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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4704_low_21 (Length: 337)

Name: NF4704_low_21
Description: NF4704
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4704_low_21
NF4704_low_21
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (1-334)||(29949587-29949920)
chr5 (1-334)||(29951225-29951558)
chr5 (1-334)||(244789-245122)
chr5 (223-334)||(38936717-38936828)
chr5 (140-331)||(16780615-16780804)
chr5 (258-334)||(21352695-21352771)
chr5 (270-334)||(21352606-21352670)
chr5 (206-315)||(23660940-23661049)
chr5 (206-315)||(23797521-23797630)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (1-334)||(15017991-15018324)
chr4 (1-334)||(15019631-15019964)
chr4 (1-334)||(13518308-13518644)
chr4 (1-334)||(9398967-9399303)
chr4 (1-334)||(39488498-39488834)
chr4 (148-331)||(13517922-13518105)
chr4 (1-64)||(9166926-9166989)
chr4 (116-334)||(11098499-11098718)
chr4 (116-334)||(42872895-42873112)
chr4 (258-334)||(46690508-46690584)
chr4 (116-334)||(21377201-21377418)
chr4 (182-315)||(19457618-19457750)
chr4 (142-324)||(24663911-24664095)
chr4 (246-334)||(18281342-18281429)
chr4 (137-235)||(30874982-30875080)
chr4 (268-332)||(22473681-22473743)
chr4 (232-313)||(19455904-19455985)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-334)||(36233308-36233641)
chr1 (1-334)||(24157402-24157737)
chr1 (3-331)||(20189147-20189478)
chr1 (1-334)||(20190778-20191114)
chr1 (65-337)||(48462803-48463074)
chr1 (139-334)||(36233845-36234040)
chr1 (124-336)||(48463831-48464040)
chr1 (1-334)||(20759106-20759432)
chr1 (116-334)||(40553903-40554120)
chr1 (223-334)||(40554628-40554738)
chr1 (245-334)||(31390149-31390237)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (1-334)||(9647283-9647619)
chr7 (1-334)||(7842676-7843012)
chr7 (1-331)||(9595784-9596117)
chr7 (1-331)||(9646747-9647080)
chr7 (1-334)||(40998567-40998903)
chr7 (1-334)||(41000426-41000763)
chr7 (64-334)||(23446662-23446932)
chr7 (291-334)||(24790122-24790165)
chr7 (291-334)||(24790156-24790199)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (1-334)||(22300244-22300580)
chr2 (1-334)||(18535650-18535986)
chr2 (1-334)||(24806631-24806969)
chr2 (1-334)||(24808487-24808825)
chr2 (191-334)||(31974034-31974177)
chr2 (210-334)||(22299690-22299814)
chr2 (116-334)||(44793275-44793492)
chr2 (273-334)||(24806089-24806151)
chr2 (223-334)||(44792615-44792725)
chr2 (210-238)||(31973966-31973994)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (1-334)||(8366107-8366443)
chr8 (1-334)||(17278023-17278358)
chr8 (154-334)||(17277409-17277589)
chr8 (182-334)||(6778187-6778338)
chr8 (116-334)||(17857163-17857380)
chr8 (291-334)||(17277677-17277720)
chr8 (223-334)||(23016334-23016444)
chr8 (116-334)||(23016561-23016778)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (1-334)||(25531636-25531972)
chr3 (1-334)||(5554139-5554475)
chr3 (1-334)||(23460202-23460538)
chr3 (1-334)||(16346634-16346970)
chr3 (1-334)||(47418324-47418660)
chr3 (65-334)||(5553198-5553467)
chr3 (114-334)||(16022616-16022836)
chr3 (1-334)||(47566476-47566811)
chr3 (139-299)||(32570515-32570674)
chr3 (137-334)||(2683485-2683681)
chr3 (240-286)||(25532821-25532867)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-334)||(54856-55193)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-334)||(86583-86915)
scaffold0026 (231-334)||(643-746)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (3-334)||(241046-241380)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-334)||(431-769)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (163-334)||(31591-31762)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (1-201)||(1751-1954)
scaffold0269 (243-334)||(1962-2051)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (223-334)||(22399-22510)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (215-334)||(17657-17776)
scaffold0021 (215-334)||(27188-27307)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (116-334)||(13365-13582)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (116-334)||(5220-5437)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (116-334)||(11265-11481)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (116-334)||(4225-4442)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (186-334)||(375245-375392)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (295-334)||(12037064-12037103)
chr6 (297-334)||(12037016-12037053)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (290-334)||(8902-8946)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29949920 - 29949587
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949920 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 29949821  T
Q  101 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949820 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaatagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 29949721  T
Q  201 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949720 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 29949621  T
Q  301 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949620 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 29949587  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29951558 - 29951225
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951558 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 29951459  T
Q  101 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951458 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaatagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 29951359  T
Q  201 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951358 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 29951259  T
Q  301 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951258 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 29951225  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 244789 - 245122
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244789 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 244888  T
Q  101 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244889 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 244988  T
Q  201 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244989 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 245088  T
Q  301 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245089 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 245122  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38936828 - 38936717
Alignment:
Q  223 cagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 322  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38936828 cagagctccatatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaattttgaacccaaaattgatttggttcttttatttcacaatgac 38936729  T
Q  323 tttattattctt 334  Q
    ||||||||||||    
T  38936728 tttattattctt 38936717  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16780804 - 16780615
Alignment:
Q  140 aatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataa 239  Q
    |||||| |||||| | ||||||| |||||| ||| || ||  |||| ||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||     
T  16780804 aatttgttcttgagttaaacagacgaaatgcagataactttctaagatttccaaggactcaaagatcgcctcaatcggacatccagaattccggatatag 16780705  T
Q  240 ccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 331  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16780704 ccaaaacaagacaaacacatcatgaactacgaaaataaaacattgaa-ccaaaattaattcaattcttttatt-cacaatgactttattatt 16780615  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 334
Target Start/End: Original strand, 21352695 - 21352771
Alignment:
Q  258 atcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21352695 atcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 21352771  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21352670 - 21352606
Alignment:
Q  270 gaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21352670 gaaaataaaactttgaatccaaaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 21352606  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23661049 - 23660940
Alignment:
Q  206 cacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttc 305  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  23661049 cacctcaatcggacatccataactctagatatgacaaaaacaagacagtcatataatcacctacgaaaataatac-ttgaaaccaaaattaatttggttc 23660951  T
Q  306 -ttttattcca 315  Q
     ||||||||||    
T  23660950 attttattcca 23660940  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 315
Target Start/End: Original strand, 23797521 - 23797630
Alignment:
Q  206 cacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttc 305  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  23797521 cacctcaatcggacatccataactctagatatgacaaaaacaagacagtcatataatcacctacgaaaataatac-ttgaaaccaaaattaatttggttc 23797619  T
Q  306 -ttttattcca 315  Q
     ||||||||||    
T  23797620 attttattcca 23797630  T

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Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 15017991 - 15018324
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15017991 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 15018090  T
Q  101 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15018091 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 15018190  T
Q  201 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15018191 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 15018290  T
Q  301 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15018291 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 15018324  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 15019631 - 15019964
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019631 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 15019730  T
Q  101 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019731 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 15019830  T
Q  201 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019831 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 15019930  T
Q  301 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019931 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 15019964  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 13518308 - 13518644
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13518308 acatattcatttgcacattgatttgtaaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagattacacaatttaacca 13518407  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13518408 cgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagttttccaacgag 13518507  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518508 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 13518607  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518608 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 13518644  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 9398967 - 9399303
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9398967 acatattcatttgcacatttatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccgcctttaattcttcagctaacacactttaacca 9399066  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| |||  |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9399067 cgtcttctgcttatatatcattctacaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagacgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 9399166  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9399167 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccatatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 9399266  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9399267 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 9399303  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 39488498 - 39488834
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39488498 acatattcatttgcacattgatttgtgaagacttattatttctagacgttacaatttcacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttaacca 39488597  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39488598 cgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattctgagtttgctcttgagtcaaacagatgaattgtggagaatttcgtaagctttccaacgag 39488697  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39488698 ttaaagatcacctcaaacggacatctagagctccagatatagccaaaataagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 39488797  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39488798 ttaggttcttttattccataatgaatttattattctt 39488834  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 331
Target Start/End: Original strand, 13517922 - 13518105
Alignment:
Q  148 cttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaaca 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||| ||||||||    
T  13517922 cttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacgaacatcggaagctccagacatagccaaaaca 13518021  T
Q  248 agacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattatt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13518022 agacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaagttaatttggttcttttattccacaataactttattatt 13518105  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9166989 - 9166926
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaac 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9166989 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaac 9166926  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11098718 - 11098499
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  11098718 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttatgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 11098620  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacc-caaaattaatttggttcttttattc 313  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  11098619 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaaataaatttgattcttttattc 11098520  T
Q  314 cacaatgactttattattctt 334  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  11098519 cataatgaatttattattctt 11098499  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 42872895 - 42873112
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  | | || |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  42872895 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttataagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 42872993  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    |||   |||||||||| |||||| |  || |||||||| | | || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  42872994 cgggattccagagctctagatatgatgaatacaagacatatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 42873092  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  42873093 ataatgaatttattattctt 42873112  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 46690584 - 46690508
Alignment:
Q  258 atcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46690584 atcatgacctacgaaaataaaactttaaatttaaaattaatttagttcttttattccacactgactttattattctt 46690508  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21377418 - 21377201
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaac 215  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || |||| ||||||||||||  |||| |||  ||||||| |   | |||||||||||||| |    
T  21377418 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgattttgtaccctttccatcacttcaaagatcacctcaatc 21377319  T
Q  216 ggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcca 315  Q
     ||  | || ||||| |||||| |  || | |||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21377318 agagttgcaaagctctagatatgatgaatataagacagatacataatgacctacgaaaataaaaatctgaaccaaaaat-aatttggttcttttattcca 21377220  T
Q  316 caatgactttattattctt 334  Q
     | ||||||||||||||||    
T  21377219 tattgactttattattctt 21377201  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19457750 - 19457618
Alignment:
Q  182 taagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaact 281  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| || | |||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||     |||||||||| |||    
T  19457750 taagttttccaacgcattaaagatcaccttaatcagacattgagaactctagatataacaaaaacaagacagccatat-atcgcaaacgaaaataacact 19457652  T
Q  282 ttgaacccaaaattaatttggttc-ttttattcca 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19457651 ttgaa-ccaaaattaatttggttcattttattcca 19457618  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 324
Target Start/End: Original strand, 24663911 - 24664095
Alignment:
Q  142 tttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataacc 241  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||| | | ||| ||||||   |    
T  24663911 tttgatcttgaccccaaaagatgaaatgcagataaatttctaagctttccaacaaattaaagattgcatcaatcggacatcgacatctctagatatggac 24664010  T
Q  242 aaaacaagacagacatatcatgatc--tacgaaaat-aaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactt 324  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  24664011 aaaacaagacagatatataatgatctatacgaatataaaaactttgaa-ccaaaaataatttggttctcttatgccataataactt 24664095  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 334
Target Start/End: Original strand, 18281342 - 18281429
Alignment:
Q  246 caagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||   |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18281342 caagacagatacataatgacctacgaaaataactatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcgataatgactttattattctt 18281429  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 30874982 - 30875080
Alignment:
Q  137 ccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagat 235  Q
    |||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||   |||  ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||    
T  30874982 ccgaatttgatcttgagtttaaatgatgaaatgtagaattttttttaaactttccaacgaattaaagatcacgttaaacagacatccagagctcaagat 30875080  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22473743 - 22473681
Alignment:
Q  268 acgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattc 332  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22473743 acgaaaataacaatttgaaccaaaaa--aaattggttcttttattccataatgactttattattc 22473681  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19455985 - 19455904
Alignment:
Q  232 agatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttc-ttttattc 313  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| || | |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19455985 agatatgacaaaaacaaaacagacatataatcacctacaaaaataacactt-gaaaccaaaattaatttggttcattttattc 19455904  T

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Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36233641 - 36233308
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233641 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgt 36233542  T
Q  101 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233541 tttcaacttacaactcattttacaccattaaatatttcgaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtta 36233442  T
Q  201 aagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233441 aagatcgcctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaattt 36233342  T
Q  301 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233341 ggttcttttattccacaatgactttattattctt 36233308  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24157402 - 24157737
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24157402 acatattcatttgca-attgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaacca 24157500  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157501 cgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaattttctcttgagttaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 24157600  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157601 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagctaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 24157700  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24157701 ttaggttcttttattccataatgactttattattctt 24157737  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Original strand, 20189147 - 20189478
Alignment:
Q  3 atattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20189147 atattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttaagcttacacactttaactacg 20189246  T
Q  100 ttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  20189247 ttttcaacttacaactcactttacaccattaaatattccgactttgctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaaactttccaacaagtt 20189346  T
Q  200 aaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatt 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20189347 gaagatcacctcaaacggacatccagaactccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaaccaaaattaatt 20189446  T
Q  300 tggttcttttattccacaatgactttattatt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20189447 tggttcttttattccacaatgactttattatt 20189478  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 20190778 - 20191114
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20190778 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttcaagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttcatca 20190877  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  20190878 cgttttcaacttacaactcattttaaaacattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagatgaaatgtagataatttagtaagctttccaaagag 20190977  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20190978 ttaaagatcacctcaaacggacatccaaagctccagatatagtcaaaacaagacagacatatcatgacatacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 20191077  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20191078 ttaggttcttttattctataatgactttattattctt 20191114  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 65 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48463074 - 48462803
Alignment:
Q  65 acctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatg 164  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  48463074 acctttaattcttcagtttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaatagatg 48462975  T
Q  165 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48462974 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacatcaaacggatatccagagctccaaatatagccaaaacaagacatacatatcatga 48462875  T
Q  265 tctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattcttctc 337  Q
     |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  48462874 cctacaaaaataaaactttgaatctaaaattaatttgattctttt-tttcgcaatgactttattattcttctc 48462803  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 139 - 334
Target Start/End: Original strand, 36233845 - 36234040
Alignment:
Q  139 gaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatata 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233845 gaatttgatcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcgcctcaaacggacatccagagctccagatata 36233944  T
Q  239 accaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233945 gccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 36234040  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 124 - 336
Target Start/End: Original strand, 48463831 - 48464040
Alignment:
Q  124 accattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatcc 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48463831 accattaaaaattccgaatttg--cttgagtcaaacagatgaaatgtaaagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatcc 48463928  T
Q  224 agagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgact 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  48463929 agagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaa-tttgaacccaaaattattttggttcttttattccacaataact 48464027  T
Q  324 ttattattcttct 336  Q
    |||||||| ||||    
T  48464028 ttattattattct 48464040  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20759432 - 20759106
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  20759432 acatattcatttgcacattgattaatcaaggcttgttatttatagatgttacaattccacaaacaccatctttaatttttcagcttatacactttaatca 20759333  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
      | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  20759332 tatcttcaacttacagttcattttacaccattaaatattccgaatttgctctt--------cagacaaaatgtagagaattttgtaaactttccatagag 20759241  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataa--ccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaatt 295  Q
    | |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20759240 taaaagattacctcactcggacatccagaactccatatatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa-ccaaaatt 20759142  T
Q  296 aatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  20759141 aatttggttctt---tttcacaatgactttattattctt 20759106  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40554120 - 40553903
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || | || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  40554120 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccagcatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 40554022  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40554021 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgattcttttattcc 40553923  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  40553922 ataatgaatttattattctt 40553903  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Original strand, 40554628 - 40554738
Alignment:
Q  223 cagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 322  Q
    |||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||     
T  40554628 cagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaa 40554726  T
Q  323 tttattattctt 334  Q
    ||||||||||||    
T  40554727 tttattattctt 40554738  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31390237 - 31390149
Alignment:
Q  245 acaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31390237 acaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 31390149  T

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Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 9647283 - 9647619
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacct---ttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9647283 acatattcatttgcacattgatttgtaaaggctgattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattcttcaggttacacaatttaacca 9647382  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9647383 cgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagttttccaacgag 9647482  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9647483 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 9647582  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9647583 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 9647619  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7843012 - 7842676
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacct---ttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7843012 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattctccagcttacacactttaacca 7842913  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7842912 cgttttctacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacggatgaattgtatagaatttcgtaagctttccaacgag 7842813  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842812 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctctagatataaccaaaacaaaacagacatatcttgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 7842713  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842712 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 7842676  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 9595784 - 9596117
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacct---ttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9595784 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattctccagcttacacactttaacca 9595883  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595884 cgttttcaacttacaactcattttaagccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 9595983  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9595984 ttaaagatcacctcaaacgaacatcgggagctccagacatagccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaagttaa 9596083  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattatt 331  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9596084 tttggttcttttattccacaataactttattatt 9596117  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 9646747 - 9647080
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacct---ttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646747 acatattcatttggacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattcttcagcttacacactttaacca 9646846  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646847 cgttttcaacttacaactcattttaagccattaaatattccgaatttgcacttgagtcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 9646946  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9646947 ttaaagatcacctcaaacgaacatcggaagctccagacatagccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaagttaa 9647046  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattatt 331  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9647047 tttggttcttttattccacaataactttattatt 9647080  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 40998567 - 40998903
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40998567 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 40998666  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40998667 cgtcttctacttacagctcattttgcaccattaaatattaagaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagctttccaacgag 40998766  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40998767 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaataagacagacatatcatgacctacgaaaataaaattttgaacccaaaattaa 40998866  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40998867 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 40998903  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 41000426 - 41000763
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41000426 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 41000525  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41000526 cgtcttctacttacaactcattttgcaccattaaatattaagaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgcaagctttccaacgag 41000625  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacg-aaaataaaactttgaacccaaaatta 296  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41000626 ttagagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagaccgacatatcatgacctacgaaaaataaaattttgaacccaaaatta 41000725  T
Q  297 atttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41000726 atttggttcttttattccacaatgactttattattctt 41000763  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 64 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23446932 - 23446662
Alignment:
Q  64 cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagat 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23446932 cacctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgactcaaacagat 23446833  T
Q  164 gaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatg 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23446832 gaaatgtagagaatttggtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatg 23446733  T
Q  264 atctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23446732 acctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 23446662  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24790165 - 24790122
Alignment:
Q  291 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790165 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 24790122  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 334
Target Start/End: Original strand, 24790156 - 24790199
Alignment:
Q  291 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790156 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 24790199  T

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Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 22300244 - 22300580
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22300244 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttgcacactttaacca 22300343  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22300344 cgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagatgaaatgtagagaattccgtaagctttccaacaag 22300443  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22300444 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccggatatagcaaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 22300543  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22300544 tttggttcttttattccacaatgaatttattattctt 22300580  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 18535650 - 18535986
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18535650 acatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 18535749  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18535750 cgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgactcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagctttccaacgag 18535849  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18535850 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataagactttgaacccaaaattaa 18535949  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535950 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 18535986  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24806631 - 24806969
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttc-tagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24806631 acatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacc 24806730  T
Q  97 acgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacga 196  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24806731 acgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacga 24806830  T
Q  197 gttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaatta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24806831 gttaaagatcacctcaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaactttgaacccaaaatta 24806930  T
Q  297 atttggttcttttattccacaatgac-tttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24806931 atttggttcttttattccacaatgacttttattattctt 24806969  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 24808487 - 24808825
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttc-tagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24808487 acatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacc 24808586  T
Q  97 acgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacga 196  Q
    |||| ||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24808587 acgtcttctaattacagctcattctgaaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaatga 24808686  T
Q  197 gttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaatta 296  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24808687 gttaaagatcacctgaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaactttgaacccaaaatta 24808786  T
Q  297 atttggttcttttattccacaatgactt-tattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24808787 atttggttcttttattccacaatgacttctattattctt 24808825  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 334
Target Start/End: Original strand, 31974034 - 31974177
Alignment:
Q  191 caacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaaccca 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31974034 caacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagaactcccgatatagccaaaacaagacaaacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaaccca 31974133  T
Q  291 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31974134 aaattaattaggttcttttattccataatgactttattattctt 31974177  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22299814 - 22299690
Alignment:
Q  210 tcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttctttt 309  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22299814 tcaagcggacatccaaagctccagatataggcaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttctttt 22299715  T
Q  310 attccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22299714 attccacaatgaatttattattctt 22299690  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 44793275 - 44793492
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  44793275 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 44793373  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44793374 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgattcttttattcc 44793472  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  44793473 ataatgaatttattattctt 44793492  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24806151 - 24806089
Alignment:
Q  273 aataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac-tttattattctt 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24806151 aataaaacattgaacccaaaattaaattggttcttttattccacaatgacttttattattctt 24806089  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44792725 - 44792615
Alignment:
Q  223 cagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 322  Q
    |||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||     
T  44792725 cagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacaaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaa 44792627  T
Q  323 tttattattctt 334  Q
    ||||||||||||    
T  44792626 tttattattctt 44792615  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31973994 - 31973966
Alignment:
Q  210 tcaaacggacatccagagctccagatata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973994 tcaaacggacatccagagctccagatata 31973966  T

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Target: chr8 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8366443 - 8366107
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8366443 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttaacca 8366344  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8366343 cgttttcaacttacaactcattttaaaccgttaaatattccgaatttgctcttgagtcaaatagataaaatgtagagaattccgtaagctttcaaacgag 8366244  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8366243 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccaaatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 8366144  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8366143 tttggttcttttattccacaatgaatttattattctt 8366107  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 17278023 - 17278358
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17278023 acatattcattttcacattgatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacacactttaacca 17278122  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17278123 cgtcttctacttatagctcattctacaccactaaatattccgaatttgcttttgagtcaaacagacgaaatgtagaaaatttcgtaagctttccaatgag 17278222  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17278223 ttaaagatcacctcaaacggacatctagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacttacgaaaat-aaactttggacccaaaattaa 17278321  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17278322 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 17278358  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17277589 - 17277409
Alignment:
Q  154 tcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacag 253  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17277589 tcaaacagacgaaatgtagagaattccgtaagctttccaatgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacat 17277490  T
Q  254 acatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17277489 acatatcatgacctacaaaaataaaactttgaacccaaaattaatttgattcttttattccacaatgactttattattctt 17277409  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 334
Target Start/End: Original strand, 6778187 - 6778338
Alignment:
Q  182 taagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaact 281  Q
    ||||||||| || || | ||||| |||||||  || | || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||    
T  6778187 taagctttctaaagactcaaagaacacctcactcgaatattcagagctccaaatatagccaaaacaagacagacatatcatgacatgtgtaaataaaact 6778286  T
Q  282 ttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6778287 tagaacc-aaaattaattcggttcttttattccacaataactttattattctt 6778338  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17857380 - 17857163
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  17857380 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 17857282  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17857281 cggagttccagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgattcttttattcc 17857183  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  17857182 ataatgaatttattattctt 17857163  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17277720 - 17277677
Alignment:
Q  291 aaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17277720 aaattaatttggttcttttattccataatgactttattattctt 17277677  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Original strand, 23016334 - 23016444
Alignment:
Q  223 cagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 322  Q
    |||||||| |||||| |  || |||||||| | | || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23016334 cagagctctagatatgatgaatacaagacaaatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattccataatgac 23016432  T
Q  323 tttattattctt 334  Q
    |||| |||||||    
T  23016433 tttaatattctt 23016444  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 23016561 - 23016778
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||| ||||||||||     
T  23016561 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttatgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaatatcacctcaat 23016659  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
     |||  | |||| ||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  23016660 tggagttgcagaactctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgatttttttattcc 23016758  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | || ||||||| |||||||    
T  23016759 ataacgactttaatattctt 23016778  T

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Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25531972 - 25531636
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25531972 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttaacca 25531873  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25531872 cgttttcaacttacaactcattttaaaccattaaatattctgaatttgctcttaagtcaaacagatgaaatgtagagaattccataagctttccaacgag 25531773  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25531772 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagtcaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 25531673  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  25531672 tttggttctttttttctacaatgaatttattattctt 25531636  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 5554139 - 5554475
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5554139 acatattcatttacacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 5554238  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5554239 cgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctatccaacgag 5554338  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5554339 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaattttgaacccaaaattaa 5554438  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5554439 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 5554475  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23460538 - 23460202
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23460538 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 23460439  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460438 cgtcttctacctacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 23460339  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460338 ttaaagatcacctcaaacggatatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatataatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 23460239  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23460238 tttggttcttttattctacaatgactttattattctt 23460202  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16346970 - 16346634
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16346970 acatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 16346871  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346870 cgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattctgaatttgctcttgactcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 16346771  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16346770 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataagactttgaacccaaaattaa 16346671  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346670 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 16346634  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 47418324 - 47418660
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47418324 acatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 47418423  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47418424 cgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattctgaatttgctcttgactcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagctttccaacgag 47418523  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47418524 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataagactttgaacccaaaattaa 47418623  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47418624 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 47418660  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 65 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5553467 - 5553198
Alignment:
Q  65 acctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatg 164  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  5553467 acctttaattcttcaactaacatacttcaaccacgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatatttcgaatttgctcttgaattaaacagatg 5553368  T
Q  165 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5553367 aaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagatagacatatcatga 5553268  T
Q  265 tctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5553267 cctacgaaaataaaattttgaacccaaaattaatttggttcttttatttcacaatgactttattattctt 5553198  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Original strand, 16022616 - 16022836
Alignment:
Q  114 ctcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaa 213  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16022616 ctcattctacaccactaaatattccgaatttgatcttgagtcaaacagacgaaatgtagagaacttcgtaagctttccaacgagttaaagaccacctcaa 16022715  T
Q  214 acggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16022716 acggacatccagagcttcagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttggacccaaaattaatttggttcttttattc 16022815  T
Q  314 cacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16022816 cacaatgactttattattctt 16022836  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47566811 - 47566476
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  47566811 acatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatttctagaaattacaattccacaaacaccacttttaattcttcaacttgcacactttaatca 47566712  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||  || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  47566711 cgtcttcaacttacagctcattctacaccattaaatattttgaatttgctc--gagtcaaacagacgaaatgtaaagaattttgtaagctttccaacgaa 47566614  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagac--atatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaatt 295  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||    
T  47566613 ttaaagatcacctcaatcgaacatccatagctccagatatagccaagacaagacaaacatatatcatgatctacgaaaataaaa-ttttaaatcaaaatt 47566515  T
Q  296 aatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47566514 aaatcaattcttttattccacaatgactttattattctt 47566476  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32570674 - 32570515
Alignment:
Q  139 gaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatata 238  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||    
T  32570674 gaatttgctctcgagtcaaacatacaaaatgtagataattttgtaagctttccaacgaattaaagatcacctcaatataacatccagaactccagatata 32570575  T
Q  239 accaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatt 299  Q
       ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  32570574 gtaaaaacaaaatagacatataatgatctacgaaaataacatttagaa-ccaaaattaatt 32570515  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2683681 - 2683485
Alignment:
Q  137 ccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagata 236  Q
    ||||||||  ||||||||   ||||| ||||| |||| ||||| |||| | || |||||| ||||||||||  | || ||||||| || ||  | |||||    
T  2683681 ccgaattttttcttgaatacgacagacgaaatatagataattttgtaatcatttcaacgaattaaagatcatttgaatcggacattcaaagtcctagata 2683582  T
Q  237 taaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||   |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2683581 tagataaaataagacagacatgttatgatctacaaaaataacactttgaaca-aaaattaatttgatttttttattccaaaatgattttattattctt 2683485  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 286
Target Start/End: Original strand, 25532821 - 25532867
Alignment:
Q  240 ccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25532821 ccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaa 25532867  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 55193 - 54856
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55193 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacca 55094  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55093 cgtcttctacttacagctcattctgcaccattaaatattccgaatttgctcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaattttgtaagctttccaacgag 54994  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54993 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagcgaaaacaagacagacatagcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 54894  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgac-tttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54893 tttggttcttttattccacaatgacttttattattctt 54856  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 86915 - 86583
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  86915 acatattgattttcacattgatttgtgaaggcttattatttatagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttactcactttaacca 86816  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  86815 cgttttcagcttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcaaacagatgaaatttagagaatttcgtaagctttcaaacgag 86716  T
Q  198 ttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  86715 ttaaagatcacctcaaacggacatcaggagctccatatatagccaaaaca----agagatatcatgacctacaaaaataaaacattgaacccaaaattaa 86620  T
Q  298 tttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  86619 tttggttcctttattccacaatgactttattattctt 86583  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Original strand, 643 - 746
Alignment:
Q  231 cagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattat 330  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  643 cagatatagccaaaacaagatagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttgattcttttatttctcaatgactttattat 742  T
Q  331 tctt 334  Q
    ||||    
T  743 tctt 746  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 241380 - 241046
Alignment:
Q  3 atattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaaccacg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  241380 atattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacacactttaaccacg 241281  T
Q  100 ttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagtt 199  Q
    | ||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  241280 tcttctacttatagctcattctacaccactaaatattccgaatttgctcctgagtcaaaaagacgaaatgtagagaacttcgtaagctttccaacgagtt 241181  T
Q  200 aaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  241180 aaagatcacctcaaacggacatccagagcttcagatatagccaaaacaagacagacatattatgacctacgaaaataaaactttaaacccaaaattaatt 241081  T
Q  300 tggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  241080 tggttcttttattctgcaatgactttattattctt 241046  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 431 - 769
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttc-tagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  431 acatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaacc 530  T
Q  97 acgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacga 196  Q
    |||| ||| | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  531 acgtcttctaattacagctcattctgaaccattaaatattccgaatttgctcttggatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaatga 630  T
Q  197 gttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaatta 296  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  631 gttaaagatcacctgaaacggacatccggagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacaaaaataaaactttgaacccaaaatta 730  T
Q  297 atttggttcttttattccacaatgactt-tattattctt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  731 atttggttcttttattccacaatgacttctattattctt 769  T

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Target: scaffold0146 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31762 - 31591
Alignment:
Q  163 tgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcat 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31762 tgaaatgtagagaattttgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcat 31663  T
Q  263 gatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31662 gacctacgaaaataagactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 31591  T

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Target: scaffold0269 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1751 - 1954
Alignment:
Q  1 acatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaacacc---tttaattcttcagcttacacactttaacca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1751 acatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaacca 1850  T
Q  98 cgttttcaacttacaactcattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtagagaatttcgtaagctttccaacgag 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1851 cgttttcaaattacaactcattttaaaccattaaatattccgaatttgctcttgagtcagacagatgaaatgtagagaattccataagctttccaacgag 1950  T
Q  198 ttaa 201  Q
    ||||    
T  1951 ttaa 1954  T

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Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 334
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2051
Alignment:
Q  243 aaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1962 aaacaagacaga--tatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgacattattattctt 2051  T

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Target: scaffold0096 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22510 - 22399
Alignment:
Q  223 cagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22510 cagagctccagatatagccaaaacaagacagacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattccacaatgac 22411  T
Q  323 tttattattctt 334  Q
    ||||||||||||    
T  22410 tttattattctt 22399  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17776 - 17657
Alignment:
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17776 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattca 17677  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17676 acactgactttattattctt 17657  T

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Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27307 - 27188
Alignment:
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27307 cggacatccagagctccagatatagccaaaacaagacatacatatcatgacctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattca 27208  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27207 acactgactttattattctt 27188  T

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Target: scaffold0094 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 13365 - 13582
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  |||| | |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  13365 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgaacccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 13463  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    ||||  |  ||||||| |||||| |  || |||| ||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13464 cggagttgtagagctctagatatgatgaatacaaaacagatacataatgacctacgaaaataaaaatttgaacccaaaat-aatttggttcttttattcc 13562  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13563 ataatgactttattattctt 13582  T

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Target: scaffold0321 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5437 - 5220
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  5437 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 5339  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    ||||  ||||||| || |||||| |  || |||||||| | | || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  5338 cggagttccagagttctagatatgatgaatacaagacacatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 5240  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  5239 ataatgaatttattattctt 5220  T

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Target: scaffold0180 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 11265 - 11481
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||| |  ||| || |||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  11265 cattttacaccatgatatatgccgattttgcttctgagtccaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttccaacgcttcaaagatcacctcaat 11363  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    ||||  | |||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11364 cggagttgcagagctctagatatgatgaatacaagacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaa-ccaaaaataatttgattcttttattcc 11462  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  11463 a-aatgactttaatattctt 11481  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4442 - 4225
Alignment:
Q  116 cattttacaccattaaatattccgaatttgatcttgaatcaaacagatgaaatgtaga-gaatttcgtaagctttccaacgagttaaagatcacctcaaa 214  Q
    ||||||||||||| | || | |||| |||| |  ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||  ||||||||||||||||     
T  4442 cattttacaccatgatatctgccgattttgcttctgagtcaaacatatgaaatgtagatgaattt-gtaccctttcgaacgctttaaagatcacctcaat 4344  T
Q  215 cggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttgaacccaaaattaatttggttcttttattcc 314  Q
    ||||  |  ||||||| | |||| |  || |||| ||||| | || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  4343 cggagttgtagagctctaaatatgatgaatacaatacagatacataatgacctacgaaaataacaatttgaaccaaaaat-aatttgattcttttattcc 4245  T
Q  315 acaatgactttattattctt 334  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4244 ataatgactttattattctt 4225  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Original strand, 375245 - 375392
Alignment:
Q  186 ctttccaacgagttaaagatcacctcaaacggacatccagagctccagatataaccaaaacaagacagacatatcatgatctacgaaaataaaactttga 285  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| |  || |||||||||| | || |||| |||| ||||||| | |||||    
T  375245 ctttccaacgcttcaaagatcacctcaatcagagttccagagctctagatatgaggaatacaagacagatacataatgacctacaaaaataacaatttga 375344  T
Q  286 acccaaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  375345 accaaaaat-aatttgattcttttattccataatgaatttattattctt 375392  T

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Target: chr6 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 334
Target Start/End: Original strand, 12037064 - 12037103
Alignment:
Q  295 taatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12037064 taatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 12037103  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12037053 - 12037016
Alignment:
Q  297 atttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12037053 atttggttcttttattccacaatgactttattattctt 12037016  T

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Target: scaffold0359 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 8902 - 8946
Alignment:
Q  290 aaaattaatttggttcttttattccacaatgactttattattctt 334  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8902 aaaattaacttggttcttatattccacaatgactttattattctt 8946  T

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