View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4751-Insertion-3 (Length: 706)

Name: NF4751-Insertion-3
Description: NF4751
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4751-Insertion-3
NF4751-Insertion-3
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (8-706)||(38325357-38326055)
chr8 (8-706)||(38320610-38321305)
chr8 (8-630)||(38316588-38317210)
chr8 (8-706)||(38299865-38300560)
chr8 (8-621)||(38308594-38309207)
chr8 (16-705)||(38313104-38313793)
chr8 (10-706)||(38305784-38306467)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (8-706)||(38850135-38850833)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 647; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 647; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 38326055 - 38325357
Alignment:
Q  8 tttataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38326055 tttataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacacattggactttccaaacttgcaaaaattacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcat 38325956  T
Q  108 taatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38325955 taatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcacagatcttttctactcttttctactcttctaccgaaggacataactcataattatcctc 38325856  T
Q  208 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38325855 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagacgagtcctgatgcaagcga 38325756  T
Q  308 acggaactacagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttag 407  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  38325755 acggaactatcgacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgatgctctctctaatttttg 38325656  T
Q  408 acacggcatcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaaccc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38325655 acacggcatcactaactagtttcaacccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaaccc 38325556  T
Q  508 attttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaa 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38325555 attttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagaacattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaa 38325456  T
Q  608 tcattcaacaattcaatcattctttcacacatctcaccaccagtggcagggtagacactacagaaattgagaaccttactatttaccttccaattcgcg 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38325455 tcattcaacaattcaatcattctttcacacatctcaccaccagtgtcagggtagacactacagaaattgagaaccttactatttaccttccaattcgcg 38325357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 38321305 - 38320610
Alignment:
Q  8 tttataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcat 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |||    
T  38321305 tttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgtgctgtgccat 38321206  T
Q  108 taatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctc 207  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38321205 taatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacacacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcataattatcatc 38321106  T
Q  208 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||| |||||||||||    
T  38321105 atacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcacagtcatagacatgtccagatgcaagcga 38321006  T
Q  308 acggaactacagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttag 407  Q
    || ||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  38321005 actgaactatcaacaccaccaaccttttcaacgcactccttaaatttttgccttcgactctttgaatccctaaaaaacaagatgctctgtctaattttcg 38320906  T
Q  408 acacggcatcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaaccc 507  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38320905 acacagcatcactaactagtttcaacccctcttcaacaatcaattttaaaacacgtgcataacaatgcccgtgaaagaactccccatcacataacaaccc 38320806  T
Q  508 attttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaa 607  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |   | ||||||   ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38320805 attttgcaaaccaagttgagttttcaatagttcttgcaaaatgtcattctcagatgaatcatctaaagtgagagagaagatctttttctctattccccaa 38320706  T
Q  608 tcattcaacaattcaatcattctttcacacatctcaccaccagtggcagggtagacactacagaaattgagaaccttactatttaccttccaattcgcg 706  Q
    ||| |||| || |||| |||||| |||||||||||| | ||||||   || |  ||| |||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38320705 tcactcaaaaactcaaccattctctcacacatctcagctccagtg---ggatcaacagtacagaaggtgagaaccttactctttaatttccaattcgcg 38320610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 38317210 - 38316588
Alignment:
Q  8 tttataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcat 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38317210 tttataactttatcttcatctcccaaactatcaactagaacacattggactttccaaacttgcaaaaaacacaagtttgaagtaggatgcgttgtgtcat 38317111  T
Q  108 taatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctc 207  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | | |  ||||||||||||  |||||||| ||    
T  38317110 taatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaaggacataactggtaattatcatc 38317011  T
Q  208 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcga 307  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| || |    
T  38317010 atacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactcatagacatgtccagatgcaggcaa 38316911  T
Q  308 acggaactacagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttag 407  Q
    || ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  |     
T  38316910 acagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaacatgatgctgtctcgaattccat 38316811  T
Q  408 acacggcatcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaaccc 507  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38316810 acacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaagaactctccatcacataacaaccc 38316711  T
Q  508 attttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaa 607  Q
    |||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| | | | |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38316710 atttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagagaaaatctttttctctattccccaa 38316611  T
Q  608 tcattcaacaattcaatcattct 630  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38316610 tcattcaacaattcaatcattct 38316588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 38300560 - 38299865
Alignment:
Q  8 tttataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcat 107  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  38300560 tttatatcttcatcttgatctcccaaacaatcaactaaaaggcattggactttccaaacttgcaaaaaatacaagttggaagtaggatgtgttgtggcat 38300461  T
Q  108 taatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctc 207  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  38300460 taatcatgttggcagtttcactaaaaggcaacaagaacacacaaatcttttgtactcttttccactcttctaccgaaggacataacacataactatcatc 38300361  T
Q  208 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||  ||| || |||| |||||||||||    
T  38300360 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcattgaataagttgagttcactcttttaggcgtgtccagatgcaagcga 38300261  T
Q  308 acggaactacagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttag 407  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  38300260 acggaacaatcaacaccaccaacctttgcaatacactccttaaatttttcccttccactctttgaatgcctcacaaacatgatgctatctctaattttac 38300161  T
Q  408 acacggcatcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaaccc 507  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  38300160 acaggacatccctaactagtttcaacccctcttcaacaatcagttttaaaatgcgtgcaaaacaatgcccgtgaaagaactccccgtcacataacaaccc 38300061  T
Q  508 attttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaa 607  Q
    ||| |||||| |||| |||  ||  |||| |||||| | |   |||||||  | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38300060 attatgcaaaacaagttgattttgaaatttttcttgcaaaattttattcttaaatgaatcttctaaagtgagagagaaaatcttttcctctattccccaa 38299961  T
Q  608 tcattcaacaattcaatcattctttcacacatctcaccaccagtggcagggtagacactacagaaattgagaaccttactatttaccttccaattcgcg 706  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||    |||||   ||  | |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38299960 tcattcaagaactcaaccattctctcacacatctcagatacagtg---ggtaaaacaagacagaaattaagaaccttactatttaacttccaatccgcg 38299865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 8 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 38309207 - 38308594
Alignment:
Q  8 tttataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcat 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||    
T  38309207 tttatatcttcatcttcatctcccaaattatcaactagaacacattggactttccaaacttgcaaaaaatacaagttggaagtacgatgtgttgcaccat 38309108  T
Q  108 taatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctc 207  Q
    | ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||  ||| ||    
T  38309107 ttatcgtgttggcagtttcgctaaaaggcaacaagaatgcacaaatcttttctactcttttccactcttctgccgcaggacatgaatcataaccatcgtc 38309008  T
Q  208 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcga 307  Q
    |||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||  ||||||| |||    
T  38309007 atacaagtgaagactttcaaatgcaagctgatatttaagagcactttgaagcatcaaataagttgagttcactctcatagacatgtctagatgcaaacga 38308908  T
Q  308 acggaactacagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttag 407  Q
    || ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||     
T  38308907 acagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaatttttccctgtgactctttgatcgcctcacaaacatgatgctctttctaatcttat 38308808  T
Q  408 acacggcatcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaaccc 507  Q
    |||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38308807 acacggcaccactaactagtttacacccctcttcaacaatcagttttaaaacatgtgcaaaacaatgagcatgaaagaactctccatcacataacaaccc 38308708  T
Q  508 attttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaa 607  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38308707 attttccaaaccaagttgagtcttcaattgttgttgcagaacattattctcaaatgaatcatctaaagtaaatgaaaaaatctttttctctactccccaa 38308608  T
Q  608 tcattcaacaattc 621  Q
    ||||||||| ||||    
T  38308607 tcattcaaccattc 38308594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 38313793 - 38313104
Alignment:
Q  16 ttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatg 115  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  38313793 ttcatcttcatctcccaaactatcaactaaaacacattgaagtttccaaacttgcgaaaaatacaagttggaagtaggatgtgttgcgccattaatcatg 38313694  T
Q  116 ttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctcatacaagt 215  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  38313693 ttggcagtttcacaaaaaggtaacaagaatgcacaaatcttttctactcttttccagtcttctgccgcaggacatgaatcataatcatcatcatacaagt 38313594  T
Q  216 gaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcgaacggaact 315  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |   ||  ||||||||||||| |||||    
T  38313593 gaagactttcaaacgcacgctgatatttaagagcactttgaagcatcaaataagttgagttcactctcatagacatatctagatgcaagcgaaccgaact 38313494  T
Q  316 acagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttagacacggca 415  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    | || ||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||| || ||| | ||  ||    
T  38313493 atcaacaccaccaaccttttcaacgcactccttaaaaaatttccatctactcttggaatgccttacaaacaaaatgctctctctgatcttacagacaaca 38313394  T
Q  416 -tcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaacccattttgc 514  Q
     || | ||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38313393 ctctc-aactagttttaacccttcatcaacaatcaggtttaaaacgcgggcaaaacaatgcacatgaaagaactctccatcacataacaacccattttgc 38313295  T
Q  515 aaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaatcattca 614  Q
    |||| ||| |||  ||| ||||||||||| | |   | ||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38313294 aaacaaagttgattttttaattgttcttgcaaaatgtcattctcagatgaatcatctaaagtgagagagaaaatctttttctctattccccaatcactca 38313195  T
Q  615 acaattcaatcattctttcacacatctcaccaccagtggcagggtagacactacagaaattgagaaccttactatttaccttccaattcgc 705  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||| | ||||| | |||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38313194 aaaactcaaccattctctcacacatctcagctccagtaggagggtaaacaagacagaagttgagaactttactatttaacttccaattcgc 38313104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 10 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 38306467 - 38305784
Alignment:
Q  10 tataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcatta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||     
T  38306467 tataacttcatcttcatctcccaaactatcaacaagaacacattggactttccaaacttgcaaaaaatacaagttggaagtgggatgtgttgcaccattg 38306368  T
Q  110 atcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctcat 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||          ||||||||  |  |||||| | | ||||    
T  38306367 atcatgttggcagtttcacgaaaaggcaacatgaatgcacaaatcttttccactcttttgca----------gaaggacacgagacataatcaccatcat 38306278  T
Q  210 acaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcgaac 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||  ||||||||||||    
T  38306277 acaagtgaaaactttcaaacacatgttgatatttaagagcactatcgagcatcaaataagttgagttcacagtcatagacatgtccatatgcaagcgaac 38306178  T
Q  310 ggaactacagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttagac 409  Q
     |||||    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38306177 tgaactgtcaataccaccaaccttttcaacgcactccttaaattttttccttctactctttgaatccctcacaaacaagatgctctctctaattttagac 38306078  T
Q  410 acggcatcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaacccat 509  Q
    ||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38306077 acgtcaccactaactagttttaacccctcttcaacaatcagttttaaaacgcgtgcagaacaatgcctgtgaaagaactctccatcacataacaaaccat 38305978  T
Q  510 tttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaatc 609  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |   || | ||  | ||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38305977 tttccaaaccaagatgagatttcaactgttcttgcaaaatgttgtccttaaatgagtcctctaaattgagagagaaaatctttttctctattccccaatc 38305878  T
Q  610 attcaacaattcaatcattctttcacacatctcaccaccagtggcagggtagacactacagaaattgagaaccttactatttaccttccaattcgcg 706  Q
    | |||| || |||| |||||| |||||||||||  |  |||||   ||  | |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38305877 actcaaaaactcaaccattctctcacacatctcggctacagtg---ggtaaaacaacacagaagttgagaaccttactatttaacttccaatccgcg 38305784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 38850135 - 38850833
Alignment:
Q  8 tttataacttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacactttggactttccaaacttgcaaaaaatacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcat 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||    
T  38850135 tttatatcttcatcttcatctcccaaactatcaactagaacacattggactttccaaacttgtaaaaaatacaagttggaagtaggatgtgttgtgctat 38850234  T
Q  108 taatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcgcaaatcttttctactcttttccactcttctaccgaaggacataactcataattatcctc 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  38850235 taatcatgttggcagtttcacaaaaaggcaacaggaatgcacaaatcttttctactcttttccactcttccgccgaaggacataaatcataactatcatc 38850334  T
Q  208 atacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcatagtcgagtcctgatgcaagcga 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||     |||  ||| ||| ||    
T  38850335 atacaagtgaaaactttcaaacgcacaccggtatttaagagctctttcaagcaacatataagttgaactcaaactcatagatatatccaaatgtaagtga 38850434  T
Q  308 acggaactacagacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaacatgaagctctctctaattttag 407  Q
    || ||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||     
T  38850435 accgaactatcaacaccaccaaccttttcaaagcactccttaaatttttccctcctactctttgaatgcctcacaaacatgatactctctctgatcttat 38850534  T
Q  408 acacggcatcactaactagtttcaatccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaagaactctccatcacacaacaaccc 507  Q
     |||  ||   ||||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  38850535 gcacaccacagctaactagttttaacgcttcttcaactatctgatttaaaacgcgtgcaaaacaattcacatgaaagaactctccatcacataacaaacc 38850634  T
Q  508 attttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagagcattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaaaatctttttctctattccccaa 607  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |   | ||||||   ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38850635 attttgcaaaacaagttgagttttcaattgttcttgcaaaatctcattctcagatgaatcatcaatagtgagagagaaaatctttttctctattccccaa 38850734  T
Q  608 tcattcaacaattcaatcattctttcacacatctcaccaccagtggcagggtagacactacagaaattgagaaccttactatttaccttccaattcgcg 706  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| ||| | ||| || |||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38850735 tcattcaacaactcaaccattctctcacaaatctccccactagtaggaggataaacaagacggaaattgataaccttactatttaacttccaattcgcg 38850833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University