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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4625-Insertion-1 (Length: 990)

Name: NF4625-Insertion-1
Description: NF4625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4625-Insertion-1
NF4625-Insertion-1
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (12-990)||(40227869-40228851)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 827; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 827; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 990
Target Start/End: Complemental strand, 40228851 - 40227869
Alignment:
Q  12 aatcatacaatttaagtgtaattaagggaaaaattacacattctgaacagtaacacgttaaatattccacaagctatcaaccgaggnnnnnnnnagggga 111  Q
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T  40228851 aatcatacaatttaagtgtaattaagggaaaaattacacattctgaacagtaacacgttaaatattccacaagctatcaaccgaggttttttttagggga 40228752  T
Q  112 tcaactgagttttttacgttggcattaaaataaaataaataatttactttgactaaagtctctttattataataggagttagatggaaaaaccaattaat 211  Q
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T  40228751 tcaactgaattttttacgttggcattaaagtaaaataaataatttactttgactaaagtctctttattataataggagttagatggaaaaaccaattaat 40228652  T
Q  212 atagattagttgagataaa-gataaatataagtgttttgtttcaaaggaatataaatgaaagtattatcgaaacaatctaattactatatttcttatgaa 310  Q
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T  40228651 ataggttagttgagataaaagataaataaaagtgttttgtttcaaaggaatataaatgaaagtattatcgaaacaatctaattactatatttcttatgaa 40228552  T
Q  311 aggaattaattagtattcttaatattatgtaaaagcaaataatttaagaaaaataaatacactgaatagaacacatattaacagagggagagtacatttg 410  Q
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T  40228551 aggaattaattagtattcttaatattatgtaaaagcaaataatttaagaaaaataaatacactgaatagaacacatattaacagagggagagtacatttg 40228452  T
Q  411 tttttaatgtattgatacacattttcaaagttgtgtaaattgtatatggcgactactaaaatctggtcttgccttcgtgtcaagctagatggctctcatg 510  Q
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T  40228451 tttttaatgtattgatacacattttcaaagt--tgtaaattgtatatggcgactactaaaatctggtcttgctttcgtgtcaagctagatggctctcatg 40228354  T
Q  511 tctctttcaaacaatggtgtaataatcatatataaattgtatgaaattgtcactattaggattttattttctttctttattaatatatatgaaatggagt 610  Q
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T  40228353 tctctttcaaacaatggtgtaataatcatatataaattgtatgaaattgtcactattaggattttattttctttctttattattatatatgaaatggagt 40228254  T
Q  611 atattttgcatnnnnnnnnttattacttttcgttttgtttaatgattatcttagttttttgttgtcacttagatggattgggtgatataggcttgatcct 710  Q
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T  40228253 atattttgcataaaaaaaattattacttttcgttttgtttaatgattatcttagttttttgttgtcacttagatggattaggtgatataggcttgatcct 40228154  T
Q  711 tagaatcttatgtaactattgagagcatgccacaaagacagtaaactacatcgtgagcatgacactttgtcttaatagctctaaatcttaacttgttcta 810  Q
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T  40228153 tagaatcttatgtaactattgagagcatgccacaaagacagtaaactacatcgtgagcatgacactttgtcttaatagctctaaatcttaacttgttcta 40228054  T
Q  811 aaaaggggcacacacttagtcca-tttaaccttgaatctgaatgatatagatagc-aagatggctaaataaatatggattttacatat-aataaatggat 907  Q
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T  40228053 aaaaggggcacacacttagtccattttaaccttgaatctgaatgatatagatagcaaagatggctaattaaatatggattttacatataaataaatggat 40227954  T
Q  908 tttctttatattttaattttagcc-aactttgacattgcaaac-aacttggcacgtgttgaacccaaattctta-gaaattcacgt 990  Q
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T  40227953 tttctttatattttaattttagccaaactttgaccttgcaaacaaacttggcacgtgttgaacccaaa-tcttaggaaattcacgt 40227869  T

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