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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
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Alignment Overview

Query: NF4681_low_52 (Length: 256)

Name: NF4681_low_52
Description: NF4681
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4681_low_52
NF4681_low_52
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-243)||(209252-209494)
chr2 (1-243)||(5351295-5351537)
chr2 (1-243)||(10620241-10620483)
chr2 (1-243)||(41564054-41564296)
chr2 (1-243)||(7267008-7267250)
chr2 (2-243)||(39798004-39798243)
chr2 (1-243)||(24753588-24753830)
chr2 (1-243)||(41181677-41181919)
chr2 (35-243)||(3795651-3795859)
chr2 (1-243)||(28342789-28343032)
chr2 (23-243)||(45479385-45479605)
chr2 (1-242)||(12905786-12906037)
chr2 (1-243)||(24601906-24602160)
chr2 (1-243)||(24611954-24612208)
chr2 (1-243)||(43943958-43944210)
chr2 (48-243)||(1096897-1097092)
chr2 (48-243)||(9659604-9659801)
chr2 (1-139)||(38950234-38950372)
chr2 (48-243)||(439374-439569)
chr2 (55-243)||(1150595-1150783)
chr2 (48-243)||(81814-82009)
chr2 (48-243)||(41052949-41053142)
chr2 (1-109)||(18000500-18000608)
chr2 (141-243)||(38949750-38949852)
chr2 (1-243)||(41004793-41005045)
chr2 (1-63)||(41052888-41052950)
chr2 (1-63)||(82008-82070)
chr2 (1-63)||(1096836-1096898)
chr2 (70-229)||(25613538-25613697)
chr2 (1-39)||(3795603-3795641)
chr2 (1-51)||(439580-439630)
chr2 (1-47)||(9659816-9659862)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-243)||(30301402-30301644)
chr8 (1-243)||(8419672-8419914)
chr8 (1-243)||(7344120-7344362)
chr8 (1-243)||(32375919-32376161)
chr8 (1-243)||(23924232-23924474)
chr8 (1-243)||(39724-39966)
chr8 (1-243)||(31959611-31959867)
chr8 (1-243)||(35962574-35962816)
chr8 (5-243)||(22588006-22588244)
chr8 (48-243)||(2124508-2124703)
chr8 (48-243)||(43376843-43377038)
chr8 (23-243)||(7171881-7172111)
chr8 (1-243)||(43679663-43679905)
chr8 (1-243)||(22661138-22661380)
chr8 (71-243)||(41744160-41744332)
chr8 (1-128)||(20548938-20549065)
chr8 (1-147)||(39751327-39751473)
chr8 (23-185)||(4867415-4867587)
chr8 (141-238)||(39751661-39751758)
chr8 (1-162)||(30972519-30972680)
chr8 (120-184)||(31281198-31281262)
chr8 (1-55)||(43377045-43377099)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-243)||(43619947-43620189)
chr7 (1-243)||(45767424-45767666)
chr7 (1-243)||(30790570-30790812)
chr7 (1-243)||(604046-604288)
chr7 (2-243)||(15069914-15070155)
chr7 (2-243)||(18109357-18109598)
chr7 (2-243)||(42503402-42503643)
chr7 (1-243)||(47742553-47742795)
chr7 (1-238)||(34622765-34623002)
chr7 (1-243)||(19044559-19044815)
chr7 (1-243)||(20709821-20710077)
chr7 (71-243)||(29592839-29593011)
chr7 (1-242)||(10705514-10705765)
chr7 (51-243)||(47064858-47065050)
chr7 (1-240)||(12111482-12111729)
chr7 (1-45)||(40928715-40928759)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-243)||(1608561-1608803)
chr6 (35-243)||(13382942-13383150)
chr6 (1-243)||(29286469-29286711)
chr6 (1-243)||(25140669-25140912)
chr6 (1-243)||(31150629-31150871)
chr6 (1-243)||(23959157-23959399)
chr6 (48-238)||(2051355-2051545)
chr6 (1-243)||(7537453-7537709)
chr6 (1-243)||(29667387-29667639)
chr6 (11-243)||(18609797-18610029)
chr6 (51-243)||(28362281-28362473)
chr6 (25-243)||(2259376-2259593)
chr6 (1-102)||(18351348-18351449)
chr6 (24-184)||(34230770-34230930)
chr6 (1-65)||(26702454-26702518)
chr6 (1-39)||(13382894-13382932)
chr6 (23-209)||(20448386-20448571)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (1-243)||(49564109-49564351)
chr4 (2-243)||(3407803-3408044)
chr4 (35-243)||(19069501-19069709)
chr4 (1-243)||(10374306-10374548)
chr4 (5-243)||(10422972-10423210)
chr4 (48-242)||(37394768-37394962)
chr4 (48-237)||(44050650-44050838)
chr4 (67-243)||(4774168-4774344)
chr4 (1-243)||(38460692-38460934)
chr4 (23-243)||(18578911-18579141)
chr4 (70-243)||(11506658-11506831)
chr4 (1-243)||(24415425-24415679)
chr4 (1-148)||(50904822-50904969)
chr4 (1-216)||(6186915-6187140)
chr4 (1-139)||(51642273-51642421)
chr4 (1-63)||(44050837-44050899)
chr4 (120-184)||(30043046-30043110)
chr4 (1-63)||(37394961-37395023)
chr4 (1-39)||(15995988-15996026)
chr4 (1-39)||(19069453-19069491)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (1-243)||(8156776-8157018)
chr3 (1-243)||(30943458-30943700)
chr3 (1-243)||(3952778-3953020)
chr3 (1-243)||(6744890-6745132)
chr3 (1-243)||(13743534-13743775)
chr3 (1-243)||(9426872-9427114)
chr3 (1-243)||(2857546-2857788)
chr3 (35-243)||(2743756-2743964)
chr3 (1-243)||(48246678-48246920)
chr3 (35-243)||(50957243-50957451)
chr3 (1-243)||(4002055-4002311)
chr3 (48-243)||(14402569-14402764)
chr3 (1-243)||(36813104-36813360)
chr3 (1-240)||(21952066-21952305)
chr3 (48-243)||(46989840-46990035)
chr3 (48-243)||(6489657-6489852)
chr3 (1-243)||(67140-67392)
chr3 (1-113)||(7841362-7841474)
chr3 (10-54)||(14402772-14402816)
chr3 (1-39)||(2743708-2743746)
chr3 (1-39)||(50957461-50957499)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (1-243)||(3944242-3944484)
chr1 (1-243)||(3993406-3993648)
chr1 (1-242)||(20353500-20353741)
chr1 (1-243)||(29352500-29352742)
chr1 (1-243)||(38771898-38772140)
chr1 (1-243)||(44469575-44469817)
chr1 (2-243)||(13633436-13633677)
chr1 (2-243)||(30909593-30909834)
chr1 (1-243)||(5081928-5082170)
chr1 (35-243)||(6558202-6558410)
chr1 (1-243)||(9710844-9711086)
chr1 (1-243)||(37018960-37019202)
chr1 (48-243)||(12643519-12643714)
chr1 (1-243)||(8459224-8459466)
chr1 (1-243)||(50113574-50113830)
chr1 (1-243)||(7966250-7966497)
chr1 (67-243)||(1655644-1655820)
chr1 (1-243)||(25039645-25039887)
chr1 (1-243)||(38690176-38690417)
chr1 (1-243)||(51666230-51666472)
chr1 (1-243)||(13177690-13177942)
chr1 (23-242)||(5141435-5141654)
chr1 (69-243)||(19495387-19495562)
chr1 (1-241)||(36072629-36072879)
chr1 (23-243)||(33168192-33168422)
chr1 (69-243)||(46978798-46978972)
chr1 (1-102)||(15051053-15051154)
chr1 (67-242)||(4517959-4518132)
chr1 (1-58)||(46886137-46886194)
chr1 (1-63)||(46979002-46979064)
chr1 (1-76)||(1179880-1179955)
chr1 (1-63)||(4518160-4518222)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (15-243)||(14280542-14280770)
chr5 (1-243)||(37814849-37815091)
chr5 (2-243)||(38855983-38856224)
chr5 (1-243)||(28882255-28882497)
chr5 (2-243)||(11029277-11029516)
chr5 (1-243)||(27863670-27863912)
chr5 (1-243)||(13563908-13564150)
chr5 (1-243)||(25890261-25890503)
chr5 (1-243)||(7796844-7797086)
chr5 (1-243)||(7017778-7018007)
chr5 (1-185)||(34079753-34079937)
chr5 (1-243)||(1039356-1039611)
chr5 (48-243)||(34122852-34123047)
chr5 (23-243)||(33994713-33994933)
chr5 (10-243)||(4196792-4197023)
chr5 (1-243)||(24053420-24053672)
chr5 (1-243)||(24050293-24050547)
chr5 (83-242)||(28387821-28387979)
chr5 (1-243)||(30352687-30352939)
chr5 (120-243)||(43179429-43179552)
chr5 (23-194)||(6267763-6267933)
chr5 (48-186)||(25877946-25878082)
chr5 (1-76)||(43179631-43179706)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (2-243)||(4890-5131)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-243)||(15519-15761)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (1-243)||(22668-22923)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-137)||(8466-8602)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (70-243)||(1315-1488)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (96-243)||(10828-10975)
[»] scaffold0219 (3 HSPs)
scaffold0219 (48-161)||(19743-19856)
scaffold0219 (159-243)||(19498-19582)
scaffold0219 (1-52)||(19866-19917)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (1-240)||(21904-22144)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 209252 - 209494
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209252 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 209351  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209352 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 209451  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209452 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 209494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5351537 - 5351295
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5351537 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 5351438  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351437 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 5351338  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351337 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 5351295  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 10620241 - 10620483
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10620241 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 10620340  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620341 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 10620440  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620441 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 10620483  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41564296 - 41564054
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41564296 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 41564197  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564196 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 41564097  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564096 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 41564054  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7267250 - 7267008
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7267250 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctactt 7267151  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7267150 acattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 7267051  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7267050 agcaaaggtatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 7267008  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39798243 - 39798004
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39798243 tttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--ccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctactta 39798146  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798145 cattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 39798046  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798045 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 39798004  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24753830 - 24753588
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24753830 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 24753731  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24753730 acattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatacgatgtcgccgtcgtcgcgaata 24753631  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24753630 agcaaaagcatatagcttgccgttttccatacgtattcatctc 24753588  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41181677 - 41181919
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41181677 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 41181776  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  41181777 acattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgtata 41181876  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41181877 agccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 41181919  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 3795651 - 3795859
Alignment:
Q  35 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3795651 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 3795750  T
Q  135 atatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795751 atatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcacgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 3795850  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  3795851 attcatctc 3795859  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 28342789 - 28343032
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28342789 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatccctactt 28342888  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccg-aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaat 199  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28342889 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaat 28342988  T
Q  200 aagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  28342989 aagccaaggcatatagcttgccgttttacatgtgtattcgtctc 28343032  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45479605 - 45479385
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatg 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45479605 gtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatg 45479506  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45479505 gaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgccgatatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccg 45479406  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  45479405 ttttccatgtgtattcatctc 45479385  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 12905786 - 12906037
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||          ||||||||||||||||||||||    
T  12905786 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaa 12905885  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12905886 atccgtacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 12905985  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12905986 gtcgcgaataagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatct 12906037  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24601906 - 24602160
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaa 86  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||||    
T  24601906 atttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaa 24602005  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24602006 ttaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatatatata--atatattatcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgttgc 24602103  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24602104 tatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctc 24602160  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24612208 - 24611954
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaa 86  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||||    
T  24612208 atttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaa 24612109  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24612108 ttaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatatatata--atatattatcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgttgc 24612011  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24612010 tatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctc 24611954  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43943958 - 43944210
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||          ||||||||||||||||||||||    
T  43943958 atttggttcaaattacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaacaacacattacaattcattacacatcattaaattaa 43944057  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  43944058 atccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatatattatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatc 43944157  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43944158 atcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 43944210  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 1096897 - 1097092
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1096897 aagtgttcataattaaacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 1096996  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1096997 tatcttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcgcaaataagcccaagcatataacttgccgttttccatgcgtattcgtctc 1097092  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9659801 - 9659604
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacataca--tatacaatat 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||    
T  9659801 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatacctacttacattcaacgcaattgcatattgaacgaacatacaaatataaaatat 9659702  T
Q  146 attgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9659701 attatcttccaccatattccgaaacataaactcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 9659604  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38950372 - 38950234
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38950372 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 38950273  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatata 139  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38950272 acattcaacacaattacatatggaacgaacatacatata 38950234  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 439569 - 439374
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  439569 aagtgttcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctccttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 439470  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  439469 tactttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccagggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 439374  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1150783 - 1150595
Alignment:
Q  55 cataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttc 154  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  1150783 cataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttc 1150684  T
Q  155 caccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1150683 catcatattccaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttccatgcgtatttatctc 1150595  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 82009 - 81814
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  82009 aagtgtgcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatgcatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 81910  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81909 tattttcaaccatattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgtctttaataagtcaagggatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 81814  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 41052949 - 41053142
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatat--ggaacgaacatacatatacaa-ta 144  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| || ||    
T  41052949 aagtgtccataattaaacaattcattacacatcattaaatt-----cctacttacattcaatgcaattgcatatatggaacgaacacacatatataaata 41053043  T
Q  145 tattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  41053044 tattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttggcgttttcaatgcgtattcgtctc 41053142  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 18000500 - 18000608
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18000500 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 18000599  T
Q  101 acattcaat 109  Q
    |||||||||    
T  18000600 acattcaat 18000608  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38949852 - 38949750
Alignment:
Q  141 aatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcat 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38949852 aatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattcat 38949753  T
Q  241 ctc 243  Q
    |||    
T  38949752 ctc 38949750  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41004793 - 41005045
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||| |||||    
T  41004793 atttggtttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaa 41004892  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||  ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | || || ||||||| |||||||||||| |||||| |  ||    
T  41004893 atcactacttacattcatcacaattgcatatggaatgaacatacatatataatatataatttttcaacatattctgaaacataaatctgacgtcccaatc 41004992  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41004993 gtctttaataagccagggcatgtagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 41005045  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 41052888 - 41052950
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 63  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41052888 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa 41052950  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 82070 - 82008
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 63  Q
    ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82070 atttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa 82008  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 1096836 - 1096898
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 63  Q
    |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1096836 atttggttcaaactacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa 1096898  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 25613538 - 25613697
Alignment:
Q  70 cattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaa 169  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  || | |||||| |||||  | || |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||  |  ||||||  |||    
T  25613538 cattacatatcattacataaaatctctattgacattctatgcacatgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatctttaattatattcataaa 25613637  T
Q  170 cataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca 229  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  25613638 cataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacatagctcgccgttttcca 25613697  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 3795603 - 3795641
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaa 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3795603 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 3795641  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 439630 - 439580
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt 51  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  439630 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaagcgttacaaagt 439580  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 9659862 - 9659816
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattaca 47  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9659862 atttggttaaaattacacaaacgcttgaaattcatcaaaacgttaca 9659816  T

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Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 30301402 - 30301644
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30301402 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 30301501  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301502 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 30301601  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301602 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 30301644  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8419672 - 8419914
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8419672 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 8419771  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419772 acattcaatgcaattacatatggaacgaacgtacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 8419871  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419872 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 8419914  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7344362 - 7344120
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7344362 atttggttaaaattaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 7344263  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7344262 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaata 7344163  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344162 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 7344120  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 32375919 - 32376161
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32375919 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 32376018  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32376019 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaata 32376118  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32376119 agcaaaggcatatagcttgccgtttcccatgcgtattcatctc 32376161  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 23924232 - 23924474
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23924232 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 23924331  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924332 acattcaacgcaactgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 23924431  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924432 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 23924474  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 39724 - 39966
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39724 atttggttaaaattaaacaaacatttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 39823  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39824 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacatcgccgtcgttgcgaata 39923  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39924 agcaaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 39966  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31959867 - 31959611
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||||    
T  31959867 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaattgtccataattaaacaactcattacacatcattaaa 31959768  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31959767 ttaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgc 31959668  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959667 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 31959611  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 35962574 - 35962816
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  35962574 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtgcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaattcctactt 35962673  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35962674 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 35962773  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35962774 agccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 35962816  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22588244 - 22588006
Alignment:
Q  5 ggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacat 104  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22588244 ggttcaaattacacaaacgtttgaaattgatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacat 22588145  T
Q  105 tcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagca 204  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||   ||| |||     
T  22588144 tcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagcc 22588045  T
Q  205 aaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588044 aagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 22588006  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 2124508 - 2124703
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2124508 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatat 2124607  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2124608 tatcttccaccatattccgaaacataaatccaaagtcgctattgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 2124703  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43377038 - 43376843
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43377038 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 43376939  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43376938 tatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcactatcgtcgcgaataaaccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 43376843  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7172111 - 7171881
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattaca----------catcattaaattaaatccatacttacattcaatgca 112  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||          |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7172111 gtttgaaattcatgaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgca 7172012  T
Q  113 attacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  7172011 attgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcata 7171912  T
Q  213 tagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7171911 tagcttgccattttccatgcgtattcatctc 7171881  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43679663 - 43679905
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  43679663 atttggttcaaattacacaaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctgctt 43679762  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||   ||||    
T  43679763 acattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtctctatcgtctttaata 43679862  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43679863 agtcaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtgttcatctc 43679905  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22661380 - 22661138
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||| |||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||  ||||     
T  22661380 atttcgttaaaattacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacatatcgttaaattaaatctctactg 22661281  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||    
T  22661280 acattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattccgaaacatagacccgacgtcgctatcgtcgtgaata 22661181  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22661180 agccaaggcatatggcttgccgttttccatgcatattcatctc 22661138  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744332
Alignment:
Q  71 attacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaac 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41744160 attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaat 41744259  T
Q  171 ataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41744260 ataaatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtattcatctc 41744332  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20549065 - 20548938
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20549065 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttactt 20548966  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacga 128  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20548965 acattcaacgcaattgcatatggaacga 20548938  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 39751327 - 39751473
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39751327 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 39751426  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39751427 acattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 39751473  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4867587 - 4867415
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||          |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4867587 gtttgaaattcatcaaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaattaaatccctacttacattcaacgca 4867488  T
Q  113 attacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg 185  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4867487 attggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataatccgaaacataaatccgacgtcg 4867415  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Original strand, 39751661 - 39751758
Alignment:
Q  141 aatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 238  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39751661 aatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttccatgcgtattc 39751758  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30972680 - 30972519
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||   ||       
T  30972680 atttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagagtatacataattaaacaacacattacacatcattacataaaatatctatcg 30972581  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatat 162  Q
    |||||| | |||  | || ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30972580 acattctacgcatgtgcaaatggaacaaacacacatatataatatattatcttcaaccatat 30972519  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Original strand, 31281198 - 31281262
Alignment:
Q  120 atggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 184  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31281198 atggaacgaacataaagatataatatattatcttcaaccatattctgaaacataaatcctacgtc 31281262  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 43377099 - 43377045
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtcc 55  Q
    |||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43377099 atttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtcc 43377045  T

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Target: chr7 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43619947 - 43620189
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43619947 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 43620046  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620047 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 43620146  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620147 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 43620189  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45767666 - 45767424
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45767666 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 45767567  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767566 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 45767467  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767466 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 45767424  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30790812 - 30790570
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30790812 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 30790713  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790712 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 30790613  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30790612 agcaaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctc 30790570  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 604046 - 604288
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  604046 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 604145  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604146 acattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 604245  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604246 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 604288  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15070155 - 15069914
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15070155 tttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactta 15070056  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070055 cattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 15069956  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069955 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 15069914  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18109598 - 18109357
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18109598 tttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactta 18109499  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109498 cattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 18109399  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109398 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 18109357  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42503643 - 42503402
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42503643 tttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactta 42503544  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42503543 cattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 42503444  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42503443 gcaaaggcatgtagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 42503402  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47742795 - 47742553
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47742795 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 47742696  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47742695 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaata 47742596  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47742595 agccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 47742553  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 34622765 - 34623002
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  34622765 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacttctactt 34622864  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34622865 acattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 34622964  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622965 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 34623002  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19044559 - 19044815
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaa 86  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19044559 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaa 19044658  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19044659 ttaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgc 19044758  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19044759 tatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctc 19044815  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20710077 - 20709821
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaa 86  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || | ||||||||||||||||||    
T  20710077 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaa 20709978  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20709977 ttaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgc 20709878  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20709877 tatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctc 20709821  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29593011
Alignment:
Q  71 attacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaac 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  29592839 attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtattatcttccaccatattccgaaac 29592938  T
Q  171 ataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592939 ataaatctgacgtcgctatcgttgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattcatctc 29593011  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 10705514 - 10705765
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacta----------ctcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |          |||||||||||||| ||||||||    
T  10705514 atttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataaattaa 10705613  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  10705614 atctctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatc 10705713  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    |||   ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10705714 gtcttcaattagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatct 10705765  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47065050 - 47064858
Alignment:
Q  51 tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgt 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47065050 tgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattat 47064951  T
Q  151 cttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  || ||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47064950 tttccaccatatttcgaaacataaatttgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 47064858  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12111482 - 12111729
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacta----------ctcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| |||||| ||  | |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |          ||||||||| |||||||||||||    
T  12111482 atttggttcaaattacaccaaagtttaaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaa 12111581  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12111582 atccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatattccgaaatataaatccgacgtcgctatc 12111679  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcat 240  Q
     ||   ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12111680 atctttaataaaccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcat 12111729  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 40928759 - 40928715
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacatta 45  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40928759 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacatta 40928715  T

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Target: chr6 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 1608561 - 1608803
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1608561 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 1608660  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608661 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 1608760  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608761 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 1608803  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 13382942 - 13383150
Alignment:
Q  35 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13382942 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 13383041  T
Q  135 atatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13383042 atatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgacgttttccatgcgt 13383141  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  13383142 attcatctc 13383150  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29286469 - 29286711
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29286469 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacctctactt 29286568  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29286569 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 29286668  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  29286669 agccaaggcatatagtttgccgttttctatgtgtattcgtctc 29286711  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25140912 - 25140669
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25140912 atttggttcaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaacacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 25140813  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacataca-tatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaat 199  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  25140812 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacattatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatgcgacgtcgctatcgtcacgaat 25140713  T
Q  200 aagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25140712 aagccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcgtctc 25140669  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31150871 - 31150629
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31150871 atttggttccaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacat 31150772  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31150771 acattcaacgcaattgcatatcgatcaaacatacatatataatatattatcttccaccatattctaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 31150672  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31150671 agccaaggcatatagcttgccgttttccaagcgtattcatctc 31150629  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 23959157 - 23959399
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23959157 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 23959256  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  23959257 acattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttacaccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtcgtgaata 23959356  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959357 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 23959399  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 2051355 - 2051545
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2051355 aagtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 2051454  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 238  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2051455 tatcttccaccatatttcgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaagacatataacttgccgttttccatgcgtattc 2051545  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7537453 - 7537709
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaa 86  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||              |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  7537453 atttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatctaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattgcacatcattaaa 7537552  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7537553 ttaaatccctacttacattcaacgcaaatgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 7537652  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
      ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7537653 tatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgctgttttccatgcgtattcgtctc 7537709  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29667639 - 29667387
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||||    
T  29667639 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaa 29667540  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||    
T  29667539 atccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattaacttccaccatattccgaaacataaatctgacatcgctatc 29667440  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29667439 gtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 29667387  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18610029 - 18609797
Alignment:
Q  11 aattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatg 110  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||       
T  18610029 aattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatca 18609930  T
Q  111 caattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||| ||||||    
T  18609929 caattgcatatggaacgaacatacatatataatatataattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggca 18609830  T
Q  211 tatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  18609829 tataacttgtcgttttccatgcatatttatctc 18609797  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28362473 - 28362281
Alignment:
Q  51 tgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgt 150  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  28362473 tgtccatcattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattctacacaattgcatatcgatcgaacatacatatataatatattat 28362374  T
Q  151 cttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28362373 cttccaccatattctgaaacataaattcgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcttattcatctc 28362281  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 2259376 - 2259593
Alignment:
Q  25 ttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatgga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||    
T  2259376 ttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttattaaattaaatccttacttacattcaacgta-ttgcatatgga 2259474  T
Q  125 acgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtt 224  Q
    || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||   ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  2259475 acaaacatgcatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctttcgtctttaataagccaatgcatatagcttgtcgtt 2259574  T
Q  225 ttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  2259575 ttctatgcgtattcatctc 2259593  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18351449 - 18351348
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18351449 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactacttattacacatcattaaattaaatccctactt 18351350  T
Q  101 ac 102  Q
    ||    
T  18351349 ac 18351348  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 184
Target Start/End: Original strand, 34230770 - 34230930
Alignment:
Q  24 tttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatgg 123  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |  || || || ||||    
T  34230770 tttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatgg 34230869  T
Q  124 aacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 184  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  34230870 aacgaacatacatatataatatattatcttctaccatattctaaaacataaatcggacgtc 34230930  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 26702518 - 26702454
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac 65  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26702518 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaac 26702454  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 13382894 - 13382932
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaa 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13382894 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 13382932  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20448571 - 20448386
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatg 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||| || ||||   ||   |||||| |  || || || |||    
T  20448571 gtttgaaattcataaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatttcatatcattacataaaatatctatcgacattctacacatttgcaaatg 20448472  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc 209  Q
     ||| |||| ||||||| |||||||| |||| || ||||| || ||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  20448471 taacaaacacacatatataatatattatctt-caacatatacctaaacataaatgaaacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggc 20448386  T

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Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 49564109 - 49564351
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49564109 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 49564208  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564209 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 49564308  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564309 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 49564351  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3408044 - 3407803
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3408044 tttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactta 3407945  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407944 cattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 3407845  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3407844 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctc 3407803  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 19069501 - 19069709
Alignment:
Q  35 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19069501 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 19069600  T
Q  135 atatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 234  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069601 atgtataatatattatcttccaccatattccgaaacataaacccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 19069700  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  19069701 attcatctc 19069709  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 10374306 - 10374548
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10374306 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaggtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 10374405  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  10374406 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaata 10374505  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10374506 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 10374548  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10423210 - 10422972
Alignment:
Q  5 ggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacat 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10423210 ggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccataattaaacaactcattacatatcattagattaaatccctacttacat 10423111  T
Q  105 tcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagca 204  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  10423110 tcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcaatcgccgcgaataagcc 10423011  T
Q  205 aaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  10423010 aagacatatagcttgtcgttttccatgtgtattcgtctc 10422972  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37394962 - 37394768
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37394962 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 37394863  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37394862 tatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatacaacttgccgttttccatgcgtattcatct 37394768  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44050838 - 44050650
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44050838 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 44050739  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtatt 237  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44050738 tatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa-acatatagcttgttgttttccatgcgtatt 44050650  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4774344 - 4774168
Alignment:
Q  67 actcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  4774344 actcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccg 4774245  T
Q  167 aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4774244 aaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 4774168  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 38460692 - 38460934
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  38460692 atttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctactt 38460791  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||   ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||   ||||    
T  38460792 acattcatcacaattgcatatgcaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctttaata 38460891  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38460892 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgcattcatctc 38460934  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 18578911 - 18579141
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||    
T  18578911 gtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatcacttcttacattcaacgca 18579010  T
Q  113 attacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcata 212  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||| ||| ||||||||    
T  18579011 attgcatatagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcttcaattagccaaggcata 18579110  T
Q  213 tagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18579111 tagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 18579141  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11506831 - 11506658
Alignment:
Q  70 cattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaa 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||    
T  11506831 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 11506732  T
Q  170 cataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||  | |||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11506731 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 11506658  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24415425 - 24415679
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||    
T  24415425 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaaattaa 24415524  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  24415525 atccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccatcatattccgaaacataaatgcaacgtcgctatc 24415624  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggc--atatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   ||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24415625 gtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctc 24415679  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 50904969 - 50904822
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  50904969 attttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgatacaaagtgttcataattaaacaattcatttcacatcattaaattaaatccctactt 50904870  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatatt 148  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  50904869 acattcaacacaattgcatatggaacaaacatacaaatataatatatt 50904822  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6186915 - 6187140
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacac----------atcattaaattaa 90  Q
    |||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||           |||||||||||||    
T  6186915 atttcgttaaaattacacgtatgtttgaaattcatcaaaacattaaagggtgtccataattaaacaacacattacaacatattacatatcattaaattaa 6187014  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||  |||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||  ||    
T  6187015 atctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattgctaaacataaatccaatgtcgctatc 6187114  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagc 216  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||    
T  6187115 gtcgtgaataagccaagacacatagc 6187140  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 51642273 - 51642421
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------actactcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          || |||||||||| |||||||| ||||    
T  51642273 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaagttaa 51642372  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatata 139  Q
    ||||  |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51642373 atcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatacatata 51642421  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 44050899 - 44050837
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 63  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44050899 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa 44050837  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30043110 - 30043046
Alignment:
Q  120 atggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 184  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30043110 atggaacgaaaatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtc 30043046  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 37395023 - 37394961
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 63  Q
    ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37395023 atttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa 37394961  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15995988 - 15996026
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaa 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15995988 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 15996026  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 19069453 - 19069491
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaa 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19069453 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 19069491  T

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Target: chr3 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8156776 - 8157018
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
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T  8156776 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 8156875  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
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T  8156876 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 8156975  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156976 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 8157018  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 30943458 - 30943700
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
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T  30943458 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 30943557  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
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T  30943558 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 30943657  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943658 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 30943700  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3953020 - 3952778
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
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T  3953020 atttggttaaaattaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 3952921  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
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T  3952920 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaata 3952821  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952820 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 3952778  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6745132 - 6744890
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6745132 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 6745033  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6745032 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaata 6744933  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744932 agcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 6744890  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13743534 - 13743775
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
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T  13743534 atttggttaaa-ttaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 13743632  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743633 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 13743732  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743733 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 13743775  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 9426872 - 9427114
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9426872 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 9426971  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9426972 acattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 9427071  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9427072 agcaaaggcatatagtttgccgttttccatgcgtattcatctc 9427114  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2857788 - 2857546
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2857788 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcttaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 2857689  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857688 acattcaacgcaattacatatggaatgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 2857589  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857588 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 2857546  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 2743756 - 2743964
Alignment:
Q  35 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2743756 tcaaaacattacaaagtgttcataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 2743855  T
Q  135 atatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 234  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2743856 gtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 2743955  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  2743956 attcatctc 2743964  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 48246678 - 48246920
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48246678 atttggttaaaattacacaaacttttgaaattcatcaaaaaattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 48246777  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48246778 acattcaacgcagttgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 48246877  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48246878 agccaaagcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 48246920  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50957451 - 50957243
Alignment:
Q  35 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50957451 tcaaaacattccaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 50957352  T
Q  135 atatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50957351 atatataatatattatcttccaccatattccgaaacaaaaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgt 50957252  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  50957251 attcatctc 50957243  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4002311 - 4002055
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtc--------------cataattaaactactcattacacatcattaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4002311 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataactaagtgtccataattaaataactcattacacatcattaaa 4002212  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4002211 ttaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgc 4002112  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4002111 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 4002055  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14402764 - 14402569
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14402764 aagtgtccataattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatat 14402665  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14402664 tattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 14402569  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 36813104 - 36813360
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36813104 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtttccataattaattgtccataattaaacaactcattacacatcattaaa 36813203  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36813204 ttatatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatattccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 36813303  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36813304 cgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccacacgtattcatctc 36813360  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21952066 - 21952305
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  21952066 atttgattaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccatgattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctagtt 21952165  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  21952166 acattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatatcatcttccaccatattccgaaacctaaatccgacgtcgctatcatcgcgaata 21952265  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcat 240  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21952266 agccaaggcacatagcttgccgttttccatgcgtattcat 21952305  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 46989840 - 46990035
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46989840 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatgtggaacgaacatacatatataatatat 46989939  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46989940 tatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgtcatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 46990035  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 6489657 - 6489852
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6489657 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 6489756  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6489757 tatcttccaccatattccgaaatataaatccgacgacgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 6489852  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 67140 - 67392
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||| ||    
T  67140 atttggttcaaactacacaaaagtttgaaattcatcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatgaa 67239  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  67240 atccctacttacattcaacgcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatt 67339  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  67340 gtctttaataagccaagacatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc 67392  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 7841362 - 7841474
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7841362 atttggttaaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctactt 7841461  T
Q  101 acattcaatgcaa 113  Q
    |||||||| ||||    
T  7841462 acattcaacgcaa 7841474  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14402816 - 14402772
Alignment:
Q  10 aaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtc 54  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14402816 aaattaaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtc 14402772  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 2743708 - 2743746
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaa 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2743708 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 2743746  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 50957499 - 50957461
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaa 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50957499 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 50957461  T

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Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 3944242 - 3944484
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3944242 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 3944341  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944342 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 3944441  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944442 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 3944484  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3993648 - 3993406
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3993648 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 3993549  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3993548 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 3993449  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993448 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 3993406  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20353741 - 20353500
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20353741 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattatacatcattaaattaaatccctactt 20353642  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353641 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 20353542  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353541 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 20353500  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29352500 - 29352742
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29352500 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 29352599  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352600 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 29352699  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352700 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 29352742  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 38771898 - 38772140
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38771898 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 38771997  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38771998 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcaccgtcgtcgcggata 38772097  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38772098 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 38772140  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44469817 - 44469575
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44469817 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 44469718  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44469717 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 44469618  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44469617 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 44469575  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13633677 - 13633436
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13633677 tttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcaataaattaaatccctactta 13633578  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13633577 cattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcatcgcgaataa 13633478  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13633477 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 13633436  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30909834 - 30909593
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30909834 tttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactcattacacatcattaaattaaatccctactta 30909735  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30909734 cattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 30909635  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30909634 gcaaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctc 30909593  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5082170 - 5081928
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5082170 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactccttacacatcattaaattaaatccatattt 5082071  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5082070 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 5081971  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5081970 agcaaaggcatataccttgtcgttttccatgcgtattcatctc 5081928  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Original strand, 6558202 - 6558410
Alignment:
Q  35 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6558202 tcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 6558301  T
Q  135 atatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 234  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558302 atatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 6558401  T
Q  235 attcatctc 243  Q
    |||||||||    
T  6558402 attcatctc 6558410  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 9710844 - 9711086
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9710844 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 9710943  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9710944 acattcaacgcaattgcatatggaaagaacatacatatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaata 9711043  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9711044 agcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc 9711086  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37019202 - 37018960
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37019202 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatctctactt 37019103  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  37019102 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcctatgtcgctatcgtcgcgaata 37019003  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37019002 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 37018960  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 12643519 - 12643714
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12643519 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 12643618  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643619 tattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 12643714  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8459224 - 8459466
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8459224 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattaaattaaatccctactt 8459323  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8459324 acattcaacgcaattacatatagaacgaacatacatgtataatatattatcttctaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 8459423  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8459424 agccaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 8459466  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 50113574 - 50113830
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaa--------------agtgtccataattaaactactcattacacatcattaaa 86  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50113574 atttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataacaaagtgtccataattaaacaactcattacacattattaaa 50113673  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50113674 ttaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgc 50113773  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113774 tatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 50113830  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7966250 - 7966497
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattac------acatcattaaattaaatcc 94  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||      |||||||||||||||||||    
T  7966250 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacatttacacatcattaaattaaatcc 7966349  T
Q  95 atacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcg 194  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  7966350 ctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcg 7966449  T
Q  195 cgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7966450 cgaataagc-aaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 7966497  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1655820 - 1655644
Alignment:
Q  67 actcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1655820 actcattacacatcattaaattaaatcattacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccg 1655721  T
Q  167 aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1655720 aaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 1655644  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25039887 - 25039645
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| ||| || ||| | |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25039887 atttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 25039788  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  25039787 acattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgacgcgaata 25039688  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25039687 agccaaggcgtatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 25039645  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 38690176 - 38690417
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38690176 atttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacacatcattatattaaatcc-tactt 38690274  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||   ||||    
T  38690275 acattcatcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaata 38690374  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38690375 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 38690417  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51666472 - 51666230
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51666472 atttggttcaaattacataaaagtttgaaattcatcaaaaagttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctactt 51666373  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||    
T  51666372 acattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtctttaata 51666273  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  51666272 agccaaggcatatagcttgtcgtgttccatgtgtattcatctc 51666230  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13177942 - 13177690
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||          ||||||||||| ||||||||||    
T  13177942 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcattacacattattaaattaa 13177843  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13177842 atccctacttactttcaatgcaattgcatatggaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 13177743  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13177742 gttgcgattaagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 13177690  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5141654 - 5141435
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatg 122  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  5141654 gtttgaaattcattaaaacgttaaatagtgtcaataattaaacaacacattatatatcgttaaattaaatctctactgacattctacgcaattgcatatg 5141555  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5141554 gaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacatacatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaacgcatatagcttgccg 5141455  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5141454 ttttccatgcgtattcatct 5141435  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Original strand, 19495387 - 19495562
Alignment:
Q  69 tcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19495387 tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaa 19495486  T
Q  169 acataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg-ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  19495487 acataaatccaacgtcgctatcgtctcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttttcatacgtattcatctc 19495562  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36072629 - 36072879
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||          ||||||||||||||||||||||    
T  36072629 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattagatagtgtccatgattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattaa 36072728  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36072729 atctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 36072828  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatc 241  Q
     ||   ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36072829 atcttcaattagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatc 36072879  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 33168192 - 33168422
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgca 112  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  33168192 gtttgaaaatcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacactcaacgca 33168291  T
Q  113 attacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   ||||||  ||||||||    
T  33168292 attacatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctaaaataagtcaaggcata 33168391  T
Q  213 tagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33168392 tagcttgttgttttccatgcgtattcatctc 33168422  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 46978972 - 46978798
Alignment:
Q  69 tcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaa 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  46978972 tcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcattaggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcgaa 46978873  T
Q  169 acataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  46978872 acataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctc 46978798  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15051154 - 15051053
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15051154 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 15051055  T
Q  101 ac 102  Q
    ||    
T  15051054 ac 15051053  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4518132 - 4517959
Alignment:
Q  67 actcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccg 166  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  4518132 actcattacacatcattatat--aatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccg 4518035  T
Q  167 aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4518034 aaacataaatccgacgttgctatagtctttaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatct 4517959  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 46886194 - 46886137
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccata 58  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46886194 atttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcgaaacattacaaagtgtccata 46886137  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 46979064 - 46979002
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 63  Q
    ||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46979064 atttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 46979002  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 1179880 - 1179955
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattaca 76  Q
    |||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||    
T  1179880 atttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccacaattaaacaacacattaca 1179955  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4518222 - 4518160
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 63  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4518222 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcagaacgttacaaaatgtccataattaa 4518160  T

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Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14280770 - 14280542
Alignment:
Q  15 aaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14280770 aaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaat 14280671  T
Q  115 tacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280670 tacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatata 14280571  T
Q  215 gcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280570 gcttgccgttttccatgcgtattcatctc 14280542  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 37814849 - 37815091
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37814849 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 37814948  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37814949 actttcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgtgaata 37815048  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37815049 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 37815091  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 38855983 - 38856224
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38855983 tttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattcaatccctactta 38856082  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856083 cattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 38856182  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856183 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 38856224  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 28882255 - 28882497
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28882255 atttcgttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccccactt 28882354  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28882355 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaata 28882454  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882455 agcaaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 28882497  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 11029277 - 11029516
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11029277 tttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--ccataattaaactactcatcacacatcattaaattaaatccctactta 11029374  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029375 cattcaacgcaattacatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 11029474  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029475 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 11029516  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27863670 - 27863912
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27863670 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 27863769  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27863770 acattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaata 27863869  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27863870 agcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc 27863912  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13563908 - 13564150
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13563908 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 13564007  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
T  13564008 acattcaacgcaattgcatatggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcgcaaata 13564107  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13564108 agccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 13564150  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 25890261 - 25890503
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25890261 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 25890360  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25890361 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgacgtcgtcgcgaata 25890460  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25890461 agcaaaggcatatcgcttgctgttttccacgcgtattcatctc 25890503  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7796844 - 7797086
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7796844 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 7796943  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7796944 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 7797043  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7797044 agccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 7797086  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7017778 - 7018007
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7017778 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 7017877  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||             || ||||||||||||||||||||||    
T  7017878 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatat-------------tctgacgtcgccgtcgtcgcgaata 7017964  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7017965 agcaaaggcatatagcttgccattttccatgtgtattcatctc 7018007  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34079937 - 34079753
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34079937 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttactt 34079838  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg 185  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34079837 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgccgtcg 34079753  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1039611 - 1039356
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa--------------actactcattacacatcattaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              || |||||||||| |||||||||    
T  1039611 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataattaagtgtcaataatttaacaactcattacatatcattaaa 1039512  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1039511 ttaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatattattttccaccatattcc-aaacataaatccgatgtcgc 1039413  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039412 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 1039356  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 34122852 - 34123047
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34122852 aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcatacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatatatatataatatat 34122951  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34122952 tatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttaccgttttccatgcgtattcatctc 34123047  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33994933 - 33994713
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatg 122  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33994933 gtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatg 33994834  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33994833 gaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattaagaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttgccg 33994734  T
Q  223 ttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  33994733 ttgtccatgcgtattcatctc 33994713  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 4196792 - 4197023
Alignment:
Q  10 aaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaat 109  Q
    |||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||      
T  4196792 aaattacacaaacgtttggtattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacatatgattatattaaatccctacttacattcatc 4196891  T
Q  110 gcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggc 209  Q
     ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   ||||||| |||||    
T  4196892 acaattgcatatggaacga--atacatatataatatattattttcgaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggc 4196989  T
Q  210 atatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4196990 atgtagcttgtcgttttccatgcatattcatctc 4197023  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24053420 - 24053672
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||     
T  24053420 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattat 24053519  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| || |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  24053520 atccctaattacattcaacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatc 24053619  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24053620 gtcttcaattcgccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc 24053672  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24050293 - 24050547
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||     
T  24050293 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattat 24050392  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatataca--atatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccg 188  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24050393 atccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgcta 24050492  T
Q  189 tcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||   |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24050493 tcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 24050547  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28387979 - 28387821
Alignment:
Q  83 taaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacg 182  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28387979 taaattaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg 28387880  T
Q  183 tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct 242  Q
    ||||  |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28387879 tcgctatcgtcgtgaataa-caaaggcatataacttgtcgttttccatgtgtattcatct 28387821  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 30352687 - 30352939
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaact----------actcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||           |||||||||| |||| ||||||||    
T  30352687 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataaattaa 30352786  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  30352787 atctttacttacattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatattattttccacaatattccgaaacataaatacgacgtcgctatc 30352886  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||   || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30352887 gtctttaacaagccaaggcatataacttgccgtttttcatgcatattcatctc 30352939  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43179552 - 43179429
Alignment:
Q  120 atggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43179552 atggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagctta 43179453  T
Q  220 ccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  43179452 ccgttttccatgcgtgttcatctc 43179429  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Original strand, 6267763 - 6267933
Alignment:
Q  23 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| | ||| || || |||    
T  6267763 gtttgaaattcatcataacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatg 6267862  T
Q  123 gaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcg 194  Q
    |||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6267863 gaacaaaaatacatatataatatattatcttccatcatattccg-aacataaattcgacgtcgccatcgtcg 6267933  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 25877946 - 25878082
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||  ||   ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25877946 aagtgtccataattaaacaactcattacacgtgattatattaaatccctacttaca--catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatat 25878043  T
Q  148 tgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25878044 tattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 25878082  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 43179706 - 43179631
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattaca 76  Q
    |||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||    
T  43179706 atttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacgttaaagagtgtccataattaaacaacacattaca 43179631  T

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Target: scaffold0494 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5131 - 4890
Alignment:
Q  2 tttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactta 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5131 tttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactta 5032  T
Q  102 cattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5031 cattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 4932  T
Q  202 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4931 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 4890  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15519
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15761 atttagttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 15662  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15661 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtccccgtcgtcgcgaata 15562  T
Q  201 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15561 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatacgtattcatctc 15519  T

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Target: scaffold0201 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22668 - 22923
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagt--------------gtccataattaaactactcattacacatcattaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22668 atttggttaaaattaaacaaacgtt-gaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaa 22766  T
Q  87 ttaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc 186  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22767 ttaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatataatattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgc 22866  T
Q  187 cgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867 cgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 22923  T

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Target: scaffold0513 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8602
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8466 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 8565  T
Q  101 acattcaatgcaattacatatggaacgaacatacata 137  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8566 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata 8602  T

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Target: scaffold0794 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1315
Alignment:
Q  70 cattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaa 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||    
T  1488 cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa 1389  T
Q  170 cataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||||||||||||  | |||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1388 cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 1315  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10975 - 10828
Alignment:
Q  96 tacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgc 195  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  10975 tacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcac 10876  T
Q  196 gaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10875 gaataagccaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctc 10828  T

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Target: scaffold0219 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19856 - 19743
Alignment:
Q  48 aagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatat 147  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19856 aagtgttcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatat 19757  T
Q  148 tgtcttccaccata 161  Q
    | ||||||||||||    
T  19756 tatcttccaccata 19743  T

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Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19498
Alignment:
Q  159 atattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19582 atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc 19498  T

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Target: scaffold0219; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 19917 - 19866
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtg 52  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19917 atttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtg 19866  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21904 - 22144
Alignment:
Q  1 atttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaa 90  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||| |||||    
T  21904 atttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaa 22003  T
Q  91 atccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatacaatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtc 190  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |     
T  22004 atccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatata---------tttttccaccatattccaaaacataaattcgacgtcgctatt 22094  T
Q  191 gtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcat 240  Q
    |||   ||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  22095 gtctttaataagccaagacatataacttgtcattttccatgcgtattcat 22144  T

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