View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4748-Insertion-7 (Length: 879)

Name: NF4748-Insertion-7
Description: NF4748
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4748-Insertion-7
NF4748-Insertion-7
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (6-879)||(3086634-3087507)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (74-695)||(4299050-4299671)
chr6 (13-544)||(4259534-4260065)
chr6 (6-691)||(4622356-4623039)
chr6 (13-560)||(4255985-4256523)
chr6 (9-695)||(4626168-4626854)
chr6 (13-450)||(4461344-4461781)
chr6 (40-472)||(4613170-4613602)
chr6 (14-691)||(4585858-4586535)
chr6 (13-531)||(4602010-4602531)
chr6 (13-556)||(4514489-4515032)
chr6 (13-531)||(4266559-4267077)
chr6 (14-531)||(4563933-4564453)
chr6 (9-691)||(4557342-4558024)
chr6 (48-559)||(4598427-4598938)
chr6 (9-531)||(4560723-4561243)
chr6 (14-531)||(4592453-4592973)
chr6 (11-450)||(4579651-4580090)
chr6 (9-538)||(4516538-4517067)
chr6 (40-531)||(4574556-4575047)
chr6 (26-447)||(4489832-4490253)
chr6 (30-450)||(4470041-4470461)
chr6 (26-565)||(3171975-3172514)
chr6 (13-472)||(4506078-4506537)
chr6 (6-472)||(4571186-4571652)
chr6 (45-531)||(4480946-4481432)
chr6 (32-531)||(4457834-4458334)
chr6 (40-472)||(4617270-4617705)
chr6 (40-450)||(4503871-4504281)
chr6 (40-448)||(4568304-4568700)
chr6 (13-183)||(4493176-4493346)
chr6 (75-253)||(4391794-4391976)
chr6 (368-427)||(4835512-4835571)
chr6 (639-685)||(4612957-4613003)
chr6 (634-691)||(4571814-4571871)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (13-565)||(3077-3630)
[»] scaffold0477 (2 HSPs)
scaffold0477 (40-574)||(4039-4570)
scaffold0477 (642-683)||(3930-3971)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (13-531)||(24103220-24103738)
chr5 (13-278)||(27999745-28000010)
chr5 (425-553)||(24107008-24107136)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (13-472)||(1281335-1281797)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (13-474)||(1674447-1674911)
chr8 (9-459)||(16685732-16686182)
chr8 (12-597)||(20863170-20863755)
chr8 (623-691)||(16685519-16685587)
chr8 (78-128)||(1965197-1965247)
chr8 (81-127)||(1969140-1969186)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (40-168)||(3441-3568)
scaffold0475 (174-271)||(3162-3259)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (337-474)||(8-148)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 694; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 694; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 879
Target Start/End: Original strand, 3086634 - 3087507
Alignment:
Q  6 cagatatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3086634 cagatatatctacagtttattggttgatctccataaaatggccaacacaacattggcactccagcaagtacgctttcaaccgttgagttccatccacaat 3086733  T
Q  106 gactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086734 gagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaatacttgctcttgcggacaccagcttgcgattagacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 3086833  T
Q  206 tgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgc 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3086834 tgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagttgc 3086933  T
Q  306 tctggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaa 405  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3086934 tcttgagtcataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagactcaagtccctttgattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaa 3087033  T
Q  406 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087034 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgaagtttgatttagtagtgaaggtaatggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgc 3087133  T
Q  506 attcattgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatcccccacttcaacgacaaattctaaaatggga 605  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3087134 attcattacatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatcccccacttcaatgacaaattctaaaatggga 3087233  T
Q  606 tcttttcgatcttcaacccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactttggtgtc-taaaatctcatct 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| |    
T  3087234 tcttttcgatcttcaacccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactctggcgtcagaaactctcatat 3087333  T
Q  705 gcttgtcataattatagaagaagtcaatagcttactaggaatacactctctaacgctttctaacacacnnnnnnnattggttaacatttatgagtctcgt 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||       | ||||| |||||||||||| ||||    
T  3087334 gcttgtcataattatagaagaagtcaatagcttgctaggaatacactctc-aacgctttctaacacacttttttcactggtttacatttatgagtttcgt 3087432  T
Q  805 caaattatgtgggactcatgaatgtaaatcagtaagagtgtgttgaaaagtgtttgacaaagagttcgttactaa 879  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3087433 taaattatgtgggactcatgaatgttaatcagaaagagtgcgttgaaaagtgtttgacaaagagtttgttactaa 3087507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 4299671 - 4299050
Alignment:
Q  74 tatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcga 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |     
T  4299671 tatgctttcaatggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacactagcttgcggttagg 4299572  T
Q  174 cctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctat 273  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4299571 cctctatttgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacaagccgccaatgacaaggtctggcctaatgatccacaaaaatggtttcctgcaat 4299472  T
Q  274 tggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaag 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||    
T  4299471 tggccaaaccccaagcaatctctaacagttgctctggagtcataactgtaacgctgccaaaattcacataaacaaccgatcccggctccttggattcaag 4299372  T
Q  374 ccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatg 473  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  4299371 ccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaata 4299272  T
Q  474 gtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctat 573  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||    
T  4299271 gtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcattacatcactctcaagttcatcataagtattaaaaacaatagcagatgctttgtgaaatctat 4299172  T
Q  574 cccccacttcaacgacaaattctaaaatgggatcttttcgatcttcaacccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaat 673  Q
    |  || |||||| | |||||||||  |||  ||| ||| ||| |  |  |||||| | |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4299171 ctgccgcttcaatggcaaattctaccatgacatcatttggatttgtactccttataaagtcagttagatctttcaatcgaaagttctgcaatcctggaat 4299072  T
Q  674 acagtctactttggtgtctaaa 695  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  4299071 acagtctagtttgatgtctaaa 4299050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4260065 - 4259534
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||    
T  4260065 atctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaacttcggcacaaatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagttaa 4259966  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  4259965 gaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgcgattaggcctctatccgaaatttcactctcaaactcagatgacaaa 4259866  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    ||||||||||| | ||| |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  4259865 ataaaggagccaccaataatgaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaaaaattgatctggag 4259766  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4259765 tcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttaaattcaagccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattgga 4259666  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcatt 512  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4259665 acctaacgatgccaggtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaatagcatataaagaagggaacatagaatagagcacattcatt 4259566  T
Q  513 gcatcactctcaagttcatcataagtgttaaa 544  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4259565 acatcactctcaagttcatcataagtgttaaa 4259534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 6 - 691
Target Start/End: Original strand, 4622356 - 4623039
Alignment:
Q  6 cagatatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaat 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||| |||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  4622356 cagatatatctacagtttgttggctgatcagcgaaaaatggccaacacagcattgaaactccagcacatatgctttcggtggttgaattccatccacaat 4622455  T
Q  106 gactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 205  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4622456 gagtcaagaatccaccaattgcagggtggttaagtacttcctcttgtggacaccaacctgcgattaggcctctacctgaaatttcattctcaaactcaga 4622555  T
Q  206 tgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgc 305  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4622556 tgacaaaataaacgagccgcccatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaatagttga 4622655  T
Q  306 tctggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaa 405  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4622656 tctcgagtcatcactgtaatgctgccaaaattcacgtaaaca--agagtcaggttccttggattcaagccactcaagacacttgatatcttctttccaaa 4622753  T
Q  406 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgc 505  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| |||||    
T  4622754 gattggaacctagagatgccaagtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaacggtatacaaagatgggaacattgaatagagcgc 4622853  T
Q  506 attcattgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatcccccacttcaacgacaaattctaaaatggga 605  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |  ||  || |||||| || ||||||||  |||  |    
T  4622854 attcatcgcatcagtctcaagttcattataagtattaaaaataatagcagaggatttgtgaaatcgttctgccgcttcaatgagaaattctaccatgaca 4622953  T
Q  606 tcttttcgatcttcaacccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactttggtgtc 691  Q
    || ||| | |||  || |||||| | |||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4622954 tcatttggctctgtaatccttataaagtcaggcaaatcctttaaccgaaagttcttcaatccaggaacacagtctacttcggtgtc 4623039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 4256523 - 4255985
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggt-tgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactca 111  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  4256523 atctacagtttgttggtctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccggcacaaatgctttcaatggttgagttccatcctcaatgagtca 4256424  T
Q  112 agaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacat 211  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||||             |||||||||||     
T  4256423 agaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccaactctcgattagtcctctatccgaaa-------------ctcagatgacaa 4256337  T
Q  212 aataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctgga 311  Q
    |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4256336 aataaaggagccaccaatgacgaggtcaggcctaatgatacacaaaaatggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaacagttgatctgga 4256237  T
Q  312 gttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgg 411  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4256236 gtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttggattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattgg 4256137  T
Q  412 aacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacag---aatatagcgcatt 508  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||   |||| || |||||    
T  4256136 aacctaacgatgccaagtgactatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaatggtatacaaacaagagaacatagaataatagagagcatt 4256037  T
Q  509 cattgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggct 560  Q
    || | |||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  4256036 caatacatcgctctcaagttcattataagtgttaaaaacaatagcagaggct 4255985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 695
Target Start/End: Original strand, 4626168 - 4626854
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| || ||   |||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4626168 atatatctacaatttgttggctgatcagcaaaatttggccaacacagcattggaactccagcgcatatgctttcaatggttgagttccatccacaatgag 4626267  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4626268 ttaagaatccaccaattgaaggatggttcagtactttctcttgcggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcggatga 4626367  T
Q  209 cataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    |  |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4626368 cgaaataaatgagccaccaatcacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagtttctgt 4626467  T
Q  309 ggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  4626468 ggagtcataactataacgctgccaaagttcacataaacaacagactttggttccttgaattcaagccattcaagacaattggtgtcttctttccaaagat 4626567  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcatt 508  Q
    ||||||||||||||  ||| || || |||||| || |||| |  || ||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||    
T  4626568 tggaacctaaagatatcaactggttttgtggacttcgattcaaaagagaatgcaaaggtccaatggtatatacagaaaggaacgtagaatagagcgcatt 4626667  T
Q  509 cattgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatcccccacttcaacgacaaattctaaaatgggatct 608  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||| || ||| |||| || |||||  || |||||| || ||||||||  |||  |||     
T  4626668 cattacatcaccctcaagttcatcgtaagtgttgaaaacaatagccgatgctctgtgaaatctatctgccgcttcaatgagaaattctaccatgacatca 4626767  T
Q  609 tttcgatcttcaacccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactttggtgtctaaa 695  Q
    ||  ||| |     |||||| | || | | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  4626768 ttaggatttgttgtccttataaagttaagaaggtccttcagccgaaagttctgcaatccgggaatacaatctagtttggtgtctaaa 4626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 450
Target Start/End: Original strand, 4461344 - 4461781
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4461344 atctacagtttgctggctgatcaccaaagaatggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaa 4461443  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  4461444 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaa 4461543  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4461544 ataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagttgatcaggag 4461643  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  4461644 tcataactgtgatgctgccaaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 4461743  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    |  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  4461744 atttaaagatgccaggtgattttgtggactttgattta 4461781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 40 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 4613602 - 4613170
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  4613602 aaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggtttaa 4613503  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatca 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||    
T  4613502 tacttgctcttgaggacaccagctcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactctgatgacaaaacaactgagccgccaatgacaagatca 4613403  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  4613402 ggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctattcgccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataacggtcatgctcccaaaattca 4613303  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||    
T  4613302 cataaacaacggacttcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacttaaacttgccaagtgattttgtgg 4613203  T
Q  440 aatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaat 472  Q
    | ||||| |||  ||||||| |||||| |||||    
T  4613202 actttgacttaaaagtgaagataaaggaccaat 4613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 691
Target Start/End: Original strand, 4585858 - 4586535
Alignment:
Q  14 tctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaag 113  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4585858 tctacagtttgttggctgatcagcaatgaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacagtgagtcaag 4585957  T
Q  114 aatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  4585958 aatccaccaattgaagggtggttcaatacttgctcttgcgggcaccaacccgcgattaggcctctatctgaaatttcattcttaaactcagatgacaaaa 4586057  T
Q  214 taaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagt 313  Q
      ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  4586058 ccaaggaaccaccaatgacaagatcaggtctaatgatccataaaaaatgttgcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgtagt 4586157  T
Q  314 tataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaa 413  Q
     ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |    
T  4586158 cataactgttgtgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttggtatcctctttccaaagatttgta 4586257  T
Q  414 cctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattg 513  Q
    | ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  | ||| | |||||| ||||||| ||| |  |||||||||  ||   | ||  |||| |||     
T  4586258 cttaaagatgctaagtggttttgtggactttgatttaaaaatgatgataaagggccaatggcataaatagaagggaacttagtggagagaacatttatta 4586357  T
Q  514 catcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatccc--ccacttcaacgacaaattctaaaatgggatctttt 611  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||  |||  | ||  |  |||||| || ||||||||  || | ||| |||    
T  4586358 catccttctcaagttcatcagaagtattaaaaataaaagcagagtctttgtg--agccgttcctgcgccttcaatgataaattctatgatcgaatcattt 4586455  T
Q  612 cgatcttcaacccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactttggtgtc 691  Q
     ||||   || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4586456 ggatcagtaatccttataaagtcaggcaaatcctttagtcgaaagttctccaatcctggaatacagtccactttagtgtc 4586535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 531
Target Start/End: Original strand, 4602010 - 4602531
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4602010 atctacagtttgttggctgatcggcaaaaaaaggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaa 4602109  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||| || || |||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |    
T  4602110 gaatccgccgatcgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcatttgtaaactcagatgacaaa 4602209  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    || |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  || |    
T  4602210 atcactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttatggcaattggccaaaccccaagcgaattctaataattgatggggtg 4602309  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||    
T  4602310 tcataactgtaatgctgccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccagaggttgga 4602409  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattc 509  Q
    ||||||| |  |||| ||||   | |||||| ||||||||| || |||| | |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4602410 acctaaacagtccaattgatgaatttgtggagtttgatttaataatgaatgcaaaggtccgatagtatataaagaagggaacatagaatatagtgcattc 4602509  T
Q  510 attgcatcactctcaagttcat 531  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4602510 attacatcactctcaagttcat 4602531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4515032 - 4514489
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||| | |||||||||||||||   |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4515032 atctacagtttgttggttgatcaccaaagaattgccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctctcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 4514933  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |    
T  4514932 gaatccgccaattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattcacaaactcagacgacaaa 4514833  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    |  |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  4514832 accactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaaggttttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttctccggag 4514733  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      |||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  4514732 acataatcgtgatgctaccaaaattaacataaacaacagatcctgattcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 4514633  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcatt 512  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |  |  ||||  || || |||||||| ||||  ||||||| || |||||| || ||||||||     
T  4514632 acctaaagattccaagtgattttgtggactttgattcaaaaacgaagcaaatgggccaatggtgtatagagaagggagcatagaataaagagcattcata 4514533  T
Q  513 gcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcaga 556  Q
     ||||||||||||| |||| | |||| || || | |||||||||    
T  4514532 acatcactctcaagatcattagaagtatttaaaaaaatagcaga 4514489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 4267077 - 4266559
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4267077 atctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaa 4266978  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |    
T  4266977 gaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttaaaaaaatcagatgacaaa 4266878  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    | ||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| | |    
T  4266877 acaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtg 4266778  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  4266777 acataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 4266678  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcatt 512  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||  || || |||||||| ||||  |||||||||| ||| || || ||||||||     
T  4266677 atttaaagatgccaagtgattttgtggactttgatttaaaaaagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcata 4266578  T
Q  513 gcatcactctcaagttcat 531  Q
     ||||||||||||||||||    
T  4266577 acatcactctcaagttcat 4266559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 531
Target Start/End: Original strand, 4563933 - 4564453
Alignment:
Q  14 tctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaag 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4563933 tctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaag 4564032  T
Q  114 aatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  4564033 aatccgccaattgaagggtggttcaatactttctcctgtggacaccaacttgcaattaagcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaa 4564132  T
Q  214 taaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagt 313  Q
      |  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||    
T  4564133 cgactgagccaccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttattgcaattggccaacccccaagcaaattccaacagttgttttggtgt 4564232  T
Q  314 tataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaa 413  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  4564233 cataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacacttagtatcttctttccaaaggttggaa 4564332  T
Q  414 cctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattca 510  Q
    ||||||||  |||| ||||   | |||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||  || |  ||||| |||| |||  | || ||||| |    
T  4564333 cctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcattta 4564432  T
Q  511 ttgcatcactctcaagttcat 531  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  4564433 ttacatcactctaaagttcat 4564453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 691
Target Start/End: Original strand, 4557342 - 4558024
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  4557342 atatatctgcagtttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgag 4557441  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  4557442 tcaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagcccgcgattaggcctctatctgaaatttcattgacaaactccgatga 4557541  T
Q  209 cataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    || || ||  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  4557542 caaaacaactgagccaccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttct 4557641  T
Q  309 ggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    |  || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4557642 gccgtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttccttggattcaagccaaccaagacacttgttatcttctttccaaagat 4557741  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcatt 508  Q
    ||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||| || ||   | | |     ||||||   ||  | ||  ||||    
T  4557742 tggtacttaaacttgccaagtgattatgtggactttgacttaaaagtgaagataaagggccgataccacaaatatttgggaacgtcgaggagagaacatt 4557841  T
Q  509 cattgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatcccccacttcaacgacaaattctaaaatgggatct 608  Q
    |||| ||||  |||||||||||  | |||| ||||| |||| |||||| ||||||||    ||  |  |  ||||||||| ||||||||  || | |||     
T  4557842 cattacatccttctcaagttcactagaagtattaaaaataaaagcagacgctttgtgagcccttcctgctgcttcaacgataaattctaccatcgaatca 4557941  T
Q  609 tttcgatcttcaacccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactttggtgtc 691  Q
    |||  ||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  4557942 tttgtatctgtaatccttataaagtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacaatccactttagtgtc 4558024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 559
Target Start/End: Original strand, 4598427 - 4598938
Alignment:
Q  48 caacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgct 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  4598427 caacacaacattggcactccggcacatatactttcagtggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgct 4598526  T
Q  148 cttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaat 247  Q
    ||||| ||||||||||||| | |   ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4598527 cttgcagacaccagcttgcaactaagcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaat 4598626  T
Q  248 gatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaaca 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||| ||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  4598627 gatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaagtctaacaacttttctgcagtcatcaccgttatgctcccaaaattcacataaaca 4598726  T
Q  348 acagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgat 447  Q
    |||||    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| || ||||||    
T  4598727 acagaccttggttcattggattcaagccagtcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacctaaagatgccaaatgcttttgttgactttgat 4598826  T
Q  448 ttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagat 547  Q
    |||  |  |||| |||||| ||||||| ||| |   ||||||||| |    | ||  |||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||  ||    
T  4598827 ttaaaaacgaagataaagggccaatggcataaatacaagggaacatactggagagaacattcaatacatcattctcaagttcattacaagtgttaagaat 4598926  T
Q  548 aatagcagaggc 559  Q
     |||||||||||    
T  4598927 tatagcagaggc 4598938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 531
Target Start/End: Original strand, 4560723 - 4561243
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
T  4560723 atatatcttcagtttgctggctgatctgcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgag 4560822  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  4560823 tcaagaatccaccgactgatgggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttc-aaaaatcagatga 4560921  T
Q  209 cataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
     | ||  |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  4560922 gaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaatggtttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaa-ggcttctct 4561020  T
Q  309 ggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
     |||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  4561021 tgagacttaacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagat 4561120  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcatt 508  Q
    |  |  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |  |||| ||| || ||||| || ||||  |||||||||| |||||| |  |||||    
T  4561121 tacagtctaaagatgtcaagtgattttgtggactttgatttacaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagggaacatagaatagaaagcatt 4561220  T
Q  509 cattgcatcactctcaagttcat 531  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  4561221 cataacatcactctcaagttcat 4561243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 531
Target Start/End: Original strand, 4592453 - 4592973
Alignment:
Q  14 tctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaag 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | | || ||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4592453 tctacagtttgttggctgatcactaaagaatggccaacacaacattggaattccagcacatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaag 4592552  T
Q  114 aatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  4592553 aatccaccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggacaccagctcgcgattacgcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaa 4592652  T
Q  214 taaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagt 313  Q
     ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |    
T  4592653 caattgtgccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaaaggtttattgcaattggccaaaccccaagcaaactctaacattttctcttcatt 4592752  T
Q  314 tataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaa 413  Q
     ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |  ||||||    
T  4592753 cataactgtaaggctgccgaaattcacataaacaacggaacccgattccttcgattcaagccatttaagacactcagtatcttctttccatatgttggaa 4592852  T
Q  414 cctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattca 510  Q
    || |||||  |||| ||||   | |||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||  || |  ||||| |||| |||  | || ||||| |    
T  4592853 ccaaaagaatccaattgatggatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcattta 4592952  T
Q  511 ttgcatcactctcaagttcat 531  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  4592953 ttacatcactctcaagttcat 4592973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 450
Target Start/End: Original strand, 4579651 - 4580090
Alignment:
Q  11 atatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactc 110  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||    
T  4579651 atatctgcagcttactgggtgatcagcgaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtgattgagttccatccgcaatgagtc 4579750  T
Q  111 aagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  4579751 aagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgttattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgaca 4579850  T
Q  211 taataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctgg 310  Q
     || |   |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||     
T  4579851 aaacagctgagccgccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgc 4579950  T
Q  311 agttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattg 410  Q
    ||| ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4579951 agtcataactgtcaagctcccaaaattcacataaacaacagacctaggttccttggattcaagccaataaagacacttggtatcttctttccaaaaattg 4580050  T
Q  411 gaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgattta 450  Q
    |  | |||||||| ||| || || | |||| |||||||||    
T  4580051 gtgcttaaagatgtcaaatggttttctggactttgattta 4580090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 538
Target Start/End: Original strand, 4516538 - 4517067
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| || ||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| |  || ||||||||||||||||||     
T  4516538 atatatctgcaatttgttggctgctcagcaaaaaaaggccaacacaacattggtactccggcacagatgctttccattgtggagttccatccacaatgag 4516637  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| |||| ||| |||| || |||||    
T  4516638 tcaagaatcctccaactgaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccagcttgctattacgcctctatccgaagtttcattcacaaaatcggatga 4516737  T
Q  209 cataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    || |||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4516738 caaaataaccgagccaccaatgacaaggtcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctgttggccaaaccccaagcgaactctaacagttgatct 4516837  T
Q  309 ggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  4516838 ggagtcatgaccgtgatgcttccaaaattcacataaactacagaaccttgttccttagattcaagccattcaagacatttcatatcttctttccaaagat 4516937  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcatt 508  Q
    | ||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||||| |  | ||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||| |  |  | |||| |||||    
T  4516938 tagaacctatagaagccaagttattttgcggactttgattcaaaaatgaagttaaagggccaatggcataaatagaagggatcttaatagatagagcatt 4517037  T
Q  509 cattgcatcactctcaagttcatcataagt 538  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  4517038 tattacatcattctcaagttcatcagaagt 4517067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 531
Target Start/End: Original strand, 4574556 - 4575047
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  4574556 aaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaa 4574655  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatca 239  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||  |  ||||| | |||||||||||||    
T  4574656 tactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatca 4574755  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||| |||  ||||| || |||||||||||| | |    
T  4574756 ggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattta 4574855  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  4574856 cataaacaacagatcttggttcttttgattcaatccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtgg 4574955  T
Q  440 aatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctcaagttcat 531  Q
    | |||||||||  |  |||| ||| || ||||| || ||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4574956 actttgatttacaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagggaacatagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 4575047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4490253 - 4489832
Alignment:
Q  26 tggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaatt 125  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || || | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4490253 tggttgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatactctccatgattgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaatt 4490154  T
Q  126 gaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgc 225  Q
    |||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |     ||||| |    
T  4490153 gaagggtgattcaataccttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgacaacacctgtgagccac 4490054  T
Q  226 taatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaat 325  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||  ||||| || ||    
T  4490053 caataacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaatagcttctctcgagacataacagtgat 4489954  T
Q  326 gctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgcc 425  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||  |    
T  4489953 gctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatttc 4489854  T
Q  426 aagtgattatgtggaatttgat 447  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  4489853 aagtgattttctggaatttgat 4489832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 450
Target Start/End: Original strand, 4470041 - 4470461
Alignment:
Q  30 tgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaag 129  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4470041 tgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaag 4470140  T
Q  130 ggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||| | ||  ||| ||| ||||| | ||  |  ||||||| |||    
T  4470141 ggtggttcagtacttgctcttgaggacaccagttcacgattaggcctctatctgaaattccatttacaatctctgatgagaaaactaccgagccgccaat 4470240  T
Q  230 gacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctg 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || | ||||    
T  4470241 gacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgccaaaccccaagcaaactctaacagtttctctggagacataactgtgacgctg 4470340  T
Q  330 ccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagt 429  Q
    || ||| | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |  |    
T  4470341 ccgaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgaaatttaaagatgctagat 4470440  T
Q  430 gattatgtggaatttgattta 450  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  4470441 gattttgtggactttgattta 4470461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 565
Target Start/End: Original strand, 3171975 - 3172514
Alignment:
Q  26 tggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaatt 125  Q
    |||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||  |||||   ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  3171975 tggttgatcagcaaaaaatggcctacacaacattggcattccagcacatacactttccgtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaatccgccaatt 3172074  T
Q  126 gaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgc 225  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||  ||||| |    
T  3172075 gaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccac 3172174  T
Q  226 taatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaat 325  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | || |||| |||  |||||  | ||    
T  3172175 caatgacaagatcaggcctaataatccacaaaaagggtttcttgctgttggctaaaccccaagcaaactctaataatttctcttgagacataactatgat 3172274  T
Q  326 gctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgcc 425  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  | ||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3172275 gctgccaaaatttacataaacaacagattttgattcttttgtttcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagaatctaaagatgcc 3172374  T
Q  426 aagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctcaa 525  Q
    |||||||| || ||| ||||| |||  |  ||||  || || ||||| || ||||  |||||||| | ||||   || | ||||||  ||||||||||||    
T  3172375 aagtgattttgcggactttgacttaaaaacgaagcgaacggaccaattgtgtatagagaagggaatatagaactaagagtattcataacatcactctcaa 3172474  T
Q  526 gttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtg 565  Q
    |||||| | ||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  3172475 gttcattagaagtgttgaaaacaatagcagaagctttgtg 3172514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 472
Target Start/End: Original strand, 4506078 - 4506537
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4506078 atctacagtttgttggttgatcaccaaagaacggccaacacagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 4506177  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||| | |||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| ||  ||||||| || |||| |    
T  4506178 gaatccaccaattgaagggtgatttaacactttctcttgtgaacaccagcttgctataaggcttctatctgaaatttcatttgcaaactctgaagacaaa 4506277  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    |  |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||    
T  4506278 accactgagccaccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaaaaatttctccggag 4506377  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      ||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||    
T  4506378 acataattgtgatgcttccaaaattcacataaacaacagaagccggttcttttgattccagccattcgagacatttagtatcctctttccaaagatttga 4506477  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaat 472  Q
    | |||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| |||||| |||||    
T  4506478 atctaaagttgcaaactgattttgtggactttgatttacaaatgaagttaaagggccaat 4506537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 472
Target Start/End: Original strand, 4571186 - 4571652
Alignment:
Q  6 cagatatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||    ||||||||||||||||| |    
T  4571186 cagatatatctacagtttgctggctgatcagcaaaaaatggctaacacaacattggaactccagtagatatgctttcggtcgttgagttccatccacagt 4571285  T
Q  106 gactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcaga 205  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||| |  || ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  4571286 gagtcaagaaaccaccaattgaaggatggttcaatactttctcttgcgagcaccaaccagcaattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccga 4571385  T
Q  206 tgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgc 305  Q
    ||||| || ||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||      
T  4571386 tgacaaaacaactgagccaccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagagttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttt 4571485  T
Q  306 tctggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaa 405  Q
    |||| ||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4571486 tctgaagtcataactgtcctgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttgttatcttctttccaaa 4571585  T
Q  406 gattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaat 472  Q
    |||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||||| |||||    
T  4571586 gattggtacttaaacttgccaagtgattctgtggactttgacttaaaagtgaagataaagggccaat 4571652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 531
Target Start/End: Original strand, 4480946 - 4481432
Alignment:
Q  45 ggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtactt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||    
T  4480946 ggccaacacaacattggcactccagcacatacactttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaaaactt 4481045  T
Q  145 gctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcct 244  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  |  |  ||||| | ||||||||||| || |||    
T  4481046 tctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatttgaaatttctttcaaatactcagatgacaacaccactgagccaccaatgacaagattagacct 4481145  T
Q  245 aatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataa 344  Q
    ||| |||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  4481146 aataatccacaaaaagttttttttgctattggcaaaaccccaagcaaactctaagagtttctcttgagacataattgtgatgctgccaaaatttacataa 4481245  T
Q  345 acaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaattt 444  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||  |||||| |||    
T  4481246 acaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaatgtttccaagtgatattgtggacttt 4481345  T
Q  445 gatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctcaagttcat 531  Q
    ||||||  |  ||||  || || |||||||| ||||  |||||||| | |||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  4481346 gatttaaaaaagaagccaatggaccaatggtgtatagagaagggaatatagaatagagagaattcataacatcactctcaagttcat 4481432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 531
Target Start/End: Original strand, 4457834 - 4458334
Alignment:
Q  32 atcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaaggg 131  Q
    ||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4457834 atcaccaaagaatggccaacgcagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtttcatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaaggg 4457933  T
Q  132 tggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatga 231  Q
    |||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||| |||   |||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||| || ||  ||||| | |||||    
T  4457934 tggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattaagcctctatcagaagtttcattcacaaaatccgatgacaaaacaaccgagccaccaatga 4458033  T
Q  232 caagatcaggcctaatgatccacaaaaatgg-tttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgc 330  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || | |||| |||  ||||| || ||||| |    
T  4458034 caagatcaggcctagttatccacaaaaaaggttttcttgctgttggccaaaacccaagcaaattctaagagcttctcttgagacataactgtgatgcttc 4458133  T
Q  331 caaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtg 430  Q
    ||||| | ||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4458134 caaaatttacataaataacagactttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatattctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtg 4458233  T
Q  431 attatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctcaagttca 530  Q
    ||| |||||| |||||||||  |  ||||  || || |||||||| ||||  |||||||||| ||| || || | ||||||  |||||||||||||||||    
T  4458234 attttgtggactttgatttataaaagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagtattcataacatcactctcaagttca 4458333  T
Q  531 t 531  Q
    |    
T  4458334 t 4458334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 472
Target Start/End: Original strand, 4617270 - 4617705
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  4617270 aaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatactttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaa 4617369  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatca 239  Q
     ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||| ||   |||||||||||| | ||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  4617370 cactttgtcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgagaaaatcactgagccaccaatgacaagatca 4617469  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  | |||||| || || ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  4617470 ggccttatgatccacaaaaatgatttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattca 4617569  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgat---tatg 436  Q
    |||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||   | ||    
T  4617570 cataaacaactgatcccggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaagagtccaattgatgaatttg 4617669  T
Q  437 tggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaat 472  Q
    |||| |||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  4617670 tggagtttgttttaataatgaaggtaaagggccaat 4617705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4504281 - 4503871
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  4504281 aaaatggccaacacaacattggcactccagcacaaacactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaa 4504182  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatca 239  Q
     ||||  ||||| |||||||| ||||| |   | |||||||  ||| |||| ||| |||| ||||||||||  |     ||||| | ||| |||||||||    
T  4504181 cactttatcttgtggacaccaacttgctacaagtcctctattagaagtttcattcacaaaatcagatgacaacacctctgagccaccaataacaagatca 4504082  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  4504081 ggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttatcttaagacataactgtaatgctgccaaaattta 4503982  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  4503981 cataaacaacagatcctggttcttttaattcaagccaatcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtgg 4503882  T
Q  440 aatttgattta 450  Q
    | |||||||||    
T  4503881 actttgattta 4503871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 448
Target Start/End: Original strand, 4568304 - 4568700
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  |||   |||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||     
T  4568304 aaaaaggccaacataacattggtactctggcacaaatgctttccaatgtggagttccatccacaatgagtcaagaatcgtccaactgaagggtggttcaa 4568403  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatca 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| | ||||||||| | |    
T  4568404 cacttgctcttgcggacaccagcttgctatttggcctctatccgaagttccattcacaaactcggatgacaaaataactgagccaccaatgacaagctaa 4568503  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||   ||||||||||| |||||| || |||| |||||| |||    
T  4568504 ggcctaatgatccacaaaaaaggtttcttgctgttggcaaaacctcaagagaactctaac---tgctctggagtcataaccatagtgcttccaaaattca 4568600  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||| |         |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  4568601 cataaactacagaaccttgttccttag---------attcaagacatttcatatcttctttccaaagattggaacctaaagaagccaagtgcttttgggg 4568691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 4493176 - 4493346
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4493176 atctacagtttgttggctgatcactaaagaaaggccaacacaacattggcactccggcacatatgtttttggtagttgagttccatccacaatgagtcaa 4493275  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctg 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||    
T  4493276 gaatccaccaatcgaatggtggttcagcagtttctcttgtggacaccaactagcaattaggcctctatctg 4493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4391976 - 4391794
Alignment:
Q  75 atgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcga----tt 170  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||     |    
T  4391976 atgctttcaatgggtgagtttcatccacaatgcgttaagaatccacaaattcaagggtggttcaatacttgctctttcggacaccatcttgcgactagat 4391877  T
Q  171 cgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatcca 253  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| || | | || | || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4391876 agacctctatctgaaatttcattctcatactcatataacaaaacacatgacctgccaatgacaaggtcaagcctaatgatcca 4391794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4835571 - 4835512
Alignment:
Q  368 ttcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaa 427  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4835571 ttcaagccattcaagacattttgtatcttccttccaaagatcggaacctaaagatgccaa 4835512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 4613003 - 4612957
Alignment:
Q  639 agatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctacttt 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4613003 agatccttcagtcgaaagttctgcaatccttgaatacagtccacttt 4612957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 634 - 691
Target Start/End: Original strand, 4571814 - 4571871
Alignment:
Q  634 caggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactttggtgtc 691  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4571814 caggcaaatccctcagtcgaaagttcttcagtcctggcatacagtccactttagtgtc 4571871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3630 - 3077
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3630 atctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggtactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaa 3531  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |    
T  3530 gaatccaccaattgaagggtggatcagtacttgctcttgtggacaccagcttgtgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctgatgacaaa 3431  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  3430 ataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaacggtttcttgctatcggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatttggag 3331  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3330 tcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattgga 3231  T
Q  413 acct-aaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcat 511  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||     
T  3230 acctaaaagattccaagtgattatgtggagtttgacttaataatgaaggtaatggtccgatactgtataatgatgggaacatagagtggagcgcattcag 3131  T
Q  512 tgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtg 565  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||    
T  3130 tacatcactctcaagttcattataagtgttaaaaacaattgcagaagctctgtg 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 40 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 4570 - 4039
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570 aaaatggccaacacaacattggcactcctacacatatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 4471  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatca 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  4470 tacttgctcttgtggacaccagctcgcaattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaaggtca 4371  T
Q  240 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggagttataaccgtaatgctgccaaaactca 339  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  4370 ggcctaatgatccacaaaaaggatttcttacaattggtcaaaacccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgcttccaaaattca 4271  T
Q  340 cataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgg 439  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  4270 cataaacaaccgactcaggttccttggatgcaagccactcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat---tagtgattatgtgg 4174  T
Q  440 aatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctcaagttcatcataagtg 539  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| | || | |||||||||||||| ||||||    
T  4173 agtttgatttaataatgaagttaaaggtccaatggtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcaatacaccgctctcaagttcatcgtaagtg 4074  T
Q  540 ttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatc 574  Q
    || || | |||||  ||||||||||| || |||||    
T  4073 ttgaaaacaatagtcgaggctttgtggaatctatc 4039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 642 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 3971 - 3930
Alignment:
Q  642 tccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctact 683  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3971 tccttcagccgaaagttctgcaatcctggaataccgtctact 3930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 531
Target Start/End: Original strand, 24103220 - 24103738
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24103220 atctacagtttgttggttgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 24103319  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||| |    
T  24103320 gaatccaccaatcgaagggtggtttaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaacttctttaaaaaaatcagatgacaaa 24103419  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    | ||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | |    
T  24103420 acaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtg 24103519  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
      ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  24103520 acataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaactgatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgga 24103619  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcatt 512  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||  || || |||||||| ||||  |||||||||| ||| || || ||||||||     
T  24103620 atttaaagatgccaagtgattttgtggactttgatttaaaaaagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcata 24103719  T
Q  513 gcatcactctcaagttcat 531  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24103720 acatcactctcaagttcat 24103738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28000010 - 27999745
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||   ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  28000010 atctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatgaccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcggtggttgagttccatccgcagtgagtcaa 27999911  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||| || |  ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  27999910 gaacccgctgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcctaaactcagatgacaaa 27999811  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggcc 278  Q
    |  |  ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27999810 accactgagccaccaatgacaagattaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaattggcc 27999745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 425 - 553
Target Start/End: Original strand, 24107008 - 24107136
Alignment:
Q  425 caagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattgcatcactctca 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  24107008 caagtgattatgttgaatttgatttaataatgaaggtaaaggtccaatagtatataaaaaagggaacatagaatagagcgtattcattacatcactctca 24107107  T
Q  525 agttcatcataagtgttaaagataatagc 553  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  24107108 agttcatcataagcgttaaaaacaatagc 24107136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 472
Target Start/End: Original strand, 1281335 - 1281797
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||| | |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1281335 atctacagtctgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaa 1281434  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  1281435 gaatccaccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcgcaaagtcagatgacaaa 1281534  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    || |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    |||||||||||||    
T  1281535 atcactgagccgccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaatggtttcttgctattagccagaccccaagcaaattcctgaagttgctctggag 1281634  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  1281635 tcataactgtaatgcttccgaaattcacataaacaacagatctcggttccttcgattcaagccattgaagacactcgatatcttctttccaaaggttgga 1281734  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaat 472  Q
    | |||||||  |||| ||||   | |||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  1281735 atctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaat 1281797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 474
Target Start/End: Original strand, 1674447 - 1674911
Alignment:
Q  13 atctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaa 112  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| || ||  ||||    
T  1674447 atctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcagtgtgtcaa 1674546  T
Q  113 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacata 212  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  1674547 gaatccgccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcataaactcagatgacaaa 1674646  T
Q  213 ataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctggag 312  Q
    |  |  ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  1674647 accactgagccaccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaatcggccaaaccccaagcaaactccaatagttgatctggag 1674746  T
Q  313 ttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgga 412  Q
    | |||||  ||||||| || ||| ||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  1674747 tcataacaataatgctaccgaaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttgga 1674846  T
Q  413 acctaaagatgccaagtgat---tatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatgg 474  Q
    |||||||||| | || ||||   | |||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  1674847 acctaaagattctaattgatgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatgg 1674911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16686182 - 16685732
Alignment:
Q  9 atatatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgac 108  Q
    |||||||| || |||  ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  16686182 atatatctgcattttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcatatatactttcagtggttgagttccatccacaatgag 16686083  T
Q  109 tcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatga 208  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  16686082 ttaagaatccaccgattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagctcgcgattaggcttctatctgagatttcattcttaaactcagatga 16685983  T
Q  209 cataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctct 308  Q
    || ||  | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  16685982 caaaaccacggaaccgcaaatgacaagatcagacctaatgatccattgaaaatgttgcttgctattggtcaaaccccaagcaaactctaatagtttttct 16685883  T
Q  309 ggagttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagat 408  Q
    | ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16685882 gcagtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggaactcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttatttccaaagat 16685783  T
Q  409 tggaacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaag 459  Q
    ||  || ||||  || ||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  16685782 tgatacttaaacttgacaactgattatgtggactttgacttaaaagtgaag 16685732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20863755 - 20863170
Alignment:
Q  12 tatctacagtttattggttgatcaccataaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactca 111  Q
    ||||| |||||| | || |||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  20863755 tatctgcagtttgtcggctgatcagcaaaaaatggccagcacaacattggcactccagcacatatgctctcaatggttgagttccatccacaatgagtta 20863656  T
Q  112 agaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgcgattcgacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacat 211  Q
      ||||||||||||||||| |||||||  || | |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |     
T  20863655 gaaatccaccaattgaaggatggttcaacaccttctcttgtggacaccaactcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaacgcagatgaaaa 20863556  T
Q  212 aataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacagttgctctgga 311  Q
    ||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |    
T  20863555 aatcaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaacaatttttctaca 20863456  T
Q  312 gttataaccgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattgg 411  Q
    |  || || ||  | ||||||||| | ||||| |||| |||  | ||||| || |||||||||||| ||||||| |  |  ||||||||||||||| | |    
T  20863455 gacatgactgtggtactgccaaaatttacatatacaatagatcccggttctttcgattcaagccatgcaagacattcagtgtcttctttccaaagacttg 20863356  T
Q  412 aacctaaagatgccaagtgattatgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcat 511  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |  |||   ||||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  20863355 aatctaaagacgccaagtgattctgtggactttgatttaaaaaagaaacaaaagggccaatggtgtatagagaagggaacatagaatagagaacattcat 20863256  T
Q  512 tgcatcactctcaagttcatcataagtgttaaagataatagcagaggctttgtgtaagctatcccccacttcaacgacaaattcta 597  Q
      ||||||||||||| ||||   |||| || || | ||||||||||||| |||| || |||||  | ||||||| || ||||||||    
T  20863255 aacatcactctcaagctcattgaaagtattgaaaacaatagcagaggctctgtgaaatctatctactacttcaatgagaaattcta 20863170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 623 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16685587 - 16685519
Alignment:
Q  623 ccttattatgtcaggcagatccttcagtcgaaagttctgcaatcctggaatacagtctactttggtgtc 691  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16685587 ccttataaagtcaggcagatccttcagtcgaatattctgcaatcctggaatacagtccactttagtgtc 16685519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1965247 - 1965197
Alignment:
Q  78 ctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaa 128  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  1965247 ctttcaagggttgagttccaaccacagtgactcaagaaccctccaattgaa 1965197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1969186 - 1969140
Alignment:
Q  81 tcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattga 127  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1969186 tcaagggttgaattccagccacaatgagtcaagaatccaccaattga 1969140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3568 - 3441
Alignment:
Q  40 aaaaaggccaacacaacattggcactccagcaagtatgctttcaacggttgagttccatccacaatgactcaagaatccaccaattgaagggtggttcag 139  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||     
T  3568 aaaatggccaacgcagcattggaactccagaacaaatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaact-aagggtggttcaa 3470  T
Q  140 tacttgctcttgcggacaccagcttgcga 168  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3469 cacttgctcttacggacaccatcttgcga 3441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3259 - 3162
Alignment:
Q  174 cctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgctaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgct 271  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |  | | || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3259 cctctatctgaagtttcattctcaaactcatataacaaagcacatgatccgccaatgacaaggtcagacctaatgatccacacaaagggtttcttgct 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 474
Target Start/End: Original strand, 8 - 148
Alignment:
Q  337 tcacataaacaacagaatcaggttcctttgattcaagccattcaagacacttggcatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgat---t 433  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||   |    
T  8 tcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaattgatgaat 107  T
Q  434 atgtggaatttgatttagtagtgaaggtaaaggtccaatgg 474  Q
     |||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  108 ttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatgg 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University