View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4619-Insertion-2 (Length: 943)

Name: NF4619-Insertion-2
Description: NF4619
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4619-Insertion-2
NF4619-Insertion-2
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (18-943)||(6402303-6403227)
chr6 (197-468)||(6585148-6585419)
chr6 (98-477)||(6432069-6432448)
chr6 (199-468)||(7119074-7119343)
chr6 (199-468)||(7131552-7131821)
chr6 (199-540)||(6594519-6594857)
chr6 (197-540)||(7994093-7994433)
chr6 (200-471)||(6415880-6416151)
chr6 (199-480)||(6394769-6395050)
chr6 (210-554)||(19632273-19632611)
chr6 (198-480)||(14820598-14820880)
chr6 (199-476)||(10579649-10579927)
chr6 (202-394)||(6596844-6597036)
chr6 (340-474)||(6603256-6603390)
chr6 (199-444)||(6409947-6410192)
chr6 (199-522)||(6589236-6589556)
chr6 (286-470)||(14818297-14818481)
chr6 (292-392)||(14802329-14802429)
chr6 (205-395)||(11936194-11936384)
chr6 (205-395)||(11948174-11948364)
chr6 (199-399)||(6426497-6426697)
chr6 (198-306)||(8913896-8914004)
chr6 (822-885)||(6422508-6422571)
chr6 (316-480)||(6423122-6423286)
chr6 (21-94)||(6602961-6603034)
chr6 (576-641)||(6431995-6432061)
chr6 (45-83)||(6432442-6432480)
chr6 (47-88)||(19632712-19632753)
chr6 (51-95)||(14820959-14821003)
chr6 (582-641)||(6409809-6409868)
chr6 (659-689)||(6409753-6409783)
chr6 (205-255)||(9411482-9411532)
chr6 (50-83)||(6410287-6410320)
chr6 (50-83)||(6416247-6416280)
chr6 (346-395)||(9411345-9411394)
chr6 (301-378)||(28935056-28935133)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (106-471)||(20477902-20478267)
chr5 (204-449)||(41889472-41889717)
chr5 (205-474)||(41901457-41901723)
chr5 (216-479)||(32267381-32267641)
chr5 (199-259)||(28525137-28525197)
chr5 (292-395)||(38267562-38267665)
chr5 (341-395)||(37937877-37937931)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (199-575)||(15092064-15092434)
chr7 (204-455)||(10614523-10614774)
chr7 (350-467)||(10170145-10170262)
chr7 (350-467)||(10177670-10177787)
chr7 (820-885)||(10613345-10613410)
chr7 (815-885)||(10612139-10612209)
chr7 (18-83)||(10614874-10614939)
chr7 (580-647)||(10611941-10612006)
chr7 (18-83)||(10167427-10167492)
chr7 (18-83)||(10169883-10169948)
chr7 (18-83)||(10177408-10177473)
chr7 (205-251)||(7977712-7977758)
chr7 (199-251)||(10170043-10170095)
chr7 (199-251)||(10177568-10177620)
chr7 (50-94)||(15091936-15091980)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (193-464)||(53761679-53761947)
chr4 (209-473)||(546825-547089)
chr4 (205-470)||(55908647-55908912)
chr4 (205-490)||(1524405-1524687)
chr4 (205-378)||(659718-659889)
chr4 (286-473)||(1513407-1513591)
chr4 (265-473)||(55505087-55505292)
chr4 (220-473)||(553391-553644)
chr4 (200-455)||(640845-641100)
chr4 (205-390)||(1548345-1548528)
chr4 (205-360)||(1600444-1600599)
chr4 (205-395)||(12121376-12121566)
chr4 (205-473)||(1537686-1537954)
chr4 (286-473)||(1489361-1489548)
chr4 (204-371)||(1519061-1519227)
chr4 (276-390)||(1552757-1552871)
chr4 (308-395)||(1508025-1508112)
chr4 (267-388)||(532186-532307)
chr4 (287-483)||(8184031-8184227)
chr4 (340-390)||(566184-566234)
chr4 (206-395)||(558488-558677)
chr4 (205-390)||(8187010-8187195)
chr4 (216-268)||(3438496-3438548)
chr4 (199-331)||(21834291-21834423)
chr4 (353-464)||(1517563-1517674)
chr4 (220-330)||(644885-644995)
chr4 (212-258)||(7225809-7225855)
chr4 (416-540)||(21834436-21834557)
chr4 (205-258)||(1533909-1533962)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (116-470)||(51764270-51764624)
chr3 (199-492)||(51113694-51113987)
chr3 (117-471)||(13470563-13470917)
chr3 (220-390)||(51120827-51120997)
chr3 (20-81)||(51764195-51764256)
chr3 (605-801)||(51767897-51768100)
chr3 (209-258)||(514651-514700)
chr3 (50-83)||(13470517-13470550)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (205-483)||(45245004-45245282)
chr2 (205-470)||(1037583-1037848)
chr2 (303-395)||(32785789-32785881)
chr2 (218-257)||(43277392-43277431)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (112-470)||(19468325-19468683)
chr1 (319-480)||(7554393-7554554)
chr1 (304-392)||(43634900-43634988)
chr1 (310-490)||(9580964-9581146)
chr1 (18-80)||(19468252-19468314)
chr1 (310-423)||(9586601-9586714)
chr1 (408-473)||(35901764-35901829)
chr1 (316-384)||(52082582-52082650)
chr1 (18-93)||(9581342-9581417)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (205-471)||(18315192-18315458)
chr8 (216-474)||(27922419-27922674)
chr8 (350-473)||(44736447-44736570)
chr8 (316-473)||(32151213-32151370)
chr8 (206-399)||(34936083-34936276)
chr8 (205-395)||(28246214-28246402)
chr8 (206-378)||(17636317-17636493)
chr8 (316-399)||(17628044-17628127)
[»] scaffold0295 (1 HSPs)
scaffold0295 (205-464)||(543-802)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (210-378)||(1388-1559)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (316-390)||(39179-39253)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (221-268)||(88933-88980)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 876; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 876; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 6403227 - 6402303
Alignment:
Q  18 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattttggtcacaattctatctattttggtcataattca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6403227 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattttggtcacaattctatctattttggtcataattca 6403128  T
Q  118 tggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgtgatcgtatatctgaaggtatttgtc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6403127 tggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgcgatcgtatatctgaaggtatttgtc 6403028  T
Q  218 aagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaagt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6403027 aagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactttgcagttccccaactagaagt 6402928  T
Q  318 gttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6402927 gttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataat 6402828  T
Q  418 gtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcatttaactgacaaaacaagggaac 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6402827 gtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcatttaactgacaaaactagggaac 6402728  T
Q  518 tcttcacgcgtcgtggatgccttgttcggtagtattcttctggaattgctatgctgaaaacacggtaagttgtttttgttttcagacaaatgaatttcct 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6402727 tcttcacgcgtcgtggatgccttgttcggtagtattcttctggaattgctatgctgaaaacacggtaagttgtttttgttttcagacaaatgaatttcct 6402628  T
Q  618 ccattgaaaactttagtctgaaattgatttccagttagtcagctttcataatataatttgtgggttttagatacnnnnnnngacattataaataaattac 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  6402627 ccattgaaaactttagtctgaaattgatttccagttagtcagctttcataatataatttgtgggttttagatac-aaaaaagacattataaataaattac 6402529  T
Q  718 atagaaaatatggatagaaaaccgaaagaggtcacaaatacacctgcaattatattacttaaaaatgtagtttcattatgttaattttataggaaaactt 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6402528 atagaaaatatggatagaaaaccgaaagaggtcacaaatacacctgcaattatattacttaaaaatgtattttcattatgttaattttataggaaaactt 6402429  T
Q  818 aatcttctctttatcaaattttaatacaaattctaaattgactttgatctgtttttaacagattgtttttgtgaaggagttatactcttactgcttctag 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6402428 aatcttctctttatcaaattttaatacaaattctaaattgactttgatctgtttttaacagattgtttttgtgaaggagttattctcttactgcttctag 6402329  T
Q  918 gttggactgtttgctactgttgtggt 943  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6402328 gttggactgtttgctactgttgtggt 6402303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 197 - 468
Target Start/End: Original strand, 6585148 - 6585419
Alignment:
Q  197 gtatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6585148 gtatatctgaaggtatttgtcatgttttaaggagatgttttaatattaggcatttgaactttactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactt 6585247  T
Q  297 tgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaacta 396  Q
    |  |||| ||||  | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||    
T  6585248 tttagttacccagttggaggtattgaacttgtcagatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgttctgcgcttttggaacta 6585347  T
Q  397 ttattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgaga 468  Q
    ||| ||| || |||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  6585348 ttactgaaaggttgtgaaaatgtcacagagaagggactgaaacatgtggtagaaatttgcacacaactgaga 6585419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6432448 - 6432069
Alignment:
Q  98 tctattttggtcataattcatggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgtgatcg 197  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6432448 tctatttgggtcacaattcatggttaaggaatgaaaggatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcaacatcttgatttgcgttggtgtcatcg 6432349  T
Q  198 tatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaacttt 297  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |    |||  || || ||||||||  ||||| ||||||    
T  6432348 tataaatgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaaacttaaacatttgaacttagcctattgtataaaagtgaagctacatggaatgaacttt 6432249  T
Q  298 gcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactat 397  Q
    | ||||||| | ||  | ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  6432248 gaagttcccaagctgaaggtgttgaacttgtcaaatacaagcgttgatgatgaaacactttatgtgatcttaaagaattgttgtgggcttctgcaactat 6432149  T
Q  398 tattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttat 477  Q
    |  ||    ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  6432148 tcctgtacaattgtgataatgtcacacagaagggagtgaaacttgtggtagaaaaatgcacacaattgagaaagatttat 6432069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7119343 - 7119074
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  7119343 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaacatttgaacttagcccactgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttg 7119244  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
      |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  7119243 ttgttcaccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactccatgtgatctcgaagaattgttgcgggcttttggaactatt 7119144  T
Q  399 attgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgaga 468  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| |||| | || ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  7119143 actgaaagattgttattatgtcacaaaaaaagaagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaattgaga 7119074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7131821 - 7131552
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  7131821 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaacatttgaacttagcccactgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttg 7131722  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
      |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  7131721 ttgttcgccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactccatgtgatctcgaagaattgttgcgggcttttggaactatt 7131622  T
Q  399 attgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgaga 468  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| | || | || ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  7131621 actgaaagattgttattatgtcacaaacaaagcagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaattgaga 7131552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 540
Target Start/End: Original strand, 6594519 - 6594857
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||     
T  6594519 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttataagattacacatttgtacttatccgggtgttcaagagtgaagctacatggaataaactttt 6594618  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
     ||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||      
T  6594619 tagttcccaaactggaggtgttgtacttgtcaaatacagaggttgatgatgagacactacgtgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactaaa 6594718  T
Q  399 attgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcattta 498  Q
    | |   | ||||| || || |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||   ||| |||||||    
T  6594719 actagaaaattgtgatcatctcacagaggagggagccaaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagagaaatgtatttgaggg---gttgtcattta 6594815  T
Q  499 actgacaaaacaagggaactcttcacgcgtcgtggatgcctt 540  Q
    | |||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6594816 agtgacgaaattagggaactcttctcgcgtcggggatgcctt 6594857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 540
Target Start/End: Original strand, 7994093 - 7994433
Alignment:
Q  197 gtatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactt 296  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || | |  ||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7994093 gtatatctgaaggtatttgttacgttttaaggaaatgttgtaagatcaggcatttgaacatagccgattgtacaagagtgaagctactaggaatgaactt 7994192  T
Q  297 tgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaacta 396  Q
    || ||||||  | ||||| ||||||||| ||||| |||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  7994193 tgtagttccgaagctagaggtgttgaacatgtcaaatacaagggttaatgacgaaacactatatgtgatctcaaagaattgttctggacttttgcaacta 7994292  T
Q  397 tta-ttgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcat 495  Q
    ||| |||| |  |||| || |||| || ||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||  |||    |||||||    
T  7994293 ttacttga-actttgtaatgatgttaccgaggagggagtgaaacatgtggtagaaaactgcacgcaactgaaagagatttatttagggg---attttcat 7994388  T
Q  496 ttaactgacaaaacaagggaactcttcacgcgtcgtggatgcctt 540  Q
     ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  7994389 ataagtgacaaaaatagggaactcttctcgcgtcacggatgcctt 7994433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6416151 - 6415880
Alignment:
Q  200 tatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| |    |||  || || ||||||||  |||||  ||||||     
T  6416151 tatctgaaggtatttgtcaagttttaaagatatgttgtaagattgggcatttgaacttagccttttgtaaaaaagtgaagctacatggaatggactttgt 6416052  T
Q  300 agttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta 399  Q
    ||||||| | || || ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6416051 agttcccaacctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaaggttaatgataaaactctctatgtgatctcaaagaattgtagcgggcttttgcaactatta 6415952  T
Q  400 -ttgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagag 471  Q
     |||| |  |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  6415951 cttga-attttgtgataatgtcacagaagtgggagtgaaacatgtggtagagaactgcacacaactaagagag 6415880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 6395050 - 6394769
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||  |||||||||||| ||   ||||||| || ||| ||||  ||||| |||||||    
T  6395050 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaagaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaaaagtgaaactacatggaatgaactttg 6394951  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
    |||||||| | || || ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||      
T  6394950 cagttcccgagctggaggtgttgaacttgtcaaatacaagcgttgatgatgaaactctttctgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaattaca 6394851  T
Q  399 a-ttgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttg 480  Q
    | |||| | ||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  6394850 acttgata-attgtaaaaatgtcacagaaaagggtgtggaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagagagattaatttg 6394769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19632611 - 19632273
Alignment:
Q  210 tatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaa 309  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||| ||  || ||||| ||||||||||||  ||||||| |     
T  19632611 tatttgtcaagttttaag---atgttgtaagataacgcatttgaacttaactcgatgttcaatagttaacctacttggaataaactttctagttcccaag 19632515  T
Q  310 ctagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagatt 409  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| | |||    
T  19632514 ctagaggtgttggacttgtcgtatacaaaggttgatgatgagcaactttttgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactcttactgaaaaatt 19632415  T
Q  410 gttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcatttaactgacaaaac 509  Q
    ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||    | |||||| || |||||||||    
T  19632414 gtgctaatatcacagagaagggagtgaaacacgtggtagaaaactgcaaacaactgaaggagatttatttggggg---atattcattcaagtgacaaaac 19632318  T
Q  510 aagggaactcttcacgcgtcgtggatgccttgttcggtagtattc 554  Q
     ||| |||||| |  ||||| |||||||||| || | ||||||||    
T  19632317 taggaaactctgcttgcgtcatggatgccttctttgctagtattc 19632273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14820880 - 14820598
Alignment:
Q  198 tatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaacttt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||      |||||| ||| ||| ||||  ||||| ||||||    
T  14820880 tatatctgaaggtatttgtcaaggtttaaggaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagaattttgttcaggagtgaaactacatggaattaacttt 14820781  T
Q  298 gcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactat 397  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||    
T  14820780 gcagttcccaagttagaggtgttgaacttatcaaatacaaaggttgataatgaaacactttatatgatctccaagaattgttgtgggcttttgcgattat 14820681  T
Q  398 ta-ttgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttg 480  Q
    || |||| | | ||| || |||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  14820680 tacttga-aaaatgtaatgatgtcacagagaagggtgtgaaacatgtggtaaaaaactgcacacagctgagagagattaatttg 14820598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 476
Target Start/End: Original strand, 10579649 - 10579927
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | |||||| |||| |||| ||||||||||||| |    ||| |||||| ||||| |||  |||||||  |||    
T  10579649 atatctgaaggtatttttcaagtttcaggaagatgtggtaagattaagcatttgaacttagccaaatgtccaagagtgaagcgacttagaataaagattg 10579748  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaacta-t 397  Q
     | ||||||| || || ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  10579749 taattccccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaaagttgatgataaaacactctattcgatctcaaagaattgttgtcggcttttggaactatt 10579848  T
Q  398 tattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagattta 476  Q
    || ||| | | ||| | |  |||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10579849 tactgaaaaactgtaaaagggtcacaaagaagggagttaaacatgtggtagaaaactgcacacaacttagagagattta 10579927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 394
Target Start/End: Original strand, 6596844 - 6597036
Alignment:
Q  202 tctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||| | | |  |||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |     
T  6596844 tctgaaggtatttgtcaagttttcaggagatgtgataagattaagcatttgaactgagccgaatgttcaagtgtgaagcgacttgaaataaactttgaaa 6596943  T
Q  302 ttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaac 394  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  6596944 ttccccagctggaggtgttgaacttgtcaagtacaaatgttgatgatgaaacactctacgctatctcaaagaattgttctgggctcttgaaac 6597036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 340 - 474
Target Start/End: Original strand, 6603256 - 6603390
Alignment:
Q  340 gttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaac 439  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||| |||||    
T  6603256 gttgatgatgaaacagtctatgcgatctcaaagagttgtcctgggcttttggaactattattgaaatattgttattatgtcacagagaaaggagtgaaac 6603355  T
Q  440 atgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatt 474  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||    
T  6603356 atgtggtagaaaactgcaaacaactgagaaagatt 6603390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6410192 - 6409947
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||| ||||||| ||||| |    ||   || || ||||||||  ||||| |||||||    
T  6410192 atatctgaaggtatttgtcaagttttacagaaatgttgtaagcttaagcatttggacttagcctattgcaaaaaagtgaagctacatggaatgaactttg 6410093  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
     ||||||| | ||  | |||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  6410092 aagttcccaagctgaaggtgttgaactagtcaaatacaagcgttgatgatgaaactctttatgtgatctcaaagaattgttgtcggcttttgcaactatt 6409993  T
Q  399 attgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtg 444  Q
     |||    | ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  6409992 tttgtacaactgtgataatgtcacacagaagggagtgaaacatgtg 6409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 522
Target Start/End: Original strand, 6589236 - 6589556
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |    |||   | || ||||||||| ||||| |||||||    
T  6589236 atatctaaaggtatttgtcaagtattgagaagatgttgtaagattaggcatttgaacttagccttctgtaagaaagtgaagctacttggaatgaactttg 6589335  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
     |||||||   || || ||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||| || || |||     
T  6589336 tagttcccatgctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaatgttaatgataaaacactatatctgatctcaaaaaattgtatagggcttatgcaattatc 6589435  T
Q  399 attgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcattta 498  Q
    | |   |  |||| || ||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||   |||||||||| || |||    | ||||||||    
T  6589436 acttcaactttgtaattatgtcacggaggagggagtgaaacatgtggtagaaaactgcacacgacttcaagagatttatctggggg---atattcattta 6589532  T
Q  499 actgacaaaacaagggaactcttc 522  Q
    | ||||||||| |||||| |||||    
T  6589533 agtgacaaaactagggaaatcttc 6589556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14818481 - 14818297
Alignment:
Q  286 ggaataaactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggc 385  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  14818481 ggaattaactttgcagttctcaagttagaggtgttgaacttatcaaatacaaaggttgataatgaaacactttatatgatctccaagaattgttctgggc 14818382  T
Q  386 ttttgaaactatta-ttgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagaga 470  Q
    |||||  | ||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  14818381 ttttgcgattattacttga-aaattgtaataatgtcacagagaagggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcacacagctgagaga 14818297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14802429 - 14802329
Alignment:
Q  292 aactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttga 391  Q
    ||||||| ||||||| |  | ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  14802429 aactttgaagttcccaagatggaagtgttgaatttgtcaaatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatttcaaagaattgttgtggtcttttga 14802330  T
Q  392 a 392  Q
    |    
T  14802329 a 14802329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 395
Target Start/End: Original strand, 11936194 - 11936384
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||    | | ||||||| |||||    
T  11936194 gaaggtattgttcatgttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgctgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttc 11936293  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    || |||| || |||||| ||||||||  ||| |  ||||| ||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11936294 ccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattggatctcaaagagttgtagtgggcttttgcaact 11936384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 395
Target Start/End: Original strand, 11948174 - 11948364
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||    | | ||||||| |||||    
T  11948174 gaaggtattgttcatgttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgctgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttc 11948273  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    || |||| || |||||| ||||||||  ||| |  ||||| ||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11948274 ccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattggatctcaaagagttgtagtgggcttttgcaact 11948364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6426697 - 6426497
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||| ||   |||||||  | ||| ||||  ||||| |||||||    
T  6426697 atatctgaaggtatttgtgaagttttaaggaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaaacgtgaaactacatggaatgaactttg 6426598  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
    |||||||| | || || |||||||| |||||| | || |   |||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  6426597 cagttcccgagctggaggtgttgaatttgtcaaacacaagcattgatgatgaaactttttatgcgatctcaaagaattgttgtcggattttgcaattatt 6426498  T
Q  399 a 399  Q
    |    
T  6426497 a 6426497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 306
Target Start/End: Original strand, 8913896 - 8914004
Alignment:
Q  198 tatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaacttt 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||   ||| || ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  8913896 tatatctaaaggtatttgtcaagttttaagaagatgttgtaagattaaacatttgaacttcgttggatgatcaagagtgaagctacttgcaataaacttt 8913995  T
Q  298 gcagttccc 306  Q
    | |||||||    
T  8913996 gtagttccc 8914004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 822 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 6422571 - 6422508
Alignment:
Q  822 ttctctttatcaaattttaatacaaattctaaattgactttgatctgtttttaacagattgttt 885  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6422571 ttctttttatcaaattttaatacaaattctaaattcattttgatctgtttttagcagattgttt 6422508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 6423286 - 6423122
Alignment:
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta-ttgagagattgttat 414  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||    
T  6423286 gtgttgaacttgtcaaatacaagagttagcgataaaacactctatgcgatctcaaagagttgttgtgggattttgcaactattacttga-agattgtgat 6423188  T
Q  415 aatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttg 480  Q
     |||| ||| | || |||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6423187 tatgtaacaaacaaaggactgaaacgtgtggtattaaactgcacacaattgagagagatttatttg 6423122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 6602961 - 6603034
Alignment:
Q  21 tgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattttggtcacaatt 94  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6602961 tgtagagaataatgattctatgatggatattggtatataccctcaattaaagtctctctatttaggtgacaatt 6603034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 6432061 - 6431995
Alignment:
Q  576 aacacggtaagttgtttt-tgttttcagacaaatgaatttcctccattgaaaactttagtctgaaat 641  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6432061 aacactgtaagttgttttcttttttaagacagatgaatttccttcattgaaaactttagtctgaaat 6431995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6432480 - 6432442
Alignment:
Q  45 ggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432480 ggatattgatgtataccctcagttaaagtctctctattt 6432442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19632753 - 19632712
Alignment:
Q  47 atattggtgtataccctcagttaaagtctctctattttggtc 88  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19632753 atattggtgtataccctcaattaaagtctctctatttgggtc 19632712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14821003 - 14820959
Alignment:
Q  51 tggtgtataccctcagttaaagtctctctattttggtcacaattc 95  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14821003 tggtgtataccctcaattgaagtctctctatttgggtcacaattc 14820959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 6409868 - 6409809
Alignment:
Q  582 gtaagttgtttttgttttcagacaaatgaatttcctccattgaaaactttagtctgaaat 641  Q
    ||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6409868 gtaagttgttcgttttttaagacagatgaatttccttcattgaaaactttagtttgaaat 6409809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 659 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 6409783 - 6409753
Alignment:
Q  659 gctttcataatataatttgtgggttttagat 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6409783 gctttcataatataatttgtgggttttagat 6409753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9411532 - 9411482
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaac 255  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9411532 gaaggtattttgcaggttttaaggagatgtggtaacattagacatttgaac 9411482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6410320 - 6410287
Alignment:
Q  50 ttggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6410320 ttggtgtataccctcaattaaagtctctctattt 6410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6416280 - 6416247
Alignment:
Q  50 ttggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6416280 ttggtgtataccctcaattaaagtctctctattt 6416247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9411394 - 9411345
Alignment:
Q  346 gatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  9411394 gatgaaatactctatgagatctcaaagaattgtcgtggacttttgcaact 9411345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28935133 - 28935056
Alignment:
Q  301 gttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgt 378  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||| |||||  |||||| ||||||| ||||    
T  28935133 gttccccaactcgaggtgttgaacttgtcacatacaagagttgacgatgaagcactcagtgtgatttcaaagagttgt 28935056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 471
Target Start/End: Original strand, 20477902 - 20478267
Alignment:
Q  106 ggtcataattcatggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgtgatcgtatatctg 205  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||  |||||||| || || |||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||    
T  20477902 ggtcataatccatggttaagtgatgaaataataataatatttgcttctatgttccccaatttgcaacatcttgattttccttggtgcaatcgtatatctg 20478001  T
Q  206 aaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttcc 305  Q
    ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  20478002 aagatatttgtcaattcttaacgagatgttgtaagttaaggcatttgaacttagctggatgtcgaagagcgaagctacttggaataaacgttgtaattcc 20478101  T
Q  306 ccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgaga 405  Q
    ||| || || ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || || || ||| |    
T  20478102 ccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgacgaaacattatctgtgatctcaaggaattgttgtgggcttttgcaaatactactgaaa 20478201  T
Q  406 gattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagag 471  Q
     ||||  |||||||||||   || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  20478202 aattgcgataatgtcacaatgaaaggagcgaaacatgtcgtagaaaactgcacacaactgagagag 20478267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 204 - 449
Target Start/End: Original strand, 41889472 - 41889717
Alignment:
Q  204 tgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagtt 303  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||| || ||||||||| | ||| ||||||  ||||    
T  41889472 tgaaggtattactcaagttttaaggatatgttgtaacattagatatttgaacttatccggatgttcaatagtgaagctacttgaaatgaactttaaagtt 41889571  T
Q  304 ccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattga 403  Q
    ||| || | || ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||| |||| | ||| | |    
T  41889572 cccaaattggaggtgttgaacttatcatatacaaaagttgatgatgaaacactttataagatctcaaagagttgttgcgggctttcgaaattgttactta 41889671  T
Q  404 gagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgataga 449  Q
     | |||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||    
T  41889672 aaaattgttatgatgtcacaaagaagggagtgaatcatgtggtaga 41889717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 474
Target Start/End: Original strand, 41901457 - 41901723
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |   |||||| | || ||    ||||| |||| |||||| |||||    
T  41901457 gaaggtattgttcaagttttaaggatgtgttgtaacattagacatttgaacttatccaagtgttccatagtgag---actagaaatagactttgaagttc 41901553  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgag 404  Q
    || |||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | | |       
T  41901554 ccaaactggaggtgttgaacttgtcatatacaaaagttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtggacttttgaaattgtcacttca 41901653  T
Q  405 agattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatt 474  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  41901654 agattgtaatgatgtcacaaagaagggagtgaagcatgtggtagaaaactgtacgcaattgagaaagatt 41901723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 32267641 - 32267381
Alignment:
Q  216 tcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaa 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||| || |||   ||||| ||| ||||||| ||||||| || | ||     
T  32267641 tcaatttttaaggatatgttgtaacattagacatttgaacttatcccagtgttcaacagtgaa---actagaaatgaactttgaagttcccaaattggag 32267545  T
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttata 415  Q
    || |||||||||||| | || |  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| | | | | | | ||||| ||     
T  32267544 gtattgaacttgtcacaaacaatagttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggcttttgaaattgtcacttaaaaattgtaatg 32267445  T
Q  416 atgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttattt 479  Q
    || ||||| | ||||||| ||| |||||  |||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||    
T  32267444 atatcacaaagaagggagtgaagcatgtagtagaaaactgcacgcaacttagaaagattaattt 32267381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28525197 - 28525137
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaa 259  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  28525197 atatctaaatgtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaagatgagggatttgaaattaa 28525137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 395
Target Start/End: Original strand, 38267562 - 38267665
Alignment:
Q  292 aactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttga 391  Q
    ||||||| ||||||| | || || |||||| ||||| || |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  38267562 aactttgaagttcccaaccttgaggtgttggacttgacacatacaagagttgatgatgacacactctatgtaatctcaaagacgtgccgtgggcttttga 38267661  T
Q  392 aact 395  Q
    ||||    
T  38267662 aact 38267665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37937931 - 37937877
Alignment:
Q  341 ttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  37937931 ttgatgatcaaacactctatgtaatctcaaagatgtgtcgtgggcttttgcaact 37937877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 575
Target Start/End: Original strand, 15092064 - 15092434
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||  ||||| |||||||    
T  15092064 atatctcaaggtatttctcaagttttaaggaaatgttataagcttaaacatttgaacttaactggatgtttaagtgtgaaactacatggaatgaactttg 15092163  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
    |||||||| | || || |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15092164 cagttcccgagctggaggtgttgaatttgtcagaaacaaaggttaatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactatt 15092263  T
Q  399 a-ttgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcattt 497  Q
    | |||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||   | | | ||| |    
T  15092264 acttga-attttgttataatgtcacagaagtgggagtgaaacatgtgctagaaaactgcacacaattgagagagattaatttgcgg---tatatccatgt 15092359  T
Q  498 aactgacaaaacaagggaactcttcacgcgtcgtggatgccttgttcggtagtattcttctggaattgctatgctgaa 575  Q
    || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| | || | |||||   ||||| |||||||||||||||    
T  15092360 aagtgacaaaactaggaaactattctcgcgtcgtggatgccatatttgctagta---ttctgaaattgctatgctgaa 15092434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10614774 - 10614523
Alignment:
Q  204 tgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagtt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    |||  || || ||||||||| ||||| ||| |||  |||    
T  10614774 tgaaggtatttgtcaagttttaaggatatgttgtaagattaggcatttgaacttagcctattgtaaaaaagtgaagctacttggaatgaacgttgttgtt 10614675  T
Q  304 ccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta-ttg 402  Q
    ||| | || || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10614674 cccaatctggaggtgttgaacttgtcaaatacgaaggttaatgataaaacactctatgtgatctcgaagaactgtagtgggcttttgcaactattacttg 10614575  T
Q  403 agagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactg 455  Q
    | |  || | |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  10614574 a-actttctcataatgtcacagaagaaggagtgaaacatgtggtagaaaactg 10614523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 467
Target Start/End: Original strand, 10170145 - 10170262
Alignment:
Q  350 aaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgataga 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||   ||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  10170145 aaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaaga 10170244  T
Q  450 aaactgtacacaactgag 467  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  10170245 aaactgctcacaactgag 10170262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 467
Target Start/End: Original strand, 10177670 - 10177787
Alignment:
Q  350 aaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgataga 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||   ||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  10177670 aaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaaga 10177769  T
Q  450 aaactgtacacaactgag 467  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  10177770 aaactgctcacaactgag 10177787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 820 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 10613410 - 10613345
Alignment:
Q  820 tcttctctttatcaaattttaatacaaattctaaattgactttgatctgtttttaacagattgttt 885  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  10613410 tcttctctttatcaaattttaaaacaaattctaaattgattttgatatgtttttagcagattgttt 10613345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 815 - 885
Target Start/End: Original strand, 10612139 - 10612209
Alignment:
Q  815 cttaatcttctctttatcaaattttaatacaaattctaaattgactttgatctgtttttaacagattgttt 885  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10612139 cttattcttctcttcatcaaattttaaaacaaattcaaaattgattttgatctgtttttagcagattgttt 10612209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10614939 - 10614874
Alignment:
Q  18 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10614939 gagtgtagagaattctgattcattggcggagtttggtgtataccctcaattaaagtctctctattt 10614874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 580 - 647
Target Start/End: Original strand, 10611941 - 10612006
Alignment:
Q  580 cggtaagttgtttttgttttcagacaaatgaatttcctccattgaaaactttagtctgaaattgattt 647  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10611941 cggtaagttgtttttgttgtcagacac--gaatttccttcattgaaaactttagtctgaaattgattt 10612006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 10167427 - 10167492
Alignment:
Q  18 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10167427 gagtttagacaattctgattctttgccggattttggtgtataccctcaattgaagtctctctattt 10167492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 10169883 - 10169948
Alignment:
Q  18 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10169883 gagtttagacaattctgattctttgccggattttggtgtataccctcaattgaagtctctctattt 10169948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 10177408 - 10177473
Alignment:
Q  18 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10177408 gagtttagacaattctgattctttgccggattttggtgtataccctcaattgaagtctctctattt 10177473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7977758 - 7977712
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcattt 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7977758 gaaggtattggtcaagttttaaggagatgttgtaacattagacattt 7977712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 251
Target Start/End: Original strand, 10170043 - 10170095
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcattt 251  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  10170043 atatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaatattaggcattt 10170095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 251
Target Start/End: Original strand, 10177568 - 10177620
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcattt 251  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  10177568 atatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaatattaggcattt 10177620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 15091936 - 15091980
Alignment:
Q  50 ttggtgtataccctcagttaaagtctctctattttggtcacaatt 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15091936 ttggtgtataccctcaattaaagtctctctatttggctcacaatt 15091980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 464
Target Start/End: Original strand, 53761679 - 53761947
Alignment:
Q  193 gatcgtatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataa 292  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  53761679 gatcgaatatctaaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttagccgagtgttcaagagtgaagctaattggaatga 53761778  T
Q  293 actttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaa 392  Q
    |||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  53761779 actttgtagttcccaagctagaggcgttgaacttgtcatttacgaaagttaacgataaaacactc--tgtgatctcgaagaattgtcgtgggcttttgca 53761876  T
Q  393 actattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaact 464  Q
    | ||||| ||| | ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  53761877 a-tattactgaaacattgtgataatgtcacggacaagggagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaact 53761947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 547089 - 546825
Alignment:
Q  209 gtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttcccca 308  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    |||| |  || ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||  |    
T  547089 gtatttgtgatgttttaaggagatgttgtaagataaggcatttgaacttatccaattgtttagtagtgaacctatttggaatgaactttgaagttcctaa 546990  T
Q  309 actagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagat 408  Q
    | | || ||| |||||||||||  ||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||| ||  |||     
T  546989 attggaggtggtgaacttgtcacgtacaattgtcaatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttggaattgttactggaagaa 546890  T
Q  409 tgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  546889 tgttttcatgtcacagagaagggagtgaaacatgtgctagaaaactgcacaaaactaagagagat 546825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 470
Target Start/End: Original strand, 55908647 - 55908912
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |    |||||||||| ||| |||||  |||||||||||  |||||    
T  55908647 gaaggtatttgtgaagttctaaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttc 55908746  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgag 404  Q
    |  || |||| ||||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||  ||      
T  55908747 ctgaattagaggtgtttaacttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctgga 55908846  T
Q  405 agattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagaga 470  Q
    | ||||| || | |||||||| || || | |||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  55908847 aaattgtgatgaagtcacagagaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaactcagaga 55908912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 490
Target Start/End: Original strand, 1524405 - 1524687
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttc-aagagcgaagctactaggaataaactttgcagtt 303  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    ||||| || |  ||| || |  ||||| ||||||| ||||    
T  1524405 gaaggtattcttcaggttttaaggagatgttgtaaacttaggcatttgaacttagccaactgttctaaaatagaa-cttcatggaatgaactttgaagtt 1524503  T
Q  304 ccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattga 403  Q
    ||| |  | || |||||||| ||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  1524504 cccaatttggaggtgttgaatttgtcacgtacaagtgttgatgatgaaacactctatatgatctcacagagttgtcgtgggcttttgcaactgttattgc 1524603  T
Q  404 gagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgtt 490  Q
    |   | ||| | |||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1524604 g---tagttgttatgtcacagagaggggagtgaattatgtgatagaaaactgcacacaactgagagagattaatttgaggggttgtt 1524687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 659889 - 659718
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |  | |||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||    
T  659889 gaagatattggtcaaattttaaggagatgttgtaacattagatatttaaacttagcctgctgttcaagagggaagctacgagtaataaattttgaagttc 659790  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgt 378  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  659789 ccaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagtgttaataatgaaaca--ctatgtgatctcaaggaattgt 659718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 473
Target Start/End: Original strand, 1513407 - 1513591
Alignment:
Q  286 ggaataaactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggc 385  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||    
T  1513407 ggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatttacaaatgttgatgatgaaacactctacgtaatctcaaagtgttgtcgtgggc 1513506  T
Q  386 ttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    ||||| ||||  || ||| ||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  1513507 ttttgcaactcatactgaaag---gttgtattgtcacagagatgggagtgaagcttgtgctagaaaaatgcacacaactgagagagat 1513591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 473
Target Start/End: Original strand, 55505087 - 55505292
Alignment:
Q  265 tgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtga 364  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  55505087 tgttcaacagtgaacctaattggaatgaactttagagtcccccaactagaggtgttgaacttgtcatatacaaaggttgacgatggaacactttatgtga 55505186  T
Q  365 tctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaact 464  Q
     ||||||||||||| |||| |||||| |  | ||||||| | || |     |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  55505187 cctcaaagaattgtcgtggacttttgcatttgttattgaaaaatag---cgatgtcacagagaagggagtgaaacacgtgttagaaaactgcacacaact 55505283  T
Q  465 gagagagat 473  Q
     ||||||||    
T  55505284 aagagagat 55505292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 553644 - 553391
Alignment:
Q  220 gttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaagtgt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||    | | ||||||  ||||| | |||| || ||||    
T  553644 gttttaaggacatgttgtaacattagacatttgaacttaacccgctgttcaagagtgaagttacgtacattgaactttaaagttctcaaactggaggtgt 553545  T
Q  320 tgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatgt 419  Q
    |||||||||||  ||| |  |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||| || |||    |||||  | ||||    
T  553544 tgaacttgtcatttacaagagttgatgatgaagcacttaatgtgatttcaaagagttgttctgggcttttgcaactgttgttgttttattgtagtgatgt 553445  T
Q  420 cacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    |||||| || |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  553444 cacagataaaggagtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaacttagagagat 553391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 641100 - 640845
Alignment:
Q  200 tatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgc 299  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| | || |||    |||  || ||||| ||||| || ||||     
T  641100 tatctgaaggaatttttcaagttttaaggatatgttgtaatgttagacatttgaacttagccggttgtgatggagtaaacctacttggaatgaaatttga 641001  T
Q  300 agttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta 399  Q
    | | ||   | | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||| | || |||    
T  641000 actaccaatattggaggtgttgaacttgtcagatacaaacgttgatgatgaaacactctacgtgacctcaaagaattgccgtggtcttttgcatctgtta 640901  T
Q  400 ttgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactg 455  Q
     ||  ||||||| || |||| ||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  640900 ctggaagattgtcattatgtaacaaagaagggagtgaatcatgtggtagaaaactg 640845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 390
Target Start/End: Original strand, 1548345 - 1548528
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctacta-ggaataaactttgcagtt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||| || |  ||| || || |||||||||  ||| | ||||||| | ||    
T  1548345 gaaggtatttgtgaagttttaag---atgttgtaagattagacagttgaacttagctcgtagtttaaaagtgaagctactttggactgaactttgaaatt 1548441  T
Q  304 ccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttg 390  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1548442 cccaaactggaggtgttgaacttgtcacatacaagtattgatgatgaaacactcaatgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttg 1548528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1600599 - 1600444
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| |   |||||||| |  |||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  1600599 gaaggtatttgtcaagttttaaggagattttctaaaattagacatttgaacttagcccagtgttcaataatgaagctgcgaggaatgaactttgaagttc 1600500  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctat 360  Q
       |||| || ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  1600499 ttaaactggaggtgttgaacttgtcatatacaagggttgacgatgaagcactctat 1600444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 395
Target Start/End: Original strand, 12121376 - 12121566
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| |||||   | |||| |||||||||||||||  | |||| | ||  |||||| |   |||| ||||||| |||||    
T  12121376 gaaggtattttccaagtcttaaggacatgttccgagattacgcatttgaacttaaccagttgtttaggaaggaagctgcgccgaatgaactttgaagttc 12121475  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||  |||  ||||||||||| ||||    
T  12121476 ccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaaacactctccgtaatctcaaagtgttgccgtgggcttttgcaact 12121566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 473
Target Start/End: Original strand, 1537686 - 1537954
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||   |  ||||||||||||||||||| || |    | |   |||||| |  ||||| ||||||| |||||    
T  1537686 gaaggtatttttcaagttttaaggacatgttccgagcttaggcatttgaacttaaccggcttaagaggttggaagctgcatggaatgaactttgaagttc 1537785  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgag 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  ||||||| | ||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||| ||      
T  1537786 ccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttaatgacaaaacactgtgtgtaatctcaaagtgttgtcgtgggcttttgcaacttttactgga 1537885  T
Q  405 agattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    |  |||||||  ||||||| | ||||||| |||  ||||| ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  1537886 actttgttatcttgtcacacagaagggagtgaagtatgtgctagaaaaatgcactcaactaagagagat 1537954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 473
Target Start/End: Original strand, 1489361 - 1489548
Alignment:
Q  286 ggaataaactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggc 385  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |  | |||||||| | ||| ||||||| |  |||  ||||||    
T  1489361 ggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttaacaacgaaacactgtgtgtaatctcaatgtgttgccgtgggc 1489460  T
Q  386 ttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    ||||| |||| ||| ||  ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  1489461 ttttgcaactcttactggaagggtgttttaatgtcacagagaagggagtgaagcatgtgctagaaaaatgcgcacaactaagagagat 1489548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 371
Target Start/End: Original strand, 1519061 - 1519227
Alignment:
Q  204 tgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagtt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| | |    |  | ||||| | |||| | | |||| ||||||| ||||    
T  1519061 tgaaggtatttgtcaagttttaagaagatgttgaaggattaggcatttgaactgagcattttaattaagagaggagctgc-atgaatgaactttgaagtt 1519159  T
Q  304 ccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaa 371  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1519160 cccaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagggttgatgaataagcactctatgtgatctcaaa 1519227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Original strand, 1552757 - 1552871
Alignment:
Q  276 gaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaat 375  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1552757 gaagctacttggactgaactttgaaattcccaaactggaagtgttgaatttgtcacatacaaatattaatgatgaaacactcaatgtgatatcaaagaat 1552856  T
Q  376 tgtagtgggcttttg 390  Q
    ||| |||||||||||    
T  1552857 tgtcgtgggcttttg 1552871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 308 - 395
Target Start/End: Original strand, 1508025 - 1508112
Alignment:
Q  308 aactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  1508025 aactagaagtgttgaacttgtcacataccaatgttgatgatgaaacactgtgtgtaatctcaaagtgttgtcgtgggcttttgcaact 1508112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 532307 - 532186
Alignment:
Q  267 ttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatc 366  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||  || ||||||| |    
T  532307 ttcaagagtgaatctacttggaatgaactttgaagtccccaagctagaggtgttgaacttgtcatatacaaacattgatgatgaaaagctttatgtgacc 532208  T
Q  367 tcaaagaattgtagtgggcttt 388  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  532207 tcaaagaattgtcgtgagcttt 532186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 483
Target Start/End: Original strand, 8184031 - 8184227
Alignment:
Q  287 gaataaactttgcagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggct 386  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||  | |||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  8184031 gaatgaactttgaagttccgaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagagttgatgatatagcactctatgcaatctcaaagagttgttgtgggct 8184130  T
Q  387 tttgaaactattattgagagattgttataatg-tcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagg 483  Q
    |||| |||| ||| ||  | ||||| | |||| |||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||| || |||  ||||||||    
T  8184131 tttggaactgttactggaaaattgtga-aatgatcacagatgagggagtgaagcatgtgctagaaaattgcacacaactgaaagtgatcaatttgagg 8184227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 566234 - 566184
Alignment:
Q  340 gttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  566234 gttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagtactgtcgtgggcttttg 566184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 558677 - 558488
Alignment:
Q  206 aaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttcc 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||  |||| | ||   ||  |||  |||   ||||||| |||| |    
T  558677 aaggtatttgtcatgttttaaggacatgttctaacattagacatttgaccctaactgactgtttaggaatcaatatacctggagcgaactttgaagttgc 558578  T
Q  306 ccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    | | ||||  |||||||||||||||   ||  |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  558577 caacctaggggtgttgaacttgtcattaacatatattgatgatgaagcactccatgtgatctcaaagagttgtcgtgggcttttggaact 558488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 390
Target Start/End: Original strand, 8187010 - 8187195
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||| |    ||| ||||||    |||    ||||| ||||||| | ||     
T  8187010 gaaggtatttgtcaagttttgaagagatgttgtgagattagggatttgaacttagcctactgtccaagagttgggctctccggaatgaactttgaaattt 8187109  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttg 390  Q
    || |||| || ||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||| ||||  || ||||||| |||| |||||||||||    
T  8187110 ccaaactggaggtgttgaacttgtcacatacaagagttgatgataaaacactttatgcaatttcaaagagttgttgtgggcttttg 8187195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 268
Target Start/End: Original strand, 3438496 - 3438548
Alignment:
Q  216 tcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgtt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  3438496 tcaagttttaaggagatgttgtaagattagacatttgaacttagctggttgtt 3438548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 331
Target Start/End: Original strand, 21834291 - 21834423
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||  | || ||||||||   | || |||||||    
T  21834291 atatcagaaggtatttgcgaagttttaaggaaatgttgtaagattaagcatttgaacttatcaggttgttataaagtgaagctacatagtatcaactttg 21834390  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcag 331  Q
     ||||||| | || || |||||| |||||||||    
T  21834391 tagttcccaagctggaggtgttggacttgtcag 21834423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 464
Target Start/End: Original strand, 1517563 - 1517674
Alignment:
Q  353 cactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaa 452  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||||| |||||||  |  |||||| |||| ||    
T  1517563 cactctttgtaatctcaaagaattgtcgtggaattttgaaactattactggaaaattgtcatgatgtcacagagaagggagttaggcatgtggtagagaa 1517662  T
Q  453 ctgtacacaact 464  Q
    |||| |||||||    
T  1517663 ctgtgcacaact 1517674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 644995 - 644885
Alignment:
Q  220 gttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaagtgt 319  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||   | | ||||||| ||||||| |||| || ||||    
T  644995 gttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgctgttcaagactgaagctacttacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgt 644896  T
Q  320 tgaacttgtca 330  Q
    |  ||||||||    
T  644895 tagacttgtca 644885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 258
Target Start/End: Original strand, 7225809 - 7225855
Alignment:
Q  212 tttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaactta 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7225809 tttgtcaagttttacggagatgttgtaagattagacatttgaactta 7225855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 416 - 540
Target Start/End: Original strand, 21834436 - 21834557
Alignment:
Q  416 atgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgttttcatttaactgacaaaacaaggga 515  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||    ||| ||||||| |||| |||  ||| |    
T  21834436 atgtcacagagaagggaatgaaacatatggtagaaagatgtacacaactgagagaaattaatttggggg---atttgcatttaagtgacgaaaagaggaa 21834532  T
Q  516 actcttcacgcgtcgtggatgcctt 540  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    
T  21834533 attcttctcgcgtcgtggatgcctt 21834557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 258
Target Start/End: Original strand, 1533909 - 1533962
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaactta 258  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  1533909 gaaggtattagtcatgttttaaggagatgttgtaagatgacacatttgaactta 1533962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 116 - 470
Target Start/End: Original strand, 51764270 - 51764624
Alignment:
Q  116 catggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgtgatcgtatatctgaaggtatttg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||| ||   ||  ||  |||| |||||| ||||| | ||    
T  51764270 catggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgattttaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctg 51764369  T
Q  216 tcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaa 315  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||     
T  51764370 tgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggag 51764469  T
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttata 415  Q
    |||||  ||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||    
T  51764470 gtgttagacttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgata 51764569  T
Q  416 atgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagaga 470  Q
    ||||||  || ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  51764570 atgtcaaggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 51764624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 492
Target Start/End: Original strand, 51113694 - 51113987
Alignment:
Q  199 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttg 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   ||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||    
T  51113694 atatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 51113793  T
Q  299 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 398  Q
     || |||| |||| || |||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  51113794 aagctcccaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgtt 51113893  T
Q  399 attgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgtttt 492  Q
    | ||| | |||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| || ||| |||| ||||||||| |||| | || |||||||    
T  51113894 actgaaaaattgttaccatgtcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaagagagattaatttaaagggttgtttt 51113987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 471
Target Start/End: Original strand, 13470563 - 13470917
Alignment:
Q  117 atggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgtgatcgtatatctgaaggtatttgt 216  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| |  ||||| |||  ||| ||  |||   ||||  |||||||||||    
T  13470563 atggttaagtgatgaaggcatcataatgtttgcttccaatttccccaatttgcagctgcttgatttgaattgttgcaatctcttatcaaaaggtatttgt 13470662  T
Q  217 caagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaag 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    |||  || || ||||||||| ||||| |||||||  |||||| | || || |    
T  13470663 caagttttaaggatatgttgtaagattaggcatttgaacttagcctattgtaaaaaagtgaagctacttggaatgaactttgttgttcccaatctggagg 13470762  T
Q  317 tgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta-ttgagagattgttata 415  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |  |||| |||    
T  13470763 tgttgaacttgtcaaatacaaaggttaatgataaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactattacttga-actttgtcata 13470861  T
Q  416 atgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagag 471  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||    
T  13470862 atgtcacagaagagggagtgaaacatgtggtagagaactgcacacagctaagagag 13470917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 390
Target Start/End: Original strand, 51120827 - 51120997
Alignment:
Q  220 gttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaagtgt 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||| ||| || |  ||||| ||||||| ||||| | || | || ||||    
T  51120827 gttttatggagatgttgtaacattagacacttgaacttcaccggttgttcaagagtgaaactgcatggaatgaactttgaagttctcaaattggaggtgt 51120926  T
Q  320 tgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttg 390  Q
    ||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  51120927 tgaacttgtcgcatacaagagttgatgatgaaaaactatatgtaatctcaaagagttgtcgtgggcttttg 51120997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 51764195 - 51764256
Alignment:
Q  20 gtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51764195 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctat 51764256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 801
Target Start/End: Original strand, 51767897 - 51768100
Alignment:
Q  605 aaatgaatttcctccattgaaaactttagtctgaaattgattt----------ccagttagtcagctttcataatataatttgtgggttttagatacnnn 694  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||          ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |       
T  51767897 aaatgaacttccttcattgaaaactttagtctaaaatagattttgctttgttaccaattagtctgctttcaaaatataatttgtgggttttagattcta- 51767995  T
Q  695 nnnngacattataaataaattacatagaaaatatggatagaaaaccgaaagaggtcacaa-----atacacctgcaattatattacttaaaaatgtagtt 789  Q
           | || || ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||     ||| || | ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  51767996 -------aatacaagtaaattacatagaaattatggaaagaaaactgaaagaggtcacaaacatgatagacttacaattatgttacttgaaaaagtagtt 51768088  T
Q  790 tcattatgttaa 801  Q
    ||||||||||||    
T  51768089 tcattatgttaa 51768100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 258
Target Start/End: Original strand, 514651 - 514700
Alignment:
Q  209 gtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaactta 258  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  514651 gtatctgtcaagttttaaagagatggtctaagattaggcatttgaactta 514700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 83
Target Start/End: Original strand, 13470517 - 13470550
Alignment:
Q  50 ttggtgtataccctcagttaaagtctctctattt 83  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13470517 ttggtgtataccctcaattaaagtctctctattt 13470550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 205 - 483
Target Start/End: Original strand, 45245004 - 45245282
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||||  | |  |||  ||||||||||||| |||||    
T  45245004 gaaggaatgtgtcatgttttaaggagatgttgtaacattaggcatttaaacttagtttgctgttcaagactggaattacgtggaataaactttgaagttc 45245103  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgag 404  Q
    |  |||| || |||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  45245104 caaaacttgaggtgttgaatttgtcagagacaatggttgatgatgaaacactccatgtgatctcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactattattgaa 45245203  T
Q  405 agattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagg 483  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||||  ||||||||    
T  45245204 aaaatgttatcatgtcacagataagggagtgaaacatgtggtagaaaattgcacacaacttacagagatcaatttgagg 45245282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 470
Target Start/End: Original strand, 1037583 - 1037848
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |    | |||||||| ||| |||||  |||||||||||  |||||    
T  1037583 gaaggtatttgtgaagttttaaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactattcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttc 1037682  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgag 404  Q
    |  || |||| ||||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||  ||      
T  1037683 ctgaattagaggtgtttaacttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctgga 1037782  T
Q  405 agattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagaga 470  Q
    | ||||| || | |||||||| || || | |||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  1037783 aaattgtgatgaagtcacagagaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaactcagaga 1037848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 395
Target Start/End: Original strand, 32785789 - 32785881
Alignment:
Q  303 tccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |   ||||||||||| |||| |||||||||||||  | || |  |||||||||||||||    
T  32785789 tcccaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagaattgatgatgaagcactttatgtgatctcaataagttttcatgggcttttgaaact 32785881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 257
Target Start/End: Original strand, 43277392 - 43277431
Alignment:
Q  218 aagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43277392 aagttttaaggagatgttgtaaaattacgcatttgaactt 43277431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 103; Significance: 9e-51; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 470
Target Start/End: Original strand, 19468325 - 19468683
Alignment:
Q  112 aattcatggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgtgatcgtatatctgaaggta 211  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||   |  ||  | |  ||||| ||||| |    
T  19468325 aattcatggttaagcgatgaaaacatcataatgtttgcttccatttttcccaatttgcagctgcttgatttgaactcatgcaaccacatatcggaaggca 19468424  T
Q  212 tttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaact 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |    |||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| | ||    
T  19468425 tttgtcaagttttaaggaggtgttctaatattaggcatttaaacttagcccactgttcaagagtgaatctacttggagtgaactttgtagttcccaagct 19468524  T
Q  312 agaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgt 411  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||  ||   | ||||    
T  19468525 ggaggtgttgaagttgtcagatacaaaggttgatgatgaaacactttatgtgatctcaaagaactgttgtggacttttggaattatttgtggacggttgt 19468624  T
Q  412 tataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagaga 470  Q
     || |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  19468625 aatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaagaaaattgctcacaactgagaga 19468683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7554554 - 7554393
Alignment:
Q  319 ttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatg 418  Q
    |||||||| ||| |||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||  |||| ||| ||| ||  ||| ||||||    
T  7554554 ttgaacttatcatatacaagtgttgatgatgaagcactctatatgatctcaaagagttgtggtggacttttacaactgttactgaaaggatgtgataatg 7554455  T
Q  419 tcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttg 480  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || | ||| | ||||||| |||||    
T  7554454 tcacagaaaagggagtgaagcatgtggtagaaaactgcacgctactcaaagagattaatttg 7554393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43634988 - 43634900
Alignment:
Q  304 ccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaa 392  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43634988 ccccagctagaggcgttgaacttgtcatatacaaaggttgacgatggaacactttatgtgacctcaaagaattgtcgtggacttttgaa 43634900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 9581146 - 9580964
Alignment:
Q  310 ctagaagtgttgaacttgtcagatacgaag--gttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagaga 407  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| ||   ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || ||| ||| |||    
T  9581146 ctagaggtgttgaacttgtcatgtacaaaaaagttaatgatgaaacgctttatgtgatctcaaagaattgtcgtggacttttgtgccttttactgaaaga 9581047  T
Q  408 ttgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgtt 490  Q
    | |||||  ||||||| | || |||| ||| | |||| ||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  9581046 tagttatggtgtcacaaacaatggagtgaagcgtgtggtagaaaattgcacacaactggaagagattgatttgaggggttgtt 9580964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 80
Target Start/End: Original strand, 19468252 - 19468314
Alignment:
Q  18 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctcta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  19468252 gagtgtagagaattctgattctttgccggattttggtgtattccctcaattaaagtatctcta 19468314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9586714 - 9586601
Alignment:
Q  310 ctagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagatt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| | || |||  || | |||    
T  9586714 ctagaggtgttgaacttgtcatatacagatgttaatgatgaaacactttatgtgacctcaatgaattgtcgtggacttttgcatcttttacagaaaaatt 9586615  T
Q  410 gttataatgtcaca 423  Q
    ||||| ||||||||    
T  9586614 gttatcatgtcaca 9586601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 473
Target Start/End: Original strand, 35901764 - 35901829
Alignment:
Q  408 ttgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35901764 ttgttatgatgtcatagagaaaggagtgagacaagtcatagaaaactgtacacaactgagagagat 35901829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52082650 - 52082582
Alignment:
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtggg 384  Q
    ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  52082650 gtgttgaacttgtcaaagacaaaaattgatgatgaaacattgtatgtgatctcaaagagttgttgtggg 52082582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9581417 - 9581342
Alignment:
Q  18 gagtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctattttggtcacaat 93  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |||||||||    
T  9581417 gagtgtcgagaattctaagtctttcaaggatattggtgtaagccctcaattaaagtctcttgatttgggtcacaat 9581342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Original strand, 18315192 - 18315458
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| | | ||||| || ||||||||| || |   |||||||  ||||||||  ||||| ||||||  |||||    
T  18315192 gaaggtatttgtcaagttttacgaagttgttctgagattagacagttgaacttagctcgtgattcaagaatgaagctacgtggaatgaactttaaagttc 18315291  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgag 404  Q
    || |||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||||      
T  18315292 ccaaactggaggtgttgaacttgtcacatacaaaagttgatgatgaagcactctatgtgatctcaaagagttgtcgtaggcttttgcaactgttattgga 18315391  T
Q  405 agattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagag 471  Q
    |   |||| | |||||||||| || ||||  ||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  18315392 acgctgttgtgatgtcacagagaaaggagaaaagtatgtggtagaaaactgcacacaactgatagag 18315458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27922674 - 27922419
Alignment:
Q  216 tcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaactagaa 315  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||  | |||   ||||| ||| ||||||| ||||||| || | ||     
T  27922674 tcaagttttagggatatgctgtaacattagacatttgaacttatccaagtgttcaatggtgaa---actagaaatgaactttgaagttcccaaattggag 27922578  T
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta-ttgagagattgttat 414  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| | | | |||| | ||||| ||    
T  27922577 gtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggcttttgaaattgtcacttga-aaattgtaat 27922479  T
Q  415 aatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatt 474  Q
     || ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||    
T  27922478 gatttcacaaagaagggagtgaaccatgtggtagaaaactgcactcaactgagaaagatt 27922419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44736570 - 44736447
Alignment:
Q  350 aaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgataga 449  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||    
T  44736570 aaacactcattgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttgtaactggtattgagctattgttataatgtcacaacgaagggagtgaaacatgttgtaga 44736471  T
Q  450 aaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  44736470 aaattgtacacaactaagagagat 44736447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32151370 - 32151213
Alignment:
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttata 415  Q
    ||||| |||||||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||     |||| |      
T  32151370 gtgttaaacttgtcatgtacaaggtttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgttattggtgtcttgtaaat 32151271  T
Q  416 atgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagat 473  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||||    
T  32151270 atgtcacagagaagggggtgaagcatgtgaggaaaaactgtatacaactgagggagat 32151213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 34936083 - 34936276
Alignment:
Q  206 aaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttcc 305  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  | |  ||||||| || ||| || |   |||| | |||||  |||||    
T  34936083 aaggtatttatcatgttttaaggagatgttgtgacattagacatttgtacttggccgattgttcaaaagtgaaccttcacagaatgatctttgatgttcc 34936182  T
Q  306 ccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta 399  Q
      ||||||| |||||| |||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  34936183 aaaactagaggtgttggacttgtcatatacaagagttgatgataaaacactctatgccatcgcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactatta 34936276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 395
Target Start/End: Original strand, 28246214 - 28246402
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||    | | ||||||| |||||    
T  28246214 gaaggtattgttcatgttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgttgttcaagactgaagctacatacattgaactttgaagttc 28246313  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaact 395  Q
    || |||| || |||||| ||||||||  ||| |  |||||  || || ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  28246314 ccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttga--ataaatcactctattggatctcaaagagttgtagcgggcttttgcaact 28246402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 378
Target Start/End: Original strand, 17636317 - 17636493
Alignment:
Q  206 aaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctac-tag---gaataaactttgcag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    | |||||||||| ||| |||| | |   |||| ||||||| ||    
T  17636317 aaggtatttgtcaagttttaaggggatgttctaatattaggcatttgaacttaggccgatgttcaagagtgaaactacatcgatcgaatgaactttgaag 17636416  T
Q  302 ttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgt 378  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||| | ||    ||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  17636417 ttcccaaattggaggtgttgaacttgtcacaaacaggagttgacgatgaagcattgtatgtgatctcaaagagttgt 17636493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 399
Target Start/End: Original strand, 17628044 - 17628127
Alignment:
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatta 399  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  17628044 gtgttgaacttgtcacatactagagttgatgataaagcactccgtgtgatctcaaagaattgttttgggctcttgaaactatta 17628127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 464
Target Start/End: Original strand, 543 - 802
Alignment:
Q  205 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttc 304  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||| ||| |    |||||||||| ||| |||||  |||||||||||  |||||    
T  543 gaaggtatttgtgaagttctaaggagatgttgtaaggctagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttc 642  T
Q  305 cccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgag 404  Q
    |  || |||| ||||| ||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||      
T  643 ctgaattagaggtgtttaacttgtcacatacaagtgtcgatgatgaaacactctatatgatctcgaagaattgttgtgggctattacaactgttactgga 742  T
Q  405 agattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaact 464  Q
    | ||||| || | |||| ||| || || | |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  743 aaattgtgatgaagtcatagagaatggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcacacaact 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 378
Target Start/End: Original strand, 1388 - 1559
Alignment:
Q  210 tatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagcgaagctactaggaataaactttgcagttccccaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||   | | | ||| | | ||| ||||||| ||||||  |     
T  1388 tatttgtcaagttttaaggagatgttataagattagacatttgaacttagcctggtgttcatctgtggacctatttgaaatgaactttgtagttcctaag 1487  T
Q  310 ctagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgat---gatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgt 378  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1488 ctagaggtgttggacttgtcaaatacaaatgttgatgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgt 1559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 39253 - 39179
Alignment:
Q  316 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttg 390  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39253 gtgttgaacttgacatttacaaaggttaatgatgaaacactttatgtgatctcaaagagttgtagtgggcttttg 39179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 88980 - 88933
Alignment:
Q  221 ttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  88980 ttttaaggagatgttgtaagattagacatttgaacttaactgagtgtt 88933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University