View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4719-Insertion-1 (Length: 1062)

Name: NF4719-Insertion-1
Description: NF4719
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4719-Insertion-1
NF4719-Insertion-1
[»] chr3 (7 HSPs)
chr3 (8-1039)||(21703892-21704926)
chr3 (8-1039)||(21714593-21715624)
chr3 (73-642)||(21622456-21623023)
chr3 (73-642)||(21644170-21644737)
chr3 (335-516)||(21596735-21596916)
chr3 (37-264)||(21115368-21115595)
chr3 (71-303)||(21122829-21123061)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (39-277)||(23010257-23010495)
chr8 (662-720)||(23009814-23009872)
chr8 (374-498)||(23010039-23010160)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 939; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 939; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1039
Target Start/End: Original strand, 21703892 - 21704926
Alignment:
Q  8 gatttgtggaaaaagtttaatttgacgagtatagggattcgcatagacagtgttaacaagggagcatggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703892 gatttgtggaaaaagtttaatctgacgagtatagggattcgcatagatagtgttaataagggagcatggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaag 21703991  T
Q  108 tatgcacttcaatgaactgtcaaaaaatgattaatctggggctcttatctgaaaatgaatcttggactttgttccaaaagcatgcagatattactgatga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703992 tatgcacttcaatgaactgtcaaaaaattattaatctggggctcttatctgaaaacgaatcttggactttgttccaaaagcatgcagatattactgatga 21704091  T
Q  208 attctctaaatcattgggtggtgtgccacatgaactctgcaataaatgtaaaggactgcctctagcaattgtaactgtggcgtcttccttaaaagggaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704092 attctctaaatcattgggtggtgtgccacatgaactctgcaataaatgtaaaggactgcctctagcaattgtaactgtggcgtcttccttaaaagggaaa 21704191  T
Q  308 cacaaaagtgagtgggatgttgcactatataagttgaggaattcagcggaattcgatgatcacgatgaaggagtgagagatgctttaagttgtcttgaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704192 cacaaaagtgagtgggatgttgcactatataagttgaggaattcagcggaattcgatgatcacgatgaaggagtgagagatgctttaagttgtcttgaac 21704291  T
Q  408 taagctatacatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgatgtgttctatgtttccagaagattacaacatatcaatagaagatttaatcat 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704292 taagctatacatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgatgtgttctatgtttccagaagattacaacatatcaatagaagatttaatcat 21704391  T
Q  508 atatgcaattggactgggtgtgggaggaagacatccactgaagatatcaaggattttgattcaagttgccatagacaaacttgtagaatcttgtttgctg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704392 atatgcaattggactgggtgtgggaggaagacatccactgaagatatcaaggattttgattcaagttgccatagacaaacttgtagaatcttgtttgctg 21704491  T
Q  608 atgcctgctgaagacatgaaatgtgtgaagatgcatgacttggttcgcgaagtggccttatggatagcaaagaggtcagaggatcacaaaattttggtaa 707  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21704492 atgcctgctgaagacatggaatgtgtgaagatgcatgacttggttcgcgaagtggccttatggatagcaaagaggtcagaggatcgcaaaattttggtaa 21704591  T
Q  708 atgttgacaaacctctcaacaccttggcaggggacgatagtatacaaaattattttgcggtatcatcatggtgggaaaatgaaaatccaattattggtcc 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704592 atgttgacaaacctctcaacaccttggcaggggacgatagtatacaaaattattttgcggtatcatcatggtgggaaaatgaaaatccaattattggtcc 21704691  T
Q  808 attgcaagctgcaaaacttcaaatgttgttgctacacataaataccagtatatcac-aagttcctttgtattatcaaatttaacatttgaaagaatagat 906  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21704692 attgcaagctgcaaaagttcaaatgttgttgctacacataaataccagtatatcacaaagttcctttgtattatcaaatttaacatttgaaggaattgat 21704791  T
Q  907 ggactc-aggttttttctctaaacaatgattcctatcatgatgtactactattctcattgcct-catcaatccaatttttaacaaatgttcgaactctgc 1004  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704792 ggactcaaggttttttctttaaccaatgattcctatcatgatgtactattcttctcattgcctccatcagtccaatttttaacaaatgttcgaactctgc 21704891  T
Q  1005 gcttgaatgggttgaagttagtgaacatttctttt 1039  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  21704892 gcttgaatgggttgaagttagatgacatttctttt 21704926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 21715624 - 21714593
Alignment:
Q  8 gatttgtggaaaaagtttaatttgacgagtatagggattcgcatagacagtgttaacaagggagcatggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaag 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21715624 gatttatggaaagagtttaatttgatgaatatagggattcacatagacaatgttaacaagggcgcatggaaaatccttgtaaccactcgtaatcagcaag 21715525  T
Q  108 tatgcacttcaatgaactgtcaaaaaatgattaatctggggctcttatctgaaaatgaatcttggactttgttccaaaagcatgcagatattactgatga 207  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||| | |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |    
T  21715524 tatgcactttaatggactgtcaaaagaatattcacctggcgctcttatctaaagatgaatcctggactttgttccaaaagcatgcaaagattactgacaa 21715425  T
Q  208 attctctaaatcattgggtggtgtgccacatgaactctgcaataaatgtaaaggactgcctctagcaattgtaactgtggcgtcttccttaaaagggaaa 307  Q
     || || || ||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||     
T  21715424 gttttccaagtcaatggatggtgtgccacgagaactctgcgataaatgtaagggactgcccctagctattgtaactatggcgtcttgcttaaaaggaaag 21715325  T
Q  308 cacaaaagtgagtgggatgttgcactatataagttgaggaattcagcggaattcgatgatcacgatgaaggagtgagagatgctttaagttgtcttgaac 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21715324 cataaaagtgagtgggatgttgcactacataagatgaggaattcatcagcatttgatgatcacgatgaaggagtgagaaatgctttgagttgtcttgaac 21715225  T
Q  408 taagctatacatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgatgtgttctatgtttccagaagattacaacatatcaatagaagatttaatcat 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |    
T  21715224 taagctataaatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgttgtgttctatgtttccagaagattgcaacatatcaatcgatgatttaatcct 21715125  T
Q  508 atatgcaattggactgggtgtgggaggaagacatccactgaagatatcaaggattttgattcaagttgccatagacaaacttgtagaatcttgtttgctg 607  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||| |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  21715124 atatgcaataggactaggtgtgggaggaagatctccactgaagttatcaaggagtttggttcaagtcggcataaacaagcttttagaatcatgtttgctg 21715025  T
Q  608 atgcctgctgaagacatgaaatgtgtgaagatgcatgacttggttcgcgaagtggccttatggatagcaaagaggtcagaggatcacaaaattttggtaa 707  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  21715024 atgccggctaaagacatgcaatgcgtgaagatgcatgacttggttcgtgaagtggccatatggatagcaaagaggtcagggaatcaaaaaattttgctaa 21714925  T
Q  708 atgttgacaaacctctcaacaccttggcaggggacgatagtatacaaaattattttgcggtatcatcatggtgggaaaatgaaaatccaattattggtcc 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |    
T  21714924 atgttgacaaacctctcaacaccttggcaggggacgatagtatgcaaaattattttgcggtatcatcatggtggcacaatgaaattccaattattggttc 21714825  T
Q  808 attgcaagctgcaaaacttcaaatgttgttgctacacataaataccagtatatcac-aagttcctttgtattatcaaatttaacatttgaaagaatagat 906  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21714824 attgcaggctgcaaaccttgaaatgttgttgctacacataaataccagtatatcacaaagttcctttgttttatcaaatttaacatttgaaggaatagaa 21714725  T
Q  907 ggactc-aggttttttctctaaacaatgattcctatcatgatgtactactattctcattgcct-catcaatccaatttttaacaaatgttcgaactctgc 1004  Q
    || ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||  |||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  21714724 gggctcaaggtattttctctaaccaatgattccaatagtga---agtactattctcattgcctccatcaatccaaatgttgacaaatgttcgaactctgc 21714628  T
Q  1005 gcttgaatgggttgaagttagtgaacatttctttt 1039  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21714627 gcttgaatgggttgaagttgggtaacatttctttt 21714593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 73 - 642
Target Start/End: Original strand, 21622456 - 21623023
Alignment:
Q  73 atggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaagtatgcacttcaatgaactgtcaaaaaatgattaatctggggctcttatctgaaaatgaatcttgg 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| | ||| |||||| || ||||||| |||    
T  21622456 atggaatatccttgtaaccactcgtaatcagcaagtatgcacttcaatggactgtcaaaagaatattcatctagagcttttatctaaagatgaatcctgg 21622555  T
Q  173 actttgttccaaaagcatgcagatattactgatgaattctctaaatcattgggtggtgtgccacatgaactctgcaataaatgtaaaggactgcctctag 272  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  | || || || ||| ||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  21622556 actttgttccaaaagcatgcaaagattactgacaagttttccaagtcaatggatggtttgccacgagaactctgcgataaatgtaagggactggccctag 21622655  T
Q  273 caattgtaactgtggcgtcttccttaaaagggaaacacaaaagtgagtgggatgttgcactatataagttgaggaattcagcggaattcgatgatcacga 372  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21622656 ctattgtaactatggcgtcttgcttaaaaggaaagcataaaagtgagtgggatgttgcactacataagatgaggaattcatcggcatttgatgatcacga 21622755  T
Q  373 tgaaggagtgagagatgctttaagttgtcttgaactaagctatacatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgatgtgttctatgtttcca 472  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21622756 cgaaggagtgagaaatgctttgagttgtcttgaactaagctataaatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgttgtgttctatatttcca 21622855  T
Q  473 gaagattacaacatatcaatagaagatttaatcatatatgcaattggactgggtgtgggaggaagacatccactgaagatatcaaggattttgattcaag 572  Q
    ||||||| ||||||||| |  || ||||||||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  21622856 gaagattgcaacatatcgaccgatgatttaatcctatatgcaataggactag--gttggaggaagatctccactgaagttatcaaggagtttggttcaag 21622953  T
Q  573 ttgccatagacaaacttgtagaatcttgtttgctgatgcctgctgaagacatgaaatgtgtgaagatgca 642  Q
      | |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  21622954 acggcataaacaagcttttagaatcatgtttgctgatgccggctaaagacatgcaacgtgtgaagatgca 21623023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 73 - 642
Target Start/End: Original strand, 21644170 - 21644737
Alignment:
Q  73 atggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaagtatgcacttcaatgaactgtcaaaaaatgattaatctggggctcttatctgaaaatgaatcttgg 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| | ||| |||||| || ||||||| |||    
T  21644170 atggaatatccttgtaaccactcgtaatcagcaagtatgcacttcaatggactgtcaaaagaatattcatctagagcttttatctaaagatgaatcctgg 21644269  T
Q  173 actttgttccaaaagcatgcagatattactgatgaattctctaaatcattgggtggtgtgccacatgaactctgcaataaatgtaaaggactgcctctag 272  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  | || || || ||| ||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  21644270 actttgttccaaaagcatgcaaagattactgacaagttttccaagtcaatggatggtttgccacgagaactctgcgataaatgtaagggactggccctag 21644369  T
Q  273 caattgtaactgtggcgtcttccttaaaagggaaacacaaaagtgagtgggatgttgcactatataagttgaggaattcagcggaattcgatgatcacga 372  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21644370 ctattgtaactatggcgtcttgcttaaaaggaaagcataaaagtgagtgggatgttgcactacataagatgaggaattcatcggcatttgatgatcacga 21644469  T
Q  373 tgaaggagtgagagatgctttaagttgtcttgaactaagctatacatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgatgtgttctatgtttcca 472  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21644470 cgaaggagtgagaaatgctttgagttgtcttgaactaagctataaatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgttgtgttctatatttcca 21644569  T
Q  473 gaagattacaacatatcaatagaagatttaatcatatatgcaattggactgggtgtgggaggaagacatccactgaagatatcaaggattttgattcaag 572  Q
    ||||||| ||||||||| |  || ||||||||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  21644570 gaagattgcaacatatcgaccgatgatttaatcctatatgcaataggactag--gttggaggaagatctccactgaagttatcaaggagtttggttcaag 21644667  T
Q  573 ttgccatagacaaacttgtagaatcttgtttgctgatgcctgctgaagacatgaaatgtgtgaagatgca 642  Q
      | |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  21644668 acggcataaacaagcttttagaatcatgtttgctgatgccggctaaagacatgcaacgtgtgaagatgca 21644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 335 - 516
Target Start/End: Original strand, 21596735 - 21596916
Alignment:
Q  335 tataagttgaggaattcagcggaattcgatgatcacgatgaaggagtgagagatgctttaagttgtcttgaactaagctatacatatttacaaaacaagg 434  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21596735 tataagatgaggaattcatcggcatttgatgatcacgatgaaggagtgagaaatgctttgagttgtcttgaactaagctataaatatttacaaaacaagg 21596834  T
Q  435 aagcagagttgctctttttgatgtgttctatgtttccagaagattacaacatatcaatagaagatttaatcatatatgcaat 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||    
T  21596835 aagcagagttgctctttttgttgtgttctatgtttccagaagattgcaacatatcgaccgacgatttaatcatatatccaat 21596916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 264
Target Start/End: Original strand, 21115368 - 21115595
Alignment:
Q  37 tatagggattcgcatagacagtgttaacaagggagcatggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaagtatgcacttcaatgaactgtcaaaaaatg 136  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| ||    |||||||  ||||  ||||||||||||||  ||| || || || |||||| |||||||||| | |    
T  21115368 tatagggattctcgtagacaatgttaacgagcacacatggaaggtcctgataaccactcgtaatgagcatgtctgtacatcaatggactgtcaaaagaag 21115467  T
Q  137 attaatctggggctcttatctgaaaatgaatcttggactttgttccaaaagcatgcagatattactgatgaattctctaaatcattgggtggtgtgccac 236  Q
    ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||  ||||   |||  ||| |||| ||| || | ||||| |||||||||||    
T  21115468 attcatttggggctcttgtctgaagatgaatcttggacattattccaaaagtttgcaagaattgatgacgaatactccaagttattggatggtgtgccac 21115567  T
Q  237 atgaactctgcaataaatgtaaaggact 264  Q
      ||| |||||||| | ||||| |||||    
T  21115568 gggaagtctgcaatgagtgtaatggact 21115595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 21122829 - 21123061
Alignment:
Q  71 gcatggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaagtatgcacttcaatgaactgtcaaaaaatgattaatctggggctcttatctgaaaatgaatctt 170  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |  | | || || | || |||||| ||||| || |||||| || |||||||||| ||  || ||||||| |    
T  21122829 gcattgaaaatccttgtaaccacacgtattgagaatgtttgtattttaatgaattgtcacaagatgattcatttggggctcttgtccaaagatgaatcct 21122928  T
Q  171 ggactttgttccaaaagcatgcagatattactgatgaattctctaaatcattgggtggtgtgccacatgaactctgcaataaatgtaaaggactgcctct 270  Q
    |||| || |||||||||| |||||  |||  ||| |||||||||   ||||| | |||||| ||||| ||| ||||| || |||| || ||||| ||  |    
T  21122929 ggacattcttccaaaagcttgcagtaattgatgacgaattctctgtgtcattagatggtgtaccacaagaaatctgctatgaatgcaagggacttccctt 21123028  T
Q  271 agcaattgtaactgtggcgtcttccttaaaagg 303  Q
    ||||||   |||| || | ||||||||||||||    
T  21123029 agcaatcaaaactatgtcttcttccttaaaagg 21123061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23010495 - 23010257
Alignment:
Q  39 tagggattcgcatagacagtgttaacaagggagcatggaaaatccttgtaaccactcgtaatcggcaagtatgcacttcaatgaactgtcaaaaaatgat 138  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||   |   ||| |||||||||| | |||    
T  23010495 tagggattcgcttagacaatgataacaagggtgcatggaagatccttgcaaccactcgtaatcaacatgtatgtgatctgatgcactgtcaaaagaagat 23010396  T
Q  139 taatctggggctcttatctgaaaatgaatcttggactttgttccaaaagcatgcagatattactgatgaattctctaaatcattgggtggtgtgccacat 238  Q
    | |||| || ||||||  |||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||  | ||| | || ||||| | ||||||||||||     
T  23010395 tcatctaggactcttagatgaagatgagtcttggtctttgttccgaaaacatgcacatattgatgaaaatttccccaagtcattagatggtgtgccacaa 23010296  T
Q  239 gaactctgcaataaatgtaaaggactgcctctagcaatt 277  Q
     || | ||||   ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23010295 aaagtatgcatggaatgtaaaggactacctatagcaatt 23010257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 662 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 23009872 - 23009814
Alignment:
Q  662 gccttatggatagcaaagaggtcagaggatcacaaaattttggtaaatgttgacaaacc 720  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23009872 gccttatggattgcaaagagatcagacaataacaaaattgtggtaaatgttgacaaacc 23009814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23010160 - 23010039
Alignment:
Q  374 gaaggagtgagagatgctttaagttgtcttgaactaagctatacatatttacaaaacaaggaagcagagttgctctttttgatgtgttctatgtttccag 473  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  |||||| |||  | | ||| |||| || ||||||||||||||||| |    
T  23010160 gaaggagtgggagttgctttaagttgtcttaaactaagctatgattatttatcaaacaaagaa--aaacttg-tcttcttaatgtgttctatgtttcctg 23010064  T
Q  474 aagattacaacatatcaatagaaga 498  Q
    ||||||| || || ||| |||||||    
T  23010063 aagattataaaatctcagtagaaga 23010039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University