View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4616-Insertion-1 (Length: 1072)

Name: NF4616-Insertion-1
Description: NF4616
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4616-Insertion-1
NF4616-Insertion-1
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (8-1070)||(46497550-46498607)
chr3 (80-935)||(46479465-46480323)
chr3 (79-792)||(46490381-46491091)
chr3 (110-782)||(46473635-46474301)
chr3 (327-783)||(46483971-46484419)
chr3 (113-767)||(5159984-5160640)
chr3 (136-782)||(5155977-5156626)
chr3 (152-782)||(45883483-45884112)
chr3 (149-782)||(46526169-46526805)
chr3 (196-635)||(47414087-47414519)
chr3 (173-559)||(45902723-45903109)
chr3 (576-783)||(46539169-46539376)
chr3 (259-770)||(46236550-46237067)
chr3 (152-693)||(16025229-16025773)
chr3 (328-501)||(51943814-51943987)
chr3 (467-784)||(46544535-46544852)
chr3 (548-767)||(46548765-46548984)
chr3 (262-691)||(46531777-46532206)
chr3 (878-982)||(46474396-46474500)
chr3 (394-785)||(47397052-47397443)
chr3 (136-218)||(46544189-46544271)
chr3 (172-216)||(46549300-46549344)
chr3 (837-943)||(51944322-51944428)
chr3 (113-251)||(47397600-47397738)
chr3 (113-315)||(51942839-51943041)
chr3 (856-940)||(46491158-46491241)
chr3 (510-785)||(4581132-4581401)
chr3 (352-785)||(4613589-4614016)
chr3 (467-689)||(46554024-46554246)
chr3 (391-500)||(46549016-46549125)
chr3 (883-939)||(46236378-46236434)
chr3 (172-207)||(4581744-4581779)
chr3 (573-699)||(51944059-51944185)
chr3 (898-939)||(46535434-46535475)
chr3 (720-761)||(53390988-53391029)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (80-787)||(35162114-35162821)
chr4 (152-782)||(15555760-15556390)
chr4 (394-787)||(35155408-35155801)
chr4 (137-289)||(35155151-35155303)
chr4 (837-930)||(15556441-15556534)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (409-776)||(21463943-21464310)
chr8 (87-780)||(9692467-9693160)
chr8 (86-780)||(9675445-9676140)
chr8 (856-926)||(21463785-21463854)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (172-779)||(17708041-17708648)
chr7 (172-784)||(17698932-17699544)
chr7 (172-779)||(16721918-16722525)
chr7 (151-784)||(17717844-17718477)
chr7 (172-767)||(17735695-17736290)
chr7 (173-632)||(17744877-17745335)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (569-782)||(20144794-20145007)
chr2 (136-522)||(20169039-20169425)
chr2 (144-522)||(20358869-20359245)
chr2 (569-782)||(20168767-20168980)
chr2 (145-229)||(20144358-20144442)
chr2 (874-943)||(20168610-20168679)
chr2 (874-926)||(20359605-20359657)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 908; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 908; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1070
Target Start/End: Original strand, 46497550 - 46498607
Alignment:
Q  8 gtatgtttctatatctcccctcttttcactacaaaatacatatgaatgtcctgattttgttaannnnnnnngtattgcaatactcgtgcaaagaactcaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46497550 gtatgtttctatatctcccctcttttcactacaaaatacatatgcatgtcctgattttgttaatattttt-gtattgcaatactcgtgcaaagaactcaa 46497648  T
Q  108 ctatatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46497649 ctatatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgttgaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggt 46497748  T
Q  208 cttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46497749 cttattaaagaacttcttcctttagggtcggtcgactactttactcagctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttg 46497848  T
Q  308 atgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtga---gaagaagcagtttattagaga 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  46497849 atgcttcggaaacgaatgtctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgatgagaagaagcagtttattagaga 46497948  T
Q  405 tttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctg 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46497949 tttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttacgatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctg 46498048  T
Q  505 ccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttca 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498049 ccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttca 46498148  T
Q  605 atatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498149 atatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgt 46498248  T
Q  705 gagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgcggccaccgcagggtttactatg 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46498249 gagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaatgaagaaggcaccaaagctgctgcggccaccgca-ggtttactatg 46498347  T
Q  805 tggaagctccttgagtcttccaacagacataaactttgtagc-gaccatccattcttatttatgatcagaggaagatttgaccggaactatcgtctttgt 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498348 tggaagctccttgagtcttccaacagacataaactttgtagctgaccacccattcttatttattatcaga-gaagatttgaccggaactatcgtctttgt 46498446  T
Q  904 tgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgatcttagtgagtcacattatattcgattgctaatagataaatagggaactttattttctcaatatttcat 1003  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46498447 tgggcaggtgctcaatcctcttgctagatgatcttagtgagtcacattatattcgattgctaatagataaatagggaac-ttattttct-aatatttcat 46498544  T
Q  1004 gtgttttatgatgaagataagtcctattatttggaatatgattcatgtgcgggtgatatttttagca 1070  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498545 gtg-tttataatgaagat-agtccta-tatttgg-atatgattcatgtgcgggtgatatttttagca 46498607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 80 - 935
Target Start/End: Original strand, 46479465 - 46480323
Alignment:
Q  80 tattgcaatactcgtgcaaagaactcaact-atatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtga 178  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46479465 tattgcaatacttgtgaaaagtactcaacttatttatatgcataattgatttttaaatttgatatggttttaaaggctgttgaagtgaccaatgaagtga 46479564  T
Q  179 atttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatgcactata 278  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   ||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  46479565 attcatgggctgaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttcttcctcttgggtcggtcaacaatgcaacccggctcatctttgccaatgcactata 46479664  T
Q  279 ctttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgact 378  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| | | ||| || ||||||||||||||||| | | |||| ||||||  |||||||||     
T  46479665 cttcaaaggagcgtggaatgataagtttgatgcttcaaaaacggaagactacgagtttcaccttttgaatggtagcccagtcaaggttcccttcatgacc 46479764  T
Q  379 agtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtactttt 478  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  46479765 agcaagaagaagcagtttattagagcttttgatggttttaaagttctcggtcttccttataagcaaggcgaagataagcgtcaattcaccatgtactttt 46479864  T
Q  479 ttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  46479865 ttcttccaaatgcaaaagatgggttggcagctttggtcgaaaaggtggcttctgaatctgagctactgcaacacaagcttccatttggtaaagtggaagt 46479964  T
Q  579 aggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggt 678  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||  |||||||    
T  46479965 aggtgactttaggattccaaagttcaatatttcatttggacttgaaacttctgatatgctaaaggagctaggtgtggttttacctttctctggtggaggt 46480064  T
Q  679 ttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctg 778  Q
     |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  46480065 ctgacaaagatggtgaactcttcagttagtcaaaacctttgtgtttccaatatatttcacaagtctttcattgaagtaaatgaagaaggcactgaagctg 46480164  T
Q  779 ctgcggccaccgcag--ggtttactatgtggaagctccttgagtcttccaacagacataaactttgtagc-gaccatccattcttatttatgatcagagg 875  Q
    ||||||| || || |    | || | |   | ||| || ||||| ||||| |     || |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  46480165 ctgcggcaactgctgcaactatattgttaaggagcgccatgagtattccacctcggctagactttgtagctgaccaccctttcttatttatgattaga-g 46480263  T
Q  876 aagatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgat 935  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46480264 aagacttgaccggaacaatcatctttgttggacaggtgctcaatcctcttgctgggtgat 46480323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 792
Target Start/End: Original strand, 46490381 - 46491091
Alignment:
Q  79 gtattgcaatactcgtgcaaagaactcaact----atatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaa 174  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||    || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||   | |||||  ||| |||    
T  46490381 gtattgcaatacttgtgaaaagaactcaacttattatctatttgaataattgattttgaattttgatatggttttaaaggcaagtgaagtggccaaagaa 46490480  T
Q  175 gtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatgcac 274  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    |||||||  |   ||||||   ||||||  ||||||||||||    
T  46490481 gtgaatttatgggctgcaaaa-agacaaatggtattattaaacaacttcttccttccaggtcggttaatagcttaaccaggctaatcattgctaatgcac 46490579  T
Q  275 tatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcat 374  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||    
T  46490580 tatacttcaaaggagtgtggaatgataagtttgatgcttcaaaaacgaaagactatgattttcaccttttgaatggcagctcaattaaggttcccttcat 46490679  T
Q  375 gactagtgag-aagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgta 473  Q
    ||||||  || ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46490680 gactagcaaggaagaa-caatatattagagctttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagataagcgtgaatttactatgta 46490778  T
Q  474 cttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||   ||| | ||||    
T  46490779 cttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagttggcttctgaatcggagtcactaaaacacaagcttccatatgatagagtg 46490878  T
Q  574 gaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatg 673  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  46490879 gaggtaggtgactttaggatcccaaggttcaatatttcatttggacttgaaacttctgatatgctgaaggagctgggcgtggttttacctttcaccaatg 46490978  T
Q  674 gaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaa 773  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||      ||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  46490979 gaggtcttactaaaatggtgaactct------agtcaaaacctatgtatttctaaaatatttcacaagtcttttattgatgtaaatgaagaaggcaccga 46491072  T
Q  774 agctgctgcggccaccgca 792  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  46491073 agctgttgcagccaccgca 46491091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 110 - 782
Target Start/End: Original strand, 46473635 - 46474301
Alignment:
Q  110 atatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtct 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||  |  |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  46473635 atatatttgcataattaattttaaaatttgatatctttttattgtttgttgaagtgaccaatgaagtgaacatatgggctgaaaaagagacaaatggtct 46473734  T
Q  210 tattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcag-ctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttga 308  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  || || ||||| | ||| ||  | |||||||||||| | || |||||||||   |||||| | ||  ||||    
T  46473735 tattaaagaaattcttcctcaagggtcaatcaacaacttatc-cagactcgtctttgctaatgcattgtattttaaaggatcatggaatcagaagattga 46473833  T
Q  309 tgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttc 408  Q
    ||||||   ||| || | |||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||     
T  46473834 tgcttcaacaacaaaagactatgatttttaccttctcaatggcagctcagttaaggtttcctttatgactagcaagaagaagcagtttattagagctttt 46473933  T
Q  409 gatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaa 508  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46473934 gatggttttaaagttcttggtcttccttataagcaaggcgaagataagcgtcgtttcactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggcttccaa 46474033  T
Q  509 ctttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatat 608  Q
     |||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46474034 gtttggttgaaaaggtggcttctgaatctgatttactacaacacaagcttccttttgataaagtggaagtaggtgactttaggattccaaagttcaatat 46474133  T
Q  609 ttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagt 708  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||  || |||  |||| ||||||||| |||||      | |    
T  46474134 ttcatttggacttgaaacttccgatatgctaaaggagctaggtgtggttttacctttctctggtgaagggctgacaaaaatggtggactct------aat 46474227  T
Q  709 caaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgc 782  Q
    ||||| |||| | | ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  46474228 caaaaactttttatgtccaatatattgcacaaatatttcattgaagtaaatgaagaaggcactgaagctgctgc 46474301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 327 - 783
Target Start/End: Original strand, 46483971 - 46484419
Alignment:
Q  327 ctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttctt 426  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  46483971 ctatgattttcaccttctcaatggcagctcagtcaaggttccctttatgactagcaagaagaagcagtttattagagcttttgatggttttaaagttctt 46484070  T
Q  427 ggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttg 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| | |    
T  46484071 ggtcttccttataagcaaggcgaagataagcgtcgtttcactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggcttccaagtttggttgaaaaggtgg 46484170  T
Q  527 cttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaac 626  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46484171 cttctgaatttgatttactacaacacaagcttccttttgataaagtggaagtaggtgactttaggattccaaagttcaatatttcatttggacttgaaac 46484270  T
Q  627 ttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttcc 726  Q
    ||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||  ||||||| |||| || ||||||||||||      | |||||| |||  ||| |||    
T  46484271 ttctgttatgctaaaggagctaggtgtggttttacctttctctggtggaggtctgacaaagatggtgaactct------aatcaaaaactt--tgtgtcc 46484362  T
Q  727 aaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgcg 783  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  46484363 aatatattgcacaaatctttcattgaagtaaatgaagaaggcactgaagctgctgcg 46484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 113 - 767
Target Start/End: Original strand, 5159984 - 5160640
Alignment:
Q  113 tatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttat 212  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5159984 tatttgcataattgatttttaaatttgatattgttttgaaggctattgaagtgactaaagaagtgaatttatgggctgaaaaagagacaaatggccttat 5160083  T
Q  213 taaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcag-ctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgc 311  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||    ||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||     
T  5160084 taaagaacttcttcctctaagatcagttgataggttaac-cagactcatctttgctaatgcactctactttaaaggagcatggagtgataagtttgatgt 5160182  T
Q  312 ttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgat 411  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||||  || ||  ||     
T  5160183 ttcgaaaacgaaagactatgattttcaccttttgaatgg-agctcagtcaaggttcccttcatgaccagcgaggagaatcagtttattgaagcttatgac 5160281  T
Q  412 gattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactt 511  Q
    || |||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || | ||||    
T  5160282 gactttaaagttcttcgtcttccgtataagaaaggcaaagataagcgtccattctctatgtacattttccttccaaatgcaaaagatggcttgtcgactt 5160381  T
Q  512 tgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttc 611  Q
    || || ||||| | ||||| |||||||||||||| || |||| | ||| ||||    |||  ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  5160382 tggttaagaaggtggcttctgaatctgagttactacaccacaggtttcatcttcctgaagaagaagtaggtgaattcagaattccaagattcaaaatttc 5160481  T
Q  612 atttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgc---tgtgagt 708  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |||  ||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||| |   |||| ||    
T  5160482 atttgagcttgaaacttctgatatgctgaaggagttaggagtgactttacctttcactcgtgaaggtttgacaaaaatggtggactcttctcttgtgggt 5160581  T
Q  709 caaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaagg 767  Q
     | | |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5160582 gatagcctttcagtttctaaaatatttcacaaatctttcattgaagtaaatgaagaagg 5160640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 136 - 782
Target Start/End: Original strand, 5155977 - 5156626
Alignment:
Q  136 tttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggt 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |    
T  5155977 tttgatttggttttaaaggctgttgaagtgactaaagaagggaatttatgggctgaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttcttcctccaagat 5156076  T
Q  236 cggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattt 335  Q
    | || ||   |||||| |  || || |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| || ||||||| || | ||||||| | |||||||||    
T  5156077 cagttgatagcttaacccgcctcatctttgctaatgcactctactttaaaggagcatggagtgagaagtttgatgttttgaaaacgaaagactatgattt 5156176  T
Q  336 tcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttcct 435  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||||  || ||  | ||  |||||||||||| | |||||     
T  5156177 tcaccttttgaatggcagctcggtcaaggttcccttcatgaccagcgaggagaatcagtttattgaagcttatggtggctttaaagttcttcgtcttccg 5156276  T
Q  436 tataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaat 535  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||| | ||| |  ||     
T  5156277 tataaaaaaggcaaagataagcgtcgattctctatgtacatttttcttccaaatgctaaagatggactgccagcattggttgagaagttggctgctaaac 5156376  T
Q  536 ctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatat 635  Q
    || | ||||| ||  | |  |||| || ||   |||  ||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5156377 ctcacttactacactatagtcttcatcctgctgaagcagaagtagttgaattcagaattccaagattcaaaatttcatttgagcttgaaacttccgatat 5156476  T
Q  636 gttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgc---tgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaata 732  Q
    ||| || ||||| || ||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |   |||| |  | | ||||| |||||| ||||||    
T  5156477 gttcaaagagctaggagtgattttacctttcactcgtggaggtttgacaaaaatggtggactctcctcttgtgggcaatagcctttctgtttctaaaata 5156576  T
Q  733 ttccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgc 782  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5156577 tttcacaaatctttcattgaagtaaatgaagaaggcactgaagctgctgc 5156626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 45884112 - 45883483
Alignment:
Q  152 aggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaac 251  Q
    |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  || |||||||    
T  45884112 aggcggttgaagtgaccaatgacgtgaatttatgggctgaaaaagagacaaatggtcttattaaagaaattctttctccagggtcagttaacaacttaac 45884013  T
Q  252 tcag-ctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatgg 350  Q
     ||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||| |    |||||| ||||| |||| ||   ||| ||||||||  ||   |||||    
T  45884012 -cagactcatatttgctaatgcattgtactttaagggagcatggaatcaaccgtttgatccttcgaaaacaaaatactacgattttcatattcataatgg 45883914  T
Q  351 aaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaa 450  Q
     |  ||||| || |||  ||||||||| ||  ||||  | || |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| |  | |||||| ||||||| | |    
T  45883913 tagttcagtcaaagttcccttcatgaccagcaagaaagatcaatttattagagcttttgatggttttaaagtgctttgtatcccttatgagcaaggtgga 45883814  T
Q  451 gacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgca-- 548  Q
    || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||| | ||||| ||||||   ||||| ||      
T  45883813 gataagcgtcgattctctatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatggactgtcagctttggtcgagaaggtggcttctgaatctacattactacacc 45883714  T
Q  549 acacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagctt 648  Q
    ||| ||||||  || |   |||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |     
T  45883713 acaaaagctttgtcattctaaagtcaaagtaggtgacttcagaattccaagattcaatgtttcatttgggcttgaaacttctaatatgttgaaggagtta 45883614  T
Q  649 ggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttca 748  Q
    || |||||||  |||||| ||  |||| ||||||| ||||||||| ||| | |    | |||| |||||||| ||||  | || || ||| |||||||||    
T  45883613 ggagtggtttcacctttctctcgtggaagtttgacaaaaatggtggactatcc---aaatcaagacctttatatttctcacatttttcactagtctttca 45883517  T
Q  749 ttgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgc 782  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  45883516 ttgaagttaatgaagaaggcactgaagctgctgc 45883483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 149 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 46526805 - 46526169
Alignment:
Q  149 taaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactactt 248  Q
    |||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  || ||| |  | ||    
T  46526805 taaaggttgttgaagtgattaaagaagtgaatttatgggctgaaaaagagacaaatggccttattagagaacttctttctcaagattcagtcaataaatt 46526706  T
Q  249 aactcag-ctaatatttgctaatgcactatacttt-aaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttga 346  Q
    ||| ||| || || ||||| || ||||| || ||| |||||||  |||||  | || |||  |||||||  ||| ||   |||||||||||||||||  |    
T  46526705 aac-cagactcatctttgcaaacgcactgtatttttaaaggagcatggaaaaagaagtttcctgcttcgagaacaaaaaactatgattttcaccttta-a 46526608  T
Q  347 atggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaagg 446  Q
    |||| | |||||| ||||||  ||||||||| || ||||| |  || ||||| || | |||||||| ||| ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  46526607 atggcagctcagtcaaggttcccttcatgaccagcgagaatagacaatttatcagtgttttcgatggtttcaaagtactccgtcttccttataagcaagg 46526508  T
Q  447 cgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactg 546  Q
     ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  | |||||| | ||||| ||| ||||||||||     
T  46526507 agaagataagcgtcaattctctatgtacatttttcttccaagagcaagagatggtttgccaactttaatcgagaaggtagcttctgaacctgagttacta 46526408  T
Q  547 caacacaagcttcctcttgac-aaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggag 645  Q
    || ||||| |||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| | ||||| || |||    
T  46526407 caccacaaccttcct-ttcacaaaagttgaagtaggtgatttcagaattccaaaattcaaattttcatttgagcttgacacttctcaaatgttgaaagag 46526309  T
Q  646 cttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactct---gctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagt 742  Q
     | |  ||| |||| |||||| ||  ||| |||||||| || || ||| |||||      |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46526308 ttagaagtgattttacctttctcttgtgggggtttgacaaatattgtggactctcaacacgcaagtcaaaacctttacgtttccaaaatatttcacaagt 46526209  T
Q  743 ctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgc 782  Q
    || ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  46526208 ctctcattgaagtaaatgagggaggcaccgaagctgctgc 46526169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 196 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 47414519 - 47414087
Alignment:
Q  196 gagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtgga 295  Q
    ||||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||| ||| || | || ||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||    
T  47414519 gagacaaatggccttattgagaaaattcttcctccagggtcagtcaacaaattcacaaaactcatctttgctaatgcactgtacttcaaaggggtgtgga 47414420  T
Q  296 atgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtt 395  Q
    || |  | ||||||||||||||||| || | ||| |||||    | |   ||||||| |||||| ||||||  ||||||||| | ||   ||||||||||    
T  47414419 atcaacaatttgatgcttcggaaacaaaagactacgattt----cat---aatggaagctcagtcaaggttcccttcatgaccaatggagagaagcagtt 47414327  T
Q  396 tattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaa 495  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| | |||  ||||  |||||||| |||||||||||||  ||| |    
T  47414326 tattggagcttttgatgattttaaagttctttgccttccttataataaaggagaagatacgcggaaattctctatgtacatttttcttccaaacacaaga 47414227  T
Q  496 gatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattc 595  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||   |||||  ||||||||||||| || ||||    
T  47414226 gatggactgtcagctttggttgagaaggtggcttctgaatctgagttactacaccacaagcttcatctttctaaagtcaaagtaggtgacttcagaattc 47414127  T
Q  596 caaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatat 635  Q
    |||| |||||  ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  47414126 caagattcaaggtttcatttgaacaagaaatttctgatat 47414087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 173 - 559
Target Start/End: Original strand, 45902723 - 45903109
Alignment:
Q  173 aagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcag-ctaatatttgctaatg 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||  || |||||||||| || | ||||| ||| || || |||||||| |    
T  45902723 aagtgaatttatgggctgaaaaagagacaaatggccttattaatgaatttctttatcgagggtcggtcaacaaattaac-cagactcatctttgctaacg 45902821  T
Q  272 cactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgactt 371  Q
    || | || ||||||||||  |||||  |||| ||| ||||||||   ||  |   |||| ||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||  |||    
T  45902822 cattgtattttaaaggagcatggaaaaataagtttcatgcttcgaggacacaaaactataatttttaccttctaaatggtagctcagtcaaggttccctt 45902921  T
Q  372 catgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatg 471  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||  | | |||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||    
T  45902922 catgaccagcgagaagaggcagtttatccgcgttttcgatggtttcaaagtacttcgtcttccttatgagcaaggagaagataagcgtcaattctctatg 45903021  T
Q  472 tacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttc 559  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||  |||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  45903022 tatatttttcttccaaaagcaaaagatggtttgcaaagtttagttgagaaggtagcttctgaatctgagttactacaccacaagcttc 45903109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 783
Target Start/End: Original strand, 46539169 - 46539376
Alignment:
Q  576 agtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatgga 675  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||  ||||||| |||||| || | |||    
T  46539169 agtaggtgacttcagaattccaagattcaaaatttcttttgagcttgaaacttctaatatgcttaaggagctaggaatggttttacctttctctcaagga 46539268  T
Q  676 ggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaag 775  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  46539269 ggtttgacaaaaatggtggactctcctacaagtcaaaacctttatgtttccgatgtattccacaagtcttttattgaagtaaatgaacaaggaaccaaag 46539368  T
Q  776 ctgctgcg 783  Q
    ||||||||    
T  46539369 ctgctgcg 46539376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 259 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 46237067 - 46236550
Alignment:
Q  259 atatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcag 358  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||   |||||||| || |||||| |||||| |||||| | |  ||| | | ||||||| ||||| | ||| |    
T  46237067 atatttgcaaatgcaatgtactttaaaggaatatggaatgagaagtttgatacttcggtaacgaaagacagtgactgttaccttttaaatggtagctccg 46236968  T
Q  359 ttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcg 458  Q
    | || |||  |||||||||     | ||||| | || |||| ||||||| |||| || ||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||  || |    
T  46236967 tcaaagttcccttcatgacctcctataagaaacggtatattggagattttgatggttataaagttctttatcttccttataatcaaggcaaagatgagtg 46236868  T
Q  459 tcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagctt 558  Q
    ||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||   ||||||| |||    
T  46236867 tcaattctctatgtatatttttcttccagatgcaaaagatgggttgtcaaccttggttgagaagctggcttctgaatttgagttaccagaacacaatctt 46236768  T
Q  559 cctc---ttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtgg 655  Q
    ||||   || | |||||||  |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| || ||| | | |||||| | || |||     
T  46236767 cctctcattaaaaaagtggcggtaggtgagttcaagattccaagattcaatatttcgtttggaattgaaactactaatacgatgaaggagttaggagtga 46236668  T
Q  656 ttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgc---tgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattga 752  Q
    |||| |||||| ||  ||||||||| || ||||| ||| | ||| |   || | || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  46236667 ttttacctttctctgctggaggttttacaaaaattgtggattcttcttttgagggtgaaaacctatatgtttccaacatatttcacaaatctttcattga 46236568  T
Q  753 agtaaacgaagaaggcac 770  Q
    |||||| |||||||||||    
T  46236567 agtaaatgaagaaggcac 46236550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 693
Target Start/End: Original strand, 16025229 - 16025773
Alignment:
Q  152 aggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaac 251  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||  ||  || ||| || |||||||    
T  16025229 aggcagttgaagtgacaaatgatgtgaatttatgggctaaaaaggagacaaatggtcttattgaggaaattctaccttcagattctgtcaacaacttaac 16025328  T
Q  252 tcagctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatgga 351  Q
      | || ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |  | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||||     
T  16025329 gaaactcatatttgctaatgcactttactttaaaggggtgtgggatcaacagtttgatgcttcggaaacaaaagactatgattttcacattctgaatggc 16025428  T
Q  352 aactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaag 451  Q
    |||  | | || |||  ||||||||| ||  |  || | || |||||| | | |||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |  ||||| ||||    
T  16025429 aacgtaatcaaagttcccttcatgaccagcaacgaggatcaatttatttgtgctttcgatgatttcaaagtacttcgtcttccatacagacaaggtgaag 16025528  T
Q  452 acaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaaca 551  Q
    | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |  ||||| |||||| | | |||||  |||| ||| |||| || ||    
T  16025529 ataagcgtcaattttgaatgtatttttttcttccaaatgaaagagatggactgtctgctttgattgagagggtggcttctcaatccgaggtactacacca 16025628  T
Q  552 caagcttc----ctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagct 647  Q
     || ||||     | ||  ||||  |  ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16025629 aaatcttcggcgtttttctcaaa-agagagtaggtgatttcagaattccaaggttcaaggtttcatttgggtttgaaacttctgatatgctgaaggagct 16025727  T
Q  648 tggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtg 693  Q
    ||| || ||||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  16025728 tggagtagttttacctttctctcctggaggtttgacaaaaatggtg 16025773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 501
Target Start/End: Original strand, 51943814 - 51943987
Alignment:
Q  328 tatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttg 427  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||     
T  51943814 tatgattttcaccttctaaatggtagctcagtcaaggttcccttcatgaccagcaataagaagcagtttattgaagtttatgatgattttaaagttcttc 51943913  T
Q  428 gccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatggg 501  Q
      |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51943914 atcttccttataagaaaggtgaagataagcgccaattctctatgtatttttttcttccaaatgcaaaagatggg 51943987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 467 - 784
Target Start/End: Original strand, 46544535 - 46544852
Alignment:
Q  467 ctatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttga 566  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  | |||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||| ||  |||| |  | ||||   ||    
T  46544535 ctatttacttttttcttcctgatgcaaaagatgggttgttagctttgactgaaaaggtagcttctgaatctgagtttctagaacatacacgtcctagaga 46544634  T
Q  567 caaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttc 666  Q
     | ||||  |||||||||||| || ||||| |  ||||||||| | ||||  |||||||||||||   || | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  46544635 aacagtgatagtaggtgacttaagaattccgaaattcaatattgcttttgggcttgaaacttctggcgtgctgaaggagctaggagtggttttacctttc 46544734  T
Q  667 actaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaag 766  Q
     |||  ||||||||||| || |||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  46544735 tctacaggaggtttgacaaatatggtggactctcctatggatcaaaaccttcatatttccaacatattccacaagtcttttattgaagtaaatgaaaagg 46544834  T
Q  767 gcaccaaagctgctgcgg 784  Q
    | ||  ||||||||||||    
T  46544835 gaactgaagctgctgcgg 46544852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 548 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 46548984 - 46548765
Alignment:
Q  548 aacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagct 647  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||    |||| ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||  || || | ||||| ||    
T  46548984 aacacaagcttcctaatgaaaaagtggaagtaaaatacttcaggattccaagattcaaaatattatttgagcttgaaacttcaaatgtgctcaaggaact 46548885  T
Q  648 tggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttc 747  Q
     || || | | | ||||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||| || |   | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46548884 aggagttgatctacctttctatcctggtggtttgacaaaaatggtgaactctcctattgataaatacctttatgtttctaaaatatttcacaagtctttc 46548785  T
Q  748 attgaagtaaacgaagaagg 767  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  46548784 attgaagtaaaagaagaagg 46548765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 691
Target Start/End: Original strand, 46531777 - 46532206
Alignment:
Q  262 tttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagtta 361  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| || |    |||||||||||  |||| || | | |||||||||||||| |   ||| | |||| |||    
T  46531777 tttgctaatgcactctactttaatggagcatggcatcaaccatttgatgcttcaaaaacaaaagaccatgattttcaccttctcggtggcagctcaatta 46531876  T
Q  362 aggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtca 461  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| |  | ||| |||| ||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | || |  |||||    
T  46531877 aggttcccttcatgactagcaagaagaagcagtttataaatgcttttgatggttttaagatccttcgtcttccttataagcaaggcaacgatattcgtca 46531976  T
Q  462 atttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcct 561  Q
    |||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||  | |||||| || ||||| |  || ||||||| |||||     
T  46531977 attctctatgtacttttttcttcccgatgcacaagatggattgttagctttgattgagaaagtggcttccaaacctgagattttgaaacacaaacttcca 46532076  T
Q  562 cttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgc 661  Q
    | | |  |||||  ||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||  | || |||||||  |||| || ||| ||||||| | || || ||||| |    
T  46532077 cgtaaggaagtgatagtgggtgacttcagaattccacgtttcaaaatttattctggacttgaactttctaatgtgtcaaaggagttaggagttgttttac 46532176  T
Q  662 ctttcactaatggaggtttgactaaaatgg 691  Q
    ||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  46532177 ctttctctggtggaggtttgacaaaaatgg 46532206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 878 - 982
Target Start/End: Original strand, 46474396 - 46474500
Alignment:
Q  878 gatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgatcttagtgagtcacattatattcgattgctaatagataaatag 977  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |  ||| |||||| |||| ||||||||    
T  46474396 gatttggccggaacaatcatctttgttggacaggtgcttaatcctcttgatgggtgatcttagcaagtcacaatggattggattgccaataaataaatag 46474495  T
Q  978 ggaac 982  Q
    |||||    
T  46474496 ggaac 46474500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 47397443 - 47397052
Alignment:
Q  394 tttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaa 493  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  47397443 tttattagtgttttccatgatttcaaagtacttcgtctttcttataggcaaggtgaagataagcgccatttctccatgtacatttttcttccaaatgcaa 47397344  T
Q  494 aagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggat 593  Q
    |||||||  || ||  |||| |||||||  | |||||  ||| |||||||||  ||||||| |||||  ||    ||  | ||||  |  |||| |  ||    
T  47397343 aagatggattgacagatttggttgagaacatggcttctaaatttgagttactagaacacaatcttccagttattcaaaagaaagtgagaaacttcaaaat 47397244  T
Q  594 tccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtg 693  Q
    |||||| |||||  ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||| |||||| |    |||||||| || |||||| ||    
T  47397243 tccaagattcaaattttcaatttggcttgaaacttctgatatgttgaaggagttaggagtgattttacctttctccctcggaggtttaacaaaaatgatg 47397144  T
Q  694 aactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgcggc 785  Q
     ||| |   | | |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| ||||    
T  47397143 gactttctagcgggtcaaaacctttttgtttccaacatatttcagaagtatttcattgaagtaaatgagaaaggcactaaagttgcttcggc 47397052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 46544189 - 46544271
Alignment:
Q  136 tttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaaga 218  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  46544189 tttgatgttgttttaaaggcttttgaagggagaaaagaagtgaatttatgggctgaaaaagagacaaatggtcttataaaaga 46544271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46549344 - 46549300
Alignment:
Q  172 gaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46549344 gaagtgaatttatgggctgaaaaagagacaaatggtcttattaaa 46549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 837 - 943
Target Start/End: Original strand, 51944322 - 51944428
Alignment:
Q  837 actttgtagc-gaccatccattcttatttatgatcagaggaagatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgat 935  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||    
T  51944322 actttgtagctgaccaccctttcttatttctgattagag-aagatttgactggaacaatcatctttgttggacaggtgctcaacccacttaccgggtgat 51944420  T
Q  936 cttagtga 943  Q
    ||||||||    
T  51944421 cttagtga 51944428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47397738 - 47397600
Alignment:
Q  113 tatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttat 212  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||||| | |||||   || ||||| |||||||||||  |||  |||||||||||| ||||    
T  47397738 tatttgcataactgatttttaaatttgatatgggtttaaaggctgatgaagtggctaaagaagtaaatttatgggccaaaaatgagacaaatggttttat 47397639  T
Q  213 taaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaac 251  Q
    ||||||| || |||||| | | |||||| || |||||||    
T  47397638 taaagaaatttttcctccaagatcggtccacaacttaac 47397600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 315
Target Start/End: Original strand, 51942839 - 51943041
Alignment:
Q  113 tatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttat 212  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||    |||||   || ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  51942839 tatttgcataattgatttttaaatttgatatggttttttaggctccagaagtgcgtaaggaagtgaacatatgggttgaaaaagagacaaatggccttat 51942938  T
Q  213 taaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgct 312  Q
    |||||||||| |||||| ||| || || ||   |||||||   || || |||||||||||  | ||||||| |||||  |||||||| || ||||||| |    
T  51942939 taaagaacttattcctccaggatcagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggagcatggaatgagaagtttgatgtt 51943038  T
Q  313 tcg 315  Q
    |||    
T  51943039 tcg 51943041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 856 - 940
Target Start/End: Original strand, 46491158 - 46491241
Alignment:
Q  856 ttcttatttatgatcagaggaagatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgatcttag 940  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  46491158 ttcttgtttatgattagag-aagaattgactggaacaatcatctttgttggacaggtgttcaatcctcttgctgggtgattttag 46491241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 4581401 - 4581132
Alignment:
Q  510 tttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatt 609  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||   | |||||||||||||||  |   |||||  |||| |||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  4581401 tttgattgagaagctagcttccgaatttgagtatttacaacacaagcttcctagtcgaaaagttaaagttggtgccttccggattccaagattcaatatt 4581302  T
Q  610 tcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcac---taatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtga 706  Q
    || |||||||||||||| |||  | || | |||||||| || |||||||| |||||  |   || ||||||| || | |||| ||||      ||||       
T  4581301 tcttttgaacttgaaacgtctagtgtgctgaaggagctaggagtggttttacctttttccgatattggaggtgtggcaaaaacggtg------gctg--- 4581211  T
Q  707 gtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgcggc 785  Q
    || ||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||    
T  4581210 gtgaaagccttgttgtttccaagatatttcacaagtcttttattgaagtaaatgaagcaggtactgaagctgctgcggc 4581132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 4614016 - 4613589
Alignment:
Q  352 aactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaag 451  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||    || ||||||||||  | | ||| |||||||||||  ||||| | ||||||| | ||||||| | ||    
T  4614016 aactctgttaaggttcccttcatgactagttgtgaggagcagtttatcggtgtttttgatgattttaagattcttcgtcttccttttgagcaaggtggag 4613917  T
Q  452 acaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaaca 551  Q
      ||||||| |||  || | ||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||  |  |||| |||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||    
T  4613916 gaaagcgtcgattctctttttacctttttcttcctgatgcagaagatggattgttagatttgattgagaagctagcttccgaatttgagtttttacaaca 4613817  T
Q  552 caagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggc 651  Q
    ||||||||||  |   |||||  |||| |||  |||  ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||  |||| | |||||||| ||     
T  4613816 caagcttcctagtcgaaaagttaaagttggtaccttccggattccaagactcaatatttcttttgagcttgaaacgtctagtatgctgaaggagctagga 4613717  T
Q  652 gtggttttgcctttcac---taatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttca 748  Q
    |||||||| |||||  |   || ||||||| || | ||||||||| |   ||         ||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  4613716 gtggttttacctttttccgatattggaggtgtggcaaaaatggtggataatg---------aaagccttgttgtttccaagatatttcacaagtctttta 4613626  T
Q  749 ttgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgcggc 785  Q
    |||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||    
T  4613625 ttgaagtaaatgaagcaggtactgaagctgctgcggc 4613589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 46554246 - 46554024
Alignment:
Q  467 ctatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttga 566  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||  | ||||| |||| ||||   ||| ||||||  ||||||  |      
T  46554246 ctatgtactttttacttcccgatgcaaaagatgggttgtcagctttgattgagaaagtggcttcggaatatgagaccctggaacacatacttcctgatag 46554147  T
Q  567 caaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttc 666  Q
     | ||| || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||   |||||  |||| ||||| | |||||| | || ||| |||| ||||||    
T  46554146 tatagttgatgtgggtgactttaggattccaagtttcgaaatttcttttgggtttgaactttctaatatgctgaaggagttgggagtgattttacctttc 46554047  T
Q  667 actaatggaggtttgactaaaat 689  Q
     ||||||||||||| || |||||    
T  46554046 tctaatggaggtttaacaaaaat 46554024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 46549125 - 46549016
Alignment:
Q  391 cagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatg 490  Q
    |||||||| || | ||| |||| ||| |||||||||   |||||||||||  ||||  |||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||     
T  46549125 cagtttatcagtgtttttgatggtttcaaagttctttatcttccttataaataaggaaaagataaacgacaattctctatgtacttttttcttccaaata 46549026  T
Q  491 caaaagatgg 500  Q
    ||||||||||    
T  46549025 caaaagatgg 46549016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 883 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 46236434 - 46236378
Alignment:
Q  883 gaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgatctta 939  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46236434 gaccggaacaatcctctttgctggacaggtgctcaatcctgttgttggatgatctta 46236378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4581779 - 4581744
Alignment:
Q  172 gaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4581779 gaagtgaatttatgggctgaaaaagagacaaatggt 4581744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 699
Target Start/End: Original strand, 51944059 - 51944185
Alignment:
Q  573 ggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaat 672  Q
    |||| ||||| ||||||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||||| || ||  |||| ||||| |||| || |||||||| |||||| |   |    
T  51944059 ggaactaggtaactttaaaattccgaaattcaatatttcatttgagcttgaagctactcgtatgctaaagaagctaggagtggttttacctttctcacct 51944158  T
Q  673 ggaggtttgactaaaatggtgaactct 699  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||    
T  51944159 ggaggttttacaaaaatggtggactct 51944185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 939
Target Start/End: Original strand, 46535434 - 46535475
Alignment:
Q  898 ctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgatctta 939  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46535434 ctttgttgggcaagtgcataatcctcttgctggatgatctta 46535475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 720 - 761
Target Start/End: Original strand, 53390988 - 53391029
Alignment:
Q  720 tgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacga 761  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53390988 tgtttcaaatatatttcacaagtctttcattgaagtaaacga 53391029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 105; Significance: 7e-52; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 787
Target Start/End: Original strand, 35162114 - 35162821
Alignment:
Q  80 tattgcaatactcgtgcaaagaactcaact-atatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtga 178  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| |||||| || |||||| || | ||||||  |  ||||| ||||||||||||||| || ||||||  || |||||||    
T  35162114 tattgaaatactggtgaaaagaattcaactgatctatttgcattactgatttgtaaatttgacatggttttaaaggctattgaagtgactaaagaagtga 35162213  T
Q  179 atttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcag-ctaatatttgctaatgcactat 277  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||| || || |||||||| ||||| |    
T  35162214 atttatgggctgaaaaagaaacaaatggccttattaaagaacttcttcctcaagggtcagtcgacaacctaac-cagacttatctttgctaacgcactgt 35162312  T
Q  278 actttaaaggagagtggaatgata-atttt-gatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatg 375  Q
    | ||||||||||  |||| |  || |||||  | |  |  || || ||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  35162313 attttaaaggagcatggagtagtacattttctaagtatgcgacacaaa--actatgattttcaccttctgaatggaagctcagtcaaggttcccttcatg 35162410  T
Q  376 actagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtact 475  Q
    ||||   |     | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||  ||||||||     
T  35162411 actaccaaccttgatcagtttattagagcttttgatggttttaaagttcttcgtcttccttataagcaaggaaaagatgagcggaaattctctatgtac- 35162509  T
Q  476 tttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtgga 575  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| | ||||| || | |||| | ||  |  ||| |||||||  | | | ||||      
T  35162510 attttcttccaaatgcaaaagatggcctgtcagctttggttgagaaggtggcttctgattttgagctcctagagaacatgcttccttgtaatagagtgcc 35162609  T
Q  576 agtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatgga 675  Q
    |||||||| ||| |  |||||||  |||||  |||||| ||  ||||||||||||  | || | ||||| || || ||| |||| |||||| ||  ||||    
T  35162610 agtaggtggcttcaaaattccaaaattcaaattttcatatgggcttgaaacttctcgtgtgctgaaggatctaggagtgattttacctttctcttctgga 35162709  T
Q  676 ggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaag 775  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   ||   ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||    
T  35162710 ggtttgacaaaaatggtggactcacttgaaggtcaaaaccttttagtttccaacatatttcacaagtctttcattgaagtaaatgagaaaggcaccgtag 35162809  T
Q  776 ctgctgcggcca 787  Q
    ||||||| ||||    
T  35162810 ctgctgcagcca 35162821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 782
Target Start/End: Original strand, 15555760 - 15556390
Alignment:
Q  152 aggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaac 251  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| | || |||  | |||||||||| ||  ||||||    
T  15555760 aggctgttgaagtgaccaatgaagtcaattcatgggttgaaaaggagacaaatggccttattaaaggagttattcaaccagggtcggtcaacagcttaac 15555859  T
Q  252 tcag-ctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatgg 350  Q
     ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||   ||| || | || |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| | |||||    
T  15555860 -cagactcatctttgcaaatgcactgtactttaaaggactatggtatcagaagtttgatgcttccaaaacgaaagactatgattttcaccttctcaatgg 15555958  T
Q  351 aaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaa 450  Q
     | |||| | ||||||   || ||||  ||  |  || | || | |||| | | ||| |||| ||| ||||| ||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  15555959 tagctcactcaaggttccgtttatgagcagcaaagaggatcaatatattggtgcttttgatggtttcaaagtactttgtcttcattataaacaaggccaa 15556058  T
Q  451 gacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaac 550  Q
     |  | || | |||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |    
T  15556059 tatgatcgccgattctctatctactttattcttccagatgcaaaagatggactctcggctttggttgaaaaggtggcttcagaatctgagttactacacc 15556158  T
Q  551 acaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttgg 650  Q
      ||| ||  ||||   |||||  |||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| | ||||| || ||    
T  15556159 gtaagtttaatctttctaaagtcaaagttggtgacttcagaattccaaagttcaatatctcatttgggtttgaaacttctgatatgctgaaggacctagg 15556258  T
Q  651 cgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcatt 750  Q
     |||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||   || | ||||| |||| | |||||| || |||||||| |||||||||||     
T  15556259 agtggttttacctttctctcccggaggtttgactaaaatggtggactcacttgcgggtcaagacctgtttgtttctaacatattccaaaagtctttcatc 15556358  T
Q  751 gaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgc 782  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15556359 caagtaaacgaagaaggcactgaagctgctgc 15556390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 394 - 787
Target Start/End: Original strand, 35155408 - 35155801
Alignment:
Q  394 tttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaa 493  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||  ||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35155408 tttattagagcttttgatggttttaaagttcttcgtcttccgtataagcaaggaaaagatgagcggaaattctctatgtacatttttcttccaaatgcaa 35155507  T
Q  494 aagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggat 593  Q
    ||||||| ||  || ||||| |||||||| | ||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||||  | | | || |  |||||||| ||| |  ||    
T  35155508 aagatggactatcagctttggttgagaaggtggcttctgaatttgagttgctagagcacaagcttccttataaaacagcgcgagtaggtggcttcaaaat 35155607  T
Q  594 tccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtg 693  Q
    |||||| |||||  |||||| | | |||||| ||||| ||||| | || || || || ||| |||| |||||| ||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35155608 tccaagattcaaattttcatctaagcttgaatcttctcatatgctgaaagacctaggagtgattttacctttctcttctgggggtttgacaaaaatggtg 35155707  T
Q  694 aactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgcggcca 787  Q
     |||||  ||   ||||||| || |  |||  ||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  35155708 gactctcttgaaggtcaaaatctctccgttagcaacatatttcagaagtgttttattgaagtaaacgaaaaaggcactaaagctgttgcagcca 35155801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 289
Target Start/End: Original strand, 35155151 - 35155303
Alignment:
Q  137 ttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtc 236  Q
    |||| |||||||| |||||| || ||||||  || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || || ||| || |||    
T  35155151 ttgacatggttttgaaggctattgaagtgactaaagaagtgaatttatgggctaaaaaagagacaaatggccttattaaaaaagttgttgctcaagagtc 35155250  T
Q  237 ggtcgactacttaactcag-ctaatatttgctaatgcactatactttaaaggag 289  Q
    |||| || ||||||| ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  35155251 ggtcaacaacttaac-cagactcatctttgctaatgcactgtattttaaaggag 35155303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 837 - 930
Target Start/End: Original strand, 15556441 - 15556534
Alignment:
Q  837 actttgtagc-gaccatccattcttatttatgatcagaggaagatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctgg 930  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  15556441 actttgtagctgaccacccattcttatttctaataagag-aagatttgaccggcacaatcctctttgttggacaggtgcttaatccttttgctgg 15556534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 7e-49; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 409 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 21464310 - 21463943
Alignment:
Q  409 gatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaa 508  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||| | || |||  | || ||||||||||||||  |||||||||||||  ||  |     
T  21464310 gatggttttaaagtccttcgtcttccttatacgcaaggtgaagacaaacatcgattctcaatttacttttttcttcctgatgcaaaagatggattgttag 21464211  T
Q  509 ctttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatat 608  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||| |||   ||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||    
T  21464210 ctttgattaagaaggttgcttccgaatctaagtttttggaacaaaagcttcctcgtgaattagtggaagttggtgacttcaggattccgaaattcaagat 21464111  T
Q  609 ttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagt 708  Q
    ||| ||||  ||||||  |||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||| || | |||| |||||| ||||||||| |||||    |   |    
T  21464110 ttcttttgggcttgaatgttctgatatgctgaaagagctaggcgtggttttacctttctctgaaggagctttgacaaaaatggtggactctcgaattgct 21464011  T
Q  709 caaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagc 776  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21464010 caaaacctttatgtgtccaacatatttcacaagtcttttattgaagtaaacgaagaaggtaccgaagc 21463943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 9693160 - 9692467
Alignment:
Q  87 atactcgtgcaaagaactcaacta-tatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatg 185  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || ||||||  ||  |||||||||||||    
T  9693160 atacttgtgaaaagaattcaactaatctatttgcataactgatttttaaatttgatatg-ttttaaaggctattgaagtgactaaacaagtgaatttatg 9693062  T
Q  186 ggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcag-ctaatatttgctaatgcactatactttaa 284  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || ||| || |||  |||||| ||| || || |||||||||||| | || |||||    
T  9693061 ggctgaaaaagagacatatggccttattaaagaaattcttcctcaagcgtcagttgacagcttaac-cagactcatctttgctaatgcattgtattttaa 9692963  T
Q  285 aggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgag 384  Q
    |||||  |||| | ||  ||||  ||||| |   || |  |  |||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||   || ||||  ||  |     
T  9692962 aggagcatggagtaatccttttcctgcttggaggacaagcgaatatgattttcaccttccgaatggcagctcagtcaaggttccttttatgagcagcaac 9692863  T
Q  385 aagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttc 484  Q
        | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||  || | ||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  9692862 cttgatcagtttattagagcttttgatggttttaaagttcttcgtcttccttataattaaggaaaaaataagcgacaattctctatgtacatttttcttc 9692763  T
Q  485 caaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtga 584  Q
    |||||||||||||||  ||   | || || |||||||  | ||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||||  | |   ||||  | |||||||    
T  9692762 caaatgcaaaagatgtactattagctatggttgagaaagtggcttctgaatttgagttcctagagcacaagcttccttataaactagtgagaataggtga 9692663  T
Q  585 ctttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgact 684  Q
     ||    |||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||  ||||   |||||| | || |||  ||| |||||| ||  ||||||||||||     
T  9692662 attccaaattccaagattcaaattttcatttgggcttgaaacttctcgtatgacgaaggagttaggagtgagtttacctttctcttctggaggtttgaca 9692563  T
Q  685 aaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgct 780  Q
    ||||||||| |||||  ||   ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  9692562 aaaatggtggactctcttgaaggtcaagacctttctgtttccaacatatttcacaagtctttcattgaagtaaacgaggaaggcactgaagctgct 9692467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 9676140 - 9675445
Alignment:
Q  86 aatactcgtgcaaagaactcaact-atatatttggataattgattttaatttttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttat 184  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||| |  ||||||||  | || |||||| || ||||||  || || ||||||||||    
T  9676140 aatacttgtgaaaagaattcaactgatctatttgaataactgatttttaaatttgatattttatttaaggctattgaagtgactaaagaggtgaatttat 9676041  T
Q  185 gggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcag-ctaatatttgctaatgcactatacttta 283  Q
    ||||||||| ||| ||| | || |||||||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  9676040 gggctgaaaaagaaacatacggccttattaaagaaattcttcctgaagggtcggtcaacaacttaac-cagactcatctttgctaatgcactatatttta 9675942  T
Q  284 aaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtga 383  Q
    ||||||| |||  |||| | |||  || ||   | ||  |   |||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||  ||| ||||  |   |    
T  9675941 aaggagaatgggttgatcaattttttgattataataccgaaaactatgattttcaccttctgaatggcagctcagtcaaagttccctttatgagcaccaa 9675842  T
Q  384 gaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttctt 483  Q
         | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| | || |||||| ||||||| | ||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  9675841 ccttgatcagtttattagagcttttgatggttttaaagtgctttgtctcccttatgagcaaggtggagataagcgacaattctctatgtacatttttctt 9675742  T
Q  484 ccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtg 583  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |  || || |||| ||| | ||||| |||| |||||| ||  | | ||||||||||  | |   |||| ||||||||     
T  9675741 ccaaatgcaaaaggtggactatcggctatggttgaaaaggtggcttctgaatttgagttcctagagcccaagcttccttataaacgagtgaaagtaggta 9675642  T
Q  584 actttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaatggaggtttgac 683  Q
    | ||    |||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||   ||| | |||||||| || ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  9675641 atttccaaattccaagattcaaattttcatttgggcttgaaacttctcgaatgatgaaggagctaggagtgattttacctttctcttctggaggtttgac 9675542  T
Q  684 taaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgct 780  Q
     ||||||||| |||||  ||   ||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  9675541 aaaaatggtggactctcttgaaggtcaagacttttctgtttccaacatatttcacaagtctaccattgaagtaaatgaggaaggcactgaagctgct 9675445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 856 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 21463854 - 21463785
Alignment:
Q  856 ttcttatttatgatcagaggaagatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttg 926  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21463854 ttcttgtttttgatcagag-aagatttgtccggaaccatactctttattgggcaagtgctcaatcctcttg 21463785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 779
Target Start/End: Original strand, 17708041 - 17708648
Alignment:
Q  172 gaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagc-taatatttgctaat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||| |   |||| || |||  |||||| |||| | ||||||||||||    
T  17708041 gaagtgaatttatgggctgaaaaggagacaaaagggcttattaaaaatcttcttccacacaggtcagttgacagcttaac-cagcctcatatttgctaat 17708139  T
Q  271 gcactatactttaaaggagagtgg-aatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgac 369  Q
    |||||||| || |||||||  ||| || ||   ||| ||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||  |    
T  17708140 gcactatatttcaaaggagtttggcaacgaccgttt-gatacttcaaaaacgaaggactatgattttgaccttctcaatggcaagtcagtaaaggttccc 17708238  T
Q  370 ttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttacta 469  Q
    || ||||| ||  ||||  | |||||||| ||   ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |  |   ||||  |||  | |    
T  17708239 tttatgaccagcaagaatgatcagtttatcagttcttttgatggttttaaagttcttggtcttccttacaaacaaggcaattatgggcgtgcattctcca 17708338  T
Q  470 tgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaa 569  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||| | | | |||||  | ||||||||  || ||||||| ||||||| |   ||    
T  17708339 tttacttttttcttcccgatgcaaaagatgggttgtcagctttgattgatacggtagcttctaattctgagtttttggaacacaatcttcctcgtagaaa 17708438  T
Q  570 agtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcact 669  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||| |  |  ||||| |  | ||  ||  ||| |||||  ||    
T  17708439 agtggaagtaggcaagttcaggattccaagattcaatatttcttttaagattgaagcttctaagttactaaagaaattaggattgactttacctttttct 17708538  T
Q  670 aatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggca 769  Q
    |  ||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| | ||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17708539 atgggaggtttgacaaaaatggtggactctcctataagtcaagaactttatgtttccggcatatttcagaagtctttcattgaagtaaatgaagaaggta 17708638  T
Q  770 ccaaagctgc 779  Q
    | ||||||||    
T  17708639 cgaaagctgc 17708648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 784
Target Start/End: Original strand, 17698932 - 17699544
Alignment:
Q  172 gaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatg 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||| |  || || ||  ||  |||||| |  || || ||||||||||    
T  17698932 gaagtgaatttctgggctgaaaaggagacaaaagggcttattaaaaatcttcttccacctggctcagttaacagcttaacccgcctcatctttgctaatg 17699031  T
Q  272 cactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgactt 371  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||  |  | || ||| || |  ||||||| | |||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||   ||    
T  17699032 cactatatttcaaaggagtgtggaaacaacagttcgatactacaaaaacgaaggactatgattttgaccttctcaatggcaagtcagtaaaggttccatt 17699131  T
Q  372 catgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatg 471  Q
     ||||| ||  ||||  | |||||||| ||    || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||  | |||  |||  ||||     
T  17699132 tatgaccagcaagaatgatcagtttatcagttcgttagatggttttaaagtccttggtcttccttataaacaaggcaaagatgaacgtgcattctctatt 17699231  T
Q  472 tacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaag 571  Q
    ||||||||||||||  |   |||||||||| || ||| |||| |||| ||  | ||||| || ||||||||  || |||  || ||||||| |   ||||    
T  17699232 tacttttttcttcctgacaaaaaagatgggttgtcaaatttgattgataaagtagcttctgattctgagtttttggaacggaatcttcctcgtagaaaag 17699331  T
Q  572 tggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaa 671  Q
    ||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||  |  ||||| |  | ||  ||| ||| ||||| |||      
T  17699332 tggaagtaggcaagttcaggattccaagattcaatatttcttttgagattgaagcttctgagttactaaagaaattaggattggctttaccttttactct 17699431  T
Q  672 tggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcacc 771  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| | ||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  17699432 gggaggtttgacaaaaatggtggactctcctataagtcaagaactttatgtttccggcatatttcagaagtctttcattgaagtaaatgaagaaggtacg 17699531  T
Q  772 aaagctgctgcgg 784  Q
    |||||||| ||||    
T  17699532 aaagctgcagcgg 17699544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 779
Target Start/End: Original strand, 16721918 - 16722525
Alignment:
Q  172 gaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagctaatatttgctaatg 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||| |  || || ||  ||  |||||| |  || || ||||||||||    
T  16721918 gaagtgaatttctgggctgaaaaggagacaaaagggcttattaaaaatcttcttccacctggctcagttaacagcttaacccgcctcatctttgctaatg 16722017  T
Q  272 cactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgactt 371  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||  |  | || ||| || |  ||||||| | |||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||   ||    
T  16722018 cactatatttcaaaggagtgtggaaacaacagttcgatactacaaaaacgaaggactatgattttgaccttctcaatggcaagtcagtaaaggttccatt 16722117  T
Q  372 catgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatg 471  Q
     ||||| ||  ||||  | |||||||| ||    || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||  | |||  |||  ||||     
T  16722118 tatgaccagcaagaatgatcagtttatcagttcgttagatggttttaaagtccttggtcttccttataaacaaggcaaagatgaacgtgcattctctatt 16722217  T
Q  472 tacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaag 571  Q
    ||||||||||||||  |   |||||||||| || ||| |||| |||| ||  | ||||| || ||||||||  || |||  || ||||||| |   ||||    
T  16722218 tacttttttcttcctgacaaaaaagatgggttgtcaaatttgattgataaagtagcttctgattctgagtttttggaacggaatcttcctcgtagaaaag 16722317  T
Q  572 tggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcactaa 671  Q
    ||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||  |  ||||| |  | ||  ||| ||| ||||| |||      
T  16722318 tggaagtaggcaagttcaggattccaagattcaatatttcttttgagattgaagcttctgagttactaaagaaattaggattggctttaccttttactct 16722417  T
Q  672 tggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggcacc 771  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| | ||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  16722418 gggaggtttgacaaaaatggtggactctcctataagtcaagaactttatgtttccggcatatttcagaagtctttcattgaagtaaatgaagaaggtacg 16722517  T
Q  772 aaagctgc 779  Q
    ||||||||    
T  16722518 aaagctgc 16722525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 784
Target Start/End: Original strand, 17717844 - 17718477
Alignment:
Q  151 aaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaa 250  Q
    ||||||| | ||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||  |  || || ||  ||  |||||    
T  17717844 aaggctgatgaagtgagaaaagaagtgaatgtatgggctgaaaaggagacaaaagggcttattaaaaatcttcttcaacctggctcagttcacagcttaa 17717943  T
Q  251 ctcagctaatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatgg 350  Q
    |    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||  |    |||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||| | |||||    
T  17717944 cgagtctaatatttgcaaatgcactatatttcaaaggagtgtggaaacaaccctttgatacttcaaaaacgaaggactatgattttgaccttctcaatgg 17718043  T
Q  351 aaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaa 450  Q
     || ||||| ||||||  ||| ||||| ||  ||||  | |||||||| ||   ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |     
T  17718044 caagtcagtaaaggttccctttatgaccagcaagaatgatcagtttatcagttcttttgatggttttaaagttcttggtcttccttacaaacaaggcaat 17718143  T
Q  451 gacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaac 550  Q
     |   ||||  |||  | || ||||||||||||||  |||||||||||||| || |  ||||| |||| ||  |  |||| || | ||||||  || |||    
T  17718144 tatgggcgtgcattctccatttacttttttcttcccgatgcaaaagatgggttgtccgctttgattgataatgtaacttctgattatgagtttttggaac 17718243  T
Q  551 acaagcttcctcttgacaaagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttgg 650  Q
    |||| ||||||| |   ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| || ||||  |  ||||| |  | ||    
T  17718244 acaatcttcctcgtagaaaagtggaagtaggcaagttcaggattccaagattcaatatttcttttgagattgaagctcctgagttactaaagaaattagg 17718343  T
Q  651 cgtggttttgcctttcactaatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcatt 750  Q
      ||  ||| |||||  |||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| |  | | ||||||| | ||| | || ||||||| ||||    
T  17718344 attgactttacctttttctatgggaggtttgacaaaaatggtggactctcctataagtcaagaaatatttgtttccgacatacttcagaagtcttgcatt 17718443  T
Q  751 gaagtaaacgaagaaggcaccaaagctgctgcgg 784  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  17718444 gaagtaaacgaagaaggtacaaaagctgcagcgg 17718477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 767
Target Start/End: Original strand, 17735695 - 17736290
Alignment:
Q  172 gaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagc-taatatttgctaat 270  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||| ||  ||||||| || |||||||| |  ||||| || |||  |||||| |||| | || ||||| |||    
T  17735695 gaagtgaatttatgggctaataaggagacaaaggggtttattaatgatcttcttccacgcgggtcagttgacagcttaac-cagcctcatctttgcgaat 17735793  T
Q  271 gcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgact 370  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||       |||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||  ||    
T  17735794 gcactatacttcaaaggagtttggaaacgaccgtttgatacttcaaaaacgaaggactatgattttgaccttctcaatggcaagtcagtaaaggttccct 17735893  T
Q  371 tcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactat 470  Q
    | ||||| ||  |||| || |||||||| ||   ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| | || ||||||  |||  ||||    
T  17735894 ttatgaccagcaagaataatcagtttatcagttcttttgatggttttaaagtccttggtcttccttacaaacaaggcaatgataagcgtgcattctctat 17735993  T
Q  471 gtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaa 570  Q
     ||||||||||||||  | | |||||||||| || || ||||| |||| ||  | ||||| || ||||||||  || |||| || ||||||| | |  ||    
T  17735994 ttacttttttcttcctgacgaaaaagatgggttgtcagctttgattgataaagtagcttctgattctgagtttttggaacagaaacttcctcgtaatcaa 17736093  T
Q  571 gtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcacta 670  Q
    ||  |||||||  | || | ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||  | |||||  |  | ||  ||  ||| |||||  | |    
T  17736094 gtcaaagtaggcaagttcatgattccaagattcaatatttcttttgagattgaagcttctgagttattaaataaattaggattgactttacctttttcga 17736193  T
Q  671 atggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaagg 767  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| | |||| |||| |||  ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17736194 agggaggtttgacaaaaatggtggactctcctataagtcaagaactttctgttaccagcatatttcagaagtctttcattgaattaaatgaagaagg 17736290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 632
Target Start/End: Original strand, 17744877 - 17745335
Alignment:
Q  173 aagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgactacttaactcagc-taatatttgctaatg 271  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||| |||| |||||||| |  || || ||  ||  |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  17744877 aagtgaatttatgggctgaaaagaagacaaaagggcttattcaagatcttcttccacacggatcagttaacagcttaac-cagcctaatctttgctaatg 17744975  T
Q  272 cactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgattttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgactt 371  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  | || |||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||| | || || || ||||| ||||||  |||    
T  17744976 cactatacttcaaaggagtatggaaacaaaagtttgatacttcaaaaacgaaggactatgattttgaccttcttaacggcaagtcagtaaaggttccctt 17745075  T
Q  372 catgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatg 471  Q
     ||||| ||  ||||  | |||||||| ||    || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||   ||||  |||  ||||     
T  17745076 tatgaccagcaagaatgatcagtttatcagttcgttagatggttttaaagtccttggtcttcc-tataaacaaggcaaagatgggcgtgcattctctatt 17745174  T
Q  472 tacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaagcttgcttccgaatctgagttactgcaacacaagcttcctcttgacaaag 571  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||  || || ||||| |||| ||  | ||||| || ||||||||  || |||| || ||||||| |||  |||    
T  17745175 tacttttttcttcctgacgaaaaagatggtttgtcagctttgattgataaagtagcttctgattctgagtttttggaacagaaacttcctcgtgaagaag 17745274  T
Q  572 tggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctga 632  Q
    |  |||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  17745275 tccaagtaggcaagttcaggattccaagattcaatatttcttttgagattgaagcttctga 17745335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 569 - 782
Target Start/End: Original strand, 20144794 - 20145007
Alignment:
Q  569 aagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcac 668  Q
    ||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||  |||||   |||||||| | || |||||||| || |||      
T  20144794 aagtgaaagtaggtgaatttaaaattccaagattcaatgtttcatttgggcttgaaactagtgataccctaaaggagttaggagtggttttaccattctt 20144893  T
Q  669 taatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggc 768  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||||| ||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  20144894 tcctggaggtttgacaaaaatggtggactctcttgcgggtcaaagcctttctgtttctcacatatttcacaagtctttcatcagagtaaacgaagaaggt 20144993  T
Q  769 accaaagctgctgc 782  Q
    ||| ||| ||||||    
T  20144994 accgaagttgctgc 20145007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20169425 - 20169039
Alignment:
Q  136 tttgatatggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggt 235  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||  ||  |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||      
T  20169425 tttgatgtggttttgaaggttgttgaagtgacaaaaaaagtgaatttatggtcggaaaaagagacaattggccttattaaagaacttcttcctcgaggac 20169326  T
Q  236 cggtcgactacttaactcagc-taatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaacgaatgcctatgatt 334  Q
    |||| || ||  | |  |||| | || |||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||| || || ||   |||  ||||  |   || |||||    
T  20169325 cggttga-tagatcagccagcgtcatctttgctaatgcattgtactttataggagcatggaatgagaagttcgacctttccaaaacagaaaactgtgatt 20169227  T
Q  335 ttcaccttttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttcc 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||   ||  |||||| ||| ||||||  || ||  || | || |||||||||| | |||||    
T  20169226 ttcatcttttgaatggaaactcagtcaaggttcctttcatggtaagcaagaagatgcaatttattgaagcttatgacggttctaaagttcttcgtcttcc 20169127  T
Q  435 ttataagcaaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaag 522  Q
    ||||||  ||||  |||| | |||||||||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  20169126 ttataaaaaaggtcaagatacgcgtcaattctctatgtatatttttttgccaaacgcaaaagatggactgccagctttagttgagaag 20169039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 522
Target Start/End: Original strand, 20358869 - 20359245
Alignment:
Q  144 ggttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctctagggtcggtcgac 243  Q
    |||||| |||| |||| ||||||  ||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  | || ||     
T  20358869 ggttttgaaggttgttgaagtgacaaaaaaagtgaatttatggtctgaaaaagagacaattggccttattaaagaacttcttcctcgaggaccagttga- 20358967  T
Q  244 tacttaactcagc-taatatttgctaatgcactatactttaaaggagagtggaatgataattttgatgcttcggaaac-gaatgcctatgattttcacct 341  Q
    ||  | |  |||| | || |||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||| || || ||   |||  |||| |||   || ||||||||| ||    
T  20358968 tagatcagccagcgtcatctttgctaatgcattgtactttataggagcatggaatgagaagttcgacctttccaaaacagaa---ctgtgattttcatct 20359064  T
Q  342 tttgaatggaaactcagttaaggttgacttcatgactagtgagaagaagcagtttattagagatttcgatgattttaaagttcttggccttccttataag 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||||||   ||  |||||| ||||||||||  || ||  || | || |||||||||| | |||||||||||     
T  20359065 tttgaatggaaactcagtcaaggttcctttcatggtaagcaagaagatgcagtttattgaagcttatgacggttctaaagttcttcgtcttccttataaa 20359164  T
Q  442 caaggcgaagacaagcgtcaatttactatgtacttttttcttccaaatgcaaaagatgggctgccaactttgcttgagaag 522  Q
     ||||  |||| | |||||||||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  20359165 aaaggtcaagatacgcgtcaattctctatgtatatttttttgccaaacgcaaaagatggactgccagctttagttgagaag 20359245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 569 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 20168980 - 20168767
Alignment:
Q  569 aagtggaagtaggtgactttaggattccaaggttcaatatttcatttgaacttgaaacttctgatatgttaaaggagcttggcgtggttttgcctttcac 668  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||  |||||||||  |||||   |||||| | | || ||| |||| || |||      
T  20168980 aagtgaaagtaggtgactttaaaattcctagattcaatgtttcatttgggcttgaaactagtgataccctaaaggggttaggagtgattttaccattctt 20168881  T
Q  669 taatggaggtttgactaaaatggtgaactctgctgtgagtcaaaacctttatgtttccaaaatattccacaagtctttcattgaagtaaacgaagaaggc 768  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| | |||   | | |||||| ||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  20168880 tcctggaggtttgacaaaaatggtggattctatcgcgggtcaaagcctttttgtttctcacatatttcacaagtctttcatcagagtaaacgaagaaggt 20168781  T
Q  769 accaaagctgctgc 782  Q
    ||| ||| ||||||    
T  20168780 accgaagttgctgc 20168767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 229
Target Start/End: Original strand, 20144358 - 20144442
Alignment:
Q  145 gttttaaaggctgtttaagtgaacaatgaagtgaatttatgggctgaaagagagacaaatggtcttattaaagaacttcttcctc 229  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||  |||||||| ||||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20144358 gttttaaaggttgttgaagtgacaaaaaaagtgaatctatggtcggaaaaagagacaattggccttattaaagaacttcttcctc 20144442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 874 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 20168679 - 20168610
Alignment:
Q  874 ggaagatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttgctggatgatcttagtga 943  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  20168679 ggaagatttgacgggaacaatcctctttgtcgggcaagtgctcaatcctcttgatgagtgatctaagtga 20168610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 874 - 926
Target Start/End: Original strand, 20359605 - 20359657
Alignment:
Q  874 ggaagatttgaccggaactatcgtctttgttgggcaggtgctcaatcctcttg 926  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20359605 ggaagatttgacgggaacaatcctctttgtcgggcaagtgctcaatcctcttg 20359657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University