View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4659-Insertion-2 (Length: 1005)

Name: NF4659-Insertion-2
Description: NF4659
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4659-Insertion-2
NF4659-Insertion-2
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (280-982)||(43362878-43363601)
chr5 (8-279)||(38191983-38192256)
chr5 (8-279)||(38219208-38219481)
chr5 (8-279)||(35387474-35387745)
chr5 (8-279)||(24135659-24135931)
chr5 (8-280)||(15464342-15464615)
chr5 (8-262)||(36932364-36932619)
chr5 (8-246)||(9353346-9353583)
chr5 (8-279)||(1457165-1457445)
chr5 (8-280)||(14520038-14520313)
chr5 (8-220)||(15044551-15044768)
chr5 (8-265)||(30631224-30631488)
chr5 (8-280)||(27449614-27449896)
chr5 (8-279)||(27444771-27445052)
chr5 (8-279)||(43592080-43592361)
chr5 (14-258)||(17003980-17004226)
chr5 (8-285)||(28832065-28832342)
chr5 (8-279)||(19588557-19588829)
chr5 (8-280)||(43598524-43598806)
chr5 (8-280)||(43604016-43604298)
chr5 (8-280)||(43609508-43609790)
chr5 (8-129)||(31180177-31180296)
chr5 (8-192)||(12084189-12084376)
chr5 (8-258)||(3880133-3880382)
chr5 (8-263)||(11916986-11917246)
chr5 (8-282)||(42127424-42127698)
chr5 (10-279)||(31300612-31300882)
chr5 (8-106)||(10281737-10281834)
chr5 (8-235)||(24553521-24553748)
chr5 (27-90)||(31401871-31401934)
chr5 (8-90)||(37556625-37556706)
chr5 (8-90)||(37561447-37561528)
chr5 (27-90)||(2785376-2785439)
chr5 (27-90)||(28807593-28807656)
chr5 (27-90)||(31397014-31397077)
chr5 (27-90)||(33768180-33768243)
chr5 (27-90)||(33791317-33791380)
chr5 (175-258)||(11182017-11182100)
chr5 (226-280)||(31180078-31180133)
chr5 (210-280)||(42126625-42126694)
chr5 (8-53)||(2630269-2630314)
chr5 (26-86)||(4410240-4410301)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (8-289)||(21639610-21639891)
chr7 (10-280)||(21645817-21646087)
chr7 (8-280)||(1533458-1533731)
chr7 (8-280)||(18413452-18413722)
chr7 (8-280)||(18408575-18408846)
chr7 (8-279)||(20357562-20357837)
chr7 (8-279)||(2057765-2058048)
chr7 (8-258)||(2479170-2479419)
chr7 (8-279)||(9190022-9190294)
chr7 (10-258)||(47263511-47263757)
chr7 (8-258)||(29159633-29159886)
chr7 (8-258)||(44848698-44848951)
chr7 (8-280)||(49091471-49091744)
chr7 (8-280)||(9185179-9185450)
chr7 (8-280)||(2580198-2580473)
chr7 (8-279)||(12396710-12396993)
chr7 (8-245)||(20283934-20284172)
chr7 (8-281)||(4866526-4866812)
chr7 (8-129)||(24024329-24024451)
chr7 (8-247)||(31109586-31109830)
chr7 (8-247)||(12406169-12406413)
chr7 (8-246)||(2647710-2647950)
chr7 (8-245)||(23403027-23403265)
chr7 (8-279)||(46516324-46516597)
chr7 (8-258)||(33332464-33332716)
chr7 (8-90)||(19992314-19992395)
chr7 (8-258)||(4796681-4796936)
chr7 (8-279)||(35960623-35960899)
chr7 (8-246)||(28617239-28617481)
chr7 (8-258)||(55770-56030)
chr7 (8-89)||(21983285-21983367)
chr7 (72-245)||(9235634-9235809)
chr7 (27-90)||(16880074-16880137)
chr7 (27-90)||(16884930-16884993)
chr7 (27-90)||(24261344-24261407)
chr7 (27-90)||(24266223-24266286)
chr7 (27-90)||(21812259-21812322)
chr7 (8-263)||(21988732-21988989)
chr7 (173-280)||(3047062-3047167)
chr7 (8-106)||(5817284-5817380)
chr7 (177-263)||(21983108-21983194)
chr7 (26-86)||(7351652-7351713)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (8-280)||(17966-18239)
scaffold0188 (8-279)||(24059-24331)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (8-281)||(26287711-26287984)
chr8 (8-281)||(26312962-26313235)
chr8 (8-279)||(1261968-1262238)
chr8 (8-280)||(31071243-31071517)
chr8 (8-280)||(26300957-26301241)
chr8 (8-279)||(36979184-36979460)
chr8 (8-279)||(4760089-4760366)
chr8 (8-287)||(30655440-30655729)
chr8 (8-268)||(10689157-10689422)
chr8 (8-280)||(33037821-33038097)
chr8 (8-282)||(18870576-18870852)
chr8 (8-280)||(18853182-18853458)
chr8 (8-279)||(6311100-6311379)
chr8 (8-280)||(4455837-4456111)
chr8 (8-258)||(7412168-7412424)
chr8 (8-257)||(26403244-26403496)
chr8 (8-280)||(19175768-19176045)
chr8 (8-279)||(7289929-7290210)
chr8 (8-258)||(5702497-5702749)
chr8 (8-279)||(19752408-19752681)
chr8 (26-258)||(9765851-9766086)
chr8 (8-258)||(6127049-6127304)
chr8 (8-198)||(4696610-4696802)
chr8 (27-243)||(39784843-39785067)
chr8 (8-108)||(25328281-25328379)
chr8 (27-90)||(10684285-10684348)
chr8 (8-258)||(23799591-23799843)
chr8 (27-90)||(35745392-35745455)
chr8 (225-279)||(28307368-28307421)
chr8 (207-280)||(6813488-6813559)
chr8 (227-279)||(10015389-10015443)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (8-282)||(25398302-25398578)
chr2 (8-280)||(25403442-25403716)
chr2 (8-279)||(3491563-3491833)
chr2 (8-283)||(9296415-9296695)
chr2 (8-280)||(14291294-14291571)
chr2 (8-279)||(11098941-11099217)
chr2 (8-280)||(40738650-40738925)
chr2 (8-258)||(28259191-28259443)
chr2 (9-280)||(42039684-42039957)
chr2 (10-280)||(23078486-23078760)
chr2 (8-280)||(10445458-10445733)
chr2 (8-279)||(21629762-21630026)
chr2 (8-258)||(8039890-8040143)
chr2 (11-263)||(36757779-36758032)
chr2 (8-279)||(17865014-17865286)
chr2 (8-279)||(20522031-20522303)
chr2 (8-280)||(34388668-34388941)
chr2 (8-245)||(31055887-31056127)
chr2 (8-257)||(34682348-34682600)
chr2 (8-282)||(13569134-13569411)
chr2 (8-245)||(33528635-33528873)
chr2 (8-282)||(44312627-44312913)
chr2 (8-279)||(16940223-16940496)
chr2 (8-279)||(17010888-17011161)
chr2 (8-243)||(39811991-39812231)
chr2 (8-239)||(32246630-32246870)
chr2 (8-245)||(10707266-10707505)
chr2 (10-281)||(8390166-8390443)
chr2 (8-245)||(33117981-33118219)
chr2 (8-198)||(39482821-39483014)
chr2 (27-90)||(19344422-19344485)
chr2 (27-90)||(19349280-19349343)
chr2 (15-106)||(14699028-14699117)
chr2 (8-60)||(25407653-25407705)
chr2 (8-162)||(2869707-2869862)
chr2 (8-69)||(27149308-27149369)
chr2 (26-105)||(1345573-1345652)
chr2 (178-239)||(14699184-14699244)
chr2 (176-257)||(35397346-35397425)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (8-280)||(24202783-24203055)
chr1 (8-280)||(19358857-19359133)
chr1 (8-280)||(19361446-19361723)
chr1 (8-280)||(19380086-19380363)
chr1 (8-279)||(13604637-13604909)
chr1 (8-246)||(24787379-24787624)
chr1 (8-258)||(26644911-26645163)
chr1 (8-279)||(3281520-3281791)
chr1 (8-264)||(21536583-21536841)
chr1 (8-280)||(16124530-16124804)
chr1 (8-279)||(29651620-29651894)
chr1 (8-245)||(47703950-47704190)
chr1 (8-258)||(37069599-37069853)
chr1 (8-279)||(775483-775755)
chr1 (8-258)||(27104386-27104635)
chr1 (8-283)||(13598202-13598481)
chr1 (8-279)||(32889249-32889522)
chr1 (8-258)||(47098838-47099089)
chr1 (8-258)||(19072757-19073011)
chr1 (8-258)||(19120647-19120901)
chr1 (8-112)||(41398216-41398318)
chr1 (8-90)||(25445092-25445173)
chr1 (8-112)||(41390561-41390663)
chr1 (27-90)||(39445501-39445564)
chr1 (27-90)||(44023894-44023957)
chr1 (8-135)||(9476217-9476344)
chr1 (8-258)||(47102855-47103106)
chr1 (27-90)||(1055032-1055095)
chr1 (27-90)||(43988485-43988548)
chr1 (145-280)||(40816883-40817021)
chr1 (177-257)||(17345703-17345782)
chr1 (176-242)||(50521286-50521352)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (8-279)||(5674784-5675057)
chr6 (8-280)||(22708828-22709101)
chr6 (8-258)||(5757492-5757742)
chr6 (9-258)||(21355869-21356118)
chr6 (8-279)||(31936398-31936670)
chr6 (8-247)||(11856809-11857056)
chr6 (8-241)||(10077179-10077413)
chr6 (8-282)||(22010700-22010986)
chr6 (8-247)||(14742439-14742683)
chr6 (8-247)||(14737579-14737824)
chr6 (174-282)||(26258181-26258289)
chr6 (8-198)||(28184393-28184587)
chr6 (11-245)||(31979358-31979593)
chr6 (8-280)||(18232654-18232928)
chr6 (144-279)||(30125947-30126084)
chr6 (8-280)||(5017483-5017760)
chr6 (8-279)||(31086487-31086749)
chr6 (8-258)||(22963531-22963782)
chr6 (8-258)||(23824611-23824862)
chr6 (8-258)||(4629792-4630037)
chr6 (8-90)||(28155572-28155653)
chr6 (27-90)||(6005418-6005481)
chr6 (27-90)||(6438502-6438565)
chr6 (27-90)||(33330466-33330529)
chr6 (8-258)||(21801358-21801614)
chr6 (27-90)||(16838745-16838808)
chr6 (27-90)||(33335963-33336026)
chr6 (142-285)||(5572744-5572888)
chr6 (8-106)||(5572255-5572351)
chr6 (176-245)||(27165547-27165616)
chr6 (55-90)||(5343482-5343517)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (8-279)||(28468543-28468813)
chr4 (8-280)||(24741747-24742023)
chr4 (8-281)||(31985648-31985921)
chr4 (8-279)||(29760449-29760724)
chr4 (11-246)||(5396688-5396927)
chr4 (8-247)||(9224410-9224654)
chr4 (8-279)||(51520258-51520539)
chr4 (8-258)||(3796533-3796788)
chr4 (8-247)||(9229197-9229441)
chr4 (8-279)||(10047190-10047462)
chr4 (8-279)||(25862036-25862308)
chr4 (8-279)||(56146714-56146995)
chr4 (8-129)||(3813986-3814106)
chr4 (8-258)||(24333641-24333892)
chr4 (8-280)||(38152453-38152728)
chr4 (8-279)||(8689499-8689765)
chr4 (8-263)||(5147503-5147760)
chr4 (8-280)||(16630694-16630969)
chr4 (8-247)||(45347820-45348065)
chr4 (8-247)||(45357299-45357544)
chr4 (8-226)||(3777413-3777632)
chr4 (8-245)||(5269205-5269446)
chr4 (8-245)||(5143104-5143342)
chr4 (141-280)||(16624156-16624298)
chr4 (8-258)||(39245824-39246077)
chr4 (8-258)||(5732486-5732747)
chr4 (8-258)||(54867013-54867266)
chr4 (27-90)||(18855728-18855791)
chr4 (178-279)||(5112052-5112151)
chr4 (8-106)||(36315243-36315339)
chr4 (8-106)||(36329452-36329548)
chr4 (8-106)||(16623307-16623403)
chr4 (8-282)||(42599586-42599866)
chr4 (8-85)||(6743429-6743507)
chr4 (207-279)||(34496038-34496108)
chr4 (172-245)||(36315390-36315464)
chr4 (172-245)||(36329599-36329673)
chr4 (8-69)||(1983314-1983375)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (8-279)||(1305761-1306031)
chr3 (8-279)||(8477171-8477445)
chr3 (8-279)||(32143133-32143404)
chr3 (8-280)||(2671600-2671877)
chr3 (66-277)||(1309668-1309878)
chr3 (8-262)||(27986450-27986704)
chr3 (8-279)||(7167051-7167327)
chr3 (8-280)||(33386670-33386943)
chr3 (8-279)||(8739077-8739354)
chr3 (8-279)||(9091315-9091592)
chr3 (8-262)||(27452786-27453041)
chr3 (8-279)||(30709794-30710068)
chr3 (8-161)||(26928605-26928757)
chr3 (8-242)||(8370490-8370726)
chr3 (8-283)||(28503879-28504149)
chr3 (8-280)||(40372809-40373086)
chr3 (8-246)||(27974956-27975192)
chr3 (8-245)||(40592786-40593025)
chr3 (8-279)||(39039996-39040269)
chr3 (8-247)||(22173198-22173442)
chr3 (8-258)||(16264180-16264433)
chr3 (8-258)||(3716006-3716259)
chr3 (8-263)||(36028931-36029176)
chr3 (8-284)||(35925287-35925563)
chr3 (8-285)||(6794717-6794994)
chr3 (8-245)||(48438059-48438297)
chr3 (8-258)||(18656256-18656517)
chr3 (8-258)||(26298813-26299071)
chr3 (8-245)||(40844497-40844734)
chr3 (142-279)||(27026754-27026894)
chr3 (8-245)||(21711071-21711306)
chr3 (8-258)||(1417494-1417745)
chr3 (8-198)||(3328360-3328552)
chr3 (8-162)||(18552887-18553041)
chr3 (142-279)||(27038100-27038239)
chr3 (27-90)||(2672952-2673015)
chr3 (27-90)||(2677108-2677171)
chr3 (27-90)||(8512218-8512281)
chr3 (27-90)||(8517098-8517161)
chr3 (27-90)||(32475486-32475549)
chr3 (27-90)||(32480344-32480407)
chr3 (8-242)||(24695168-24695402)
chr3 (9-162)||(25795709-25795863)
chr3 (8-106)||(1736309-1736405)
chr3 (8-135)||(37466247-37466374)
chr3 (175-258)||(47649571-47649655)
chr3 (142-279)||(47924010-47924146)
chr3 (176-258)||(1417097-1417179)
chr3 (27-90)||(24968108-24968171)
chr3 (8-106)||(47923910-47924006)
chr3 (42-90)||(10207935-10207983)
chr3 (144-245)||(8126546-8126648)
chr3 (26-86)||(38210568-38210629)
chr3 (8-69)||(3323694-3323755)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (8-243)||(8433-8670)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (8-258)||(43975-44225)
scaffold0087 (8-246)||(36846-37085)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (8-279)||(133294-133566)
scaffold0006 (8-245)||(2337-2575)
scaffold0006 (8-283)||(5487-5766)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (8-258)||(45087-45336)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (58-279)||(300-527)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (8-279)||(85495-85766)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (8-247)||(35065-35309)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (8-129)||(9645-9764)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (8-258)||(10558-10812)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (154-284)||(1212-1344)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (27-90)||(364-427)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (27-90)||(14330-14393)
scaffold0197 (30-90)||(19189-19249)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (27-90)||(181985-182048)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (27-90)||(2272-2335)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (8-245)||(17111-17346)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (27-90)||(148977-149040)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (201-279)||(29699-29777)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (201-279)||(43067-43145)
scaffold0078 (176-279)||(23340-23443)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 280 - 982
Target Start/End: Original strand, 43362878 - 43363601
Alignment:
Q  280 aaaagtaatgctaagagctttccacatctgtacatatttgattatttgataccgtttctgaattgatagaagaattcgttaagcaattaagtcaatatg- 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43362878 aaaagtaatgctaagagcttcccacatctgtacatatttgattatttgataccgtttctgaattgatagaagaattcgttaagcaattaagtcaatatgt 43362977  T
Q  379 -----------ttaaatagattatcaaagaatacaacaaaaagtgttataactcattagtgatcgaagaaatataatttaccatgactttgaacgttatt 467  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43362978 ggttagttatgttaaatagattatcaaagaatacaacaaaaagtgttataactcattagtcatcgacgaaatataatttacaatgactttgaacgttatt 43363077  T
Q  468 aactacaatttgcaagtgtgtatttgtactcaagattgtggtaatgaatatcatctgaatttaaagtttgaacacctggagatcacctagacttgaacat 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43363078 aactacaatttgcaagtgtgtatttgtactcaagatcgtggtaatgaatatcatctgaatttaaagtttgaacacctggagatcacctagacttgaacat 43363177  T
Q  568 aattttgacgaataatgaaatgtatatttgaacacatgaaatttgtggataatcatattcaaaatc----------gtgttatatgaatgataagttgtc 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||    
T  43363178 aattttgacgaataatgaaatgtatatttgaacacatgaaatttgtggataatcatattcaaaatcgtgtttaattgtgttatatgaatgataagttgtc 43363277  T
Q  658 acgccttgttattcattaaccaataaatttgatgataaattcttctaaatatgatttttcattttgtattttcaattgtttgtaccaaagcagagaaatt 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43363278 acgccttgttattcattaaccaataaatttgatgataaattcttctaaatatcatttttcattttgtattttcaattatttgtaccaaagcagagaaatt 43363377  T
Q  758 gaaaagaaagttgaagaaattatggacaatggttcttcaattgtataannnnnnnnacatgtacatacaaacacactaca-aagcaatcacattaagata 856  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43363378 gaaaagaaagttgaagaaattatggacaatggttcttcaattgtatca-tttttttacatgtacatacaaacacactacacaaacaatcacattaagata 43363476  T
Q  857 gaacagcattgtatggaatggccacttctgctgcccctatggctatcctgtcctattcataaaaaagaatcccttatcaaacctttcccac-aatttcag 955  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43363477 gaacagcattgtatggaatggccacttctgctgcccctatggctatcctgtcctattcat-aaacagaatcccttatcaaacc-ttcccacaaatttcag 43363574  T
Q  956 tttcagaagcttcagcatattagtggc 982  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43363575 tttcaaaagcttcggcatattagtggc 43363601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38192256 - 38191983
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192256 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 38192157  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38192156 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 38192057  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38192056 acatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38191983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38219481 - 38219208
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219481 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 38219382  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38219381 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 38219282  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38219281 acatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38219208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35387745 - 35387474
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387745 tgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 35387646  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  35387645 tcctttcttgcttatctcgtttgctttgtattctcttgtggagttgctctacactagactagggttgtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 35387546  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387545 atagattatcacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 35387474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24135931 - 24135659
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24135931 tgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtgtttgttct 24135832  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagactttttac 205  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24135831 tccttttctagcttatcttgtttgctttgtattatcttgtggtgttgctctacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagactctttac 24135733  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24135732 tcatagattaccactcccttttgctccacacatctttattttcattggtgtgagttttatccggattcacaaca 24135659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15464615 - 15464342
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15464615 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttt 15464517  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
     | ||||| |||||||||||  ||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15464516 cttctttcattgcttatctttattgttttggttatacttgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 15464417  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15464416 acattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaacaa 15464342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 262
Target Start/End: Original strand, 36932364 - 36932619
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36932364 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 36932462  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttt-tgttgttgttgcttggagacttttta 204  Q
     |  |||| |||||||||||  || |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  36932463 cttttttcattgcttatctttgtt-ctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacacttta 36932561  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttt 262  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932562 cacattgattacctcttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttt 36932619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 9353346 - 9353583
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9353346 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 9353444  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
     | ||||| |||||||||||  || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9353445 cttctttcattgcttatctttgtt-ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 9353543  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttt 246  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9353544 acattgtttaccacttcc-tttgctccacacatctttgttt 9353583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 1457165 - 1457445
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1457165 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 1457262  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |    
T  1457263 tcctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ctttgttgttgtttgcttggagaccat 1457361  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaaca 279  Q
    || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1457362 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 1457445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14520313 - 14520038
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14520313 tgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 14520215  T
Q  107 -ttcctttct-tgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     || |||||  |||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14520214 ctttctttcagtgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactt 14520116  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccgg-attcacaacaa 280  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  14520115 tacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga-ttttcaccggaattcacaacaa 14520038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15044768 - 15044551
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15044768 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 15044671  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac--t 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  |    
T  15044670 tccttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgttggtttggagaccat 15044572  T
Q  200 ttttactcattgattaccact 220  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  15044571 ttgttctcattgattaccact 15044551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30631488 - 30631224
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30631488 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 30631391  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagac--tt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| |   |||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  30631390 tcctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgttgcttgaaaaccatt 30631292  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaa 265  Q
    | | ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||    
T  30631291 tgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcatttgtgtgagttttaa 30631224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27449896 - 27449614
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  27449896 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 27449799  T
Q  108 tcctttcttg-cttatcttgttt--gctttgtattctctt---gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac-- 198  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||||||  ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||      
T  27449798 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctat-gttgttgtttgcttggagacca 27449700  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaacaa 280  Q
    ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27449699 tttgtactcattgattaccactatctcttgctccacatatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacaa 27449614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27445052 - 27444771
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  27445052 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 27444955  T
Q  108 tcctttcttg-cttatcttgttt--gctttgtattctctt---gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac-- 198  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||||||  ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||      
T  27444954 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctat-gttgttgtttgcttggagacca 27444856  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaaca 279  Q
    ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27444855 tttgtactcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27444771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43592361 - 43592080
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  43592361 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 43592264  T
Q  108 tcctttcttg-cttatcttgttt--gctttgtattctctt---gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac-- 198  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||||||  ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||      
T  43592263 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgcttt-gttgttgtttgcttggagacca 43592165  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaaca 279  Q
    ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  43592164 tttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattgatgtgactttggaaccggattcacaaca 43592080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Original strand, 17003980 - 17004226
Alignment:
Q  14 actttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc-ttcct 111  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||    
T  17003980 actttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcctttct 17004076  T
Q  112 ttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||       
T  17004077 ttcattgcttatcttttttgctttg-attatgcttgtggtgttgct-tacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatct 17004174  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  17004175 attgattaccacttccttttgctccacacctctttgtttttcattggtgtga 17004226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28832342 - 28832065
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||   ||||||||||||     
T  28832342 tgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttt 28832246  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     || ||||| |||||||||||  ||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  28832245 gtttctttcattgcttatctttattgatttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagattaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactt 28832147  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaagt 285  Q
    ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  |||  |||||||||||||||    
T  28832146 tatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtatga-ttttgtccgatttcacaacaaaaagt 28832065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19588829 - 19588557
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  19588829 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatcttt---gagtgtttgttc 19588733  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||  |    
T  19588732 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctttttttgttgttgttgcttggagacgct 19588634  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  19588633 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 19588557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43598806 - 43598524
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  43598806 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgt-tttgttct 43598709  T
Q  108 tcctttcttg-cttatcttgttt--gctttgtattctctt---gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagact- 199  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||||||  ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||      
T  43598708 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgcttt-gttgttgtttgcttggagacca 43598610  T
Q  200 -ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaacaa 280  Q
     || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  43598609 attgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaacaa 43598524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43604298 - 43604016
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  43604298 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgt-tttgttct 43604201  T
Q  108 tcctttcttg-cttatcttgttt--gctttgtattctctt---gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagact- 199  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||||||  ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||      
T  43604200 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgcttt-gttgttgtttgcttggagacca 43604102  T
Q  200 -ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaacaa 280  Q
     || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  43604101 attgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaacaa 43604016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43609790 - 43609508
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  43609790 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgt-tttgttct 43609693  T
Q  108 tcctttcttg-cttatcttgttt--gctttgtattctctt---gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagact- 199  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||||||  ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||      
T  43609692 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgcttt-gttgttgtttgcttggagacca 43609594  T
Q  200 -ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaacaa 280  Q
     || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  43609593 attgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaacaa 43609508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31180296 - 31180177
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31180296 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 31180199  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgttt 129  Q
    | ||||||| ||||||||||||    
T  31180198 ttctttctttcttatcttgttt 31180177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 12084189 - 12084376
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  12084189 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat-attttggtgtgtttgttc 12084287  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgctt 192  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12084288 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgtttttgttgctt 12084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3880382 - 3880133
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||||||   ||||||||||  | |    
T  3880382 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatc---ttggtgtgttgttcc 3880286  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
    || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||   ||||||||| ||| ||||  ||    
T  3880285 tttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctttacacttagatttaggtctgttt---ttgttgttgattgaagacactt 3880190  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3880189 tatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 3880133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 11916986 - 11917246
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||   | ||||||||||||     
T  11916986 tgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---tcggtgtgtttgttc 11917082  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggc---tgtttttgttgttgttgcttggagact 199  Q
    ||| || || |||||||||||  ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |   | ||||| || || ||||||| ||||     
T  11917083 ctttctctcattgcttatctttattgcactgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagatctaggtctttttttttttttttttttgcttgaagaca 11917182  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagtttt 263  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  11917183 ctttacacattgattaccacttcc-tttgcttcacacatctttgttattcattggtgtgattttt 11917246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 42127424 - 42127698
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  42127424 tgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 42127520  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctac-actaga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||| |||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  42127521 ctttctttcattgcttatctttattgttttg-attatgcttgtggtgttgctctacaattagatttaagtctg-ttttgttgttgttgcttggagacact 42127618  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaa 282  Q
    |||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  42127619 ttatccattgattaccactttc-tttgctccacacatctttgttattcattagtgtga-ttttgtccgaattcacaacaaaa 42127698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 279
Target Start/End: Original strand, 31300612 - 31300882
Alignment:
Q  10 taacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttctt 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  31300612 taacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttcct 31300708  T
Q  109 c-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttta 204  Q
    | ||||| |||||||||||  ||| ||||  | | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||| ||||||| | ||  ||||    
T  31300709 ctctttcattgcttatctttattgttttgattacacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgtttttgcttgaaaacacttta 31300807  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatcttt-gtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
       ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||  ||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  31300808 tctattgattaccagttccttttgctcaatacatctttatttttcattagtgtga-ttttgaccgaattcacaaca 31300882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10281834 - 10281737
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10281834 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc--tttggtgtgtttgttc 10281737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 24553521 - 24553748
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  24553521 tgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 24553616  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  24553617 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgtttctctacacttagatttaggtctgtttttgttgatgttgcttggagacact 24553715  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccaca 235  Q
    |||  ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  24553716 ttatccattgattatcacttcc-tttgctccaca 24553748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 31401871 - 31401934
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31401871 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 31401934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 37556625 - 37556706
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37556625 tgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 37556706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 37561447 - 37561528
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37561447 tgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 37561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2785439 - 2785376
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2785439 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 2785376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 28807593 - 28807656
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28807593 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 28807656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 31397014 - 31397077
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31397014 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 31397077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 33768243 - 33768180
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33768243 tggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 33768180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 33791380 - 33791317
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33791380 tggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 33791317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 258
Target Start/End: Original strand, 11182017 - 11182100
Alignment:
Q  175 tttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11182017 tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttac-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 11182100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31180133 - 31180078
Alignment:
Q  226 ttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31180133 ttgctccacacatcattgttattcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaa 31180078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 280
Target Start/End: Original strand, 42126625 - 42126694
Alignment:
Q  210 tgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  42126625 tgattaccacttccttt-gctccacacatctttgttattcattggtgtga-ttttatccgaattcacaacaa 42126694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2630314 - 2630269
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctca 53  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2630314 tgtatcactttcatcatagtggattgaagagctgctatctccctca 2630269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 4410240 - 4410301
Alignment:
Q  26 gtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410240 gtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21639891 - 21639610
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639891 tgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 21639792  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21639791 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttactc 21639692  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaagtaatg 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21639691 atagattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattgatgtgagttttaatcggattcacaacacaatgtaatg 21639610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21646087 - 21645817
Alignment:
Q  10 taacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646087 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc 21645988  T
Q  110 ctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcat 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21645987 ctttcttgcttatcttgtttgttttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttactcat 21645888  T
Q  210 tgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645887 agattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 21645817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 1533458 - 1533731
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1533458 tgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttattggtgtgtttgttct 1533557  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctctt-gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1533558 ttctttcttgcttatattgtttgctttgtattctctttgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgttgcttggaaacttttttct 1533657  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533658 cattgattaccactatattttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 1533731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18413722 - 18413452
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18413722 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc-cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 18413625  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  18413624 ttctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 18413525  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18413524 atagattaccacttccttttgctcctcacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaacaa 18413452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18408846 - 18408575
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18408846 tgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 18408748  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |    
T  18408747 ttctttcttgcttatcttgtttgctttgtatttgtttgtggtgttgctctacactagactacggctgtttttgttgttgttgcgtggagacactttacac 18408648  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18408647 atagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaacaa 18408575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 20357562 - 20357837
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20357562 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtat-tttgttct 20357659  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaga-cttt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  20357660 tccttttcttgcttatcttgtttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccatt 20357759  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |  ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20357760 tggctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 20357837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2058048 - 2057765
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2058048 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 2057950  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttg------tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggag 196  Q
    ||| ||| ||||||||||||      |||||||||   |||||   |||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  2057949 tccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgtttgcttggaa 2057850  T
Q  197 a-ctttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    | | ||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2057849 accatttgactcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 2057765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2479419 - 2479170
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2479419 tgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctccccct-agattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttt 2479322  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
     | ||||| |||||||||||  || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  2479321 cttctttcattgcttatctttgtt-ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgcttagagacactttac 2479223  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2479222 acattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 2479170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 9190022 - 9190294
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9190022 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 9190118  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     || ||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||  ||    
T  9190119 ctctctttcattgcttatctttattgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtttg-ttttgttgttgttgcttggagacactt 9190217  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  9190218 tacacattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga-ttttgaccgaattcacaaca 9190294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263511
Alignment:
Q  10 taacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttctt 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctccccc--atattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgtttct 47263661  T
Q  109 cctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
      |||| |||||||||||  || |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||| |    
T  47263660 tatttcattgcttatctttatt-ctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctatttttgtttttgttgcttggagacactttacac 47263562  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  47263561 attgattaccacttcc-tttgctccacgcatctttgtttttcattggtgtga 47263511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29159886 - 29159633
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  29159886 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 29159790  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29159789 ctctctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 29159691  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29159690 ttatctattgattaccacttccctttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 29159633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 44848698 - 44848951
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44848698 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatc-ttttggtgtgtatgttc 44848796  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctg---tttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     | ||||| ||||||||||| | | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44848797 cttctttcattgcttatctt-tgttctttgtatatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgttttttttgttgttgttgcttggagacactt 44848895  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    | | ||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44848896 tgcacattgattagcactacc-tttgctccacacatccttgtttttcattggtgtga 44848951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49091744 - 49091471
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||    
T  49091744 tgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatctt---ggtgcgtttgttc 49091648  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacactaga--ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  49091647 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 49091550  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  49091549 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtaccgaattcacaacaa 49091471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 9185179 - 9185450
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  9185179 tgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg-----gtgtttgttc 9185273  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     || ||||| |||||||||||  ||||||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  9185274 ctctctttcattgcttatctttattgctttgtttatgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactt 9185372  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  9185373 tacacattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattagtgtga-ttttgaccgaattcacaacaa 9185450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2580473 - 2580198
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  2580473 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 2580377  T
Q  107 ttcc----tttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagact 199  Q
     ||     |||| |||||||||||  ||||||||  |   ||||||||||  ||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||     
T  2580376 ctctcttttttcattgcttatctttattgctttggttatacttgtggtgtatctctacacttagatttaggtctgtttt-gttgttgttgcttgaagaca 2580278  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  2580277 ctttacacattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtga-ttttgtccgaattcacaacaa 2580198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12396993 - 12396710
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  12396993 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 12396896  T
Q  108 t-cctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    | |||||   |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |    
T  12396895 tccctttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ctttgttgttgtttgcttggagaccat 12396797  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtga--gtttt--aaccggattcacaaca 279  Q
    || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12396796 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaaggtttttgaaccggattcacaaca 12396710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20284172 - 20283934
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  20284172 tgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 20284076  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| || ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  20284075 ctttctttcatttcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgtttcttggagacact 20283977  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20283976 ttatccattgattatcact-tcttttgctccacacatctttgtt 20283934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4866812 - 4866526
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  4866812 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 4866715  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttg-tttgcttt-gtattctcttgt---ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac-- 198  Q
    ||| |||   |||||||||| |||||||| ||||  | ||||   | | ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  4866714 tccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactg-ttttgttgttgtttgcttggagacca 4866616  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtga--gtttt--aaccggattcacaacaaa 281  Q
    ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  4866615 tttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaaggtttttgaaccggattcacaacaaa 4866526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 24024329 - 24024451
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24024329 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttc 24024427  T
Q  107 ttcc-tttcttgcttatcttgttt 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  24024428 ttccttttcttgcttatcttgttt 24024451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 31109586 - 31109830
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  31109586 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttc 31109683  T
Q  107 ttcc-tttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac-- 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  31109684 ttccttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactag-ttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagacca 31109781  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    ||| | ||||||||||| ||||  |  ||||| |||||||| |||||||    
T  31109782 tttgttctcattgattatcactatcacttgctgcacacatcattgttta 31109830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12406413 - 12406169
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc- 106  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||     
T  12406413 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 12406316  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||| |||   |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |    
T  12406315 ttcttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ctttgttgttgtttgcttggagaccat 12406217  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  12406216 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgttta 12406169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 2647710 - 2647950
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||   ||| ||||||||||     
T  2647710 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatc---ttgatgtgtttgttc 2647806  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |    
T  2647807 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctaaacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagatat 2647905  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttt 246  Q
    ||||   ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  2647906 tttatctattgattaccatttcc-tttgctccacacatctttgttt 2647950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 23403027 - 23403265
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||    ||||||||||||    
T  23403027 tgtaacactttcatcttagtagattggagggctgctcactccctcagattaggtcatattagaccgaattgggtcaacaatctta---gtgtgtttgttc 23403123  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||| ||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  23403124 ctttctttcattgcttatatttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttacatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggaaacact 23403222  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  23403223 ttatccattgattatcacttcc-tttgctccacacatctttgtt 23403265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 46516324 - 46516597
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  46516324 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 46516420  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| ||| ||||||   |||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||| ||||  || | ||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  46516421 ctttctttcattgtttatctctattgctttg-attatgcttttggtgttgctttacacttagatttaagtctgttttttgttgttgttgtttggagacac 46516519  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  46516520 tttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 46516597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 33332464 - 33332716
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||| | | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33332464 tgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 33332560  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  33332561 ctttctttcattgcttatctttattgatttg-attatgcttatggtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgtttggatacact 33332659  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  33332660 ttatctattgattaccacttcc-tttggtccacacatcttggttattcattggtgtga 33332716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19992395 - 19992314
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992395 tgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 19992314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 4796681 - 4796936
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| || |||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  4796681 tgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatctt---ggtgtgtttgttc 4796777  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg---tttttgttgttgttgcttggagac 198  Q
     || || || |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||   |||||||||||||||||||||||     
T  4796778 ctttctctcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttttgttgttgttgcttggagaa 4796876  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
      ||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4796877 actttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 4796936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35960899 - 35960623
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  35960899 tgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 35960803  T
Q  107 --ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgttt--ttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
      ||| ||  || ||||||||  ||||||| | |   || |||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||      
T  35960802 atttcattaatttcttatctttattgctttatttatgctggtggtgtttctctacacttagatttaggcctgttttgttgttgttgttgcttggaaacac 35960703  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga-gttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  35960702 tttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgattttttgaccgaattcacaaca 35960623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 28617239 - 28617481
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttg--t 104  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||| | ||||||||| |||||   | ||||||||||||  |    
T  28617239 tgtatcactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa---tattggtgtgtttgttt 28617335  T
Q  105 tcttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgc-tctacact-agac-tagggctgttt--ttgttgttgttgcttggagact 199  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||| | ||| || |||| |||| || |||  ||||| ||||| ||| ||| ||    
T  28617336 tcttcctttcttgcttatctttgttgctttgaatatgcttgtggtgttgcttttactctaagacttaggtctattttgttgttcttgtttctt-gaggct 28617434  T
Q  200 -ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttt 246  Q
      |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28617435 actttactcattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttt 28617481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 56030 - 55770
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  56030 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccc-cagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatc---ttggtgtgtttgttc 55935  T
Q  107 --ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgt---------ttttgttgttgttgct 191  Q
      |||||| | ||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||         |||| |||||||||||    
T  55934 ctttccttccattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctatacttagatctaggtctgtttttttttattttattgttgttgct 55837  T
Q  192 tggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  55836 tggagacactttacacattgattaccacttcc-tttacttcacacatctttgttattcattggtgtga 55770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21983367 - 21983285
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983367 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Original strand, 9235634 - 9235809
Alignment:
Q  72 gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc-ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact 167  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | ||| |    
T  9235634 gaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttcatttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacatttagatt 9235729  T
Q  168 -agggctgtttt--tgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
     ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9235730 taggtctgtttttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 9235809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16880137 - 16880074
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16880137 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 16880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16884993 - 16884930
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16884993 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 16884930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 24261344 - 24261407
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24261344 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 24261407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 24266223 - 24266286
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24266223 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 24266286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 21812259 - 21812322
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21812259 tggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 21812322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21988989 - 21988732
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21988989 tgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctcctcc--agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctc---ggtgtgtttgttc 21988895  T
Q  107 --ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctctt-gtggtgttgctctacact-agact-agggctgtt-tttgttgttgttgcttggagact 199  Q
      || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||||||  ||| | ||| |||   |||||||||||||||||| |||     
T  21988894 cttttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgtttgtggtgttgctctacacccagatttaggtctggagtttgttgttgttgcttggtgaca 21988796  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatc-tttgtttacattggtgtgagtttt 263  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||    
T  21988795 ctttacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatcattatttttcattggtgtgattttt 21988732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3047167 - 3047062
Alignment:
Q  173 tgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggatt 272  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||    
T  3047167 tgttattgttgttgttgcttgaggacactttactcattgattatcactttcttt-gctccacacatctttgttttcattggtgtga-ttttgtccgaatt 3047070  T
Q  273 cacaacaa 280  Q
    ||||||||    
T  3047069 cacaacaa 3047062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 5817284 - 5817380
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  5817284 tgtatcactttcatattagtggattggagagctgctctctccc-cagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatc--tttggtgtgtttgttc 5817380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21983194 - 21983108
Alignment:
Q  177 tttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagtttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21983194 tttgttgttgttgcttggagatactttacacattgattaccact-tcatttgctccatacatcattgtttttcattggtgtgattttt 21983108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7351713 - 7351652
Alignment:
Q  26 gtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 86  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7351713 gtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 17966 - 18239
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17966 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 18065  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  18066 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttaca 18165  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18166 catagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtttgagttttaaccggattcacaacaa 18239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 24059 - 24331
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24059 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 24158  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  24159 tcctttctttcttatcttgttttctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttaca 24258  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24259 catagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-121; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26287984 - 26287711
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287984 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 26287885  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  26287884 tcctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 26287785  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaa 281  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26287784 atagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaacaaa 26287711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26313235 - 26312962
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313235 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 26313136  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  26313135 tcctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 26313036  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaa 281  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26313035 atagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaacaaa 26312962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 1261968 - 1262238
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261968 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 1262067  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1262068 tcctttctatcttatcttgtttgctt-gtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttactc 1262166  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262167 atagattaccactcccttttactccacacatctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1262238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 31071243 - 31071517
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071243 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 31071342  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  31071343 ttcctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttaca 31071442  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgag-ttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  31071443 catagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagtttttatccgaattcacaacaa 31071517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26301241 - 26300957
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301241 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 26301142  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgg-tgttg---ctctacac-taga-------ctagggctgtttttgttgttgttgcttgga 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||   || ||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||      
T  26301141 tcctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggttgttgacactttacacatagattaggccatagggctgtttttgttgttgttgcttgtt 26301042  T
Q  196 gactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26301041 gacactttacacatagattaccacttccttttgctccacgcatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaacaa 26300957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36979460 - 36979184
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36979460 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 36979362  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-ctttt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  36979361 tcctttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattt 36979262  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |  |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36979261 tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 36979184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 4760089 - 4760366
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  4760089 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttgatgt-tttgttct 4760187  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-cttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  4760188 tcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccatt 4760287  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4760288 ttgctcattgattaccactatctctagctccacacatctttgtttttcattgatgtgagtttcaaccggattcacaaca 4760366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30655729 - 30655440
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtg---tgtttgt 104  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||    
T  30655729 tgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttttttgt 30655630  T
Q  105 tcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctg-tttttgttgttgttgcttggaga- 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  30655629 tcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttgttgcttggaaac 30655530  T
Q  198 ctttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaagtaa 287  Q
    | ||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30655529 cattttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaataagtaa 30655440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 10689157 - 10689422
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10689157 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 10689255  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-ctttt 202  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||     
T  10689256 tcctttcttacttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttgttgcttggaaaccatta 10689355  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccg 268  Q
     |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  10689356 gactcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccg 10689422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 33037821 - 33038097
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33037821 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 33037918  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgttt-ttgttgttgttgcttggaga-cttt 201  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||   |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||    
T  33037919 tcttttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttgttgcttggaaaccatt 33038018  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  33038019 ttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttttcattggtgttagatttaaccgcatccacaacaa 33038097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 18870576 - 18870852
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18870576 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 18870674  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-ctttt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||   |||||| |||||||| || || |||||||  ||||||||||  ||||||||| | | |||    
T  18870675 tcctttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgttttttgttgt--ttgcttggaaaccattt 18870772  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaa 282  Q
     |||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18870773 aactcatagattaccattatctcttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaaaa 18870852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 18853182 - 18853458
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18853182 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 18853280  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggaga-cttt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||   |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| |||||| ||||||||| | | ||    
T  18853281 tcctttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaaccatt 18853380  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    | |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18853381 tgactcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgttt-cgttggtgtgagtttcaaccggattcacaacaa 18853458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6311379 - 6311100
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6311379 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 6311282  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||  |    
T  6311281 tcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ctttgttgttgtttgcttggaaaccat 6311183  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || | ||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6311182 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 6311100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4456111 - 4455837
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  4456111 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatc-ttttggtgtgtttgttc 4456013  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-agactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |   ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  4456012 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgttgtgttgctctacactaagtccaggtctgtttttgctgttgttgcttggagacacttt 4455914  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  4455913 acacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgatattcattggtgtgatttttaagggaattcacaacaa 4455837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7412424 - 7412168
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  7412424 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgttc 7412325  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-----gcttggagactt 200  Q
     | ||||| |||||||||||  || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||     ||||||||||      
T  7412324 cttctttcattgcttatctttgtt-ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttttttttttttttttgcttggagacac 7412226  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7412225 tttacacattcattaccacttccttt-gctccacacatctttgtttttcattggtgtga 7412168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Original strand, 26403244 - 26403496
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  26403244 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 26403340  T
Q  107 ttccttt--cttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || |||   |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||       
T  26403341 ctcgttttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttattgcttggagacaca 26403439  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtg 257  Q
    |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26403440 ttatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtg 26403496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 19175768 - 19176045
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  19175768 tgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttt-gtgtgtttgttc 19175866  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-agactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||    
T  19175867 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctg-ctttgttgttgttgcttggagacacttt 19175964  T
Q  204 ac----tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  19175965 acacattaattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttttaccagaattcacaacaa 19176045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 7289929 - 7290210
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  7289929 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 7290026  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac-- 198  Q
    ||| ||| |  |||||||||||  || |||||  |||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||      
T  7290027 tccttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ctttgttgttgtttgtttggagacca 7290125  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaaca 279  Q
    ||| | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7290126 tttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcaatgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 7290210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 5702497 - 5702749
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5702497 tgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 5702593  T
Q  107 --ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
      ||||||  | ||||||||   |||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  5702594 ctttccttcatagcttatctctattgcttta-attatgcttgtggtgatgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgctaggagacact 5702692  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5702693 ttattcattgattaccact-tcatttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 5702749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 19752408 - 19752681
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  19752408 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 19752504  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| || |||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  19752505 ctctctttcattacttatctctattgctttg-attatgcttgtggtgttgcactacacttagatttaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacact 19752602  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg--tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19752603 ttatatattgattaccacttccttttgctccacacatctttgttttttcattggtgtga-tttttaccggattcacaaca 19752681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Original strand, 9765851 - 9766086
Alignment:
Q  26 gtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttcttgcttat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| ||  ||||||||    
T  9765851 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcatt--ggtgtgtttgttcccttctttcattgcttat 9765948  T
Q  123 cttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccac 219  Q
    |||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||    
T  9765949 ctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattatcac 9766047  T
Q  220 tcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9766048 ttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 9766086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6127304 - 6127049
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| | |||||| ||||||||  | |||| |||||||||||    
T  6127304 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa--tatttgatgtgtttgttc 6127207  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact--agactagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
     || ||||| |||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |   ||   ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  6127206 atctctttcattgcttatctttagtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttaaatttatatctgttttttgttgttgttgcttggagacac 6127108  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    || |   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6127107 ttaatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 6127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 4696610 - 4696802
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4696610 tgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 4696706  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagac 198  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4696707 atttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgtttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgttgttgcttggagac 4696802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 243
Target Start/End: Original strand, 39784843 - 39785067
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttctt--cctttcttgcttatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||  | |||   |||||||    
T  39784843 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgt-tttgttctttccttttaccgcttatc 39784941  T
Q  124 ttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac--tttttactcattgattac 216  Q
    |||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||| | |||||||||||     
T  39784942 ttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattat 39785040  T
Q  217 cactcccttttgctccacacatctttg 243  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  39785041 cactatcacttgctccacacatctttg 39785067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Original strand, 25328281 - 25328379
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  25328281 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 25328378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 10684285 - 10684348
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10684285 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 10684348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 23799591 - 23799843
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  23799591 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 23799687  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggct-gtttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||   |||||||| ||| |  |||||||  | |||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||      
T  23799688 ctttctttcattgcttatctctattgctttg-attatgtttgtggtacttctctacacttagatctaggtctattttttgttgttgtttcttggagacac 23799786  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtga 258  Q
    ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23799787 tttatctattgattaacactttc-tttgctccacacatattttttttcattggtgtga 23799843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 35745455 - 35745392
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35745455 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 35745392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28307421 - 28307368
Alignment:
Q  225 tttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  28307421 tttgctccacacatctttgttttcattggtgtga-ttttatccgaattcacaaca 28307368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6813559 - 6813488
Alignment:
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  6813559 cattgattaccactcacttt-gctcaacacatctttgttttcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaacaa 6813488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 279
Target Start/End: Original strand, 10015389 - 10015443
Alignment:
Q  227 tgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaa--ccggattcacaaca 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  10015389 tgctccacacatctttgttttcattggtgtaagttttaaatccgaattcacaaca 10015443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25398578 - 25398302
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398578 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 25398479  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25398478 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 25398379  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaa 282  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25398378 acatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaaaa 25398302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25403716 - 25403442
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403716 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 25403617  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25403616 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 25403517  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25403516 acatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaa 25403442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3491833 - 3491563
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3491833 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 3491735  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  3491734 tcctttcttgcttatcttggttgctttctatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 3491635  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3491634 atagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaaca 3491563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 9296415 - 9296695
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9296415 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 9296513  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggaga-cttt 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||    
T  9296514 tcctttcttgcttttcttgttttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccatt 9296613  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaa 283  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296614 ttgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaa 9296695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14291571 - 14291294
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14291571 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 14291473  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggaga-cttt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||    
T  14291472 tcctttcttgcttatcttgttttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccatt 14291373  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    || | ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291372 ttgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 14291294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 11098941 - 11099217
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11098941 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 11099039  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-ctttt 202  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  11099040 tcctttcttccttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattt 11099139  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |  |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11099140 tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 11099217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40738925 - 40738650
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40738925 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctccccc-cagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 40738828  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctg-----tttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||     || |||||||||||||||||||||  ||    
T  40738827 tcctttctagcttatctttattgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagatctggttttttgttgttgttgttgcttggagacactt 40738728  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  40738727 tacatatagattaccacttccttttactccacacatctttatttacattggtgtgagttttgtagggattcacaacaa 40738650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 28259191 - 28259443
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttg-tt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28259191 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttttggtgtgtttgttt 28259289  T
Q  106 cttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctg--tttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
    |||| ||  ||||||||||| | | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||  |||    
T  28259290 cttctttcattgcttatctt-tgttctttgtatatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttttgttattgttgcttggagacacttt 28259388  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    || |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28259389 acacattgattattacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 28259443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Original strand, 42039684 - 42039957
Alignment:
Q  9 gtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttg-ttc 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  42039684 gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatc-ttttggtgtgcttgctcc 42039782  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-tagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttta 204  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||| |   |||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42039783 tttctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacacttaatctaggtatgtttttgttgttgttgcttggagacacttta 42039881  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  42039882 cacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttttaccggaattcacaacaa 42039957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 280
Target Start/End: Original strand, 23078486 - 23078760
Alignment:
Q  10 taacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc-- 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||      
T  23078486 taacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattctttt-ggtgtgtttgttcca 23078584  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
    ||| ||  ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23078585 ttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatgttttttgttgttgttgcttggagacactt 23078682  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  23078683 tacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatttttaccggaattcacaacaa 23078760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 10445458 - 10445733
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  10445458 tgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 10445554  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  10445555 ctctctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggttttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacac 10445653  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  10445654 tttatccattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaacaa 10445733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21630026 - 21629762
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  21630026 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc-cagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 21629931  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| |     |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  21629930 ctttctttcattgcttatctttattgctttgaa-----ttgtggtgctgctctacacttagatctaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactt 21629837  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  21629836 tatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttttcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 21629762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8040143 - 8039890
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||| ||| |||    
T  8040143 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatc---ttgatgtattttttc 8040047  T
Q  107 --ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
       |||||  |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  8040046 ctctccttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacact 8039948  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8039947 ttatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 8039890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 36757779 - 36758032
Alignment:
Q  11 aacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc-tt 108  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36757779 aacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttcctt 36757877  T
Q  109 cctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacacta-gactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
     ||||| ||||||||||| | |||||||| |   |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  36757878 tctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttaca 36757975  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagtttt 263  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  36757976 cattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttt 36758032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17865286 - 17865014
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  17865286 tgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgattgttc 17865190  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| ||| |||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17865189 ctttctttcattgattatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatgtttttgttgttgttggttggagacatt 17865091  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  17865090 ttatccattgattaccacttcctttt-ctccacacatttttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 17865014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20522303 - 20522031
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  20522303 tgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 20522207  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| || ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  20522206 ctttctttcatttcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctttttttgttgtttttgcttggagacact 20522108  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  20522107 ttatccattgattaccacttcctttt-ctccacacatctttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 20522031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34388941 - 34388668
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    |||||||||||||    
T  34388941 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctc---ggtgtgtttgttc 34388845  T
Q  107 -ttcctttctt-gcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     || ||||||| | ||||||| | |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  34388844 ctttctttctttgtttatctt-tgtgctttgattttgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactt 34388746  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  34388745 tacatattgattaccacttcc-tttgctccacacatcttcgttatttattggtgtgatttttaccagaattcacaacaa 34388668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31056127 - 31055887
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31056127 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatc--tttggtgtgtttgttc 31056030  T
Q  107 --ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
      || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  31056029 cttttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacac 31055931  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    ||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31055930 tttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 31055887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Original strand, 34682348 - 34682600
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  34682348 tgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 34682444  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||| ||  ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34682445 ctctctttcattgcttatatttatttgtttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 34682543  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtg 257  Q
    |||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34682544 ttatctattgattaccactttcttttgctccacacatctttgttattcattggtgtg 34682600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13569411 - 13569134
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||| ||     
T  13569411 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa---ttttggtgtgtttattc 13569315  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  13569314 ctttctttcattgattatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgtttctctatacttagatctaagcctgttttttgttgttgttgtttggagacac 13569217  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccgg-attcacaacaaaa 282  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  13569216 tttacacattgattaccacttcc-tttactccacacatctttgttattcattggtgtgattttttaccggaattcacaacaaaa 13569134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 33528635 - 33528873
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  33528635 tgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 33528731  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctaca-ctaga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| ||| |||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  33528732 ctttctttcattgtttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacatttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggggacact 33528830  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33528831 ttatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 33528873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 44312627 - 44312913
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  44312627 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 44312724  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||| ||| | |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||| | ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||  |    
T  44312725 tccttttatcgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggc-ggctttgttgttgtttgcttggagaccat 44312823  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtga----gttttaaccggattcacaacaaaa 282  Q
    || | ||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||     ||| |||||||||||||||||||    
T  44312824 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaagatttttgaaccggattcacaacaaaa 44312913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 16940223 - 16940496
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16940223 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 16940319  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||| |||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||  |    
T  16940320 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttttggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcatagagacact 16940418  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  16940419 ttattcattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtaccgaattcacaaca 16940496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 17010888 - 17011161
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17010888 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 17010984  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||| |||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||  |    
T  17010985 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttttggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcatagagacact 17011083  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  17011084 ttattcattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtaccgaattcacaaca 17011161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Original strand, 39811991 - 39812231
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  39811991 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 39812088  T
Q  108 tcctttctt-gcttatcttgtttg--ctttgtattctcttgtg--gtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac--t 199  Q
    | ||||    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  39812089 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 39812187  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg 243  Q
    || | ||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  39812188 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttg 39812231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32246870 - 32246630
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  32246870 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttc 32246773  T
Q  107 ttcc----tttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaga 197  Q
    ||||    ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32246772 ttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctaggactg-ttttgttgttgttagcttggaga 32246674  T
Q  198 c--tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatc 239  Q
    |  ||| | ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  32246673 ccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatc 32246630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 10707266 - 10707505
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||   | ||||||||| |||    
T  10707266 tgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---tcggtgtgtttattc 10707362  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgttt--ttgttgttgttgcttggagact 199  Q
     || ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | ||||  |||||||||||||| |||| |||||  | |||  |||||||||||||||||||||     
T  10707363 atttctttctttgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgcagtgttgctctacacttagatctaggtatattttcttgttgttgttgcttggagaca 10707460  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10707461 ctttacacattgattaccact-tcttttgctccacacatctttgtt 10707505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 281
Target Start/End: Original strand, 8390166 - 8390443
Alignment:
Q  10 taacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc-t 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |    
T  8390166 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa---ttttggtgtgtttgttcat 8390262  T
Q  108 tcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg----tttttgttgttgttgcttggagact 199  Q
    | ||||| | ||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    || |||||||||||| ||||| ||     
T  8390263 ttctttcatcgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctggtttttgttgttgttgttgtttggataca 8390360  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatcttt-gtttacattggtgtgagttttaaccgg-attcacaacaaa 281  Q
     ||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  8390361 ctttatccattgattaccacttcc-tttactccacacatctttatttttcattggtgtgattttgtaccggaattcacaacaaa 8390443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33118219 - 33117981
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| | ||||||||   ||||||||||||||     
T  33118219 tgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatc---ttggtgtgtttgttc 33118123  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  || ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |    
T  33118122 ctttctttcattgcttatctttattactttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgatgtttgaagacact 33118024  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||   ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  33118023 ttatctattgattaccacttcc-tttgatccacacatctttgtt 33117981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39483014 - 39482821
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  39483014 tgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 39482918  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagac 198  Q
     || ||||| ||| |||||||  ||||||||  |   |||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39482917 ctctctttcattgtttatctttattgctttggttatgcttgtggtgttgttctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagac 39482821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19344485 - 19344422
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19344485 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 19344422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19349343 - 19349280
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19349343 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 19349280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Original strand, 14699028 - 14699117
Alignment:
Q  15 ctttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  14699028 ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 14699117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25407705 - 25407653
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattagg 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25407705 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 2869707 - 2869862
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgt-- 104  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  | | |||| |||||||| | ||||||||| |||||   | |||||||||||||      
T  2869707 tgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa---tattggtgtgtttgttc 2869803  T
Q  105 tcttccttt-cttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact 162  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  2869804 tcttcctttatttgcttatctttgttgctttgaatatgcttatggtgttgctctacact 2869862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 27149308 - 27149369
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg 69  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  27149308 tgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 1345573 - 1345652
Alignment:
Q  26 gtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt 105  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1345573 gtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat-ttcttggtgtgtttgtt 1345652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 239
Target Start/End: Original strand, 14699184 - 14699244
Alignment:
Q  178 ttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatc 239  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14699184 ttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatc 14699244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35397425 - 35397346
Alignment:
Q  176 ttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtg 257  Q
    ||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35397425 ttttgttgttgttgcttgaggtcatttcactcattgattactacttcc-tctgctccgcacatctttgttt-cattggtgtg 35397346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 24202783 - 24203055
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202783 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 24202882  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagactttttact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||     
T  24202883 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagtttagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagacactttaca 24202981  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202982 catagattaccactcccttttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 24203055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 19358857 - 19359133
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19358857 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctttt-gatgtgtttgttct 19358955  T
Q  108 tccttt-cttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgt----ttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||  ||    
T  19358956 tccttttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtatttttttgttgttgttgcttggagacactt 19359055  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19359056 tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 19359133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 19361446 - 19361723
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19361446 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 19361544  T
Q  108 tccttt-cttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgtt-----gttgttgcttggagacttt 201  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||  |    
T  19361545 tccttttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacact 19361644  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19361645 ttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccagattcacaacaa 19361723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 19380086 - 19380363
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19380086 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 19380184  T
Q  108 tccttt-cttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgtt-----gttgttgcttggagacttt 201  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||  |    
T  19380185 tccttttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacact 19380284  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19380285 ttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccagattcacaacaa 19380363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 13604637 - 13604909
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13604637 tgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 13604735  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgtt-gttgttgcttggagacttttta 204  Q
     | ||||| || ||||||||  |||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||||  ||||    
T  13604736 cttctttcattacttatctttattgctttgtatatgcttgtgatgttgctctatactagactatgtctgttttgctttgttgttgtttggagacacttta 13604835  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  13604836 cacattgattatcacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 13604909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 24787379 - 24787624
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24787379 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 24787476  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgttt----ttgttgttgttgcttggaga-c 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||||||||||||| | |    
T  24787477 tccttttcttgcttatcttgtttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttgcttggaaacc 24787576  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttt 246  Q
     |||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24787577 attttgctcatttattaccactatctcttgctccacacatctttgttt 24787624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 26644911 - 26645163
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  26644911 tgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttttggtgtgtttgttc 26645009  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-agactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  |||    
T  26645010 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctgcttttgttgttgttgcttaaagacacttt 26645108  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26645109 acacattgattaccact-tcatttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 26645163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3281791 - 3281520
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||     
T  3281791 tgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatc-ttttgatgtgtttgttc 3281693  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-tagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3281692 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttattcttgtggtgttgctctacacaaagtctatgtctttttttgttgttgttgcttggagacacttt 3281594  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || |||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  3281593 acacattgattaccacttcc-tttactc--cacatctttgttattcattggtgtgatttttaacggaattcacaaca 3281520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 264
Target Start/End: Original strand, 21536583 - 21536841
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21536583 tgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 21536681  T
Q  107 -ttcctttctt-gcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacacta-gactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
     || ||||| | ||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  21536682 ctttctttcatcgcttatctt-tgtgctttgtctatgcttgtggtgttgctctacagtaagtctaggtctatttttgttgttgttgattggagacacttt 21536780  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagtttta 264  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21536781 acacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgattttta 21536841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 16124530 - 16124804
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  16124530 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 16124626  T
Q  107 --ttcctttctt-gcttatcttgtttgctttgtattctctt-gtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
      || ||||| | |||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  16124627 cttttctttcatagcttatctttattgctttg-attatgtttgtggtgttgctctacatttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggacacat 16124725  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  16124726 tttattcattgattaccacttcc-tttgcttcacacatctttgttattcattggtgtga-ttttgtccggattcacgacaa 16124804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29651894 - 29651620
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||||||     
T  29651894 tgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatc---ttggtgtgtttgttc 29651798  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||  ||||      
T  29651797 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaagtctgttttttgttgttgttgattatagacac 29651699  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  29651698 tttattcattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttttgtccgaattcacaaca 29651620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 47703950 - 47704190
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||| ||     
T  47703950 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgttttttc 47704046  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||||||||  |   |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||  |||||||||||| |||||||||||  |    
T  47704047 ctttctttcattgcttatctttattgctttgattaaacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctattttttgttgttgctgcttggagacact 47704146  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47704147 ttatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtt 47704190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37069853 - 37069599
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  37069853 tgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttttggtgtgtttgttc 37069755  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-agactagggctg--tttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    |||  |||| ||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||| | || ||| | |||  ||||| || |||||||||||||||  |    
T  37069754 ctttatttcgttgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacattaagtctaagtctgtttttttttttttgttgcttggagacact 37069656  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37069655 ttacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 37069599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 775755 - 775483
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||   ||| ||||||||||     
T  775755 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc---ttgatgtgtttgttc 775659  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  775658 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 775560  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||   |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  775559 ttatctattggttaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 775483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 27104386 - 27104635
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||     
T  27104386 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 27104482  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    |||  |||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||    ||||||||||||||||||  |    
T  27104483 ctttatttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtt----ttgttgttgcttggagacact 27104577  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27104578 ttatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 27104635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13598481 - 13598202
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13598481 tgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 13598385  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgct---tggagac 198  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |   |||||||    
T  13598384 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagac 13598286  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaa 283  Q
      || ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    | |||||||||||||||    
T  13598285 acttaact-attgattaccacttccttta-ctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtctcagattcacaacaaaaa 13598202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32889522 - 32889249
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||||||| | ||||| | |||||||||||   |||||||||||||    
T  32889522 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 32889426  T
Q  107 ttcc--tttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     ||   |||| |||||||||||  ||||||||  |   ||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  32889425 ctctcttttcattgcttatctttattgctttggttatacttgtggtgttgctctacacttagatttagatctgtttt-gttgttattgcttggagacact 32889327  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  32889326 ttacacattgattatcactttcttttgctccacacatctttgttttcattggtatgatttttgtacggattcacaaca 32889249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 47098838 - 47099089
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  47098838 tgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 47098934  T
Q  107 --ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
      ||| ||  |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  47098935 ctttctttgattgcttatctttattgctttg-attatacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttacttggagacact 47099032  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47099033 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 47099089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19073011 - 19072757
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  19073011 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc--tttggtgtgtttgttc 19072914  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||      
T  19072913 ctttctttcattgcttatctttattgttttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacac 19072815  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||   ||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  19072814 tttatctattgattactacttcc-tttgttccacatatctttgttattcattggtgtga 19072757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19120901 - 19120647
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  19120901 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc--tttggtgtgtttgttc 19120804  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||      
T  19120803 ctttctttcattgcttatctttattgttttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacac 19120705  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||   ||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  19120704 tttatctattgattactacttcc-tttgttccacatatctttgttattcattggtgtga 19120647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 41398318 - 41398216
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  41398318 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 41398221  T
Q  108 tcctt 112  Q
    |||||    
T  41398220 tcctt 41398216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 25445092 - 25445173
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445092 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 25445173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 41390663 - 41390561
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  41390663 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatcttctcgatgt-tttgttct 41390566  T
Q  108 tcctt 112  Q
    |||||    
T  41390565 tcctt 41390561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 39445564 - 39445501
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445564 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 39445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 44023894 - 44023957
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023894 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 44023957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9476344 - 9476217
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  9476344 tgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 9476248  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttg 135  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  9476247 ctttctttcattgtttatcttttttgctttg 9476217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 47102855 - 47103106
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47102855 tgtaacattttcatcttagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa---ttttggtgtgtttgttc 47102951  T
Q  107 --ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
      ||| ||  |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  47102952 ctttctttgattgcttatctttattgctttg-attatacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgctttgagacact 47103049  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||   |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  47103050 ttatctattgattaccact-tcatttgctccacacgtctttattattcattggtgtga 47103106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 1055032 - 1055095
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055032 tggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1055095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 43988485 - 43988548
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43988485 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaatctt 43988548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 280
Target Start/End: Original strand, 40816883 - 40817021
Alignment:
Q  145 gtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctt 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40816883 gtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctt 40816981  T
Q  242 tgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||| | ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||    
T  40816982 tgttattcattggtgtgttttttgtccgaattcacaacaa 40817021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 257
Target Start/End: Original strand, 17345703 - 17345782
Alignment:
Q  177 tttgttgttgttgcttggagact--ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtg 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17345703 tttgttgttgttgcttg-aggctacttttactcattgattactacttccttt-gctccacacatctttgttt-cattggtgtg 17345782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 242
Target Start/End: Original strand, 50521286 - 50521352
Alignment:
Q  176 ttttgttgttgttgcttggagact--ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatcttt 242  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  50521286 ttttgttgttgttgtttg-agactacttttactcattgattaccacttcc-tttactccacacatcttt 50521352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 5674784 - 5675057
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5674784 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctctttggtgtgtttgttct 5674883  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctc-ttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgctt-ggagactttttac 205  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5674884 ttctttcttgcttatattgtttgctttgtattctctttgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgttgcttgggaaactttttac 5674983  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674984 tctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 5675057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22709101 - 22708828
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22709101 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaat-tttttggtgtgtttgttc 22709003  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactaga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22709002 ttcctttcttgcttatctttattgctttggatacacttgtggtgttgctctacattagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 22708903  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
     ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22708902 acatagattaccactcccctttgcactacacatctttgtttatattggtgtgagttttatccggattcacaacaa 22708828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 5757492 - 5757742
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5757492 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 5757590  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
     | ||||| |||||||||||  || |||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5757591 cttctttcattgcttatctttgtt-ctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactagattaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 5757689  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  5757690 acattgattaccacttcc-tttgctccacacttctttgtttttcattggtgtga 5757742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21356118 - 21355869
Alignment:
Q  9 gtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  21356118 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgtttc 21356020  T
Q  108 tcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
    | ||||| |||||||||||  || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  21356019 ttctttcattgcttatctttgtt-ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttaca 21355921  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21355920 cattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 21355869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31936670 - 31936398
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  31936670 tgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 31936574  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacacta-gactaggg-ctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     |  ||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  31936573 ctatctttcattgcttatctttattgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactttgattaaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactt 31936475  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31936474 tacacattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga-ttttaaccggattcacaaca 31936398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11857056 - 11856809
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtg--tgtttgtt 105  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  11857056 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtttttttgtt 11856958  T
Q  106 cttcc-tttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac- 198  Q
    ||||| ||| | |||| ||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  11856957 cttccttttatcgcttgtcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagacc 11856859  T
Q  199 -tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
     ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  11856858 atttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgttta 11856809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Original strand, 10077179 - 10077413
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||     
T  10077179 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 10077275  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10077276 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 10077374  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctt 241  Q
    |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10077375 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctt 10077413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 22010700 - 22010986
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  22010700 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 22010797  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||| ||| | |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||| | ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||  |    
T  22010798 tccttttatcgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggc-ggctttgttgttgtttgcttggagaccat 22010896  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtga----gttttaaccggattcacaacaaaa 282  Q
    || | ||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||     ||| |||||||||||||||||||    
T  22010897 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaagatttttgaaccggattcacaacaaaa 22010986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 14742439 - 14742683
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc- 106  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||     
T  14742439 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 14742536  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgt-tgcttggagac--t 199  Q
    ||| |||   |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |    
T  14742537 ttcttttaccgcttatcttgttttgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtatgcttggagaccat 14742635  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    || | ||||||||||| ||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  14742636 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgttta 14742683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 14737579 - 14737824
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc- 106  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||     
T  14737579 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 14737676  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct----tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac-- 198  Q
    ||| |||   |||||||||| |||||||||   |||||    |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  14737677 ttcttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagacca 14737775  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    ||| | ||||||||||| ||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  14737776 tttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgttta 14737824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 282
Target Start/End: Original strand, 26258181 - 26258289
Alignment:
Q  174 gtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26258181 gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattggttaccacttccttttgctccatacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattc 26258280  T
Q  274 acaacaaaa 282  Q
    | |||||||    
T  26258281 agaacaaaa 26258289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28184587 - 28184393
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  28184587 tgtaacactttc-tcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 28184490  T
Q  108 tcctttct--tgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac 198  Q
    | |||| |   ||||||||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28184489 ttctttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 28184393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31979593 - 31979358
Alignment:
Q  11 aacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttc 109  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  31979593 aacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttcctc 31979497  T
Q  110 -ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttta 204  Q
      |||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  31979496 tatttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtgatgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacacttta 31979398  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
       ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31979397 tctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 31979358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18232928 - 18232654
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||| | ||  || ||||||||||   |||||||||||||||    
T  18232928 tgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 18232832  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| | |||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18232831 ctctctttcatcgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacact 18232733  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |||   ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||   ||| |||||||||||    
T  18232732 ttatctattgattaccacttcc-tttgcttcacacatctttgttattcattggtgtgattttgttccgaattcacaacaa 18232654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 279
Target Start/End: Original strand, 30125947 - 30126084
Alignment:
Q  144 tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagacttttta-ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctt 241  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  30125947 tgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttggctcatagattatcactacctcttgctccacacatctt 30126046  T
Q  242 tgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30126047 tgttttcattggtgtgattttcaaccggattcacaaca 30126084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 5017483 - 5017760
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccata-ttggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  5017483 tgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 5017579  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg----tttttgttgttgttgcttggaga 197  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    ||||| |||||||||||||||||    
T  5017580 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttttttttgttgttgcttggaga 5017677  T
Q  198 ctttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |  ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| | | |||||||||||    
T  5017678 cactttatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattagtgtgatttttaccggaattcacaacaa 5017760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 31086487 - 31086749
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||  |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  31086487 tgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 31086583  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | ||||          ||||| ||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  31086584 ctttctttcattgcttatctt-tgtgct----------ttgtgatgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgtttttgcttggagacactt 31086672  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  31086673 tatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttcttcattggtgtgattttgtaccgaattcacaaca 31086749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22963782 - 22963531
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |||||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22963782 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccc-cagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 22963687  T
Q  107 -ttcctttctt-gcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgttttt-gttgttgttgcttggagactt 200  Q
     || ||||| | ||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||      
T  22963686 ctttctttcatagcttatctctattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacac 22963588  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtga 258  Q
    |||| | ||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||  ||||||||||    
T  22963587 tttattaattgattaccacttcc-ttagctccacacatcatagtttgtattggtgtga 22963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 23824611 - 23824862
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |||||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23824611 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccc-cagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 23824706  T
Q  107 -ttcctttctt-gcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttt-tgttgttgttgcttggagactt 200  Q
     || ||||| | ||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  23824707 ctttctttcatagcttatctctattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacac 23824805  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtga 258  Q
    |||| | ||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||  ||||||||||    
T  23824806 tttattaattgattaccacttcc-ttagctccacacatcatagtttgtattggtgtga 23824862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4630037 - 4629792
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||     
T  4630037 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatc--tttgatgtgtttgttc 4629940  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||         |||||||| ||    
T  4629939 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgt---------ttggagacatt 4629850  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  4629849 ttatctattgattaccacttccttttactccacacatctttattattcattggtgtga 4629792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 28155572 - 28155653
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28155572 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 28155653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 6005481 - 6005418
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6005481 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 6005418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 6438565 - 6438502
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6438565 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatctt 6438502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 33330466 - 33330529
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33330466 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 33330529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 21801358 - 21801614
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt---tttggtgtgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||    
T  21801358 tgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaact-ggtcaacacttttatctttggtgtgtttg 21801456  T
Q  104 tt-cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggaga 197  Q
    || ||| ||||| || ||||||||  |||||||| ||| |  ||||||| ||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21801457 ttcctttctttcattacttatctttattgctttg-attatgattgtggtattgttctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttggaga 21801555  T
Q  198 ctttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |  ||||   ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21801556 cactttatctattgattaccacttcctt---ctccacacatctttgttattcattggtgtga 21801614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16838808 - 16838745
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16838808 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatctt 16838745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 33335963 - 33336026
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33335963 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatctt 33336026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 285
Target Start/End: Original strand, 5572744 - 5572888
Alignment:
Q  142 cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatc 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5572744 cttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgctgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatc 5572842  T
Q  240 tttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaagt 285  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||    
T  5572843 tttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaacacaaagt 5572888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 5572255 - 5572351
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  5572255 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 5572351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27165616 - 27165547
Alignment:
Q  176 ttttgttgttgttgcttggagact--ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27165616 ttttgttgttgttgcttg-agactacttttgctcattgattacgacttccttt-gctccacacatctttgtt 27165547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5343517 - 5343482
Alignment:
Q  55 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5343517 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 5343482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 28468543 - 28468813
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28468543 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 28468641  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  28468642 tcctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 28468741  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28468742 atagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaaca 28468813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24742023 - 24741747
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24742023 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 24741925  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-ctttt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  24741924 tcctttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattt 24741825  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24741824 tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaa 24741747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Original strand, 31985648 - 31985921
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31985648 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc-cagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 31985745  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttt-tgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  31985746 ttcctttcttgcttatctttattgctttgtatatgcttgtggagttgctctacactagactaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttac 31985845  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaa 281  Q
     ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  31985846 acatagattaccacttccttttgcaccacacatctttgtttacattggtgtgagttttgtccgaattcacaacaaa 31985921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29760724 - 29760449
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29760724 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 29760626  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-ctttt 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | | |||    
T  29760625 tcctttcttgcttatcttgttttgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttg-ttttgttgttgttgcttggaaaccattt 29760527  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |  | |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29760526 tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 29760449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 5396688 - 5396927
Alignment:
Q  11 aacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc-tt 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  5396688 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttcttcctt 5396786  T
Q  109 cctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacacta----gactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
     ||||| ||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5396787 tctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaattagtctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacacttt 5396885  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttt 246  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5396886 acacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttt 5396927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 9224410 - 9224654
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  9224410 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 9224507  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||| |||   |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  9224508 tccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccat 9224606  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  9224607 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgttta 9224654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51520539 - 51520258
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  51520539 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 51520442  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac-- 198  Q
    ||| ||| |  |||||||||||  ||||||||  |||||   | |||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||      
T  51520441 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctg-ctttgttgttgtttgcttggagacca 51520343  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaaca 279  Q
    ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51520342 tttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 51520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 3796533 - 3796788
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3796533 tgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatc--tttggtgtgtttgttc 3796630  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||| |||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  3796631 ctctctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtgatgttactctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttggagacac 3796729  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3796730 tttatctattgattatcacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 3796788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 9229197 - 9229441
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  9229197 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgt-tttgttct 9229294  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||| |||   |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  9229295 tccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccat 9229393  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  9229394 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgttta 9229441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10047462 - 10047190
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  10047462 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 10047366  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| ||| |||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  10047365 ctttctttcattgtttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctatttttgttgttattgcttggagacact 10047267  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  10047266 ttatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatttttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 10047190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 25862036 - 25862308
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   ||||||||||| ||     
T  25862036 tgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttattc 25862132  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25862133 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 25862231  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  25862232 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 25862308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 56146714 - 56146995
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  56146714 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgt-tttgttct 56146811  T
Q  108 tcctttcttg-cttatcttgttt--gctttgtattctctt---gtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagact- 199  Q
    ||||||  |  ||||||||||||  |||||||  ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||      
T  56146812 tccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgcttt-gttgttgtttgcttggagacca 56146910  T
Q  200 -ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt-taaccggattcacaaca 279  Q
     || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  56146911 attgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaatttggaaccggattcacaaca 56146995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3814106 - 3813986
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  3814106 tgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgt-tttgttc 3814009  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3814008 ttcctttcttgcttatcttgttt 3813986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24333892 - 24333641
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttg-tt 105  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| || |||||||   |||||||||||| ||    
T  24333892 tgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatc---ttggtgtgtttgttt 24333796  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||   |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  24333795 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgctt---gtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacac 24333700  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24333699 tttatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 24333641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 38152453 - 38152728
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  38152453 tgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 38152549  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgttt--ttgttgttgttgcttggagact 199  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||     
T  38152550 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctatacacttagatctaggtctgttttattgttgttgttgcttggaaaca 38152647  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
     || |  ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  38152648 cttcatacattgattaccact-tcatttgctctacacatctttgttattcattggtgtgatttttaccggaattcacaacaa 38152728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 8689499 - 8689765
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  8689499 tgtaacactttcatcatagtggataggagagct--cctctcccccatattagatcatattggaccgaactggatcaacaatc-ttttggtgtgtttgtta 8689595  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-agactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |   |||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  8689596 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctgcattaagtctaggtctgtttttgttgttgttacttggagacacttt 8689694  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||     |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  8689695 ac-----gattaccacttcc-tttactccacacatctttgttattcattggtgtgatttttaccggaattcacaaca 8689765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5147760 - 5147503
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  5147760 tgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctc---ggtgtgtttgttc 5147664  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctctt-gtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| ||||||||||   ||| |||| ||| | || |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  5147663 ctttctttcattgcttatctctattgttttg-attatgtttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttattgttgttgtttcttggagacact 5147565  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagtttt 263  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  5147564 ttacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatcattgttattcattggtgtgattttt 5147503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 16630694 - 16630969
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  || |||| | |||||||| | ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  16630694 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaacctt---ggtgtgtttgttc 16630790  T
Q  107 --ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
      || ||||| |||||||||||  || ||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||      
T  16630791 cttttctttcattgcttatctttgtt-ctttg-attatgcttgtggtgttgctttacacttagatctaggtttgtttttgttgttgctgcttggagacac 16630888  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccg-gattcacaacaa 280  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  16630889 tttacacattgattaccagttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttttaccgaaattcacaacaa 16630969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 45347820 - 45348065
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  45347820 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 45347917  T
Q  108 t--cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac-- 198  Q
    |  | |||   ||||||||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||      
T  45347918 ttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctttacactagtctaggactg-ttttgttgttgttagcttgaagacca 45348016  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    ||| | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  45348017 tttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgttta 45348065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 45357299 - 45357544
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  45357299 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 45357396  T
Q  108 t--cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac-- 198  Q
    |  | |||   ||||||||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||      
T  45357397 ttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctttacactagtctaggactg-ttttgttgttgttagcttgaagacca 45357495  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    ||| | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  45357496 tttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgttta 45357544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3777632 - 3777413
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  3777632 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctc---ggtgtgtttgttc 3777536  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3777535 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggttttgttctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 3777438  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttt 226  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  3777437 ttacacattgattaccacttccttt 3777413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 5269205 - 5269446
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||     
T  5269205 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc---ttgttgtgtttgttc 5269301  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgttt---ttgttgttgttgcttggagac 198  Q
    ||| ||||| || ||||| ||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||   |||||||||||||||||||||    
T  5269302 ctttctttcatttcttatatttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatatttttgttgttgttgttgcttggagac 5269400  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
      ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5269401 actttatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 5269446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5143342 - 5143104
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||   |  |||||||||||     
T  5143342 tgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc---tcagtgtgtttgttc 5143246  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||   ||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  5143245 ctttctttcattgcttatctctattgttttg-attatgtttgtggtgttgttctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgtttggagacact 5143147  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  5143146 ttacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatcattgtt 5143104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 280
Target Start/End: Original strand, 16624156 - 16624298
Alignment:
Q  141 tcttgtggtgttgctctacactaga--ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  16624156 tcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattatcacttcc-tttgctccacacat 16624254  T
Q  239 ctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccgg-attcacaacaa 280  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16624255 ctttgttattcattggtgtgattttttaccggaattcacaacaa 16624298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39246077 - 39245824
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  39246077 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 39245981  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||| |||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  39245980 ctttctttcattgcttatctttattgttttg-attatgcctgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacac 39245882  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||   |||||||||||||  | || ||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  39245881 tttatctattgattaccact-tcattcgctccacacatctttattattcattggtgtga 39245824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5732747 - 5732486
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt----tggtgtgtttg 103  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    || | | ||||    
T  5732747 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttg 5732649  T
Q  104 ttc-ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 198  Q
    ||| |||||||   | ||||||||||||||||||   ||||   |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5732648 ttctttcctttaccgtttatcttgtttgctttgttagctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttagcttggagac 5732550  T
Q  199 --tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg--tttacattggtgtga 258  Q
      ||| | |||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  5732549 catttgttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattgtattttcattggtgtga 5732486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54867266 - 54867013
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  54867266 tgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctccc-cagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 54867171  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg--tttttgttgttgttgcttggagact 199  Q
    ||| ||||| |||||||||||  || ||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  54867170 ctttctttcattgcttatctttattactttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctgtttttttgttgttgttgcttggagaca 54867072  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
     ||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  54867071 ctttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 54867013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18855791 - 18855728
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855791 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18855728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5112151 - 5112052
Alignment:
Q  178 ttgttgttgttgcttggagactt-tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcaca 276  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  5112151 ttgttgttgttgcttg-agacttgtttactcattgattaccactcccttt-gctccacacatttttgttttcattggtgtga-ttttatccgaattcaca 5112055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 36315243 - 36315339
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  36315243 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca---ttcttggtgtgtttgttc 36315339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 36329452 - 36329548
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  36329452 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca---ttcttggtgtgtttgttc 36329548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 16623307 - 16623403
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16623307 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 16623403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 42599586 - 42599866
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctg--ctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgt 104  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  42599586 tgtaacattttcatcttagtggattggagggttgctctctctcccccatattatgtcatattggactgaattgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgt 42599682  T
Q  105 t-cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctaca-ctaga-ctagggctgt---ttttgttgttgttgcttggag 196  Q
    | ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||  |||   |||||||||||||||||||||    
T  42599683 tcctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacatttagatctaggtttgtttgttttgttgttgttgcttggag 42599781  T
Q  197 actttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaa 282  Q
     |  ||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || | |||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  42599782 tcactttatctattgattaccacttcc-tttgcttcacacatctttattattcattagtgtga-ttttgtccgaattcacaacaaaa 42599866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 85
Target Start/End: Original strand, 6743429 - 6743507
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 85  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743429 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 34496038 - 34496108
Alignment:
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  34496038 cattgattaccgctaccttt-gctccacacatctttgttttcattggtgtga-ttttgaccgaattcacaaca 34496108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 245
Target Start/End: Original strand, 36315390 - 36315464
Alignment:
Q  172 ctgtttttgttgttgttgcttggag--actttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  36315390 ctgtttttgttgttgttgcttggagacactttttgtccattgattaccacttcc-tttactccacacatttttgtt 36315464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 245
Target Start/End: Original strand, 36329599 - 36329673
Alignment:
Q  172 ctgtttttgttgttgttgcttggag--actttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  36329599 ctgtttttgttgttgttgcttggagacactttttgtccattgattaccacttcc-tttactccacacatttttgtt 36329673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 1983314 - 1983375
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg 69  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  1983314 tgtatcactttgatcctagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattgg 1983375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1306031 - 1305761
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1306031 tgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttct 1305933  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactc 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  1305932 tcctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 1305833  T
Q  208 attgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1305832 atagattaccacttctttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaaca 1305761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8477445 - 8477171
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8477445 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtgtttgttct 8477346  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctc-ttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgctt-ggagactttttac 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8477345 ttctttcttgcttatcttgtttgctttgtattatctttgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgttgcttgggaaactttttac 8477246  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagtttta-accggattcacaaca 279  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8477245 tctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagttttataccggattcacaaca 8477171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32143404 - 32143133
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32143404 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 32143306  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  32143305 ttcctttcttgcttatctttattgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttaca 32143206  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32143205 catagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttatccgaattcacaaca 32143133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 2671600 - 2671877
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2671600 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 2671698  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggaga-cttt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  2671699 tcctttcttgcttatcttgttttgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggagaccatt 2671798  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    |  ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671799 tggctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 2671877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 66 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1309878 - 1309668
Alignment:
Q  66 ttggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1309878 ttggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacactaga 1309780  T
Q  166 ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1309779 ctagggctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttat 1309680  T
Q  266 ccggattcacaa 277  Q
    ||| ||||||||    
T  1309679 ccgaattcacaa 1309668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 262
Target Start/End: Original strand, 27986450 - 27986704
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27986450 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 27986548  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttact 206  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  27986549 attctttcttgcttatctttattgctttgtatatgcttgtggtgttgctctacactagactaggtctatttttgttgttgttgcttgaagacactttaca 27986648  T
Q  207 cattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttt 262  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986649 catagattaccacttccttttgctccatacatctttgtttacattggtgtgagttt 27986704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7167327 - 7167051
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7167327 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 7167229  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-cttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  7167228 tcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctg-ttttgttgttgttgcttggaaaccatt 7167130  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7167129 ttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 7167051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 33386670 - 33386943
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  33386670 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctttt-ggtgtgtttgttt 33386768  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttt-tgttgttgttgcttggagacttttta 204  Q
     | ||||| |||||||||||  ||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  33386769 cttctttcattgcttatctttattgttttggttatacttgtggtgttgctctacactagactaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacacttta 33386868  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  33386869 cacattgattaccacttccttttactccacacatctttgtttacattggtgtgag-tttgtccggattcacaacaa 33386943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 8739077 - 8739354
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8739077 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 8739175  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtgg-tgttgctctacactagactagggctgtttttgttgtt-gttgcttggaga-ctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||   ||||| | ||| |||| || || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | | |    
T  8739176 tcctttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccat 8739275  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || |||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  8739276 ttgactcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 8739354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 9091315 - 9091592
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9091315 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 9091413  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtgg-tgttgctctacactagactagggctgtttttgttgtt-gttgcttggaga-ctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||   ||||| | ||| |||| || || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | | |    
T  9091414 tcctttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccat 9091513  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || |||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  9091514 ttgactcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgttttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 9091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27453041 - 27452786
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27453041 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatc-ttttggtgtgtttgttc 27452943  T
Q  107 ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgttt----------ttgttgttgttgcttggag 196  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||||||          || ||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||    
T  27452942 cttctttcttgcttatctttattgctttgtat---------atgctgctctacactagactaggtctgttttttgttgttgttgttgttgttgcttggag 27452852  T
Q  197 actttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttt 262  Q
    ||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27452851 acactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgttagttt 27452786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 30709794 - 30710068
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30709794 tgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 30709892  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  30709893 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttatggtgttgctctaaacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 30709990  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  30709991 ttacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttttaccggaattcacaaca 30710068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 26928605 - 26928757
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26928605 tgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatc-ttttggtgtgtttgttct 26928703  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac 161  Q
    | |||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26928704 ttctttctagcttatctttattgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacac 26928757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 8370490 - 8370726
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  8370490 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttttggtgtgtttgttc 8370588  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8370589 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 8370686  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatcttt 242  Q
    |||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  8370687 ttacacattgattacctcttcc-tttactccacacatcttt 8370726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 28503879 - 28504149
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  28503879 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 28503976  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggaga-cttttt 203  Q
    |||||||||| |||       ||||||||  |||||   |||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  28503977 tcctttcttgttta-------tgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctg-ttttgttgttgttgcttggaaaccatttt 28504068  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaa 283  Q
     ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  28504069 tctcatagattatcactaccttttgctccacacatcattgttattcattggtgtgagttaagaccggattcacaacaaaaa 28504149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 40372809 - 40373086
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40372809 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttct 40372907  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct-tgtggtgttgctctacactagact--agggctgtttttgttgttg-ttgcttggaga-cttt 201  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||   ||   ||| || | | |  ||   | |||||| ||||| ||||||||| | | ||    
T  40372908 tcctatcttgcttatcttgttttgctttgttatctctatgtgaaattaaactaaacaaaaataaagaaatatttttgatgttgtttgcttggaaaccatt 40373007  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 280  Q
    || | ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40373008 ttgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgttttcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 40373086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 27974956 - 27975192
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27974956 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttttggtgtgtttgttc 27975054  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
     | ||||| ||||||||||| | | |||| | |   |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  27975055 cttctttcattgcttatctt-tgttctttatttatgcttgtggtgttgctctacactagattaggtctg-ttttgctgttgttgcttggagacactttac 27975152  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttt 246  Q
     ||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  27975153 acattgattatcacttcc-tttactccacatatctttgttt 27975192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 40592786 - 40593025
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  40592786 tgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 40592882  T
Q  107 --ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
      || ||||| ||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40592883 cttttctttcattgcttatctatattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacat 40592981  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40592982 tttatccattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 40593025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 39039996 - 39040269
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39039996 tgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 39040094  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacacta-gactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
     || ||||| ||||||||||| | |||||||| |   |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  39040095 ctttctttcattgcttatctt-tgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacacttt 39040192  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccgg-attcacaaca 279  Q
    || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| || |  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  39040193 acacattgattaccacttcc-tttgttccacacatctttattatttattggtgtgattttttaccggaattcacaaca 39040269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 22173198 - 22173442
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  22173198 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 22173295  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatctt-gtttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||| |||   |||||||||  |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  22173296 tccttttaccgcttatcttattttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccat 22173394  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22173395 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgttta 22173442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16264433 - 16264180
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  16264433 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttt-gtgtgtttgttc 16264335  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16264334 ctttctttcattgtttatctt-tgtgctttg-attatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggattgtttttgttgttgtttcttggagacact 16264237  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  16264236 ttacacattgattaccact-tctgttgctccacacgtctttgttattcattggtgtga 16264180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 3716006 - 3716259
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3716006 tgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 3716102  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  ||| | || ||| | ||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  3716103 ctctctttcattgcttatctttattgttgtg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgttgttgcttgtagacact 3716201  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3716202 ttatctattgattaccacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 3716259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36029176 - 36028931
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  36029176 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatctc---ggtgtgtttgttc 36029080  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     || ||||| |||||||||||          ||| ||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36029079 ctttctttcattgcttatctt----------tatgct--tgtggtgttgctctatacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactt 36028992  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagtttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  36028991 tacacattgattaccact-tcatttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttt 36028931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35925563 - 35925287
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||  | |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35925563 tgtaacactttcatcatagtggattggagaactgccc-ctccc--aaattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 35925468  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| | || |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35925467 ttttctttcattgctcatctt-tgtgttttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttacttggagacatt 35925370  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccgg-attcacaacaaaaag 284  Q
    |||| ||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  35925369 ttacacattgattaccac-ctgctttgctccacatatctttgtttttcattggtgtg-gtttttaccggaattcacaacataaag 35925287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 6794717 - 6794994
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||   ||||||||||||||     
T  6794717 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 6794813  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagac-tt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||   |||||||| ||| | |||||| || | |||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  6794814 ctttctttcattgcttatctctattgctttg-attatgcttgtgatgctactctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacact 6794911  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaagt 285  Q
    ||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  6794912 ttttct-attgattaccacttcc-tttgctccacacatcgttgtttttcattggtgtga-ttttgtccgaattcacaacaataagt 6794994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48438297 - 48438059
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||   ||||||||||||||     
T  48438297 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatc---ttggtgtgtttgttc 48438201  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| || || ||| |||||||  ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  48438200 ctttctgtcattgtttatctttattgttttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagatact 48438102  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||   ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  48438101 ttatctattgattaccatttcc-tttgctccacacatccttgtt 48438059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18656517 - 18656256
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt----tggtgtgtttg 103  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    || | | ||||    
T  18656517 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttg 18656419  T
Q  104 ttc-ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 198  Q
    ||| |||||||   | ||||||||||||||||||   ||||   |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18656418 ttctttcctttaccgtttatcttgtttgctttgttagctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttagcttggagac 18656320  T
Q  199 --tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg--tttacattggtgtga 258  Q
      ||| | |||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  18656319 catttgttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattgtattttcattggtgtga 18656256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26299071 - 26298813
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||  | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  26299071 tgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 26298975  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgttt------ttgttgttgttgcttgga 195  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||      |||||||||||| |||||    
T  26298974 ctctctttcgttgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgttgttgtttgga 26298876  T
Q  196 gactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26298875 gacactttatccattgattaccacttcc-tttgatccacacatctttgttattcattggtgtga 26298813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40844734 - 40844497
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||   |||||||| ||||    
T  40844734 tgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctctccc-cagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatctt---ggtgtgttcgttc 40844639  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40844638 atttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtagtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacact 40844540  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||   |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  40844539 ttatctattgattaccact-tcttttactccacacatctttgtt 40844497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27026894 - 27026754
Alignment:
Q  142 cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatc 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  27026894 cttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttcttgttgttgcttggagacactttacacattgattacca-tttcatttgctccacacatc 27026796  T
Q  240 tttgtt-tacattggtgtgagttttaaccgg-attcacaaca 279  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  27026795 tttgttattcattggtgtgattttttaccggaattcacaaca 27026754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21711306 - 21711071
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  21711306 tgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 21711210  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctaca--ctagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||   |||||||| ||| | | | |||||||||||||||   |    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21711209 ctttctttcattgcttatctctattgctttg-attatgcctatggtgttgctctacatggtgatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 21711111  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||   ||   |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21711110 ttatctat---ttaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 21711071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 1417494 - 1417745
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  1417494 tgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 1417590  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||| |||| |||||||| ||||  || |  || |||||||||||||||||| ||||  |    
T  1417591 ctctctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtgatgttactctacacttagatttatgtatg-ttttgttgttgttgcttgaagacact 1417688  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
    |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1417689 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 1417745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 3328360 - 3328552
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||   | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  3328360 tgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 3328456  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagac 198  Q
     || ||||| |||||||||||  ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3328457 ctctctttcattgcttatctttattgttttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgtttcttggagac 3328552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 18552887 - 18553041
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||| ||||||     
T  18552887 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc---ttggtgtatttgttc 18552983  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact 162  Q
    ||| ||||| ||| |||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18552984 ctttctttcattgattatctttattgctttg-attatgtttgtggtgttgctctacact 18553041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27038239 - 27038100
Alignment:
Q  142 cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatc 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  27038239 cttgtggtgttgctctacacttagatctagatctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacattgattacca-tttcatttgctccacacatc 27038141  T
Q  240 tttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    || ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  27038140 ttagttattcattggtgtgattttttaccgaattcacaaca 27038100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 2672952 - 2673015
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2672952 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 2673015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 2677108 - 2677171
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2677108 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 2677171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8512281 - 8512218
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8512281 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 8512218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8517161 - 8517098
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8517161 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 8517098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32475549 - 32475486
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32475549 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 32475486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32480407 - 32480344
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32480407 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 32480344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 24695168 - 24695402
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||  | |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  24695168 tgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 24695264  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
     || ||||| ||| |||||||  |||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||| ||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24695265 atttctttcattgtttatctttattgctttg-attatgcttgtg-tgttgctctatacttagatttagctctgtttttgttgttgttgcttgaagacatt 24695362  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatcttt 242  Q
    |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24695363 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatcttt 24695402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25795863 - 25795709
Alignment:
Q  9 gtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc- 106  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  25795863 gtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc--tttggtgtgtttgttca 25795766  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact 162  Q
    || ||||| |||||||| ||  ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  25795765 tttctttcattgcttatttttattg-tttttattatgcttgtggtgttgctctacact 25795709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 1736309 - 1736405
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  1736309 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa---tattggtgtgtttgttc 1736405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37466374 - 37466247
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  37466374 tgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 37466278  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttg 135  Q
     || ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37466277 atttctttcattgcttatctttattgctttg 37466247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47649655 - 47649571
Alignment:
Q  175 tttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47649655 tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttccttttgttccacacatctttgttattcattggtgtga 47649571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Original strand, 47924010 - 47924146
Alignment:
Q  142 cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatc 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  47924010 cttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgt---tgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcc-tttactccacacatc 47924105  T
Q  240 tttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||||| | ||||||||||| ||   |||| ||||||||||    
T  47924106 tttgttattcattggtgtgatttagtaccgaattcacaaca 47924146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1417179 - 1417097
Alignment:
Q  176 ttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  1417179 ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc-tttactccacacatctttattattcattggtgtga 1417097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24968171 - 24968108
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24968171 tggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatctt 24968108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 47923910 - 47924006
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  47923910 tgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 47924006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207935
Alignment:
Q  42 ctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 10207935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8126648 - 8126546
Alignment:
Q  144 tgtggtgttgctctacact-agact-agggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctt 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  8126648 tgtggtgttgctctacacttagatttaggtatgtttttgttgttgttggttggagacattgtatctattgaataccacttcc-tttgctccacacatctt 8126550  T
Q  242 tgtt 245  Q
    ||||    
T  8126549 tgtt 8126546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 38210568 - 38210629
Alignment:
Q  26 gtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210568 gtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Original strand, 3323694 - 3323755
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg 69  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| | || |||||| ||||||||    
T  3323694 tgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 119; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Original strand, 8433 - 8670
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  8433 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttt 8531  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttt-tgttgttgttgcttggagacttttta 204  Q
     | ||||| |||||||||||  ||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  8532 cttctttcattgcttatctttattgttttggttatacttgtggtgttgctctacactagactaggtctgttttttgttgttattgcttggagacacttta 8631  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg 243  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8632 cacattgattaccacttccttttgctccacacatctttg 8670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 43975 - 44225
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43975 tgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 44073  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
     | ||||| |||||||||||  || |||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44074 cttctttcattgcttatctttgtt-ctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactagattaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 44172  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtga 258  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44173 acattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 44225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 36846 - 37085
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36846 tgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 36944  T
Q  107 --ttcctttcttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacacta-gactagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttttt 203  Q
      ||| ||| ||||||||||| | |||||||| |   |||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36945 ctttcttttattgcttatctt-tgtgctttgtttatacttgtggtgttggtctacaccaagtctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacacttt 37043  T
Q  204 actcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttt 246  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37044 acacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttt 37085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 115; Significance: 7e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Original strand, 133294 - 133566
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  133294 tgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 133392  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgtt-gttgttgcttggagacttttta 204  Q
     | ||||| || ||||||||  |||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||||  ||||    
T  133393 cttctttcattacttatctttattgctttgtatatgcttgtgatgttgctctatactagactatgtctgttttgctttgttgttgtttggagacacttta 133492  T
Q  205 ctcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  133493 cacattgattatcacttccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtga-ttttgtccgaattcacaaca 133566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2575 - 2337
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgtt- 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  2575 tgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 2479  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2478 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgttctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacact 2380  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||   |||||| | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  2379 ttatctattgatcaacacttcc-tttgctccacacatctttgtt 2337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5766 - 5487
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5766 tgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtgtttgttc 5670  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgct---tggagac 198  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |   |||||||    
T  5669 ctttctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagac 5571  T
Q  199 tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaa 283  Q
      || ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    | |||||||||||||||    
T  5570 acttaact-attgattaccacttccttta-ctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtctcagattcacaacaaaaa 5487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45336 - 45087
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45336 tgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttc 45238  T
Q  107 ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttac 205  Q
     | ||||| |||||||||||  || ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  45237 attctttcattgcttatctttgtt-ctttgtatatgtttgtggtgttgctctacactagacttggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttac 45139  T
Q  206 tcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacattggtgtga 258  Q
     ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45138 acattgattaccact-tcatttgctccacacatctttgttttaattggtgtga 45087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 279
Target Start/End: Original strand, 300 - 527
Alignment:
Q  58 aggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-gctttgtattctctt---gtggtgttg 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||   ||||| |||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttctttctttctagcttatcttgttttgctttattatctctttgtgtggttttg 398  T
Q  154 ctctacactagactagggctgttttt-gttgttgttgcttggagac--tttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtttacat 250  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||    
T  399 ctcctcactagtttagggctgttttttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgttttcat 498  T
Q  251 tggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  499 tggtgtgagttttaaatggattcacaaca 527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 88; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 85766 - 85495
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||   | | |||||||||||    
T  85766 tgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatc---tagatgtgtttgttc 85670  T
Q  107 -ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttt 202  Q
     || ||||| ||||||||||| | |||||||  |   |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  85669 ttttctttcattgcttatctt-tgtgctttggttatgcttgtgatgttgctctacacttagatctaggtctg-ttttattgttgttgcttggagacactt 85572  T
Q  203 tactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  85571 tacacattgattaccacttcc-tttgctctacacatctttgtttttcattggtgtgatttttaccggaattcacaaca 85495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 35065 - 35309
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  35065 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgt-tttgttct 35162  T
Q  108 tcc-tttcttgcttatcttg-tttgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac--t 199  Q
    ||| |||   |||||||||| |||||||||   |||||   |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  35163 tccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccat 35261  T
Q  200 ttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgttta 247  Q
    || | ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  35262 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgttta 35309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 9645 - 9764
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttct 107  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  9645 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttct 9742  T
Q  108 tcctttcttgcttatcttgttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9743 tcctttcttgcttatcttgttt 9764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10812 - 10558
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  10812 tgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatc---ttggtgtgtttgttc 10716  T
Q  107 ttc-ctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctg-tttttgttgttgttgcttggagactt 200  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||        
T  10715 ctctctttcattgcttatctttattgctttg-attatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagtaac 10617  T
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtga 258  Q
    ||||   || |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10616 tttatctatcgattaccacttctttttgctccacacatctttgttattcattggtgtga 10558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1344 - 1212
Alignment:
Q  154 ctctacacta-gactagggctgtttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg--tttacat 250  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||    
T  1344 ctctacactaagtctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgttttttcat 1246  T
Q  251 tggtgtgagttttaaccggattcacaacaaaaag 284  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  1245 tggtgtgatttttaccagaattcacaacaaaaag 1212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 364
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  427 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 14330 - 14393
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14330 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 14393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 19189 - 19249
Alignment:
Q  30 attggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19189 attggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatctt 19249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 181985 - 182048
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  181985 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 182048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2335
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2272 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 2335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17346 - 17111
Alignment:
Q  8 tgtaacactttcatcatggtggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttg-tt 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  | ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||   |||||||||||||| |     
T  17346 tgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa---ttttggtgtgtttgctc 17250  T
Q  106 cttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacttt 201  Q
    ||| ||||| || ||||||||  |||||||  ||| | ||||||||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||   |||||||| ||    
T  17249 ctttctttcatttcttatctttattgcttt-aattatgcttgtggtgttgctctatacttagatttaggtatgtttttgttgttgt---ttggagacatt 17154  T
Q  202 ttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttgtt 245  Q
    |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17153 ttatctattgattaccacttcc-tttgctccacacatctttgtt 17111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 148977 - 149040
Alignment:
Q  27 tggattggagagctgctctctccctcatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  148977 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 149040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 279
Target Start/End: Original strand, 29699 - 29777
Alignment:
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  29699 tttactcattgattaccacttcc-tttgcttcacacatttttgtttttcattggtgtgatttttgaccgaattcacaaca 29777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43145 - 43067
Alignment:
Q  201 tttactcattgattaccactcccttttgctccacacatctttg-tttacattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 279  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  43145 tttactcattgattaccacttcc-tttgcttcacacatttttgtttttcattggtgtgatttttgaccgaattcacaaca 43067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23443 - 23340
Alignment:
Q  176 ttttgttgttgttgcttggagactttttactcattgattaccactcccttttgctccacacatcttt-gtttacattggtgtgagttttaaccggattca 274  Q
    |||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||| |||| | || |||||    
T  23443 ttttgttgttattgcttgaggatattttactcattgattaccacttcc-tttgctcaacacatctttactttttattggtgtgatttttgatcgaattca 23345  T
Q  275 caaca 279  Q
    |||||    
T  23344 caaca 23340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University