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Alignment Overview

Query: NF4745-Insertion-10 (Length: 673)

Name: NF4745-Insertion-10
Description: NF4745
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4745-Insertion-10
NF4745-Insertion-10
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (52-673)||(28703964-28704583)
chr5 (41-673)||(28677961-28678589)
chr5 (41-673)||(5506074-5506694)
chr5 (45-673)||(30489802-30490418)
chr5 (46-673)||(759240-759857)
chr5 (196-575)||(34016190-34016561)
chr5 (137-500)||(38740219-38740583)
chr5 (510-673)||(26506600-26506760)
chr5 (520-673)||(17343785-17343936)
chr5 (325-500)||(20883208-20883383)
chr5 (328-500)||(35049027-35049188)
chr5 (520-650)||(20884320-20884449)
chr5 (315-500)||(32911028-32911204)
chr5 (380-500)||(16109787-16109907)
chr5 (127-181)||(34016153-34016207)
chr5 (164-205)||(23941391-23941432)
chr5 (427-500)||(26505891-26505964)
chr5 (164-211)||(3759500-3759548)
chr5 (160-206)||(3759548-3759594)
chr5 (160-206)||(11135809-11135855)
chr5 (164-206)||(17636412-17636454)
chr5 (169-206)||(38740619-38740656)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (42-673)||(55527284-55527915)
chr4 (41-672)||(24973518-24974149)
chr4 (165-557)||(45244811-45245203)
chr4 (447-673)||(34234455-34234679)
chr4 (41-177)||(12586666-12586801)
chr4 (41-172)||(36501737-36501868)
chr4 (311-500)||(41420271-41420460)
chr4 (327-500)||(1939003-1939176)
chr4 (135-245)||(23283584-23283694)
chr4 (315-500)||(18486722-18486906)
chr4 (498-650)||(50007333-50007485)
chr4 (325-476)||(50334314-50334464)
chr4 (498-646)||(50335099-50335247)
chr4 (315-500)||(156335-156509)
chr4 (41-158)||(45237486-45237602)
chr4 (510-575)||(41784350-41784415)
chr4 (380-421)||(41785104-41785145)
chr4 (451-500)||(41785205-41785254)
chr4 (165-211)||(32304987-32305033)
chr4 (44-109)||(23283710-23283775)
chr4 (162-211)||(35313949-35313998)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (41-673)||(38386249-38386881)
chr7 (41-673)||(4552-5175)
chr7 (41-673)||(38047721-38048340)
chr7 (220-673)||(19363560-19364011)
chr7 (325-500)||(44226109-44226283)
chr7 (41-224)||(19365216-19365398)
chr7 (302-500)||(23943354-23943554)
chr7 (46-192)||(8377962-8378108)
chr7 (498-650)||(44225336-44225488)
chr7 (299-463)||(10525960-10526124)
chr7 (316-497)||(12168500-12168681)
chr7 (520-640)||(2368802-2368921)
chr7 (591-673)||(26151808-26151885)
chr7 (604-672)||(24503381-24503445)
chr7 (510-563)||(24503484-24503537)
chr7 (380-421)||(29248679-29248720)
chr7 (162-211)||(12168325-12168374)
chr7 (604-669)||(12868916-12868981)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (49-673)||(33617911-33618521)
chr1 (41-673)||(33401483-33402094)
chr1 (197-673)||(28474981-28475450)
chr1 (64-609)||(35563595-35564108)
chr1 (266-672)||(48026502-48026907)
chr1 (41-237)||(33617719-33617915)
chr1 (41-225)||(48026915-48027099)
chr1 (329-500)||(23943295-23943466)
chr1 (64-149)||(35563450-35563535)
chr1 (325-500)||(1181148-1181313)
chr1 (325-500)||(12067650-12067815)
chr1 (315-477)||(36183078-36183234)
chr1 (498-650)||(12066929-12067081)
chr1 (593-673)||(7318925-7319005)
chr1 (513-627)||(30704112-30704225)
chr1 (327-500)||(30703304-30703466)
chr1 (168-399)||(25818876-25819107)
chr1 (168-211)||(31206699-31206742)
chr1 (127-181)||(28474943-28474997)
chr1 (498-563)||(23942632-23942698)
chr1 (164-206)||(37259379-37259421)
chr1 (467-500)||(25818809-25818842)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (41-673)||(12703889-12704524)
chr6 (45-673)||(4319163-4319791)
chr6 (127-673)||(31483798-31484345)
chr6 (220-673)||(32274714-32275167)
chr6 (318-500)||(1031372-1031552)
chr6 (41-217)||(32274259-32274435)
chr6 (498-650)||(1030593-1030745)
chr6 (327-465)||(23236171-23236308)
chr6 (41-90)||(17436495-17436544)
chr6 (455-500)||(23232184-23232229)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (41-673)||(39645849-39646467)
chr3 (41-673)||(35068668-35069290)
chr3 (41-574)||(19871628-19872144)
chr3 (194-673)||(34084310-34084784)
chr3 (45-470)||(15040760-15041186)
chr3 (138-491)||(7665853-7666197)
chr3 (41-201)||(34082914-34083074)
chr3 (315-500)||(20513713-20513897)
chr3 (327-500)||(54336403-54336575)
chr3 (325-492)||(53771936-53772101)
chr3 (600-673)||(19871558-19871631)
chr3 (498-650)||(30930404-30930556)
chr3 (41-102)||(7665808-7665869)
chr3 (498-650)||(14439627-14439778)
chr3 (520-673)||(27933683-27933829)
chr3 (520-650)||(20514680-20514809)
chr3 (520-650)||(54336116-54336245)
chr3 (605-673)||(30530706-30530770)
chr3 (161-206)||(11423001-11423046)
chr3 (510-563)||(30530809-30530862)
chr3 (380-500)||(30531441-30531561)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (127-673)||(8273396-8273942)
chr2 (136-500)||(22727915-22728279)
chr2 (167-500)||(35004479-35004812)
chr2 (498-673)||(26225153-26225332)
chr2 (325-500)||(19379859-19380032)
chr2 (315-500)||(9826908-9827091)
chr2 (498-673)||(35003718-35003891)
chr2 (136-222)||(26224246-26224332)
chr2 (520-650)||(22728878-22729007)
chr2 (520-648)||(9827724-9827851)
chr2 (416-500)||(26224463-26224547)
chr2 (591-673)||(14330099-14330177)
chr2 (288-367)||(26224391-26224470)
chr2 (505-546)||(28758457-28758498)
chr2 (160-207)||(26224195-26224242)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (196-673)||(34278964-34279441)
chr8 (383-673)||(5966655-5966944)
chr8 (41-321)||(5966959-5967240)
chr8 (41-181)||(34279424-34279564)
chr8 (327-500)||(5075903-5076075)
chr8 (325-497)||(22675543-22675720)
chr8 (325-500)||(5015674-5015849)
chr8 (269-463)||(33228647-33228839)
chr8 (327-500)||(41601259-41601434)
chr8 (325-500)||(32076740-32076914)
chr8 (498-649)||(5016468-5016619)
chr8 (352-500)||(24618647-24618795)
chr8 (586-650)||(32075857-32075921)
chr8 (510-668)||(15893493-15893644)
chr8 (510-667)||(30944283-30944435)
chr8 (45-105)||(31762320-31762380)
[»] scaffold0700 (2 HSPs)
scaffold0700 (138-497)||(4619-4977)
scaffold0700 (520-673)||(4358-4509)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (323-500)||(33252-33428)
scaffold0015 (586-650)||(32490-32554)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 673
Target Start/End: Original strand, 28703964 - 28704583
Alignment:
Q  52 aaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacatgcgctag 151  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28703964 aaattataacgtaaattaagataagtagcatgacttaacacgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaggttaacatgcgctag 28704063  T
Q  152 tgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcatgcaag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  28704064 tgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgacatttgcactagcgtgagttaactcatgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcaggcagt 28704163  T
Q  252 tacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacg 351  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28704164 tacagaactgtcttttgaaaagtctagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaactgaattacgccagtttaacaagattatcggataatacg 28704263  T
Q  352 acataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggca 451  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  28704264 acataatctattcaaagtactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcatacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaattcgtcagta 28704363  T
Q  452 atgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28704364 atgacccttaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattggccataaat 28704463  T
Q  552 atcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatc 651  Q
    ||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28704464 atcaaaattacacaaccggccaccaaaaaa--atgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacctatc 28704561  T
Q  652 taactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  28704562 taactagactattgatagtgca 28704583  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Original strand, 28677961 - 28678589
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28677961 tgcgctactgaaaattataacgtaacttaaaataagtagcgtgacttaacatgcgatactgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaggtta 28678060  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28678061 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgacatttgcactagcgtgagttaactcacattcatagcagacaacagaaactgcaataa 28678160  T
Q  241 atgcatgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattat 340  Q
    ||||| |||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28678161 atgcaggcatttacataattatcttttgaaaagtctagaatgacctgtaatcacgccacattcataacttaactgaattacgccagtttaacaagattat 28678260  T
Q  341 cggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaa 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28678261 cggataatacgacataatcgattcaaattactcaaaaacatcgttttt-tcacaatcatgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcacaa 28678359  T
Q  441 agtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatat 540  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28678360 attcgccagtaatgacccgtaataatttaaatacact---tgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatat 28678456  T
Q  541 tggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtc-ggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||       | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28678457 tggccataaatatcaaaattacacaactggccaccaaaaaatt-tgtcgggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtg 28678555  T
Q  640 tcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28678556 tcataacctatctaactagactattgatagtgca 28678589  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 5506694 - 5506074
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5506694 tgcgccagtgcaaattataacataacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgtcatttgtgagttatttgttgaatgcttagtgcaagtta 5506595  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5506594 acatgcgctagtgtactgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagtta-----cgttcatagcagacagcagaaactgcaataa 5506500  T
Q  241 atgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatta 339  Q
    ||||| ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||    
T  5506499 atgcagtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacctgtaatcacgccacattcataacttaacccaattacgtcagtttaacaagatta 5506400  T
Q  340 tcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttc-tcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcac 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||    
T  5506399 tcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcatttttcctcacaatcacgtaatcacacataaacg---------gtccaaatttcac 5506309  T
Q  439 aaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacat 538  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5506308 aaattcgccggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacaattcaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacat 5506209  T
Q  539 attggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  5506208 attggccataaatatcaaaattacacagccggccaccaaaaaaatatgtcggggtctaataccaccaaaaaatatgacgaacaccgaccgacccaaaaat 5506109  T
Q  639 gtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5506108 gtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 5506074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 673
Target Start/End: Original strand, 30489802 - 30490418
Alignment:
Q  45 ctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacat 144  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489802 ctagtgcagattataacgtaacttaaaataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacat 30489901  T
Q  145 gcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgc 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489902 gcgctagtgtattgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgc 30490001  T
Q  245 a-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcgg 343  Q
    | ||||   |||||| ||    ||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30490002 agtgcagtaacagaactggaacttgaaaagtgtaaaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaagagtatcgg 30490101  T
Q  344 ataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagt 443  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  30490102 ataatacgacataatcaatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttc------- 30490194  T
Q  444 cgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattgg 543  Q
      |||  ||| || |   |  || ||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30490195 --ccgaaaat-acac---aagatataagcagacttaatgacacgtaaacaatccaaaacaattcatttcatatatttatataatattagttacatattgg 30490288  T
Q  544 ccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcat 643  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30490289 ccataaatatcaaaattacacaaccggccaccaaaaaaatatttcggggtgtaataccaacaaaaaaaatgacgaacaccgaccgacccagaagtgtcat 30490388  T
Q  644 aacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30490389 aacatatctaactagactagtgatagtgca 30490418  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 46 - 673
Target Start/End: Original strand, 759240 - 759857
Alignment:
Q  46 tagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgt-gagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacat 144  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |           ||||| | ||||||||||    
T  759240 tagtgtaaattacaacgtaacttaagatatgttgtgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtagagtaa-----------cttagtgtaagttaacat 759328  T
Q  145 gcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgc 244  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  759329 gcgctagtgtaatgtgtaacgtgagttaactcacgttgctatttgtacaagcatgagttaactcacgttcgtagcagacaacagaaactgcaataaatac 759428  T
Q  245 a-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcgg 343  Q
    | ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || | |  || | ||  | |||||    
T  759429 agtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgtcacattcataacttaaccgaatcacgccacattcataacttaatcgg 759528  T
Q  344 ataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagt 443  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  759529 ataatacgacataatcaatccaaataactcaaaaacatcattttactcacaatcacgtaatcacacgtaaacgatccaaacgatccaaatttcacaaatt 759628  T
Q  444 cgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattgg 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  759629 cgccggtaatgacccgtaataatttacacacacttaatgacacgcaaatgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattgg 759728  T
Q  544 ccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcat 643  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  759729 ccataaatatcaaaattacacaaccgaccacc-aaaaaatatgttggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgactgacccaaaagtgtcat 759827  T
Q  644 aacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  759828 aacctatctaactagactagtgatagtgca 759857  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 196 - 575
Target Start/End: Original strand, 34016190 - 34016561
Alignment:
Q  196 cgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcac 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||    ||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  34016190 cgtgagttaactaacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcagtgcaataacagaactgaaacttgaaaggtgtagaatgacccataatcac 34016289  T
Q  295 gtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcaca 394  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  34016290 gccacactcataacttaaccgaattacgccagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgttcttctcaca 34016389  T
Q  395 atcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacga 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34016390 atcacgtaatcacacataaacgatcca---------aatttcacaaattcgccggtaatgaccggtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacga 34016480  T
Q  495 tccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccacc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34016481 tccaaaataaatcatttcatatatttatataatattagttacatattgacaataaatatcaaaattacacaaccagccacc 34016561  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 137 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 38740583 - 38740219
Alignment:
Q  137 gttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgca 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38740583 gttaacatgcgctagtgtaatgtgtaacgtgagttaactcacgtttccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcgtagcagacaacagaaactgca 38740484  T
Q  237 ataaatgcatgcaagta-cagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaag 335  Q
    |||||||||    |||| ||||| ||    ||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||     
T  38740483 ataaatgcagcgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtttagaatgacccgtaatcacgctacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaac 38740384  T
Q  336 attatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaattt 435  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||||||     
T  38740383 attatcatataatacgacataatcgatccaaattacacaaaaacatagtttttcactcaatcacataatcaccaataaacgatccaaacagtccaaatta 38740284  T
Q  436 cacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38740283 cacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 38740219  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 510 - 673
Target Start/End: Original strand, 26506600 - 26506760
Alignment:
Q  510 ttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaa 609  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||       || |||||  | |||||||||||||||    
T  26506600 ttcatatatttatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaa-tacgtcgg--tataataccaccaaaaa 26506696  T
Q  610 ataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26506697 ataggacgaacaccgacgaaccaaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 26506760  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 520 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17343936 - 17343785
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||       || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17343936 tatataatattagttatatattggccataaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaa-tacgtcggggtgtaataccac-aaaaaataggacgaa 17343839  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17343838 caccgaccgatcaaaaagtgtcataacctagctaactaggctagtgatagtgca 17343785  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Original strand, 20883208 - 20883383
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttct-cacaatcacgtaatcacacataaacgatccaga 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |    
T  20883208 agtttaacaagattattggataatacgacacaattgatcaaaattacacaaaaacatcattttttttcacaatcacataatcacacttaa-cgatccaaa 20883306  T
Q  424 cggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||||| || | |||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20883307 cggtccaatttacgcaaattcgtcggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacaatccaaa 20883383  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 500
Target Start/End: Original strand, 35049027 - 35049188
Alignment:
Q  328 ttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggt 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||          || |    
T  35049027 ttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttt-tcacaatcacataatcacacataa----------cgat 35049115  T
Q  428 ccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35049116 ccaaattacacaaattcgccggtaatgacccataatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 35049188  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 650
Target Start/End: Original strand, 20884320 - 20884449
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||       || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20884320 tatataatattagttacatattggccacaaatatcaaaattacataaccggccaccaaaaaa-tacgtcgggatgtaataccaccaaaaaataggacgaa 20884418  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  20884419 caccgaccgacctataagtgtcctaacctat 20884449  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32911204 - 32911028
Alignment:
Q  315 gaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaa 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||        ||||||||||| ||    
T  32911204 gaattacaccagtttaacaagattatcggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacattgtttttctca--------taatcacacat-aa 32911114  T
Q  415 cgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||| | || || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   |||| || | |||| || ||||||||||||||||    
T  32911113 cgatctaaacagtacaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcccttaatcataattaacgatacgtaaacgatccaaa 32911028  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16109907 - 16109787
Alignment:
Q  380 atcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacactta 479  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||  |||| | ||| ||  |||||| | |||| | |||| ||||||||    
T  16109907 atcgtttatcacaaaatcacataatcacgcataaatgatccaaacgatccaaatgacacagactcgtcgttaatgacacataatcacttaatcacactta 16109808  T
Q  480 atgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16109807 atgacacataaacgatccaaa 16109787  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 181
Target Start/End: Original strand, 34016153 - 34016207
Alignment:
Q  127 cttagcgcaagttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgtt 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  34016153 cttagcgtaagttaacatgcgctaatgtaatgtgtaacgtgagttaactaacgtt 34016207  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23941432 - 23941391
Alignment:
Q  164 cgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23941432 cgtgagttaactcacgttgccatttacactagcgtaagttaa 23941391  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 500
Target Start/End: Original strand, 26505891 - 26505964
Alignment:
Q  427 tccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||  |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26505891 tccaaatttcacaaattcgtcgttaatgatgcgtaatcacttaatcacacttaatgacatgtaaacgatccaaa 26505964  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3759548 - 3759500
Alignment:
Q  164 cgtgagttaactcacgttgccatttgca-ctagcgtgagttaactcacg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  3759548 cgtgagttaactcacgttgccatttacacctcgcgtgagttaactcacg 3759500  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Original strand, 3759548 - 3759594
Alignment:
Q  160 gcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaac 206  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3759548 gcaatgtgtgttaactcacgttggcatttgtactagcgtgagttaac 3759594  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11135855 - 11135809
Alignment:
Q  160 gcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaac 206  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11135855 gcaacgtgtgttaacttacgttgtcatttgcactagcgtaagttaac 11135809  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17636454 - 17636412
Alignment:
Q  164 cgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaac 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17636454 cgtgagttaactcacgtttccatttacattagcgtgagttaac 17636412  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 206
Target Start/End: Original strand, 38740619 - 38740656
Alignment:
Q  169 gttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaac 206  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38740619 gttaacttacgttgtcatttgcactagcgtgagttaac 38740656  T

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Target: chr4 (Bit Score: 455; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 55527915 - 55527284
Alignment:
Q  42 gcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55527915 gcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcactagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaa 55527816  T
Q  142 catgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55527815 catgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcatgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcattgcagacaacagaaactgcaataaa 55527716  T
Q  242 tgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattat 340  Q
    |||| ||||   |||||| ||     |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||     
T  55527715 tgcagtgcagtaacagaactgaaacctgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgtcagtttaacaagattac 55527616  T
Q  341 cggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaa 440  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55527615 cggataacacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcacaa 55527516  T
Q  441 agtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatat 540  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  55527515 attcgccggtaattacccgtaataatttaaacacgcttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatgt 55527416  T
Q  541 tggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgt 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55527415 tggccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtgt 55527317  T
Q  641 cataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55527316 cataacctatctaactagactagtgatagtgca 55527284  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 24974149 - 24973518
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24974149 tgcgctagtgcaaattataatgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgtttagctcaagtta 24974050  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24974049 acatgcgctagtgtattgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 24973950  T
Q  241 atgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatta 339  Q
    ||||| ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24973949 atgcagtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaactgaattacgccagtttaacaagatta 24973850  T
Q  340 tcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcaca 439  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24973849 tcggataatacggcgtaatcgatccaaattactcaaaaacctcatttttctcacaatcacgtaatcaagcataaacgatccaaacggtccaaatttcaca 24973750  T
Q  440 aagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacata 539  Q
    || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  24973749 aattcgccggtaattacctgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatt 24973650  T
Q  540 ttggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24973649 ttggccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaatatgacgaacaccgaccgacccaaaagtg 24973551  T
Q  640 tcataacctatctaactagactagtgatagtgc 672  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24973550 tcataacctatctaactagactattgatagtgc 24973518  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 165 - 557
Target Start/End: Original strand, 45244811 - 45245203
Alignment:
Q  165 gtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcatgcaagtacagaattgtct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||| |||||    
T  45244811 gtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacaaaaactgcaataaatgcaggcagttaaagaagtgtct 45244910  T
Q  265 tttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattc 364  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45244911 tttgaaaaatgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgctagtttaagaagattatcggataatacaacataatcgatcc 45245010  T
Q  365 aaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaata 464  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45245011 aaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaacgttccaaatttcacaaattcgccggtaatgacccgtaata 45245110  T
Q  465 atttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45245111 atttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattggccataaatatcaaa 45245203  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 447 - 673
Target Start/End: Original strand, 34234455 - 34234679
Alignment:
Q  447 cggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggcca 546  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  34234455 cggcaatgatccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaatgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattgaccg 34234554  T
Q  547 taaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataac 646  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||       ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34234555 taaatatcaaaattacacaaccagcaacc-aaaaaatatgtcgaggcgtaatacca-caaaaaatagaacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataac 34234652  T
Q  647 ctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34234653 ctatataactagactagtgatagtgca 34234679  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12586801 - 12586666
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12586801 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcactagtgttatttgtgagtta-ttgttgaatgcttagcgcaagtta 12586703  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactca 177  Q
    | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  12586702 agatgcgttagtgtattgtgaaatgtgagttaactca 12586666  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36501868 - 36501737
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36501868 tgcgctggtgcaaattataacgtaactcaagataagtaacgtgacttaacatgtgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 36501769  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagtta 172  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36501768 atatgcggtagtgtattgtgaaacgtgagtta 36501737  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 311 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41420460 - 41420271
Alignment:
Q  311 aactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacaca 410  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41420460 aactgaattacgcctgtataacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcatttttttcacaatcacataatcacaca 41420361  T
Q  411 taaacgatccaga-cggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41420360 taa-cgatccaaaacggtccaaattacacaaattcgccggtaatgactcgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 41420271  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1939176 - 1939003
Alignment:
Q  327 tttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttct-cacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacg 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  1939176 tttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttttttcacaatcacataatcacacataa-cgatccaaacg 1939078  T
Q  426 gtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1939077 gtccaagttacacaaattcgccggtaatgacctgtaatcacttaaacacatttaatgacacgtaaacgatccaaa 1939003  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23283694 - 23283584
Alignment:
Q  135 aagttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactg 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23283694 aagttaacatgcgctagtgtaatgtgtaacgtgagttaactcacgttgacatttatactagcgtgagttaacttacgttcatagcagacaacagaaactg 23283595  T
Q  235 caataaatgca 245  Q
    |||||||||||    
T  23283594 caataaatgca 23283584  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18486906 - 18486722
Alignment:
Q  315 gaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaa 414  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  18486906 gaattacgccagtttaacaagattatcgaataatatgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatcatttttctcacaatcacataatcatacataa- 18486808  T
Q  415 cgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||| || ||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18486807 cgattcaaacaatccaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 18486722  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 498 - 650
Target Start/End: Original strand, 50007333 - 50007485
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||       ||||||||||||||    
T  50007333 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccaaaaatatccaaattacttaaccggccaccaaaaaa-tatgtcggggtgta 50007431  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  50007432 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcataacctat 50007485  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 325 - 476
Target Start/End: Original strand, 50334314 - 50334464
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagac 424  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |     
T  50334314 agtttaacaagattgttggataatacgacacaatcgatgaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcacataatcacgcat-aacgatccaaat 50334412  T
Q  425 ggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacac 476  Q
    |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  50334413 ggtccaaattacacaaattcgctggtaatgacccgtaatcacttaaacacac 50334464  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 498 - 646
Target Start/End: Original strand, 50335099 - 50335247
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||       || |||||||||||    
T  50335099 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattagccacaaatatccaaattacataatcggccaccaaaaaa-tacgtcggggtgta 50335197  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataac 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  50335198 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaac 50335247  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 500
Target Start/End: Original strand, 156335 - 156509
Alignment:
Q  315 gaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaa 414  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| || |||||| |||||||||| |||               
T  156335 gaattacgccagtttaacaagattattggataatacgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatagtttttttcacaatcacataa----------- 156423  T
Q  415 cgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  156424 cgatccaaacggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttgatgacacgtaaacgatccaaa 156509  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Original strand, 45237486 - 45237602
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||  | ||||||    
T  45237486 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagatacgttgcgtatgctaacatgcgctagtgttatttgtgtgtaattt-ttgaatacttaatgtaagtta 45237584  T
Q  141 acatgcgctagtgtattg 158  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45237585 acatgcgctagtgtattg 45237602  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41784415 - 41784350
Alignment:
Q  510 ttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccacc 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  41784415 ttcatatatttatataatattagttacatattgatcacaaatatccaaattacataattggccacc 41784350  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 41785145 - 41785104
Alignment:
Q  380 atcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatcca 421  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41785145 atcgtttttctcaaaatcacataatcacacataaacgatcca 41785104  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41785254 - 41785205
Alignment:
Q  451 aatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41785254 aatgacccgtaatcacttaatcacaattaatgacacgtaaacgatccaaa 41785205  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 32304987 - 32305033
Alignment:
Q  165 gtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32304987 gtgagttaactcacgtagccattagcacatgcgtgagttaactcacg 32305033  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23283775 - 23283710
Alignment:
Q  44 gctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgt 109  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  23283775 gctagtgcaaattacaacataacttaagatacgttgcgtaagttaacatgcactagtgatatttgt 23283710  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Original strand, 35313949 - 35313998
Alignment:
Q  162 aacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacg 211  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35313949 aacgcgagttaactcacgtagagatttacactagcgtgagttaactcacg 35313998  T

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Target: chr7 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Original strand, 38386249 - 38386881
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38386249 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgactttacatgcgctagtgttatttgtaagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 38386348  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38386349 acatgtgctagtgtattgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgcgagttaactcatgttcatagctgacaacagaaactgcaataa 38386448  T
Q  241 atgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatta 339  Q
    ||||| ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  38386449 atgcagtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaagatta 38386548  T
Q  340 tcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcaca 439  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38386549 tcggataatacgacataattgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcaca 38386648  T
Q  440 aagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacata 539  Q
    || |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38386649 aatttaccggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacata 38386748  T
Q  540 ttggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  38386749 ttggccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccgaccgatccaaaagtg 38386847  T
Q  640 tcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38386848 tcataacctatctaactagactagtgatagtgca 38386881  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 5175 - 4552
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5175 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagcagcgtgacttaacatacgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagtgcaagtta 5076  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5075 acatgcgctagtgtattgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactcgcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacaaaaactgcaataa 4976  T
Q  241 atgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatta 339  Q
    ||||| || |   |||||| ||    ||||||| | ||||||||    |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  4975 atgcagtgtagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacttgtaatcactccacattcataacttaaccgaactacgccagtttaacaagatta 4876  T
Q  340 tcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcaca 439  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         | |||||||||||    
T  4875 tcagataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacattcacgtaatcacacataaacga---------ttcaaatttcaca 4785  T
Q  440 aagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacata 539  Q
     | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4784 gattcgccgttaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcattttatttatttatttaatattagttacata 4685  T
Q  540 ttggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||    
T  4684 ttggccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccgaccgatctaaaagtg 4586  T
Q  640 tcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4585 tcataacctatctaactagactagtgatagtgca 4552  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Original strand, 38047721 - 38048340
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38047721 tgcgctagtacaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgtttagcgcaagtta 38047820  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgcca-tttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaata 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38047821 acatgcgctagtgtattgtgaaacgtgagttaactcacgttatcattttgcactagcgtgagt----tcacgttcatagcagacaacagaaacttcaata 38047916  T
Q  240 aatgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatt 338  Q
    |||||| ||||   ||| || ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||   | ||||||||||||    
T  38047917 aatgcagtgcagtaacataactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaatcgaattacgtcaatttaacaagatt 38048016  T
Q  339 atcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcac 438  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  38048017 at-ggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatagtttttctcacaatcacataatcacacataa---------acggtccaaatttcac 38048106  T
Q  439 aaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacat 538  Q
    ||| || | |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38048107 aaattccctgataattacccgtaataatttaaactcacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacat 38048206  T
Q  539 attggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38048207 attggccataaatatcaaaattacacaatcggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccgaccgacccaaaagt 38048305  T
Q  639 gtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38048306 gtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 38048340  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 220 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 19364011 - 19363560
Alignment:
Q  220 agacaacagaaactgcaataaatgcatgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaatt 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |  |||| || | ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19364011 agacaatagaaactgcaataaatgca-gtagttacaaaactatcttttgaaaagtctagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaatt 19363913  T
Q  320 acacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatc 419  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19363912 acgccagtttaagaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatc 19363813  T
Q  420 cagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatt 519  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19363812 caaacggtccaaatttcacaaattcgccggtaatgacctgtaataatttaaacacacttaatgacaggtaaacgatccaaaataattcatttcatatata 19363713  T
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  19363712 tatataatattagttacatattagccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccactaaaatatatgacgaa 19363614  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19363613 catcgatcgatccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 19363560  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44226283 - 44226109
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagac 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  44226283 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcacataatcacacataa-cgatccaaac 44226185  T
Q  425 ggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44226184 ggtccaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 44226109  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19365398 - 19365216
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| || | ||||    
T  19365398 tgcgctagtgcaaattagaacgtaatttaagatatgttgcgtaagttaacatgcactagtgttaattgtgtgttatctgttgaatactta-cgtatgtta 19365300  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagaca 224  Q
    |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19365299 acatgccctactgtattgtttaacgtgagttaactcacgtttccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagaca 19365216  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 302 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23943554 - 23943354
Alignment:
Q  302 tcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattact-aaaaaatatcgtttttct--cacaatca 398  Q
    |||||| | ||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||| ||||||||| |  ||||||||    
T  23943554 tcataattgaaccgaattacgctaatttaacaagattattggataatacgacaaaatcgatcaaaattacacaaaaaacatcgtttttttttcacaatca 23943455  T
Q  399 cgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatcca 498  Q
    | |||||| |||||| | ||||| || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23943454 cataatcagacataa-caatccaaacagttcaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatcca 23943356  T
Q  499 aa 500  Q
    ||    
T  23943355 aa 23943354  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8378108 - 8377962
Alignment:
Q  46 tagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacatg 145  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  8378108 tagtgtaaattataacgtaacttcagataatttgcgtaagttaacatgcgctagtattatttgtgtgttatttgttgaatacttaacataagttaacatg 8378009  T
Q  146 cgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcac 192  Q
    | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8378008 cactaatgtattatgtaacgtgagttaactcacgttgtcatttgcac 8377962  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 498 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 44225488 - 44225336
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||       || |||||||||||    
T  44225488 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaa-tacgtcggggtgta 44225390  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  44225389 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 44225336  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 463
Target Start/End: Original strand, 10525960 - 10526124
Alignment:
Q  299 cattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatca 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||  ||||| || ||||||| ||||||||    
T  10525960 cattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaacattatcagataatacgacattatcaatcaaaattacacaaaaacatagtttttcgcacaatca 10526059  T
Q  399 cgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaat 463  Q
    |||||||||  |||||| ||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  10526060 cgtaatcaccaataaacaatcaaaatggtccaaattacacaaattcgccggtaataacccgtaat 10526124  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 497
Target Start/End: Original strand, 12168500 - 12168681
Alignment:
Q  316 aattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaac 415  Q
    |||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||| ||  |||||||| |||| || ||||||     
T  12168500 aattacgctagtttaacaacattatcagataatacgacataatcgatccaaattacacaaaatcatcgtttatcatacaatcacataataacgcataaaa 12168599  T
Q  416 gatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatcc 497  Q
    ||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||  |||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12168600 gattcaaacgatccaaattacacaaattcgtcgttaatgacgcgtaatcacttaattacacttaatgacacgtaaacgatcc 12168681  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 640
Target Start/End: Original strand, 2368802 - 2368921
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2368802 tatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacatgaccggccaccaaaaaa-tacgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 2368900  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgt 640  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  2368901 caccgaccgaccaaaaagtgt 2368921  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 26151885 - 26151808
Alignment:
Q  591 ggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26151885 ggtgtaatatcaacaaaaaataggacaaacaccaacaaa----aaagtgtcataacctatctaactag-ctagtgatagtgca 26151808  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 604 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 24503445 - 24503381
Alignment:
Q  604 caaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgc 672  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24503445 caaaaaataggacaaacaccgaccaa----aaagtctcataacctatctaagtagtctagtgatagtgc 24503381  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 24503537 - 24503484
Alignment:
Q  510 ttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattaca 563  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24503537 ttcatatatttatacaatattagttaaatattggccacaaatatccaaattaca 24503484  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 421
Target Start/End: Original strand, 29248679 - 29248720
Alignment:
Q  380 atcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatcca 421  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29248679 atcgtttttctcaaaatcacataatcacacataaacgatcca 29248720  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12168374 - 12168325
Alignment:
Q  162 aacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12168374 aacgtgagttaactcacattgaaatttacactagcttgagttaactcacg 12168325  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12868981 - 12868916
Alignment:
Q  604 caaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatag 669  Q
    |||||||||||||||||||| || ||   |||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  12868981 caaaaaataggacgaacaccaacaaaaaaaaaaatgtcatagcctatctaactagcttagtgatag 12868916  T

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Target: chr1 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 673
Target Start/End: Original strand, 33617911 - 33618521
Alignment:
Q  49 tgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacatgcgc 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33617911 tgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttcaatgcttagcgcaagttaacatgtgc 33618010  T
Q  149 tagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcatgc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            
T  33618011 tagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcaccagcgtgagttaactcacgttcatagctgacaacagaaactgcaataa-------- 33618102  T
Q  249 aagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataat 348  Q
         ||||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33618103 -----cagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaagattatcggataat 33618197  T
Q  349 acgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccg 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  33618198 acgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaa-ggtccaaatttcacaaattcgccg 33618296  T
Q  449 gcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccata 548  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33618297 gtaattatccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattggccata 33618396  T
Q  549 aatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaata-ggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacc 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33618397 aatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaaaattgacgaacactgaccgacccaaaagtgtcataacc 33618495  T
Q  648 tatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33618496 tatctaactagactagtgataatgca 33618521  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Original strand, 33401483 - 33402094
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||    
T  33401483 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgt-----------tgaatgcttagcgcaagtta 33401571  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33401572 acatgtgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcatgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagaca-cagaaactgcaataa 33401670  T
Q  241 atgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatta 339  Q
    ||||| |||||  |||||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  33401671 atgcagtgcaataacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaagatta 33401770  T
Q  340 tcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcaca 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||    
T  33401771 tcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacga---------tccaaatttcaca 33401861  T
Q  440 aagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacata 539  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33401862 aattcgccggtaattatccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacata 33401961  T
Q  540 ttggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  33401962 ttggccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaaattgacgaacaccgaccgacccaaaagtg 33402060  T
Q  640 tcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33402061 tcataacctatctaactagactagtgatagtgca 33402094  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 197 - 673
Target Start/End: Original strand, 28474981 - 28475450
Alignment:
Q  197 gtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcatgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||     
T  28474981 gtgagttaactcacgttcatagcagacaacat------caataaatgcaggcagttacagaactgtcttttgaaaaatttagaatgacccgtaatcacgc 28475074  T
Q  297 cacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaat 396  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28475075 cacattcataacttaaccgaattacaccagtttaagaagattatcggataatgcgacttaatcgatccaaattactcaaaaacattgtttttctcacaat 28475174  T
Q  397 cacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28475175 cacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcacaaattcgctggcaatgacctgtaataatttaaacacacttaatgacacataaacgatc 28475274  T
Q  497 caaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||       ||||  ||||||||    
T  28475275 caaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattggctgtaaatatcaaaattacacaaccgaccacc-aaaaaatatgatggggtgta 28475373  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28475374 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagcgatagtgca 28475450  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 64 - 609
Target Start/End: Original strand, 35563595 - 35564108
Alignment:
Q  64 aacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacatgcgctagtgtattgtgcaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35563595 aacttaagataagtagcgtgacttaacatgcactagtgttatttgtgatttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacatgcgctagtgtattgtgcaa 35563694  T
Q  164 cgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgca-tgcaagtacagaattgt 262  Q
    ||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  | |||| ||     
T  35563695 cg---------------tgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacaaaaactgcaataaatgtagtgcaataatagaactga 35563779  T
Q  263 cttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgat 362  Q
       ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  35563780 aacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgtcagtttaaccagattatcagataatacgacataatcga- 35563878  T
Q  363 tcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaa 462  Q
          | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  35563879 ------tcctcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcacaaattcgccggtaattacctgtaa 35563972  T
Q  463 taatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattac 562  Q
    ||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35563973 taatttaaac------aatgacacgtaaacaatccaaaata----atttcatatatttatataatattagttacatattggccataaatatcaaaattac 35564062  T
Q  563 acaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaa 609  Q
    ||||  |||| ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  35564063 acaaatggcctcc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaa 35564108  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 266 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 48026907 - 48026502
Alignment:
Q  266 ttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattca 365  Q
    ||||||| | |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  48026907 ttgaaaagtgtagattgacccgtaatcacgccacattcataacttaatcgaattacgctagtttaacaagattattggataacacaacataatcgatcca 48026808  T
Q  366 aattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataa 465  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  48026807 aattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcaaaaattcgtcggtaattacccgtaataa 48026708  T
Q  466 tttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacaca 565  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48026707 tttaaacacacttaatgacatgtaaacgatccaaaataattcattacatatatttatataatattagttacatattgaccataaatatcaaaattacaca 48026608  T
Q  566 atcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtg 665  Q
    | |||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48026607 accggccatc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatatgacgaacaccgacctatccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtc 48026509  T
Q  666 atagtgc 672  Q
    |||||||    
T  48026508 atagtgc 48026502  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Original strand, 33617719 - 33617915
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33617719 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttcaatgcttagcgcaggtta 33617818  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaa 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33617819 acatgtgctagtgtattgtgcaatgtgagttaactcacgtggccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaa 33617915  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48027099 - 48026915
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48027099 tgcgttagtgcaaattataacgtaatttaagataagtagcgtgacttaaaatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttaacgcaagtta 48027000  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaa 225  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48026999 acatgtgctagtgtattgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtaagttaactcacgttcatagtagacaa 48026915  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 329 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23943466 - 23943295
Alignment:
Q  329 taacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaga-cggt 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  23943466 taacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcatttttttcacaatcacataatcacacataa-cgatccaaaacggt 23943368  T
Q  428 ccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23943367 ccaaattacacaaattcgccggtaatgacacgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaagcgatccaaa 23943295  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 35563450 - 35563535
Alignment:
Q  64 aacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacatgcgct 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35563450 aacttaagataagtagcgtgacttaacatgcactagtgttatttgtgatttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacatgcgct 35563535  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1181313 - 1181148
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagac 424  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||          |    
T  1181313 agtttaataagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacgtcgtttttttcacaatcacataatcacacataa----------c 1181224  T
Q  425 ggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1181223 gatccaaattccacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacataaacgatccaaa 1181148  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12067815 - 12067650
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagac 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||          ||    
T  12067815 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcacataatcactcata----------ac 12067726  T
Q  425 ggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    | |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12067725 gatccaaacttaacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacataaacgatccaaa 12067650  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 477
Target Start/End: Original strand, 36183078 - 36183234
Alignment:
Q  315 gaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaa 414  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||      |    
T  36183078 gaattacgccagtttaacaagattatcggataatatgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgtttttctcacaatcacataatcac------a 36183171  T
Q  415 cgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacact 477  Q
    ||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36183172 cgatccaaacggaccaaattacaaaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacact 36183234  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 498 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 12067081 - 12066929
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||       || |||||||||||    
T  12067081 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccacc-aaaaaatacgtcggggtgta 12066983  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || |||| ||||||||    
T  12066982 ataccaccaaaaaataggacgaacaccaaccgacctataaatgtcctaacctat 12066929  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 593 - 673
Target Start/End: Original strand, 7318925 - 7319005
Alignment:
Q  593 tgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7318925 tgtaatactacaaaaaaatatgacgaacaccgaccgaccaaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgataatgca 7319005  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 513 - 627
Target Start/End: Original strand, 30704112 - 30704225
Alignment:
Q  513 atatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaata 612  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| |       |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30704112 atatatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccatcaaaaaa-tatgtcggggtgtaataccaccaaaatata 30704210  T
Q  613 ggacgaacaccgacc 627  Q
    |||||||||||||||    
T  30704211 ggacgaacaccgacc 30704225  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Original strand, 30703304 - 30703466
Alignment:
Q  327 tttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacgg 426  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||| ||| ||||| ||||||  || |||||||||||||          ||     
T  30703304 tttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattac-acaaaacatcatttttttcacaactacataatcacacataa----------cga 30703392  T
Q  427 tccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30703393 tccaaattacacaaatttgccggtaatgatccgtaatcacttaaacacacttaatgacatgtaaacgatccaaa 30703466  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 25819107 - 25818876
Alignment:
Q  168 agttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgca-tgcaagtacagaat-tgtctt 265  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | | |  ||  || |||||||| |||||  || |||  ||| ||    
T  25819107 agttaattcacgttgccatttacactagcgtgggttaactcacgttcatagcagtaagcggttacaacattaaatgcagtgcaac-actgaacatgt-tt 25819010  T
Q  266 ttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattca 365  Q
    ||| ||| ||   ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |  ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||    
T  25819009 ttggaaagtcataaatgacccgtaatcacgccacgttcataacttaaccgaattacgccatattaacaatattataagataatacaacataatcgatcca 25818910  T
Q  366 aattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcac 399  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  25818909 aattacacaaaatcatcgtttttctcacaatcac 25818876  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31206742 - 31206699
Alignment:
Q  168 agttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31206742 agttaactcaagttgccatttgcactagcgtgagttaactcacg 31206699  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 181
Target Start/End: Original strand, 28474943 - 28474997
Alignment:
Q  127 cttagcgcaagttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgtt 181  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28474943 cttagcgtaagttaacatgggctagtgtattgtgtaatgtgagttaactcacgtt 28474997  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 23942698 - 23942632
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattaca 563  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23942698 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatacaaattaca 23942632  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37259421 - 37259379
Alignment:
Q  164 cgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37259421 cgtgagttaactcacgttgccatttacactagcgtgaattaac 37259379  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25818842 - 25818809
Alignment:
Q  467 ttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25818842 ttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 25818809  T

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Target: chr6 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Original strand, 12703889 - 12704524
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaa---- 136  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| | ||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |        
T  12703889 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagctacgttgcgtaagttaacacacgttagtgttatttgtgtgttatttgtagaatacttagcgttaatta 12703988  T
Q  137 gttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgca 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12703989 gttaacatgcgctagtatattgtgtaacgtgatttaactcacgttgccatttgcactagtgtgagttaactcacattcatagcagacaacagaaactgca 12704088  T
Q  237 ataaatgcatgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaaga 336  Q
    ||||||||| |||  |||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  12704089 ataaatgcaggcagttacaaaactgtcttttgaaaagtctagaatgacctgtaatcacgccacattcataacttaactgaattaccctagtttaagaaga 12704188  T
Q  337 ttatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12704189 ttatcggataatacgacataatcgatcctaattactcaaaaacatcgtttttttgacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttc 12704288  T
Q  437 acaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttac 536  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12704289 acaaattcgccggtaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgatacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttac 12704388  T
Q  537 atattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12704389 atattggccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacactgaccgacccaaaa 12704487  T
Q  637 gtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12704488 atgtcatatcctatctaactagactagtgatattgca 12704524  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 673
Target Start/End: Original strand, 4319163 - 4319791
Alignment:
Q  45 ctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacat 144  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||  | || | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  4319163 ctagtgcaaattagaacgtaacttaagatacattgcataagttaacatgcgctagtgttaattgtgtgttatttgttgaatacttagtgtatgttaacat 4319262  T
Q  145 gcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgc 244  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4319263 gtgctagtgtattgtttaacgtgagttaactcacgtctccatttgcactagcgtgagttaactcaccttcatagtagacaacggaaactgcaataaatgc 4319362  T
Q  245 atgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcgga 344  Q
    | |||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  4319363 aggcagttacagaactgtcttttcaaaagtctagaatgacccgtaatcacgccacactcataacttaaccgaattacgccagtttaagaagattatcgga 4319462  T
Q  345 taatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaat--cacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaag 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  4319463 taatacgacataatcgatccaaattact-caaaacatcgtttttctcacaattacgtaatcacacacataaacgatctaaacggtccaaatttcacaaat 4319561  T
Q  443 tcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattg 542  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4319562 tcgccggtgatgacccgtaataatttatacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataataatagttacatattg 4319661  T
Q  543 gccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtca 642  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4319662 gccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcagggtgtaataccaccaaaaaattggacgaacaccgaccgacccaaaagtgtca 4319760  T
Q  643 taacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4319761 caacctatctaactagactagtgatagtgca 4319791  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 673
Target Start/End: Original strand, 31483798 - 31484345
Alignment:
Q  127 cttagcgcaagttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaac 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483798 cttagcgtaagttaacatgcgctagtgtaatgtgtaacgtgagttaactcacgttgccatttgtactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaac 31483897  T
Q  227 agaaactgcaataaatgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaa 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  31483898 agaaactgcaataaatgcagtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgaccagtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgcca 31483997  T
Q  326 gtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31483998 gtttaacaagattatcggataatacaacataatagatcaaaattacttaaaaacatcgtttttctcacaattacgtaatcacacataaatgatccaaacg 31484097  T
Q  426 gtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatata 525  Q
    |||||||||| | ||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484098 gtccaaatttaaaaaattcaccggtaatgtcccgtaacaatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatata 31484197  T
Q  526 atactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccacc-aaaaaataggacgaacaccg 624  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |       ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31484198 atattagttacatattggccataaatatcaaaattacacaaccggccatc-aaaaaatatttcggggtgtaataccaccaaaaaaataggacgaacaccg 31484296  T
Q  625 accaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484297 accgacccaaaagggtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 31484345  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 220 - 673
Target Start/End: Original strand, 32274714 - 32275167
Alignment:
Q  220 agacaacagaaactgcaataaatgcatgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaatt 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32274714 agacaacagaaactgcaataagtgcaggcagttacagaactgtcttttgaaaagtttagaatgacccgtaatcacgacacattcataacttaaccgaatt 32274813  T
Q  320 acacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatc 419  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32274814 acgccagtttaagaagattatcgaataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatc 32274913  T
Q  420 cagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatt 519  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32274914 caaacggtccaaatttcacaaattcgccgataatgacccgtaataatttaaacacactcaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatt 32275013  T
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32275014 tatataatattaggtacatattggccataaatatcaaaattacacaaccagccaccaaaaaaatatgtcggggtgtaataccaccaaaaaatataacgaa 32275113  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32275114 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaacaagactagtgatagtgca 32275167  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 318 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1031552 - 1031372
Alignment:
Q  318 ttacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacga 417  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1031552 ttacaccagtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacattgttttt-tcacaatcacataatcacacataa-cga 1031455  T
Q  418 tccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1031454 tccaaacggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaatcatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 1031372  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 32274259 - 32274435
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || || | | ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  32274259 tgcgctagtgcaaattagaacataacttaagatatgttgcctaagttaacatgcactagtgttaattgtgtgttatttgttgaatacttagcgtatgtta 32274358  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcata 217  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32274359 acatgcgccagtgtattgtgtaacgtgagttaactcacgtttccatttgctctagcgttagttaactcacgttcata 32274435  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 498 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 1030745 - 1030593
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||       || |||||||||||    
T  1030745 aaaataattcatctcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaa-taagtcggggtgta 1030647  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  1030646 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 1030593  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 327 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23236308 - 23236171
Alignment:
Q  327 tttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacgg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23236308 tttaacaagattatcggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgtttttctcacaataacataatcacacat-aacgatccaaacgg 23236210  T
Q  427 tccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataa 465  Q
    |||||||| |||| | ||||| | | |||||||| ||||    
T  23236209 tccaaattacacatattcgcccgtagtgacccgttataa 23236171  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 17436544 - 17436495
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaac 90  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  17436544 tgcgctagtgcaaattacaacgtaacttaagatgcgttgcgtgacttaac 17436495  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23232229 - 23232184
Alignment:
Q  455 acccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23232229 acccgtaatcacttaaacacactaaatgacacgtcaacgatccaaa 23232184  T

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Target: chr3 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Original strand, 39645849 - 39646467
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||| | ||||||||| ||||||||||||||            |||| || |||| ||||||    
T  39645849 tgcgctagtgcaaattataatgtaacttaagctacgttgcgtaagttaacatgcactagtgttatttgta-----------gaatact-agcgtaagtta 39645936  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39645937 acatgcgctagtgtattgtgtaacgtgagttaacccacgttgcaatttgcactagcgtgagctaactcacgttcattgcagacaacagaaactgcaataa 39646036  T
Q  241 atgcatgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattat 340  Q
    ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  39646037 atgcaggcagttacagaactgt-ttttgaaaagtctagaatgacccgtaatcacgccacattcgtaacttaactgaattacgttagtttaagaagattat 39646135  T
Q  341 cggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaa 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39646136 cggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatagtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacaatccaaacggtccaaatttcacaa 39646235  T
Q  441 agtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatat 540  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39646236 attcgccggtaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatat 39646335  T
Q  541 tggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgt 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39646336 tggccataaatatcaaaattacacaacctgccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaatgggacgaacaccgaccgacccaaaagtgt 39646434  T
Q  641 cataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646435 cataacctatctaactagactagtgatagtgca 39646467  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 35069290 - 35068668
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatg-cttagcgcaagtt 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| |||||||            ||||  ||||||| |||||    
T  35069290 tgcgctagtgcaaattacaacgtaacttaagatacgttgcgtaggttaacatgcgctagtgatatttgta-----------gaataacttagcgtaagtt 35069202  T
Q  140 aacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaata 239  Q
    ||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35069201 aacattcgttagtgtaatgtgtaatgtgagttaactcacgttgacatttgtactagcgcgagttaactcacgttcatagcagacatcagaaactgcaata 35069102  T
Q  240 aatgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatt 338  Q
    |||||| ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||    ||||||||||||||    
T  35069101 aatgcagtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacatttataacttaaccgaattatgtcagtttaacaagatt 35069002  T
Q  339 atcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcac 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35069001 atcagataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacattgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaactatccaaacggtccaaatttcac 35068902  T
Q  439 aaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacat 538  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35068901 aaattcgccggtaatgacccgtaataatttaaacacaattaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacat 35068802  T
Q  539 attggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagt 638  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||       |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  35068801 attggccataaatatcaaaattatacaaccggccacc-aaaaaatatgtcagggtgtaataccacaaaaaaatatgacgaacaccgaccgactcaaaagt 35068703  T
Q  639 gtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35068702 gtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 35068668  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 41 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 19872144 - 19871628
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  19872144 tgcgttagtgcaaactataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaaaatgtgttagtgttatttgtgagttacttatcgaatgcttagcgcaagtta 19872045  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19872044 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaacttacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacataaactgcaataa 19871945  T
Q  241 atgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagatta 339  Q
    ||||| ||||   | |||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  19871944 atgcagtgcagtaagagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgtcagtttaacaagatta 19871845  T
Q  340 tcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcaca 439  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||    
T  19871844 tcggataatatgacataatcgatctaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatc------------------ca 19871763  T
Q  440 aagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacata 539  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19871762 aattcgccggtaattacccgtaataatttaaacacactttatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacata 19871663  T
Q  540 ttggccataaatatcaaaattacacaatcggccac 574  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19871662 ttgaccataaatatcaaaattacacaaccggccac 19871628  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 194 - 673
Target Start/End: Original strand, 34084310 - 34084784
Alignment:
Q  194 agcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcatg-caagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  |||||| ||    ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  34084310 agcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacaaaaacggcaataaatgcaaggcaataacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccataatc 34084409  T
Q  293 acgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctca 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34084410 acgtcacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctca 34084509  T
Q  393 caatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaac 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34084510 caatcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcacaaattcgccggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaac 34084609  T
Q  493 gatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcgggg 592  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||       ||||||||||    
T  34084610 gatccaaaatagttcatttcatatatttatataatattagttacgtattggccataaatatcaaaattacacaaccgaccacc-aaaaaatatgtcgggg 34084708  T
Q  593 tgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||     ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34084709 tgtaataccaccaaaaaatatgacgaa-----accgacccaaaaatgtcataacctatctaactaaactagtgatagtgca 34084784  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 45 - 470
Target Start/End: Original strand, 15040760 - 15041186
Alignment:
Q  45 ctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagttaacat 144  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15040760 ctagtgcaaattataacgtagcttaagataaatagcgtgacttaacatgtgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagtgcaagttaacat 15040859  T
Q  145 gcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgc 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15040860 gcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactaacgttagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgc 15040959  T
Q  245 a-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcgg 343  Q
    | ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15040960 agtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgaccagtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaagattatcgg 15041059  T
Q  344 ataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagt 443  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15041060 ataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacattgtttttctcacaatcatgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcacaaatt 15041159  T
Q  444 cgccggcaatgacccgtaataatttaa 470  Q
    || ||| ||| | ||||||||||||||    
T  15041160 cgtcggtaattatccgtaataatttaa 15041186  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 138 - 491
Target Start/End: Original strand, 7665853 - 7666197
Alignment:
Q  138 ttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7665853 ttaacatgcgctagtgtattgtgaaacgtgaattaactcacgttgtcatttgcactagtgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaa 7665952  T
Q  238 taaatgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaaga 336  Q
    |||||||| ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  7665953 taaatgcagtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacctgtaatcacaccacattcataacttaaccgaattatgccagtttaacaaga 7666052  T
Q  337 ttatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |         ||||||||||    
T  7666053 ttatcggataatacgacataatcgatccaaatt-ctcaaaaacattgtttttctcacaatcacttaatcacacataaacaa---------tccaaatttc 7666142  T
Q  437 acaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaa 491  Q
    | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7666143 agaaattcgccggtaattacccgtaataatttaaacatacttaatgacacgtaaa 7666197  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Original strand, 34082914 - 34083074
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34082914 tgcgctggtacaaattataacataacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 34083013  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgag 201  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34083014 acatgcactagtgtattgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgag 34083074  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 315 - 500
Target Start/End: Original strand, 20513713 - 20513897
Alignment:
Q  315 gaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaa 414  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||    
T  20513713 gaattacgccagtttaacaagattatcggatcatacgacataatcgatccaaattacacaaaaacatcgtttttctcataatcacataatcacacgt-aa 20513811  T
Q  415 cgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| | |||| |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  20513812 cgatccaaacggtccaaattacacaaattcaccggtaatgacccgtaatcacttaatcacaattaacgatacgtaaacgatccaaa 20513897  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 54336575 - 54336403
Alignment:
Q  327 tttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacgg 426  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||    
T  54336575 tttaacaaaattatcggataatatgacataatcgttcaaaattacacaaaaacgtcgtttttctcacaatcacataatcacacataa-cgatcaaaacgg 54336477  T
Q  427 tccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54336476 tccaaatttcacaaatttgccggtaatgacctgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 54336403  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 325 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 53772101 - 53771936
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagac 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||    
T  53772101 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttt-tcacaatcacataatcacacgtaat-gatccaaac 53772004  T
Q  425 ggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaac 492  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  53772003 ggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaatcacttaaacactcttaatgacacgtaaac 53771936  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 600 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 19871631 - 19871558
Alignment:
Q  600 ccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19871631 ccacaaaaaaataggatgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 19871558  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 498 - 650
Target Start/End: Original strand, 30930404 - 30930556
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||       || ||||||||| |    
T  30930404 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatatttgccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaa-tacgtcggggtgaa 30930502  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  30930503 ataccacaaaaaaataggacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 30930556  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 102
Target Start/End: Original strand, 7665808 - 7665869
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7665808 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgt 7665869  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 498 - 650
Target Start/End: Original strand, 14439627 - 14439778
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||       ||  | ||||||||    
T  14439627 aaaataattcatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccacc-aaaaaatacattggggtgta 14439725  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  14439726 ataccaccaaaaaataggac-aacaccgaccgacctataagtgtcctaacctat 14439778  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 27933829 - 27933683
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||       || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27933829 tatataatgttagttacatattggccacaaatattcaaattacataaccggccaccaaaaaa-tacgtcgg--tgtaataccaccaaaaaataggacgaa 27933733  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  27933732 caccgacca----aaaagtgtcataatcaatctaattagactagtgatagtgca 27933683  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 520 - 650
Target Start/End: Original strand, 20514680 - 20514809
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||        |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20514680 tatataatattagttacatattggccacaaatctccaaattacataaccggccacccaaaaaa-atgttggggtgtaatatcaccaaaaaataggacgaa 20514778  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  20514779 catcgaccgacctaaaagtgtcataatctat 20514809  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 520 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 54336245 - 54336116
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||       || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  54336245 tatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccgaccaccagaaaa-tacgtcgggatgtaataccaccagaaaataggacaaa 54336147  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  54336146 cattgaccgaccaaaaagagtcataacctat 54336116  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 30530770 - 30530706
Alignment:
Q  605 aaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30530770 aaaaaataggacggacaccgaccaa----aaagtgtcataacctatctaactagactaatgatagtgca 30530706  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11423046 - 11423001
Alignment:
Q  161 caacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaac 206  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  11423046 caacgtgagttaactcacattgcaatttacactagcgtgagttaac 11423001  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 30530862 - 30530809
Alignment:
Q  510 ttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattaca 563  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  30530862 ttcatatatttatataatattagttacataatgagcacaaatatccaaattaca 30530809  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 30531561 - 30531441
Alignment:
Q  380 atcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacactta 479  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||| || | | | |||||| |||||| ||| ||  |||||| | ||||   |||| ||||||||    
T  30531561 atcgtttatcactcaatcacataatcacacataaatgattcaaatgattcaaattacacaaattcgtcgttaatgacgcataatctcttaatcacactta 30531462  T
Q  480 atgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  30531461 atgacacatagacgatccaaa 30531441  T

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Target: chr2 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 127 - 673
Target Start/End: Original strand, 8273396 - 8273942
Alignment:
Q  127 cttagcgcaagttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaac 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8273396 cttagcgtaagttaacatgcgctagtgtaatgtgtaacgtgagttaactcacgttgacatttgtactagcgtgagttaactcacgttcatagcacacaac 8273495  T
Q  227 agaaactgcaataaatgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaa 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  8273496 agaaactgcaataaatgcagtgcagtaacagaactgaaatttgaaaagtgtagaatgatccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgcca 8273595  T
Q  326 gtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8273596 gtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaaaacatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccaaaca 8273695  T
Q  426 gtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatata 525  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8273696 ttccaaatttcacaaattcaccggtaatgactcgtaataatttaaaaacacttaatgacacataaacgatccaaaataattcatttcatatatttatata 8273795  T
Q  526 atactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccga 625  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8273796 atattagttacatattgaccataaatatcaaaattacacaaccggccacc-aaaaaatatgtcggggtgtaataccacaaaaaaataggacgaacatcga 8273894  T
Q  626 ccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8273895 ccgacccaaaagtgtcataacctatctaactaaactagtgatagtgca 8273942  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 136 - 500
Target Start/End: Original strand, 22727915 - 22728279
Alignment:
Q  136 agttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgc 235  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  22727915 agttaacatgcgctagtgtaatttgtagcgtgagttaactcacgttgccatttgcactaacgtgagttaactcacgtttttagtagacaacagaaacaac 22728014  T
Q  236 aataaatgcatgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaag 335  Q
    | | ||||||  ||  ||| | |    ||||  |||| ||||||||||  | |||||||| |  |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||     
T  22728015 atttaatgcaatcagttactgcacatactttcaaaaagtctagaatgactcgtaatcacgccgtattcataacttacccgaattacgccagtttaacaac 22728114  T
Q  336 attatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaattt 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||     
T  22728115 attatcagataatacgacataatcgatccaaattacacaaaaacatcatttttctcacaatcacataatcacccataaacgaaccaaacggtccaaatta 22728214  T
Q  436 cacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22728215 cacaaattcgctggtaatgacccgtaatgacttaaacacatttaatgacacgtaaatgatccaaa 22728279  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 167 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 35004812 - 35004479
Alignment:
Q  167 gagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgca-tgcaagtacagaattgtctt 265  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||| | |||| |||| |||     ||    
T  35004812 gagttaactcacgttatcatttgcactagtgtgagttaactcacgtttatagcagaaagcagaaactgcatttaatgtagtgca-gtactgaacaagttt 35004714  T
Q  266 ttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattca 365  Q
    ||| ||| ||   ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  35004713 ttggaaagtcataaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgccagtttaacaacattatcatataatacgacataatcgatcca 35004614  T
Q  366 aattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataa 465  Q
    ||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||  | || ||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||| |    
T  35004613 aattacacaaaattattgtttttcgcacaatcaaattattaccaataaacgatccaaacggttcaaattacacaaattcgtcgataatgacccgtaatca 35004514  T
Q  466 tttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35004513 ctaaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 35004479  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 498 - 673
Target Start/End: Original strand, 26225153 - 26225332
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatttatataatac------tagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggg 591  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||    
T  26225153 aaaataattcattt-atatatttatataatatataatatagttacatattgatcataaatatccaaattacacaatcggccaccaaaaaa-tatgtcggg 26225250  T
Q  592 gtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26225251 gtgtaataccacaaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacgtatctacctagactagtgatagtgca 26225332  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19380032 - 19379859
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagac 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  19380032 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgaacaaaattacacaaaaacatcatttttttcacaatcacataatcacacataa-cgatccaaac 19379934  T
Q  425 ggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19379933 ggtccaaattacacaaattcgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacaagt-aacgatccaaa 19379859  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 500
Target Start/End: Original strand, 9826908 - 9827091
Alignment:
Q  315 gaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaa 414  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9826908 gaattacgctagtttaacaagattgtcagataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacattgtttttctcacaatcacataatcacacat-aa 9827006  T
Q  415 cgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||  | | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9827007 cgatccaaacggtccgaattacacaaattcatcagtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaat-acacgtaaacgatccaaa 9827091  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 498 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 35003891 - 35003718
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaa 597  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |  || |||||       ||  |||||||||||    
T  35003891 aaaatatttcatttcatatatttatataatattagttacatattgaccacaaatatccaaattacatatccgaccaccaaaaaa-tacatcggggtgtaa 35003793  T
Q  598 taccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35003792 taccaccagaaaataggacgaacaccga-cgacctaaaagtgacataacctatctaactaggctattgatagtgca 35003718  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 222
Target Start/End: Original strand, 26224246 - 26224332
Alignment:
Q  136 agttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcaga 222  Q
    |||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224246 agttaacatgcgctagtgttaattgcagcgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcaga 26224332  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 650
Target Start/End: Original strand, 22728878 - 22729007
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||  |||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22728878 tatataatattagttacatattggccacagatatccaaattaaataactggccacccaaaaa-tacgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 22728976  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22728977 caccgatcgacctaaaagtgtcataacctat 22729007  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 520 - 648
Target Start/End: Original strand, 9827724 - 9827851
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||       || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9827724 tatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccaccaaaaaa-tacgtcggggtgtaataccacaaaaaaataagacgaa 9827822  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacct 648  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  9827823 caccgaccgacctataagtgtcctaacct 9827851  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Original strand, 26224463 - 26224547
Alignment:
Q  416 gatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224463 gatccaaacggtcaaaattacacaaattcgtcggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 26224547  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 673
Target Start/End: Original strand, 14330099 - 14330177
Alignment:
Q  591 ggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14330099 ggtgtaatatcgacaaaaaataggacgaacaccgaccaa----aaactgtcataatctatctaactagactagtgatagtgca 14330177  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 367
Target Start/End: Original strand, 26224391 - 26224470
Alignment:
Q  288 taatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaa 367  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26224391 taatcacgccacattcatgacttaaccgaattacgtcagtttaacaacattatcagataatacgacataatagatccaaa 26224470  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28758498 - 28758457
Alignment:
Q  505 ttcatttcatatatttatataatactagttacatattggcca 546  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28758498 ttcacttcatatatttatataatactagttacatattggcca 28758457  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26224242 - 26224195
Alignment:
Q  160 gcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaact 207  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26224242 gcaacgtgtgttaacttacgttgacatttgcactagtgtgagttaact 26224195  T

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Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 196 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 34279441 - 34278964
Alignment:
Q  196 cgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcatgcaagta-cagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| |     ||||||| | |||||||| || |||||||    
T  34279441 cgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataaatgcagtgtagtaacagaactaaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcac 34279342  T
Q  295 gtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcaca 394  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34279341 gccacattcataacttaaccgaattatgccagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgatccaaattactcaaacacatcgtttttctcaca 34279242  T
Q  395 atcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacga 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279241 atcacgtaatcacacataaacgatccaaacggtccaaatttcacaaattcgtcggtaattacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacga 34279142  T
Q  495 tccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtg 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||       ||||||||||||    
T  34279141 tccaaaataattcatttcatatatttatataatattagttacatattggccataaatataaaaattacacaaccgaccacc-aaaaaatatgtcggggtg 34279043  T
Q  595 taataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34279042 taataccaccaaaaaataagacgaacaccgatcgatccaaaagtgtcataacctatctaactaaaatagtgatagtgca 34278964  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 383 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 5966944 - 5966655
Alignment:
Q  383 gtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatg 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5966944 gtttttctcacaatcacataatcacacataaacgatccaaacggtccacatttcacacattcgtcggtaatgacccgtaataatttaaacacacttagtg 5966845  T
Q  483 acacgtaaacgatccaaaataattcatttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnn 582  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||           
T  5966844 acacgtaaacgatccaaactaattcatttcatatatttatataatattagttacatattggtcataaatatcaaaattacacaaccggtcacc-aaaaaa 5966746  T
Q  583 tatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5966745 tatgtcgaggtgtaataccacaaaaaaataggacgaacaccgaccgacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 5966655  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5967240 - 5966959
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5967240 tgcgctagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagtgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgtgttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 5967141  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaataa 240  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5967140 acatgcgctagagtattgtgaaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaaaagaaactgcaataa 5967041  T
Q  241 atgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattac 321  Q
    ||||| ||||   |||||| ||    ||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5967040 atgcagtgcagtaacagaactgaaacttgaaaagtgtagaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaattgaattac 5966959  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34279564 - 34279424
Alignment:
Q  41 tgcgctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279564 tgcgttagtgcaaattataacgtaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttatttgtgagttatttgttgaatgcttagcgcaagtta 34279465  T
Q  141 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgtt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279464 acatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgtt 34279424  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5076075 - 5075903
Alignment:
Q  327 tttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacgg 426  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||  |||||||  ||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  5076075 tttaacaagattattggataatgcgacacaatcaatcaaaattacacaaaaacatcgtttttttcacaatcgcatgatcacacataa-cgatccaaacgg 5075977  T
Q  427 tccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5075976 tccaaattacacaaattcgccggtaatgacctgtaatgacttaaaaacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 5075903  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 325 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22675720 - 22675543
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacata-----aacgatc 419  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||     
T  22675720 agtttaacaagattatcggatagtacgacataatcgatcaaaattatacaaaaacatcgtttttctcacaatcacataatcacacataagtataacgatt 22675621  T
Q  420 cagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatcc 497  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22675620 caaacggtccaaatttcacaaattcgctggtgatggcccataatcacttaaacacacttaatgacacataaacgatcc 22675543  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Original strand, 5015674 - 5015849
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttct-cacaatcacgtaatcacacataaacgatccaga 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||      
T  5015674 agtttaacaagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacgcaaaaacatcattttttttcacaatcacataatcacacataa-cgatccaag 5015772  T
Q  424 cggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015773 cggtccaaattacacaaattcgctagtaatgacccataatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 5015849  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 33228839 - 33228647
Alignment:
Q  269 aaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaat 368  Q
    |||| |||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  33228839 aaaagtctagaatgacccgtagtcacgccgcattcataacttaaccgaattacaccagtttaacaacattatcagataatacgacattatcgatccaaat 33228740  T
Q  369 tactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaat 463  Q
    |||  | ||| || ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  33228739 tac--acaaacatagtttttcgcacaaccacgtaatcaccaataaacgatcaaaacggtccaaattacacaaattcgccggtaatcacccataat 33228647  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41601434 - 41601259
Alignment:
Q  327 tttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttct---cacaatcacgtaatcacacataaacgatccaga 423  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||| ||||  | |    
T  41601434 tttaataagattattggataatacgacacaatcgatcaaaattacacaaaaacatcgttttttttttcacaatcacataatcacacataa-cgatttaaa 41601336  T
Q  424 cggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
     |||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41601335 tggtccaaattacacaaattcgtcggtaatgactcgtaatcacttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 41601259  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 325 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32076914 - 32076740
Alignment:
Q  325 agtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagac 424  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||    
T  32076914 agtttaacaacattataagataatacgacataatcgatcaaaattacacaaaatcatcgtttttctcacgatcacataatcacacat-aacaatcaaaac 32076816  T
Q  425 ggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| | | || |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  32076815 ggtccaaattacagaaattcgccggtaatgacccgtaatcaatgaatcacaattaacgatacgtaaacgatccaaa 32076740  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 498 - 649
Target Start/End: Original strand, 5016468 - 5016619
Alignment:
Q  498 aaaataattcatttcatatatt-tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgta 596  Q
    ||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||       || |||| ||||||    
T  5016468 aaaataatttatttcatttaatatatataatattagttacatattggccacaaatatccaaattacataaccggccacc-aaaaaatacgtcgaggtgta 5016566  T
Q  597 ataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataaccta 649  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  5016567 ataccacaaaaaaataagacgaacaccgaccgacctataagtgtcctaaccta 5016619  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 500
Target Start/End: Original strand, 24618647 - 24618795
Alignment:
Q  352 acataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttcacaaagtcgccggca 451  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||| || ||    
T  24618647 acataaacgatccaaattacacaaatttatcgtttatcacacaatcacataatcacacataaacgatcaaaacgatccaaattacagaaattcgtcgtca 24618746  T
Q  452 atgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    ||||| | |||| | |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  24618747 atgacgcataatcacttaatcacagttaatgacacataaactatccaaa 24618795  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 32075921 - 32075857
Alignment:
Q  586 gtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  32075921 gtcggggtgtaataccactaaaaaataagacgaacaccgaccgaccaaaaagtgtcatagcctat 32075857  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 668
Target Start/End: Original strand, 15893493 - 15893644
Alignment:
Q  510 ttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaa 609  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||        |||||  ||||||||| |  ||||||    
T  15893493 ttcatatatttatataatattaattacatattggccacaaatatccaaattacataaccgaccaccaaaaaaa-atgtc--ggtgtaatatcgacaaaaa 15893589  T
Q  610 ataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgata 668  Q
    |||||| ||| || |||||    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15893590 ataggaggaatactgacca----aaaagtgtcttcacctatctaactagactagtgata 15893644  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 30944435 - 30944283
Alignment:
Q  510 ttcatatatttatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaa 609  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||       || ||||| ||  |||| |  ||||||    
T  30944435 ttcatatatttatataatattagttagatattggccacaaatatccaaattacataactggccaccaaaaaaatacgtcggtgt-aaatatcgacaaaaa 30944337  T
Q  610 ataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgat 667  Q
    ||||||| |||||||||||    |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  30944336 ataggacaaacaccgacca----aaaagtctcataacctatctaagtagtatagtgat 30944283  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Original strand, 31762320 - 31762380
Alignment:
Q  45 ctagtgcaaattataacgcaacttaagataagtagcgtgacttaacatgcgctagtgttat 105  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  31762320 ctagtgcaaattattacgtaattaaagatacgttgcgtaagttaacatgcgctagtgttat 31762380  T

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Target: scaffold0700 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 138 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4977 - 4619
Alignment:
Q  138 ttaacatgcgctagtgtattgtgcaacgtgagttaactcacgttgccatttgcactagcgtgagttaactcacgttcatagcagacaacagaaactgcaa 237  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||     
T  4977 ttaacatgcgctagtgttaagtgcagcgcaagttaactcacgttgccatttgtactagcgtgagttaactcacgttcataggagaaatgagaaactgcat 4878  T
Q  238 taaatgca-tgcaagtacagaattgtcttttgaaaaatctagaatgatccataatcacgtcacattcataacttaactgaattacacaagtttaacaaga 336  Q
    | |||||| |||| |||| |||  |    ||| ||| |  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||    
T  4877 ttaatgcaatgca-gtactgaacaggtaattggaaagttaaaaatgacccgtaatcacgccacattcataacttaaccgaattacgccaatttaaaaaga 4779  T
Q  337 ttatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccagacggtccaaatttc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4778 ttatcggataatacgacataatcgaacaaaattacataagaacatcgtttttctcacaatcacttaatcacacat-aacgatccaaacggtccaaatttc 4680  T
Q  437 acaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatcc 497  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4679 acaaatttgccggtaatgacccgtaatcacttaaacacacttaatgacaagtaaatgatcc 4619  T

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Target: scaffold0700; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 520 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 4509 - 4358
Alignment:
Q  520 tatataatactagttacatattggccataaatatcaaaattacacaatcggccaccnnnnnnntatgtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaa 619  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4509 tatataatattaattatatattggccataaatatccaaattacacaatcggccaccaaaaaa-tacgtcggggtgtaatacaaccaaaaaataggacgaa 4411  T
Q  620 caccgaccaacccaaaagtgtcataacctatctaactagactagtgatagtgca 673  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410 caccgaccgaccc-aaagtttcataacctatctaactagactagtgatagtgca 4358  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 323 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33428 - 33252
Alignment:
Q  323 caagtttaacaagattatcggataatacgacataatcgattcaaattactaaaaaatatcgtttttctcacaatcacgtaatcacacataaacgatccag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||     
T  33428 caagtttaacaagattatcggatagtacgacataattgatcaaaattacacaaaaatattgcttttctcacaatcacataattacacat-aacgatccaa 33330  T
Q  423 acggtccaaatttcacaaagtcgccggcaatgacccgtaataatttaaacacacttaatgacacgtaaacgatccaaa 500  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||  ||||| | | ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33329 aaggtccaaattacacaaattcgccgttaatgatcggcaatcacttaaacacaattattgacacgtaaacgatccaaa 33252  T

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Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 32554 - 32490
Alignment:
Q  586 gtcggggtgtaataccaccaaaaaataggacgaacaccgaccaacccaaaagtgtcataacctat 650  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  32554 gtcggggtgtaataccaccaaaaactaggacgaacactgacctgccaaaaagtgtcataacctat 32490  T

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