View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4657-Insertion-1 (Length: 1010)

Name: NF4657-Insertion-1
Description: NF4657
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4657-Insertion-1
NF4657-Insertion-1
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (6-345)||(35412566-35412905)
chr4 (669-973)||(35413228-35413548)
chr4 (440-592)||(35412999-35413151)
chr4 (443-592)||(1763590-1763738)
chr4 (443-592)||(7069575-7069723)
chr4 (443-592)||(28185304-28185452)
chr4 (443-592)||(51549710-51549858)
chr4 (443-592)||(28972718-28972866)
chr4 (443-592)||(48080783-48080931)
chr4 (443-576)||(13391360-13391492)
chr4 (443-592)||(34487698-34487846)
chr4 (443-592)||(36505248-36505396)
chr4 (443-592)||(55762006-55762154)
chr4 (462-592)||(6377335-6377464)
chr4 (443-592)||(7878314-7878462)
chr4 (447-592)||(13051284-13051428)
chr4 (441-592)||(32352243-32352393)
chr4 (443-592)||(11509367-11509516)
chr4 (474-592)||(54571444-54571561)
chr4 (443-592)||(18732828-18732976)
chr4 (443-592)||(49268960-49269108)
chr4 (460-591)||(47462166-47462296)
chr4 (474-592)||(31846178-31846295)
chr4 (443-592)||(42383915-42384063)
chr4 (464-552)||(14515583-14515671)
chr4 (481-586)||(23289745-23289848)
chr4 (477-591)||(24285948-24286062)
chr4 (441-535)||(1033722-1033815)
chr4 (505-564)||(52163667-52163726)
chr4 (220-262)||(13051639-13051682)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (441-592)||(44088843-44088993)
chr2 (443-592)||(9650783-9650931)
chr2 (443-592)||(3237227-3237375)
chr2 (443-592)||(4158905-4159053)
chr2 (443-592)||(25324909-25325057)
chr2 (443-592)||(40021991-40022139)
chr2 (443-592)||(4185457-4185605)
chr2 (443-592)||(3587435-3587583)
chr2 (443-592)||(26827171-26827319)
chr2 (443-592)||(33906902-33907050)
chr2 (441-590)||(45116565-45116713)
chr2 (443-592)||(12569181-12569329)
chr2 (465-591)||(44088139-44088264)
chr2 (516-592)||(17138291-17138367)
chr2 (447-590)||(38288853-38288994)
chr2 (441-590)||(38553435-38553583)
chr2 (443-547)||(11706339-11706442)
chr2 (461-591)||(32888111-32888238)
chr2 (443-592)||(42808218-42808366)
chr2 (441-592)||(38992191-38992337)
chr2 (474-591)||(12396541-12396657)
chr2 (518-590)||(45517066-45517138)
chr2 (447-505)||(45517836-45517894)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (443-592)||(34968020-34968169)
chr1 (443-592)||(4447486-4447634)
chr1 (443-592)||(10924010-10924158)
chr1 (443-592)||(5153865-5154013)
chr1 (443-592)||(8222904-8223052)
chr1 (443-592)||(26003324-26003472)
chr1 (443-592)||(26519622-26519770)
chr1 (443-592)||(31198528-31198676)
chr1 (443-592)||(35825622-35825770)
chr1 (443-592)||(38614098-38614246)
chr1 (441-592)||(20270815-20270965)
chr1 (443-592)||(13982279-13982427)
chr1 (443-592)||(50579039-50579187)
chr1 (441-591)||(42051215-42051364)
chr1 (443-592)||(29579854-29580002)
chr1 (443-592)||(36364726-36364874)
chr1 (443-592)||(44745449-44745597)
chr1 (443-592)||(36368855-36369003)
chr1 (441-591)||(37573617-37573766)
chr1 (452-590)||(33488781-33488916)
chr1 (447-585)||(1356999-1357136)
chr1 (468-589)||(6462292-6462413)
chr1 (447-592)||(45072209-45072349)
chr1 (443-592)||(7026059-7026197)
chr1 (463-592)||(17874231-17874358)
chr1 (478-592)||(48814345-48814458)
chr1 (474-552)||(24672449-24672526)
chr1 (477-589)||(44916058-44916170)
chr1 (443-590)||(21069818-21069956)
chr1 (481-566)||(17673164-17673248)
chr1 (544-588)||(24672381-24672425)
chr1 (450-537)||(26783315-26783402)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (443-592)||(25942661-25942809)
chr7 (443-592)||(29646853-29647001)
chr7 (443-592)||(46510336-46510484)
chr7 (441-592)||(10318664-10318814)
chr7 (446-592)||(8242339-8242484)
chr7 (454-592)||(15976431-15976568)
chr7 (443-592)||(13932442-13932590)
chr7 (443-592)||(32455672-32455820)
chr7 (443-592)||(10361315-10361463)
chr7 (447-592)||(989487-989634)
chr7 (443-592)||(45261564-45261715)
chr7 (476-591)||(34871261-34871376)
chr7 (474-592)||(34080247-34080364)
chr7 (480-592)||(19347643-19347754)
chr7 (474-591)||(297392-297508)
chr7 (474-592)||(11911015-11911135)
chr7 (468-592)||(46275439-46275560)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (443-592)||(6862277-6862425)
chr6 (443-592)||(10321132-10321280)
chr6 (443-592)||(21038524-21038673)
chr6 (443-592)||(2978804-2978952)
chr6 (443-592)||(15707486-15707634)
chr6 (450-592)||(34676840-34676981)
chr6 (441-590)||(3106621-3106769)
chr6 (465-591)||(34760593-34760718)
chr6 (465-591)||(11546181-11546306)
chr6 (452-592)||(32011423-32011562)
chr6 (469-572)||(6566531-6566634)
chr6 (441-592)||(32508362-32508510)
chr6 (474-566)||(6574831-6574923)
chr6 (523-592)||(2164234-2164303)
chr6 (523-592)||(2175867-2175936)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (443-592)||(18405961-18406109)
chr5 (443-592)||(10371026-10371174)
chr5 (443-592)||(28210543-28210691)
chr5 (443-592)||(35540376-35540524)
chr5 (447-592)||(23219574-23219718)
chr5 (463-592)||(18256267-18256395)
chr5 (443-592)||(34374848-34374996)
chr5 (489-590)||(7956315-7956416)
chr5 (452-588)||(7962832-7962967)
chr5 (441-592)||(7744813-7744962)
chr5 (441-592)||(2189899-2190040)
chr5 (486-571)||(35587053-35587138)
chr5 (441-553)||(6630941-6631052)
chr5 (441-537)||(23348109-23348205)
chr5 (460-547)||(21836571-21836657)
chr5 (447-592)||(4442412-4442556)
chr5 (474-592)||(10534098-10534216)
chr5 (517-576)||(27896905-27896964)
chr5 (528-591)||(39022408-39022471)
chr5 (503-592)||(25062805-25062893)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (443-592)||(31372676-31372824)
chr3 (443-592)||(55140274-55140422)
chr3 (443-592)||(9145026-9145174)
chr3 (443-592)||(18972017-18972165)
chr3 (443-592)||(28985849-28985997)
chr3 (443-592)||(28991353-28991501)
chr3 (443-592)||(29323015-29323163)
chr3 (443-592)||(33774797-33774945)
chr3 (443-592)||(45199800-45199948)
chr3 (443-592)||(46558667-46558815)
chr3 (443-592)||(50462923-50463071)
chr3 (443-592)||(13159028-13159176)
chr3 (443-592)||(24426179-24426327)
chr3 (443-592)||(25630684-25630832)
chr3 (462-592)||(29170199-29170328)
chr3 (443-592)||(40503015-40503163)
chr3 (443-592)||(44905957-44906105)
chr3 (446-592)||(26135277-26135422)
chr3 (441-591)||(24397142-24397287)
chr3 (452-592)||(42445919-42446059)
chr3 (447-590)||(53302753-53302895)
chr3 (447-590)||(53303920-53304062)
chr3 (482-592)||(45316816-45316925)
chr3 (447-592)||(16341291-16341435)
chr3 (447-592)||(55010468-55010612)
chr3 (452-563)||(45682619-45682731)
chr3 (465-590)||(41202848-41202972)
chr3 (485-592)||(38733759-38733869)
chr3 (441-516)||(37136937-37137012)
chr3 (443-497)||(45199991-45200045)
chr3 (544-592)||(37136878-37136926)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (443-592)||(58424-58572)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (443-592)||(27126840-27126988)
chr8 (476-592)||(26106244-26106359)
chr8 (441-592)||(14066955-14067105)
chr8 (443-590)||(15871039-15871185)
chr8 (441-592)||(31170077-31170227)
chr8 (443-592)||(2612288-2612436)
chr8 (443-592)||(26741488-26741636)
chr8 (441-588)||(1386805-1386951)
chr8 (447-590)||(41131032-41131174)
chr8 (443-592)||(7990006-7990154)
chr8 (443-592)||(18405013-18405161)
chr8 (443-592)||(35596118-35596266)
chr8 (443-592)||(39585107-39585255)
chr8 (447-592)||(10730152-10730296)
chr8 (441-591)||(38953062-38953209)
chr8 (474-592)||(6838015-6838132)
chr8 (474-592)||(41881590-41881705)
chr8 (474-592)||(44599103-44599220)
chr8 (474-591)||(41427656-41427772)
chr8 (441-592)||(39580048-39580198)
chr8 (446-590)||(37698271-37698414)
chr8 (441-591)||(30232489-30232639)
chr8 (441-550)||(25018825-25018933)
chr8 (474-592)||(13099012-13099128)
chr8 (443-527)||(26909718-26909801)
chr8 (464-582)||(14435984-14436095)
chr8 (520-590)||(34491147-34491217)
chr8 (453-583)||(17875597-17875724)
chr8 (474-547)||(38993123-38993195)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (441-576)||(22315-22449)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (443-592)||(3910-4058)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (443-592)||(147812-147960)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (443-592)||(49705-49853)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (457-590)||(33992-34124)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (443-592)||(24491-24631)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (523-592)||(18106-18175)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 345
Target Start/End: Original strand, 35412566 - 35412905
Alignment:
Q  6 cataaatcctgtcacatgatgatttcatgcgtcctttcccactaccatcatcacctctcagttgctttagctccctttctctcaactcttttatcccatt 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35412566 cataaatcctgtcccatgatgatttcatgcgtcctttcccactaccataatcacctctcagttgctttagctccctttctctcaactcttttatcccatt 35412665  T
Q  106 tggtgtcccacatggtagatacacctatcatcatggtgtagaccaaacttaatataaaacaattcctgtaaacattaagctctacaatgtccttaaggca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35412666 tggtgtcccacatggtagatacacctatcatcatggtgtagaccaaacttaatataaaacaattccggtaaacattaagctttacaatgtccttaaggca 35412765  T
Q  206 -ttgtnnnnnnntgtgtcggactaatgggccggctattagcctatattttgggtcgggatcggccgcaaaaagctattccaaaatggggtcgggtcggac 304  Q
     ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35412766 tttgttaaaaaatgtgtcggactaatgggccggctattagcctatattttgggtcggggtcggccgcaaaaagctatcccaaaacggggtcgggtcggac 35412865  T
Q  305 tgactcaatcgggcttcaaatcggcccaatatcaatatttc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35412866 tgactc-atcgggcttcaaatcggcccaatatcaatatttc 35412905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 669 - 973
Target Start/End: Original strand, 35413228 - 35413548
Alignment:
Q  669 caagacagaccaggttggcccatggcccacatgaatcggatcgggatttagaatatgtggcccaattacaaattgggccggttgatccatttatatagtc 768  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35413228 caagacagaccaggttggcccatggcccacacgaatcggatcgggatctagaatatgtggctcaattacaaattggaccggttgatccatttatataatc 35413327  T
Q  769 gagcctatatatca-gctagaccggactaggcagggccaacttatttgacacctctacttattagcaagaccatacgtt-aaaatgacattttgtaaac- 865  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  35413328 gagcctatatatcatgccagaccggaccgggcagggccaacttatttgacacctctacttattagcgagatcatacgttaaaaatgacattttgtaaact 35413427  T
Q  866 ------ttgagtgaccatacaacttcaaatgc-atatcacta-tttttatgtcttaacaaa-ggtctcgtgagcct---tctacataacctttaaaaaga 953  Q
          |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |  |||||||| |||||||||    
T  35413428 tgaatattgattgaccatacaacttcaaatgcaatatcactactttttatgtcttaacaaagggtatcgtgagcctttgttaacataacccttaaaaaga 35413527  T
Q  954 aaag-aaatgctaaccagttt 973  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  35413528 aaagaaaatgctaaccagttt 35413548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 440 - 592
Target Start/End: Original strand, 35412999 - 35413151
Alignment:
Q  440 gaaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattca 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35412999 gaaatggatgattttagctcaaagttctaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattca 35413098  T
Q  540 atgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35413099 atgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccatttaatcatattttagc 35413151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 1763738 - 1763590
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1763738 atggatgagtttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 1763640  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1763639 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 1763590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 7069575 - 7069723
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7069575 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 7069673  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7069674 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 7069723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 28185304 - 28185452
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28185304 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 28185402  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28185403 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 28185452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 51549710 - 51549858
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  51549710 atggatgaatttagcttatagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 51549808  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  51549809 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 51549858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 28972866 - 28972718
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28972866 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 28972768  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28972767 ttaatataaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 28972718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 48080783 - 48080931
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  48080783 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 48080881  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48080882 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 48080931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 576
Target Start/End: Original strand, 13391360 - 13391492
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13391360 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 13391458  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccat 576  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13391459 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccat 13391492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 34487698 - 34487846
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34487698 atggatgaatttagattacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 34487796  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||    
T  34487797 ttaatgtaaaaattatttatatttttgtgtccattcattcatattttagc 34487846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 36505396 - 36505248
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36505396 atggatgaatttagcttagagttttaaaattttaatgtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 36505298  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  36505297 ttaatgtaaaaattatttatatttttatctccatccaatcatattttagc 36505248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 55762154 - 55762006
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55762154 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatctgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 55762056  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  55762055 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtctatccaatcatattttagc 55762006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 462 - 592
Target Start/End: Original strand, 6377335 - 6377464
Alignment:
Q  462 agttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattattta 561  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6377335 agttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgaattaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatgtaaaaattattta 6377433  T
Q  562 cacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6377434 tatttttatgtccatccaatcatattttagc 6377464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 7878462 - 7878314
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||  |||| |||||||||    
T  7878462 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatctagagttatattattattcaatg 7878364  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  7878363 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatgttttagc 7878314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 13051428 - 13051284
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13051428 atgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaactaaaggaataatt-tagagtttaattattattcaatgttaa 13051330  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||    
T  13051329 tgtaaaaattatttacaattttatgttcatccaaacatattttagc 13051284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 32352393 - 32352243
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  32352393 aaatgaatgaatttagcttaaagttttaaaattttacagtttataaatcattaattttatttaattgaatgaatag-tctagagtttcattaatattcaa 32352295  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  32352294 tgttaatgtaaaagttatttacacttttaagtcaatctaatcatattttagc 32352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 11509367 - 11509516
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatatt-aaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaat 541  Q
    ||||| || ||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11509367 atggaagaatttagcttacagttttaaaatttttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaat 11509465  T
Q  542 gctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  11509466 gttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccattcatattttagc 11509516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 54571561 - 54571444
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54571561 ttaaagtttataaattattaatttgatttaatcgaatgaataa-tctagagtttcattaatattcaatgttaatgtaaaacttatttacacttttatgtc 54571463  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  54571462 catctaatcatattttagc 54571444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 18732828 - 18732976
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18732828 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatctagagtttagttattattcaatg 18732926  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     ||| |||||||||||||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  18732927 ttaacgtaaaaattatttatattttttagtccatccaatcatattttagc 18732976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 49269108 - 49268960
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| |   ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  49269108 atggatgaatttagcttaccattttaaatttttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 49269010  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49269009 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 49268960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 460 - 591
Target Start/End: Original strand, 47462166 - 47462296
Alignment:
Q  460 aaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatt 559  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  47462166 aaagttttaaaattttaaagtatataaactattaatttgatttaattgaatgaataa-tatagagtttcattaatattcaatgttaatgtaaaaattact 47462264  T
Q  560 tacacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  47462265 tacacttttatgttcatccaatcatattttag 47462296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Original strand, 31846178 - 31846295
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31846178 ttaaaatttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatgttaatgtaaaaattatttatatttttatgtc 31846276  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  31846277 catccaatcatattttagc 31846295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 42384063 - 42383915
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  42384063 atggatgaatttagcttataattttaaaattttaaaacttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattatacaatg 42383965  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     ||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  42383964 ttaatgcaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 42383915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 464 - 552
Target Start/End: Original strand, 14515583 - 14515671
Alignment:
Q  464 ttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaa 552  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14515583 ttttaaaattttaatgtttataaattattaaattgatacaattgaaggactaaatctagagtttaattaatattcaattttaatgtaaa 14515671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 586
Target Start/End: Original strand, 23289745 - 23289848
Alignment:
Q  481 ttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaa 580  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||    
T  23289745 ttataaattattaatttgattc--ttgaaggaataaatctactgtttaattaatattcaatatcaatgtaaacattatttacacttctaagtccatctaa 23289842  T
Q  581 tcatat 586  Q
    ||||||    
T  23289843 tcatat 23289848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 24286062 - 24285948
Alignment:
Q  477 aagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccat 576  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||  | | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24286062 aagtttataaagtattaatttgattcaattgaaattataaataaaaaatttaactaatatttaatgttaatgtaaaaattatttacacttctatgtcaat 24285963  T
Q  577 taaatcatattttag 591  Q
      |||||| ||||||    
T  24285962 ccaatcatgttttag 24285948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 1033815 - 1033722
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaata 535  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1033815 aaatgaatgaatttagctcaaagttttcaaattataaaatttataaattattagtttgattcaatagaatgaat-aatctagagtttaattaata 1033722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 52163726 - 52163667
Alignment:
Q  505 ttgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacac 564  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  52163726 ttgaagtaatatatcaagagtttaattaatatttaatgttaatgtaaaaattaattacac 52163667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13051682 - 13051639
Alignment:
Q  220 gtcggactaatgggccggc-tattagcctatattttgggtcggg 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13051682 gtcggactaatgggccggcctattaacctatattttgggtcggg 13051639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 4e-44; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Original strand, 44088843 - 44088993
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44088843 aaatgaatgaatttagtttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcattaatattcaa 44088941  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44088942 tgttaatgtaaaaattatttacacttttatgtccatctaatcatattttagc 44088993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 9650931 - 9650783
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9650931 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 9650833  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9650832 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 9650783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 3237375 - 3237227
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  3237375 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataatt-tagagtttaattattattcaatg 3237277  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3237276 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtctattcaatcatattttagc 3237227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 4158905 - 4159053
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4158905 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttatgaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 4159003  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4159004 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccattcattcatattttagc 4159053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 25325057 - 25324909
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25325057 atggatgaatttagcttacaattttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 25324959  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25324958 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 25324909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 40022139 - 40021991
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40022139 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 40022041  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     ||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40022040 ttaatgtataaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 40021991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 4185457 - 4185605
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  4185457 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttgattattattcaatg 4185555  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4185556 ttaatgtaacaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 4185605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 3587435 - 3587583
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3587435 atggatgaatttagcttacagttttataattttaaagtttataaattataaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 3587533  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3587534 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccattcatattttagc 3587583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 26827319 - 26827171
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26827319 atggatgaatttagcttacagtttaaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 26827221  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||| ||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  26827220 ttaatataaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 26827171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 33907050 - 33906902
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33907050 atggatgaatttagattacagttttaaaattttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 33906952  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33906951 ttaatataaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 33906902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 441 - 590
Target Start/End: Original strand, 45116565 - 45116713
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45116565 aaatgaatgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaat-aatctagagtttcattaatattcaa 45116663  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    |  |||||| |||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  45116664 tattaatgtcaaaattatttgcacttttatttccctccaatcatatttta 45116713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 12569329 - 12569181
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  12569329 atggatgaatttagcttacaattttaaaatttgaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaataataa-tctagagtttaattattatacaatg 12569231  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  12569230 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 12569181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 465 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 44088264 - 44088139
Alignment:
Q  465 tttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacac 564  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||     
T  44088264 tttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaggaataa-tctagagtttaactattattcaacgttaatgtaaaaattattgacat 44088166  T
Q  565 ttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    ||| |||| |||  |||||||||||||    
T  44088165 tttaatgttcatccaatcatattttag 44088139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 516 - 592
Target Start/End: Original strand, 17138291 - 17138367
Alignment:
Q  516 aatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17138291 aatctagagttttattaatattcaatgttaatgtaaaaattatttacacttttatgtccatccaatcatattttagc 17138367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 447 - 590
Target Start/End: Original strand, 38288853 - 38288994
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||| |||    
T  38288853 atgaatttagcttaaagttttaaaactttaaattttataa-ttattaatttgatttaattgaaggaataa-tatagagtttaactattattcaatgttaa 38288950  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  38288951 tgtaaaaattatttatatttttatgtcaatccaatcatatttta 38288994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 590
Target Start/End: Original strand, 38553435 - 38553583
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38553435 aaatgaatgaatttagctcaaagttttcaaattctaaaatttaaaaattattaatttgattcaatagaatgaataa-tctattgtttaattaatattcaa 38553533  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||||||    
T  38553534 tgtcaatgtaaaaattatttacaattctatgaccatccaattatatttta 38553583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 11706442 - 11706339
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11706442 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatctagagtttaattattattcaatg 11706344  T
Q  543 ctaat 547  Q
     ||||    
T  11706343 ttaat 11706339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 461 - 591
Target Start/End: Original strand, 32888111 - 32888238
Alignment:
Q  461 aagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattattt 560  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || ||   |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  32888111 aagttttaatattttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaaaaa---tagagtttcattaatattcattgttaatgtaaaaattactt 32888207  T
Q  561 acacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  32888208 acacttttatgttcatccaatcatattttag 32888238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 42808218 - 42808366
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaatt-attaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaat 541  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  42808218 atggatgaatttagcttacaattttaaaactttaaagtttataaatttattaatttgattta-ttgaaagaataa-tgtagagtttaattattattcaat 42808315  T
Q  542 gctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | ||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42808316 gttaatgtaaaaattatatatatttttatgtccatccaatcatattttagc 42808366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 38992337 - 38992191
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    | | ||  |||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  38992337 aaatgaatgaatttagcttaaagttttaaaatttcaaagtttataaattattaaa---aatgaac-gaatgaataa-tctagagtttcattaacattcaa 38992243  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38992242 tgttaaggtaaaaattatttacacttttatgtccatccaatcatattttagc 38992191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 474 - 591
Target Start/End: Original strand, 12396541 - 12396657
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||   |||| | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  12396541 ttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatggataa-tatagagtttcattgatattcaatgttaatgtaaaaattacttacatttttatgtt 12396639  T
Q  574 cattaaatcatattttag 591  Q
    |||  |||||||||||||    
T  12396640 catccaatcatattttag 12396657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 45517138 - 45517066
Alignment:
Q  518 tctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||    
T  45517138 tctagagtttaattaatattcaatgttaatataaaaattatttacacttctatgaccatccaatcatatttta 45517066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45517894 - 45517836
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaat 505  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45517894 atgaatttagctcaaagttttaagattataaagtttataaattattaatttgattcaat 45517836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 87; Significance: 4e-41; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 34968169 - 34968020
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctca-aagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaat 541  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34968169 atggatgaatttagcttacaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaat 34968071  T
Q  542 gctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34968070 gttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccattcaatcatattttagc 34968020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 4447486 - 4447634
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4447486 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 4447584  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4447585 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 4447634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 10924010 - 10924158
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10924010 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 10924108  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10924109 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 10924158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 5154013 - 5153865
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  5154013 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 5153915  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5153914 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 5153865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 8223052 - 8222904
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8223052 atggatgaatttaacttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 8222954  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8222953 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 8222904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 26003472 - 26003324
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  26003472 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaata 26003374  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26003373 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccattcattcatattttagc 26003324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 26519770 - 26519622
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  26519770 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 26519672  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26519671 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 26519622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 31198676 - 31198528
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31198676 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 31198578  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  31198577 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtacatccaatcatattttagc 31198528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 35825622 - 35825770
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  35825622 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 35825720  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35825721 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 35825770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 38614246 - 38614098
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  38614246 atggatgaatttagcttatagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tccagagtttaattattattcaatg 38614148  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38614147 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 38614098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 20270965 - 20270815
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  20270965 aaatgaatgaatttaacttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcgttaacattcaa 20270867  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20270866 tgttaatgtcaaaattatttgcacttttatgtccattcaatcatattttagc 20270815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 13982427 - 13982279
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  13982427 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataatt-tagagtttaattattattcaatg 13982329  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13982328 ttaatgtgaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 13982279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 50579187 - 50579039
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50579187 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttacaaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 50579089  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  50579088 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 50579039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 441 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 42051364 - 42051215
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  42051364 aaatgaatgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaataa-tatagagtttcattaatattcaa 42051266  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  42051265 tgttaatgtaaaaattacgtacacttttatgttcatccaatcatattttag 42051215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 29579854 - 29580002
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  29579854 atggattaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 29579952  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||    
T  29579953 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccgatcatattttagc 29580002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 36364726 - 36364874
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  36364726 atggatgaatttagcttacaattttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattatacaatg 36364824  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  36364825 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 36364874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 44745597 - 44745449
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44745597 atggatgaatttagcttgcagtttttaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 44745499  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  44745498 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 44745449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 36368855 - 36369003
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  36368855 atggatgaatttagcttacaattttaaaatttgaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattatacaatg 36368953  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  36368954 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 36369003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 591
Target Start/End: Original strand, 37573617 - 37573766
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  37573617 aaatgaatgaatttaccttaaagttttaaaattttaaagtttataaactattaatttgatttagttgaatgaataa-tatagagtttcattaatattcaa 37573715  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  37573716 tattaatgtaaaaattacttacacttttatgttcatccaatcatattttag 37573766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 452 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 33488916 - 33488781
Alignment:
Q  452 tttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaa 551  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  33488916 tttacctcaaagttttaaaattctaaagtttataaattataaatttgattcaatgaaaggaataa-tctagagtttagt--atattcaatgttaatgtaa 33488820  T
Q  552 aaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  33488819 aaattatttacacttctatgttcatccaatcatatttta 33488781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 447 - 585
Target Start/End: Original strand, 1356999 - 1357136
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||  |||||| || ||||||| | |||    
T  1356999 atgaatttagtttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaggaa-aaatctattgtttaactattattcaacgttaa 1357097  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcata 585  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  1357098 tgtaaaaattatttacatttttatatccatccaatcata 1357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 589
Target Start/End: Original strand, 6462292 - 6462413
Alignment:
Q  468 aaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttt 567  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||| | |||    
T  6462292 aaaatcttaaagtttataaagtattaatttgattcaattgaatgaataaatctagagtttaattaatatttaatgtttattttaaaattatttatatttt 6462391  T
Q  568 tatgtccattaaatcatatttt 589  Q
    |||||||||  ||| |||||||    
T  6462392 tatgtccatctaattatatttt 6462413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Original strand, 45072209 - 45072349
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45072209 atgaatttaacttaaagttttaaaattttaaagttta--aattattaatttgatttgattgaaggaataa--ctagagtttaattattattcaatgttaa 45072304  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45072305 t-taaaaaatatttacatttttatgtccatccaatcatattttagc 45072349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 7026059 - 7026197
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7026059 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatt----------gaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 7026147  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7026148 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 7026197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 463 - 592
Target Start/End: Original strand, 17874231 - 17874358
Alignment:
Q  463 gttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttac 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17874231 gttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttatttgaaggaat-aatctagagtttaa-tattattcaatgttaatgtagaaattatttac 17874328  T
Q  563 acttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | | ||| || |||  ||||||||||||||    
T  17874329 attattaagttcatccaatcatattttagc 17874358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 478 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 48814458 - 48814345
Alignment:
Q  478 agtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccatt 577  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  48814458 agtttgtaagttattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatgtaaaaattatttatatttttatatccatc 48814360  T
Q  578 aaatcatattttagc 592  Q
     ||||||||||||||    
T  48814359 caatcatattttagc 48814345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 24672526 - 24672449
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaa 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24672526 ttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagattttaattaatattcaatgttaatgtaaa 24672449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 44916170 - 44916058
Alignment:
Q  477 aagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccat 576  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||   | |||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  44916170 aagtttataaattactagtttgattcaattgaaagtataaatctagagtttaatcaacgatgaatgttaatttaaaaattatttacacttttatattcat 44916071  T
Q  577 taaatcatatttt 589  Q
    | ||| |||||||    
T  44916070 tcaattatatttt 44916058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 443 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 21069956 - 21069818
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||       
T  21069956 atggatgaatttagcttacaattttaaaatttgaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatctagagtttaattattataca--- 21069861  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
         |||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  21069860 -----gtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatatttta 21069818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 17673248 - 17673164
Alignment:
Q  481 ttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacactt 566  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  17673248 ttataaattattaatttgattcaattgaaggaatgaatattgagattaattaatattaaatgttaaagt-aaagttatttacactt 17673164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 24672425 - 24672381
Alignment:
Q  544 taatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24672425 taatgtaaaaattatttacacttttatgtccatacaatcatattt 24672381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 537
Target Start/End: Original strand, 26783315 - 26783402
Alignment:
Q  450 attttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatatt 537  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||| |||| | |||| ||  |||||||||||||||    
T  26783315 attttagctaaaacttttaaaatttaaaagtttataaattattaattttgtttaatggaaggagtaaaactttagtttaattaatatt 26783402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 25942661 - 25942809
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25942661 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 25942759  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25942760 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 25942809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 29646853 - 29647001
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29646853 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 29646951  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29646952 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 29647001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 46510484 - 46510336
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46510484 atggatgaatttagcttacggttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 46510386  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46510385 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccattcaatcatattttagc 46510336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Original strand, 10318664 - 10318814
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10318664 aaatgaatgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcattaatattcaa 10318762  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || |||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  10318763 tgttaatataaaaattatttacgctcttatgtccatctaatcatattttagc 10318814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 446 - 592
Target Start/End: Original strand, 8242339 - 8242484
Alignment:
Q  446 gatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgcta 545  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8242339 gatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgtta 8242437  T
Q  546 atgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8242438 atgtaaaaattatttatatttttatgtccattcattcatattttagc 8242484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 454 - 592
Target Start/End: Original strand, 15976431 - 15976568
Alignment:
Q  454 tagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||    
T  15976431 tagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcattaatattcaatgtcaatgtcaaa 15976529  T
Q  554 attatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15976530 attatttgcacttttatgtccattcaatcatattttagc 15976568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 13932590 - 13932442
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13932590 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 13932492  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     ||| |||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  13932491 ttaaggtaaaaattatttatatttttatatccatccaatcatattttagc 13932442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 32455672 - 32455820
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32455672 atggatgaatttagcttacagttttataattttaaagtttataaattattaatttgatttaatcgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 32455770  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32455771 ttaatgtaaaaattacttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 32455820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 10361315 - 10361463
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  10361315 atggatgaatttagcttacaattttaaaatttgaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattatacaatg 10361413  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  10361414 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 10361463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 989634 - 989487
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatatt---caatgc 543  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||   |||||     
T  989634 atgaatttacctcaaagttttaaaattctaaagtttataaattataaattcgattcaatcaaaggaataa-tctagagttttattaatattattcaatgt 989536  T
Q  544 taatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  989535 taatgtgaaaattatttacacttttatgtccatcaaatcaaattttagc 989487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 45261564 - 45261715
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatatt---ca 539  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||   ||    
T  45261564 atggatgaatttagcttacacttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagactttaattattattattca 45261662  T
Q  540 atgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45261663 atgttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccattcattcatattttagc 45261715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 476 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 34871376 - 34871261
Alignment:
Q  476 aaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtcca 575  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  34871376 aaagtttataatttattaatttgattcaattcaaggaatacatctaaagtttgattaatatacaatgttaatgtataaattatttacacttatatgtaca 34871277  T
Q  576 ttaaatcatattttag 591  Q
    | ||||||||||||||    
T  34871276 tcaaatcatattttag 34871261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Original strand, 34080247 - 34080364
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  34080247 ttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaagtaataa-tctaaagtttaactattattcaatgttaatataaaaattatttacatttttatgtt 34080345  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  34080346 catccaatcatattttagc 34080364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 480 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 19347754 - 19347643
Alignment:
Q  480 tttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaa 579  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |    
T  19347754 tttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatcca 19347656  T
Q  580 atcatattttagc 592  Q
    |||||||||||||    
T  19347655 atcatattttagc 19347643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 297508 - 297392
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  297508 ttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaataa-tatagagtttcattaatattcaatgttaatataaaaattacttacacttttatgtt 297410  T
Q  574 cattaaatcatattttag 591  Q
    |||  |||||||||||||    
T  297409 catccaatcatattttag 297392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Original strand, 11911015 - 11911135
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatatt---caatgctaatgtaaaaattatttacacttttat 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11911015 ttaaaatttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattatacaatgttaatgtaaaaattatttatatttttat 11911113  T
Q  571 gtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || |||  ||||||||||||||    
T  11911114 gttcatccaatcatattttagc 11911135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 468 - 592
Target Start/End: Original strand, 46275439 - 46275560
Alignment:
Q  468 aaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttt 567  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||    
T  46275439 aaaattttaaactttatcaattattaatttgattcaattgaagggat-aatcta-agtttaattaatattcaatgttaacataaaaattatttcca-ttt 46275535  T
Q  568 tatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||    
T  46275536 tacgtctatccaatcatattttagc 46275560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 6862277 - 6862425
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6862277 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 6862375  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6862376 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 6862425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 10321280 - 10321132
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10321280 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 10321182  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10321181 ttaatgtaaaagttatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 10321132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21038673 - 21038524
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa-t 541  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21038673 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatctagagtttaattattattcaatt 21038575  T
Q  542 gctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21038574 gttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 21038524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 2978804 - 2978952
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  2978804 atggatgaatttagcttacaattttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 2978902  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2978903 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 2978952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 15707486 - 15707634
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15707486 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 15707584  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||||    
T  15707585 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtacatccattcatattttagc 15707634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 34676981 - 34676840
Alignment:
Q  450 attttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgt 549  Q
    ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34676981 attttagcttacggttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatgt 34676883  T
Q  550 aaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  34676882 aaaaattatttatatttttatatccatccaatcatattttagc 34676840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 441 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 3106769 - 3106621
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| |||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||| |    
T  3106769 aaatgaatgaatttaacttaaggttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctacagtttcattaatattcca 3106671  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  3106670 agttaatgtaaaaattatttacacttttatgttcatctaatcatatttta 3106621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 465 - 591
Target Start/End: Original strand, 34760593 - 34760718
Alignment:
Q  465 tttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacac 564  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||     
T  34760593 tttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaggaataa-tctagagtttaattattattcaacgttaatgtaaaaattattgacat 34760691  T
Q  565 ttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    ||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  34760692 tttaatgtccatccaatcatactttag 34760718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 465 - 591
Target Start/End: Original strand, 11546181 - 11546306
Alignment:
Q  465 tttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacac 564  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||     
T  11546181 tttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaggaat-aatctagagtttaactattattcaacgttaatgtaaaaattattgacat 11546279  T
Q  565 ttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  11546280 tttaatgtctatccaatcatattttag 11546306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 452 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 32011562 - 32011423
Alignment:
Q  452 tttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaa 551  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  32011562 tttagcttaaagttttaaagtgttagaaattataaattattaatttgatttaattgaaggaataa-tctagagtttaactattattcaacgttaatgtaa 32011464  T
Q  552 aaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||    
T  32011463 aaattatttacatttttatgtccagccaatcatatattagc 32011423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 469 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 6566634 - 6566531
Alignment:
Q  469 aaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacactttt 568  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  6566634 aaattttaaagcttataaattactaatttgattcaatcgaatgaatagatctagagtttaatgaatattcaatgttaatgtaaaaaatatttacacttct 6566535  T
Q  569 atgt 572  Q
    ||||    
T  6566534 atgt 6566531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Original strand, 32508362 - 32508510
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  32508362 aaatgaatgaatttagcttaaggttttaaaattttaa-gtttataaattattattttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcattattattcaa 32508459  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || ||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  32508460 tgttaacgtaaaa-ttatttacatttttatgtctatctaatcatattttagc 32508510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 474 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 6574923 - 6574831
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacactt 566  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6574923 ttaaagcttataaattactaatttgattcaatcgaatgaatagatctagagtttaatgaatattcaatgttaatgtaaaaaatatttacactt 6574831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 2164303 - 2164234
Alignment:
Q  523 agtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  2164303 agttttattaatattcaatgttaatgtaaaaattatttacatttttatgaccatccaatcttattttagc 2164234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 2175936 - 2175867
Alignment:
Q  523 agtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  2175936 agttttattaatattcaatgttaatgtaaaaattatttacatttttatgaccatccaatcttattttagc 2175867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 18405961 - 18406109
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18405961 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 18406059  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18406060 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 18406109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 10371174 - 10371026
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  10371174 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 10371076  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10371075 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 10371026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 28210691 - 28210543
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28210691 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 28210593  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  28210592 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccattcatattttagc 28210543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 35540376 - 35540524
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35540376 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 35540474  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||| |||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35540475 ttaatataaaaactatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 35540524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 23219718 - 23219574
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| | |||    
T  23219718 atgaatttagcttaaagttttaaaattttaaattttataaattattaatttgatttaattgaagtaat-aatctagagtttaactattattcaacgttaa 23219620  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  23219619 tgtaaaaattgtttacatttttatgttcatccaatcatattttagc 23219574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 463 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 18256395 - 18256267
Alignment:
Q  463 gttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttac 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  18256395 gttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaactgaatgaataa-tctagaggttaattattattcaatgttaacgtaaaaactatttac 18256297  T
Q  563 acttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18256296 atttttatgtccattcaatgatattttagc 18256267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 34374848 - 34374996
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  34374848 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattataaatttgatttaattgaaagaat-aatctaaagtttaattattattcaatg 34374946  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  34374947 ttaatataaaaattatttatatgtttttgtccatccaatcatattttagc 34374996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 489 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 7956416 - 7956315
Alignment:
Q  489 tattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattt 588  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  7956416 tattaatttgattcaattgaagaaataaatctagagtttaattagtatttaatggtaatgtaaaaaatatttatacttctatatccattcaattatattt 7956317  T
Q  589 ta 590  Q
    ||    
T  7956316 ta 7956315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 452 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 7962967 - 7962832
Alignment:
Q  452 tttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaa 551  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  7962967 tttagctcaaagatttaaaattctaaagtttataaattattaattgaat-caattgaaggaataaatctcaagtttaattagtatttaatgttaatgtaa 7962869  T
Q  552 aaattatttacacttttatgtccattaaatcatattt 588  Q
    ||||||||| || || ||||| |||  ||||||||||    
T  7962868 aaattatttgcatttctatgttcatccaatcatattt 7962832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 7744962 - 7744813
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| ||||| | || | |||||||||||||||     
T  7744962 aaatgaatgaatttagctcaaagttttaaaat-ttaaaatttatatgttattaatttgatccaatcgaaggaataatt-tataatttaattaatattcat 7744865  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || |||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  7744864 tgttaatgtaaaaattatttttacttctatctccattcaatcatattttagc 7744813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 2190040 - 2189899
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||           ||    
T  2190040 aaatggataaattaagctcaaagttttaaaattttaaagttcataaattattaattcgattcaattgaaggaataaatctagagttt-----------aa 2189952  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttt-tatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2189951 tgctaatgtaaatattatttacattttatatgttcattcaatcatattttagc 2189899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 35587138 - 35587053
Alignment:
Q  486 aattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatg 571  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35587138 aattattaatttgattcaattgaaggaataagtctagaatttaataaatatccaatgttaatataaaaattatttacacttttatg 35587053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 553
Target Start/End: Original strand, 6630941 - 6631052
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  6630941 aaatgaatgaatttagcttaaagctttaaaattttaaagtttataaaatattaatttgatttaattgaatgaat-aatatagagtttcattaatattcaa 6631039  T
Q  541 tgctaatgtaaaa 553  Q
    || ||||||||||    
T  6631040 tgttaatgtaaaa 6631052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 23348205 - 23348109
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatatt 537  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  23348205 aaatggatgaacttagctcaaagttttataattttaaagtttaaatactattaatttgattcaattgaaggaataaatctaaagttcaattaatatt 23348109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 460 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 21836657 - 21836571
Alignment:
Q  460 aaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaat 547  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21836657 aaagttttaaaattttaaagttaataaattattaatttgatttaattgaatgaat-aatctagagtttcattaatattcaatgttaat 21836571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Original strand, 4442412 - 4442556
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaata-ttcaatgcta 545  Q
    |||| |||| || |||||||||||||  |||| |||||||||| | ||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||    
T  4442412 atgaatttaccttaaagttttaaaattctaaa-tttataaattttaaatttgattcattcaaaggaataa-tctagagttttattaataattcactgtta 4442509  T
Q  546 atgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  4442510 atgtaaaaattatttacacttctatgtccatccaatcatatcttagc 4442556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Original strand, 10534098 - 10534216
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||     
T  10534098 ttaaaatttctaaattagtagtttgtttcaattgaacgaataaatttagagtttaattaatattcaatgttatcataaaaattatttacacttgtatgtt 10534197  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
     ||  ||||||||||||||    
T  10534198 aatccaatcatattttagc 10534216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 517 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 27896964 - 27896905
Alignment:
Q  517 atctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccat 576  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27896964 atctagagttttataaatattcaatgttaatgtaaaaattatttacacttctatgtccat 27896905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 39022471 - 39022408
Alignment:
Q  528 aattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||    
T  39022471 aattaatattcaatgttaatgtaaaaattatttacagttctatgtctatccaatcatattttag 39022408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 503 - 592
Target Start/End: Original strand, 25062805 - 25062893
Alignment:
Q  503 aattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| || |||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  25062805 aattgaaggaataa-tctagagtttaattaatattcaaatttaacgtaaaaattatttgcatttttatgttcatccaatcacattttagc 25062893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 31372824 - 31372676
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31372824 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 31372726  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31372725 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 31372676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 55140274 - 55140422
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55140274 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 55140372  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55140373 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 55140422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 9145174 - 9145026
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9145174 atggatgaatttagcttagagttttaaaattttgaagtttataaattattaatttgatttaatcgaaagaataa-tctagagtttaattaatattcaatg 9145076  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9145075 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 9145026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 18972017 - 18972165
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18972017 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 18972115  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18972116 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtacatccaatcatattttagc 18972165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 28985997 - 28985849
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  28985997 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaatcattattcaatg 28985899  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28985898 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccattcattcatattttagc 28985849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 28991353 - 28991501
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  28991353 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 28991451  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28991452 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 28991501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 29323163 - 29323015
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  29323163 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 29323065  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29323064 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 29323015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 33774945 - 33774797
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33774945 atggatgaatttagcttacagatttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 33774847  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33774846 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 33774797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 45199948 - 45199800
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  45199948 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 45199850  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45199849 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 45199800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 46558815 - 46558667
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46558815 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttaatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 46558717  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||    
T  46558716 ttaatgtaaaaattatttatatttttatatccattcaaacatattttagc 46558667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 50463071 - 50462923
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  50463071 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 50462973  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50462972 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 50462923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 13159176 - 13159028
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  13159176 atggatgaatttagcttacggttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 13159078  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13159077 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 13159028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 24426179 - 24426327
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  24426179 atggatgaatttagcttatagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagttgaattattattcaatg 24426277  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24426278 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtctatccaatcatattttagc 24426327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 25630832 - 25630684
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25630832 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 25630734  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
      ||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25630733 tcaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccattcatattttagc 25630684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 462 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 29170328 - 29170199
Alignment:
Q  462 agttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattattta 561  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29170328 agttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatgtaaaaattattta 29170230  T
Q  562 cacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     | ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29170229 tatttttatgtccatccattcatattttagc 29170199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 40503163 - 40503015
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40503163 atggatgaatttagctaacaattttaaaattttaaagtttataaattagtaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 40503065  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40503064 ttattgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 40503015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 44906105 - 44905957
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44906105 atggatgaatctagcttacaattttaaaattttaaagtttataaattattattttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 44906007  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44906006 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 44905957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 446 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 26135422 - 26135277
Alignment:
Q  446 gatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgcta 545  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26135422 gatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgtta 26135324  T
Q  546 atgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||||||| | ||||  || |||  ||||||||||||||    
T  26135323 atgtaaaaattatttatattttttagttcatccaatcatattttagc 26135277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 441 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 24397287 - 24397142
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24397287 aaatggataaatttaactcaaagttttaaaatttcaaagtttataaattattaatttgattcaa----agaa-taaatctagattttaattaatattcaa 24397193  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  24397192 tatcaatgtaaaaattatttacacttctatatccatccaatcatattttag 24397142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 452 - 592
Target Start/End: Original strand, 42445919 - 42446059
Alignment:
Q  452 tttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaa 551  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  42445919 tttagcttaaagtattaaaattttaaagtttataaattatcaatttgatttaattgaaggaa-aaatctatagtttaactattattcaacgttaatgtaa 42446017  T
Q  552 aaattatttacacttttatgtccat-taaatcatattttagc 592  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42446018 aaattatttacatttttatgtccatccaaatcatattttagc 42446059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 447 - 590
Target Start/End: Original strand, 53302753 - 53302895
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| || ||||||| || ||||||| | |||    
T  53302753 atgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaggaa-aaatatatagtttaactattattcaacgttaa 53302851  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||||||||    
T  53302852 tgtaaaaattatttacattttgatctccatccaattatatttta 53302895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 447 - 590
Target Start/End: Original strand, 53303920 - 53304062
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| || ||||||| || ||||||| | |||    
T  53303920 atgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaggaa-aaatatatagtttaactattattcaacgttaa 53304018  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||||||||    
T  53304019 tgtaaaaattatttacattttgatctccatccaattatatttta 53304062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 482 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 45316925 - 45316816
Alignment:
Q  482 tataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaat 581  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||    
T  45316925 tataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaat 45316827  T
Q  582 catattttagc 592  Q
    |||||||||||    
T  45316826 catattttagc 45316816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 16341435 - 16341291
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  16341435 atgaatttagcttacacttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatgtagagtttaattattattcaatattaa 16341337  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    | |||||| |||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  16341336 tataaaaactatttatatttttaagtccatccaatcatattttagc 16341291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 55010612 - 55010468
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| || ||||||| ||||||| || |||| || | |||    
T  55010612 atgaatttagcataaagttttaaaattttaaagtttataaattactaatttgacttaattgaaggaa-aaatctatagtttaactattattgaacgttaa 55010514  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||    
T  55010513 tgtaaaaattatttacatttttatgttcaaccaatcatattttagc 55010468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 452 - 563
Target Start/End: Original strand, 45682619 - 45682731
Alignment:
Q  452 tttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgct-aatgta 550  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  45682619 tttagctcaaagttttaaaattctaaaggttataaattattaatttagttaaattgaagtaatatatctagaatttaattaatatttaatgttaaatgta 45682718  T
Q  551 aaaattatttaca 563  Q
    ||| |||||||||    
T  45682719 aaacttatttaca 45682731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 465 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 41202972 - 41202848
Alignment:
Q  465 tttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacac 564  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  41202972 tttaaaattttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaataa-tatagagtttcattgatattcaatgttaatgtaaaaattacttagac 41202874  T
Q  565 ttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||    
T  41202873 ttttatgttcatccaatcctatttta 41202848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 485 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 38733869 - 38733759
Alignment:
Q  485 aaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaat----attcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaa 580  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||    
T  38733869 aaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattatttattattcaatgttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaa 38733771  T
Q  581 tcatattttagc 592  Q
    | ||||||||||    
T  38733770 ttatattttagc 38733759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 37137012 - 37136937
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataa 516  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||    
T  37137012 aaatgaatgaatttaacttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattaaataaataa 37136937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 45200045 - 45199991
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaattt 497  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45200045 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaattt 45199991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 544 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 37136926 - 37136878
Alignment:
Q  544 taatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37136926 taatgtcaaaattatttgcacttttatgtccatccaatcatattttagc 37136878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 58424 - 58572
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  58424 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaattttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 58522  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  58523 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 58572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 27126840 - 27126988
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  27126840 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 27126938  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27126939 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 27126988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 476 - 592
Target Start/End: Original strand, 26106244 - 26106359
Alignment:
Q  476 aaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtcca 575  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26106244 aaagtttataaattattaatttgatttaattgaaggaataa-tctagagtttaattattattcaatgctaatgtaaaaattatttacatttttatgtcca 26106342  T
Q  576 ttaaatcatattttagc 592  Q
    |  ||||||||||||||    
T  26106343 tccaatcatattttagc 26106359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Original strand, 14066955 - 14067105
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  14066955 aaatgaatgaatttagctcaagcttttaaaattctaaagtttatatattattaatttgattcaattgaaggaataa-tctagagttgaattaatatttaa 14067053  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  14067054 tgttaatgtaaaaattatttacacttctacgtccatccaatcatattttagc 14067105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 443 - 590
Target Start/End: Original strand, 15871039 - 15871185
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15871039 atggatgaatttagcttacagttttaaaatttttaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 15871137  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15871138 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatatttta 15871185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 31170227 - 31170077
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  31170227 aaatgaatgaatttagctcaaaattttaaaattctaaattttataaattattaatttgattcaatagaaggaataatt-tagagtttaattaatattcat 31170129  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  31170128 tgttaatgaaaaaattatttacacttctttgtccatcaaatcatattttagc 31170077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 2612436 - 2612288
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2612436 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttgtaaatttttaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 2612338  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2612337 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 2612288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 26741488 - 26741636
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  26741488 atggatgaatttagcttacaattttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattatttaatg 26741586  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26741587 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 26741636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 1386805 - 1386951
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  1386805 aaatgaatgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaataa-tatagagtttcattaatattcaa 1386903  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattt 588  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  1386904 tgttaatgtaaaaattacttacacttttatgttcatccaatcatattt 1386951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 447 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 41131174 - 41131032
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||    
T  41131174 atgaatttagcttaaagttataaaattttaaattttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcagtaatattcgatgttaa 41131076  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41131075 tgtaaaaattatttacacttttatgtccatctaatcatatttta 41131032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 7990154 - 7990006
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7990154 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaattttttaaatttttaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 7990056  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7990055 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 7990006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 18405013 - 18405161
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  18405013 atggatgaatttagcttacaattttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattatacaatg 18405111  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18405112 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 18405161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 35596266 - 35596118
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  35596266 atggatgaatttagcttacaattttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattatacaatg 35596168  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  35596167 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgttcatccaatcatattttagc 35596118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 39585107 - 39585255
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  39585107 atggatgaatttaacttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaattcgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaata 39585205  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39585206 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 39585255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 447 - 592
Target Start/End: Original strand, 10730152 - 10730296
Alignment:
Q  447 atgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaa 546  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  10730152 atgaatttagcttacagttttaaaattttaaactttataaatttttaatttgatttaattgaaagaataa-tctggagtttaattattattcaatgttaa 10730250  T
Q  547 tgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10730251 tgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 10730296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 441 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 38953209 - 38953062
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  |||||   |||||||| ||||||||||||    
T  38953209 aaatgaatgaatttagcttaaagttttaaaattttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaataa---tagagttttattaatattcaa 38953113  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
     |  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  38953112 cgtgaatgtaaaaattacttacacttttatgtttatccaatcatattttag 38953062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Original strand, 6838015 - 6838132
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6838015 ttaaaatttaaaaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatgtaaaaattatttatatttttatgtc 6838113  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  6838114 catccaatcatattttagc 6838132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 41881705 - 41881590
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  41881705 ttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcattaatattcaatgttaatgtcaaaattatttgcac--ttatgtc 41881609  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  41881608 catccaatcatattttagc 41881590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 44599220 - 44599103
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||    
T  44599220 ttaaaatttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaatataaaaattatttatatttttaagtc 44599122  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  44599121 catccaatcatattttagc 44599103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 41427772 - 41427656
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  41427772 ttaaagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaataa-tatagagtttcattaatattcaatgttaatgtaaaaattacttacacttttatgtt 41427674  T
Q  574 cattaaatcatattttag 591  Q
    |||  |||| ||||||||    
T  41427673 catccaatcttattttag 41427656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 441 - 592
Target Start/End: Original strand, 39580048 - 39580198
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||| |    
T  39580048 aaatgaatgaatttagctcaaaattttaaaattcggaagtttataaattactattttgattgaattgaaggaa-aaatataaagtttaattaatattcga 39580146  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  39580147 tgttaatataaacattatttacacttatatgtccatccaattatattttagc 39580198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 446 - 590
Target Start/End: Original strand, 37698271 - 37698414
Alignment:
Q  446 gatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgcta 545  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||  |||||||||| ||| ||||| ||    
T  37698271 gatgaatttagcttacaattttaaaatttgaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatctcaagtttaattattatacaatgtta 37698369  T
Q  546 atgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  |||  ||||||||||||    
T  37698370 atgtaaaaattatttatatttttatgctcatccaatcatatttta 37698414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 441 - 591
Target Start/End: Original strand, 30232489 - 30232639
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaa-agtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattca 539  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||| || ||||||||    
T  30232489 aaatgaatgaattttgcttaaagttttaaacaatttacagtttataaactattaatttgatttaattgaatgaataa-tatagagtttcatcaatattca 30232587  T
Q  540 atgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttag 591  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  30232588 atgttaatgttaaaattacttacacttttatgttcatccaatcatattttag 30232639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 441 - 550
Target Start/End: Original strand, 25018825 - 25018933
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25018825 aaatgaatgaatttaccacaaagttttaaaattttaaagtttatagattatgaatttgattcagtcgaaggaat-aatctagactttaattaatattcaa 25018923  T
Q  541 tgctaatgta 550  Q
    || |||||||    
T  25018924 tgttaatgta 25018933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 592
Target Start/End: Original strand, 13099012 - 13099128
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||     
T  13099012 ttaaagtttataaattattaatttgatttagttgaaggaat-aatctagagtttaattattattcaacgttgatgt-aaaattatttacatttttacgtt 13099109  T
Q  574 cattaaatcatattttagc 592  Q
    |||  ||||||||| ||||    
T  13099110 catccaatcatattatagc 13099128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 26909801 - 26909718
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagttt 527  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  26909801 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaat-aatctagagttt 26909718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 14436095 - 14435984
Alignment:
Q  464 ttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttaca 563  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | | |||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||    
T  14436095 ttttaaaatcttaaa-tttataaagtattaatttgactaaattgaatgaatacatctaaagtttaagtaatatt------taatgtaaaaattatttaca 14436003  T
Q  564 cttttatgtccattaaatc 582  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  14436002 cttttatgttcattaaatc 14435984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 520 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 34491217 - 34491147
Alignment:
Q  520 tagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  34491217 tagagattcattaatattcaatgttcatgtaaaaattacttacacttttatgttcatcaaatcatatttta 34491147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 17875724 - 17875597
Alignment:
Q  453 ttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaa 552  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | |    
T  17875724 ttagctaaaacttttaaaattttaaagtttataaattactaattcagttca---gagttaataaatttagagtttaattaatattcaatgttattggata 17875628  T
Q  553 aattatttacacttttatgtccattaaatca 583  Q
    || |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17875627 aaatatttacactttcatgttcatcaaatca 17875597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 474 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 38993195 - 38993123
Alignment:
Q  474 ttaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaat 547  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38993195 ttaaaatttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatgttaat 38993123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 441 - 576
Target Start/End: Original strand, 22315 - 22449
Alignment:
Q  441 aaatggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaa 540  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22315 aaatgaatgaatttaccttaaagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaatgaataa-tctagagtttcattaatattcaa 22413  T
Q  541 tgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccat 576  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22414 tgttaatgtaaaaattacttacacttttatgtccat 22449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 3910 - 4058
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  3910 atggatgaatttagcttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagattttaattattattcaatg 4008  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4009 ttaatataaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 4058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 147812 - 147960
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  147812 atggatgaatttagcttacggttttaaaattttaaagtttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tcttgagtttaattattattcaatg 147910  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  147911 ttaatgtaaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 147960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 49705 - 49853
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  49705 atggatgaatttagtttacagttttaagattttaaaatttataaattattaatttgatttaattgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 49803  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49804 ttaatataaaaattatttatatttttatgtccatccaatcatattttagc 49853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 457 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 34124 - 33992
Alignment:
Q  457 ctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaatt 556  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34124 ctcagagttttaaaattctaaagtttataaattataaattcgattgaattgaaggaataatt-tagagtttaattaatattcaatattaatgtaaaaatt 34026  T
Q  557 atttacacttttatgtccattaaatcatatttta 590  Q
    |||||||||| ||| | |||  ||||||||||||    
T  34025 atttacacttctatattcatccaatcatatttta 33992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 592
Target Start/End: Original strand, 24491 - 24631
Alignment:
Q  443 atggatgattttagctcaaagttttaaaatattaaagtttataaattattaatttcattcaattgaagaaataaatctagagtttaattaatattcaatg 542  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24491 atggatgaatttaacttacagttttaaaattttaaagtttataaattattaattt--------tgaaagaataa-tctagagtttaattattattcaatg 24581  T
Q  543 ctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
     |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24582 ttaatgtaaaatttatttatatttttatgtccattcactcatattttagc 24631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 592
Target Start/End: Original strand, 18106 - 18175
Alignment:
Q  523 agtttaattaatattcaatgctaatgtaaaaattatttacacttttatgtccattaaatcatattttagc 592  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  18106 agttttattaatattcaatgttaatgtaaaaattatttacatttttatgaccatccaatcttattttagc 18175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University