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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF4654-Insertion-4 (Length: 1030)
Name: NF4654-Insertion-4
Description: NF4654
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4654-Insertion-4 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 432 - 1020
Target Start/End: Original strand, 27589604 - 27590202
Alignment:
| Q |
432 |
atgaggaaattaattgcatatgcaatatataattgtttgtattgatgttatgttgatgtggaacactgacacgtattggacaacaaacacatctttgatc |
531 |
Q |
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| T |
27589604 |
atgaggaaattaattgcatatgcaatatataattgtttgtattgatgttatgttgatgtggaacactgacacgtattgaacaacaaacacatcttcgatc |
27589703 |
T |
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| Q |
532 |
aaattttttgctttgggggcaacaacatatggtaacaatgctctctatagtattggcatgttcccatttttgttattccacccacccttttttgttnnnn |
631 |
Q |
| |
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| T |
27589704 |
aaattttttgctttggcggcaacaacatagggtaacaatgctctctatagtattggcatgttcccatttttgttattccacccacccttttttgttaaaa |
27589803 |
T |
|
| Q |
632 |
nnntgacccttcccaaatatggaattgtatcgatacaaatacaatcctatcggaagtgtaacttttgattgatacaaagtccctcaatatattgaaacgt |
731 |
Q |
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| T |
27589804 |
aaatgacccttcccaaatatggaattgtatcaatacaaatacaatcctatcggaagtgtaactttcgattgatacaaagtccctcaatatattgaaacgt |
27589903 |
T |
|
| Q |
732 |
aactttcaatcgcatataacctatcgaaagatatgatatgatccgatcgatttttatttatatctcccgatcaac-tatttcagaggttgagcaatccaa |
830 |
Q |
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|
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| T |
27589904 |
aactttcaatcgcatataatctatcgaaagatatgatatgatccgatcgatttttatttatatctcctgatcaacttatttaagaggttgagcaatccaa |
27590003 |
T |
|
| Q |
831 |
gggacgcataaaacaattgtccttgttgatattgaactc-aaaacaaattaagcaattaatattttattggcctatatttatttataaaggaaattacat |
929 |
Q |
| |
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|
| T |
27590004 |
gggacgcataaaacaattgtccttgttgatattgaactcaaaaacaaatgaagcaattaatattttattggcctatatttatttataaatgaaattacat |
27590103 |
T |
|
| Q |
930 |
tttacactccc--ttttttggtagaaacatgctcattcttgttttga-tttctccct-cttctct-ccttc--ttttacttatcag-atttgatttctc |
1020 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27590104 |
tttacactcccttttttttgctagaaacatgctcattcttgttttgattttctccctccttctctcccttccttttaacttatcagaatttgatttctc |
27590202 |
T |
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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 372
Target Start/End: Original strand, 27589233 - 27589605
Alignment:
| Q |
7 |
actaaatagcgttgccttgttcaagtgaaaatgatgtgtgtattaaaggacttgtcccactctagaaaggaccacaactgaagtctaagcctgcaaacca |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27589233 |
actaaatagcgttgccttgttcaagtgaaaatgatgtgtgtattaaaggacttgtcccactctagaaaggaccacagctgaagtctaagcctgcaaacca |
27589332 |
T |
|
| Q |
107 |
ttagttttcaatctttgtggtccatatatctgtttcaaaggaagatttacccttatgctactatatgtttgttag-------aatggatgattttgtttt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27589333 |
ttagttttcaatctttgtggtccatatatctgtttcaaaggaagatttacccttatgctactatatgtttgttagaacttagaatggatgattttgtttt |
27589432 |
T |
|
| Q |
200 |
gagttacagttaagaggcagtgagattcttgttcaattaaatgctcaatttacaaagaagaactaccagacaaatacgtaagtcaatgcacaatagtctt |
299 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27589433 |
gagttacagttaagaggcagtgaaattcttgttcaattaaatgctcaatttacaaagaagaactaccagacaaatacgtaagtcaatgcacaatagtctt |
27589532 |
T |
|
| Q |
300 |
catgatatgatcatatttattacaaatagcctttatgccaatatttcatgctaaacatattttttacgaaaat |
372 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27589533 |
catgatatgatcatatttattacaaattgcctttatgcctatatttcatgctaaacatattttttacgaaaat |
27589605 |
T |
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