View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4710-Insertion-6 (Length: 421)

Name: NF4710-Insertion-6
Description: NF4710
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4710-Insertion-6
NF4710-Insertion-6
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (8-421)||(15083576-15083987)
chr5 (11-421)||(15428661-15429071)
chr5 (10-421)||(15331808-15332220)
chr5 (11-421)||(16397301-16397711)
chr5 (11-413)||(15347634-15348036)
chr5 (11-346)||(15357903-15358238)
chr5 (11-186)||(16403893-16404068)
chr5 (11-361)||(16414626-16414976)
chr5 (27-375)||(15336277-15336625)
chr5 (18-187)||(17928231-17928400)
chr5 (8-200)||(15452724-15452916)
chr5 (208-268)||(17928427-17928487)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (15-421)||(8187738-8188144)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 421
Target Start/End: Original strand, 15083576 - 15083987
Alignment:
Q  8 tgcaagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15083576 tgcaagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaatacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccaaacgtca 15083675  T
Q  108 tccaatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15083676 tccaatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatgttgaagtcttctttgtagtggttctagatccaaatcttcacatgagttcttagtttccgctt 15083775  T
Q  208 ctatgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagat 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083776 cgatgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactc--agtgttggaccaccctttcatgattgaagat 15083873  T
Q  308 aagttgggaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctaca 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083874 aagttgggcaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctaca 15083973  T
Q  408 attttatccttatc 421  Q
    ||||||||||||||    
T  15083974 attttatccttatc 15083987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15429071 - 15428661
Alignment:
Q  11 aagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatcc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || || |||    
T  15429071 aagacgagtagtgaccaaaattgaagaaccctttcctctacaagccaaaacagatctcaatttttgccaattctcttgtttaacgtcccatacatcgtcc 15428972  T
Q  111 aatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttcta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| |  |||||| |    
T  15428971 aatacaagcaaaaatctttttccttgaagcaggtcttgaagtcttgtttgtagtgtctctagatccaaaataccacatgacttcttagatgtcgcttcga 15428872  T
Q  211 tgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagataag 310  Q
    | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  15428871 ttatcgttttagtcattctcttcaaactaaaatcttctgaaacacaaacccaaattctcggctcaaagtgtttgaccaccctctcgtgattgaagataag 15428772  T
Q  311 ttgggaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctacaatt 410  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15428771 ttgggcaagtgttgtttttccaagtccacctataccaacaattggataaacacacaaatcctcaagaccagaagcttcaccaaccaaaaaatctacaatt 15428672  T
Q  411 ttatccttatc 421  Q
    |||||| ||||    
T  15428671 ttatccatatc 15428661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 421
Target Start/End: Original strand, 15331808 - 15332220
Alignment:
Q  10 caagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatc 109  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || | ||| || |||||    
T  15331808 caagacgagtagtgaccaatactgaagcaccctttcctccacaagccaacaaagatttcaacttgtgccatttctcttgtttttcattccacacatcatc 15331907  T
Q  110 caatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatctt-gaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttc 208  Q
     || ||||||||| || |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||    
T  15331908 taaaacaagcaaatatttttttctttgcaatagatctttgaagttttctttgtagtggctcaagatccaaatcatcacaagatttcttagttgcagcttc 15332007  T
Q  209 tatgattgctt-tagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagat 307  Q
     ||||| |||| |||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||    
T  15332008 aatgat-gcttctagtcattcttttgatactaaaatcatctgaaacacacacccacattctcagatcaaagtgtttgacaacactttcatgattgaatat 15332106  T
Q  308 aagttgggaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctaca 407  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| ||||||     
T  15332107 aagttgggcaagtgttgtttttccaagtccgcctagtcccacaattggataaaccgacaaatcctcaaaaccagaagcaccgttaaccaaaatatctacc 15332206  T
Q  408 attttatccttatc 421  Q
    ||||||||| ||||    
T  15332207 attttatccctatc 15332220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Original strand, 16397301 - 16397711
Alignment:
Q  11 aagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatcc 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  16397301 aagacgggtagtgaccaaaattgaagcgccttttcctccacaagccaatacagatttcaatctttgccaattctcttgtttgtcattccacacgtcatcc 16397400  T
Q  111 aatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttcta 210  Q
    || ||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  16397401 aaaacaagcaagtatctttttcttcgaagtagatcttgaagttttctttgaagtagctctagatctaaatcctcacaggacttcttagttgccccttcta 16397500  T
Q  211 tgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagataag 310  Q
    |||| ||||| |||||||  || | | | |||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||| | ||| | | | |||||||||||||  ||    
T  16397501 tgatggcttttgtcattctttttagagtgaaatcttctgaaacgcacacccaaatttttaactcaaagtggttgactatcttgtcatgattgaagacgag 16397600  T
Q  311 ttgggaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctacaatt 410  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||  | || |||||  |  | ||||| || | ||||||||| |||||||||    
T  16397601 ttgagcaagtgttgttttacctagtccacctagcccaacaattggatagacggataagtcctcttgttcggaagcatcaccaaccaaaaagtctacaatt 16397700  T
Q  411 ttatccttatc 421  Q
    |||||||||||    
T  16397701 ttatccttatc 16397711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 413
Target Start/End: Original strand, 15347634 - 15348036
Alignment:
Q  11 aagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatcc 110  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||    
T  15347634 aagacgagtggttactaaaatcgaagcacccttgcctccacaagccaatacaaatctcaatctctgccaattctcttggtcgtcgtcccacacatcatcc 15347733  T
Q  111 aatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttcta 210  Q
    || || |||||| ||||||||| ||| || | || |  |||| ||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |  |    || |   | |||||    
T  15347734 aacaccagcaaatatctttttctttgcagcaaatttaaaagttttctttgcagcggctctagctctaaatcctcacaagcatgaccagatgtagattcta 15347833  T
Q  211 tgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagataag 310  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||   ||||||||  | ||| ||| | ||||||||||| | ||     
T  15347834 tgatggcttttgtcattctcttcaaactgaaatcttctgaaacgcatacccaaattcttagctcaaagtagttgactaccttctcatgattgaacacaat 15347933  T
Q  311 ttgggaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctacaatt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||  | |||||||||| || |||||| ||   ||||||||| |||||||||    
T  15347934 ttgggcaagtgttgttttcccaagtccacctaaaccgacaattggataaactgataaatcctcaaaactagaagcatcatcaaccaaaaagtctacaatt 15348033  T
Q  411 tta 413  Q
    |||    
T  15348034 tta 15348036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Original strand, 15357903 - 15358238
Alignment:
Q  11 aagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatcc 110  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||    
T  15357903 aagacgagtggttaccaaaaccgaagcacccttgcctccgcaagccaatacagatttcaatctctgccaattctcttgtccatcatcccatacatcatcc 15358002  T
Q  111 aatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttcta 210  Q
    || || |||||| ||||||||| | |||| | |||    ||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |  |    || | | |||||||    
T  15358003 aacaccagcaaatatctttttcttcgtagcaaatccaacagttttctttgcaacggctctagatctaaatcctcacaagcatggccagatgcagcttcta 15358102  T
Q  211 tgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagataag 310  Q
    ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| | ||     
T  15358103 tgatgccttttgtcattctcttcaaactgaaatcttctgaaacacatacccaaattcttagctcaaagtgtttgactaccttctcatgattgaacacaac 15358202  T
Q  311 ttgggaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacc 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15358203 ttgggcaagtgttgttttcccaagtccaccaagacc 15358238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 16403893 - 16404068
Alignment:
Q  11 aagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatcc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | || |||||||| |||||| ||||||||| | || ||| | |||||||    
T  16403893 aagacgagtagtgaccaaaattgaagtaccctttccaccacaagccaatagaaatttcaatctcagccaatactcttgtttttggttccacaagtcatcc 16403992  T
Q  111 aatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcac 186  Q
    || ||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16403993 aaaacaagcaaatatctttttcttcgaagtagaacttgaagtcttttttgtagtagctctagatccaaatcctcac 16404068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 361
Target Start/End: Original strand, 16414626 - 16414976
Alignment:
Q  11 aagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatcc 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| || | || |||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  16414626 aagacgagtagtgaccaaaactgaagcacccttgcctccacaagccaatacatattttaacctctgccagttctcttgttcatcatcccatacatcatcc 16414725  T
Q  111 aatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttcta 210  Q
    |  || |||||| | |||||||||| ||| | ||||  |||| |||| || |  ||||||||||| |  || || || |  |    ||   ||| |||||    
T  16414726 agcactagcaaatacctttttccttttagcaaatctaaaagttttctctgcaacggctctagatctaggtcctcgcaagcatggccagaagccgattcta 16414825  T
Q  211 tgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagataag 310  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  16414826 tgatggcttttgtcattctcttcaaactaaaatcttctgaaacacatacccaaattcttagctcaaagtggttgactaccctttcatgattaaagatcag 16414925  T
Q  311 ttgggaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagac 361  Q
    ||||  ||||| |||||| || |  || |||||||| ||||||||| ||||    
T  16414926 ttggacaagtgctgttttacccaaaccacctagacctacaattggatagac 16414976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Original strand, 15336277 - 15336625
Alignment:
Q  27 aaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatccaatacaagcaaaaatc 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  15336277 aaaatcgaagcacccttgcctccacaagccaatacagatctcaatctttgccaattctctgatttgtcgtcccacacatcatccaacacaagcaaatatc 15336376  T
Q  127 tttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttctatgattgctttagtcat 226  Q
    |||||| |||||| | |||   |||  ||||||| |  ||||||||||| || || ||||| |  |    || | | | ||||||||| ||||| |||||    
T  15336377 tttttctttgtagcaaatccaaaagctttctttgcaacggctctagatctaattcctcacaagcatgaccagatgcagattctatgatggcttttgtcat 15336476  T
Q  227 tcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagataagttgggaaagtgttgtt 326  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||| || | ||| || || ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  15336477 tcttttcaaactgaaatcttctgaaacacatacccaaattcttagatcaaactggttgactacactctcatgattgaagataagttgggtcaatgttgtt 15336576  T
Q  327 ttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaa 375  Q
    || |||| ||| || | ||| ||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  15336577 tttccaattccaccaacaccgacaattggataaacagataaatcctcaa 15336625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 17928231 - 17928400
Alignment:
Q  18 gtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatccaatacaa 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  || |||||||||||||||  || ||||| |  |||||||| ||||    
T  17928231 gtagtgaccaaaatcgaagcaccttttcctccacaagccaatacagacttcaacttcagccaattctcttgttcctcatcccacaaatcatccaaaacaa 17928330  T
Q  118 gcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcaca 187  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17928331 gcaaatatctttttcttcgaagtagctcttgcagtcttctttgtaggggctctagatctaaatcctcaca 17928400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15452916 - 15452724
Alignment:
Q  8 tgcaagacgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtca 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||    | ||| |||||||||||||| | ||| || |||    
T  15452916 tgcaagacgggtagtgaccaaaactgaagaaccctttcctccacaaaccaatagagatttcaaatcataccatttctcttgtttatcattccacacatca 15452817  T
Q  108 tccaatacaagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtt 200  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||    | ||||  | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  15452816 tccaaaattagcaaatatctttttgtacgaagtaccttttgaagttttatttgtagtgtctctagatccaaatccttacaagacttcttagtt 15452724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 268
Target Start/End: Original strand, 17928427 - 17928487
Alignment:
Q  208 ctatgattgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattct 268  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17928427 ctatgataacttttgtcattctcttcagactgaaatcttctgaaacagacacccaaattct 17928487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Original strand, 8187738 - 8188144
Alignment:
Q  15 cgagtagtgaccaaaattgaagcaccctttcctccacaagccaacacagatctcaatctctgccaattctcttgtttatcgtcccagacgtcatccaata 114  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||| || || ||||| |    
T  8187738 cgagtggtgaccaaaactgaagcgccttctctcccacaagccaatacagatttcaacctctgccagtttccttgttcatcatcccacacatcgtccaaaa 8187837  T
Q  115 caagcaaaaatctttttccttgtagtagatcttgaagtcttctttgtagtggctctagatccaaatcttcacatgacttcttagtttccgcttctatgat 214  Q
    | |||||| ||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| || || |||||  || |||  |    || | | | |||||||||    
T  8187838 cgagcaaatatctttttctttgtaatatttctacaagtcttctttgtagtggctcaagttctaaatcagcagatgcatgtccagatgctgattctatgat 8187937  T
Q  215 tgctttagtcattcgcttcaaactaaaatcttctgaaacacacacccacattctggactcaaagtgttggaccaccctttcatgattgaagataagttgg 314  Q
     | | |  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||   ||||||||| | ||| | | | |||||||||||||| ||||||    
T  8187938 ggatcttatcattctcttcaaactgaaatcttcagaaacacatacccaaattcttagctcaaagtggtcgactatcttctcatgattgaagatgagttgg 8188037  T
Q  315 gaaagtgttgttttcccaagtccgcctagacccacaattggacagacacacaaatcctcaagaccagaagcttccctaaccaaaaaatctacaattttat 414  Q
    |  ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||  | || ||||||||| || | ||| | ||| |||| ||||||||    
T  8188038 gtcagtgttgtttttccaagtccacctagaccaactattggatagacagataaattttgaaaaccagaagcatcaccaacaagaaagtctataattttat 8188137  T
Q  415 ccttatc 421  Q
    || ||||    
T  8188138 ccctatc 8188144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University