View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4761_low_5 (Length: 310)

Name: NF4761_low_5
Description: NF4761
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4761_low_5
NF4761_low_5
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-166)||(14048111-14048276)
chr5 (153-310)||(10775656-10775813)
chr5 (165-310)||(18319025-18319171)
chr5 (156-310)||(29329959-29330113)
chr5 (3-126)||(41095575-41095698)
chr5 (165-306)||(24067136-24067278)
chr5 (156-310)||(264751-264905)
chr5 (156-310)||(10732923-10733077)
chr5 (156-310)||(39363409-39363563)
chr5 (158-310)||(11581184-11581336)
chr5 (153-310)||(36154763-36154917)
chr5 (153-310)||(2154593-2154751)
chr5 (153-310)||(20901988-20902146)
chr5 (156-310)||(20909037-20909191)
chr5 (156-310)||(29346005-29346159)
chr5 (156-310)||(39245161-39245315)
chr5 (156-310)||(42245348-42245502)
chr5 (156-310)||(29348478-29348632)
chr5 (156-310)||(29350951-29351105)
chr5 (156-310)||(32027418-32027572)
chr5 (154-310)||(31061093-31061250)
chr5 (176-310)||(23064536-23064671)
chr5 (177-310)||(38619459-38619593)
chr5 (156-310)||(20917935-20918085)
chr5 (175-310)||(22144077-22144213)
chr5 (175-310)||(23390453-23390589)
chr5 (232-310)||(21997547-21997627)
chr5 (229-279)||(20766130-20766180)
chr5 (229-310)||(22412212-22412294)
chr5 (213-307)||(9077983-9078078)
chr5 (229-310)||(24529248-24529331)
chr5 (229-310)||(25421560-25421643)
chr5 (229-310)||(25431422-25431505)
chr5 (229-310)||(24493597-24493679)
chr5 (175-310)||(1096495-1096631)
chr5 (229-310)||(21729074-21729157)
chr5 (229-310)||(21808399-21808482)
chr5 (229-310)||(13025339-13025421)
chr5 (229-310)||(13095523-13095605)
chr5 (234-310)||(8286857-8286936)
chr5 (107-151)||(29496758-29496802)
chr5 (107-155)||(29496848-29496896)
chr5 (175-227)||(40725965-40726017)
chr5 (229-310)||(22075047-22075130)
chr5 (107-151)||(39436942-39436986)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (153-310)||(13212841-13212999)
chr1 (153-310)||(21346986-21347144)
chr1 (153-310)||(21342121-21342279)
chr1 (156-310)||(13988891-13989045)
chr1 (156-310)||(21475070-21475224)
chr1 (156-310)||(21923274-21923428)
chr1 (156-310)||(29776713-29776867)
chr1 (165-310)||(40389179-40389325)
chr1 (159-310)||(15859994-15860146)
chr1 (175-310)||(16361942-16362077)
chr1 (175-310)||(23593737-23593872)
chr1 (156-310)||(21840792-21840946)
chr1 (156-310)||(29298162-29298315)
chr1 (156-310)||(31612338-31612492)
chr1 (156-310)||(16275346-16275501)
chr1 (153-310)||(21707192-21707349)
chr1 (153-310)||(21711734-21711891)
chr1 (156-310)||(22123050-22123205)
chr1 (152-310)||(45574821-45574980)
chr1 (153-310)||(433037-433193)
chr1 (229-310)||(50210223-50210306)
chr1 (175-273)||(21861527-21861624)
chr1 (175-273)||(21896213-21896310)
chr1 (229-310)||(34509808-34509891)
chr1 (175-310)||(27250686-27250822)
chr1 (107-151)||(23633068-23633112)
chr1 (118-151)||(12785283-12785316)
chr1 (175-208)||(16758781-16758814)
chr1 (175-273)||(35261038-35261132)
chr1 (107-151)||(9132304-9132348)
chr1 (107-151)||(9132349-9132393)
chr1 (175-247)||(12271647-12271717)
chr1 (107-147)||(41137827-41137867)
chr1 (107-151)||(52272981-52273025)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (156-310)||(15355307-15355462)
chr4 (153-310)||(15367718-15367876)
chr4 (153-310)||(15402731-15402889)
chr4 (153-310)||(15371230-15371388)
chr4 (153-310)||(15373511-15373669)
chr4 (153-310)||(15370046-15370203)
chr4 (156-310)||(15118335-15118489)
chr4 (152-310)||(18215253-18215411)
chr4 (156-310)||(52312535-52312689)
chr4 (153-310)||(16223560-16223718)
chr4 (160-310)||(12294-12444)
chr4 (156-310)||(44615313-44615467)
chr4 (156-310)||(44773070-44773224)
chr4 (154-310)||(21815566-21815722)
chr4 (175-310)||(19242724-19242859)
chr4 (175-310)||(50222341-50222476)
chr4 (156-310)||(1837492-1837646)
chr4 (156-310)||(18239402-18239556)
chr4 (156-310)||(19618155-19618309)
chr4 (152-310)||(51463847-51464005)
chr4 (165-310)||(20149854-20150000)
chr4 (153-310)||(44102239-44102396)
chr4 (156-310)||(3515032-3515186)
chr4 (156-310)||(7641175-7641319)
chr4 (152-310)||(12610975-12611126)
chr4 (156-310)||(14970690-14970844)
chr4 (152-310)||(23803244-23803402)
chr4 (175-310)||(44928881-44929017)
chr4 (237-310)||(8574887-8574960)
chr4 (229-310)||(14280341-14280423)
chr4 (165-263)||(22353910-22354007)
chr4 (213-310)||(14038676-14038774)
chr4 (175-273)||(13808-13905)
chr4 (175-310)||(16377480-16377614)
chr4 (229-310)||(54798764-54798847)
chr4 (175-310)||(16270193-16270328)
chr4 (175-310)||(43198510-43198648)
chr4 (229-310)||(52873377-52873460)
chr4 (229-310)||(6899919-6900001)
chr4 (230-310)||(7798802-7798884)
chr4 (62-100)||(46225032-46225070)
chr4 (175-310)||(7088905-7089041)
chr4 (175-310)||(12902785-12902921)
chr4 (175-310)||(22636463-22636599)
chr4 (229-273)||(16239980-16240024)
chr4 (108-151)||(11150609-11150652)
chr4 (229-308)||(7893733-7893814)
chr4 (174-247)||(15464887-15464959)
chr4 (107-151)||(15703750-15703794)
chr4 (107-151)||(25127116-25127160)
chr4 (118-155)||(42597269-42597306)
chr4 (107-151)||(15703795-15703839)
chr4 (107-151)||(19612741-19612785)
chr4 (175-247)||(52243151-52243222)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (153-310)||(2108-2266)
scaffold0247 (175-310)||(17984-18120)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (153-310)||(85559-85717)
scaffold0001 (156-310)||(501109-501263)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (156-310)||(20046178-20046332)
chr8 (156-310)||(1484427-1484581)
chr8 (156-310)||(5853275-5853429)
chr8 (156-310)||(20403252-20403406)
chr8 (175-310)||(45290696-45290832)
chr8 (156-310)||(14409427-14409581)
chr8 (156-310)||(15203214-15203368)
chr8 (156-310)||(22001778-22001932)
chr8 (153-309)||(19801362-19801517)
chr8 (156-310)||(16413299-16413453)
chr8 (156-310)||(19936988-19937143)
chr8 (153-310)||(41598213-41598370)
chr8 (156-310)||(4483306-4483459)
chr8 (156-310)||(19896290-19896447)
chr8 (156-310)||(4542356-4542510)
chr8 (156-310)||(14823798-14823952)
chr8 (176-310)||(15070583-15070718)
chr8 (156-307)||(26223947-26224098)
chr8 (152-265)||(25484254-25484366)
chr8 (229-310)||(26219742-26219823)
chr8 (229-310)||(26225303-26225384)
chr8 (175-310)||(6759286-6759419)
chr8 (175-310)||(22875093-22875228)
chr8 (229-310)||(16092352-16092435)
chr8 (229-310)||(22626764-22626846)
chr8 (156-222)||(24486027-24486093)
chr8 (175-310)||(13597574-13597710)
chr8 (229-310)||(23406407-23406490)
chr8 (240-310)||(31971285-31971356)
chr8 (175-310)||(13508042-13508178)
chr8 (229-310)||(7372806-7372889)
chr8 (229-310)||(28649054-28649137)
chr8 (156-210)||(32810056-32810110)
chr8 (151-247)||(20498655-20498751)
chr8 (229-310)||(18818419-18818502)
chr8 (229-310)||(21919010-21919093)
chr8 (229-310)||(21923938-21924021)
chr8 (175-273)||(17612067-17612164)
chr8 (175-310)||(20536236-20536372)
chr8 (107-151)||(9882578-9882622)
chr8 (111-155)||(12577180-12577224)
chr8 (107-151)||(40387813-40387857)
chr8 (108-151)||(12577139-12577182)
chr8 (240-310)||(16199666-16199737)
chr8 (107-151)||(42145634-42145678)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (153-310)||(4239-4396)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (153-310)||(16809-16966)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (165-310)||(16448518-16448664)
chr6 (156-310)||(2291163-2291317)
chr6 (156-310)||(12742342-12742496)
chr6 (156-310)||(19005071-19005225)
chr6 (156-310)||(19858902-19859056)
chr6 (156-310)||(24422572-24422726)
chr6 (156-310)||(33861819-33861973)
chr6 (156-310)||(33864303-33864457)
chr6 (153-310)||(18456744-18456901)
chr6 (156-310)||(8055054-8055208)
chr6 (156-310)||(18334575-18334729)
chr6 (152-310)||(22782252-22782410)
chr6 (156-310)||(1540894-1541048)
chr6 (156-310)||(1595574-1595728)
chr6 (107-310)||(3851949-3852154)
chr6 (156-310)||(26924623-26924777)
chr6 (156-310)||(34963398-34963552)
chr6 (1-106)||(13611562-13611667)
chr6 (152-310)||(20556873-20557029)
chr6 (152-310)||(25754834-25754992)
chr6 (156-310)||(30676693-30676847)
chr6 (183-310)||(18461904-18462031)
chr6 (156-310)||(25656654-25656808)
chr6 (156-310)||(25688527-25688681)
chr6 (213-310)||(19303536-19303633)
chr6 (175-310)||(18409784-18409920)
chr6 (176-310)||(29060568-29060703)
chr6 (229-310)||(20076728-20076810)
chr6 (153-210)||(19847929-19847986)
chr6 (213-308)||(20593803-20593899)
chr6 (175-310)||(25629312-25629448)
chr6 (262-310)||(18821889-18821937)
chr6 (182-273)||(20109205-20109295)
chr6 (175-310)||(25644348-25644485)
chr6 (175-310)||(20360917-20361053)
chr6 (229-310)||(16496272-16496355)
chr6 (229-310)||(17287806-17287889)
chr6 (175-273)||(8227468-8227565)
chr6 (234-310)||(20638298-20638376)
chr6 (107-150)||(27572970-27573013)
chr6 (110-151)||(9547904-9547945)
chr6 (229-273)||(23019473-23019517)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (156-310)||(24702263-24702417)
chr7 (156-310)||(456346-456500)
chr7 (156-310)||(11393270-11393424)
chr7 (156-310)||(11972521-11972675)
chr7 (156-310)||(15376696-15376850)
chr7 (156-310)||(16232545-16232699)
chr7 (156-310)||(20385106-20385260)
chr7 (156-310)||(21189578-21189732)
chr7 (156-310)||(27216885-27217039)
chr7 (156-310)||(32125516-32125670)
chr7 (156-310)||(41522942-41523096)
chr7 (156-310)||(41525404-41525558)
chr7 (156-310)||(14949105-14949259)
chr7 (156-310)||(18640297-18640451)
chr7 (156-310)||(24704713-24704864)
chr7 (153-310)||(44116534-44116691)
chr7 (107-310)||(3386358-3386563)
chr7 (156-310)||(16410084-16410238)
chr7 (153-310)||(38898356-38898514)
chr7 (156-310)||(18430737-18430891)
chr7 (153-310)||(17061895-17062052)
chr7 (153-304)||(12756651-12756802)
chr7 (152-310)||(13647353-13647512)
chr7 (156-310)||(16213709-16213863)
chr7 (176-310)||(13869371-13869506)
chr7 (186-310)||(24275196-24275320)
chr7 (158-310)||(20110581-20110723)
chr7 (156-279)||(26355966-26356089)
chr7 (156-279)||(26358418-26358541)
chr7 (152-243)||(15081928-15082019)
chr7 (175-310)||(18456370-18456505)
chr7 (212-310)||(13831398-13831496)
chr7 (175-310)||(38227509-38227644)
chr7 (213-310)||(3564359-3564457)
chr7 (216-306)||(48273421-48273512)
chr7 (175-273)||(2280076-2280173)
chr7 (107-151)||(11509575-11509619)
chr7 (229-310)||(10589067-10589150)
chr7 (175-310)||(12698859-12698996)
chr7 (175-247)||(15113036-15113106)
chr7 (234-310)||(9509217-9509295)
chr7 (175-273)||(19486701-19486798)
chr7 (107-151)||(11509620-11509664)
chr7 (175-247)||(15116573-15116643)
chr7 (107-151)||(18148609-18148653)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (152-310)||(8899119-8899277)
chr3 (156-310)||(17463203-17463357)
chr3 (156-310)||(38961874-38962028)
chr3 (156-310)||(45606890-45607044)
chr3 (153-310)||(12119704-12119862)
chr3 (156-310)||(7781330-7781484)
chr3 (156-310)||(17446638-17446792)
chr3 (156-310)||(34159351-34159505)
chr3 (156-310)||(55476516-55476670)
chr3 (153-310)||(53070633-53070790)
chr3 (156-310)||(6469117-6469271)
chr3 (156-310)||(9707590-9707744)
chr3 (156-310)||(10247706-10247860)
chr3 (156-310)||(16282794-16282948)
chr3 (156-310)||(16454264-16454418)
chr3 (156-310)||(28848594-28848748)
chr3 (152-310)||(50242847-50243005)
chr3 (156-310)||(41123915-41124066)
chr3 (175-310)||(8499543-8499679)
chr3 (156-310)||(13151773-13151928)
chr3 (156-310)||(13154238-13154393)
chr3 (175-310)||(29172585-29172720)
chr3 (156-310)||(12567585-12567739)
chr3 (156-310)||(13544050-13544204)
chr3 (153-310)||(17672651-17672808)
chr3 (152-310)||(43550457-43550616)
chr3 (176-310)||(15412454-15412589)
chr3 (204-310)||(15977540-15977646)
chr3 (229-310)||(21618474-21618555)
chr3 (229-310)||(36166623-36166704)
chr3 (229-310)||(55500967-55501049)
chr3 (217-310)||(10557010-10557104)
chr3 (213-310)||(40213716-40213813)
chr3 (175-310)||(14972882-14973018)
chr3 (153-219)||(17248221-17248287)
chr3 (229-310)||(24153219-24153301)
chr3 (237-310)||(44494834-44494908)
chr3 (175-310)||(24340680-24340816)
chr3 (175-310)||(53301507-53301644)
chr3 (240-310)||(14572617-14572688)
chr3 (175-310)||(17487884-17488020)
chr3 (175-310)||(17499366-17499502)
chr3 (175-310)||(27165275-27165411)
chr3 (175-310)||(42386438-42386574)
chr3 (175-310)||(14576790-14576925)
chr3 (229-310)||(12399237-12399320)
chr3 (229-310)||(43840960-43841043)
chr3 (175-310)||(13442302-13442438)
chr3 (175-247)||(2051156-2051227)
chr3 (107-151)||(3586252-3586296)
chr3 (240-310)||(11424781-11424852)
chr3 (229-310)||(18438562-18438645)
chr3 (229-310)||(25476395-25476478)
chr3 (229-310)||(26686915-26686998)
chr3 (234-310)||(20698450-20698528)
chr3 (175-273)||(23274754-23274851)
chr3 (175-273)||(37642222-37642319)
chr3 (175-227)||(22147482-22147534)
chr3 (107-151)||(52466284-52466328)
chr3 (175-247)||(52523684-52523755)
chr3 (238-310)||(17737261-17737337)
chr3 (229-310)||(23083371-23083454)
chr3 (118-151)||(39728092-39728125)
chr3 (107-151)||(3472734-3472778)
chr3 (107-151)||(3475977-3476021)
chr3 (107-151)||(18539094-18539138)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (153-310)||(20360-20515)
scaffold0031 (229-265)||(128825-128861)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (156-310)||(20772-20926)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (156-310)||(37846-38000)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (156-310)||(94436-94590)
scaffold0023 (156-310)||(17423-17577)
scaffold0023 (176-310)||(44479-44614)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (156-310)||(158433-158587)
scaffold0003 (229-310)||(339960-340040)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (156-310)||(18808968-18809122)
chr2 (156-310)||(23709515-23709669)
chr2 (156-310)||(23711996-23712150)
chr2 (156-310)||(24367799-24367953)
chr2 (156-310)||(39682338-39682492)
chr2 (152-309)||(32039477-32039634)
chr2 (156-310)||(571422-571576)
chr2 (156-310)||(6726020-6726174)
chr2 (156-310)||(21155043-21155197)
chr2 (156-310)||(23130887-23131041)
chr2 (156-310)||(23133354-23133508)
chr2 (156-310)||(34402505-34402659)
chr2 (151-310)||(43137324-43137483)
chr2 (156-310)||(23135615-23135769)
chr2 (156-310)||(24898178-24898333)
chr2 (156-310)||(24900661-24900816)
chr2 (156-310)||(24903138-24903293)
chr2 (156-310)||(24905615-24905770)
chr2 (156-310)||(24908090-24908245)
chr2 (175-310)||(38967399-38967535)
chr2 (156-310)||(26505404-26505558)
chr2 (156-310)||(26507882-26508036)
chr2 (156-310)||(28577124-28577278)
chr2 (156-310)||(32214904-32215058)
chr2 (156-310)||(45029837-45029991)
chr2 (156-310)||(22105437-22105592)
chr2 (153-310)||(24529508-24529666)
chr2 (152-251)||(24642835-24642933)
chr2 (175-273)||(7690-7787)
chr2 (158-310)||(19671858-19672010)
chr2 (175-310)||(23060541-23060677)
chr2 (152-210)||(22173808-22173866)
chr2 (175-310)||(23708576-23708712)
chr2 (240-310)||(38136-38207)
chr2 (229-310)||(23076470-23076553)
chr2 (175-310)||(22337143-22337279)
chr2 (262-310)||(24643039-24643087)
chr2 (175-244)||(22459519-22459587)
chr2 (107-151)||(16092613-16092657)
chr2 (108-151)||(27401588-27401631)
chr2 (234-310)||(22731249-22731327)
chr2 (118-155)||(37379729-37379766)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (156-310)||(4719-4873)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (156-310)||(13972-14126)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (156-310)||(134236-134390)
scaffold0028 (156-310)||(136705-136859)
scaffold0028 (156-310)||(139174-139328)
scaffold0028 (156-310)||(144112-144266)
scaffold0028 (156-310)||(141643-141797)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (153-310)||(161069-161227)
scaffold0007 (153-257)||(164570-164674)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (152-306)||(135-289)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (156-310)||(13417-13571)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (152-310)||(1259-1418)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (153-310)||(29957-30114)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (155-310)||(9774-9930)
scaffold0145 (175-310)||(32970-33105)
scaffold0145 (234-308)||(38791-38866)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (156-310)||(10798-10952)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (156-310)||(9267-9421)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (153-310)||(4322-4479)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (153-310)||(79264-79421)
scaffold0056 (229-310)||(17225-17310)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (156-310)||(40425-40579)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (152-310)||(82097-82255)
scaffold0037 (177-310)||(22630-22763)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (152-310)||(12089-12241)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (156-310)||(11313-11467)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (156-306)||(12232-12382)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (229-310)||(116455-116536)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (175-310)||(3108-3243)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (175-310)||(22911-23046)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (175-310)||(38659-38795)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (175-273)||(53506-53603)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (178-251)||(13093-13165)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (175-310)||(39505-39640)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (175-310)||(75172-75307)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (229-310)||(16610-16693)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (229-310)||(44717-44800)
scaffold0122 (217-310)||(26064-26158)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (175-310)||(1879-2015)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (175-310)||(39941-40076)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (182-310)||(8494-8623)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (153-227)||(12041-12115)
scaffold0503 (258-310)||(11991-12044)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (229-310)||(32967-33049)
scaffold0120 (229-310)||(45956-46038)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (175-310)||(4536-4671)
scaffold0228 (175-310)||(12118-12253)
scaffold0228 (175-310)||(22070-22205)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (175-310)||(13239-13375)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (105-153)||(22672-22720)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (175-310)||(25924-26059)
scaffold0026 (175-310)||(39886-40021)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (240-310)||(13525-13596)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (175-273)||(3487-3585)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (240-310)||(15485-15556)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (175-273)||(12635-12731)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (62-154)||(106985-107079)
scaffold0024 (105-154)||(109095-109144)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (175-273)||(225474-225570)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (175-310)||(11492-11628)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (175-272)||(16057-16153)
scaffold0357 (175-273)||(13195-13293)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (175-272)||(27706-27802)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (175-310)||(38213-38349)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (188-310)||(1980-2103)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (229-310)||(4877-4960)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (229-310)||(28442-28525)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (229-310)||(51941-52024)
scaffold0011 (175-310)||(167936-168071)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (175-310)||(1006-1141)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (237-310)||(3204-3279)
[»] scaffold0281 (3 HSPs)
scaffold0281 (108-155)||(948-995)
scaffold0281 (88-151)||(997-1060)
scaffold0281 (107-151)||(862-906)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (175-258)||(27912-27994)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (240-310)||(32095-32165)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (175-310)||(24259-24396)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (156-210)||(6072-6126)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (106-151)||(15544-15589)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (175-310)||(3498-3634)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14048276 - 14048111
Alignment:
Q  1 tattagctaaaaataatatactttgtttccaggtgattgtataaagataaattatttgacgattatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048276 tattagctcaaaataatatacttcttttccaggtgattgtatagagataaattatttgacgattatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatg 14048177  T
Q  101 tatgttgatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatgatttgatgatg 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14048176 tatgttgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatgatattatgatg 14048111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 10775656 - 10775813
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10775656 atgatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 10775754  T
Q  253 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775755 gtcatgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 10775813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Original strand, 18319025 - 18319171
Alignment:
Q  165 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 263  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  18319025 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 18319124  T
Q  264 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319125 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18319171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29330113 - 29329959
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29330113 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29330015  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29330014 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29329959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 41095575 - 41095698
Alignment:
Q  3 ttagctaaaaataatatactttgtttccaggtgattgtataaagataaattatttgacgattatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatgta 102  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41095575 ttagctcaaaataatatacttcttttccaggtgattgtataaagataaattatttgacgattatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatgta 41095674  T
Q  103 tgttgatgtgttatgtgaagatgt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  41095675 tgttgatgtgctatgtgaagatgt 41095698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24067278 - 24067136
Alignment:
Q  165 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 263  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24067278 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 24067179  T
Q  264 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24067178 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcat 24067136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 264751 - 264905
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  264751 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 264849  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  264850 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 264905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 10732923 - 10733077
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10732923 atttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10733021  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10733022 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39363563 - 39363409
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39363563 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 39363465  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39363464 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 39363409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581336
Alignment:
Q  158 ttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcat 257  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcat 11581282  T
Q  258 gttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11581283 gttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11581336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 36154763 - 36154917
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36154763 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 36154861  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154862 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagt 36154917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154751
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatattatta 2154691  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2154692 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 2154751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902146
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatattatta 20902086  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20902087 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20902146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20909191 - 20909037
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20909191 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20909093  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20909092 atgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagt 20909037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29346159 - 29346005
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29346159 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29346061  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29346060 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 29346005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39245315 - 39245161
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  39245315 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtc 39245217  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39245216 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 39245161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 42245348 - 42245502
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42245348 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 42245446  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42245447 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 42245502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29348632 - 29348478
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29348632 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29348534  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  29348533 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagt 29348478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29351105 - 29350951
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29351105 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29351007  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  29351006 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagt 29350951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32027572 - 32027418
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  32027572 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtc 32027474  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  32027473 atgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagt 32027418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31061250 - 31061093
Alignment:
Q  154 tgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaag 253  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31061250 tgatttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatg 31061151  T
Q  254 tcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||| || |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31061150 tcatgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 31061093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23064671 - 23064536
Alignment:
Q  176 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  23064671 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 23064572  T
Q  275 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23064571 tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23064536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38619593 - 38619459
Alignment:
Q  177 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgtt 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |    
T  38619593 atataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactact 38619494  T
Q  276 gtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619493 gtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38619459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 20917935 - 20918085
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    || ||||||||  |||    
T  20917935 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttg-ttgactt----tttatattattttgtc 20918029  T
Q  256 atgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20918030 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20918085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22144213 - 22144077
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact-g 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||      
T  22144213 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactac 22144115  T
Q  274 ttgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22144114 ctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagt 22144077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 23390453 - 23390589
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23390453 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 23390551  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23390552 tctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 310
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997627
Alignment:
Q  232 acttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21997627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Original strand, 20766130 - 20766180
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20766130 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgttgtgt 20766180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22412294 - 22412212
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22412294 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagt 22412212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9078078 - 9077983
Alignment:
Q  213 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatg 307  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9078078 ataattgagatgttg-ttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 9077983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24529331 - 24529248
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529331 ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 24529248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25421643 - 25421560
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421643 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25431505 - 25431422
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25431505 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagt 25431422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24493679 - 24493597
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  24493679 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagt 24493597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1096631 - 1096495
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||   |  |||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||     
T  1096631 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatacta 1096533  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1096532 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 21729074 - 21729157
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21729074 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 21808399 - 21808482
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21808399 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13025421 - 13025339
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13025421 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13025339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13095605 - 13095523
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13095605 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13095523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Original strand, 8286857 - 8286936
Alignment:
Q  234 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt--gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8286857 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8286936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 29496758 - 29496802
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29496758 gatgtgttatttgaagttgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 29496802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Original strand, 29496848 - 29496896
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 155  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29496848 gatgtgctatttgaagttgtgtgatttaaagatgtgttatataaatatg 29496896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40726017 - 40725965
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  40726017 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 40725965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22075130 - 22075047
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||   | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22075130 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 39436942 - 39436986
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39436942 gatgtgttatttaaagatgtgtgatttagagatgtgttatataaa 39436986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 13212841 - 13212999
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13212841 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 13212940  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13212941 gtcatgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13212999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21346986
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21347144 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 21347045  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21347044 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21346986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21342279 - 21342121
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21342279 atgatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 21342180  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342179 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21342121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13989045 - 13988891
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13989045 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13988947  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13988946 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13988891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 21475070 - 21475224
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21475070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21475168  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475169 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21475224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 21923274 - 21923428
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21923274 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21923372  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923373 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21923428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29776867 - 29776713
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29776867 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29776769  T
Q  256 atgtt-gttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29776768 atgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29776713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40389325 - 40389179
Alignment:
Q  165 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 263  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  40389325 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 40389226  T
Q  264 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40389225 ttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagt 40389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 310
Target Start/End: Original strand, 15859994 - 15860146
Alignment:
Q  159 tgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg 258  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15859994 tgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatg 15860093  T
Q  259 ttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15860094 ttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15860146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16362077 - 16361942
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttg-tatactg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  16362077 tgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactg 16361979  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361978 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 16361942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 23593737 - 23593872
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  23593737 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23593835  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593836 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23593872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21840946 - 21840792
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21840946 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21840848  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21840847 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21840792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29298315 - 29298162
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  29298315 atttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatt-attc 29298218  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29298217 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29298162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31612492 - 31612338
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31612492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 31612394  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31612393 atgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 31612338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 16275346 - 16275501
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16275346 atttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtc 16275445  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  16275446 atgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagt 16275501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21707349 - 21707192
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  21707349 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattct 21707251  T
Q  253 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21707250 gtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21707192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21711891 - 21711734
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  21711891 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattct 21711793  T
Q  253 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21711792 gtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21711734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 22123050 - 22123205
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22123050 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22123148  T
Q  256 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22123149 atgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagt 22123205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 45574821 - 45574980
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45574821 tatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattatta 45574919  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || ||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45574920 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45574980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433037
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgtt-atatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 433095  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     ||| || || ||||||||||||  |||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  433094 tgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgt---tgccgttatttaactaagctgcatgagt 433037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 50210223 - 50210306
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50210223 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50210306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 21861527 - 21861624
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  21861527 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 21861624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 21896213 - 21896310
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||    
T  21896213 tgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactg 21896310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34509891 - 34509808
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34509891 ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34509808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 27250686 - 27250822
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  27250686 tgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 27250784  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27250785 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 23633068 - 23633112
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23633068 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 23633112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12785316 - 12785283
Alignment:
Q  118 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12785316 tgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 12785283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16758814 - 16758781
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatat 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16758814 tgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16758781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 35261038 - 35261132
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||  |||||| ||||||    |||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  35261038 tgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat----ttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 35261132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 9132304 - 9132348
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  9132304 gatgtgttatttgaagttgtgggatttaaagatgtgttatataaa 9132348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 9132349 - 9132393
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  9132349 gatgtgttatttgaagttgtgcgatttaaagatgtgttatataaa 9132393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12271717 - 12271647
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12271717 tgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgat-gacttgcatttgatatt 12271647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 147
Target Start/End: Original strand, 41137827 - 41137867
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttata 147  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41137827 gatgtgttatttgaagttgtgtgatttaaagatgtgttata 41137867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 52273025 - 52272981
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52273025 gatgtgttatataaagatgtgtgatttaaagatgtgtcatataaa 52272981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 15355307 - 15355462
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15355307 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15355406  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15355407 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15355462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15367876 - 15367718
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15367876 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 15367777  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15367776 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15367718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15402889 - 15402731
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15402889 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 15402790  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15402789 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15402731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15371388 - 15371230
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15371388 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattat 15371289  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15371288 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15371230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15373669 - 15373511
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15373669 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattat 15373570  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15373569 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15373511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15370203 - 15370046
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15370203 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 15370105  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15370104 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15370046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 15118335 - 15118489
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15118335 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 15118433  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15118434 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15118489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215411
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215253 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 18215351  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18215352 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18215411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 52312689 - 52312535
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52312689 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 52312591  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52312590 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 52312535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16223718 - 16223560
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16223718 atgatgtgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattat 16223619  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16223618 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16223560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 310
Target Start/End: Original strand, 12294 - 12444
Alignment:
Q  160 gatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgt 259  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12294 gatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 12392  T
Q  260 tg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12393 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44615467 - 44615313
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44615467 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 44615369  T
Q  256 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44615368 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44615313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 44773070 - 44773224
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44773070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 44773168  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44773169 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44773224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Original strand, 21815566 - 21815722
Alignment:
Q  154 tgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaag 253  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  21815566 tgatttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattattatg 21815664  T
Q  254 tcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21815665 tcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagt 21815722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19242859 - 19242724
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  19242859 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 19242761  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19242760 ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19242724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 50222341 - 50222476
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||    
T  50222341 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatg 50222439  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50222440 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50222476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 1837492 - 1837646
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  1837492 atttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattattatgtc 1837590  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837591 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1837646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 18239402 - 18239556
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18239402 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18239500  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18239501 atgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18239556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 19618155 - 19618309
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19618155 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19618253  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19618254 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19618309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51464005
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  51463847 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 51463945  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51463946 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 51464005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20150000 - 20149854
Alignment:
Q  165 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 263  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  20150000 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 20149901  T
Q  264 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  20149900 ttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagt 20149854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44102396 - 44102239
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  44102396 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-tttacttgcatttgatattattat 44102298  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44102297 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagt 44102239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3515186 - 3515032
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3515186 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 3515088  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     || || |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3515087 ttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagt 3515032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 7641175 - 7641319
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7641175 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 7641273  T
Q  256 atgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7641274 atgttgttt---------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7641319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12611126 - 12610975
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12611126 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 12611028  T
Q  252 agtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| ||||||      |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12611027 tgtcatgctgtttt------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12610975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 14970690 - 14970844
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14970690 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14970788  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14970789 atgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14970844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 23803244 - 23803402
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23803244 tatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 23803342  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23803343 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23803402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 44928881 - 44929017
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  44928881 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgtt-attgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactg 44928979  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44928980 cttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44929017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 8574887 - 8574960
Alignment:
Q  237 catttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8574887 catttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8574960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14280423 - 14280341
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14280423 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22354007 - 22353910
Alignment:
Q  165 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtt 263  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  22354007 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgtt 22353910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14038774 - 14038676
Alignment:
Q  213 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14038774 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14038676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 13808 - 13905
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  13808 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 13905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 16377480 - 16377614
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  16377480 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgc 16377577  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16377578 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16377614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 54798764 - 54798847
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  54798764 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 16270193 - 16270328
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  16270193 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 16270291  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16270292 ctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 16270328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 43198510 - 43198648
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg--ttgttttgtatact 272  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||  |||||  |||||||| ||| |    
T  43198510 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattga-tgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatatt 43198608  T
Q  273 gt-tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    || | ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43198609 gtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 43198648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 52873377 - 52873460
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52873377 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 52873460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6900001 - 6899919
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  6900001 ttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagt 6899919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7798884 - 7798802
Alignment:
Q  230 tgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7798884 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 100
Target Start/End: Original strand, 46225032 - 46225070
Alignment:
Q  62 attatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46225032 attatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatg 46225070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7089041 - 7088905
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||| |||| | ||||  | ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  7089041 tgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 7088943  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7088942 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7088905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12902921 - 12902785
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || || || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12902921 tgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 12902823  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12902822 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22636599 - 22636463
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  22636599 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactg 22636501  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22636500 tctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Original strand, 16239980 - 16240024
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16239980 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 16240024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11150652 - 11150609
Alignment:
Q  108 atgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11150652 atgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 11150609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7893814 - 7893733
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatga 308  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7893814 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 7893733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 247
Target Start/End: Original strand, 15464887 - 15464959
Alignment:
Q  174 ttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  15464887 ttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatatt 15464959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15703794 - 15703750
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15703794 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 15703750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 25127116 - 25127160
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25127116 gatgtattatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 25127160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 155
Target Start/End: Original strand, 42597269 - 42597306
Alignment:
Q  118 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 155  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42597269 tgaagatgtatgatttaaagatgtgttatataaatatg 42597306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15703839 - 15703795
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15703839 gatgtgttatttgaagatgtgttatttgaagatgtgttatataaa 15703795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 19612741 - 19612785
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  19612741 gatgtgttatttgaagatgtctgatttaaatatgtgttatataaa 19612785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 247
Target Start/End: Original strand, 52243151 - 52243222
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||  |||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  52243151 tgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgaatttcatttgatatt 52243222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2266
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  2108 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattat 2207  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2208 gtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagt 2266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 17984 - 18120
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| |||| || ||| ||     
T  17984 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataatgc 18082  T
Q  274 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  18083 atatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 18120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 85559 - 85717
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  85559 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattat 85658  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85659 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 85717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 501263 - 501109
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  501263 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 501165  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  501164 atgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 501109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 20046178 - 20046332
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20046178 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20046276  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20046277 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20046332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1484581 - 1484427
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1484581 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 1484483  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1484482 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1484427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 5853275 - 5853429
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5853275 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 5853373  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5853374 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 5853429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20403406 - 20403252
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20403406 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20403308  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20403307 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20403252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 45290696 - 45290832
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  45290696 tgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 45290795  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290796 ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45290832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 14409427 - 14409581
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14409427 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14409525  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14409526 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14409581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 15203214 - 15203368
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15203214 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtc 15203312  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15203313 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15203368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22001932 - 22001778
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22001932 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22001834  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22001833 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22001778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 309
Target Start/End: Original strand, 19801362 - 19801517
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    |||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  19801362 atgacttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcgtttgatattattat 19801460  T
Q  253 gtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgag 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19801461 gtcatgctgttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgag 19801517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 16413299 - 16413453
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16413299 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16413397  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16413398 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16413453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 19936988 - 19937143
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19936988 atttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtc 19937087  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19937088 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19937143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598213
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41598370 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 41598272  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41598271 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagt 41598213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4483459 - 4483306
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4483459 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4483361  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4483360 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagt 4483306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19896447 - 19896290
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttga---tattattaa 252  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||     
T  19896447 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattattat 19896349  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19896348 gtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19896290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 4542356 - 4542510
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4542356 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4542454  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4542455 atgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 4542510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14823952 - 14823798
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14823952 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14823854  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  14823853 atgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt 14823798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15070718 - 15070583
Alignment:
Q  176 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  15070718 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15070619  T
Q  275 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15070618 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15070583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223947
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26224000  T
Q  256 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatg 307  Q
    ||| |  ||||||||| || | | | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26223999 atgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatg 26223947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 265
Target Start/End: Original strand, 25484254 - 25484366
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25484254 tatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 25484352  T
Q  252 agtcatgttgtttt 265  Q
     |||||| ||||||    
T  25484353 tgtcatgctgtttt 25484366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26219823 - 26219742
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26219823 ttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26219742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 26225303 - 26225384
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26225303 ttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26225384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6759419 - 6759286
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6759419 tgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttga----cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 6759324  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6759323 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 6759286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22875228 - 22875093
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22875228 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 22875130  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22875129 ctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagt 22875093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 16092352 - 16092435
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092352 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22626846 - 22626764
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22626846 ttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22626764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 24486027 - 24486093
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgaga 222  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24486027 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 13597574 - 13597710
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| ||||||| || |||     
T  13597574 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcattctgc 13597672  T
Q  274 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    || ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  13597673 ttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 13597710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23406490 - 23406407
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23406490 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23406407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971285
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 31971285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 13508042 - 13508178
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| |||| || ||| ||     
T  13508042 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatattgc 13508140  T
Q  274 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  13508141 ctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 13508178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7372889 - 7372806
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7372889 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 28649054 - 28649137
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28649054 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagt 28649137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32810110 - 32810056
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 210  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32810110 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgt 32810056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20498751 - 20498655
Alignment:
Q  151 atatgatttgatgatgtt-atatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    ||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20498751 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatatt 20498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 18818419 - 18818502
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18818419 ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 21919010 - 21919093
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21919010 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 21923938 - 21924021
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923938 ttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 17612067 - 17612164
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  17612067 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 17612164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20536372 - 20536236
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  20536372 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20536274  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536273 cctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9882622 - 9882578
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9882622 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 9882578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12577224 - 12577180
Alignment:
Q  111 tgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 155  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12577224 tgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtattatataaatatg 12577180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 40387857 - 40387813
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40387857 gatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgagttatataaa 40387813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12577182 - 12577139
Alignment:
Q  108 atgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12577182 atgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 12577139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199737
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt-gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16199737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42145678 - 42145634
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42145678 gatgtgttatttgaatatgtgtgatttaaagatgtgtaatataaa 42145634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4396 - 4239
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4396 atgatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 4298  T
Q  253 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4297 gtcatgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagt 4239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16966 - 16809
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16966 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 16868  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16867 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Original strand, 16448518 - 16448664
Alignment:
Q  165 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 263  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  16448518 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 16448617  T
Q  264 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448618 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16448664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 2291163 - 2291317
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2291163 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 2291261  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2291262 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 2291317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12742496 - 12742342
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12742496 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 12742398  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12742397 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19005225 - 19005071
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19005225 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19005127  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19005126 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19005071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19859056
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19858902 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19859000  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19859001 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19859056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24422726 - 24422572
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24422726 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24422628  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24422627 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24422572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33861973 - 33861819
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33861973 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 33861875  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33861874 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 33861819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33864457 - 33864303
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33864457 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 33864359  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33864358 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 33864303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456744
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18456901 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 18456803  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456802 gtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18456744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8055208 - 8055054
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8055208 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 8055110  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8055109 atgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8055054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 18334575 - 18334729
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18334575 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18334673  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18334674 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18334729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22782410 - 22782252
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782410 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 22782312  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782311 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22782252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 1540894 - 1541048
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1540894 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 1540992  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1540993 atactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1541048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1595728 - 1595574
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  1595728 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgaattgcatttgatattattatgtc 1595630  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1595629 atgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1595574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 310
Target Start/End: Original strand, 3851949 - 3852154
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataa--atatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaatt 204  Q
    ||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||| | |  || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3851949 gatgtgtcatataaagatgtgttatttaaagatgtgttatttgatgatgtgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 3852048  T
Q  205 atatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctg 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  3852049 atatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctg 3852147  T
Q  304 catgagt 310  Q
    |||||||    
T  3852148 catgagt 3852154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 26924623 - 26924777
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26924623 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26924721  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26924722 atgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26924777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34963552 - 34963398
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34963552 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34963454  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34963453 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 34963398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13611667 - 13611562
Alignment:
Q  1 tattagctaaaaataatatactttgtttccaggtgattgtataaagataaattatttgacgattatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13611667 tattagctcaaaataatatacttcttttccaggtgattgtataaagataaattatttgacgattatttgacaatgtgtatttgtgagttatttgattatg 13611568  T
Q  101 tatgtt 106  Q
    ||||||    
T  13611567 tatgtt 13611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20557029
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga--aattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 20556969  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20556970 tgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20557029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25754992 - 25754834
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25754992 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 25754894  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25754893 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 25754834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 30676693 - 30676847
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  30676693 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatatc 30676791  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30676792 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 30676847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461904
Alignment:
Q  183 ttgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcg 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttg 18461933  T
Q  282 ctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18461932 ctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25656808 - 25656654
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25656808 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 25656710  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656709 atgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 25656654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25688681 - 25688527
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    ||||| || ||||||||  |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  25688681 atttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatattattatgtc 25688583  T
Q  256 atgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25688582 atgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 25688527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 310
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303633
Alignment:
Q  213 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatac-tgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 18409784 - 18409920
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||||||   |  || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18409784 tgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactg 18409882  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18409883 cctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagt 18409920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060568
Alignment:
Q  176 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg- 273  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc 29060605  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29060604 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29060568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20076810 - 20076728
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20076810 ttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20076728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847986
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgt 19847986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593803
Alignment:
Q  213 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatga 308  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20593899 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatga 20593803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 25629312 - 25629448
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25629312 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactg 25629410  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      |||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25629411 catgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagt 25629448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 310
Target Start/End: Original strand, 18821889 - 18821937
Alignment:
Q  262 ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18821889 ttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18821937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109205
Alignment:
Q  182 attgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactg 20109205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25644485 - 25644348
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||  ||| | || ||||| ||||||    
T  25644485 tgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactg 25644387  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25644386 cctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagt 25644348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 20360917 - 20361053
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||    
T  20360917 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctg 20361015  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20361016 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16496355 - 16496272
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16496355 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 17287806 - 17287889
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgt-tttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||   | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17287806 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 8227468 - 8227565
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  8227468 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 8227565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638376
Alignment:
Q  234 ttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 20638376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 150
Target Start/End: Original strand, 27572970 - 27573013
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataa 150  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27572970 gatgtgctatttgaagatgtgtgttttaaagatgtgttatataa 27573013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9547945 - 9547904
Alignment:
Q  110 gtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9547945 gtgttatttgtagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 9547904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23019517 - 23019473
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  23019517 ttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 23019473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24702417 - 24702263
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24702417 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24702319  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24702318 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24702263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 456500 - 456346
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  456500 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 456402  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  456401 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 456346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 11393270 - 11393424
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11393270 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11393368  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11393369 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11393424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11972675 - 11972521
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11972675 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11972577  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11972576 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11972521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 15376696 - 15376850
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15376696 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 15376794  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15376795 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15376850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16232699 - 16232545
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16232699 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16232601  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232600 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16232545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 20385106 - 20385260
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20385106 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20385204  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20385205 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20385260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 21189578 - 21189732
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21189578 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21189676  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21189677 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21189732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27217039 - 27216885
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27217039 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 27216941  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27216940 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 27216885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32125670 - 32125516
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32125670 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 32125572  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32125571 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 32125516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41523096 - 41522942
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41523096 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41522998  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41522997 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 41522942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41525558 - 41525404
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41525558 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41525460  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41525459 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 41525404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 14949105 - 14949259
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14949105 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14949203  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14949204 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14949259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18640451 - 18640297
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640451 attttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18640353  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640352 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18640297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24704864 - 24704713
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24704864 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24704766  T
Q  256 atgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24704765 ttgt--ttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24704713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116534
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44116691 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 44116593  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44116592 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagt 44116534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3386563 - 3386358
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataa--atatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaatt 204  Q
    ||||||| || | |||||||||  | |||||||||||||| | |  || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3386563 gatgtgtcatataaagatgtgttatctaaagatgtgttatttgatgatgtgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaatt 3386464  T
Q  205 atatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctg 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3386463 atatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 3386365  T
Q  304 catgagt 310  Q
    |||||||    
T  3386364 catgagt 3386358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16410238 - 16410084
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16410238 atttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16410140  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16410139 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16410084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 38898356 - 38898514
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38898356 atgatttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattat 38898455  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38898456 gtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38898514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18430891 - 18430737
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18430891 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18430793  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18430792 atgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18430737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17062052
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  17061895 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttg-ctgacttgcatttgatattattat 17061993  T
Q  253 gtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| | |||||||||||| || || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17061994 gtcatgctattttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagt 17062052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 304
Target Start/End: Original strand, 12756651 - 12756802
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  12756651 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttg-tttacttgcatttgatattattat 12756749  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgc 304  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  12756750 gtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgc 12756802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647353
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13647512 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 13647414  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || ||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13647413 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13647353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16213863 - 16213709
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16213863 atttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtc 16213765  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16213764 atgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16213709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13869506 - 13869371
Alignment:
Q  176 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  13869506 gatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 13869407  T
Q  275 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13869406 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13869371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275196
Alignment:
Q  186 tatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctg 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg 24275222  T
Q  285 tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagt 24275196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110581
Alignment:
Q  158 ttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcat 257  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcat 20110625  T
Q  258 gttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | |||||         |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20110624 gctgttt---------ttgtatagctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20110581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 279
Target Start/End: Original strand, 26355966 - 26356089
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26355966 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtt 26356064  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgt 279  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  26356065 atgctgtttttgtatactgttgtgt 26356089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 279
Target Start/End: Original strand, 26358418 - 26358541
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26358418 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtt 26358516  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgt 279  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  26358517 atgctgtttttgtatactgttgtgt 26358541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Original strand, 15081928 - 15082019
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttga 243  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15081928 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 18456370 - 18456505
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18456370 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 18456468  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18456469 ctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagt 18456505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13831496 - 13831398
Alignment:
Q  212 aataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13831496 aataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 13831398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38227644 - 38227509
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  38227644 tgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 38227546  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38227545 ctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 38227509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 310
Target Start/End: Original strand, 3564359 - 3564457
Alignment:
Q  213 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3564359 ataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3564457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273421
Alignment:
Q  216 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 306  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48273512 attgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 48273421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 2280076 - 2280173
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  2280076 tgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactg 2280173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 11509575 - 11509619
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11509575 gatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 11509619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10589150 - 10589067
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10589150 ttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10589067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12698996 - 12698859
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgt--tttgtatact 272  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  12698996 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatact 12698898  T
Q  273 gt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12698897 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12698859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15113106 - 15113036
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15113106 tgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttga-tgacttgcatttgatatt 15113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9509295 - 9509217
Alignment:
Q  234 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtt-ttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509295 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 19486701 - 19486798
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  19486701 tgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 19486798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 11509620 - 11509664
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11509620 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgttttatataaa 11509664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15116643 - 15116573
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  15116643 tgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttga-tgacttgcaattgatatt 15116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 18148609 - 18148653
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  18148609 gatgtgttatttgaagatgtgtgatttaacgatgtgtcatataaa 18148653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899119
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8899277 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 8899179  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899178 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8899119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17463357 - 17463203
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17463357 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17463259  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17463258 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17463203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 38961874 - 38962028
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38961874 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 38961972  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38961973 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 38962028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 45606890 - 45607044
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45606890 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 45606988  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45606989 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45607044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 12119704 - 12119862
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12119704 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 12119803  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12119804 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagt 12119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 7781330 - 7781484
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  7781330 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtc 7781428  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781429 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7781484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 17446638 - 17446792
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17446638 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17446736  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17446737 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17446792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34159505 - 34159351
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34159505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34159407  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34159406 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34159351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55476670 - 55476516
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  55476670 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 55476572  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55476571 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 55476516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070790
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  53070633 atgatttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 53070731  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53070732 gtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 53070790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 6469117 - 6469271
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6469117 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 6469215  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6469216 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 6469271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 9707590 - 9707744
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  9707590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgtatttgatattattatgtc 9707688  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9707689 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 9707744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 10247706 - 10247860
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10247706 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10247804  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10247805 atgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 10247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 16282794 - 16282948
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  16282794 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattcaatattattatgtc 16282892  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16282893 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16282948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 16454264 - 16454418
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16454264 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16454362  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16454363 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 16454418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 28848594 - 28848748
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28848594 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 28848692  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28848693 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 28848748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50243005 - 50242847
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50243005 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 50242907  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50242906 tgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50242847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41124066 - 41123915
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41124066 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41123968  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41123967 atgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagt 41123915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8499679 - 8499543
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  8499679 tgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta 8499580  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499579 ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8499543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 13151773 - 13151928
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13151773 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13151871  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13151872 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 13151928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 13154238 - 13154393
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13154238 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13154336  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13154337 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 13154393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 29172585 - 29172720
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  29172585 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 29172683  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29172684 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29172720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12567739 - 12567585
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12567739 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 12567641  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567640 atgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12567585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13544204 - 13544050
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13544204 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13544106  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13544105 atgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13544050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17672808 - 17672651
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  17672808 atgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 17672710  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17672709 gtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 17672651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 43550457 - 43550616
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43550457 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 43550555  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     ||||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43550556 tgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagt 43550616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15412589 - 15412454
Alignment:
Q  176 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  15412589 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15412490  T
Q  275 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15412489 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15412454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977540
Alignment:
Q  204 tatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagct 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagct 15977548  T
Q  303 gcatgagt 310  Q
    ||||||||    
T  15977547 gcatgagt 15977540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21618555 - 21618474
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618555 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36166704 - 36166623
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36166704 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 36166623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55501049 - 55500967
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55501049 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 55500967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10557010
Alignment:
Q  217 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10557010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 310
Target Start/End: Original strand, 40213716 - 40213813
Alignment:
Q  213 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttt-tgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40213716 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagt 40213813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14973018 - 14972882
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattat--atgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatac 271  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||| |||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  14973018 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatata--tgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 14972922  T
Q  272 tgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14972921 tgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248287
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattg 219  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 24153219 - 24153301
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact-gttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24153219 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagt 24153301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494834
Alignment:
Q  237 catttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44494834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 24340680 - 24340816
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| |||| || ||||||     
T  24340680 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatactgc 24340778  T
Q  274 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  24340779 atatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 24340816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 53301507 - 53301644
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 274  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||||||||| | |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  53301507 tgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgt 53301606  T
Q  275 -tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| |||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  53301607 ctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagt 53301644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572617
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14572617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17488020 - 17487884
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  17488020 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17487922  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17487921 tctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17499502 - 17499366
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  17499502 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17499404  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17499403 tctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27165411 - 27165275
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 274  Q
    ||||||||||||||| ||| || || |||||||| | |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  27165411 tgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgt 27165313  T
Q  275 -tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | | | |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27165312 ctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 27165275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42386574 - 42386438
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||||||||   | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  42386574 tgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactg 42386476  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42386475 cctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 14576790 - 14576925
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 274  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  14576790 tgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgt 14576888  T
Q  275 -tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  14576889 ctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagt 14576925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12399320 - 12399237
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12399320 ttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43841043 - 43840960
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43841043 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13442438 - 13442302
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13442438 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 13442340  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  13442339 cctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 247
Target Start/End: Original strand, 2051156 - 2051227
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  2051156 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatatt 2051227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3586296 - 3586252
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3586296 gatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 3586252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424852
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11424852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18438645 - 18438562
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18438645 ttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 18438562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 25476395 - 25476478
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatact-gttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  25476395 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagt 25476478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26686998 - 26686915
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26686998 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Original strand, 20698450 - 20698528
Alignment:
Q  234 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20698450 ttgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20698528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23274851 - 23274754
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  23274851 tgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 23274754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 37642222 - 37642319
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  37642222 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 37642319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Original strand, 22147482 - 22147534
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  22147482 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 22147534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 52466284 - 52466328
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52466284 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 52466328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 247
Target Start/End: Original strand, 52523684 - 52523755
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  52523684 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcattcgatatt 52523755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737261
Alignment:
Q  238 atttgatattattaagtcatgttgtttt----gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17737261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 23083371 - 23083454
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23083371 ttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 151
Target Start/End: Original strand, 39728092 - 39728125
Alignment:
Q  118 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39728092 tgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 39728125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 3472734 - 3472778
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3472734 gatgtgctatttaaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 3472778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3476021 - 3475977
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3476021 gatgtgttatataaagatgtatgatttaaagatgtgttatataaa 3475977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Original strand, 18539094 - 18539138
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18539094 gatgtgttatataaagatgtgtgatttaaagatgtgttatgtaaa 18539138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 20360 - 20515
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20360 atgatttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 20457  T
Q  253 gtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20458 gtcatgttgttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 128861 - 128825
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  128861 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 128825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20926 - 20772
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20926 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20828  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20827 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38000 - 37846
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38000 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 37902  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37901 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 37846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 94590 - 94436
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  94590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 94492  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94491 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 94436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 17423 - 17577
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17423 atttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17521  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17522 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 17577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44479
Alignment:
Q  176 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt--gtatactg 273  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg 44516  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158587
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 158531  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  158532 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 158587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 339960 - 340040
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  339960 ttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagt 340040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18809122 - 18808968
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18809122 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18809024  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18809023 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18808968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 23709515 - 23709669
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23709515 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23709613  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23709614 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23709669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 23711996 - 23712150
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23711996 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23712094  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23712095 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23712150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24367953 - 24367799
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24367953 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24367855  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24367854 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24367799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39682492 - 39682338
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39682492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 39682394  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39682393 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 39682338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039634
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32039477 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 32039575  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgag 309  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32039576 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgag 32039634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 571576 - 571422
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  571576 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 571478  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  571477 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 571422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6726174 - 6726020
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6726174 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtc 6726076  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6726075 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 6726020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 21155043 - 21155197
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  21155043 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtc 21155141  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21155142 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21155197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23131041 - 23130887
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23131041 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23130943  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23130942 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23130887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23133508 - 23133354
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23133508 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23133410  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23133409 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 34402505 - 34402659
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34402505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34402603  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34402604 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34402659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43137483 - 43137324
Alignment:
Q  151 atatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43137483 atatgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatt 43137385  T
Q  251 aagtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | ||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43137384 atgtcatgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 43137324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23135769 - 23135615
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23135769 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23135671  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23135670 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23135615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 24898178 - 24898333
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24898178 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24898276  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24898277 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24898333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 24900661 - 24900816
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24900661 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24900759  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24900760 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24900816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 24903138 - 24903293
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24903138 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24903236  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24903237 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24903293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 24905615 - 24905770
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24905615 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24905713  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24905714 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24905770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 24908090 - 24908245
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24908090 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24908188  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24908189 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24908245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38967535 - 38967399
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg-ttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||| ||    
T  38967535 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattg 38967436  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967435 ttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagt 38967399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26505558 - 26505404
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26505558 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26505460  T
Q  256 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26505459 atgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26505404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26508036 - 26507882
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26508036 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26507938  T
Q  256 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26507937 atgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26507882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28577278 - 28577124
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  28577278 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttggcttgcatttgatattattatatc 28577180  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28577179 atgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 28577124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 32214904 - 32215058
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32214904 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 32215002  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32215003 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 32215058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 45029837 - 45029991
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45029837 atttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 45029935  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45029936 atgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 45029991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22105592 - 22105437
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22105592 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22105494  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || ||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22105493 atgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22105437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529666
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttg-ttaacttgcacttgatattatta 24529606  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24529607 tgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagt 24529666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 24642835 - 24642933
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24642835 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 7690 - 7787
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  7690 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671858
Alignment:
Q  158 ttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcat 257  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  258 gttgttttgtatactg-ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | ||||||| ||||||  | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  19671912 gatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 19671858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23060677 - 23060541
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23060677 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 23060579  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23060578 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 210
Target Start/End: Original strand, 22173808 - 22173866
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22173808 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgt 22173866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 23708576 - 23708712
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| || || ||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||     
T  23708576 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcga-tgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgc 23708674  T
Q  274 ttgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  23708675 ctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagt 23708712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38207
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 38207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23076553 - 23076470
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076553 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22337279 - 22337143
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttg-tatactg 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |    
T  22337279 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacag 22337181  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22337180 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 310
Target Start/End: Original strand, 24643039 - 24643087
Alignment:
Q  262 ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24643039 ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24643087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 244
Target Start/End: Original strand, 22459519 - 22459587
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgat 244  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  22459519 tgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttga-tgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16092657 - 16092613
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16092657 gatgtgttatttgaagatgtttgatttaaagatgtgttatataaa 16092613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Original strand, 27401588 - 27401631
Alignment:
Q  108 atgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27401588 atgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgtcatataaa 27401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Original strand, 22731249 - 22731327
Alignment:
Q  234 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22731249 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37379766 - 37379729
Alignment:
Q  118 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 155  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37379766 tgaagatgtatgatttaaagatgtgttatataaatatg 37379729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4873 - 4719
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4873 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4775  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4774 atgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14126 - 13972
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14126 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14028  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14027 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagt 13972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 134390 - 134236
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  134390 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 134292  T
Q  256 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  134291 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 134236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 136859 - 136705
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  136859 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 136761  T
Q  256 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  136760 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 136705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 139328 - 139174
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  139328 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 139230  T
Q  256 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139229 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 139174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 144266 - 144112
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  144266 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 144168  T
Q  256 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  144167 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 144112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 141797 - 141643
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  141797 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 141699  T
Q  256 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  141698 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 141643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 161069 - 161227
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  161069 atgatttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattat 161168  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||  || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  161169 gtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagt 161227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 257
Target Start/End: Original strand, 164570 - 164674
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  164570 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattat 164669  T
Q  253 gtcat 257  Q
    |||||    
T  164670 gtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 135
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  289 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 191  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 306  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  190 tgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13417
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13571 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13473  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13472 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 1259 - 1418
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattatta 1358  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||  |||||   ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1359 tgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagt 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30114 - 29957
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  30114 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacacttgatattattat 30016  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30015 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9774
Alignment:
Q  155 gatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaag 253  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  9930 gatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatattattatg 9832  T
Q  254 tcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9831 tcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 9774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33105 - 32970
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  33105 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 33007  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  33006 ctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 32970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38866 - 38791
Alignment:
Q  234 ttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatga 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  38866 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatga 38791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10952 - 10798
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10952 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10854  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10853 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9267
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9421 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 9323  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9322 atgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4479 - 4322
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||     
T  4479 atgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttg-ttgatttgcaattgatattattat 4381  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4380 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 4322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79421
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  79264 atgatttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgaaattattat 79362  T
Q  253 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79363 gtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 79421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 17225 - 17310
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtca---tgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17225 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40579 - 40425
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40579 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 40481  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40480 atcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagt 40425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 82255 - 82097
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  82255 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 82157  T
Q  252 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  82156 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagt 82097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 310
Target Start/End: Original strand, 22630 - 22763
Alignment:
Q  177 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-t 275  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | | | || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||  ||||| || |||| ||||||| |    
T  22630 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtct 22727  T
Q  276 gtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22728 atgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12089
Alignment:
Q  152 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12241 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 12143  T
Q  252 agtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||      ||||||||||||||||||||    
T  12142 tgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagt 12089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11467 - 11313
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11467 atttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11369  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11368 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 11313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 306
Target Start/End: Original strand, 12232 - 12382
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 255  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  12232 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattttgtc 12330  T
Q  256 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 306  Q
    ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12331 atgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 12382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 116536 - 116455
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  116536 ttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 116455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 3108 - 3243
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3108 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 3206  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3207 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23046 - 22911
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  23046 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 22948  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22947 gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 38659 - 38795
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 274  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  38659 tgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgt 38757  T
Q  275 -tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| |||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  38758 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagt 38795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 53506 - 53603
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  53506 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 53603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13093
Alignment:
Q  178 tataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 251  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 13093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39640 - 39505
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  39640 tgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 39542  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39541 ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 39505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 75172 - 75307
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  75172 tgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 75270  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75271 ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 75307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 16610 - 16693
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16610 ttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 44717 - 44800
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44717 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26158
Alignment:
Q  217 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttg-ttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2015 - 1879
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2015 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 1917  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1916 tctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40076 - 39941
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||   ||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  40076 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgtt-attgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 39978  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  39977 ctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 39941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8494
Alignment:
Q  182 attgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtc 280  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||  | |||     
T  8623 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgtt 8525  T
Q  281 gctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||    
T  8524 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 8494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12115 - 12041
Alignment:
Q  153 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttg 227  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12115 atgatttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttg 12041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12044 - 11991
Alignment:
Q  258 gttgttttg-tatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12044 gttgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 32967 - 33049
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32967 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 33049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46038 - 45956
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  46038 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4536
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  4671 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 4573  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4572 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12253 - 12118
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  12253 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 12155  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12154 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22205 - 22070
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  22205 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 22107  T
Q  274 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22106 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13375 - 13239
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13375 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13277  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13276 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22720 - 22672
Alignment:
Q  105 ttgatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaata 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22720 ttgatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaata 22672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26059 - 25924
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||| ||||  | |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||     
T  26059 tgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgc 25961  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  25960 ctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 25924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40021 - 39886
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||| ||||  | |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||     
T  40021 tgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgc 39923  T
Q  274 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  39922 ctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 39886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13525
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3585
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 273  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  3487 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15556
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagt 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12731 - 12635
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  12731 tgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 12635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 107079 - 106985
Alignment:
Q  62 attatttgacaatgtgta-tttgtgagttatttgattatgt-atgttgatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatat 154  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  107079 attatttgactaagtgtaatttgtgagttatttgatgatgtgaaattgatgtgttatttgataatgtgtattttaaagatgtgttatataaatat 106985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 109144 - 109095
Alignment:
Q  105 ttgatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatat 154  Q
    |||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  109144 ttgatgtgttatttgataatgtgtattttaaagatgtgttatataaatat 109095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 225570 - 225474
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||    
T  225570 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgttttgcatactg 225474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11628 - 11492
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||     
T  11628 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgc 11530  T
Q  274 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  11529 ctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 11492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 16057 - 16153
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||  |||||| |||| |||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  16057 tgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttg-ttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatact 16153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13293 - 13195
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaat-aattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||   || ||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  13293 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 13195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 27706 - 27802
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact 272  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||| |||| |||| || ||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||    
T  27706 tgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttg-ttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatact 27802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 38213 - 38349
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||     
T  38213 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgc 38311  T
Q  274 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  38312 ctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 38349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1980
Alignment:
Q  188 tatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgt 285  Q
    ||||||||| |||||| || | | |||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgt 2005  T
Q  286 cgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  2004 tgttaattaactaagctgcatgagt 1980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4960 - 4877
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4960 ttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagt 4877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28525 - 28442
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28525 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 28442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 52024 - 51941
Alignment:
Q  229 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52024 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 51941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 167936 - 168071
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  167936 tgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 168033  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  168034 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 168071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 1006 - 1141
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  1006 tgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 1103  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1104 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 3204 - 3279
Alignment:
Q  237 catttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3204 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0281 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0281
Description:

Target: scaffold0281; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 995 - 948
Alignment:
Q  108 atgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 155  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  995 atgtgttatttaaagatgtgtgattcaaagatgtgttatataaatatg 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0281; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1060 - 997
Alignment:
Q  88 ttatttgattatgtatgttgatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    ||||||||  |||| | |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1060 ttatttgacgatgtgtattgatgtgctatttgaaaatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0281; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 906 - 862
Alignment:
Q  107 gatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  906 gatgtgttatttgcatatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27994 - 27912
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg 258  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27994 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32165 - 32095
Alignment:
Q  240 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 32095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 24259 - 24396
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgt--tttgtatact 272  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||    
T  24259 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatact 24357  T
Q  273 gt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
    |  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24358 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6126 - 6072
Alignment:
Q  156 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 210  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6126 atttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgt 6072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15589 - 15544
Alignment:
Q  106 tgatgtgttatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 151  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15589 tgatgtgctatttgaagatgtgtaatttaaagatgtgttatataaa 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3634 - 3498
Alignment:
Q  175 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 273  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  3634 tgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3536  T
Q  274 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 310  Q
      | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  3535 cctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University