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Alignment Overview

Query: NF4671_high_2 (Length: 281)

Name: NF4671_high_2
Description: NF4671
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4671_high_2
NF4671_high_2
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (19-258)||(22132718-22132958)
chr4 (19-258)||(22134949-22135190)
chr4 (19-258)||(17662557-17662797)
chr4 (19-258)||(24347988-24348228)
chr4 (19-258)||(14787752-14787992)
chr4 (19-258)||(44600157-44600399)
chr4 (19-258)||(5100772-5101011)
chr4 (19-258)||(56030218-56030458)
chr4 (86-258)||(30136344-30136516)
chr4 (137-258)||(47211158-47211279)
chr4 (87-253)||(9022094-9022252)
chr4 (86-201)||(38890517-38890633)
chr4 (86-255)||(10112658-10112815)
chr4 (19-159)||(53404998-53405141)
chr4 (86-180)||(19322547-19322641)
chr4 (133-252)||(9863534-9863650)
chr4 (121-207)||(54929094-54929180)
chr4 (128-207)||(10979676-10979755)
chr4 (19-68)||(18709490-18709539)
chr4 (186-258)||(19322437-19322510)
chr4 (19-68)||(47211065-47211114)
chr4 (210-258)||(38890624-38890672)
chr4 (121-253)||(38209098-38209235)
chr4 (209-258)||(5516771-5516820)
chr4 (168-207)||(14647175-14647214)
chr4 (216-255)||(14789500-14789539)
chr4 (145-204)||(29609838-29609897)
chr4 (206-253)||(54929198-54929245)
chr4 (158-207)||(5516703-5516752)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (19-258)||(746451-746691)
chr3 (19-258)||(25533136-25533374)
chr3 (19-258)||(10621859-10622098)
chr3 (19-258)||(53915813-53916053)
chr3 (19-254)||(457983-458220)
chr3 (19-254)||(455606-455843)
chr3 (19-258)||(1313111-1313350)
chr3 (19-258)||(42989981-42990222)
chr3 (19-258)||(27635944-27636183)
chr3 (19-255)||(4104216-4104451)
chr3 (17-258)||(42991982-42992224)
chr3 (19-255)||(51943074-51943311)
chr3 (19-258)||(53917981-53918221)
chr3 (19-258)||(41848833-41849082)
chr3 (121-204)||(11066346-11066429)
chr3 (132-255)||(54287487-54287627)
chr3 (213-255)||(6561645-6561687)
chr3 (137-202)||(53974011-53974077)
chr3 (204-255)||(53974124-53974175)
chr3 (137-207)||(11072731-11072801)
chr3 (204-255)||(11072666-11072717)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (19-257)||(31735846-31736085)
chr1 (19-258)||(47905985-47906224)
chr1 (19-258)||(24325376-24325616)
chr1 (19-258)||(9463571-9463811)
chr1 (19-258)||(21948512-21948754)
chr1 (19-258)||(27339455-27339701)
chr1 (19-258)||(9459744-9459984)
chr1 (19-254)||(27337263-27337499)
chr1 (86-255)||(15295238-15295407)
chr1 (19-258)||(39931791-39932031)
chr1 (89-258)||(48664881-48665050)
chr1 (19-258)||(28998574-28998815)
chr1 (19-258)||(29004290-29004531)
chr1 (89-255)||(2949617-2949783)
chr1 (19-258)||(17324957-17325198)
chr1 (102-258)||(6115532-6115688)
chr1 (97-258)||(45693834-45693995)
chr1 (95-258)||(4131690-4131853)
chr1 (89-249)||(6996067-6996221)
chr1 (99-258)||(6997243-6997395)
chr1 (19-175)||(46432049-46432207)
chr1 (172-258)||(46432521-46432607)
chr1 (19-163)||(2510649-2510799)
chr1 (134-255)||(16561163-16561284)
chr1 (121-207)||(11693580-11693666)
chr1 (89-153)||(26520516-26520580)
chr1 (86-148)||(6115479-6115541)
chr1 (121-258)||(13785662-13785816)
chr1 (121-204)||(14352759-14352842)
chr1 (19-68)||(48665082-48665131)
chr1 (168-220)||(13112047-13112099)
chr1 (204-250)||(10115509-10115555)
chr1 (158-207)||(32260833-32260882)
chr1 (121-204)||(10115572-10115653)
chr1 (209-256)||(16855265-16855312)
chr1 (19-56)||(2949552-2949589)
chr1 (19-56)||(6996021-6996058)
chr1 (206-255)||(32260768-32260817)
chr1 (19-57)||(42922156-42922194)
chr1 (19-68)||(15295169-15295218)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (19-258)||(15808991-15809231)
chr8 (19-258)||(28283544-28283784)
chr8 (19-258)||(43529900-43530140)
chr8 (19-258)||(3873779-3874022)
chr8 (19-258)||(41384522-41384761)
chr8 (86-255)||(608502-608671)
chr8 (19-258)||(41382448-41382689)
chr8 (129-258)||(32339123-32339252)
chr8 (170-258)||(3265635-3265723)
chr8 (19-136)||(181434-181553)
chr8 (19-68)||(32339272-32339321)
chr8 (19-68)||(24873506-24873555)
chr8 (121-207)||(11701364-11701447)
chr8 (133-204)||(13986214-13986285)
chr8 (206-255)||(13986304-13986352)
chr8 (206-235)||(27820149-27820178)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (19-258)||(11756954-11757194)
chr7 (19-258)||(20299184-20299424)
chr7 (19-258)||(38396015-38396256)
chr7 (19-255)||(1606203-1606440)
chr7 (19-258)||(7351977-7352217)
chr7 (19-258)||(21470614-21470854)
chr7 (19-258)||(3035444-3035687)
chr7 (19-258)||(31156230-31156471)
chr7 (19-255)||(28485293-28485532)
chr7 (19-258)||(7349598-7349838)
chr7 (19-258)||(38393712-38393952)
chr7 (19-255)||(1849697-1849935)
chr7 (19-258)||(7092498-7092739)
chr7 (19-258)||(18345266-18345507)
chr7 (87-258)||(47865357-47865528)
chr7 (19-258)||(28487278-28487519)
chr7 (19-258)||(7472303-7472545)
chr7 (86-258)||(7094814-7094986)
chr7 (19-258)||(20625763-20626004)
chr7 (19-258)||(20629654-20629895)
chr7 (19-258)||(20642073-20642314)
chr7 (19-258)||(21989882-21990121)
chr7 (86-258)||(7470420-7470592)
chr7 (19-255)||(42331318-42331561)
chr7 (19-258)||(37412447-37412687)
chr7 (86-255)||(24258190-24258358)
chr7 (19-218)||(13099795-13099996)
chr7 (19-207)||(43253843-43254035)
chr7 (139-258)||(443355-443474)
chr7 (86-258)||(3677026-3677179)
chr7 (20-183)||(20297163-20297327)
chr7 (121-249)||(40281824-40281952)
chr7 (121-207)||(12310442-12310528)
chr7 (19-56)||(443528-443565)
chr7 (19-68)||(7470345-7470394)
chr7 (204-257)||(10690704-10690756)
chr7 (204-237)||(12310542-12310575)
chr7 (209-241)||(6628852-6628884)
chr7 (210-250)||(12485044-12485084)
chr7 (210-250)||(12506475-12506515)
chr7 (209-241)||(12657667-12657699)
chr7 (160-207)||(12484976-12485023)
chr7 (160-207)||(12506407-12506454)
chr7 (224-258)||(20297127-20297161)
chr7 (86-115)||(443461-443490)
chr7 (19-68)||(3677201-3677250)
chr7 (19-68)||(7094745-7094794)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (19-258)||(18468727-18468967)
chr5 (19-254)||(10586562-10586799)
chr5 (19-258)||(25803736-25803976)
chr5 (19-258)||(3373360-3373601)
chr5 (19-258)||(27910164-27910405)
chr5 (19-258)||(27912248-27912490)
chr5 (19-258)||(15551954-15552195)
chr5 (19-255)||(18511533-18511770)
chr5 (86-258)||(18509706-18509878)
chr5 (19-258)||(26097450-26097693)
chr5 (19-258)||(26098570-26098812)
chr5 (19-207)||(18466453-18466640)
chr5 (19-258)||(18596355-18596607)
chr5 (104-258)||(21288558-21288713)
chr5 (135-255)||(17415748-17415868)
chr5 (89-207)||(15143262-15143373)
chr5 (183-255)||(6661929-6662001)
chr5 (86-154)||(40221340-40221408)
chr5 (208-255)||(40221314-40221361)
chr5 (204-255)||(5779144-5779195)
chr5 (19-56)||(41586025-41586062)
chr5 (206-241)||(2532750-2532785)
chr5 (134-207)||(32520241-32520316)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (19-258)||(12195834-12196075)
chr6 (19-255)||(2629209-2629447)
chr6 (86-258)||(5275727-5275899)
chr6 (19-258)||(30966952-30967193)
chr6 (19-258)||(26932889-26933129)
chr6 (19-255)||(18317783-18318021)
chr6 (19-258)||(30034926-30035167)
chr6 (86-255)||(19704964-19705133)
chr6 (19-258)||(17852295-17852537)
chr6 (90-255)||(17011811-17011973)
chr6 (86-255)||(22858343-22858504)
chr6 (121-255)||(20526578-20526708)
chr6 (121-207)||(30445318-30445404)
chr6 (204-255)||(30445253-30445304)
chr6 (204-255)||(30443046-30443097)
chr6 (121-207)||(30443111-30443195)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (19-258)||(11792-12032)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (19-255)||(42452481-42452719)
chr2 (19-258)||(23452560-23452800)
chr2 (19-255)||(35215915-35216152)
chr2 (19-255)||(35218296-35218533)
chr2 (86-258)||(42923893-42924065)
chr2 (86-255)||(28568556-28568718)
chr2 (86-255)||(27583713-27583875)
chr2 (121-207)||(15693669-15693755)
chr2 (158-255)||(27136368-27136473)
chr2 (192-255)||(34575608-34575671)
chr2 (121-206)||(7502638-7502723)
chr2 (136-207)||(39286971-39287042)
chr2 (86-182)||(34575528-34575617)
chr2 (128-207)||(41304806-41304884)
chr2 (129-207)||(41303457-41303535)
chr2 (204-253)||(15693607-15693655)
chr2 (19-56)||(42923830-42923867)
chr2 (204-240)||(41303549-41303585)
chr2 (212-255)||(28568368-28568411)
chr2 (209-250)||(39286911-39286952)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (19-258)||(51738-51978)
scaffold0005 (216-255)||(50191-50230)
scaffold0005 (168-207)||(170076-170115)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (19-255)||(1767-2005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (19-258)||(78912-79154)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (172-258)||(2070-2156)
scaffold0468 (86-144)||(2022-2080)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (139-255)||(4578-4694)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (193-258)||(1-66)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (134-204)||(57836-57905)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (209-250)||(2232-2273)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (19-57)||(16137-16175)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 22132718 - 22132958
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132718 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 22132816  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132817 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 22132916  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22132917 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 22132958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 22134949 - 22135190
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22134949 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgaatcaaa 22135047  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135048 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 22135147  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22135148 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 22135190  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 17662557 - 17662797
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662557 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 17662655  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662656 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcgtacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 17662755  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17662756 tttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 17662797  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24348228 - 24347988
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348228 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacattgaa-gatactttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 24348130  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24348129 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc-gcacaaaatat 24348031  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24348030 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 24347988  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 14787752 - 14787992
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787752 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 14787850  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14787851 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaccacaaaatata 14787950  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14787951 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctcca 14787992  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 44600157 - 44600399
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| |            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600157 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacaaataccacactgaa-gattcgttttttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 44600255  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44600256 aaatataatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatata 44600355  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44600356 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 44600399  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5101011 - 5100772
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | | || |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101011 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccagattgaa-gatacgttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 5100913  T
Q  118 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100912 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 5100813  T
Q  218 ttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5100812 ttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 5100772  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 56030458 - 56030218
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||  || |||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56030458 tatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaaagaataccacaccgaa-gatacttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcaccaaaa 56030360  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030359 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 56030260  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56030259 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 56030218  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30136516 - 30136344
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  30136516 ctccttcaatgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattctcttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttatt 30136417  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30136416 gtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 30136344  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 137 - 258
Target Start/End: Original strand, 47211158 - 47211279
Alignment:
Q  137 atatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211158 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttgagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 47211257  T
Q  237 ttttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  47211258 tttttagcaacaatattctcca 47211279  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9022252 - 9022094
Alignment:
Q  87 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattg 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  9022252 tcctttagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattcccttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcatacggtagaaaaatatatttattg 9022160  T
Q  187 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatatt 253  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9022159 tc-ataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatcatttatattttcaacaacaatatt 9022094  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 38890517 - 38890633
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatt-ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttat 184  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38890517 ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacaatacaaaaatatatttat 38890616  T
Q  185 tgtccataaatatattt 201  Q
    |||||||||||||||||    
T  38890617 tgtccataaatatattt 38890633  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10112815 - 10112658
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||       ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10112815 ctcctttagtgaaataatatttgcatcaaa-------tattctctttcaaa-tatatttacatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttatt 10112724  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10112723 gtccataaatatagtttcagcacaaaatatatttgaaac----cttttatatttttagcaacaatattct 10112658  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 53405141 - 53404998
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||            |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53405141 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaaa-atacgtttttttttttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaa 53405043  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 159  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405042 aaatataatttttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 53404998  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19322641 - 19322547
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||    
T  19322641 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcctttatacagtacaaaaatatat 19322547  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9863650 - 9863534
Alignment:
Q  133 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9863650 caaaatatatttgcatcaaatcttccttcatgc---acaaaaatatatttattgttcataaatatatttttagcacaaaatatgtttgaaacaaatcatt 9863554  T
Q  233 tatattttcagcaacaatat 252  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  9863553 tatatttttagtaacaatat 9863534  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 54929094 - 54929180
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54929094 aatattcctattaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattttttgtccataaatatattttcagca 54929180  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10979755 - 10979676
Alignment:
Q  128 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10979755 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacagcacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagca 10979676  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 18709490 - 18709539
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18709490 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacact 18709539  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19322510 - 19322437
Alignment:
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagc-aacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19322510 gtccataaatatattttcagtataaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaaaaaatattctcca 19322437  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 47211065 - 47211114
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47211065 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacact 47211114  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 258
Target Start/End: Original strand, 38890624 - 38890672
Alignment:
Q  210 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890624 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 38890672  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 253
Target Start/End: Original strand, 38209098 - 38209235
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaa-atatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttat--tgtccataaatatattttc--agcacaaaatat 215  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||  | || | ||  || || |   ||||||||||||    
T  38209098 aatattccttttcaaatatatatttgcatcaaatcttccttcatacagtacaaaaatatatttatattttcaacaacaatcttcttgaagcacaaaatat 38209197  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatatt 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38209198 atttaaaacaaatcttttatatttttaacaacaatatt 38209235  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 258
Target Start/End: Original strand, 5516771 - 5516820
Alignment:
Q  209 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5516771 aaaatatatttgaaacaattcatttatatttttagcaacaatattctcca 5516820  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 14647175 - 14647214
Alignment:
Q  168 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647175 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 14647214  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 255
Target Start/End: Original strand, 14789500 - 14789539
Alignment:
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14789500 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattct 14789539  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 204
Target Start/End: Original strand, 29609838 - 29609897
Alignment:
Q  145 gcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 204  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  29609838 gcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactcttcataaatatattttca 29609897  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 54929198 - 54929245
Alignment:
Q  206 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatatt 253  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54929198 cacaaaatacatttaaatcaaatcttttatatttttagcaacaatatt 54929245  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 5516703 - 5516752
Alignment:
Q  158 cttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  5516703 cttcatacgataaaaaaatatatttattatctataaatatatttttagca 5516752  T

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Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 746691 - 746451
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746691 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 746593  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746592 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 746493  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  746492 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 746451  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25533374 - 25533136
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533374 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttagaacaaatatcacactgaa-gatacgtttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaat 25533276  T
Q  119 ataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533275 ataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatt 25533176  T
Q  219 tgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25533175 tgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 25533136  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 10621859 - 10622098
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621859 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 10621957  T
Q  118 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10621958 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaatatatat 10622057  T
Q  218 ttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10622058 ttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 10622098  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 53915813 - 53916053
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915813 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactcaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 53915911  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915912 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 53916011  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53916012 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 53916053  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 458220 - 457983
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458220 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 458122  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  458121 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccacaaatatattttcagcacaaaatat 458022  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  458021 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattc 457983  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 455843 - 455606
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455843 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccgcactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 455745  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  455744 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccacaaatatattttcagcacaaaatat 455645  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  455644 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattc 455606  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1313350 - 1313111
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313350 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaatatcacactaaa-gatactttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 1313252  T
Q  118 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1313251 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacagaaatatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatat 1313152  T
Q  218 ttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1313151 ttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaatattctcca 1313111  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42990222 - 42989981
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990222 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacattttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 42990124  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42990123 aatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatactttcagcaaaaaatat 42990024  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42990023 atttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctcca 42989981  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 27635944 - 27636183
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaag-tataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 117  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635944 tatatttgtagtaaaaaatataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacatttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 27636042  T
Q  118 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636043 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 27636142  T
Q  218 ttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27636143 ttgaaactaatattttatatttttagcaacaatattctcca 27636183  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 4104216 - 4104451
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4104216 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgatacgtt-ttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaat 4104314  T
Q  119 ataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4104315 ataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcataaagtatatt 4104414  T
Q  219 tgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4104415 tgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 4104451  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42992224 - 42991982
Alignment:
Q  17 tatatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992224 tatatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaattaatattacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 42992126  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992125 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 42992026  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42992025 tatttgaaacaaaccttttatatttttaacaacaatattctcca 42991982  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51943311 - 51943074
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||          |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51943311 tatatttatagtaaaagtataaatcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgtttttctttctccttcaatgaaagaatatttacatcaaaa 51943213  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943212 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 51943113  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51943112 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 51943074  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 53917981 - 53918221
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| || |||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53917981 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacgaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaa 53918079  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  53918080 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaaaaaaatatatttattgtccataaatatatgttcaacacaaaatata 53918179  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53918180 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 53918221  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41849082 - 41848833
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatac-----------nnnnnnnnctccttcagtgaaagaatattt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||                   ||| |||||| |||||||||||    
T  41849082 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacact-gaagatacgttttttttttttttttttctctttcagttaaagaatattt 41848984  T
Q  108 gcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848983 gcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 41848884  T
Q  208 caaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41848883 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 41848833  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11066429 - 11066346
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 204  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11066429 aatattctctttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtaaaaaaatatatttattgtccataaatgtattttca 11066346  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 255
Target Start/End: Original strand, 54287487 - 54287627
Alignment:
Q  132 tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca-----------------gcacaaaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||                 |||| |||||    
T  54287487 tcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacagtacaaaaatgtatttattatccataaatatattttcaacagcaatcttttggaagcacgaaata 54287586  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54287587 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatcttct 54287627  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6561687 - 6561645
Alignment:
Q  213 tatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6561687 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 6561645  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Original strand, 53974011 - 53974077
Alignment:
Q  137 atatatttgcatcaaatcgttctt-catgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 202  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974011 atatatttgcatcaaatcttcctttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 53974077  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 53974124 - 53974175
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  53974124 agcacaaaatataattgaaacaaatcttttatatttttaacaacaacattct 53974175  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11072801 - 11072731
Alignment:
Q  137 atatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||||||||||||||| | | | || || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11072801 atatatttgcatcaaatcttccgtaatacggtacaaaaatctatttgttgtccataaatgtattttcagca 11072731  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11072717 - 11072666
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  11072717 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatattttttgcaacaatcttct 11072666  T

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Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 31735846 - 31736085
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735846 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 31735944  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735945 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 31736044  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31736045 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcc 31736085  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47906224 - 47905985
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47906224 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatactttttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaa 47906126  T
Q  118 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906125 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatat 47906026  T
Q  218 ttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47906025 ttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 47905985  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24325616 - 24325376
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325616 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactaaa-gatacatttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 24325518  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24325517 atataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatata 24325418  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24325417 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 24325376  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 9463571 - 9463811
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9463571 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaatgaa-gatacgtttttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaa 9463669  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463670 atataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgatataaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 9463769  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9463770 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 9463811  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 21948512 - 21948754
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||            ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21948512 tatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgttttttttttcctccttctgtgaaagaatatttgcatcaa 21948610  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948611 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 21948710  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948711 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 21948754  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 27339455 - 27339701
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnct----ccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||         |    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27339455 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttcttttttttttccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 27339553  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataa----atatattttcagcacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  27339554 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatatattttcagcacaa 27339653  T
Q  211 aatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27339654 aatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 27339701  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 9459744 - 9459984
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9459744 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaatgaa-gatacgtttttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaa 9459842  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459843 atataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 9459942  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9459943 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 9459984  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 27337263 - 27337499
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnct--ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||         |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27337263 tatatttatagtaaaagtataacgcataaatttggaacaaataccaca-tcgaagatacgtttttttttttccttcagttaaagaatatttgcatcaaaa 27337361  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337362 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 27337461  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattc 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27337462 tttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattc 27337499  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Original strand, 15295238 - 15295407
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15295238 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 15295337  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295338 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 15295407  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39932031 - 39931791
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||          |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39932031 tatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacgaatactacactgaa-gatacgtttttttttctccttcaataaaagaatatttgcatcaaaa 39931933  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931932 gtataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 39931833  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39931832 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 39931791  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48665050 - 48664881
Alignment:
Q  89 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48665050 cttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatgtgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtc 48664951  T
Q  189 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48664950 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 48664881  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 28998574 - 28998815
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998574 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaat-atacggtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 28998672  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998673 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 28998772  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28998773 attttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctcca 28998815  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 29004290 - 29004531
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004290 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaat-atacggtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 29004388  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004389 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 29004488  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29004489 attttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctcca 29004531  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 255
Target Start/End: Original strand, 2949617 - 2949783
Alignment:
Q  89 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2949617 cttcagtgaaagaatatttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacaatacaaaaatatatttattgtc 2949716  T
Q  189 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2949717 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 2949783  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 17324957 - 17325198
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || |||||           |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17324957 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaatatcaccctgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaa 17325055  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17325056 aatataatattcccttgcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaactcaaaatat 17325155  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17325156 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 17325198  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 102 - 258
Target Start/End: Original strand, 6115532 - 6115688
Alignment:
Q  102 atatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115532 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 6115631  T
Q  202 tcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6115632 tcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 6115688  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 258
Target Start/End: Original strand, 45693834 - 45693995
Alignment:
Q  97 aaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaata 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693834 aaagaatatttgcataaaaaatatattattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaata 45693933  T
Q  197 tattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45693934 tatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 45693995  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 95 - 258
Target Start/End: Original strand, 4131690 - 4131853
Alignment:
Q  95 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattta-ttgtccataa 193  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4131690 tgaaagaatatttgcatcaaaa-tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatttgtccataa 4131788  T
Q  194 atatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4131789 atatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 4131853  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6996221 - 6996067
Alignment:
Q  89 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  6996221 cttcagtgaaagaatatttgcaacaaaaatataatattccctttcaa------tttacatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatgtattgtc 6996128  T
Q  189 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6996127 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaagtcttttatatttttagcaacaa 6996067  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6997395 - 6997243
Alignment:
Q  99 agaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997395 agaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaa------tttgcatcaaatcgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataa-tata 6997303  T
Q  199 ttttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6997302 tttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctcca 6997243  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 46432049 - 46432207
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432049 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacagtgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 46432147  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46432148 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaa 46432207  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 258
Target Start/End: Original strand, 46432521 - 46432607
Alignment:
Q  172 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46432521 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 46432607  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 2510649 - 2510799
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-------ctccttcagtgaaagaatatttgcat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||               ||||||||||||||||||||||||||    
T  2510649 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaaa-atacgttttttttctttccctccttcagtgaaagaatatttgcat 2510747  T
Q  112 caaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510748 caaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 2510799  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16561284 - 16561163
Alignment:
Q  134 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 233  Q
    ||||||||||||  ||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16561284 aaaatatatttgtttcaaatattccttcatacggtacaaaaagatatttattgtcaataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatatttt 16561185  T
Q  234 atattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  16561184 atatttttagcaacaatattct 16561163  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 11693580 - 11693666
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11693580 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 11693666  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Original strand, 26520516 - 26520580
Alignment:
Q  89 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520516 cttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 26520580  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 148
Target Start/End: Original strand, 6115479 - 6115541
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115479 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 6115541  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 258
Target Start/End: Original strand, 13785662 - 13785816
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca------------- 207  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||                 
T  13785662 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttactatctataaatatattttcagcaacaatattctaga 13785761  T
Q  208 ----caaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  13785762 aacacaaaatatatttgaaacaaatctttcatatttttagcgacaatattctcca 13785816  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14352842 - 14352759
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14352842 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactattcataaatatattttca 14352759  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 48665131 - 48665082
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  48665131 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatactacact 48665082  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 13112047 - 13112099
Alignment:
Q  168 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13112047 tacaaaaatatatttattgtccatgaatatattttcagcataaaatacatttg 13112099  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10115555 - 10115509
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10115555 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaat 10115509  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32260882 - 32260833
Alignment:
Q  158 cttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32260882 cttcatacggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 32260833  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10115653 - 10115572
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115653 aatattccgtttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacgggataaaa--atatttattgtccataaatatattttca 10115572  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 256
Target Start/End: Original strand, 16855265 - 16855312
Alignment:
Q  209 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  16855265 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttctgcatcaatcttctc 16855312  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 2949552 - 2949589
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 56  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949552 tatatttattgtaaaagtataactcataaatttggaac 2949589  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 6996021 - 6996058
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 56  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6996021 tatatttataataaaagtataactcataaatttggaac 6996058  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32260817 - 32260768
Alignment:
Q  206 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32260817 cacaaaatatattttaaacaattcttttatatttttagcaacaatcttct 32260768  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 42922194 - 42922156
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaaca 57  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42922194 tatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaaca 42922156  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 15295169 - 15295218
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15295169 tatatttatagtaaacatataactcataaattaggaacgaataccacact 15295218  T

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Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15809231 - 15808991
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809231 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 15809133  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15809132 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatata 15809033  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15809032 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 15808991  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 28283544 - 28283784
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283544 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatattacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 28283642  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283643 atataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 28283742  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28283743 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctcca 28283784  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43530140 - 43529900
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||          ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43530140 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaataaataccacactgaa-gatacttttttttttctccttcagtgaaagaatattagcataaaaa 43530042  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530041 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 43529942  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43529941 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 43529900  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3874022 - 3873779
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874022 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaa-gatatgtttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 3873924  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtt-cttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaat 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873923 aaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaat 3873824  T
Q  214 atatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3873823 atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 3873779  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41384761 - 41384522
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnct--ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||         |  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41384761 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgtttttttttttccttcaatgaaagaatatttgcat-aaaa 41384664  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41384663 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagtataaaatata 41384564  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41384563 ttcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 41384522  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 608671 - 608502
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  608671 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaatatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 608572  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  608571 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 608502  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41382689 - 41382448
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||           ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41382689 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgttttttttttctcattcagtgaaagaatatttgcataaaa 41382591  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41382590 aatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttgttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagtataaaatat 41382491  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41382490 attcgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattctcca 41382448  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32339252 - 32339123
Alignment:
Q  129 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339252 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 32339153  T
Q  229 cttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32339152 cttttatatttttagcaacaatattctcca 32339123  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 258
Target Start/End: Original strand, 3265635 - 3265723
Alignment:
Q  170 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3265635 caaacatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 3265723  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 181553 - 181434
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnct---ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||        ||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  181553 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgtttttttcttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaa 181455  T
Q  116 aatataatattccctttcaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  181454 aatataatattccctttcaaa 181434  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 32339321 - 32339272
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32339321 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacact 32339272  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 24873506 - 24873555
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24873506 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatacaacact 24873555  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 11701364 - 11701447
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||  ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11701364 aatattccctttaaaaatatatttacatcaattc-ttc--catacggtacaaaaatatatttactgaccataaatatattttcagca 11701447  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Original strand, 13986214 - 13986285
Alignment:
Q  133 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  13986214 caaaatatatttgcatcaaatcttctttcatgcggtacaaaaatttattaactatccataaatatattttca 13986285  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Original strand, 13986304 - 13986352
Alignment:
Q  206 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  13986304 cacaaaatatatttaaaacaaatc-tttatatttttagcaacaatcttct 13986352  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 235
Target Start/End: Original strand, 27820149 - 27820178
Alignment:
Q  206 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820149 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 27820178  T

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Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11757194 - 11756954
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757194 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 11757096  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757095 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 11756996  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11756995 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 11756954  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20299424 - 20299184
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299424 tatatttatagtaaaagtataactcataaatatggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 20299326  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299325 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 20299226  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20299225 tttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 20299184  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38396256 - 38396015
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396256 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 38396158  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396157 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtacataaatatattttcagcacaaaatat 38396058  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38396057 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 38396015  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1606440 - 1606203
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606440 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gattcgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 1606342  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1606341 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatata 1606242  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1606241 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 1606203  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 7351977 - 7352217
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||          ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7351977 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacactgaa-gatacgtttttttttctcattcagtgaaagaatatttgcctcaaaa 7352075  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7352076 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatata 7352175  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7352176 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 7352217  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 21470614 - 21470854
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470614 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 21470712  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470713 atataatattccctttcaaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgatataaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 21470812  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21470813 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 21470854  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3035687 - 3035444
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-----ctccttcagtgaaagaatatttgcatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||             ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035687 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccatactgaa-gatacgttttttttctttctccttcagtgaaagaatatttgcatca 3035589  T
Q  114 aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035588 aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaat 3035489  T
Q  214 atatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3035488 atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 3035444  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 31156230 - 31156471
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156230 tatatttatagtaaaagtatagctcataaatttggaacaaataccacactgaa-gattcgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 31156328  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31156329 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatat 31156428  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31156429 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 31156471  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28485532 - 28485293
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||            ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28485532 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtgttttttttcctccttcggtgaaagaatatttgcatcaa 28485434  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485433 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 28485334  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28485333 tatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattct 28485293  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 7349598 - 7349838
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||          ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7349598 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacactgaa-gatacgtttttttttctcattcagtgaaagaatatttgcctcaaaa 7349696  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7349697 atataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatata 7349796  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7349797 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 7349838  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38393952 - 38393712
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnctc--cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||         ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393952 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttattttttcaccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 38393854  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38393853 atataacattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaataaattttcagcacaaaatata 38393754  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38393753 tttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattctcca 38393712  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1849935 - 1849697
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |           |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1849935 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gattcgttttttttttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaa 1849837  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849836 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 1849737  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1849736 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 1849697  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 7092498 - 7092739
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092498 tatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacaattttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 7092596  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7092597 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaaaatat 7092696  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7092697 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 7092739  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18345507 - 18345266
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345507 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 18345409  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18345408 aatataatattccatttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtcaataaatatatttttagcacaaaatat 18345309  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18345308 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 18345266  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47865528 - 47865357
Alignment:
Q  87 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47865528 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattg 47865429  T
Q  187 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47865428 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 47865357  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28487519 - 28487278
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487519 tatatttataggaaaagtataactcataaatttagaacaaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 28487421  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487420 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaattatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 28487321  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28487320 atttgaagcaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 28487278  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 7472303 - 7472545
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||            |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7472303 tatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaa 7472401  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472402 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgatacaataatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 7472501  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7472502 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 7472545  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Original strand, 7094814 - 7094986
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7094814 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7094913  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094914 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 7094986  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20626004 - 20625763
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatac---nnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20626004 tatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacact-gaagatacgtttttttttgctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaa 20625906  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625905 aatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 20625806  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20625805 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 20625763  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20629895 - 20629654
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatac---nnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20629895 tatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacact-gaagatacgtttttttttgctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaa 20629797  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629796 aatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 20629697  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20629696 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 20629654  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20642314 - 20642073
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatac---nnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||           |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20642314 tatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacact-gaagatacgtttttttttgctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaa 20642216  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642215 aatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 20642116  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20642115 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 20642073  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21990121 - 21989882
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990121 tatatttatagtaaaattataactcataaatttggaacgaataccacac-agaagatacgtttttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 21990023  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  21990022 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca--acacaatat 21989925  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21989924 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 21989882  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Original strand, 7470420 - 7470592
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7470420 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 7470519  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7470520 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatgttttatatttttagcaataatattctcca 7470592  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 42331318 - 42331561
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--------ctccttcagtgaaagaatatttgca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||                |||||||| ||||||||||||||||    
T  42331318 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaa-gatacgtttttttttttctttctccttcaatgaaagaatatttgca 42331416  T
Q  111 tcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331417 tcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatacttattgtccataaatatattttcagcacaa 42331516  T
Q  211 aatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42331517 aatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 42331561  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 37412447 - 37412687
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||          ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37412447 tatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaacgaataacacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtggaagaatatttgcatcaaaa 37412545  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412546 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgttacataattatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 37412645  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37412646 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 37412687  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24258358 - 24258190
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24258358 ctccttcagtgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa-tcgtccttcatactgtacaaaaatatatttatt 24258260  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24258259 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 24258190  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 13099795 - 13099996
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099795 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 13099893  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099894 aatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacggtacgaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 13099993  T
Q  216 att 218  Q
    |||    
T  13099994 att 13099996  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 43253843 - 43254035
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-----ctccttcagtgaaagaatatttgcatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||             ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253843 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaa-gatactttcttattttttctccttcagtgaaagaatatttgcatca 43253941  T
Q  114 aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43253942 aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttttagca 43254035  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 443474 - 443355
Alignment:
Q  139 atatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443474 atatttgcatcaaattgttcttcagacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 443375  T
Q  239 ttcagcaacaatattctcca 258  Q
    || |||||||||||||||||    
T  443374 tttagcaacaatattctcca 443355  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3677179 - 3677026
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||           
T  3677179 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatat------- 3677087  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3677086 ------------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 3677026  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20297327 - 20297163
Alignment:
Q  20 atatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaa 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||          ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20297327 atatttttagtaaaagtataactcgtaaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaa 20297229  T
Q  118 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattta 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20297228 tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattta 20297163  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 249
Target Start/End: Original strand, 40281824 - 40281952
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttg 220  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | |||||||  |  ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40281824 aatattccttttaaaaatatatccgtatcaaatattctttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatattttcaacacaaaatatatttg 40281923  T
Q  221 aaacaaatcttttatattttcagcaacaa 249  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40281924 aaacaaatattttatatttttagcaacaa 40281952  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 12310442 - 12310528
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||    
T  12310442 aatattccttttaaaaatatatttacatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattaactgtccttaagtataatttcagca 12310528  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 443565 - 443528
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443565 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 443528  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 7470345 - 7470394
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7470345 tatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacgaataccacact 7470394  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10690756 - 10690704
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcc 257  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10690756 agcacaaaatatatttgaaacata-cttttatatttttagcaacaatcttctcc 10690704  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 237
Target Start/End: Original strand, 12310542 - 12310575
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310542 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatat 12310575  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6628884 - 6628852
Alignment:
Q  209 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628884 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 6628852  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Original strand, 12485044 - 12485084
Alignment:
Q  210 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12485044 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttctacaacaat 12485084  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 250
Target Start/End: Original strand, 12506475 - 12506515
Alignment:
Q  210 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12506475 aaatatatttgaaacaaatcttttatattttctacaacaat 12506515  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 241
Target Start/End: Original strand, 12657667 - 12657699
Alignment:
Q  209 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657667 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 12657699  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 207
Target Start/End: Original strand, 12484976 - 12485023
Alignment:
Q  160 tcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12484976 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12485023  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 207
Target Start/End: Original strand, 12506407 - 12506454
Alignment:
Q  160 tcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12506407 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12506454  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20297161 - 20297127
Alignment:
Q  224 caaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297161 caaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 20297127  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 443490 - 443461
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443490 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 443461  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3677250 - 3677201
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  3677250 tatatttatagtaaaaacataactcataaatttggaacgaatatcacact 3677201  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 7094745 - 7094794
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacact 68  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7094745 tatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacact 7094794  T

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Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18468967 - 18468727
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468967 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatactttttattttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 18468869  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468868 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 18468769  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18468768 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctcca 18468727  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10586799 - 10586562
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586799 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 10586701  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586700 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 10586601  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10586600 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattc 10586562  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25803976 - 25803736
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803976 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatattacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 25803878  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803877 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 25803778  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25803777 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 25803736  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 3373360 - 3373601
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||           |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3373360 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaa 3373458  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3373459 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatat 3373558  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3373559 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 3373601  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27910405 - 27910164
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910405 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatactttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 27910307  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910306 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 27910207  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27910206 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctcca 27910164  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27912490 - 27912248
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912490 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacactgaa-gatacgtttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 27912392  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912391 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 27912292  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27912291 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 27912248  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15552195 - 15551954
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552195 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacgctgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 15552097  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15552096 aatgtcatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaatatat 15551997  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15551996 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 15551954  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 18511533 - 18511770
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511533 tatatttatattaaacatataactcataaatttggaacgaataccacactaaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 18511631  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511632 atataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 18511731  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18511732 ttcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 18511770  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Original strand, 18509706 - 18509878
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18509706 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttatt 18509805  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18509806 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 18509878  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26097693 - 26097450
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097693 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacatttttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 26097595  T
Q  116 aatataatattccctt--tcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaat 213  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26097594 aatataacatttccttcttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagtacaaaat 26097495  T
Q  214 atatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26097494 atatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctcca 26097450  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 26098570 - 26098812
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || |||||            |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  26098570 tatatttatagtaaaagtataactcataaaattggaacgaataccacattgaa-gatacgtttttttatttctccttcaatgaaagaatttttgtatcaa 26098668  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098669 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 26098768  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26098769 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctcca 26098812  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18466640 - 18466453
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18466640 tatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gatacttttttttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaat 18466542  T
Q  119 ataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466541 ataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttttagca 18466453  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18596607 - 18596355
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||           |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18596607 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgatagaatatttgtatcaaa 18596509  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttat-----------tgtccataaatatattttca 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||    
T  18596508 aatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatggtatatttattgtccataaatatattttca 18596409  T
Q  205 gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18596408 acacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 18596355  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21288713 - 21288558
Alignment:
Q  104 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgataca-aaaatatatttattgtccataaatatatttt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288713 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcataaaatcgttcttcatacggtaccgaaaatatatttattgtccataaatatatttt 21288614  T
Q  203 cagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21288613 cagcacaaaatatattttaaacaaatcttttttatttttagcaacaatattctcca 21288558  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 255
Target Start/End: Original strand, 17415748 - 17415868
Alignment:
Q  135 aaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 234  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415748 aaatatatttgcatcaaattttccttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttta 17415847  T
Q  235 tattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  17415848 tatttttagcaacaatattct 17415868  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15143373 - 15143262
Alignment:
Q  89 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  15143373 cttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatgtatttattgtc 15143281  T
Q  189 cataaatatattttcagca 207  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  15143280 cataaatatatttttagca 15143262  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 6661929 - 6662001
Alignment:
Q  183 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6661929 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattct 6662001  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40221408 - 40221340
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40221408 ctcctgcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgaaacaaatc 40221340  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40221361 - 40221314
Alignment:
Q  208 caaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40221361 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 40221314  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 5779144 - 5779195
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  5779144 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatcttct 5779195  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 41586025 - 41586062
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41586025 tatatttatagtaaaagtataactcatagatttggaac 41586062  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 241
Target Start/End: Original strand, 2532750 - 2532785
Alignment:
Q  206 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttc 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2532750 cacaagatatatttgaaacaaatcttttatattttc 2532785  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32520316 - 32520241
Alignment:
Q  134 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatata--tttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||    
T  32520316 aaaatatgtttgcatcaaatttttcttcgtacggtacaaaaatatatttttactctacataaatatattttcagca 32520241  T

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Target: chr6 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 12195834 - 12196075
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195834 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gattcgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 12195932  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12195933 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatat 12196032  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12196033 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 12196075  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 2629209 - 2629447
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629209 tatatttatagtaaaagtataactaataaatttggaacaaatactacactgaa-gatacgtttttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 2629307  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629308 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 2629407  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2629408 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 2629447  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Original strand, 5275727 - 5275899
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5275727 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 5275826  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5275827 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 5275899  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30967193 - 30966952
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967193 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa-gattcgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 30967095  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967094 aatataatattcgctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 30966995  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30966994 atttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 30966952  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 26932889 - 26933129
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| |          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932889 tatatttatagtgaaagtataacccataaatttggaacaaataccacactgaa-gattcgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 26932987  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  26932988 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataataatattttcagcacaatatata 26933087  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26933088 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 26933129  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18318021 - 18317783
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||           |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18318021 tatatttatagtgaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaa 18317923  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317922 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 18317823  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18317822 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 18317783  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 30034926 - 30035167
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||           |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30034926 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacattgaa-gatacgtttttattttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaa 30035024  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30035025 aatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtctataaatatatttttagcacaaaatat 30035124  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30035125 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 30035167  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Original strand, 19704964 - 19705133
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19704964 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 19705063  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19705064 gtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 19705133  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17852537 - 17852295
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn-----ctccttcagtgaaagaatatttgcatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||             ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17852537 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacacgaa--gatacttttttttttcttctctttcagtgaaataatatttgcatca 17852440  T
Q  114 aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  17852439 aaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcataaggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcataaa-- 17852342  T
Q  214 atatttgaaacaaatcttttatattttcagca--acaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  17852341 atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacacaatattctcca 17852295  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17011973 - 17011811
Alignment:
Q  90 ttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtcc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17011973 ttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccatcatacggtacaaaaatatatttattgtcc 17011874  T
Q  190 ataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17011873 ataaatatattttctacacaaa--atatttaaaacaaa-cttttatatttttagcaataatattct 17011811  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Original strand, 22858343 - 22858504
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  22858343 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaa--------ttccctttcaaaatatatttgcatctaatcttctttcatacggtacaaaaatatatttatt 22858434  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22858435 gtccataaatatattttcagcacaaagtatatttaaaacaaatcttttatatttttattaacaatattct 22858504  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20526708 - 20526578
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaa-tatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattt 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20526708 aatattctctttcaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatgta-----cataaatatattttcagcataaaatatattt 20526614  T
Q  220 gaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20526613 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 20526578  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30445404 - 30445318
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30445404 aatattcctttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 30445318  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30445304 - 30445253
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  30445304 agcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttctagcaacaatattct 30445253  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30443097 - 30443046
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  30443097 agcaaaaaatatatttgaaacaaatctcttatatttttaacaacaatattct 30443046  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30443195 - 30443111
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| | ||| || || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30443195 aatatttcttttaaaaatacatttgcatcaaatcttcctttatacggtacaaacatatattt--tgtccataaatatattttcagca 30443111  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 11792 - 12032
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11792 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 11890  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11891 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 11990  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11991 tttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctcca 12032  T

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Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42452719 - 42452481
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452719 tatatttataataaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaa-gatacattttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 42452621  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452620 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 42452521  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42452520 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 42452481  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Original strand, 23452560 - 23452800
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452560 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagg-tacttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 23452658  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23452659 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatttattttcagcataaaatata 23452758  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23452759 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 23452800  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 35215915 - 35216152
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |          |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215915 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaa-gattcatttttttttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaa 35216013  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216014 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 35216113  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35216114 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 35216152  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 35218296 - 35218533
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||| |          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218296 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggagcaaataccacactgaa-gattcgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 35218394  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218395 atataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 35218494  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35218495 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 35218533  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Original strand, 42923893 - 42924065
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42923893 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt 42923992  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42923993 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 42924065  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Original strand, 28568556 - 28568718
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  28568556 ctccttcggtgaaagaatatatgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcacacgatacaaaaatatatttatt 28568648  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28568649 gtccataaatatattttcaaaacaaaatatatttgaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattct 28568718  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 255
Target Start/End: Original strand, 27583713 - 27583875
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  | || |||||||||||||||    
T  27583713 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccttttcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtataaaaatatatttatt 27583805  T
Q  186 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583806 gttcataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 27583875  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15693755 - 15693669
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15693755 aatatcccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgcccataaatatattttcagca 15693669  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 255
Target Start/End: Original strand, 27136368 - 27136473
Alignment:
Q  158 cttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatat--------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaa 249  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27136368 cttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatatttatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaccaa 27136467  T
Q  250 tattct 255  Q
    ||||||    
T  27136468 tattct 27136473  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 255
Target Start/End: Original strand, 34575608 - 34575671
Alignment:
Q  192 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575608 aaatatattttcagcacaaaatatatttagaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 34575671  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7502723 - 7502638
Alignment:
Q  121 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct-tcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagc 206  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7502723 aatatttcctttaaaaatatatttgcatcaaatc-ttctgtcatacaatacaaaaatatttttattgttcataaatatattttcagc 7502638  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39287042 - 39286971
Alignment:
Q  136 aatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39287042 aatatatttgcatcaaatcttcattcatatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttaagca 39286971  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 182
Target Start/End: Original strand, 34575528 - 34575617
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatattt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  | |||||||||||||||    
T  34575528 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaattttcctttatatggtacaaaaatatattt 34575617  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Original strand, 41304806 - 41304884
Alignment:
Q  128 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  41304806 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatg-tacaaaaatatatttactatccataaatatattgtcagca 41304884  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Original strand, 41303457 - 41303535
Alignment:
Q  129 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || | |||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41303457 ctttaaaaatatatttgaatcaattcttccttcacacggtacaaaattatatttactgtccataaatatattttcagca 41303535  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15693655 - 15693607
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatatt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15693655 agcacaaaatatatttgaaacaaatc-tttatatttttagcaacaatatt 15693607  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 42923830 - 42923867
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923830 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 42923867  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 240
Target Start/End: Original strand, 41303549 - 41303585
Alignment:
Q  204 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41303549 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 41303585  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28568411 - 28568368
Alignment:
Q  212 atatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28568411 atatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattct 28568368  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39286952 - 39286911
Alignment:
Q  209 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39286952 aaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaat 39286911  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51978 - 51738
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn--ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51978 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgtttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 51880  T
Q  117 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51879 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaccacaaaatata 51780  T
Q  217 tttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51779 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctcca 51738  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50230 - 50191
Alignment:
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50230 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattct 50191  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 170115 - 170076
Alignment:
Q  168 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170115 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 170076  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1767
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||           |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2005 tatatttatagtgaaagtataacttataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaa 1907  T
Q  116 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906 aatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 1807  T
Q  216 atttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1806 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 1767  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 79154 - 78912
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacagataccacactaaaagatacnnnnnnnn----ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79154 tatatttatagtaaaggtataactcataaatttggaacgaataccacactgaa-gatacattttttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 79056  T
Q  115 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  79055 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttattatccataaatatatttttagcagaaaata 78956  T
Q  215 tatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  78955 tatttgagacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 78912  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 258
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2156
Alignment:
Q  172 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2070 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 2156  T

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Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2080
Alignment:
Q  86 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatattt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2022 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatattt 2080  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4578
Alignment:
Q  139 atatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 238  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4694 atatttgcatcaaattgtccttcatacagtacaaaaatatatatattgtccataaatatattttcagcacgaaatatattcgaaacaaatcttttatatt 4595  T
Q  239 ttcagcaacaatattct 255  Q
    || ||||||||||||||    
T  4594 tttagcaacaatattct 4578  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Original strand, 1 - 66
Alignment:
Q  193 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaatattctcca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctcca 66  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 204
Target Start/End: Original strand, 57836 - 57905
Alignment:
Q  134 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  57836 aaaatatatttgcatcaaatt-ttcttcatacggtacaaaaatatatttattgttcatacatatattttca 57905  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Original strand, 2232 - 2273
Alignment:
Q  209 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttcagcaacaat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2232 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttctgcaacaat 2273  T

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Target: scaffold0224 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Original strand, 16137 - 16175
Alignment:
Q  19 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaaca 57  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16137 tatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaaca 16175  T

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