View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4611_high_11 (Length: 325)

Name: NF4611_high_11
Description: NF4611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4611_high_11
NF4611_high_11
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (1-300)||(10811-11110)
chr5 (1-300)||(29192137-29192435)
chr5 (5-300)||(21075006-21075302)
chr5 (5-300)||(21933678-21933973)
chr5 (5-300)||(21939848-21940143)
chr5 (5-300)||(35580719-35581014)
chr5 (5-300)||(37010682-37010977)
chr5 (5-300)||(25901844-25902139)
chr5 (5-300)||(37051449-37051744)
chr5 (5-300)||(21234924-21235220)
chr5 (5-300)||(20615077-20615372)
chr5 (21-300)||(22368001-22368282)
chr5 (1-300)||(25425082-25425382)
chr5 (1-300)||(19498260-19498560)
chr5 (1-300)||(11341096-11341396)
chr5 (1-300)||(9732185-9732484)
chr5 (5-300)||(24594965-24595261)
chr5 (5-300)||(4201484-4201780)
chr5 (5-318)||(27008476-27008790)
chr5 (25-298)||(16534791-16535064)
chr5 (5-300)||(23327417-23327713)
chr5 (5-300)||(43445271-43445571)
chr5 (21-300)||(10779696-10779977)
chr5 (25-318)||(22884682-22884976)
chr5 (21-300)||(110501-110782)
chr5 (21-300)||(1221248-1221529)
chr5 (21-298)||(11213124-11213401)
chr5 (42-298)||(35792654-35792907)
chr5 (206-300)||(7424343-7424437)
chr5 (206-300)||(18779513-18779607)
chr5 (5-116)||(7424067-7424178)
chr5 (206-300)||(17473289-17473384)
chr5 (205-300)||(23513461-23513557)
chr5 (21-101)||(23510395-23510475)
chr5 (205-300)||(23510655-23510751)
chr5 (21-298)||(4863740-4864025)
chr5 (205-300)||(11582539-11582635)
chr5 (205-300)||(20710802-20710898)
chr5 (205-300)||(28258265-28258361)
chr5 (207-300)||(21652802-21652896)
chr5 (21-101)||(17473566-17473645)
chr5 (205-300)||(21392853-21392949)
chr5 (205-298)||(25192518-25192611)
chr5 (21-123)||(27185420-27185521)
chr5 (21-116)||(1170320-1170414)
chr5 (42-101)||(18779788-18779847)
chr5 (21-123)||(21661310-21661411)
chr5 (21-116)||(21392605-21392699)
chr5 (21-116)||(21653051-21653145)
chr5 (206-300)||(24184613-24184708)
chr5 (21-116)||(24470711-24470805)
chr5 (25-99)||(11582325-11582398)
chr5 (205-300)||(1170061-1170157)
chr5 (173-298)||(21649463-21649588)
chr5 (21-88)||(25211623-25211689)
chr5 (21-88)||(25275775-25275841)
chr5 (207-298)||(27185236-27185327)
chr5 (42-116)||(28258021-28258094)
chr5 (72-123)||(21615537-21615588)
chr5 (72-123)||(23492528-23492579)
chr5 (72-122)||(19860758-19860808)
chr5 (72-117)||(13793655-13793700)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (1-300)||(2450725-2451024)
chr3 (1-300)||(22273504-22273803)
chr3 (1-300)||(18909149-18909448)
chr3 (5-300)||(1469051-1469346)
chr3 (5-300)||(8269800-8270096)
chr3 (5-300)||(8276911-8277207)
chr3 (5-300)||(8305720-8306016)
chr3 (5-300)||(30151797-30152093)
chr3 (5-318)||(27839168-27839483)
chr3 (5-300)||(53769121-53769417)
chr3 (2-300)||(16819367-16819667)
chr3 (5-300)||(44227888-44228185)
chr3 (5-300)||(45859480-45859776)
chr3 (7-300)||(16745569-16745862)
chr3 (5-300)||(13956200-13956498)
chr3 (5-300)||(13977032-13977331)
chr3 (5-300)||(41268702-41268998)
chr3 (5-300)||(12265889-12266183)
chr3 (25-318)||(49230696-49230990)
chr3 (1-297)||(15613523-15613816)
chr3 (1-300)||(15574504-15574800)
chr3 (1-300)||(15469866-15470161)
chr3 (5-300)||(55314842-55315152)
chr3 (1-300)||(15939859-15940160)
chr3 (3-300)||(14846060-14846357)
chr3 (1-147)||(23081716-23081862)
chr3 (21-298)||(33340320-33340599)
chr3 (21-298)||(17913653-17913930)
chr3 (21-298)||(23490983-23491262)
chr3 (21-298)||(2048538-2048816)
chr3 (42-298)||(16259544-16259797)
chr3 (1-101)||(18905354-18905454)
chr3 (21-298)||(19945107-19945382)
chr3 (19-298)||(5227193-5227471)
chr3 (21-298)||(51159880-51160161)
chr3 (21-298)||(10737036-10737312)
chr3 (21-114)||(19262602-19262695)
chr3 (205-300)||(15860546-15860642)
chr3 (205-300)||(13816175-13816271)
chr3 (21-119)||(30141363-30141460)
chr3 (21-117)||(17957994-17958090)
chr3 (205-300)||(19572171-19572267)
chr3 (21-116)||(25057250-25057345)
chr3 (21-281)||(50113547-50113816)
chr3 (189-300)||(18905197-18905307)
chr3 (205-300)||(17099376-17099472)
chr3 (205-300)||(30205116-30205212)
chr3 (21-116)||(17099088-17099182)
chr3 (21-116)||(19572429-19572523)
chr3 (21-123)||(319200-319301)
chr3 (42-123)||(8630338-8630419)
chr3 (206-300)||(16183410-16183509)
chr3 (21-116)||(15860807-15860901)
chr3 (22-117)||(19230531-19230625)
chr3 (205-298)||(25057510-25057603)
chr3 (21-116)||(6148456-6148548)
chr3 (205-261)||(11813528-11813584)
chr3 (205-300)||(22145673-22145768)
chr3 (206-300)||(14297161-14297256)
chr3 (206-300)||(14302788-14302883)
chr3 (21-116)||(16183664-16183758)
chr3 (206-300)||(35122350-35122445)
chr3 (207-308)||(17957727-17957828)
chr3 (21-91)||(45581313-45581382)
chr3 (205-300)||(17523809-17523905)
chr3 (21-116)||(30204870-30204962)
chr3 (234-300)||(6148241-6148308)
chr3 (21-116)||(11813310-11813404)
chr3 (208-298)||(19230726-19230816)
chr3 (21-116)||(22145881-22145975)
chr3 (44-122)||(7852301-7852379)
chr3 (205-298)||(7852471-7852564)
chr3 (56-123)||(12351432-12351499)
chr3 (206-300)||(53899921-53900016)
chr3 (205-298)||(8630510-8630603)
chr3 (205-261)||(14522747-14522804)
chr3 (205-300)||(17138128-17138225)
chr3 (72-123)||(5229669-5229720)
chr3 (72-123)||(15874686-15874737)
chr3 (72-123)||(48420193-48420244)
chr3 (207-261)||(47786311-47786365)
chr3 (72-117)||(14523004-14523049)
chr3 (205-309)||(40938393-40938498)
chr3 (72-116)||(9592349-9592393)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (1-300)||(19888177-19888476)
chr2 (5-300)||(28777098-28777393)
chr2 (5-300)||(11232650-11232945)
chr2 (5-300)||(22514497-22514792)
chr2 (5-300)||(5889694-5889990)
chr2 (5-300)||(14907837-14908132)
chr2 (5-300)||(20013585-20013880)
chr2 (5-300)||(23818642-23818937)
chr2 (5-300)||(12726515-12726811)
chr2 (1-300)||(34822656-34822956)
chr2 (5-300)||(23772999-23773295)
chr2 (1-318)||(8942104-8942423)
chr2 (1-300)||(21140335-21140636)
chr2 (1-300)||(3800510-3800811)
chr2 (1-300)||(12637562-12637863)
chr2 (1-300)||(21275924-21276225)
chr2 (5-300)||(17397994-17398290)
chr2 (5-300)||(24687066-24687363)
chr2 (21-300)||(12643424-12643703)
chr2 (1-300)||(24827967-24828259)
chr2 (1-279)||(22692748-22693028)
chr2 (1-279)||(22697395-22697675)
chr2 (1-150)||(24832562-24832711)
chr2 (1-254)||(22282576-22282831)
chr2 (1-298)||(22273343-22273642)
chr2 (206-300)||(461402-461497)
chr2 (1-92)||(25211338-25211429)
chr2 (21-298)||(43644378-43644654)
chr2 (21-123)||(8886612-8886713)
chr2 (205-300)||(20628793-20628889)
chr2 (205-300)||(24966960-24967056)
chr2 (208-300)||(36892110-36892203)
chr2 (21-101)||(461142-461221)
chr2 (21-117)||(25877616-25877711)
chr2 (205-298)||(15632060-15632153)
chr2 (21-117)||(20629015-20629111)
chr2 (21-101)||(24966693-24966772)
chr2 (21-117)||(36892358-36892453)
chr2 (22-101)||(9654505-9654583)
chr2 (21-117)||(15631867-15631963)
chr2 (205-300)||(22691351-22691447)
chr2 (205-300)||(22695998-22696094)
chr2 (206-300)||(269851-269946)
chr2 (21-298)||(6877914-6878199)
chr2 (21-123)||(22861959-22862060)
chr2 (206-300)||(4449630-4449725)
chr2 (207-300)||(25600626-25600720)
chr2 (21-123)||(25600432-25600533)
chr2 (205-261)||(22581374-22581431)
chr2 (267-300)||(25877350-25877383)
chr2 (207-299)||(27260248-27260341)
chr2 (42-123)||(19435060-19435143)
chr2 (72-123)||(4878-4929)
chr2 (72-123)||(19658471-19658522)
chr2 (72-123)||(19670731-19670782)
chr2 (72-123)||(23823110-23823161)
chr2 (72-123)||(23825054-23825105)
chr2 (72-123)||(23832189-23832240)
chr2 (72-123)||(24296174-24296225)
chr2 (72-123)||(25304090-25304141)
chr2 (206-298)||(9654231-9654323)
chr2 (205-300)||(22787438-22787535)
chr2 (72-116)||(22137424-22137468)
chr2 (72-116)||(24272580-24272624)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (1-300)||(25174020-25174319)
chr6 (5-300)||(27655484-27655780)
chr6 (5-300)||(10487348-10487643)
chr6 (5-300)||(16377684-16377979)
chr6 (5-300)||(16385008-16385303)
chr6 (1-300)||(33315979-33316280)
chr6 (1-300)||(23976033-23976334)
chr6 (5-300)||(16230049-16230345)
chr6 (5-300)||(29870872-29871169)
chr6 (5-300)||(14628009-14628305)
chr6 (5-300)||(26088303-26088599)
chr6 (5-300)||(16650643-16650940)
chr6 (20-300)||(23993644-23993925)
chr6 (5-300)||(16557413-16557710)
chr6 (43-298)||(16827278-16827534)
chr6 (1-300)||(1651350-1651646)
chr6 (21-300)||(4989381-4989662)
chr6 (1-300)||(1659111-1659407)
chr6 (1-300)||(11214603-11214903)
chr6 (21-300)||(16238849-16239129)
chr6 (47-300)||(15861243-15861491)
chr6 (21-298)||(19984607-19984884)
chr6 (21-298)||(1554325-1554600)
chr6 (5-183)||(16642526-16642705)
chr6 (206-300)||(19609167-19609261)
chr6 (8-116)||(22227260-22227369)
chr6 (206-300)||(18088111-18088206)
chr6 (208-300)||(22227040-22227133)
chr6 (5-116)||(18088371-18088482)
chr6 (5-116)||(19608891-19609002)
chr6 (212-300)||(17343683-17343772)
chr6 (205-300)||(18004373-18004469)
chr6 (205-300)||(35017082-35017177)
chr6 (18-116)||(17343846-17343945)
chr6 (21-116)||(18004634-18004729)
chr6 (21-116)||(18825419-18825513)
chr6 (21-116)||(18843480-18843574)
chr6 (21-123)||(31626914-31627015)
chr6 (208-300)||(18431304-18431397)
chr6 (21-101)||(13622798-13622877)
chr6 (205-300)||(25646227-25646323)
chr6 (21-116)||(25646517-25646611)
chr6 (208-297)||(18825162-18825251)
chr6 (21-298)||(18128757-18129046)
chr6 (208-298)||(15736583-15736674)
chr6 (21-116)||(18422210-18422304)
chr6 (205-295)||(18843225-18843315)
chr6 (21-116)||(25745897-25745991)
chr6 (24-101)||(18740861-18740937)
chr6 (44-123)||(22428673-22428752)
chr6 (207-300)||(13622514-13622608)
chr6 (224-300)||(18569274-18569350)
chr6 (21-94)||(18775687-18775759)
chr6 (205-300)||(31627106-31627202)
chr6 (207-300)||(16084086-16084180)
chr6 (207-300)||(16105228-16105322)
chr6 (42-116)||(35017302-35017376)
chr6 (208-300)||(13016185-13016278)
chr6 (205-300)||(18397594-18397690)
chr6 (44-123)||(16105056-16105135)
chr6 (208-298)||(18775882-18775972)
chr6 (234-298)||(22430945-22431009)
chr6 (43-87)||(32896494-32896538)
chr6 (72-123)||(18383276-18383327)
chr6 (72-123)||(34965471-34965522)
chr6 (206-290)||(18741119-18741203)
chr6 (208-300)||(32897394-32897487)
chr6 (72-116)||(19852796-19852840)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-300)||(5641-5940)
scaffold0003 (1-298)||(217153-217451)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (1-300)||(16416929-16417228)
chr7 (5-300)||(7821390-7821685)
chr7 (5-300)||(7828701-7828996)
chr7 (5-300)||(27175082-27175377)
chr7 (5-300)||(38785041-38785336)
chr7 (5-300)||(11514588-11514883)
chr7 (5-300)||(27102949-27103244)
chr7 (5-300)||(27110297-27110592)
chr7 (5-300)||(30263526-30263821)
chr7 (5-300)||(15442961-15443256)
chr7 (5-300)||(10988077-10988373)
chr7 (5-300)||(25293680-25293976)
chr7 (5-300)||(13757044-13757341)
chr7 (5-300)||(26010593-26010890)
chr7 (5-300)||(13912515-13912811)
chr7 (47-300)||(42057565-42057819)
chr7 (21-298)||(369367-369646)
chr7 (18-300)||(18255224-18255508)
chr7 (25-300)||(15952496-15952772)
chr7 (1-300)||(2436090-2436386)
chr7 (21-298)||(32495960-32496239)
chr7 (133-300)||(15525886-15526056)
chr7 (5-117)||(15518443-15518555)
chr7 (21-298)||(15761775-15762050)
chr7 (206-300)||(18981309-18981403)
chr7 (206-300)||(16480338-16480432)
chr7 (5-116)||(18981568-18981680)
chr7 (206-300)||(15926034-15926129)
chr7 (5-116)||(15925758-15925869)
chr7 (206-300)||(36051331-36051426)
chr7 (5-116)||(2192357-2192469)
chr7 (5-116)||(16480587-16480699)
chr7 (21-300)||(26071668-26071956)
chr7 (21-300)||(26095455-26095743)
chr7 (206-300)||(16210447-16210542)
chr7 (79-298)||(2027095-2027316)
chr7 (206-300)||(11582243-11582338)
chr7 (21-298)||(3893569-3893854)
chr7 (205-300)||(12545115-12545211)
chr7 (205-300)||(15823813-15823909)
chr7 (205-300)||(44863908-44864004)
chr7 (42-117)||(1938364-1938439)
chr7 (21-99)||(11582551-11582628)
chr7 (234-300)||(13571526-13571592)
chr7 (205-300)||(13867477-13867573)
chr7 (205-300)||(47288440-47288536)
chr7 (21-119)||(7291259-7291355)
chr7 (44-123)||(12753377-12753456)
chr7 (206-300)||(13038507-13038602)
chr7 (21-116)||(13867687-13867781)
chr7 (92-298)||(125378-125585)
chr7 (209-298)||(142296-142386)
chr7 (73-298)||(3058582-3058806)
chr7 (25-98)||(122986-123059)
chr7 (21-113)||(112899-112990)
chr7 (22-101)||(36051071-36051149)
chr7 (205-298)||(7291519-7291612)
chr7 (21-99)||(13038825-13038902)
chr7 (206-298)||(2192101-2192193)
chr7 (21-116)||(44863618-44863712)
chr7 (21-123)||(45453844-45453944)
chr7 (21-114)||(15824105-15824197)
chr7 (24-116)||(142046-142137)
chr7 (207-298)||(1938176-1938266)
chr7 (21-101)||(16210186-16210265)
chr7 (5-53)||(42059941-42059989)
chr7 (207-281)||(12753549-12753623)
chr7 (21-99)||(47288151-47288228)
chr7 (42-98)||(11285642-11285698)
chr7 (55-116)||(9322663-9322727)
chr7 (21-78)||(3055196-3055253)
chr7 (207-298)||(45453661-45453754)
chr7 (72-123)||(4483269-4483320)
chr7 (72-123)||(9058224-9058275)
chr7 (72-123)||(13388489-13388540)
chr7 (207-261)||(11285878-11285932)
chr7 (207-261)||(12249556-12249610)
chr7 (21-117)||(12545402-12545498)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (5-300)||(2975-3270)
scaffold0124 (207-298)||(23102-23194)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-300)||(18246648-18246947)
chr4 (5-300)||(10487133-10487428)
chr4 (5-300)||(16329323-16329618)
chr4 (1-300)||(19998985-19999286)
chr4 (1-300)||(47355783-47356084)
chr4 (5-300)||(13049563-13049859)
chr4 (5-300)||(26337947-26338243)
chr4 (5-300)||(14950482-14950777)
chr4 (1-300)||(26678502-26678802)
chr4 (21-300)||(15274159-15274439)
chr4 (21-298)||(22355965-22356242)
chr4 (1-296)||(14994658-14994951)
chr4 (1-181)||(15138077-15138258)
chr4 (56-298)||(16521301-16521544)
chr4 (21-298)||(5684305-5684583)
chr4 (1-105)||(8372931-8373035)
chr4 (21-298)||(109960-110236)
chr4 (21-255)||(15211817-15212054)
chr4 (205-300)||(18167456-18167551)
chr4 (206-300)||(15288409-15288503)
chr4 (206-300)||(15295519-15295613)
chr4 (1-116)||(18167175-18167291)
chr4 (5-116)||(15288611-15288722)
chr4 (5-116)||(15295778-15295889)
chr4 (205-300)||(10642849-10642945)
chr4 (206-300)||(13245115-13245210)
chr4 (205-300)||(54119661-54119757)
chr4 (205-300)||(33738927-33739023)
chr4 (21-116)||(10642589-10642684)
chr4 (205-300)||(44345489-44345585)
chr4 (205-300)||(45460357-45460453)
chr4 (21-116)||(9293927-9294022)
chr4 (205-298)||(9294187-9294280)
chr4 (21-300)||(12901172-12901459)
chr4 (205-300)||(53706190-53706286)
chr4 (21-116)||(16366360-16366454)
chr4 (205-298)||(7133851-7133945)
chr4 (172-298)||(25120524-25120650)
chr4 (205-300)||(53909170-53909266)
chr4 (22-116)||(53909430-53909523)
chr4 (21-123)||(12837914-12838017)
chr4 (21-94)||(44054334-44054406)
chr4 (205-300)||(44054584-44054680)
chr4 (21-101)||(54119904-54119983)
chr4 (44-123)||(21961155-21961234)
chr4 (21-99)||(13244768-13244845)
chr4 (205-298)||(34393716-34393809)
chr4 (42-123)||(8874080-8874161)
chr4 (205-309)||(13751685-13751790)
chr4 (42-117)||(44345260-44345335)
chr4 (205-298)||(8873896-8873989)
chr4 (21-115)||(33738638-33738731)
chr4 (42-123)||(14899970-14900053)
chr4 (42-117)||(43283041-43283118)
chr4 (23-88)||(7134088-7134152)
chr4 (234-298)||(8373045-8373109)
chr4 (205-281)||(21960987-21961064)
chr4 (207-251)||(30235942-30235986)
chr4 (72-123)||(12245848-12245899)
chr4 (72-123)||(15852912-15852963)
chr4 (21-95)||(7848829-7848902)
chr4 (46-117)||(52267123-52267196)
chr4 (72-116)||(41257951-41257995)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (6-300)||(41392914-41393208)
chr1 (5-300)||(17003286-17003581)
chr1 (5-300)||(51451074-51451369)
chr1 (5-300)||(22034309-22034605)
chr1 (1-300)||(17147238-17147539)
chr1 (5-300)||(20826629-20826925)
chr1 (5-300)||(18602451-18602747)
chr1 (5-300)||(5073708-5074004)
chr1 (5-308)||(7641990-7642286)
chr1 (1-300)||(22226439-22226738)
chr1 (1-300)||(45050144-45050440)
chr1 (21-300)||(22352604-22352885)
chr1 (146-300)||(22029299-22029454)
chr1 (1-298)||(44036308-44036607)
chr1 (1-138)||(35935143-35935280)
chr1 (25-299)||(15862839-15863108)
chr1 (1-298)||(20929930-20930228)
chr1 (206-300)||(18061015-18061109)
chr1 (206-300)||(21651342-21651436)
chr1 (6-116)||(21651601-21651712)
chr1 (5-101)||(29137281-29137376)
chr1 (206-300)||(22365417-22365512)
chr1 (21-298)||(37845874-37846159)
chr1 (208-300)||(18506021-18506114)
chr1 (21-123)||(20444217-20444318)
chr1 (205-300)||(20895098-20895194)
chr1 (208-300)||(49966313-49966406)
chr1 (205-300)||(22407601-22407697)
chr1 (205-300)||(41210707-41210803)
chr1 (21-116)||(22365158-22365253)
chr1 (205-300)||(2422377-2422473)
chr1 (21-101)||(20529981-20530060)
chr1 (56-119)||(22250618-22250681)
chr1 (21-116)||(49966058-49966152)
chr1 (205-298)||(22250362-22250455)
chr1 (21-116)||(9785898-9785992)
chr1 (21-116)||(22407893-22407987)
chr1 (21-99)||(20895406-20895483)
chr1 (42-123)||(35053332-35053413)
chr1 (21-116)||(2422732-2422826)
chr1 (206-300)||(35523826-35523921)
chr1 (205-298)||(41218115-41218208)
chr1 (24-117)||(5676199-5676291)
chr1 (206-298)||(21716868-21716961)
chr1 (29-101)||(21857966-21858037)
chr1 (205-298)||(5676009-5676102)
chr1 (258-300)||(20122065-20122107)
chr1 (205-298)||(35053504-35053597)
chr1 (21-117)||(22836909-22837006)
chr1 (205-298)||(9785642-9785735)
chr1 (42-117)||(20956625-20956702)
chr1 (72-123)||(37235553-37235604)
chr1 (74-116)||(18505814-18505856)
chr1 (205-298)||(20526780-20526873)
chr1 (205-253)||(2422531-2422579)
chr1 (72-116)||(5471983-5472027)
chr1 (72-116)||(22144991-22145035)
chr1 (72-116)||(41213266-41213310)
chr1 (205-261)||(51657770-51657826)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (5-300)||(642953-643248)
chr8 (5-300)||(272601-272896)
chr8 (5-300)||(828759-829054)
chr8 (5-300)||(5236658-5236953)
chr8 (5-300)||(24662645-24662940)
chr8 (5-300)||(43684117-43684412)
chr8 (1-300)||(3432974-3433274)
chr8 (5-300)||(21845889-21846185)
chr8 (5-300)||(21853294-21853590)
chr8 (5-300)||(16675724-16676020)
chr8 (5-318)||(224542-224857)
chr8 (5-318)||(738165-738480)
chr8 (5-318)||(862060-862375)
chr8 (17-300)||(16874336-16874621)
chr8 (5-300)||(22089841-22090138)
chr8 (5-318)||(700955-701270)
chr8 (5-300)||(15320457-15320754)
chr8 (5-300)||(15500826-15501123)
chr8 (1-300)||(24547683-24547979)
chr8 (1-298)||(24387110-24387408)
chr8 (28-298)||(24930516-24930789)
chr8 (1-117)||(23509377-23509493)
chr8 (21-298)||(16203739-16204016)
chr8 (21-294)||(29758771-29759045)
chr8 (206-300)||(6775630-6775725)
chr8 (206-300)||(43374980-43375075)
chr8 (205-300)||(13664034-13664130)
chr8 (205-300)||(13723309-13723405)
chr8 (205-300)||(22007877-22007973)
chr8 (27-298)||(270226-270494)
chr8 (27-298)||(645426-645694)
chr8 (27-298)||(831161-831429)
chr8 (21-116)||(22008138-22008233)
chr8 (205-300)||(24718816-24718912)
chr8 (21-116)||(24108244-24108338)
chr8 (205-309)||(41245327-41245432)
chr8 (21-116)||(13664295-13664390)
chr8 (21-116)||(13723570-13723665)
chr8 (21-119)||(22909142-22909239)
chr8 (205-300)||(22322834-22322930)
chr8 (205-298)||(24107987-24108079)
chr8 (22-101)||(43375200-43375278)
chr8 (21-116)||(19994801-19994895)
chr8 (206-315)||(19994536-19994646)
chr8 (22-116)||(24719076-24719169)
chr8 (26-123)||(41244113-41244209)
chr8 (205-300)||(16416924-16417020)
chr8 (205-300)||(20655423-20655519)
chr8 (205-300)||(25121206-25121302)
chr8 (207-300)||(20648838-20648932)
chr8 (205-298)||(22908885-22908978)
chr8 (42-116)||(25120939-25121013)
chr8 (205-298)||(37605657-37605750)
chr8 (205-298)||(37610031-37610124)
chr8 (205-298)||(20480337-20480429)
chr8 (21-94)||(37605464-37605536)
chr8 (42-117)||(16416737-16416812)
chr8 (210-300)||(20568666-20568757)
chr8 (210-300)||(20574859-20574950)
chr8 (21-117)||(20480073-20480168)
chr8 (21-116)||(22323101-22323194)
chr8 (72-116)||(23116418-23116462)
chr8 (205-261)||(28543600-28543656)
chr8 (72-123)||(39448413-39448464)
chr8 (72-116)||(22498901-22498945)
chr8 (42-123)||(25294491-25294574)
chr8 (42-123)||(25756480-25756563)
chr8 (72-116)||(33170786-33170830)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (5-300)||(37752-38047)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (5-300)||(25366-25661)
scaffold0141 (5-300)||(21111-21406)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (5-300)||(17491-17787)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (5-300)||(29814-30111)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (1-300)||(15902-16203)
scaffold0396 (21-123)||(13782-13883)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (5-300)||(34796-35093)
scaffold0023 (1-300)||(155754-156051)
scaffold0023 (208-300)||(844-936)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-300)||(4300-4601)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (9-300)||(6549-6842)
scaffold0022 (9-203)||(58933-59129)
scaffold0022 (72-123)||(106512-106563)
scaffold0022 (72-116)||(130410-130454)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (3-300)||(106461-106760)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-300)||(128847-129146)
scaffold0028 (207-300)||(90285-90376)
scaffold0028 (25-116)||(90599-90689)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-300)||(9326-9627)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (1-300)||(14759-15058)
scaffold0225 (1-245)||(28280-28523)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (74-300)||(66840-67067)
scaffold0044 (205-300)||(94985-95081)
scaffold0044 (5-35)||(67062-67092)
scaffold0044 (5-34)||(67093-67122)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-300)||(51491-51790)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (4-300)||(18-315)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (42-300)||(109482-109742)
scaffold0032 (21-298)||(54119-54395)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (1-298)||(32595-32894)
scaffold0184 (22-119)||(33756-33852)
scaffold0184 (205-298)||(34016-34109)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (1-298)||(39950-40249)
scaffold0078 (22-119)||(38992-39088)
scaffold0078 (205-298)||(38735-38828)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (1-300)||(1186-1488)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (22-298)||(145012-145288)
scaffold0025 (22-298)||(147271-147547)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (21-298)||(4153-4432)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (21-298)||(558-836)
scaffold0269 (22-116)||(3426-3519)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (21-298)||(48993-49272)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (26-298)||(5002-5274)
scaffold0266 (26-117)||(12786-12876)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (21-315)||(270599-270895)
scaffold0009 (21-298)||(236654-236939)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (26-296)||(7465-7736)
scaffold0498 (42-82)||(7322-7362)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (1-114)||(1-114)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (26-298)||(129603-129877)
scaffold0008 (23-116)||(21037-21129)
scaffold0008 (23-115)||(28627-28718)
scaffold0008 (207-300)||(21325-21419)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (21-298)||(2535-2815)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (58-298)||(41222-41464)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-298)||(197507-197803)
scaffold0004 (72-116)||(84943-84987)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (21-298)||(11439-11713)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (205-300)||(1848-1944)
scaffold1140 (21-116)||(1510-1604)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (5-116)||(15530-15641)
scaffold0251 (205-300)||(15263-15359)
[»] scaffold0011 (10 HSPs)
scaffold0011 (205-300)||(193278-193374)
scaffold0011 (207-300)||(76092-76186)
scaffold0011 (205-300)||(124691-124787)
scaffold0011 (205-300)||(256309-256405)
scaffold0011 (21-101)||(125007-125086)
scaffold0011 (21-117)||(256558-256653)
scaffold0011 (21-115)||(72012-72105)
scaffold0011 (21-115)||(76393-76486)
scaffold0011 (24-116)||(192983-193074)
scaffold0011 (241-300)||(262915-262975)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (21-300)||(138212-138499)
scaffold0021 (205-300)||(87106-87202)
scaffold0021 (21-117)||(76760-76855)
scaffold0021 (205-280)||(77048-77124)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (7-87)||(24878-24958)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (205-300)||(78216-78312)
scaffold0034 (21-101)||(77900-77979)
scaffold0034 (205-298)||(38875-38969)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (206-300)||(27912-28007)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-300)||(14149-14439)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (42-298)||(870-1122)
scaffold0383 (21-123)||(5706-5807)
scaffold0383 (205-298)||(5898-5991)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (206-300)||(3092-3187)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (206-300)||(6549-6644)
scaffold0218 (22-101)||(6824-6902)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (21-300)||(27045-27335)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (21-300)||(6019-6307)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (205-300)||(28549-28645)
scaffold0116 (42-116)||(28254-28328)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-63)||(25813-25875)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (44-300)||(7927-8193)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (205-300)||(26125-26221)
scaffold0037 (21-117)||(26414-26509)
scaffold0037 (207-297)||(70801-70892)
scaffold0037 (42-94)||(66337-66389)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (206-300)||(2242-2337)
scaffold0673 (20-116)||(3706-3801)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (206-300)||(6762-6857)
scaffold0480 (21-115)||(7013-7106)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (208-300)||(13142-13235)
scaffold0359 (44-116)||(13433-13505)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (208-300)||(14664-14757)
scaffold0138 (21-99)||(15022-15099)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (22-99)||(40006-40082)
scaffold0106 (205-298)||(40263-40356)
[»] scaffold0692 (2 HSPs)
scaffold0692 (21-116)||(1045-1139)
scaffold0692 (205-300)||(796-892)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (238-300)||(4469-4531)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (21-123)||(60047-60148)
scaffold0068 (205-291)||(60239-60325)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (46-119)||(17075-17148)
scaffold0315 (207-298)||(17314-17405)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (42-115)||(56432-56505)
scaffold0051 (241-300)||(58899-58959)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (21-300)||(4601-4890)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (205-300)||(6009-6104)
scaffold0407 (27-99)||(6326-6397)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (205-300)||(32247-32343)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-113)||(249140-249231)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (210-308)||(18971-19070)
scaffold0234 (21-101)||(19246-19325)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (21-116)||(31211-31305)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (21-116)||(20905-20999)
scaffold0039 (205-260)||(20686-20741)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (81-298)||(1-219)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (21-298)||(12671-12956)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (22-116)||(30998-31091)
scaffold0049 (55-110)||(44638-44693)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (207-300)||(69432-69526)
scaffold0031 (205-261)||(30740-30796)
[»] scaffold2147 (2 HSPs)
scaffold2147 (24-116)||(712-803)
scaffold2147 (205-261)||(966-1022)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (21-116)||(18058-18152)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (42-117)||(163828-163903)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (21-123)||(3132-3233)
scaffold0434 (207-300)||(3326-3420)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (207-300)||(7459-7553)
scaffold0338 (42-117)||(7225-7300)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (21-115)||(17778-17871)
scaffold0195 (21-115)||(19862-19955)
scaffold0195 (205-298)||(20056-20149)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (207-300)||(8745-8839)
scaffold0190 (72-122)||(8601-8651)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (172-298)||(52678-52804)
scaffold0018 (172-298)||(56630-56756)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (205-300)||(71853-71949)
scaffold0001 (44-117)||(72104-72177)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (246-300)||(5700-5755)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (21-123)||(3098-3199)
scaffold0447 (205-298)||(3290-3383)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (205-298)||(27686-27779)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-123)||(37935-38036)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (207-300)||(6737-6831)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (206-300)||(4507-4602)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (72-123)||(3887-3938)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (72-123)||(7256-7307)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (72-117)||(4950-4995)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (205-261)||(20362-20419)
scaffold0150 (205-261)||(27191-27248)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (72-116)||(212-256)
scaffold0786 (72-116)||(5267-5311)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (45-117)||(7072-7147)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (72-116)||(3800-3844)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 10811 - 11110
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10811 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 10910  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 11010  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11011 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 11110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29192435 - 29192137
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192435 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatacttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 29192336  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192335 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 29192236  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192235 aacaacgactatgatgcatggacatg-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 29192137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21075302 - 21075006
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21075302 tcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 21075203  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21075202 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 21075103  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21075102 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 21075006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21933973 - 21933678
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21933973 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 21933874  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21933873 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 21933774  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21933773 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 21933678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21940143 - 21939848
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940143 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 21940044  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21940043 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 21939944  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21939943 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 21939848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 35580719 - 35581014
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580719 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 35580818  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35580819 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 35580918  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35580919 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 35581014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37010977 - 37010682
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37010977 tcattcttctctattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 37010878  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37010877 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaagctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 37010778  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37010777 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 37010682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25902139 - 25901844
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  25902139 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctat 25902040  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25902039 aaggtcgtcaccttcgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 25901940  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25901939 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 25901844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 37051449 - 37051744
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37051449 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 37051548  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37051549 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgcctcacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 37051648  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37051649 acgactatgatgcatggacatgtgcaaagactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 37051744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21235220 - 21234924
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaa-tctcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  21235220 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgttatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaaatctcaa 21235121  T
Q  104 caaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21235120 caaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaac 21235021  T
Q  204 aacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21235020 aacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 21234924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 20615077 - 20615372
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  20615077 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcgctaccaaatctctac 20615176  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20615177 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcacatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 20615276  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20615277 acgactatgatgcatggacatgtgtaaagactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 20615372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22368282 - 22368001
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368282 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 22368183  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcat 219  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368182 atggacaagtcaacatcgtatgtaaggctcacccctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacaacgactatgatgcat 22368083  T
Q  220 ggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22368082 ggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 22368001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 25425082 - 25425382
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425082 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 25425181  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425182 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 25425280  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425281 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 25425380  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  25425381 at 25425382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 19498260 - 19498560
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498260 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 19498359  T
Q  101 caacaaggtcgtcacct-ccgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498360 caacaaggtcgtcaccttccgatgc-cacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 19498458  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19498459 gcaacaacgactatgatgtatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattg 19498558  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  19498559 at 19498560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 11341096 - 11341396
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341096 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 11341195  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341196 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 11341294  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11341295 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcaataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattg 11341394  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  11341395 at 11341396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9732484 - 9732185
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9732484 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcagatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattaacacatagatgcatgtggtaccaaatct 9732385  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacag 199  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9732384 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgtatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttatcccttttacag 9732286  T
Q  200 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9732285 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattga 9732186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 24594965 - 24595261
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24594965 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 24595064  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24595065 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 24595163  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24595164 caacaactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 24595261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4201780 - 4201484
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201780 tcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 4201681  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201680 aaggtcgtcacctttcgatgt-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 4201582  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4201581 caacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 4201484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Original strand, 27008476 - 27008790
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27008476 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgaggtaccaaatctcaac 27008575  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27008576 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagtaa 27008674  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  27008675 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgatta 27008774  T
Q  303 tgtccatctcattgca 318  Q
    | |||| | |||||||    
T  27008775 tctccaccacattgca 27008790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 16534791 - 16535064
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgg 124  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16534791 ccaatcacatagttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgg 16534890  T
Q  125 acaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggaca 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16534891 acaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggaca 16534990  T
Q  225 tgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16534991 tgtaacaagacttgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 16535064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 23327417 - 23327713
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23327417 tcattcacctcaattcatcacgaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacccataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 23327516  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23327517 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatctcttttacagcaa 23327615  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23327616 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 23327713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43445571 - 43445271
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43445571 tcattcatctcatttcatcaccaatcatatatttcacataagattcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 43445472  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatccctttta---cag 199  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  43445471 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttattacag 43445373  T
Q  200 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43445372 caacaacgactatgatgcatggatatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattg 43445273  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  43445272 at 43445271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10779977 - 10779696
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct-cc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10779977 atcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 10779878  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  ||  |  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10779877 gatgc-cacttgcacatcgtatgtaaggctcacacctgccttacaataatctcaaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgca 10779779  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10779778 tggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatatatgataacacccaattatattgat 10779696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22884976 - 22884682
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc-gatg 123  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  22884976 ccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttttgatg 22884878  T
Q  124 gacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgga 222  Q
      ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22884877 c-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgga 22884779  T
Q  223 catgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgatgatgtccatctcattgca 318  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  22884778 catgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcattgca 22884682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 110782 - 110501
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-c 119  Q
    |||| ||||||||||  |||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  110782 atcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 110683  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  ||  |  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  110682 gatgc-cacttgcacatcgtatgtaaggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgca 110584  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  110583 tggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatacaggacaacacccaattatattgat 110501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1221529 - 1221248
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-c 119  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  1221529 atcaccaatcacat-ttccaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaagttcgtcacctttc 1221431  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    ||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221430 gatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaacccttttacagcaacaacgactatgatgc 1221332  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1221331 atggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaacttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 1221248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11213401 - 11213124
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-c 119  Q
    |||| ||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  11213401 atcatcaatcacttatatcatatgagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 11213302  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    ||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  11213301 gatgc-cacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaacccttttacagccac-acgactatgatgc 11213204  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11213203 atggacatgtaacaatactagataatgcgac-acaa-tcacaattttcaacacaatatataggacgacacccaattatattg 11213124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35792907 - 35792654
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcat 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35792907 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcat 35792808  T
Q  142 gtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcg 238  Q
    |||| || ||||     |||||| ||||||| |||||||||||||||   | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||   |  |||||    
T  35792807 gtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagtcggactcttttacaacaac-tcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcg 35792714  T
Q  239 ataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35792713 ataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 35792654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 7424343 - 7424437
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7424343 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 7424437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18779607 - 18779513
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18779607 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatatatgacgacaaccaattatattgat 18779513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 7424067 - 7424178
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  7424067 tcattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctccaa 7424165  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  7424166 aaaggtcgtcacc 7424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17473384 - 17473289
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17473384 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 17473289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 23513461 - 23513557
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23513461 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 23513557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 23510395 - 23510475
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23510395 atcaccaatcacatttatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgttgtaccaaatctc 23510475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 23510655 - 23510751
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23510655 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 23510751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 4863740 - 4864025
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  4863740 atcaccaatcacatttatca-ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 4863838  T
Q  121 atg-gacaagttaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaaca--------acga 208  Q
    |||  ||||   ||||||| ||||||| | ||||  | | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||        ||||    
T  4863839 atgcaacaa--aaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 4863935  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
     ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4863936 ttatgatgcatggacatgtaataaaactcaataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 4864025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 11582539 - 11582635
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11582539 acgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgat 11582635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 20710802 - 20710898
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20710802 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgat 20710898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 28258265 - 28258361
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28258265 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacgacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 28258361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21652896 - 21652802
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21652896 gactataatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 21652802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17473645 - 17473566
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17473645 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 17473566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 21392853 - 21392949
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21392853 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactccataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaaaacccaattatattgat 21392949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25192611 - 25192518
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25192611 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaa-acacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 25192518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27185521 - 27185420
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  27185521 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 27185423  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  27185422 atg 27185420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1170414 - 1170320
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1170414 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatattcacctattgatacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 1170320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18779847 - 18779788
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779847 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 18779788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21661411 - 21661310
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  21661411 atcaccattcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 21661313  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  21661312 atg 21661310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 21392605 - 21392699
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21392605 atcaccaaacacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaactcaaggtcgtcacc 21392699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21653145 - 21653051
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21653145 atcaccaatcacatttatca-ataagactcgtgtcatgatatgcacttatcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatgtcctcaaggtcgtcacc 21653051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24184708 - 24184613
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24184708 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatacacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 24184613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 24470711 - 24470805
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24470711 atcagcaatcacatatatcag-taagactcatgtcatgatatgcacctattgacccatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 24470805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 11582325 - 11582398
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11582325 ccaatcacatacatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 11582398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1170157 - 1170061
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtg-taagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1170157 acgactatgatgcatggacatgtaataaga-ctcgataacgcgacaacaatccaaaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgat 1170061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 21649463 - 21649588
Alignment:
Q  173 gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactc 269  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |    
T  21649463 gaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccac 21649559  T
Q  270 aatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21649560 aatatataggataacacccaattatattg 21649588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 25211689 - 25211623
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgt 88  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25211689 atcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25211623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 25275841 - 25275775
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgt 88  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25275841 atcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25275775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27185327 - 27185236
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat-ctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27185327 gactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattctcaccacaatatataggacaatacccaattatattg 27185236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 28258021 - 28258094
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  28258021 ataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcacc 28258094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 21615537 - 21615588
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  21615537 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 21615588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 23492528 - 23492579
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  23492528 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 23492579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 19860758 - 19860808
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgat 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  19860758 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccccaaggtcgtcaccttcgat 19860808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 117
Target Start/End: Original strand, 13793655 - 13793700
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  13793655 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacct 13793700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2451024 - 2450725
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2451024 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 2450925  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450924 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 2450825  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450824 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 2450725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 22273504 - 22273803
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273504 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 22273603  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273604 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 22273703  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273704 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 22273803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 18909149 - 18909448
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909149 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 18909248  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909249 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 18909348  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18909349 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 18909448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1469346 - 1469051
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469346 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 1469247  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1469246 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 1469147  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1469146 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 1469051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8270096 - 8269800
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8270096 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 8269997  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8269996 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacaccgaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 8269898  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8269897 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 8269800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8277207 - 8276911
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8277207 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 8277108  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8277107 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacaccgaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 8277009  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8277008 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 8276911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8306016 - 8305720
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8306016 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 8305917  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305916 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacaccgaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 8305818  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8305817 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 8305720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 30151797 - 30152093
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30151797 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 30151896  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30151897 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 30151995  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30151996 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 30152093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Original strand, 27839168 - 27839483
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27839168 tcattcatctcaattcatcatcaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 27839267  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27839268 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 27839366  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27839367 caacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatt 27839466  T
Q  302 atgtccatctcattgca 318  Q
    || ||||  ||||||||    
T  27839467 atctccacatcattgca 27839483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 53769121 - 53769417
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53769121 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 53769220  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53769221 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 53769319  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53769320 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 53769417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 16819367 - 16819667
Alignment:
Q  2 taatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819367 taatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 16819466  T
Q  102 aacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacag 199  Q
    ||||||||||||||||   |  | ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16819467 aacaaggtcgtcacctttcaatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttgcaataatctcgaagtaaaagagttcaacccttttacag 16819566  T
Q  200 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16819567 caacaacgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattga 16819666  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  16819667 t 16819667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 44227888 - 44228185
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44227888 tcattcatctcatttaatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 44227987  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44227988 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaacccttttacagca 44228086  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44228087 acatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 44228185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 45859480 - 45859776
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45859480 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 45859579  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45859580 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 45859678  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45859679 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacatccaattatattgat 45859776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16745862 - 16745569
Alignment:
Q  7 attcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaa 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745862 attcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaa 16745763  T
Q  107 ggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaa 205  Q
    |||||||||||   |  | ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16745762 ggtcgtcacctttcaatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaac-a 16745664  T
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16745663 cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacca-tcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 16745569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13956498 - 13956200
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13956498 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 13956399  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13956398 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagggtcatcccttttacagcaa 13956300  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaata--tataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  13956299 caacgactatgatgcatggacatgtgtaacgactcgataatgcgacaacaattctcaatgtcaactcaatatatataggacaacacccaattattttgat 13956200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13977331 - 13977032
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13977331 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 13977232  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13977231 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagggtcatcccttttacagcaa 13977133  T
Q  203 caacga-ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaata--tataggacgacacccaattatattga 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  13977132 caacgaactatgatgcatggacatgtgtaacgactcgataatgcgacaacaattctcaatgtcaactcaatatatataggacaacacccaattatattga 13977033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 41268702 - 41268998
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41268702 tcattcatctcaaaacatcaccaatcacccaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 41268801  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41268802 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccctttacagcaa 41268900  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41268901 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacatttctcaatctcaactcaatacataggacaacacccaattatattgat 41268998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12266183 - 12265889
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  12266183 tcattcatctcatttcatcaccaatcaaatatttcacataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaa 12266084  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||| | ||    
T  12266083 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttaaaaca 12265989  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12265988 acatcgactatgattcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 12265889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Original strand, 49230696 - 49230990
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatg 123  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  49230696 ccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaacgtcgtcacctttcgatg 49230794  T
Q  124 gacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgga 222  Q
      ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49230795 c-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgga 49230893  T
Q  223 catgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgatgatgtccatctcattgca 318  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  49230894 catgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcattgca 49230990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 15613523 - 15613816
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15613523 ataatcattcatctcattccatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 15613622  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||    
T  15613623 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttac 15613717  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15613718 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatatt 15613816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 15574504 - 15574800
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15574504 ataatcattcatctcattccatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 15574603  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtc-atcccttttaca 198  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||     |||||||  | | |||||||||||||| |   | ||||||||    
T  15574604 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagttaaagtcgcatgtaaggggtcac----tccttacataattttcgaagtaaaagagccggactcttttaca 15574699  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15574700 acaac-tcgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattg 15574798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15470161 - 15469866
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470161 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacaaatttcacataagacttatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 15470062  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| |   | |||||||    
T  15470061 ccaaaaggtcgtcatctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccggactcttttac 15469967  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15469966 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaataa-tcacaatttcaactcaatatataggacaacacccaattatatt 15469869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 55314842 - 55315152
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55314842 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacccaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 55314941  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaaga--------------gtcat 188  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||              || ||    
T  55314942 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtacatgatatataagacatgtgtaat 55315040  T
Q  189 cccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacaccc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55315041 cccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacaccc 55315140  T
Q  289 aattatattgat 300  Q
    ||||||||||||    
T  55315141 aattatattgat 55315152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15940160 - 15939859
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15940160 ataatcattcaccacatttcatcaccaatcacataaatcacataagactcatgttatgatatgaacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatct 15940061  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15940060 ccaaaaggtcgtcacctccgatagacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaaaagttcagcccttttac 15939962  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15939961 aacaac-acgactatgatgcatgggcatgtataaggactcaataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatgtatatgacaacacccaattatat 15939863  T
Q  297 tgat 300  Q
    ||||    
T  15939862 tgat 15939859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14846357 - 14846060
Alignment:
Q  3 aatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctca 102  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14846357 aatcattcatctcattttatcaccaatcacatatattacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcc 14846258  T
Q  103 acaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacag 199  Q
    | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  14846257 aaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcaccccccccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaa 14846161  T
Q  200 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14846160 caac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttaacctcaatatataggacaacacccaattatattg 14846062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23081862 - 23081716
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081862 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 23081763  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaagg 147  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23081762 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaagg 23081716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 33340320 - 33340599
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33340320 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 33340419  T
Q  121 atgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  33340420 atggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatg 33340517  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33340518 catgtacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 33340599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17913930 - 17913653
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc-tcc 119  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17913930 atcatcaatcacatacatcatataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 17913831  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    ||| | ||  |  |||||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  17913830 gat-gccacttgcacatcgtacgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagcttaacccttttacagccac-acgactatgatgc 17913733  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17913732 atggacatgtaacaagactagataatgcgac-acaa-tcacaattgtcaacacaatatataggacgacatccaattatattg 17913653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 23490983 - 23491262
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23490983 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 23491082  T
Q  121 atgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||  || || ||||||| | || ||||||||||||    
T  23491083 atggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagcacaacctttttacaactac-acgactatgatg 23491180  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23491181 catggacatgtaaaaaaactagataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattg 23491262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 2048538 - 2048816
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  2048538 atcaccaatcacatatatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcaccttcg 2048637  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||||  |  | |||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  2048638 atggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 2048735  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2048736 atggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 2048816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 16259544 - 16259797
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcat 141  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16259544 ataagacccatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcat 16259643  T
Q  142 gtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcg 238  Q
    |||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| |   | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||   |  |||||    
T  16259644 gtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccggactcttttacaacaac-tcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcg 16259737  T
Q  239 ataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16259738 ataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 16259797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18905454 - 18905354
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18905454 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 18905355  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  18905354 c 18905354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 19945107 - 19945382
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19945107 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 19945205  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||   ||    |||||| |||||| || |||   |  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  19945206 atgataaa--acacatcgtatgtaagggttcaaaaccaccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 19945301  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945302 atggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 19945382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 298
Target Start/End: Original strand, 5227193 - 5227471
Alignment:
Q  19 tcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |    
T  5227193 tcatcactaatcacatatatcaaacaagactcatgttatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatctccaaaaaggtcgtcacat 5227292  T
Q  118 ccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgat 215  Q
     |||||   ||    |||| | |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||    
T  5227293 tcgatgataaa--acacattgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagccaacccttttacaactac-acgactatgat 5227388  T
Q  216 gcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227389 gcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 5227471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51160161 - 51159880
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  51160161 atcaccaatcacatatatca-atgagactcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 51160063  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-----ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatg 213  Q
    |||||  |  | |||||| ||||||     || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||    
T  51160062 atggaacaactcacatcgtatgtaaggaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatg 51159965  T
Q  214 atgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51159964 atgcatggacatgtaataag-actcgataatgcgacaccaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 51159880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 10737036 - 10737312
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||    
T  10737036 atcaccaatcacatatatcaaatcagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgccaccttcg 10737135  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||   ||    |||||| |||||| || ||||  | ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  10737136 atgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctctgaagtagaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 10737231  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||||||| | |||| | ||  | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10737232 atggacatgtcacaagactcgataatgcgacaacaa-taacaattttctccacaatatataggacaacacccaattgtattg 10737312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19262695 - 19262602
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtca 114  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19262695 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 19262602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15860642 - 15860546
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15860642 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 15860546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 13816175 - 13816271
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13816175 acgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattctcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 13816271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Original strand, 30141363 - 30141460
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30141363 atcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctcc 30141460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17958090 - 17957994
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17958090 atcatcaatcacatatatcatataagactcatgtcatgagatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 17957994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19572267 - 19572171
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19572267 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 19572171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 25057250 - 25057345
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25057250 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacc 25057345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 50113816 - 50113547
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  50113816 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 50113717  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaaca--------acgac 209  Q
    ||| | |    ||||||| |||||||   ||||  | | ||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||        |||||    
T  50113716 atgca-ataaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttgc-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 50113619  T
Q  210 tatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggac 281  Q
    |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  50113618 tatgatgcatgggcatgtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcacctcaatatataggac 50113547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18905307 - 18905197
Alignment:
Q  189 cccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacc 287  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  18905307 cccttttacaacaact-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcaataatgcgaaaacaa-tcacaatttcaacctcaatatataggacaacacc 18905210  T
Q  288 caattatattgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  18905209 caattatattgat 18905197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 17099376 - 17099472
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17099376 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgtcagcaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 17099472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 30205116 - 30205212
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30205116 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctgaatatattggacaacacccaattatattgat 30205212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 17099088 - 17099182
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  17099088 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggttgtcacc 17099182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19572523 - 19572429
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19572523 atcaccactcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 19572429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 319301 - 319200
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||    
T  319301 atcaccaatcgcat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcaccttcg 319203  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  319202 atg 319200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 8630338 - 8630419
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||    
T  8630338 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctccaggtcgtcaccttcgatg 8630419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16183509 - 16183410
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat------ctcaactcaatatataggacgacacccaattatattga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16183509 cgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttacacctcaa-tcaatatataggacaacacccaattatattga 16183411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15860901 - 15860807
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  15860901 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatgtgcatgttgtaccaaatctccaaagggtcgtcacc 15860807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Original strand, 19230531 - 19230625
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||    
T  19230531 tcaccaatcacatttatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtaccaaatctccaaaacgtcgtcacct 19230625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 25057510 - 25057603
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25057510 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 25057603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 6148548 - 6148456
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6148548 atcaccaatcacatat--ca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 6148456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 11813528 - 11813584
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11813528 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaat 11813584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22145768 - 22145673
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22145768 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgataacaatccacaattttcacctcaatatataggac-acacccaattatattgat 22145673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 14297161 - 14297256
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14297161 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 14297256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 14302788 - 14302883
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14302788 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 14302883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16183758 - 16183664
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  16183758 atcaccaaacacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcacc 16183664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 35122350 - 35122445
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35122350 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcataattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 35122445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17957828 - 17957727
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgatgatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17957828 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatgt 17957730  T
Q  306 cca 308  Q
    |||    
T  17957729 cca 17957727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 45581313 - 45581382
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggt 91  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45581313 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 45581382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17523905 - 17523809
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcac-aatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||   | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17523905 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacggttttcaccccaatatataggacaactcccaattatattgat 17523809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 30204870 - 30204962
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  30204870 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacaca--aatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 30204962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6148308 - 6148241
Alignment:
Q  234 actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6148308 actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatgtaggacaacacccaattatattgat 6148241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 11813310 - 11813404
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  11813310 atcagcaatcacatttatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 11813404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Original strand, 19230726 - 19230816
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19230726 actatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 19230816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22145975 - 22145881
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  22145975 atcaccaatcacatatatca-ataagactcgtgtcatcacatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaattacctcaaggtcgtcacc 22145881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Original strand, 7852301 - 7852379
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgat 122  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  7852301 aagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatacatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgat 7852379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 7852471 - 7852564
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7852471 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 7852564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12351499 - 12351432
Alignment:
Q  56 atgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  12351499 atgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtactggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 12351432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53900016 - 53899921
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |  |||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||| || |||||||||||||||    
T  53900016 cgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacattatataggacaactcccaattatattgat 53899921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 8630510 - 8630603
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |  |||||||||||| |||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8630510 acgactatgatgcatggatatgtaacaagactcgataatgcaacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 8630603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14522804 - 14522747
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaaga-actcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14522804 acgactatgatgcatggacatgtaacagagactcgataatgcgacatcaattcacaat 14522747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 17138128 - 17138225
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| || || |||| | ||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  17138128 acgactatgatgcatggacatgtaataaagactcgataatgcgacatcactttacaattttcacctcaatataaaggacaactcccaactatattgat 17138225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5229720 - 5229669
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  5229720 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 5229669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 15874686 - 15874737
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  15874686 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 15874737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 48420193 - 48420244
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  48420193 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 48420244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47786365 - 47786311
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47786365 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaat 47786311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14523049 - 14523004
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  14523049 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacct 14523004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 309
Target Start/End: Original strand, 40938393 - 40938498
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| ||||| |||| | ||| | ||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| ||    
T  40938393 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaccaatttacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcat 40938492  T
Q  304 gtccat 309  Q
     |||||    
T  40938493 ctccat 40938498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9592393 - 9592349
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9592393 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 9592349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19888476 - 19888177
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888476 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 19888377  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888376 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 19888277  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888276 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 19888177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28777393 - 28777098
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28777393 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 28777294  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28777293 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 28777194  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28777193 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 28777098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11232945 - 11232650
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232945 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 11232846  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11232845 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 11232746  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11232745 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 11232650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22514792 - 22514497
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22514792 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 22514693  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22514692 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 22514593  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22514592 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 22514497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5889990 - 5889694
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5889990 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 5889891  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5889890 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 5889791  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5889790 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 5889694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14908132 - 14907837
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14908132 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 14908033  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14908032 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 14907933  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14907932 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 14907837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 20013585 - 20013880
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20013585 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 20013684  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20013685 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 20013784  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20013785 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 20013880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 23818642 - 23818937
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23818642 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 23818741  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23818742 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 23818841  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23818842 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 23818937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 12726515 - 12726811
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726515 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 12726614  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726615 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 12726713  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12726714 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 12726811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 34822656 - 34822956
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822656 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 34822755  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822756 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 34822854  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34822855 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattg 34822954  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  34822955 at 34822956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 23772999 - 23773295
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23772999 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 23773098  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23773099 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 23773197  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23773198 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 23773295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 8942104 - 8942423
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8942104 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcacttggtaccaaatct 8942203  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942204 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 8942302  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8942303 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 8942402  T
Q  298 gatgatgtccatctcattgca 318  Q
    ||| || ||||  ||||||||    
T  8942403 gattatctccacatcattgca 8942423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 21140335 - 21140636
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140335 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 21140434  T
Q  101 caacaaggtcgtcacct-ccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  |  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21140435 caacaaggtcgtcaccttccgatgc-cacttgcacatcgtatgtaaggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttaca 21140533  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21140534 gcaacatcgactatgatgcatgaacatgtataagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 21140633  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  21140634 gat 21140636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3800811 - 3800510
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3800811 ataaccattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 3800712  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3800711 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 3800613  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800612 gcaacaacaactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 3800513  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  3800512 gat 3800510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12637863 - 12637562
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637863 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 12637764  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637763 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 12637665  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacc-caattatatt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||    
T  12637664 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggataacaccaccattatatt 12637565  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  12637564 gat 12637562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21276225 - 21275924
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21276225 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcaaatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 21276126  T
Q  101 caacaaggtcgtcacct-ccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  |  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21276125 caacaaggtcgtcaccttccgatgc-cacttgcacatcgtatgtaaggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttaca 21276027  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21276026 gcaacgtcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatatt 21275927  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  21275926 gat 21275924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17398290 - 17397994
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17398290 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 17398191  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17398190 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatccattttacagcaa 17398092  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17398091 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 17397994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24687363 - 24687066
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24687363 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 24687264  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||| ||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||    
T  24687263 aaggtcgtcaactttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaactcttttacaaca 24687165  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24687164 acaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 24687066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12643703 - 12643424
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-c 119  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12643703 atcaccaatcacat-ttccaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 12643605  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  ||  |  |||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643604 gatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcgcacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 12643506  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12643505 tggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 12643424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24828259 - 24827967
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24828259 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 24828160  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttaca 198  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||        |||||| ||||||| ||||||||||||| |   | ||| ||||    
T  24828159 ccaaaaggttgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaaggct--------ccttac-ataatctccgaagtaaaagagccggactcttataca 24828069  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
      |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24828068 agaac-tcgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 24827970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22692748 - 22693028
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22692748 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcaaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 22692847  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22692848 ccataaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaa-aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttac 22692946  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatatagg 279  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  22692947 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg 22693028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22697395 - 22697675
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22697395 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcaaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 22697494  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22697495 ccataaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaa-aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttac 22697593  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatatagg 279  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  22697594 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg 22697675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24832711 - 24832562
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24832711 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 24832612  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctc 150  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24832611 ccaaaaggttgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaaggctc 24832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22282576 - 22282831
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22282576 ataatcattaatcacatttcatgaacaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 22282675  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22282676 ccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaaccctttta 22282774  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaat 254  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||    
T  22282775 caactac-acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat 22282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 22273343 - 22273642
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273343 ataatcattaatcacatttcatgaacaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 22273442  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  22273443 ccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctcttaagtaaaagagctcaactctttta 22273541  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || | |  |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22273542 caacta-tacgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattata 22273639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 461402 - 461497
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461402 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 461497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 25211338 - 25211429
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggta 92  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25211338 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggta 25211429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43644654 - 43644378
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||    
T  43644654 atcaccaatcacatttatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacgcatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcaccttcg 43644556  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatc-tcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
     || | ||||   |||||| |||||| || ||||  | |||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  43644555 ttgaatcaag--cacatcgtatgtaagggttcacacccgcctcac-ataatcttcgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatg 43644460  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||| |||   | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43644459 catggacttgtaacaaaactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 43644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 8886612 - 8886713
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  8886612 atcaccaatcacacatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 8886710  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  8886711 atg 8886713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20628889 - 20628793
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20628889 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccactatttcaacctcaatatataggacgatacccaattatattgat 20628793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 24966960 - 24967056
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24966960 acgactatgattcatggacatgtatacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 24967056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36892203 - 36892110
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36892203 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaactcccaattatattgat 36892110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 461142 - 461221
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  461142 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 461221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25877711 - 25877616
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25877711 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatatcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacct 25877616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 15632060 - 15632153
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtg-taagaactcgataatgcgacaacaattcacaat-ctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15632060 acgactatgatgcatggacatgtaataaga-ctcgataatgcgacaacaat-cacaattctcaacacaatatataggacaacacccaattatattg 15632153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20629111 - 20629015
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  20629111 atcaccaatcacatatatca-ataagactcttgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaagatcgtcacct 20629015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 24966693 - 24966772
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24966693 atcaccaatcacatatatca-ataagattcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 24966772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 36892453 - 36892358
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  36892453 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcaagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacct 36892358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9654583 - 9654505
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9654583 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatggcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 9654505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 15631867 - 15631963
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||    
T  15631867 atcaccaatcacatttatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgactcaaaaatgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcacct 15631963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22691447 - 22691351
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcaca-atctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22691447 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 22691351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22696094 - 22695998
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcaca-atctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22696094 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 22695998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 269851 - 269946
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  269851 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaccacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 269946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 6877914 - 6878199
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |  ||| |||||||||| ||    
T  6877914 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatttggtaccggatcacctcaaagtcgtcaccttcg 6878012  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    ||| | |||   ||||||| |||||||  | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||        |||    
T  6878013 atgcaacaaa--aacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 6878109  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||| ||   |  ||||||||||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6878110 ctatgatgcatggacaagtaacaagactcgataatgcgaccacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 6878199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 22861959 - 22862060
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||  || || |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||| ||    
T  22861959 atcaccaatcacac-ttccaaataagaatcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacgagatcacctcaaggtcgtcaccttcg 22862057  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  22862058 atg 22862060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4449725 - 4449630
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaaga-actcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  4449725 cgactatgatgcatggacatgta-acgagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaacttccaattatattgat 4449630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 25600626 - 25600720
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaact-caatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25600626 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaatttttaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 25600720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 25600432 - 25600533
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||| ||    
T  25600432 atcaccaaccacatttatca-ataagattcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccatattacctcaaggtcgtcaccttcg 25600530  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  25600531 atg 25600533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22581431 - 22581374
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaaga-actcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22581431 acgactatgatgcatggacatgtaacagagactcgataatgcgacatcaattcacaat 22581374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25877383 - 25877350
Alignment:
Q  267 ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877383 ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 25877350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 299
Target Start/End: Original strand, 27260248 - 27260341
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattga 299  Q
    |||||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27260248 gactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccataatatataggacaactcccaattatattga 27260341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19435143 - 19435060
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  19435143 ataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 19435060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4929 - 4878
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  4929 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 4878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 19658471 - 19658522
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  19658471 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 19658522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19670782 - 19670731
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  19670782 gacacataaatgcatgtggtgccgaatctcctcaaggtcgtcaccttcgatg 19670731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23823161 - 23823110
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  23823161 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 23823110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23825105 - 23825054
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  23825105 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 23825054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23832240 - 23832189
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  23832240 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 23832189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24296225 - 24296174
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  24296225 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 24296174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 25304090 - 25304141
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  25304090 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 25304141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9654323 - 9654231
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  9654323 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatatagagcaacacccaattatattg 9654231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22787535 - 22787438
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatg-tgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatc-tcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  22787535 acgactatgatgcatggatatgttgcaaagactcgataatgcgacatcaactcacagtcttcaccacaatatagaggacgacttccaaatatattgat 22787438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22137468 - 22137424
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22137468 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 22137424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 24272580 - 24272624
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24272580 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacc 24272624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 25174020 - 25174319
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174020 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 25174119  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174120 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 25174219  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25174220 aacaacgactataatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacactcaattatattgat 25174319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27655780 - 27655484
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655780 tcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 27655681  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27655680 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcctcccttttacagcaaca 27655581  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27655580 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 27655484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 10487348 - 10487643
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10487348 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 10487447  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10487448 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 10487547  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10487548 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 10487643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16377979 - 16377684
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377979 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 16377880  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16377879 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 16377780  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16377779 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 16377684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16385303 - 16385008
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385303 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 16385204  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16385203 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 16385104  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16385103 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 16385008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33316280 - 33315979
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33316280 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 33316181  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33316180 caacaaggtcgtcaccttcgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttacag 33316081  T
Q  200 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33316080 caacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattg 33315981  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  33315980 at 33315979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 23976033 - 23976334
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976033 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 23976132  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976133 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 23976231  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23976232 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcggcaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 23976331  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  23976332 gat 23976334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 16230049 - 16230345
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16230049 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 16230148  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230149 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 16230247  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16230248 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 16230345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29871169 - 29870872
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29871169 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 29871070  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29871069 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 29870971  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacc-caattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  29870970 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacaccaccattatattgat 29870872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14628305 - 14628009
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14628305 tcattcatctcatttcatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 14628206  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14628205 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 14628107  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14628106 caacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 14628009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 26088303 - 26088599
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088303 tcattcatttcgtttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgttatgatatgcacttatggacgcataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 26088402  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088403 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 26088501  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26088502 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcaacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 26088599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16650940 - 16650643
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16650940 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 16650841  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16650840 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaactcttttacagca 16650742  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16650741 acaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatacgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaagtatattgat 16650643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 23993644 - 23993925
Alignment:
Q  20 catcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc- 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  23993644 catcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 23993743  T
Q  119 cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23993744 cgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatttcaaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 23993842  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23993843 atggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 23993925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16557710 - 16557413
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16557710 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaatctcaac 16557611  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16557610 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaactcttttacagca 16557512  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16557511 acaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatacgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaagtatattgat 16557413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16827534 - 16827278
Alignment:
Q  43 taagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatg 142  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16827534 taagactcatgtcaagatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatg 16827435  T
Q  143 taaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgata 241  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16827434 taaggctcacctctgcccaacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgata 16827335  T
Q  242 atgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827334 atgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 16827278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1651646 - 1651350
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651646 ataatcattcatctcattccatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 1651547  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| |   | |||||||    
T  1651546 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccggactcttttac 1651452  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651451 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 1651353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 4989381 - 4989662
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-c 119  Q
    |||| ||||||||||  |||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4989381 atcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 4989480  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  ||  |  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4989481 gatgc-cacttgcacatcgtatgtaaggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaacatcgactatgatgca 4989579  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4989580 tggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 4989662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1659407 - 1659111
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1659407 ataagcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcatataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 1659308  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||    
T  1659307 ccaaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttac 1659215  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1659214 aacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 1659115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 11214603 - 11214903
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11214603 ataatcattaatctcatttcatcatcaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 11214702  T
Q  101 -caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
     ||| |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  11214703 ccaaaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacccccgctttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaaccatttta 11214799  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11214800 caacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataagtactctataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 11214898  T
Q  296 ttgat 300  Q
    |||||    
T  11214899 ttgat 11214903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 16238849 - 16239129
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc-aacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  16238849 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacatatatgcatgtggtacaaaatctccaaaaaggtcgtcacctcc 16238947  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    ||||   ||    |||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16238948 gatgataaaac--acatcgtatgtaagggttcacccccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaact-cgactatgatg 16239043  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaac-aattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16239044 catggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacaccaaattatattgat 16239129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 15861243 - 15861491
Alignment:
Q  47 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaag 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||||    
T  15861243 actcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgataaaac--acatcgtatgtaag 15861340  T
Q  147 gc-tcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataat 243  Q
    |  ||||     ||||||| ||||||| |||||||||||| | |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15861341 gggtcact----ccttaca-taatctccgaagtaaaagagccgaattcttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaagactcgataat 15861435  T
Q  244 gcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15861436 gcgacaacaa-tcacaatttcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 15861491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19984884 - 19984607
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||    
T  19984884 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaggtcgtcaccttcg 19984785  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||||  |  | |||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  19984784 atggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 19984687  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19984686 atggacatgtaacaagactagataattcgacaacaa-tcacaatttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 19984607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 1554325 - 1554600
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  1554325 atcaccaaccacatttatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 1554424  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||   ||    |||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  1554425 atgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 1554520  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1554521 atggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 1554600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16642705 - 16642526
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16642705 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaatctcaac 16642606  T
Q  105 aaggtcgtcacc-tccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaaga 183  Q
     ||||||||||| | |||| | ||  |  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16642605 caggtcgtcacctttcgat-gccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtcaaaga 16642526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 19609167 - 19609261
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609167 cgactatgatgcatcgacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 19609261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22227369 - 22227260
Alignment:
Q  8 ttcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caacaa 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  22227369 ttcatctcgtttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatctccaaaaa 22227270  T
Q  107 ggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||    
T  22227269 ggtcgtcacc 22227260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18088206 - 18088111
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18088206 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 18088111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22227133 - 22227040
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22227133 actatgatgcatggacatgtataaggactcgaaaatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 22227040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18088482 - 18088371
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  18088482 tcattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctccaa 18088384  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  18088383 aaaggtcgtcacc 18088371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 19608891 - 19609002
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  19608891 tcattcatcacaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatacacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctccaa 19608989  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  19608990 aaaggtcgtcacc 19609002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17343772 - 17343683
Alignment:
Q  212 tgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17343772 tgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 17343683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18004469 - 18004373
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18004469 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 18004373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35017177 - 35017082
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35017177 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 35017082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17343945 - 17343846
Alignment:
Q  18 ttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  17343945 ttcatcaccaatcacttatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcgtaaatgcatgtggtaccgaatctccaaaaaggtcgtcacc 17343846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18004729 - 18004634
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18004729 atcaccaatcacatttctcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 18004634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18825513 - 18825419
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18825513 atcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 18825419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18843574 - 18843480
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18843574 atcaccaatcacat-tttcaaatatgacgcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 18843480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 31626914 - 31627015
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  31626914 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatagacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 31627012  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  31627013 atg 31627015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 18431304 - 18431397
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18431304 actatgatacatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 18431397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13622877 - 13622798
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13622877 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 13622798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25646323 - 25646227
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25646323 acgactatgatgcatggacatgtacaaggacttgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattttattgat 25646227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25646611 - 25646517
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25646611 atcaccaatcaaatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 25646517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18825251 - 18825162
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18825251 actatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaa-acacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatatt 18825162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 18128757 - 18129046
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| ||    
T  18128757 atcaccaatcacat--ttcatataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatcacctccagttcgtcaccttcg 18128854  T
Q  121 at----ggacaagttaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatc-tcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaaca--------a 205  Q
    ||     | ||  | ||||||| |||||||   ||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||        |    
T  18128855 attcgatgccacttgaacatcgtatgtaagatttcacacctgtcttac-ataatcttcgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaaca 18128953  T
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18128954 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacaatatataggacaacacccgattatattg 18129046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15736674 - 15736583
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaac-tcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15736674 actattatgcatggacatgtacacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattg 15736583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 18422210 - 18422304
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18422210 atcaccaatcacatacatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 18422304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18843315 - 18843225
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18843315 acgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacgacaa-acacaattttctccacaatatataggacgacacccaattata 18843225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25745991 - 25745897
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25745991 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcagttattgacacataaattcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 25745897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 18740861 - 18740937
Alignment:
Q  24 accaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18740861 accaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 18740937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 22428673 - 22428752
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  22428673 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 22428752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13622608 - 13622514
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaac-tcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13622608 gactatgatgcatgaacatgtacacggactcgataatgcaaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaactcccaattatattgat 13622514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Original strand, 18569274 - 18569350
Alignment:
Q  224 atgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18569274 atgtataaggactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 18569350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 18775687 - 18775759
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtacc 94  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18775687 atcaccattcacat-tttcaaataagacttatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 18775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 31627106 - 31627202
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31627106 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatataggacaatccccaattatattgat 31627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 16084086 - 16084180
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |  | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16084086 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgaaaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgat 16084180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 16105228 - 16105322
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||| |||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16105228 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataacgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgat 16105322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35017376 - 35017302
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  35017376 ataagactcatgtcatgatatgcacatattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 35017302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13016278 - 13016185
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || || | ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  13016278 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgactacaatccataattttcacctcaatatataggtctatatccaattatattgat 13016185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 18397594 - 18397690
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||  |||| | ||| | ||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  18397594 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatctacaattttcaccacaatatatagggcaactcccaattatattgat 18397690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 16105056 - 16105135
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |  |||||||||||||| |||||    
T  16105056 aagactcatgtcatgatatgtacttattgacacataaatgcatgtggtaccggataacctcaaggtcgtcaccttcgatg 16105135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Original strand, 18775882 - 18775972
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18775882 actataatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 18775972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 22430945 - 22431009
Alignment:
Q  234 actcgataatgcgacaacaattcacaatctcaact-caatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22430945 actcgataatgcgacaacaat-cacaatttaaaccacaatatataggacaacacccaattatattg 22431009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Original strand, 32896494 - 32896538
Alignment:
Q  43 taagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatg 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32896494 taagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 32896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18383327 - 18383276
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  18383327 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 18383276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 34965471 - 34965522
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  34965471 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 34965522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Original strand, 18741119 - 18741203
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  18741119 cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaa 18741203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 32897394 - 32897487
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||| ||||||||   |  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  32897394 actatgatgcacggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactctcaattttattgat 32897487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 19852796 - 19852840
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19852796 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 19852840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 5641 - 5940
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcgcatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 5740  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5741 caacaaggtcgtcacctccgatgggcaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacaac 5840  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5841 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 5940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 217451 - 217153
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||  || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  217451 ataatcattaattacatttcatgaacaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 217352  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  217351 ccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacc-ccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaaccctttta 217254  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    ||   || |||||||||||| ||||| ||||   |  |||||||||||||||||||| ||| || | ||  |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  217253 caattac-acgactatgatgtatggatatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcataattttctccataatatataggacaacacccaattata 217156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 16416929 - 16417228
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16416929 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcgcatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 16417028  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16417029 caacaaggtcgtcacctccgatgggcaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacaac 16417128  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417129 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 16417228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 7821390 - 7821685
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7821390 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 7821489  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7821490 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 7821589  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7821590 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 7821685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 7828701 - 7828996
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7828701 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 7828800  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7828801 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 7828900  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7828901 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 7828996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 27175082 - 27175377
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27175082 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 27175181  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27175182 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 27175281  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27175282 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 27175377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38785336 - 38785041
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38785336 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 38785237  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38785236 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 38785137  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38785136 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 38785041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 11514588 - 11514883
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11514588 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctac 11514687  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11514688 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 11514787  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11514788 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 11514883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27103244 - 27102949
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27103244 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 27103145  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27103144 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 27103045  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27103044 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 27102949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27110592 - 27110297
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27110592 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 27110493  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27110492 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 27110393  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27110392 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 27110297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30263821 - 30263526
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30263821 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 30263722  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30263721 aaggttgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatataaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 30263622  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30263621 acgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 30263526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15443256 - 15442961
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15443256 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 15443157  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15443156 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 15443057  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15443056 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 15442961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 10988077 - 10988373
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10988077 tcattcatctcatttaatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 10988176  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10988177 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 10988275  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10988276 caacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 10988373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25293976 - 25293680
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25293976 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 25293877  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293876 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 25293778  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25293777 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 25293680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 13757044 - 13757341
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13757044 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 13757143  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13757144 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatccattttacagcaa 13757242  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757243 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 13757341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26010890 - 26010593
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26010890 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtgccaaatctcaac 26010791  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26010790 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaacccttttacagca 26010692  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26010691 acatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 26010593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13912811 - 13912515
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13912811 tcattcatctcaattcatcgtcaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttacggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 13912712  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13912711 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 13912613  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13912612 caccgactatgatgcatggacatgtataatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 13912515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42057819 - 42057565
Alignment:
Q  47 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  |||||    
T  42057819 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaa 42057721  T
Q  146 gg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatg 244  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42057720 gggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatg 42057621  T
Q  245 cgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42057620 cgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 42057565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 369367 - 369646
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-c 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  369367 atcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 369466  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  ||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  369467 gatgc-cacttgcacatcgtatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaacccttttacagcaacatcgactatgatgca 369565  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  369566 tggacatgtataaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 369646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18255508 - 18255224
Alignment:
Q  18 ttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18255508 ttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 18255409  T
Q  118 ccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatga 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| | | | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  18255408 ccgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagcgcttagcccttttacaacaac-acgactatga 18255311  T
Q  215 tgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18255310 tgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 18255224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15952772 - 15952496
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-cgatg 123  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  15952772 ccaatcacat-tttcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaagtctcaacaaggtcgtcacctttcgatg 15952674  T
Q  124 gacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgga 222  Q
      ||  |  |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15952673 c-cacttgcacatcaaatgtaagggctcacatctgccttacaataatctcaaagtaaaagagttcaaccttttacaacaacaacgactatgatgcatgga 15952575  T
Q  223 catgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15952574 catgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 15952496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 2436090 - 2436386
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2436090 ataatcattcatcccatttcatcaccaatcacataattcacataggactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 2436189  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    ||| |||||||||||||  ||||   ||    ||||| ||||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||    
T  2436190 caaaaaggtcgtcacctttgatgataaa--acacatcacatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttac 2436282  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2436283 aacaacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 2436382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32496239 - 32495960
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32496239 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 32496140  T
Q  121 atgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  32496139 atggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgcgttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatg 32496042  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32496041 catggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 32495960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15526056 - 15525886
Alignment:
Q  133 acatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgta 230  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15526056 acatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtttaacctttttacagcaacatcgactatgatgcatggacatgtata 15525957  T
Q  231 agaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15525956 aggactcgataatgcgacaacgattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 15525886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15518555 - 15518443
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15518555 tcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 15518456  T
Q  105 aaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||    
T  15518455 aaggtcgtcacct 15518443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15762050 - 15761775
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  15762050 atcaccaaccacatttatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 15761951  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||   ||    |||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  15761950 atgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 15761855  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15761854 atggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 15761775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18981403 - 18981309
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18981403 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 18981309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16480432 - 16480338
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16480432 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 16480338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18981680 - 18981568
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18981680 tcattcatctcatttcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatctccaa 18981581  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  18981580 aaaggtcgtcacc 18981568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 15926034 - 15926129
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15926034 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 15926129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 15925758 - 15925869
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  15925758 tcattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctccaa 15925856  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  15925857 aaaggtcgtcacc 15925869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 36051331 - 36051426
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051331 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 36051426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2192469 - 2192357
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2192469 tcattcatctcatttcatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatttccaa 2192370  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  2192369 aaaggtcgtcacc 2192357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16480699 - 16480587
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16480699 tcattcatctcatttcatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgatacataaatgcatgtggtaccaaatctccaa 16480600  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  16480599 aaaggtcgtcacc 16480587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26071956 - 26071668
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  26071956 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 26071858  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    ||| | |||   ||||||| |||||||  | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||        |||    
T  26071857 atgcaacaaa--aacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 26071761  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26071760 ctatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgat 26071668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26095743 - 26095455
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  26095743 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 26095645  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    ||| | |||   ||||||| |||||||  | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||        |||    
T  26095644 atgcaacaaa--aacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 26095548  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26095547 ctatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgat 26095455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 16210447 - 16210542
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16210447 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacctaattatattgat 16210542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 298
Target Start/End: Original strand, 2027095 - 2027316
Alignment:
Q  79 aaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaag 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |  | |||||| |||||| || ||||| | | ||||| ||||||| |||||    
T  2027095 aaatgcatgtggtaccaaatctcgaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacccccgacttac-ataatctccgaag 2027193  T
Q  177 taaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa--tctcaactcaata 273  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | |||||    
T  2027194 taaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgcgtggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaaattttctccacaata 2027291  T
Q  274 tataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  2027292 tataggacaacacccaattatattg 2027316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11582338 - 11582243
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11582338 cgactatgatgcatggacatgtataaagactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacactcaattatattgat 11582243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 3893569 - 3893854
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  3893569 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 3893667  T
Q  121 atg-gacaagttaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaaca--------acga 208  Q
    |||  ||||   ||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||        ||||    
T  3893668 atgcaacaa--aaacatcgtatgtaagagttcacacctgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 3893764  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3893765 ctatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacaatatatatgacaacacccatttatattg 3893854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12545211 - 12545115
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12545211 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgat 12545115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15823909 - 15823813
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatc-tcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15823909 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaattaacaatcttcacctcaatataaaggacaacacccaattatattgat 15823813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 44863908 - 44864004
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44863908 acgactatgatgcatggacatatacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 44864004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1938439 - 1938364
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1938439 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 1938364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11582628 - 11582551
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582628 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 11582551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 300
Target Start/End: Original strand, 13571526 - 13571592
Alignment:
Q  234 actcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13571526 actcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataagacaacacccaattatattgat 13571592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13867573 - 13867477
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13867573 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacttcaatatatagaacaacacccaattatattgat 13867477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 47288440 - 47288536
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47288440 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattttcacctcaaaatataggacaacacccaattatattgat 47288536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Original strand, 7291259 - 7291355
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  7291259 atcaccaatcacat--ttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggccgccacctcc 7291355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 12753377 - 12753456
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  12753377 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 12753456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13038602 - 13038507
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaac-tcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||| || |||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13038602 cgactatgatgcttgaacatgtatagggactcaataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccgattatattgat 13038507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13867781 - 13867687
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13867781 atcaccaaccacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 13867687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Original strand, 125378 - 125585
Alignment:
Q  92 accaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctc-acctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcat 188  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |  | |||||| |||||||| |  ||  | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||     
T  125378 accaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggtttacacccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagctcaa 125476  T
Q  189 cccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacc 287  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||||||||    
T  125477 cccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacc 125574  T
Q  288 caattatattg 298  Q
    |||||||||||    
T  125575 caattatattg 125585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 142296 - 142386
Alignment:
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  142296 ctatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 142386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 298
Target Start/End: Original strand, 3058582 - 3058806
Alignment:
Q  73 acacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||   ||    |||||| |||||| || ||||  | ||||||  |||||||    
T  3058582 acacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccgcctta-tataatct 3058678  T
Q  172 -cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaact 268  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  |     
T  3058679 ccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctcca 3058776  T
Q  269 caatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3058777 caatatataggacaatacccaattatattg 3058806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Original strand, 122986 - 123059
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaat 98  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  122986 ccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtgccaaat 123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 112990 - 112899
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtc 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  112990 atcaccaatcacat-tttcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattaacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtc 112899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 36051071 - 36051149
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36051071 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgttatgttatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 36051149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 7291519 - 7291612
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7291519 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 7291612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13038902 - 13038825
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13038902 atcaccaatcacatatatca-ataaaactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 13038825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2192193 - 2192101
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2192193 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacagcaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 2192101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 44863618 - 44863712
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  44863618 atcaccaatcacatacatca-ataagactcatgtcatgatattcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 44863712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 45453944 - 45453844
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| |||||| ||    
T  45453944 atcaccaatcacaa--ttcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcatcaccttcg 45453847  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  45453846 atg 45453844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15824197 - 15824105
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtca 114  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  15824197 atcaccaaacacatacatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 15824105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 142046 - 142137
Alignment:
Q  24 accaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  142046 accaatcacatacatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcaacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 142137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1938266 - 1938176
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtg-taagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1938266 gactatgatgcatggacatgtaataaga-ctcgataatgcgacaacaattca-attttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 1938176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 16210186 - 16210265
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16210186 atcacaaatcacatatatca-atgagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcacgtggtaccaaatctc 16210265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 42059989 - 42059941
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatg 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42059989 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatg 42059941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Original strand, 12753549 - 12753623
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggac 281  Q
    |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||    
T  12753549 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaccacaatataaaggac 12753623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 47288151 - 47288228
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47288151 atcaccaattacatacatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 47288228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Original strand, 11285642 - 11285698
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaat 98  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11285642 ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaat 11285698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9322727 - 9322663
Alignment:
Q  55 tatgatatgcacttat---ggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9322727 tatgatatgcacttaatccggacacatatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacc 9322663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Original strand, 3055196 - 3055253
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacat 78  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  3055196 atcaccaatcacatatatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacat 3055253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45453754 - 45453661
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgac-acccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  45453754 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacttcccaattatattg 45453661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 4483269 - 4483320
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  4483269 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacgtcaaggtcgtcaccttcgatg 4483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9058275 - 9058224
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  9058275 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 9058224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 13388489 - 13388540
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  13388489 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 13388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Original strand, 11285878 - 11285932
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11285878 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaat 11285932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12249610 - 12249556
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12249610 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaat 12249556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12545498 - 12545402
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtacc-aaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||| |||  |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  12545498 atcaccaaccacatttatca-ataagacttatgtcatgatatgcaccaattgacacatatatgcatgtggtaccaaaatcacctcaaggtcgtcacct 12545402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3270 - 2975
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3270 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 3171  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3170 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 3071  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3070 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 2975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23194 - 23102
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23194 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 23102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 18246648 - 18246947
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246648 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 18246747  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18246748 caacaaggtcgtcacctctgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtaatcccttttacagc 18246847  T
Q  201 aacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246848 aacaacaactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaaaaaatcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 18246947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 10487133 - 10487428
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10487133 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 10487232  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10487233 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 10487332  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10487333 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 10487428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16329618 - 16329323
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16329618 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 16329519  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16329518 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 16329419  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16329418 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 16329323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 19998985 - 19999286
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19998985 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 19999084  T
Q  101 caacaaggtcgtcacct-ccgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19999085 caacaaggtcgtcaccttccgatgc-cacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 19999183  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19999184 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 19999283  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  19999284 gat 19999286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 47355783 - 47356084
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47355783 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgaacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 47355882  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47355883 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 47355981  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47355982 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatatt 47356081  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  47356082 gat 47356084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13049859 - 13049563
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13049859 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacatataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 13049760  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13049759 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 13049661  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13049660 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 13049563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 26337947 - 26338243
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26337947 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatagaactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaatctcaac 26338046  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26338047 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacaccgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 26338145  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26338146 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 26338243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 14950482 - 14950777
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950482 tcattcatctcaattcatcaccaatcacgtatttcacataggactcatgatatgatatgcacttattgacccataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 14950581  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950582 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcatacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 14950680  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14950681 ca-cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 14950777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 26678502 - 26678802
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678502 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcgtgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 26678601  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26678602 caacaaggtcgtcatctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagaatcatcccttttaca 26678700  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26678701 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatatt 26678799  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  26678800 gat 26678802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15274439 - 15274159
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct-cc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15274439 atcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggttgtcaccttcc 15274340  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15274339 gatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctaccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 15274241  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15274240 tggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 15274159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22356242 - 22355965
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc-c 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22356242 atcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 22356144  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356143 gatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 22356045  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22356044 tggacatgtataaggactcgataatgcgacaacagttcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattg 22355965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 14994658 - 14994951
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994658 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 14994757  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||     | |||| ||||||| ||||||||||||| |   | |||||||    
T  14994758 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaaggggtcac----tcgttac-ataatctccgaagtaaaagagccggactcttttac 14994852  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14994853 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 14994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15138258 - 15138077
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15138258 ataatcattcatcacatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 15138159  T
Q  101 caacaaggtcgtcacc-tccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaa 181  Q
    |||||||||| ||||| | |||| | ||  |  |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15138158 caacaaggtcatcacctttcgat-gccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaa 15138077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 16521301 - 16521544
Alignment:
Q  56 atgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacct 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||     
T  16521301 atgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacctccgatggacaagccaacatcgtatgtaagggttcaccc 16521400  T
Q  155 ctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaaca 252  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||    
T  16521401 ccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaac-tcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaaca 16521498  T
Q  253 attcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    | |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16521499 a-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 16521544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5684583 - 5684305
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc-tcc 119  Q
    |||| ||||||||||  |||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  5684583 atcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtgataccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 5684484  T
Q  120 gatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    ||| | ||  |  |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  5684483 gat-gccacttgcacatcgtatgtaaggactcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagctcaactcttttacagccac-acgactatgatgc 5684386  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684385 atggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttgtccacaatatataggacgacacccaattatattg 5684305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 8372931 - 8373035
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8372931 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 8373030  T
Q  101 caaca 105  Q
    |||||    
T  8373031 caaca 8373035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 109960 - 110236
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  109960 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 110059  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||   ||    |||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  110060 atgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 110155  T
Q  218 atggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  110156 atggacatgtaataag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattg 110236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Original strand, 15211817 - 15212054
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  15211817 atcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgagacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaaggacgtcacctct 15211916  T
Q  120 gatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgat 215  Q
    ||||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  15211917 gatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgat 15212014  T
Q  216 gcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaatt 255  Q
    ||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||    
T  15212015 gcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatt 15212054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 18167456 - 18167551
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18167456 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 18167551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15288503 - 15288409
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15288503 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaaactcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 15288409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15295613 - 15295519
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295613 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaaactcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 15295519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 18167175 - 18167291
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18167175 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatgtcacataagactcatgttatgatttgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatct 18167274  T
Q  101 -caacaaggtcgtcacc 116  Q
     ||| ||||||||||||    
T  18167275 ccaaaaaggtcgtcacc 18167291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15288722 - 15288611
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  15288722 tcattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctccaa 15288624  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  15288623 aaaggtcgtcacc 15288611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15295889 - 15295778
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  15295889 tcattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctccaa 15295791  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  15295790 aaaggtcgtcacc 15295778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 10642849 - 10642945
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10642849 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 10642945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 13245115 - 13245210
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13245115 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgaaacccaattatattgat 13245210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 54119757 - 54119661
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54119757 acgactatgatacatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 54119661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 33738927 - 33739023
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33738927 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 33739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 10642589 - 10642684
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10642589 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 10642684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 44345489 - 44345585
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44345489 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatgggacaacacccaattatattgat 44345585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45460453 - 45460357
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45460453 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcaataatgcgacgacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 45460357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 9293927 - 9294022
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9293927 atcaccaatcacatttatgaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 9294022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 9294187 - 9294280
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9294187 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 9294280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12901459 - 12901172
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  12901459 atcaccaatcacat--ttcaaagaagactcatgtcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 12901362  T
Q  121 atg-gacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    |||  ||||   ||||||| ||||||    ||||  | | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||          |    
T  12901361 atgcaacaa--aaacatcgtatgtaatatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatttcaacttta 12901265  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901264 ctatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 12901172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53706286 - 53706190
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53706286 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaataataatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 53706190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16366454 - 16366360
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16366454 atcactaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 16366360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7133945 - 7133851
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7133945 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacatttcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 7133851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25120650 - 25120524
Alignment:
Q  172 cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactc 269  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |    
T  25120650 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccac 25120553  T
Q  270 aatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120552 aatatataggacgacacccaattatattg 25120524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53909266 - 53909170
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53909266 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatacaggacaacacccaattatattgat 53909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 53909523 - 53909430
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  53909523 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 53909430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12838017 - 12837914
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatg--gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc 118  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  12838017 atcaccaatcacatatatcaaa-aagactcatgtcatgatatgcacctatatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacctt 12837919  T
Q  119 cgatg 123  Q
    |||||    
T  12837918 cgatg 12837914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 44054334 - 44054406
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtacc 94  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44054334 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 44054406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 44054584 - 44054680
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44054584 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 44054680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 54119983 - 54119904
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  54119983 atcaccgatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatctggtaccaaatctc 54119904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21961234 - 21961155
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  21961234 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 21961155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 13244768 - 13244845
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13244768 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatccacctattgacacatatatgcatgtgggaccaaatc 13244845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 34393716 - 34393809
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34393716 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 34393809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8874161 - 8874080
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  8874161 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 8874080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13751790 - 13751685
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||  || || ||||||||||||||| ||    
T  13751790 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataacacaactcccaattatattgatcat 13751691  T
Q  304 gtccat 309  Q
     |||||    
T  13751690 ctccat 13751685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 44345260 - 44345335
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  44345260 ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaacaaatcacctcaaggtcgtcacct 44345335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8873989 - 8873896
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8873989 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 8873896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 33738638 - 33738731
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  33738638 atcaccaatcacatacatca-ataagactcatgtcatgatatgcatgtatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccttaaggtcgtcac 33738731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 14899970 - 14900053
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  14899970 ataagactcatgtcatgatatgcacgtagttcgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcacctccgatg 14900053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 43283118 - 43283041
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  43283118 ataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacct 43283041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 7134152 - 7134088
Alignment:
Q  23 caccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgt 88  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7134152 caccaatcacat-ttccaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 7134088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Original strand, 8373045 - 8373109
Alignment:
Q  234 actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373045 actcgataatgcgacaacaat-cacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 8373109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21961064 - 21960987
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  21961064 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaattcacaattttcaccacaatatataggac 21960987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30235986 - 30235942
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaac 251  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  30235986 gactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaac 30235942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12245899 - 12245848
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  12245899 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 12245848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15852963 - 15852912
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  15852963 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 15852912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 7848829 - 7848902
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtacca 95  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7848829 atcaccactcaca-atttcaaatgagattcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacca 7848902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 52267196 - 52267123
Alignment:
Q  46 gactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  52267196 gactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacct 52267123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41257995 - 41257951
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41257995 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 41257951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Original strand, 41392914 - 41393208
Alignment:
Q  6 cattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaaca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41392914 cattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatactatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaaca 41393013  T
Q  106 aggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41393014 aggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaa 41393113  T
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41393114 cgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcagtatataggacaacacccaattatattgat 41393208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 17003286 - 17003581
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003286 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 17003385  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17003386 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 17003485  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17003486 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 17003581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 51451074 - 51451369
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51451074 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 51451173  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51451174 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 51451273  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51451274 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 51451369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 22034309 - 22034605
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22034309 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 22034408  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22034409 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 22034507  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22034508 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 22034605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 17147238 - 17147539
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147238 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 17147337  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147338 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 17147436  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147437 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatatt 17147536  T
Q  298 gat 300  Q
    |||    
T  17147537 gat 17147539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20826925 - 20826629
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20826925 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 20826826  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826825 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 20826727  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20826726 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 20826629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18602747 - 18602451
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18602747 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacccaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 18602648  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18602647 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcgtcccttttacagcaa 18602549  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18602548 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 18602451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5074004 - 5073708
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5074004 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacccaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 5073905  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5073904 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 5073806  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5073805 caacgactatgatgcatggtcatgtgtaatgactcgataatgcgacaccaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 5073708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7642286 - 7641990
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7642286 tcattcatatcgattcatcaccaatcacataattcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 7642187  T
Q  105 aaggtcgtcacc-tccgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||| | |||| | ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  7642186 aaggtcgtcacctttcgat-gccacttgcacatcgaatgtaaggactcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcc--------gcaa 7642096  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7642095 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgatga 7641996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 22226439 - 22226738
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22226439 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 22226538  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22226539 ccaaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttac 22226635  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22226636 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 22226734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 45050144 - 45050440
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45050144 ataatcattcatctcattccatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttgttgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 45050243  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| |   | |||||||    
T  45050244 ccaaaaggtcatcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccggactcttttac 45050338  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45050339 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatatt 45050437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 22352604 - 22352885
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22352604 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 22352703  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22352704 atggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctctgaagtaagagagctcaacccttttacaacaac-acgactatgatgc 22352801  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22352802 atggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaaacaacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 22352885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 22029299 - 22029454
Alignment:
Q  146 ggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgc 245  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22029299 ggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgc 22029398  T
Q  246 gacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacc-caattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  22029399 gacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacaccaccattatattgat 22029454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44036607 - 44036308
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036607 ataatcattaatcacatttcatgaacaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttactgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 44036508  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44036507 ccaaaaggtcgtcacctctgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggtccacccctgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaaccctttta 44036409  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || | || ||||||||||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  44036408 caactac-acgactatgatgcatagacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatgtataggacaacacccaattata 44036311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35935280 - 35935143
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35935280 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacgaatttgacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 35935181  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcg 138  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35935180 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcg 35935143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15863108 - 15862839
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgg 124  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  15863108 ccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatga 15863010  T
Q  125 acaagttaacatcgcatgtaaggc-tcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgg 221  Q
      ||    |||||| ||||||||  ||||     ||||||| ||||||| |||||||||||| | | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15863009 taaaac--acatcgtatgtaaggggtcact----ccttaca-taatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaacaacatcgactatgatgcatgg 15862917  T
Q  222 acatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattga 299  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15862916 acatgtataaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattga 15862839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 20929930 - 20930228
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || |||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20929930 ataatcattaatcacatttcatggacaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 20930028  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatg-gacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| || |||||    
T  20930029 ccaaaaggtcgtcacctccgatgtaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccaaagtaaaagagctcaaccatttta 20930127  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20930128 caacaac-acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccataatatataggacaacacccaattata 20930225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18061109 - 18061015
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18061109 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggactacacccaattatattgat 18061015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21651436 - 21651342
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651436 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatacgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 21651342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21651712 - 21651601
Alignment:
Q  6 cattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  21651712 cattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatctccaaa 21651613  T
Q  105 aaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||    
T  21651612 aaggtcgtcacc 21651601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 29137281 - 29137376
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29137281 tcattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctc 29137376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 22365417 - 22365512
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22365417 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 22365512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37846159 - 37845874
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  37846159 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 37846061  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaaca--------acga 208  Q
    ||| | |||    |||||| |||||| || ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | |||        | ||    
T  37846060 atgaatcaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctctgaagtaaaagagctcagcccttttacaactacaatttcaacatga 37845964  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37845963 ctatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 37845874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 18506021 - 18506114
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18506021 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 18506114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 20444217 - 20444318
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  20444217 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 20444315  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  20444316 atg 20444318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20895194 - 20895098
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20895194 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgccacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacacaattatattgat 20895098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 49966313 - 49966406
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49966313 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 49966406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22407697 - 22407601
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22407697 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactggataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 22407601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 41210707 - 41210803
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41210707 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatataggacaacacctaattatattgat 41210803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 22365158 - 22365253
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22365158 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 22365253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2422473 - 2422377
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2422473 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaactttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 2422377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 20529981 - 20530060
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20529981 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 20530060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22250681 - 22250618
Alignment:
Q  56 atgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22250681 atgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctcc 22250618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 49966058 - 49966152
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  49966058 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 49966152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22250455 - 22250362
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22250455 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggactacacccaattatattg 22250362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9785992 - 9785898
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9785992 atcaccaaccacatttatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 9785898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22407987 - 22407893
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22407987 atcaccaatcacatatatca-ataagacttatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 22407893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20895483 - 20895406
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20895483 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 20895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 35053332 - 35053413
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  35053332 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 35053413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2422826 - 2422732
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  2422826 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcacc 2422732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35523921 - 35523826
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35523921 cgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 35523826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 41218115 - 41218208
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41218115 acgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacgacacccaattatattg 41218208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5676291 - 5676199
Alignment:
Q  24 accaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||    
T  5676291 accaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccgtatcacctcaaggtcgtcacct 5676199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 298
Target Start/End: Original strand, 21716868 - 21716961
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21716868 cgactatgatgcatggacatgcaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattg 21716961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 21857966 - 21858037
Alignment:
Q  29 tcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21857966 tcacatatgtca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtaccaaatctc 21858037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5676102 - 5676009
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5676102 acgactatgatgcatgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 5676009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20122107 - 20122065
Alignment:
Q  258 caatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20122107 caatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 20122065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 35053504 - 35053597
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35053504 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcaataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 35053597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22837006 - 22836909
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  22837006 atcatcaatcacatttatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacct 22836909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9785735 - 9785642
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9785735 acgactatgatgtatggacatgtgacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattg 9785642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20956702 - 20956625
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20956702 ataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacct 20956625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37235604 - 37235553
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  37235604 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 37235553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 116
Target Start/End: Original strand, 18505814 - 18505856
Alignment:
Q  74 cacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18505814 cacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 18505856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 20526780 - 20526873
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20526780 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaactttctccacaatatataggacaccacccagttatattg 20526873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2422579 - 2422531
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||    
T  2422579 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa 2422531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 5472027 - 5471983
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  5472027 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 5471983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22145035 - 22144991
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22145035 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 22144991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41213310 - 41213266
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41213310 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 41213266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51657826 - 51657770
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  51657826 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcaacatcacttcacaat 51657770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 642953 - 643248
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  642953 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 643052  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  643053 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 643152  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  643153 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 643248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 272896 - 272601
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272896 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 272797  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  272796 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 272697  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  272696 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 272601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 828759 - 829054
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828759 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 828858  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  828859 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 828958  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  828959 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 829054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 5236658 - 5236953
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236658 tcattcttctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 5236757  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236758 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 5236857  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5236858 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 5236953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24662940 - 24662645
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24662940 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 24662841  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24662840 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 24662741  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24662740 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 24662645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 43684117 - 43684412
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43684117 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcagtaccaaatctcaac 43684216  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43684217 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatctcttttacagcaaca 43684316  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43684317 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 43684412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3433274 - 3432974
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433274 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 3433175  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433174 caacaaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttaca 3433076  T
Q  199 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433075 gcaacaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 3432976  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  3432975 at 3432974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21846185 - 21845889
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846185 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 21846086  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21846085 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagaatcatcccttttacagcaa 21845987  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21845986 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 21845889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21853590 - 21853294
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21853590 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 21853491  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21853490 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 21853392  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21853391 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacagcaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 21853294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16676020 - 16675724
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16676020 tcattcatcccaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 16675921  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16675920 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 16675822  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16675821 caacgactatgatgcatggacatgtgtaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 16675724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 224857 - 224542
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  224857 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 224758  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  224757 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagcaaaagagtcatcccttttacagcaa 224659  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  224658 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatt 224559  T
Q  302 atgtccatctcattgca 318  Q
    || ||||  ||||||||    
T  224558 atctccacatcattgca 224542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 738480 - 738165
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  738480 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 738381  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  738380 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagcaaaagagtcatcccttttacagcaa 738282  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  738281 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatt 738182  T
Q  302 atgtccatctcattgca 318  Q
    || ||||  ||||||||    
T  738181 atctccacatcattgca 738165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 862375 - 862060
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  862375 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 862276  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  862275 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagcaaaagagtcatcccttttacagcaa 862177  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  862176 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatt 862077  T
Q  302 atgtccatctcattgca 318  Q
    || ||||  ||||||||    
T  862076 atctccacatcattgca 862060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16874621 - 16874336
Alignment:
Q  17 attcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874621 attcatcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 16874522  T
Q  117 tc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatga 214  Q
    |  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874521 tttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatga 16874423  T
Q  215 tgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874422 tgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 16874336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22090138 - 22089841
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090138 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 22090039  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |    
T  22090038 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaactcttttacagaa 22089940  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22089939 acaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 22089841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 701270 - 700955
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  701270 tcattcatctcaattcatcacccatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacaaaaaaatgcatgcggtaccaaatctcaac 701171  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  701170 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagcaaaagagtcatcccttttacagcaa 701072  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  701071 caacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatt 700972  T
Q  302 atgtccatctcattgca 318  Q
    || ||||  ||||||||    
T  700971 atctccacatcattgca 700955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15320754 - 15320457
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15320754 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 15320655  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  15320654 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaactcttttacagca 15320556  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15320555 acaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattgtattgat 15320457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15501123 - 15500826
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15501123 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 15501024  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  15501023 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaactcttttacagca 15500925  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15500924 acaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattgtattgat 15500826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 24547683 - 24547979
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24547683 ataatcattcatctcattccatcaccaatcacgaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 24547782  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||| |   | |||||||    
T  24547783 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagagccggactcttttac 24547877  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24547878 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatatt 24547976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24387408 - 24387110
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24387408 ataatcattaatcacatttcatgaacaatcatatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 24387309  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24387308 caa-aaggtcgtcacctctgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggctcacccctgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaaccctttta 24387211  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24387210 caactac-acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattata 24387113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24930789 - 24930516
Alignment:
Q  28 atcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgg-ac 126  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  24930789 atcacgtatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaac 24930690  T
Q  127 aagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggac 223  Q
    || | ||||||| |||||| || ||||| | || |||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  24930689 aactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgctttac-ataatctctgaagtaaaagagctcaactcttttacaacaac-acgagtatgatgcatggac 24930592  T
Q  224 atgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24930591 atgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattg 24930516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 23509377 - 23509493
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509377 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 23509476  T
Q  101 caacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  23509477 caacaaggtcgtcacct 23509493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16204016 - 16203739
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  16204016 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 16203918  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||||  | || |||||| |||||| || ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  16203917 atggatcaattcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 16203820  T
Q  218 atggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16203819 atggacatgtaataag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 16203739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Original strand, 29758771 - 29759045
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  29758771 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 29758870  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||||  |  | |||| | |||||| || ||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  29758871 atggaacaaatcacattgtatgtaagggttcacacccgccttacaa-aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgc 29758968  T
Q  218 atggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattat 294  Q
    ||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29758969 atgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattat 29759045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6775725 - 6775630
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6775725 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 6775630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43375075 - 43374980
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43375075 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 43374980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13664130 - 13664034
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13664130 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 13664034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13723405 - 13723309
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13723405 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 13723309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22007973 - 22007877
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22007973 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 22007877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 298
Target Start/End: Original strand, 270226 - 270494
Alignment:
Q  27 aatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggac 126  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||       
T  270226 aatcacatatatca-ataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata 270324  T
Q  127 aagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggaca 224  Q
    ||    |||||| ||  | || |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  270325 aa--acacatcgtattaatggttcacatccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgcatggaca 270420  T
Q  225 tgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  270421 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 270494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 645694 - 645426
Alignment:
Q  27 aatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggac 126  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||       
T  645694 aatcacatatatca-ataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata 645596  T
Q  127 aagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggaca 224  Q
    ||    |||||| ||  | || |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  645595 aa--acacatcgtattaatggttcacatccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagatcaacccttttacaactac-acgactatgatgcatggaca 645500  T
Q  225 tgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  645499 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 645426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 831429 - 831161
Alignment:
Q  27 aatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggac 126  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||       
T  831429 aatcacatatatca-ataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata 831331  T
Q  127 aagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggaca 224  Q
    ||    |||||| ||  | || |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  831330 aa--acacatcgtattaatggttcacatccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgcatggaca 831235  T
Q  225 tgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  831234 tgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 831161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22008233 - 22008138
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22008233 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 22008138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24718912 - 24718816
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24718912 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 24718816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 24108338 - 24108244
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24108338 atcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacc 24108244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 309
Target Start/End: Original strand, 41245327 - 41245432
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  41245327 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggactactcccaattatattgattat 41245426  T
Q  304 gtccat 309  Q
     |||||    
T  41245427 ctccat 41245432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13664390 - 13664295
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13664390 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacc 13664295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13723665 - 13723570
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13723665 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacc 13723570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22909239 - 22909142
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22909239 atcatcaatcacat-tttcaaatctgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctcc 22909142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22322930 - 22322834
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322930 acgactatgatgcatggacatgtacaaggacttgataatgcgacaataatccataattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 22322834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24108079 - 24107987
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24108079 acgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaaca--ccacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 24107987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 43375278 - 43375200
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43375278 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 43375200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19994895 - 19994801
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19994895 atcaccaaacacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 19994801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19994646 - 19994536
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatgatg 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||     
T  19994646 cgactataatgcatggacatgtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacacaactatattgattatc 19994547  T
Q  305 tccatctcatt 315  Q
    ||||| |||||    
T  19994546 tccatttcatt 19994536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 24719169 - 24719076
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24719169 tcaccaatcatatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 24719076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 41244113 - 41244209
Alignment:
Q  26 caatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  41244113 caatcacatatatca-ataagattcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 41244209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 16416924 - 16417020
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||  || |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16416924 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgtgacaattatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 16417020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20655519 - 20655423
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20655519 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 20655423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 25121206 - 25121302
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  25121206 acgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacttccaattatattgat 25121302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20648932 - 20648838
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || || |||||||||||||||    
T  20648932 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatatagaacaactcccaattatattgat 20648838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22908978 - 22908885
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22908978 acgactatgatgcatggacatatacaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 22908885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 25120939 - 25121013
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25120939 ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 25121013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 37605657 - 37605750
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37605657 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 37605750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 37610031 - 37610124
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37610031 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 37610124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 20480337 - 20480429
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20480337 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacattttcaccacaatatataggacaacacctaattatattg 20480429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 37605464 - 37605536
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtacc 94  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37605464 atcatcaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 37605536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 16416737 - 16416812
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  16416737 ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcatcacct 16416812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20568757 - 20568666
Alignment:
Q  210 tatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20568757 tatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 20568666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20574950 - 20574859
Alignment:
Q  210 tatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20574950 tatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 20574859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 20480073 - 20480168
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||    
T  20480073 atcaccgagcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaatgtcgtcacct 20480168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22323194 - 22323101
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22323194 atcaccaaacacatttatca-ataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcacc 22323101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23116462 - 23116418
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23116462 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacc 23116418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 28543600 - 28543656
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28543600 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaat 28543656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39448464 - 39448413
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  39448464 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 39448413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22498945 - 22498901
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22498945 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 22498901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 25294491 - 25294574
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||  | ||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  25294491 ataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 25294574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 25756480 - 25756563
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||  | ||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  25756480 ataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 25756563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 33170786 - 33170830
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  33170786 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 33170830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 37752 - 38047
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37752 tcattcttctccattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 37851  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37852 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagattcatcccttttacagcaaca 37951  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37952 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 38047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 25366 - 25661
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25366 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 25465  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25466 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 25565  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25566 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaa-tcaccatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 25661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 21111 - 21406
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21111 tcattcatctcaattcatcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccatatctcaac 21210  T
Q  105 aaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211 aaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaaca 21310  T
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21311 acgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgataacaa-tcaccatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 21406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17787 - 17491
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17787 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 17688  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaa 202  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17687 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcaaagtaaaagagtcatcccttttacaacaa 17589  T
Q  203 caacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17588 caacgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaatgatattgat 17491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 29814 - 30111
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29814 tcattcatctcaaatcatcaccaatcacacaattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaac 29913  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  29914 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctcgaagtaaaagagttcaactcttttacagca 30012  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30013 acaacgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 30111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 15902 - 16203
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15902 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtatcaaatct 16001  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16002 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttac 16100  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16101 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtgtaaggactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 16199  T
Q  297 tgat 300  Q
    ||||    
T  16200 tgat 16203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13782
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  13883 atcaccaaccacatttatca-ataagattcatgtcatgatatacacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 13785  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  13784 atg 13782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 34796 - 35093
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 104  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34796 tcattcatctcatttaatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaac 34895  T
Q  105 aaggtcgtcacctc-cgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctcgaagtaaaagagt-catcccttttacagca 201  Q
    |||||||||||||  |||||  ||  |  |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  34896 aaggtcgtcacctttcgatgc-cacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatatcgaagtaaaagagttcaatccttttatagca 34994  T
Q  202 acaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34995 acatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 35093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 156051 - 155754
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  156051 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatgtcacataagactcatgttatgatctgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 155952  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagtc--atccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||     |||||| |||||||| |||||||||||| |  ||  ||||||    
T  155951 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctctgaagtaaaagagccggat-tctttta 155858  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  155857 caacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataagaactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattata 155759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 844
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  936 actatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacacccaattatattgat 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4601
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4300 ataatcattaatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 4399  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4400 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttac 4498  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4499 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 4597  T
Q  297 tgat 300  Q
    ||||    
T  4598 tgat 4601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6842 - 6549
Alignment:
Q  9 tcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaagg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6842 tcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaagg 6743  T
Q  109 tcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||      
T  6742 tcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaac-t 6645  T
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6644 cgactatgatgcatggaaatgtataaggactcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 59129 - 58933
Alignment:
Q  9 tcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaagg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  59129 tcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaattttaaaaagg 59030  T
Q  109 tcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  59029 tcgtcacctccgatggacaagtcaacatcttatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaac 58933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 106563 - 106512
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  106563 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 106512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 130410 - 130454
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  130410 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 130454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 300
Target Start/End: Original strand, 106461 - 106760
Alignment:
Q  3 aatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctca 102  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  106461 aatcattcaccacatttcatcaccaatcacataagtcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcc 106560  T
Q  103 acaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacag 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  106561 aaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcatatgtaagggatcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaa 106659  T
Q  200 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106660 caac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaaaaatccacagtttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattg 106758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 128847 - 129146
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  128847 ataatcattcatctcatttcatcatcaatcacctataacacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 128946  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc--atccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||     |||||| ||||||| ||||||||||||  |  | | ||||||    
T  128947 ccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcac----tccttac-ataatctccgaagtaaaagaagccgaactctttta 129041  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctc-aactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  129042 caacgacatcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattata 129141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 90376 - 90285
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  90376 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcg---acaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 90285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 90689 - 90599
Alignment:
Q  25 ccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||    
T  90689 ccaatcacatacatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatttggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 90599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9627 - 9326
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9627 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcactttttgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 9528  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||| |||||||||||||||| || || |||  |||||| || ||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9527 ccaaaaggtcatcacctccgatggacatgtcaatatcatatgtaagggttcaaccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttac 9429  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9428 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgctacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacagcacccaattatat 9330  T
Q  297 tgat 300  Q
    ||||    
T  9329 tgat 9326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 14759 - 15058
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14759 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggaaccaaatct 14858  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||| |  |||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14859 ccaaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacccccaccttac-ataatctccgaaataaaagagctcaacccttttac 14955  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaac-tcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14956 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacttcaatatataggacaacacccaattatat 15054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28280 - 28523
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28280 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgatatgatattcatttattgacacataaatgcatgtggcaccaaatct 28379  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  28380 ccaaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaattaaaagagctcaacccttttac 28476  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgc 245  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28477 aacaac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgc 28523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 74 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 67067 - 66840
Alignment:
Q  74 cacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaagg-ctcacctctgccttacaataatctc 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    | | ||  |  ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  67067 cacataaatgcatgaggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgttgccacttgcacatcgattgtaagggctcacacctgccttacaataatctc 66968  T
Q  173 gaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  66967 gaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtctaatgactcgataatgcgacaacaattctcaatctcaactcaat 66868  T
Q  273 atataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  66867 atataggacaacacccaattatattgat 66840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 94985 - 95081
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  94985 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatatagaacaacactcaattatattgat 95081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 67092 - 67062
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacata 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67092 tcattcatctcaattcatcaccaatcacata 67062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 67122 - 67093
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacat 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67122 tcattcatctcaattcatcaccaatcacat 67093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 51491 - 51790
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51491 ataatcattcatctcatttcatcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcacgtggtaccaaatct 51590  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    | | |||||| ||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51591 ccaaaaggtcatcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacccccgcctgac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttac 51687  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    | ||||  ||| ||||||||||| | |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51688 aacaac-tcgaatatgatgcatgaaaatgtataaggaatcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatat 51786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Original strand, 18 - 315
Alignment:
Q  4 atcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-ca 102  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18 atcattaatcacatttcatcaccaaccacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaattctcca 117  T
Q  103 acaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacag 199  Q
    | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||     
T  118 aaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaa 214  T
Q  200 caacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  215 caac-tcgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattg 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 109742 - 109482
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcat 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  109742 ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggacaagtcaacatcgtat 109643  T
Q  142 gtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcg 238  Q
    |||| || ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  109642 gtaagggttcacccccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagatcaaccattttacaacaac-tcgactatgatgcataaacatgtataaggactcg 109545  T
Q  239 ataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  109544 ataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 109482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 54119 - 54395
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||    
T  54119 atcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcactttcg 54218  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgc 217  Q
    |||   ||    |||||| |||||| || ||||  |   ||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| | |  |||||||||||||    
T  54219 atgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccagcttac-ataatctctgaagtaaaagagctcaacctttttacaacta-tacgactatgatgc 54314  T
Q  218 atggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54315 atggacatgtagtaag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 54395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32894 - 32595
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32894 ataatcattaatcacatttcatgaacaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 32795  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32794 ccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaaccctttta 32696  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattat 294  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32695 caactac-acgactatgatgcatggacatgtagcaag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacagccaattat 32599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Original strand, 33756 - 33852
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33756 tcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctcc 33852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 34016 - 34109
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34016 acgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattg 34109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 39950 - 40249
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950 ataatcattaatcacatttcatgaacaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 40049  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40050 ccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaaccctttta 40148  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattat 294  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40149 caactac-acgactatgatgcatggacatgtagcaag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacagccaattat 40245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39088 - 38992
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39088 tcaccaatcacat-tttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctcc 38992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38828 - 38735
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38828 acgactatgatgcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccataatatataggacaacacccaattatattg 38735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1186
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattca-tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1488 ataatcattcatctcatttcaatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 1389  T
Q  100 tcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttac 197  Q
    || | |||||||||||||||||||   ||    |||||| |||||||| |   ||   |||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||    
T  1388 tccaaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacatcgtatgtaagggttcact---ccttac-ataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttac 1295  T
Q  198 agcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-------ctcaatatataggacgacacccaa 290  Q
    | ||||  ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||       ||||||||||||||| ||||||||    
T  1294 aacaac-tcgactatgatgcatgaacatatataaggactcgataatgcgaccacaattcacaatttcaatctcaatctcaatatataggacaacacccaa 1196  T
Q  291 ttatattgat 300  Q
    ||||||||||    
T  1195 ttatattgat 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Original strand, 145012 - 145288
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccga 121  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  145012 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcga 145110  T
Q  122 tggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  |  | |||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  145111 tggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgca 145208  T
Q  219 tggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  145209 tggacatgtaataag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 145288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Original strand, 147271 - 147547
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccga 121  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||    
T  147271 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcaccttcga 147369  T
Q  122 tggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    ||||  |  | |||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  147370 tggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgca 147467  T
Q  219 tggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  147468 tggatatgtaataag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattg 147547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4432 - 4153
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4432 atcaccaatcacatatatcaaataagagtaatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 4333  T
Q  121 atgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4332 atggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaac-acgactatgatg 4235  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||| ||||   |  ||||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  4234 catggatatgtaacaagactcgataatgcgacaagaa-tcacaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattg 4153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 558 - 836
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  558 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 656  T
Q  121 atgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  657 atggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaaccac-acgactatgatg 754  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||| |||    |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  755 catggagatggaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Original strand, 3426 - 3519
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  3426 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 3519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 49272 - 48993
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  49272 atcaccaatcacatatatcaaataagagtaatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 49173  T
Q  121 atgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49172 atggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaacaac-acgactatgatg 49075  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||| ||||   |  ||||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  49074 catggatatgtaacaagactcgataatgcgacaagaa-tcacaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattg 48993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5274 - 5002
Alignment:
Q  26 caatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgga 125  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5274 caatcacatatatca-ataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 5176  T
Q  126 caagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgga 222  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  5175 caagtaaacatcgtatgtaagggttcactgccgccttac-ataatctccaaagtaaaagagctcaacccttttaccacaac-acgactatgatgcatgga 5078  T
Q  223 catgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5077 catgtaataag-actcgacaatgcgacaataa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12876 - 12786
Alignment:
Q  26 caatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12876 caatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 12786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Original strand, 270599 - 270895
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  270599 atcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcacctccg 270698  T
Q  121 atgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatg 216  Q
    |||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||    
T  270699 atggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatg 270796  T
Q  217 catggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgatgatgtccatctcatt 315  Q
    |||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  270797 catgaacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctccatatcatt 270895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 236654 - 236939
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| ||    
T  236654 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccttatcacctctaggtcgtcaccttcg 236752  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaaca--------acgac 209  Q
    || |  |  ||||||||| |||||||   ||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||        |||||    
T  236753 at-gctactttaacatcgtatgtaagatttcacacctttcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 236850  T
Q  210 tatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  236851 tatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaatttccaccacaatatataggacaacacccaattatattg 236939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 7465 - 7736
Alignment:
Q  26 caatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgga 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  7465 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgtacttgttgacacataaatgcatgtcgtaccaaatctccaaaaggtcatcacctctgatgga 7564  T
Q  126 caagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgga 222  Q
    ||||| ||||||| || ||| || ||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7565 caagtcaacatcgtatataagggttcaccccagccttac-ataatctccaaagtaaaagagttcaacccttttacaacaac-acgactatgatgcatgga 7662  T
Q  223 catgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatat 296  Q
    |||||   |  |||||||||| ||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7663 catgtaacaagactcgataatacgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatat 7736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Original strand, 7322 - 7362
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaat 82  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7322 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaat 7362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 1
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 ataatcattcatttcatttcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatct 15  T
Q  101 caacaaggtcgtca 114  Q
    | | ||||||||||    
T  14 ccaaaaggtcgtca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 129877 - 129603
Alignment:
Q  26 caatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgg- 124  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||     
T  129877 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcttcacctccgatgga 129778  T
Q  125 acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatgg 221  Q
    |||| | ||||| | |||||| || ||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  129777 acaactcaacattgtatgtaagggttcacccccgccttac-ataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttacaacaa-tacgactatgatgcatgg 129680  T
Q  222 acatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129679 acatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 129603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Original strand, 21037 - 21129
Alignment:
Q  23 caccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21037 caccaatcacatacatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 21129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 115
Target Start/End: Original strand, 28627 - 28718
Alignment:
Q  23 caccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  28627 caccaatcacatacatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtgccaaatctcctcaaggtcgtcac 28718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 21325 - 21419
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||  ||||| | |||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21325 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatacgacaacaaaccacaattttcacttcagtatataggacaacaccgaattatattgat 21419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2815 - 2535
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatg--cacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctc 118  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2815 atcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgatatgtgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc 2716  T
Q  119 cgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatga 214  Q
     ||||| |||| | ||||||| |||||| || ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  2715 tgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatga 2618  T
Q  215 tgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||   |  ||||| |||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2617 tgcatggacatgtaacaagactcg-taatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 298
Target Start/End: Original strand, 41222 - 41464
Alignment:
Q  58 gatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatgg-acaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctc 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||| || ||||| |    
T  41222 gatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacagctcaacatcgtatgtaagggttcacccc 41321  T
Q  156 tgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaa 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  41322 tgccttac-ataatctacgaagtaaaagagctcaacccttttacaactac-acgactatgatgcatagaaatgtaaaaagactcgataatgcgacaacaa 41419  T
Q  254 ttcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
     |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41420 -tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 41464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 197803 - 197507
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  197803 ataatcattaatcacatttcatgaacaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatacatgtggtaccaaatct 197704  T
Q  101 caacaaggtcgtcacctccgatg-gacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagag-tcatccctttta 196  Q
    | | ||||||||||||| |||||  | |||   |||||| |||||| || ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  197703 ccaaaaggtcgtcaccttcgatgataaaag---acatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctctgaagtaaaagagctcaaccctttta 197608  T
Q  197 cagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattata 295  Q
    || | || || |||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  197607 caactac-acaactatgatacatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattata 197510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 84943 - 84987
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  84943 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 84987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11713 - 11439
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  11713 atcaccaatcacatacatcaaataagactcatgtcatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcg 11614  T
Q  121 atggacaagttaacatcgcatgtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtcatcccttttacagcaacaacgactatgatgca 218  Q
    |||   ||    |||||| |||||| || ||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  11613 atgataaa--acacatcgtatgtaagggttcacacccgccttac-ataatctccgaagtaaaagaacca-cccttttacaactac-acgactatgatgca 11519  T
Q  219 tggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||   |  |||||||||||| ||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11518 tggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 11439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 1848 - 1944
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1848 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 1510 - 1604
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  1510 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaagggtcgtcacc 1604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15641 - 15530
Alignment:
Q  5 tcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatct-caa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  15641 tcattcatctcaattcatcaccaatcacccatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacat-aatgcatgtggtaccgaatctccaa 15543  T
Q  104 caaggtcgtcacc 116  Q
     ||||||||||||    
T  15542 aaaggtcgtcacc 15530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15359 - 15263
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15359 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 15263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 10)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 193278 - 193374
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193278 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 193374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 76186 - 76092
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  76186 gactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggatgacacccaattatattgat 76092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 124787 - 124691
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  124787 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 124691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 256405 - 256309
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  256405 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 256309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 125086 - 125007
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  125086 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 125007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 256653 - 256558
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  256653 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacct 256558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 72105 - 72012
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  72105 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaagggtcgtcac 72012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 76486 - 76393
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  76486 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaagggtcgtcac 76393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 192983 - 193074
Alignment:
Q  24 accaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  192983 accaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaagggtcgtcacc 193074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 262975 - 262915
Alignment:
Q  241 aatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  262975 aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 262915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 138499 - 138212
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  138499 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 138401  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    ||| | |||   ||||||| ||||||   | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||        |||    
T  138400 atgcaacaaa--aacatcgtatgtaatatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 138304  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  138303 ctatgatgcatggacatgtacagggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcacttcaatatataggacaacacctaattatattgat 138212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 87106 - 87202
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  87106 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgat 87202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 76760 - 76855
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  76760 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacct 76855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Original strand, 77048 - 77124
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatatagga 280  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  77048 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga 77124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24958 - 24878
Alignment:
Q  7 attcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatg 87  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24958 attcatctcaattcaccaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatg 24878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 78216 - 78312
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  78216 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 78312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 77900 - 77979
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77900 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatatcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 77979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 38875 - 38969
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||| ||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38875 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 38969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28007 - 27912
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28007 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgggacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgat 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 14149 - 14439
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttca-cataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |    
T  14149 atcaccaatcacaattttcaacataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcatcttc 14248  T
Q  120 gatg-gacaagttaacatcgcatgtaag-gctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaag-agtcatcccttttacagcaaca--------acg 207  Q
    ||||  ||||   ||||||| |||||||   | ||  | | ||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| | |||        | |    
T  14249 gatgcaacaa--aaacatcgtatgtaagatttgacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagaattcaacccttttacaactacaatctcaacaag 14345  T
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14346 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgacaatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaacacccaattatattgat 14439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 870 - 1122
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcat 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||    |||| | ||    
T  870 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgataaa--acacattgtat 967  T
Q  142 gtaa-ggctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagtc-atcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcg 238  Q
    |||| || ||||     |||||| ||||| | ||||||||||||| | | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||    
T  968 gtaaggggtcac----tccttac-ataatatccgaagtaaaagagccgaactcttttacaacaacatcgactatgatgcatggacatgtaacaagactcg 1062  T
Q  239 ataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1063 ataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 1122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 5706 - 5807
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||    
T  5706 atcaccaatcacatttatca-ataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcaccttcg 5804  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  5805 atg 5807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 5898 - 5991
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaat-tcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5898 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatctca-attttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 5991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3187 - 3092
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3187 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacactcaattatattgat 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6644 - 6549
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6644 cgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaataatccacaatttcaacctcaatatataggacgacgcccaattatattgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6902 - 6824
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6902 tcaccaatcatatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatctc 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 27045 - 27335
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttca-cataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||| |    
T  27045 atcaccaatcacaattttcaacataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtagtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttc 27144  T
Q  120 gatgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaac--------g 207  Q
    |||| | |||   ||||||| |||||||  | |||  |   |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||         |    
T  27145 gatgcaacaaa--aacatcgtatgtaagatttcacacccatcttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaag 27241  T
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27242 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaaaacccaattatattgat 27335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 6019 - 6307
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  6019 atcatcaatcacatatatca-ataaaactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 6117  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    ||| | |||   || |||| |||||||  | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||        |||    
T  6118 atgcaacaaa--aatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 6214  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6215 ctatgattcatgaacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 6307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 28549 - 28645
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28549 acgactatgatgcatgaacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 28645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 28254 - 28328
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  28254 ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 28328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 25813 - 25875
Alignment:
Q  1 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatg 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25813 ataatcattcatctcaattcatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatg 25875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 300
Target Start/End: Original strand, 7927 - 8193
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg-gacaagttaacatcgcatg 142  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  ||||   ||||||| |||    
T  7927 aagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaa--aaacatcgtatg 8024  T
Q  143 taag-gctcacctctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaaca--------acgactatgatgcatggacatgtgtaa 231  Q
    ||||   ||||  | | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||        ||||||||||||||| |||||||   |    
T  8025 taagatttcacaaccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatgcattgacatgtaaca 8123  T
Q  232 gaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8124 agactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagaacaacacccaattatattgat 8193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26221 - 26125
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26221 acgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgat 26125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26509 - 26414
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  26509 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcaagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacct 26414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70801
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  70892 gactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaagtttctcctcaatatataggataacacccatttatatt 70801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 66389 - 66337
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtacc 94  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  66389 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtacc 66337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2337 - 2242
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2337 cgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccacttatattgat 2242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3801 - 3706
Alignment:
Q  20 catcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  3801 catcatcaatcacatatatca-acaaaactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6762
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6857 cgactatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgctacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 6762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7106 - 7013
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  7106 atcaccaaacacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaataacctcaaggtcgtcac 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13235 - 13142
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13235 actatgatgcatggacatgtacaaggactcgataatgcgacaacaatccataattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 13142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13505 - 13433
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||  |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  13505 aagactcatgtcatgatatgaacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacc 13433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14757 - 14664
Alignment:
Q  208 actatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14757 actatgatgcatggacaagtataaggactcgataatgcgacaaaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacctaattatattgat 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15099 - 15022
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15099 atcaccagtcacatgtatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacaaaatc 15022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 40006 - 40082
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40006 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 40082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 40263 - 40356
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40263 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattg 40356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1139 - 1045
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1139 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcataatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcacc 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 892 - 796
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  | ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  892 acgactatgatgcatggacatgtaacaagattcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 300
Target Start/End: Original strand, 4469 - 4531
Alignment:
Q  238 gataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4469 gataatgcgacaacaattctcaatctcgactcaatatataggacaacacccaattatattgat 4531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 60047 - 60148
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  60047 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 60145  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  60146 atg 60148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 291
Target Start/End: Original strand, 60239 - 60325
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaat 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  60239 acgaatatgatgcatgaacatgtaaaaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaat 60325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 119
Target Start/End: Original strand, 17075 - 17148
Alignment:
Q  46 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctcc 119  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17075 gactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctcc 17148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 17314 - 17405
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |  | | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17314 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatcccaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattg 17405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 115
Target Start/End: Original strand, 56432 - 56505
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  56432 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcaccaaaaggtcgtcac 56505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Original strand, 58899 - 58959
Alignment:
Q  241 aatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  58899 aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataagacgacacccaattatattgat 58959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 4601 - 4890
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    ||||||||||||||||   | | || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  4601 atcaccaatcacatatccaaaacaatactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 4700  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    ||| | |||   ||||||  |||||||  | |||  | | |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||        |||    
T  4701 atgcaacaaa--aacatcatatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 4797  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||  |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4798 ctatgatgcatggacatgtaacaaaactcgataacacgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 4890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6104 - 6009
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaac-tcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6104 acgagtatgatccatggacatgtataaggactcgc-aatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgat 6009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6397 - 6326
Alignment:
Q  27 aatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatc 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6397 aatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatc 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 32247 - 32343
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32247 acgactatgatgcatggacatgtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 32343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 249231 - 249140
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtc 113  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  249231 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtc 249140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19070 - 18971
Alignment:
Q  210 tatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgatgatgtcca 308  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  19070 tatgatacatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatgtcca 18971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19325 - 19246
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc 101  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19325 atcaccaatcacatatatcaaa-aagactcatgtcatgatatgcacctatcgccacatatatgcatgtggtatcaaatctc 19246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 31211 - 31305
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  31211 atcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 31305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 20999 - 20905
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  20999 atcaccaatcacatatatcat-taagactcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20741 - 20686
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20741 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaa 20686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 298
Target Start/End: Original strand, 1 - 219
Alignment:
Q  81 atgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatggacaagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagta 178  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||  |  | |||||| |||||||| | |||  | |||||||| ||||||| ||||||    
T  1 atgcatgtggtaccaaatctccaaaagctcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttaca-taatctccgaagta 99  T
Q  179 aaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatata 275  Q
    ||| || ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |||||||    
T  100 aaaaagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaataag-actcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatata 196  T
Q  276 taggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||| || |||| ||||||||    
T  197 taggacaactcccagttatattg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 12671 - 12956
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  12671 atcaccaatcacat-ttccaaataggactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 12769  T
Q  121 atgga-caagttaacatcgcatgtaaggct-cacctctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagt-catcccttttacagcaacaa--------cga 208  Q
    ||| | |||   ||||||| |||||||  | |||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||   | ||||        |||    
T  12770 atgcaacaaa--aacatcgtatgtaagatttcacacccgccttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaagccttttatgactacaatctcaacacga 12866  T
Q  209 ctatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12867 ctatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaat-cacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 12956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Original strand, 30998 - 31091
Alignment:
Q  22 tcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  30998 tcaccaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcacc 31091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Original strand, 44638 - 44693
Alignment:
Q  55 tatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtc 110  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44638 tatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtc 44693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 69432 - 69526
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaa-ctcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  69432 gactatgatgcatggacatgtaacaggactcgatagtgcgacaacaattcacaattttaaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 69526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 30740 - 30796
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30740 acgactatgatgcatggacatgtagcaaga-ctcgataatgcgacatcaattcacaat 30796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 712 - 803
Alignment:
Q  24 accaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  712 accaatcacatatatca-ataagactcatgtcatggtatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctaaaggtcgtcacc 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 966 - 1022
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  966 acgactatgatgcatggacatgtataaggactcgataatgcgacaacaatccacaat 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 18058 - 18152
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18058 atcaccaaccacatttatca-ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 18152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 163828 - 163903
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  163828 ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacct 163903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 3132 - 3233
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  3132 atcaccaaccacatttatca-ataagactcgtggcatgatatgcacctattgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 3230  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  3231 atg 3233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 3326 - 3420
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||| |||||||| || ||| | || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3326 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcaacaacaatacaaaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 3420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 7459 - 7553
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7459 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggaccactcccaattatattgat 7553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 7225 - 7300
Alignment:
Q  42 ataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  7225 ataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtactaaatcacctcaaggtcgtcacct 7300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 17778 - 17871
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17778 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatatcatgatatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 17871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 19862 - 19955
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19862 atcaccaatcacat-ttccaaataagactcatatcatgatatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 19955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 20056 - 20149
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20056 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 20149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 8745 - 8839
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8745 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgat 8839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 8601 - 8651
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgat 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  8601 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggccgtcacctccgat 8651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 52804 - 52678
Alignment:
Q  172 cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactc 269  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| | ||  | |    
T  52804 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgtgacaacaa-tcacaattttctccac 52707  T
Q  270 aatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52706 aatatataggacaacacccaattatattg 52678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 56756 - 56630
Alignment:
Q  172 cgaagtaaaagag-tcatcccttttacagcaacaacgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactc 269  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| | ||  | |    
T  56756 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca-cgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgtgacaacaa-tcacaattttctccac 56659  T
Q  270 aatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56658 aatatataggacaacacccaattatattg 56630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 71949 - 71853
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  71949 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaattctcaattttcaccacaatatataggataactcccaattatattgat 71853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 72177 - 72104
Alignment:
Q  44 aagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||    
T  72177 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcacct 72104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Original strand, 5700 - 5755
Alignment:
Q  246 gacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacgacacc-caattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  5700 gacaacaattcacaatctcaactcaatatataggacaacaccaccattatattgat 5755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 3098 - 3199
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||    
T  3098 atcaccaatcacatttatca-ataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcaccttcg 3196  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  3197 atg 3199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 3290 - 3383
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaat-tcacaatctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3290 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaatctca-attttcaccacaatatataggacaacacccaattatattg 3383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27779
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27686 acgactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacaacaa-tcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattg 27779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 37935 - 38036
Alignment:
Q  21 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccg 120  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||    
T  37935 atcaccaatcacatacatcac-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacacgtacatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcg 38033  T
Q  121 atg 123  Q
    |||    
T  38034 atg 38036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6831 - 6737
Alignment:
Q  207 gactatgatgcatggacatgtgtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  6831 gactatgatgcatggacatgtaacaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaattatattgat 6737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 4507 - 4602
Alignment:
Q  206 cgactatgatgcatggacatgtg-taagaactcgataatgcgacaacaattcacaa-tctcaactcaatatataggacgacacccaattatattgat 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  4507 cgactacgatggatggacatgtaataaga-ctcgataatgtgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattattttgat 4602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3938 - 3887
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  3938 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 3887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7256
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctccgatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  7307 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatg 7256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4995 - 4950
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  4995 gacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacct 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 20362 - 20419
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20362 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcaactcacaat 20419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 27191 - 27248
Alignment:
Q  205 acgactatgatgcatggacatgt-gtaagaactcgataatgcgacaacaattcacaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27191 acgactatgatgcatggacatgtagcaaagactcgataatgcgacatcaactcacaat 27248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 212 - 256
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  212 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 5267 - 5311
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  5267 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 5311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Original strand, 7072 - 7147
Alignment:
Q  45 agactcatgctatgatatgcactta--tggacacataaatgcatgtggtaccaaatctc-aacaaggtcgtcacct 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  7072 agactcatgttatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaattctctttcaaggtcgtcacct 7147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 3800 - 3844
Alignment:
Q  72 gacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  3800 gacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacc 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University