View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4681-Insertion-2 (Length: 704)

Name: NF4681-Insertion-2
Description: NF4681
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4681-Insertion-2
NF4681-Insertion-2
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (34-702)||(6140532-6141200)
chr3 (14-702)||(13271668-13272356)
chr3 (34-702)||(6257448-6258116)
chr3 (34-702)||(6167143-6167805)
chr3 (14-702)||(6263908-6264599)
chr3 (14-699)||(6898314-6898999)
chr3 (14-702)||(7748228-7748916)
chr3 (14-699)||(6592471-6593156)
chr3 (131-685)||(6236068-6236622)
chr3 (14-663)||(6915327-6915976)
chr3 (14-702)||(6880742-6881430)
chr3 (14-671)||(6723225-6723882)
chr3 (14-670)||(6850427-6851081)
chr3 (14-544)||(6243543-6244073)
chr3 (567-702)||(6244072-6244207)
chr3 (132-417)||(7586212-7586497)
chr3 (116-516)||(5297073-5297473)
chr3 (198-364)||(5266489-5266655)
chr3 (198-414)||(4390320-4390536)
chr3 (147-360)||(8452991-8453204)
chr3 (131-360)||(8469900-8470129)
chr3 (197-360)||(8570415-8570578)
chr3 (405-664)||(5279276-5279535)
chr3 (147-294)||(6730252-6730399)
chr3 (446-538)||(4390217-4390309)
chr3 (226-330)||(6521626-6521730)
chr3 (236-360)||(6528477-6528601)
chr3 (217-360)||(6481446-6481589)
chr3 (446-664)||(5248814-5249032)
chr3 (196-294)||(6450324-6450422)
chr3 (404-527)||(5262399-5262522)
chr3 (147-334)||(6522972-6523159)
chr3 (584-664)||(8570111-8570191)
chr3 (636-664)||(8588582-8588610)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (552-702)||(35141484-35141634)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (256-367)||(6574779-6574890)
[»] scaffold1643 (1 HSPs)
scaffold1643 (443-526)||(825-908)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 505; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 702
Target Start/End: Original strand, 6140532 - 6141200
Alignment:
Q  34 caaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctgagttccacaaaggatggccct 133  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6140532 caaagaagtcttcaacttccaactcttcaagaaaggcactattaattagaactttctctagggtggattcaatgacgtgagttccacaaaggatggccct 6140631  T
Q  134 tttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaactct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6140632 tttcaagcttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttagttctatatcactgatattagcagccttgggaattgaagcctccaactct 6140731  T
Q  234 tcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  6140732 tcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaagatgatgaggcagggcacttttcaacttgggacattgttttagacaaagctcttgaagcaaag 6140831  T
Q  334 ggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaacatttgatgaataatagccgca 433  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  6140832 ggaaaccttcaaggcataaccattccttccattcagacatatactcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatgcaacatttgatgaattatagctgca 6140931  T
Q  434 aagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacaatgttta 533  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6140932 aaactctgaaccaatgatctctattccatgacagcctgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacagtgtgta 6141031  T
Q  534 catcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctcatga 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141032 catcccaacaattcaagagatactaaattgggtagatgatgatccccaagccaattaggaaagctactacctctgtagtcattgatggtgagcctcatga 6141131  T
Q  634 gatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6141132 ggtttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgtgcttctgttactgagccatccatttctc 6141200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 13272356 - 13271668
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13272356 ggaccattctagatttggaccaaagaagtcttcaacttccagttcttcaagaaagggactactaactagaattttctctagggtgatttcaatgacatga 13272257  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  13272256 gttccacaaaggatggcccttttcaagcttgatggcaattcatttataaaaatgccatcacatctctttagttctatatcactgatattagcagcattag 13272157  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  13272156 gaattgaagcctccaactcttggcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaacgtgctgaggcagagcactcttcaacttgggacaatgcgttat 13272057  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13272056 acaaagctcttgaagcaatgggaaaccttcaagacataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 13271957  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13271956 tttgatggattatagccgcaaaactctgaaccaatgatctctattccatgacagccagaaatggaaagcttctcgagagaaggcaactgcccaagtggtg 13271857  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  13271856 gcaactgggaacagagtttacatcccaacaattcaagagatactaaattgggtagatgatgatccccaagccaatttggaaagctactacctctgtagtc 13271757  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13271756 attgatggtgagtctcatgaggtgtctatttggttgaagagcttccaagaccgagacacgtgcttcagttactaagccatccatttctc 13271668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 702
Target Start/End: Original strand, 6257448 - 6258116
Alignment:
Q  34 caaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctgagttccacaaaggatggccct 133  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  6257448 caaagaagtcttcaacttccaactcttcaagaaaggcactattaattagaactttctctagggtggattcaatgacgtgagtgccacaaaggatggccgt 6257547  T
Q  134 tttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaactct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  6257548 tttcaagcttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttagttctatatcactgatattagcagcctttggaattaaagcctccaactct 6257647  T
Q  234 tcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| ||    
T  6257648 tcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaagatgatgaggcagggcacttttcaacttgggacattgttttagacaaagctcttgaagcagag 6257747  T
Q  334 ggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaacatttgatgaataatagccgca 433  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6257748 ggaaaccttcaaggcataaccattccttccattcagacatatactcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatgcaacatttgatgaattatagccgca 6257847  T
Q  434 aagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacaatgttta 533  Q
    || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257848 aaactctgaaccaatgatctttattccatgacagcctgaaatggaaagcttcttgagagaagggaacttcccaagtggtggcaactgggaacaatgttta 6257947  T
Q  534 catcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctcatga 633  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257948 catcccactaattcaagagatactaaatttggtagattaagatccccaagccaatttggaaagctactacctctgtagtcattgatggtgagcctcatga 6258047  T
Q  634 gatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  6258048 ggtttctattaggttgaagagcctccaagaccgatacacgtgcttcagtttctgagccatccatttctc 6258116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 702
Target Start/End: Original strand, 6167143 - 6167805
Alignment:
Q  34 caaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctgagttccacaaaggatggccct 133  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6167143 caaagaagtcttcaacttccaactctttaagaaaggcactattaattagaactttctctagggtggattcaatgacgtgagttccacaaaggatggccct 6167242  T
Q  134 tttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaactct 233  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6167243 tatcaagcatgatggcaattcatttatcgaaatgccatcacatctctttagttctatatcactgatattagcagccttgggaattgaagcctccaactct 6167342  T
Q  234 tcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaag 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  6167343 tcgcaatcaataatttccaacttttgcaaacaaggaagatgatgaggcagagcacttttcaacttgggacattgttttagacaaagctcttgaagcaaag 6167442  T
Q  334 ggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaacatttgatgaataatagccgca 433  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||      ||| ||||||| |    
T  6167443 ggaaaccttcaaggcataaccattccttccattcagacatatactccacccgcaaagtttcaagggatctaaatgcagcat------aattatagccgaa 6167536  T
Q  434 aagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacaatgttta 533  Q
    || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6167537 aaactctgaaccaatgttctctattccatgacagccggaaatggaaagcttcttgagagaatggaactgcccaagtggtggcaactgggaacagtgttta 6167636  T
Q  534 catcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctcatga 633  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6167637 catccaaacaattcaagagatactaaattgggtagatgatgatccccaagccaatttggaaagctactacctctgtagtcattgatggtgagcctcatga 6167736  T
Q  634 gatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  6167737 gatttctatttggttgaagagcctccaagaccaagagacgtgcttcagtttctgagccttccatttctc 6167805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 702
Target Start/End: Original strand, 6263908 - 6264599
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6263908 ggaccattctagatttggaccaaagaagtcttcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaactagaattttctctagggtggtttcaatgacatga 6264007  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |    
T  6264008 gttccacaaaggatggccctttccaagcttgatggcaatttatttataaaaatgccatcacatctctttagctctatatcactgatattagcagcattag 6264107  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||     
T  6264108 gaattgaagcctccaactcttggcaatcaataatctccaattttagcaaagaagggaggtgataaggcagggtacttttcaatttgggacaatgatttag 6264207  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264208 agaaagctctttaactaaagggaaaccatcaagacataaccattccttccattcagacatgttcttgaaacacaaagtttcaagggatctaaatggaaca 6264307  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264308 tttgctgaattatagcggcaaaactctgaaccaatgatctctactccatgacagcctgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 6264407  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggta---aatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgta 610  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6264408 gcaactgggaacagtgtgtacatcccaacaattcaagagataataaattggctagatgatgatgatccccaagccaattaggaaagctactacctctgta 6264507  T
Q  611 gtcattgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6264508 gtcattgatgctgagcctcgtgagatttctatttggtcgcagagcctccaagaccgagaaacatgcttcagttactgagccatccatttctc 6264599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 699
Target Start/End: Original strand, 6898314 - 6898999
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6898314 ggaccattctagattttgaccaaagaagtcttcaacttctaacacttcaagaaaggcactgctaaatagaattttctctagggcggattcaatgacctga 6898413  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  6898414 gttccacaaaggatggcctttttcaagctggatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttagttctagctcactgatattatcagccttgg 6898513  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  6898514 gaattgaagcctgcaactcttggcaatcaataattttcaacttttgcaaagaaggaaggtgttgaggcagggaacttttcaacttcggacaatgtttgat 6898613  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6898614 acaaagctcttgaagcaaatgaaaacattcaagacataaccattccttccattcagacatgtgctcaaatcgcaaagtttcaagggatctaaatggatca 6898713  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    ||||||||||  ||||| |||| ||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  6898714 tttgatgaattgtagccacaaatctctgtaccaatgatatctattccatcacagcctgaaatggaaagcttcttgagagagggtaactgcccaagtgggg 6898813  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6898814 gcaactgggaacgaagtttacatcccaacaattctagagatactaaattgggtaaatgatgaaccccaagccaatttggaaatctactgcctctgtagtc 6898913  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccattt 699  Q
     |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||    
T  6898914 tttgatggttagcctcatgaggtttatatttggttgaagagcctctaagacagagacacgtgctttagttactgatccatccattt 6898999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 702
Target Start/End: Original strand, 7748228 - 7748916
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||  | ||||||||| || ||| |||  |  |||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  7748228 ggaccattctaaatttggaccaaagaagtcttcaacttccaacttttcaagaaaagcgctgttaaataaaattttctctagggtggattcaatgacccaa 7748327  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    |  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7748328 gacccacaaaggatgacccttttcaagctagatggcaattcatttattaaaatgccatcacatctctttagttctaggtcactgatattatcagccttgg 7748427  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7748428 gaattgaagcctgcaactcttggcaatcaataatctccaatttttgcaaagaaggaaggtgttgaggcagggaacttttcaacttcggacaatgttttat 7748527  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7748528 acaaagctctcgaagcaaagggaaacattcaagacataaccattccttccattctgacatgtgctcaaatcgcaaagtttcaagagatctaaatgaaaca 7748627  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  7748628 tttgatgaattatagccacaaatctctgcaccaataatctctattccatcgcagcctgaaatggaaagcttcttgagagagtggaactgcccaagtgatg 7748727  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7748728 gtaactgggaacaaagtttacatcccaacaattcaagagtaactaaattgggtaaatgataatcgccaagccaatttggaaagctactgcctctgtagtc 7748827  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||||    
T  7748828 tttgatggttagcctcatgaggtttctatttggttggagagcctctaagacagagacatgtgcttcagttactgatccatccatttctc 7748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 6593156 - 6592471
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  6593156 ggaccattctagatttgaatcaaagaagtcctcaacttccaactcttcaagaaagacactgttaaatagaattttctctagggaggatttaatgacctga 6593057  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  6593056 gttccacaaaggatgacccttttcaagctggatggatattcatttatcaaaatgtcatcacatctcttcagttctagctcagtgatattatcagccttgg 6592957  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6592956 gaattgaagcctccaactcttggcaatcagtaatctccaatttttgcaaagaaggaaggtgttgaggcagggctcttttcaacttgggacaatgttttat 6592857  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6592856 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagacataaccattccttccattcagacatgttctcaaatcgcaatgtttcaaggaatctaaatggaaca 6592757  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    |||||||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6592756 tttgatgaattatagccgtaaaattctgtaccaatgatctctattccatcacagcctgaaaaggaaagcttcttgagagaggggaactgcccaagtggtg 6592657  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    |||| | ||||     ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  6592656 gcaattcggaatggaatttacatcccaacaattcaagggatactaacttgggtaaataaagatcgccaagccaatttggaaagcttctgcctctgtagtc 6592557  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccattt 699  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| || || | |||||||  |||||||||||||    
T  6592556 tttgatggtgagcctcatgaggtttctatttggttgaagaatctccatgacagaggcatgtgcctcagttattgagccatccattt 6592471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 131 - 685
Target Start/End: Original strand, 6236068 - 6236622
Alignment:
Q  131 ccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaac 230  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  6236068 ccttttcaaggtggatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttagttctagctcactgatattaccagccttgggaattgacgcctccaac 6236167  T
Q  231 tcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagca 330  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  6236168 tcttggcaatcaataatctccaatttttgcaaacaaggaaggtattgaggcaggtcacttttcaacttgggacaatgttttatacaaagctctttaagaa 6236267  T
Q  331 aagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaacatttgatgaataatagcc 430  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| | || ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6236268 aagggaaacctccacgacataaccataccttccattcagacatgttcttaaaacacaatgtttcaagggatctaaatggaacatttgatgaattatagcc 6236367  T
Q  431 gcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacaatgt 530  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6236368 gcaaaactctgaaccaatgaacgttattccatgacatcctgatatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacaatat 6236467  T
Q  531 ttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctca 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6236468 ttacatcccaacaattcaagagatactaaattgggtagatgatgatccccaagccaattaggaaagctactacctctgtagtcattgatgccgagcctca 6236567  T
Q  631 tgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttac 685  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  6236568 tgagatttctatttggtcgaagagcctccaagatcgagacacgtgctttagttac 6236622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 663
Target Start/End: Original strand, 6915327 - 6915976
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||  |  |||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  6915327 ggaccattctagatttggaccaaagaagtcttcaacttccaattcttcaagaatggcacagttaaataaaatttgctctagggaggatcgaatgacctga 6915426  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |    
T  6915427 gttccacaaaggatgactcttttcaaggtagctggcaactcatttatcaatatgtcatcacatctctttagttctagctcactgatattagcagccatcg 6915526  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  6915527 gaattgaagccgccaactcttggcaatcaataatctccaatttttgcaaagaaggaaggtgttgaggcagggaacttttcaacttgggacaatgttttat 6915626  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6915627 acaaagctcttgaagcaaagggaaacattcaagacataaccattccttccattcggacatgtgctcaaatcgcaaagtttcaagggatttaaatgaaaca 6915726  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    ||||||||||  |||||  | | ||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6915727 tttgatgaattgtagccatagaactctgtaccaatgatttctattccatcacagcctgaaataaaaagcttcttgagagaggggaactgcccaagtggcg 6915826  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||  |||||    
T  6915827 gcaactgggaacggagtttacatcccaacaattcaagagatactaaatttggtaaatgataatctccaagccaatatggaaagctactgcctccatagtc 6915926  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaaga 663  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6915927 tttgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaaga 6915976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 702
Target Start/End: Original strand, 6880742 - 6881430
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | | |  |  |||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  6880742 ggaccattctagatttggaccaaagaagtcttcaacttccaactcttcaagaaaggcacagttcaacaaaatttgctctagggttgattgaatgacctga 6880841  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    |||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  6880842 gttccacaaaggatgattcttttcaatttagatggcaattcatttatcaaaatgtcatcacatctctttagttctagctcagtgatattagcagccttgg 6880941  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6880942 gaattgaagccgccaactcttggcaatcaataatctccaatttttgcaaagaagggaggtgttgaggaagggcacttttcaacttgggacaatgttttat 6881041  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6881042 acaaagcttttgaagcaaagggaaaccttcaagacataaccattccttccattcagccatgttttcaaatcgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 6881141  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    | |||||||| |||||||  || ||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  6881142 tctgatgaattatagccgagaaactctgtaccaataatttctattccatcacagcttgaaatggaacacttcttgagagagggaaactgcccaagcggtg 6881241  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  6881242 gcaactgggaatggattttacatcccaacaattcaagagatactaaatttggtaaatgacgatccccaagccagtttggaaagctaccgcctctgtagtc 6881341  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
     |||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||| || |||||||||||||    
T  6881342 tttgatggttagactcgtgaggtttatatttggttgaagagcctccaagacagaggcttgtgcttcagttactgatccatccatttctc 6881430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 6723882 - 6723225
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||| || |  |||||   ||    
T  6723882 ggaccattctagattatgatcaaagaagtcttcaacttccaactcttctagaaaggcactgttaaatagaattttctctagggaggatcgaatgatgcga 6723783  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||    
T  6723782 gttccaccaaggatgaccgttttcaaggtagagggcaattcatttatcaaaatatcatcacatctctttagttctagcttactgatattatcagccttgg 6723683  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  6723682 gaattgaagcctccagctcttggcaatcaataatctccaatttttgcaatgaaggaaggtgttgaggcagggaacttttcaacttgggacaatgttttat 6723583  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6723582 acaaagctcttgtagcaaagggaaaccttcaagacataaccattccttccattcagacatttgctcaaatcgcaaagttacaagggatctaaatggaaca 6723483  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
     |||| | || ||||||||||| ||| |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  6723482 cttgaagcattatagccgcaaaactctgttccaatggtctctattccatcacagcctgaaatggaaagcttctcgagaaaggggaactgcccaagtggtg 6723383  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||    
T  6723382 gtaactgggaacagaatttacatcccaacaattcaagagatactaaattgggtaaatgacgatacccaacccaatttggaaagctactgcctccatagtc 6723283  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagaca 671  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6723282 tttgatggtgagcctcatgaggtttttatttggttgaagagcctccaagacagagaca 6723225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6851081 - 6850427
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| | |||  |  |||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  6851081 ggaccattctagatttggaccaaagaagtcttcaactttcaactcttcaagaaaggcacagttaaataaaatttgctctagggaggatggaatgacctga 6850982  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  | ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |   |  |||||    
T  6850981 gttccgcaaaggatgactcttttcaaggtagatggtaactcatttatcaatatgtcatcacatctctttagttctagctcactgataatgtaaatcttgg 6850882  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6850881 gaattgaagccgccaactcttggcaatcaataatctccaatttttgctaagaagggaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgttttat 6850782  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6850781 acaaagctcttgaagtaaagggaaaccttcaagggata-ccattccttccactcagacatgtgcccaaatcgcaaagtttcaagggatttaaatggaaca 6850683  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  6850682 tttgatgaattgtagccgtaaaactctggaccaatgatctctattccatcacagcctgaaatggaaagattcttgagagaggggaacagcccaagtgatg 6850583  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtc 613  Q
    | |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||    
T  6850582 gaaactgggaatggtgtttacatcccaacaa-tcaagagatactaaattgggtaaatgataatccccgagccaatatgggaagctactgcctcggtagtc 6850484  T
Q  614 attgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccgagac 670  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6850483 tttgatggttagcctcatgaggtttccatttggttgaagagcttccaagacagagac 6850427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Original strand, 6243543 - 6244073
Alignment:
Q  14 ggaccattctagatttgaagcaaagaagtcgtcaacttccagttcttcaagaaaggcactgctaacgagtattttctctagggtggtttcaatgacctga 113  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  || ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  6243543 ggaccattctagattttgaccaaagaagtcttcaacttccaattcttcaagaaaggtactgttaaatagaattttctctagggcggattcaatgatctga 6243642  T
Q  114 gttccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgg 213  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||  |||  |||    
T  6243643 gttccacaaaggatgacctttttcaagttggatgacaatttatttatcaaaatgccatcacatctctttagttctagctgaatgatattataagcaatgg 6243742  T
Q  214 gatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttat 313  Q
    || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| |   ||||    
T  6243743 gaattgaagcctccaaatcttggcaatcaattatctccaatttttgcaagcaaggaagatgttgaggcagtttccttttcaacttgggacagtatcttat 6243842  T
Q  314 acaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaaca 413  Q
      |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6243843 tgaaagctctttcagcaaagggaaaccttcaatacataaccaatctttccattcagacatattctcaaaccgcaaagtttcaagggatctaaatgtaaaa 6243942  T
Q  414 tttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtg 513  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | |||    
T  6243943 tttgatgaattatagcggcaaaactctgaaccaatgatacctattccatgacagcctgaaatggaaagcttcttgagagatgggaactgcttaatttgtg 6244042  T
Q  514 gcaactgggaacaatgtttacatcccaacaa 544  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  6244043 gcaacttggaacagagtttacatcccaacaa 6244073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 567 - 702
Target Start/End: Original strand, 6244072 - 6244207
Alignment:
Q  567 aaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagaccg 666  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  |    
T  6244072 aaatgatgatccccaagccaatttggaaagctactacctctgtagtcattgatggtgagcctcacgaggttactatttggttgaagagcctccaagatag 6244171  T
Q  667 agacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
    ||||| || |||||||| | ||| |||| |||||||    
T  6244172 agacatgtgcttcagtttctgagtcatctatttctc 6244207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 417
Target Start/End: Original strand, 7586212 - 7586497
Alignment:
Q  132 cttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaact 231  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||  ||  | |||||| ||  ||| ||| || | ||  ||||||    
T  7586212 cttttcaaatttgtcggcaattcatttaccaaaattctatcacatctctttatatctaactctatcatattatcacacttcggaattaatgcttccaact 7586311  T
Q  232 cttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaa 331  Q
      | ||||||  |||||||||  || || ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||| ||||||    
T  7586312 tcttgcaatctttaatctccagtttctgtaaagaaggaaggtgttgaggcagagcccttttcaacttgggacatttttttatagaaagctctttaagcaa 7586411  T
Q  332 agggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaacatttg 417  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    ||||   ||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7586412 aggaaacccttcaagatgtgaccattcctcccattccgacatcgaatcaaaatgcagaatttcaagggatctgaatggaacatttg 7586497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 516
Target Start/End: Original strand, 5297073 - 5297473
Alignment:
Q  116 tccacaaaggatggcccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttggga 215  Q
    ||||||||||||| |  |||||||  | |||||||||||||||| |||||||   |||||||  ||||  ||||  |||   |||||| |||||||||||    
T  5297073 tccacaaaggatgacatttttcaaggtggatggcaattcatttaccaaaatgttttcacatccttttagctctagctcaacaatattatcagccttggga 5297172  T
Q  216 tttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatac 315  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    ||||||||||| || || |   ||||      
T  5297173 atcgaagcctccaactcttggcaatcactaatcttcaatttttgcaaagaaggaagatgttgaggcagtttccttttcaacttagggcagtatcttattg 5297272  T
Q  316 aaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaagggatctaaatggaacatt 415  Q
    | |||||||  |||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||| | |||||  |||||| || | ||||| || || | ||||||    
T  5297273 acagctctttcagcaaagggaaacctgtaacacataaccaatctttccattcagacattttctcaaatcgcaaaattgcgagggacctgaacgcaacatt 5297372  T
Q  416 tgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggc 515  Q
    |||||| |  |  ||| ||| |||    |||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  5297373 tgatgagttgtttccgtaaaactctttgccaatgctctctattccatggcagcctgaaattgaaagttctttgagagagcagagctgcccaagtggtggc 5297472  T
Q  516 a 516  Q
    |    
T  5297473 a 5297473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 364
Target Start/End: Original strand, 5266489 - 5266655
Alignment:
Q  198 atattagcagccttgggatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaact 297  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||     ||||||| |    
T  5266489 atattagaagcctcgggaattgaagccttcaactcttcgcaatcattaatcaccaatttttgcaaagaaggaaggtgttgaggtagatattttttcaatt 5266588  T
Q  298 tcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttcca 364  Q
    |  |||||   | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  5266589 tgtgacaactttctataaaaagctcttcaagcaaagggaaactttcaacacataaccattccttcca 5266655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4390536 - 4390320
Alignment:
Q  198 atattagcagccttgggatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaact 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||    |||||| ||||||||||||| || ||     || |||| |    
T  4390536 atattagaagccttgggaattgaaacctccaactcttggcaatcaataatcaccaatccctgcaaagaaggaaggtgttggggtagaaattttgtcaatt 4390437  T
Q  298 tcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattccttccattcagacatatgctcaacccgcaaagtttcaag 397  Q
    | |||||||    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||| | |||||  |||||| |||||||    
T  4390436 ttggacaattacgtatagaaagctctttaagcaaagggaaaccttcaacacataaccattccttccaattggacatgtcctcaaatcgcaaaatttcaag 4390337  T
Q  398 ggatctaaatggaacat 414  Q
    | | || ||||||||||    
T  4390336 gaacctgaatggaacat 4390320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 360
Target Start/End: Original strand, 8452991 - 8453204
Alignment:
Q  147 ggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaac-tcttcgcaatcaata 245  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| || | |||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||| ||    
T  8452991 ggcaattcatttaccaaaattctatcacatctctttatatctaaatctatgatattatcaccgttgggaattgatgcttccaacatctt-gcaatcatta 8453089  T
Q  246 atctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaa 345  Q
    ||   ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||| |   ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  8453090 atgaacaatttttgtaaagaaggaaggtgttgaggcagggacattttcaatttgggacattctcttatataaagctctttaagcaaaggaaacccttcaa 8453189  T
Q  346 gatataaccattcct 360  Q
    || | ||||||||||    
T  8453190 gacacaaccattcct 8453204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 360
Target Start/End: Original strand, 8469900 - 8470129
Alignment:
Q  131 ccttttcaaacttgatggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaac 230  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  ||||  ||  |||||||| || |||||||| | || ||| | |||    
T  8469900 ccttttcaagctggttggcaattcatttattaaaatgtgatcacatctctgtagatctaactctatgatattatcacccttgggaatcgatgcctctaac 8469999  T
Q  231 tcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagca 330  Q
      ||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||| |||| |  |||||    |||||| ||||||||| |||||    
T  8470000 agttcacagtcaataatctctaatttttgtaaagaaggaaggtgttgaggcaatgcgcttctcaattcgggacagctttttatagaaagctctttaagca 8470099  T
Q  331 aagggaaaccttcaagatataaccattcct 360  Q
    |||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  8470100 aaggaaacccttcaagacacaaccattcct 8470129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8570578 - 8570415
Alignment:
Q  197 gatattagcagccttgggatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaac 296  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| | |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  8570578 gatattatcagccttgggaattgaagcctccaacttcttgcaatcactgatctccagtttttgtaaagaaggaaggtgtcgaggcagggcccttttcaat 8570479  T
Q  297 ttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattcct 360  Q
     |  ||||||   ||||| |||||| || ||||||||| || ||||||| | | ||||||||||    
T  8570478 ctgtgacaatatcttatagaaagctttttaagcaaaggaaacccttcaatacaaaaccattcct 8570415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 664
Target Start/End: Original strand, 5279276 - 5279535
Alignment:
Q  405 aatggaacatttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcc 504  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||   ||| || ||||||| ||||| |||   |||||| ||||||| ||| ||||| || | |||||    
T  5279276 aatggaacagttgatgaattatagccataaaactcttcaccgataatctctattccatcacattctgaaatagaaagctccttaagagagggaagctgcc 5279375  T
Q  505 caagtggtggcaactgggaacaatgtttacatcccaacaattcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcc 604  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |  |||||    || |||||| |||||||||| | |||||| |   |||||||||||||  ||||||  | ||||    
T  5279376 caagtggtggaaactggaaacaaaatccacatctattcagttcaagggatactaaattgagtaaataacagtccccaagccaatgtggaaagccagtgcc 5279475  T
Q  605 tctgtagtcattgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagac 664  Q
    ||||||||| | |||| |||| ||  |||| || ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  5279476 tctgtagtcctcgatgatgagactattgaggttgctatttggttcgagaacctccaagac 5279535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6730399 - 6730252
Alignment:
Q  147 ggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataa 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||  | || |||  |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||  || ||    
T  6730399 ggcaattcatttaccaaaatgctttcacatcccactagatgtaaatctatgatattatcacccttgggaattgatgcctccaactctttgcaacaaacaa 6730300  T
Q  247 tctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttca 294  Q
    ||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6730299 tcttcaatttttctaaagaaggaaggtgttgaggcagggcccttttca 6730252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4390309 - 4390217
Alignment:
Q  446 aatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacaatgtttacatcc 538  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| || |||||| | || |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4390309 aatgatctctattccaggacagcttgaaatacaaagattattgagatagggaaacttctcaaatggtggcaactgggaacaaagttgacatcc 4390217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6521730 - 6521626
Alignment:
Q  226 ccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttg 325  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||| |||||||||     
T  6521730 ccaactcgttgcaatcactgatcttcaatttttgtaaagaagaaaggtgttgaggcagggtgcttttcaatttaggacaattttttatataaagctcttt 6521631  T
Q  326 aagca 330  Q
    |||||    
T  6521630 aagca 6521626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6528601 - 6528477
Alignment:
Q  236 gcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaaggg 335  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||    ||||| ||| ||||| |||||||||     
T  6528601 gcaatcaataatctccagtttttgtaaagaaggaaggtgttgaggcagagcccttttcaattcgggacaacttgttatagaaatctctttaagcaaagga 6528502  T
Q  336 aaaccttcaagatataaccattcct 360  Q
    ||  || ||||  ||||||||||||    
T  6528501 aactctccaaggcataaccattcct 6528477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6481589 - 6481446
Alignment:
Q  217 ttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttataca 316  Q
    |||||||| ||||||  | ||||| |||||||  ||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||||      
T  6481589 ttgaagcctccaacttgttgcaattaataatcgacaatttctgtaaagaaggaaggtgttgaggaagggcccttttcaatttgggacaatcttttatagt 6481490  T
Q  317 aagctcttgaagcaaagggaaaccttcaagatataaccattcct 360  Q
    |||||||| |||| |  | || |||||| || ||||||||||||    
T  6481489 aagctctttaagcgacagaaacccttcatgacataaccattcct 6481446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 664
Target Start/End: Original strand, 5248814 - 5249032
Alignment:
Q  446 aatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaacaatgtttacatcccaacaat 545  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||| | || |||  | ||| ||||||||| |||||||||  || |||||| | ||      
T  5248814 aatgatctctattccatgacaacctgaaatataaagcttcttgagatagggaaacaactcaaatggtggcaaatgggaacaaaattcacatcctaccaga 5248913  T
Q  546 tcaagagatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctcatgagatttctatttg 645  Q
    || |||||| |||||| |   ||||||  | |||||||||| || |||||| || ||||||  ||||  |||||||| ||| |  | || || |||||||    
T  5248914 tccagagattctaaattgaacaaatgactacccccaagccagtttggaaagctagtgcctcgatagtgtttgatggtcagcatattaaggttactatttg 5249013  T
Q  646 gttgaagagcctccaagac 664  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  5249014 gttcaagggcctccaagac 5249032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6450422 - 6450324
Alignment:
Q  196 tgatattagcagccttgggatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataatctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttca 294  Q
    |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||| | ||||  || ||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6450422 tgatattatcacccttgggaattgatgcctccaactcattgcaacaaacaatcttcaatttttctaaagaaggaaggtgttgaggcagggcccttttca 6450324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 527
Target Start/End: Original strand, 5262399 - 5262522
Alignment:
Q  404 aaatggaacatttgatgaataatagccgcaaagctcagaaccaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||   ||| |||||||||| ||||| |||   |||||| |||||||  || ||||| || | || |    
T  5262399 aaatggaacagttgatgaattatagccataaaactcttcaccgatgatctctattccataacattctgaaatagaaagctctttaagagagggaagcttc 5262498  T
Q  504 ccaagtggtggcaactgggaacaa 527  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  5262499 ccaagtggtggcaaccgggaacaa 5262522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6523159 - 6522972
Alignment:
Q  147 ggcaattcatttatcaaaatgccatcacatctctttatttctatatcactgatattagcagccttgggatttgaagccaccaactcttcgcaatcaataa 246  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||| ||||  ||  | |||||| ||  ||||||| |||| ||| ||| ||  | ||||| | |||    
T  6523159 ggcaattcatttaccaaaattctatcacaactctgtatatctaactctatcatattatcacacttgggaattgatgcctccatcttgttgcaattactaa 6523060  T
Q  247 tctccaacttttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaagg 334  Q
    ||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||   ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  6523059 tcttcagtttttgtaaagaaggaaggtgttgaggcagagcccttttcaattcgggacaatttcttatagaaatctctttaagcaaagg 6522972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8570191 - 8570111
Alignment:
Q  584 ccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaagagcctccaagac 664  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||   |||||||||||||| | |  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8570191 ccaatttggaaagctactgccattgtagtatgtgatggtgagcctcttcaagttgctatttggttgaagagcatccaagac 8570111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 664
Target Start/End: Original strand, 8588582 - 8588610
Alignment:
Q  636 tttctatttggttgaagagcctccaagac 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8588582 tttctatttggttgaagagcctccaagac 8588610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 552 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 35141634 - 35141484
Alignment:
Q  552 gatactaaatagggtaaatgatgatccccaagccaattaggaaaggtactgcctctgtagtcattgatggtgagcctcatgagatttctatttggttgaa 651  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35141634 gatactaaattgggtaaatgatgatccccaagccaatttggaaagctactacctctgtagtcattgatggtgagcctcatgaggtttctatttggctgaa 35141535  T
Q  652 gagcctccaagaccgagacacgttcttcagttaccgagccatccatttctc 702  Q
    ||| |||||| || ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  35141534 gagactccaacactgagacacatgcttctgttactgagccatcgatttctc 35141484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6574890 - 6574779
Alignment:
Q  256 tttgcaaacaaggaaggtgttgaggcagggcacttttcaacttcggacaatgctttatacaaagctcttgaagcaaagggaaacc-ttcaagatataacc 354  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||   |||||||| || |||||||| | |||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  6574890 tttgcaaagaaagaaggttttgaggcaggaaccttttcaatttgggacaatggtctatataaagctctttgagcaa-gggaaaccgttcaagttaaaacc 6574792  T
Q  355 attccttccattc 367  Q
    |||||||||||||    
T  6574791 attccttccattc 6574779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1643 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1643
Description:

Target: scaffold1643; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 443 - 526
Target Start/End: Original strand, 825 - 908
Alignment:
Q  443 accaatgatctctactccatgacagcttgaaatggaaagcttcttgagagaagggaactgcccaagtggtggcaactgggaaca 526  Q
    ||||||||||| || ||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  825 accaatgatctttattccatcacaatatgaaatagaaagattcttgagagaaggaagctgcccaagtggtggaaaatgggaaca 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University