View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4707_high_7 (Length: 384)

Name: NF4707_high_7
Description: NF4707
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4707_high_7
NF4707_high_7
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (1-384)||(27394998-27395381)
chr2 (1-384)||(11631609-11631992)
chr2 (1-384)||(21673600-21673983)
chr2 (1-384)||(27779670-27780053)
chr2 (1-384)||(27819427-27819810)
chr2 (1-384)||(37682320-37682703)
chr2 (1-384)||(37697585-37697968)
chr2 (1-384)||(16825763-16826146)
chr2 (1-384)||(16895334-16895717)
chr2 (1-384)||(27119960-27120343)
chr2 (1-384)||(31879722-31880105)
chr2 (1-384)||(34294590-34294973)
chr2 (1-384)||(37928805-37929188)
chr2 (1-384)||(13932972-13933355)
chr2 (1-384)||(3785929-3786312)
chr2 (1-384)||(9346411-9346794)
chr2 (1-384)||(19412926-19413309)
chr2 (1-384)||(32053239-32053622)
chr2 (1-384)||(34865120-34865503)
chr2 (1-384)||(40236944-40237327)
chr2 (1-384)||(12590244-12590627)
chr2 (1-384)||(27430866-27431249)
chr2 (1-384)||(257078-257461)
chr2 (1-384)||(20841349-20841732)
chr2 (1-384)||(21699596-21699979)
chr2 (1-384)||(27807139-27807522)
chr2 (1-384)||(31889916-31890299)
chr2 (1-384)||(37381113-37381496)
chr2 (1-384)||(22924573-22924956)
chr2 (1-384)||(12658972-12659355)
chr2 (1-384)||(34158280-34158663)
chr2 (1-384)||(39048244-39048627)
chr2 (1-384)||(39893505-39893888)
chr2 (1-384)||(12713026-12713409)
chr2 (1-384)||(16164916-16165299)
chr2 (1-384)||(23124994-23125376)
chr2 (1-384)||(37948287-37948670)
chr2 (1-384)||(19452848-19453231)
chr2 (1-276)||(28885823-28886098)
chr2 (1-285)||(34271345-34271629)
chr2 (154-384)||(27827896-27828126)
chr2 (208-384)||(28885643-28885819)
chr2 (64-380)||(34533931-34534247)
chr2 (67-383)||(42393972-42394288)
chr2 (22-380)||(26723722-26724080)
chr2 (67-344)||(34701552-34701829)
chr2 (65-344)||(21760104-21760383)
chr2 (67-384)||(12384096-12384413)
chr2 (67-384)||(22949829-22950146)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-384)||(22077322-22077691)
chr8 (1-384)||(18712920-18713303)
chr8 (1-384)||(19204759-19205142)
chr8 (1-384)||(31357964-31358347)
chr8 (1-384)||(28358349-28358732)
chr8 (1-384)||(19677883-19678266)
chr8 (1-384)||(18794140-18794523)
chr8 (1-384)||(19691534-19691917)
chr8 (1-384)||(12089120-12089503)
chr8 (1-384)||(14561060-14561443)
chr8 (1-384)||(2133657-2134040)
chr8 (1-384)||(15771010-15771393)
chr8 (1-384)||(27605302-27605685)
chr8 (1-384)||(31486268-31486651)
chr8 (1-384)||(33262170-33262553)
chr8 (1-384)||(44564420-44564803)
chr8 (1-384)||(9358061-9358444)
chr8 (1-384)||(29832762-29833145)
chr8 (1-384)||(21344568-21344951)
chr8 (1-294)||(19657738-19658031)
chr8 (1-295)||(33245894-33246188)
chr8 (124-383)||(19844604-19844863)
chr8 (67-383)||(14212476-14212792)
chr8 (22-380)||(16768763-16769121)
chr8 (67-344)||(22412414-22412691)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (1-384)||(28112433-28112816)
chr3 (1-384)||(4627183-4627566)
chr3 (1-384)||(18228594-18228977)
chr3 (1-384)||(5605793-5606176)
chr3 (1-384)||(5714471-5714854)
chr3 (1-384)||(5725381-5725764)
chr3 (1-384)||(5766604-5766987)
chr3 (1-384)||(24331561-24331944)
chr3 (1-384)||(6205301-6205684)
chr3 (1-384)||(17981428-17981811)
chr3 (1-384)||(19697888-19698271)
chr3 (1-384)||(22384057-22384440)
chr3 (1-384)||(28342575-28342958)
chr3 (1-384)||(32442549-32442932)
chr3 (1-384)||(4420313-4420696)
chr3 (1-384)||(4687053-4687436)
chr3 (1-384)||(6539221-6539604)
chr3 (1-384)||(18304133-18304516)
chr3 (1-384)||(31960934-31961317)
chr3 (1-384)||(47026851-47027234)
chr3 (1-384)||(4725029-4725412)
chr3 (1-384)||(5017112-5017495)
chr3 (1-384)||(8215133-8215516)
chr3 (1-384)||(8285949-8286332)
chr3 (1-384)||(18334028-18334411)
chr3 (1-384)||(32294026-32294409)
chr3 (16-384)||(7999958-8000326)
chr3 (1-384)||(4343155-4343538)
chr3 (1-384)||(4793114-4793497)
chr3 (1-384)||(8299369-8299752)
chr3 (1-384)||(10399542-10399925)
chr3 (1-384)||(15737573-15737956)
chr3 (1-384)||(18246139-18246522)
chr3 (13-384)||(18273543-18273914)
chr3 (13-384)||(18288844-18289215)
chr3 (1-384)||(20573322-20573705)
chr3 (1-384)||(21678101-21678484)
chr3 (1-384)||(31032715-31033098)
chr3 (16-384)||(10646471-10646839)
chr3 (1-384)||(5592836-5593219)
chr3 (1-384)||(7076604-7076987)
chr3 (1-384)||(11106838-11107221)
chr3 (1-384)||(20069438-20069821)
chr3 (1-384)||(48469325-48469708)
chr3 (1-383)||(29145235-29145617)
chr3 (1-384)||(5470386-5470769)
chr3 (1-384)||(28024680-28025063)
chr3 (1-384)||(35884164-35884547)
chr3 (1-384)||(51785421-51785804)
chr3 (1-384)||(15889184-15889567)
chr3 (1-384)||(29661449-29661832)
chr3 (1-384)||(18054660-18055043)
chr3 (1-384)||(22867327-22867710)
chr3 (1-384)||(22882386-22882769)
chr3 (1-384)||(16620969-16621352)
chr3 (117-384)||(17992526-17992793)
chr3 (1-294)||(5653573-5653866)
chr3 (65-344)||(20443555-20443834)
chr3 (1-121)||(17973340-17973460)
chr3 (67-344)||(11924903-11925180)
chr3 (62-384)||(6962973-6963295)
chr3 (67-344)||(22959891-22960168)
chr3 (124-344)||(7088629-7088849)
chr3 (67-344)||(6571792-6572069)
chr3 (67-344)||(16431843-16432120)
chr3 (124-344)||(15704911-15705131)
chr3 (124-341)||(15918958-15919175)
chr3 (124-373)||(15592513-15592762)
chr3 (204-374)||(4446843-4447013)
chr3 (67-384)||(5950347-5950664)
chr3 (67-384)||(46380732-46381049)
chr3 (22-179)||(4450378-4450535)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (1-384)||(26316169-26316552)
chr7 (1-384)||(26271407-26271790)
chr7 (1-384)||(4202823-4203206)
chr7 (1-384)||(16747838-16748221)
chr7 (1-384)||(45390654-45391037)
chr7 (1-384)||(16446327-16446710)
chr7 (1-384)||(26666235-26666618)
chr7 (1-384)||(4141567-4141950)
chr7 (1-384)||(5143661-5144044)
chr7 (1-384)||(24588855-24589238)
chr7 (1-384)||(10913190-10913573)
chr7 (1-384)||(26512017-26512400)
chr7 (1-384)||(31127341-31127724)
chr7 (1-384)||(39209460-39209843)
chr7 (1-384)||(2158008-2158391)
chr7 (1-384)||(26681427-26681810)
chr7 (1-384)||(2106484-2106867)
chr7 (1-384)||(2776688-2777071)
chr7 (1-384)||(11421100-11421483)
chr7 (1-384)||(3448740-3449123)
chr7 (1-384)||(11444321-11444704)
chr7 (1-384)||(16514751-16515134)
chr7 (1-384)||(22145629-22146012)
chr7 (1-384)||(26516226-26516609)
chr7 (1-384)||(26534194-26534577)
chr7 (1-384)||(31086943-31087326)
chr7 (1-384)||(31560711-31561094)
chr7 (1-384)||(26438691-26439074)
chr7 (1-384)||(10845054-10845437)
chr7 (1-380)||(5131434-5131813)
chr7 (1-374)||(16044762-16045132)
chr7 (1-384)||(45734747-45735124)
chr7 (1-384)||(10842315-10842698)
chr7 (1-294)||(5161907-5162200)
chr7 (67-383)||(2556970-2557286)
chr7 (67-344)||(29089990-29090267)
chr7 (124-344)||(16127262-16127482)
chr7 (65-344)||(797908-798187)
chr7 (22-380)||(1892917-1893275)
chr7 (62-384)||(25726931-25727252)
chr7 (67-344)||(15193557-15193834)
chr7 (65-344)||(16286764-16287043)
chr7 (67-384)||(30369333-30369650)
chr7 (67-384)||(16392821-16393138)
chr7 (67-384)||(9469754-9470071)
chr7 (206-324)||(16237975-16238093)
chr7 (62-171)||(16238112-16238221)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (1-384)||(9320920-9321303)
chr5 (1-384)||(12135619-12136002)
chr5 (1-384)||(26483838-26484221)
chr5 (1-384)||(3792985-3793368)
chr5 (1-384)||(8661808-8662191)
chr5 (1-384)||(30155475-30155858)
chr5 (1-384)||(33519824-33520207)
chr5 (1-384)||(41678149-41678532)
chr5 (4-384)||(22891907-22892287)
chr5 (1-384)||(23629414-23629797)
chr5 (1-384)||(25203722-25204105)
chr5 (1-384)||(25267877-25268260)
chr5 (1-384)||(30032872-30033255)
chr5 (1-384)||(31434908-31435291)
chr5 (1-384)||(37667819-37668202)
chr5 (1-384)||(40469883-40470266)
chr5 (1-384)||(43081699-43082082)
chr5 (1-384)||(2514506-2514889)
chr5 (1-384)||(5641232-5641615)
chr5 (1-384)||(18497058-18497441)
chr5 (1-384)||(24586818-24587201)
chr5 (1-384)||(30171913-30172296)
chr5 (1-384)||(33295972-33296355)
chr5 (1-384)||(15655091-15655474)
chr5 (1-384)||(24973350-24973733)
chr5 (1-384)||(30938079-30938462)
chr5 (1-384)||(31822740-31823123)
chr5 (1-384)||(37758427-37758810)
chr5 (1-384)||(37767324-37767707)
chr5 (1-384)||(11552799-11553182)
chr5 (1-384)||(13183126-13183509)
chr5 (1-384)||(18371867-18372250)
chr5 (1-384)||(22995450-22995833)
chr5 (1-384)||(28652686-28653069)
chr5 (1-384)||(29887530-29887913)
chr5 (1-384)||(33878574-33878957)
chr5 (1-384)||(37354976-37355359)
chr5 (1-384)||(6877749-6878132)
chr5 (1-384)||(9547042-9547425)
chr5 (1-384)||(24727413-24727796)
chr5 (1-384)||(28956118-28956501)
chr5 (1-384)||(13321163-13321546)
chr5 (1-384)||(13439016-13439399)
chr5 (1-384)||(18124749-18125132)
chr5 (1-384)||(34619962-34620345)
chr5 (1-384)||(33780933-33781312)
chr5 (1-384)||(32592607-32592990)
chr5 (1-384)||(11327081-11327464)
chr5 (1-384)||(15755185-15755568)
chr5 (220-384)||(24684697-24684861)
chr5 (67-383)||(3483602-3483918)
chr5 (62-384)||(351609-351931)
chr5 (22-380)||(20388343-20388701)
chr5 (65-344)||(34469106-34469385)
chr5 (67-384)||(11943821-11944138)
chr5 (124-384)||(31520751-31521011)
chr5 (67-374)||(15784124-15784431)
chr5 (67-384)||(5439624-5439941)
chr5 (124-344)||(17957581-17957801)
chr5 (67-384)||(36375361-36375678)
chr5 (67-384)||(37000015-37000332)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-384)||(10966104-10966487)
chr1 (1-384)||(10948516-10948899)
chr1 (1-384)||(41789746-41790129)
chr1 (1-384)||(3644574-3644958)
chr1 (1-384)||(16204470-16204853)
chr1 (1-384)||(28588424-28588807)
chr1 (1-384)||(28153175-28153558)
chr1 (1-384)||(51641657-51642040)
chr1 (1-384)||(21894184-21894568)
chr1 (1-384)||(20464415-20464798)
chr1 (4-291)||(20336855-20337142)
chr1 (62-344)||(22489500-22489782)
chr1 (288-384)||(20339024-20339120)
chr1 (67-384)||(5628500-5628817)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (1-384)||(27286743-27287126)
chr6 (1-384)||(29576448-29576831)
chr6 (1-384)||(27626090-27626473)
chr6 (1-384)||(30554395-30554778)
chr6 (1-384)||(3699517-3699900)
chr6 (1-384)||(28163925-28164308)
chr6 (1-384)||(16677574-16677957)
chr6 (1-384)||(27011165-27011548)
chr6 (1-384)||(27060940-27061323)
chr6 (1-384)||(27358489-27358872)
chr6 (1-384)||(27448832-27449215)
chr6 (1-384)||(29504850-29505233)
chr6 (1-384)||(33372810-33373193)
chr6 (1-384)||(4528719-4529102)
chr6 (1-384)||(4761197-4761580)
chr6 (1-384)||(13295330-13295713)
chr6 (1-384)||(14141773-14142156)
chr6 (1-384)||(27488567-27488950)
chr6 (1-384)||(4720514-4720897)
chr6 (1-384)||(4776314-4776697)
chr6 (1-384)||(13520571-13520954)
chr6 (1-384)||(16753255-16753638)
chr6 (1-384)||(16940406-16940789)
chr6 (1-384)||(26112791-26113174)
chr6 (1-384)||(26789250-26789633)
chr6 (1-384)||(27022570-27022953)
chr6 (1-384)||(27197619-27198002)
chr6 (1-384)||(27251233-27251616)
chr6 (1-384)||(28210888-28211271)
chr6 (1-384)||(34460885-34461268)
chr6 (13-383)||(27179891-27180261)
chr6 (13-383)||(27268978-27269348)
chr6 (1-384)||(4542153-4542536)
chr6 (1-384)||(17088822-17089205)
chr6 (1-384)||(26921811-26922194)
chr6 (1-384)||(29552991-29553374)
chr6 (1-384)||(22931263-22931646)
chr6 (1-384)||(23853708-23854091)
chr6 (1-384)||(24867150-24867533)
chr6 (1-384)||(8902082-8902465)
chr6 (1-384)||(15420699-15421082)
chr6 (1-384)||(26775006-26775389)
chr6 (4-384)||(20171981-20172361)
chr6 (4-384)||(22163630-22164010)
chr6 (1-295)||(24302136-24302430)
chr6 (118-384)||(22455610-22455876)
chr6 (219-384)||(26992229-26992394)
chr6 (64-380)||(27545340-27545656)
chr6 (1-140)||(15408912-15409051)
chr6 (62-383)||(23971210-23971531)
chr6 (67-383)||(18119904-18120220)
chr6 (64-384)||(25707445-25707765)
chr6 (67-344)||(18212114-18212391)
chr6 (124-384)||(9135855-9136115)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-384)||(9473-9856)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-384)||(7397-7780)
scaffold0143 (1-384)||(30730-31113)
scaffold0143 (1-384)||(19507-19890)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-384)||(5009325-5009708)
chr4 (1-384)||(27159753-27160136)
chr4 (1-384)||(31122948-31123331)
chr4 (1-384)||(6573308-6573691)
chr4 (1-384)||(21973151-21973534)
chr4 (1-384)||(54836841-54837224)
chr4 (1-384)||(1903704-1904087)
chr4 (1-384)||(33670236-33670619)
chr4 (1-384)||(40102073-40102456)
chr4 (1-384)||(18797050-18797433)
chr4 (1-384)||(24116112-24116495)
chr4 (1-384)||(24588797-24589180)
chr4 (1-384)||(36340953-36341336)
chr4 (1-384)||(39854087-39854470)
chr4 (1-384)||(14101993-14102376)
chr4 (1-384)||(20334857-20335240)
chr4 (25-384)||(14759766-14760125)
chr4 (1-384)||(18313614-18313997)
chr4 (1-384)||(34185396-34185779)
chr4 (1-384)||(15231322-15231705)
chr4 (1-384)||(17016496-17016879)
chr4 (135-384)||(15387948-15388197)
chr4 (1-384)||(30757210-30757593)
chr4 (1-384)||(14668466-14668849)
chr4 (4-384)||(15281376-15281756)
chr4 (1-140)||(15384784-15384923)
chr4 (1-150)||(5698219-5698368)
chr4 (67-344)||(14725301-14725578)
chr4 (64-380)||(1881598-1881914)
chr4 (62-384)||(22146066-22146388)
chr4 (67-344)||(19767829-19768106)
chr4 (124-368)||(12515698-12515942)
chr4 (65-298)||(55784668-55784901)
chr4 (22-179)||(18044714-18044871)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-384)||(11364-11747)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-384)||(9459-9842)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-384)||(22627-23010)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-384)||(16018-16401)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-384)||(13008-13391)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-384)||(3504-3887)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-384)||(11386-11769)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (3-384)||(9482-9863)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (1-384)||(5615-5998)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (19-358)||(5125-5464)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-180)||(22757-22936)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (33-370)||(43181-43533)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-178)||(118769-118946)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (67-383)||(10656-10972)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (124-373)||(34799-35048)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (62-384)||(4412-4734)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (124-368)||(4969-5213)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (288-384)||(1347-1443)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (1-121)||(1979-2102)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (67-384)||(29607-29924)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27395381 - 27394998
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27395381 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacaaaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 27395282  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27395281 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcacccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcg 27395182  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
27395181 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 27395082  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27395081 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 27394998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 11631609 - 11631992
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
11631609 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11631708  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
11631709 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 11631808  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
11631809 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 11631908  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
11631909 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtaaacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 11631992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 21673600 - 21673983
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
21673600 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 21673699  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
21673700 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 21673799  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
21673800 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 21673899  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
21673900 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 21673983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27780053 - 27779670
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27780053 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27779954  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27779953 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27779854  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
27779853 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 27779754  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
27779753 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 27779670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27819810 - 27819427
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27819810 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27819711  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27819710 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27819611  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
27819610 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 27819511  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
27819510 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 27819427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 37682320 - 37682703
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
37682320 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 37682419  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37682420 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37682519  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37682520 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37682619  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
37682620 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 37682703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 37697585 - 37697968
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
37697585 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 37697684  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37697685 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37697784  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37697785 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37697884  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
37697885 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 37697968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 16825763 - 16826146
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16825763 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16825862  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16825863 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16825962  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
16825963 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 16826062  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16826063 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 16826146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16895717 - 16895334
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16895717 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16895618  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16895617 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16895518  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
16895517 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 16895418  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16895417 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 16895334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27120343 - 27119960
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
27120343 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcg 27120244  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||    
27120243 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcg 27120144  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
27120143 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 27120044  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
27120043 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 27119960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31880105 - 31879722
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
31880105 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 31880006  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31880005 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31879906  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
31879905 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 31879806  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
31879805 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 31879722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34294973 - 34294590
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
34294973 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34294874  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
34294873 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 34294774  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
34294773 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaagtagtagatagcatgctct 34294674  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
34294673 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 34294590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37929188 - 37928805
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
37929188 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 37929089  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37929088 caatctttccagtgacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37928989  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37928988 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37928889  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
37928888 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 37928805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 13932972 - 13933355
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
13932972 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13933071  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
13933072 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgccgcaggcg 13933171  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
13933172 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 13933271  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
13933272 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 13933355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3786312 - 3785929
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
3786312 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3786213  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
3786212 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 3786113  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
3786112 tttggcagcccaagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 3786013  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
3786012 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 3785929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 9346411 - 9346794
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
9346411 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9346510  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
9346511 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 9346610  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
9346611 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 9346710  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
9346711 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 9346794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 19412926 - 19413309
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
19412926 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 19413025  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
19413026 cgatctttccagtaacggcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 19413125  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
19413126 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 19413225  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
19413226 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 19413309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32053622 - 32053239
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
32053622 agaggttgataagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttctgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 32053523  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
32053522 cgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttaatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 32053423  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
32053422 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 32053323  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
32053322 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 32053239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34865503 - 34865120
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
34865503 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34865404  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
34865403 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 34865304  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
34865303 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 34865204  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
34865203 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 34865120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40237327 - 40236944
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
40237327 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 40237228  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||  |||||||    
40237227 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcg 40237128  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
40237127 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 40237028  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
40237027 ttctttcccgtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 40236944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12590627 - 12590244
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
12590627 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12590528  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
12590527 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 12590428  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
12590427 tttagcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 12590328  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
12590327 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 12590244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27430866 - 27431249
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
27430866 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattccgacaaaagcatctgccaacgtg 27430965  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27430966 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27431065  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
27431066 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 27431165  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||| |||||||||    
27431166 ttctttccagtctcgccttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataatcaaaggccttcct 27431249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 257078 - 257461
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
257078 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 257177  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
257178 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 257277  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
257278 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 257377  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
257378 ttctttccagtttcatcttgctgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 257461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20841732 - 20841349
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
20841732 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 20841633  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
20841632 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 20841533  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
20841532 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 20841433  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||    
20841432 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaagtacataatcaaaggccttcct 20841349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 21699596 - 21699979
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
21699596 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcatg 21699695  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
21699696 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 21699795  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
21699796 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgttct 21699895  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
21699896 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaatactgacaaatacataatcaaaggccttcct 21699979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27807522 - 27807139
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27807522 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27807423  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
27807422 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 27807323  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
27807322 tttagcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 27807223  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
27807222 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 27807139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31889916 - 31890299
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
31889916 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31890015  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31890016 caatcttcccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31890115  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
31890116 tttggcagcccaagctagaacacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 31890215  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
31890216 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 31890299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37381496 - 37381113
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
37381496 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaccgtg 37381397  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37381396 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37381297  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
37381296 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 37381197  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
37381196 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccattgattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 37381113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22924573 - 22924956
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
22924573 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22924672  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
22924673 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22924772  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
22924773 tttggcagcccaagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 22924872  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| || ||||||    
22924873 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttcct 22924956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12659355 - 12658972
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
12659355 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12659256  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
12659255 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 12659156  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
12659155 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 12659056  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
12659055 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 12658972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34158663 - 34158280
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
34158663 agaggttggtaagcaagatgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34158564  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
34158563 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 34158464  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
34158463 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 34158364  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| ||  |||| |||||  |||||||||    
34158363 ttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacatatacaaaatcagaggccttcct 34158280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 39048244 - 39048627
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
39048244 agaggttggtaagcaaggtgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39048343  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||  |||||||    
39048344 caatcttcccagtgacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcg 39048443  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
39048444 tttggcggcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttaggtagtagatagcatgctct 39048543  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
39048544 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 39048627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39893888 - 39893505
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
39893888 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39893789  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
39893788 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 39893689  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
39893688 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 39893589  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
39893588 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 39893505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 12713026 - 12713409
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
12713026 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtg 12713125  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
12713126 caatctttccagtaacggccgctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 12713225  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
12713226 tttggcagcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 12713325  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
12713326 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 12713409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16165299 - 16164916
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16165299 agaggttggtaagcaaggtgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 16165200  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16165199 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16165100  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
16165099 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 16165000  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
16164999 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 16164916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 23124994 - 23125376
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |    
23124994 agaggttggtacgcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttt-gaacacaatatcgtattcagataaaagcatctgccagcgtg 23125092  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
23125093 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 23125192  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
23125193 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 23125292  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
23125293 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 23125376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 37948287 - 37948670
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
37948287 agaggttgacaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37948386  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37948387 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37948486  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37948487 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37948586  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
37948587 ttctttcaagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 37948670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 19452848 - 19453231
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
19452848 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 19452947  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  | |||||    
19452948 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttatatgattcaccaaataatgacgtaggcg 19453047  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
19453048 tttggcggcccaggccggagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagataatagatagcatgttct 19453147  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
19453148 ttctttccagtctcatctcgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 19453231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28886098 - 28885823
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
28886098 agaggttggtacgcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28885999  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28885998 caattttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactatatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28885899  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttg 276  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
28885898 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagttttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttg 28885823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 34271345 - 34271629
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
34271345 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34271444  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||  |||||||    
34271445 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatggttcaccaaataatgacgcaggcg 34271544  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatag 285  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||    
34271545 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatag 34271629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27828126 - 27827896
Alignment:
154 ctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccggg 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
27828126 ctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgag 27828027  T
254 cttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaa 353  Q
     ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
27828026 tttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaa 27827927  T
354 cactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
     |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27827926 tactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27827896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 208 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28885819 - 28885643
Alignment:
208 gcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttc 307  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
28885819 gcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttc 28885720  T
308 cagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
28885719 cagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataaccaagggccttcct 28885643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 380
Target Start/End: Original strand, 34533931 - 34534247
Alignment:
64 acaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatca 163  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||    
34533931 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 34534030  T
164 agcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtc 263  Q
    | ||||| || ||||| | || ||| ||  | || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  || || ||    
34534031 accaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 34534130  T
264 ggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaag 363  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| |||||     
34534131 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaa 34534230  T
364 tacataatcaagggcct 380  Q
    ||||| ||||| |||||    
34534231 tacatgatcaaaggcct 34534247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 42394288 - 42393972
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
42394288 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 42394189  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
42394188 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 42394089  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||  ||||| || |||    
42394088 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtactgttaaatac 42393989  T
367 ataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||| || |||||    
42393988 atgatcaaaggtcttcc 42393972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 380
Target Start/End: Original strand, 26723722 - 26724080
Alignment:
22 tcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcag 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || |||||   | | ||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || | ||| |    
26723722 tcagcaagaatactacctttgatggctttctgagtgcggtagacaatgtcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccg 26723821  T
122 ctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagc 221  Q
      |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||  | || || ||||||||||| || |||||    
26723822 gcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagc 26723921  T
222 acaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgt 321  Q
     ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  || || || |||||||||||  |||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
26723922 gcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgt 26724021  T
322 tgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggcct 380  Q
    ||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
26724022 tgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcct 26724080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34701829 - 34701552
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
34701829 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 34701730  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
34701729 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 34701630  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
34701629 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 34701552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 21760104 - 21760383
Alignment:
65 caatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaa 164  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||| |||| || | ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||    
21760104 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 21760203  T
165 gcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcg 264  Q
     ||||| |||||| | |||| ||||||  | |||||||| || ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||| | ||| || | ||| || ||     
21760204 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatca 21760303  T
265 gtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
    |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
21760304 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcacacaacccatgga 21760383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12384413 - 12384096
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
12384413 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 12384314  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    | || || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
12384313 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 12384214  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||    
12384213 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 12384114  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
12384113 atgatcaaaggtcttcct 12384096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22950146 - 22949829
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
22950146 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 22950047  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
22950046 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 22949947  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||| ||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||| |||||| | ||||    
22949946 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtac 22949847  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
22949846 atgatcaaaggtcttcct 22949829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22077322 - 22077691
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22077322 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 22077421  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           
22077422 caatttttccagtaacatcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggt------- 22077514  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
22077515 -------gcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtatattgggcttcgcagtcggtaaagttcttgctcagatagtagatagcatgctct 22077607  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22077608 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 22077691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18713303 - 18712920
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18713303 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18713204  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
18713203 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 18713104  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||    
18713103 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttct 18713004  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18713003 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18712920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 19204759 - 19205142
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
19204759 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 19204858  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
19204859 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 19204958  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
19204959 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 19205058  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
19205059 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 19205142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31358347 - 31357964
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
31358347 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 31358248  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31358247 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31358148  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
31358147 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 31358048  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
31358047 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 31357964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 28358349 - 28358732
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
28358349 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28358448  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28358449 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28358548  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
28358549 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 28358648  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
28358649 ttcttcccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 28358732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19678266 - 19677883
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
19678266 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 19678167  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
19678166 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 19678067  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
19678066 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 19677967  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
19677966 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 19677883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18794523 - 18794140
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18794523 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18794424  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||    
18794423 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcatcaaataatgacgcaggcg 18794324  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
18794323 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 18794224  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18794223 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18794140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19691917 - 19691534
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
19691917 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 19691818  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  | |||||    
19691817 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcg 19691718  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
19691717 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 19691618  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
19691617 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 19691534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 12089120 - 12089503
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
12089120 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12089219  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
12089220 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 12089319  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
12089320 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 12089419  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
12089420 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 12089503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14561443 - 14561060
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
14561443 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 14561344  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
14561343 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 14561244  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||    
14561243 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttct 14561144  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
14561143 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 14561060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 2133657 - 2134040
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
2133657 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2133756  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
2133757 caattttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 2133856  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
2133857 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 2133956  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
2133957 ttccttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 2134040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15771393 - 15771010
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
15771393 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15771294  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
15771293 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 15771194  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
15771193 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 15771094  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
15771093 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 15771010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27605302 - 27605685
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27605302 agaggttggtaagcaaggtgatcgacaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27605401  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27605402 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27605501  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
27605502 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 27605601  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27605602 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27605685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31486268 - 31486651
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |    
31486268 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31486367  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31486368 caatcttcccggtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31486467  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
31486468 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctct 31486567  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
31486568 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 31486651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33262553 - 33262170
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
33262553 agaggttgataagcaaggtgatcggcgaggatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33262454  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
33262453 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33262354  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
33262353 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 33262254  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
33262253 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 33262170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44564803 - 44564420
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
44564803 agaggttggtaagccagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 44564704  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
44564703 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 44564604  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
44564603 tttggcagcccaagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 44564504  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
44564503 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 44564420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9358444 - 9358061
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
9358444 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagtcttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9358345  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
9358344 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 9358245  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
9358244 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 9358145  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
9358144 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 9358061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29833145 - 29832762
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
29833145 agaggttgataagcaaggtgatcggcgaggatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29833046  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
29833045 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 29832946  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
29832945 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 29832846  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
29832845 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 29832762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 21344568 - 21344951
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |    
21344568 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgtcagcgtg 21344667  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |  |  | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
21344668 caatcttcccagtaacaacagctttctcagagatatacttgagctgggcggttctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 21344767  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
21344768 tttagcggcctaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 21344867  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| | |||||||||    
21344868 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcgaaggccttcct 21344951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 19657738 - 19658031
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
19657738 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 19657837  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
19657838 caatcttcccagtaacagcaactttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatggcgcaggcg 19657937  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagca 294  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
19657938 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 19658031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33246188 - 33245894
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |    
33246188 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttaagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtg 33246089  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
33246088 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33245989  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcat 295  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
33245988 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcat 33245894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19844863 - 19844604
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  | || ||||| |||||||| |||||| |||    
19844863 ttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgtttggcagcccaggctaaatcac 19844764  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    ||||||| |||||||| | || ||| ||||  || || ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
19844763 aacaagttttctcaagtaccgaatatcgggactcacaatcggtgaacttcttactcaaatagtagatagcttgctctttctttccggtttcatcttgttg 19844664  T
324 accgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcc 383  Q
    ||| |  ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
19844663 acccaacacacagcccatggaatcttccaatactgttaaatacatgatcaaaggtcttcc 19844604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14212792 - 14212476
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
14212792 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 14212693  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
14212692 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 14212593  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||  ||||| || |||    
14212592 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtactgttaaatac 14212493  T
367 ataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||| || |||||    
14212492 atgatcaaaggtcttcc 14212476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16769121 - 16768763
Alignment:
22 tcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcag 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || |||||   | | ||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || | ||| |    
16769121 tcagcaagaatactacctttgatggctttctgagtgcggtagacaatgtcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccg 16769022  T
122 ctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagc 221  Q
      |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||  | || || ||||||||||| || |||||    
16769021 gcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagc 16768922  T
222 acaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgt 321  Q
     ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  || || || |||||||||||  |||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
16768921 gcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgt 16768822  T
322 tgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggcct 380  Q
    ||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
16768821 tgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcct 16768763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22412691 - 22412414
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
22412691 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 22412592  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
22412591 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 22412492  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
22412491 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 22412414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 28112433 - 28112816
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
28112433 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28112532  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28112533 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28112632  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
28112633 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 28112732  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
28112733 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 28112816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4627566 - 4627183
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4627566 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgccagcgtg 4627467  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
4627466 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 4627367  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
4627366 tttagcggcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 4627267  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4627266 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcgaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4627183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18228977 - 18228594
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18228977 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18228878  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
18228877 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18228778  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
18228777 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 18228678  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
18228677 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 18228594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 5605793 - 5606176
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
5605793 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcggacaaaagcatctgccagcgtg 5605892  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5605893 cgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5605992  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
5605993 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 5606092  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
5606093 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 5606176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5714854 - 5714471
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
5714854 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtg 5714755  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5714754 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5714655  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5714654 tttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 5714555  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
5714554 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 5714471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5725764 - 5725381
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
5725764 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtg 5725665  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5725664 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5725565  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5725564 tttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 5725465  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
5725464 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 5725381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 5766604 - 5766987
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
5766604 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtg 5766703  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5766704 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5766803  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5766804 tttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 5766903  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
5766904 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 5766987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24331944 - 24331561
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
24331944 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24331845  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
24331844 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 24331745  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
24331744 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 24331645  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
24331644 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 24331561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6205684 - 6205301
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
6205684 agaggttggtaagcaagatgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtg 6205585  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
6205584 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 6205485  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
6205484 tttagcggcccaagccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 6205385  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
6205384 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttcct 6205301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 17981428 - 17981811
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
17981428 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 17981527  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
17981528 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 17981627  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
17981628 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctct 17981727  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
17981728 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 17981811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19698271 - 19697888
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
19698271 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcggg 19698172  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
19698171 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 19698072  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
19698071 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 19697972  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
19697971 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcgaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 19697888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22384057 - 22384440
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
22384057 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22384156  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
22384157 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22384256  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
22384257 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 22384356  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22384357 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 22384440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28342958 - 28342575
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
28342958 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28342859  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
28342858 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 28342759  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
28342758 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 28342659  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
28342658 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 28342575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32442932 - 32442549
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
32442932 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 32442833  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
32442832 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 32442733  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
32442732 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 32442633  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
32442632 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 32442549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4420696 - 4420313
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4420696 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4420597  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
4420596 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 4420497  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
4420496 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagatagcatgctct 4420397  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4420396 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4420313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4687436 - 4687053
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4687436 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgactgtcttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4687337  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
4687336 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 4687237  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
4687236 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttct 4687137  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
4687136 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttcct 4687053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 6539221 - 6539604
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
6539221 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 6539320  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
6539321 caatcttccccgtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 6539420  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
6539421 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 6539520  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
6539521 ttctttccggtttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 6539604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18304133 - 18304516
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18304133 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18304232  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
18304233 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18304332  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
18304333 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 18304432  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18304433 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18304516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31960934 - 31961317
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
31960934 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgtctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31961033  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
31961034 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 31961133  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
31961134 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 31961233  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
31961234 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 31961317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47027234 - 47026851
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
47027234 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 47027135  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
47027134 caatctttccagtgacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 47027035  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
47027034 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 47026935  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
47026934 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 47026851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4725412 - 4725029
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4725412 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatttccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4725313  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
4725312 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 4725213  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
4725212 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttct 4725113  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
4725112 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttcct 4725029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5017495 - 5017112
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
5017495 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 5017396  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5017395 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5017296  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
5017295 tttggtagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 5017196  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
5017195 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 5017112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8215516 - 8215133
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
8215516 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8215417  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
8215416 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 8215317  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
8215316 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtaggtagcatgctct 8215217  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
8215216 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 8215133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 8285949 - 8286332
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
8285949 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8286048  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
8286049 caatcttcccggtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 8286148  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
8286149 tttagcggcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 8286248  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
8286249 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 8286332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18334411 - 18334028
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18334411 agaggttggtaagcaagatgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18334312  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
18334311 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18334212  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
18334211 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 18334112  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18334111 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18334028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32294409 - 32294026
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
32294409 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 32294310  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
32294309 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 32294210  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
32294209 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 32294110  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
32294109 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 32294026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8000326 - 7999958
Alignment:
16 aggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaa 115  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||    
8000326 aggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaa 8000227  T
116 cagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagc 215  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
8000226 cggccgctttctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagc 8000127  T
216 taaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcg 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
8000126 tagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttca 8000027  T
316 tcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
8000026 tcttgttgaccaagtacacatcccatggattcgtcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 7999958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 4343155 - 4343538
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |    
4343155 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 4343254  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
4343255 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 4343354  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
4343355 tttagcggcccaggctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 4343454  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||| |||||||||    
4343455 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataatcaaaggccttcct 4343538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 4793114 - 4793497
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4793114 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4793213  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||    
4793214 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcg 4793313  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
4793314 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 4793413  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4793414 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4793497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8299752 - 8299369
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
8299752 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaattctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8299653  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
8299652 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcg 8299553  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
8299552 tttagcggcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 8299453  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
8299452 ttctttccaatctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 8299369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10399925 - 10399542
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
10399925 agaggttggtaagcaaggtgatcgacaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10399826  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
10399825 caatcttcccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 10399726  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
10399725 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttct 10399626  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
10399625 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 10399542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 15737573 - 15737956
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
15737573 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacatttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15737672  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
15737673 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 15737772  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
15737773 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 15737872  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
15737873 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 15737956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18246522 - 18246139
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18246522 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18246423  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
18246422 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18246323  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
18246322 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 18246223  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18246222 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18246139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Original strand, 18273543 - 18273914
Alignment:
13 gcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccag 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||    
18273543 gcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccag 18273642  T
113 taacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagccca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||    
18273643 taacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggccca 18273742  T
213 agctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtc 312  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
18273743 ggccaaagcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtc 18273842  T
313 tcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18273843 tcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18273914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Original strand, 18288844 - 18289215
Alignment:
13 gcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccag 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||    
18288844 gcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccag 18288943  T
113 taacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagccca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||    
18288944 taacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggccca 18289043  T
213 agctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtc 312  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
18289044 ggccaaagcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtc 18289143  T
313 tcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18289144 tcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18289215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 20573322 - 20573705
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
20573322 agaggttgataagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 20573421  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
20573422 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 20573521  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
20573522 tttagcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 20573621  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
20573622 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 20573705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21678484 - 21678101
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
21678484 agaggttggcaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 21678385  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||  |||||||    
21678384 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcatccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcg 21678285  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
21678284 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 21678185  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
21678184 ttctttcccgtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 21678101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31032715 - 31033098
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
31032715 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31032814  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31032815 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31032914  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
31032915 tttagcggcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 31033014  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
31033015 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 31033098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10646839 - 10646471
Alignment:
16 aggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaa 115  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||    
10646839 aggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaa 10646740  T
116 cagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagc 215  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
10646739 cggccgctttctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagc 10646640  T
216 taaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcg 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
10646639 tagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttca 10646540  T
316 tcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
10646539 tcttgttgaccaagtacacatctcatggattcgtcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 10646471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 5592836 - 5593219
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | |    
5592836 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgcgttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagtgtg 5592935  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5592936 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5593035  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
5593036 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 5593135  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
5593136 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 5593219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7076987 - 7076604
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
7076987 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 7076888  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
7076887 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatattttatcggatccattctggatgtcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 7076788  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
7076787 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 7076688  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
7076687 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 7076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 11106838 - 11107221
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
11106838 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11106937  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
11106938 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 11107037  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||    
11107038 tttagaggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttct 11107137  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
11107138 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 11107221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20069821 - 20069438
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |    
20069821 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgctagcgtg 20069722  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||  |||||||    
20069721 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatttcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcg 20069622  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
20069621 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgcataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 20069522  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
20069521 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 20069438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48469708 - 48469325
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
48469708 agaggttggtaagcaagatgattggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcg 48469609  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||    
48469608 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcg 48469509  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
48469508 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 48469409  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
48469408 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 48469325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 29145235 - 29145617
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |    
29145235 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtg 29145334  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
29145335 caatcttcccggtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 29145434  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
29145435 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 29145534  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcc 383  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
29145535 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcc 29145617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5470769 - 5470386
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
5470769 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5470670  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
5470669 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5470570  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
5470569 tttggcagcccacgctagagcacaacaagtcttctctagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 5470470  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
5470469 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 5470386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28025063 - 28024680
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |    
28025063 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 28024964  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28024963 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28024864  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || | ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||    
28024863 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 28024764  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
28024763 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 28024680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35884547 - 35884164
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
35884547 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttaattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 35884448  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
35884447 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 35884348  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
35884347 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 35884248  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
35884247 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 35884164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51785804 - 51785421
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
51785804 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 51785705  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
51785704 caatcttcccagtgacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 51785605  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
51785604 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 51785505  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
51785504 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 51785421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 15889184 - 15889567
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
15889184 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15889283  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
15889284 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttaccggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 15889383  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
     ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||    
15889384 cttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttatatagtagatagcatgttct 15889483  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
15889484 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 15889567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 29661449 - 29661832
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
29661449 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtg 29661548  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
29661549 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 29661648  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
29661649 tttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 29661748  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
29661749 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 29661832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18055043 - 18054660
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
18055043 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18054944  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
18054943 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18054844  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||  | | ||||||||||||||| |||    
18054843 tttagcggcccagaccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttaaatagtagatagcatgttct 18054744  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18054743 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18054660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22867327 - 22867710
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
22867327 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22867426  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
22867427 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22867526  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
22867527 tttggcagcccaagctagtgcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctct 22867626  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22867627 ttctttccggttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 22867710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22882386 - 22882769
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
22882386 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22882485  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
22882486 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22882585  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
22882586 tttggcagcccaagctagtgcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctct 22882685  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22882686 ttctttccggttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 22882769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 16620969 - 16621352
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
16620969 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 16621068  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||    
16621069 caatcttcctagtaacagcaggtttctcgaagatatactttatctgatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcg 16621168  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || |||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
16621169 tttggcggcccagaccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcagtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 16621268  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16621269 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 16621352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 117 - 384
Target Start/End: Original strand, 17992526 - 17992793
Alignment:
117 agcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
17992526 agcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 17992625  T
217 aaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgt 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
17992626 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 17992725  T
317 cttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    || |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
17992726 ctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 17992793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5653866 - 5653573
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || |    
5653866 agaggttggtaggcaggatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgtcagcgtg 5653767  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||    
5653766 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcg 5653667  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagca 294  Q
    |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| | ||||||| | |||||||||||||||    
5653666 tttagcggcccaggccagagcataacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgagcttcttgcttagatagtagatagca 5653573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20443834 - 20443555
Alignment:
65 caatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaa 164  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||| |||| || | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||    
20443834 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcaggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 20443735  T
165 gcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcg 264  Q
     ||||| |||||| | |||| ||||||  | || |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| | ||| || | ||| |||||     
20443734 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttagcagcccaggctagtgcgcaacaagtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtca 20443635  T
265 gtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
    |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
20443634 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcacacaacccatgga 20443555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 17973340 - 17973460
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
17973340 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 17973439  T
101 caatttttccagtaacagcag 121  Q
    |||| ||||||||||||||||    
17973440 caatctttccagtaacagcag 17973460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Original strand, 11924903 - 11925180
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |    
11924903 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcctggatatcaacc 11925002  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
11925003 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 11925102  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
11925103 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 11925180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 6962973 - 6963295
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || |  || |  |||||||| |  |||||||| ||||||||  |||||||    
6962973 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 6963072  T
162 caagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcag 261  Q
    ||| ||||| || || |  | ||  |||||  | || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||  || ||     
6963073 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaa 6963172  T
262 tcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 361  Q
    || |||||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||    
6963173 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtca 6963272  T
362 agtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
6963273 agtacatgatcaaaggccttcct 6963295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22960168 - 22959891
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
22960168 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 22960069  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
22960068 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 22959969  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
22959968 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 22959891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 344
Target Start/End: Original strand, 7088629 - 7088849
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||    
7088629 ttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 7088728  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    ||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || || ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
7088729 aacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttg 7088828  T
324 accgagtacacatcccatgga 344  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
7088829 acccaaaacacagcccatgga 7088849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6572069 - 6571792
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| || || ||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |    
6572069 atatcatactcggacaataacatttgccagcgagcgatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatatcaacc 6571970  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
6571969 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcggcccaggccaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgagactcacaatcagt 6571870  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
6571869 gaacttcttactcaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatgga 6571792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16432120 - 16431843
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
16432120 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 16432021  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |  || ||||  || || || ||    
16432020 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagt 16431921  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
16431920 gaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 16431843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15705131 - 15704911
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||    
15705131 ttctcaaatatgtacttgattgggtccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 15705032  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    ||||||| |||||||| |  |  || ||||  || || || || || |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
15705031 aacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagtgaatttcttactcaaatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttg 15704932  T
324 accgagtacacatcccatgga 344  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
15704931 acctaacacacagcccatgga 15704911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15919175 - 15918958
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| || | |||||    
15919175 ttctcaaatatgtacttgattggatccattttggatatcaaccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggccagagcac 15919076  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| || | ||| ||||| |||||||| ||| | | ||| || || || ||||| ||| ||||| | || ||||||||    
15919075 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaactttttgcttaaataataaatggcgtgctccttccttccaatttcatcttgttg 15918976  T
324 accgagtacacatcccat 341  Q
     ||||||||||| |||||    
15918975 tccgagtacacaacccat 15918958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Original strand, 15592513 - 15592762
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||  ||||| |||||| | |||| ||| ||  | |||||||| ||| |||| |||| |||||    
15592513 ttctcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcagccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcaacccaggctagagcac 15592612  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| || | ||| | ||| |||||||||||| | | ||| || || || ||||| ||  ||| ||| || ||||||||    
15592613 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcaccgtcagtaaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcctttcttctagtttcatcttgttg 15592712  T
324 accgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatca 373  Q
     ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||| |||||||||||    
15592713 tccgagtacacaacccatagaatcttctagcacagtcaggtacataatca 15592762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4447013 - 4446843
Alignment:
204 agcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttc 303  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  | ||| ||||  || || || |||||||||||  |||  ||||| || ||||||||||||    
4447013 agcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcaaagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttc 4446914  T
304 tttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaa 374  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||    
4446913 tttcccgtctcgtcctgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacggtcaagtacatgatcaa 4446843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 5950347 - 5950664
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
5950347 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5950446  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
5950447 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5950546  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||| |||||| | ||||    
5950547 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtac 5950646  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
5950647 atgatcaaaggtcttcct 5950664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46381049 - 46380732
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| | ||||||||| || || ||||||||||||||  | |||| ||  |    
46381049 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 46380950  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || || || |||| ||| ||  | ||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
46380949 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 46380850  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | ||||    
46380849 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaatcttctaacaccgttaggtac 46380750  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
46380749 atgatcaaaggtcttcct 46380732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4450535 - 4450378
Alignment:
22 tcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcag 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || |||||   | | ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| |||||| |||| || | ||| |    
4450535 tcagcaagaatactacctttgatggctttctgagtgcggtagacaatatcatactcgaacaataacatttgccaacgagcaattcttcctgttaaagccg 4450436  T
122 ctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgatt 179  Q
      |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |||||    
4450435 gcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgatt 4450378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26316169 - 26316552
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26316169 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26316268  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26316269 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26316368  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26316369 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 26316468  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
26316469 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 26316552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26271407 - 26271790
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26271407 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26271506  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26271507 caatctttcccgtaacaacagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26271606  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26271607 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 26271706  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
26271707 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 26271790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4203206 - 4202823
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4203206 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4203107  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
4203106 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatatttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 4203007  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
4203006 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgctct 4202907  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4202906 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4202823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 16747838 - 16748221
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16747838 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16747937  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16747938 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16748037  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
16748038 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 16748137  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16748138 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 16748221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45391037 - 45390654
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
45391037 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 45390938  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
45390937 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 45390838  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
45390837 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 45390738  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
45390737 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 45390654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 16446327 - 16446710
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
16446327 agaggttgataagcaaggtgatcagcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaagagcatctgccagcgtg 16446426  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16446427 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16446526  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||| | ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
16446527 tttaacggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 16446626  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16446627 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 16446710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26666235 - 26666618
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
26666235 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 26666334  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26666335 caatctttccagtgacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26666434  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
26666435 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 26666534  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
26666535 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 26666618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 4141567 - 4141950
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
4141567 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 4141666  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||    
4141667 caatctttccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcg 4141766  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
4141767 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 4141866  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4141867 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4141950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 5143661 - 5144044
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
5143661 agaggttggtaggcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5143760  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5143761 caatcttcccagtaacggctgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5143860  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
5143861 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 5143960  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
5143961 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 5144044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 24588855 - 24589238
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
24588855 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24588954  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
24588955 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 24589054  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
24589055 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctct 24589154  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
24589155 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 24589238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 10913190 - 10913573
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
10913190 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10913289  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
10913290 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 10913389  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
10913390 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 10913489  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
10913490 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 10913573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26512017 - 26512400
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26512017 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26512116  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26512117 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26512216  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
26512217 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 26512316  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
26512317 ttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 26512400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31127724 - 31127341
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
31127724 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31127625  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
31127624 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcg 31127525  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
31127524 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 31127425  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
31127424 ttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 31127341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 39209460 - 39209843
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
39209460 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39209559  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
39209560 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 39209659  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
39209660 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 39209759  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
39209760 ttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 39209843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2158391 - 2158008
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
2158391 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2158292  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
2158291 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 2158192  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
2158191 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 2158092  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
2158091 ttctttctagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 2158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26681427 - 26681810
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |    
26681427 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgcccgcgtg 26681526  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26681527 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26681626  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
26681627 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 26681726  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
26681727 ttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 26681810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 2106484 - 2106867
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
2106484 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2106583  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
2106584 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 2106683  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
2106684 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 2106783  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||||    
2106784 ttctttccagtctcatcttgttgaccaattacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttcct 2106867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2777071 - 2776688
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
2777071 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2776972  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
2776971 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 2776872  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
2776871 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttcgcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 2776772  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
2776771 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 2776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 11421100 - 11421483
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
11421100 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11421199  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
11421200 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 11421299  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
11421300 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 11421399  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||||    
11421400 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttcct 11421483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3449123 - 3448740
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
3449123 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3449024  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||    
3449023 caatctttccagtgacggcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcg 3448924  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
3448923 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 3448824  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
3448823 ttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 3448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11444704 - 11444321
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
11444704 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11444605  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||    
11444604 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcg 11444505  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
11444504 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctct 11444405  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
11444404 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 11444321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 16514751 - 16515134
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16514751 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16514850  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16514851 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatctattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16514950  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
16514951 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 16515050  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16515051 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 16515134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22146012 - 22145629
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
22146012 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgcctttcgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22145913  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
22145912 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22145813  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
22145812 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 22145713  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
22145712 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 22145629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26516609 - 26516226
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
26516609 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtg 26516510  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
26516509 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 26516410  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
26516409 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 26516310  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
26516309 ttctttccagtttcatcttgttgaccgagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 26516226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26534194 - 26534577
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26534194 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26534293  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26534294 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26534393  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
26534394 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaatttcttgctcagatagtagatagcatgctct 26534493  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
26534494 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 26534577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31086943 - 31087326
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
31086943 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtg 31087042  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31087043 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31087142  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
31087143 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 31087242  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
31087243 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 31087326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31560711 - 31561094
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
31560711 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31560810  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31560811 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31560910  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
31560911 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 31561010  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
31561011 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 31561094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26439074 - 26438691
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26439074 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26438975  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26438974 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26438875  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||    
26438874 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttct 26438775  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
26438774 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 26438691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10845437 - 10845054
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |    
10845437 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtg 10845338  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
10845337 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 10845238  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
10845237 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 10845138  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
10845137 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 10845054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5131813 - 5131434
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
5131813 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5131714  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||    
5131713 caatcttcctagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcg 5131614  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
5131613 tttagcggcctaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 5131514  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggcct 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||    
5131513 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggcct 5131434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16045132 - 16044762
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
16045132 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctaccagcgtg 16045033  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16045032 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16044933  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || |||||||| | |||   ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
16044932 tttggcggcccaagccagagc---acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 16044836  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaa 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
16044835 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaa 16044762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45735124 - 45734747
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
45735124 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 45735025  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||      || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
45735024 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagata------atcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 45734931  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
45734930 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 45734831  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| || ||||||    
45734830 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttcct 45734747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 10842315 - 10842698
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |    
10842315 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtg 10842414  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
10842415 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 10842514  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
10842515 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 10842614  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
10842615 ttctttccagtctcatcttgttgacctattacgcaccccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 10842698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5162200 - 5161907
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
5162200 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgccagcgtg 5162101  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5162100 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5162001  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagca 294  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
5162000 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 5161907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2557286 - 2556970
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
2557286 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 2557187  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
2557186 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 2557087  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||  ||||| || |||    
2557086 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtactgttaaatac 2556987  T
367 ataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||| || |||||    
2556986 atgatcaaaggtcttcc 2556970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29090267 - 29089990
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
29090267 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 29090168  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
29090167 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 29090068  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
29090067 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 29089990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 344
Target Start/End: Original strand, 16127262 - 16127482
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||    
16127262 ttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcac 16127361  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    ||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || || ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
16127362 aacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttg 16127461  T
324 accgagtacacatcccatgga 344  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
16127462 acccaaaacacagcccatgga 16127482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 797908 - 798187
Alignment:
65 caatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaa 164  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||| |||| || | ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
797908 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcctagatatcaa 798007  T
165 gcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcg 264  Q
     ||||| |||||| | |||| ||||||  | |||||||| || ||||| ||||  || ||||| |||||||| | ||| | ||| || | ||| || |||    
798008 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgaccatggaatagcgagattcacaatcg 798107  T
265 gtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
    |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
798108 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcacacaacccatgga 798187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 380
Target Start/End: Original strand, 1892917 - 1893275
Alignment:
22 tcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcag 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || |||||   | | ||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || | ||| |    
1892917 tcagcaagaatactacctttgatggctttctgagtgcggtagacaatgtcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccg 1893016  T
122 ctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagc 221  Q
      |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||  | || || ||||||||||| || |||||    
1893017 gcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagc 1893116  T
222 acaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgt 321  Q
     ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  || || || |||||||||||  |||  ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
1893117 gcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggtgtgctctttctttccagtctcgtcttgt 1893216  T
322 tgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggcct 380  Q
    ||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
1893217 tgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcct 1893275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25727252 - 25726931
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||| |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||| || |||||  |||| ||    
25727252 acacaatatcatactcagacaataacatctgccagcgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcgggtccattttggacat 25727153  T
162 caagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcag 261  Q
    ||| ||||| || ||||| | ||  |||||  | ||  | ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || ||     
25727152 caaccaagtagtgtgattaaccatgtagtgacggagatgcttagcagcccatgc-aaagcgcaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaa 25727054  T
262 tcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 361  Q
    || || ||||||||  |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
25727053 tcagtgaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccaagcacacagcccatagaatcatctaacacagtca 25726954  T
362 agtacataatcaagggccttcct 384  Q
    | ||||| ||||| |||||||||    
25726953 aatacatgatcaacggccttcct 25726931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15193834 - 15193557
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
15193834 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 15193735  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  | ||| ||||  || || || ||    
15193734 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaaatacagaatatcgggactcacaatcagt 15193635  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
15193634 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttcttcccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 15193557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 16286764 - 16287043
Alignment:
65 caatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaa 164  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||| |||| || | ||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
16286764 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagacgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 16286863  T
165 gcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcg 264  Q
     || || |||||| | |||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||| ||||| | ||| || | ||| |||||     
16286864 ccatgtagtatgactaatcatatagtggcggaggcgttttgcagcccaggctagtgcacaacaggttttctcgagcatgggatagcgagattcacagtca 16286963  T
265 gtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
    |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
16286964 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 16287043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 30369333 - 30369650
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
30369333 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 30369432  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
30369433 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 30369532  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||    
30369533 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 30369632  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
30369633 atgatcaaaggtcttcct 30369650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 16392821 - 16393138
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
16392821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 16392920  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
16392921 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 16393020  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||| |||||| | ||||    
16393021 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtac 16393120  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
16393121 atgatcaaaggtcttcct 16393138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9470071 - 9469754
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
9470071 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 9469972  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    | || || ||||| |||| ||| ||  | |||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
9469971 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtctggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 9469872  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||    
9469871 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 9469772  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
9469771 atgatcaaaggtcttcct 9469754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16238093 - 16237975
Alignment:
206 cagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctt 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||  || || || || ||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||    
16238093 cagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtatagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaataggagatagcgtgctctttctt 16237994  T
306 tccagtctcgtcttgttga 324  Q
    ||| || || |||||||||    
16237993 tccggtttcatcttgttga 16237975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16238221 - 16238112
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||  |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
16238221 acacaatatcatactcggacaataacatctgccatcgagcaatccttccagttaaagttggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatat 16238122  T
162 caagcaagtt 171  Q
    ||| ||||||    
16238121 caaccaagtt 16238112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9321303 - 9320920
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
9321303 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9321204  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
9321203 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 9321104  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
9321103 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 9321004  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
9321003 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 9320920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12136002 - 12135619
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
12136002 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacataatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 12135903  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
12135902 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 12135803  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
12135802 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 12135703  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
12135702 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 12135619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26484221 - 26483838
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26484221 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26484122  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26484121 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26484022  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26484021 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 26483922  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
26483921 ttcttcccagtttcatcctgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 26483838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3793368 - 3792985
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
3793368 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3793269  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
3793268 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcgggtccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 3793169  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
3793168 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 3793069  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||| |||||||||    
3793068 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttcct 3792985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 8661808 - 8662191
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
8661808 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 8661907  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
8661908 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 8662007  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
8662008 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 8662107  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
8662108 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 8662191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30155858 - 30155475
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
30155858 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 30155759  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
30155758 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 30155659  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
30155658 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 30155559  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
30155558 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 30155475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33520207 - 33519824
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
33520207 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33520108  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
33520107 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33520008  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
33520007 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 33519908  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
33519907 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 33519824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41678532 - 41678149
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
41678532 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 41678433  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
41678432 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 41678333  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
41678332 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 41678233  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
41678232 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 41678149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22892287 - 22891907
Alignment:
4 ggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
22892287 ggttgataggcaaggtgatcaacaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaa 22892188  T
104 tttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgttt 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
22892187 tctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttttatgattcaccaaatagtgacgcaggcgttt 22892088  T
204 agcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttc 303  Q
     || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
22892087 ggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 22891988  T
304 tttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22891987 tttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcgtcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 22891907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23629797 - 23629414
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
23629797 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 23629698  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
23629697 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 23629598  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
23629597 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 23629498  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
23629497 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 23629414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25204105 - 25203722
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
25204105 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 25204006  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||  |||||||    
25204005 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcg 25203906  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||    
25203905 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttct 25203806  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
25203805 ttctttcccgtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataatcaaaggccttcct 25203722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25268260 - 25267877
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
25268260 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 25268161  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||  |||||||    
25268160 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcg 25268061  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||    
25268060 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttct 25267961  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
25267960 ttctttcccgtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataatcaaaggccttcct 25267877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30033255 - 30032872
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
30033255 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 30033156  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
30033155 caatctttccagtaacagcagccttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 30033056  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
30033055 tttggtagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 30032956  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
30032955 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 30032872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31435291 - 31434908
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
31435291 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31435192  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
31435191 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31435092  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
31435091 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 31434992  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
31434991 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 31434908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 37667819 - 37668202
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
37667819 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37667918  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37667919 caatcttcccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37668018  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37668019 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37668118  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
37668119 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 37668202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 40469883 - 40470266
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
40469883 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 40469982  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
40469983 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 40470082  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
40470083 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 40470182  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||| |||||||||    
40470183 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttcct 40470266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43082082 - 43081699
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
43082082 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 43081983  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
43081982 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 43081883  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
43081882 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 43081783  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
43081782 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 43081699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2514889 - 2514506
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
2514889 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 2514790  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||    
2514789 caatctttccagtgacggcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcg 2514690  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
2514689 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 2514590  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
2514589 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 2514506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5641615 - 5641232
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
5641615 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5641516  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||  |||||||    
5641515 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcg 5641416  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
5641415 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctct 5641316  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
5641315 ttctttccagtttcatcttgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 5641232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18497058 - 18497441
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18497058 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18497157  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
18497158 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18497257  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
18497258 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 18497357  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
18497358 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 18497441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24587201 - 24586818
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
24587201 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24587102  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
24587101 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 24587002  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
24587001 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 24586902  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
24586901 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 24586818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30172296 - 30171913
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
30172296 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30172197  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
30172196 caatctttccagtaacggcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 30172097  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
30172096 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 30171997  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
30171996 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 30171913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33296355 - 33295972
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
33296355 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33296256  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
33296255 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33296156  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
33296155 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 33296056  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
33296055 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 33295972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 15655091 - 15655474
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
15655091 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcg 15655190  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  | |||||    
15655191 caatcttcccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcg 15655290  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
15655291 tttagcagcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 15655390  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
15655391 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 15655474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24973733 - 24973350
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
24973733 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtg 24973634  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
24973633 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 24973534  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
24973533 tttagcggcccaggccaaaggacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 24973434  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
24973433 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 24973350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30938462 - 30938079
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
30938462 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30938363  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
30938362 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 30938263  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
30938262 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 30938163  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
30938162 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 30938079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31822740 - 31823123
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
31822740 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31822839  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
31822840 cgatcttcccagtaacggccgctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 31822939  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
31822940 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 31823039  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
31823040 ttctttccagtttcatcttgttgcccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 31823123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37758810 - 37758427
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
37758810 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37758711  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37758710 caatctttccagtaacggcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37758611  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37758610 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37758511  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||| |||||||||    
37758510 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttcct 37758427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 37767324 - 37767707
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
37767324 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37767423  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
37767424 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 37767523  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37767524 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37767623  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||| |||||||||    
37767624 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccagatacataatcaaaggccttcct 37767707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11553182 - 11552799
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
11553182 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11553083  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
11553082 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 11552983  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||    
11552982 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgttct 11552883  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
11552882 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 11552799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 13183126 - 13183509
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |    
13183126 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattaagacaaaagcatctgccagcgtg 13183225  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
13183226 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 13183325  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
13183326 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgatct 13183425  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
13183426 ttctttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcccacggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 13183509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18371867 - 18372250
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18371867 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18371966  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
18371967 caatctttccagtaacggcagctttctcaaagatatacttgatctgatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18372066  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
18372067 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 18372166  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
18372167 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 18372250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22995450 - 22995833
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
22995450 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22995549  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
22995550 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22995649  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||    
22995650 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttct 22995749  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22995750 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 22995833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28653069 - 28652686
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
28653069 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28652970  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28652969 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28652870  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
28652869 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 28652770  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
28652769 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 28652686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 29887530 - 29887913
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |    
29887530 agaggttggtaggcgagattatcggcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagagtg 29887629  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
29887630 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatacttgataggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 29887729  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
29887730 tttggcagcccaggctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 29887829  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
29887830 ttctttccagtctcatcttattgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 29887913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33878957 - 33878574
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
33878957 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33878858  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
33878857 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33878758  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
33878757 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 33878658  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
33878657 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 33878574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 37354976 - 37355359
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
37354976 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 37355075  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
37355076 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 37355175  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
37355176 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 37355275  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
37355276 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 37355359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6878132 - 6877749
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
6878132 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 6878033  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||    
6878032 caatctttccagtgacggcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcg 6877933  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
6877932 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 6877833  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
6877832 ttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 6877749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 9547042 - 9547425
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
9547042 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9547141  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
9547142 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 9547241  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
9547242 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 9547341  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
9547342 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 9547425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24727796 - 24727413
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
24727796 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24727697  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
24727696 caatcttcccagtgacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 24727597  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
24727596 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 24727497  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
24727496 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 24727413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 28956118 - 28956501
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
28956118 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28956217  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28956218 caatctttccagtaacggcagctttctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28956317  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
28956318 tttagcggcccaggccaaagcgcaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 28956417  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
28956418 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 28956501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 13321163 - 13321546
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
13321163 agaggttgataagcaaggtgatcggcgaggatgctacctttgatcgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtg 13321262  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
13321263 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 13321362  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
13321363 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagataacatgctct 13321462  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
13321463 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 13321546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 13439016 - 13439399
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
13439016 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13439115  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||  |||||||    
13439116 caatcttcccagtgacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgatttaccaaataatgacgcaggcg 13439215  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
13439216 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 13439315  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
13439316 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 13439399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18124749 - 18125132
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
18124749 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaacagcatctgccagcgtg 18124848  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||  |||||||    
18124849 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcg 18124948  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
18124949 ttttgcggcccgggccaaggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 18125048  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18125049 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18125132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34620345 - 34619962
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |    
34620345 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 34620246  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
34620245 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 34620146  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
34620145 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 34620046  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
34620045 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcattaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 34619962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33781312 - 33780933
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
33781312 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttg----ttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33781217  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
33781216 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33781117  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
33781116 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 33781017  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
33781016 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 33780933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 32592607 - 32592990
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |    
32592607 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtg 32592706  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
32592707 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 32592806  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || | ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||    
32592807 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 32592906  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
32592907 ttctttccggtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 32592990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11327464 - 11327081
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
11327464 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11327365  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
11327364 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 11327265  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |  ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||    
11327264 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 11327165  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  | |||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
11327164 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacaggttcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 11327081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 15755185 - 15755568
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
15755185 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15755284  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
15755285 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 15755384  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
15755385 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgctct 15755484  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||| |||||||||    
15755485 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgctaaatacatgatcaaaggccttcct 15755568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 24684697 - 24684861
Alignment:
220 gcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtctt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
24684697 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctt 24684796  T
320 gttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
24684797 gttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 24684861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 383
Target Start/End: Original strand, 3483602 - 3483918
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
3483602 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 3483701  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
3483702 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 3483801  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||  ||||| || |||    
3483802 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtactgttaaatac 3483901  T
367 ataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||| || |||||    
3483902 atgatcaaaggtcttcc 3483918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 351609 - 351931
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || |  || |  |||||||| |  |||||||| ||||||||  |||||||    
351609 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 351708  T
162 caagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcag 261  Q
    ||| ||||| || || |  | ||  |||||  | || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||  || ||     
351709 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaa 351808  T
262 tcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 361  Q
    || |||||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||    
351809 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtca 351908  T
362 agtacataatcaagggccttcct 384  Q
    | ||||| ||||| |||||||||    
351909 aatacatgatcaaaggccttcct 351931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 380
Target Start/End: Original strand, 20388343 - 20388701
Alignment:
22 tcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcag 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || |||||   | | ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || | ||  |    
20388343 tcagcaagaatactacctttgatggctttctgagtgcggtagacaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagtcg 20388442  T
122 ctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagc 221  Q
      |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||  | || ||  |||||||||| || |||||    
20388443 gcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcatagcagcccatgccaaagc 20388542  T
222 acaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgt 321  Q
     | ||| || ||||||||||| | ||| ||||  || || || |||||||||||  |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
20388543 gcgacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgt 20388642  T
322 tgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggcct 380  Q
    ||||| |  ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
20388643 tgacccaacacacagcccatagaattttctaacacggtcaagtacatgatcaaaggcct 20388701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34469385 - 34469106
Alignment:
65 caatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaa 164  Q
    ||||||||||||| || |  | ||| ||||| || |||||| |||| || | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||    
34469385 caatatcatattcggatagtaacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcaggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 34469286  T
165 gcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcg 264  Q
     ||||| |||||| | |||| ||||||  | || ||||| ||||||||  |||  || ||||| |||||||| ||||| | ||| || | ||| |||||     
34469285 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttggcagcccagactagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtca 34469186  T
265 gtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
    |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
34469185 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 34469106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 11943821 - 11944138
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
11943821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 11943920  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
11943921 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 11944020  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||    
11944021 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 11944120  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
11944121 atgatcaaaggtcttcct 11944138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31521011 - 31520751
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  ||||| || ||||| |||| ||| ||  | ||||| || |||||||| |||| |||||    
31521011 ttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagccaagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcac 31520912  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    |||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || |||||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || ||||||||    
31520911 aacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttg 31520812  T
324 accgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
     ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||    
31520811 tccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtacatgatcaaaggtcttcct 31520751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 374
Target Start/End: Original strand, 15784124 - 15784431
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
15784124 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 15784223  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    | || || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
15784224 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 15784323  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||    
15784324 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 15784423  T
367 ataatcaa 374  Q
    || |||||    
15784424 atgatcaa 15784431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 5439624 - 5439941
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
5439624 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5439723  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | ||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
5439724 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5439823  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || | ||||    
5439824 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacaccgttaggtac 5439923  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
5439924 atgatcaaaggtcttcct 5439941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17957801 - 17957581
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| ||| ||  | ||||| || |||||||| |||| |||||    
17957801 ttctcaaatatgtacttgattggatccattttagatatcagccaagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcac 17957702  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    |||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || |||||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || ||||||||    
17957701 aacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttg 17957602  T
324 accgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
17957601 tccgagcacacaacccatgga 17957581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 36375361 - 36375678
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || || ||||||||||||||  | |||| ||  |    
36375361 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 36375460  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |  || || | ||| || || ||    
36375461 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagt 36375560  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||| ||| | | ||| || || || || |||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||    
36375561 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 36375660  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
36375661 atgatcaaaggtcttcct 36375678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 37000015 - 37000332
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || || ||||||||||||||  | |||| ||  |    
37000015 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 37000114  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |  || || | ||| || || ||    
37000115 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagt 37000214  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||| ||| | | ||| || || || || |||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||    
37000215 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 37000314  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
37000315 atgatcaaaggtcttcct 37000332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10966487 - 10966104
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
10966487 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10966388  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
10966387 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 10966288  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10966287 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 10966188  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
10966187 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 10966104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10948899 - 10948516
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
10948899 agaggttgataagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 10948800  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
10948799 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 10948700  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
10948699 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 10948600  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
10948599 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 10948516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 41789746 - 41790129
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
41789746 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 41789845  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
41789846 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 41789945  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
41789946 cttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 41790045  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
41790046 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 41790129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3644958 - 3644574
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
3644958 agaggttgataagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3644859  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
3644858 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 3644759  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccg-ggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctc 299  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
3644758 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagttttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttc 3644659  T
300 tttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
3644658 tttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 3644574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 16204470 - 16204853
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
16204470 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatcttccagcggg 16204569  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16204570 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16204669  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||| | || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
16204670 tttggcggcctaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 16204769  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16204770 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 16204853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28588807 - 28588424
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |    
28588807 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtg 28588708  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28588707 caatctttccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28588608  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
28588607 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 28588508  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
28588507 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 28588424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28153558 - 28153175
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
28153558 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28153459  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28153458 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28153359  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
28153358 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 28153259  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
28153258 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 28153175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51642040 - 51641657
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
51642040 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacagtatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 51641941  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||  |||||||    
51641940 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatggttcaccaagtaatgacgcaggcg 51641841  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
51641840 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 51641741  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
51641740 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 51641657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 21894184 - 21894568
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
21894184 agaggttggtaggcaagatgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaatagcatctgccagcgtg 21894283  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
21894284 caaccttcccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 21894383  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagca-tgctc 299  Q
     ||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
21894384 cttagcggcccaggccagagcacaacaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcagtgctc 21894483  T
300 tttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
21894484 tttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 21894568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20464798 - 20464415
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
20464798 agaggttggcaggcaagatgattggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 20464699  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||     
20464698 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggca 20464599  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
20464598 ttttgcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagtatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 20464499  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || ||||||    
20464498 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataattaaaggtcttcct 20464415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 20336855 - 20337142
Alignment:
4 ggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaa 103  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
20336855 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataagagcatctgccagcgtgcaa 20336954  T
104 tttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgttt 203  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
20336955 tcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgttt 20337054  T
204 agcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagata 291  Q
     || ||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
20337055 ggcggcccaggccagagcacaacaagttttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 20337142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22489782 - 22489500
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    |||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
22489782 acacgatatcatactcggacaataacatctgccatcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatat 22489683  T
162 caagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcag 261  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || ||     
22489682 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtactgaatatcgggactcacaa 22489583  T
262 tcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
    || || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |  ||||| ||||||||    
22489582 tcagtgaacttcttactcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttggcccaacacacagcccatgga 22489500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 384
Target Start/End: Original strand, 20339024 - 20339120
Alignment:
288 gatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
20339024 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttcct 20339120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 5628500 - 5628817
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  |    
5628500 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5628599  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || || || |||| ||| ||  | ||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
5628600 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5628699  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | ||||    
5628700 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaatcttctaacaccgttaggtac 5628799  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
5628800 atgatcaaaggtcttcct 5628817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27286743 - 27287126
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
27286743 agaggttgataggcaagatgatcggcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccaacgtg 27286842  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27286843 caatcttcccagtaatagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcg 27286942  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
27286943 tttggcagcccatgccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 27287042  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27287043 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27287126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29576831 - 29576448
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
29576831 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29576732  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
29576731 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 29576632  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
29576631 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 29576532  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
29576531 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 29576448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27626090 - 27626473
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27626090 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtg 27626189  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27626190 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27626289  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||    
27626290 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttct 27626389  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||    
27626390 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaagtacataatcaaaggccttcct 27626473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 30554395 - 30554778
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
30554395 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30554494  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
30554495 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 30554594  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
30554595 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 30554694  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
30554695 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 30554778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3699900 - 3699517
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
3699900 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3699801  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
3699800 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttattggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 3699701  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
3699700 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 3699601  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
3699600 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 3699517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28164308 - 28163925
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
28164308 agaggttggtaagcaagatgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28164209  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
28164208 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 28164109  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
28164108 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 28164009  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||||    
28164008 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttcct 28163925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16677957 - 16677574
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16677957 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccctttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16677858  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
16677857 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagacatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 16677758  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
16677757 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcagtgaacttcttgctcaggtagtagatagcatgctct 16677658  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16677657 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 16677574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27011548 - 27011165
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27011548 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27011449  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
27011448 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27011349  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
27011348 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 27011249  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27011248 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27011165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27061323 - 27060940
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |    
27061323 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatataatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27061224  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27061223 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27061124  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
27061123 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 27061024  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27061023 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27060940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27358489 - 27358872
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27358489 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27358588  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27358589 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27358688  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
27358689 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 27358788  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27358789 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27358872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27448832 - 27449215
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27448832 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27448931  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27448932 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27449031  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
27449032 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 27449131  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27449132 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27449215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29505233 - 29504850
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
29505233 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29505134  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
29505133 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 29505034  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
29505033 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 29504934  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
29504933 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 29504850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 33372810 - 33373193
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
33372810 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33372909  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
33372910 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33373009  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
33373010 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcagtgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttct 33373109  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
33373110 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 33373193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4529102 - 4528719
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4529102 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4529003  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
4529002 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 4528903  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
4528902 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 4528803  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4528802 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4761580 - 4761197
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4761580 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4761481  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
4761480 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctatatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 4761381  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
4761380 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 4761281  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4761280 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4761197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 13295330 - 13295713
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
13295330 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13295429  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
13295430 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 13295529  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
13295530 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 13295629  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
13295630 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 13295713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 14141773 - 14142156
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
14141773 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 14141872  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
14141873 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 14141972  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
14141973 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttct 14142072  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
14142073 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 14142156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27488950 - 27488567
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27488950 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27488851  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27488850 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaggttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27488751  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
27488750 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 27488651  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27488650 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27488567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 4720514 - 4720897
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4720514 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4720613  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
4720614 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 4720713  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
4720714 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctct 4720813  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4720814 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4720897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4776697 - 4776314
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4776697 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4776598  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
4776597 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 4776498  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
4776497 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 4776398  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4776397 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4776314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 13520571 - 13520954
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
13520571 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13520670  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
13520671 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 13520770  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
13520771 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 13520870  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
13520871 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 13520954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16753638 - 16753255
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16753638 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16753539  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16753538 caatcttcccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16753439  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
16753438 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttct 16753339  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||  |||||||||    
16753338 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcagaggccttcct 16753255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 16940406 - 16940789
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16940406 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16940505  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16940506 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16940605  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
16940606 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 16940705  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| || ||||||    
16940706 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaatacataatcaaaggtcttcct 16940789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26112791 - 26113174
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26112791 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26112890  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
26112891 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 26112990  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
26112991 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 26113090  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
26113091 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 26113174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26789633 - 26789250
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26789633 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26789534  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||     
26789533 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggct 26789434  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
26789433 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 26789334  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
26789333 ttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 26789250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27022953 - 27022570
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27022953 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27022854  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||    
27022853 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcg 27022754  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
27022753 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 27022654  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27022653 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27022570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27198002 - 27197619
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27198002 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27197903  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27197902 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27197803  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
27197802 tttggcagctcaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 27197703  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
27197702 ttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 27197619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27251233 - 27251616
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27251233 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27251332  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27251333 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27251432  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
27251433 tttggcagctcaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 27251532  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
27251533 ttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 27251616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28211271 - 28210888
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
28211271 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 28211172  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
28211171 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 28211072  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
28211071 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 28210972  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
28210971 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 28210888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 34460885 - 34461268
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
34460885 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34460984  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
34460985 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 34461084  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
34461085 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcctctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 34461184  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
34461185 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 34461268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27180261 - 27179891
Alignment:
13 gcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccag 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||    
27180261 gcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccag 27180162  T
113 taacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagccca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||| |    
27180161 taacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggccta 27180062  T
213 agctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtc 312  Q
     || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
27180061 ggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtc 27179962  T
313 tcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
27179961 tcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcc 27179891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 383
Target Start/End: Original strand, 27268978 - 27269348
Alignment:
13 gcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccag 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||    
27268978 gcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccag 27269077  T
113 taacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagccca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||| |    
27269078 taacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggccta 27269177  T
213 agctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtc 312  Q
     || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
27269178 ggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtc 27269277  T
313 tcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
27269278 tcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcc 27269348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 4542153 - 4542536
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
4542153 agaggttgataagcaaggtgattggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 4542252  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
4542253 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 4542352  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
4542353 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctct 4542452  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
4542453 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 4542536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 17088822 - 17089205
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
17088822 agaggttgataagcaaggtgatcagcaaggatgctacctttgattgccatttgagttttgaacacaatatcatattcggacaagagcatctgccatcgtg 17088921  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || || |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
17088922 caatcttccctgtaacagtcgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 17089021  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
17089022 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctct 17089121  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
17089122 ttctttccagtcccatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcgaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 17089205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26922194 - 26921811
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
26922194 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26922095  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||    
26922094 caatcttcccagtaacagccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcg 26921995  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
26921994 tttagcggcccaggccagagcacaacaggtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 26921895  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||  |||||||||    
26921894 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcagaggccttcct 26921811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29553374 - 29552991
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
29553374 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 29553275  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
29553274 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 29553175  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
29553174 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 29553075  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
29553074 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacagcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 29552991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22931263 - 22931646
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
22931263 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 22931362  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
22931363 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22931462  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
22931463 gttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttct 22931562  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22931563 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 22931646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 23853708 - 23854091
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
23853708 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 23853807  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
23853808 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 23853907  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
23853908 gttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttct 23854007  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
23854008 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 23854091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24867533 - 24867150
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
24867533 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24867434  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
24867433 caatcttcccggtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 24867334  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
24867333 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 24867234  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
24867233 ttctttccagtctcatcttgttgacaaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 24867150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 8902082 - 8902465
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
8902082 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 8902181  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
8902182 caatattcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 8902281  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
8902282 tttagcggcccaggccagagcacaacaagttttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 8902381  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  ||| |||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
8902382 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagatgcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttcct 8902465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 15420699 - 15421082
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
15420699 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15420798  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
15420799 caatcttcctagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 15420898  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
15420899 tttagcggcccaggccaaagcgcaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 15420998  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
15420999 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 15421082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 26775006 - 26775389
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
26775006 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 26775105  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
26775106 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 26775205  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
26775206 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 26775305  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
26775306 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 26775389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20172361 - 20171981
Alignment:
4 ggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaa 103  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
20172361 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaa 20172262  T
104 tttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgttt 203  Q
    | || || |||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||    
20172261 tcttcccggtaacagcaggtttctcgaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgttt 20172162  T
204 agcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttc 303  Q
    |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
20172161 agcaacccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 20172062  T
304 tttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| | | |||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
20172061 tttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 20171981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Original strand, 22163630 - 22164010
Alignment:
4 ggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaa 103  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
22163630 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaa 22163729  T
104 tttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgttt 203  Q
    | || || |||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||    
22163730 tcttcccggtaacagcaggtttctcgaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgttt 22163829  T
204 agcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttc 303  Q
    |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
22163830 agcaacccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 22163929  T
304 tttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| | | |||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22163930 tttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 22164010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 24302136 - 24302430
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |    
24302136 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtg 24302235  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
24302236 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 24302335  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcat 295  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
24302336 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 24302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 118 - 384
Target Start/End: Original strand, 22455610 - 22455876
Alignment:
118 gcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagcta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
22455610 gcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagcta 22455709  T
218 aagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtc 317  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
22455710 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatc 22455809  T
318 ttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22455810 ttgttgaccaagtacgcatcccacggattcaccaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 22455876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 219 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26992394 - 26992229
Alignment:
219 agcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
26992394 agcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcc 26992295  T
319 tgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
26992294 tgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 26992229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27545656 - 27545340
Alignment:
64 acaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatca 163  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||    
27545656 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 27545557  T
164 agcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtc 263  Q
    | ||||| || ||||| | || ||||||  | || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  || || ||    
27545556 accaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 27545457  T
264 ggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaag 363  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| |||||     
27545456 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaa 27545357  T
364 tacataatcaagggcct 380  Q
    ||||| ||||| |||||    
27545356 tacatgatcaaaggcct 27545340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 15408912 - 15409051
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
15408912 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtg 15409011  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatactt 140  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
15409012 caatcttcctagtaacagcagctttctcaaagatatactt 15409051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 383
Target Start/End: Original strand, 23971210 - 23971531
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |  |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
23971210 acacaatatcatactcggacaataacatctgccatcaagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatat 23971309  T
162 caagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcag 261  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || ||     
23971310 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaa 23971409  T
262 tcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 361  Q
    || || ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || |  ||||| |    
23971410 tcagtgaacttcttactcaaatagtagatatcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatggaatcttccagtactgtta 23971509  T
362 agtacataatcaagggccttcc 383  Q
    ||||||| ||||| || |||||    
23971510 agtacatgatcaaaggtcttcc 23971531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18120220 - 18119904
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
18120220 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18120121  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
18120120 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 18120021  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||  ||||| || |||    
18120020 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtactgttaaatac 18119921  T
367 ataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||| || |||||    
18119920 atgatcaaaggtcttcc 18119904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25707765 - 25707445
Alignment:
64 acaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatca 163  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| || | |||||  |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
25707765 acaatatcatactcggacaatagcatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagcaggcttctcaaaaatgtacttgattggatccattttggatatca 25707666  T
164 agcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtc 263  Q
    | ||||| || ||||| | ||  || ||  | || || ||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| | ||  || || ||    
25707665 accaagtagtgtgattaaccatttattgacgaagacgcttagcagcccatgtcaaagcgcaacaggttttctctagcatagaatatctggactcacaatc 25707566  T
264 ggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaag 363  Q
     |||||||||||  |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||| || || |||||| | ||||||    
25707565 agtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttttttccagtctcgtcttgttgatccaacacacagcccatagaatcttctaacccggtcaag 25707466  T
364 tacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
25707465 tacatgatcaaaggccttcct 25707445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Original strand, 18212114 - 18212391
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
18212114 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18212213  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |  || ||||  || || || ||    
18212214 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagt 18212313  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
18212314 gaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 18212391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 384
Target Start/End: Original strand, 9135855 - 9136115
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||  ||||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| |||||    
9135855 ttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagccaagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcac 9135954  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    |||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || |||||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || ||||||||    
9135955 aacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttg 9136054  T
324 accgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
     ||||| ||||| |||||||| |  |||| |||||| | |||||| ||||| || ||||||    
9136055 tccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtacatgatcaaaggtcttcct 9136115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9856 - 9473
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
9856 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9757  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
9756 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 9657  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||    
9656 tttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttct 9557  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
9556 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 9473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7780 - 7397
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
7780 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 7681  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
7680 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 7581  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
7580 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 7481  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
7480 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 7397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31113 - 30730
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |    
31113 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatctgccagcgtg 31014  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31013 caatcttcccagtaacagcaggtttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 30914  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
30913 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 30814  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
30813 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 30730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19890 - 19507
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |    
19890 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtg 19791  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
19790 caatcttcccagtaacagcaggtttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 19691  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
19690 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 19591  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
19590 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 19507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5009708 - 5009325
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
5009708 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5009609  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
5009608 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 5009509  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
5009508 tttggcagcccaagccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 5009409  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
5009408 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 5009325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27159753 - 27160136
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
27159753 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 27159852  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
27159853 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 27159952  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
27159953 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 27160052  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
27160053 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 27160136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31122948 - 31123331
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
31122948 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 31123047  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
31123048 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 31123147  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
31123148 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 31123247  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
31123248 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 31123331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6573691 - 6573308
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
6573691 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 6573592  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
6573591 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 6573492  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
6573491 tttggcagcccaaactaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 6573392  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
6573391 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacaacccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 6573308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21973534 - 21973151
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
21973534 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 21973435  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
21973434 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 21973335  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
21973334 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 21973235  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
21973234 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 21973151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 54837224 - 54836841
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
54837224 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 54837125  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
54837124 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 54837025  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
54837024 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 54836925  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
54836924 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 54836841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1904087 - 1903704
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
1904087 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 1903988  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
1903987 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 1903888  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
1903887 tttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 1903788  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
1903787 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 1903704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 33670236 - 33670619
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
33670236 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 33670335  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
33670336 caatcttcccagtaacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 33670435  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||| |||    
33670436 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagataacatgttct 33670535  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
33670536 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 33670619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 40102073 - 40102456
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
40102073 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtg 40102172  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
40102173 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 40102272  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
40102273 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 40102372  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
40102373 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 40102456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18797050 - 18797433
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18797050 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18797149  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
18797150 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18797249  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
18797250 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 18797349  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
18797350 ttctttccagtctcatcttgttgtccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 18797433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24116495 - 24116112
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
24116495 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24116396  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
24116395 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 24116296  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
24116295 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 24116196  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
24116195 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 24116112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 24588797 - 24589180
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
24588797 agaggttggtaagcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 24588896  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
24588897 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 24588996  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||| || |||| |||    
24588997 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagttatcatgttct 24589096  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
24589097 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 24589180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 36340953 - 36341336
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
36340953 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 36341052  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
36341053 caatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 36341152  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||    
36341153 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgttct 36341252  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
36341253 ttctttccagtttcatcttgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 36341336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39854470 - 39854087
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
39854470 agaggttggtaagcaagatgatctgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 39854371  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
39854370 caatctttccagtaacggccgctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 39854271  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
39854270 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 39854171  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
39854170 ttctttccagtttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 39854087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14102376 - 14101993
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
14102376 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 14102277  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
14102276 caatctttccagtaacggcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 14102177  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
14102176 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 14102077  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
14102076 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 14101993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 20334857 - 20335240
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
20334857 agaggttggtaagcagggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 20334956  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
20334957 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 20335056  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
20335057 tttggaggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 20335156  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
20335157 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 20335240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 384
Target Start/End: Original strand, 14759766 - 14760125
Alignment:
25 gcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctt 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
14759766 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 14759865  T
125 tctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcaca 224  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||    
14759866 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 14759965  T
225 acaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttga 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
14759966 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttga 14760065  T
325 ccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
14760066 ccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 14760125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 18313614 - 18313997
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
18313614 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 18313713  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
18313714 caatcttcccagtaacaacagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 18313813  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
18313814 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 18313913  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
18313914 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 18313997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 34185396 - 34185779
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
34185396 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 34185495  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
34185496 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 34185595  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
34185596 tttatcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 34185695  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
34185696 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 34185779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15231705 - 15231322
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
15231705 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 15231606  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
15231605 caacctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 15231506  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |  ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
15231505 tttggtggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataacgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttct 15231406  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
15231405 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcattaaacactgacaaatacataatcaaaggtcttcct 15231322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17016879 - 17016496
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
17016879 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 17016780  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
17016779 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 17016680  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
17016679 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 17016580  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
17016579 ttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 17016496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 135 - 384
Target Start/End: Original strand, 15387948 - 15388197
Alignment:
135 atacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
15387948 atacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttc 15388047  T
235 tcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacac 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
15388048 tcaagcatcgtatatcgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcaaatagtagatagcatgctctttctttccagtcttgtcttgttgaccgagtacac 15388147  T
335 atcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
15388148 atcccatggattcatctaacactatcaagtacataatcaagggccttcct 15388197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30757593 - 30757210
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
30757593 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 30757494  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||    
30757493 caatcttcccagtgacagcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcg 30757394  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
30757393 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 30757294  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
30757293 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 30757210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14668849 - 14668466
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |    
14668849 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatatttagacaaaagcatctgccagcgtg 14668750  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||| ||    
14668749 caatcttcccggtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccatcttggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcagacg 14668650  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
14668649 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 14668550  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||| |||||||||    
14668549 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatacttccaaatacataatcaaaggccttcct 14668466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Original strand, 15281376 - 15281756
Alignment:
4 ggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaa 103  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||    
15281376 ggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacataatgtcatatttggacaagagcatttgccagcgtgcaa 15281475  T
104 tttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgttt 203  Q
    | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||    
15281476 tcttcccagtaacagcaggtttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggctttt 15281575  T
204 agcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttc 303  Q
     || ||||| || | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
15281576 ggcggcccaggccagagagcaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 15281675  T
304 tttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
15281676 tttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacgaattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttcct 15281756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 15384784 - 15384923
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15384784 agaggctgataggcaacgtgatatgcaagaatgctacctttgattgacttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 15384883  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatactt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15384884 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatactt 15384923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5698368 - 5698219
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
5698368 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5698269  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatcc 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5698268 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatcc 5698219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Original strand, 14725301 - 14725578
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
14725301 atatcatattcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 14725400  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
14725401 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 14725500  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
14725501 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 14725578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 380
Target Start/End: Original strand, 1881598 - 1881914
Alignment:
64 acaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatca 163  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||    
1881598 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 1881697  T
164 agcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtc 263  Q
    | ||||| || ||||| | || ||| ||  | || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||  || || ||    
1881698 accaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 1881797  T
264 ggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaag 363  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| |||||     
1881798 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaa 1881897  T
364 tacataatcaagggcct 380  Q
    ||||| ||||| |||||    
1881898 tacatgatcaaaggcct 1881914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 22146066 - 22146388
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || |  || |  |||||||| |  |||||||| ||||||||  |||||||    
22146066 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 22146165  T
162 caagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcag 261  Q
    ||| ||||| || || |  | ||  |||||  | || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||  || ||     
22146166 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaa 22146265  T
262 tcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 361  Q
    || |||||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||    
22146266 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtca 22146365  T
362 agtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
22146366 agtacatgatcaaaggccttcct 22146388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19768106 - 19767829
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
19768106 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 19768007  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | |  || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
19768006 aagttgtatgattaatcatataatgacggaaacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 19767907  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatgga 344  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
19767906 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatgga 19767829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12515942 - 12515698
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||    
12515942 ttctcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 12515843  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    | |||||||||||||| ||   |||||| |  || |  || |||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||| || ||||| ||    
12515842 atcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttccttccagtttcttcttgctg 12515743  T
324 accgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacat 368  Q
     ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||    
12515742 cccgagcacacaacccatagaatcttctagcacggtcaaatacat 12515698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 55784901 - 55784668
Alignment:
65 caatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaa 164  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||| |||| || | ||| | |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||    
55784901 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcgggtccatcttagatatcaa 55784802  T
165 gcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcg 264  Q
     ||||| |||||| | |||| ||||||  | |||||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||| | ||| || | ||| || ||     
55784801 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcagcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatca 55784702  T
265 gtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgct 298  Q
    |||||||||||| ||| ||| || || |||||||    
55784701 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgct 55784668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18044871 - 18044714
Alignment:
22 tcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcag 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || |||||   | | ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| |||||| |||| || | ||| |    
18044871 tcagcaagaatactacctttgatggctttctgagtgcggtagacaatatcatactcgaacaataacatttgccaacgagcaattcttcctgttaaagccg 18044772  T
122 ctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgatt 179  Q
      |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |||||    
18044771 gcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgatt 18044714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 11364 - 11747
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
11364 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11463  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
11464 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 11563  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
11564 tttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 11663  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
11664 ttcttcccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 11747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9842 - 9459
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
9842 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 9743  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
9742 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 9643  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
9642 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 9543  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
9542 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 9459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22627 - 23010
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
22627 agaggttgataagcaaggtgatcggcgagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtg 22726  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
22727 caatctttccagtaacagcagctttctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 22826  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
22827 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctct 22926  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
22927 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttcct 23010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16401 - 16018
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
16401 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 16302  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
16301 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 16202  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
     ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
16201 cttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttct 16102  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
16101 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 16018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13008
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
13391 agaggttggtaagcaaggtgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 13292  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
13291 caatcttcccagtaacggccgccttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 13192  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
13191 tttagtggcccaggctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 13092  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
13091 ttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttcct 13008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3887 - 3504
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
3887 agaggttggtaagcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 3788  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
3787 caatcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcg 3688  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
3687 tttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttct 3588  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
3587 ttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 3504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11769 - 11386
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
11769 agaggttgataagcaaggtgatcggcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 11670  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
11669 cgatcttcccagtaacggccgctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcg 11570  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
11569 tttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 11470  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
11469 ttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttcct 11386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9863 - 9482
Alignment:
3 aggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgca 102  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
9863 aggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaacatcatattcagacaagagcatctgccagcttgca 9764  T
103 atttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtt 202  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
9763 atcttcccagtaacagcagctttctcaaagatatattttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtt 9664  T
203 tagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctcttt 302  Q
    | || ||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
9663 tggcggccaaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttcttt 9564  T
303 ctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
9563 ctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacagatacataatcaaaggccttcct 9482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 5615 - 5998
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
5615 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtg 5714  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcg 200  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||    
5715 caatctttccagtgacggcagctttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcg 5814  T
201 tttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctct 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
5815 tttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctct 5914  T
301 ttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
5915 ttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttcct 5998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 5125 - 5464
Alignment:
19 tgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||    
5125 tgatcggcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacag 5224  T
119 cagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaa 218  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||  || ||  | |||||||| |||||||| ||||     
5225 caggcttctcgaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagtagtatgatttaccaggtaatgacgaaggcgtttggcagcccaggctag 5324  T
219 agcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtct 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
5325 agcacagcaagtcttctcaagcatcgtataccgaatttcgcagtcggtaaacttcttgcttagatagtagatggcatgctctttctttccagtctcgtct 5424  T
319 tgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactg 358  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
5425 tgttgacccaatacacatcccatagattcatcaaacactg 5464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22936 - 22757
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22936 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 22837  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattc 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
22836 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattc 22757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 370
Target Start/End: Original strand, 43181 - 43533
Alignment:
33 gctacctttgactgcctttt-gagtttt-gaacacaatatc-atattcagacaaga-gcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagcttt-ct 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||    
43181 gctacctttgattgcctttttgagtttttgaacacaatatctatattcagacaaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttact 43280  T
128 caaagatat-acttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattc-atcaaatagt-ggtgcagg-cgtttagcagccca--agctaaagc 221  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||| |||||  | | ||||     
43281 caaagatattactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaaccaaataatagacgcaggtcgtttagcggcccaggaccaaaagg 43380  T
222 ac-aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttc-gcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttc-tttccagtctc-gtc 317  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||    
43381 acaaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttctacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttcttttccagtctcattc 43480  T
318 ttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataa 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||    
43481 ttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataa 43533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 118769 - 118946
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaatgctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcg 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
118769 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtg 118868  T
101 caatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgat 178  Q
    |||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
118869 caatcttcccagtaacaacaggtttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcacccaagttgtatgat 118946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10972 - 10656
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||  ||||||| | ||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
10972 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 10873  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
10872 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 10773  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||  ||||| || |||    
10772 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtactgttaaatac 10673  T
367 ataatcaagggccttcc 383  Q
    || ||||| || |||||    
10672 atgatcaaaggtcttcc 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Original strand, 34799 - 35048
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||  ||||| |||||| | |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| |||||    
34799 ttctcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcagccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcac 34898  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| || | ||| ||||| |||||||||||| | ||||| || || || ||||| ||  ||||||| || ||||||||    
34899 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgcttagataataaatggcgtgctcctttcttccagtttcatcttgttg 34998  T
324 accgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatca 373  Q
     ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||| |||||||||||    
34999 tccgagtacacaacccatagaatcttctagcacagtcaggtacataatca 35048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 384
Target Start/End: Original strand, 4412 - 4734
Alignment:
62 acacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||| |||||| |||| || |  || |  |||||||| |  |||||||| ||||||||  |||||||    
4412 acacaatatcataatcagacaataacatctgcaaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 4511  T
162 caagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcag 261  Q
    ||| ||||| || || |  | ||  |||||  | || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |  || ||||  || ||     
4512 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagagtatcgggactcacaa 4611  T
262 tcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 361  Q
    || |||||||||||  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||    
4612 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcaacccatagaatcatccaacacagtca 4711  T
362 agtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||    
4712 agtacatgatcaaaggcattcct 4734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 368
Target Start/End: Original strand, 4969 - 5213
Alignment:
124 ttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagcaagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcac 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||    
4969 ttctcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 5068  T
224 aacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 323  Q
    | |||||||||||||| ||   |||||| |  || |  || |||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||| || ||||| ||    
5069 atcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttccttccagtttcttcttgctg 5168  T
324 accgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacat 368  Q
     ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||    
5169 cccgagcacacaacccatagaatcttctagcacggtcaaatacat 5213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 384
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1443
Alignment:
288 gatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttcct 384  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
1347 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttcct 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2102 - 1979
Alignment:
1 agaggttgataggcaaggtgatcagcaagaat---gctacctttgactgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaac 97  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |    
2102 agaggttggtaggcaagatgatcggcaagaataatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgccatattcagacaagagcatctgccagc 2003  T
98 gcgcaatttttccagtaacagcag 121  Q
    |  |||| || | |||||||||||    
2002 gtccaatcttcctagtaacagcag 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29924 - 29607
Alignment:
67 atatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaagc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||| |||||||||||||  | |||| ||  |    
29924 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacctgattggatccattttagataccagcc 29825  T
167 aagttgtatgattcatcaaatagtggtgcaggcgtttagcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggt 266  Q
    |||| || ||||| |||| ||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |  || || | ||| || || ||    
29824 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 29725  T
267 aaacttcttggtcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtac 366  Q
    |||||||||| | | ||| || || || ||||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || | ||||    
29724 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacaccgttaggtac 29625  T
367 ataatcaagggccttcct 384  Q
    || ||||| || ||||||    
29624 atgatcaaaggtcttcct 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University