccatc 214  Q
    |||| ||||    
T  101 atgttcatc 109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 169111 - 169312
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  169111 aattaacatttggaatgatggatcaacgattatcataccctccactttcgtttccacagtttgataa-atttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 169209  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
     ||| | |||||||| || | | || |||| |  |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||    
T  169210 gagaaactagggttatattatactaaggtttaaggcttgacttgatcaggattatgtca-ttagacttatccaaaaatcccaagacataagaagtctact 169308  T
Q  201 cact 204  Q
    ||||    
T  169309 cact 169312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Original strand, 33802 - 33911
Alignment:
Q  106 attagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33802 attagggttacataagattaaggcttagagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcact 33901  T
Q  205 gatgtccatc 214  Q
     |||| ||||    
T  33902 catgttcatc 33911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44066 - 44251
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44066 aattgatatttgagatgatgaattaataatta-ctaaccctccactttcgcttctacaatttgatatttgttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 44164  T
Q  101 tagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    || | |||||||||   |||||             |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  44165 taaaaattagggtt---taaga-------------cttgatttgattacgattatgtcatt-agacttatccaacaatcccaagacaagaagagtctact 44247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Original strand, 6790 - 6970
Alignment:
Q  35 aaaccctccactttc-gtttccac-agtttgataatggttaattcatgttaaaa-cggtgaattt-agattagagattaggg-ttacataagatta-ggg 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||    
T  6790 aaaccctccactttccgtttccactagtttgataatggttgatccatatttaaagcggtgaattttagataaggaattaggggttacataagattaaggg 6889  T
Q  129 ttaatag-cttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccc-aagacaatag-aagtctactcactga 206  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  6890 tttaaagtcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaaagacaagagaaagtctactcactga 6970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48026 - 47829
Alignment:
Q  28 aattatcaaaccct-ccactttcgtttccacag-tttgat-aatggtt-aattcatgttaaaacggtgaatttagattagagattagggtt-acataaga 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  48026 aattatcaaaccctaccactttcgtttccacagttttgataaatggttaaatccatgttaagacggtgaattcagataagaaactagggttaacataaga 47927  T
Q  123 ttagggttaatagc-ttggtttgattaggattatgtc-atttagacttatcaaacaat-cccaag-aca--atagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||| || | |  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  47926 ttaaggcttagggctttggtttgattaggattatgtcaatttagacttatccaacaatacccaagaacaagaaagaagtctactcactcatgttcatc 47829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 74293 - 74174
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttagat 100  Q
    |||||| |||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  74293 aattaacatttggaataatggattaacgattatcaaaccctccacttttgtttccacagtttgataatatttaatccatgttaaaacggtgaatttagaa 74194  T
Q  101 tagagattagggttacataa 120  Q
     ||| | |||||||||||||    
T  74193 gagaaactagggttacataa 74174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Original strand, 8915 - 8977
Alignment:
Q  37 accctccactttcgtttccacagtttgataatggttaattcatgttaaaacggtgaatttaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8915 accctccactttcgtttccacagtttgataatggttaactcatgttaaaacggtcaatttaga 8977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Original strand, 8977 - 9043
Alignment:
Q  134 agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8977 agcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaagagaattctact 9043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22533 - 22604
Alignment:
Q  1 aattaatatttgagatgatggattaataattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggtt 72  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22533 aattgatatttgggataatggataaacaattatcaaaccctccactttcgtttccacagtttgataatggtt 22604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4040 - 3972
Alignment:
Q  142 ttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  4040 ttgattaggattatgtcatttagacttatccaacaatcccaagacaaaaagaagtctactcactcatgt 3972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6663
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | |  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||    
T  6543 aaaacggtgaaattagattagaaagtggatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttaggcttatccaacaatccca 6641  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  6642 agacaagaagagtctactcact 6663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 9058 - 9178
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||  ||| |||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9058 aaaacagtgaatttagattagaaagtagatttatataaaattagagtttatggtttggtttgattaggattacgtca-ttagatttatccaacaatccca 9156  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |  ||||||||||||    
T  9157 agacaagaagagtctactcact 9178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 22261 - 22381
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  22261 aaaacggtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttggtttgattaggattacgtcatt-agacttatccatcaatccca 22359  T
Q  183 agacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||| |   |||||||||||    
T  22360 agacaagaagtgtctactcact 22381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49945 - 49820
Alignment:
Q  83 aaaacggtgaatttagattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatccca 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||| || | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  49945 aaaacagtgaaattagattagaaagtagatttatataaaattagggtttatggtttagtttgattaggattacgtca-ttagacttatccaaaaatccca 49847  T
Q  183 agacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||    
T  49846 agacaagaaaggtctactcacttatgt 49820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38773 - 38664
Alignment:
Q  98 gattagagattagggttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtct 197  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||    ||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  38773 gattagaaaatagggttacataaaattagggttctaggcttggtttgaatatgattaggtca-ttagactcatccaacaatctcaagacaa-agaagtct 38676  T
Q  198 actcactgatgt 209  Q
    ||||||| ||||    
T  38675 actcactcatgt 38664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1871 - 1772
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtcca 212  Q
    |||||||| |||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||    
T  1871 ttacataaaattagggtcataggcttggtttgaataggattaggtca-ttagactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtttactcactcatgttca 1774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0855
Description:

Target: scaffold0855; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3690 - 3596
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3690 ttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0847
Description:

Target: scaffold0847; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3855 - 3761
Alignment:
Q  113 ttacataagattagggttaatagcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3855 ttacataaaattagggttcgaggcttggtttgatagggattaggtcatt-agactcatccaacaatcccaagacaa-agaagtctactcactcatgt 3761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21371 - 21308
Alignment:
Q  140 gtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  21371 gtttgattaggattatgtcatt-agacttatccaacaatcccaaaacaagaagagtctactcact 21308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21797 - 21748
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21797 gcttggtttgattaggattatgtca-ttagatttatccaacaatcccaaga 21748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4719 - 4658
Alignment:
Q  142 ttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcact 204  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4719 ttgattaggattacatcatt-agacttatccaacaatcccaagtcaaaagaagtctactcact 4658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14291 - 14218
Alignment:
Q  135 gcttggtttgattaggattatgtcatttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgt 209  Q
    |||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  14291 gcttggttcgatagggattaggtcatt-agacttatcaaacaatcccaagacaagaagagtctactcactcatgt 14218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6841 - 6785
Alignment:
Q  159 atttagacttatcaaacaatcccaagac-aatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6841 atttagacttatccaacaatcccaagacaaaaagaagtctactcactcatgttcatc 6785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5266 - 5210
Alignment:
Q  159 atttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  5266 atttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 5210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Original strand, 11753 - 11799
Alignment:
Q  168 tatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11753 tatccaacaatcccaagacaagagaagtctactcactaatgttcatc 11799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33822 - 33768
Alignment:
Q  161 ttagacttatcaaacaatcccaagacaa-tagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  33822 ttagacttatccaacaatcccaagacaaggagaagtctactcactcatgttcatc 33768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21496 - 21443
Alignment:
Q  161 ttagacttatcaaacaatcccaagacaatagaagtctactcactgatgtccatc 214  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  21496 ttagacctatccaacaatcccaagacaagaaaagtctactcactcatgttcatc 21443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University