View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4690_low_6 (Length: 332)

Name: NF4690_low_6
Description: NF4690
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4690_low_6
NF4690_low_6
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (1-287)||(35015052-35015339)
chr6 (1-282)||(18583395-18583677)
chr6 (1-280)||(19983187-19983466)
chr6 (6-282)||(26089813-26090091)
chr6 (6-282)||(18002395-18002673)
chr6 (6-282)||(23995001-23995279)
chr6 (6-282)||(15742120-15742397)
chr6 (7-247)||(4991186-4991427)
chr6 (54-270)||(22585495-22585711)
chr6 (54-270)||(22590326-22590542)
chr6 (2-270)||(15889601-15889871)
chr6 (54-271)||(15004856-15005072)
chr6 (54-244)||(25640505-25640694)
chr6 (98-244)||(32276756-32276902)
chr6 (226-278)||(13014822-13014874)
chr6 (226-282)||(32898868-32898924)
chr6 (231-282)||(25744331-25744382)
chr6 (226-282)||(18570357-18570413)
chr6 (226-282)||(22441012-22441068)
chr6 (226-287)||(18777219-18777280)
chr6 (147-244)||(19629447-19629544)
chr6 (226-282)||(18432721-18432777)
chr6 (226-282)||(31628346-31628402)
chr6 (153-242)||(26512260-26512349)
chr6 (153-242)||(26517376-26517465)
chr6 (226-282)||(16106594-16106650)
chr6 (147-247)||(16300022-16300122)
chr6 (147-247)||(18823429-18823529)
chr6 (163-247)||(18839300-18839384)
chr6 (5-38)||(1650020-1650053)
chr6 (226-282)||(16086095-16086151)
chr6 (6-38)||(16232199-16232231)
chr6 (6-38)||(19610325-19610357)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (1-284)||(5682423-5682706)
chr4 (6-287)||(14951835-14952117)
chr4 (1-287)||(25119102-25119389)
chr4 (6-282)||(15272211-15272489)
chr4 (54-236)||(19559483-19559665)
chr4 (82-247)||(34177617-34177781)
chr4 (54-247)||(49071800-49071993)
chr4 (6-107)||(15135907-15136010)
chr4 (226-282)||(53704846-53704902)
chr4 (200-282)||(34395335-34395418)
chr4 (97-247)||(14500208-14500358)
chr4 (226-282)||(820029-820085)
chr4 (226-282)||(8872584-8872640)
chr4 (226-282)||(30457981-30458037)
chr4 (226-282)||(44055993-44056049)
chr4 (226-282)||(44346905-44346961)
chr4 (226-282)||(53907812-53907868)
chr4 (226-282)||(16732247-16732303)
chr4 (226-282)||(21959576-21959632)
chr4 (230-282)||(55376714-55376766)
chr4 (200-282)||(23270020-23270103)
chr4 (147-247)||(14996241-14996341)
chr4 (147-247)||(16522932-16523032)
chr4 (226-287)||(30232609-30232670)
chr4 (97-218)||(32460699-32460820)
chr4 (147-247)||(8045058-8045158)
chr4 (147-247)||(9295808-9295908)
chr4 (153-244)||(16225211-16225301)
chr4 (226-281)||(45458968-45459023)
chr4 (226-280)||(12837313-12837367)
chr4 (126-196)||(21417471-21417541)
chr4 (5-38)||(14996445-14996478)
chr4 (1-38)||(54118163-54118200)
chr4 (6-38)||(7131982-7132014)
chr4 (147-247)||(9795330-9795430)
chr4 (6-38)||(13246737-13246769)
chr4 (6-38)||(15287162-15287194)
chr4 (6-38)||(15294271-15294303)
chr4 (6-38)||(16327840-16327872)
chr4 (6-38)||(16609013-16609045)
chr4 (6-38)||(17145574-17145606)
chr4 (6-38)||(20001030-20001062)
chr4 (6-38)||(26680517-26680549)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (7-287)||(11342758-11343039)
chr5 (6-287)||(2031883-2032165)
chr5 (54-282)||(21205004-21205232)
chr5 (6-282)||(21650773-21651050)
chr5 (6-247)||(16105757-16105999)
chr5 (83-235)||(22662653-22662805)
chr5 (82-247)||(25004929-25005094)
chr5 (200-282)||(21397170-21397253)
chr5 (226-282)||(4865341-4865397)
chr5 (200-282)||(21646826-21646908)
chr5 (226-282)||(1168317-1168373)
chr5 (200-282)||(24475658-24475738)
chr5 (226-282)||(28261599-28261655)
chr5 (147-247)||(7529014-7529114)
chr5 (226-282)||(20712154-20712210)
chr5 (147-244)||(17909622-17909719)
chr5 (147-247)||(9730424-9730524)
chr5 (226-282)||(24183245-24183301)
chr5 (226-287)||(11584124-11584188)
chr5 (226-282)||(11337299-11337355)
chr5 (226-282)||(21906795-21906851)
chr5 (147-247)||(108874-108974)
chr5 (6-38)||(7425631-7425663)
chr5 (6-38)||(20623286-20623318)
chr5 (6-38)||(21233442-21233474)
chr5 (6-38)||(23507270-23507302)
chr5 (6-38)||(25900320-25900352)
chr5 (6-38)||(35791015-35791047)
chr5 (6-38)||(37053061-37053093)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (1-287)||(126488-126775)
chr7 (1-287)||(32493941-32494228)
chr7 (1-287)||(111164-111451)
chr7 (6-282)||(2028999-2029276)
chr7 (6-282)||(42056188-42056466)
chr7 (6-282)||(2190085-2190363)
chr7 (6-282)||(3049661-3049937)
chr7 (1-270)||(1936912-1937177)
chr7 (54-244)||(39291458-39291648)
chr7 (10-139)||(15516765-15516896)
chr7 (54-247)||(13352065-13352258)
chr7 (200-286)||(44865304-44865391)
chr7 (230-282)||(39046740-39046792)
chr7 (200-282)||(143717-143800)
chr7 (200-282)||(47289859-47289942)
chr7 (84-268)||(15977820-15978004)
chr7 (202-287)||(35094889-35094974)
chr7 (226-282)||(3895103-3895159)
chr7 (226-282)||(11287495-11287551)
chr7 (226-286)||(12369953-12370013)
chr7 (147-247)||(371203-371303)
chr7 (226-282)||(15822544-15822600)
chr7 (1-37)||(7283951-7283987)
chr7 (226-282)||(7284173-7284229)
chr7 (226-282)||(12759065-12759121)
chr7 (60-180)||(18151259-18151379)
chr7 (226-282)||(26070377-26070433)
chr7 (226-282)||(26094164-26094220)
chr7 (6-43)||(25124445-25124482)
chr7 (6-38)||(7293333-7293365)
chr7 (6-38)||(11516544-11516576)
chr7 (6-38)||(13758677-13758709)
chr7 (6-38)||(14113903-14113935)
chr7 (6-38)||(15441478-15441510)
chr7 (6-38)||(15862226-15862258)
chr7 (6-38)||(15927875-15927907)
chr7 (6-38)||(16212071-16212103)
chr7 (6-38)||(18979938-18979970)
chr7 (6-38)||(30262043-30262075)
chr7 (6-38)||(36052971-36053003)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (6-287)||(30153015-30153297)
chr3 (1-287)||(45581704-45581992)
chr3 (7-287)||(54685202-54685483)
chr3 (1-287)||(7854055-7854342)
chr3 (1-287)||(17955879-17956166)
chr3 (1-287)||(54038019-54038306)
chr3 (1-282)||(3992628-3992910)
chr3 (6-282)||(53771119-53771397)
chr3 (1-282)||(2844269-2844551)
chr3 (6-282)||(23492451-23492728)
chr3 (6-282)||(16261531-16261809)
chr3 (6-287)||(33341954-33342236)
chr3 (6-282)||(38167992-38168269)
chr3 (6-260)||(28558271-28558526)
chr3 (1-224)||(55513006-55513230)
chr3 (54-247)||(18970034-18970227)
chr3 (82-247)||(48421690-48421855)
chr3 (1-244)||(15550714-15550958)
chr3 (226-282)||(16996172-16996228)
chr3 (226-282)||(317621-317677)
chr3 (226-282)||(50112164-50112220)
chr3 (200-282)||(22144358-22144441)
chr3 (97-247)||(19946812-19946962)
chr3 (200-280)||(6146832-6146913)
chr3 (202-282)||(6154419-6154500)
chr3 (221-282)||(34439451-34439512)
chr3 (226-282)||(12349843-12349899)
chr3 (226-282)||(13817590-13817646)
chr3 (226-282)||(19570801-19570857)
chr3 (200-282)||(53898541-53898624)
chr3 (226-282)||(12349652-12349708)
chr3 (112-200)||(14177017-14177105)
chr3 (226-282)||(17100731-17100787)
chr3 (226-282)||(17101416-17101472)
chr3 (226-282)||(54424090-54424146)
chr3 (163-247)||(8275902-8275986)
chr3 (147-247)||(9303141-9303241)
chr3 (147-247)||(14285075-14285175)
chr3 (226-282)||(14298499-14298555)
chr3 (226-282)||(14304126-14304182)
chr3 (147-247)||(16934015-16934115)
chr3 (60-204)||(17393590-17393735)
chr3 (226-282)||(19260952-19261008)
chr3 (226-282)||(35123774-35123830)
chr3 (200-282)||(16182032-16182114)
chr3 (226-281)||(17523002-17523057)
chr3 (163-247)||(8268802-8268886)
chr3 (54-198)||(11402752-11402896)
chr3 (110-200)||(12539066-12539156)
chr3 (2-43)||(13301360-13301401)
chr3 (2-43)||(13312016-13312057)
chr3 (5-38)||(15615137-15615170)
chr3 (1-38)||(15857158-15857195)
chr3 (1-38)||(19232089-19232126)
chr3 (206-247)||(39656453-39656494)
chr3 (6-43)||(51961031-51961068)
chr3 (6-38)||(2050115-2050147)
chr3 (6-38)||(2449152-2449184)
chr3 (6-38)||(8268650-8268682)
chr3 (6-38)||(8275750-8275782)
chr3 (6-38)||(14842487-14842519)
chr3 (6-38)||(16933869-16933901)
chr3 (6-38)||(17912398-17912430)
chr3 (6-38)||(18911300-18911332)
chr3 (6-38)||(19260749-19260781)
chr3 (110-181)||(37915290-37915361)
chr3 (200-248)||(38527841-38527889)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-287)||(31175-31462)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-287)||(41382-41669)
scaffold0078 (6-38)||(36980-37012)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-287)||(79937-80224)
scaffold0034 (226-287)||(46238-46299)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (6-287)||(41506709-41506991)
chr8 (1-282)||(274521-274803)
chr8 (1-282)||(641046-641328)
chr8 (1-282)||(826852-827134)
chr8 (1-287)||(39115348-39115635)
chr8 (1-280)||(24716757-24717037)
chr8 (6-267)||(24385652-24385914)
chr8 (96-246)||(22321437-22321587)
chr8 (147-282)||(16038923-16039058)
chr8 (6-244)||(21259391-21259630)
chr8 (54-247)||(17502274-17502467)
chr8 (54-247)||(4233968-4234161)
chr8 (54-247)||(23217990-23218183)
chr8 (200-282)||(22234890-22234972)
chr8 (200-271)||(19993141-19993212)
chr8 (226-282)||(41246736-41246792)
chr8 (200-282)||(37611746-37611829)
chr8 (97-237)||(21494452-21494592)
chr8 (83-200)||(18118259-18118376)
chr8 (147-244)||(22147555-22147652)
chr8 (226-282)||(20481683-20481739)
chr8 (222-282)||(20561740-20561800)
chr8 (226-282)||(20573305-20573361)
chr8 (222-282)||(20647938-20647998)
chr8 (226-282)||(20654018-20654074)
chr8 (147-247)||(22886440-22886540)
chr8 (147-246)||(2545061-2545160)
chr8 (147-244)||(18612523-18612620)
chr8 (147-244)||(18619428-18619525)
chr8 (147-247)||(3431322-3431422)
chr8 (6-40)||(31194217-31194251)
chr8 (1-38)||(16404895-16404932)
chr8 (6-38)||(5238404-5238436)
chr8 (6-38)||(13662182-13662214)
chr8 (6-38)||(13720845-13720877)
chr8 (6-38)||(16872968-16873000)
chr8 (6-38)||(22907128-22907160)
chr8 (6-38)||(24661162-24661194)
chr8 (6-38)||(43373392-43373424)
chr8 (6-38)||(43685863-43685895)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (6-282)||(878-1155)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (7-287)||(15861327-15861608)
chr1 (1-287)||(44034866-44035153)
chr1 (1-287)||(21860084-21860371)
chr1 (82-287)||(22367092-22367296)
chr1 (200-285)||(22403196-22403282)
chr1 (1-98)||(41218667-41218765)
chr1 (226-282)||(41212150-41212206)
chr1 (226-282)||(49967728-49967784)
chr1 (226-282)||(35522432-35522488)
chr1 (147-247)||(21650081-21650181)
chr1 (226-282)||(21718306-21718362)
chr1 (147-244)||(20254430-20254527)
chr1 (226-287)||(27329868-27329929)
chr1 (226-287)||(35054829-35054890)
chr1 (1-38)||(41394527-41394564)
chr1 (5-38)||(45051726-45051759)
chr1 (6-38)||(37844374-37844406)
chr1 (6-38)||(46523695-46523727)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-287)||(5978-6265)
scaffold0686 (1-151)||(5772-5923)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-287)||(22274795-22275082)
chr2 (1-282)||(22284033-22284315)
chr2 (6-282)||(9652796-9653073)
chr2 (60-282)||(21274004-21274226)
chr2 (7-247)||(25213162-25213403)
chr2 (1-247)||(15633327-15633574)
chr2 (82-244)||(7321633-7321795)
chr2 (200-282)||(23836791-23836874)
chr2 (200-282)||(25876006-25876088)
chr2 (97-247)||(28031230-28031380)
chr2 (226-282)||(32465936-32465992)
chr2 (200-282)||(6879515-6879597)
chr2 (83-200)||(20279571-20279688)
chr2 (147-270)||(33128135-33128258)
chr2 (226-282)||(271248-271304)
chr2 (147-247)||(24826760-24826860)
chr2 (163-247)||(17204445-17204529)
chr2 (226-282)||(25602102-25602158)
chr2 (226-282)||(36890798-36890854)
chr2 (2-43)||(19666843-19666884)
chr2 (5-38)||(19689314-19689347)
chr2 (1-38)||(19794624-19794661)
chr2 (1-38)||(20627233-20627270)
chr2 (6-38)||(463043-463075)
chr2 (6-38)||(3798520-3798552)
chr2 (226-282)||(4448246-4448302)
chr2 (6-38)||(8944153-8944185)
chr2 (6-38)||(12635785-12635817)
chr2 (6-38)||(12641559-12641591)
chr2 (6-38)||(12728699-12728731)
chr2 (6-38)||(14906354-14906386)
chr2 (6-38)||(16935900-16935932)
chr2 (6-38)||(17006560-17006592)
chr2 (6-38)||(22863235-22863267)
chr2 (6-38)||(23820388-23820420)
chr2 (226-282)||(28974127-28974183)
chr2 (6-38)||(36982364-36982396)
chr2 (6-38)||(42177886-42177918)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (6-282)||(55659-55936)
scaffold0032 (6-108)||(108075-108179)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-287)||(347-633)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (1-287)||(162073-162360)
scaffold0016 (1-287)||(166159-166446)
scaffold0016 (226-282)||(164293-164349)
scaffold0016 (1-40)||(116446-116485)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (6-282)||(13285-13563)
scaffold0251 (177-282)||(21432-21537)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (6-282)||(6443-6720)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (6-282)||(17304-17581)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (6-287)||(12418-12702)
scaffold0039 (253-287)||(19049-19083)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-287)||(30164-30454)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (5-282)||(193396-193664)
scaffold0004 (145-282)||(186566-186702)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (73-282)||(15027-15236)
scaffold0175 (6-38)||(882-914)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (6-251)||(4346-4593)
scaffold0303 (82-282)||(5-205)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (6-287)||(9882-10148)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (7-247)||(130670-130911)
scaffold0028 (222-281)||(89578-89637)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (163-282)||(9565-9684)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (62-270)||(44071-44279)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (7-139)||(42575-42708)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (82-247)||(219-384)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (147-282)||(95053-95192)
scaffold0037 (226-282)||(24841-24897)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (82-247)||(1478-1643)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (54-245)||(3786-3981)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (110-247)||(5996-6133)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (200-282)||(32281-32363)
scaffold0091 (200-282)||(41940-42022)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (200-282)||(14952-15034)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (226-282)||(15584-15640)
scaffold0077 (5-38)||(36836-36869)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (200-282)||(6932-7014)
scaffold0673 (226-282)||(935-991)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (200-282)||(254900-254983)
scaffold0011 (200-282)||(261506-261589)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (97-247)||(17812-17962)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (226-282)||(5359-5415)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (226-282)||(132363-132419)
scaffold0021 (226-282)||(88353-88409)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (226-282)||(11821-11877)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (226-282)||(38376-38432)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (226-282)||(146679-146735)
scaffold0025 (6-38)||(146906-146938)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (226-282)||(22769-22825)
scaffold0008 (6-38)||(128095-128127)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (226-282)||(70735-70791)
scaffold0001 (147-247)||(165007-165107)
scaffold0001 (233-282)||(60884-60933)
scaffold0001 (6-38)||(172210-172242)
scaffold0001 (6-38)||(177913-177945)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (200-282)||(4363-4445)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (200-282)||(11740-11823)
scaffold0359 (226-282)||(1395-1451)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (226-284)||(21588-21646)
scaffold0120 (226-279)||(31292-31345)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (226-282)||(222-278)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (147-247)||(5622-5722)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (226-282)||(7647-7703)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (226-282)||(10015-10071)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (147-247)||(34454-34554)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (147-270)||(61268-61391)
scaffold0023 (6-38)||(48903-48935)
scaffold0023 (6-38)||(153924-153956)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (226-282)||(85410-85466)
scaffold0014 (222-282)||(159377-159438)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (97-244)||(5338-5485)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (221-282)||(48225-48286)
scaffold0068 (221-282)||(61673-61734)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (226-282)||(689-745)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (147-270)||(17355-17478)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (226-282)||(631-687)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (147-243)||(11862-11958)
scaffold0162 (6-38)||(26340-26372)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (226-282)||(118076-118132)
scaffold0035 (233-282)||(109582-109631)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (147-247)||(49889-49989)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (226-282)||(253102-253158)
scaffold0012 (6-38)||(247366-247398)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (147-247)||(6257-6357)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (226-278)||(9069-9121)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (226-282)||(99-155)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (226-278)||(25040-25092)
scaffold0158 (226-278)||(25293-25345)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (226-282)||(11681-11737)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (222-282)||(33740-33800)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (226-282)||(5019-5075)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (226-282)||(112658-112714)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (6-40)||(5990-6024)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (6-40)||(57392-57426)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (147-244)||(12637-12734)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (226-282)||(70691-70748)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (6-38)||(1431-1463)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-37)||(1701-1737)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-37)||(94-130)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (6-38)||(1492-1524)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (6-38)||(9183-9215)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (6-38)||(2700-2732)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (1-37)||(5-41)
scaffold0310 (1-37)||(6299-6335)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (6-38)||(12418-12450)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (6-38)||(1430-1462)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (6-38)||(22857-22889)
scaffold0141 (6-38)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (6-38)||(1496-1528)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-37)||(19845-19881)
scaffold0122 (1-37)||(24149-24185)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-37)||(20493-20529)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (6-38)||(272330-272362)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 35015052 - 35015339
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015052 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 35015151  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35015152 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 35015251  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35015252 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 35015339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18583677 - 18583395
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18583677 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcctgttctatgcatcattgattatgggaataagtgattatcatg 18583578  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18583577 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 18583478  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583477 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 18583395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 19983187 - 19983466
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983187 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 19983286  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19983287 aatccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 19983386  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatg 280  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983387 tgtatgaaaatgggtagttt-aaaactatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatg 19983466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26089813
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 26089992  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26089991 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcataatgta 26089892  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26089891 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 26089813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002673
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgggcataagtgattatcatgaacc 18002494  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18002495 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttcatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 18002594  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002595 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 18002673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995001
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 23995180  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23995179 caatatttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 23995080  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995079 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 23995001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742397
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatcctttggttaattctttttctcttgttc-atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 15742218  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatg-ttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15742219 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgattatgttaatttgatgattaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15742318  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742319 tgaaaatgggtaatttgtatattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 15742397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991186
Alignment:
Q  7 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgtttaattctttttctcttgattttatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 4991328  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||| ||||||    
T  4991327 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgtt-atttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 4991229  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  4991228 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 4991186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 270
Target Start/End: Original strand, 22585495 - 22585711
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||| |||    
T  22585495 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatttta 22585594  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catgg 252  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  22585595 atttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-g 22585693  T
Q  253 ttgttgatgaattgtgat 270  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22585694 ttgttgttgaattgtgat 22585711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 270
Target Start/End: Original strand, 22590326 - 22590542
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||| |||    
T  22590326 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatttta 22590425  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catgg 252  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  22590426 atttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-g 22590524  T
Q  253 ttgttgatgaattgtgat 270  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22590525 ttgttgttgaattgtgat 22590542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Original strand, 15889601 - 15889871
Alignment:
Q  2 taattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||        ||||| |||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||  ||    
T  15889601 taattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaatacgtgattattgtg 15889700  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15889701 aacccaacctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttcatga 15889800  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 270  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15889801 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaactgatgaattatgacat-gttgttgatgaattgtgat 15889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 271
Target Start/End: Original strand, 15004856 - 15005072
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||| |    
T  15004856 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagagattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgt-a 15004954  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catgg 252  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |    
T  15004955 atttgatgttgattgaattgttgatgaggaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatgacat-g 15005053  T
Q  253 ttgttgatgaattgtgata 271  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  15005054 ttgttgttgaattgtgata 15005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 244
Target Start/End: Original strand, 25640505 - 25640694
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  25640505 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtag-gatatgtttgagtatgtta 25640603  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  25640604 atttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtagataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 25640694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 244
Target Start/End: Original strand, 32276756 - 32276902
Alignment:
Q  98 tgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcat 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||| | | ||||  ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || ||||||    
T  32276756 tgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcat 32276855  T
Q  198 gatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  32276856 aatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaatt 32276902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Original strand, 13014822 - 13014874
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13014822 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttca 13014874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32898924 - 32898868
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32898924 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgat 32898868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744382
Alignment:
Q  231 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 25744382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18570413 - 18570357
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18570413 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 18570357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22441068 - 22441012
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  22441068 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgat 22441012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18777280 - 18777219
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18777280 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatg 18777219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19629544 - 19629447
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  19629544 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 19629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18432777 - 18432721
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18432777 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 18432721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31628402 - 31628346
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31628402 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 31628346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26512349 - 26512260
Alignment:
Q  153 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa 242  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| || | ||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26512349 aatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaa 26512260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26517465 - 26517376
Alignment:
Q  153 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa 242  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| || | ||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26517465 aatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaa 26517376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16106650 - 16106594
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16106650 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 16106594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 16300022 - 16300122
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||  ||||| | ||||||    
T  16300022 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcctaattgataaattat 16300121  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  16300122 g 16300122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 18823429 - 18823529
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   || ||||||| ||||| ||| ||||    
T  18823429 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaagttatgcttaattgatgacttat 18823528  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  18823529 g 18823529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 18839300 - 18839384
Alignment:
Q  163 taaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  18839300 taaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 18839384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 38
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650053
Alignment:
Q  5 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1650053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16086151 - 16086095
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  16086151 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgat 16086095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 16232231 - 16232199
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232231 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16232199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 19610357 - 19610325
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610357 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 19610325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 5682423 - 5682706
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnnctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682423 ataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcatttagttaattttttcctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatga 5682522  T
Q  101 acccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5682523 acccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 5682622  T
Q  201 gtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatta 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682623 gtatgaaattgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatta 5682706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14951835
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 14952018  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14952017 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 14951918  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14951917 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 14951835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 25119102 - 25119389
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25119102 ataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 25119201  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25119202 aacccaatcttgaaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 25119301  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25119302 tgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 25119389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272489
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15272310  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15272311 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaacgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15272410  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15272411 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgat 15272489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19559665 - 19559483
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| |  ||||||    
T  19559665 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatgtacccaacttttgaaattcctgctcatgttgtagtgatatgtttgagcatgtta 19559566  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19559565 atttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaatt 19559483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Original strand, 34177617 - 34177781
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  34177617 gaataagtgattattgtgaatccaatcttgaaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaattacatgataattgaattgttgatgat 34177716  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
     |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  34177717 aaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtag-ttgagaattatgttcaattggtgaattatg 34177781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49071993 - 49071800
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||  || |||||| ||||| ||| | |||||||    
T  49071993 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatcattgtgaacccaaccgttgaaattcgtgctcatattgtagtgatatgtttgagtatgtta 49071894  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||  || ||  | || |||||||||||| |||||||||    
T  49071893 atttgatgttaattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgatatatgtatatgaatacttgatgaaatatgctcaattgatgaattatg 49071800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15136010
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15136006  T
Q  104 caat 107  Q
    ||||    
T  15136007 caat 15136010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 53704846 - 53704902
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704846 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 53704902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34395418 - 34395335
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34395418 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 34395335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Original strand, 14500208 - 14500358
Alignment:
Q  97 atgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||| | | ||||  ||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  14500208 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaatttaatgataaatgaattattggtgatgaaataacatgttca 14500307  T
Q  197 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14500308 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 14500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 820029 - 820085
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  820029 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 820085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 8872584 - 8872640
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8872584 tatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 8872640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30458037 - 30457981
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30458037 tatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 30457981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44056049 - 44055993
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44056049 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgat 44055993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44346961 - 44346905
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44346961 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgat 44346905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 53907812 - 53907868
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53907812 tatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgat 53907868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732247
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16732303 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 16732247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959632
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21959576 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 21959632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 282
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376766
Alignment:
Q  230 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 55376766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 23270020 - 23270103
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23270020 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgat 23270103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14996341 - 14996241
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  14996341 tatgttaattgaatgataaaagaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaattat 14996242  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  14996241 g 14996241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16523032 - 16522932
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16523032 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 16522933  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  16522932 g 16522932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232670
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  30232609 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatg 30232670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Original strand, 32460699 - 32460820
Alignment:
Q  97 atgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||| | |  |||  ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||    
T  32460699 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggttataattttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 32460798  T
Q  197 tgatgtatgaaaatgggtagtt 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  32460799 taatgtatgaaaaggggtagtt 32460820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8045158 - 8045058
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  8045158 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 8045059  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  8045058 g 8045058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9295908 - 9295808
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| | || ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9295908 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtaatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 9295809  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  9295808 g 9295808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 16225211 - 16225301
Alignment:
Q  153 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| || | ||||| || ||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16225211 aatttgatggtatttgaattgttgttgtttaaattacatgttcatgaa-tatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaatt 16225301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 281
Target Start/End: Original strand, 45458968 - 45459023
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 281  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatga 45459023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837367
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  12837313 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatg 12837367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21417541 - 21417471
Alignment:
Q  126 tgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21417541 tgttttagagatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttca 21417471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 14996478 - 14996445
Alignment:
Q  5 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14996478 ttaaggtaagggggttagttattatcataatcat 14996445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 54118163 - 54118200
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54118163 ataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 54118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 7131982 - 7132014
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7131982 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7132014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9795430 - 9795330
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||| ||||  || |||||| |||| | |||||| ||||||   |||||||| | ||||||||||||||    
T  9795430 tatgttaattgaatgataaatgaattcttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtcaaaatgagtagttgtgaaattatgtttaattggtgaattat 9795331  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  9795330 g 9795330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246737
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13246737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 15287162 - 15287194
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287162 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 15294271 - 15294303
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294271 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15294303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 17145574 - 17145606
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17145574 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17145606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20001062 - 20001030
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20001062 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 20001030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11343039 - 11342758
Alignment:
Q  7 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11343039 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 11342940  T
Q  106 atctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatg 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11342939 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 11342840  T
Q  206 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11342839 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 11342758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2032165 - 2031883
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2032165 taaggtaagggggttagttttcatcataatcgtttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 2032066  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2032065 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 2031966  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2031965 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 2031883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21205232 - 21205004
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  21205232 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgtta 21205133  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205132 atttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggt 21205033  T
Q  254 tgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205032 tgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 21205004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21651050 - 21650773
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||        |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21651050 taaggtaagggggttaatatttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctgtgcatagttgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 21650951  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21650950 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 21650851  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21650850 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 21650773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105757
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16105900  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||| |||||    
T  16105899 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgta 16105801  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16105800 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 16105757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 22662653 - 22662805
Alignment:
Q  83 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatc 182  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  22662653 aataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatg 22662752  T
Q  183 aaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaat 235  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22662753 aaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaat 22662805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25005094 - 25004929
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||| | | ||||||||| | | ||| ||||||||| || ||    
T  25005094 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgaagtgatatgtttgagtgtgttaatttaaggataattgaattgttaattat 25004995  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  25004994 gaaattgcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgagaattatgctcaattggtgatttatg 25004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21397253 - 21397170
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21397253 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 21397170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865341
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865397 tatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgat 4865341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 21646826 - 21646908
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646826 tgtatgaaaatgggtatgtatgaaaat-atgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 21646908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168373
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1168317 tatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 1168373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24475738 - 24475658
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24475738 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgat 24475658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28261655 - 28261599
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28261655 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgat 28261599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7529114 - 7529014
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  7529114 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattat 7529015  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  7529014 g 7529014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20712210 - 20712154
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20712210 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgat 20712154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17909719 - 17909622
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  17909719 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 17909622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 9730424 - 9730524
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9730424 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 9730523  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  9730524 g 9730524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183301
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  24183245 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgat 24183301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11584188 - 11584124
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11584188 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 11584124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337355
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11337299 tatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 11337355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21906851 - 21906795
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21906851 tatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 21906795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 108874 - 108974
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| || |  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  108874 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaattaacatgttcataatgtatgaaaatggattgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 108973  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  108974 g 108974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 7425663 - 7425631
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7425663 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507270
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23507270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 35791015 - 35791047
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35791015 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 35791047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 126775 - 126488
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126775 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctattgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 126676  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  126675 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgcagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 126576  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  126575 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 126488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 32493941 - 32494228
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32493941 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 32494040  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32494041 aacccaatctttgaaattcgtgtttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 32494140  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494141 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 32494228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 111164 - 111451
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  111164 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgaaaataagtgattatcatg 111263  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  111264 aacccaatatttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatga 111363  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  111364 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 111451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2028999
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattttttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 2029177  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  2029176 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtac 2029077  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2029076 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgat 2028999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056466
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 42056287  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42056288 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 42056387  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056388 tgaaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 42056466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 2190085 - 2190363
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2190085 taaggtaaggcggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgtacc 2190184  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2190185 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 2190284  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190285 tgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 2190363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049661
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 3049838  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3049837 aatctttgaaattcgtgtttatattgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattg-ggatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 3049739  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3049738 gaatatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 3049661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 1936912 - 1937177
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936912 ataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 1937011  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1937012 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttcatgatgaaattgcaagttcatga 1937111  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgat 270  Q
    |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1937112 t-----aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaattatgat 1937177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 244
Target Start/End: Original strand, 39291458 - 39291648
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  39291458 ctctttttctatgcataagtacttatttgaataagtgattattgtgaacctaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtta 39291557  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39291558 atttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttgatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaatt 39291648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 139
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516896
Alignment:
Q  10 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 15516864  T
Q  108 ctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15516865 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatat 15516896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13352258 - 13352065
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  13352258 ctctttttctatgcataagtgtttatttgaataagtgattattgtgaacccaacccttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgtta 13352159  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13352158 atttgatgatatttgatttgttgatggtgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtattttaattatgctcaattgatgaattatg 13352065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44865391 - 44865304
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaat 286  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44865391 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaat 44865304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 282
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046792
Alignment:
Q  230 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 39046792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 143800 - 143717
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  143800 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgat 143717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47289942 - 47289859
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  47289942 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgat 47289859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 268
Target Start/End: Original strand, 15977820 - 15978004
Alignment:
Q  84 ataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc-ctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatc 182  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||     
T  15977820 ataagtgattattatgaactaaatgtttgaaattcatgctcta-gttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatg 15977918  T
Q  183 aaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtg 268  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||| || ||  | |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  15977919 aaattgcatgttcatggtgtatatatatggatacttgatgaattatactcaaatgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtg 15978004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35094974 - 35094889
Alignment:
Q  202 tatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  35094974 tatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaatg 35094889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3895103
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3895159 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 3895103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287495
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287551 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 11287495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370013
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12369953 tatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaat 12370013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 371303 - 371203
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  371303 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 371204  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  371203 g 371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 15822544 - 15822600
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15822544 tatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 15822600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 7283951 - 7283987
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7283951 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 7284173 - 7284229
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7284173 tatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 7284229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12759065
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  12759121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgat 12759065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Original strand, 18151259 - 18151379
Alignment:
Q  60 ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttga 159  Q
    |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||  || | |||||||||||||  ||||||||| |||||  ||   ||||||||||||     
T  18151259 ttctatgcataaattcttatttgaataagtgattattgtgaacttaaccgttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgattaggtatgttaatttgt 18151358  T
Q  160 tgttaaatgaattgttgatga 180  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  18151359 tgataattgaattgttgatga 18151379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070433
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26070377 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 26070433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094220
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26094164 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 26094220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124445
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 43  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 25124445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 13758709 - 13758677
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13758709 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15862258 - 15862226
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862258 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15862226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15927907 - 15927875
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15927907 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15927875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16212071
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16212071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 18979938 - 18979970
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18979938 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052971
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36052971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153015
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttaattaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 30153198  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30153197 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 30153098  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30153097 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 30153015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45581992 - 45581704
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaaggggg-ttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45581992 ataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 45581893  T
Q  99 gaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45581892 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 45581793  T
Q  199 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581792 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 45581704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Original strand, 54685202 - 54685483
Alignment:
Q  7 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 105  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685202 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 54685301  T
Q  106 atctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatg 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54685302 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 54685401  T
Q  206 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54685402 aaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 54685483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7854342 - 7854055
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7854342 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 7854243  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7854242 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 7854143  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7854142 tgtatgaaaatggataattggtaaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 7854055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 17955879 - 17956166
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17955879 ataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataatcgattatgagaataagtgattatcatg 17955978  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17955979 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtctgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 17956078  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17956079 tgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 17956166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 54038019 - 54038306
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038019 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 54038118  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54038119 aactcaatgtttgacattcgtgcttatattgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 54038218  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54038219 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatg 54038306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3992910 - 3992628
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3992910 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtaattatcatg 3992811  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3992810 aactcaacctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaggttcatga 3992711  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3992710 tgtaggaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 3992628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771119
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 53771298  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53771297 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 53771198  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771197 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 53771119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2844551 - 2844269
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2844551 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttgattctttttctcttattctatgcataattgattatgggaataagcgattatcatg 2844452  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2844451 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatttttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 2844352  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2844351 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgat 2844269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492451
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 23492629  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23492628 aatctttgaaattcttgcttatgttgtagagatatgtttgaatgtgttaatttgatgttaaatgaattgttgattatgaaattgcaagttcatgatgtat 23492529  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492528 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 23492451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261531
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcgtaattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16261710  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16261709 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 16261610  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261609 cgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 16261531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33341954
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 33342137  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33342136 aatctttgaaattcgtgctaatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 33342037  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33342036 gaaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatg 33341954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38167992
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 38168170  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38168169 aatctttgaaattcgtacttatgttgtagaaatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 38168070  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38168069 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgat 38167992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28558526 - 28558271
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28558526 taaggtaagagggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttccatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacct 28558427  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28558426 aatctttgaaattcgtgcttatgtgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgataaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 28558327  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558326 gaaaatgggtagtttgtaaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55513230 - 55513006
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  55513230 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatggaaataagtgattatcatg 55513131  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  55513130 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattcgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttaatga 55513031  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  55513030 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 55513006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18970227 - 18970034
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  18970227 ctctttttctatgcataagtgattatttgaataagtgattattatgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttaagtatgtta 18970128  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18970127 atttgatgttaattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaattatg 18970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48421855 - 48421690
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  48421855 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcatgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttggtgat 48421756  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
     |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  48421755 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaattggtgaattatg 48421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15550958 - 15550714
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||        ||||  || ||||||||| || | ||  ||||||||||||||  ||    
T  15550958 ataattaagataagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctctttttatgcataagtgctaatttgaataagtgattattgtg 15550859  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15550858 aacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatga 15550759  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  15550758 tgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 15550714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 16996172 - 16996228
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996172 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 16996228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 317621 - 317677
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317621 tatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 317677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 50112164 - 50112220
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50112164 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 50112220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 22144358 - 22144441
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22144358 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 22144441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19946962 - 19946812
Alignment:
Q  97 atgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||| | | |||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||    
T  19946962 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataaatttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 19946863  T
Q  197 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    | ||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  19946862 taatgtatgaaaatgagtagttgtgaaattatgcttaattgatgatttatg 19946812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Original strand, 6146832 - 6146913
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatg 280  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6146832 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatg 6146913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 282
Target Start/End: Original strand, 6154419 - 6154500
Alignment:
Q  202 tatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6154419 tatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgat 6154500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439512
Alignment:
Q  221 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgat 34439512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 12349843 - 12349899
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12349843 tatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgat 12349899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13817646 - 13817590
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13817646 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgat 13817590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 19570801 - 19570857
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19570801 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgat 19570857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 53898541 - 53898624
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  53898541 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgat 53898624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349708
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12349652 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 12349708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 200
Target Start/End: Original strand, 14177017 - 14177105
Alignment:
Q  112 gaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgat 200  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14177017 gaaattcgtcctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttcatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 14177105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100731
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17100787 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 17100731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101416
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17101472 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 17101416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54424090
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54424146 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 54424090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 8275902 - 8275986
Alignment:
Q  163 taaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8275902 taaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatg 8275986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 9303141 - 9303241
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9303141 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 9303240  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  9303241 g 9303241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14285175 - 14285075
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  14285175 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaaatatgcttaattgatgaattat 14285076  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  14285075 g 14285075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14298555 - 14298499
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14298555 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgat 14298499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14304182 - 14304126
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14304182 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgat 14304126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 16934015 - 16934115
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16934015 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 16934114  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  16934115 g 16934115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17393735 - 17393590
Alignment:
Q  60 ttctatgcataattgatta--tgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc-ctatgttgtagagatatattttaatatgttaatt 156  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||    
T  17393735 ttctatgcataattgcttaattgaga-taagtgattattatgaacttaattgttgaaattcgtgctcta-gttgtagtgatatgtttgggtatgttaatt 17393638  T
Q  157 tgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    || || ||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  17393637 tgttgataattgaattattgacgatgaaattgcatgttcatgctgtat 17393590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 19260952 - 19261008
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19260952 tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 19261008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35123830 - 35123774
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  35123830 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgat 35123774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 16182032 - 16182114
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16182032 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgat 16182114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 281
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523057
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 281  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17523002 tatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatga 17523057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 8268802 - 8268886
Alignment:
Q  163 taaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||| ||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8268802 taaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaattggttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatg 8268886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11402896 - 11402752
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    |||| |||||||||| || || ||||  ||||||||||||||  |||||  |||  |||||||||||||  || || ||| ||||| ||| | ||| | |    
T  11402896 ctctagttctatgcacaagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatatga 11402797  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatg 198  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  11402796 atttgatgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcatg 11402752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Original strand, 12539066 - 12539156
Alignment:
Q  110 ttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgat 200  Q
    |||||||||||||   |||| ||| |||||  || | ||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12539066 ttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatggttgagtatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 12539156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 13301360 - 13301401
Alignment:
Q  2 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 43  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13301360 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13301401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 13312016 - 13312057
Alignment:
Q  2 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 43  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13312016 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13312057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15615137
Alignment:
Q  5 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15615137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 15857158 - 15857195
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15857158 ataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 19232126 - 19232089
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19232126 ataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 19232089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39656494 - 39656453
Alignment:
Q  206 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  39656494 aaaatgggtagtttgtgaattatattcaattggtgaattatg 39656453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961068
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 43  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 51961068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2050115
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2050115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 8268650 - 8268682
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8268650 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 8275750 - 8275782
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8275750 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842519
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 18911332 - 18911300
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18911332 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18911300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260781
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 181
Target Start/End: Original strand, 37915290 - 37915361
Alignment:
Q  110 ttgaaattcgtgc-ctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37915290 ttgaaattcgtgctcta-gttgtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttgatgat 37915361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38527889 - 38527841
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgc 248  Q
    ||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38527889 tgtatgaaaatgggtatgtgggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 31175 - 31462
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31175 ataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 31274  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31275 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 31374  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31375 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 31462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41669 - 41382
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41669 ataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 41570  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41569 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 41470  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41469 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 41382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 80224 - 79937
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80224 ataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 80125  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  80124 aacccaatctttgaaatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 80025  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80024 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 79937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46238
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  46299 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatg 46238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Original strand, 41506709 - 41506991
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41506709 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 41506808  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41506809 aatctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 41506908  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41506909 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 41506991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 274803 - 274521
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  274803 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatg 274704  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  274703 aacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 274604  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  274603 tgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 274521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 641046 - 641328
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  641046 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatg 641145  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  641146 aacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 641245  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  641246 tgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 641328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 826852 - 827134
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  826852 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatg 826951  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  826952 aacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 827051  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  827052 tgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 827134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39115635 - 39115348
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39115635 ataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 39115536  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39115535 aacccaatctttgacattcgtgcttatgttgtaaagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 39115436  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39115435 tgtatgaaaatgggtaatttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatg 39115348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 24716757 - 24717037
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716757 ataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 24716856  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  24716857 aacccgatctttgaaattcgtggttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgataatgaaattgcaagttcacga 24716956  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatg 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24716957 tgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatg 24717037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 267
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385914
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattccttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattattatgaaccc 24385751  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24385752 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgataatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 24385851  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24385852 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgt 24385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 22321437 - 22321587
Alignment:
Q  96 catgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22321437 catgaacccaatctttgaaattcgtgctcaggttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 22321536  T
Q  196 atgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321537 atgacgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 22321587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 147 - 282
Target Start/End: Original strand, 16038923 - 16039058
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16038923 tatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagtgaattat 16039022  T
Q  247 gcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16039023 gcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 16039058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 244
Target Start/End: Original strand, 21259391 - 21259630
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||        ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  21259391 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 21259490  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    ||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21259491 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtat 21259590  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21259591 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 21259630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17502467 - 17502274
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  17502467 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtta 17502368  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17502367 atttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaaagggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatg 17502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4234161 - 4233968
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  4234161 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgcagtgatatgtttgagtatgtta 4234062  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  4234061 atttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattattttcaattgatgaattatg 4233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23218183 - 23217990
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgtta 153  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| | |||||||    
T  23218183 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgcttatgtggtagtgatatgtttgagtatgtta 23218084  T
Q  154 atttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23218083 atttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttaatgatgtatataaatggctagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatg 23217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 22234890 - 22234972
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234890 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 22234972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 271
Target Start/End: Original strand, 19993141 - 19993212
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgata 271  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19993141 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgata 19993212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41246792 - 41246736
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41246792 tatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 41246736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37611829 - 37611746
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37611829 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgat 37611746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Original strand, 21494452 - 21494592
Alignment:
Q  97 atgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||| | | ||||  ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||    
T  21494452 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataattttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 21494551  T
Q  197 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattg 237  Q
    | ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||    
T  21494552 taatgtatgaaaaggggtagttgtgaaattatgcttaattg 21494592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Original strand, 18118259 - 18118376
Alignment:
Q  83 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatc 182  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||   |||| ||||||||| |||   ||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||     
T  18118259 aataagtgattattgtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcgtgttatagagatatgtttgcgtatataaatttgatgataattgaattgttgttgatg 18118358  T
Q  183 aaattgcaagttcatgat 200  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18118359 aaattgcatgttcatgat 18118376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22147652 - 22147555
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  22147652 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 22147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20481739 - 20481683
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20481739 tatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgat 20481683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 282
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561800
Alignment:
Q  222 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 20561800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 20573305 - 20573361
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20573305 tatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 20573361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 282
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20647998
Alignment:
Q  222 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 20647998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 20654018 - 20654074
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20654018 tatgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 20654074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22886540 - 22886440
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||| |||    
T  22886540 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaactat 22886441  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  22886440 g 22886440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2545160 - 2545061
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2545160 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatattcataatgtgtgaaaatgggtagttgtaaaattatgcttaattgatgaattat 2545061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18612620 - 18612523
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  18612620 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 18612523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18619525 - 18619428
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  18619525 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 18619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 3431322 - 3431422
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  3431322 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 3431421  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  3431422 g 3431422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 40
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194251
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 40  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcattt 31194251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 16404895 - 16404932
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16404895 ataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 13662182 - 13662214
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662182 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13662214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 13720845 - 13720877
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13720845 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13720877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 16872968 - 16873000
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16872968 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16873000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373424
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43373424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 878 - 1155
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 977  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  978 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagaggtttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 1077  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861608
Alignment:
Q  7 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 15861426  T
Q  106 atctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatg 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15861427 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 15861526  T
Q  206 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15861527 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 15861608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 44034866 - 44035153
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034866 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 44034965  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44034966 aacccaatctttgaaattcttgtttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 44035065  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44035066 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 44035153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21860371 - 21860084
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860371 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 21860272  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21860271 aacccaatctttgaaattcgtacttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttaatgatgaaattgcaagttcatga 21860172  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860171 tgaatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 21860084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22367296 - 22367092
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367296 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 22367197  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 281  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367196 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa-tatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 22367098  T
Q  282 ttaatg 287  Q
    | ||||    
T  22367097 tcaatg 22367092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 285
Target Start/End: Original strand, 22403196 - 22403282
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaa 285  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22403196 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaa 22403282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41218765 - 41218667
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaa-nnnnnnnctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41218765 ataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattctcat 41218667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41212206 - 41212150
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41212206 tatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 41212150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 49967784 - 49967728
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49967784 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgat 49967728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522488
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 35522488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 21650081 - 21650181
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  21650081 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 21650180  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  21650181 g 21650181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21718362 - 21718306
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21718362 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgat 21718306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20254527 - 20254430
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  20254527 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 20254430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27329929
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  27329868 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatg 27329929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35054890 - 35054829
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  35054890 tatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatg 35054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 41394564 - 41394527
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41394564 ataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 41394527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051726
Alignment:
Q  5 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 45051726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844406
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 46523727 - 46523695
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46523727 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 46523695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 5978 - 6265
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5978 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 6077  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6078 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgatttgttaatgatgaaattgcaagttcatga 6177  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6178 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 6265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 5772 - 5923
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5772 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 5871  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||    
T  5872 aacccaatctttgaaattcgtgcttctgttgtagagatgtgtttgaatatgt 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22275082 - 22274795
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275082 ataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 22274983  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22274982 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 22274883  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274882 tgtatgaaaatgggttgtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatg 22274795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22284315 - 22284033
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284315 ataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcatatttgattatgagaataagtgattatcatg 22284216  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22284215 aactcaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttaatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 22284116  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22284115 tgtatgaaaatgaatagttagtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgat 22284033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9653073
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnnct-cttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttttcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 9652895  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9652896 aatctttgaaattcgtggttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 9652995  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9652996 gaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgat 9653073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 21274004 - 21274226
Alignment:
Q  60 ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  21274004 ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttga 21274103  T
Q  160 tgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttga 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274104 tgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttga 21274203  T
Q  260 tgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  21274204 tgaattgtaatatgtttcatgat 21274226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213162
Alignment:
Q  7 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 25213304  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||| ||||||    
T  25213303 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 25213205  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  25213204 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 25213162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15633574 - 15633327
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15633574 ataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcacttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattataatg 15633475  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||  ||||| |||||||   |||| | | ||||  ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |    
T  15633474 aacccaattcttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataa 15633375  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    ||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15633374 tgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 15633327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7321795 - 7321633
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    |||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||    
T  7321795 gaataagtgactattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattttttatgat 7321696  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
     ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  7321695 gaaatttcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 7321633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 23836791 - 23836874
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23836791 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 23836874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 25876006 - 25876088
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25876006 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgat 25876088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Original strand, 28031230 - 28031380
Alignment:
Q  97 atgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||| | | ||||  ||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||| ||||  || |||||    
T  28031230 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagttttagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 28031329  T
Q  197 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    | |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28031330 taatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 28031380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32465992 - 32465936
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32465992 tatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgat 32465936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6879597 - 6879515
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6879597 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgat 6879515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20279688 - 20279571
Alignment:
Q  83 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatc 182  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||   ||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||     
T  20279688 aataagtgattatggtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcatgttatagagatatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatg 20279589  T
Q  183 aaattgcaagttcatgat 200  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20279588 aaattgcatgttcatgat 20279571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33128258 - 33128135
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  33128258 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 33128159  T
Q  247 g-catggttgttgatgaattgtgat 270  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||    
T  33128158 gacat-gttgttgttgaattgtgat 33128135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 271304 - 271248
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  271304 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 271248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 24826760 - 24826860
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  24826760 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 24826859  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  24826860 g 24826860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17204529 - 17204445
Alignment:
Q  163 taaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  17204529 taaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 17204445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25602158 - 25602102
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25602158 tatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgat 25602102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890854
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36890798 tatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgat 36890854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19666884 - 19666843
Alignment:
Q  2 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 43  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19666884 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 19666843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 38
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  5 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 19794624 - 19794661
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19794624 ataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19794661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 20627233 - 20627270
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20627233 ataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcat 20627270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 463043
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 463043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 3798520 - 3798552
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3798520 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 3798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 4448246 - 4448302
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4448246 tatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgat 4448302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 8944185 - 8944153
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8944185 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8944153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 12635785 - 12635817
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12635785 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12635817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 12641559 - 12641591
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12641559 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 12728731 - 12728699
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12728731 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12728699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 16935932 - 16935900
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16935932 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16935900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17006592 - 17006560
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17006592 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17006560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863235
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22863235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28974183 - 28974127
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28974183 tatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgat 28974127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982396
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36982396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 42177886 - 42177918
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42177886 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 42177918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55659
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 55837  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55836 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtag 55737  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55736 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 55659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108179
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 108174  T
Q  104 caatc 108  Q
    |||||    
T  108175 caatc 108179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 347 - 633
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnnctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  347 ataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatctagttaattcttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatga 446  T
Q  101 acccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgat 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  447 acccaatatttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatatttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgtagatgatgaaattgcaagttcatgat 546  T
Q  201 gtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  547 gtatgaaaatgaatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 162073 - 162360
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162073 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 162172  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  162173 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatga 162272  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  162273 tgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 162360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 166159 - 166446
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166159 ataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 166258  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  166259 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatga 166358  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  166359 tgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 166446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 164349 - 164293
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164349 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 164293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 116446 - 116485
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 40  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  116446 ataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattt 116485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13563
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 13384  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13385 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 13484  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13485 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 13563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 282
Target Start/End: Original strand, 21432 - 21537
Alignment:
Q  177 atgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21432 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 21531  T
Q  277 catgat 282  Q
    ||||||    
T  21532 catgat 21537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6720
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgataataggtgcttatcatgaaccc 6542  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6543 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtcaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 6642  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6643 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgat 6720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17581
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcatttaggtaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataattgattatcatgaaccc 17403  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17404 aatctttgaaattagtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgattttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 17503  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17504 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 17581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12702
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttcttttgttctatgcataattgattatgggaataagttattatcatgaaccc 12517  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatg--aattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgt 202  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12518 aatctttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgtgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 12617  T
Q  203 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 12702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 287
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19083
Alignment:
Q  253 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 19083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30454 - 30164
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30454 ataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcatttagttaattatttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 30355  T
Q  100 aacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatga 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30354 aaccctatctttgaaattcatgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 30255  T
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatta---tgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30254 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgttgtttgaaattgtatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 30164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193664
Alignment:
Q  5 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 193495  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||| |||||||||||||         |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  193496 caatcattgaaattcgtgc---------agagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 193586  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  193587 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgat 193664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 282
Target Start/End: Original strand, 186566 - 186702
Alignment:
Q  145 aatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186566 aatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 186665  T
Q  245 atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  186666 atgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgat 186702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 73 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 15027
Alignment:
Q  73 tgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236 tgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtcgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 15137  T
Q  173 gttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15136 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtttattttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 15037  T
Q  273 gtttcatgat 282  Q
    ||||||||||    
T  15036 gtttcatgat 15027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 882 - 914
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 251
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4593
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||        |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacc 4445  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4446 caatctttgaaattagtgcttatgttgtagagatatgtttaaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 4545  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 5 - 205
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 104  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 281  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  105 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatga 204  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  205 t 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Original strand, 9882 - 10148
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataa-ttgattatgagaataagtgattatcatgaacc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataaattgattatgaaaataagtgattatcatgaacc 9981  T
Q  104 caatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9982 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 10081  T
Q  204 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 287  Q
    ||||||||||||                 |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10082 tgaaaatgggta-----------------aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatg 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130670
Alignment:
Q  7 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 130812  T
Q  105 aatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtat 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||| ||||||    
T  130811 aatctttgaaattcgtgctcatgttgtagagatatgtttggatacgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 130713  T
Q  205 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  130712 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 130670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 281
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89637
Alignment:
Q  222 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatga 89637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 282
Target Start/End: Original strand, 9565 - 9684
Alignment:
Q  163 taaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatga 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9565 taaatgaattgttgatgatgaaattgcaagtttatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatga 9664  T
Q  263 attgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  9665 attgtgataagtttcatgat 9684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 270
Target Start/End: Original strand, 44071 - 44279
Alignment:
Q  62 ctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatg 161  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  44071 ctatgcataagtgattatttgaataagtgattattgtgaacctaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatg 44170  T
Q  162 ttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgat 260  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |    
T  44171 gtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaaataagtagtttgtgagttatgctcaattgacgaattatgacat-gttgttgtt 44269  T
Q  261 gaattgtgat 270  Q
    ||||||||||    
T  44270 gaattgtgat 44279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42708 - 42575
Alignment:
Q  7 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaannnnnnn-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42708 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 42609  T
Q  106 atctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatat 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42608 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatat 42575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 219
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  384 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcttgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 285  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
     |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  284 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgtgtagtttgtgaattatgctcaattgttgaattatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 95192 - 95053
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttt----gtaaattatgctcaattggtgaa 242  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||| |||||    
T  95192 tatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatagatagtttatttgtaaattatgctcaattagtgaa 95093  T
Q  243 ttatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95092 ttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 95053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 24841 - 24897
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24841 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 24897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Original strand, 1478 - 1643
Alignment:
Q  82 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 181  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1478 gaataaatgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 1577  T
Q  182 caaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
     |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1578 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgagtagtttgagaattatgctcaattgatgaattatg 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Original strand, 3786 - 3981
Alignment:
Q  54 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatat----tttaatat 149  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    || | |||    
T  3786 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaaccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatatgtttgagtat 3885  T
Q  150 gttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatta 245  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  3886 gttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaatta 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6133 - 5996
Alignment:
Q  110 ttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaa 209  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||    
T  6133 ttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatataagtaaa 6034  T
Q  210 tgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  6033 tgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgatttatg 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32363 - 32281
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32363 tgtatgaaaatgggtatgtttgaaaat-atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 32281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 41940 - 42022
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41940 tgtatgaaaatgggtatgtttg-aaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 42022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14952
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 14952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15640
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15584 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 15640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 38
Target Start/End: Original strand, 36836 - 36869
Alignment:
Q  5 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7014
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6932 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 7014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 935 - 991
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  935 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgat 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 254900 - 254983
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  254900 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 254983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 261506 - 261589
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  261506 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 261589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17962 - 17812
Alignment:
Q  97 atgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||| | | ||||  ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||    
T  17962 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 17863  T
Q  197 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 247  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  17862 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 17812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 5359 - 5415
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5359 tatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 5415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 132363 - 132419
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  132363 tatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 132419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 88409 - 88353
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  88409 tatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 88353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11877
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11821 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgat 11877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38432 - 38376
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38432 tatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146679
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  146735 tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 146679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146906
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22825 - 22769
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22825 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 22769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128127
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 128127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 70735 - 70791
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70735 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgat 70791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 165007 - 165107
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  165007 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttcttatgaaattatgcttaattgatgaattat 165106  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  165107 g 165107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60884
Alignment:
Q  233 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 60884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172210
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 172210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177913
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 177913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4363
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4445 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgat 4363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 282
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11823
Alignment:
Q  200 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11740 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgat 11823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1395
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1451 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 1395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21588
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21646 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatta 21588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31345 - 31292
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcat 279  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31345 tatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcat 31292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 222
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  278 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 5622 - 5722
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||  ||||||||    
T  5622 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttttgaaattatgcttaattaatgaattat 5721  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  5722 g 5722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7647
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  7703 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgat 7647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 10015
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10071 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 34454 - 34554
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  34454 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattat 34553  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  34554 g 34554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 270
Target Start/End: Original strand, 61268 - 61391
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  61268 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttat 61367  T
Q  247 g-catggttgttgatgaattgtgat 270  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||    
T  61368 gacat-gttgttgttgaattgtgat 61391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48903
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 48903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 153924 - 153956
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  153924 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 153956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85410
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  85466 tatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 85410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159377
Alignment:
Q  222 aaattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgat 159377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5485 - 5338
Alignment:
Q  97 atgaacccaatctttgaaattcgtgcctatgttgtagagatatattttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||| | | ||||  ||| | ||||||||||   || |||||||||||||| |||| ||||  || |||||    
T  5485 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 5386  T
Q  197 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  5385 taatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 5338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48225
Alignment:
Q  221 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgat 48225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61673
Alignment:
Q  221 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgat 61673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 689 - 745
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  689 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 270
Target Start/End: Original strand, 17355 - 17478
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| | |   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17355 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgctgtgaaattatgcttaattgatgacttat 17454  T
Q  247 g-catggttgttgatgaattgtgat 270  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||    
T  17455 gacat-gttgttgttgaattgtgat 17478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 631 - 687
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  631 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11958 - 11862
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaat 243  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  11958 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaat 11862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26372
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118132
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  118076 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 118132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 282
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109631
Alignment:
Q  233 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 109631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 49889 - 49989
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||||    
T  49889 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatacttaattgatgaattat 49988  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  49989 g 49989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 253102 - 253158
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 253158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247398
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 247398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 6257 - 6357
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 246  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  6257 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattaagcttaattgatgacttat 6356  T
Q  247 g 247  Q
    |    
T  6357 g 6357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 9069
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttca 9069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 99
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  155 tatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgat 99  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 25040
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25092 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttca 25040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25293
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25345 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttca 25293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 11681 - 11737
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  11681 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgat 11737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33740
Alignment:
Q  222 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgat 33740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 5019
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5075 tatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 5019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 112658 - 112714
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  112658 tatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgat 112714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 40
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6024
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 40  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 40
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57426
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 40  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 57426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12734
Alignment:
Q  147 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatcaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 244  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| | |||  |||||  || ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12637 tatgttaacttgttgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgttatatataaatgaataattgataaattatgctcaattgatgaatt 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 70748 - 70691
Alignment:
Q  226 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  70748 tatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 70691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1463
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1431 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 1737 - 1701
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1737 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 130 - 94
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  130 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1524
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1492 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9183
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2700
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2732 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 5 - 41
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 6299 - 6335
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6299 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1430
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 19845 - 19881
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19845 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 24149 - 24185
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24149 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 20529 - 20493
Alignment:
Q  1 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20529 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272330
Alignment:
Q  6 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 38  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 272330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University