View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4701-Insertion-3 (Length: 394)

Name: NF4701-Insertion-3
Description: NF4701
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4701-Insertion-3
NF4701-Insertion-3
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (110-392)||(43348709-43348991)
chr5 (110-382)||(7440291-7440563)
chr5 (110-382)||(26525040-26525312)
chr5 (110-386)||(3631334-3631610)
chr5 (110-386)||(16823206-16823482)
chr5 (110-394)||(30772954-30773238)
chr5 (110-390)||(43358485-43358765)
chr5 (110-394)||(32304451-32304735)
chr5 (110-382)||(25701232-25701503)
chr5 (110-382)||(9595976-9596248)
chr5 (110-394)||(8074037-8074321)
chr5 (113-386)||(13084449-13084722)
chr5 (113-386)||(13013061-13013334)
chr5 (113-394)||(10925587-10925868)
chr5 (173-394)||(26784968-26785189)
chr5 (110-380)||(15374190-15374445)
chr5 (110-382)||(41084392-41084664)
chr5 (110-379)||(26296822-26297091)
chr5 (141-386)||(15374319-15374578)
chr5 (213-382)||(9737631-9737799)
chr5 (211-394)||(20656769-20656952)
chr5 (110-248)||(9737651-9737789)
chr5 (216-384)||(20487040-20487208)
chr5 (110-234)||(29390344-29390468)
chr5 (119-248)||(20656801-20656931)
chr5 (213-362)||(3631324-3631472)
chr5 (108-248)||(20487045-20487186)
chr5 (213-362)||(26525174-26525322)
chr5 (213-366)||(19577120-19577273)
chr5 (213-361)||(8074184-8074331)
chr5 (213-338)||(41084549-41084674)
chr5 (110-248)||(19577124-19577263)
chr5 (223-366)||(22578874-22579017)
chr5 (211-330)||(26296984-26297103)
chr5 (220-366)||(41817525-41817671)
chr5 (213-362)||(7440425-7440573)
chr5 (213-362)||(43348699-43348847)
chr5 (213-362)||(43358475-43358623)
chr5 (121-248)||(41817539-41817667)
chr5 (213-352)||(29390334-29390472)
chr5 (216-362)||(37042496-37042643)
chr5 (213-362)||(9596110-9596258)
chr5 (213-362)||(30772944-30773092)
chr5 (110-214)||(5844181-5844285)
chr5 (213-353)||(16823196-16823335)
chr5 (110-248)||(13013085-13013224)
chr5 (110-248)||(26785018-26785157)
chr5 (213-362)||(32304597-32304745)
chr5 (216-372)||(28662185-28662341)
chr5 (110-248)||(13084473-13084612)
chr5 (110-224)||(10925697-10925812)
chr5 (110-248)||(22578878-22579017)
chr5 (110-248)||(28662192-28662331)
chr5 (110-248)||(37042496-37042636)
chr5 (213-324)||(30050074-30050184)
chr5 (213-358)||(13013203-13013347)
chr5 (213-330)||(15374180-15374296)
chr5 (213-328)||(5844171-5844285)
chr5 (213-358)||(10925574-10925718)
chr5 (213-358)||(13084591-13084735)
chr5 (223-330)||(20071189-20071296)
chr5 (110-219)||(20071186-20071296)
chr5 (173-246)||(26683033-26683107)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (110-394)||(44254400-44254684)
chr3 (110-382)||(29125855-29126127)
chr3 (110-394)||(32270718-32271003)
chr3 (110-382)||(11231966-11232238)
chr3 (110-394)||(27742561-27742845)
chr3 (110-386)||(28952199-28952475)
chr3 (119-394)||(35083877-35084152)
chr3 (110-382)||(52202057-52202329)
chr3 (110-382)||(50527445-50527717)
chr3 (121-386)||(49657019-49657284)
chr3 (110-382)||(1092689-1092961)
chr3 (110-382)||(22729295-22729567)
chr3 (131-394)||(16908618-16908881)
chr3 (110-382)||(12251319-12251591)
chr3 (110-346)||(13594721-13594957)
chr3 (110-381)||(21259133-21259405)
chr3 (110-362)||(21259266-21259518)
chr3 (110-394)||(36633562-36633839)
chr3 (121-392)||(52571234-52571497)
chr3 (213-381)||(7160216-7160384)
chr3 (214-382)||(25246149-25246317)
chr3 (110-284)||(49169868-49170042)
chr3 (110-382)||(45045284-45045556)
chr3 (110-247)||(18163793-18163930)
chr3 (131-295)||(743958-744113)
chr3 (110-248)||(4618226-4618362)
chr3 (213-382)||(44205477-44205646)
chr3 (110-248)||(44205487-44205626)
chr3 (213-382)||(18163783-18163951)
chr3 (110-248)||(35083981-35084120)
chr3 (110-248)||(49657043-49657182)
chr3 (110-239)||(34660821-34660950)
chr3 (213-362)||(11232100-11232248)
chr3 (213-362)||(29125989-29126137)
chr3 (110-248)||(7160235-7160374)
chr3 (227-366)||(31174500-31174639)
chr3 (213-362)||(12251453-12251601)
chr3 (214-362)||(27742552-27742699)
chr3 (121-248)||(31174504-31174632)
chr3 (214-362)||(50527579-50527726)
chr3 (110-248)||(16908650-16908789)
chr3 (220-362)||(32270865-32271006)
chr3 (221-362)||(44254546-44254686)
chr3 (213-362)||(52202047-52202195)
chr3 (216-366)||(2618953-2619102)
chr3 (215-362)||(22729287-22729433)
chr3 (110-248)||(2618960-2619098)
chr3 (213-362)||(13594819-13594967)
chr3 (213-362)||(28952337-28952485)
chr3 (213-362)||(36633552-36633700)
chr3 (213-362)||(45045274-45045423)
chr3 (213-362)||(49169858-49170006)
chr3 (216-356)||(34660814-34660953)
chr3 (215-362)||(1092823-1092969)
chr3 (110-248)||(25246169-25246308)
chr3 (213-362)||(35083858-35084006)
chr3 (213-389)||(4618216-4618389)
chr3 (215-362)||(49657157-49657303)
chr3 (213-362)||(21259380-21259528)
chr3 (110-194)||(52499197-52499281)
chr3 (298-393)||(49170160-49170255)
chr3 (213-343)||(52571389-52571518)
chr3 (306-366)||(18657975-18658035)
chr3 (231-366)||(576405-576539)
chr3 (196-233)||(18657979-18658016)
chr3 (223-300)||(52499204-52499281)
chr3 (110-194)||(744042-744125)
chr3 (215-249)||(25894698-25894732)
chr3 (215-249)||(25911665-25911699)
chr3 (71-100)||(7160422-7160451)
chr3 (67-100)||(28952523-28952556)
chr3 (310-362)||(744015-744067)
chr3 (220-284)||(18657913-18657977)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (110-394)||(23469195-23469479)
chr7 (110-382)||(31065434-31065706)
chr7 (110-394)||(36675286-36675570)
chr7 (110-382)||(44467832-44468104)
chr7 (110-394)||(45350126-45350410)
chr7 (110-394)||(46027755-46028039)
chr7 (110-394)||(17166941-17167226)
chr7 (113-394)||(22723575-22723856)
chr7 (110-382)||(26873778-26874050)
chr7 (110-382)||(36358121-36358393)
chr7 (108-382)||(44142835-44143108)
chr7 (110-376)||(31428812-31429078)
chr7 (110-380)||(44723876-44724146)
chr7 (113-382)||(43859169-43859438)
chr7 (110-394)||(9624071-9624355)
chr7 (110-382)||(40055666-40055938)
chr7 (119-382)||(42241740-42242003)
chr7 (113-394)||(41367737-41368018)
chr7 (113-382)||(39976399-39976668)
chr7 (110-382)||(16834086-16834360)
chr7 (110-386)||(29075002-29075268)
chr7 (213-394)||(8461764-8461945)
chr7 (213-394)||(31931823-31932004)
chr7 (213-385)||(18104240-18104411)
chr7 (216-382)||(46828761-46828926)
chr7 (217-366)||(25174216-25174365)
chr7 (213-362)||(26873768-26873916)
chr7 (111-248)||(25174223-25174361)
chr7 (213-393)||(23562561-23562740)
chr7 (211-362)||(17166929-17167080)
chr7 (110-248)||(43859279-43859418)
chr7 (216-366)||(29502072-29502222)
chr7 (244-386)||(29663010-29663152)
chr7 (213-362)||(22723721-22723869)
chr7 (110-248)||(16649541-16649679)
chr7 (110-248)||(17623902-17624040)
chr7 (108-248)||(29502076-29502217)
chr7 (213-362)||(44467966-44468114)
chr7 (213-362)||(45350116-45350264)
chr7 (213-362)||(46027745-46027893)
chr7 (110-248)||(23562592-23562730)
chr7 (215-362)||(29075130-29075276)
chr7 (110-248)||(31931855-31931994)
chr7 (220-366)||(28754878-28755023)
chr7 (110-248)||(46828781-46828919)
chr7 (213-362)||(31065568-31065716)
chr7 (213-362)||(36675432-36675580)
chr7 (213-362)||(44724008-44724156)
chr7 (110-248)||(41367847-41367986)
chr7 (213-362)||(43859156-43859304)
chr7 (113-248)||(30781089-30781224)
chr7 (110-248)||(8461774-8461913)
chr7 (211-366)||(9013879-9014033)
chr7 (110-248)||(22723607-22723746)
chr7 (219-362)||(23469341-23469483)
chr7 (213-362)||(44142827-44142974)
chr7 (213-362)||(9624061-9624209)
chr7 (217-366)||(16649537-16649685)
chr7 (217-366)||(17623898-17624046)
chr7 (213-362)||(36358255-36358403)
chr7 (216-366)||(22499722-22499868)
chr7 (279-362)||(6961163-6961246)
chr7 (110-216)||(18104295-18104401)
chr7 (110-248)||(42241760-42241899)
chr7 (240-366)||(9021516-9021642)
chr7 (131-248)||(29663010-29663128)
chr7 (213-338)||(16834246-16834370)
chr7 (213-362)||(31428802-31428950)
chr7 (216-366)||(30781079-30781228)
chr7 (157-245)||(4248865-4248954)
chr7 (232-372)||(9014476-9014623)
chr7 (213-362)||(42241874-42242022)
chr7 (118-229)||(9014475-9014587)
chr7 (213-358)||(39976386-39976530)
chr7 (255-359)||(4248865-4248969)
chr7 (110-248)||(8727797-8727936)
chr7 (213-358)||(41367724-41367868)
chr7 (219-287)||(22566599-22566667)
chr7 (113-228)||(28754884-28754999)
chr7 (118-248)||(9013899-9014029)
chr7 (196-248)||(6961194-6961246)
chr7 (129-248)||(9021518-9021638)
chr7 (110-248)||(22499726-22499861)
chr7 (215-366)||(40883349-40883499)
chr7 (223-329)||(4248977-4249083)
chr7 (150-199)||(14629639-14629688)
chr7 (110-248)||(40883357-40883495)
chr7 (256-366)||(8727830-8727940)
chr7 (213-266)||(6961112-6961165)
chr7 (110-167)||(22566606-22566663)
chr7 (173-233)||(24779600-24779661)
chr7 (306-366)||(24779581-24779641)
chr7 (110-152)||(6961122-6961164)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (110-394)||(22658146-22658430)
chr8 (110-394)||(4231295-4231579)
chr8 (110-390)||(21434915-21435195)
chr8 (110-382)||(7242447-7242718)
chr8 (110-386)||(41388081-41388357)
chr8 (110-386)||(41837762-41838038)
chr8 (117-394)||(4697889-4698166)
chr8 (110-386)||(7012413-7012688)
chr8 (110-382)||(10092330-10092602)
chr8 (110-382)||(28564960-28565232)
chr8 (110-382)||(28572583-28572855)
chr8 (108-392)||(36060431-36060715)
chr8 (110-378)||(42555909-42556177)
chr8 (110-386)||(43117424-43117701)
chr8 (110-382)||(1183898-1184170)
chr8 (110-394)||(3659622-3659906)
chr8 (110-382)||(5589985-5590257)
chr8 (110-382)||(6316952-6317224)
chr8 (110-382)||(24796865-24797137)
chr8 (110-382)||(2317137-2317409)
chr8 (110-382)||(3886592-3886864)
chr8 (121-382)||(1098144-1098405)
chr8 (108-386)||(38567203-38567459)
chr8 (110-393)||(7413107-7413390)
chr8 (213-394)||(197268-197449)
chr8 (213-394)||(312105-312286)
chr8 (130-389)||(41169793-41170046)
chr8 (110-366)||(7421883-7422132)
chr8 (211-362)||(43117412-43117563)
chr8 (213-386)||(9830673-9830845)
chr8 (216-366)||(36108837-36108987)
chr8 (110-248)||(9830683-9830821)
chr8 (216-366)||(11635828-11635978)
chr8 (213-338)||(7413097-7413222)
chr8 (215-366)||(25382979-25383129)
chr8 (213-362)||(3886726-3886874)
chr8 (213-362)||(42556039-42556187)
chr8 (214-362)||(22658292-22658439)
chr8 (213-362)||(7421994-7422142)
chr8 (213-362)||(10092320-10092468)
chr8 (108-248)||(24796885-24797026)
chr8 (213-362)||(28564950-28565098)
chr8 (213-362)||(28572573-28572721)
chr8 (110-248)||(1098246-1098385)
chr8 (216-363)||(25642676-25642823)
chr8 (110-244)||(36108844-36108979)
chr8 (213-362)||(2317127-2317275)
chr8 (213-362)||(3659768-3659916)
chr8 (213-362)||(4231285-4231433)
chr8 (110-234)||(17836503-17836628)
chr8 (213-362)||(24796999-24797147)
chr8 (213-362)||(36060423-36060571)
chr8 (306-386)||(34934292-34934372)
chr8 (110-248)||(197278-197417)
chr8 (110-248)||(312115-312254)
chr8 (215-362)||(5590119-5590265)
chr8 (110-248)||(11635835-11635974)
chr8 (110-248)||(25642677-25642816)
chr8 (212-362)||(4697871-4698020)
chr8 (218-364)||(17836498-17836644)
chr8 (213-362)||(41837900-41838048)
chr8 (214-362)||(41169764-41169912)
chr8 (110-248)||(4697995-4698134)
chr8 (211-362)||(6316940-6317090)
chr8 (213-362)||(7242581-7242728)
chr8 (216-366)||(8995039-8995189)
chr8 (213-362)||(7012403-7012551)
chr8 (213-362)||(21434905-21435053)
chr8 (213-362)||(38567195-38567343)
chr8 (110-248)||(8996424-8996561)
chr8 (216-365)||(8996417-8996564)
chr8 (213-358)||(1098123-1098267)
chr8 (213-362)||(1183888-1184036)
chr8 (213-362)||(41388071-41388219)
chr8 (110-212)||(41169887-41169989)
chr8 (231-365)||(43073117-43073250)
chr8 (158-248)||(43073157-43073247)
chr8 (110-234)||(8995046-8995171)
chr8 (213-366)||(32017916-32018069)
chr8 (110-248)||(25382983-25383121)
chr8 (119-226)||(32017942-32018050)
chr8 (196-248)||(34934316-34934368)
chr8 (225-288)||(42559031-42559094)
chr8 (211-251)||(26149486-26149526)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (110-382)||(15469165-15469436)
chr6 (110-392)||(26468524-26468806)
chr6 (100-386)||(24130051-24130338)
chr6 (110-386)||(12698570-12698845)
chr6 (110-382)||(7021893-7022164)
chr6 (110-382)||(11450316-11450587)
chr6 (110-381)||(16461220-16461492)
chr6 (110-392)||(2660639-2660921)
chr6 (113-378)||(24635285-24635550)
chr6 (110-382)||(34023353-34023625)
chr6 (110-382)||(34127573-34127845)
chr6 (113-386)||(9078863-9079135)
chr6 (114-382)||(8560505-8560774)
chr6 (110-382)||(23258765-23259038)
chr6 (114-362)||(23258899-23259147)
chr6 (108-363)||(12996357-12996613)
chr6 (110-393)||(14882962-14883245)
chr6 (213-371)||(13405298-13405456)
chr6 (213-362)||(7021883-7022031)
chr6 (211-362)||(12698558-12698707)
chr6 (213-366)||(7536522-7536675)
chr6 (213-362)||(2660783-2660931)
chr6 (213-362)||(26468514-26468662)
chr6 (213-362)||(9079001-9079148)
chr6 (213-362)||(15469155-15469303)
chr6 (216-337)||(10290526-10290647)
chr6 (221-362)||(11450449-11450589)
chr6 (213-358)||(24635419-24635563)
chr6 (213-362)||(34127563-34127711)
chr6 (110-248)||(13405307-13405446)
chr6 (213-326)||(14883142-14883255)
chr6 (213-362)||(8560491-8560639)
chr6 (213-362)||(34023487-34023635)
chr6 (110-248)||(8560614-8560754)
chr6 (154-229)||(31968955-31969031)
chr6 (110-248)||(7536532-7536671)
chr6 (211-362)||(23259013-23259163)
chr6 (155-223)||(10290578-10290647)
chr6 (213-362)||(16461354-16461502)
chr6 (253-366)||(31968932-31969046)
chr6 (223-363)||(1398049-1398188)
chr6 (110-233)||(1398065-1398188)
chr6 (211-249)||(2399362-2399400)
chr6 (212-249)||(18234977-18235014)
chr6 (220-317)||(31489894-31489991)
chr6 (318-366)||(2064778-2064826)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (110-378)||(16194327-16194595)
chr2 (110-382)||(26293235-26293507)
chr2 (110-394)||(11764869-11765153)
chr2 (110-382)||(36435993-36436265)
chr2 (119-382)||(6749817-6750080)
chr2 (110-382)||(1020879-1021151)
chr2 (110-378)||(2249656-2249924)
chr2 (110-382)||(26860473-26860745)
chr2 (110-382)||(1114849-1115121)
chr2 (110-382)||(23869738-23870010)
chr2 (110-382)||(34983351-34983623)
chr2 (110-394)||(7366226-7366510)
chr2 (110-378)||(13615778-13616046)
chr2 (110-381)||(31392622-31392891)
chr2 (110-386)||(44545536-44545812)
chr2 (110-378)||(42016578-42016846)
chr2 (113-394)||(12995044-12995325)
chr2 (110-382)||(38527249-38527520)
chr2 (110-382)||(28745315-28745575)
chr2 (110-363)||(11935205-11935459)
chr2 (110-281)||(38763789-38763960)
chr2 (110-380)||(3836154-3836423)
chr2 (213-386)||(22674660-22674833)
chr2 (213-393)||(43471367-43471547)
chr2 (213-386)||(34494396-34494568)
chr2 (112-248)||(34494420-34494556)
chr2 (213-382)||(41699249-41699415)
chr2 (215-372)||(31643545-31643702)
chr2 (110-248)||(19283875-19284013)
chr2 (108-248)||(41699257-41699395)
chr2 (221-394)||(19283843-19284015)
chr2 (213-362)||(34983341-34983489)
chr2 (110-248)||(43471398-43471537)
chr2 (213-362)||(1021013-1021161)
chr2 (221-378)||(2077563-2077720)
chr2 (213-362)||(11935320-11935469)
chr2 (213-362)||(26293225-26293373)
chr2 (110-248)||(6749837-6749976)
chr2 (213-362)||(1114983-1115131)
chr2 (213-362)||(38763779-38763927)
chr2 (110-248)||(12995154-12995293)
chr2 (211-362)||(26860607-26860757)
chr2 (213-362)||(2249646-2249794)
chr2 (213-362)||(13615908-13616056)
chr2 (213-362)||(16194317-16194465)
chr2 (213-362)||(23869728-23869876)
chr2 (108-248)||(23869849-23869990)
chr2 (213-362)||(36436127-36436275)
chr2 (213-362)||(42016568-42016716)
chr2 (215-362)||(7366218-7366364)
chr2 (110-248)||(22674684-22674823)
chr2 (110-248)||(31643555-31643694)
chr2 (216-366)||(32099999-32100154)
chr2 (224-366)||(29141871-29142013)
chr2 (213-362)||(11764859-11765007)
chr2 (213-362)||(44545674-44545822)
chr2 (213-343)||(12995031-12995160)
chr2 (213-362)||(31392612-31392759)
chr2 (213-362)||(28745438-28745585)
chr2 (215-362)||(3836284-3836431)
chr2 (216-366)||(29035340-29035490)
chr2 (213-362)||(38527239-38527386)
chr2 (110-248)||(2077565-2077704)
chr2 (119-229)||(32100015-32100131)
chr2 (213-280)||(17526052-17526119)
chr2 (119-248)||(29035344-29035474)
chr2 (111-248)||(29141875-29142013)
chr2 (213-362)||(6749951-6750099)
chr2 (341-382)||(38763961-38764002)
chr2 (211-249)||(1538194-1538232)
chr2 (211-248)||(44788477-44788514)
[»] chr1 (90 HSPs)
chr1 (111-382)||(40567042-40567313)
chr1 (110-386)||(25298894-25299170)
chr1 (110-394)||(33011855-33012139)
chr1 (110-382)||(16692759-16693031)
chr1 (110-386)||(40428587-40428863)
chr1 (110-382)||(51139761-51140033)
chr1 (110-394)||(919508-919792)
chr1 (110-382)||(23177417-23177689)
chr1 (110-394)||(42372045-42372329)
chr1 (110-378)||(8086305-8086573)
chr1 (110-382)||(47561802-47562074)
chr1 (112-382)||(24790512-24790783)
chr1 (110-394)||(46224560-46224842)
chr1 (113-392)||(17285093-17285373)
chr1 (110-382)||(44052269-44052541)
chr1 (110-386)||(48708223-48708499)
chr1 (121-382)||(29981517-29981778)
chr1 (110-382)||(37125768-37126040)
chr1 (114-386)||(45836923-45837195)
chr1 (113-382)||(29170020-29170289)
chr1 (110-362)||(24544548-24544800)
chr1 (110-382)||(8530158-8530436)
chr1 (119-382)||(9042229-9042491)
chr1 (121-382)||(24542590-24542852)
chr1 (113-382)||(6849831-6850099)
chr1 (121-362)||(24542724-24542966)
chr1 (121-362)||(24542838-24543080)
chr1 (121-362)||(24542952-24543194)
chr1 (121-362)||(24543066-24543308)
chr1 (121-362)||(24543180-24543422)
chr1 (121-362)||(24543294-24543536)
chr1 (121-362)||(24543408-24543650)
chr1 (121-362)||(24543522-24543764)
chr1 (121-362)||(24543636-24543878)
chr1 (121-362)||(24543750-24543992)
chr1 (121-362)||(24543864-24544106)
chr1 (121-362)||(24543978-24544220)
chr1 (121-362)||(24544092-24544334)
chr1 (121-362)||(24544206-24544448)
chr1 (121-362)||(24544320-24544562)
chr1 (121-362)||(24544434-24544676)
chr1 (110-248)||(44317642-44317780)
chr1 (243-394)||(37343082-37343233)
chr1 (212-377)||(49001410-49001576)
chr1 (189-366)||(9246840-9247019)
chr1 (110-248)||(40567154-40567293)
chr1 (215-371)||(32540528-32540684)
chr1 (216-366)||(21852069-21852219)
chr1 (213-362)||(25299032-25299180)
chr1 (213-362)||(17285238-17285386)
chr1 (213-362)||(33012001-33012149)
chr1 (213-382)||(44317632-44317800)
chr1 (213-362)||(48708361-48708509)
chr1 (213-362)||(51139751-51139899)
chr1 (215-362)||(8086297-8086443)
chr1 (110-248)||(29981537-29981676)
chr1 (110-224)||(45837032-45837147)
chr1 (213-362)||(919654-919802)
chr1 (213-362)||(16692893-16693041)
chr1 (110-248)||(17285123-17285263)
chr1 (213-362)||(42372035-42372183)
chr1 (215-362)||(24790502-24790648)
chr1 (130-248)||(37343082-37343201)
chr1 (220-363)||(46601074-46601217)
chr1 (108-248)||(21852074-21852215)
chr1 (213-362)||(29981651-29981799)
chr1 (213-362)||(37125758-37125906)
chr1 (213-362)||(45836909-45837057)
chr1 (110-248)||(9042249-9042388)
chr1 (110-248)||(29170130-29170269)
chr1 (110-244)||(32540541-32540676)
chr1 (215-362)||(40428725-40428871)
chr1 (119-248)||(49001425-49001554)
chr1 (213-354)||(8530148-8530288)
chr1 (213-362)||(24544662-24544810)
chr1 (221-362)||(46224704-46224844)
chr1 (110-248)||(9246844-9246983)
chr1 (213-362)||(23177407-23177555)
chr1 (110-248)||(6849941-6850079)
chr1 (129-239)||(29055886-29055997)
chr1 (213-358)||(6849818-6849962)
chr1 (223-372)||(29055868-29056015)
chr1 (213-358)||(29170007-29170151)
chr1 (213-362)||(44052403-44052551)
chr1 (213-362)||(47561792-47561940)
chr1 (171-248)||(46601138-46601216)
chr1 (267-363)||(25030371-25030467)
chr1 (155-229)||(25030372-25030447)
chr1 (211-249)||(45807075-45807113)
chr1 (211-246)||(1243675-1243710)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (108-382)||(36584496-36584770)
chr4 (110-394)||(41832451-41832736)
chr4 (112-382)||(31663978-31664248)
chr4 (110-386)||(11650773-11651049)
chr4 (110-394)||(36954809-36955093)
chr4 (110-390)||(44745393-44745673)
chr4 (110-382)||(12700379-12700651)
chr4 (110-394)||(44134569-44134852)
chr4 (110-394)||(6755904-6756187)
chr4 (110-394)||(13233305-13233589)
chr4 (110-382)||(31581561-31581833)
chr4 (110-382)||(38141368-38141640)
chr4 (110-392)||(40228231-40228513)
chr4 (110-394)||(13612891-13613175)
chr4 (110-394)||(18491262-18491546)
chr4 (110-386)||(43564493-43564769)
chr4 (113-382)||(16925184-16925453)
chr4 (113-394)||(2654709-2654990)
chr4 (110-386)||(19653452-19653727)
chr4 (110-382)||(52581531-52581804)
chr4 (112-382)||(22647189-22647458)
chr4 (110-393)||(54795529-54795812)
chr4 (110-393)||(27270428-27270711)
chr4 (110-393)||(50767109-50767392)
chr4 (111-380)||(10096270-10096538)
chr4 (110-382)||(4632515-4632788)
chr4 (121-302)||(44817441-44817621)
chr4 (110-245)||(45670035-45670170)
chr4 (214-394)||(51001542-51001721)
chr4 (110-248)||(13857687-13857826)
chr4 (213-362)||(4632649-4632798)
chr4 (110-248)||(13869217-13869356)
chr4 (110-248)||(31663998-31664137)
chr4 (212-362)||(36584487-36584636)
chr4 (213-338)||(50767099-50767224)
chr4 (110-248)||(7638702-7638840)
chr4 (110-228)||(10096308-10096426)
chr4 (220-366)||(36801801-36801947)
chr4 (213-362)||(10096401-10096549)
chr4 (216-365)||(13857680-13857829)
chr4 (213-362)||(36954955-36955103)
chr4 (213-362)||(38141502-38141650)
chr4 (213-362)||(41832441-41832590)
chr4 (213-338)||(54795697-54795822)
chr4 (110-248)||(16925294-16925433)
chr4 (213-362)||(6755894-6756042)
chr4 (213-362)||(13233295-13233443)
chr4 (217-366)||(13869211-13869360)
chr4 (221-366)||(7638698-7638842)
chr4 (213-362)||(11650911-11651059)
chr4 (213-362)||(18491252-18491400)
chr4 (213-330)||(27270418-27270535)
chr4 (213-362)||(43564483-43564631)
chr4 (213-362)||(44745535-44745683)
chr4 (213-359)||(45670025-45670170)
chr4 (221-366)||(10393896-10394041)
chr4 (213-362)||(12700513-12700661)
chr4 (213-362)||(13613037-13613185)
chr4 (213-362)||(31581695-31581843)
chr4 (213-362)||(2654855-2655003)
chr4 (112-248)||(26653080-26653217)
chr4 (213-362)||(40228375-40228523)
chr4 (213-362)||(44134559-44134706)
chr4 (282-366)||(7776903-7776987)
chr4 (225-389)||(26653053-26653217)
chr4 (7-71)||(27886463-27886527)
chr4 (110-229)||(51001551-51001670)
chr4 (110-248)||(22647299-22647438)
chr4 (215-362)||(44817495-44817640)
chr4 (213-358)||(16925171-16925315)
chr4 (213-362)||(52581521-52581669)
chr4 (318-382)||(45670168-45670232)
chr4 (110-248)||(10393898-10394037)
chr4 (110-248)||(36801805-36801944)
chr4 (159-232)||(18707805-18707879)
chr4 (213-366)||(18707742-18707898)
chr4 (149-229)||(18735298-18735379)
chr4 (213-362)||(19653590-19653737)
chr4 (196-248)||(7776931-7776983)
chr4 (149-232)||(18669047-18669131)
chr4 (157-228)||(9046060-9046131)
chr4 (213-362)||(133416-133564)
chr4 (108-249)||(133424-133565)
chr4 (306-366)||(5734194-5734254)
chr4 (213-366)||(18668994-18669150)
chr4 (149-232)||(18715047-18715131)
chr4 (213-366)||(18735245-18735401)
chr4 (270-366)||(9046036-9046131)
chr4 (110-192)||(44817438-44817520)
chr4 (196-233)||(5734198-5734235)
chr4 (213-253)||(9046134-9046174)
chr4 (211-248)||(11975782-11975819)
chr4 (213-246)||(18714845-18714878)
chr4 (212-248)||(2763032-2763068)
chr4 (220-284)||(5734132-5734196)
chr4 (310-366)||(18715095-18715150)
chr4 (68-100)||(36584419-36584451)
chr4 (204-248)||(45670168-45670212)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (110-382)||(19121-19393)
scaffold0050 (216-362)||(19114-19259)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (110-362)||(65009-65261)
scaffold0014 (110-382)||(65122-65395)
scaffold0014 (214-362)||(65000-65147)
[»] scaffold0978 (3 HSPs)
scaffold0978 (119-394)||(1188-1463)
scaffold0978 (215-362)||(1171-1317)
scaffold0978 (110-232)||(1292-1415)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (110-327)||(331847-332064)
scaffold0002 (213-362)||(331837-331985)
scaffold0002 (319-382)||(332441-332504)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (110-302)||(11253-11445)
scaffold0131 (213-362)||(11243-11391)
[»] scaffold0041 (2 HSPs)
scaffold0041 (215-366)||(82785-82935)
scaffold0041 (110-248)||(82789-82927)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (223-330)||(303794-303901)
scaffold0003 (110-219)||(303791-303901)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 110 - 392
Target Start/End: Original strand, 43348709 - 43348991
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43348709 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataat 43348808  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  43348809 tcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 43348908  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43348909 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccatcctaa 43348991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7440563 - 7440291
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7440563 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 7440464  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||    
T  7440463 tcaactataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccga 7440364  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7440363 aaattttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 7440291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26525312 - 26525040
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26525312 tattttgcgagattttttgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 26525213  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  26525212 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggtttaaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 26525113  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26525112 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtgg 26525040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 3631334 - 3631610
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3631334 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 3631433  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  3631434 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 3631533  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3631534 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgggactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 3631610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 16823206 - 16823482
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16823206 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataat 16823305  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  16823306 tcaattatagatctattttgcgagattttatatgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 16823405  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16823406 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 16823482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 30772954 - 30773238
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30772954 tattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataat 30773053  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  30773054 tcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 30773153  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30773154 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcagtagttaattttagtggcccaccctaaca 30773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 390
Target Start/End: Original strand, 43358485 - 43358765
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43358485 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtagtgtagtgacccacccgaaaatttaaataat 43358584  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  43358585 tcaattataggtttattttgcgagattttatacaattttatgtctgttttaggttacggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaa 43358684  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcct 390  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  43358685 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtgacccatcct 43358765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32304735 - 32304451
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||    
T  32304735 tattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtattggcccacccaaaaattgaaataat 32304636  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  32304635 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccga 32304536  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32304535 aaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacattttttcaatagttaattttagtgatccatcctaaca 32304451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25701503 - 25701232
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25701503 tattttgcaagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 25701404  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||    
T  25701403 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaa-tttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccacccga 25701305  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25701304 aaaatttaaataattcaattataggtctaattttttagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 25701232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9596248 - 9595976
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9596248 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttagttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataat 9596149  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||    
T  9596148 tcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttgtgttgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccga 9596049  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9596048 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtgg 9595976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8074321 - 8074037
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8074321 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtagtgtagtggtccacccaaaaatttaaataat 8074222  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  8074221 tcaattataaatctattttgcgagattttatacaatttaatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccga 8074122  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  8074121 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtggcccaccctaaca 8074037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13084722 - 13084449
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13084722 tttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgcagtgtcccacccgaaaatttaaataattca 13084623  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | | |||||||    
T  13084622 attataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcagttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaa 13084523  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13084522 atttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 13084449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13013334 - 13013061
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  13013334 tttgcgagattttaagcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgtagtgtcccactcgaaaatttaaataattca 13013235  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | | |||||||    
T  13013234 attataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcggttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaa 13013135  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13013134 atttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 13013061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 113 - 394
Target Start/End: Original strand, 10925587 - 10925868
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10925587 tttgcgagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttagttgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacctgaaaatttaaataattca 10925686  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||| | | | |||||    
T  10925687 attatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattttggcaaattggtgtagtggtctaccagaaaa 10925786  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  10925787 atttaaataattcaattataggtctaacttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgacccaccctaaca 10925868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 173 - 394
Target Start/End: Original strand, 26784968 - 26785189
Alignment:
Q  173 aaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttga 272  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26784968 aaagtggtgtagtggcccacccaaaaattgaaataattcaactataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttga 26785067  T
Q  273 tccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagtta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26785068 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagtttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttttcaatggtta 26785167  T
Q  373 attttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  26785168 attttagtggcccaccctaaca 26785189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 110 - 380
Target Start/End: Original strand, 15374190 - 15374445
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  15374190 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatcgaaattcttgcaaagtggtgtaatggtccacccacaaatttaaataat 15374289  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||| ||               ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||    
T  15374290 tcaattatatgt---------------ttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactga 15374374  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagt 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15374375 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 15374445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41084664 - 41084392
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  41084664 tattttgcgagattttatagaattttgtgtcgattttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaaatttaaataa 41084565  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| || | | | | |    
T  41084564 ttcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttaattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccgg 41084466  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41084465 aaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtgg 41084392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 110 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26297091 - 26296822
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaa-atttaaataa 208  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  26297091 tattttgcaagatcttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaatatttaaataa 26296992  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| || | | | |||    
T  26296991 ttcaattataggcctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccg 26296893  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttag 379  Q
    |||||| |||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26296892 aaaaatgtaaacaattcaattatagatctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttag 26296822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 386
Target Start/End: Original strand, 15374319 - 15374578
Alignment:
Q  141 ggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagatttta 239  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15374319 ggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagacttta 15374418  T
Q  240 tacaatttt----------atgtcagt---tttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattca 326  Q
     ||||||||          || | |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||||||||||    
T  15374419 aacaatttttcaatagttaattttagtagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgacccaactgaaaaatttaaataattca 15374518  T
Q  327 attaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15374519 attataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgatcca 15374578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9737799 - 9737631
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  9737799 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 9737700  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9737699 -tttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 9737631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20656952 - 20656769
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20656952 caattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaa 20656853  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  20656852 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgatccaccctaaca 20656769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9737789 - 9737651
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9737789 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 9737690  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  9737689 tcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 9737651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 384
Target Start/End: Original strand, 20487040 - 20487208
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  20487040 ataggtatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatt 20487139  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtc 384  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20487140 taaaaaattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaccgttaattttagtggtc 20487208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 29390344 - 29390468
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29390344 tattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 29390443  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgaga 234  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  29390444 tcaattatagatctaatttgcgaga 29390468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20656931 - 20656801
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattat 217  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20656931 agattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattat 20656832  T
Q  218 aggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  20656831 aggtctaatttgtgaaactttaaacaatttt 20656801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 3631324 - 3631472
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  3631324 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 3631422  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  3631423 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 3631472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 20487045 - 20487186
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||     
T  20487045 tatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatttaaaa 20487144  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20487145 aattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttt 20487186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26525322 - 26525174
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  26525322 attataggtctattttgcgagattttttgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccg-aaa 26525224  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  26525223 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 26525174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19577273 - 19577120
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||    
T  19577273 attatagatctattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 19577174  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19577173 atttaaataatttaattataggtctgttttgcgagacattaaacaatttttcaa 19577120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8074331 - 8074184
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | | || ||||    
T  8074331 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtagtgtagtggtcca-cccaaaa 8074233  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaattt 361  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  8074232 atttaaataattcaattataaatctattttgcgagattttatacaattt 8074184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41084674 - 41084549
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  41084674 attataggtctattttgcgagattttatagaattttgtgtcgattttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaa 41084575  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtcta 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  41084574 atttaaataattcaattataggtcta 41084549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19577263 - 19577124
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  19577263 tattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataa 19577164  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  19577163 tttaattataggtctgttttgcgagacattaaacaatttt 19577124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22579017 - 22578874
Alignment:
Q  223 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataa 322  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  22579017 tattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataa 22578918  T
Q  323 ttcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22578917 ttcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttttcaa 22578874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 211 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26297103 - 26296984
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  26297103 caattataggtctattttgcaagatcttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaa 26297004  T
Q  311 aaatttaaataattcaatta 330  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  26297003 atatttaaataattcaatta 26296984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 41817525 - 41817671
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  41817525 gtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaa 41817624  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||  |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41817625 taattcaattgtaggtatattttacgagtctttaaacaatttttcaa 41817671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7440573 - 7440425
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  7440573 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 7440475  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7440474 atttaaataattcaactataggtctattttgcgagattttatacaatttt 7440425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 43348699 - 43348847
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  43348699 attataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-cccaaaa 43348797  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  43348798 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgatttt 43348847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 43358475 - 43358623
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| || | ||| |||    
T  43358475 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtagtgtagtgacccacccg-aaa 43358573  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  43358574 atttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttatacaatttt 43358623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 41817539 - 41817667
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41817539 attttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattgtag 41817638  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || |||||| ||||  |||| ||||||||    
T  41817639 gtatattttacgagtctttaaacaatttt 41817667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 29390334 - 29390472
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  29390334 attataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 29390432  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagacttt 352  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29390433 atttaaataattcaattatagatctaatttgcgagacttt 29390472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37042643 - 37042496
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg-aaaaat 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| | ||| |||||     
T  37042643 atagatctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaa 37042544  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  37042543 ttaaataattcaactataggtctattttgtgagactttaaataatttt 37042496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9596258 - 9596110
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  9596258 attatatgtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttagttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggccca-cccaaaa 9596160  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  9596159 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 9596110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 30772944 - 30773092
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  30772944 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-cccaaaa 30773042  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  30773043 atttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 30773092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Original strand, 5844181 - 5844285
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5844181 tattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacccgaaaatttaaataat 5844280  T
Q  210 tcaat 214  Q
    |||||    
T  5844281 tcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 353
Target Start/End: Original strand, 16823196 - 16823335
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| || | ||| |||    
T  16823196 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccacccg-aaa 16823294  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagacttta 353  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  16823295 atttaaataattcaattatagatctattttgcgagatttta 16823335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13013224 - 13013085
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13013224 tattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcggttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataa 13013125  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||    
T  13013124 ttcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttt 13013085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 26785018 - 26785157
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  26785018 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagtttaaataa 26785117  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  26785118 ttcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttt 26785157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32304745 - 32304597
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | || ||||    
T  32304745 attataagtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtattggccca-cccaaaa 32304647  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  32304646 attgaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 32304597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 372
Target Start/End: Original strand, 28662185 - 28662341
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||   ||||| ||||||  |||    |||||||||||    
T  28662185 atagatctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatt 28662284  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagtta 372  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  28662285 taaataattcaattataggtttattttgcaagactttaaacattttttcaacagtta 28662341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13084612 - 13084473
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13084612 tattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcagttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataa 13084513  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||    
T  13084512 ttcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttt 13084473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Original strand, 10925697 - 10925812
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10925697 tattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattttggcaaattggtgtagtggtctaccagaaaaatttaaataa 10925796  T
Q  209 ttcaattataggtcta 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  10925797 ttcaattataggtcta 10925812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22579017 - 22578878
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |   |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22579017 tattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataa 22578918  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22578917 ttcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttt 22578878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 28662192 - 28662331
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgg-tccacccgaaaatttaaataa 208  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||    
T  28662192 tattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatttaaataa 28662291  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  28662292 ttcaattataggtttattttgcaagactttaaacattttt 28662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37042636 - 37042496
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg--aaaatttaaata 207  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||  ||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||||    
T  37042636 tattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaattaaata 37042537  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  37042536 attcaactataggtctattttgtgagactttaaataatttt 37042496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30050184 - 30050074
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||| ||||||  || ||| |||||| |||||||| || ||||    
T  30050184 attataggtctattttacgatattttatacaattttgtgtcaatttttggttacggttgattcaaattttcgtaaagtggtgtagtggccaa-cctaaaa 30050086  T
Q  313 atttaaataatt 324  Q
    ||||||||||||    
T  30050085 atttaaataatt 30050074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13013347 - 13013203
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||  ||||| ||| || |  || |||    
T  13013347 attataggtctaatttgcgagattttaagcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgtagtgtcccactcg-aaa 13013249  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  13013248 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaa 13013203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Original strand, 15374180 - 15374296
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||  ||||| ||||||  ||| | | || | ||    
T  15374180 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatcgaaattcttgcaaagtggtgtaatggtcca-cccacaa 15374278  T
Q  313 atttaaataattcaatta 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15374279 atttaaataattcaatta 15374296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Original strand, 5844171 - 5844285
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||  ||||| ||||  |||||||||||||   ||||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  5844171 attataggtctattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacccg-aaa 5844269  T
Q  313 atttaaataattcaat 328  Q
    ||||||||||||||||    
T  5844270 atttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 10925574 - 10925718
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| | || |||||| |||| ||||||| ||||||||  |||| |||||| |||| | | ||  |||    
T  10925574 attatatgtctaatttgcgagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttagttgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggtcca-cctgaaa 10925672  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||    
T  10925673 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaa 10925718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13084735 - 13084591
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||  ||||  ||| || | ||| |||    
T  13084735 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgcagtgtcccacccg-aaa 13084637  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  13084636 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaa 13084591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20071296 - 20071189
Alignment:
Q  223 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataa 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||| ||  ||| |||||| |||| | |||||||   ||| |||||    
T  20071296 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatttttttaataa 20071197  T
Q  323 ttcaatta 330  Q
    ||||||||    
T  20071196 ttcaatta 20071189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20071296 - 20071186
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaa-aatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||    
T  20071296 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatttttttaataa 20071197  T
Q  209 ttcaattatag 219  Q
    |||||||||||    
T  20071196 ttcaattatag 20071186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26683107 - 26683033
Alignment:
Q  173 aaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaa--ttataggtctattttgcgagattttatacaatt 246  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26683107 aaagtggtgcagtggcccacc-gaaaaattaaaaaattaaaaattataggtctattttgtgagattttaaacaatt 26683033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44254684 - 44254400
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44254684 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 44254585  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  44254584 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 44254485  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44254484 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 44254400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29126127 - 29125855
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29126127 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 29126028  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29126027 tcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccga 29125928  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29125927 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 29125855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32271003 - 32270718
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32271003 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 32270904  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtgg-ccaatccg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||    
T  32270903 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccaccccg 32270804  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32270803 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 32270718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11232238 - 11231966
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11232238 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 11232139  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  11232138 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 11232039  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11232038 aaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 11231966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 27742561 - 27742845
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  27742561 tattttgagagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcctatccgaaaatttaaataat 27742660  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  27742661 tcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcgtttttaggtttcggttgatcccaattcccgtaaattggtgtagtggcccacccga 27742760  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27742761 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccaccctaaca 27742845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28952475 - 28952199
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28952475 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttttgcaaaggggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 28952376  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  28952375 tcaattacaggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaa 28952276  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28952275 aaaatttaaataattcaattatgggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 28952199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 394
Target Start/End: Original strand, 35083877 - 35084152
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattata 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35083877 agattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggtccacccgaaaagttaaataattcaattata 35083976  T
Q  219 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  35083977 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgatgtagtggcccacccgaaaaatttaa 35084076  T
Q  319 ataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  35084077 ataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgacccaccctaaca 35084152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 52202057 - 52202329
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  52202057 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgacccacccaaaaatttaaataat 52202156  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  | |    
T  52202157 tcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccactcaa 52202256  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52202257 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 52202329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50527717 - 50527445
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50527717 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataat 50527618  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||    
T  50527617 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccga 50527518  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50527517 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 50527445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 121 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 49657284 - 49657019
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattatagg 220  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  49657284 attttatgcaattttacgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacctgaaaatttaaataattcaattataga 49657185  T
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  49657184 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaat 49657085  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  49657084 aattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatgataaattttagtggtcca 49657019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1092961 - 1092689
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1092961 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtgggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 1092862  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  1092861 tcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcga 1092762  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1092761 aaaatttaaataattcaattataggtctgatttgcgagacttaaaacaatttttcaatggttaattttagtgg 1092689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 22729295 - 22729567
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22729295 tatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataat 22729394  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  22729395 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaccaaccga 22729494  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  22729495 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtgg 22729567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16908881 - 16908618
Alignment:
Q  131 attttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 230  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908881 attttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattccagcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 16908782  T
Q  231 gagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaatta 330  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16908781 tagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaatta 16908682  T
Q  331 aaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16908681 taggtctaatttgctagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaaca 16908618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12251591 - 12251319
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12251591 tattttgtgagattttatataattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 12251492  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  |||    
T  12251491 tcaattataggtctattttgcgagaatttatacaattttatgtcgattttagatttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtaatggcccactcga 12251392  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12251391 aaaatttaaataattcaactataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 12251319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13594957 - 13594721
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13594957 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 13594858  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13594857 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccga 13594758  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcga 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13594757 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcga 13594721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 110 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21259405 - 21259133
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  21259405 tattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataa 21259306  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  21259305 ttcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccg 21259206  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtg 381  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21259205 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtg 21259133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 110 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21259518 - 21259266
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21259518 tattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataat 21259419  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  21259418 tcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccga 21259319  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  21259318 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataatttt 21259266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 36633562 - 36633839
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36633562 tattttgtgagattttatacaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagcggcccacccgaaaatttaaataat 36633661  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | | ||    
T  36633662 tcaattataggtctattttgcgagatattatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggtccaccaga 36633761  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  36633762 aaaatttaaataattc-------ggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatggttaattttagtggtccaccctaaca 36633839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52571497 - 52571234
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattatagg 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  52571497 attttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccactcaaaaatttaaataattcaattatagg 52571398  T
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    ||||||||| |||        ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | || |||||||||||     
T  52571397 tctattttgtgag--------caaatttatgtcggttttagatttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtctacccaaaaaatttaaac 52571306  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaa 392  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  52571305 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaaattttcaatagttaattttagtagtccaccctaa 52571234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 213 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7160384 - 7160216
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  7160384 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 7160285  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtg 381  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7160284 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtg 7160216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25246317 - 25246149
Alignment:
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  25246317 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaa 25246218  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25246217 tttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 25246149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 284
Target Start/End: Original strand, 49169868 - 49170042
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49169868 tattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccgaaaatttaaataat 49169967  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccg 284  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49169968 tcaattatgggtctattttgcaagactttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccg 49170042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 45045284 - 45045556
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45045284 tattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataa 45045383  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||     
T  45045384 tttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtcca-ccc 45045482  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  45045483 aaaaattcaaataattcaattatatatttattttgcgagactttaaacaattttttataagataattttagtgg 45045556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 247
Target Start/End: Original strand, 18163793 - 18163930
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18163793 tattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaatttaaataat 18163892  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  18163893 tcaattataggtctattttgtgagactttaaacaattt 18163930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 743958 - 744113
Alignment:
Q  131 attttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  743958 attttgtgtcggttttatgttttggttgatcaaaattcctg--------tgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgg 744049  T
Q  231 gagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgt 295  Q
     |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  744050 aagattttatacaattttacgtc-ggtttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgt 744113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 4618226 - 4618362
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4618226 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttattttttg-ttgatccaaactctttcaaagtg-tgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 4618323  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4618324 tcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttt 4618362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 382
Target Start/End: Original strand, 44205477 - 44205646
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaatttta-tgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| || |  ||||||||||||||  ||||| || ||| |||||  | ||||||    
T  44205477 attatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcacccgaaa 44205576  T
Q  312 aatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44205577 a-tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 44205646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 44205487 - 44205626
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaatttt-gtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44205487 tattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcacccgaaaatttaaataa 44205586  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44205587 ttcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 44205626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 382
Target Start/End: Original strand, 18163783 - 18163951
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| || | | | |||||||    
T  18163783 attataggtctattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 18163882  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18163883 -tttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttctcaatagttaattttcgtgg 18163951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 35083981 - 35084120
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35083981 tattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgatgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 35084080  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  35084081 ttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 35084120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49657182 - 49657043
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49657182 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 49657083  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  49657082 ttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 49657043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 34660821 - 34660950
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34660821 tattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat-a 34660919  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagatttta 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34660920 ttcaattataggtctattttgcgagacttta 34660950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11232248 - 11232100
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  11232248 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 11232150  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  11232149 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 11232100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29126137 - 29125989
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  29126137 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccg-aaa 29126039  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  29126038 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgatttt 29125989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7160374 - 7160235
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7160374 tattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 7160275  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7160274 ttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 7160235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31174639 - 31174500
Alignment:
Q  227 ttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattca 326  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  31174639 ttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattca 31174540  T
Q  327 attaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31174539 attgtaggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 31174500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12251601 - 12251453
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  12251601 attataggtctattttgtgagattttatataattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 12251503  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12251502 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagaatttatacaatttt 12251453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 27742552 - 27742699
Alignment:
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  27742552 ttataggtctattttgagagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcctatccg-aaaa 27742650  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  27742651 tttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaatttt 27742699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31174632 - 31174504
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31174632 attttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattgtag 31174533  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31174532 gtctattttgcgagtctttaaacaatttt 31174504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50527726 - 50527579
Alignment:
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||| ||||    
T  50527726 ttatagttctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccg-aaaa 50527628  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  50527627 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 50527579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16908789 - 16908650
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16908789 tattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 16908690  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  16908689 ttcaattataggtctaatttgctagactttaaacaatttt 16908650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32271006 - 32270865
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  32271006 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaa 32270908  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  32270907 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 32270865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44254686 - 44254546
Alignment:
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  44254686 tctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaat 44254588  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44254587 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44254546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 52202047 - 52202195
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || | || ||||    
T  52202047 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgaccca-cccaaaa 52202145  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  52202146 atttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaatttt 52202195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 2618953 - 2619102
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat- 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||      
T  2618953 ataggtctattttgcgagattttatacaattgt--gttggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaa 2619050  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2619051 ttaaataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttttcaa 2619102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Original strand, 22729287 - 22729433
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||  |||||    
T  22729287 tataggtctatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggccca-ccccaaaat 22729385  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  22729386 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 22729433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 2618960 - 2619098
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg--aaaatttaaata 207  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||    
T  2618960 tattttgcgagattttatacaatt--gtgttggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaattaaata 2619057  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  2619058 attcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttt 2619098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13594967 - 13594819
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  | |||| ||||||||  |||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  13594967 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 13594869  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  13594868 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 13594819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28952485 - 28952337
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||   |||||  ||||| |||||| | ||| |||    
T  28952485 attatgggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttttgcaaaggggtgtagtggcccacccg-aaa 28952387  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  28952386 atttaaataattcaattacaggtctattttgcgagattttatacaatttt 28952337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 36633552 - 36633700
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||| | ||| |||    
T  36633552 attataggtctattttgtgagattttatacaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagcggcccacccg-aaa 36633650  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  36633651 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagatattatacaatttt 36633700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 45045274 - 45045423
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||  | | |||||||    
T  45045274 attatagatttattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacccgaaaa 45045373  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  45045374 atttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 45045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 49169858 - 49170006
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |||| | ||||| ||||||  ||||| | ||| |||    
T  49169858 attataggtctattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccg-aaa 49169956  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  49169957 atttaaataattcaattatgggtctattttgcaagactttatacaatttt 49170006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 356
Target Start/End: Original strand, 34660814 - 34660953
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||   ||||| |||||| |||| | | ||||||||||    
T  34660814 ataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatt 34660913  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaac 356  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34660914 taaat-attcaattataggtctattttgcgagactttaaac 34660953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1092969 - 1092823
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| | ||| |||||    
T  1092969 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtgggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaat 1092871  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  1092870 ttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 1092823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25246308 - 25246169
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||   ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25246308 tattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaatttaaataa 25246209  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  25246208 ttcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttt 25246169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 35083858 - 35084006
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  35083858 attataggtcaattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 35083956  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  35083957 agttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 35084006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 4618216 - 4618389
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||| ||   |||| || ||| |||| | | |||||||    
T  4618216 attatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatttttt-gttgatccaaactctttcaaagtg-tgtagtggtccacccgaaaa 4618313  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcc 389  Q
     ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4618314 -tttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttttcaataattaattttagtggtccatcc 4618389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 49657303 - 49657157
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||  |||||    
T  49657303 tataggtctattttttgaaattttatgcaattttacgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtcca-cctgaaaat 49657205  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  49657204 ttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 49657157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21259528 - 21259380
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| |||||| |||  | | ||| |||    
T  21259528 attataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccg-aaa 21259430  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  21259429 atttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataatttt 21259380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499197
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc 194  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagtggtccaccc 52499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Original strand, 49170160 - 49170255
Alignment:
Q  298 tggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  49170160 tggcccatccgaaaaatttaaataactaaattataggtttaatttgcgaaactttaaacaatttttcaatgattaatttttgtggtccaccctaac 49170255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52571518 - 52571389
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | |  ||||    
T  52571518 attataggtctaatttgcgatattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggccca-ctcaaaa 52571420  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttg 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  52571419 atttaaataattcaattataggtctattttg 52571389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 18657975 - 18658035
Alignment:
Q  306 ccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  18657975 ccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaa 18658035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 576539 - 576405
Alignment:
Q  231 gagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaatta 330  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||||| |||| ||||||| || | | |||||| |||||| |||||| |    |||||||||||| |||||||||    
T  576539 gagattttatacaattttgtatcgattttagatttcggttgatctaagtacacgcaaagtggtgtagtggcctactaaaaaaatttaaattattcaatta 576440  T
Q  331 aaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
     |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  576439 taggtat-attttcgagtctttaaacaatttttcaa 576405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 18657979 - 18658016
Alignment:
Q  196 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18657979 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 18658016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499204
Alignment:
Q  223 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||| | ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagtgg 52499204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 744042 - 744125
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc 194  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  || ||||| | |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  744042 tattttggaagattttatacaattttacgtcggttt-aggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtcgtccaccc 744125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25894732 - 25894698
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaatttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25894732 tataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 25894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25911699 - 25911665
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaatttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25911699 tataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 25911665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7160451 - 7160422
Alignment:
Q  71 gcagtggcggagcctttcatgggctggggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7160451 gcagtggcggagcctttcatgggctggggt 7160422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28952556 - 28952523
Alignment:
Q  67 aagagcagtggcggagcctttcatgggctggggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28952556 aagagcagtggcggagcccttcatgggctggggt 28952523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 362
Target Start/End: Original strand, 744015 - 744067
Alignment:
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||| ||||||||    
T  744015 aaaatttaaataattcaattataggtctattttggaagattttatacaatttt 744067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 284
Target Start/End: Original strand, 18657913 - 18657977
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccg 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||   || |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18657913 gtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcccg 18657977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23469479 - 23469195
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469479 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacccgaaaatttaaataat 23469380  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  23469379 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccatctga 23469280  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23469279 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctaaca 23469195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31065706 - 31065434
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31065706 tattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 31065607  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||    
T  31065606 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccga 31065507  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31065506 aaaatttaaataaatcaattacaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 31065434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36675570 - 36675286
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36675570 tattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 36675471  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||    
T  36675470 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccacccga 36675371  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36675370 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccatcctaaca 36675286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44468104 - 44467832
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44468104 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 44468005  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | ||    
T  44468004 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcaattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctga 44467905  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44467904 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 44467832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 45350126 - 45350410
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  45350126 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaaaatttaaataat 45350225  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||    
T  45350226 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtgtcccacccga 45350325  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45350326 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 45350410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 46027755 - 46028039
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46027755 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 46027854  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  46027855 taaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttagatttaggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 46027954  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  46027955 aaaatttaaataattcaattataggtataatttgcgagactttaaacgatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 46028039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 17166941 - 17167226
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  17166941 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataa 17167040  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | | |||    
T  17167041 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattgatgtagtggtccacccg 17167140  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17167141 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctaaca 17167226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 113 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22723856 - 22723575
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22723856 tttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattca 22723757  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||    
T  22723756 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaatttcccgcaaattggtgtagtggcccacccgcaaa 22723657  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22723656 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagtccaccctaaca 22723575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 26873778 - 26874050
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26873778 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 26873877  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  26873878 tcaattataggtctaatttgcgaggttttatacaattttatgtcagttttagatttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 26873977  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26873978 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtgg 26874050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36358393 - 36358121
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36358393 tattttgcgacattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccaaaaatttaaataat 36358294  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  36358293 tcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 36358194  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36358193 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 36358121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 108 - 382
Target Start/End: Original strand, 44142835 - 44143108
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaata 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  44142835 tatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttctttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgg-ccacctggaaatttaaata 44142933  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatcc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  44142934 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaccc 44143033  T
Q  308 gaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44143034 gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 44143108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 110 - 376
Target Start/End: Original strand, 31428812 - 31429078
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31428812 tattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 31428911  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| | | ||||    
T  31428912 ttaattatagatctattttgcgagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcagttgatctcaattcccgtaaattggtgtagtggtccacccga 31429011  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31429012 aaaatgtaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 31429078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 110 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44724146 - 44723876
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44724146 tattttgagagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagaggcccacccgaaaatttaaataat 44724047  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  44724046 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccatccga 44723947  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagt 380  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44723946 agaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagt 44723876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 113 - 382
Target Start/End: Original strand, 43859169 - 43859438
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43859169 tttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattca 43859268  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| | | |||||||    
T  43859269 attataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 43859368  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43859369 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 43859438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 9624071 - 9624355
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  9624071 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacccaaaaatttaaataat 9624170  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  9624171 ttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 9624270  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9624271 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccctaaca 9624355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 40055666 - 40055938
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40055666 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttgtatgttttggttgatccaaattcttgataagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 40055765  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || |    
T  40055766 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaa 40055865  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  40055866 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtgg 40055938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 119 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42242003 - 42241740
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattata 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42242003 agattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgactcacccgaaaatttaaataattcaattata 42241904  T
Q  219 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaa 318  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | | | |||||||||||||    
T  42241903 gatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccggaaattggtgtagtcgtccacccgaaaaatttaa 42241804  T
Q  319 ataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42241803 ataattcaattatagatctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 42241740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 394
Target Start/End: Original strand, 41367737 - 41368018
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41367737 tttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattca 41367836  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||  | | |||||||    
T  41367837 gttataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggttttagttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtgatccacccgaaaa 41367936  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  41367937 atttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccctaaca 41368018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 382
Target Start/End: Original strand, 39976399 - 39976668
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39976399 tttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattca 39976498  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||| | | |||||||    
T  39976499 attatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttagatttcaattgatccaaatttctgtaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 39976598  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39976599 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 39976668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16834360 - 16834086
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16834360 tattttgtaaaattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 16834261  T
Q  210 tcaattataggtctatttt--gcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatcc 307  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || ||| || | ||    
T  16834260 tcaattataggtctatattatgagagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattctcacaaattggggtagtgtcccaccc 16834161  T
Q  308 gaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16834160 aaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 16834086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29075268 - 29075002
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29075268 tattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 29075169  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||          ||||||||| |||| | | ||||    
T  29075168 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatcca----------aattggtgtagtggtccacccga 29075079  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29075078 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaattttttaatagttaattttagtggtcca 29075002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Original strand, 8461764 - 8461945
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  8461764 attataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 8461863  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8461864 atttaaataattcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 8461945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31932004 - 31931823
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||    
T  31932004 attataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaa 31931905  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31931904 atttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 31931823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18104411 - 18104240
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18104411 attataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaa 18104313  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18104312 atttaaataattcaattaaagatctaatttactaaactttaaacaatttttcaataattaattttagtggtcc 18104240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 216 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 46828926 - 46828761
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |  || ||||||    
T  46828926 ataggtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcg-aaaatt 46828828  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||| || |||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46828827 taaataactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtgg 46828761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Original strand, 25174216 - 25174365
Alignment:
Q  217 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaattt 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| |||| | | |||||||||||    
T  25174216 taggtcaattttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaattt 25174315  T
Q  317 aaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25174316 aaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 25174365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 26873768 - 26873916
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  26873768 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 26873866  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  26873867 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgaggttttatacaatttt 26873916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 248
Target Start/End: Original strand, 25174223 - 25174361
Alignment:
Q  111 attttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataat 209  Q
    ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25174223 attttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataat 25174322  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25174323 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 25174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23562740 - 23562561
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   || || ||| | |||||||||||| ||||||| |||||| || | | | |||||||    
T  23562740 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcgaattaagttttga-ttgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 23562642  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  23562641 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccctaac 23562561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 17166929 - 17167080
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||    
T  17166929 caattatagttctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaa 17167028  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  17167029 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 17167080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 43859279 - 43859418
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43859279 tattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 43859378  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  43859379 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 43859418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29502222 - 29502072
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  29502222 ataggtatattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 29502123  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  29502122 taaataattgaattataggtctattttgtgagactttaaactatttttcaa 29502072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 244 - 386
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663152
Alignment:
Q  244 attttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttg 343  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||| | |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  344 cgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtcca 29663152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22723869 - 22723721
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  22723869 attataggtctactttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 22723771  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  22723770 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 22723721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16649679 - 16649541
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16649679 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaatttaaataat 16649580  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  16649579 tcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 16649541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17624040 - 17623902
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17624040 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaatttaaataat 17623941  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  17623940 tcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 17623902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29502217 - 29502076
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29502217 tatattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaat 29502118  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  29502117 aattgaattataggtctattttgtgagactttaaactatttt 29502076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44468114 - 44467966
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  44468114 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 44468016  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44468015 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44467966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 45350116 - 45350264
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||| ||||| |||    
T  45350116 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtaatggcccatccg-aaa 45350214  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  45350215 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 45350264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 46027745 - 46027893
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  46027745 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 46027843  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  46027844 atttaaataattaaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 46027893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23562730 - 23562592
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |  || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  23562730 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcgaattaa-gttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaa 23562632  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  23562631 ttcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttt 23562592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29075276 - 29075130
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |||||    
T  29075276 tataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaat 29075178  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  29075177 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 29075130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31931994 - 31931855
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc-gaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31931994 tattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataa 31931895  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  31931894 ttcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttt 31931855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Original strand, 28754878 - 28755023
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||| |||||| | || ||||| |||||    
T  28754878 gtctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatt-ttgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaa 28754976  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  28754977 taattcaattataagtctattttccaagtctttaaacaatttttcaa 28755023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46828919 - 46828781
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  46828919 tattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcgaaaatttaaataac 46828820  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  46828819 tcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttt 46828781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31065716 - 31065568
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  31065716 attataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 31065618  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31065617 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 31065568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36675580 - 36675432
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| | ||| |||    
T  36675580 attatagatctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccg-aaa 36675482  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36675481 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 36675432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44724156 - 44724008
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| | ||| |||    
T  44724156 attataggtttattttgagagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagaggcccacccg-aaa 44724058  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44724057 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44724008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 41367847 - 41367986
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41367847 tattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggttttagttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataa 41367946  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  41367947 ttcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttt 41367986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 43859156 - 43859304
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||| |||    
T  43859156 attataggtcgaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccg-aaa 43859254  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  43859255 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 43859304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 30781089 - 30781224
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattc 211  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30781089 tttgcaaaattttatacaattttgtgtaggttttg-gtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatttaaataattc 30781187  T
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  30781188 aattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 30781224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 8461774 - 8461913
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8461774 tattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 8461873  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||||    
T  8461874 ttcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttt 8461913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 9013879 - 9014033
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||   ||||||| |||| || |||| || |||  ||||| |||||||    
T  9013879 caatcataggtctatttcttaagattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatttcc-caaaatgttgtaatggcccatccgaa 9013977  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013978 aaatttatataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 9014033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22723746 - 22723607
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22723746 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaatttcccgcaaattggtgtagtggcccacccgcaaaatttaaataa 22723647  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  22723646 ttcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttt 22723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23469483 - 23469341
Alignment:
Q  219 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||| |||||| || | | | ||| |||||||||    
T  23469483 ggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacccg-aaaatttaa 23469385  T
Q  319 ataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  23469384 ataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 23469341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 44142827 - 44142974
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||   ||    
T  44142827 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttctttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcca--cctggaa 44142924  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44142925 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44142974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 9624061 - 9624209
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  |||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | || ||||    
T  9624061 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggccca-cccaaaa 9624159  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  9624160 atttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaatttt 9624209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16649685 - 16649537
Alignment:
Q  217 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaattt 316  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||   | || |||| |||    
T  16649685 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaa-ttt 16649587  T
Q  317 aaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16649586 aaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaa 16649537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17624046 - 17623898
Alignment:
Q  217 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaattt 316  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||   | || |||| |||    
T  17624046 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaa-ttt 17623948  T
Q  317 aaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17623947 aaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaa 17623898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36358403 - 36358255
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | | || ||||    
T  36358403 attatagatctattttgcgacattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtcca-cccaaaa 36358305  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36358304 atttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 36358255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22499868 - 22499722
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||      
T  22499868 ataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggccca-cctaaaaa-- 22499772  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
     ||| |||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22499771 -aaaaaattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttttcaa 22499722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 279 - 362
Target Start/End: Original strand, 6961163 - 6961246
Alignment:
Q  279 ttcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6961163 ttcccgcaaaatggtgcggtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18104401 - 18104295
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18104401 tattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataa 18104303  T
Q  209 ttcaatta 216  Q
    ||||||||    
T  18104302 ttcaatta 18104295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42241899 - 42241760
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42241899 tattttacgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccggaaattggtgtagtcgtccacccgaaaaatttaaataa 42241800  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  42241799 ttcaattatagatctaatttgagagactttaaacaatttt 42241760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 366
Target Start/End: Original strand, 9021516 - 9021642
Alignment:
Q  240 tacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaa 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  9021516 tacaattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctat 9021615  T
Q  340 tttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9021616 tttgcgagactttaaacaatttttcaa 9021642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 248
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663128
Alignment:
Q  131 attttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 229  Q
    ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  230 cgagattttatacaatttt 248  Q
    | ||| |||| ||||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttt 29663128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16834370 - 16834246
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  16834370 attataggtttattttgtaaaattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccatccg-aaa 16834272  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtcta 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  16834271 atttaaataattcaattataggtcta 16834246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 31428802 - 31428950
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  31428802 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 31428900  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  31428901 atttaaataatttaattatagatctattttgcgagattttataaaatttt 31428950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 30781079 - 30781228
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||   ||| | | || |||||||    
T  30781079 atagatctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggtttt-ggtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatt 30781177  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30781178 taaataattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 30781228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4248954 - 4248865
Alignment:
Q  157 tgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaat 245  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  4248954 tgatctaaatttttgcaaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacaat 4248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 372
Target Start/End: Original strand, 9014476 - 9014623
Alignment:
Q  232 agattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaa 331  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   | |||||||||  |||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||     
T  9014476 agattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaattat 9014575  T
Q  332 aggtcta-------atttgcgagactttaaacaatttttcaaaagtta 372  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9014576 aggtctattttgatttttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 9014623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42242022 - 42241874
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |  | ||| |||    
T  42242022 attataggtttaatttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgactcacccg-aaa 42241924  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  42241923 atttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaatttt 42241874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 9014475 - 9014587
Alignment:
Q  118 aagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaatta 216  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  9014475 aagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaatta 9014574  T
Q  217 taggtctattttg 229  Q
    |||||||||||||    
T  9014575 taggtctattttg 9014587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 39976386 - 39976530
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| ||| || | ||| |||    
T  39976386 attatatgtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacccg-aaa 39976484  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||    
T  39976485 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaa 39976530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4248969 - 4248865
Alignment:
Q  255 gttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaa 354  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||   ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  4248969 gttttagttttcagctgatctaaatttttgcaaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaa 4248870  T
Q  355 acaat 359  Q
    |||||    
T  4248869 acaat 4248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 8727797 - 8727936
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtcca-cccgaaaatttaaataa 208  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  | ||||||||| |||||| |||  |  |||||||||| ||    
T  8727797 tattttacaagattttatgtcattttgtgttgattttatgtttcggctgatccaaattcttacaaagtggtatagtggcccatgcaaaaaatttaaacaa 8727896  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  8727897 ttcgattgtaggtctattttacgaaactttaaacaatttt 8727936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 41367724 - 41367868
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||  |||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||| | ||||| |||    
T  41367724 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggtccatccg-aaa 41367822  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  41367823 atttaaataattcagttataggtctattttgtgagattttatacaa 41367868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22566667 - 22566599
Alignment:
Q  219 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  22566667 ggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaattgccgcaa 22566599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 28754884 - 28754999
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaat-ttaaataattc 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  28754884 tttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaattt-tgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaataattc 28754982  T
Q  212 aattataggtctatttt 228  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28754983 aattataagtctatttt 28754999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 248
Target Start/End: Original strand, 9013899 - 9014029
Alignment:
Q  118 aagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaatta 216  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||| || |||| ||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  9013899 aagattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatttcc-caaaatgttgtaatggcccatccgaaaaatttatataatttaatta 9013997  T
Q  217 taggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  9013998 taggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 9014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 248
Target Start/End: Original strand, 6961194 - 6961246
Alignment:
Q  196 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6961194 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Original strand, 9021518 - 9021638
Alignment:
Q  129 caattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattt 227  Q
    |||||||||||   ||||| |||| || ||||| ||||||| ||||| | |||| |||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  9021518 caattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctattt 9021617  T
Q  228 tgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  9021618 tgcgagactttaaacaatttt 9021638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22499861 - 22499726
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||   ||| |||    
T  22499861 tattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacctaaaaa---aaaaaat 22499765  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22499764 tcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttt 22499726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 366
Target Start/End: Original strand, 40883349 - 40883499
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg--aaaa 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |  |||||||||  || |||| ||| || |||| | | |||  ||||    
T  40883349 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 40883448  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    | ||||| ||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40883449 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 40883499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4249083 - 4248977
Alignment:
Q  223 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataa 322  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||  | ||| |||||| | ||   |||||||||||||||||||    
T  4249083 tattttgcaagattttatataattttatgccggttttaggtttcagcaaatccaaattcttggaaagtggtgtagaggttcatccgaaaaatttaaataa 4248984  T
Q  323 ttcaatt 329  Q
     ||||||    
T  4248983 gtcaatt 4248977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14629688 - 14629639
Alignment:
Q  150 ttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa 199  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14629688 ttttggtagatccaaatccctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa 14629639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 40883357 - 40883495
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg---aaaatttaaat 206  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||  ||| ||  ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||   |||| |||||     
T  40883357 tattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaaaattaaaa 40883456  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||   || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40883457 aa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 40883495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 366
Target Start/End: Original strand, 8727830 - 8727940
Alignment:
Q  256 ttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaa 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||   |||| |||| | |||||| || | ||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  8727830 ttttatgtttcggctgatccaaattcttacaaagtggtatagtggcccatgcaaaaaatttaaacaattcgattgtaggtctattttacgaaactttaaa 8727929  T
Q  356 caatttttcaa 366  Q
    |||||||||||    
T  8727930 caatttttcaa 8727940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 6961112 - 6961165
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttc 266  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6961112 attatatgtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttc 6961165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22566663 - 22566606
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatt 167  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  22566663 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaatt 22566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24779661 - 24779600
Alignment:
Q  173 aaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgag 233  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  24779661 aaagtggtctaatggtccacccgaaaaatttaaataattaaattatagatccattttgcgag 24779600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24779641 - 24779581
Alignment:
Q  306 ccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24779641 ccgaaaaatttaaataattaaattatagatccattttgcgagtctttaaacattttttcaa 24779581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 152
Target Start/End: Original strand, 6961122 - 6961164
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttt 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  6961122 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggttt 6961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22658430 - 22658146
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22658430 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 22658331  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||    
T  22658330 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccacaaattggtgtagtggcccacccga 22658231  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  22658230 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttaatggcccaccctaaca 22658146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 4231295 - 4231579
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4231295 tattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 4231394  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  4231395 tcaattataggtctattttacgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgccccatccga 4231494  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4231495 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggtccaccctaaca 4231579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 390
Target Start/End: Original strand, 21434915 - 21435195
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21434915 tattttgcgaggttttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataat 21435014  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  21435015 tcaattataggtctattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaa 21435114  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcct 390  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21435115 aaagtttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccatcct 21435195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7242718 - 7242447
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7242718 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtatagtggcccacccgaaa-tttaaataat 7242620  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  7242619 tcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 7242520  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7242519 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 7242447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 41388081 - 41388357
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41388081 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataat 41388180  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  41388181 tcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccacccga 41388280  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41388281 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggtcca 41388357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41838038 - 41837762
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41838038 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 41837939  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  41837938 tcaattataggtttattttgggagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccga 41837839  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41837838 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 41837762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 117 - 394
Target Start/End: Original strand, 4697889 - 4698166
Alignment:
Q  117 caagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaatta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4697889 caagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaatta 4697988  T
Q  217 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaattt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  4697989 tagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaattt 4698088  T
Q  317 aaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4698089 aaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 4698166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 7012413 - 7012688
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7012413 tattttgcgatatcttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaccctaaaatttaaataat 7012512  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||    
T  7012513 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggagtagtggtccacccga 7012612  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7012613 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag-taattttagtggtcca 7012688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 10092330 - 10092602
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10092330 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttttgttttagttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 10092429  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  10092430 tcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggtagatccaaattcccgcaaattggtatagtggcccatccga 10092529  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10092530 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 10092602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 28564960 - 28565232
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28564960 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatgat 28565059  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  28565060 tcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 28565159  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28565160 aaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 28565232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 28572583 - 28572855
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28572583 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatgat 28572682  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  28572683 tcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 28572782  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28572783 aaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 28572855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 108 - 392
Target Start/End: Original strand, 36060431 - 36060715
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaata 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36060431 tatattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaattttatgttttggttgatccaaattcctggaaagtggtgtagtggcacacccgaaaatttaaata 36060530  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatcc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||    
T  36060531 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccaccc 36060630  T
Q  308 gaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  36060631 gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccctaa 36060715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42556177 - 42555909
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42556177 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccacccgaaaatttaaataat 42556078  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||    
T  42556077 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaatttggtgtagtggcccacccga 42555978  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42555977 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttatttta 42555909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 43117424 - 43117701
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  43117424 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataa 43117523  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||    
T  43117524 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtttagtggcccacccg 43117623  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43117624 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtggtcca 43117701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 1183898 - 1184170
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1183898 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctaaaaagtagtgtagtggaccacccaaaaatttaaataat 1183997  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1183998 tcaattataggtctaatttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccga 1184097  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1184098 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 1184170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3659906 - 3659622
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3659906 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaggtttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccggaaatttaaataat 3659807  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | ||||    
T  3659806 tcaattataggtctgttttgcgagattttatacaattttatatcggttttaggtttcggttgatcaaaatttccgcaaattggtgtagtggctcacccga 3659707  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3659706 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaaca 3659622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5590257 - 5589985
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5590257 tatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataat 5590158  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  5590157 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 5590058  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5590057 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtgg 5589985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 6316952 - 6317224
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6316952 tattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 6317051  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  6317052 tcaattatagttttattttgcgagaatttatacaattttatgtcgattttaggtttcggatgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 6317151  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6317152 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttacttttagtgg 6317224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24797137 - 24796865
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24797137 tattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataat 24797038  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||    
T  24797037 tcaattatagatataatttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattaccgcaaattggtgtagtggtccacccga 24796938  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24796937 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 24796865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 2317137 - 2317409
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2317137 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtaatggcccacccgaaaatttaaataat 2317236  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||    
T  2317237 tcaattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggttcacccga 2317336  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2317337 aaaatttaaataattcagttatagatctagtttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 2317409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3886864 - 3886592
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  3886864 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaaccaaaaatttaaataat 3886765  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  || || | ||||    
T  3886764 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatcccaattcccgcaaattggtgtactgacccacccga 3886665  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3886664 aaaatttaaataatttaattataggtctaatttgtgagactttaaacaattttttaaaagttaattttagtgg 3886592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 121 - 382
Target Start/End: Original strand, 1098144 - 1098405
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattatagg 220  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098144 attttatgcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaattcctataaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagg 1098243  T
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  1098244 tctattttgtgagattttatacaaatttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaat 1098343  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1098344 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 1098405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Original strand, 38567203 - 38567459
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaata 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38567203 tatattttgcgagattttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacccgaaaatttaaata 38567302  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatcc 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||         
T  38567303 attcgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcc----- 38567397  T
Q  308 gaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
                     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38567398 -----------------caattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 38567459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Original strand, 7413107 - 7413390
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  7413107 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataa 7413206  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| || | | | |||    
T  7413207 ttcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattccctcaaagtggtgtagtagtccacccg 7413305  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  7413306 aaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaattttaatggcccaccctaac 7413390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Original strand, 197268 - 197449
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  197268 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 197367  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  197368 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccatcctaaca 197449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Original strand, 312105 - 312286
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  312105 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 312204  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  312205 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccatcctaaca 312286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 389
Target Start/End: Original strand, 41169793 - 41170046
Alignment:
Q  130 aattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctatttt 228  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41169793 aattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgtagtgacccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 41169892  T
Q  229 gcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaat 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||||||||||       
T  41169893 gcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcg-aaaatttaaataattc--- 41169988  T
Q  329 taaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcc 389  Q
       ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  41169989 ---aggtctattttgtaaaactttaaacaatttttcaacggataattttaatggtccatcc 41170046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7422132 - 7421883
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  7422132 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgaaaagtgatgtagtgacccacccgaaaaatttaaata- 7422034  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||      |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||  | | ||     
T  7422033 ttcaattataggtctattttgcgagattttataaaattttatatcagt------tttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtgatcca-ccc 7421941  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7421940 aaaaatttaaacaattcaattatatgtctattttgcaagactttaaacaatttttcaa 7421883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 43117412 - 43117563
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  43117412 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaa 43117511  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  43117512 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 43117563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 386
Target Start/End: Original strand, 9830673 - 9830845
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  9830673 attataggtttattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaa 9830772  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9830773 -tttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaacagttaattttagtggtcca 9830845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 36108837 - 36108987
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  36108837 ataggtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 36108936  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36108937 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaaattttcaa 36108987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 9830683 - 9830821
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9830683 tattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaatttaaataat 9830782  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  9830783 tcaatcataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttt 9830821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 11635828 - 11635978
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||| | ||| || | ||||||||||    
T  11635828 ataggtctattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatt 11635927  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11635928 taaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaa 11635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Original strand, 7413097 - 7413222
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  7413097 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaa 7413196  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtcta 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  7413197 atttaaataattcaattataggtcta 7413222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 215 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25383129 - 25382979
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||    
T  25383129 tataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaat 25383031  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25383030 ttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttttcaa 25382979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3886874 - 3886726
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  3886874 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaacc-aaaa 3886776  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  3886775 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 3886726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42556187 - 42556039
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| | ||| |||    
T  42556187 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccacccg-aaa 42556089  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  42556088 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 42556039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22658439 - 22658292
Alignment:
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||||    
T  22658439 ttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaa 22658341  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  22658340 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 22658292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7422142 - 7421994
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| || | |||||||    
T  7422142 attataggtttattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgaaaagtgatgtagtgacccacccgaaaa 7422043  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  7422042 atttaaat-attcaattataggtctattttgcgagattttataaaatttt 7421994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 10092320 - 10092468
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  10092320 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttttgttttagttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacccg-aaa 10092418  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  10092419 atttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 10092468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24797026 - 24796885
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaat 206  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24797026 tataatttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattaccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 24796927  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  24796926 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 24796885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 28564950 - 28565098
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  28564950 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 28565048  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  28565049 atttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 28565098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 28572573 - 28572721
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  28572573 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 28572671  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  28572672 atttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 28572721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 1098246 - 1098385
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1098246 tattttgtgagattttatacaaatttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataa 1098345  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  1098346 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 1098385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25642823 - 25642676
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||  |||| | | ||||||||||    
T  25642823 ataggtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatt 25642724  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaattttt 363  Q
    ||||||||| | ||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25642723 taaataatttagttataggcctattttacgagactttgaacaattttt 25642676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 244
Target Start/End: Original strand, 36108844 - 36108979
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  36108844 tattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataa 36108943  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36108944 ttcaattataggtctattttgcgagactttaaacaa 36108979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 2317127 - 2317275
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| | ||| |||    
T  2317127 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtaatggcccacccg-aaa 2317225  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  2317226 atttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaatttt 2317275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3659916 - 3659768
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||  ||    
T  3659916 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaggtttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-gaa 3659818  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  3659817 atttaaataattcaattataggtctgttttgcgagattttatacaatttt 3659768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 4231285 - 4231433
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  4231285 attataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 4231383  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  4231384 atttaaataattcaattataggtctattttacgagattttatacaatttt 4231433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 17836503 - 17836628
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  17836503 tattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaatttaaataa 17836602  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgaga 234  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  17836603 tttaattataggtctattttacgaga 17836628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24797147 - 24796999
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  24797147 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-cccaaaa 24797049  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  24797048 atttaaataattcaattatagatataatttgcgagattttatacaatttt 24796999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 36060423 - 36060571
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||  | ||| |||    
T  36060423 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaattttatgttttggttgatccaaattcctggaaagtggtgtagtggcacacccg-aaa 36060521  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36060522 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 36060571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 306 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34934372 - 34934292
Alignment:
Q  306 ccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34934372 ccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 34934292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 197278 - 197417
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtcca-cccgaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||    
T  197278 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaaatttaaataa 197377  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  197378 ttcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 197417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 312115 - 312254
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtcca-cccgaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||    
T  312115 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaaatttaaataa 312214  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  312215 ttcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 312254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5590265 - 5590119
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||  |||||    
T  5590265 tataggtctatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggccca-ccccaaaat 5590167  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  5590166 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 5590119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 11635835 - 11635974
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  11635835 tattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatttaaataa 11635934  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  11635935 ttcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttt 11635974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25642816 - 25642677
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25642816 tattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatttaaataa 25642717  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || | ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  25642716 tttagttataggcctattttacgagactttgaacaatttt 25642677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 362
Target Start/End: Original strand, 4697871 - 4698020
Alignment:
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaa 311  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  4697871 aattataggtttactttacaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccg-aa 4697969  T
Q  312 aatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  4697970 aatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 4698020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 364
Target Start/End: Original strand, 17836498 - 17836644
Alignment:
Q  218 aggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaattta 317  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| || | ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17836498 aggtgtattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaattta 17836597  T
Q  318 aataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttc 364  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  17836598 aataatttaattataggtctattttacgagacaataaacaatttttc 17836644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41838048 - 41837900
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  41838048 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 41837950  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||| |||| |||| ||||||||    
T  41837949 atttaaataattcaattataggtttattttgggagattttatacaatttt 41837900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 41169764 - 41169912
Alignment:
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||| ||| || |||| |||||    
T  41169764 ttatacgtctattttacgatattttaaataattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgtagtgacccatccaaaaaa 41169863  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  41169864 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataatttt 41169912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 4697995 - 4698134
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  4697995 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataa 4698094  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  4698095 ttcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttt 4698134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 6316940 - 6317090
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |    
T  6316940 caattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-a 6317038  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||||| || | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  6317039 aaatttaaataattcaattatagttttattttgcgagaatttatacaatttt 6317090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7242728 - 7242581
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| | |||  ||    
T  7242728 attataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtatagtggcccacccg--aa 7242631  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7242630 atttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaatttt 7242581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 8995039 - 8995189
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||| ||||||    |||||||||||| | |||| || ||| |||||| | || |||||||    
T  8995039 ataggtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatt 8995138  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  8995139 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttgagcaatttttcaa 8995189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 7012403 - 7012551
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||  |||    
T  7012403 attataggtctattttgcgatatcttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtcca-ccctaaa 7012501  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7012502 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 7012551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 21434905 - 21435053
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |  || |||    
T  21434905 attataggtttattttgcgaggttttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccactcg-aaa 21435003  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  21435004 atttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatacaatttt 21435053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 38567195 - 38567343
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| | ||| |||    
T  38567195 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacccg-aaa 38567293  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  38567294 atttaaataattcgattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 38567343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 8996424 - 8996561
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||  |  ||| ||||||||  | | | ||||||| |||||||||    
T  8996424 tattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat--aaaatggtgtaggaggctatccgaaaaatttaaataa 8996521  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8996522 ttcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 8996561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 365
Target Start/End: Original strand, 8996417 - 8996564
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||| |||    ||| |||||| |  | | ||||||||||||    
T  8996417 ataggtttattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat--aaaatggtgtaggaggctatccgaaaaatt 8996514  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttca 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8996515 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttttca 8996564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 1098123 - 1098267
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||||   ||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  1098123 attataggtctaatttgcgatattttatgcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaattcctataaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 1098221  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  1098222 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaa 1098267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 1183888 - 1184036
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||| ||||||||   ||| | |||| |||| | | || ||||    
T  1183888 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctaaaaagtagtgtagtggacca-cccaaaa 1183986  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1183987 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttatacaatttt 1184036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 41388071 - 41388219
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||  | | ||| |||    
T  41388071 attataggtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccg-aaa 41388169  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  41388170 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 41388219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 212
Target Start/End: Original strand, 41169887 - 41169989
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41169887 tattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataat 41169986  T
Q  210 tca 212  Q
    |||    
T  41169987 tca 41169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 365
Target Start/End: Original strand, 43073117 - 43073250
Alignment:
Q  231 gagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaatta 330  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||| |||||| || ||| | ||||||| |||||||| || |||||    
T  43073117 gagattttaaacaattttatttcagttttaagtttcaggcgatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccgaaaa-tttaaatatttaaatta 43073215  T
Q  331 aaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttca 365  Q
     ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  43073216 taggtctattttgcaaaactttaaacaatttttca 43073250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 248
Target Start/End: Original strand, 43073157 - 43073247
Alignment:
Q  158 gatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  43073157 gatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccgaaaatttaaatatttaaattataggtctattttgcaaaactttaaacaatttt 43073247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 8995046 - 8995171
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||||| | ||||| | ||||||  |||||||||||    ||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  8995046 tattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatttaaataa 8995145  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8995146 ttcaattataggtctattttgcgaga 8995171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32018069 - 32017916
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||| |||||||| || |||| ||| || |||| | || |||||     
T  32018069 attataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcgaaat 32017970  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
     ||| || |||||||||| ||||||| | |   |||||||||||||||||||||    
T  32017969 tttttaacaattcaattataggtctattataaaagactttaaacaatttttcaa 32017916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25383121 - 25382983
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  25383121 tattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaatttaaataa 25383023  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || | ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  25383022 tttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttt 25382983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32018050 - 32017942
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaa-atttaaataattcaattat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||  ||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||  ||| || |||||||||||    
T  32018050 agattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcgaaattttttaacaattcaattat 32017951  T
Q  218 aggtctatt 226  Q
    |||||||||    
T  32017950 aggtctatt 32017942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34934368 - 34934316
Alignment:
Q  196 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  34934368 aaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 34934316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 42559031 - 42559094
Alignment:
Q  225 ttttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaa 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  42559031 ttttgtgagattttatacaattttgtgtcgattttaggtttcagcttatccaaatatccgcaaa 42559094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26149526 - 26149486
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatg 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26149526 caattataggtttattttgcgagattttaaacaattatatg 26149486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 15469165 - 15469436
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15469165 tattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 15469264  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  15469265 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt-atcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 15469363  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15469364 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaaaagttaattttagtgg 15469436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 110 - 392
Target Start/End: Original strand, 26468524 - 26468806
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26468524 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttataatttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 26468623  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  26468624 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggacaaaccga 26468723  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26468724 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaa 26468806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 100 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24130338 - 24130051
Alignment:
Q  100 tcaacgattata-ttttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaa 198  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24130338 tcaacgattataattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaa 24130239  T
Q  199 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24130238 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagtttttatacgattttatgccggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcatattggtgtagt 24130139  T
Q  299 ggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24130138 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 24130051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 12698570 - 12698845
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12698570 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 12698669  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  12698670 tcaattat-ggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 12698768  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12698769 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 12698845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 7021893 - 7022164
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7021893 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 7021992  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||     
T  7021993 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccacccg- 7022091  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7022092 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtgg 7022164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11450587 - 11450316
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11450587 tattttgcgagatcttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 11450488  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||     
T  11450487 tcaattattggtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccg- 11450389  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11450388 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 11450316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16461492 - 16461220
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16461492 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattccttcaaagttgtgtagtggtccactcgaaaatttaaataat 16461393  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtc-agttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16461392 tcaattatatgtctattttgcgagattttatataattttatgtcgggttttaggtttcagttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtggcctatccg 16461293  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtg 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16461292 aaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtg 16461220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 110 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2660921 - 2660639
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2660921 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggatgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 2660822  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  2660821 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 2660722  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  2660721 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaa 2660639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 113 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24635550 - 24635285
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24635550 tttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattca 24635451  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||    
T  24635450 attataggtctattttgtgagattttatacaaatttaaatcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaa 24635351  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24635350 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 24635285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34023625 - 34023353
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  34023625 tattttacgagattttatataattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaatttctgcaaagtggtgtagtgtcccacccaaaaatttaaataat 34023526  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||    
T  34023525 tcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgaaccacccga 34023426  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34023425 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 34023353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 34127573 - 34127845
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  34127573 tattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatgccccacccaaaaatttaaataat 34127672  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||     
T  34127673 tcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgg 34127772  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34127773 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttacaatagttaattttagtgg 34127845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9079135 - 9078863
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9079135 tttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattca 9079036  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  9079035 attataggtctattttgtgaga-tttaaacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggaccacccgaaaa 9078937  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9078936 atttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagtcca 9078863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 382
Target Start/End: Original strand, 8560505 - 8560774
Alignment:
Q  114 ttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaa 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8560505 ttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaa 8560604  T
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | | ||||||    
T  8560605 ttatagatctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtgcacctgaaaaa 8560704  T
Q  314 tttaaataattcaattaaagg-tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8560705 tttaaataattcaattataggatctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 8560774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23259038 - 23258765
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23259038 tattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataa 23258939  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||| | | |||    
T  23258938 ttcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccg 23258839  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23258838 aaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 23258765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23259147 - 23258899
Alignment:
Q  114 ttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaa 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23259147 ttgcgagattttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaa 23259048  T
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  23259047 ttataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaa 23258948  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  23258947 tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 23258899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 363
Target Start/End: Original strand, 12996357 - 12996613
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaat 206  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12996357 tatattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcgattgatgcaaattccctcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaaatttaaat 12996456  T
Q  207 aa-ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaat 305  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  12996457 aaattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccat 12996556  T
Q  306 ccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaattttt 363  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12996557 ccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaattttt 12996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14883245 - 14882962
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttg-tgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataa 208  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  14883245 tatttcgcgagattttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccaccaaaaaatttaaataa 14883146  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||| |||  | | |||    
T  14883145 ttcatttttaggtctattttttgagattttatacaaatttatgtcggctttagatttcggttgatccaaattcccgc-aagaggtgtagtgatccacccg 14883047  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||    
T  14883046 aaaaatttaaataatttaattataggtctattttgctaggctttaaacaatttttcaacggttaattttaatagtccaccctaac 14882962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13405456 - 13405298
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||   || ||  ||  ||||| |||||||||    
T  13405456 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccgaaaa 13405357  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagtt 371  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13405356 atttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttttcaacagtt 13405298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 7021883 - 7022031
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| | ||| |||    
T  7021883 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccg-aaa 7021981  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7021982 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 7022031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 12698558 - 12698707
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |    
T  12698558 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccg-a 12698656  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  12698657 aaatttaaataattcaatt-atggtctattttgtgagattttatacaatttt 12698707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 366
Target Start/End: Original strand, 7536522 - 7536675
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||  || || | |||||||    
T  7536522 attatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaaa 7536621  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7536622 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaa 7536675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2660931 - 2660783
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  2660931 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggatgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 2660833  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  2660832 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 2660783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 26468514 - 26468662
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   ||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  26468514 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttataatttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 26468612  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  26468613 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 26468662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9079148 - 9079001
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  9079148 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 9079050  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  9079049 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaga-tttaaacaatttt 9079001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 15469155 - 15469303
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  15469155 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 15469253  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  15469254 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 15469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 337
Target Start/End: Original strand, 10290526 - 10290647
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttca-gttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  10290526 ataggtctactttgcgagattttatacaatttg-tgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaat 10290624  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtct 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  10290625 ttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11450589 - 11450449
Alignment:
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  11450589 tctattttgcgagatcttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccg-aaaatttaaat 11450491  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  11450490 aattcaattattggtctattttacgagattttatacaatttt 11450449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24635563 - 24635419
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||| |||    
T  24635563 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccg-aaa 24635465  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  24635464 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaa 24635419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 34127563 - 34127711
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  || || | || ||||    
T  34127563 attataagtctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatgcccca-cccaaaa 34127661  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  34127662 atttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaatttt 34127711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13405446 - 13405307
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |    |||||  ||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  13405446 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccgaaaaatttaaataa 13405347  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13405346 ttcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 13405307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14883255 - 14883142
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaatttta-tgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaa 311  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || |||    
T  14883255 attataagtctatttcgcgagattttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggccca-ccaaaa 14883157  T
Q  312 aatttaaataattca 326  Q
    |||||||||||||||    
T  14883156 aatttaaataattca 14883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 8560491 - 8560639
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  8560491 attataggtctaaattgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 8560589  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  8560590 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 8560639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34023635 - 34023487
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| ||| || | || ||||    
T  34023635 attataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaatttctgcaaagtggtgtagtgtccca-cccaaaa 34023537  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  34023536 atttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaatttt 34023487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 8560614 - 8560754
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  8560614 tattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtgcacctgaaaaatttaaataa 8560713  T
Q  209 ttcaattatagg-tctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||    
T  8560714 ttcaattataggatctaatttgtaagactttaaacaatttt 8560754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31969031 - 31968955
Alignment:
Q  154 ggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttg 229  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31969031 ggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttg 31968955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 7536532 - 7536671
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||   ||||| |||| || ||||| |||||   ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  7536532 tattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaaaatttaaataa 7536631  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  7536632 ttcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttt 7536671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23259163 - 23259013
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||| |||||| | ||||| || ||| |||||| | || ||    
T  23259163 caattataggtccaacttgcgagattttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgtagtggccca-cccaa 23259065  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  23259064 aaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 23259013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Original strand, 10290578 - 10290647
Alignment:
Q  155 gttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtct 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10290578 gttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16461502 - 16461354
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| | |||| |||| | |  || |||    
T  16461502 attataagcctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattccttcaaagttgtgtagtggtccactcg-aaa 16461404  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  16461403 atttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatataatttt 16461354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31969046 - 31968932
Alignment:
Q  253 cagttttaggtttcag-ttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactt 351  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |  |||    
T  31969046 cagttttaggtttcgggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgtaactctt 31968947  T
Q  352 taaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||||    
T  31968946 taaacaatttttcaa 31968932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1398188 - 1398049
Alignment:
Q  223 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataa 322  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||| |||||||| |||||  || ||| ||||||  || || ||  |||||||||||||||    
T  1398188 tattttacgagattttatccaattttgtgttggttttagattt-agttgatctaaattttcgtaaagtggtgttttgtcccatttgaaaaatttaaataa 1398090  T
Q  323 ttcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaattttt 363  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  1398089 tttaattataggtctattttgcgagtgtttaaataattttt 1398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1398188 - 1398065
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||  | ||||||||||  ||  |||   ||||| |||||||||    
T  1398188 tattttacgagattttatccaattttgtgttggtttta-gatttagttgatctaaattttcgtaaagtggtgttttgtcccatttgaaaaatttaaataa 1398090  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgag 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  1398089 tttaattataggtctattttgcgag 1398065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2399400 - 2399362
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2399400 caattataggtctattctgcgagattttaaacaatttta 2399362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 249
Target Start/End: Original strand, 18234977 - 18235014
Alignment:
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18234977 aattataggtatattttgcgagattttaaacaatttta 18235014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 317
Target Start/End: Original strand, 31489894 - 31489991
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaattta 317  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||| |||| |||| |||||||||| | |||| |||||| |||  | |||| |||||||||    
T  31489894 gtctattttgtgagattttatataattttgtatcgattttaagttttagttaatccaaattctcacaaagtggtgtagtgatccatccaaaaaattta 31489991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2064826 - 2064778
Alignment:
Q  318 aataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  2064826 aataattaaattataggtctattgtgcgagactttaaacattttttcaa 2064778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 110 - 378
Target Start/End: Original strand, 16194327 - 16194595
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16194327 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcagagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 16194426  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  16194427 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtagcccacccga 16194526  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16194527 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 16194595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 26293235 - 26293507
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26293235 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 26293334  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  26293335 tcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 26293434  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26293435 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 26293507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 11764869 - 11765153
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11764869 tattttgcaagattttatacaactttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacacaaaaatttaaataat 11764968  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  11764969 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcagctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 11765068  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11765069 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaaca 11765153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36436265 - 36435993
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36436265 tattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 36436166  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  36436165 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 36436066  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36436065 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 36435993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 119 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6750080 - 6749817
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6750080 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattata 6749981  T
Q  219 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaa 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  6749980 ggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaa 6749881  T
Q  319 ataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6749880 ataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacagtttttcaatagttaattttagtgg 6749817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1021151 - 1020879
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1021151 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 1021052  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  1021051 tcaattataggtctattttgagagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccatccga 1020952  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1020951 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 1020879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 378
Target Start/End: Original strand, 2249656 - 2249924
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2249656 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 2249755  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  2249756 tcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 2249855  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2249856 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 2249924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26860745 - 26860473
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26860745 tattttgcgagattttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataat 26860646  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| | ||||    
T  26860645 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaatttccgcaaattgatgtagtggcccacccga 26860546  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26860545 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 26860473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1115121 - 1114849
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1115121 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 1115022  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||    
T  1115021 ttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttgattttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcctacccga 1114922  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1114921 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 1114849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 23869738 - 23870010
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23869738 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtagtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 23869837  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23869838 tcaattataggtatattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 23869937  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23869938 aaaatttaaataattcaattatgaatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 23870010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 34983351 - 34983623
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  34983351 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaatttaaataat 34983450  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | || |    
T  34983451 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtagtgacccacccaa 34983550  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34983551 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttttgtgg 34983623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 7366226 - 7366510
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7366226 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtgagttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 7366325  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  7366326 tcaattatacatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcga 7366425  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  7366426 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccctaaca 7366510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13616046 - 13615778
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13616046 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 13615947  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||    
T  13615946 ttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggcccacctga 13615847  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13615846 aaaatttaaataattcaattataggtctaattcgcgagattttaaacaatttttcaatagttaatttta 13615778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 110 - 381
Target Start/End: Original strand, 31392622 - 31392891
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  31392622 tattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-aaaatttaagtaat 31392720  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||    
T  31392721 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatcccaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccga 31392820  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtg 381  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31392821 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttc-aaagttaattttagtg 31392891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44545812 - 44545536
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  44545812 tattttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtaatggcccactcgaaaatttaaataat 44545713  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | ||    
T  44545712 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctga 44545613  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44545612 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 44545536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 110 - 378
Target Start/End: Original strand, 42016578 - 42016846
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42016578 tattttgtgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaattgatgcagtggcccacccaaaaatttaaataat 42016677  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |    
T  42016678 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagcggcccacccaa 42016777  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42016778 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaatttta 42016846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 394
Target Start/End: Original strand, 12995044 - 12995325
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12995044 tttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaattggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattca 12995143  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  12995144 attataggtctattttgtaagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 12995243  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12995244 atttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 12995325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 38527249 - 38527520
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38527249 tattttgtgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtcttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagcccacccgaaaatttaaataat 38527348  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || |    
T  38527349 tcaattataggt-tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaa 38527447  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38527448 aaaatttaaataatttatttataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttcgtgg 38527520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28745575 - 28745315
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28745575 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaatttaaataat 28745477  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | ||    
T  28745476 tcaattataggtctattttgcgagattttatataattttatgccggttttagattttggttgatctaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacctga 28745377  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28745376 aaaatttaaataattcaatta-----------tgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 28745315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 110 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11935459 - 11935205
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  11935459 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagattttggttgatccaaattctcgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataa 11935360  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | | |    
T  11935359 ttcaattataggtctattttgcgaggttttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtattggcccaccag 11935260  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaattttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11935259 aaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagactttaaacaattttt 11935205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 281
Target Start/End: Original strand, 38763789 - 38763960
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38763789 tatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 38763888  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  38763889 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattc 38763960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3836423 - 3836154
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaattt-aaataa 208  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||    
T  3836423 tattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgtagtgaaccacctaaaaattttaaataa 3836324  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||  ||     
T  3836323 ttcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtctgttttaggtttcagttgatcaaaattcccgcaaagtgatgtagtggcca--ccc 3836226  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagt 380  Q
     ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  3836225 gaaaatttaaataattcaattatatatctattttacgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagt 3836154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 213 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22674833 - 22674660
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||    
T  22674833 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaa 22674734  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22674733 atttaaataattcaattgaaggtctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 22674660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43471547 - 43471367
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| || | | | |||||||    
T  43471547 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 43471448  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  43471447 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtccaccctaac 43471367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34494568 - 34494396
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  34494568 attataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 34494469  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34494468 -tttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 34494396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34494556 - 34494420
Alignment:
Q  112 ttttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34494556 ttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattc 34494457  T
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  34494456 aattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 34494420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 382
Target Start/End: Original strand, 41699249 - 41699415
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||   | | |||||||    
T  41699249 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaattgtagaggt---ccacccgaaaa 41699345  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41699346 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 41699415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 215 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31643702 - 31643545
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||    
T  31643702 tatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaat 31643603  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagtta 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31643602 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaaggtta 31643545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19284013 - 19283875
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19284013 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacccgaaaatttaaataat 19283914  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||    
T  19283913 tcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttt 19283875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 41699257 - 41699395
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41699257 tatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaa---ttgtagaggtccacccgaaaaatttaaat 41699353  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41699354 aattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 41699395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 221 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19284015 - 19283843
Alignment:
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| || | ||||||| |||||||    
T  19284015 tctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacccgaaaa-tttaaat 19283917  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19283916 aattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 19283843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 34983341 - 34983489
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  34983341 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatcc-aaaa 34983439  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  34983440 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 34983489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43471537 - 43471398
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  43471537 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaa 43471438  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  43471437 ttcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttt 43471398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1021161 - 1021013
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  1021161 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 1021063  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  1021062 atttaaataattcaattataggtctattttgagagattttatacaatttt 1021013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 378
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077720
Alignment:
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| ||| || ||||   |||| ||||||||||||    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttttcaacggttaatttta 2077720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11935469 - 11935320
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| | || ||||    
T  11935469 attataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagattttggttgatccaaattctcgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaa 11935370  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  11935369 atttaaataattcaattataggtctattttgcgaggttttatacaatttt 11935320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 26293225 - 26293373
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  26293225 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 26293323  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  26293324 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgatttt 26293373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6749976 - 6749837
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6749976 tattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 6749877  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  6749876 ttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacagtttt 6749837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1115131 - 1114983
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  1115131 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 1115033  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  1115032 atttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 1114983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 38763779 - 38763927
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  38763779 attataggtctatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 38763877  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  38763878 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 38763927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 12995154 - 12995293
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12995154 tattttgtaagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 12995253  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||    
T  12995254 ttcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttt 12995293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26860757 - 26860607
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||  ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||| | || ||    
T  26860757 caattataggtctattttgcgagattttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggccca-cccaa 26860659  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  26860658 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 26860607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 2249646 - 2249794
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  2249646 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 2249744  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  2249745 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgatttt 2249794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13616056 - 13615908
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  13616056 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacccg-aaa 13615958  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  13615957 atttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 13615908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 16194317 - 16194465
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| | ||| |||    
T  16194317 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcagagtggtgtagtggcccacccg-aaa 16194415  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  16194416 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 16194465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 23869728 - 23869876
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| | |||| |||||| | ||| |||    
T  23869728 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtagtgtagtggcccacccg-aaa 23869826  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  23869827 atttaaataattcaattataggtatattttgcgagattttatacaatttt 23869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 23869849 - 23869990
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaat 206  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23869849 tatattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaat 23869948  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  23869949 aattcaattatgaatctaatttgcgagactttaaacaatttt 23869990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36436275 - 36436127
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  36436275 attataagtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 36436177  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36436176 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 36436127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 42016568 - 42016716
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| | || ||||    
T  42016568 attataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaattgatgcagtggccca-cccaaaa 42016666  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  42016667 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 42016716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Original strand, 7366218 - 7366364
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||    
T  7366218 tataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtgagttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaat 7366316  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7366317 ttaaataattcaattatacatctattttgcgagattttatacaatttt 7366364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22674823 - 22674684
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc-gaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22674823 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataa 22674724  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||  ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  22674723 ttcaattgaaggtctaatttgagagactttaaacaatttt 22674684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31643694 - 31643555
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  31643694 tattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaatttaaataa 31643595  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31643594 ttcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 31643555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 32099999 - 32100154
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtgg-----ccaatccgaa 310  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||     || | |||||    
T  32099999 ataggtatactttacgagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaa 32100098  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  32100099 aaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagtctttaaataatttttcaa 32100154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141871
Alignment:
Q  224 attttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataat 323  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||| |||| |||||||||||||| |  ||| || |||  ||||| | || |||||||||||||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  324 tcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 29141871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 11764859 - 11765007
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | | |  ||||    
T  11764859 attataggtctattttgcaagattttatacaactttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggtcca-cacaaaa 11764957  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  11764958 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 11765007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44545822 - 44545674
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| |  || |||    
T  44545822 attataggtctattttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtaatggcccactcg-aaa 44545724  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44545723 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44545674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Original strand, 12995031 - 12995160
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||| |||    
T  12995031 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaattggtgtagtggcccacccg-aaa 12995129  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttg 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12995130 atttaaataattcaattataggtctattttg 12995160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 31392612 - 31392759
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||  |||    
T  31392612 attataagtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc--aaa 31392709  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31392710 atttaagtaattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 31392759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28745585 - 28745438
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||  | |||||||    
T  28745585 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 28745487  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  28745486 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataatttt 28745438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3836431 - 3836284
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||  | | |  |||| |    
T  3836431 tatagatctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgtagtgaaccacctaaaaatt 3836332  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  3836331 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 3836284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29035490 - 29035340
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||| ||  || |  |||||||||    
T  29035490 ataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatt 29035391  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  29035390 taaataattcaattatagatctattttgcaagtctttaaacaatttttcaa 29035340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 38527239 - 38527386
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||| || |  ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| | ||| |||    
T  38527239 attataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtcttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagcccacccg-aaa 38527337  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  38527338 atttaaataattcaattataggt-tattttgcgagattttatacaatttt 38527386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 2077565 - 2077704
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| || ||||| ||||| |  |||||||| |||||||| || || |||| |||||||||    
T  2077565 tattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaataa 2077664  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  2077665 ttcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttt 2077704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 32100015 - 32100131
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggt-----ccacccg-aaaatttaaataattca 212  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||    
T  32100015 agattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaaaaatttaaataattca 32100114  T
Q  213 attataggtctattttg 229  Q
    ||||||| |||||||||    
T  32100115 attatagatctattttg 32100131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17526119 - 17526052
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaatt 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17526119 attatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaatt 17526052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29035474 - 29035344
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattat 217  Q
    ||||||| | ||| ||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29035474 agattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatttaaataattcaattat 29035375  T
Q  218 aggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || |||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  29035374 agatctattttgcaagtctttaaacaatttt 29035344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141875
Alignment:
Q  111 attttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataat 209  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||| | |||||  ||| ||||||||||||||     ||| || |||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 29141875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6750099 - 6749951
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||   |||||||||||| | ||||| |||||| |||  | | ||| |||    
T  6750099 attataggtctatttattgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgatccacccg-aaa 6750001  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  6750000 atttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaatttt 6749951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 382
Target Start/End: Original strand, 38763961 - 38764002
Alignment:
Q  341 ttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38763961 ttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 38764002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1538232 - 1538194
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1538232 caattataggtctattatgcgagattttaaacaatttta 1538194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44788514 - 44788477
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44788514 caattataggtctatttttcgagattttaaacaatttt 44788477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 90)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 111 - 382
Target Start/End: Original strand, 40567042 - 40567313
Alignment:
Q  111 attttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataatt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  40567042 attttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatagtt 40567141  T
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  40567142 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 40567241  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40567242 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 40567313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25299170 - 25298894
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25299170 tattttgcgagattttatgcaactttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccggaaaatttaaataat 25299071  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  25299070 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggcccacccga 25298971  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25298970 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 25298894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33012139 - 33011855
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33012139 tattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 33012040  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33012039 tcaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccga 33011940  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33011939 aaaatttaaataattcaattatttttctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 33011855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16693031 - 16692759
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16693031 tattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 16692932  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  16692931 tcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 16692832  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16692831 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatatttaattttagtgg 16692759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40428863 - 40428587
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40428863 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccactcgaaaatttaaataat 40428764  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  40428763 tcaattatagttctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 40428664  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40428663 aaaattaaaataattcaattataaatttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 40428587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 51139761 - 51140033
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51139761 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 51139860  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  51139861 tcaattataggtttattttgcgagattttttacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 51139960  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51139961 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 51140033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 919792 - 919508
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  919792 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataat 919693  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || | | | || |    
T  919692 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttccattgatccaaattccagcaaattggtgtagtagtccacccaa 919593  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  919592 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtcgcccaccctaaca 919508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 23177417 - 23177689
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23177417 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataat 23177516  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  23177517 tcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccatccga 23177616  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23177617 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 23177689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 42372045 - 42372329
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42372045 tattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 42372144  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || |    
T  42372145 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccaa 42372244  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||    
T  42372245 aaaatttaaataattcaattattgatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagcggcccaccctaaca 42372329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 378
Target Start/End: Original strand, 8086305 - 8086573
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8086305 tattttgctagattttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 8086404  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  8086405 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacacga 8086504  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttta 378  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  8086505 aaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacaattttttaatggttaatttta 8086573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 47561802 - 47562074
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  47561802 tattttgcgatattttatgcaattttgtgtaggttttatgttttggttgatccaaattactgcaaagtgatgtagtgaaccaaccaaaaatttaaataat 47561901  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||    
T  47561902 tcaattataggtctattttgcgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccga 47562001  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47562002 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 47562074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Original strand, 24790512 - 24790783
Alignment:
Q  112 ttttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790512 ttttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattc 24790611  T
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagtttta-ggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||    
T  24790612 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttacgttttgggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcaagcgaa 24790711  T
Q  311 aaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24790712 aaatttaaataattcaattataggtcaaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtgg 24790783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46224842 - 46224560
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46224842 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 46224743  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||    
T  46224742 tcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacctga 46224643  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  46224642 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagac--taaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 46224560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 113 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17285373 - 17285093
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17285373 tttgcgagattttatgcaattttatatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattca 17285274  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtgg-ccaatccgaaa 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||    
T  17285273 attataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccaccccgaaa 17285174  T
Q  312 aatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaa 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  17285173 aatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaa 17285093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44052541 - 44052269
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44052541 tattttgcgagattttatgtaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataat 44052442  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||    
T  44052441 tcaattataggtctattttgtgagattttatagaattttatgtcggttttaggttttggttgattcaaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccga 44052342  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44052341 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 44052269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 48708499 - 48708223
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48708499 tattttgcgagattttatgcaattttatatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataat 48708400  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||    
T  48708399 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgtctcacccga 48708300  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48708299 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 48708223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 121 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29981778 - 29981517
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattatagg 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29981778 attttatgcaattttgtgtcggttttaagttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagg 29981679  T
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||     
T  29981678 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaac 29981579  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29981578 aattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 29981517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 37125768 - 37126040
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  37125768 tattttgcgatattttatgcaattttgcgtcagttttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtacagtgacccacccgaaaatttaaataat 37125867  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  37125868 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatatcagttttaggtttcggttgatcaaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccga 37125967  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37125968 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 37126040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 114 - 386
Target Start/End: Original strand, 45836923 - 45837195
Alignment:
Q  114 ttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaa 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45836923 ttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataatttaa 45837022  T
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  45837023 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaa 45837122  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45837123 tttaaataattcaattataggtctaatttttgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagttgtcca 45837195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 382
Target Start/End: Original strand, 29170020 - 29170289
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  29170020 tttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtagcccacccaaaaatttaaataattca 29170119  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||  | | |||||||    
T  29170120 attataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgcagtgatccacccgaaaa 29170219  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29170220 atttaaataattcaactataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 29170289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 110 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544800 - 24544548
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24544800 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataat 24544701  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  24544700 tcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccga 24544601  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24544600 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24544548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 8530158 - 8530436
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8530158 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttctggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataat 8530257  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgag------attttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggcca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |     
T  8530258 tcaattataggtctattttgcgagattttaattttatacaattttctgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgcagtggtcc 8530357  T
Q  304 atccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8530358 acccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgaaactttatacaatttttcaaaagttaattttagtgg 8530436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 119 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9042491 - 9042229
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattata 218  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9042491 agattttatgcaattt-gtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcacacccgaaaatttaaataattcaattata 9042393  T
Q  219 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaa 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||||||||    
T  9042392 ggtctattttgtgagattttatacaaatttaagtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaa 9042293  T
Q  319 ataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9042292 ataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgg 9042229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 121 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24542852 - 24542590
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24542852 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24542753  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24542752 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24542653  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24542652 taattcaattatagttctaattagcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 24542590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 113 - 382
Target Start/End: Original strand, 6849831 - 6850099
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6849831 tttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattca 6849930  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||||   | |||||||    
T  6849931 attatagatctattttgtgagattttatacaaatttatatcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattagtatagtggttcacccgaaaa 6850030  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6850031 atttaaataattcaattataggt-taatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtgg 6850099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24542966 - 24542724
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24542966 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24542867  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24542866 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24542767  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24542766 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24542724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543080 - 24542838
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543080 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24542981  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24542980 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24542881  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24542880 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24542838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543194 - 24542952
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543194 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543095  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543094 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24542995  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24542994 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24542952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543308 - 24543066
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543308 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543209  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543208 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543109  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543108 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543422 - 24543180
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543422 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543323  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543322 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543223  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543222 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543536 - 24543294
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543536 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543437  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543436 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543337  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543336 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543650 - 24543408
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543650 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543551  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543550 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543451  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543450 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543764 - 24543522
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543764 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543665  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543664 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543565  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543564 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543878 - 24543636
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543878 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543779  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543778 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543679  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543678 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24543992 - 24543750
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24543992 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24543893  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24543892 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543793  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543792 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544106 - 24543864
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24544106 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24544007  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24544006 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24543907  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24543906 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544220 - 24543978
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24544220 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24544121  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24544120 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24544021  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24544020 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24543978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544334 - 24544092
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24544334 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24544235  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24544234 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24544135  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24544134 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24544092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544448 - 24544206
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24544448 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24544349  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24544348 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24544249  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24544248 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24544206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544562 - 24544320
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24544562 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24544463  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24544462 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24544363  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24544362 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24544320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544676 - 24544434
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattatag 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24544676 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24544577  T
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24544576 gtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaa 24544477  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24544476 taattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24544434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 44317642 - 44317780
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44317642 tattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 44317741  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317742 ttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44317780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343233
Alignment:
Q  243 aattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaattt 342  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  343 gcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 37343233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49001576 - 49001410
Alignment:
Q  212 aattataggtctattttgcgaga--ttttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  49001576 aattataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggttt-agttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccga 49001478  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttt 377  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  49001477 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaatttt 49001410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9247019 - 9246840
Alignment:
Q  189 ccacccgaaaatttaaataattca--attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgca 286  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | | |||||||||| | ||    
T  9247019 ccacccgaaaaattaaaaaattaaggattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcaca 9246920  T
Q  287 aattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    || |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9246919 aagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttttcaa 9246840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 40567154 - 40567293
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40567154 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 40567253  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40567254 ttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40567293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32540684 - 32540528
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||  || |||| ||||||  ||||| | |||||||||    
T  32540684 tataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaat 32540585  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagtt 371  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32540584 ttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaacaaattttcaacagtt 32540528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 21852069 - 21852219
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||||   | ||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21852069 ataggtatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 21852168  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21852169 taaattattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 21852219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25299180 - 25299032
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  25299180 attataggtctattttgcgagattttatgcaactttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-ccggaaa 25299082  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  25299081 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 25299032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17285386 - 17285238
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  17285386 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttatatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 17285288  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  17285287 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 17285238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33012149 - 33012001
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  33012149 attataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 33012051  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  33012050 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 33012001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 382
Target Start/End: Original strand, 44317632 - 44317800
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||   ||||| ||||  ||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||| | |||||||    
T  44317632 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 44317731  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44317732 -tttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttttcaatagttaattttagtgg 44317800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48708509 - 48708361
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||  |||    
T  48708509 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttatatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-cctgaaa 48708411  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  48708410 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 48708361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 51139751 - 51139899
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  51139751 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 51139849  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||  ||||||||    
T  51139850 atttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttttacaatttt 51139899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Original strand, 8086297 - 8086443
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||    
T  8086297 tatagatctattttgctagattttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaat 8086395  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  8086396 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 8086443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29981676 - 29981537
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29981676 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaacaa 29981577  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  29981576 ttcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttt 29981537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Original strand, 45837032 - 45837147
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45837032 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 45837131  T
Q  209 ttcaattataggtcta 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  45837132 ttcaattataggtcta 45837147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 919802 - 919654
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||  |||    
T  919802 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-cctgaaa 919704  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  919703 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 919654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16693041 - 16692893
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  16693041 attataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 16692943  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  16692942 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 16692893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17285263 - 17285123
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc--gaaaatttaaata 207  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17285263 tattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccaccccgaaaaatttaaata 17285164  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  17285163 attcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 17285123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 42372035 - 42372183
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  42372035 attataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 42372133  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  42372134 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 42372183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Original strand, 24790502 - 24790648
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||| |||||    
T  24790502 tataagtctgttttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaat 24790600  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  24790601 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 24790648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343201
Alignment:
Q  130 aattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctatttt 228  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  229 gcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttt 37343201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 363
Target Start/End: Original strand, 46601074 - 46601217
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||| || |  |||||||| ||| |||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  46601074 gtctattttgtgaaagattatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaa 46601173  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaattttt 363  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46601174 taattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaattttt 46601217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 21852074 - 21852215
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaat 206  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21852074 tatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaat 21852173  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  21852174 tattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 21852215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29981799 - 29981651
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  29981799 attataggtctactttgtgatattttatgcaattttgtgtcggttttaagttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 29981701  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  29981700 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 29981651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 37125758 - 37125906
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||   ||| || | ||| |||    
T  37125758 attataggtctattttgcgatattttatgcaattttgcgtcagttttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtacagtgacccacccg-aaa 37125856  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  37125857 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 37125906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 45836909 - 45837057
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  45836909 attataggtctatattgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 45837007  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  45837008 atttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 45837057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9042388 - 9042249
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc-gaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||  || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9042388 tattttgtgagattttatacaaatttaagtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataa 9042289  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  9042288 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 9042249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 29170130 - 29170269
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  29170130 tattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgcagtgatccacccgaaaaatttaaataa 29170229  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  29170230 ttcaactataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 29170269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32540676 - 32540541
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  32540676 tattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaatttaaataa 32540577  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaa 244  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  32540576 ttcaattatatgtctattttgagagactttaaacaa 32540541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40428871 - 40428725
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| || | | |  || |||||    
T  40428871 tataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccactcg-aaaat 40428773  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40428772 ttaaataattcaattatagttctattttgcgagattttatacaatttt 40428725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49001554 - 49001425
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattat 217  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| || |||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49001554 agattttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattat 49001456  T
Q  218 aggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49001455 agatctattttgcgagactttaaacaatttt 49001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 8530148 - 8530288
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||   ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||  |||    
T  8530148 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttctggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggccca-cctgaaa 8530246  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaa 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  8530247 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttaa 8530288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24544810 - 24544662
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |  || |||    
T  24544810 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccactcg-aaa 24544712  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  24544711 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaatttt 24544662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 46224844 - 46224704
Alignment:
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  46224844 tctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaat 46224746  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  46224745 aattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 46224704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9246983 - 9246844
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| || | |||||||||    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  9246983 tattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataa 9246884  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  9246883 ttcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttt 9246844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 23177407 - 23177555
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||  |||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  23177407 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggccca-cccaaaa 23177505  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  23177506 atttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaatttt 23177555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 6849941 - 6850079
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6849941 tattttgtgagattttatacaaatttatatcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattagtatagtggttcacccgaaaaatttaaataa 6850040  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||    
T  6850041 ttcaattataggt-taatttgtgagactttaaacaatttt 6850079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29055997 - 29055886
Alignment:
Q  129 caattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattt 227  Q
    ||||||||||| | |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29055997 caattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattt 29055898  T
Q  228 tgcgagatttta 239  Q
    ||||||| ||||    
T  29055897 tgcgagacttta 29055886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 6849818 - 6849962
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||  |||||| |||||| |  |||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  6849818 attataggtctaatttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 6849916  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||    
T  6849917 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaa 6849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29056015 - 29055868
Alignment:
Q  223 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataa 322  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| |||| | | ||||||||| | ||||| ||||||  ||||| | || ||||||||||||||    
T  29056015 tattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataa 29055917  T
Q  323 ttcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagtta 372  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  29055916 ttcaattataggtctattttgcgagactttaaa-tattttttaaaagtta 29055868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 29170007 - 29170151
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| || ||| | || ||||    
T  29170007 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtagccca-cccaaaa 29170105  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  29170106 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaa 29170151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44052551 - 44052403
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||| ||||   ||||||||||||||  |||| |||||| ||| || | ||| |||    
T  44052551 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacccg-aaa 44052453  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  44052452 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatagaatttt 44052403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 47561792 - 47561940
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| || ||| |||  | | || ||||    
T  47561792 attataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtaggttttatgttttggttgatccaaattactgcaaagtgatgtagtgaaccaacc-aaaa 47561890  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  47561891 atttaaataattcaattataggtctattttgcgaaattttatacaatttt 47561940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 248
Target Start/End: Original strand, 46601138 - 46601216
Alignment:
Q  171 gcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46601138 gcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaatttt 46601216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 363
Target Start/End: Original strand, 25030371 - 25030467
Alignment:
Q  267 agttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaattttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||   | || |||||||||||||||| ||||| || |||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  25030371 agttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaaaatttaaataatttaattatagatctattttggaagactttaaataattttt 25030467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 25030372 - 25030447
Alignment:
Q  155 gttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgg-tccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 229  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25030372 gttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaaaatttaaataatttaattatagatctattttg 25030447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Original strand, 45807075 - 45807113
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45807075 caattataggtctattttgcgagattttaaacaatttta 45807113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1243710 - 1243675
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1243710 caattataggtctattttgcgagattttaaacaatt 1243675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 108 - 382
Target Start/End: Original strand, 36584496 - 36584770
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaata 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36584496 tatattttgcgagattttatgcaattttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaata 36584595  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatcc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||    
T  36584596 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttttagttgatccaaattcccgctaattggtgtagtggctcaccc 36584695  T
Q  308 gaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36584696 gaaaaatttaaatatttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 36584770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 41832451 - 41832736
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaattt-aaataa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  41832451 tattttgcaagattttatgcaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaacttttaaataa 41832550  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | |||    
T  41832551 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccg 41832650  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41832651 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccatcctaaca 41832736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31664248 - 31663978
Alignment:
Q  112 ttttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31664248 ttttgcgagattttatgcaattttgagtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattc 31664149  T
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  31664148 aattataggtctattttgcaagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaa 31664049  T
Q  312 aatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31664048 aatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 31663978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11651049 - 11650773
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651049 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 11650950  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  11650949 tcaattataggtttattttgggagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccga 11650850  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11650849 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 11650773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36955093 - 36954809
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36955093 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 36954994  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  36954993 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttacgtttcggttgatccaaatccccgcaaattggtgtagtggcccacccga 36954894  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36954893 aaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagaatttaaacaatttttcaatagttaatattagtggcccatcctaaca 36954809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44745673 - 44745393
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44745673 tattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccactcgaaaatttaaataat 44745574  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |    
T  44745573 tcaattgtaggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccactcaa 44745474  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcct 390  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44745473 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattttagtggtccatcct 44745393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12700651 - 12700379
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12700651 tattttgcgagactttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatagt 12700552  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  12700551 taaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggttcatccga 12700452  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12700451 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 12700379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 44134569 - 44134852
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44134569 tattttgtgagattttatgcaatttt-tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataat 44134667  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||    
T  44134668 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggcccacctga 44134767  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  44134768 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccaccctaaca 44134852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 6755904 - 6756187
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6755904 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 6756003  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  6756004 tcaattataggtctattttgcgagattttatactattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcc-acccga 6756102  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  6756103 aaaatttaaatgattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaattttttaattgttaattttagtggcccaccctaaca 6756187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 13233305 - 13233589
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13233305 tattttgcgatattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataat 13233404  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||    
T  13233405 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaatcggtgtagtggtccacccga 13233504  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  13233505 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccctaaca 13233589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31581833 - 31581561
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31581833 tattttgctagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtagtgtaatggcccactcgaaaatttaaataat 31581734  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  31581733 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtactggctcatccga 31581634  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31581633 aaaatttaaataactcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 31581561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38141640 - 38141368
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38141640 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcaattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 38141541  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  38141540 tcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaaccga 38141441  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38141440 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgatactttaaataatttttcaatagttaattttagtgg 38141368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 110 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40228513 - 40228231
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40228513 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtggcccactcgaaaatttaaataat 40228414  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||    
T  40228413 tcaattgtaggtctatttggcgagattttatacgattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgttgtagtggcccacccga 40228314  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  40228313 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagtatttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaa 40228231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13613175 - 13612891
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  13613175 tattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacccaaaaatttaaataat 13613076  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  13613075 ttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 13612976  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13612975 aaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccctaaca 13612891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 394
Target Start/End: Original strand, 18491262 - 18491546
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18491262 tattttgtgagattttatgtaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgccccacccgaaaatttaaataat 18491361  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  18491362 ttaactataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 18491461  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  18491462 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatgtttcaatagttaattttagtgacccaccctaaca 18491546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Original strand, 43564493 - 43564769
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  43564493 tattttgcgatattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtgccccatccaaaaatttaaataat 43564592  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||    
T  43564593 tcaattataagtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaacacccga 43564692  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43564693 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagagtttaaacaatttttcaatagttgattttagtggtcca 43564769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 113 - 382
Target Start/End: Original strand, 16925184 - 16925453
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925184 tttgcgagactttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 16925283  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  16925284 attataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 16925383  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16925384 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgg 16925453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2654990 - 2654709
Alignment:
Q  113 tttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  2654990 tttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccatccgaaaatttaaatagttca 2654891  T
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  2654890 attataggtctattttatgagattttatacaattttacgtcggttttagatttcggttgatcccaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 2654791  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2654790 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccatcctaaca 2654709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 110 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19653727 - 19653452
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  19653727 tattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaaatagtgtaatggcccacttgaaaatttaaataat 19653628  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
T  19653627 tcaattataggtctattt-gtgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccatccga 19653529  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtcca 386  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19653528 aaaatttaaataactcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtcca 19653452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 52581531 - 52581804
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  52581531 tattttgcaatattttatggagttttgtgtcggtttcatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtcgcccatccaaaaatttaaataat 52581630  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtgg-ccaatccg 308  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||| || | ||     
T  52581631 tcaattatatgtttattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtagatccaaatttccacaaattggtgtagtggtcccaccca 52581730  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52581731 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 52581804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Original strand, 22647189 - 22647458
Alignment:
Q  112 ttttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22647189 ttttgcgagattttatgcaattttgtgtcg-ttttatatttttgttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattc 22647287  T
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | || |||    
T  22647288 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaa 22647387  T
Q  312 aatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  22647388 aaattaaataattcaattatatgtctaatttgtgagactttaaacaattttttaatggttaatttcagtgg 22647458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 54795812 - 54795529
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  54795812 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataa 54795713  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || | | | |||    
T  54795712 ttcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccg 54795614  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  54795613 aaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccctaac 54795529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Original strand, 27270428 - 27270711
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  27270428 tattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatcaaaattcccgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataa 27270527  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || | | | |||    
T  27270528 ttcaattatagatctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccg 27270626  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  27270627 aaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtgatccaccctaac 27270711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Original strand, 50767109 - 50767392
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc-gaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  50767109 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaattaa 50767208  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || | | | |      
T  50767209 ttcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccaa 50767307  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaac 393  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  50767308 aaaaatttaaacaattcaattataggtctattttacgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccatcctaac 50767392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10096538 - 10096270
Alignment:
Q  111 attttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtcca-cccgaaaatttaaataat 209  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||    
T  10096538 attttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttccgcaaagtggtgtagt-gtccattcaaaaaatttaaataat 10096440  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |  ||     
T  10096439 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgattgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccactcg- 10096341  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagt 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10096340 aaaatttaaataattcaattataggtctattttctaaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 10096270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4632788 - 4632515
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  4632788 tattttgcgagattttatacaattttgtgttagttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacgcgaaaaatttaaataa 4632689  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| || |||||| |||| | | ||     
T  4632688 ttcaatcataggtctattttgcgagattatatacaattttgtgtcgattttaggattcggttgatctaaatttccgccaagtggtgtagtggaccaccca 4632589  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4632588 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgagagaatttaaacaatttttcaacggttaattttagtgg 4632515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44817621 - 44817441
Alignment:
Q  121 attttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattatagg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  44817621 attttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatttaaata-ttcaattatagg 44817523  T
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggcc 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44817522 tctattctgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcc 44817441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Original strand, 45670035 - 45670170
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45670035 tattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 45670134  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaat 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45670135 tcaattatatgtctattttgcgagattttatacaat 45670170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 214 - 394
Target Start/End: Original strand, 51001542 - 51001721
Alignment:
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  51001542 ttataagtctattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaa-ttcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaa 51001640  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51001641 tttaaataattcaattataggtctaatttgtaaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaaca 51001721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 13857687 - 13857826
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13857687 tattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 13857786  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13857787 ttcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13857826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4632798 - 4632649
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |  ||||||    
T  4632798 attataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgttagttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacgcgaaaa 4632699  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  4632698 atttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattatatacaatttt 4632649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 13869217 - 13869356
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13869217 tattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaatttaaataa 13869316  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13869317 ttcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13869356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31664137 - 31663998
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31664137 tattttgcaagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 31664038  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31664037 ttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 31663998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 362
Target Start/End: Original strand, 36584487 - 36584636
Alignment:
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaa 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||    
T  36584487 aattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aa 36584585  T
Q  312 aatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36584586 aatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 36584636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Original strand, 50767099 - 50767224
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  50767099 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaa 50767198  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtcta 338  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  50767199 atttaattaattcaattataggtcta 50767224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7638840 - 7638702
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7638840 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaattttaataat 7638741  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7638740 tccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7638702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10096426 - 10096308
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10096426 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgattgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccactcgaaaatttaaataat 10096327  T
Q  210 tcaattataggtctatttt 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10096326 tcaattataggtctatttt 10096308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36801947 - 36801801
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| | |||| |||||| | |||||||||||| |    
T  36801947 gtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatttata 36801848  T
Q  320 taattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36801847 taattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttttcaa 36801801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10096549 - 10096401
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || || | ||||    
T  10096549 attataggttcattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtgtcc-attcaaaaa 10096451  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  10096450 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 10096401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 365
Target Start/End: Original strand, 13857680 - 13857829
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| | ||||||||||| | | ||| |||||| |||||| | ||||||||||    
T  13857680 ataggtgtattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatt 13857779  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttca 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  13857780 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttca 13857829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36955103 - 36954955
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  36955103 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 36955005  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36955004 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 36954955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38141650 - 38141502
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  38141650 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcaattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 38141552  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  38141551 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 38141502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 41832441 - 41832590
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | || |||     
T  41832441 attatatgtctattttgcaagattttatgcaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaac 41832540  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41832541 ttttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 41832590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 54795822 - 54795697
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  54795822 attataggtctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaa 54795723  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtcta 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  54795722 atttaaataattcaattataggtcta 54795697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 16925294 - 16925433
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16925294 tattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 16925393  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  16925394 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 16925433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 6755894 - 6756042
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  6755894 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 6755992  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  6755993 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatactatttt 6756042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 13233295 - 13233443
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | || ||||    
T  13233295 attatagatctattttgcgatattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-cccaaaa 13233393  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  13233394 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 13233443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Original strand, 13869211 - 13869360
Alignment:
Q  217 taggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaattt 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| | ||||| || ||  |||| | | |||||||||||    
T  13869211 taggtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaattt 13869310  T
Q  317 aaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13869311 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttcaa 13869360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7638842 - 7638698
Alignment:
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| ||||||| |||    
T  7638842 tctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaattttaat 7638744  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7638743 aattccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7638698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11651059 - 11650911
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  11651059 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 11650961  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||| |||| |||| ||||||||    
T  11650960 atttaaataattcaattataggtttattttgggagattttatacaatttt 11650911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 18491252 - 18491400
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || | ||| |||    
T  18491252 attataggtctattttgtgagattttatgtaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgccccacccg-aaa 18491350  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  18491351 atttaaataatttaactataggtctattttgcgagattttatacaatttt 18491400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Original strand, 27270418 - 27270535
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| | || ||||    
T  27270418 attataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatcaaaattcccgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaa 27270517  T
Q  313 atttaaataattcaatta 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27270518 atttaaataattcaatta 27270535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 43564483 - 43564631
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| || |||| ||||    
T  43564483 attataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtgccccatcc-aaaa 43564581  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  43564582 atttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttt 43564631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44745683 - 44745535
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |  || |||    
T  44745683 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccactcg-aaa 44745585  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44745584 atttaaataattcaattgtaggtctattttgcgagattttatacaatttt 44745535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 359
Target Start/End: Original strand, 45670025 - 45670170
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  45670025 attataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 45670123  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaat 359  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  45670124 atttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaat 45670170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 366
Target Start/End: Original strand, 10393896 - 10394041
Alignment:
Q  221 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaat 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||   |||| |||||| || |||| |||||| |||||| | |||||||||||| ||    
T  10393896 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 10393995  T
Q  321 aattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    || ||||||| | |||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  10393996 aactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttttcaa 10394041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12700661 - 12700513
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||    
T  12700661 attataggtttattttgcgagactttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 12700563  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12700562 atttaaatagttaaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 12700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13613185 - 13613037
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  |||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | || ||||    
T  13613185 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggccca-cccaaaa 13613087  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  13613086 atttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaatttt 13613037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31581843 - 31581695
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| | ||||  ||||| |  || |||    
T  31581843 attataggtctattttgctagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtagtgtaatggcccactcg-aaa 31581745  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31581744 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 31581695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2655003 - 2654855
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||| |||    
T  2655003 attatagatctagtttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccatccg-aaa 2654905  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||| |||| ||||||||    
T  2654904 atttaaatagttcaattataggtctattttatgagattttatacaatttt 2654855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653080
Alignment:
Q  112 ttttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataatt 210  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
     |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaatttt 26653080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40228523 - 40228375
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |  || |||    
T  40228523 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtggcccactcg-aaa 40228425  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||    
T  40228424 atttaaataattcaattgtaggtctatttggcgagattttatacgatttt 40228375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 44134559 - 44134706
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||  | | ||| |||    
T  44134559 attataggtctattttgtgagattttatgcaatttt-tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccg-aaa 44134656  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  44134657 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44134706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 366
Target Start/End: Original strand, 7776903 - 7776987
Alignment:
Q  282 ccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7776903 ccgcaaaatggtgtagtgtcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7776987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653053
Alignment:
Q  225 ttttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataatt 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||  | | ||||||||| |   ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  325 caattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcc 389  Q
     ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaattttttaatggtaaattttagtggcccatcc 26653053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 27886463 - 27886527
Alignment:
Q  7 atttcaccgggtcctccattcattctagaggattcaatcatgataccttattgcatctacaagag 71  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27886463 atttcactgggtcctccattcattctagaggattcaatcatgataccttattgcatttacaagag 27886527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 229
Target Start/End: Original strand, 51001551 - 51001670
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51001551 tattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaa-ttcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 51001649  T
Q  209 ttcaattataggtctattttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  51001650 ttcaattataggtctaatttg 51001670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 22647299 - 22647438
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccaccc-gaaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||| | | ||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  22647299 tattttgcgagattttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaataa 22647398  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  22647399 ttcaattatatgtctaatttgtgagactttaaacaatttt 22647438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44817640 - 44817495
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| |||| | |||||| |||| ||||||    
T  44817640 tataggtctatttttcgaaattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatcc-aaaaat 44817542  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  44817541 ttaaat-attcaattataggtctattctgcgagattttatacaatttt 44817495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 16925171 - 16925315
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||| |||| | | ||| |||    
T  16925171 attataggtctaatttgcgagactttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacccg-aaa 16925269  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaa 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  16925270 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaa 16925315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 52581521 - 52581669
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  | |||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |||| ||||    
T  52581521 attataggtctattttgcaatattttatggagttttgtgtcggtttcatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtcgcccatcc-aaaa 52581619  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| | || || ||| ||||| |||| ||||||||    
T  52581620 atttaaataattcaattatatgtttattttacgagattttatacaatttt 52581669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 382
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670232
Alignment:
Q  318 aataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 45670232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 10393898 - 10394037
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |  |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10393898 tattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataa 10393997  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
     ||||||||| |||||| ||| |||| | || ||||||||    
T  10393998 ctcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttt 10394037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36801944 - 36801805
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||| | | ||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36801944 tattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatttatataa 36801845  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  36801844 ttcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttt 36801805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Original strand, 18707805 - 18707879
Alignment:
Q  159 atccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18707805 atccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga 18707879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 366
Target Start/End: Original strand, 18707742 - 18707898
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaatt----ttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    || |||| ||   ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||| || ||| | |||    
T  18707742 attataggtctactttgcaagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccg 18707841  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18707842 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga-tctttaaacaatttttcaa 18707898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Original strand, 18735298 - 18735379
Alignment:
Q  149 gttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttg 229  Q
    |||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18735298 gtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttg 18735379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19653737 - 19653590
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| | ||||  ||||| | |   |||    
T  19653737 attataggtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaaatagtgtaatggccca-cttgaaa 19653639  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  19653638 atttaaataattcaattataggtct-atttgtgagattttatacaatttt 19653590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 248
Target Start/End: Original strand, 7776931 - 7776983
Alignment:
Q  196 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7776931 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7776983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 232
Target Start/End: Original strand, 18669047 - 18669131
Alignment:
Q  149 gttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 232  Q
    |||| |||| ||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18669047 gtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga 18669131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9046131 - 9046060
Alignment:
Q  157 tgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 228  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9046131 tgatccaaatttccacaaagtggtatagtggcccaccaaaaaatttaaataattcaattatatgtctatttt 9046060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 133416 - 133564
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||   || || |||||| |||||| |||| | |||||| | || ||||    
T  133416 attataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggccca-cctaaaa 133514  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    | || ||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  133515 aatttaataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataatttt 133564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Original strand, 133424 - 133565
Alignment:
Q  108 tatattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaata 207  Q
    |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |  || || |||||   |||||||||| |||||| |||||  |||| || ||||    
T  133424 tatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaaaaatttaata 133523  T
Q  208 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttta 249  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| |||| | |||||||    
T  133524 attcaatcatagatctattttgtgagactttaaataatttta 133565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Original strand, 5734194 - 5734254
Alignment:
Q  306 ccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  5734194 ccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaa 5734254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 366
Target Start/End: Original strand, 18668994 - 18669150
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaatt----ttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||   ||||||| ||| ||| ||||| || |||| | |||| || | | | |||    
T  18668994 attataggtctactttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccg 18669093  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18669094 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga-tctttaaacaatttttcaa 18669150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 232
Target Start/End: Original strand, 18715047 - 18715131
Alignment:
Q  149 gttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 232  Q
    |||| |||| ||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18715047 gtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataagtctattttgcga 18715131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 366
Target Start/End: Original strand, 18735245 - 18735401
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatac----aattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||   ||||||| ||| ||| ||||| || |||| |||||| || | | | |||    
T  18735245 attataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtccacccg 18735344  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  18735345 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgtga-tctttaaacaatgtttcaa 18735401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9046131 - 9046036
Alignment:
Q  270 tgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||| || |||| |||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  9046131 tgatccaaatttccacaaagtggtatagtggccca-ccaaaaaatttaaataattcaattatatgtctattttatgagactttaaataatttttcaa 9046036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44817520 - 44817438
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccac 192  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  44817520 tattctgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccac 44817438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 5734198 - 5734235
Alignment:
Q  196 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5734198 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 5734235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9046174 - 9046134
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtc 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9046174 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtc 9046134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11975819 - 11975782
Alignment:
Q  211 caattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11975819 caattataggtctattctgcgagattttaaacaatttt 11975782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 246
Target Start/End: Original strand, 18714845 - 18714878
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaatt 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18714845 attataggtctactttgcgagattttatacaatt 18714878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 2763032 - 2763068
Alignment:
Q  212 aattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2763032 aattatatgtctattttgagagattttatacaatttt 2763068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 284
Target Start/End: Original strand, 5734132 - 5734196
Alignment:
Q  220 gtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccg 284  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||   || |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5734132 gtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcccg 5734196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 366
Target Start/End: Original strand, 18715095 - 18715150
Alignment:
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18715095 aaaatttaaattattcaattataagtctattttgcga-tctttaaacaatttttcaa 18715150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 100
Target Start/End: Original strand, 36584419 - 36584451
Alignment:
Q  68 agagcagtggcggagcctttcatgggctggggt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36584419 agagcagtggcggagcccttcatgggctggggt 36584451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670212
Alignment:
Q  204 aataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttt 45670212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19393
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19121 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 19220  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||| | ||||    
T  19221 tcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccaaaaaattggtgtagtggcccacccga 19320  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19321 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 19393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 362
Target Start/End: Original strand, 19114 - 19259
Alignment:
Q  216 ataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||||||    
T  19114 ataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaatt 19212  T
Q  316 taaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  19213 taaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 19259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 110 - 362
Target Start/End: Original strand, 65009 - 65261
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  65009 tattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 65108  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  65109 tcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 65208  T
Q  310 aaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  65209 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 65261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 110 - 382
Target Start/End: Original strand, 65122 - 65395
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  65122 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 65221  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  65222 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccg 65321  T
Q  309 aaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65322 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 65395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 65000 - 65147
Alignment:
Q  214 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||||    
T  65000 ttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaa 65098  T
Q  314 tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  65099 tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 65147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 119 - 394
Target Start/End: Original strand, 1188 - 1463
Alignment:
Q  119 agattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattata 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1188 agattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattata 1287  T
Q  219 ggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||    
T  1288 tgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaa 1387  T
Q  319 ataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccatcctaaca 394  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||    
T  1388 ataattcaattatagatttaatttgcgaaactttaaacagtttttcaatggtaaattttagtggcccaccctaaca 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 362
Target Start/End: Original strand, 1171 - 1317
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaat 314  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||    
T  1171 tataggtctacttttcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaat 1269  T
Q  315 ttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  1270 ttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaatttt 1317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1415
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg-aaaatttaaataa 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1292 tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 1391  T
Q  209 ttcaattataggtctattttgcga 232  Q
    ||||||||||| | || |||||||    
T  1392 ttcaattatagatttaatttgcga 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 110 - 327
Target Start/End: Original strand, 331847 - 332064
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  331847 tattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaatttaaataat 331946  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccga 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | || |    
T  331947 tcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccaa 332046  T
Q  310 aaaatttaaataattcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||    
T  332047 aaaatttaaataattcaa 332064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 331837 - 331985
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| || | | | ||| |||    
T  331837 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccg-aaa 331935  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  331936 atttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 331985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 382
Target Start/End: Original strand, 332441 - 332504
Alignment:
Q  319 ataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtgg 382  Q
    |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  332441 ataattcaattatagctctaatttgtaagactttaaacaatttttcaacagttaattttcgtgg 332504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 302
Target Start/End: Original strand, 11253 - 11445
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  11253 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatttaaataat 11352  T
Q  210 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggcc 302  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11353 tcaattatagatcaattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggcc 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11391
Alignment:
Q  213 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaa 312  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  11243 attatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatcc-aaaa 11341  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 362  Q
    |||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||| ||||||||    
T  11342 atttaaataattcaattatagatcaattttgcgagattttatacaatttt 11391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 82935 - 82785
Alignment:
Q  215 tataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccg--aaaa 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |  |||||||||  || |||| ||| || |||| | | |||  ||||    
T  82935 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 82836  T
Q  313 atttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 366  Q
    | ||||| ||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  82835 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 82785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 82927 - 82789
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccg---aaaatttaaat 206  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||  ||| ||  ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||   |||| |||||     
T  82927 tattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaaaattaaaa 82828  T
Q  207 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 248  Q
    ||   || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  82827 aa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 82789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 303901 - 303794
Alignment:
Q  223 tattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtggtggccaatccgaaaaatttaaataa 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||| ||  ||| |||||| |||| | |||||||   ||| |||||    
T  303901 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatttttttaataa 303802  T
Q  323 ttcaatta 330  Q
    ||||||||    
T  303801 ttcaatta 303794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 303901 - 303791
Alignment:
Q  110 tattttgcaagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaa-aatttaaataa 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||    
T  303901 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatttttttaataa 303802  T
Q  209 ttcaattatag 219  Q
    |||||||||||    
T  303801 ttcaattatag 303791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University