View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4686-Insertion-3 (Length: 968)

Name: NF4686-Insertion-3
Description: NF4686
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4686-Insertion-3
NF4686-Insertion-3
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (8-948)||(36314146-36315089)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (11-832)||(19503690-19504492)
chr8 (8-832)||(19344848-19345653)
chr8 (8-607)||(19390270-19390864)
chr8 (11-458)||(19337135-19337582)
chr8 (44-458)||(19355188-19355602)
chr8 (8-445)||(19376296-19376733)
chr8 (18-440)||(19287403-19287825)
chr8 (250-797)||(19410701-19411229)
chr8 (8-427)||(19404427-19404846)
chr8 (8-440)||(19172821-19173250)
chr8 (250-795)||(19592051-19592574)
chr8 (250-636)||(19457720-19458091)
chr8 (250-636)||(19522987-19523358)
chr8 (250-795)||(19540124-19540647)
chr8 (250-782)||(19469213-19469723)
chr8 (11-218)||(19469728-19469935)
chr8 (11-218)||(19540652-19540859)
chr8 (11-218)||(19591839-19592046)
chr8 (8-237)||(19448193-19448422)
chr8 (8-237)||(19532654-19532883)
chr8 (534-846)||(19355714-19356022)
chr8 (521-846)||(19337681-19337996)
chr8 (516-832)||(19376801-19377113)
chr8 (510-800)||(19404923-19405209)
chr8 (242-427)||(19468610-19468795)
chr8 (242-427)||(19555531-19555716)
chr8 (8-218)||(19410486-19410696)
chr8 (8-218)||(19457505-19457715)
chr8 (8-218)||(19523363-19523573)
chr8 (510-797)||(19555171-19555454)
chr8 (8-218)||(19468792-19469002)
chr8 (8-218)||(19555713-19555923)
chr8 (510-633)||(19468410-19468533)
chr8 (674-797)||(19390951-19391073)
chr8 (8-114)||(19489780-19489886)
chr8 (282-415)||(19370913-19371046)
chr8 (525-607)||(19172660-19172742)
chr8 (522-620)||(19287901-19287999)
chr8 (282-415)||(19341133-19341266)
chr8 (674-800)||(19172474-19172599)
chr8 (753-848)||(19450698-19450793)
chr8 (753-848)||(19530283-19530378)
chr8 (544-591)||(19371145-19371192)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (66-440)||(19542803-19543177)
chr6 (510-606)||(19543241-19543337)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 875; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 875; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 36315089 - 36314146
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36315089 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttttgcttcaacaactttacccaaat 36314990  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314989 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 36314890  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36314889 cattggtttcatggttgactcctttgctacaaacgtcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcgggaa 36314790  T
Q  308 agtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314789 agtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccagtgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaag 36314690  T
Q  408 aatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagtttatacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgcta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36314689 aatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagtttatatgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgttgaagacaatgcta 36314590  T
Q  508 gtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314589 gtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggt 36314490  T
Q  608 ttttcagaaaaaggtgggaacacc---aagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314489 ttttcagaaaaaggtgggaacaccaaaaagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggaatgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgt 36314390  T
Q  705 tggagaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314389 tggagaaattgtagttgcaat-ggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagac 36314291  T
Q  805 agtcagggtaactttaacgtcttggtaatgccaacaaaatcagctctacgtaagttataatatcattttgattagatagggtcaaagtgattatttactg 904  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36314290 agtcagggtaactttaacgtcttggtaatgccaacaaaatcagctctacgtaagttataatatcattttaattagataggttcaaagtgattatttactg 36314191  T
Q  905 cttatttcaccgtagacatagcctt-cttcataccattagataca 948  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36314190 cttatttcaccgtagacatagccttccttcataccattagataca 36314146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 19504492 - 19503690
Alignment:
Q  11 accaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504492 accaataatcatttactcttcgcctcaaccaaccaacgacactgtggccactatgttagacaccggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 19504393  T
Q  111 acaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504392 acaaagagtatattatggcagagttttgattatccaacatacattttgatctcaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcat 19504293  T
Q  211 tggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  19504292 tggtttcatggttgactccttcgctaccaactccaggtaaatttagtcttgtatgggaaccaaaagaacgtgaattgaacataaggaaaagcggcaaagt 19504193  T
Q  311 gtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaat 410  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19504192 gcattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggaatattcgagaacattcccacaaaagttcaacgtatatatcagtacattattgtctctaacaagaat 19504093  T
Q  411 gaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagtttatacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgctagtg 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| | ||||  |   ||| ||||            ||    
T  19504092 gaagattctttcgctttcgaagttaaagatgggaagtttgcacgatggcaactaacctcgaaggggaggttagta---ggtcatga------------tg 19504008  T
Q  511 gagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttt 610  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19504007 gagagattgggaatgcagatatgtgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggaaataccaaattgtagggaaaatggtgaggtttt 19503908  T
Q  611 tcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggaga 710  Q
    ||||||||  | ||||||||||   ||  | ||||||||| || | | ||||  |  ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19503907 tcagaaaattgcgggaacacca---aacgtagacaatgcaacaacgtttgaacaggatgtgacttatagttacagtgattgcaagattagatgttggaga 19503811  T
Q  711 aattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagacagtcag 810  Q
    ||||||| ||||||| ||||||   ||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  19503810 aattgtaattgcaat-ggattccaggaattttatggtaatgggactggatgtatattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttggtgagtcag 19503712  T
Q  811 ggtaactttaacgtcttggtaa 832  Q
      ||||||  ||||||||||||    
T  19503711 aataacttctacgtcttggtaa 19503690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 832
Target Start/End: Original strand, 19344848 - 19345653
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19344848 gaaaccaataatcatttactcgtcacctcaacccataaacaacactttggccactatattagacacaggtaactttgtgcttcaacaatttcacccaaat 19344947  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19344948 gggacaaatagtttattatggcagagttttgattatcccgatcacactttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaactggacataattggt 19345047  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  19345048 cattggtttcatggatgactccttcgctaccaactccaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaagaaggtgaattgaacatcaagaaaagcggcat 19345147  T
Q  308 agtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaag 407  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19345148 agcgtattggaaaagcggaaaacttaatagcaatggaatattcgagaacattcccacgaaagttcaacgtatatatcagtacattattgtctctaacaag 19345247  T
Q  408 aatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagtttatacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgcta 507  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||| || | ||||  |   ||| ||||               
T  19345248 aatgaagattctttcgctttcgaagttaaagatgggaagtttgcacgatggcaactaacctcgaacgggaggttagta---ggtcatga----------- 19345333  T
Q  508 gtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggt 607  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19345334 -tggagatattgggaatgcagatatgtgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggaaataccaaattgtagggaaaatggtgaggt 19345432  T
Q  608 ttttcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttgg 707  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |    | ||| ||| | ||   | |||||    ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19345433 ttttcagaaaatggtgggaacaccaacc---ttagactatgaaacagtgtttgaattcgatgtgacttatagttacagtgattgcaagattagatgttgg 19345529  T
Q  708 agaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagacagt 807  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||   ||||| |||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||    
T  19345530 agaaattgttattgcaat-ggattccaggaattttatggtaatgggactggatgtacattctattcatggaattcaacacaatatgttgatttggtgagt 19345628  T
Q  808 cagggtaactttaacgtcttggtaa 832  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||    
T  19345629 cagaataacttctacgtcttggtaa 19345653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 607
Target Start/End: Original strand, 19390270 - 19390864
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19390270 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacccataaacaacactatggcaactatgctagacaccggtaactttgtgcttcaaaaatttcacccaaat 19390369  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390370 ggtacaaagagtttattatggcagagttttgattatcccgacgacactttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 19390469  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaa 307  Q
    ||||||||        | || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19390470 cattggtt--------ggcttcttcgctaccaactccaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggggaattgaacatcaagaaacgcggcaa 19390561  T
Q  308 agtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaag 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19390562 agtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggtttattcgagaacattccggtgaatgttcaacgtatatatcaatacattattgtctctaacaag 19390661  T
Q  408 aatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagtttatacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatga---agacaatg 504  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |  |||||||||| | ||||| ||||| ||||||   ||| | |     
T  19390662 gatgaagattcttttgctttcgaagttaaagatgggaagtttatacgatggttcattacctcgaaggggaggttaataagtgctgatgagggagagattt 19390761  T
Q  505 ctagtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtga 604  Q
     ||||| ||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19390762 atagtgcagacattgctaatgcagataagtgttatggatataatagtgatgccgggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgcagggaccctcgtga 19390861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 458
Target Start/End: Original strand, 19337135 - 19337582
Alignment:
Q  11 accaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 110  Q
    |||||| ||||||||   ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19337135 accaattatcatttattattcgcctcaaccaaccaacgacactgtggccactatgttagacaccggtaacttcgtgcttcaacagcttcacccaaatggg 19337234  T
Q  111 acaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||  |||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19337235 acaaagagtatattatggcagagttttgattctcccgtagacactttgttaccaacgatgaagttaggtgttaatcgtaaaacaggacataattggtcat 19337334  T
Q  211 tggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagt 310  Q
    |||||||| ||||| ||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  19337335 tggtttcacggttggctcattcgctaccaactccaggtgaacttagtcttgaatgggaaccaaaagaaggtgaattgaacatcaggaaaagtggcaaagt 19337434  T
Q  311 gtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaat 410  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19337435 gcattggaaaagtggaaaactcaaaagcaatggaatgttcgagaacattcctgcgaaagttcaacgtatataccagtacattattgtgtctaacaaggat 19337534  T
Q  411 gaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagtttatacgatgg 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19337535 gaagattcttttgcttttgaagttaaagatgggaaatttatacgatgg 19337582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 44 - 458
Target Start/End: Original strand, 19355188 - 19355602
Alignment:
Q  44 caacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatgggacaaagagtatattatggcagagttttgattat 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19355188 caacgacactgtggccactatgttagacacaggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatgggacaaagagtatactatggcagagttttgactat 19355287  T
Q  144 cccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcattggtttcatggttgactcctttgctacaaactt 243  Q
    || ||| |   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || || |||||    
T  19355288 ccaacagatagtttgatcccaacgatgaagttaggtgttaatcgaaaaacaggacataattggtcattggtttcacggttggctcattcgcgaccaactt 19355387  T
Q  244 caggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatgg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  19355388 caggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaagaaggtgaattgaacataaggaaaagcggcaaagtgcattggaaaagcggaaaacttagaagtaatgg 19355487  T
Q  344 aatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatggg 443  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| ||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  19355488 aatattcgagaacattccagcgaaagttcaaagtatatatcggtacattattgtgtctaacaaggatgaagattcttttgctttcgaagttaatgatggg 19355587  T
Q  444 aagtttatacgatgg 458  Q
    || ||||||||||||    
T  19355588 aattttatacgatgg 19355602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 445
Target Start/End: Original strand, 19376296 - 19376733
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  19376296 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaaccaataaacaacactttggccactatattagacacaggtaactttgtgcttcaacaatttcatcccaat 19376395  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19376396 gggtcaaagactgttttgtggcagagttttgattatccatcagacgttttgatcccaacgatgaagttaggcgttaatcgaaaaacaggatataattggt 19376495  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaa 307  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  19376496 cattggtgtcctggttgactccttcgcggacaacttcaggtgaatttagtcttgagtgggaaccaaaacaaggtgaactgaacatcaagaaaagcggcaa 19376595  T
Q  308 agtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaag 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  19376596 agtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggattattcgagaatattccggccaatgttcaaaatatgtatcggtacatcattgtctctaacaag 19376695  T
Q  408 aatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaa 445  Q
     |||||||||| ||   ||||||| |||||||| ||||    
T  19376696 gatgaagattcctttagttttgaaattaaagatcggaa 19376733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 440
Target Start/End: Original strand, 19287403 - 19287825
Alignment:
Q  18 atcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatgggacaaaga 117  Q
    ||||||||| |||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19287403 atcatttactcttcgcctcatccgaccaataatactgtcgccactatgttagacaccggtaactttgtgcttcaaaaaattcacccaaatgggacaaaga 19287502  T
Q  118 gtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcattggtttc 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19287503 atatattatggcagagttttgattatcccacagccactttgatcccaacaatgaagttaggtgttaaccgaaaaaccggacataattggtcgttggtttc 19287602  T
Q  218 atggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattgg 317  Q
    ||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19287603 atggttggctcattcgctaccaaattcaggtggatttagtcttgaatgggaacctaaagaaggtgaattgaacatcaagcaacgcggcaaagtgtattgg 19287702  T
Q  318 aaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagatt 417  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  19287703 aaaagcggaaaacgtagacgcaatggtttattcgagaacattccagtgaaagttcaacgtgtgtatcaatacattattgtctctaacaaggatgaagact 19287802  T
Q  418 ctttcgcttttgaagttaaagat 440  Q
    | ||| |||| ||| | ||||||    
T  19287803 ccttcactttcgaaatcaaagat 19287825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 250 - 797
Target Start/End: Original strand, 19410701 - 19411229
Alignment:
Q  250 aatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgtt 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  19410701 aatttaatcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggattatt 19410800  T
Q  350 cgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagttt 449  Q
    |||||| |||||    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  19410801 cgagaatattccggccaatgttcaaagtaggtatcagtacattattgtctctaacaaggatgaagattctttcacgttcgaagttaaagatgggaagttt 19410900  T
Q  450 atacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgctagtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataata 549  Q
      || |||||| |||||||||||||| ||||||  |   ||||||||            |||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19410901 gcacaatgggaactatcctcgaaggggaagttagta---ggtgatga------------tggatatattgctaatgcagatatgtgttacggatataata 19410985  T
Q  550 gcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgc 649  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||   || |||||| |    
T  19410986 gtgatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgcagggaacctggtgagatgtttcagaaaaaggcgggaagaccaagc---atagacaattc 19411082  T
Q  650 atcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataa 749  Q
    | || |||||||||     || | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |  ||  |||  |||    
T  19411083 aacaacatatgaattcgacgtgacttatagttacagtgattgcaagatcagatgttggaaaaattgtagttgcaat-ggattccaactatattatagtaa 19411181  T
Q  750 tttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttga 797  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19411182 tatgactggatgtgtattcctttcatggaattcgacacaatatgttga 19411229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Original strand, 19404427 - 19404846
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  19404427 gaaaccaattatcatttattcttcacctcaacccataaacaacactttggctactatattagacacaggtaactttgtgcttcgacaatttcaccccaat 19404526  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||| |||||| | | || ||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19404527 gggtcaaagactgtgttgtggcagagttttgattacccatcagacgttttgatcccaacgatgaagttaggagttaatcgaaaaacagcacataattggt 19404626  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaa 307  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||  | || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||    
T  19404627 cattggtgtcatggttaactccttcgcggccaaattcaggtaaatttagtcttgagtgggaaccaaaacaaggtgaactgaacatcaagaaaagaggcaa 19404726  T
Q  308 agtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaag 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    |||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  19404727 agtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcgatggattattcgagaatattccggccaatgttcaaactatgtatcaatacactattgtctctaacaag 19404826  T
Q  408 aatgaagattctttcgcttt 427  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  19404827 gatgaagattctttcacttt 19404846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19173250 - 19172821
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||  ||||   || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||     
T  19173250 gaaaccaataatcatatgctcttcacctcaacccataaaca---ctttggccactatattagacacaggtaactttgtgcttcgacaaatttaccccaac 19173154  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19173153 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccataaccactttgatcccaacgatgaagttaggtgttaaccgaaaaaccggacataattggt 19173054  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaa 307  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19173053 cattggtttcgtggttggctccttcgctaccgaattcaggtggatttagtgttgaatgggaaccaatggaaggtgaattgaacatcaagcaacgcggcaa 19172954  T
Q  308 agtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaag 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19172953 agtgtattggaaaagcggaaaacttaacagcaatggattattcaagaacattctagtgaaagttcaacatgtgtatcaatacattattgtctctaacaag 19172854  T
Q  408 aatgaagattctttcgcttttgaagttaaagat 440  Q
     ||||||| || ||| |||| ||| | ||||||    
T  19172853 gatgaagactccttcactttcgaaatcaaagat 19172821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 250 - 795
Target Start/End: Original strand, 19592051 - 19592574
Alignment:
Q  250 aatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgtt 349  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  19592051 aatttaatcttgaatggggaccaaaagaaggagaattgaacatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggattatt 19592150  T
Q  350 cgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagttt 449  Q
    |||||| |||||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  19592151 cgagaatattccggccaatgttcaaaataggtatcagtacattattgtctctaacaaggatgaagattctttcacgttcgaagttaaagatgggaagttt 19592250  T
Q  450 atacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgctagtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataata 549  Q
      || |||||| |||  |||||| || | ||||  |   ||||||||            |||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||||   |||    
T  19592251 gcacaatgggaactaatctcgaaagggaggttagta---ggtgatga------------tggatatattgctaatgcagatatgtgttacggat---ata 19592332  T
Q  550 gcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgc 649  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  | ||||||||    
T  19592333 gtgatggaggatgccaaaaatgggaggatataccaacttgcagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggcgggaacacca---aacgtagacaatgc 19592429  T
Q  650 atcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataa 749  Q
    | || | | ||||  |  ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||  |||||  ||||||||    
T  19592430 aacaacgtttgaacaggatgtgacttatagttacagtgattgcaagattagatgttggagaaattgtaattgcagt-gcattccaagaatattatgataa 19592528  T
Q  750 tttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgtt 795  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19592529 tgggactggatgtgtattccattcatggaattcgacacaatatgtt 19592574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 250 - 636
Target Start/End: Original strand, 19457720 - 19458091
Alignment:
Q  250 aatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgtt 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  19457720 aatttaatcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggattatt 19457819  T
Q  350 cgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagttt 449  Q
    |||||| |||||    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  19457820 cgagaatattccggccaatgttcaaagtaggtatcagtacattattgtctctaacaaggatgaagattctttcacgttcgaagttaaagatgggaagttt 19457919  T
Q  450 atacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgctagtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataata 549  Q
      || |||||| |||||||||||||| ||||||  |   ||||||||            |||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19457920 gcacaatgggaactatcctcgaaggggaagttagta---ggtgatga------------tggatatattgctaatgcagatatgtgttacggatataata 19458004  T
Q  550 gcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggtgggaacaccaagca 636  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19458005 gtgatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgcagggaacctggtgagatgtttcagaaaaaggcgggaagaccaagca 19458091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 250 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 19523358 - 19522987
Alignment:
Q  250 aatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgtt 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  19523358 aatttaatcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggattatt 19523259  T
Q  350 cgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagttt 449  Q
    |||||| |||||    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  19523258 cgagaatattccggccaatgttcaaagtaggtatcagtacattattgtctctaacaaggatgaagattctttcacgttcgaagttaaagatgggaagttt 19523159  T
Q  450 atacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgctagtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataata 549  Q
      || |||||| |||||||||||||| ||||||  |   ||||||||            |||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19523158 gcacaatgggaactatcctcgaaggggaagttagta---ggtgatga------------tggatatattgctaatgcagatatgtgttacggatataata 19523074  T
Q  550 gcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggtgggaacaccaagca 636  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19523073 gtgatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgcagggaacctggtgagatgtttcagaaaaaggcgggaagaccaagca 19522987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 250 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 19540647 - 19540124
Alignment:
Q  250 aatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgtt 349  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  19540647 aatttaatcttgaatggggaccaaaagaaggagaattgaacatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggattatt 19540548  T
Q  350 cgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagttt 449  Q
    |||||| |||||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  19540547 cgagaatattccggccaatgttcaaaataggtatcagtacattattgtctctaacaaggatgaagattctttcacgttcgaagttaaagatgggaagttt 19540448  T
Q  450 atacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgctagtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataata 549  Q
      || |||||| |||  |||||| || | ||||  |   ||||||||            |||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||||   |||    
T  19540447 gcacaatgggaactaatctcgaaagggaggttagta---ggtgatga------------tggatatattgctaatgcagatatgtgttacggat---ata 19540366  T
Q  550 gcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgc 649  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||   || |||||| |    
T  19540365 gtgatggaggatgccaaaaatgggaggatataccaacttgcagggaacctggtgaggtgtttcagaaaaaggcgggaagaccaagc---attgacaattc 19540269  T
Q  650 atcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataa 749  Q
    | || | | ||||  |  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||  |||||  ||||||||    
T  19540268 aacaacgtttgaagaggatgtgacttatagttacagtgattgcaagatgagatgttggaaaaattgtaattgcagt-gcattccaagaatattatgataa 19540170  T
Q  750 tttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgtt 795  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19540169 tgggactggatgtgtattccattcatggaattcgacacaatatgtt 19540124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 250 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 19469723 - 19469213
Alignment:
Q  250 aatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgtt 349  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  19469723 aatttaatcttgaatggggaccaaaagaaggagaattgaacatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaatggattatt 19469624  T
Q  350 cgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagatgggaagttt 449  Q
    |||||| |||||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  19469623 cgagaatattccggccaatgttcaaaataggtatcagtacattattgtctctaacaaggatgaagattctttcacgttcgaagttaaagatgggaagttt 19469524  T
Q  450 atacgatgggagctatcctcgaagggcaagttaacaagtggtgatgaagacaatgctagtggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataata 549  Q
      || |||||| |||  |||||| || | ||||  |   ||||||||            |||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||||   |||    
T  19469523 gcacaatgggaactaatctcgaaagggaggttagta---ggtgatga------------tggatatattgctaatgcagatatgtgttacggat---ata 19469442  T
Q  550 gcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgc 649  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||   || |||||| |    
T  19469441 gtgatggaggatgccaaaaatgggaggatataccaacttgcagggaacctggtgaggtgtttcagaaaaaggcgggaagaccaagc---attgacaattc 19469345  T
Q  650 atcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataa 749  Q
    | || | | ||||  |  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||  |||||  ||||||||    
T  19469344 aacaacgtttgaagaggatgtgacttatagttacagtgattgcaagatgagatgttggaaaaattgtaattgcagt-gcattccaagaatattatgataa 19469246  T
Q  750 tttgactggatgtgtattctattcatggaattc 782  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19469245 tgggactggatgtgtattccattcatggaattc 19469213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19469935 - 19469728
Alignment:
Q  11 accaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19469935 accaataatcatttactcttcacctcaacctaccaacaacactatggccactattttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 19469836  T
Q  111 acaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19469835 acaaagagtatattatggcagagtttcgattatcccacagacgtattgatcccaatgatgaagttgggagttaatcgaaaaactggacataaatggtcat 19469736  T
Q  211 tggtttca 218  Q
    ||||||||    
T  19469735 tggtttca 19469728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19540859 - 19540652
Alignment:
Q  11 accaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540859 accaataatcatttactcttcacctcaacctaccaacaacactatggccactattttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 19540760  T
Q  111 acaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19540759 acaaagagtatattatggcagagtttcgattatcccacagacgtattgatcccaatgatgaagttgggagttaatcgaaaaactggacataaatggtcat 19540660  T
Q  211 tggtttca 218  Q
    ||||||||    
T  19540659 tggtttca 19540652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 19591839 - 19592046
Alignment:
Q  11 accaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19591839 accaataatcatttactcttcacctcaacctaccaacaacactatggccactattttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatggg 19591938  T
Q  111 acaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19591939 acaaagagtatattatggcagagtttcgattatcccacagacgtattgatcccaatgatgaagttgggagttaatcgaaaaactggacataaatggtcat 19592038  T
Q  211 tggtttca 218  Q
    ||||||||    
T  19592039 tggtttca 19592046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 19448193 - 19448422
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19448193 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacccataaacaacactttggccactatattagacacaggtaactttgtgcttcaacaatttcaccccaat 19448292  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19448293 gggtcaaagactgtgttgtggcagagttttgattatccatcagacgttttgatcccaacgatgaagttaggcgttaatcaaaaaacaggacataattggt 19448392  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctac 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19448393 cattggtgtcatggttgactccttcgctac 19448422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19532883 - 19532654
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19532883 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacccataaacaacactttggccactatattagacacaggtaactttgtgcttcaacaatttcaccccaat 19532784  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19532783 gggtcaaagactgtgttgtggcagagttttgattatccatcagacgttttgatcccaacgatgaagttaggcgttaatcaaaaaacaggacataattggt 19532684  T
Q  208 cattggtttcatggttgactcctttgctac 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19532683 cattggtgtcatggttgactccttcgctac 19532654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 534 - 846
Target Start/End: Original strand, 19355714 - 19356022
Alignment:
Q  534 tgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaaggtgggaacaccaa 633  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19355714 tgttatggatataatagcgatggagggtgccaaaaatgggaggaaataccaaattgtagggaacctggtgaggtttttcggaaaaaggtgggaagaccaa 19355813  T
Q  634 gcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagttgcaatgggattcg 733  Q
      |||   ||||||||| || |   |||| |   ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||     
T  19355814 ataaa---gacaatgcaacaactactgaaggtgatgtgaattatggttatagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtaattgctat-ggattcc 19355909  T
Q  734 tagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagacagtcagggtaactttaacgtcttggtaat 833  Q
     |||||||||   |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||  ||||||| ||| ||||||||     
T  19355910 aagaattatacattaattttactggatgtatatactattcatggaattcaacacaagacgttgatttggacaaaaagaataacttttacgccttggtaaa 19356009  T
Q  834 gccaacaaaatca 846  Q
    |||||||||||||    
T  19356010 gccaacaaaatca 19356022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 521 - 846
Target Start/End: Original strand, 19337681 - 19337996
Alignment:
Q  521 aaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaag 620  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19337681 aaatgcagacatgtgttatggatataatagcgatggagggtgccaaaaatgggaggaaataccaaattgtagggaacctggtgaggtttttcggaaaatg 19337780  T
Q  621 gtgggaacaccaagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagtt 720  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||||||| || || |||||     ||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19337781 gtgggaagaccaaataaa---gacaatgcaacaacagatgaa---cctg---ctaatggttacgatgattgcaagatgagatgttggagaaattgtaatt 19337871  T
Q  721 gcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagacagtcagggtaacttta 820  Q
    || || ||||||| |||||||||   |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||  |||||||     
T  19337872 gctat-ggattcgaagaattatacagtaattttactggatgtatatactattcatggaattcgacacaagacgttgatttggacaaaaagaataactttt 19337970  T
Q  821 acgtcttggtaatgccaacaaaatca 846  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||    
T  19337971 acgccttggtaaagccaacaaaatca 19337996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 516 - 832
Target Start/End: Original strand, 19376801 - 19377113
Alignment:
Q  516 attggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcaga 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  19376801 attggaaatgcagatatatgttatggatataatagtgatcgagggtgccaaaaatgggaggatataccagcttgcagggaacctggtgaggtgtttcaaa 19376900  T
Q  616 aaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattg 715  Q
     ||||   |||| ||||| || |   |||||||||||| |   ||||  |  ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19376901 gaaagactggaagaccaaacata---gacaatgcatcaaccattgaacaggatgtgacttatgtttacagtgattgcaagataagatgttggagaaattg 19376997  T
Q  716 tagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagacagtcagggtaa 815  Q
    || ||||||||| ||||  |||||| |||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||    
T  19376998 taattgcaatgg-attccaagaattttatcgcaatgggactggatgtatattctattcatggaattcgacacaagatcttgatttggtgagtcaggataa 19377096  T
Q  816 ctttaacgtcttggtaa 832  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  19377097 cttttacgccttggtaa 19377113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 510 - 800
Target Start/End: Original strand, 19404923 - 19405209
Alignment:
Q  510 ggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggttt 609  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19404923 ggagatattggaaatgcagatatgtgttatggatataatagggacggagggtgccaaaagtgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtgt 19405022  T
Q  610 ttcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggag 709  Q
    ||||||  |||  ||||| ||||| ||  ||   |||||||||| |   |||| |   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19405023 ttcagaggaagacgggaagaccaaacatcat---caatgcatcaactactgaaggtgatgtgaattatggttacagtgattgcaagatgagatgttggag 19405119  T
Q  710 aaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgattt 800  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||| ||||   |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19405120 aaattgtaattgctat-ggattcgaagaactatacagtaattttactggatgtatatactattcatggaattcgacacaagacgtggattt 19405209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19468795 - 19468610
Alignment:
Q  242 ttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaat 341  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19468795 ttcaggtgaatttaatctagattgggaaccaaaacaaggtgaattgatcatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaat 19468696  T
Q  342 ggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttt 427  Q
    ||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  19468695 ggattattcgagaatattccggtgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtctctaacaaagacgaagattctttcacttt 19468610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19555716 - 19555531
Alignment:
Q  242 ttcaggtgaatttagtcttgaatgggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaat 341  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19555716 ttcaggtgaatttaatctagattgggaaccaaaacaaggtgaattgatcatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttaaaagcaat 19555617  T
Q  342 ggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttt 427  Q
    ||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  19555616 ggattattcgagaatattccggtgaatgttcaacatatgtatcagtacattattgtctctaacaaagacgaagattctttcacttt 19555531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Original strand, 19410486 - 19410696
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || ||     
T  19410486 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacctaccaacaacactgtggccactatgttagacgccggtaactttgtgcttcaacaatttcttcccaac 19410585  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||  ||| |||| | || ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410586 ggctcaatgagtgtgttgtggcagagttttgattatccatcagacgttttgatcccaatgatgaagttaggcgttaatcgaaaaacaggacataattggt 19410685  T
Q  208 cattggtttca 218  Q
    |||||||||||    
T  19410686 cattggtttca 19410696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Original strand, 19457505 - 19457715
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || ||     
T  19457505 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacctaccaacaacactgtggccactatgttagacgccggtaactttgtgcttcaacaatttcttcccaac 19457604  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||  ||| |||| | || ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19457605 ggctcaatgagtgtgttgtggcagagttttgattatccatcagacgttttgatcccaatgatgaagttaggcgttaatcgaaaaacaggacataattggt 19457704  T
Q  208 cattggtttca 218  Q
    |||||||||||    
T  19457705 cattggtttca 19457715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19523573 - 19523363
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  || ||     
T  19523573 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacctaccaacaacactgtggccactatgttagacgccggtaactttgtgcttcaacaatttcttcccaac 19523474  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||  ||| |||| | || ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19523473 ggctcaatgagtgtgttgtggcagagttttgattatccatcagacgttttgatcccaatgatgaagttaggcgttaatcgaaaaacaggacataattggt 19523374  T
Q  208 cattggtttca 218  Q
    |||||||||||    
T  19523373 cattggtttca 19523363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 510 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 19555454 - 19555171
Alignment:
Q  510 ggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggttt 609  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  19555454 ggagatattgtaaatgcagatatgtgttatggatataatagtgatggaggatgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggcacctggtgaggggt 19555355  T
Q  610 ttcagaaaaaggtgggaacaccaagcaaaatggacaatgcatcatcatatgaatggagtgtaatttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggag 709  Q
    |||||||||||| ||||| ||||   || || |||||| || || | |||||||    ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19555354 ttcagaaaaaggcgggaagacca---aacatagacaattcaacaacgtatgaattcgatgtgacttatagttacagtgattgcaagatgaaatgttggaa 19555258  T
Q  710 aaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttga 797  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |  ||  |||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19555257 aaattgtagttgcaat-ggattccaactatattatagtaatatgactggatgtgtattcctttcatggaattcgacacaatatgttga 19555171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19469002 - 19468792
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||    
T  19469002 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacccataaacaacactatggccactatattagacacaggtaactttgtgcttcgacaatttcatcccaat 19468903  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||  ||| |||| | || |||||||||||||||||||||    ||  |||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19468902 ggctcaatgagtgtgttgtggcagagttttgattatcccgatgacactttggttccaacgatgaagttaggcgttaatcggaaaacaggacataattggt 19468803  T
Q  208 cattggtttca 218  Q
    |||||||||||    
T  19468802 cattggtttca 19468792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19555923 - 19555713
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||    
T  19555923 gaaaccaataatcatttactcttcacctcaacccataaacaacactatggccactatattagacacaggtaactttgtgcttcgacaatttcatcccaat 19555824  T
Q  108 gggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaacgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggt 207  Q
    ||  ||| |||| | || |||||||||||||||||||||    ||  |||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19555823 ggctcaatgagtgtgttgtggcagagttttgattatcccgatgacactttggttccaacgatgaagttaggcgttaatcggaaaacaggacataattggt 19555724  T
Q  208 cattggtttca 218  Q
    |||||||||||    
T  19555723 cattggtttca 19555713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 510 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 19468533 - 19468410
Alignment:
Q  510 ggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggttt 609  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  19468533 ggagatattgtaaatgcagatatgtgttatggatataatagtgatggaggatgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggcacctggtgaggggt 19468434  T
Q  610 ttcagaaaaaggtgggaacaccaa 633  Q
    |||||||||||| ||||| |||||    
T  19468433 ttcagaaaaaggcgggaagaccaa 19468410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 674 - 797
Target Start/End: Original strand, 19390951 - 19391073
Alignment:
Q  674 ttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattc 773  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  19390951 ttatagttacagtgattgcaagatgagatgttggaaaaattgtagttgcaat-ggattccaagaattgtatgataatgggactggatgtatattctattc 19391049  T
Q  774 atggaattcgacacaagatgttga 797  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  19391050 atggaattcgacgcaatatgttga 19391073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 19489780 - 19489886
Alignment:
Q  8 gaaaccaatgatcatttacacttcacctcaacccaacaacaacactgtggccactatgttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaat 107  Q
    ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19489780 gaaaccaataatcatttacttgtcaactcaacccaccaacaacacggtggccactatgttagacaccggtaacttggtgattcaacaacttcacccaaat 19489879  T
Q  108 gggacaa 114  Q
    |||||||    
T  19489880 gggacaa 19489886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 415
Target Start/End: Original strand, 19370913 - 19371046
Alignment:
Q  282 gaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgt 381  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||| |||    
T  19370913 gaattgaacattaagaaacaaggcaaagtgcattggaaaagtggaaaacttagaagcaatggattattcgagaacattccagagaatgtccaacatgtgt 19371012  T
Q  382 atcagtacattattgtttctaacaagaatgaaga 415  Q
    |||  ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  19371013 atcgatacatgattgtctctaacaaagatgaaga 19371046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 525 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 19172742 - 19172660
Alignment:
Q  525 gcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggt 607  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  19172742 gcagatatgtgttatggctataataccgatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacctgcagggaacccggtgaggt 19172660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 522 - 620
Target Start/End: Original strand, 19287901 - 19287999
Alignment:
Q  522 aatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgaggtttttcagaaaaag 620  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  19287901 aatgcagataagtgttatggatataataatgatgaagggtgccaaaaatgggaggatatgccaacttgcagggaacgtggtgaggtctttcaaaaaaag 19287999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 415
Target Start/End: Original strand, 19341133 - 19341266
Alignment:
Q  282 gaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatgaatgttcaacatatgt 381  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| |||    
T  19341133 gaattgaacattaagaaacaaggcaaagtgcattggaaaagtggaaaacttggaagcaatggattattcgagaacattctagagaatgtccaacatgtgt 19341232  T
Q  382 atcagtacattattgtttctaacaagaatgaaga 415  Q
    |||  ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  19341233 atcgatacatgattgtctctaacaaagatgaaga 19341266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19172599 - 19172474
Alignment:
Q  674 ttatggttacagtgattgcaagatgagatgttggagaaattgtagttgcaatgggattcgtagaattatatgataatttgactggatgtgtattctattc 773  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||||||||| |||  |||||| |||  ||||  |||||||||| |||| |||||    
T  19172599 ttatggttacagtgattgtaagatcagttgttggagaaactgtgaatgcaatggg-ttccaagaattttatcgtaatgggactggatgtatattttattc 19172501  T
Q  774 atggaattcgacacaagatgttgattt 800  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  19172500 atcgaattcgacacaagatgttgattt 19172474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 753 - 848
Target Start/End: Original strand, 19450698 - 19450793
Alignment:
Q  753 gactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagacagtcagggtaactttaacgtcttggtaatgccaacaaaatcagc 848  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || | |||   ||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19450698 gactggatgtatattctattcatggaattcgacaaaagaagtggatttggagaatcaatataatttttacgccttggtaaagccaacaaaaacagc 19450793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 753 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 19530378 - 19530283
Alignment:
Q  753 gactggatgtgtattctattcatggaattcgacacaagatgttgatttagacagtcagggtaactttaacgtcttggtaatgccaacaaaatcagc 848  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || | |||   ||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19530378 gactggatgtatattctattcatggaattcgacaaaagaagtggatttggagaatcaatataatttttacgccttggtaaagccaacaaaaacagc 19530283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 591
Target Start/End: Original strand, 19371145 - 19371192
Alignment:
Q  544 ataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgta 591  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19371145 ataatagtaatggtggatgccaaaaatgggagtatataccaacttgta 19371192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 440
Target Start/End: Original strand, 19542803 - 19543177
Alignment:
Q  66 ttagacacgggtaactttgtgcttcaacaacttcacccaaatgggacaaagagtatattatggcagagttttgattatcccacaaactttttgatcccaa 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||  ||| | |||||||||||||||||| ||| |  | ||| || ||| ||||    
T  19542803 ttagacaccggtaactttgttcttcaacaatttcaccccaatggttcaacaagtgttttatggcagagttttgatcatctcttacactgttggattccaa 19542902  T
Q  166 cgatgaagttgggagttaatcgaaaaacaggacataattggtcattggtttcatggttgactcctttgctacaaacttcaggtgaatttagtcttgaatg 265  Q
     ||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19542903 tgatgaagttaggtattaaccgaataaccggacataattggtctttagtttcatggatgactccttcgctatcaacttcaggtgaatttagtcttgaatg 19543002  T
Q  266 ggaaccaaaacaaggtgaattgaacatcaaaaaacgcggcaaagtgtattggaaaagtggaaaacttaaaagcaatggaatgttcgagaacattccaatg 365  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  | |||| |||||| ||   |    
T  19543003 ggaaccaaagcaacgtgaattggaaatcaagaaaagcggcaaagtgtattggaaaagcggaaaacttagaagaaatgggttattcgtgaacataccggcg 19543102  T
Q  366 aatgttcaacatatgtatcagtacattattgtttctaacaagaatgaagattctttcgcttttgaagttaaagat 440  Q
    |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  ||||| || ||||||||    
T  19543103 aatgttcaacgtgtgtatgaatacattattgtttctaagaaagatgaagattcctttacttttaaaattaaagat 19543177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 510 - 606
Target Start/End: Original strand, 19543241 - 19543337
Alignment:
Q  510 ggagaaattggaaatgcagatatatgttatggatataatagcaatggagggtgccaaaaatgggaggatataccaacttgtagggaacctggtgagg 606  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19543241 ggagatattggaaatgcagacttgtgttatggatataatatcaacggagggtgccaaaaatgggaggatataccaagttgtagggaacctggtgagg 19543337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University