View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4704-Insertion-1 (Length: 1040)

Name: NF4704-Insertion-1
Description: NF4704
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4704-Insertion-1
NF4704-Insertion-1
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (7-1029)||(8545544-8546570)
chr7 (7-691)||(8570222-8570906)
chr7 (7-690)||(8576237-8576920)
chr7 (7-690)||(8581611-8582294)
chr7 (135-691)||(8559372-8559928)
chr7 (9-691)||(8537949-8538631)
chr7 (58-690)||(8601936-8602568)
chr7 (7-691)||(29577242-29577929)
chr7 (9-690)||(8382450-8383131)
chr7 (9-691)||(29581414-29582096)
chr7 (9-562)||(8609830-8610383)
chr7 (60-690)||(8585280-8585910)
chr7 (23-691)||(7877306-7877974)
chr7 (170-691)||(8635916-8636437)
chr7 (67-691)||(8667390-8668014)
chr7 (67-690)||(13333030-13333653)
chr7 (67-689)||(10493949-10494571)
chr7 (63-690)||(8646844-8647468)
chr7 (67-689)||(8654421-8655043)
chr7 (20-691)||(8590562-8591233)
chr7 (63-571)||(8659330-8659838)
chr7 (63-513)||(27830626-27831076)
chr7 (60-513)||(17267903-17268356)
chr7 (68-690)||(6789484-6790106)
chr7 (60-460)||(17260205-17260605)
chr7 (81-689)||(3147249-3147865)
chr7 (173-690)||(8628609-8629126)
chr7 (63-690)||(1301427-1302058)
chr7 (326-677)||(8671217-8671568)
chr7 (79-280)||(8017397-8017598)
chr7 (93-400)||(39985643-39985950)
chr7 (261-370)||(6786816-6786925)
chr7 (114-235)||(8102685-8102806)
chr7 (494-629)||(8640184-8640316)
chr7 (135-193)||(6786690-6786748)
chr7 (608-690)||(8610429-8610511)
chr7 (94-179)||(8616679-8616764)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (22-691)||(12528430-12529099)
chr8 (237-690)||(43744990-43745441)
chr8 (65-231)||(43744785-43744951)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (63-690)||(16661566-16662193)
chr2 (60-545)||(7542190-7542675)
chr2 (60-690)||(12244980-12245610)
chr2 (63-545)||(16657236-16657718)
chr2 (60-513)||(12258332-12258785)
chr2 (60-513)||(14703372-14703825)
chr2 (69-541)||(12234662-12235134)
chr2 (203-513)||(11999501-11999811)
chr2 (63-690)||(43625379-43626004)
chr2 (75-214)||(17621995-17622134)
chr2 (69-154)||(11999380-11999465)
chr2 (112-196)||(17718019-17718103)
chr2 (75-214)||(17648091-17648230)
chr2 (113-214)||(17705788-17705889)
chr2 (79-196)||(17716755-17716872)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (63-545)||(34466512-34466994)
chr1 (68-648)||(15595006-15595588)
chr1 (63-306)||(4678516-4678759)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (102-690)||(35132454-35133040)
chr4 (63-507)||(30775219-30775663)
chr4 (67-630)||(9335525-9336088)
chr4 (79-280)||(54396406-54396607)
chr4 (120-196)||(23587801-23587877)
chr4 (79-196)||(23596653-23596770)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (260-690)||(28220115-28220545)
chr5 (63-243)||(28219885-28220065)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (167-690)||(28910653-28911176)
chr6 (140-223)||(11133038-11133121)
chr6 (140-214)||(11156314-11156388)
chr6 (140-214)||(11196767-11196841)
chr6 (140-214)||(11199932-11200006)
chr6 (149-226)||(11170623-11170700)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 853; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 853; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1029
Target Start/End: Original strand, 8545544 - 8546570
Alignment:
Q  7 agtcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaa 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8545544 agtcaataccttgatataaagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaa 8545643  T
Q  107 ggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtga 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8545644 ggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaaagtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaa 8545743  T
Q  207 gtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8545744 gtgtctccagcagtggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8545843  T
Q  307 tctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacc 406  Q
    |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8545844 tcttatcaac-caattagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccggcaatttcacc 8545942  T
Q  407 tgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctct 506  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8545943 tgcatcttttgtggatctttgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctct 8546042  T
Q  507 cgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccgg 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546043 cgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccgg 8546142  T
Q  607 aaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgcnnnnnnntaagggca 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||    
T  8546143 aaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaaaggaatcactatatttccttccaattaacctctttgcatctgcaaaaaaaaaagggca 8546242  T
Q  707 catttacttcctattttcattttcatatcaactaataaacacatgagagcatagattcaatatttcacttg---ttctcttctacaatttttgtaacata 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  8546243 catttacttcctattttcattttcatatcaactaataaacacatgagagcatagattcaatatttcacttgtcattctcttctacaatttttgtaacata 8546342  T
Q  804 tttgacatttttggaagttttgaaaatggtaaaacatagttgttatggtttctgaaaaaacattttttctagtttgccttctatcttttatctagcacaa 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546343 tttgacatttttggaagttttgaaaatggtaaaacatagttgttatggtttctgaaaaaacattttttctagtttgccttctatcttttatctagcacaa 8546442  T
Q  904 ttatcaactatatgagtatatcaaacccatgttagcaatttaaaatgaataccaa--atatgtttttagaaagtaaacaggccct-aaatggtgatctat 1000  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8546443 ttattaac--tatgagtatatcaaacccatgttagcaatttaaaatgaataccaaatatatgtttttagaaagtaaacaagccctaaaatggtgatctat 8546540  T
Q  1001 aatatgttgtact-atgaaagtaaagaaca 1029  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8546541 aatatgttgtactaattaaagtaaagaaca 8546570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 691
Target Start/End: Original strand, 8570222 - 8570906
Alignment:
Q  7 agtcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaa 106  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  8570222 agtcaattcccttatatatagcatctagctcaattgtggcctcagtatcatatgaaagtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaa 8570321  T
Q  107 ggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtga 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  8570322 ggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaaagtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtga 8570421  T
Q  207 gtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8570422 gtgtctccagcagtggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8570521  T
Q  307 tctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacc 406  Q
    |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8570522 tcttatcaacaaaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacc 8570621  T
Q  407 tgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctct 506  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8570622 tgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggagactccaaaaatgcttctgcaatctct 8570721  T
Q  507 cgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccgg 606  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||||  ||| ||||||    
T  8570722 cgcatctttgagagaatcacagatgatatttcttcagctacaaaacgtttttccttacccatgtacttcacaatgattgttggtttgttgttagcaccgg 8570821  T
Q  607 aaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8570822 agatgaccttaaagggccacaaaagtcgatccatctgaacgatggaatcactatacttccttccaattaacctctttacatctgc 8570906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 690
Target Start/End: Original strand, 8576237 - 8576920
Alignment:
Q  7 agtcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaa 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  8576237 agtcaatacctttatatatagcatctagttcaattgtggcatcagtgtcatatgaaagtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaa 8576336  T
Q  107 ggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtga 206  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||  || |||||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  8576337 ggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaaagtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtga 8576436  T
Q  207 gtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttc 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8576437 gtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8576536  T
Q  307 tctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacc 406  Q
    | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8576537 ttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacc 8576636  T
Q  407 tgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctct 506  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  8576637 tgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataagcaggcacagaaatcactgcattcttaacaggtgtctgcagaaaagcctctgcaatctct 8576736  T
Q  507 cgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccgg 606  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  8576737 cgcatctttgagagaatcacagatgatatttcttcagcaacaaagcgtttttcctcacctttgtagttcacaacgattgtcggtttgtcattagtaccgg 8576836  T
Q  607 aaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
     ||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8576837 caatgaccttaaagggccacaaaagacaatccttctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacctctttgtatctg 8576920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 690
Target Start/End: Original strand, 8581611 - 8582294
Alignment:
Q  7 agtcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaa 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| || || |||||||| || |     
T  8581611 agtcaataccttgatgtatagaatctaggtcaattgtggcctcagtgtcatatgaaagtgtccttttcgctctctcacaagcagtcctcaaccttctaat 8581710  T
Q  107 ggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtga 206  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||||| || |  || ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  8581711 ggcttttggatttccaataatctcctctttatgttttctcttgaactccgacacaaagtgattcaccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtga 8581810  T
Q  207 gtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8581811 gtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgagaatagacacatcaaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttc 8581910  T
Q  307 tctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacc 406  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  8581911 tcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacc 8582010  T
Q  407 tgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctct 506  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8582011 tgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctct 8582110  T
Q  507 cgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccgg 606  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |    
T  8582111 cgcatctgtgtcagaataacagatgatatttcttcagcaagaaagtgtttttccttacccttgtagttcacaacgattgtcggtttgtcattagcacctg 8582210  T
Q  607 aaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
       ||||||| ||||||||||||   | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8582211 cggtgaccttgaagggccacaacttgatatccttttgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacctctttgcatctg 8582294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 135 - 691
Target Start/End: Original strand, 8559372 - 8559928
Alignment:
Q  135 ttgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaa 234  Q
    |||||||||||||  ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  8559372 ttgttcttcctctcaaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaa 8559471  T
Q  235 agaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttg 334  Q
    |||  ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  8559472 agagattattcttaattgtgagaagagaaacatcaaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttctctctttaacacaattagatctcttttg 8559571  T
Q  335 aaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaa 434  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  8559572 aagtccatatgcaagagcagctgcagttggttcattgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaa 8559671  T
Q  435 tcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgata 534  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||    
T  8559672 tcattaaaataagcaggtacggtaatcacagcattctcaaccgtcgactccaaaaatgcttctgcaatctctcgcatctgtgtgagaatcatagctgata 8559771  T
Q  535 tttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtag 634  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||  ||| |||| |||||||| |  || |||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||     
T  8559772 tttcttcggcaacaagatgcttttccttgcccctgtatttcacaaggaccgttggtttgtcattatcgccagcgatgaccttaaagggccacaacagtac 8559871  T
Q  635 atcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    |||| | || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8559872 atcactttggactatggaatcactgtatttccttccaattaacctctttgcatctgc 8559928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 691
Target Start/End: Original strand, 8537949 - 8538631
Alignment:
Q  9 tcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaagg 108  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||  |    
T  8537949 tcaacaccctgacatatagcatctatatcaattgtggcttcagtgtcgtaagaaagcgacctttttgccctctcgcatgcagttctcaacttcctcagag 8538048  T
Q  109 cttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagt 208  Q
    ||||||  || |||||||| ||  | ||||| |||||||| || || |||| ||| || |||||||  |  ||||||||||| || || || ||||||||    
T  8538049 cttttgaatttccactaatgtcaactttgtttttcctcttcaattcattcacaaaatgattcaccaaccgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 8538148  T
Q  209 gtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctc 308  Q
     ||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| || | |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  8538149 atctccggcagtggccttgactgtaaaggcattattcttcaatgtaaggagagatacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaacttttctc 8538248  T
Q  309 tcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctg 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| |    
T  8538249 tcttcaacacaattagctctcttttgaaggccgtatgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaatgacaccag 8538348  T
Q  409 catctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcg 508  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || || | ||| ||    
T  8538349 catctttggtggctcttcgctgtgaatcattgaaataagcaggtactgtaatcactgcatttttgacaggtgactccaaaaatacttcagcgaactcccg 8538448  T
Q  509 catctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaa 608  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||  |  |||| | |||  | ||||| |||||| || | | |    
T  8538449 catctttgtgaggaccatagctgatatttcttcagcaaaaaagtgtttctcttcccccttacacgtcacgacaatcatgggtttatcattagcatcagca 8538548  T
Q  609 atgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
     | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  8538549 tttaccttgaagggccacaacagtaaatcattctgaataacagaatcactatattttcttccaaccaacctcttagcatctgc 8538631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 58 - 690
Target Start/End: Original strand, 8601936 - 8602568
Alignment:
Q  58 atgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactcctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| || |   |  | ||| |||||||||| ||||   | | |||||| ||||||||| |    
T  8601936 atgaaagtgtcctttttgtcctctcgcaggccgttcttaaccttctaagcaccctcgggctcccactaatgtccttcatatacttcctgttgaactccat 8602035  T
Q  158 cataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaaga 257  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||    
T  8602036 aacaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgaga 8602135  T
Q  258 atagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccg 357  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8602136 agagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctg 8602235  T
Q  358 cagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagt 457  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||| || |||||    
T  8602236 cagttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcacagt 8602335  T
Q  458 aatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttt 557  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||||| ||  |||| ||  ||||| ||||| ||||||   |||||||||    
T  8602336 aacaactgcattcttgacaggtgactccagaaacttctctgcaatttcacgcatctttgtaaggaccattgatgagatttcctcagcacagaagtgcttt 8602435  T
Q  558 tcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcac 657  Q
    ||| ||||||| || || ||||  ||    |||||||||| |   || | ||  |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  |  |||||||    
T  8602436 tccccacccttatacttaacaatgatctcaggtttgtcatcattgccaggaacaaccttaaatggccacaaccgtatgtcattctgaatgacagaatcac 8602535  T
Q  658 tatatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8602536 tatatttccttccaattaacctctttgcatctg 8602568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 29577929 - 29577242
Alignment:
Q  7 agtcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaa 106  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| | |||| ||    
T  29577929 agtcaataccctgacatatagcatctatgtcaattgtggcctcaatgtcatatgaaagtgccctctttgccctctcacaagcagttctcagcttccttaa 29577830  T
Q  107 ggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtga 206  Q
     ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| || || |||||||||    
T  29577829 agcttttgggttcaaactaatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtga 29577730  T
Q  207 gtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttc 306  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||    | ||  |||| ||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||    
T  29577729 gtatcaccagcagtggcctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagagacacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaagatgaatacatttc 29577630  T
Q  307 tct---cttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttc 403  Q
     ||   |  ||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||       
T  29577629 gctttccaacaacaaaattacctctcttttgaattccatatgcaagtgcagcagcagttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataat 29577530  T
Q  404 acctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatc 503  Q
     || |||||||| |||||| |||  || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  29577529 gccggcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagctggcactgtgatcactgcattctttacgggtaactccaaaaatttctctgcaatc 29577430  T
Q  504 tctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacac 603  Q
    ||  |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||| || |  |||||||| || ||||| ||  | || ||||||| | | |    
T  29577429 tcctgcatctttgagaggatcatagacgatatttcctcagcaacaaagcacttctctttgcccttgtacttaacaaggatcttgggattgtcatcagctc 29577330  T
Q  604 cggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    | | ||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29577329 caggaatgaccttaaagggccacaactttatatctttccgaataatggaatcactgaatttccttccaattaacctcttcgcatctgc 29577242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 8383131 - 8382450
Alignment:
Q  9 tcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaagg 108  Q
    |||||||| | ||| | |||||||| |||||| | ||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || |  |    
T  8383131 tcaataccctcatacagagcatctatgtcaatcgcggcctcaatatcaaatgaaagtgtcctttttgccctctcgcaagccgttcttaaccttctaagag 8383032  T
Q  109 cttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagt 208  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |  | |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  8383031 cctttgggttcccactaatgtccttattatgcttcctcttgaactcgtcaacaaagtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagt 8382932  T
Q  209 gtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctc 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8382931 gtctccggcagtggccttcacaacaaagacattattcttaattgtgaggagagacacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctc 8382832  T
Q  309 tcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctg 408  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| |    
T  8382831 tcttcaagacaattagctctcttctgaaggccatatgcaagagcagcggcagttggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccag 8382732  T
Q  409 catctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcg 508  Q
    ||||||| |||||| | | ||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  ||| ||||||  | |||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  8382731 catcttttgtggctttccgttgagaatcattgaaatatgcaggcacggtaacaactacattctcgataggtgactccaaaaaattctctgcaatctcacg 8382632  T
Q  509 catctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaa 608  Q
    ||||| |  ||||| || ||| || ||||| || |||  || ||| |||||||||||||| || || ||||  ||    || ||||||| |  ||| | |    
T  8382631 catctttttgaggaccatagaggagatttcctcggcacaaaggtgtttttcctcacccttatacttaacaattatctcaggcttgtcatcagaaccagca 8382532  T
Q  609 atgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    |  || ||||| ||||| ||  |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8382531 agtactttaaatggccataattgtatgtcattctgaataatagaatcactatatttccttccaatcaatctctttgcatctg 8382450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 29582096 - 29581414
Alignment:
Q  9 tcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaagg 108  Q
    |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| | |||| || |    
T  29582096 tcaataccttgacaaatggcatctacgtcaattgtggtctcaatgtcaaatgaaagtgtcctctttgccctctcacaagctgttctcagcttccttaaag 29581997  T
Q  109 cttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagt 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||  |||||  |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  29581996 cttttgggttcccactaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcgcaaagtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagt 29581897  T
Q  209 gtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctc 308  Q
     || |||||||||||||| ||||||||    | ||  || | ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||      
T  29581896 atcgccagcagtggccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaatatatttcgt 29581797  T
Q  309 tcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctg 408  Q
    | | ||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||    || |    
T  29581796 tttccaacaaaattacctcccttttgaataccatatgcaagtgcagcagcagttggttcgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccag 29581697  T
Q  409 catctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcg 508  Q
    ||||||| |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||  ||||||||| ||  |    
T  29581696 catctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtaatcactgcattctttacaggcaattccaaaaatttctctgcaatatcatg 29581597  T
Q  509 catctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaa 608  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || ||||||| |   || | |    
T  29581596 catctttgagaggatcatagatgatatttcctcagcaacaaacctcttctcttcacccttgtacttaacaaggatcatgggattgtcatcagtgccagca 29581497  T
Q  609 atgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    |  |||||||||||||||||   || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  29581496 actaccttaaagggccacaaatttatatcatcctgaataatagaatcactatattttcttccgattaacctctttgcatctgc 29581414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 562
Target Start/End: Original strand, 8609830 - 8610383
Alignment:
Q  9 tcaataccttgatatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaagg 108  Q
    |||||||| | | |||||||||| |  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| |  |    
T  8609830 tcaataccctcagatatagcatcaatatcaattgtggcctccgtgtcaaatgaaagtgtcctctttgccctctcacaagcagtcctcaacctcctaagag 8609929  T
Q  109 cttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagt 208  Q
    |  | | ||||||||| ||||| |     | |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| || || || ||||||||    
T  8609930 ccctcgagttcccactgatatcttttgaatgcttccttttgaactccttcacaaagtgattaaccattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 8610029  T
Q  209 gtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctc 308  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||  | || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  8610030 atctccagcagtagccttgacatcgaaagcattgtttttaattgtgagaacagacacatcgaaagtcccaccaccaagatcaaagataaaaatatttcta 8610129  T
Q  309 tcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctg 408  Q
    | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||| |||  |||| |    
T  8610130 ttttccacacaattagctctcttctgaagaccatatgcaagagccgcagccgttggttcattgataatccggattacattaaggccagaaatgacaccag 8610229  T
Q  409 catctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcg 508  Q
    ||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||   |||||||||||||  ||| || ||||||      
T  8610230 catcttttgtggctttccgctgagaatcattaaaataagcaggcacagtgatcactgcatctttaacctttgactccaaaaatttctcggctatctcttt 8610329  T
Q  509 catctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctc 562  Q
    ||| | ||  ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8610330 catttttgcaaggatcatagatgaaatttcctccgcaacaaagtgcttttcctc 8610383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 8585910 - 8585280
Alignment:
Q  60 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||| || ||||  |    
T  8585910 gaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaa 8585811  T
Q  160 taaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaat 259  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||| | |||||| || || || ||||||||||| | |  ||||||||| || |     
T  8585810 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggag 8585711  T
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||  || |||||||| || | || | |||||||||||||| ||| || |||    
T  8585710 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacagttacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagca 8585611  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||  |||| |||||  | |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  8585610 gtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacagtca 8585511  T
Q  460 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttc 559  Q
      |||||||| | ||||||||| | |||| ||| |||||||||||    ||| | || |||||| | |||||||||||| ||||||   | || ||||||    
T  8585510 caactgcattttgaacaggtgatttcaaatatgtctctgcaatcttcttcatgtttgtgaggatgatagatgatatttcctcagcacataggttcttttc 8585411  T
Q  560 ctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcacta 659  Q
     | ||||||||| || |||  |||  | ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||    
T  8585410 ttgacccttgtacttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagagataaccttgaatggccacaacattatatcattttgaacaacgggatcacta 8585311  T
Q  660 tatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
     | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  8585310 aacttcctaccaattaacctcttggcatctg 8585280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7877974 - 7877306
Alignment:
Q  23 tatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttccca 122  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| | |||  | ||||| |||    
T  7877974 tatagcatctatgtcaattgtagtctcagtatcaaatgacagtgtccttttagccctctcacatgcagttctcaacctcctaagggccctcgggtttcca 7877875  T
Q  123 ctaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtgg 222  Q
    | ||| ||| | || ||||||||||| |||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  7877874 ccaatgtccactttattcttcctcttaaactccatcactaaatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtag 7877775  T
Q  223 ccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagtt 322  Q
    |  | || ||||||   | || ||| | ||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || | |||||  | | | |     ||    
T  7877774 ctattacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagagacacatcgaaagtgccaccaccaagatcaatgatgaacacatttcgttttccgatgttatt 7877675  T
Q  323 agctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggct 422  Q
       |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| | |||| |||||||| ||||||    
T  7877674 tattctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagttggttcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggct 7877575  T
Q  423 cttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagagga 522  Q
     ||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||  ||||    
T  7877574 tttcgttgagaatcattgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggtgactccaaaaacttctctgcaatctcgcgcatctttgtaagga 7877475  T
Q  523 tcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaaggg 622  Q
    |||  ||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||    || ||||||| |  ||| | ||  |||||||| ||    
T  7877474 tcatggatgatatttcctcggcacaaaagtgcttttcctcgcccttatacttaacaatgatatcaggcttgtcatcagaaccagcaacaaccttaaatgg 7877375  T
Q  623 ccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7877374 ccacaacagaatatcattctgaataacagaatcgctatatttccttccaatcaacctctttgcatctgc 7877306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 170 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 8636437 - 8635916
Alignment:
Q  170 caccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| | |  ||||||| | || |||||||| ||     
T  8636437 caccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggctttaacttcaaagacttcacctttaattttgagtatagacacgtcg 8636338  T
Q  270 aaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcat 369  Q
    || || ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||||    
T  8636337 aatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacacagttacctctcttttgaagtccatacgcaaaagctgcagcagttggttcat 8636238  T
Q  370 tgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcatt 469  Q
    |||||||||| || ||||| || || |||||  |||| |||||||| |||| | | |  || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  8636237 tgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggatttacgctgagaatcattgaaataagcgggcacagtaatgactgcatt 8636138  T
Q  470 cttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttg 569  Q
    ||| |||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||  |||| || ||| |||||||| |||| || ||  |||||||  |||||||||    
T  8636137 cttgacagatgattccagatatgcctcagcaatctctcgcatctttgtcaggaccatagacgatatttcctcaggaaaaagttgcttttgttcacccttg 8636038  T
Q  570 tagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttc 669  Q
    || ||||||| |||  | |||||||||| |  ||| | ||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||    
T  8636037 tatttcacaacaatcatgggtttgtcatcacgaccagcaattaccttaaagggccacatatttagatcattctgaattattggatcactataattccttc 8635938  T
Q  670 caattaacttctttgcatctgc 691  Q
    |||| ||| | ||| |||||||    
T  8635937 caatcaacctttttacatctgc 8635916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 691
Target Start/End: Original strand, 8667390 - 8668014
Alignment:
Q  67 tcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||| | || |||||| | || |||||||  | ||| |     
T  8667390 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgactgatgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaata 8667489  T
Q  167 gttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacaca 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| | |   |||||||| || |||||||||    
T  8667490 gttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacaca 8667589  T
Q  267 tcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggtt 366  Q
    |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||      || |||||| |  |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  8667590 tcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggctaccatcacagtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgccgcagtaggtt 8667689  T
Q  367 cattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||   ||| |||||| | |||||  |||  || |||||||| || ||||| || |||||||  || ||    
T  8667690 cattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacggc 8667789  T
Q  467 attcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcaccc 566  Q
    |||||| || || ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||  || | || ||| |||||||| ||||||  ||||||||| || | ||||    
T  8667790 attcttgaccggcgaccccagatatgcctccgcaacctctcgcatctttgtaagcaccatagaagatatttcctcagcacaaaagtgcttctcttgaccc 8667889  T
Q  567 ttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttcc 666  Q
    ||||| || |||  |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||  | ||||||| ||  |||||| | ||||    
T  8667890 ttgtacttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaacaatatatctctttgaacaacggggtcactaaacttcc 8667989  T
Q  667 ttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||    
T  8667990 taccaattaacctcttagcatctgc 8668014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 13333653 - 13333030
Alignment:
Q  67 tcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtg 166  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | || |||||| | ||||||||||  | ||| |     
T  13333653 tccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaata 13333554  T
Q  167 gttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacaca 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| | |    |||||||||| |||||||||    
T  13333553 gttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtgagtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacaca 13333454  T
Q  267 tcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggtt 366  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||   || |||| | |  |||||| | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  13333453 tcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcgcttaccatcacaatcacgtctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggtt 13333354  T
Q  367 cattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgc 466  Q
    |||||||||| || |||| ||| || ||||||||  |||| |||||| | |||||  |||  || |||||||| || ||||| || |||||||  || ||    
T  13333353 cattgattattcgaatgatattaaggccagcaatagcaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagccggcacagtaacaacggc 13333254  T
Q  467 attcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcaccc 566  Q
    |||||| || |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||| || |||  ||||||||| || | ||||    
T  13333253 attcttgactggtgaccccatatatgcctctgcaacctctcgcatctttgtaaggaccatagatgatatttcctcggcacaaaagtgcttctcttgaccc 13333154  T
Q  567 ttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttcc 666  Q
    ||| | ||  |   |||  | || ||||| || ||||| ||| | ||||| || |||||||||| || |||||| |||||||  | ||||||| | ||||    
T  13333153 ttgcacttagcggtaatcataggcttgtcgttgacaccagaagtaaccttgaatggccacaacattatatcattttgaacaaccggatcactaaacttcc 13333054  T
Q  667 ttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    | ||||||||| |||| |||||||    
T  13333053 taccaattaacctcttagcatctg 13333030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 67 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 10494571 - 10493949
Alignment:
Q  67 tcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||| | || |||||| | ||||||||||  | ||| |     
T  10494571 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaata 10494472  T
Q  167 gttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacaca 266  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||  || |||||||| || ||||||||||| | |   |||||||| || |||||||||    
T  10494471 attcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacaca 10494372  T
Q  267 tcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggtt 366  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||  |   |  |||| | |  |||||| | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  10494371 tcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccctcacaatcacttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggtt 10494272  T
Q  367 cattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||  || ||    
T  10494271 cattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgttgaagtaagccggcacagtaacaacagc 10494172  T
Q  467 attcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcaccc 566  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |   |||| || |||||||||||| || |||  ||||||||| || | ||||    
T  10494171 attcttgactggtgaccccaaatatgcctctgcaacctctcgcatctttataaggaccatagatgatatttcctcggcacaaaagtgcttctcttgaccc 10494072  T
Q  567 ttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttcc 666  Q
    ||||| ||  |   |||  | ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||||| || ||| || |||||||  | ||||||| | ||||    
T  10494071 ttgtacttagcggtaatcataggtttgtcattgacacctgaagtaaccttgaatggccacaacattatatcgttttgaacaaccggatcactaaacttcc 10493972  T
Q  667 ttccaattaacttctttgcatct 689  Q
    | ||||||||| |||| ||||||    
T  10493971 tgccaattaacctcttagcatct 10493949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 690
Target Start/End: Original strand, 8646844 - 8647468
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||| ||| | ||||||||| | || || || |    ||    
T  8646844 agtgtcctttttgctctctcgcatgccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaa 8646943  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||| || || | |||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  8646944 agtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagaga 8647043  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||| |||| || | |||||| | |||||||||||| ||||| || || ||     
T  8647044 cacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatatttcgttcttcagcacaatttgttctcttgtcaaggccatatgcgagagcagcagctgtt 8647143  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||  | || |||||| |||||||| |||  ||  ||||||| || || ||||| |||||||  |    
T  8647144 ggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggcttttcgctgataatcattgaagtatgcaggcacagtaacaa 8647243  T
Q  463 ctgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctc 562  Q
    |||||||||| ||||| |||   ||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||  | |  |||| || ||    
T  8647244 ctgcattctttacaggggacattaaatatttctctgcaacctctcgcatctttgtgaggatcatcgatgatatttcctcagcacaataacgcttctcttc 8647343  T
Q  563 acccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatat 662  Q
    ||||||||| || |||| |||  | ||||||||||| || ||   ||||||||| || |||||||||     ||||||||||||||  ||||||  | |     
T  8647344 acccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacccc---aatgaccttgaatggccacaacttcttatcattctgaacaacagaatcaaaaaac 8647440  T
Q  663 ttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    ||||| || |||||| |||| |||||||    
T  8647441 ttcctaccgattaacctcttagcatctg 8647468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 689
Target Start/End: Original strand, 8654421 - 8655043
Alignment:
Q  67 tcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||| | || |||||| | ||||||||||  | |||||     
T  8654421 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagta 8654520  T
Q  167 gttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacaca 266  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||| | |   |||||||| || |||||||||    
T  8654521 gtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacaca 8654620  T
Q  267 tcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggtt 366  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |  |   || || |||||  || ||| | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  8654621 tcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggtt 8654720  T
Q  367 cattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgc 466  Q
    |||||| |||||| ||||| || || ||||||||  |||| |||||| | || ||| |||  || || ||||| || || || || |||||||  ||  |    
T  8654721 cattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgac 8654820  T
Q  467 attcttaacaggtgactccaa-aaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacc 565  Q
    ||| || || ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| ||  || | | ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||    
T  8654821 atttttgacgggtga-tccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttgacc 8654919  T
Q  566 cttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttc 665  Q
     ||||| || |||  |||  | ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||||||||  | ||| || |||||||| | ||||||||| |||    
T  8654920 tttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttc 8655019  T
Q  666 cttccaattaacttctttgcatct 689  Q
    || ||||||||| |||| ||||||    
T  8655020 ctaccaattaacctcttagcatct 8655043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Original strand, 8590562 - 8591233
Alignment:
Q  20 atatatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttc 119  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||| |  ||  ||| ||||    
T  8590562 atatatagcatctatgccgattgttgcctcagtatcatatgacagtgtccttttagccctctcacaagctgttttcaacctcctaagagcccttgcgttc 8590661  T
Q  120 ccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcag 219  Q
    ||||| | |||| | || ||||||||| | ||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| | ||    
T  8590662 ccacttaaatccactttattcttcctcctaaactccttcaccaaatggtgaaccattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaag 8590761  T
Q  220 tggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacaca 319  Q
    |||| || || ||||||   | |  ||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||  | | | |        
T  8590762 tggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaacacatttcgttttccgatgtt 8590861  T
Q  320 gttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtg 419  Q
      |  |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||  |||| |||||||| ||     
T  8590862 actttctctcttttgaaggccatatgcaaggccagcggcagttggttcattaattatccgcattacattcaagccagcaatgacaccagcatctttggta 8590961  T
Q  420 gctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgaga 519  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    || |||||||||||||||| || ||    
T  8590962 gctttcctctgagaatcattaaaataagctggcacagtaacaactgcattcttgacaggtgactccaaaaacttttcagcaatctctcgcatctttgtga 8591061  T
Q  520 ggatcacagatgatatttcttcagcaacaaag-tgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaa 618  Q
    | | ||  ||||| ||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||  |||   || ||||||| || ||||||||  |||||||    
T  8591062 gaaccatggatgagatttcctccgc-acaaagacgcttttcctcacccttgtacttaacaatgatttcaggcttgtcatcaaaaccggaaacaaccttaa 8591160  T
Q  619 agggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    | ||||||||    |  ||||||||||  |  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8591161 atggccacaattccatgtcattctgaattacagaatcactgaatttccttccaatcaacctctttgcatctgc 8591233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 571
Target Start/End: Original strand, 8659330 - 8659838
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| | || |||||| | ||||||||||  | ||    
T  8659330 agtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaa 8659429  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| | |   || |||||||| |||||    
T  8659430 agtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaagtggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggataga 8659529  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||   |   || |||||| | ||||||| | ||  |||||||||| ||| || |||||     
T  8659530 cacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattttgtttaccatcacagtcacctctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagta 8659629  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||  |||| | |||| | |||||| |||  || |||||||| || || ||||| || ||||  |    
T  8659630 ggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccggaatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaactatgcaggcactgtaacaa 8659729  T
Q  463 ctgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctc 562  Q
    | |||||||| |||||||||   | | ||| ||||||||  |||||||| | ||  || | || |||||||||||| || |||  ||||||||| ||||     
T  8659730 cagcattcttcacaggtgacattagatatgtctctgcaacttctcgcatttttgtaagtaccatagatgatatttcctccgcacaaaagtgcttctcctg 8659829  T
Q  563 acccttgta 571  Q
    |||||||||    
T  8659830 acccttgta 8659838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27831076 - 27830626
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | |||||| |||||||| ||| || ||    
T  27831076 agtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttcccactaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaa 27830977  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    | | ||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||  |||||||||| || |||    
T  27830976 aatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagttgccttaacttggaagaccttatccttaattgtaacaagaga 27830877  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||| |  ||| ||  | | || | || | | | |||||||||||||| ||| || |||||     
T  27830876 cacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtatattttgttcccgtgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagta 27830777  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    || ||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| | ||||  ||||||| ||| ||| || ||||| |||||||| || || || || |    
T  27830776 ggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggcttttcgttgagagtcattgaaataagctggcacggttatta 27830677  T
Q  463 ctgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatct 513  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  27830676 ctgcattcttaaccggtgattgcaaatatgcctccgcgatctctcgcatct 27830626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 513
Target Start/End: Original strand, 17267903 - 17268356
Alignment:
Q  60 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |   || || ||||| ||||  ||||  |    
T  17267903 gaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttgggttcccaacaattttcaatttttttttccttttgatttcctcaa 17268002  T
Q  160 taaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaat 259  Q
     ||| | ||  |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||  |     
T  17268003 caaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgag 17268102  T
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||| || |||    
T  17268103 agacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttcaacacagttagttctcttgccaaggccatatgcaatagctgcagca 17268202  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
    || ||||||||||||| |  ||  ||||| || ||||||||  |||| |||||| | |||||| |||  || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  17268203 gttggttcattgattaccttcaatacattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcgttgaagtaagccgggacagtaa 17268302  T
Q  460 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatct 513  Q
    | || |||||| |||| | ||| || | | || |||| |||||||| |||||||    
T  17268303 tgacagcattcataaccgatgattctagatattcctcagcaatctcccgcatct 17268356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 690
Target Start/End: Original strand, 6789484 - 6790106
Alignment:
Q  68 cctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtgg 167  Q
    |||||| ||| | ||||| || ||||||||||| || |||||  ||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    ||||| |    
T  6789484 ccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtag 6789583  T
Q  168 ttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacat 267  Q
    || |||| || |||||||||||| || || || |||||||||| |||| | |||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||    
T  6789584 tttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtggccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacat 6789683  T
Q  268 caaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttc 367  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||| | ||| || |  | |||| |||||| | |||||||||||||||||| || || || |||||    
T  6789684 cgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaattagttctcttatcaaggccatatgcaagagcagcagctgttggttc 6789783  T
Q  368 attgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgca 467  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||||  |||| ||||||  ||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6789784 attgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtggctttccgttgagaatcattgaaataagcaggcacagtaataactgca 6789883  T
Q  468 ttcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaag-tgcttttcctcaccc 566  Q
    || || |    ||||| |||| ||  ||| |||||||| |||||||  | |||||||| ||| || | ||| ||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  6789884 ttttttatctctgactgcaaatatttctcagcaatctcccgcatcttggtgaggatcatagacgaaacttcctcaac-acatagttgcttctcctcaccc 6789982  T
Q  567 ttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttcc 666  Q
    || || |  |||| |||  | || |||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||  ||||||||| | ||||    
T  6789983 ttatactcaacaacaatcatgggcttgtcattgacgccagcaatgaccttgaatggccaaaacatcatatcattttgaacaacagaatcactaaacttcc 6790082  T
Q  667 ttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    | ||||||||| |||| |||||||    
T  6790083 taccaattaacctcttagcatctg 6790106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 460
Target Start/End: Original strand, 17260205 - 17260605
Alignment:
Q  60 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||   || ||| | || |||| |||||  |    
T  17260205 gaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttcccaataatgtccaattttttcgttcttttgatctcctcta 17260304  T
Q  160 taaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaat 259  Q
     ||| | || ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||  |     
T  17260305 caaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgag 17260404  T
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| |   ||| |||||| |||| ||||||   |||||||||||||| ||| || |||    
T  17260405 agacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaaacacaattagttctcttgacaaggccatatgcaatagctgcagca 17260504  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
     | |||||||| |||| |  ||  ||||  || ||||||||  |||| |||||| | |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17260505 ataggttcattaattaacttcaaaacataaaggccagcaataacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggaacagtaa 17260604  T
Q  460 t 460  Q
    |    
T  17260605 t 17260605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 689
Target Start/End: Original strand, 3147249 - 3147865
Alignment:
Q  81 tcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgt 180  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||     ||||| ||||||||| || |    
T  3147249 tcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcactaatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctat 3147348  T
Q  181 tatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccacc 280  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||| ||| ||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3147349 tatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggccttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccacc 3147448  T
Q  281 gccaagatcaaagataaaaatatttctctcttc--------aacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattga 372  Q
     || |  ||||||||||||||||| | ||| ||         ||||| |||| |||||| |  || ||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||    
T  3147449 acccaagtcaaagataaaaatattacgctcctctacacaattacacaattagttctcttgtccagtccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattga 3147548  T
Q  373 ttatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattctt 472  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||  |||| |||||| | || ||| | |  || | |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3147549 ttatccgcataatattaaggccagcaataacaccagcatctattgtcgctttccgctgagcatcattgaaataagcaggtacggtaacaactgcattctt 3147648  T
Q  473 aacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtag 572  Q
     |||||  | || |||||  |||||||| |||  ||||||| ||  || | || |||||| ||||||||||||   | |||||| ||||  |||||| |     
T  3147649 gacaggcaattctaaaaactcctctgcagtcttgcgcatctttgttagaaccatagatgagatttcttcagcacataggtgcttctcctgtcccttgcac 3147748  T
Q  573 ttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaa 672  Q
    || ||   |||  | ||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||  | |||||| |||||||  ||||||| | | ||||| ||||    
T  3147749 ttaaccgaaatcatgggtttgtcattcactccgcaaatgaccttgaatggccacaacatcatatcattttgaacaacagaatcaccaaacttcctaccaa 3147848  T
Q  673 ttaacttctttgcatct 689  Q
    ||||| |||||||||||    
T  3147849 ttaacctctttgcatct 3147865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 690
Target Start/End: Original strand, 8628609 - 8629126
Alignment:
Q  173 cattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaa 272  Q
    |||||||||||||||||| || || || |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| | |  ||||||||| || | |||||||||||||    
T  8628609 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 8628708  T
Q  273 gttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattga 372  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||  || ||||  || || | || | |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||    
T  8628709 gtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattga 8628808  T
Q  373 ttatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattctt 472  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||||||  |||| ||||   | |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| || || |  |||||||| ||    
T  8628809 ttatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcattttt 8628908  T
Q  473 aacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtag 572  Q
     |||||||| | |||| | |||||||||||||    ||| | ||  ||||| | |||||||||||| ||||||   | || ||| || | |||||||||     
T  8628909 tacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctcagcacataggttcttctcttgacccttgtac 8629008  T
Q  573 ttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaa 672  Q
    || |||  |||  | || |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||  | ||| || |||||||  | ||||||| | ||||| ||||    
T  8629009 ttaacagcaatcataggcttgtcattaagaccagaaataaccttgaatggccagaacatgatatccttttgaacaacaggatcactaaacttcctaccaa 8629108  T
Q  673 ttaacttctttgcatctg 690  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  8629109 ttaacctcttggcatctg 8629126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 690
Target Start/End: Original strand, 1301427 - 1302058
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||| ||| | || |||||| |  |||||||||  | ||    
T  1301427 agtgtcctttttgccctctcacacgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttctgaactcctctacaa 1301526  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||| |     || || ||||| |||||    
T  1301527 agtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggataga 1301626  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcag-- 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |  |   || |||||| |  |||||| | ||  ||||| |||| ||| || ||||      
T  1301627 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagtcacttctcttgtcaaaaccatacgcaatagctgcagcagta 1301726  T
Q  361 --tcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagta 458  Q
      | |||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||  || |||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  1301727 gctaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaatgtgcaggcacagta 1301826  T
Q  459 atcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgctttt 558  Q
    |  || |||||  | || ||||||   | | ||| ||||||||| ||||||||||  |  |||| || |||||||||||| ||  |   ||||||||| |    
T  1301827 acaacagcatttgtcactggtgacattagatatgtctctgcaatttctcgcatcttcgtaaggaccatagatgatatttcctccacgcaaaagtgcttct 1301926  T
Q  559 cctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcact 658  Q
    ||| ||||||||| || |||| |||    ||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||  |  || || |||||||  ||||||||    
T  1301927 cctgacccttgtacttaacaacaatcacgggtttgtcattcacaccggcgatgaccttgaatggccacaacatcatgtctttttgaacaactgaatcact 1302026  T
Q  659 atatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    | | ||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  1302027 aaacttcctaccaattaatctcttagcatctg 1302058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 8671568 - 8671217
Alignment:
Q  326 tctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctctt 425  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||   ||| |||||  | |||||  ||    
T  8671568 tctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgtt 8671469  T
Q  426 cattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatca 525  Q
    |  || |||||||| || ||||| || || ||||  || |||||||| || |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||  || | ||    
T  8671468 cgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattcttgaccggtgactccagatatgcctccgcaacctctcgcatctttgtaagcacca 8671369  T
Q  526 cagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggcca 625  Q
     ||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||| | ||| || |||  |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  8671368 tagaagatatttcctcagcacaaaattgcttctctagaccttcgtacttgacagtaatcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggcca 8671269  T
Q  626 caacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaac 677  Q
    ||||| || |||  | |||||||  | ||||||| | ||||| |||||||||    
T  8671268 caacaatatatctctttgaacaaccggatcactaaacttcctaccaattaac 8671217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8017598 - 8017397
Alignment:
Q  79 tctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattct 178  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  | ||| || || ||||||||    
T  8017598 tctcacaagctgtcctcaacctcctaagtgctctagggtttccactaatatccttcttgttcttcctcttaaactcctgaacaaaatgattaaccattct 8017499  T
Q  179 gttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttcca 278  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||||| |||||||| |     | || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  8017498 gttgtcaaaatcttcaccaccaagatgggtatcaccagcagtagccttaacttcaaaaataccctcttcaatagtaagaagagacacatcaaaagtacca 8017399  T
Q  279 cc 280  Q
    ||    
T  8017398 cc 8017397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 400
Target Start/End: Original strand, 39985643 - 39985950
Alignment:
Q  93 ctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtctt 192  Q
    ||||||||||| |  ||| | ||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  39985643 ctcaacctcctaagagctctggggttgccactgatgtccttcttgttctttctcttgaactcttgaacaaagtggttcaccattctgttgtcaaaatcct 39985742  T
Q  193 caccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaa 292  Q
    |||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||     | || ||| || || | ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  39985743 cacctccaagatgggtgtctccggctgtggctttcacctcaaagataccctcttcaatagttagcaaagagacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaa 39985842  T
Q  293 gataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttaga 392  Q
    ||| || | |||  ||||| |||||| | | ||| |||| | ||| ||||| ||||  || || ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  39985843 gatcaagacattcttctctccaacactggttgctttcttgtcaagaccataagcaatggcagcagcagtgggctcattgataattcgcatgacattaaga 39985942  T
Q  393 ccagcaat 400  Q
    || |||||    
T  39985943 ccggcaat 39985950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 370
Target Start/End: Original strand, 6786816 - 6786925
Alignment:
Q  261 gacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcag 360  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | || |||||||| | |||  ||||||||||||| ||  |||    
T  6786816 gacatatcaaaagttctacaaccaagatcaaagataaatatattcctattttcaacaaaatttgctctcttataaagatcatatgcaagagcagcaacag 6786915  T
Q  361 tcggttcatt 370  Q
    | ||||||||    
T  6786916 taggttcatt 6786925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Original strand, 8102685 - 8102806
Alignment:
Q  114 gggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctc 213  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |  | ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || || || || || |    
T  8102685 gggtttccgctaatatccttcttgttcttcctcttaaactcttgaacaaaatgggtaaccattctgttatcaaaatcttcaccaccaagatgggtatcac 8102784  T
Q  214 cagcagtggccttgacttcaaa 235  Q
    | ||||| ||||| ||||||||    
T  8102785 ctgcagtagccttaacttcaaa 8102806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 8640316 - 8640184
Alignment:
Q  494 ctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttg 593  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||| || |||  |||  |||| || ||||||||||| || |||| ||| || ||||||    
T  8640316 ctctgcaacctctcgcatcttcgaaaggatcatagatgatatttcctcggcacaaaaacgcttctcttcacccttgtatttaacaataatcgtgggtttg 8640217  T
Q  594 tcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaac 629  Q
    ||||| || ||   ||||||||| || |||||||||    
T  8640216 tcattcacccc---aatgaccttgaatggccacaac 8640184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Original strand, 6786690 - 6786748
Alignment:
Q  135 ttgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttc 193  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  6786690 ttgtgcttccgcgtgaactccttcacaaagtggttcaccattctattattaaaatcttc 6786748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 608 - 690
Target Start/End: Original strand, 8610429 - 8610511
Alignment:
Q  608 aatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||| || |  | ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8610429 aattaccttaaagggccacaactgaagatcgttttttataacagaatcgctatatttccttccaatcaacctctttgcatctg 8610511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Original strand, 8616679 - 8616764
Alignment:
Q  94 tcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctg 179  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  8616679 tcaaccgcctcaacgatcttgggttcctagtaatatccacattgttcttcctcttaaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 691
Target Start/End: Original strand, 12528430 - 12529099
Alignment:
Q  22 atatagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttccc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  12528430 atatagcatctatgtcaattgtagcctctgtatcgtatgaaagtgtccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttccc 12528529  T
Q  122 actaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtg 221  Q
    | |||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  12528530 aataatgtcaactttgttcttcctcttaaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtg 12528629  T
Q  222 gccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagt 321  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  12528630 gccttgacttcgaagacattattctttactgtaagaagagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaaaataaaaatccttctctcttcaagacaat 12528729  T
Q  322 tagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggc 421  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||| ||||| || |||||    
T  12528730 tagctctcttttgaatgccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacattgaggccagcaatgacaccagcatccttggtggc 12528829  T
Q  422 tcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagagg 521  Q
    || ||  || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  12528830 tcgtcgctgcgaatcattgaaatacgctggcaccgtaatcactgcattcttaacaggtgactcaagaaatgcatctgcaatctctcgcatctgtgataga 12528929  T
Q  522 atcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagg 621  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| | | |||||||||| |    
T  12528930 atcatagaggatatttcttcagcaacaaagtgatgttccttcccattgtagttcacaaggatcttcggtttgtcattagcaccagcagtgaccttaaatg 12529029  T
Q  622 gccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctgc 691  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  12529030 gccacaacagttgatccttctgaactatggagtcactatactttcttccaattaacctctttgcatctgc 12529099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 690
Target Start/End: Original strand, 43744990 - 43745441
Alignment:
Q  237 accttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaa 336  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||  ||   ||| |||||| ||||||||  |    
T  43744990 accttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctcgcacagagttagttctcttttcca 43745089  T
Q  337 ggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatc 436  Q
    | |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||  ||| ||||  || ||||||||  |||| |||||  |||||||| | |  ||  ||||    
T  43745090 gaccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatc--tagtggctttccgctgataatc 43745187  T
Q  437 attaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatt 536  Q
    ||| |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||  || |||| |||||| |||    
T  43745188 attgaaataagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggcaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgagatt 43745287  T
Q  537 tcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagat 636  Q
    ||||| |||   | |||||| ||||  |||||||| || |||  |||    ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||   | ||    
T  43745288 tcttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttcatat 43745387  T
Q  637 cattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    |||| ||||||   |||||| || | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  43745388 cattttgaacatcagaatcattaaacttcctaccaattaacctcttagcatctg 43745441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 43744785 - 43744951
Alignment:
Q  65 tgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaag 164  Q
    ||||||||||||  | || || || |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||| |||| |||||||     |||    
T  43744785 tgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaag 43744884  T
Q  165 tggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgactt 231  Q
    | ||||||||| || |||||||| || || || || |||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  43744885 tagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttccagaggtggccttcactt 43744951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 1e-84; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 16662193 - 16661566
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||| | ||||||||||| || || || |||| ||    
T  16662193 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 16662094  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| | |  ||||||||| || | |||    
T  16662093 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagaga 16661994  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  || |||| |||  ||| || | |||||||||||||| ||| || |||||     
T  16661993 cacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaattacttcttttgtcaaggccatatgcaatagctgctgcagtg 16661894  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    |||||||||||||||| ||  || || || ||||||||  |||| |||||  | |||||| |||  || ||||| |||||||||||||| ||||| |  |    
T  16661893 ggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgttaaaataagcaggaacagtgacaa 16661794  T
Q  463 ctgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctc 562  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||   ||| | || |||||  | |||||| ||||| || |||  || | |||| ||||     
T  16661793 ctgcatttttaaccggtgattccaaataagcctctgcaacctccttcatgtttgtgaggacaatagatgagatttcctcggcacaaaggagcttctcctg 16661694  T
Q  563 acccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatat 662  Q
    ||||||||| || |||  ||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||| ||  |||||| ||    
T  16661693 acccttgtacttaacactaatcgtaggtttgtcattaacaccagcaataaccttgaacggccacaacagtatatctttttgaacaacggggtcactaaat 16661594  T
Q  663 ttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16661593 ttcctaccaattaacctcttagcatctg 16661566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 545
Target Start/End: Original strand, 7542190 - 7542675
Alignment:
Q  60 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 159  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |  |    
T  7542190 gaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttctttctcttgaactcttgta 7542289  T
Q  160 taaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaat 259  Q
     ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||   ||    ||||| || || |     
T  7542290 caaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttgttgcccttaatcgttagtaa 7542389  T
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || || | | || |||||| | |||||||||||||| ||| || |||    
T  7542390 agacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaacagctgcggca 7542489  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
    || |||||||| |||  || ||| ||||| || ||||||||  |||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7542490 gtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattaaaataagcaggtacagtaa 7542589  T
Q  460 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagca 545  Q
      ||||||||| | |||| ||  || ||| | | ||| ||||| |||||||||| || ||| | || ||||||||  |||||||||    
T  7542590 caactgcattcgtcacagttgtttctaaatacgactcagcaatttctcgcatctttgtgagtaccatagatgatacctcttcagca 7542675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 12245610 - 12244980
Alignment:
Q  60 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 159  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||   |  |||||||||||   |||||||| |||||||||||||       
T  12245610 gaaagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggcttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaactcctgtg 12245511  T
Q  160 taaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaat 259  Q
     ||||| ||| |||||||| |||||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  ||||  ||||| || || ||    
T  12245510 caaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttggaagatgttatccttaatagttaggat 12245411  T
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||    
T  12245410 agaaacgtcaaaagtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttcaaggccatatgcaacagctgcagca 12245311  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
    || |||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||   || |||||| | || ||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12245310 gtgggttcattcattaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaatcactaaaataagcaggtacagtaa 12245211  T
Q  460 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaag-tgctttt 558  Q
      || |||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||  || | || |||||||| ||||||||| ||| || ||||| |    
T  12245210 caacagcattctttaccggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatctttgttagtaccatagatgatacttcttcagc-acatagctgcttct 12245112  T
Q  559 cctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcact 658  Q
    |||  || |||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||| | | ||||||| || ||||| || | |  ||||| | ||||||| | ||||||    
T  12245111 cctggcctttgtagttaacagtaattattggtttgtcattgacaccagcagtgaccttgaacggccataataatgcatcatccagaacaataggatcact 12245012  T
Q  659 atatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    | | ||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  12245011 aaacttcctaccaattaatctcttagcatctg 12244980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16657718 - 16657236
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | || |||||| | |  |||||||  | ||    
T  16657718 agtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgagttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaa 16657619  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || | |   ||||||||||| |||||    
T  16657618 agtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggataga 16657519  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |   || |||| | |  |||||| | ||| |||||||||| ||| || |||||     
T  16657518 cacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaagaccatatgcaatagctgcagcagta 16657419  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||| |||||| | |||||| |||  || |||||||| || ||||| || |||||||  |    
T  16657418 ggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaa 16657319  T
Q  463 ctgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagca 545  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16657318 cagcattcttgacaggcgactccataaatgcctcagcaacttctcgcatctttgtaaggatcatagatgatatttcctcagca 16657236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12258785 - 12258332
Alignment:
Q  60 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 159  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||| || ||| |||| |||||||| ||| |||| || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||| |  |    
T  12258785 gaaagtgatctttttgcactctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctcttgaactcttcta 12258686  T
Q  160 taaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaat 259  Q
     |||||   |||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| |||||| || ||||| |||| |||||| ||||  ||||| || || |     
T  12258685 caaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtag 12258586  T
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |  | ||| ||||| |||  ||| || | |||||||||||||| ||| || |||    
T  12258585 agacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattccgtttttcgacacaattaattcttttgtcaaggccatatgcaaaagctgcagca 12258486  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
    || |||||||| | ||||  ||| ||||| || ||| |||| | |||  ||||| |||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  12258485 gtaggttcatttaatatcttcataacattcaggccaacaatattacccacatctatagtggctttcctttgtgaatcactaaaatatgcaggcacagtaa 12258386  T
Q  460 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatct 513  Q
      |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  12258385 caactgcattcttaacgggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatct 12258332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 513
Target Start/End: Original strand, 14703372 - 14703825
Alignment:
Q  60 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 159  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||    |||| || ||||||||||| |  |    
T  14703372 gaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaaggcttttggatttccactaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaa 14703471  T
Q  160 taaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaat 259  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||| ||||| | ||  |||||  |    |||||||| || |     
T  14703472 caaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcagtagccttaatttggaagacggtgcccttaattgttaggag 14703571  T
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |  ||| || || | | || |||||| | |||||||||||||| ||| || ||     
T  14703572 agacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatattacgttctccaccataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagct 14703671  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
    || |||||||| |||| || ||| ||||| || || |||||  |||| |||||  |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  14703672 gtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtggcttttctttgagaatcactaaaataagcaggcaccgtaa 14703771  T
Q  460 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatct 513  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  14703772 caactgcattcttaacagttgactctaaatatgtctcagcaatttctcgcatct 14703825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 541
Target Start/End: Original strand, 12234662 - 12235134
Alignment:
Q  69 ctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggt 168  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | || ||||| || |||||||| |    || || ||    
T  12234662 ctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttccactcatgtccacttttttctttctattgaactcttgagcaaggtagt 12234761  T
Q  169 tcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatc 268  Q
    | |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||| || ||||| || ||||  ||||| |||  ||| ||||| || | |||||||||    
T  12234762 ttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagacacatc 12234861  T
Q  269 aaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttca 368  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  ||| ||||||| | || |||||| | ||| |||||||||| ||| || ||  | |||||     
T  12234862 aaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaatcagttctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgggttcg 12234961  T
Q  369 ttgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcat 468  Q
    || |||| || ||| ||||| || ||||||||  |||| |||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||    
T  12234962 ttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttgcttttcgttgagaatcattgaaataagcaggcacggtaacaactgcat 12235061  T
Q  469 tcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttc 541  Q
    ||||||| ||  | |  ||| ||||||| || || |||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||    
T  12235062 tcttaactggaaattgtaaatatgcctcagcgatttctcgcatctttgtgagtaccatagatgatacttcttc 12235134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 513
Target Start/End: Original strand, 11999501 - 11999811
Alignment:
Q  203 gtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaata 302  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||| || |  |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  11999501 gtgagtgtttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccaccgccaagatcaaagactaaaatg 11999600  T
Q  303 tttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaattt 402  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||  || ||||| |||||||| |||| ||  || ||||| |  |||||||||     
T  11999601 tttctttctccaacacaatcagctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattcattacccttataacattgatgccagcaattg 11999700  T
Q  403 cacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaat 502  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11999701 caccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagctggtacagtaacaacaacattctttaccggtgattctaaatatgcctcagcaat 11999800  T
Q  503 ctctcgcatct 513  Q
     ||||||||||    
T  11999801 ttctcgcatct 11999811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 690
Target Start/End: Original strand, 43625379 - 43626004
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    |||||||||||| |  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||  || || |    ||    
T  43625379 agtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttgagtttccaataatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaa 43625478  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| || ||    |||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  43625479 agtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggctttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtataga 43625578  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||  |||||| | |||||| ||||| ||||| || || ||     
T  43625579 cacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctccaacacaattaattctcttgttaaggccgtatgctagagcagcagctgtt 43625678  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    |||||||||||||  || |  ||||| || ||  ||||  ||||  ||||| | |||||| |||  || |||||||| || |||||||| || ||||  |    
T  43625679 ggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaagtaagcaggcacggtaacaa 43625778  T
Q  463 ctgcattcttaac-aggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcct 561  Q
    |||||||||| ||  || |||   ||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||| |  |||  |||| || |    
T  43625779 ctgcattctttacggggggacattaaaaatttctctgcaacctctcgcatctttgtgaggatcatagacgatatttcctcaggacaaaaacgcttctctt 43625878  T
Q  562 cacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactata 661  Q
     ||||||||| || |||| |||  | ||||||||||  || ||   ||||||| | || ||||||||||  | |||||| |||||||  ||||||||| |    
T  43625879 gacccttgtattttacaataatcattggtttgtcatccacccc---aatgaccctgaatggccacaacatgatatcattttgaacaacagaatcactaaa 43625975  T
Q  662 tttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||    
T  43625976 cttcctaccgattaacctcttagcatctg 43626004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17622134 - 17621995
Alignment:
Q  75 gccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcacca 174  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| | |  ||| ||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  17622134 gccttctcacaagcagtcctcaacctcataagagctcttgggttgccactgatgtccttcttgttctttctcttgaactcttgaacaaagtggttcacca 17622035  T
Q  175 ttctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctcc 214  Q
    ||||||||| ||| || ||||| || || || ||||||||    
T  17622034 ttctgttattaaaatcctcacctccaagatgggtgtctcc 17621995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 154
Target Start/End: Original strand, 11999380 - 11999465
Alignment:
Q  69 ctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactc 154  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  11999380 ctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttgaacttccactaatatccacttcgttctttatcttgaactc 11999465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17718103 - 17718019
Alignment:
Q  112 ttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcacc 196  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  17718103 ttgggttgccactaatgtccttcttgttctttctcttgaactcttgaacaaagtggttcaccattctgttattaaaatcctcacc 17718019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17648230 - 17648091
Alignment:
Q  75 gccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcacca 174  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| | |  ||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||| | |  | |||||| |||||||    
T  17648230 gccttctcacaagcagtcctcaacctcataagagctcttgggttgccactaatgtccttcttgttctttctcttgaacacttgaacaaagtgattcacca 17648131  T
Q  175 ttctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctcc 214  Q
    ||||||||| ||| || ||||| || || || ||||||||    
T  17648130 ttctgttattaaaatcctcacctccaagatgggtgtctcc 17648091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17705889 - 17705788
Alignment:
Q  113 tgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtct 212  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || || ||||||    
T  17705889 tgggttgccactaatgtccttcttcttctttctcttgaactcttaaacaaagtggttcaccattctgttattaaaatcctcacctccaagatgggtgtct 17705790  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  17705789 cc 17705788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17716872 - 17716755
Alignment:
Q  79 tctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattct 178  Q
    ||||||| || || ||||||||| | |  ||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||    
T  17716872 tctcacaagcagtcctcaacctcataagagctcttgggttgccactaatgtccttcttgttctttctcttgaactctcgaacaaagtggttcaccattct 17716773  T
Q  179 gttatcaaagtcttcacc 196  Q
    ||||| ||| || |||||    
T  17716772 gttattaaaatcctcacc 17716755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 34466994 - 34466512
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||   ||    
T  34466994 agtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttgcaa 34466895  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||    
T  34466894 agtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggagaga 34466795  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||| ||| || |||||     
T  34466794 cacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttccacaaagtcagctctcttgtcaagtccatatgcaatagctgcagcagtg 34466695  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||| || ||||||||   ||| |||||   ||| ||| |||  || |||||||||||||||||||| || || || |    
T  34466694 ggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcattaaaataagcaggcacggtgataa 34466595  T
Q  463 ctgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagca 545  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||| | || ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  34466594 ctgcattcttaattggtgattccaaatattcctctgcagtatcccgcatctttgaaaggatcatagatgagatttcctcagca 34466512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 648
Target Start/End: Original strand, 15595006 - 15595588
Alignment:
Q  68 cctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtgg 167  Q
    |||||||||| | || || || |||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |  ||||| |    
T  15595006 cctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttcccagtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtag 15595105  T
Q  168 ttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacat 267  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||  | |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| || ||||||||||    
T  15595106 ttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtggccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacat 15595205  T
Q  268 caaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccg-------ccgcag 360  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||| |       | || |    
T  15595206 caaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacagttaatcctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtcagctg 15595305  T
Q  361 tcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaat 460  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||| || ||||     
T  15595306 tcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattgagataagcaggcacggtaac 15595405  T
Q  461 cactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcc 560  Q
     |||||||| || || || ||||  ||||||  |||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||| |||||||| ||||||  |||| |||||||     
T  15595406 aactgcattgtttacgggagact--aaaaatttctctgcaacctctcgcatctttttgagaatcatagacgatatttcctcagcacaaaagcgcttttct 15595503  T
Q  561 tcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaa 648  Q
    | ||||||||| || |||| |||  | ||||||||||| |||||   ||||||||| || |||||||||  || |||||| |||||||    
T  15595504 tgacccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacacc---aatgaccttgaatggccacaactttatatcattttgaacaa 15595588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4678759 - 4678516
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||  |||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||  | ||    
T  4678759 agtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaa 4678660  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||   |   || ||| |||| |||||    
T  4678659 agtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggataga 4678560  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttc 306  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||    
T  4678559 cacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 4678516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 690
Target Start/End: Original strand, 35132454 - 35133040
Alignment:
Q  102 ctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgccta 201  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |    
T  35132454 ctcaaggcttttgaattcccactaatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccga 35132553  T
Q  202 ggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaat 301  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35132554 gatgagtgtttccggcagtggccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaat 35132653  T
Q  302 atttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatt 401  Q
    ||||   ||| || |||| | || |||||| | ||||||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||  | ||| |||||  ||||||||||     
T  35132654 attttgttctccagcacaatcagatctcttgtcaaggccatatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaata 35132753  T
Q  402 tcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaa 501  Q
     |||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| || ||| ||||  ||||||    
T  35132754 gcaccagcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagcaggcacagtaacaactgcattcttaacagttgattctaaatatgc--ctgcaa 35132851  T
Q  502 tctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaac 601  Q
    | |||||||||| || ||| | ||  ||||||| |||||| |||   |  |||||||||||| ||||||| || ||   |||  | ||||||||||| ||    
T  35132852 tttctcgcatctttgtgagtaccatggatgatacttcttccgcatagagttgcttttcctcatccttgtacttaaccgtaatcatgggtttgtcatttac 35132951  T
Q  602 accggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    ||||| | ||||||| || ||||| | ||||| |||||  |||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | || |||||||    
T  35132952 accggcagtgaccttgaatggccatagcagtatatcatcttgaacaataggatcactaaacttcctaccaattaaccttttagcatctg 35133040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 507
Target Start/End: Original strand, 30775219 - 30775663
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   ||||| ||| |||| |||||  |||| ||| | ||||||||| |||| || ||||  | ||    
T  30775219 agtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaa 30775318  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 262  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| || || || | |||||||| ||||||||| || || |||||||| || | || | |||| || |||| |||    
T  30775319 agtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagaga 30775418  T
Q  263 cacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||  || ||||||| | ||| |||||||||| ||| || |||||     
T  30775419 cacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtg 30775518  T
Q  363 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatca 462  Q
    || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  30775519 ggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacagtgataa 30775618  T
Q  463 ctgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctc 507  Q
    ||||||| ||||| || || |||||| |   ||||||||||||||    
T  30775619 ctgcatttttaactggggattccaaatacatctctgcaatctctc 30775663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 9336088 - 9335525
Alignment:
Q  67 tcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    | || ||| | || |||||| | || ||||| | || ||| |     
T  9336088 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttattcttcttttttaactcttccacaaaata 9335989  T
Q  167 gttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacaca 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||| |  | |   |||||||| || |||||||||    
T  9335988 gttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatcacccttaattgtgaggatagacaca 9335889  T
Q  267 tcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggtt 366  Q
    |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||  |   || |||||| |  |||||| | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  9335888 tcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatttctcttatcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggtt 9335789  T
Q  367 cattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgc 466  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||   ||| |||||| | |||||  |||  || |||||||| || ||||| || || ||||  || ||    
T  9335788 cattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggc 9335689  T
Q  467 attcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcaccc 566  Q
    |||||| || || ||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||  || | || ||| |||||||| ||||||  ||||||||| || | ||||    
T  9335688 attcttgaccggcgaccccaaatatgcctccgcaacctctctcatctttgtaagcaacatagaagatatttcctcagcacaaaagtgcttctcttgaccc 9335589  T
Q  567 ttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaaca 630  Q
    |||||||| |||  |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  9335588 ttgtagttaacagtaatcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaaca 9335525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Original strand, 54396406 - 54396607
Alignment:
Q  79 tctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattct 178  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||  || |||||||||||||  || || |||||| | ||||||   | ||| || |||||||||||    
T  54396406 tctcacaagctgttcttaatctcctcaaagctcttgcattaccactaatatccttcttatttttcctcctaaactccgaaacaaaatgattcaccattct 54396505  T
Q  179 gttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacacatcaaaagttcca 278  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| |||| |   | || ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  54396506 gttatcaaaatcttcaccaccaagatgagtatcaccagcagtagctttcacttcgaagatcccttcttcaatagtaagaagagaaacatcgaaagttcca 54396605  T
Q  279 cc 280  Q
    ||    
T  54396606 cc 54396607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23587877 - 23587801
Alignment:
Q  120 ccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcacc 196  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| || |  | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23587877 ccactaatatccttcttattcttcctcttgaattcttgaacaaaatggttcaccatcctgttatcaaaatcttcacc 23587801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23596770 - 23596653
Alignment:
Q  79 tctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattct 178  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |  ||  |||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || |  | ||| ||||||||||| ||    
T  23596770 tctcacaagcagttctcaaccttctaagagcccttggatttccactaatatctttcttattcttcctcttgaattcttgaacaaaatggttcaccatcct 23596671  T
Q  179 gttatcaaagtcttcacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  23596670 gttatcaaaatcttcacc 23596653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 690
Target Start/End: Original strand, 28220115 - 28220545
Alignment:
Q  260 agacacatcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  ||| | |  ||||||| ||| || |  |  |||||||||| ||| || |||    
T  28220115 agacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcgttctcccatgcagttagttcttttgtccaatccatatgcaatagcagcagca 28220214  T
Q  360 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 459  Q
    || |||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||   |||||||||| | |||||| | |  ||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28220215 gtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcattgaaataagcaggcacagtaa 28220314  T
Q  460 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttc 559  Q
    | ||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  || | || |||||| |||||||| |||   | |||||| ||    
T  28220315 taactgcattcttgacaggaaattccaaaaaggcctctgcaatctcacgcatctttgttagaaccatagatgagatttcttcggcacataggtgcttctc 28220414  T
Q  560 ctcacccttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcacta 659  Q
    ||  |||||||| || |||  |||  | |||||||| ||    |||||||||||||| || |||||||||  || |||||  |||||||  || ||||||    
T  28220415 ctgtcccttgtacttaacagaaatcatgggtttgtcgttcgttccggaaatgaccttgaatggccacaactttatatcatcttgaacaacagagtcacta 28220514  T
Q  660 tatttccttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
     | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  28220515 aacttcctaccaattaacctcttagcatctg 28220545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 243
Target Start/End: Original strand, 28219885 - 28220065
Alignment:
Q  63 agtgtcctttttgccttctcacaggccgttctcaacctcctcaaggcttttgggttcccactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcataa 162  Q
    ||||||||||||||  |||  || || |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||| ||| | ||||||||| |||| |||||||     |    
T  28219885 agtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcga 28219984  T
Q  163 agtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttat 243  Q
    ||| ||||||||| ||  |||||||||| || || || |||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  28219985 agtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttcacttggaagaccttat 28220065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 690
Target Start/End: Original strand, 28910653 - 28911176
Alignment:
Q  167 gttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacaca 266  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||  | || |||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||  | ||||||||| | ||| |||    
T  28910653 gttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaaaca 28910752  T
Q  267 tcaaaagttccaccgccaagatcaaagataaaaatatttctctcttcaacacagttagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggtt 366  Q
    |||||||| ||||  || || || ||||| ||| ||||||  ||| || |||| | ||||||||| |  |||||||||| || |||  | |||||  | |    
T  28910753 tcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtgagct 28910852  T
Q  367 cattgattatccgcatgacatttagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcattgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgc 466  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |   ||||  |||| |||||| | |||||| | |  |  |||||||| |||||| |||  | |||||  | |||    
T  28910853 cattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataaccagtcaaagtaacaattgc 28910952  T
Q  467 attcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcaccc 566  Q
    |||||| || ||  | |||||||||| | |||||||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||||   || | ||| |||| | ||    
T  28910953 attcttgacgggcaattccaaaaatgtcactgcaatctcgcgaatctttgagagaaccacagatgagatttcctcagcacataatttcttctcctgatcc 28911052  T
Q  567 ttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaatggaatcactatatttcc 666  Q
    ||||| || |||   ||  | || |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||| |  ||| || ||||||| || ||||||| | ||||    
T  28911053 ttgtacttgacagatatcatggggttgtcattgacaccggcaatgaccttgaacggcgacaacattgaatcgttttgaacaacgggatcactaaacttcc 28911152  T
Q  667 ttccaattaacttctttgcatctg 690  Q
    |  |||||| | |||| |||||||    
T  28911153 tatcaattatcctcttagcatctg 28911176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 223
Target Start/End: Original strand, 11133038 - 11133121
Alignment:
Q  140 cttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggc 223  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||    
T  11133038 cttcctcaagaactctttcacgaaatggttcaccattgtgttatcaaagtcttgtcccccgaggtgagtatctccagcagtggc 11133121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 11156314 - 11156388
Alignment:
Q  140 cttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctcc 214  Q
    |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  11156314 cttcctcgagaactcattcacaaaatggttcaccattgtattatcaaagtcttgtcccccaaggtgagtgtctcc 11156388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 11196767 - 11196841
Alignment:
Q  140 cttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctcc 214  Q
    |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  11196767 cttcctcgagaactctttcacaaaatggttcaccattgtattatcaaagtcttgtcccccaaggtgagtgtctcc 11196841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 11199932 - 11200006
Alignment:
Q  140 cttcctcttgaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctcc 214  Q
    |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  11199932 cttcctcgagaactctttcacaaaatggttcaccattgtattatcaaagtcttgtcccccaaggtgagtgtctcc 11200006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Original strand, 11170623 - 11170700
Alignment:
Q  149 gaactccttcataaagtggttcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtgagtgtctccagcagtggcctt 226  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11170623 gaactctttcacaaaatggttcaccattgcattatcaaagtcttgtcccccgaggtgagtgtctcctccagtggcctt 11170700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University