View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4724-Insertion-4 (Length: 755)

Name: NF4724-Insertion-4
Description: NF4724
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4724-Insertion-4
NF4724-Insertion-4
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (484-753)||(40735171-40735440)
chr7 (130-302)||(3434563-3434735)
chr7 (7-137)||(40735573-40735703)
chr7 (302-453)||(40735440-40735590)
chr7 (130-301)||(36361843-36362012)
chr7 (130-301)||(36362027-36362196)
chr7 (130-301)||(8080301-8080482)
chr7 (130-301)||(19329843-19330024)
chr7 (130-303)||(38267041-38267224)
chr7 (130-301)||(4999432-4999613)
chr7 (130-301)||(7389390-7389570)
chr7 (130-301)||(38837218-38837399)
chr7 (130-292)||(19436114-19436286)
chr7 (130-301)||(35137534-35137715)
chr7 (130-301)||(32951411-32951592)
chr7 (130-301)||(40957708-40957889)
chr7 (126-279)||(3783992-3784155)
chr7 (129-297)||(35522876-35523054)
chr7 (134-297)||(21234406-21234579)
chr7 (134-297)||(46374746-46374897)
chr7 (132-272)||(3694370-3694520)
chr7 (134-297)||(8238217-8238391)
chr7 (130-301)||(11044189-11044360)
chr7 (134-297)||(46033723-46033896)
chr7 (134-297)||(38044202-38044375)
chr7 (134-297)||(22343366-22343539)
chr7 (134-297)||(26296649-26296822)
chr7 (134-297)||(41915746-41915919)
chr7 (134-233)||(18207185-18207283)
chr7 (170-297)||(16374746-16374883)
chr7 (134-239)||(36208178-36208283)
chr7 (233-289)||(31735991-31736047)
chr7 (134-233)||(39255920-39256018)
chr7 (130-239)||(10343553-10343662)
chr7 (233-297)||(41423796-41423860)
chr7 (233-285)||(27744243-27744295)
chr7 (134-271)||(32564374-32564521)
chr7 (134-233)||(40846109-40846208)
chr7 (134-297)||(7727911-7728084)
chr7 (229-297)||(2318163-2318231)
chr7 (134-239)||(31735889-31735987)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (130-301)||(12831048-12831229)
chr8 (130-301)||(504039-504220)
chr8 (130-301)||(14547923-14548104)
chr8 (130-301)||(15197334-15197515)
chr8 (130-301)||(23122515-23122696)
chr8 (130-301)||(34012214-34012395)
chr8 (130-297)||(40423865-40424042)
chr8 (130-302)||(1179857-1180039)
chr8 (130-302)||(44507005-44507186)
chr8 (134-297)||(10284553-10284726)
chr8 (129-297)||(5957830-5958008)
chr8 (130-297)||(37038480-37038657)
chr8 (148-297)||(8841354-8841513)
chr8 (129-303)||(9122195-9122369)
chr8 (134-297)||(43414503-43414676)
chr8 (134-289)||(15048111-15048276)
chr8 (134-239)||(10621077-10621182)
chr8 (233-301)||(42710212-42710280)
chr8 (134-298)||(24307714-24307888)
chr8 (134-297)||(16056323-16056496)
chr8 (134-297)||(34307221-34307394)
chr8 (130-297)||(4854785-4854962)
chr8 (134-263)||(16383382-16383521)
chr8 (233-297)||(42354510-42354574)
chr8 (134-298)||(30479395-30479569)
chr8 (130-233)||(42221516-42221619)
chr8 (233-297)||(32707925-32707989)
chr8 (134-289)||(14055522-14055687)
chr8 (134-233)||(17443830-17443929)
chr8 (130-238)||(20074933-20075033)
chr8 (134-297)||(32032730-32032902)
chr8 (134-239)||(15258919-15259024)
chr8 (134-192)||(24307634-24307692)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (130-302)||(5574417-5574587)
chr2 (130-302)||(13438344-13438526)
chr2 (130-301)||(10249300-10249481)
chr2 (132-303)||(28863458-28863639)
chr2 (130-302)||(17473021-17473203)
chr2 (130-301)||(7465653-7465834)
chr2 (130-302)||(32505565-32505747)
chr2 (132-301)||(19930738-19930917)
chr2 (130-299)||(33436020-33436199)
chr2 (130-301)||(9058481-9058662)
chr2 (130-301)||(40701479-40701660)
chr2 (130-301)||(27864705-27864873)
chr2 (130-302)||(38882728-38882912)
chr2 (130-301)||(28381573-28381754)
chr2 (130-301)||(30915464-30915645)
chr2 (130-301)||(4060686-4060867)
chr2 (130-297)||(20700816-20700993)
chr2 (134-297)||(40613824-40613997)
chr2 (134-292)||(38273070-38273237)
chr2 (134-292)||(42257198-42257366)
chr2 (134-285)||(2533129-2533289)
chr2 (134-297)||(36168841-36169014)
chr2 (134-297)||(43490126-43490299)
chr2 (134-297)||(38732359-38732532)
chr2 (134-238)||(26891495-26891599)
chr2 (145-297)||(13365369-13365531)
chr2 (147-297)||(2997409-2997569)
chr2 (134-233)||(45097731-45097830)
chr2 (135-239)||(3439985-3440089)
chr2 (125-233)||(17820000-17820108)
chr2 (130-233)||(33436212-33436315)
chr2 (129-233)||(41575137-41575242)
chr2 (233-297)||(41758701-41758765)
chr2 (233-297)||(44152041-44152105)
chr2 (172-239)||(3737986-3738053)
chr2 (233-297)||(17823902-17823966)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (130-303)||(53982012-53982195)
chr3 (133-301)||(48587019-48587187)
chr3 (130-301)||(33644201-33644382)
chr3 (129-302)||(31456689-31456872)
chr3 (130-301)||(11095285-11095452)
chr3 (130-301)||(49607415-49607596)
chr3 (134-301)||(52629305-52629482)
chr3 (130-301)||(54868813-54868994)
chr3 (130-300)||(27714822-27714990)
chr3 (130-297)||(8076394-8076571)
chr3 (130-301)||(17470406-17470587)
chr3 (130-300)||(36707347-36707523)
chr3 (134-297)||(33118772-33118946)
chr3 (134-297)||(11347844-11348017)
chr3 (134-297)||(26141452-26141627)
chr3 (130-299)||(9563000-9563179)
chr3 (133-297)||(30801655-30801829)
chr3 (134-297)||(20764837-20765010)
chr3 (134-297)||(51419282-51419455)
chr3 (130-297)||(35536627-35536804)
chr3 (130-297)||(14623761-14623938)
chr3 (134-297)||(41189686-41189859)
chr3 (134-239)||(26754700-26754805)
chr3 (134-239)||(11907376-11907481)
chr3 (130-297)||(8956763-8956940)
chr3 (130-289)||(13897985-13898154)
chr3 (134-297)||(47531870-47532043)
chr3 (130-239)||(24699944-24700053)
chr3 (134-239)||(48375696-48375801)
chr3 (134-297)||(45058475-45058647)
chr3 (130-297)||(35965704-35965873)
chr3 (165-271)||(36331277-36331393)
chr3 (136-297)||(35093592-35093763)
chr3 (233-297)||(42823225-42823289)
chr3 (170-271)||(1758405-1758515)
chr3 (130-233)||(41080710-41080811)
chr3 (132-233)||(25407143-25407245)
chr3 (137-239)||(39670019-39670121)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (130-301)||(32869679-32869860)
chr6 (132-301)||(22880576-22880755)
chr6 (130-301)||(17598555-17598736)
chr6 (130-301)||(11427617-11427800)
chr6 (130-301)||(29857828-29858009)
chr6 (134-297)||(31976253-31976426)
chr6 (130-301)||(6209384-6209564)
chr6 (132-301)||(23128044-23128224)
chr6 (130-298)||(15832578-15832756)
chr6 (130-239)||(31109390-31109499)
chr6 (134-297)||(31110683-31110854)
chr6 (134-297)||(15989964-15990137)
chr6 (134-297)||(30341282-30341455)
chr6 (130-297)||(31952952-31953129)
chr6 (133-297)||(28536410-28536582)
chr6 (129-300)||(946376-946557)
chr6 (134-297)||(15507946-15508119)
chr6 (134-297)||(4231553-4231726)
chr6 (134-233)||(9379708-9379807)
chr6 (255-297)||(22422001-22422043)
chr6 (173-239)||(30870058-30870124)
chr6 (130-233)||(12732483-12732586)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (130-301)||(41236348-41236529)
chr4 (130-303)||(6034045-6034228)
chr4 (130-303)||(48182965-48183148)
chr4 (130-301)||(11511381-11511561)
chr4 (130-301)||(42044285-42044466)
chr4 (130-299)||(54473453-54473632)
chr4 (130-278)||(480388-480546)
chr4 (134-297)||(31910197-31910370)
chr4 (130-297)||(50052350-50052527)
chr4 (130-301)||(24995025-24995206)
chr4 (130-297)||(29239887-29240064)
chr4 (130-301)||(23608236-23608417)
chr4 (130-233)||(3481655-3481758)
chr4 (130-239)||(29234235-29234344)
chr4 (167-297)||(41823920-41824060)
chr4 (130-297)||(50526093-50526270)
chr4 (134-303)||(53352490-53352660)
chr4 (134-297)||(19670638-19670811)
chr4 (134-289)||(40574784-40574949)
chr4 (134-297)||(55475196-55475369)
chr4 (130-297)||(29977886-29978063)
chr4 (134-297)||(47986213-47986385)
chr4 (134-297)||(50813814-50813987)
chr4 (147-297)||(17983665-17983825)
chr4 (134-233)||(32766963-32767062)
chr4 (134-297)||(29547881-29548054)
chr4 (137-230)||(28480267-28480360)
chr4 (137-230)||(28481142-28481235)
chr4 (137-230)||(28482017-28482110)
chr4 (134-239)||(48647716-48647821)
chr4 (134-194)||(55079749-55079809)
chr4 (137-292)||(29589667-29589831)
chr4 (233-297)||(18924417-18924481)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (130-302)||(48716199-48716381)
chr1 (130-301)||(27564653-27564834)
chr1 (130-301)||(9474794-9474975)
chr1 (130-301)||(2581916-2582097)
chr1 (130-301)||(47452238-47452419)
chr1 (130-303)||(41758806-41758989)
chr1 (130-301)||(3000320-3000501)
chr1 (134-297)||(32813252-32813425)
chr1 (130-297)||(50630459-50630636)
chr1 (130-287)||(38632253-38632420)
chr1 (130-301)||(43133-43314)
chr1 (130-301)||(38595155-38595336)
chr1 (130-302)||(8346304-8346487)
chr1 (130-300)||(37649199-37649379)
chr1 (132-301)||(26274435-26274611)
chr1 (130-297)||(51898605-51898782)
chr1 (132-242)||(44548363-44548473)
chr1 (136-297)||(26440741-26440902)
chr1 (149-297)||(45044482-45044640)
chr1 (134-297)||(49811449-49811622)
chr1 (125-297)||(50590922-50591104)
chr1 (130-289)||(11152308-11152476)
chr1 (157-236)||(13414789-13414868)
chr1 (134-297)||(5958922-5959095)
chr1 (134-289)||(37926368-37926533)
chr1 (130-229)||(3302533-3302632)
chr1 (134-297)||(41608415-41608588)
chr1 (134-297)||(47748448-47748620)
chr1 (130-239)||(23597081-23597190)
chr1 (129-297)||(44453979-44454161)
chr1 (172-237)||(48489343-48489408)
chr1 (236-278)||(9501601-9501643)
chr1 (264-301)||(44548303-44548340)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (130-301)||(2740275-2740456)
chr5 (132-301)||(18520802-18520981)
chr5 (130-289)||(36732872-36733041)
chr5 (130-303)||(35785200-35785383)
chr5 (130-301)||(14831815-14831996)
chr5 (130-301)||(33149556-33149737)
chr5 (130-293)||(13811653-13811826)
chr5 (130-301)||(40145408-40145589)
chr5 (181-303)||(31132396-31132518)
chr5 (134-297)||(15409532-15409705)
chr5 (134-297)||(35943814-35943987)
chr5 (134-297)||(31008993-31009166)
chr5 (130-236)||(42414295-42414401)
chr5 (134-239)||(28177780-28177885)
chr5 (134-297)||(6679703-6679876)
chr5 (134-289)||(26720521-26720686)
chr5 (134-289)||(26990270-26990435)
chr5 (129-297)||(36875538-36875703)
chr5 (134-297)||(3921187-3921360)
chr5 (134-297)||(2252090-2252263)
chr5 (125-233)||(6259997-6260105)
chr5 (130-297)||(9603814-9603991)
chr5 (130-297)||(33825246-33825423)
chr5 (130-220)||(41470425-41470515)
chr5 (134-297)||(39688819-39688992)
chr5 (130-239)||(20073506-20073615)
chr5 (255-301)||(16115250-16115296)
chr5 (173-239)||(21370048-21370114)
chr5 (233-297)||(2177478-2177542)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (130-301)||(4030-4211)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (134-301)||(10027-10204)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (130-297)||(851-1028)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (130-297)||(851-1028)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (125-297)||(8785-8967)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (145-297)||(152514-152676)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (172-238)||(17097-17163)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 262; Significance: 1e-145; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 484 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40735440 - 40735171
Alignment:
Q  484 tggtaactcaagggatgaaactaccaaaatattgctctatcccttggaagagttatacattttatttttggatctgattctactaaagtaatagattcat 583  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735440 tggtaactcaagggatgaagctaccaaaatattgctctatcccttggaagagttatacattttatttttggatctgattctactaaagtaatagattcat 40735341  T
Q  584 tttacatgaaaatatgagaagttatagcaaggattagaaaatcaacccttgaaatcatgactatatgtatgcatataataataagttaagttgtcttgaa 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735340 tttacatgaaaatatgagaagttatagcaaggattagaaaatcaaccattgaaatcatgactatatgtatgcatataataataagttaagttgtcttgaa 40735241  T
Q  684 tctcaattgtcattattcttaactaattgctctaagtcctcacttttcccttgtaggactttatgctttt 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735240 tctcaattgtcattattcttaactaattgctctaagtcctcacttttcccttgtaggactttatgctttt 40735171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Original strand, 3434563 - 3434735
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3434563 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 3434662  T
Q  230 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3434663 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggctgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactca 3434735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40735703 - 40735573
Alignment:
Q  7 actatcaaagctggttttgattagaaaaagttcatcttgaaaccgaaatctgaagccaataaagattgagttacaacaatctgatttcataagtttgaag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735703 actatcaaagctggttttgattagaaaaagttcatcttgaaaccgaaatctgaagccaataaagattgagttacaacaatctgatttcataagtttgaag 40735604  T
Q  107 ggacataacatttatcttatttaagtaatga 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40735603 ggacataacatttatcttattttaggaatga 40735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 302 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 40735590 - 40735440
Alignment:
Q  302 atcttattttaggaatgaatatagtgaacagtctactattagaaagtctgatagtaaggaaagggtgggaaattgcaaaaattaacactatatttaggcc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735590 atcttattttaggaatgaatatagtgaacagtctactattacaaagtctgatagtaaggaaagggtgggaaattgcaaaaattaacactatatttaggcc 40735491  T
Q  402 aaatatgtagannnnnnnncttatatttgagaccggagagagtacaccagct 453  Q
    |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735490 aaatatgtaga-tttttgtcttatatttgagaccggagagagtacaccagct 40735440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36362012 - 36361843
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36362012 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttct 36361913  T
Q  230 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36361912 ctttt--ctcttcctaatacatggaatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 36361843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 36362027 - 36362196
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36362027 agtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttct 36362126  T
Q  230 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36362127 cttt--tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 36362196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8080482 - 8080301
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8080482 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 8080383  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8080382 cttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 8080301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 19329843 - 19330024
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19329843 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttct 19329942  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19329943 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 19330024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Original strand, 38267041 - 38267224
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38267041 agtaatgatacatagacacccttatgtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 38267140  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    |||          |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38267141 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacgaaggtgtatggaaataaatgatatctatgtatcattactcat 38267224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4999613 - 4999432
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4999613 agtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgatacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttct 4999514  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4999513 cttttatctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcattactc 4999432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 7389390 - 7389570
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389390 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 7389489  T
Q  230 cttt----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||          |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7389490 cttttctctcctactctctcttcctaatacatggggtgtac-agggtgtatgggaataaaggatgtctatgtatcattactc 7389570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 38837218 - 38837399
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38837218 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacccttgtacacctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 38837317  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38837318 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcattactc 38837399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19436286 - 19436114
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19436286 agtaatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcataagcacactttct 19436187  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgta 292  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19436186 cttttctcttctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgta 19436114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 35137534 - 35137715
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35137534 agtaatgataaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttct 35137633  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  35137634 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaacaaatggtatctatggatcattactc 35137715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32951592 - 32951411
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32951592 agtaatgatacatagacactcttagatgacaatacatcctttaacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 32951493  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32951492 cttttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaggggtgtctatgtatcattactc 32951411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 40957708 - 40957889
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  40957708 agtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacactctttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgtacaagcacactttct 40957807  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  40957808 cttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataatgggtgtctatgtatcattactc 40957889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 279
Target Start/End: Original strand, 3783992 - 3784155
Alignment:
Q  126 tttaagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacact 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3783992 tttaaataatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacact 3784091  T
Q  226 ttctctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 279  Q
    |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  3784092 ttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagaatgtatgtgaataaa 3784155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Original strand, 35522876 - 35523054
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 228  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| | | ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  35522876 aagttatgatacatagacatccttaagtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggatcccgcacaagcacactttc 35522975  T
Q  229 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522976 tcttttctctcttcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtttatgtaacatt 35523054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 21234406 - 21234579
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct---- 229  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||||        
T  21234406 atgatacatagacatccttaggtgacaatacaccctttgacactcacacaaaaatttgacacgtagccacatgtaccccgcacaagcacattttctctta 21234505  T
Q  230 ------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
          |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  21234506 cctctcctttcctctcttcctaatgtatggggtgtacaatggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacatt 21234579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46374897 - 46374746
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||              
T  46374897 atgatacatagacatccttaggtggcaacacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcaca---------- 46374808  T
Q  234 tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46374807 --tctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacatt 46374746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 272
Target Start/End: Original strand, 3694370 - 3694520
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 231  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3694370 taatgatatatacacacccttaggtgacaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggatcccgcacaagcacactttctct 3694469  T
Q  232 tttct----------ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgg 272  Q
    |||||          ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3694470 tttctctcctcttctctcttcccaatgcatggggtgtacaagagtgtatgg 3694520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 8238217 - 8238391
Alignment:
Q  134 atgatacatagacaccct-taggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt 232  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8238217 atgatacataaacaccctgtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcatatggaccccgcacaagtacactttctctt 8238316  T
Q  233 ----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||| ||||    
T  8238317 tcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggcgtctatgtaacatt 8238391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 11044189 - 11044360
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11044189 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacaccc----------ctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagtacactttct 11044278  T
Q  230 cttt----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||          ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11044279 ctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagagtgtctatgtatcattactc 11044360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46033896 - 46033723
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| | |||||||||    
T  46033896 atgatacatagatattcttaggtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtggtcacatgaactccgcacaagcatattttctcttt 46033797  T
Q  234 tctctc----------ttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||          ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46033796 tctctcctcttctctattcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 46033723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 38044202 - 38044375
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38044202 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctgacatgtagccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 38044301  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  38044302 cttcttctcttttctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 38044375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 22343366 - 22343539
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  |   ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22343366 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 22343465  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  22343466 cttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 22343539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 26296649 - 26296822
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| || | | ||  |||||||||||||||| || ||||||||     
T  26296649 atgatacatagacatccttaggtgacaatataccctttaacatccacataaaaatctgatacgtggccatatggaccccgcacaagcgcattttctcttt 26296748  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  26296749 tctctcctcttctctcttcttaatgtatgaggtgtacaagggtgtatggaaatatatggtgtctacgtaacatt 26296822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 41915746 - 41915919
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  41915746 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacctacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 41915845  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  41915846 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 41915919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Original strand, 18207185 - 18207283
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18207185 atgatacatagacaaccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctaacacgt-ggcacgtgaaccccacacaagcacactttctcttt 18207283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16374883 - 16374746
Alignment:
Q  170 ttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt----------tctctcttcctaatgcatggggtgta 259  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||          ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16374883 ttgacatccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggatctcacacaagcacacattctctttcatctctttttctctcttcctaatgtatggagtgta 16374784  T
Q  260 caagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  16374783 caaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 16374746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 36208178 - 36208283
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36208178 atgatacatagacacccttaggtggtaatacattcattgacacccacacaaaaagctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttctcttt 36208277  T
Q  234 tctctc 239  Q
     |||||    
T  36208278 cctctc 36208283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 289
Target Start/End: Original strand, 31735991 - 31736047
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31735991 ttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtatctat 31736047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39256018 - 39255920
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  39256018 atgatacatagacaaccttaggtggcaatacaccacttgatacccatacaaaaatctgacacgt-ggcacgtggactccacacaagaacactttctcttt 39255920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10343662 - 10343553
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||| | ||| | |||||||||||    
T  10343662 agtaatgatacatagacacccttaggtggaaatacacatcttgacacccacacaaaaatctgacacatgtttccgtggactctgcagacgcacactttct 10343563  T
Q  230 cttttctctc 239  Q
    |||| |||||    
T  10343562 ctttcctctc 10343553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Original strand, 41423796 - 41423860
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  41423796 ttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacatt 41423860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27744295 - 27744243
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgt 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27744295 ttctctcttcctagtgcatgggatgtacaaggatatatgggaataaatggtgt 27744243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32564521 - 32564374
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| |||  |||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32564521 atgatacataaacattcttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggctatatggaccccgcacaaatacactttctcttt 32564422  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatg 271  Q
              |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32564421 cttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatg 32564374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40846208 - 40846109
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||  |||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40846208 atgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctaacatgtagttatatggaccccgcacaaatacactttctcttt 40846109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 7727911 - 7728084
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||| |||  ||||||  || | ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  7727911 atgatacataaacacccttaggtggtaatacacctcttgacattcacataaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttctgttt 7728010  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  7728011 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 7728084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2318231 - 2318163
Alignment:
Q  229 tcttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  2318231 tcttctctctctctctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatggaaataaagtgtgtctatgtaacatt 2318163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 31735889 - 31735987
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| || |||| ||||||| |||||       ||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31735889 atgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttaacacccacacaaa-------cacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttctcttt 31735981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 12831048 - 12831229
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12831048 agtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 12831147  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12831148 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtatcattactc 12831229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 504220 - 504039
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  504220 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacattct 504121  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  504120 cttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 504039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 14547923 - 14548104
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14547923 agtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 14548022  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14548023 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 14548104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 15197334 - 15197515
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15197334 agtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 15197433  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15197434 cttttctctcctcttttctcttccaaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaagtgtctatgtatcattactc 15197515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23122696 - 23122515
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23122696 agtaatgatacatagacacccttaagtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttct 23122597  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23122596 cttttctctcctgttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 23122515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34012395 - 34012214
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34012395 agtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 34012296  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34012295 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 34012214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40424042 - 40423865
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40424042 agtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttct 40423943  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||          |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40423942 cttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 40423865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1180039 - 1179857
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1180039 agtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggattccgcacaagcacactttct 1179940  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  1179939 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatatatgggaataaaggatgtctatctatcattactca 1179857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44507186 - 44507005
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44507186 agtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcatactttct 44507087  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44507086 cttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaat-atgtctatgtatcattactca 44507005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10284726 - 10284553
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10284726 atgatacatagacacccttaagtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 10284627  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  10284626 cctttcatcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaggttgtataagaataaaaggtgtctatgtaacatt 10284553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Original strand, 5957830 - 5958008
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 228  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5957830 aagtaatgatacatagacattcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaatcacactttc 5957929  T
Q  229 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  5957930 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacatt 5958008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 37038480 - 37038657
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37038480 agtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 37038579  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||    
T  37038580 atttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacatt 37038657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8841513 - 8841354
Alignment:
Q  148 cccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt----------ttctc 237  Q
    |||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||    
T  8841513 cccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttcctctcctcttctc 8841414  T
Q  238 tcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8841413 ttttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 8841354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 303
Target Start/End: Original strand, 9122195 - 9122369
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9122195 aagtaatgatacatagacacccttaggtggcaata----------cacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 9122284  T
Q  229 tcttttct----------ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  9122285 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagaatgtctatgtatcattactcat 9122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43414676 - 43414503
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43414676 atgatacatagacatccttagatggcaacacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtggtcacatggatcccgcacaagcacactttctcttt 43414577  T
Q  234 tc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  43414576 tctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggcaataaagggtgtctatgtaacatt 43414503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15048276 - 15048111
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15048276 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactttctcttt 15048178  T
Q  233 ----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
              |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15048177 ttatctcctcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagggtgtatcggaataaagggtgtctat 15048111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10621182 - 10621077
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10621182 atgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatcgatcccgcacaagcacactttctcttt 10621083  T
Q  234 tctctc 239  Q
    ||||||    
T  10621082 tctctc 10621077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42710280 - 42710212
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42710280 ttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctgtgtatcattactc 42710212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24307888 - 24307714
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |  | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24307888 atgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 24307789  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatta 298  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||    
T  24307788 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatta 24307714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16056496 - 16056323
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16056496 atgatacataaacatccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 16056397  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  16056396 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 16056323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 34307221 - 34307394
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  || |||||||||||| ||||||||||||     
T  34307221 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggacatatgaaccccgcacaagtacactttctcttt 34307320  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  34307321 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 34307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4854962 - 4854785
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||| | | |||||||||| |  | | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4854962 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacataaaaatctgatatgtggccacatggaccctgcacaagcacactttct 4854863  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||          |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  4854862 cttttctctcctcttctctcttactaatgtatgggatgtacaagggtatatgagaataaagagtgtctatgtaacatt 4854785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Original strand, 16383382 - 16383521
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16383382 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 16383481  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaag 263  Q
             ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16383482 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaag 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42354574 - 42354510
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42354574 ttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 42354510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30479569 - 30479395
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  | |  |  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30479569 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacataaaaatctgacatgtggctatatggacctcgcacaagtacactttctcttt 30479470  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatta 298  Q
              |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||    
T  30479469 cttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatta 30479395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 42221516 - 42221619
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  42221516 agtaatgatacatatacatccttaggtgacaatacattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttct 42221615  T
Q  230 cttt 233  Q
    ||||    
T  42221616 cttt 42221619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32707989 - 32707925
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  32707989 ttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 32707925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14055687 - 14055522
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggacccc-gcacaagcacactttctctt 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  14055687 atgatacattgacacccttaggtgacaatacactccttgacatccacacaaaaatcttacatgtagtcacgtggacccctacacaagc-cactttttctt 14055589  T
Q  233 ----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
              |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14055588 tcctctgatcttctctcttcttaatgaatgaggtatacaaaggtgtatgagaataaatagtgtctat 14055522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Original strand, 17443830 - 17443929
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   || |||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  17443830 atgatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaagacactttctcttt 17443929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20075033 - 20074933
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||| | |||||| |||        ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20075033 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtga--------cacgtggaccctgcacaagcacactttct 20074942  T
Q  230 cttttctct 238  Q
    |||| ||||    
T  20074941 ctttcctct 20074933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 32032730 - 32032902
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||  | | ||  |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  32032730 atgatacataaacacccttaggtggcaatacatcctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcctgcacaagtacactttctcttt 32032828  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  32032829 ctccttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 32032902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15259024 - 15258919
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||| || |||||  | ||||| | || | |||| ||| | ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15259024 atgatacatagatactcttagatggcaatacatccctggacatccacataaaaatctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttctcttt 15258925  T
Q  234 tctctc 239  Q
     |||||    
T  15258924 cctctc 15258919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 24307634 - 24307692
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctga 192  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  24307634 atgatacataaacacccttaggtggcaatacatccattgacacccacacaaaaatctga 24307692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5574587 - 5574417
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5574587 agtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 5574488  T
Q  230 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5574487 ctttt--ctcttcctaatgcatggcgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactca 5574417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Original strand, 13438344 - 13438526
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13438344 agtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 13438443  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13438444 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactca 13438526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10249481 - 10249300
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10249481 agtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 10249382  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10249381 cttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 10249300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 303
Target Start/End: Original strand, 28863458 - 28863639
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28863458 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 28863557  T
Q  232 t----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    |          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28863558 tttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactcat 28863639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Original strand, 17473021 - 17473203
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17473021 agtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 17473120  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    |||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17473121 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactca 17473203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7465834 - 7465653
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7465834 agtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttct 7465735  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7465734 cttttatctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 7465653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32505747 - 32505565
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32505747 agtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 32505648  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
              || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32505647 attttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcattactca 32505565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19930917 - 19930738
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19930917 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaaacacactttctct 19930818  T
Q  232 tttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19930817 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattactc 19930738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33436199 - 33436020
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33436199 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 33436100  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattac 299  Q
    |||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33436099 ctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgcatcattac 33436020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 9058481 - 9058662
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9058481 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttct 9058580  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  9058581 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtatttatatatcattactc 9058662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 40701479 - 40701660
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40701479 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttct 40701578  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40701579 cttttctctcatcttctctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcattactc 40701660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 27864705 - 27864873
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27864705 agtaatgatacatagacacccttatgtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcaaaagcacactttct 27864804  T
Q  230 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27864805 ctt---tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtcaatgtatcattactc 27864873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38882912 - 38882728
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtgga---ccccgcacaagcacactt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  38882912 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaata-accctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccccccgcacaagcgcactt 38882814  T
Q  227 tctcttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38882813 tctcttttctcttatcttatctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtctctatgtatcattactca 38882728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28381754 - 28381573
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28381754 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacctttcgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggactccgcacaagcacactttct 28381655  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28381654 cttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 28381573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 30915464 - 30915645
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30915464 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacccccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttct 30915563  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  30915564 cttttctctcatcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcattactc 30915645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 4060686 - 4060867
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4060686 agtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttct 4060785  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
     ||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  4060786 tttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaagatgtttatgtatcattactc 4060867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 20700816 - 20700993
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20700816 agtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccctttgactcctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttct 20700915  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20700916 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacatt 20700993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40613997 - 40613824
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40613997 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttctcttt 40613898  T
Q  234 tctc----------tcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40613897 tctctcctattctttcttcataatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacatt 40613824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38273237 - 38273070
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    ||||||||||||||  |||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38273237 atgatacatagacattcttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcactagcacactttctcttt 38273138  T
Q  234 tc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgta 292  Q
    ||          ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38273137 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa-gatgtatgagaataaatggtgtttatgta 38273070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 292
Target Start/End: Original strand, 42257198 - 42257366
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| | ||||| | ||||| | | ||||||||||| | ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42257198 atgatacatagacatctttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttctcttt 42257297  T
Q  234 tctc----------tcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgta 292  Q
    ||||          ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  42257298 tctctcctcttctttcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatagaaataaagggtgtctatgta 42257366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 285
Target Start/End: Original strand, 2533129 - 2533289
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||| | | ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||     
T  2533129 atgatacatagacatccttaagtggcaatacatcctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatagaccccgcacaagcacactttttcttt 2533227  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgt 285  Q
             ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2533228 tatctcctcttctctcttcccaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 2533289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 36168841 - 36169014
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||| || |||| |||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  36168841 atgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaactcccacacaaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcatactttctcttt 36168940  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  36168941 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacatt 36169014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 43490126 - 43490299
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  43490126 atgatacataaacacccttaggtgacaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttatcttt 43490225  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  43490226 cttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 43490299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 38732359 - 38732532
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38732359 atgatacataaacacccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 38732458  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  38732459 cttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 38732532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26891599 - 26891495
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  26891599 atgatacatagccacccttaggtggcaatacacccctagacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggacctcgaacaagcacattttctcttt 26891500  T
Q  234 tctct 238  Q
     ||||    
T  26891499 cctct 26891495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 297
Target Start/End: Original strand, 13365369 - 13365531
Alignment:
Q  145 acacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt----------t 234  Q
    ||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |   ||  ||||||||||||||| |||||||||||||          |    
T  13365369 acacccttagatggcaatataccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctctt 13365468  T
Q  235 ctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  13365469 ctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgaatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 13365531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2997569 - 2997409
Alignment:
Q  147 acccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt----------ttct 236  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||          ||||    
T  2997569 acccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttct 2997470  T
Q  237 ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||||    
T  2997469 ctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatt 2997409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45097830 - 45097731
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45097830 atgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 45097731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 239
Target Start/End: Original strand, 3439985 - 3440089
Alignment:
Q  135 tgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttt 234  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| || | | |||||||| |||||||||| |||  |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3439985 tgatacgtagacacccttaggtggcaatacactcctggacacccacacaaaaatctaacatgtgattacgtggaccccgcacaagcacattttctctttc 3440084  T
Q  235 ctctc 239  Q
    |||||    
T  3440085 ctctc 3440089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17820108 - 17820000
Alignment:
Q  125 atttaagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacac 224  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |  |||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||     
T  17820108 atttgagttatgatacatagacaactataggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggaccccacacaaacacat 17820009  T
Q  225 tttctcttt 233  Q
    |||||||||    
T  17820008 tttctcttt 17820000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 33436212 - 33436315
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |   || ||||||   |||||||||||||||||    
T  33436212 agtaatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctgacacgtgaccatgtggactttgcacaagcacactttct 33436311  T
Q  230 cttt 233  Q
    ||||    
T  33436312 cttt 33436315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Original strand, 41575137 - 41575242
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggacccc-gcacaagcacacttt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |  |||| |||||||||||  || |||||||| |||||  | |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  41575137 aagtaatgatacatagacatccttagatggtaatacaccctttgacattcacacaaaaatttgacatgtggtcatgtggacccctacacaagcacacttt 41575236  T
Q  228 ctcttt 233  Q
    ||||||    
T  41575237 ctcttt 41575242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Original strand, 41758701 - 41758765
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  41758701 ttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacatt 41758765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Original strand, 44152041 - 44152105
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  44152041 ttctctcttcctaatgcatgagatatacaagggtgtatgcgaataaaaggtgtttatgtaacatt 44152105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 239
Target Start/End: Original strand, 3737986 - 3738053
Alignment:
Q  172 gacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctc 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  3737986 gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtggaccccgcacaagcacattttctttttcctctc 3738053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Original strand, 17823902 - 17823966
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||    
T  17823902 ttctctcttccaaatatatggggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtctatgtaacatt 17823966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Original strand, 53982012 - 53982195
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53982012 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 53982111  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53982112 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggttgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactcat 53982195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 48587187 - 48587019
Alignment:
Q  133 aatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48587187 aatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagtacactttctctt 48587088  T
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48587087 ttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtatatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 48587019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 33644201 - 33644382
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33644201 agtaatgatacatagacacccttgggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 33644300  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33644301 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 33644382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 302
Target Start/End: Original strand, 31456689 - 31456872
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31456689 aagtaatgatacatagacacccataggcggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 31456788  T
Q  229 tcttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31456789 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgcatgggaataaagggtgtttatgtatcattactca 31456872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11095452 - 11095285
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  11095452 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt--accccgcataaacacactttct 11095355  T
Q  230 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11095354 cttt--tctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 11095285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 49607415 - 49607596
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  49607415 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttct 49607514  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49607515 cttttctctcctcttttctcttcctaatgcatgacgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 49607596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 301
Target Start/End: Original strand, 52629305 - 52629482
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  52629305 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 52629404  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  52629405 tctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcattactc 52629482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 54868994 - 54868813
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54868994 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttct 54868895  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  54868894 cttttctctcatcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcattactc 54868813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27714990 - 27714822
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27714990 agtaatgatacatagacacctttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttct 27714891  T
Q  230 cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattact 300  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  27714890 c--ttctctcttcccaatacatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagagtgtatatgtatcattact 27714822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 8076394 - 8076571
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8076394 agtaatgatacataaacacccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 8076493  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8076494 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 8076571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 17470406 - 17470587
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17470406 agtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttct 17470505  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17470506 cttttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaatatgtatgagaataaatggtgtctatgtatcattactc 17470587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36707523 - 36707347
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    |||||||||||    
T  36707523 agtaatgatacatagatacccttaggtgacaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgc----gcacactttct 36707428  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattact 300  Q
    |||          |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36707427 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagaatgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattact 36707347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33118946 - 33118772
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||     
T  33118946 atgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatccctcagaaacacactttctcttt 33118847  T
Q  233 ----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  33118846 cctctcctccttctctctccctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctacgtaacatt 33118772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11348017 - 11347844
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11348017 atgatacatagacatccttaggtgacaatacatcctttgacatccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccctgcataagcacactttctcttt 11347918  T
Q  234 tc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||          ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11347917 tctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaccatt 11347844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26141627 - 26141452
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26141627 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaagcacactttctcttt 26141528  T
Q  234 tc------------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||            ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  26141527 tctctcctcttctttctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacatt 26141452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Original strand, 9563000 - 9563179
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  9563000 agtaatgatacataaacaccattagatgacaatacaacctttgacatccatataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaacacactttct 9563099  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattac 299  Q
              || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9563100 ctcttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagttgtacaaaggtgtatgggaataaagggtatctatgtatcattac 9563179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30801829 - 30801655
Alignment:
Q  133 aatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30801829 aatgatacatagacacccttaggtgataatacaccctttgatacccacacaaaaatatgacatgtagtcatatggaccccacacaagcacattttctctt 30801730  T
Q  233 ----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  30801729 tcctctcatcttctctcttcctagtacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacatt 30801655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20765010 - 20764837
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |  |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20765010 atgagacatagacatccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgtacaagcacactttctcttt 20764911  T
Q  234 tctctc----------ttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||          ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20764910 tctctcatcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 20764837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51419455 - 51419282
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  51419455 atgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatagaccccgcacaagcacactttctcttt 51419356  T
Q  234 tc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  51419355 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtttatgtaacatt 51419282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 35536627 - 35536804
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| | |||| |||||||   ||||||||||||| ||    
T  35536627 agtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccatttgacacccacataaaaatgtgacacgtggtcatgtggaccttacacaagcacacttcct 35536726  T
Q  230 cttt----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  35536727 ctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 35536804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14623938 - 14623761
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||  |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  14623938 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttct 14623839  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||| ||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14623838 ctttcatcttctcttctctctttctagtgcatgaggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 14623761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41189859 - 41189686
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||| | | ||||||||||| | |||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41189859 atgatacatatacatccttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttctcttt 41189760  T
Q  234 tctc----------tcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  41189759 tctctcctcttctttcttcctaatgtatggagtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacatt 41189686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 26754700 - 26754805
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26754700 atgattcatagacacccttaggtggcaatacacccttggacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctcttt 26754799  T
Q  234 tctctc 239  Q
     |||||    
T  26754800 cctctc 26754805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 11907376 - 11907481
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || | |  |||| || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11907376 atgatacatagacacccttaggtgacaatacacacctgaacactcacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagcacattttctcttt 11907475  T
Q  234 tctctc 239  Q
    ||||||    
T  11907476 tctctc 11907481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 8956763 - 8956940
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||| | ||||||||||||| | |||||| |||||| |  ||| |||||||   ||||||||||||| ||    
T  8956763 agtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacatcctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgttcatgtggaccttacacaagcacacttcct 8956862  T
Q  230 cttt----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  8956863 ctttcatcttctcttctctcttcctagtgcacagggtgtagaagggtgtatgagaataaatgctgtctatgtaacatt 8956940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13898154 - 13897985
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  13898154 agtaatgatagataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttct 13898055  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
    |||          |||||||| |||| || |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  13898054 ctttcatcttctcttctctctccctagtgtatggggtgtagaaaagtgtatgagaataaatggtgtctat 13897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 47531870 - 47532043
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||||| ||| ||| ||| ||| |||| |||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  47531870 atgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttaacatccacacaagaatctgacacgtggccatatgaaccccgcacaagcacactttctcttt 47531969  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  47531970 tctctcctattctctcttcctaatgtatggaatgtacaagtgtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 47532043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24700053 - 24699944
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||| | | ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  24700053 agtaatgatacatagacatccttagttggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctggcacgtggccacgtggaccctgtacaaacacactttct 24699954  T
Q  230 cttttctctc 239  Q
    |||| |||||    
T  24699953 ctttcctctc 24699944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48375801 - 48375696
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |  | | |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48375801 atgattcatagacacccttaggtgacaatacacccctgaaaatccatacaaaaatctgacgtgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctcttt 48375702  T
Q  234 tctctc 239  Q
     |||||    
T  48375701 cctctc 48375696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45058647 - 45058475
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  |   ||  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45058647 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccacataaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtatactttctcttt 45058549  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  45058548 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaatggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 45058475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35965873 - 35965704
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | || |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||        ||||| || |||||||||||||||||    
T  35965873 agtaatgatacatatacatccttaagtgataatacatcctttgacacccacataaaaatctgacac--------gtggatcctgcacaagcacactttct 35965782  T
Q  230 cttttctctc----------ttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||| |||||          ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  35965781 ctttcctctcctcttttcttttcttaattcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacatt 35965704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36331393 - 36331277
Alignment:
Q  165 accctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt----------tctctcttcctaatgcatggg 254  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||||| ||||||    
T  36331393 accccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggg 36331294  T
Q  255 gtgtacaagggtgtatg 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  36331293 gtgtacaagggtgtatg 36331277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 297
Target Start/End: Original strand, 35093592 - 35093763
Alignment:
Q  136 gatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt--- 232  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||| | | ||||||| |||  |||||||||||||  | |||| ||| || ||  ||||||||||||||||||       
T  35093592 gatacatagacaactttaggtgacaatacaacatttgacatccacgcaaaaatctgacatgtggtcatgtgaactccatacaagcacactttctcttgca 35093691  T
Q  233 -------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
           ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  35093692 tctttttttctctcttcctagtgcatgagatgtacaaaggtgtatgagaataaatgatgtctaggtaacatt 35093763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Original strand, 42823225 - 42823289
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  42823225 ttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 42823289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1758515 - 1758405
Alignment:
Q  170 ttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgta 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||| ||||||||          ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1758515 ttgacacccacacaaaaatctgacatatggttacgtggactccacacaaacacattttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcat-gggtgta 1758417  T
Q  260 caagggtgtatg 271  Q
    ||| ||||||||    
T  1758416 caaaggtgtatg 1758405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 41080710 - 41080811
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |  | |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  41080710 agtaatgatacatagacatccttagtag-caaaacaccctttgacacccacgcaaaaatctgatatgtggtcatgtgga-cccacacaagcacattttct 41080807  T
Q  230 cttt 233  Q
    ||||    
T  41080808 cttt 41080811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25407245 - 25407143
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatac-aaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctc 230  Q
    |||||||||||| ||| || |||| | |||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  25407245 taatgatacatacacaaccataggtggcaatataccccttgacacacacacaaaaaatctgacacgtgatcatatggatcccacacaaacacactttctc 25407146  T
Q  231 ttt 233  Q
    |||    
T  25407145 ttt 25407143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Original strand, 39670019 - 39670121
Alignment:
Q  137 atacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttct 236  Q
    ||||||||||| ||||| | | ||||||| || |||||| | ||| |||||| |||||| |  ||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  39670019 atacatagacatccttatgtggcaatatatcccttgacatctatataaaaatttgacacgtgatcatgtggacctcgtacacgcacacttcctcttttct 39670118  T
Q  237 ctc 239  Q
    |||    
T  39670119 ctc 39670121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 32869679 - 32869860
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32869679 agtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 32869778  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32869779 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 32869860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22880755 - 22880576
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880755 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaattctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 22880656  T
Q  232 tttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22880655 tttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtatatgtatcattactc 22880576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 17598555 - 17598736
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17598555 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgttgtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 17598654  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17598655 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcattactc 17598736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 11427617 - 11427800
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacaccct--taggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11427617 agtaatgatacatagacaccctcttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 11427716  T
Q  228 ctctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11427717 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 11427800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 29857828 - 29858009
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29857828 agtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttct 29857927  T
Q  230 cttttct----------ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29857928 cttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 29858009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 31976253 - 31976426
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  31976253 atgatacatagacatccttaggtggcaatataccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatgaaccccgcacaagcacactttctcttt 31976352  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31976353 tctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 31976426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6209564 - 6209384
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6209564 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactatttgacactcacacaaaaatctgtcacgtagtcacgtggaccccgcactagcacactttct 6209465  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6209464 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaagatgta-gggaataaagggtatctatgtatcattactc 6209384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23128224 - 23128044
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 231  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | || |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23128224 taatgatatatagacacctttatgtgataatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttctct 23128125  T
Q  232 tttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatgg-tgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  23128124 tttctctcctcttttctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaaaggttctctatgtatcattactc 23128044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 298
Target Start/End: Original strand, 15832578 - 15832756
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||  ||| |||||    
T  15832578 agtaatgatacatagacacctttaggtgacaataaatcatttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaatacattttct 15832677  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatta 298  Q
    |||          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  15832678 cttttttctcctcttctatcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtattggaataaagggtgtctacgtatcatta 15832756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31109499 - 31109390
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  31109499 agtaatgattaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtagaccccgcaaaagtacactttct 31109400  T
Q  230 cttttctctc 239  Q
    ||||||||||    
T  31109399 cttttctctc 31109390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31110854 - 31110683
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31110854 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacactca--caaaaatctgacacgtaaccacatggaccctgcacaagcacactttctcttt 31110757  T
Q  234 t----------ctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |          |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  31110756 tctctactcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaaggtgtatggaaataaaggatgtctatgtaacatt 31110683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15990137 - 15989964
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15990137 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 15990038  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  15990037 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 15989964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30341455 - 30341282
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  30341455 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 30341356  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  30341355 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 30341282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31953129 - 31952952
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||  |  ||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  31953129 agtaatgatagatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaaacacactttct 31953030  T
Q  230 cttt----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31953029 ctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 31952952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28536582 - 28536410
Alignment:
Q  133 aatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28536582 aatgatacataaacatccttaggtggcaatacaacccttgacacccacacaaaaatctgacac--ggtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 28536485  T
Q  233 ----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||    
T  28536484 ttatcttctcttccctcttcctactgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataaatgatgtcgatgtaacatt 28536410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 300
Target Start/End: Original strand, 946376 - 946557
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 228  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  | ||||| | |||||||||||    
T  946376 aagtaacgatacatagacatccttaggtgataatacaccctttgacacctacccaaaaatctgacacctagtcacgtaaatcccgctctagcacactttc 946475  T
Q  229 tcttttct----------ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattact 300  Q
    ||||||||          |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  946476 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagatgtacaagaatgtatgacaataaaaagtgtcaatgtatcattact 946557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15508119 - 15507946
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15508119 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 15508020  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  15508019 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 15507946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 4231553 - 4231726
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    ||||| |||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4231553 atgattcataaacatcattaggtggcaatacaccccttgccacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 4231652  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  4231653 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 4231726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9379807 - 9379708
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| | | || ||||| | | ||||| |||| |||||||||    
T  9379807 atgatacatagacatccttagatgacaatacatcccttgacacccatacaaaaatttgacacgtggccatgtggatctcacacaaacacattttctcttt 9379708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22422043 - 22422001
Alignment:
Q  255 gtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22422043 gtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 22422001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 239
Target Start/End: Original strand, 30870058 - 30870124
Alignment:
Q  173 acacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctc 239  Q
    ||||||||| |||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30870058 acacccatataaaaatctaacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctctc 30870124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 12732483 - 12732586
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | | |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| | |  | ||||| ||| || ||||||| |||||    
T  12732483 agtaatgatacatagacattcttaagtggcaatataatcattgacacccacacaaaaatctgacacgtggctatgtggatcccacataagcacattttct 12732582  T
Q  230 cttt 233  Q
    ||||    
T  12732583 cttt 12732586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 41236348 - 41236529
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41236348 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 41236447  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41236448 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 41236529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Original strand, 6034045 - 6034228
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6034045 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 6034144  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6034145 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcattactcat 6034228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48183148 - 48182965
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48183148 agtaatgatacatagacacccttacgtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 48183049  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    ||||||          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48183048 cttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactcat 48182965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11511561 - 11511381
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11511561 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 11511462  T
Q  230 ctttt----------ctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||||          |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11511461 cttttctcttctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtacaagggtgtatggaaataaat-gtgtctatgtatcattactc 11511381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42044466 - 42044285
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42044466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatccttgtacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 42044367  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42044366 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcattactc 42044285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 54473632 - 54473453
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54473632 agtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttat 54473533  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattac 299  Q
    ||||||          |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  54473532 cttttctctcctcttctctcttcctaatacatggagtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgttcatgtatcattac 54473453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 480546 - 480388
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  480546 agtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttct 480447  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataa 278  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  480446 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaaggtgtatggaaataa 480388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 31910197 - 31910370
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31910197 atgatacatagacatccttaggtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagccacatggaccccgcacaagcacactttctcttt 31910296  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31910297 tctctcatcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagagtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacatt 31910370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50052527 - 50052350
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50052527 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 50052428  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50052427 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcataaggtgtacaaaggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacatt 50052350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24995206 - 24995025
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24995206 agtaatgatatatggacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacattttct 24995107  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24995106 cttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaatggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 24995025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 29239887 - 29240064
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29239887 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttct 29239986  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29239987 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacatt 29240064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 23608236 - 23608417
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  23608236 agtaatgatatatagacacccttagatgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgaactccacacaagcacactttct 23608335  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23608336 cttttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacagggatgtatgggaataaaggatgtctatgtatcattactc 23608417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 3481655 - 3481758
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3481655 agtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccacacaagcacactttct 3481754  T
Q  230 cttt 233  Q
    ||||    
T  3481755 cttt 3481758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29234344 - 29234235
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29234344 agtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgataccttcacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 29234245  T
Q  230 cttttctctc 239  Q
    ||||||||||    
T  29234244 cttttctctc 29234235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 297
Target Start/End: Original strand, 41823920 - 41824060
Alignment:
Q  167 cctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt----------ttctctcttcctaatgcatggggt 256  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||    
T  41823920 cctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcttctctcttcctaatgcatgaggt 41824019  T
Q  257 gtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41824020 gtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacatt 41824060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50526270 - 50526093
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  50526270 agtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggattccgcacaagcacgctttct 50526171  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||    
T  50526170 atttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacatt 50526093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53352660 - 53352490
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||| ||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53352660 atgatacatagacacccttaggtg-caatacattctttaacacctacacaaaaatctgacacgtagttaagtggaccccgcacaagcatactttctcttt 53352562  T
Q  234 tctctcttcctaatgcat--ggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    |||||| || |    | |    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53352561 tctctcctcttctctcttcctaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcattactcat 53352490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19670811 - 19670638
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  19670811 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 19670712  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  19670711 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 19670638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Original strand, 40574784 - 40574949
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |  || |||| |||| ||||||||||||||||||     
T  40574784 atgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgctgctacatggatcccgaacaagcacactttctcttt 40574883  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
             |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40574884 tctctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctat 40574949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 55475196 - 55475369
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  55475196 atgatacataaacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcataagtacactttctcttt 55475295  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  55475296 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 55475369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 29977886 - 29978063
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| | | || |||| | ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  29977886 agtaatgatacatacagaaccataggtggcaatacaccccttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatatggaccccacacaagcacactttct 29977985  T
Q  230 ctt-----ttctctcttc-----ctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||     |||||| |||     |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||| ||||    
T  29977986 ctttcatcttctcttttctctcactaatgtatggggtgtacaagtgtgtataggaataaaagatatctatgtaacatt 29978063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 47986213 - 47986385
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  47986213 atgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 47986312  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||    
T  47986313 cttattctcttctctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtat-gcaattaaaggtgtctatgtaacatt 47986385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50813987 - 50813814
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| |||| |||||| |  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||  || |||||||||||| ||||||||||||     
T  50813987 atgatacataaacactcttaggtggtaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaaccccgcacaagtacactttctcttt 50813888  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  50813887 cttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 50813814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17983825 - 17983665
Alignment:
Q  147 acccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt----------ttct 236  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||          ||||    
T  17983825 acccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttct 17983726  T
Q  237 ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||||    
T  17983725 ctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatt 17983665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Original strand, 32766963 - 32767062
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32766963 atgatacataaacactcttaggtggcaatacaccccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcacaagtacactttctcttt 32767062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29548054 - 29547881
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  |||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  29548054 atgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcataagtacactttttcttt 29547955  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  29547954 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 29547881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28480360 - 28480267
Alignment:
Q  137 atacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctc 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||   || |||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28480360 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctc 28480267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28481235 - 28481142
Alignment:
Q  137 atacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctc 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||   || |||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28481235 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctc 28481142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28482110 - 28482017
Alignment:
Q  137 atacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctc 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||   || |||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28482110 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctc 28482017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48647821 - 48647716
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||| ||||| ||| |||||||  |||||| |||  || ||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48647821 atgacacataaacatccttaggtaacaatacacctcttaacacccacataaaaatctaacacgtggtcacgtggactccgcacaagcacaatttctcttt 48647722  T
Q  234 tctctc 239  Q
     |||||    
T  48647721 cctctc 48647716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 55079809 - 55079749
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgaca 194  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  55079809 atgatacataaacacccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctgaca 55079749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29589831 - 29589667
Alignment:
Q  137 atacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt--- 233  Q
    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |  | | ||  |||||||| |||||| |||||||||||||       
T  29589831 atacataaacacccttagttg-caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccacacaagtacactttctctttctt 29589733  T
Q  234 -------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgta 292  Q
           |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||    
T  29589732 cttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgta 29589667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18924481 - 18924417
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  18924481 ttctctcttcctaatacatgaggtgtaaaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 18924417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48716381 - 48716199
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48716381 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttat 48716282  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48716281 cttttctttcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactca 48716199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27564834 - 27564653
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564834 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttct 27564735  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27564734 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 27564653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9474975 - 9474794
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9474975 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttct 9474876  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9474875 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcattactc 9474794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 2581916 - 2582097
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2581916 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 2582015  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
              || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2582016 tttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtattagaataaagggtgtttatgtatcattactc 2582097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47452419 - 47452238
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47452419 agtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 47452320  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47452319 cttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagagtgtctatgtatcattactc 47452238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Original strand, 41758806 - 41758989
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41758806 agtaatgatacatagacaccattaaatggcaatacaccctttgacaaccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaaacacactttct 41758905  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41758906 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactcat 41758989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 3000320 - 3000501
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3000320 agtaatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttct 3000419  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  3000420 cttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcattactc 3000501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 32813252 - 32813425
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  32813252 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttt 32813351  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32813352 tctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacatt 32813425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 50630459 - 50630636
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630459 agtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacatcctttgttacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 50630558  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  50630559 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgcatcatt 50630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38632420 - 38632253
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38632420 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttttt 38632321  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtct 287  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38632320 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtct 38632253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 43133 - 43314
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43133 agtaatgatacatagacagtcttaggagacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggactccgcacaagcacactttct 43232  T
Q  230 cttt----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||          |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43233 cttttctctcctcctctctctttctaatgcatggggtgtacaagagtgtataagaataaagggtatctatgtatcattactc 43314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 38595155 - 38595336
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38595155 agtaatgatacataaacacctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttct 38595254  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  38595255 cttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcattactc 38595336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8346487 - 8346304
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8346487 agtaatgatacatagtcacctttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccctgcacaagcacactttct 8346388  T
Q  230 cttttc-----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactca 302  Q
    ||||||           |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8346387 cttttctctcctctttttctcttcctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaatggtatttatgtatcattactca 8346304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Original strand, 37649199 - 37649379
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  37649199 agtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtgaattccgcacaagcacactttcc 37649298  T
Q  230 cttttct----------ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattact 300  Q
    |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37649299 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattact 37649379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Original strand, 26274435 - 26274611
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacac------- 224  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||| | | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||           
T  26274435 taatgatacatagacacccttatgtggcaatacatcatttgacatccacagaaaaatctgacacatagtcacgtggatcctgcacaagtacactttttct 26274534  T
Q  225 tttctcttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26274535 tttctctcttctctcttcctaatgcatgagatgcacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 26274611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51898782 - 51898605
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51898782 agtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 51898683  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||    
T  51898682 atttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacatt 51898605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44548473 - 44548363
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 231  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44548473 taatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccatttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 44548374  T
Q  232 tttctctcttc 242  Q
    |||||||||||    
T  44548373 tttctctcttc 44548363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 297
Target Start/End: Original strand, 26440741 - 26440902
Alignment:
Q  136 gatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 235  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26440741 gatagatagacatccttagatgacaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcataagcacactttctcttttc 26440840  T
Q  236 tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||    
T  26440841 tctcttcgtaatgtatggaatgtacaagggtgtataggaataaaggatgtttatgtaacatt 26440902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45044640 - 45044482
Alignment:
Q  149 ccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttt----------ctct 238  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||          ||||    
T  45044640 ccttaggtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaacacattttctcttttctcttctcttctct 45044541  T
Q  239 cttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  45044540 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatgatgtctacgtaacatt 45044482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 49811622 - 49811449
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49811622 atgatagatagacatccttaggtgacaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagccatatagactccgcacaagcacactttctcttt 49811523  T
Q  234 tc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||          ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  49811522 tctctcctcttctctcttcctaatgtatgtggtgcacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 49811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50591104 - 50590922
Alignment:
Q  125 atttaagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacac 224  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  50591104 atttgagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacac 50591005  T
Q  225 tttctctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||| ||||    
T  50591004 tttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacatt 50590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11152476 - 11152308
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  11152476 agtaatgaaacatagacacc-ttaggtggcaatacacccttcgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtagaccccgcacaagcacgctttct 11152378  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
              || ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11152377 ttttcctctcctcttctctcttcccagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctat 11152308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 236
Target Start/End: Original strand, 13414789 - 13414868
Alignment:
Q  157 gacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttct 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13414789 gacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacattttctcttttct 13414868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5959095 - 5958922
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||| | | ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  5959095 atgatacataaacacccttaagtggcaatacacctcttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 5958996  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||||    
T  5958995 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacatt 5958922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37926533 - 37926368
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||| | | ||||| | ||||| | | ||| ||||||| | ||||||||||||| | | ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  37926533 atgatacatagatatctttaggtggcaatacatcttttaacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggatcccgtacaagtacactttctcttt 37926434  T
Q  234 tctct----------cttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
    |||||          |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37926433 tctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaggatgtatgtgaataaatggtgtctat 37926368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3302632 - 3302533
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  3302632 agtaatgatacatatacatccttaggtgacaatatattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttct 3302533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41608588 - 41608415
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||  | | ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  41608588 atgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgtacaagtacactttctcttt 41608489  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||| ||||    
T  41608488 cttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtttatgtaacatt 41608415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 47748448 - 47748620
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  | | ||  |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  47748448 atgatacataaatacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccatataaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcacaagtatactttctcttt 47748546  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  47748547 cttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 47748620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23597190 - 23597081
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||  |||||| |||||||| |    
T  23597190 agtaatgatacatagacatcattaggtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggccacgttgaccttgcacaaacacactttat 23597091  T
Q  230 cttttctctc 239  Q
    ||||||||||    
T  23597090 cttttctctc 23597081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Original strand, 44453979 - 44454161
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 228  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| | |  |||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  44453979 aagttatgatacatagacacctttaagtggcaatacatctcttgatacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggatcccacacaagcacactttt 44454078  T
Q  229 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggt----gtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  44454079 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtcagagtataagggtgtataagaataaatggtgtttatgtaacatt 44454161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 48489343 - 48489408
Alignment:
Q  172 gacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctc 237  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48489343 gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcccgcacaagcacattttctattttctc 48489408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9501643 - 9501601
Alignment:
Q  236 tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataa 278  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9501643 tctcttcttaatgcatggcgtgtacaagggtgtatgtgaataa 9501601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44548340 - 44548303
Alignment:
Q  264 ggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44548340 ggtgtatgggaataaaatgtgtctatgtatcattactc 44548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 2740275 - 2740456
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2740275 agtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 2740374  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2740375 cttttctctccccttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 2740456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18520981 - 18520802
Alignment:
Q  132 taatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520981 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 18520882  T
Q  232 t----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18520881 tttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcattactc 18520802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36733041 - 36732872
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36733041 agtaatgatacatagacacccttaggtagcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 36732942  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
    ||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36732941 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctat 36732872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 303
Target Start/End: Original strand, 35785200 - 35785383
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35785200 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcacaatcacactttct 35785299  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35785300 cttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcattactcat 35785383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 14831815 - 14831996
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14831815 agtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 14831914  T
Q  230 ----------cttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
              || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14831915 tttttttctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcattactc 14831996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33149737 - 33149556
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33149737 agtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 33149638  T
Q  230 cttttc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33149637 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 33149556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 293
Target Start/End: Original strand, 13811653 - 13811826
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13811653 agtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 13811752  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtat 293  Q
    |||          |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13811753 cttctctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaggatgtatgggaataaatggtgtctatgtat 13811826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 40145408 - 40145589
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40145408 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 40145507  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||          |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40145508 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcacgaggtgtacaagggtatatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 40145589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 303
Target Start/End: Original strand, 31132396 - 31132518
Alignment:
Q  181 acaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaat 280  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||     
T  31132396 acaaaaatctgacaagtagtcacgtggaccccgcacaagcatactttttcttttctctctttctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaag 31132495  T
Q  281 ggtgtctatgtatcattactcat 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  31132496 ggtgtttatgtatcattactcat 31132518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15409705 - 15409532
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15409705 atgatacatagacatccttaggtgacaatacattctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactctctcttt 15409606  T
Q  234 tc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  15409605 tctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgcgaataaagggtgtttatgtaacatt 15409532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35943987 - 35943814
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  35943987 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccacacaagcacactttctcttt 35943888  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  35943887 cctctcctcttttctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaatgtgtctatgtaacatt 35943814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 31008993 - 31009166
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc----- 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||         
T  31008993 atgatacataaacatccttaggtgacaatacattcttccacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctattt 31009092  T
Q  229 -----tcttttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
         ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  31009093 cctcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatt 31009166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42414401 - 42414295
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  42414401 agtaatgatacatagacaccagtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttat 42414302  T
Q  230 cttttct 236  Q
    |||||||    
T  42414301 cttttct 42414295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 28177780 - 28177885
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28177780 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacactttctcttt 28177879  T
Q  234 tctctc 239  Q
    ||||||    
T  28177880 tctctc 28177885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Original strand, 6679703 - 6679876
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  6679703 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacattttctcttt 6679802  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  6679803 tctctcctcttctctcttcctaatgtatagggtgtacaagggtgtatgacaataaatgatgtctatgtaacatt 6679876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Original strand, 26720521 - 26720686
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  26720521 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttctcttt 26720620  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
             |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26720621 tctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctat 26720686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Original strand, 26990270 - 26990435
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  26990270 atgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttctcttt 26990369  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctat 289  Q
             |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26990370 tctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctat 26990435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36875703 - 36875538
Alignment:
Q  129 aagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36875703 aagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaa---------atagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 36875613  T
Q  229 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36875612 tcttttttctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaaggg----tggaaataaatggtgtctatgtaacatt 36875538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3921360 - 3921187
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  3921360 atgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 3921261  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  3921260 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 3921187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2252263 - 2252090
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt- 232  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2252263 atgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctcttt 2252164  T
Q  233 ---------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
             |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  2252163 cttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 2252090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6260105 - 6259997
Alignment:
Q  125 atttaagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacac 224  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  6260105 atttgagtaatgatacatacacaaccataggtgacaatacaccctttaacacccacgcaaaaatctaacacatggtcacatggacctcacagaagcacac 6260006  T
Q  225 tttctcttt 233  Q
    |||||||||    
T  6260005 tttctcttt 6259997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Original strand, 9603814 - 9603991
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || |||| || | || ||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||| ||||||||||    
T  9603814 agtaatgatacatatacatccttaggtgataatacactcattcacacctacacaaaaatctgacacatggtcatatggaccccatacaatcacactttct 9603913  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          |||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  9603914 ctttcatttcgtcttctctcttcttagtgcttgggatgtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctacgtaacatt 9603991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33825423 - 33825246
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| | ||||| || | |||||||||| | ||||||||||||| |  ||| ||| |||   ||||||||||||||||    
T  33825423 agtaatgatgcatagacattcttaggtggcaatacactccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgaaccttacacaagcacactttct 33825324  T
Q  230 ctttt----------ctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||||          ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33825323 cttttatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggctgtatgagaataaatggtgtcaatgtaacatt 33825246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41470515 - 41470425
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagc 220  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||| | |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41470515 agtaataatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttaaaattcatataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagc 41470425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39688992 - 39688819
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||| ||||||||| | | ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |  | ||||  || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  39688992 atgatacataaacacccttaagtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggtcatatgaaccccgcataagtacactttctcttt 39688893  T
Q  234 ----------tctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
              |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  39688892 cttcttttcttctctcttcctaatacatagggtgtacaaaggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 39688819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20073615 - 20073506
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| || | ||||||||  ||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20073615 agtaatgatatatagacatcattagatgacaatacaccctttgacactcacataaaaatcttgcacgtgaccacgtggaccctgcacaagcacactttct 20073516  T
Q  230 cttttctctc 239  Q
     ||| |||||    
T  20073515 atttcctctc 20073506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16115296 - 16115250
Alignment:
Q  255 gtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16115296 gtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcattactc 16115250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 239
Target Start/End: Original strand, 21370048 - 21370114
Alignment:
Q  173 acacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctc 239  Q
    |||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21370048 acacccactcaaaaatctgacatgtggtcacgtggaccccgcacaaacacattttctctttcctctc 21370114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Original strand, 2177478 - 2177542
Alignment:
Q  233 ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||    
T  2177478 ttctctcttcctagtgcattggatgtacaagggtgtatgagaataaaatgtgtctctgtaacatt 2177542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4211
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4030 agtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttct 4129  T
Q  230 cttttct----------ctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4130 cttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 4211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10204 - 10027
Alignment:
Q  134 atgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10204 atgatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttgacatccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccgcgtacaagcacactttctcttt 10105  T
Q  234 tc----------tctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcattactc 301  Q
    ||          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10104 tctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcattactc 10027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1028 - 851
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1028 agtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttct 929  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  928 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1028 - 851
Alignment:
Q  130 agtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 229  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1028 agtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttct 929  T
Q  230 ctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    |||          ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  928 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8967 - 8785
Alignment:
Q  125 atttaagtaatgatacatagacacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacac 224  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  ||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  8967 atttgagttatgatatatagacatccttaagtgacaatacactatttgacatctacacaaaaatttgacacatagtcacgtggaccccacacaagtacat 8868  T
Q  225 tttctctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||||          |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  8867 tttctctttcctcccatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtataagaataaaaggtgtctatgtaacatt 8785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 297
Target Start/End: Original strand, 152514 - 152676
Alignment:
Q  145 acacccttaggcgacaatataccctttgacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt----------tt 234  Q
    |||||||| || | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||          ||    
T  152514 acacccttgggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggatcccgcacaaatacactttctctttcttcttctctt 152613  T
Q  235 ctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 297  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  152614 ctctctttctaatacatgggatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 152676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 238
Target Start/End: Original strand, 17097 - 17163
Alignment:
Q  172 gacacccatacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctct 238  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17097 gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctct 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University