View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4745_high_26 (Length: 258)

Name: NF4745_high_26
Description: NF4745
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4745_high_26
NF4745_high_26
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (12-216)||(14422702-14422907)
chr8 (12-219)||(18594533-18594741)
chr8 (12-217)||(39206584-39206790)
chr8 (16-217)||(10836762-10836964)
chr8 (12-216)||(29938060-29938265)
chr8 (12-199)||(144411-144598)
chr8 (12-213)||(13110406-13110608)
chr8 (12-217)||(22260633-22260839)
chr8 (12-217)||(24113169-24113375)
chr8 (12-211)||(2042527-2042727)
chr8 (12-215)||(34842368-34842572)
chr8 (12-218)||(4035844-4036051)
chr8 (12-218)||(6144276-6144483)
chr8 (12-199)||(7774781-7774968)
chr8 (12-217)||(39218775-39218981)
chr8 (12-216)||(33278399-33278604)
chr8 (12-216)||(35118034-35118239)
chr8 (12-214)||(7791412-7791615)
chr8 (14-199)||(34679462-34679647)
chr8 (13-198)||(38167159-38167344)
chr8 (12-212)||(41575516-41575717)
chr8 (12-199)||(34998899-34999086)
chr8 (12-199)||(44804947-44805134)
chr8 (12-216)||(5320563-5320768)
chr8 (12-217)||(7811993-7812199)
chr8 (12-218)||(36491154-36491361)
chr8 (60-218)||(40117903-40118062)
chr8 (12-217)||(33287040-33287234)
chr8 (12-211)||(42571598-42571795)
chr8 (12-213)||(8021721-8021915)
chr8 (12-199)||(28639295-28639484)
chr8 (12-199)||(66182-66370)
chr8 (77-218)||(26783801-26783943)
chr8 (11-137)||(9807339-9807465)
chr8 (65-218)||(2322068-2322222)
chr8 (88-191)||(5005191-5005294)
chr8 (65-199)||(39220273-39220407)
chr8 (129-199)||(9806890-9806960)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (12-218)||(12101171-12101378)
chr7 (12-218)||(30181017-30181224)
chr7 (12-216)||(33359083-33359288)
chr7 (12-218)||(42964989-42965196)
chr7 (12-217)||(24792325-24792531)
chr7 (12-215)||(20346487-20346691)
chr7 (12-218)||(3511319-3511526)
chr7 (12-218)||(5280856-5281063)
chr7 (12-218)||(43067966-43068173)
chr7 (14-214)||(7164184-7164385)
chr7 (16-216)||(22649691-22649892)
chr7 (12-218)||(42204150-42204358)
chr7 (16-216)||(25748485-25748686)
chr7 (12-215)||(8630665-8630869)
chr7 (12-199)||(933301-933488)
chr7 (12-218)||(6394747-6394954)
chr7 (16-199)||(38866560-38866743)
chr7 (12-212)||(4477314-4477515)
chr7 (12-199)||(1803042-1803229)
chr7 (12-218)||(15655908-15656115)
chr7 (12-217)||(33846522-33846723)
chr7 (12-194)||(12097583-12097765)
chr7 (12-217)||(32041539-32041745)
chr7 (12-218)||(36890823-36891029)
chr7 (12-199)||(42673481-42673664)
chr7 (12-199)||(9452606-9452793)
chr7 (12-199)||(43156729-43156916)
chr7 (12-218)||(4347269-4347475)
chr7 (12-199)||(46134297-46134484)
chr7 (12-159)||(48865689-48865836)
chr7 (14-178)||(16894502-16894666)
chr7 (12-199)||(17753616-17753803)
chr7 (16-213)||(46891336-46891535)
chr7 (12-218)||(43021573-43021776)
chr7 (70-218)||(19828266-19828415)
chr7 (65-218)||(37005857-37006011)
chr7 (120-199)||(37704996-37705075)
chr7 (65-199)||(43405036-43405170)
chr7 (121-203)||(27691428-27691510)
chr7 (72-191)||(36849590-36849709)
chr7 (65-218)||(15655458-15655612)
chr7 (65-216)||(30075277-30075426)
chr7 (81-148)||(20163886-20163953)
chr7 (217-254)||(22851551-22851588)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (12-218)||(33491199-33491406)
chr5 (12-217)||(1579035-1579241)
chr5 (12-217)||(1605574-1605780)
chr5 (12-218)||(9008060-9008267)
chr5 (12-217)||(27679172-27679378)
chr5 (12-219)||(4120934-4121142)
chr5 (12-218)||(24105674-24105881)
chr5 (13-218)||(27420856-27421062)
chr5 (12-199)||(16069371-16069558)
chr5 (12-199)||(16737450-16737637)
chr5 (12-218)||(19358524-19358731)
chr5 (12-216)||(5202972-5203177)
chr5 (12-199)||(31883162-31883349)
chr5 (12-217)||(8374342-8374547)
chr5 (16-199)||(3386493-3386676)
chr5 (12-218)||(3921579-3921786)
chr5 (12-199)||(1165604-1165791)
chr5 (12-218)||(20992149-20992356)
chr5 (12-199)||(33991158-33991345)
chr5 (12-218)||(35782647-35782854)
chr5 (12-217)||(38598453-38598659)
chr5 (12-216)||(31410476-31410681)
chr5 (12-172)||(27025001-27025161)
chr5 (12-178)||(26602945-26603111)
chr5 (82-218)||(20992354-20992495)
chr5 (76-199)||(33284642-33284765)
chr5 (12-67)||(35420427-35420482)
chr5 (81-188)||(31638174-31638281)
chr5 (65-217)||(25634581-25634732)
chr5 (98-150)||(41818552-41818604)
chr5 (217-256)||(10585693-10585732)
chr5 (16-47)||(27024822-27024853)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (12-217)||(37698132-37698338)
chr3 (12-218)||(42307894-42308101)
chr3 (12-216)||(25999382-25999587)
chr3 (12-218)||(8042599-8042806)
chr3 (14-218)||(32244112-32244317)
chr3 (12-216)||(25494274-25494479)
chr3 (14-217)||(29445481-29445685)
chr3 (12-218)||(15520131-15520338)
chr3 (12-199)||(21581054-21581241)
chr3 (12-217)||(22174979-22175185)
chr3 (12-217)||(46452151-46452357)
chr3 (12-218)||(12117647-12117854)
chr3 (16-214)||(38856089-38856288)
chr3 (12-217)||(15520629-15520835)
chr3 (12-217)||(50528922-50529128)
chr3 (14-217)||(54870165-54870369)
chr3 (12-218)||(20842337-20842544)
chr3 (12-218)||(32359251-32359458)
chr3 (12-199)||(2895197-2895388)
chr3 (12-215)||(20699144-20699348)
chr3 (15-199)||(42104963-42105147)
chr3 (12-198)||(35226460-35226646)
chr3 (12-217)||(38933939-38934144)
chr3 (12-217)||(54534317-54534521)
chr3 (16-217)||(24835692-24835894)
chr3 (12-199)||(44609322-44609509)
chr3 (16-217)||(34700334-34700536)
chr3 (12-216)||(26122808-26123013)
chr3 (12-190)||(44688782-44688959)
chr3 (12-199)||(48924992-48925177)
chr3 (12-199)||(53028237-53028416)
chr3 (16-178)||(16354379-16354541)
chr3 (60-215)||(35643212-35643368)
chr3 (77-199)||(50529827-50529949)
chr3 (12-188)||(12915930-12916105)
chr3 (12-97)||(24366143-24366228)
chr3 (83-218)||(49128041-49128177)
chr3 (12-90)||(13696914-13696992)
chr3 (14-56)||(50528873-50528915)
chr3 (162-199)||(24366104-24366141)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (12-216)||(26704342-26704547)
chr6 (12-216)||(30691850-30692055)
chr6 (12-217)||(2837543-2837749)
chr6 (12-217)||(6086602-6086808)
chr6 (12-217)||(21893453-21893659)
chr6 (12-216)||(26946879-26947084)
chr6 (12-218)||(3347526-3347733)
chr6 (25-214)||(3955782-3955972)
chr6 (12-199)||(34887295-34887482)
chr6 (12-213)||(17261076-17261278)
chr6 (12-216)||(9459562-9459767)
chr6 (12-218)||(18613535-18613742)
chr6 (12-216)||(20726790-20726991)
chr6 (12-217)||(11167238-11167444)
chr6 (12-199)||(1153610-1153797)
chr6 (16-217)||(16307015-16307217)
chr6 (12-217)||(35198282-35198487)
chr6 (14-199)||(30698934-30699119)
chr6 (12-199)||(28199511-28199699)
chr6 (12-146)||(33464399-33464533)
chr6 (53-217)||(52834-52999)
chr6 (12-123)||(53001-53112)
chr6 (138-218)||(33463698-33463779)
chr6 (217-258)||(26259896-26259937)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (12-218)||(54189540-54189747)
chr4 (12-217)||(53717455-53717661)
chr4 (12-217)||(15241019-15241225)
chr4 (14-218)||(45424527-45424732)
chr4 (12-200)||(31969695-31969883)
chr4 (12-215)||(40428711-40428915)
chr4 (12-216)||(19913621-19913826)
chr4 (12-216)||(23776450-23776655)
chr4 (12-216)||(38055154-38055359)
chr4 (12-219)||(44784908-44785116)
chr4 (12-214)||(1756755-1756958)
chr4 (12-218)||(20877042-20877249)
chr4 (16-218)||(50353796-50353999)
chr4 (12-217)||(6611351-6611557)
chr4 (14-218)||(14987787-14987992)
chr4 (12-215)||(11639569-11639773)
chr4 (18-217)||(50055098-50055298)
chr4 (16-199)||(28032707-28032890)
chr4 (12-203)||(37968748-37968939)
chr4 (12-214)||(54412627-54412830)
chr4 (12-217)||(27488639-27488845)
chr4 (12-217)||(48909842-48910048)
chr4 (12-212)||(16700782-16700983)
chr4 (11-213)||(52139203-52139406)
chr4 (12-217)||(2481399-2481605)
chr4 (12-217)||(37464717-37464923)
chr4 (12-217)||(43289951-43290157)
chr4 (12-199)||(8591083-8591270)
chr4 (19-212)||(19164971-19165164)
chr4 (12-218)||(23704200-23704407)
chr4 (12-213)||(1617084-1617286)
chr4 (12-218)||(30423556-30423762)
chr4 (12-199)||(33703856-33704043)
chr4 (12-216)||(6688618-6688817)
chr4 (12-217)||(15669179-15669385)
chr4 (12-213)||(35490764-35490966)
chr4 (12-217)||(27536095-27536297)
chr4 (12-215)||(47632032-47632237)
chr4 (12-218)||(8932169-8932376)
chr4 (12-218)||(53353050-53353265)
chr4 (12-212)||(53875658-53875859)
chr4 (12-199)||(44379178-44379365)
chr4 (12-199)||(27583623-27583810)
chr4 (25-199)||(38071327-38071498)
chr4 (12-199)||(40680029-40680216)
chr4 (12-199)||(55344816-55345003)
chr4 (43-199)||(28360445-28360602)
chr4 (12-212)||(30171581-30171782)
chr4 (18-214)||(44375844-44376041)
chr4 (11-192)||(16703843-16704024)
chr4 (12-137)||(23269037-23269162)
chr4 (65-217)||(50053439-50053592)
chr4 (12-96)||(53408137-53408222)
chr4 (66-148)||(51780763-51780845)
chr4 (129-218)||(23265865-23265955)
chr4 (65-199)||(44548185-44548319)
chr4 (12-72)||(23261877-23261937)
chr4 (12-112)||(9595893-9595982)
chr4 (12-56)||(50055303-50055347)
chr4 (12-75)||(48748197-48748260)
chr4 (65-177)||(17493370-17493482)
chr4 (81-199)||(46257269-46257387)
chr4 (70-123)||(55344724-55344777)
chr4 (12-43)||(55344684-55344715)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (12-217)||(36701-36907)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (12-217)||(25897370-25897576)
chr1 (12-217)||(39260349-39260555)
chr1 (12-218)||(20089466-20089673)
chr1 (12-214)||(26663257-26663460)
chr1 (12-199)||(29078531-29078718)
chr1 (12-217)||(29288145-29288349)
chr1 (12-217)||(33510480-33510686)
chr1 (12-217)||(52753150-52753356)
chr1 (12-217)||(1168499-1168705)
chr1 (16-217)||(26580277-26580479)
chr1 (12-196)||(7145226-7145409)
chr1 (12-218)||(16052091-16052298)
chr1 (12-217)||(1940750-1940956)
chr1 (12-216)||(970527-970734)
chr1 (12-217)||(2347652-2347859)
chr1 (12-218)||(32671574-32671781)
chr1 (12-217)||(41928498-41928704)
chr1 (12-199)||(38829084-38829271)
chr1 (12-217)||(1170447-1170653)
chr1 (12-213)||(8079712-8079914)
chr1 (12-213)||(19715164-19715366)
chr1 (12-216)||(42370798-42371003)
chr1 (16-216)||(52696788-52696989)
chr1 (12-199)||(12682835-12683022)
chr1 (12-213)||(2473722-2473924)
chr1 (12-212)||(8120870-8121071)
chr1 (16-219)||(43905648-43905852)
chr1 (12-218)||(49146167-49146374)
chr1 (14-198)||(17587510-17587694)
chr1 (16-214)||(5215384-5215583)
chr1 (12-218)||(13996726-13996933)
chr1 (12-199)||(15203127-15203314)
chr1 (12-217)||(17591687-17591890)
chr1 (12-199)||(23498475-23498662)
chr1 (12-199)||(46760981-46761168)
chr1 (12-178)||(40149499-40149665)
chr1 (12-199)||(46409450-46409639)
chr1 (14-214)||(6765458-6765659)
chr1 (16-199)||(40092506-40092689)
chr1 (12-216)||(51359220-51359424)
chr1 (12-217)||(15554155-15554353)
chr1 (12-199)||(15717800-15717986)
chr1 (48-215)||(29695673-29695842)
chr1 (12-199)||(38171847-38172021)
chr1 (85-199)||(52086282-52086396)
chr1 (66-199)||(23322897-23323030)
chr1 (65-147)||(5217840-5217921)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (29-218)||(1108275-1108464)
chr2 (12-218)||(26323189-26323396)
chr2 (12-217)||(42937715-42937922)
chr2 (12-216)||(31517218-31517423)
chr2 (12-217)||(2178772-2178978)
chr2 (16-199)||(33906054-33906237)
chr2 (12-217)||(18806887-18807093)
chr2 (12-216)||(3873247-3873452)
chr2 (12-213)||(4016039-4016241)
chr2 (17-199)||(16066302-16066484)
chr2 (12-203)||(5733410-5733601)
chr2 (16-218)||(30270686-30270889)
chr2 (16-217)||(4232149-4232351)
chr2 (12-217)||(6174831-6175037)
chr2 (12-217)||(39635448-39635654)
chr2 (12-199)||(1482906-1483092)
chr2 (12-199)||(19383938-19384125)
chr2 (14-199)||(28329844-28330027)
chr2 (14-218)||(19901143-19901347)
chr2 (12-199)||(851012-851199)
chr2 (13-199)||(429831-430017)
chr2 (12-214)||(30420182-30420373)
chr2 (16-217)||(16588783-16588985)
chr2 (12-199)||(44947552-44947732)
chr2 (65-191)||(3585313-3585439)
chr2 (65-178)||(42446625-42446738)
chr2 (72-181)||(22101210-22101319)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (14-216)||(22956-23159)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (12-218)||(10233-10440)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (12-215)||(3708-3912)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (12-194)||(9-191)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (12-214)||(298-501)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (12-199)||(145248-145435)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-199)||(9-197)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14422907 - 14422702
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422907 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 14422808  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14422807 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaac 14422708  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  14422707 ggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18594741 - 18594533
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18594741 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 18594642  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18594641 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 18594542  T
Q  211 ggggccttg 219  Q
    |||||||||    
T  18594541 ggggccttg 18594533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39206790 - 39206584
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206790 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatg 39206691  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39206690 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 39206591  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  39206590 ggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 10836762 - 10836964
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10836762 aatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaac 10836861  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  10836862 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgagg 10836961  T
Q  215 cct 217  Q
    |||    
T  10836962 cct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29938265 - 29938060
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938265 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 29938166  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29938165 aaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29938066  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  29938065 ggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 144598 - 144411
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144598 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 144499  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  144498 aaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataa 144411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13110608 - 13110406
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13110608 agagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatt 13110509  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13110508 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 13110409  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  13110408 ggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 22260633 - 22260839
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260633 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 22260732  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22260733 aaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 22260832  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  22260833 ggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 24113169 - 24113375
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24113169 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 24113268  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  24113269 aaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 24113368  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  24113369 ggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Original strand, 2042527 - 2042727
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2042527 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 2042626  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2042627 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 2042726  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  2042727 g 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 34842368 - 34842572
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34842368 agagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 34842467  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34842468 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 34842567  T
Q  211 ggggc 215  Q
    |||||    
T  34842568 ggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4036051 - 4035844
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036051 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 4035952  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4035951 aaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaac 4035852  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  4035851 ggggcctt 4035844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 6144276 - 6144483
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144276 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatg 6144375  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||    
T  6144376 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaac 6144475  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  6144476 ggggcctt 6144483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7774968 - 7774781
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7774968 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatg 7774869  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7774868 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataa 7774781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39218981 - 39218775
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39218981 agagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 39218882  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39218881 aagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 39218782  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  39218781 ggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33278604 - 33278399
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33278505  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||||| || ||||||||    
T  33278504 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaac 33278405  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  33278404 ggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 35118034 - 35118239
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35118034 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 35118133  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35118134 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 35118233  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  35118234 ggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7791615 - 7791412
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7791615 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatg 7791516  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  7791515 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaac 7791416  T
Q  211 gggg 214  Q
    ||||    
T  7791415 gggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 34679462 - 34679647
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34679462 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaa 34679561  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34679562 actatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 34679647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 38167159 - 38167344
Alignment:
Q  13 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167159 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 38167258  T
Q  113 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38167259 aactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaata 38167344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41575717 - 41575516
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41575717 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 41575618  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41575617 aaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaac 41575518  T
Q  211 gg 212  Q
    ||    
T  41575517 gg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 34998899 - 34999086
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34998899 agagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 34998998  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34998999 aaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataa 34999086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 44804947 - 44805134
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44804947 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 44805046  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44805047 aaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataa 44805134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5320768 - 5320563
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  5320768 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatg 5320669  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5320668 aaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaac 5320569  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  5320568 ggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7812199 - 7811993
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7812199 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatg 7812100  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||    
T  7812099 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaac 7812000  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  7811999 ggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36491361 - 36491154
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  36491361 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatg 36491262  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||     
T  36491261 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaat 36491162  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  36491161 ggggcctt 36491154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118062
Alignment:
Q  60 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  160 gtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 40118062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 33287040 - 33287234
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287040 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagct------------agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33287127  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  33287128 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 33287227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42571795 - 42571598
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42571795 agagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatg 42571698  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42571697 aaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 42571599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8021915 - 8021721
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8021915 agagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 8021824  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  8021823 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 8021724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28639484 - 28639295
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639484 agagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 28639387  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtct----tatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||    ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  28639386 aaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataa 28639295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 66182 - 66370
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtc-agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 110  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  66182 agagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttat 66281  T
Q  111 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||    
T  66282 gaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataa 66370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 218
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783943
Alignment:
Q  77 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  177 aaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctt 26783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9807465 - 9807339
Alignment:
Q  11 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9807465 cagagaaacgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 9807366  T
Q  111 gaaactatgataaactatttttattta 137  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9807365 gaagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322222
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctt 2322222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005191
Alignment:
Q  88 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacata 187  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  188 agct 191  Q
    ||||    
T  5005194 agct 5005191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220273
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||  ||||||||   || |||||||||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataa 39220273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806890
Alignment:
Q  129 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataa 9806890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 12101171 - 12101378
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101171 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 12101270  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  12101271 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaat 12101370  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  12101371 ggggcctt 12101378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 30181017 - 30181224
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181017 agagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 30181116  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30181117 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 30181216  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  30181217 ggggcctt 30181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 33359083 - 33359288
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359083 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33359182  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33359183 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 33359282  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  33359283 ggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 42964989 - 42965196
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964989 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42965088  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||     
T  42965089 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaa 42965188  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  42965189 ggggcctt 42965196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 24792325 - 24792531
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792325 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 24792424  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||||||||    
T  24792425 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaac 24792524  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  24792525 ggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20346691 - 20346487
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346691 agagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatg 20346592  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20346591 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 20346492  T
Q  211 ggggc 215  Q
    |||||    
T  20346491 ggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3511526 - 3511319
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511526 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3511427  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3511426 aaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaac 3511327  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||| ||||    
T  3511326 gggacctt 3511319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5281063 - 5280856
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5281063 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 5280964  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5280963 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 5280864  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||| ||||    
T  5280863 gggacctt 5280856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 43067966 - 43068173
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43067966 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatg 43068065  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||    
T  43068066 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaac 43068165  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  43068166 ggggcctt 43068173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7164385 - 7164184
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164385 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 7164286  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7164285 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 7164186  T
Q  213 gg 214  Q
    ||    
T  7164185 gg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 22649691 - 22649892
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22649691 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaat 22649790  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  22649791 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacgggg 22649890  T
Q  215 cc 216  Q
    ||    
T  22649891 cc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42204358 - 42204150
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204358 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42204259  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaa 209  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  42204258 aaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 42204159  T
Q  210 cggggcctt 218  Q
    |||||||||    
T  42204158 cggggcctt 42204150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25748686 - 25748485
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748686 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 25748587  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||| || ||||||||||||    
T  25748586 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacgggg 25748487  T
Q  215 cc 216  Q
    ||    
T  25748486 cc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8630869 - 8630665
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630869 agagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 8630770  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaac-catccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  8630769 aaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaac 8630670  T
Q  211 ggggc 215  Q
    |||||    
T  8630669 ggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 933488 - 933301
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933488 agagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 933389  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  933388 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataa 933301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6394954 - 6394747
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6394954 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 6394855  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  6394854 aaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaac 6394755  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  6394754 ggggcctt 6394747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38866743 - 38866560
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38866743 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaac 38866644  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866643 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 38866560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 4477314 - 4477515
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4477314 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 4477413  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4477414 aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 4477513  T
Q  211 gg 212  Q
    ||    
T  4477514 gg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1803229 - 1803042
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  1803229 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatg 1803130  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1803129 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1803042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15656115 - 15655908
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656115 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 15656016  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15656015 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 15655916  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  15655915 ggggcctt 15655908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 33846522 - 33846723
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33846522 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatg 33846616  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33846617 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 33846716  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  33846717 ggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 12097583 - 12097765
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12097583 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatg 12097682  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaa 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  12097683 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaa 12097765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32041745 - 32041539
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32041745 agagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatg 32041646  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  32041645 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaac 32041546  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  32041545 ggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 36890823 - 36891029
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36890823 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatg 36890922  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaaccatccaaacg 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |  | |||||||||    
T  36890923 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaataagtcaatccaaacg 36891022  T
Q  212 gggcctt 218  Q
    |||||||    
T  36891023 gggcctt 36891029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42673664 - 42673481
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673664 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42673565  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42673564 aaactatgataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataa 42673481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9452793 - 9452606
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9452793 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatg 9452694  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||   ||||||||||||||||||    
T  9452693 aaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataa 9452606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43156916 - 43156729
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  43156916 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatg 43156817  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43156816 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 43156729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4347475 - 4347269
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4347475 agagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatg 4347377  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  4347376 aaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaac 4347277  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  4347276 ggggcctt 4347269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 46134297 - 46134484
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  46134297 agagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatg 46134396  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46134397 aaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataa 46134484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48865836 - 48865689
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865836 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 48865737  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48865736 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 48865689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 16894502 - 16894666
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894502 agaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 16894601  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16894602 actatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 16894666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17753803 - 17753616
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753803 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 17753704  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||    
T  17753703 aaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataa 17753616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 46891336 - 46891535
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46891336 aatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaac 46891435  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggg 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46891436 tatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 43021573 - 43021776
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||    
T  43021573 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatg 43021668  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||| || ||||||| || |||||||     
T  43021669 aaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaat 43021768  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  43021769 ggggcctt 43021776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828266
Alignment:
Q  70 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatggg 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  170 agtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctt 19828266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006011
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    || | ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcctt 37006011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704996
Alignment:
Q  120 ataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 37704996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405036
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    || ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataa 43405036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691510
Alignment:
Q  121 taaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaacca 27691510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 191
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849709
Alignment:
Q  72 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggag 171  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  172 tagataaacccacataagct 191  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagct 36849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655612
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    |||  |||||| || | |||||||| | | ||||| || ||||||||| ||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctt 15655612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||   | | ||| | |||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggcc 216  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  81 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 148  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 254
Target Start/End: Original strand, 22851551 - 22851588
Alignment:
Q  217 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaa 254  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22851551 ttgaactccctttagtaacatcacgtgataaattctaa 22851588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 33491199 - 33491406
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33491199 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatg 33491298  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33491299 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 33491398  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  33491399 ggggcctt 33491406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1579241 - 1579035
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1579142  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  1579141 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1579042  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  1579041 ggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 1605574 - 1605780
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605574 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1605673  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  1605674 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1605773  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  1605774 ggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 9008060 - 9008267
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008060 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 9008159  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9008160 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 9008259  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  9008260 ggggcctt 9008267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 27679172 - 27679378
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679172 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 27679271  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27679272 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 27679371  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  27679372 ggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4121142 - 4120934
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121142 agagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 4121043  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca-tccaaac 210  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4121042 aaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaac 4120943  T
Q  211 ggggccttg 219  Q
    |||||||||    
T  4120942 ggggccttg 4120934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 24105674 - 24105881
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24105674 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 24105773  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24105774 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 24105873  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    || |||||    
T  24105874 ggagcctt 24105881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27421062 - 27420856
Alignment:
Q  13 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421062 gagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 27420963  T
Q  113 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  27420962 aactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 27420863  T
Q  212 gggcctt 218  Q
    |||||||    
T  27420862 gggcctt 27420856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16069558 - 16069371
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069558 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16069459  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16069458 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataa 16069371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 16737450 - 16737637
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737450 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16737549  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16737550 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 16737637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19358731 - 19358524
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19358731 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatg 19358632  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  19358631 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaac 19358532  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  19358531 ggggcctt 19358524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5203177 - 5202972
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5203177 agagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 5203078  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  5203077 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaac 5202978  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  5202977 ggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31883349 - 31883162
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31883349 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 31883250  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31883249 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataa 31883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 8374342 - 8374547
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374342 agagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 8374440  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  8374441 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaac 8374540  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  8374541 ggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 3386493 - 3386676
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386493 aatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 3386592  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3386593 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataa 3386676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3921786 - 3921579
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921786 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3921687  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3921686 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaac 3921587  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||| ||||    
T  3921586 gggacctt 3921579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 1165604 - 1165791
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1165604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 1165703  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1165704 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataa 1165791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 20992149 - 20992356
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20992149 agagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatg 20992248  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||    
T  20992249 aaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaac 20992348  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  20992349 ggggcctt 20992356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33991345 - 33991158
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33991345 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 33991246  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  33991245 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataa 33991158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 35782647 - 35782854
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782647 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatg 35782746  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  35782747 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaac 35782846  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  35782847 ggggcctt 35782854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 38598453 - 38598659
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598453 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 38598552  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  38598553 aaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaac 38598652  T
Q  211 ggggcct 217  Q
     ||||||    
T  38598653 cgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31410681 - 31410476
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31410681 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttata 31410582  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  31410581 aaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaac 31410482  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    | ||||    
T  31410481 gcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27025161 - 27025001
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27025161 agagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatg 27025062  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagt 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27025061 aaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 26602945 - 26603111
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26602945 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatg 26603044  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26603045 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa 26603111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992495
Alignment:
Q  82 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  182 c----acataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    |    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctt 20992495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284765
Alignment:
Q  76 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtaga 175  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  176 taaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataa 33284765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 35420427 - 35420482
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  35420427 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638174
Alignment:
Q  81 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaac 180  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||| |    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  181 ccacataa 188  Q
     |||||||    
T  31638181 tcacataa 31638174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634581
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||||||||   ||| |||   |||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 217  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcct 25634581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 150
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818604
Alignment:
Q  98 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacac 150  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacac 41818604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10585732 - 10585693
Alignment:
Q  217 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaat 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10585732 ttgaactccctttaataacatcacatgataaattctaaat 10585693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 37698132 - 37698338
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37698132 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 37698231  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37698232 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 37698331  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  37698332 ggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 42307894 - 42308101
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307894 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 42307993  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42307994 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 42308093  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  42308094 ggggcctt 42308101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25999587 - 25999382
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999587 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 25999488  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25999487 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 25999388  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  25999387 ggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8042806 - 8042599
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042806 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 8042707  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8042706 aaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaac 8042607  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  8042606 ggggcctt 8042599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244112
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 32244118  T
Q  213 ggcctt 218  Q
    | ||||    
T  32244117 gacctt 32244112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 25494274 - 25494479
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494274 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 25494373  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  25494374 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 25494473  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  25494474 ggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29445685 - 29445481
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29445685 agaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaa 29445586  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29445585 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 29445486  T
Q  213 ggcct 217  Q
    |||||    
T  29445485 ggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 15520131 - 15520338
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520131 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 15520230  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15520231 aaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 15520330  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  15520331 ggggcctt 15520338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21581241 - 21581054
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581241 agagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 21581142  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21581141 aaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 21581054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 22174979 - 22175185
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174979 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 22175078  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22175079 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 22175178  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  22175179 ggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 46452151 - 46452357
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46452151 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 46452250  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||||||||    
T  46452251 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaac 46452350  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  46452351 ggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 12117647 - 12117854
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12117647 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 12117746  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  12117747 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaac 12117846  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  12117847 ggggcctt 12117854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38856288 - 38856089
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856288 aatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 38856189  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38856188 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15520835 - 15520629
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520835 agagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 15520736  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15520735 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 15520636  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  15520635 ggggcct 15520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50529128 - 50528922
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529128 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 50529029  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50529028 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 50528929  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  50528928 ggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 54870165 - 54870369
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54870165 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 54870264  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  54870265 acgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacgg 54870364  T
Q  213 ggcct 217  Q
    |||||    
T  54870365 ggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 20842337 - 20842544
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20842337 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatg 20842436  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20842437 aaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 20842536  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  20842537 ggggcctt 20842544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32359458 - 32359251
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359458 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 32359359  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32359358 aaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaac 32359259  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||| ||||    
T  32359258 gggacctt 32359251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2895388 - 2895197
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895388 agagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 2895289  T
Q  108 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895288 tatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataa 2895197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20699348 - 20699144
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699348 agagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 20699249  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20699248 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 20699149  T
Q  211 ggggc 215  Q
    |||||    
T  20699148 ggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 42104963 - 42105147
Alignment:
Q  15 gaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42104963 gaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaa 42105062  T
Q  115 ctatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42105063 ctatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 42105147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35226646 - 35226460
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226646 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 35226547  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 198  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35226546 aaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaata 35226460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38934144 - 38933939
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38934144 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatg 38934045  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38934044 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagat-aagccacataagctcaaaataagccaatccaaac 38933946  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  38933945 ggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 54534317 - 54534521
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  54534317 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt-gaatatggcataagcagcttat- 54534414  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54534415 aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 54534514  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  54534515 ggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 24835692 - 24835894
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24835692 aatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaac 24835791  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaacgggg 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24835792 tataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacgggg 24835891  T
Q  215 cct 217  Q
    |||    
T  24835892 cct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 44609322 - 44609509
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609322 agagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 44609421  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44609422 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataa 44609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34700536 - 34700334
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34700536 aatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 34700437  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34700436 tatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacgggg 34700337  T
Q  215 cct 217  Q
    |||    
T  34700336 cct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26123013 - 26122808
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26123013 agagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 26122914  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26122913 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 26122814  T
Q  211 ggggcc 216  Q
     |||||    
T  26122813 tgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44688959 - 44688782
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44688959 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatg 44688861  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagc 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44688860 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 48924992 - 48925177
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48924992 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatg 48925091  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  48925092 aaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataa 48925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53028416 - 53028237
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53028416 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatg 53028317  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||        | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53028316 aaaatatgataagctatttttatttatttacc--------tctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 53028237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16354541 - 16354379
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16354541 aatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaac 16354442  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16354441 tatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643212
Alignment:
Q  60 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  160 gtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacggggc 215  Q
    | ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  35643268 ggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 199
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529949
Alignment:
Q  77 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagat 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  177 aaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||  |||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataa 50529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12916105 - 12915930
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  12916105 agagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatg 12916006  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataa 188  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||    
T  12916005 aaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24366228 - 24366143
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366228 agagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128041
Alignment:
Q  83 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaaccc 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  183 acataagctcaaaataa-accatccaaacggggcctt 218  Q
    ||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctt 49128041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 13696992 - 13696914
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 90  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696992 agagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 56
Target Start/End: Original strand, 50528873 - 50528915
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 56  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528873 agaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaag 50528915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24366141 - 24366104
Alignment:
Q  162 cttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366141 cttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataa 24366104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 26704342 - 26704547
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704342 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 26704441  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26704442 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaac 26704541  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  26704542 ggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30692055 - 30691850
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692055 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 30691956  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30691955 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 30691856  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    | ||||    
T  30691855 gaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2837749 - 2837543
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2837749 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatg 2837650  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2837649 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 2837550  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  2837549 ggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 6086602 - 6086808
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6086602 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 6086701  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6086702 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 6086801  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  6086802 ggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21893659 - 21893453
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893659 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 21893560  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21893559 aaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaac 21893460  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  21893459 ggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 26946879 - 26947084
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26946879 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 26946978  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  26946979 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 26947078  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  26947079 ggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 3347526 - 3347733
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3347526 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 3347625  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3347626 aaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3347725  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  3347726 ggggcctt 3347733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955972
Alignment:
Q  25 aggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  125 ctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 34887295 - 34887482
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34887295 agagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatg 34887394  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34887395 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataa 34887482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 17261076 - 17261278
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17261076 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 17261175  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17261176 aaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 17261275  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  17261276 ggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9459767 - 9459562
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459767 agagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 9459668  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  9459667 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaac 9459568  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  9459567 ggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18613742 - 18613535
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18613742 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 18613643  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  18613642 gaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaac 18613543  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  18613542 ggggcctt 18613535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20726991 - 20726790
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726991 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 20726892  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20726891 aaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 20726796  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  20726795 ggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11167444 - 11167238
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11167444 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 11167345  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  | || |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11167344 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaac 11167245  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  11167244 ggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1153797 - 1153610
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153797 agagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1153698  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  1153697 aaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataa 1153610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 16307015 - 16307217
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307015 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16307114  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacgggg 214  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16307115 tatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 16307214  T
Q  215 cct 217  Q
    |||    
T  16307215 cct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35198487 - 35198282
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35198487 agagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 35198388  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||    
T  35198387 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaag-cttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaac 35198289  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  35198288 ggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 30698934 - 30699119
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30698934 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaa 30699033  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | || |||| | ||||||| |||| |||||    
T  30699034 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataa 30699119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 28199511 - 28199699
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  28199511 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatg 28199609  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagta---gataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  28199610 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataa 28199699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33464533 - 33464399
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464533 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33464434  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464433 aaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52834
Alignment:
Q  53 taagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacactt 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  153 ttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 217  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 53112 - 53001
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53112 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 53013  T
Q  112 aaactatgataa 123  Q
    ||||||||||||    
T  53012 aaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463698
Alignment:
Q  138 tttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 33463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26259937 - 26259896
Alignment:
Q  217 ttgaactccctttaatgacatcacgtgataaattctaaatgg 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26259937 ttgaactccctttagtgacatcacgtgataaattctaaatgg 26259896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 54189747 - 54189540
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189747 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 54189648  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54189647 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 54189548  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  54189547 ggggcctt 54189540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 53717455 - 53717661
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53717455 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatg 53717554  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  53717555 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaac 53717654  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  53717655 ggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 15241019 - 15241225
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15241019 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 15241118  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15241119 aaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 15241218  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    | |||||    
T  15241219 gaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 45424527 - 45424732
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424527 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 45424626  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaacgg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  45424627 actatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 45424726  T
Q  213 ggcctt 218  Q
    ||||||    
T  45424727 ggcctt 45424732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31969883 - 31969695
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31969883 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 31969784  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31969783 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaa 31969695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 40428711 - 40428915
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40428711 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatg 40428810  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  40428811 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaac 40428910  T
Q  211 ggggc 215  Q
    |||||    
T  40428911 ggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 19913621 - 19913826
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19913621 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 19913720  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19913721 aaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 19913820  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  19913821 ggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 23776450 - 23776655
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776450 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 23776549  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23776550 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 23776649  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  23776650 ggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38055359 - 38055154
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055359 agagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 38055260  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  38055259 aaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 38055160  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  38055159 ggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 44784908 - 44785116
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44784908 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 44785007  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44785008 aaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 44785107  T
Q  211 ggggccttg 219  Q
    |||||||||    
T  44785108 ggggccttg 44785116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 1756755 - 1756958
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756755 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1756854  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  1756855 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1756954  T
Q  211 gggg 214  Q
    ||||    
T  1756955 gggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20877249 - 20877042
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20877249 agagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 20877150  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20877149 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 20877050  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||| ||||    
T  20877049 gggacctt 20877042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50353999 - 50353796
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353999 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 50353900  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  50353899 tatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 50353800  T
Q  215 cctt 218  Q
    ||||    
T  50353799 cctt 50353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 6611351 - 6611557
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  6611351 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatg 6611450  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6611451 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaac 6611550  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  6611551 ggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14987992 - 14987787
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14987992 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 14987893  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14987892 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 14987793  T
Q  213 ggcctt 218  Q
    ||||||    
T  14987792 ggcctt 14987787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 11639569 - 11639773
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639569 agagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 11639668  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11639669 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaac 11639768  T
Q  211 ggggc 215  Q
    |||||    
T  11639769 ggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055298
Alignment:
Q  18 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  118 tgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcc 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50055297  T
Q  217 t 217  Q
    |    
T  50055298 t 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 28032707 - 28032890
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28032707 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatac 28032806  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28032807 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 28032890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 37968748 - 37968939
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37968748 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 37968847  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37968848 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaacca 37968939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54412830 - 54412627
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  54412830 agagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatg 54412731  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54412730 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 54412631  T
Q  211 gggg 214  Q
    ||||    
T  54412630 gggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 27488639 - 27488845
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488639 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatg 27488738  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||||||||    
T  27488739 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaac 27488838  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  27488839 ggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48910048 - 48909842
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48910048 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatg 48909949  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48909948 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 48909849  T
Q  211 ggggcct 217  Q
     ||||||    
T  48909848 agggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16700983 - 16700782
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16700983 agagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 16700884  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16700883 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 16700784  T
Q  211 gg 212  Q
    ||    
T  16700783 gg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52139406 - 52139203
Alignment:
Q  11 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139406 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 52139307  T
Q  111 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaa 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  52139306 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaa 52139207  T
Q  210 cggg 213  Q
    ||||    
T  52139206 cggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 2481399 - 2481605
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481399 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 2481498  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2481499 aaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 2481598  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  2481599 ggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37464923 - 37464717
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464923 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 37464824  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  37464823 aaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaac 37464724  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  37464723 ggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 43289951 - 43290157
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289951 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 43290050  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| || ||||||||    
T  43290051 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaac 43290150  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    || ||||    
T  43290151 ggagcct 43290157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 8591083 - 8591270
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8591083 agagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatg 8591182  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8591183 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataa 8591270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 19164971 - 19165164
Alignment:
Q  19 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19164971 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactat 19165068  T
Q  119 gataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19165069 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 23704200 - 23704407
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23704200 agagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23704299  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  23704300 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaac 23704399  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
     |||||||    
T  23704400 agggcctt 23704407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1617286 - 1617084
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1617286 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatg 1617187  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1617186 aaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 1617087  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  1617086 ggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 30423556 - 30423762
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30423556 agagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatg 30423654  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  30423655 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaac 30423754  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||| ||||    
T  30423755 gggacctt 30423762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33704043 - 33703856
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33704043 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 33703944  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33703943 aaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataa 33703856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 6688618 - 6688817
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  6688618 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca------g 6688711  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  6688712 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 6688811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15669385 - 15669179
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15669385 agagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatg 15669286  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15669285 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 15669186  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  15669185 ggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 35490764 - 35490966
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35490764 agagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 35490863  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  35490864 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 35490963  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  35490964 ggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 27536095 - 27536297
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27536095 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 27536194  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    ||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  27536195 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaac 27536290  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  27536291 ggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47632237 - 47632032
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632237 agagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatg 47632138  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaa 209  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||||||    
T  47632137 aaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaa 47632038  T
Q  210 cggggc 215  Q
    ||||||    
T  47632037 cggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 8932169 - 8932376
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932169 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatg 8932268  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  8932269 aaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaac 8932368  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  8932369 ggggcctt 8932376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 53353265 - 53353050
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  53353265 agagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagct 53353166  T
Q  108 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccaca----taagctcaaaataaacc- 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |    |||||||||||||| ||     
T  53353165 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagcca 53353066  T
Q  203 atccaaacggggcctt 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  53353065 atccaaacggggcctt 53353050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53875859 - 53875658
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  53875859 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttata 53875760  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  53875759 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaac 53875660  T
Q  211 gg 212  Q
    ||    
T  53875659 gg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 44379178 - 44379365
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44379178 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 44379277  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  44379278 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataa 44379365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 27583623 - 27583810
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27583623 agagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatg 27583722  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27583723 caactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataa 27583810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071498
Alignment:
Q  25 aggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  125 ctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataa 38071498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 40680029 - 40680216
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40680029 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatg 40680128  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  40680129 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataa 40680216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 55344816 - 55345003
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  55344816 agagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatg 55344915  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344916 caaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataa 55345003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360445
Alignment:
Q  43 agctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttattta 141  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  142 cccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataa 28360445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30171782 - 30171581
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30171782 agagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatg 30171683  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30171682 aaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 30171583  T
Q  211 gg 212  Q
    ||    
T  30171582 gg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375844
Alignment:
Q  18 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  118 tgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16704024 - 16703843
Alignment:
Q  11 cagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704024 cagagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 16703925  T
Q  111 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctc 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  16703924 gaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 23269037 - 23269162
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23269037 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23269136  T
Q  112 aaactatgataaactatttttattta 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  23269137 aaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053439
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcct 217  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 53408222 - 53408137
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcag-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408222 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 148
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  66 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 148  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265955
Alignment:
Q  129 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggcctt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 23265955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 199
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548319
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataa 44548319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 23261877 - 23261937
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctga 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23261877 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 9595893 - 9595982
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||           | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9595893 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 9595981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 50055347 - 50055303
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055347 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 50055303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 48748260 - 48748197
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaa 75  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  48748260 agagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493370
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  165 atgggagtagata 177  Q
    || ||||||||||    
T  17493382 ataggagtagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 46257269 - 46257387
Alignment:
Q  81 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaac 180  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||  ||||||  |||||||||||    
T  46257269 gcttattaaactatagaataaacagcttatgaaattgtgataaactctttcaattgatttacccaaacaattttgtaaatgcttatgtcagtagataaac 46257368  T
Q  181 ccacataagctcaaaataa 199  Q
      |||||| || |||||||    
T  46257369 ttacataaacttaaaataa 46257387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  70 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 43
Target Start/End: Original strand, 55344684 - 55344715
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataa 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344684 agagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36907 - 36701
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36907 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 36808  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36807 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 36708  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  36707 ggggcct 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25897576 - 25897370
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897576 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 25897477  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  25897476 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 25897377  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  25897376 ggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 39260349 - 39260555
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39260349 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatg 39260448  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39260449 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 39260548  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  39260549 ggggcct 39260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20089673 - 20089466
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20089673 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 20089574  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20089573 aaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 20089474  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  20089473 ggggcctt 20089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26663460 - 26663257
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26663460 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatg 26663361  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26663360 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 26663261  T
Q  211 gggg 214  Q
    ||||    
T  26663260 gggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29078718 - 29078531
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078718 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatg 29078619  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29078618 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 29078531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29288349 - 29288145
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288349 agagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 29288252  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  29288251 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 29288152  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  29288151 ggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33510686 - 33510480
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510686 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33510587  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  33510586 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaac 33510487  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  33510486 ggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 52753150 - 52753356
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52753150 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatg 52753249  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  52753250 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 52753349  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  52753350 ggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1168705 - 1168499
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168705 agagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1168606  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1168605 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 1168506  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  1168505 ggggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 26580277 - 26580479
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580277 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 26580376  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26580377 tatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26580476  T
Q  215 cct 217  Q
    |||    
T  26580477 cct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7145409 - 7145226
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145409 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 7145310  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7145309 aaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaa 7145226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16052298 - 16052091
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052298 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16052199  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  16052198 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaac 16052099  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  16052098 ggggcctt 16052091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 1940750 - 1940956
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1940750 agagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatg 1940849  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  1940850 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1940949  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  1940950 ggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 970527 - 970734
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  970527 agagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatg 970626  T
Q  112 aaac--tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaa 208  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  970627 aaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 970726  T
Q  209 acggggcc 216  Q
    ||||||||    
T  970727 acggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2347859 - 2347652
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2347859 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttat 2347760  T
Q  111 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaac-catccaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2347759 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaa 2347660  T
Q  210 cggggcct 217  Q
    ||||||||    
T  2347659 cggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32671781 - 32671574
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32671781 agagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatg 32671682  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32671681 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaac 32671582  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  32671581 ggggcctt 32671574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 41928498 - 41928704
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41928498 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatg 41928597  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41928598 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaac 41928697  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  41928698 ggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38829271 - 38829084
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38829271 agagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatg 38829172  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38829171 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataa 38829084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 1170447 - 1170653
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170447 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 1170546  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  1170547 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaac 1170646  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  1170647 ggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 8079712 - 8079914
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8079712 agagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatg 8079811  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8079812 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 8079911  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  8079912 ggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 19715164 - 19715366
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19715164 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 19715263  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19715264 aaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaac 19715363  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  19715364 ggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 42370798 - 42371003
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42370798 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatg 42370897  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  42370898 aaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaac 42370997  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  42370998 ggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52696989 - 52696788
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696989 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 52696890  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52696889 tatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 52696790  T
Q  215 cc 216  Q
    ||    
T  52696789 cc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12683022 - 12682835
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12683022 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatg 12682923  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12682922 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataa 12682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2473924 - 2473722
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2473924 agagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 2473825  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2473824 aaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaac 2473725  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  2473724 ggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8121071 - 8120870
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8121071 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatg 8120972  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8120971 aaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 8120872  T
Q  211 gg 212  Q
    ||    
T  8120871 gg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43905852 - 43905648
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905852 aatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 43905753  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  43905752 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggag 43905653  T
Q  215 ccttg 219  Q
    |||||    
T  43905652 ccttg 43905648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49146374 - 49146167
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49146374 agagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatg 49146275  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49146274 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaac 49146175  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    || |||||    
T  49146174 ggagcctt 49146167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 17587510 - 17587694
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587510 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 17587609  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaata 198  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  17587610 aatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5215583 - 5215384
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5215583 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaac 5215484  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5215483 tatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 13996726 - 13996933
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13996726 agagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 13996825  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  13996826 aaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaac 13996925  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
     |||||||    
T  13996926 agggcctt 13996933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15203314 - 15203127
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15203314 agagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatg 15203215  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15203214 aaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataa 15203127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17591890 - 17591687
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17591890 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 17591791  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  17591790 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagat-aagccacataagctc--aataagccaatccaaac 17591694  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  17591693 ggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23498662 - 23498475
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  23498662 agagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatg 23498563  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23498562 aaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataa 23498475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 46761168 - 46760981
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46761168 agagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 46761069  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  46761068 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataa 46760981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40149665 - 40149499
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  40149665 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttata 40149566  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataa 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40149565 aaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 40149499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 46409639 - 46409450
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46409639 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 46409540  T
Q  110 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  46409539 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataa 46409450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6765659 - 6765458
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6765659 agaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaa 6765560  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  6765559 aatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgg 6765460  T
Q  213 gg 214  Q
    ||    
T  6765459 gg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40092689 - 40092506
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092689 aatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 40092590  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  40092589 tatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataa 40092506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 51359220 - 51359424
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51359220 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatg 51359319  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  51359320 aaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaac 51359418  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  51359419 ggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 15554155 - 15554353
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15554155 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatg 15554254  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||   |||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||||||||    
T  15554255 aa---atg-----ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaac 15554346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15717986 - 15717800
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15717986 agagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatg 15717887  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||  || |||||| ||||||||||    
T  15717886 aaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataa 15717800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  48 cttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  148 cacttttaaaaagtc-ttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacggggc 215  Q
    ||| ||||||||    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38172021 - 38171847
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||    
T  38172021 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatg 38171935  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  38171934 aaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataa 38171847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086282
Alignment:
Q  85 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccac 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  185 ataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||| |||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataa 52086282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323030
Alignment:
Q  66 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctta 165  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| | || |||||   |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  166 tgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataa 23323030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217921
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 147  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaa 5217921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108275
Alignment:
Q  29 tacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  129 ttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaaccatccaaacggggcctt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggcctt 1108275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 26323189 - 26323396
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323189 agagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 26323288  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26323289 aaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaac 26323388  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  26323389 ggggcctt 26323396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42937922 - 42937715
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42937922 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttat 42937823  T
Q  111 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  42937822 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaa 42937723  T
Q  210 cggggcct 217  Q
    ||| ||||    
T  42937722 cggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 31517218 - 31517423
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31517218 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatg 31517317  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  31517318 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaac 31517417  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    ||||||    
T  31517418 ggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 2178772 - 2178978
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178772 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 2178871  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaa-ccatccaaac 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  2178872 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaac 2178971  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  2178972 ggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 33906054 - 33906237
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906054 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 33906153  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33906154 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataa 33906237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 18806887 - 18807093
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18806887 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 18806986  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18806987 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaac 18807086  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  18807087 ggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 3873247 - 3873452
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873247 agagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3873346  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3873347 aaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3873446  T
Q  211 ggggcc 216  Q
    | ||||    
T  3873447 gaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4016241 - 4016039
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4016241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatg 4016142  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4016141 aaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaac 4016042  T
Q  211 ggg 213  Q
    |||    
T  4016041 ggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 16066302 - 16066484
Alignment:
Q  17 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066302 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 16066401  T
Q  117 atgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16066402 atgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataa 16066484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5733601 - 5733410
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5733601 agagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 5733502  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacca 203  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5733501 aaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaacca 5733410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 30270686 - 30270889
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30270686 aatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 30270785  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  30270786 tatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 30270885  T
Q  215 cctt 218  Q
    ||||    
T  30270886 cctt 30270889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 4232149 - 4232351
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232149 aatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaac 4232248  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  4232249 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacgggg 4232348  T
Q  215 cct 217  Q
    |||    
T  4232349 cct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 6174831 - 6175037
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  6174831 agagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatg 6174930  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6174931 aaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 6175030  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  6175031 ggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39635654 - 39635448
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39635654 agagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatg 39635555  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaac-catccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  39635554 aaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaac 39635455  T
Q  211 ggggcct 217  Q
    |||||||    
T  39635454 ggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 1482906 - 1483092
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482906 agagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1483005  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1483006 aaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataa 1483092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 19383938 - 19384125
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19383938 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatg 19384037  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | || |||| ||||||||||    
T  19384038 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataa 19384125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 28329844 - 28330027
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28329844 agaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaa 28329941  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28329942 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataa 28330027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 19901143 - 19901347
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19901143 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaa 19901242  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19901243 actatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19901341  T
Q  213 ggcctt 218  Q
    ||||||    
T  19901342 ggcctt 19901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 851199 - 851012
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  851199 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttata 851100  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  851099 aaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataa 851012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 430017 - 429831
Alignment:
Q  13 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  430017 gagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatga 429918  T
Q  113 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  429917 aattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataa 429831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 30420182 - 30420373
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420182 agagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaag------------ctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 30420269  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30420270 aacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 30420369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 16588783 - 16588985
Alignment:
Q  16 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588783 aatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16588882  T
Q  116 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgggg 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |    
T  16588883 tataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggag 16588982  T
Q  215 cct 217  Q
    |||    
T  16588983 cct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 44947552 - 44947732
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  44947552 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatg 44947644  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44947645 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataa 44947732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585313
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  165 atgggagtagataaacccacataagct 191  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagct 3585313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 178
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446738
Alignment:
Q  65 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtctt 164  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  165 atgggagtagataa 178  Q
    |||  |||||||||    
T  42446725 atgttagtagataa 42446738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 181
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101319
Alignment:
Q  72 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggag 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||  |||| || ||||||||| ||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  172 tagataaacc 181  Q
    ||||||||||    
T  22101310 tagataaacc 22101319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23159
Alignment:
Q  14 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  114 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaacgg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 23155  T
Q  213 ggcc 216  Q
    ||||    
T  23156 ggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10440 - 10233
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10440 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatg 10341  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa-accatccaaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||    
T  10340 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaac 10241  T
Q  211 ggggcctt 218  Q
    ||||||||    
T  10240 ggggcctt 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3912 - 3708
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3912 agagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 3813  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3812 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaac 3713  T
Q  211 ggggc 215  Q
    |||||    
T  3712 ggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 9 - 191
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatg 108  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaa 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  109 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaa 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 298 - 501
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  298 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatg 397  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaacc-atccaaac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  398 aaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaac 497  T
Q  211 gggg 214  Q
    ||||    
T  498 gggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 145248 - 145435
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  145248 agagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 145347  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  145348 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataa 145435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 9 - 197
Alignment:
Q  12 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatg 107  T
Q  112 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagtcttatgggagta---gataaacccacataagctcaaaataa 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  108 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataa 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University