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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4650-Insertion-4 (Length: 786)

Name: NF4650-Insertion-4
Description: NF4650
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4650-Insertion-4
NF4650-Insertion-4
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (15-786)||(50459873-50460646)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 727; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 727; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 786
Target Start/End: Original strand, 50459873 - 50460646
Alignment:
Q  15 ggtcccccaaagctccccatgacccaacagatatatgttccaatgattattcaattttatgaccaatct--agctatagttttttataattcctttttag 112  Q
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T  50459873 ggtccctcaaagctccccatgatccaacagatatatgttccaatgattattcaattttatgaccaatctctagctatagttttttataattcctttttag 50459972  T
Q  113 ccacccactgagccaaatatataaaaataaaagatgatttgatcttccttnnnnnnnntgatgatttgatctaattcaatcacatttattccctccaacc 212  Q
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T  50459973 ccacccactgagccaaatatataaaaataaaagatgatttgatcttccttaaaaaaaatgatgatttgatctaattcaatcacatttattccctccaacc 50460072  T
Q  213 aaatggttactacggctactactagttagttatatatatgcaatgcagggcaattaatgttacttcatcacaatattataatactctatccattagtttc 312  Q
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T  50460073 aaatggttactacggctactactagttagttatatatatgcaatgcagggcaattaatgttacttcatcacaatattataatactctatccattagtttc 50460172  T
Q  313 ttcagctagtggcatgttttgtgcacattataaatctcattgattttgacacattttagcaaagaggtccatagcataaaacaatattctgatcattcag 412  Q
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T  50460173 ttcagctagtggcatgttttgtgcacattataaatctcattgattttgacacattttagcaaagaggtccatagcataaaacaatattctgatcattcag 50460272  T
Q  413 aacttcattactttgataacatattttatcgtgcactttctaatggggatcaatttgaacagggtcactattgttgatattgagcttcgaattttcttca 512  Q
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T  50460273 aacttcattactttgataacatattttatcgtgcactttctaatggggatcaatttgaacagggtcactattgttgatattgagcttcgaattttcttca 50460372  T
Q  513 tagtcttggtcttttttaagatttcaacttcagacaatctaccagcaaattttgtatttggagattctctagttgatgtaggaaacaataattacattat 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50460373 tagtcttggtcttttttaagatttcaacttcagacaatctacctgcaaattttgtatttggagattctctagttgatgtaggaaacaataattacattat 50460472  T
Q  613 ttctctctcaaaggctaattttttgcctaatggtatcgattttggaagaccaacagggagattcaccaatggaagaaccatagttgacatcattggtaag 712  Q
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T  50460473 ttctctctcaaaggctaattttttgcctaatggtatcgattttggaagaccaacagggagattcaccaatggaagaaccatagttgacatcattggtaag 50460572  T
Q  713 attttattagtaataaaattatttcccttatttcattctacttgatagtcactatttttatataacgagtctta 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50460573 attttattagtaataaaattatttcccttatttcattctacttgatagtcactatttttatataacgagtctta 50460646  T

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