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Alignment Overview

Query: NF4705_high_13 (Length: 329)

Name: NF4705_high_13
Description: NF4705
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4705_high_13
NF4705_high_13
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (20-300)||(16376349-16376629)
chr6 (20-300)||(16383673-16383953)
chr6 (20-300)||(10488699-10488979)
chr6 (20-300)||(16556115-16556395)
chr6 (20-300)||(16632671-16632951)
chr6 (20-300)||(22225714-22225994)
chr6 (20-300)||(1556005-1556285)
chr6 (20-300)||(19610018-19610298)
chr6 (100-300)||(16231972-16232172)
chr6 (100-300)||(18086799-18086999)
chr6 (100-300)||(13620770-13620970)
chr6 (100-300)||(23977849-23978049)
chr6 (158-300)||(19299375-19299517)
chr6 (89-300)||(29665942-29666153)
chr6 (194-300)||(22251542-22251648)
chr6 (20-107)||(33314387-33314474)
chr6 (140-300)||(29869752-29869911)
chr6 (85-200)||(27740903-27741018)
chr6 (221-300)||(16825724-16825803)
chr6 (157-278)||(14626124-14626243)
chr6 (188-300)||(1650077-1650189)
chr6 (249-300)||(25175792-25175843)
chr6 (248-300)||(27653955-27654007)
chr6 (141-278)||(15862592-15862728)
chr6 (127-278)||(35009445-35009595)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (20-300)||(1467715-1467995)
chr3 (20-300)||(49232436-49232716)
chr3 (20-300)||(25058739-25059019)
chr3 (20-300)||(12902066-12902346)
chr3 (24-299)||(5228317-5228591)
chr3 (64-300)||(22275253-22275489)
chr3 (64-300)||(15468316-15468552)
chr3 (20-300)||(12264768-12265049)
chr3 (100-300)||(18911073-18911273)
chr3 (117-300)||(12811938-12812121)
chr3 (20-300)||(44228985-44229265)
chr3 (94-300)||(54651531-54651737)
chr3 (20-142)||(18897133-18897255)
chr3 (190-300)||(18897020-18897130)
chr3 (42-278)||(11986172-11986408)
chr3 (159-300)||(16821280-16821419)
chr3 (188-300)||(55316387-55316499)
chr3 (221-300)||(41270276-41270355)
chr3 (131-300)||(15936611-15936779)
chr3 (158-300)||(15614973-15615113)
chr3 (257-300)||(15938453-15938496)
chr3 (157-278)||(51158024-51158143)
chr3 (102-236)||(17912530-17912662)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (20-300)||(11231314-11231594)
chr2 (20-300)||(22513161-22513441)
chr2 (20-300)||(28775783-28776063)
chr2 (20-300)||(24685757-24686037)
chr2 (20-300)||(12728392-12728672)
chr2 (20-300)||(34824475-34824755)
chr2 (20-300)||(16935593-16935873)
chr2 (20-300)||(17006253-17006533)
chr2 (20-300)||(23778021-23778301)
chr2 (100-300)||(8943926-8944126)
chr2 (100-300)||(12635844-12636044)
chr2 (100-300)||(42177945-42178145)
chr2 (100-300)||(3798579-3798779)
chr2 (100-300)||(12641618-12641818)
chr2 (20-300)||(21141895-21142175)
chr2 (140-300)||(23774257-23774416)
chr2 (140-300)||(5888606-5888765)
chr2 (157-284)||(7507844-7507969)
chr2 (221-300)||(19886633-19886712)
chr2 (127-278)||(25265396-25265546)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (20-300)||(31309-31589)
scaffold0107 (20-300)||(39646-39926)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (20-300)||(39103-39383)
scaffold0076 (158-300)||(43137-43277)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (20-300)||(271336-271616)
chr8 (20-300)||(644304-644584)
chr8 (20-300)||(830039-830319)
chr8 (20-300)||(22088770-22089050)
chr8 (20-300)||(15319135-15319415)
chr8 (20-300)||(15499504-15499784)
chr8 (20-300)||(22006234-22006514)
chr8 (20-300)||(13662241-13662521)
chr8 (100-300)||(13720904-13721104)
chr8 (20-300)||(16195230-16195511)
chr8 (100-300)||(16873027-16873227)
chr8 (158-300)||(21844544-21844684)
chr8 (158-300)||(21851937-21852077)
chr8 (157-300)||(24549120-24549261)
chr8 (157-299)||(6774231-6774371)
chr8 (139-300)||(16674364-16674524)
chr8 (248-300)||(30120950-30121002)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (20-300)||(7822728-7823008)
chr7 (20-300)||(7830039-7830319)
chr7 (20-300)||(27101613-27101893)
chr7 (20-300)||(27108961-27109241)
chr7 (20-300)||(27176433-27176713)
chr7 (20-300)||(38783705-38783985)
chr7 (20-300)||(15950767-15951047)
chr7 (20-300)||(15760090-15760370)
chr7 (100-300)||(18979997-18980197)
chr7 (100-300)||(14250874-14251074)
chr7 (100-300)||(15927648-15927848)
chr7 (100-300)||(13758450-13758650)
chr7 (153-296)||(48622646-48622788)
chr7 (140-300)||(10000346-10000505)
chr7 (140-300)||(16418618-16418777)
chr7 (71-278)||(13321065-13321273)
chr7 (158-300)||(13572816-13572956)
chr7 (157-300)||(16478934-16479075)
chr7 (139-300)||(13910996-13911156)
chr7 (188-300)||(10989577-10989689)
chr7 (188-300)||(18253819-18253931)
chr7 (188-300)||(2437625-2437737)
chr7 (157-278)||(47481037-47481156)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (20-300)||(35582036-35582316)
chr5 (20-300)||(21932357-21932637)
chr5 (20-300)||(21938527-21938807)
chr5 (20-300)||(22883060-22883340)
chr5 (20-300)||(36989746-36990026)
chr5 (20-300)||(1219496-1219776)
chr5 (20-300)||(7425324-7425604)
chr5 (64-300)||(17471564-17471800)
chr5 (100-300)||(10777946-10778146)
chr5 (100-300)||(23514641-23514841)
chr5 (20-300)||(35791074-35791355)
chr5 (20-300)||(11212041-11212321)
chr5 (140-300)||(23328678-23328837)
chr5 (140-300)||(24616282-24616441)
chr5 (140-300)||(24712658-24712817)
chr5 (140-300)||(24745676-24745835)
chr5 (44-278)||(32950717-32950952)
chr5 (158-300)||(27009981-27010121)
chr5 (221-300)||(18777964-18778043)
chr5 (221-300)||(12575-12654)
chr5 (221-300)||(25426829-25426908)
chr5 (157-300)||(29188256-29188397)
chr5 (188-299)||(43443368-43443479)
chr5 (221-300)||(19500100-19500179)
chr5 (221-300)||(22366453-22366532)
chr5 (248-300)||(21073567-21073619)
chr5 (139-300)||(4199957-4200117)
chr5 (20-67)||(23328558-23328605)
chr5 (22-67)||(24616165-24616210)
chr5 (22-67)||(24712541-24712586)
chr5 (22-67)||(24745559-24745604)
chr5 (141-275)||(34939398-34939531)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (20-300)||(17004638-17004918)
chr1 (20-300)||(18059734-18060014)
chr1 (20-300)||(38055067-38055347)
chr1 (25-300)||(46523394-46523669)
chr1 (100-300)||(17148647-17148847)
chr1 (158-300)||(19962475-19962617)
chr1 (140-300)||(7640910-7641069)
chr1 (140-300)||(22035568-22035727)
chr1 (157-300)||(22227947-22228088)
chr1 (157-300)||(22232644-22232785)
chr1 (188-300)||(5072360-5072472)
chr1 (188-300)||(18601090-18601202)
chr1 (157-300)||(2116393-2116534)
chr1 (157-300)||(45051561-45051702)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (20-300)||(29162-29442)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (20-300)||(153983-154263)
scaffold0023 (248-300)||(169884-169936)
scaffold0023 (254-300)||(36327-36373)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (20-300)||(18168970-18169250)
chr4 (20-300)||(19020486-19020766)
chr4 (20-300)||(15287221-15287501)
chr4 (20-300)||(15294330-15294610)
chr4 (100-299)||(7132042-7132241)
chr4 (20-300)||(17145633-17145913)
chr4 (20-300)||(18248218-18248498)
chr4 (100-300)||(20000803-20001003)
chr4 (141-300)||(22738390-22738549)
chr4 (20-230)||(8374508-8374718)
chr4 (140-300)||(26339140-26339299)
chr4 (155-300)||(22352040-22352184)
chr4 (159-300)||(10644360-10644499)
chr4 (236-300)||(8378367-8378431)
chr4 (89-236)||(40885602-40885748)
chr4 (248-300)||(47357882-47357934)
chr4 (71-278)||(15675095-15675301)
chr4 (20-61)||(22738269-22738310)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (20-300)||(1551-1831)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (20-300)||(10315-10595)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (20-300)||(2392-2672)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (20-269)||(3-252)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (20-294)||(34140-34414)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (100-300)||(1490-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (20-300)||(7432-7712)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (20-300)||(54416-54696)
scaffold0066 (71-300)||(45081-45310)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (153-299)||(54008-54153)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (157-300)||(5188-5329)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (140-300)||(6718-6877)
scaffold0183 (20-67)||(6598-6645)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (153-299)||(3547-3692)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (89-278)||(56105-56294)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (140-300)||(7330-7489)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (188-300)||(3890-4002)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (102-300)||(3045-3242)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (140-300)||(23725-23884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (160-299)||(177-314)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (157-300)||(9321-9462)
scaffold0215 (157-300)||(16219-16360)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (188-300)||(1276-1388)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (248-300)||(10724-10776)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (158-300)||(64495-64640)
scaffold0026 (188-300)||(107914-108026)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (157-300)||(13297-13438)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (254-300)||(12103-12149)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (158-300)||(21088-21228)
scaffold0139 (158-300)||(14034-14173)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (155-278)||(3324-3447)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (188-278)||(41815-41905)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (127-278)||(13613-13763)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (254-300)||(31647-31693)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (157-278)||(3588-3707)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (134-278)||(962-1105)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (157-278)||(36919-37038)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16376629 - 16376349
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16376629 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16376530  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16376529 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16376430  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16376429 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16376349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16383953 - 16383673
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16383953 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16383854  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16383853 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16383754  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16383753 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16383673  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 10488699 - 10488979
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10488699 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 10488798  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10488799 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 10488898  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10488899 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 10488979  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16556395 - 16556115
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16556395 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16556296  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16556295 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16556196  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16556195 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16556115  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16632951 - 16632671
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16632951 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16632852  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16632851 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16632752  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16632751 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 16632671  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22225994 - 22225714
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225994 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 22225895  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22225894 caatcaaaacatttcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22225795  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225794 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 22225714  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 1556005 - 1556285
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1556005 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 1556104  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1556105 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1556204  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556205 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 1556285  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 19610018 - 19610298
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  19610018 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaactacatctcattt 19610117  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19610118 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataattttataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 19610217  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19610218 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatac 19610298  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 16231972 - 16232172
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231972 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16232071  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232072 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 16232171  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  16232172 c 16232172  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18086999 - 18086799
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086999 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18086900  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086899 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18086800  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  18086799 c 18086799  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13620970 - 13620770
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13620970 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaattt 13620871  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620870 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13620771  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  13620770 c 13620770  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 23977849 - 23978049
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23977849 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23977948  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23977949 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 23978048  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  23978049 c 23978049  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299517
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  19299375 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19299474  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19299475 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatac 19299517  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 300
Target Start/End: Original strand, 29665942 - 29666153
Alignment:
Q  89 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 188  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||| || |||| |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29665942 acatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatgcatactttgaa 29666041  T
Q  189 acatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaac 288  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  29666042 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcacc 29666141  T
Q  289 ccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||    
T  29666142 ccattttcatac 29666153  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251542
Alignment:
Q  194 taatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  294 ttcatac 300  Q
    |||||||    
T  22251548 ttcatac 22251542  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 33314474 - 33314387
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaat 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314474 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaat 33314387  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29869911 - 29869752
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29869911 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacacttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 29869812  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29869811 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 29869752  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 27740903 - 27741018
Alignment:
Q  85 aaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactt 184  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  |  || || |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740903 aaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactt 27741002  T
Q  185 tgaaacatgtaatttc 200  Q
     |||||||||||||||    
T  27741003 cgaaacatgtaatttc 27741018  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16825803 - 16825724
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16825803 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 16825724  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14626243 - 14626124
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||    
T  14626243 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 14626146  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  14626145 gagcacgaatttagcaataatt 14626124  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1650189 - 1650077
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  ||  || | |||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  1650189 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 1650090  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  1650089 cccattttcatac 1650077  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 25175792 - 25175843
Alignment:
Q  249 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25175792 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatac 25175843  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27654007 - 27653955
Alignment:
Q  248 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27654007 tcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatac 27653955  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 278
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862728
Alignment:
Q  141 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| ||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  |    
T  15862592 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaa 15862689  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    | ||| | ||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  15862690 acataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaatt 15862728  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35009595 - 35009445
Alignment:
Q  127 aacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatca 225  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||    
T  35009595 aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 35009498  T
Q  226 attcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||| |||||  ||  || | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  35009497 attcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 35009445  T

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Target: chr3 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1467995 - 1467715
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1467995 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 1467896  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1467895 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 1467796  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1467795 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 1467715  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 49232436 - 49232716
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49232436 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 49232535  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  49232536 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 49232635  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232636 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 49232716  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 25058739 - 25059019
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25058739 catcatcaattcacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcataagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 25058838  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25058839 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 25058938  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058939 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 25059019  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12902346 - 12902066
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12902346 catcattaatccacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagtatcagttaataataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 12902247  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12902246 caatcaaaacatatcaaatttaatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12902147  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12902146 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatac 12902066  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 5228317 - 5228591
Alignment:
Q  24 atcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaat 123  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5228317 atcaattcacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacacctcatttcaat 5228416  T
Q  124 caaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5228417 caaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 5228516  T
Q  224 caattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5228517 caattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa-tgttcatcaacccattttcata 5228591  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Original strand, 22275253 - 22275489
Alignment:
Q  64 acaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcata 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22275253 acaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatg 22275352  T
Q  164 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22275353 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacg 22275452  T
Q  264 aatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275453 aatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 22275489  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15468552 - 15468316
Alignment:
Q  64 acaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcata 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15468552 acaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatg 15468453  T
Q  164 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15468452 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacg 15468353  T
Q  264 aatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15468352 aatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatac 15468316  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12265049 - 12264768
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12265049 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 12264950  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccata 218  Q
    |||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12264949 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 12264850  T
Q  219 atcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264849 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 12264768  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 18911073 - 18911273
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911073 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18911172  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911173 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18911272  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  18911273 c 18911273  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 117 - 300
Target Start/End: Original strand, 12811938 - 12812121
Alignment:
Q  117 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacatacca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12811938 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataaattcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacatacca 12812037  T
Q  217 taatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12812038 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatac 12812121  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 44228985 - 44229265
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44228985 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 44229084  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  44229085 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 44229184  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44229185 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 44229265  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 300
Target Start/End: Original strand, 54651531 - 54651737
Alignment:
Q  94 aatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatg 193  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54651531 aatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgcaacatg 54651630  T
Q  194 taatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 293  Q
     |||||| | || || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  54651631 caatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccatt 54651730  T
Q  294 ttcatac 300  Q
    |||||||    
T  54651731 ttcatac 54651737  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18897255 - 18897133
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18897255 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 18897156  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18897155 caatcaaaacatatcaaatttca 18897133  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18897020
Alignment:
Q  190 catgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacc 289  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18897130 catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc 18897031  T
Q  290 cattttcatac 300  Q
    |||||||||||    
T  18897030 cattttcatac 18897020  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11986408 - 11986172
Alignment:
Q  42 atacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttc 141  Q
    |||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||| |  | | |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||| |||    
T  11986408 atacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattc 11986309  T
Q  142 atcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaa 241  Q
    |  | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||| || ||||| || ||| ||| | ||||    
T  11986308 actatttgagcacaatttcataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaa 11986209  T
Q  242 atagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11986208 ataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Original strand, 16821280 - 16821419
Alignment:
Q  159 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaaga 258  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||| | |||||  || ||| | |||||||||||    
T  16821280 tcatagcttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaaga 16821377  T
Q  259 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16821378 gcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatac 16821419  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 55316387 - 55316499
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  55316387 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 55316486  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  55316487 cccattttcatac 55316499  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 41270276 - 41270355
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270276 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 41270355  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15936779 - 15936611
Alignment:
Q  131 tatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattc 229  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||||| || |||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||    
T  15936779 tatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacaca-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc 15936682  T
Q  230 aagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    | |||||  || ||| | | ||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936681 atgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatac 15936611  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 15614973 - 15615113
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| |  ||||| |||    
T  15614973 ttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaag 15615070  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15615071 agcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 15615113  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15938496 - 15938453
Alignment:
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938496 gagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatac 15938453  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 51158143 - 51158024
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
T  51158143 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 51158046  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  51158045 gagcacgaatttagcaacaatt 51158024  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17912662 - 17912530
Alignment:
Q  102 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttc 200  Q
    |||||||| | |||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  17912662 atgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaatt-catcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatattt--aaacatgtaatttc 17912566  T
Q  201 gcccataaacataccataatcatcaattcaagcata 236  Q
     || | || ||||| || |||||||||||| |||||    
T  17912565 accaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 17912530  T

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Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11231594 - 11231314
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11231594 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 11231495  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11231494 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 11231395  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11231394 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 11231314  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22513441 - 22513161
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22513441 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22513342  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22513341 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22513242  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22513241 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 22513161  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28776063 - 28775783
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28776063 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 28775964  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28775963 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 28775864  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28775863 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 28775783  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24686037 - 24685757
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24686037 catcatcaatccacaattaagtatacctaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 24685938  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24685937 caatcaaaacacatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 24685838  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24685837 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 24685757  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 12728392 - 12728672
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12728392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 12728491  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12728492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12728591  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728592 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 12728672  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 34824475 - 34824755
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34824475 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 34824574  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34824575 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34824674  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824675 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 34824755  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 16935593 - 16935873
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16935593 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 16935692  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  16935693 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 16935792  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935793 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 16935873  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 17006253 - 17006533
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17006253 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 17006352  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  17006353 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 17006452  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006453 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 17006533  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23778301 - 23778021
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23778301 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 23778202  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  23778201 caatcaaatcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 23778102  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23778101 tcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 23778021  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 8943926 - 8944126
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8943926 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 8944025  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944026 cacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 8944125  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  8944126 c 8944126  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12636044 - 12635844
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12636044 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12635945  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12635944 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcata 12635845  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  12635844 c 12635844  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42178145 - 42177945
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178145 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 42178046  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178045 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 42177946  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  42177945 c 42177945  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3798779 - 3798579
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798779 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 3798680  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3798679 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 3798580  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  3798579 c 3798579  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12641818 - 12641618
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641818 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12641719  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12641718 cagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 12641619  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  12641618 c 12641618  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 21141895 - 21142175
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21141895 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 21141994  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21141995 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 21142094  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21142095 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 21142175  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 23774257 - 23774416
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23774257 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23774356  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23774357 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 23774416  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5888765 - 5888606
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  5888765 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 5888667  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     || |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5888666 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 5888606  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7507969 - 7507844
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  7507969 tttcataacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa 7507872  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcat 284  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  7507871 gagcacgaatttagcaataattattcat 7507844  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19886712 - 19886633
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19886712 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 19886633  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25265546 - 25265396
Alignment:
Q  127 aacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatca 225  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||    
T  25265546 aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 25265449  T
Q  226 attcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||| |||||  || ||| | ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25265448 attcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 25265396  T

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Target: scaffold0107 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 31309 - 31589
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31309 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 31408  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31409 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 31508  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31509 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 31589  T

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Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 39646 - 39926
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  39646 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatgaaatatgaataacatctcattt 39745  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  39746 caaaaaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataa 39845  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846 tcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 39926  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39383
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39103 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 39202  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39203 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 39302  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39303 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 39383  T

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Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 43137 - 43277
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | || |||||||    
T  43137 ttcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaag 43234  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43235 agcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatac 43277  T

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Target: chr8 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 271616 - 271336
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  271616 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 271517  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  271516 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 271417  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  271416 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 271336  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 644304 - 644584
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  644304 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 644403  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  644404 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 644503  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  644504 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 644584  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 830039 - 830319
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 830138  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 830238  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 830319  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22089050 - 22088770
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22089050 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22088951  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22088950 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataa 22088851  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22088850 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatac 22088770  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15319415 - 15319135
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15319415 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15319316  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15319315 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15319216  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15319215 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 15319135  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15499784 - 15499504
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15499784 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15499685  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15499684 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15499585  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15499584 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 15499504  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22006514 - 22006234
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22006514 catcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 22006415  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22006414 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 22006315  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006314 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 22006234  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13662521 - 13662241
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13662521 catcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 13662422  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13662421 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 13662322  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13662321 tcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatac 13662241  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13721104 - 13720904
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721104 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13721005  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721004 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13720905  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  13720904 c 13720904  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 16195230 - 16195511
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||   ||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16195230 catcatcaatccataattatatatacctaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 16195329  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccata 218  Q
    |||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16195330 caacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 16195429  T
Q  219 atcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195430 atcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 16195511  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16873227 - 16873027
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873227 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16873128  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16873127 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 16873028  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  16873027 c 16873027  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21844684 - 21844544
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
T  21844684 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 21844587  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21844586 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatac 21844544  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21852077 - 21851937
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||| ||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
T  21852077 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 21851980  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21851979 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatac 21851937  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 24549120 - 24549261
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
T  24549120 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 24549217  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24549218 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 24549261  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6774371 - 6774231
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
T  6774371 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 6774274  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6774273 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcata 6774231  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16674524 - 16674364
Alignment:
Q  139 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataa 237  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| ||||||||||| || | || ||||| |  | ||| |||||| ||||||    
T  16674524 ttcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataa 16674427  T
Q  238 gaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     || ||| | |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16674426 aaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatac 16674364  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 30120950 - 30121002
Alignment:
Q  248 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  30120950 tcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatac 30121002  T

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Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 7822728 - 7823008
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7822728 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7822827  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7822828 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7822927  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7822928 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 7823008  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 7830039 - 7830319
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7830138  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7830238  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 7830319  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27101893 - 27101613
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27101893 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27101794  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27101793 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27101694  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27101693 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 27101613  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27109241 - 27108961
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27109241 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27109142  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27109141 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27109042  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27109041 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 27108961  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 27176433 - 27176713
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27176433 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27176532  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27176533 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27176632  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27176633 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 27176713  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38783985 - 38783705
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38783985 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38783886  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38783885 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38783786  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38783785 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 38783705  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15951047 - 15950767
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15951047 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 15950948  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15950947 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15950848  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950847 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 15950767  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15760370 - 15760090
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15760370 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcattattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15760271  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  15760270 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataa 15760171  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15760170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatac 15760090  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18980197 - 18979997
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980197 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18980098  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980097 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18979998  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  18979997 c 18979997  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14251074 - 14250874
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251074 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 14250975  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250974 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 14250875  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  14250874 c 14250874  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 15927648 - 15927848
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927648 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 15927747  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15927748 cacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcata 15927847  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  15927848 c 15927848  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 13758450 - 13758650
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758450 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13758549  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13758550 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 13758649  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  13758650 c 13758650  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48622788 - 48622646
Alignment:
Q  153 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcaca 252  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||    
T  48622788 ataatttcacaacttaacaattatgcatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcaca 48622690  T
Q  253 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttc 296  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48622689 gtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttc 48622646  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10000505 - 10000346
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  10000505 tcatcaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 10000407  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||| | |  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10000406 aaacaacaacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatac 10000346  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 16418618 - 16418777
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  16418618 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 16418716  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     || |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16418717 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 16418777  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 13321065 - 13321273
Alignment:
Q  71 catcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaa--aacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactta 168  Q
    ||||| ||||||| ||  |||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||  ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||     
T  13321065 catcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaa-caatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttg 13321163  T
Q  169 acatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaattt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||  |||||||||||||    
T  13321164 acatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt 13321263  T
Q  269 aacaacaatt 278  Q
    | ||||||||    
T  13321264 agcaacaatt 13321273  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 13572816 - 13572956
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||| || | || || || || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
T  13572816 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 13572913  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13572914 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 13572956  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16479075 - 16478934
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | || ||| ||    
T  16479075 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaa 16478978  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16478977 gagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatac 16478934  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13911156 - 13910996
Alignment:
Q  139 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataa 237  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| ||||||||||| || | || ||||| || | |||||||||| |||||     
T  13911156 ttcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatac 13911059  T
Q  238 gaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     || ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  13911058 aaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatac 13910996  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 10989577 - 10989689
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  10989577 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaa 10989676  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  10989677 cccattttcatac 10989689  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18253931 - 18253819
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | | ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 18253832  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  18253831 cccattttcatac 18253819  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 2437625 - 2437737
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |     
T  2437625 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattat 2437724  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  2437725 cccattttcatac 2437737  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47481156 - 47481037
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |  | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||  |    
T  47481156 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtta 47481059  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  47481058 gagcacgaatttagcaacaatt 47481037  T

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Target: chr5 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 35582036 - 35582316
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35582036 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 35582135  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35582136 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 35582235  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35582236 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 35582316  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21932637 - 21932357
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21932637 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21932538  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21932537 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21932438  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21932437 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 21932357  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21938807 - 21938527
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21938807 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21938708  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21938707 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21938608  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21938607 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 21938527  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22883340 - 22883060
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22883340 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22883241  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22883240 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataa 22883141  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22883140 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 22883060  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36990026 - 36989746
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36990026 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 36989927  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36989926 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 36989827  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36989826 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 36989746  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1219776 - 1219496
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1219776 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatgaaatatgaatcacatctcattt 1219677  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1219676 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1219577  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219576 tcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 1219496  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 7425324 - 7425604
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7425324 catcatcaatccataattaagtatatccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 7425423  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7425424 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 7425523  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7425524 ccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatac 7425604  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 64 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17471800 - 17471564
Alignment:
Q  64 acaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcata 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17471800 acaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatt 17471701  T
Q  164 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17471700 acttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacg 17471601  T
Q  264 aatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471600 aatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatac 17471564  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10778146 - 10777946
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778146 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 10778047  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778046 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 10777947  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  10777946 c 10777946  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 23514641 - 23514841
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514641 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23514740  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514741 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 23514840  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  23514841 c 23514841  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35791355 - 35791074
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||   ||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35791355 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 35791256  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccata 218  Q
    |||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  35791255 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcactcacaaacataccata 35791156  T
Q  219 atcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791155 atcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 35791074  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11212321 - 11212041
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11212321 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 11212222  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||  | ||||||| ||| ||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11212221 caacaacaacatattaaaattcactacttgagtataatttcataacttaacatttatacacactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 11212122  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11212121 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 11212041  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 23328678 - 23328837
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23328678 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23328777  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23328778 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 23328837  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 24616282 - 24616441
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24616282 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24616381  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24616382 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 24616441  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 24712658 - 24712817
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24712658 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24712757  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24712758 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 24712817  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 24745676 - 24745835
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24745676 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataaga 24745775  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24745776 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 24745835  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 32950717 - 32950952
Alignment:
Q  44 acccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcat 143  Q
    |||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||| |  | | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||| ||||     
T  32950717 acccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattcac 32950816  T
Q  144 caattaagcataatttcataactta-acatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaa 242  Q
    || || |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||| |||  || | |||||    
T  32950817 catttgagcacaatttcataactttgacctttatacatactttgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaa 32950916  T
Q  243 tagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32950917 taacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Original strand, 27009981 - 27010121
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||| || | |  ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||    
T  27009981 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 27010078  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27010079 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 27010121  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18778043 - 18777964
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18778043 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatac 18777964  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 12575 - 12654
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12575 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 12654  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 25426829 - 25426908
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25426829 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 25426908  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29188397 - 29188256
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
T  29188397 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 29188300  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29188299 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccattttcatac 29188256  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43443479 - 43443368
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43443479 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaa 43443380  T
Q  288 cccattttcata 299  Q
     |||||||||||    
T  43443379 tccattttcata 43443368  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 19500100 - 19500179
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  19500100 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatac 19500179  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22366532 - 22366453
Alignment:
Q  221 catcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22366532 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatac 22366453  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21073619 - 21073567
Alignment:
Q  248 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21073619 tcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatac 21073567  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4200117 - 4199957
Alignment:
Q  139 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataa 237  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| ||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||     
T  4200117 ttcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatac 4200020  T
Q  238 gaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     || ||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  4200019 aaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatac 4199957  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Original strand, 23328558 - 23328605
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23328558 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 23328605  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 24616165 - 24616210
Alignment:
Q  22 tcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  24616165 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 24616210  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 24712541 - 24712586
Alignment:
Q  22 tcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  24712541 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 24712586  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Original strand, 24745559 - 24745604
Alignment:
Q  22 tcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  24745559 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 24745604  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 275
Target Start/End: Original strand, 34939398 - 34939531
Alignment:
Q  141 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||   ||||||| ||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  |    
T  34939398 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaa 34939495  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaaca 275  Q
    | ||| | ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  34939496 acataacatcacagttagagcacgaatttagcaaca 34939531  T

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Target: chr1 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 17004638 - 17004918
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17004638 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 17004737  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17004738 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 17004837  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17004838 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 17004918  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18060014 - 18059734
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18060014 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18059915  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18059914 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 18059815  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059814 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 18059734  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38055347 - 38055067
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38055347 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38055248  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38055247 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38055148  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38055147 tcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatac 38055067  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Original strand, 46523394 - 46523669
Alignment:
Q  25 tcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatc 124  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46523394 tcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatc 46523493  T
Q  125 aaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  46523494 aaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatc 46523593  T
Q  225 aattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523594 aattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 46523669  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 17148647 - 17148847
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148647 atatgatttacatctcatttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 17148746  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17148747 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 17148846  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  17148847 c 17148847  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19962617 - 19962475
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  19962617 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19962518  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19962517 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatac 19962475  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7641069 - 7640910
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7641069 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 7640970  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7640969 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 7640910  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 22035568 - 22035727
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22035568 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 22035667  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22035668 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 22035727  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 22227947 - 22228088
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |  | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||    
T  22227947 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaa 22228044  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22228045 gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 22228088  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 22232644 - 22232785
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |  | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||    
T  22232644 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaa 22232741  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22232742 gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 22232785  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5072472 - 5072360
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  5072472 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 5072373  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  5072372 cccattttcatac 5072360  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18601202 - 18601090
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  18601202 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaa 18601103  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  18601102 cccattttcatac 18601090  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 2116393 - 2116534
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||| ||    
T  2116393 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 2116490  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2116491 aagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatac 2116534  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 45051561 - 45051702
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  ||  || | |||||| ||    
T  45051561 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaa 45051658  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45051659 gaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 45051702  T

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Target: scaffold0213 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 29162 - 29442
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29162 catcatcaatacacaattaagtataaccaaatcataattcactaacaataacataaattaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 29261  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29262 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataa 29361  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29362 tcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 29442  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 154263 - 153983
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  154263 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacccacaatagcataagttaacaataaccacatcaatggaatatgattcacatctcattt 154164  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  154163 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataa 154064  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154063 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 153983  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 169936 - 169884
Alignment:
Q  248 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  169936 tcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 169884  T

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Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36373
Alignment:
Q  254 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatac 36373  T

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Target: chr4 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 18168970 - 18169250
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18168970 catcatcaattcacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagcattatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18169069  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18169070 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 18169169  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 18169250  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 19020486 - 19020766
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19020486 catcatcaatccacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 19020585  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19020586 caatcaaaacatatcaaatttcatccattaaggataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 19020685  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19020686 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 19020766  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15287501 - 15287221
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15287501 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15287402  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15287401 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15287302  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15287301 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatac 15287221  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15294610 - 15294330
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15294610 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15294511  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15294510 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15294411  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15294410 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatac 15294330  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7132241 - 7132042
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132241 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 7132142  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132141 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 7132042  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17145913 - 17145633
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17145913 catcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 17145814  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||  | ||||||||||| ||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17145813 caacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 17145714  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17145713 tcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatac 17145633  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 18248218 - 18248498
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||| | |||||  |||||| || |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18248218 catcatcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 18248317  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||  | ||||||| ||| ||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18248318 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcatatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 18248417  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18248418 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 18248498  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Original strand, 20000803 - 20001003
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000803 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 20000902  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20000903 cacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 20001002  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  20001003 c 20001003  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 141 - 300
Target Start/End: Original strand, 22738390 - 22738549
Alignment:
Q  141 catcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22738390 catcaattaagcataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaa 22738489  T
Q  241 aatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22738490 aatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatac 22738549  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 8374508 - 8374718
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||| | |||||  |||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8374508 catcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 8374607  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||  | ||||||| ||| ||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8374608 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataa 8374707  T
Q  220 tcatcaattca 230  Q
    |||||||||||    
T  8374708 tcatcaattca 8374718  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 26339140 - 26339299
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26339140 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 26339239  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26339240 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 26339299  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22352184 - 22352040
Alignment:
Q  155 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagc 254  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||  || | |    
T  22352184 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataac 22352086  T
Q  255 aagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22352085 aagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 22352040  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Original strand, 10644360 - 10644499
Alignment:
Q  159 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaaga 258  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |  | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||    
T  10644360 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 10644457  T
Q  259 gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644458 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 10644499  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 300
Target Start/End: Original strand, 8378367 - 8378431
Alignment:
Q  236 aagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8378367 aagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 8378431  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40885748 - 40885602
Alignment:
Q  89 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 188  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40885748 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttcataacttgacatttatacatactttg-a 40885650  T
Q  189 acatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcata 236  Q
    |||||||||||| || | |||||| | || |||| ||||||| |||||    
T  40885649 acatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcata 40885602  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 47357882 - 47357934
Alignment:
Q  248 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47357882 tcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 47357934  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15675301 - 15675095
Alignment:
Q  71 catcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaa 169  Q
    ||||| ||||||| ||  |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  15675301 catcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttca 15675202  T
Q  170 catttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaattta 269  Q
    ||||| |||||| ||   ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||   |||||||||||||    
T  15675201 catttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattta 15675104  T
Q  270 acaacaatt 278  Q
     ||||||||    
T  15675103 gcaacaatt 15675095  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 22738269 - 22738310
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcac 61  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22738269 catcattaatccacaattaagtatacccaagtcataattcac 22738310  T

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Target: scaffold0761 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1551
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| | |||||||||||    
T  1831 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaattttatatgatttacatctcattt 1732  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1731 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1632  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 1551  T

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Target: scaffold0467 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10595 - 10315
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10595 catcatcaatccacaattaagtatacccaagtcatgattccctcacaatagcatcagttaacaacaacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 10496  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10495 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 10396  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10395 tcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatac 10315  T

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Target: scaffold0383 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 2392 - 2672
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaaccatgattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 2491  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 2591  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2592 gcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 2672  T

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Target: scaffold1666 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 3
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  252 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataactacatcaatgtaatatgaattacatctcattt 153  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  152 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 53  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaattta 269  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34414 - 34140
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34414 catcatcaatccataatttagtatacccaagtcatgattcactcacaatagcatcagttaatagcaacaacattaatggaacatgaatcatatctcattt 34315  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||  | |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34314 caacaacaacatatccaaattcatcaattaagtataacttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34215  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattt 294  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34214 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaacccattt 34140  T

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Target: scaffold1500 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1490
Alignment:
Q  100 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1690 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 1591  T
Q  200 cgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590 cacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 1491  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  1490 c 1490  T

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Target: scaffold0191 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7712 - 7432
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7712 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacatcagttaataacaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 7613  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7612 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 7513  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7512 tcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatac 7432  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 54416 - 54696
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 119  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  54416 catcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 54515  T
Q  120 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataa 219  Q
    |||  | ||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |    
T  54516 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaatta 54615  T
Q  220 tcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54616 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatac 54696  T

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Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 71 - 300
Target Start/End: Original strand, 45081 - 45310
Alignment:
Q  71 catcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaac 170  Q
    |||||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||| || | ||||||| ||||| ||    
T  45081 catcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcaaaacttgac 45180  T
Q  171 atttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaa 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  45181 atttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaa 45280  T
Q  271 caacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45281 caacaattattcatcaacccattttcatac 45310  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Original strand, 54008 - 54153
Alignment:
Q  153 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcaca 252  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  54008 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcaca 54106  T
Q  253 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  54107 gtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcata 54153  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5329 - 5188
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  5329 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 5232  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5231 gagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatac 5188  T

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Target: scaffold0183 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 6718 - 6877
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6718 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 6817  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||  |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6818 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 6877  T

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Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Original strand, 6598 - 6645
Alignment:
Q  20 catcatcaatccacaattaactatacccaaatcataattcacttacaa 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  6598 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaa 6645  T

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Target: scaffold0892 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3692
Alignment:
Q  153 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcaca 252  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||| | | |||||    
T  3547 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcaca 3645  T
Q  253 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3646 gtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcata 3692  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 56294 - 56105
Alignment:
Q  89 acattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 188  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||| |||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  56294 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttaaa 56195  T
Q  189 acatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56194 acatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7489
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  7330 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 7428  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     || |||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7429 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 7489  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 3890 - 4002
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 3989  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  3990 cccattttcatac 4002  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 300
Target Start/End: Original strand, 3045 - 3242
Alignment:
Q  102 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||| |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||    
T  3045 atgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttc 3142  T
Q  201 gcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     || | || ||||| || |||||||||||| | |||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3143 accaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 3242  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23884 - 23725
Alignment:
Q  140 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataaga 239  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||     
T  23884 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataag- 23786  T
Q  240 aaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||| | |  || | | ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  23785 aaacaacaacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatac 23725  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 299
Target Start/End: Original strand, 177 - 314
Alignment:
Q  160 cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagag 259  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||||||||    
T  177 cataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 274  T
Q  260 cacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 299  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  275 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcata 314  T

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Target: scaffold0215 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9462 - 9321
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||    
T  9462 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 9365  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9364 aagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 9321  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16360 - 16219
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||    
T  16360 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 16263  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16262 aagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 16219  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1388 - 1276
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |  | |||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  1388 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 1289  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  1288 cccattttcatac 1276  T

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Target: scaffold0092 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10776 - 10724
Alignment:
Q  248 tcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10776 tcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatac 10724  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 64640 - 64495
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaat-----tcaagcataagaaaatagcttcaca 252  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||     ||| |||||  || ||| | |||||    
T  64640 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcaca 64543  T
Q  253 gcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  64542 gcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatac 64495  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 107914 - 108026
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaa 287  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | | ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 108013  T
Q  288 cccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||    
T  108014 cccattttcatac 108026  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13297
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | |||||  ||    
T  13438 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaa 13341  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13340 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatac 13297  T

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Target: scaffold0516 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12103
Alignment:
Q  254 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatac 12103  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21228 - 21088
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |  | || ||||  || |||||||||| | | |||  || ||| | ||||| ||||    
T  21228 ttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaag 21131  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21130 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatac 21088  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 14034
Alignment:
Q  158 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaag 257  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||||||||| |  | || ||||  || |||||||||||| |||||   | ||| | ||||||||||    
T  14173 ttcataacttatcatttttacatatttc--aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaag 14076  T
Q  258 agcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14075 agcacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatac 14034  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 278
Target Start/End: Original strand, 3324 - 3447
Alignment:
Q  155 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagc 254  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||| |  ||||| |||||| |||||  ||  || | |||||||    
T  3324 aatttcataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagc 3423  T
Q  255 aagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
     |||||||||||||| || |||||    
T  3424 tagagcacgaatttagcatcaatt 3447  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 278
Target Start/End: Original strand, 41815 - 41905
Alignment:
Q  188 aacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41815 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 41905  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 278
Target Start/End: Original strand, 13613 - 13763
Alignment:
Q  127 aacatatcaaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatca 225  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||| || | || ||||| || |||||||    
T  13613 aacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 13710  T
Q  226 attcaagcataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||| |||||  || ||| | ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13711 attcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 13763  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31647
Alignment:
Q  254 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatac 300  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatac 31647  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3707 - 3588
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
T  3707 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 3610  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  3609 gagcacgaatttagcaacaatt 3588  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1105 - 962
Alignment:
Q  134 caaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaag 232  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| || |||||||||||| |    
T  1105 caaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 1008  T
Q  233 cataagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||  || ||| | ||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  1007 catacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 962  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37038 - 36919
Alignment:
Q  157 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcgcccataaacataccataatcatcaattcaagcataagaaaatagcttcacagcaa 256  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || | ||| || |||||||||||| |||||  || ||| | ||||||       
T  37038 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 36941  T
Q  257 gagcacgaatttaacaacaatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36940 gagcacgaatttaacaacaatt 36919  T

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