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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4752_high_16 (Length: 331)

Name: NF4752_high_16
Description: NF4752
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4752_high_16
NF4752_high_16
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (27-321)||(21815-22109)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (22-321)||(39800486-39800786)
chr5 (26-321)||(40056733-40057022)
chr5 (21-211)||(35188789-35188979)
chr5 (27-211)||(23428985-23429169)
chr5 (29-171)||(39207331-39207473)
chr5 (42-202)||(42836748-42836908)
chr5 (25-197)||(33742927-33743091)
chr5 (42-147)||(3925977-3926082)
chr5 (27-210)||(2209288-2209473)
chr5 (27-103)||(26621224-26621300)
chr5 (73-202)||(42879090-42879219)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (26-321)||(42625098-42625392)
chr2 (25-212)||(5938484-5938671)
chr2 (26-211)||(5109958-5110142)
chr2 (36-211)||(13626490-13626665)
chr2 (22-147)||(13807318-13807443)
chr2 (35-140)||(45151486-45151591)
chr2 (72-211)||(5704399-5704538)
chr2 (65-211)||(31576140-31576286)
chr2 (126-216)||(45458572-45458662)
chr2 (36-158)||(31604592-31604714)
chr2 (28-131)||(42604217-42604320)
chr2 (30-146)||(38724612-38724725)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (27-321)||(27336693-27336987)
chr7 (30-211)||(23809871-23810052)
chr7 (25-216)||(2944257-2944448)
chr7 (27-147)||(5972731-5972851)
chr7 (27-197)||(33189144-33189314)
chr7 (26-211)||(11039381-11039565)
chr7 (27-211)||(25501894-25502078)
chr7 (25-195)||(36298528-36298697)
chr7 (27-211)||(38440640-38440818)
chr7 (30-197)||(7766814-7766981)
chr7 (46-188)||(30541697-30541839)
chr7 (27-208)||(22519387-22519568)
chr7 (35-148)||(1053336-1053450)
chr7 (27-111)||(47924740-47924824)
chr7 (272-320)||(22519268-22519316)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (27-321)||(12148783-12149079)
chr3 (27-202)||(13825659-13825834)
chr3 (25-211)||(25874900-25875086)
chr3 (27-202)||(4127751-4127927)
chr3 (27-209)||(48251842-48252024)
chr3 (26-138)||(21287865-21287977)
chr3 (25-211)||(27926816-27927002)
chr3 (34-101)||(5294978-5295045)
chr3 (36-163)||(36584156-36584283)
[»] scaffold0691 (1 HSPs)
scaffold0691 (27-210)||(7668-7851)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (35-321)||(40571976-40572261)
chr4 (27-211)||(41039084-41039268)
chr4 (35-209)||(8819497-8819670)
chr4 (27-197)||(23626606-23626776)
chr4 (28-202)||(51356934-51357107)
chr4 (47-211)||(19841513-19841677)
chr4 (27-184)||(22278061-22278217)
chr4 (30-211)||(38951375-38951556)
chr4 (36-197)||(24916610-24916771)
chr4 (36-163)||(24912926-24913053)
chr4 (27-196)||(40715062-40715223)
chr4 (27-156)||(36465061-36465190)
chr4 (27-118)||(42555082-42555171)
chr4 (90-211)||(17120476-17120597)
chr4 (27-131)||(47223056-47223160)
chr4 (269-320)||(8819381-8819432)
chr4 (27-97)||(42595816-42595886)
chr4 (272-320)||(23626855-23626903)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (27-321)||(25294027-25294301)
chr1 (27-211)||(48379283-48379467)
chr1 (35-211)||(31292947-31293123)
chr1 (30-211)||(31585423-31585604)
chr1 (27-211)||(29678511-29678695)
chr1 (30-211)||(47140542-47140723)
chr1 (27-211)||(17562976-17563160)
chr1 (27-197)||(38264528-38264698)
chr1 (27-208)||(19884602-19884783)
chr1 (27-188)||(2192002-2192163)
chr1 (51-211)||(36728944-36729104)
chr1 (122-202)||(15378741-15378821)
chr1 (20-100)||(25987135-25987214)
chr1 (35-76)||(15378691-15378732)
chr1 (37-95)||(17145512-17145570)
chr1 (51-159)||(11894077-11894184)
chr1 (271-320)||(11894301-11894350)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (26-207)||(35167909-35168090)
chr6 (27-211)||(8576501-8576685)
chr6 (35-208)||(28581907-28582082)
chr6 (27-202)||(34435001-34435176)
chr6 (25-211)||(7622113-7622299)
chr6 (42-211)||(5999308-5999468)
chr6 (27-128)||(32292657-32292758)
chr6 (35-161)||(10788329-10788457)
chr6 (35-164)||(642297-642426)
chr6 (27-145)||(10409193-10409311)
chr6 (269-317)||(34433271-34433319)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (35-211)||(7987419-7987595)
chr8 (27-197)||(36583096-36583266)
chr8 (27-147)||(8227485-8227605)
chr8 (25-197)||(31005765-31005937)
chr8 (48-211)||(7968627-7968790)
chr8 (30-209)||(11481187-11481366)
chr8 (60-156)||(9765250-9765346)
chr8 (62-202)||(13355588-13355728)
chr8 (27-100)||(6870791-6870864)
chr8 (27-65)||(9766107-9766145)
chr8 (269-317)||(13355812-13355860)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (29-192)||(66350-66513)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (83-188)||(10735-10840)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (35-125)||(7156-7245)
scaffold0155 (151-213)||(7083-7145)


Alignment Details
Target: scaffold0115 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Original strand, 21815 - 22109
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccatgcgga 21914  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannnnnnnn 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            
T  21915 tatccatatagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaaattgttta-ttttttt 22013  T
Q  227 agataaatttaaaacc-aaaattcataacatgcannnnnnnnnagcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaat 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22014 aggtaaatttaaaaccaaaaattcataacatgcatttttttttagcaaaacataatatcgatagattataacaacaacaaagatccttgactcaat 22109  T

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Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39800786 - 39800486
Alignment:
Q  22 gtgagtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccat 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39800786 gtgagtagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatataaaatccgtaccctatccatatccat 39800687  T
Q  122 gcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannn 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  39800686 gcagatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgttta-tt 39800588  T
Q  222 nnnnnagataaatttaaaacc-aaaattcataacatgca-nnnnnnnnnagcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactca 319  Q
         || ||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39800587 ttttaaggtaaatttaaaaccaaaaattcataacatgcattttttttttagcaaaacataatatcgatagattataacaacaacaaagatccttgactca 39800488  T
Q  320 at 321  Q
    ||    
T  39800487 at 39800486  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 321
Target Start/End: Original strand, 40056733 - 40057022
Alignment:
Q  26 gtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40056733 gtagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtttccactccgttagataaatatgaaattcgtaccctatccatatccatgcgg 40056832  T
Q  126 atatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannnnnnn 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  40056833 atatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgttta-tttttt 40056931  T
Q  226 nagataaatttaaaacc-aaaattcataacatgcannnnnnnnnagcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaat 321  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||||      |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40056932 tagataaatttaaaaccaaaaattcataacatgcatttttttttagcaaaacataatatc------ttataacaacaacaaaaatccttgactcaat 40057022  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35188979 - 35188789
Alignment:
Q  21 tgtgagtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatcca 120  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||     
T  35188979 tgtgattagagatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatattcgtgtccgctccgttagataaatatgaaatctgtatcctatctatatccg 35188880  T
Q  121 tgcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  35188879 tgcgaatatccatttagcggataatccatggatttttaggtatccgcaggtttatacaaatatccatggataacatttataaaaataaaat 35188789  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 23428985 - 23429169
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23428985 tagggatgtaaatagatattcatggatgcggatagtgtgatatccttgtctgctccgatagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccgtgcgga 23429084  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  23429085 tatccatttagcgggcaatccacggatttttaggtatccgcgagtttatacatatatccatggataacatttataaaaataaaat 23429169  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39207473 - 39207331
Alignment:
Q  29 gggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggata 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  39207473 gggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtctgctccgttagataaatatgaaatccgtaccctttccatatccgtgcggata 39207374  T
Q  129 tccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggat 171  Q
    ||| |||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  39207373 tccgtttagcgggtaatccgcggattttgagatatccatggat 39207331  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Original strand, 42836748 - 42836908
Alignment:
Q  42 atatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcgga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  42836748 atatccatggatgcggatagtgtgatatctgtgtccgctccgttagataaatatgaaatatgtaccatatccatatccgtgcagatatccatttaacgga 42836847  T
Q  142 taatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42836848 taatccgaggagttttaggtatccgcgggtttacacagatattcatggataacatttataa 42836908  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33743091 - 33742927
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||      
T  33743091 agtagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgata--------cgctccgttacataaatatgtaatccgtaccctatccatatccgtgtc 33743000  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33742999 gatatccttttagcgggtaatccgtggattttgaggtatatgcgggtttatacagatatccatggataacatt 33742927  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Original strand, 3925977 - 3926082
Alignment:
Q  42 atatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcgga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  3925977 atatccatggatgtggatagtgtgatatttgtgtccgctccgttagataaatatgaaatccgtaccatatccatatccgtgcagatatccatttagcggg 3926076  T
Q  142 taatcc 147  Q
    ||||||    
T  3926077 taatcc 3926082  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Original strand, 2209288 - 2209473
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcg--gatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |  || ||| || |||||| |||||||  |||||| |||| ||| ||     
T  2209288 tagggatgtaaatgaatatccatagatgtgtagatagtgtgatatccgtgtacgttctgttggacaaatataaaatccgcgccctatccatacccacgca 2209387  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaa 210  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  2209388 aatatccgtttagcgggtaatccatggattttgaggtatatgcgggtttatacagatatccatggataacatttattaaaaaaaaa 2209473  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 26621224 - 26621300
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccg 103  Q
    ||||||| |||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26621224 tagggatgtaaatgaatatctttgaatgcagatagtgtgatatccgtgtccactccgctaaataaatatgaaatccg 26621300  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42879219 - 42879090
Alignment:
Q  73 tgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatt 172  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||  ||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||| | | | ||    
T  42879219 tgtctactccgttggataaatatgaaatatgtacaatatccatatcccggcggatatccgtttagcgggtaatccgtagatgttgaggtattcgcaggtt 42879120  T
Q  173 tatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
    |||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  42879119 tatacatatattcatggataacatttataa 42879090  T

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Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42625392 - 42625098
Alignment:
Q  26 gtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42625392 gtagggatgtaaatggatatccatggatgcggagagtgtgatatccgtgtccactc-gttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccatgcgg 42625294  T
Q  126 atatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannnnnnn 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  42625293 atattcatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgttta-tttttt 42625195  T
Q  226 nagataaatttaaaacc-aaaattcataacatgcannnnnnnnnagcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaat 321  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42625194 taggtaaatttaaaaccaaaaattcataacatgcatttttttttagcaaaacataatatcgatagattataacaacaacaaagatccttgactcaat 42625098  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 5938484 - 5938671
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |    
T  5938484 agtaaggatgtaaatggatatccatggatgtgaatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaattcgtaccctatccatatccgcgtg 5938583  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatt 212  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  5938584 gatatccgtttagcgggtaatccacagattttgaagtatctgcgggtttatacaaatatccatggataacatttatataaaaaaaatt 5938671  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Original strand, 5109958 - 5110142
Alignment:
Q  26 gtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgg 125  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  5109958 gtagggatgtaaatagatatccatg-atgcggatagtgtgatatttgtgtgcgctctgtcagataaatatgaaatccgtattctatccatattcatgcgg 5110056  T
Q  126 atatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5110057 atatccgtttagcgggtaatccacggattttgaggtatccgcggatttttacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 5110142  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13626665 - 13626490
Alignment:
Q  36 aaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccattt 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||    
T  13626665 aaatggatatccatagatgcggatagtgtgatattcgtgtccgtttcgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccgggcggatatcctctt 13626566  T
Q  136 agcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    || || ||||||    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  13626565 agagggtaatccgcatattttgagatatccgcgggtttatacagatattcatggataacatttataaaaataaaat 13626490  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 13807318 - 13807443
Alignment:
Q  22 gtgagtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccat 121  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  13807318 gtgaatagggatgtaaatggatatccatggacgcggatagtgtgatatctgtgtccgcctcgttagaaaaatatgaaatccgtatcctatccatatccgt 13807417  T
Q  122 gcggatatccatttagcggataatcc 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13807418 gcggatatccatttagcgggtaatcc 13807443  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45151591 - 45151486
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatt 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  45151591 taaatggatatccatgcatgcggatagtgtgatatccgtgtccgctctgttagataaatatgaaatctgtatcctattcatatctgtgtggatatccatt 45151492  T
Q  135 tagcgg 140  Q
    ||||||    
T  45151491 tagcgg 45151486  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 5704399 - 5704538
Alignment:
Q  72 gtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggat 171  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  5704399 gtgtccgctccattagataaatatgaaatctgtactctatctatatccgcgcggatatccgtttagcgggtaatccaatgattttgaggtatccgcgggt 5704498  T
Q  172 ttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5704499 ttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 5704538  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31576286 - 31576140
Alignment:
Q  65 gatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatc 164  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||    
T  31576286 gatatccgtgtccactccattatataaatatgaaatttgtaccctatccatatccgtgtggatatccatttagcgggtaatccgcgaatttttaggtatc 31576187  T
Q  165 cacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |  || ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  31576186 cgtgggtttgtacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 31576140  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45458662 - 45458572
Alignment:
Q  126 atatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  45458662 atatccatttagcgggtaatccacagattttgaagtatccacaaatttatacagatatccatggataacatttataaaaaaaaaaattgtt 45458572  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 158
Target Start/End: Original strand, 31604592 - 31604714
Alignment:
Q  36 aaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccattt 135  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  |||||  ||||||||||  |||    
T  31604592 aaatggatattcatggacacggatagtgtgatatttgtgtctgctccgttggataaatatgaaatttgtaccttatctatatctgtgcggatatctgttt 31604691  T
Q  136 agcggataatccatggattttga 158  Q
    | ||| |||||||  ||||||||    
T  31604692 aacgggtaatccacagattttga 31604714  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 42604217 - 42604320
Alignment:
Q  28 agggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggat 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||  ||  ||| | ||| |||||||||||    
T  42604217 agggatgtaaatggatatccatgtgtgtggatagtatgatatccgtgtccgctctattagataaaaatgatatatgtgtcctctccatttccatgcggat 42604316  T
Q  128 atcc 131  Q
    ||||    
T  42604317 atcc 42604320  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38724725 - 38724612
Alignment:
Q  30 ggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatat 129  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||  |||||  || | ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||| ||||    
T  38724725 ggatgtaaatggatatc-atggatgcagatagtatgacat--gtgtctccttcattagataaatatgaaatctctactttattcatatccacgcgcatat 38724629  T
Q  130 ccatttagcggataatc 146  Q
    || |||| |||||||||    
T  38724628 ccgtttaacggataatc 38724612  T

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Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Original strand, 27336693 - 27336987
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27336693 tagggatgtaaatggatgtccatggatgcagatagtgtgatatccgtgtccacttcgttagataaatatgaaatccagaccctatccatatccatgcgga 27336792  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannnnnnnn 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  27336793 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgttta-ttttttt 27336891  T
Q  227 agataaatttaaaacc-aaaattcataacatgcannnnnnnnnagcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaat 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27336892 aggtaaatttaaaaccaaaaattcataacatgcatttttttttagcaaaacataatatcgatagattataacaacaacaaagatccttgactcaat 27336987  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23810052 - 23809871
Alignment:
Q  30 ggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  23810052 ggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgcgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccgtggggatat 23809953  T
Q  130 ccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||| |||| || |||||    
T  23809952 ccatttagcgagtaatccacggatttttaggtatccgcgagtttatacagatatccataaataacatttataaaaataaaat 23809871  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2944448 - 2944257
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||  | |     
T  2944448 agtagagatgtaaatggacatccatggatgtggatggtgtgatatccgtgtccgctctgttgtataagtatgaaaactgtaccctattcatatctgtcca 2944349  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtt 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2944348 gatatccgtttagcgggtaatccacggattttgaggtatccgcgggtttatacagatatccatggataatatttataataaaaaaatttgtt 2944257  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 147
Target Start/End: Original strand, 5972731 - 5972851
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  5972731 tagggatgtaaatggatatccatgaatgcggatagtgtgatatccgtgtctgctccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatacgtgcgga 5972830  T
Q  127 tatccatttagcggataatcc 147  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  5972831 tatccatttagcgggtaatcc 5972851  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 33189144 - 33189314
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||  ||||||    |||    
T  33189144 tagggatgtaaatggatatctatggatgcagatagtttgatatccgtgtccactccgtttgataaatatgaaatatgtgccctatcaatatccgcatgga 33189243  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33189244 tatccgtttagcgggtaatccatagattttgaggtattcacgagtttatacagatatccatggataacatt 33189314  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11039565 - 11039381
Alignment:
Q  26 gtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgg 125  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||    
T  11039565 gtagggatgtaaatagatatccatggatgcagataatatgatatccgtgtccactccgttggataaatatgaaatttgtaccatatccatatccgtgcgg 11039466  T
Q  126 atatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
     ||||| || ||||| | ||||| | |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  11039465 gtatccgttcagcgggt-atccacgaattttgaggtatctgcgggtttatacagatatccatggatgacatttataaaaataaaat 11039381  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 25501894 - 25502078
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |  || ||    
T  25501894 tagggatgtaaatggatatccatgaatgttgaaagtgtgatatccatgttcgctccgttagataaatatgaaatttataccctattcatatacgcgcaga 25501993  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    ||||| ||||||   ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  25501994 tatccgtttagctagtaatccacgaattttgaggtatccgcgggtttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 25502078  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Original strand, 36298528 - 36298697
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |  |||||||||||  ||  |||||||||||||  ||     
T  36298528 agtagagatataaatggatatccatggatgcgaatagtgtcacatccgtgttcactccgttgggcaaatatgaaatttgt-gcctattcatatccgcgca 36298626  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataaca 195  Q
     ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  36298627 aatatccatttagcgggtaatctacgaattttgaggtatccgtgaatttatacagatatccatggataaca 36298697  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38440818 - 38440640
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||      ||||||||  ||| |    
T  38440818 tagggatgtaaatgaatatccatggatgcggatagtgtgatattcgtgtccgcttcgttggataaatatgaaattcgta------tcatatccgcgcgaa 38440725  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  38440724 tatccatttagcaggtaattcgtggattttgaggtatctgcaggtttatacagatatccatagataacatttataaaaataaaat 38440640  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 7766814 - 7766981
Alignment:
Q  30 ggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatat 129  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| | ||| ||||||| || ||||||    
T  7766814 ggatgtaaatggatatacatggatgcggatagtgtgatattcatgtccgctccgttggataaatatgaaatatgtatcttatccatatccgtgtggatat 7766913  T
Q  130 ccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    || |||||||| ||||||   |||||||| |||| | ||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7766914 ccgtttagcgggtaatccgcagattttgaagtattcgcgcgtttatacagatttccatggataacatt 7766981  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30541839 - 30541697
Alignment:
Q  46 ccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataat 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||  || |    
T  30541839 ccatggatgcggatagtatgatattcgtatccgctccgttggattaatatgaaatccgtaccctatccatatccgcgcggatatccattgaacgagtact 30541740  T
Q  146 ccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatg 188  Q
    || ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  30541739 ccgtggattttgaggtatccgcaggtttatacagatatccatg 30541697  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22519568 - 22519387
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||  | |||    
T  22519568 tagggatgtaaatggatatccatggatacggatagtgtaatatttttgtctgctcggttggataattatgaaatccgtaccctatccgtatccgcgtgga 22519469  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaa 208  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||  ||| |||||||  ||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  22519468 tatccatttagcaggtaatccacgaattttaaggtatcatcgggtttatacaaatatccatggatatcatttataaaaaaaa 22519387  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1053450 - 1053336
Alignment:
Q  35 taaatggata-tccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccat 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||| |||    
T  1053450 taaatggataatccatggatgcagatagtgtgatatccgtgtccgctccattagacaaatatgaaatctgtgccttattcatatccacacggatatacat 1053351  T
Q  134 ttagcggataatcca 148  Q
    |||| ||||||||||    
T  1053350 ttagtggataatcca 1053336  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 111
Target Start/End: Original strand, 47924740 - 47924824
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctat 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||| |||||||  | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  47924740 tagggatataaatggatattcatggatgtagatagtctaatatacgtgtccgtttcattggataaatatgaaatccgtaccctat 47924824  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22519316 - 22519268
Alignment:
Q  272 aaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaa 320  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22519316 aaaacataatatctatacattacaaaaacaacaaagttcattgactcaa 22519268  T

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Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Original strand, 12148783 - 12149079
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12148783 tagggatgtaaatcgatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccatgcgga 12148882  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannnnnnnn 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||             
T  12148883 tatccatttagcggataatcaatggattttgaggtatccacgaatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaaaattatttattttttt 12148982  T
Q  227 agataaatttaaaacc-aaaattcataacatgca-nnnnnnnnnagcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaat 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12148983 aggtaaatttaaaaccaaaaattcataacatgcattttttttttatcaaaacataatatcgatagattataacaacaacaaagatcattgactcaat 12149079  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 202
Target Start/End: Original strand, 13825659 - 13825834
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  13825659 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatatgtgtccgctccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccgcgcgga 13825758  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13825759 tatccatttagcgggtaatctgcggattttgagatatctgcaggtttatacagatatccatggataacatttataa 13825834  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25875086 - 25874900
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  25875086 agtagggatgtaaatggatatacatggatgtggatagtgtgatatccgtgtccgctccgttagataaagatgaaatccgtaccctatccatatccgcgca 25874987  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
     |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  25874986 aatatccgtttagcgggtaatccgcggattttgaggtatccgtgggtttatacagatatccatggataacgtttataaaaataaaat 25874900  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 202
Target Start/End: Original strand, 4127751 - 4127927
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |    
T  4127751 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccgttccgttggataaatatgaaatccgaaccctatccatattcacgcata 4127850  T
Q  127 tatc-catttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
    ||||  |||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  4127851 tatcaaatttagggggtaatccacagattttgaggtatccgcgggtttatacatatatccatggataacatttataa 4127927  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48252024 - 48251842
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||    
T  48252024 tagggatgtaaatggatatccatgaatgtggatagtgtgatatccatatccgttccgttggataaatatgaaattcgtaccctatcgatatccacgtgga 48251925  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaa 209  Q
    ||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||| || | |||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  48251924 tatccgtttagcaggtaatccacgaattttgaggtatctactggtttatacatatatccatgaataacatttataaaaaaaaa 48251842  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Original strand, 21287865 - 21287977
Alignment:
Q  26 gtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  21287865 gtagggatgtaaatggatatccatggatgcagatagtgtgatatctgtgtcccctccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatattcgtgcag 21287964  T
Q  126 atatccatttagc 138  Q
    |||||| ||||||    
T  21287965 atatccgtttagc 21287977  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27927002 - 27926816
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||| |  ||    
T  27927002 agtagggatataaatggatattcatggatgtagatagtgtcatatccgtgtccgctccgttagataaatatgaaatatgtactctatctatatcgacacg 27926903  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    | ||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| || || ||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  27926902 gttatccgtttaacgggtaatgcatagattttgagctacccgcgagtttatacagatatcgatggataacatttataaaaataaaat 27926816  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Original strand, 5294978 - 5295045
Alignment:
Q  34 ataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatc 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5294978 ataaatggatattcatggatgcggatagtgtgatatccgtgtcccctccgttagataaatatgaaatc 5295045  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Original strand, 36584156 - 36584283
Alignment:
Q  36 aaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccattt 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||  |||| || |||||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36584156 aaatggatatccatggatgcagatagtatgatatctgtatctgctccattggataaatatgaaattcatgctctattcatatccgcgcggatatccattt 36584255  T
Q  136 agcggataatccatggattttgaggtat 163  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  36584256 aacggataatccacgaattttgaggtat 36584283  T

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Target: scaffold0691 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0691
Description:

Target: scaffold0691; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Original strand, 7668 - 7851
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7668 tagggatgtaaatcgatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccatgcgga 7767  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7768 tatccatttagcggataatcaatggattttgaggtatccacgaatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaa 7851  T

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Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40572261 - 40571976
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatt 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40572261 taaatggatatccatggatgtggatagtgtgatattcgtgtccactccgttagataaatgtgaaatt--taccctatccatatccatgcggatatccatt 40572164  T
Q  135 tagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannnnnnnnagataaat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||        || |||||    
T  40572163 tagcggataatccatggattttgaggtatctacggatttatacggatatctatggataacattcataagaaaaaaacttgttta--ttttttaggtaaat 40572066  T
Q  235 ttaaaaccaaaa--ttcataacatgcannnnnnnnnag-caaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaat 321  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||         || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40572065 ttaaaaccaaaaattacataacatgcatttttttttagtcaaaacataatatcgatagattataacaacaacaaagatccttgactcaat 40571976  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 41039084 - 41039268
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  41039084 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggataatgtgatatccgtgtccgctccgttagataaatatgaaatccgtaccatatccatatccgtgcgga 41039183  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  41039184 tatccatttagcgggtaatccgcggatttttaggtatccgcagatttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 41039268  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8819670 - 8819497
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  8819670 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatattcgcgtccactccgttggacaaatatgaaattcgttccctatccatatccgcgcggatatccatt 8819571  T
Q  135 tagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaa 209  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  8819570 tagcgggtaatccacgaattttaaggtatccgtggatttatacagatatcc-tagataacatttataaaaaaaaa 8819497  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 23626606 - 23626776
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23626606 tagggatgtaaatggatatccatggatgcaaatagtgtgatatttgtgtccgctccgtcggataaatatgaaattcgtacactattcatatccatgcgga 23626705  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    ||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  23626706 tatccgtttagcaggtaatccacagattttgaggtatccgcgagtttatacatatatccatggataacatt 23626776  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 51356934 - 51357107
Alignment:
Q  28 agggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggat 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||  || |||||| ||||||||  |||||    
T  51356934 agggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatctgtgtccgctccgttggacaaatatgaaatttgtgccctatccatatccacacggat 51357033  T
Q  128 atccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51357034 atcaatttagcgggtaatccacgaattttga-gtacccgcaggtttatacagatatccatggataacatttataa 51357107  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 19841513 - 19841677
Alignment:
Q  47 catggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19841513 catggatgcggatagtgtgatatctatgtccgctctgtcggataaatatgaaatccgtaccctatcgatatctgtgcggatatccgtttagcgggtaatc 19841612  T
Q  147 catggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  19841613 tgctgattttgaggtatccgcggatttatacagatattcatggataacatttataaaaataaaat 19841677  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Original strand, 22278061 - 22278217
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22278061 tagggatgtaaatggatatccatggatgtagatattatgatatccgtgtccgttccgttggataaatatgaaatccgtaccctatcaatatctatgcgga 22278160  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatc 184  Q
    ||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  22278161 tatccgtttatcgggt-atccacggattttgaggtatttgcgggtttatacagatatc 22278217  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 38951375 - 38951556
Alignment:
Q  30 ggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||  ||||||||    
T  38951375 ggatgtaaatggatatccatggatgcggagagtgtgatattcgtgtccgttccgttagataaatataaaattcatactctatccatatccgcgcggatat 38951474  T
Q  130 ccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    || |||| |||||||||   | |||||||||||  | ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  38951475 ccgtttaacggataatctgcgaattttgaggtaatcgcgggtttatatagatatccgtggataacatttataataataaaat 38951556  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 24916610 - 24916771
Alignment:
Q  36 aaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccattt 135  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| || | |  ||| || ||||||||||  |||||  ||     
T  24916610 aaatggatatccatggacgcagatagtatgatatccgtgtccgcttcgttggataaatatgatattcatgtcctctttatatccatgcaaatatctgtta 24916709  T
Q  136 agcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  | |||||  |||| || ||||||||||    
T  24916710 agcggataatccatgaattttaaggtatgcacgagtatatacaaatattcaaggataacatt 24916771  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Original strand, 24912926 - 24913053
Alignment:
Q  36 aaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccattt 135  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || | |  ||| || ||||||||||| |||||  ||     
T  24912926 aaatggatatccatggacgcatatagtatgatatatgtgtccacttcgttggataaatatgatattcatgtcctctttatatccatgcgaatatctgtta 24913025  T
Q  136 agcggataatccatggattttgaggtat 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24913026 agcggataatccatgaattttgaggtat 24913053  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40715223 - 40715062
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||  |||| |||||||| | |||||      |||||| |||||    
T  40715223 tagggatgtaaatggatatccaaggatgcagatagtgtgatattcgtgtctgatccgttgaataagtatgaaattcataccc------tatccacgcgga 40715130  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacat 196  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||   | |||||||  |||||||||||||||||    
T  40715129 tatccgtttagcgg-taat-catggattttaaggtatccgtaggtttatacatatatccatggataacat 40715062  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36465190 - 36465061
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| || ||||||||||||  |   |||| |||||||    ||     
T  36465190 tagggatgtaaatggatatctacggatgcggatagtgtgatatttgtatccgctccgttggacaaatatgaaatcaatgttctatccatatccgcatggt 36465091  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggatttt 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36465090 tatccatttagcgggtaatccatggatttt 36465061  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Original strand, 42555082 - 42555171
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatc 118  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  42555082 tagggatgtagatggatatccatggatgcggatagtgtgatgt--atatccgctccgtttgataaatatgaaatttgtactctatccatatc 42555171  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17120597 - 17120476
Alignment:
Q  90 aaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatgg 189  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||| ||  ||||||  |||||| |||     
T  17120597 aaatatgaaatttgtaccatattcatatccacgagaatatccgtttagcgggtaatccacaaattttgagctatccgcgagtttatatagatatctatga 17120498  T
Q  190 ataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||||| |||| | ||||||    
T  17120497 ataacatttataaaataaaaat 17120476  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 47223056 - 47223160
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||   | || | |||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||||||| ||||||    
T  47223056 tagggatgtaaatggatatccatgagtgcggatagtatgatatttatatctattccgttggataaatatgatatttgtgccctctccatatccgtgcgga 47223155  T
Q  127 tatcc 131  Q
    |||||    
T  47223156 tatcc 47223160  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8819432 - 8819381
Alignment:
Q  269 agcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaa 320  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  8819432 agcaaaacataatatctatacattataataacaacaaagatcattgattcaa 8819381  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 42595886 - 42595816
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatga 97  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||| |||||||||||    
T  42595886 tagggatgtcaatgggtatccatggatacggatagtatgatatccattcccgctccgttggataaatatga 42595816  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Original strand, 23626855 - 23626903
Alignment:
Q  272 aaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaa 320  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  23626855 aaaacataatatccatatattacaataacaacaaagatcattgactcaa 23626903  T

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Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25294301 - 25294027
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25294301 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatctgtaccctatccatatccatgcgga 25294202  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaatttgtttannnnnnnn 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            
T  25294201 tatccatttagcggataatccatggattttga--------------------gatatccatgggtaacattcataagaaaaaaatttgttta-ttttttt 25294123  T
Q  227 agataaatttaaaacc-aaaattcataacatgcannnnnnnnnagcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaat 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25294122 aggtaaatttaaaaccaaaaattcataacatgcatttttttttagcaaaacataatatcgatagattataacaacaacaaagatccttgactcaat 25294027  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48379467 - 48379283
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  48379467 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgaaatccgtgtccgctccgttagataaatatgaaatccgtaccatatccatatccgtgcgga 48379368  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||| ||||||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  48379367 tatcaatttagcaggtaatccgcggatttttaggtatccgcgggtttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 48379283  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31293123 - 31292947
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatt 134  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  31293123 taaatgaatatctatggatgcggataatgtgatatttatatccgctccgttagataaatatgaaatccgcagcctatccatatctgtgcggatatccatt 31293024  T
Q  135 tagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  31293023 tagcggataatccatggatttttaggtatccgcggatttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 31292947  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31585604 - 31585423
Alignment:
Q  30 ggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  31585604 ggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtaatatccttgtccgctccgttagataaatataaaatccgtaccctatccatatcaacgcggatat 31585505  T
Q  130 ccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    || |||||||| ||||||   |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  31585504 ccgtttagcgggtaatccgcagattttgaagtatccgcgggtttatacagatattcatggataacatttataaaaataaaat 31585423  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29678695 - 29678511
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||    
T  29678695 tagggatgtaaatggatatccattgatgcagatagtatgatatatgtgtccgctccgttggataaatatgaaatccataccctatccatatccgcgcgga 29678596  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    ||||| ||||  || ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  29678595 tatccgtttaatgggtaatccgcggattttgaggtatccacgggtttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 29678511  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 47140542 - 47140723
Alignment:
Q  30 ggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatat 129  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||  ||||||  ||||||||    
T  47140542 ggatgtaaatagatatccatggatgcggatagtgtgatattcgtgtccgctccgttggataaatatgaaatccatatcttatctatatccgcgcggatat 47140641  T
Q  130 ccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
     | |||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  47140642 tcgtttagcgggtaatccgcggattttgaggtatccgcgggtttgtacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 47140723  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17563160 - 17562976
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||    
T  17563160 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtaatatctttgtccgctctgttagataaatataaaatccataccctatccatatcaacgcgga 17563061  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
     |||| |||||||| ||||||   |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  17563060 catccgtttagcgggtaatccgcagattttgaagtatccgcgggtttatacagatattcatggataacatttataaaaataaaat 17562976  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38264698 - 38264528
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||    
T  38264698 tagggatgtaaatggatattcatggatacggatactgtgatatatgtgtccgttccgttagacaaatatgaaatccgtgccctatccatatccgcgcaga 38264599  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    ||||| |||||| | ||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38264598 tatccgtttagccggtaatccacgaattttgaagtatccgcgggtttatacagatatccatggataacatt 38264528  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19884783 - 19884602
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| | | ||||||  ||||||   || |    
T  19884783 tagggatgtaaatggatattcatggatgcggatagtgtgatatctgtgtccgctccgttggacaaatatgaaattcatgccctatctatatccgcacgaa 19884684  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaa 208  Q
    ||| |||||| |||  |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19884683 tattcatttaacggggaatccacgaattttgaggtatccgcgggtttatatagatatccatggataacatttataaaaaaaa 19884602  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2192163 - 2192002
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |  ||||| |||||||  ||| |    
T  2192163 tagggatgtaaatggatgtccatggatgcggataatgtgatatccgtgtccgctccattagacaaatatgaaatctatgtcctatccatatccgcgcgaa 2192064  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatg 188  Q
     ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  2192063 catccatttagcagataatccacagattttgaggtatctgcgagtttatacagatatccatg 2192002  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36729104 - 36728944
Alignment:
Q  51 gatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| || |||  |    
T  36729104 gatgcggatagtgtgatatccgtgtccgatccgttggataaatatgaaattcgtaccctatcaatatccgtgcggatatccgtttagcgggtagtccgcg 36729005  T
Q  151 gattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    ||||||||  ||||| | | || ||||  |||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  36729004 gattttgacatatccgcaggttcatacaaatattcatggataacatttataaaaataaaat 36728944  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Original strand, 15378741 - 15378821
Alignment:
Q  122 gcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  15378741 gcggatatccatttagcgggtaatccatggattttgaggtatcaacggatttatacaaatatccatggataacatttataa 15378821  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 25987135 - 25987214
Alignment:
Q  20 ttgtgagtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaat 100  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25987135 ttgtgggtagggatgtaaatgaatacccatg-atgtggatagtgtgatatacgtgtccgctccgttagataagtatgaaat 25987214  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Original strand, 15378691 - 15378732
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtc 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15378691 taaatggatatccgtggatgcggatagtgtgatatccgtgtc 15378732  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17145570 - 17145512
Alignment:
Q  37 aatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatat 95  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  17145570 aatggatatccatgggtacggatagtatgatacccgtctccgctccgttagataaatat 17145512  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 159
Target Start/End: Original strand, 11894077 - 11894184
Alignment:
Q  51 gatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatg 150  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||   ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||  |||||||| |||||||      
T  11894077 gatgcggatagtgtaatatttgtgtctgttccattggataaatatgaaatctgtaccatattcatat-cgtacggatatctgtttagcgggtaatccaca 11894175  T
Q  151 gattttgag 159  Q
    |||||||||    
T  11894176 gattttgag 11894184  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 320
Target Start/End: Original strand, 11894301 - 11894350
Alignment:
Q  271 caaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgactcaa 320  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11894301 caaaacataatattcatacattataataacaacaaagatcattgactcaa 11894350  T

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Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35168090 - 35167909
Alignment:
Q  26 gtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35168090 gtagggatgtaaatggatatccatggatgcgaatagtatgatatccgtatccactccattagataaatataaaatccgtaccctattcatatccgtgcgg 35167991  T
Q  126 atatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaa 207  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35167990 atatccgtttcgcgggtaatccgtggattttgaggtatccgcgggtttatacagatatccatggataacatttataaaaaaa 35167909  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Original strand, 8576501 - 8576685
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||    
T  8576501 tagggatgtaaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccgttccgttaaataaatatgaaatccgtactctatccatatccgcgcgga 8576600  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  8576601 tatccatttagcgagtaatccgccgattttgaggtatccgcgggtttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 8576685  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 28581907 - 28582082
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatt 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  28581907 taaatggatatccatggatgtggatagtgtgatatccatgtctgctccgttagataaatatgaaatccataccctattcatatccgcgcggatatccgtt 28582006  T
Q  135 tagcggataatccatggattttgaggtatccacggatt--tatacggatatccatggataacattcataagaaaaa 208  Q
    |||||| |||||||   |||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28582007 tagcgggtaatccacatatttagaggtatccgcgggtttatatacagatatccatggataacatttataaaaaaaa 28582082  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34435176 - 34435001
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||     
T  34435176 tagggatgtaaatggatattcatggatgcggatagtgtgatatccgtatccgctccattagataaatatgaaatctctaccctatctatatccgtgcggg 34435077  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
    ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34435076 tatccgtttagcgggtaattcgtggattttgaggtatccgttggtttatacagatatccatggataacatttataa 34435001  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 7622113 - 7622299
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  | |    
T  7622113 agtagggatgtaaatggatatccacagatgcagatagtgtgatatctgtgtccgttccgttgaataaatatgaaatctgtaccttatccatatccgcgtg 7622212  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  7622213 gatatccatttagcggataatccgtggattttgagttatccgcgggtttatacagatattcatggataacatttataaaaataaaat 7622299  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 5999308 - 5999468
Alignment:
Q  42 atatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcgga 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||     ||        
T  5999308 atatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccgctccgttagataaatatgaaatccgtaccctatccatatccgcgcggatatc-----ag---- 5999398  T
Q  142 taatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5999399 taatccgcggattttgaggtatctgcgggtttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 5999468  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32292758 - 32292657
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  32292758 tagggatgtaaatggatatcgatggatgcggatagtatgatatccgtgtccgctccgttggataaatatgaaatccataccctatccatatccgtgcgga 32292659  T
Q  127 ta 128  Q
    ||    
T  32292658 ta 32292657  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Original strand, 10788329 - 10788457
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgt--ccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatcca 132  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||     
T  10788329 taaatggatattcatgtatgcggatagtgtgatatccgtgtgtccgctccgttagataaacatgaaatccataccctatccatatccgcgcggatatccg 10788428  T
Q  133 tttagcggataatccatggattttgaggt 161  Q
    ||||| ||||||| |   |||||||||||    
T  10788429 tttagtggataattcgcagattttgaggt 10788457  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 642426 - 642297
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatt 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||    
T  642426 taaatggatatccaaggatgcggatagtgtaatatcctcatccgttccgttaaaaaaatatgaaatccgtactctatcaatatccgtgcggatatccgtt 642327  T
Q  135 tagcggataatccatggattttgaggtatc 164  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  642326 tagcaggtaatccgcggattttgaggtatc 642297  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10409311 - 10409193
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  10409311 tagggatatcaatggatattcatggatgatgatagtgtgatatatgtgttcgctccgttggataaatataaaatccgtaccctatccatatccacatgga 10409212  T
Q  127 tatccatttagcggataat 145  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  10409211 tatccgtttagcgggtaat 10409193  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34433319 - 34433271
Alignment:
Q  269 agcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgact 317  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  34433319 agcaaaacataatatctatacattacaataacaacaaagatcattgact 34433271  T

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Target: chr8 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7987595 - 7987419
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatt 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  7987595 taaatggatatccatggatgcagatattgtgatatctgtgtccgctccgttggataaatatgaaatccgtaccctatccatatccgtgcggatatccgtt 7987496  T
Q  135 tagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  7987495 tagcgggtaatctgcggattttgaggtatctgcgggtttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaat 7987419  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36583266 - 36583096
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  36583266 tagggatgtaaatggatatccatggatgcgtatagtatgatatccgtgtccgttccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccgcgcgga 36583167  T
Q  127 tatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    ||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||  ||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36583166 tatccgtttaacgggtaatccacagattttgaggtatcagcgagtttatatagatatccatggataacatt 36583096  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8227605 - 8227485
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8227605 tagggatgtaaatggatatccatggatgtggatagtgtgatatccgtgtccgctccgttagataaatatgaaatccgtactctatccatatccatgcgga 8227506  T
Q  127 tatccatttagcggataatcc 147  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  8227505 tatccatttagcgggtaatcc 8227485  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 31005765 - 31005937
Alignment:
Q  25 agtagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcg 124  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||    
T  31005765 agtagggatgtaaatgtatatccatggatgcagatagtgtgatatccgtgtccgctccgttggacaaatatgaaatccgtgccctatccatattcgcgcg 31005864  T
Q  125 gatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacatt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||| || ||||||||||||    
T  31005865 gatatccgtttagcggataatccacggattttgaggtatctgcggatttataaagatctctatggataacatt 31005937  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7968790 - 7968627
Alignment:
Q  48 atggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatcc 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7968790 atggatgcagatagtgtgatatccgtgtccgctccgttggataaatatgaaatccgtaccctatccatatccgtgcggatatccgtttagcgggtaatcc 7968691  T
Q  148 atggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaat 211  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||| |||| || |||||    
T  7968690 gcggattttgaggtatccacgggtttatacatatatccatagatgacatttataaaaataaaat 7968627  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 11481187 - 11481366
Alignment:
Q  30 ggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatat 129  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11481187 ggatgtaaatggatatccatagatgcggatagtgtgatatttgtgtccgctccaatagataaatatgaaattcgtatcctatccatatccgtgcggatat 11481286  T
Q  130 ccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaa 209  Q
     ||||||||  |||||||  ||||||| || |||    || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  11481287 tcatttagccaataatccgcggatttttagatatatgtgggtttatacagatattcatggataacatttataaaaaaaaa 11481366  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9765346 - 9765250
Alignment:
Q  60 agtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatggatttt 156  Q
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T  9765346 agtgtgatatatgtgtccgcttcgttagataaatattaaatccgtaccctatccatatccgcgtggatatccatttagcgggtaatccgtggatttt 9765250  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Original strand, 13355588 - 13355728
Alignment:
Q  62 tgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggt 161  Q
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T  13355588 tgtgatatccatatccgttccattagataaatatgaaatacgtaccctatctatattcgtgtggatatccgtttagcaggtaatccgtggattttgaggt 13355687  T
Q  162 atccacggatttatacggatatccatggataacattcataa 202  Q
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T  13355688 atccgtgggtttatacagatatcgaaagataacatttataa 13355728  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6870864 - 6870791
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaat 100  Q
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T  6870864 tagggatgtaaatatatatccatggatgcggataatgtaatatccgtgtctgctatgttggataaatatgaaat 6870791  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 9766145 - 9766107
Alignment:
Q  27 tagggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtg 65  Q
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T  9766145 tagggatgtaaatggatattcatggatgcggatagtgtg 9766107  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 13355812 - 13355860
Alignment:
Q  269 agcaaaacataatatcgatagattataaaaacaacaaagatccttgact 317  Q
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T  13355812 agcaaaacataatatccatacattagaacaacaacaaagatcattgact 13355860  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 66350 - 66513
Alignment:
Q  29 gggatataaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggata 128  Q
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T  66350 gggatgtaaatggatgtccatggatgcggatagtgtgatatttgtgtcagctccattggacaaatatgaaatctgagccctatccatatctgtgcgaata 66449  T
Q  129 tccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggata 192  Q
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T  66450 tttatttagcgggtaattcatggattttgaggtatccgcgggattatacagatatccatggata 66513  T

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Target: scaffold0246 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10840 - 10735
Alignment:
Q  83 gttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcggatatccatttagcggataatccatggattttgaggtatccacggatttatacggata 182  Q
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T  10840 gttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccacgcggatatccgtttagcgggtaatccatgtatttcatggtatttgcgggtttatacagata 10741  T
Q  183 tccatg 188  Q
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T  10740 tccatg 10735  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7245 - 7156
Alignment:
Q  35 taaatggatatccatggatgcggatagtgtgatatccgtgtccactccgttagataaatatgaaatccgtaccctattcatatccatgcgg 125  Q
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T  7245 taaatggatatccatggatgcagatagtgtgatatctgtatccgctc-gttagataaatatgaaattcgtaccctatctatatccatgcgg 7156  T

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Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7145 - 7083
Alignment:
Q  151 gattttgaggtatccacggatttatacggatatccatggataacattcataagaaaaaaattt 213  Q
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T  7145 gatttttaggtattcacggatttatacagatatccatggataacatttataaaaataaaattt 7083  T

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