View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4776_low_1 (Length: 508)

Name: NF4776_low_1
Description: NF4776
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4776_low_1
NF4776_low_1
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (31-500)||(10075-10544)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (31-500)||(32067-32536)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (31-500)||(701-1170)
[»] chr2 (145 HSPs)
chr2 (31-500)||(20309108-20309577)
chr2 (31-500)||(37765-38235)
chr2 (35-500)||(23285865-23286329)
chr2 (35-500)||(23654052-23654507)
chr2 (35-497)||(298457-298933)
chr2 (35-500)||(22737822-22738300)
chr2 (35-500)||(22730875-22731355)
chr2 (35-500)||(23076442-23076919)
chr2 (38-500)||(22337115-22337591)
chr2 (35-500)||(23660023-23660501)
chr2 (35-350)||(27753728-27754054)
chr2 (35-483)||(32451571-32452033)
chr2 (199-500)||(23060513-23060815)
chr2 (383-500)||(23103399-23103516)
chr2 (44-189)||(23071614-23071768)
chr2 (31-118)||(28291940-28292027)
chr2 (35-124)||(22133859-22133948)
chr2 (12-96)||(24658055-24658139)
chr2 (148-481)||(23708383-23708721)
chr2 (11-126)||(25963336-25963451)
chr2 (35-129)||(25176227-25176321)
chr2 (11-75)||(45677774-45677838)
chr2 (351-497)||(22105412-22105560)
chr2 (404-500)||(23071972-23072070)
chr2 (296-496)||(40622123-40622327)
chr2 (11-97)||(21917935-21918021)
chr2 (11-97)||(37525078-37525164)
chr2 (11-75)||(24674012-24674076)
chr2 (384-496)||(7679589-7679702)
chr2 (11-72)||(40621827-40621888)
chr2 (383-484)||(7735-7838)
chr2 (424-500)||(8946657-8946732)
chr2 (57-125)||(28406368-28406436)
chr2 (404-500)||(19671830-19671928)
chr2 (351-497)||(26505379-26505526)
chr2 (351-497)||(26507857-26508004)
chr2 (428-495)||(28405981-28406048)
chr2 (11-97)||(22811553-22811639)
chr2 (427-484)||(23207293-23207350)
chr2 (351-494)||(21155075-21155219)
chr2 (436-500)||(23040247-23040310)
chr2 (428-496)||(25175854-25175922)
chr2 (337-499)||(32214921-32215085)
chr2 (351-497)||(18808943-18809090)
chr2 (428-499)||(22134256-22134326)
chr2 (351-497)||(23130862-23131009)
chr2 (351-497)||(23133329-23133476)
chr2 (351-497)||(23135590-23135737)
chr2 (351-497)||(23709547-23709694)
chr2 (351-497)||(23712028-23712175)
chr2 (351-497)||(34402537-34402684)
chr2 (351-497)||(39682313-39682460)
chr2 (34-189)||(22460843-22460999)
chr2 (11-128)||(27263610-27263727)
chr2 (402-497)||(571397-571493)
chr2 (402-497)||(6725995-6726091)
chr2 (11-71)||(21327196-21327256)
chr2 (11-71)||(24175227-24175287)
chr2 (429-484)||(20520243-20520298)
chr2 (351-481)||(24367790-24367921)
chr2 (351-497)||(45029869-45030016)
chr2 (10-189)||(15477901-15478081)
chr2 (11-97)||(22798745-22798831)
chr2 (402-495)||(43137301-43137395)
chr2 (428-481)||(18786952-18787005)
chr2 (34-189)||(19928155-19928311)
chr2 (427-484)||(22413186-22413243)
chr2 (11-96)||(22740579-22740664)
chr2 (11-96)||(22758334-22758419)
chr2 (11-75)||(24654967-24655032)
chr2 (10-111)||(30970608-30970709)
chr2 (11-71)||(21318265-21318325)
chr2 (11-189)||(24716160-24716339)
chr2 (11-71)||(24870307-24870367)
chr2 (351-497)||(24898210-24898358)
chr2 (351-497)||(24900693-24900841)
chr2 (351-497)||(24903170-24903318)
chr2 (351-497)||(24905647-24905795)
chr2 (351-497)||(24908122-24908270)
chr2 (11-71)||(40428892-40428952)
chr2 (12-123)||(12829434-12829545)
chr2 (429-484)||(23004764-23004819)
chr2 (429-484)||(25108903-25108958)
chr2 (351-497)||(32039513-32039660)
chr2 (11-110)||(37318652-37318751)
chr2 (13-123)||(21138903-21139013)
chr2 (10-124)||(24503473-24503587)
chr2 (11-128)||(26125562-26125679)
chr2 (447-497)||(28577099-28577149)
chr2 (447-497)||(38967374-38967424)
chr2 (11-71)||(10327273-10327333)
chr2 (11-71)||(23187491-23187551)
chr2 (429-485)||(23287378-23287433)
chr2 (11-71)||(23598754-23598814)
chr2 (402-497)||(24529595-24529691)
chr2 (438-494)||(24643054-24643109)
chr2 (11-63)||(24735827-24735879)
chr2 (145-188)||(22133977-22134020)
chr2 (138-189)||(22740717-22740768)
chr2 (14-97)||(23019328-23019411)
chr2 (429-484)||(23791289-23791344)
chr2 (430-485)||(26392397-26392451)
chr2 (56-102)||(39827602-39827648)
chr2 (10-123)||(10101274-10101387)
chr2 (10-123)||(21146918-21147031)
chr2 (381-473)||(22799126-22799220)
chr2 (51-124)||(23207744-23207817)
chr2 (10-111)||(24640590-24640691)
chr2 (381-481)||(25616204-25616306)
chr2 (34-71)||(41667365-41667402)
chr2 (11-71)||(61231-61291)
chr2 (12-124)||(27197248-27197360)
chr2 (10-98)||(27602186-27602274)
chr2 (154-189)||(12901286-12901321)
chr2 (30-125)||(18786445-18786540)
chr2 (47-98)||(19672318-19672369)
chr2 (51-126)||(22412717-22412792)
chr2 (35-78)||(23038468-23038511)
chr2 (35-78)||(23100873-23100916)
chr2 (65-112)||(23171413-23171460)
chr2 (65-112)||(23582670-23582717)
chr2 (35-102)||(23708261-23708328)
chr2 (154-189)||(24628252-24628287)
chr2 (154-189)||(24649654-24649689)
chr2 (429-484)||(24697657-24697712)
chr2 (154-189)||(27379206-27379241)
chr2 (154-189)||(27383252-27383287)
chr2 (154-189)||(27602094-27602129)
chr2 (154-189)||(41530783-41530818)
chr2 (56-98)||(23005221-23005263)
chr2 (381-427)||(23019706-23019752)
chr2 (148-186)||(28406297-28406335)
chr2 (34-112)||(29233904-29233982)
chr2 (34-112)||(29347203-29347281)
chr2 (56-98)||(34137412-34137454)
chr2 (41-98)||(18546536-18546593)
chr2 (10-71)||(24628107-24628168)
chr2 (147-188)||(25176158-25176199)
chr2 (41-110)||(41604391-41604460)
chr2 (41-110)||(41610288-41610357)
chr2 (45-78)||(44369952-44369985)
chr2 (10-98)||(12901141-12901229)
chr2 (35-63)||(18855115-18855143)
chr2 (419-479)||(23038048-23038107)
chr2 (153-189)||(31756232-31756268)
[»] chr7 (186 HSPs)
chr7 (31-498)||(40443393-40443860)
chr7 (31-500)||(27847482-27847951)
chr7 (30-500)||(16385895-16386369)
chr7 (35-500)||(9509189-9509668)
chr7 (35-500)||(12698831-12699311)
chr7 (30-500)||(26211995-26212469)
chr7 (35-500)||(38227481-38227959)
chr7 (155-500)||(10589039-10589386)
chr7 (35-497)||(3564006-3564482)
chr7 (42-481)||(15143686-15144139)
chr7 (288-497)||(18456319-18456530)
chr7 (35-497)||(17061602-17062077)
chr7 (33-128)||(15754527-15754622)
chr7 (30-189)||(28504938-28505106)
chr7 (35-193)||(44116816-44116983)
chr7 (35-190)||(12756359-12756523)
chr7 (35-189)||(2831948-2832110)
chr7 (35-128)||(9751192-9751285)
chr7 (35-185)||(39267288-39267447)
chr7 (35-128)||(18302564-18302657)
chr7 (31-125)||(34201172-34201266)
chr7 (404-500)||(16495402-16495500)
chr7 (404-500)||(28505321-28505419)
chr7 (404-500)||(34200786-34200884)
chr7 (351-500)||(13647325-13647476)
chr7 (35-128)||(44014560-44014653)
chr7 (31-103)||(11995696-11995768)
chr7 (11-97)||(17137682-17137768)
chr7 (35-128)||(810771-810864)
chr7 (331-497)||(16213684-16213852)
chr7 (296-496)||(17137978-17138177)
chr7 (11-96)||(10508701-10508786)
chr7 (428-500)||(67745-67817)
chr7 (35-129)||(68131-68225)
chr7 (11-97)||(2760542-2760628)
chr7 (11-97)||(3272202-3272288)
chr7 (405-500)||(11996051-11996148)
chr7 (35-129)||(47832193-47832287)
chr7 (11-96)||(11880668-11880753)
chr7 (11-96)||(12187429-12187514)
chr7 (11-75)||(9703703-9703767)
chr7 (11-75)||(14430315-14430379)
chr7 (12-96)||(15211844-15211928)
chr7 (381-500)||(16219717-16219835)
chr7 (35-103)||(18006052-18006120)
chr7 (296-496)||(12187019-12187218)
chr7 (383-497)||(48273392-48273508)
chr7 (11-97)||(12321361-12321447)
chr7 (35-129)||(16324391-16324485)
chr7 (351-497)||(24704688-24704832)
chr7 (428-496)||(811180-811248)
chr7 (428-496)||(18005650-18005718)
chr7 (428-496)||(44014182-44014250)
chr7 (428-500)||(47831807-47831879)
chr7 (30-129)||(9389332-9389431)
chr7 (404-500)||(15754910-15755008)
chr7 (351-497)||(24702238-24702385)
chr7 (35-129)||(16219358-16219452)
chr7 (351-500)||(18430709-18430859)
chr7 (383-481)||(2280121-2280221)
chr7 (11-189)||(26292692-26292871)
chr7 (11-71)||(15581108-15581168)
chr7 (402-497)||(44116509-44116605)
chr7 (351-497)||(456321-456468)
chr7 (351-497)||(11972496-11972643)
chr7 (351-497)||(14949137-14949284)
chr7 (351-497)||(15376728-15376875)
chr7 (383-481)||(16056347-16056446)
chr7 (351-497)||(16232520-16232667)
chr7 (351-497)||(18640272-18640419)
chr7 (351-497)||(20385138-20385285)
chr7 (351-497)||(21189610-21189757)
chr7 (351-481)||(24275187-24275318)
chr7 (351-497)||(32125491-32125638)
chr7 (351-497)||(41522917-41523064)
chr7 (351-497)||(41525379-41525526)
chr7 (382-447)||(2530139-2530205)
chr7 (351-496)||(11393302-11393448)
chr7 (47-129)||(22073301-22073383)
chr7 (10-123)||(4318174-4318287)
chr7 (56-129)||(12255454-12255527)
chr7 (11-71)||(11313064-11313124)
chr7 (11-71)||(12318543-12318603)
chr7 (11-71)||(13635099-13635159)
chr7 (11-71)||(15604902-15604962)
chr7 (402-497)||(16410059-16410155)
chr7 (432-500)||(22072913-22072981)
chr7 (404-500)||(10063841-10063939)
chr7 (351-497)||(27216860-27217007)
chr7 (34-189)||(13149451-13149607)
chr7 (30-96)||(24054884-24054950)
chr7 (10-124)||(44407988-44408102)
chr7 (56-125)||(2279781-2279850)
chr7 (10-111)||(6016800-6016901)
chr7 (424-481)||(12901342-12901399)
chr7 (11-71)||(9445788-9445848)
chr7 (402-497)||(13869346-13869442)
chr7 (429-481)||(14044765-14044817)
chr7 (429-481)||(14354795-14354847)
chr7 (11-71)||(17701275-17701335)
chr7 (45-129)||(21064814-21064898)
chr7 (11-71)||(42205530-42205590)
chr7 (47-98)||(2529631-2529682)
chr7 (438-497)||(3386333-3386391)
chr7 (12-71)||(16583650-16583709)
chr7 (35-78)||(18154479-18154522)
chr7 (404-500)||(19486767-19486865)
chr7 (35-78)||(19649127-19649170)
chr7 (429-484)||(20220238-20220293)
chr7 (427-481)||(1868043-1868097)
chr7 (34-189)||(6801509-6801665)
chr7 (428-478)||(12255842-12255892)
chr7 (10-124)||(14953560-14953674)
chr7 (419-481)||(18154882-18154943)
chr7 (447-497)||(20110556-20110606)
chr7 (41-123)||(20702651-20702733)
chr7 (10-124)||(26420340-26420454)
chr7 (41-123)||(32768038-32768120)
chr7 (34-71)||(8917842-8917879)
chr7 (34-71)||(13462177-13462214)
chr7 (405-497)||(13831373-13831466)
chr7 (39-124)||(14959526-14959611)
chr7 (427-484)||(15008547-15008604)
chr7 (427-484)||(48991196-48991253)
chr7 (148-216)||(16056616-16056684)
chr7 (11-71)||(16724261-16724321)
chr7 (11-71)||(35152021-35152081)
chr7 (429-472)||(14036282-14036325)
chr7 (429-472)||(14346312-14346355)
chr7 (34-128)||(16275850-16275944)
chr7 (150-189)||(18302494-18302533)
chr7 (148-190)||(810894-810936)
chr7 (34-128)||(9593704-9593798)
chr7 (34-128)||(9644667-9644761)
chr7 (47-129)||(16056713-16056795)
chr7 (34-189)||(16438687-16438843)
chr7 (34-71)||(11043-11080)
chr7 (34-71)||(18711-18748)
chr7 (67-124)||(11547953-11548010)
chr7 (67-124)||(11554549-11554606)
chr7 (34-71)||(11987628-11987665)
chr7 (57-126)||(14045212-14045281)
chr7 (39-124)||(14148932-14149017)
chr7 (57-126)||(14355242-14355311)
chr7 (47-112)||(14655082-14655147)
chr7 (34-71)||(15728740-15728777)
chr7 (11-96)||(20569226-20569311)
chr7 (148-197)||(22073223-22073272)
chr7 (47-123)||(70431-70507)
chr7 (47-123)||(74539-74615)
chr7 (10-110)||(9410321-9410421)
chr7 (150-189)||(9389462-9389501)
chr7 (150-189)||(9751316-9751355)
chr7 (65-112)||(11238655-11238702)
chr7 (150-189)||(11995796-11995835)
chr7 (65-124)||(12692858-12692917)
chr7 (154-189)||(12718966-12719001)
chr7 (154-189)||(12723877-12723912)
chr7 (67-126)||(12901793-12901852)
chr7 (394-496)||(14932747-14932851)
chr7 (394-496)||(15356182-15356286)
chr7 (394-496)||(15360296-15360400)
chr7 (154-189)||(16906974-16907009)
chr7 (47-122)||(17017045-17017120)
chr7 (138-189)||(17137820-17137871)
chr7 (154-189)||(18279701-18279736)
chr7 (154-189)||(18283664-18283699)
chr7 (150-189)||(34201099-34201138)
chr7 (41-123)||(33471-33553)
chr7 (151-189)||(68061-68099)
chr7 (56-122)||(9177252-9177318)
chr7 (431-485)||(9177718-9177772)
chr7 (66-124)||(11262691-11262749)
chr7 (56-98)||(11768526-11768568)
chr7 (148-190)||(12255556-12255598)
chr7 (51-97)||(15008102-15008148)
chr7 (66-124)||(25038895-25038953)
chr7 (447-481)||(38898489-38898523)
chr7 (57-126)||(1867650-1867719)
chr7 (10-111)||(7536561-7536662)
chr7 (66-123)||(18531608-18531665)
chr7 (34-71)||(18557387-18557424)
chr7 (447-496)||(19649557-19649606)
chr7 (148-189)||(44014489-44014530)
chr7 (11-71)||(48593085-48593146)
chr7 (447-499)||(2832509-2832561)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (31-500)||(15114-15584)
scaffold0114 (332-496)||(7295-7459)
scaffold0114 (12-96)||(7705-7789)
scaffold0114 (31-85)||(32914-32968)
[»] chr4 (165 HSPs)
chr4 (31-500)||(14052951-14053422)
chr4 (35-500)||(12902757-12903224)
chr4 (35-500)||(7088877-7089345)
chr4 (35-500)||(44052829-44053308)
chr4 (35-374)||(3096772-3097111)
chr4 (35-498)||(22636437-22636913)
chr4 (11-364)||(17047702-17048055)
chr4 (35-497)||(16377164-16377639)
chr4 (35-495)||(14038653-14039128)
chr4 (263-500)||(17046487-17046724)
chr4 (148-493)||(23374125-23374473)
chr4 (131-500)||(7893703-7894073)
chr4 (177-500)||(16239764-16240090)
chr4 (35-306)||(15091093-15091376)
chr4 (35-233)||(7798967-7799176)
chr4 (35-497)||(44928565-44929042)
chr4 (291-500)||(16270145-16270356)
chr4 (319-500)||(7798774-7798958)
chr4 (31-128)||(15552199-15552296)
chr4 (26-128)||(16597031-16597133)
chr4 (35-194)||(44102520-44102688)
chr4 (35-128)||(6190819-6190912)
chr4 (35-189)||(24029057-24029220)
chr4 (35-189)||(13812451-13812614)
chr4 (35-128)||(20156932-20157025)
chr4 (35-128)||(22633855-22633948)
chr4 (183-483)||(6190479-6190782)
chr4 (331-500)||(6899891-6900062)
chr4 (35-128)||(16239634-16239728)
chr4 (381-500)||(52873367-52873488)
chr4 (404-500)||(15551817-15551915)
chr4 (35-190)||(21814945-21815109)
chr4 (35-190)||(21815274-21815438)
chr4 (35-190)||(21818367-21818531)
chr4 (35-127)||(12774385-12774477)
chr4 (11-97)||(16356572-16356658)
chr4 (419-500)||(3096293-3096373)
chr4 (35-128)||(8846761-8846854)
chr4 (351-498)||(22353835-22353984)
chr4 (35-129)||(39705930-39706024)
chr4 (331-484)||(13800-13956)
chr4 (11-75)||(16348311-16348375)
chr4 (11-97)||(15121422-15121508)
chr4 (11-96)||(44676047-44676132)
chr4 (428-496)||(12774011-12774079)
chr4 (11-75)||(13569948-13570012)
chr4 (328-496)||(15121749-15121917)
chr4 (428-500)||(39706337-39706409)
chr4 (383-497)||(14280316-14280431)
chr4 (56-481)||(52242856-52243298)
chr4 (11-97)||(15094187-15094273)
chr4 (328-447)||(43256106-43256227)
chr4 (428-481)||(12288259-12288312)
chr4 (11-96)||(23843894-23843979)
chr4 (11-75)||(12570457-12570521)
chr4 (30-129)||(15099735-15099834)
chr4 (351-497)||(18215289-18215436)
chr4 (383-497)||(54798756-54798872)
chr4 (11-97)||(16487697-16487783)
chr4 (337-497)||(23803265-23803427)
chr4 (47-129)||(43198242-43198324)
chr4 (428-496)||(8846360-8846428)
chr4 (35-103)||(13844950-13845018)
chr4 (337-503)||(19242693-19242861)
chr4 (337-499)||(19618172-19618336)
chr4 (11-71)||(36133592-36133652)
chr4 (351-497)||(12322-12469)
chr4 (351-497)||(15118367-15118514)
chr4 (47-126)||(15868289-15868368)
chr4 (65-112)||(17046718-17046765)
chr4 (37-189)||(19757257-19757410)
chr4 (37-189)||(19782396-19782549)
chr4 (351-497)||(44615288-44615435)
chr4 (351-497)||(52312510-52312657)
chr4 (14-189)||(2015075-2015251)
chr4 (337-497)||(3515007-3515169)
chr4 (10-189)||(9556827-9557007)
chr4 (435-481)||(43198611-43198657)
chr4 (337-497)||(51463868-51464030)
chr4 (10-123)||(7900800-7900913)
chr4 (383-481)||(8574871-8574969)
chr4 (36-129)||(15190702-15190795)
chr4 (11-189)||(16243030-16243209)
chr4 (427-484)||(46640504-46640561)
chr4 (30-126)||(13410-13506)
chr4 (331-497)||(1837503-1837671)
chr4 (11-71)||(11250191-11250251)
chr4 (11-71)||(16351478-16351538)
chr4 (402-497)||(44773153-44773249)
chr4 (351-497)||(18239434-18239581)
chr4 (351-497)||(50222354-50222501)
chr4 (429-484)||(53082202-53082257)
chr4 (10-124)||(14679325-14679439)
chr4 (10-124)||(35614301-35614415)
chr4 (39-124)||(14685534-14685619)
chr4 (10-123)||(15321723-15321836)
chr4 (56-125)||(15464592-15464661)
chr4 (10-123)||(51493447-51493560)
chr4 (10-111)||(53433753-53433854)
chr4 (11-71)||(3413212-3413272)
chr4 (337-497)||(12610950-12611105)
chr4 (402-481)||(15355391-15355471)
chr4 (10-110)||(16956279-16956379)
chr4 (34-186)||(26243318-26243471)
chr4 (11-189)||(1951391-1951570)
chr4 (438-497)||(7641286-7641344)
chr4 (402-500)||(15367690-15367789)
chr4 (402-500)||(15370018-15370117)
chr4 (402-500)||(15371202-15371301)
chr4 (402-500)||(15373483-15373582)
chr4 (402-500)||(15402703-15402802)
chr4 (41-124)||(40471837-40471920)
chr4 (148-190)||(12774313-12774355)
chr4 (11-69)||(16678219-16678277)
chr4 (34-189)||(18222031-18222187)
chr4 (10-124)||(23838796-23838910)
chr4 (10-128)||(27534384-27534502)
chr4 (47-97)||(32851868-32851918)
chr4 (41-123)||(40478511-40478593)
chr4 (447-497)||(44102214-44102264)
chr4 (11-96)||(15124773-15124858)
chr4 (447-500)||(16223532-16223585)
chr4 (34-71)||(18602398-18602435)
chr4 (34-71)||(18608992-18609029)
chr4 (14-71)||(25555932-25555989)
chr4 (11-71)||(14708264-14708324)
chr4 (11-71)||(15352936-15352996)
chr4 (11-71)||(18237308-18237368)
chr4 (16-123)||(385989-386096)
chr4 (150-189)||(3332201-3332240)
chr4 (337-481)||(14970707-14970853)
chr4 (34-189)||(17152140-17152296)
chr4 (151-189)||(22633980-22634018)
chr4 (41-123)||(26284568-26284650)
chr4 (34-189)||(45938444-45938600)
chr4 (10-111)||(9271733-9271834)
chr4 (148-189)||(15099665-15099706)
chr4 (152-189)||(15552129-15552166)
chr4 (404-462)||(16596686-16596746)
chr4 (34-71)||(23139686-23139723)
chr4 (34-71)||(28569097-28569134)
chr4 (34-71)||(43255813-43255850)
chr4 (148-257)||(15464694-15464805)
chr4 (31-63)||(17053482-17053514)
chr4 (11-71)||(42997080-42997140)
chr4 (154-189)||(4561107-4561142)
chr4 (154-189)||(5756711-5756746)
chr4 (51-126)||(12287791-12287866)
chr4 (150-189)||(20157056-20157095)
chr4 (449-484)||(21815699-21815734)
chr4 (154-189)||(33742675-33742710)
chr4 (65-123)||(6873060-6873118)
chr4 (66-124)||(12522447-12522505)
chr4 (34-112)||(14268111-14268189)
chr4 (41-123)||(14757082-14757164)
chr4 (41-123)||(17810636-17810718)
chr4 (34-128)||(18228528-18228622)
chr4 (56-98)||(32306582-32306624)
chr4 (70-124)||(35170991-35171045)
chr4 (66-124)||(41385430-41385488)
chr4 (148-189)||(8846689-8846730)
chr4 (51-128)||(53081755-53081832)
chr4 (35-71)||(9530849-9530885)
chr4 (429-485)||(17333292-17333347)
chr4 (148-188)||(39706052-39706092)
[»] chr8 (152 HSPs)
chr8 (31-500)||(16199296-16199765)
chr8 (34-500)||(31971257-31971724)
chr8 (31-500)||(45130669-45131117)
chr8 (35-500)||(21918652-21919121)
chr8 (35-500)||(18878879-18879352)
chr8 (35-500)||(20536208-20536687)
chr8 (35-500)||(18818052-18818530)
chr8 (12-364)||(25362770-25363123)
chr8 (35-500)||(21923570-21924049)
chr8 (35-500)||(22626736-22627214)
chr8 (35-500)||(23406379-23406860)
chr8 (35-499)||(28648686-28649164)
chr8 (35-503)||(6759255-6759736)
chr8 (34-499)||(23648554-23649033)
chr8 (35-500)||(16091983-16092463)
chr8 (35-500)||(7372778-7373228)
chr8 (35-500)||(22875065-22875544)
chr8 (287-500)||(21389358-21389571)
chr8 (287-500)||(21395888-21396101)
chr8 (287-500)||(21790381-21790594)
chr8 (300-500)||(21778697-21778897)
chr8 (35-497)||(41598188-41598663)
chr8 (31-189)||(5865915-5866082)
chr8 (30-125)||(17141302-17141397)
chr8 (33-128)||(21255605-21255700)
chr8 (33-128)||(21249767-21249862)
chr8 (30-124)||(21491382-21491476)
chr8 (404-500)||(5866297-5866395)
chr8 (404-500)||(17140916-17141014)
chr8 (405-500)||(21490995-21491092)
chr8 (11-97)||(22010298-22010384)
chr8 (35-128)||(21674091-21674184)
chr8 (11-75)||(20465658-20465722)
chr8 (384-500)||(6520368-6520486)
chr8 (11-97)||(15602636-15602722)
chr8 (11-97)||(15611088-15611174)
chr8 (35-129)||(19801069-19801163)
chr8 (35-128)||(26355340-26355433)
chr8 (11-75)||(377714-377778)
chr8 (428-500)||(38855300-38855372)
chr8 (14-96)||(19899510-19899592)
chr8 (428-500)||(23760893-23760962)
chr8 (11-97)||(30642910-30642996)
chr8 (35-129)||(38854893-38854987)
chr8 (11-96)||(16185143-16185228)
chr8 (11-96)||(17353556-17353641)
chr8 (11-126)||(21168340-21168455)
chr8 (12-126)||(16409875-16409989)
chr8 (11-97)||(16860956-16861042)
chr8 (11-124)||(16411888-16412001)
chr8 (12-97)||(21161735-21161820)
chr8 (383-481)||(21285616-21285716)
chr8 (11-75)||(23776452-23776517)
chr8 (404-500)||(21249384-21249483)
chr8 (404-500)||(21255222-21255321)
chr8 (351-497)||(14409459-14409606)
chr8 (30-129)||(39834217-39834316)
chr8 (337-481)||(16413316-16413462)
chr8 (428-481)||(983455-983508)
chr8 (31-96)||(21389091-21389156)
chr8 (35-103)||(6520779-6520847)
chr8 (404-493)||(13508108-13508199)
chr8 (11-96)||(19983508-19983595)
chr8 (402-497)||(20046261-20046357)
chr8 (383-484)||(20498578-20498681)
chr8 (11-71)||(22028973-22029033)
chr8 (11-75)||(24756157-24756221)
chr8 (428-496)||(26355747-26355815)
chr8 (351-497)||(1484402-1484549)
chr8 (351-497)||(5853307-5853454)
chr8 (404-500)||(17612133-17612231)
chr8 (351-497)||(20403227-20403374)
chr8 (30-125)||(20499049-20499144)
chr8 (351-497)||(22001753-22001900)
chr8 (429-484)||(24353036-24353091)
chr8 (429-484)||(37116363-37116418)
chr8 (35-129)||(23760482-23760576)
chr8 (427-484)||(19154935-19154992)
chr8 (11-96)||(19259221-19259305)
chr8 (11-96)||(19976860-19976947)
chr8 (11-75)||(20856044-20856108)
chr8 (11-67)||(22057768-22057824)
chr8 (429-484)||(17267044-17267099)
chr8 (35-122)||(21414869-21414956)
chr8 (12-71)||(23252393-23252452)
chr8 (10-111)||(26934805-26934906)
chr8 (404-493)||(13597640-13597731)
chr8 (402-497)||(15203297-15203393)
chr8 (11-97)||(17926333-17926412)
chr8 (11-71)||(18619894-18619954)
chr8 (40-96)||(21395630-21395686)
chr8 (40-96)||(21790123-21790179)
chr8 (11-71)||(22045274-22045334)
chr8 (10-110)||(23845412-23845512)
chr8 (11-71)||(39094571-39094631)
chr8 (351-497)||(4483281-4483427)
chr8 (438-497)||(4542477-4542535)
chr8 (429-484)||(17439557-17439612)
chr8 (438-497)||(19896265-19896323)
chr8 (47-97)||(13507663-13507713)
chr8 (47-97)||(13597195-13597245)
chr8 (381-498)||(18678102-18678221)
chr8 (10-124)||(20527812-20527926)
chr8 (34-128)||(23834532-23834626)
chr8 (34-189)||(24433890-24434046)
chr8 (447-497)||(26225359-26225409)
chr8 (41-123)||(29123449-29123531)
chr8 (10-111)||(3216637-3216738)
chr8 (402-484)||(19801448-19801530)
chr8 (432-481)||(21673723-21673772)
chr8 (383-481)||(26219733-26219831)
chr8 (402-481)||(15070574-15070654)
chr8 (447-503)||(19937118-19937174)
chr8 (11-71)||(30308384-30308444)
chr8 (402-481)||(45290761-45290841)
chr8 (12-71)||(32599094-32599153)
chr8 (12-71)||(32605626-32605685)
chr8 (47-125)||(982980-983058)
chr8 (34-189)||(15538745-15538901)
chr8 (65-123)||(18865695-18865753)
chr8 (34-189)||(22113381-22113537)
chr8 (34-189)||(22134884-22135040)
chr8 (381-498)||(32121734-32121853)
chr8 (34-71)||(15532304-15532341)
chr8 (152-189)||(17141229-17141266)
chr8 (51-124)||(17266574-17266647)
chr8 (152-189)||(21249697-21249734)
chr8 (34-71)||(22166034-22166071)
chr8 (56-125)||(37116813-37116882)
chr8 (148-189)||(39834147-39834188)
chr8 (11-71)||(16231105-16231165)
chr8 (11-71)||(17055019-17055079)
chr8 (41-112)||(19111601-19111672)
chr8 (41-112)||(19117892-19117963)
chr8 (51-126)||(24353488-24353563)
chr8 (154-189)||(43252110-43252145)
chr8 (64-98)||(17085770-17085804)
chr8 (418-496)||(17353983-17354060)
chr8 (65-123)||(18855300-18855358)
chr8 (431-485)||(20502154-20502207)
chr8 (447-497)||(25484380-25484430)
chr8 (34-71)||(17828236-17828273)
chr8 (152-189)||(21255535-21255572)
chr8 (34-63)||(23844567-23844596)
chr8 (47-83)||(21286652-21286688)
chr8 (148-188)||(21674021-21674061)
chr8 (149-189)||(21972353-21972393)
chr8 (149-189)||(21976438-21976478)
chr8 (429-485)||(22525573-22525628)
chr8 (149-189)||(37116664-37116704)
chr8 (148-188)||(38855015-38855055)
chr8 (56-124)||(40492438-40492506)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (31-500)||(13497-13967)
[»] chr5 (173 HSPs)
chr5 (31-500)||(21292619-21293090)
chr5 (34-500)||(8286494-8286964)
chr5 (35-500)||(22075018-22075487)
chr5 (35-500)||(23390138-23390617)
chr5 (35-500)||(24493569-24494047)
chr5 (35-500)||(13095495-13095973)
chr5 (35-500)||(25421532-25422011)
chr5 (35-497)||(24529223-24529700)
chr5 (35-500)||(13025311-13025789)
chr5 (11-365)||(22107002-22107357)
chr5 (35-500)||(9077952-9078431)
chr5 (35-480)||(25431414-25431873)
chr5 (35-500)||(1096467-1096946)
chr5 (35-364)||(21985789-21986130)
chr5 (35-196)||(11580887-11581058)
chr5 (336-500)||(21808343-21808510)
chr5 (350-500)||(21729033-21729185)
chr5 (11-189)||(22119811-22119998)
chr5 (35-497)||(36154470-36154942)
chr5 (30-128)||(19660474-19660572)
chr5 (383-493)||(37723910-37724020)
chr5 (35-128)||(21871213-21871306)
chr5 (35-128)||(21875493-21875586)
chr5 (35-128)||(21565930-21566023)
chr5 (39-189)||(24766983-24767142)
chr5 (35-127)||(22959175-22959267)
chr5 (402-500)||(21997555-21997655)
chr5 (404-500)||(36314577-36314675)
chr5 (428-500)||(19660884-19660956)
chr5 (384-500)||(21329500-21329618)
chr5 (56-484)||(22144065-22144508)
chr5 (35-128)||(19669286-19669379)
chr5 (12-97)||(21366286-21366371)
chr5 (384-484)||(20026942-20027046)
chr5 (296-496)||(22032323-22032520)
chr5 (296-496)||(18769919-18770118)
chr5 (11-97)||(20805961-20806047)
chr5 (11-96)||(18769623-18769708)
chr5 (11-96)||(21887239-21887324)
chr5 (11-96)||(22032731-22032816)
chr5 (11-96)||(23201784-23201869)
chr5 (428-496)||(22959581-22959649)
chr5 (14-97)||(23512521-23512604)
chr5 (35-129)||(21329137-21329231)
chr5 (35-129)||(21498659-21498753)
chr5 (385-496)||(21565546-21565659)
chr5 (328-447)||(18356367-18356488)
chr5 (11-75)||(14079584-14079648)
chr5 (428-500)||(21502205-21502277)
chr5 (328-400)||(23572180-23572252)
chr5 (288-497)||(22412187-22412388)
chr5 (351-497)||(29329934-29330081)
chr5 (12-75)||(31342539-31342602)
chr5 (402-481)||(26012056-26012137)
chr5 (402-497)||(11581265-11581361)
chr5 (11-75)||(17918781-17918845)
chr5 (11-71)||(22760081-22760141)
chr5 (12-96)||(37724319-37724403)
chr5 (351-497)||(264783-264930)
chr5 (351-497)||(10732955-10733102)
chr5 (351-497)||(20909012-20909159)
chr5 (11-78)||(23500964-23501031)
chr5 (351-497)||(39363384-39363531)
chr5 (11-97)||(12028195-12028281)
chr5 (328-447)||(20910745-20910866)
chr5 (34-189)||(21340420-21340576)
chr5 (34-189)||(26665784-26665940)
chr5 (34-189)||(26937381-26937537)
chr5 (288-481)||(18418599-18418793)
chr5 (11-60)||(23572510-23572559)
chr5 (11-71)||(1858606-1858666)
chr5 (428-500)||(19668898-19668970)
chr5 (402-481)||(20902075-20902155)
chr5 (11-71)||(24222304-24222364)
chr5 (402-497)||(39245136-39245232)
chr5 (30-129)||(5888812-5888911)
chr5 (351-497)||(42245380-42245527)
chr5 (34-189)||(16674449-16674605)
chr5 (34-189)||(18356624-18356780)
chr5 (34-189)||(23535242-23535398)
chr5 (34-189)||(24532701-24532857)
chr5 (427-484)||(22178269-22178326)
chr5 (10-123)||(25406789-25406902)
chr5 (402-497)||(2154680-2154776)
chr5 (10-110)||(25808115-25808215)
chr5 (11-71)||(26742376-26742436)
chr5 (438-497)||(20918052-20918110)
chr5 (30-129)||(21741180-21741279)
chr5 (351-497)||(29345980-29346127)
chr5 (41-123)||(17284430-17284512)
chr5 (10-124)||(21294892-21295006)
chr5 (11-97)||(26680980-26681066)
chr5 (11-97)||(26952587-26952673)
chr5 (34-128)||(33409565-33409659)
chr5 (447-497)||(38619434-38619484)
chr5 (10-123)||(15441583-15441696)
chr5 (11-60)||(17410874-17410923)
chr5 (402-494)||(18319100-18319193)
chr5 (10-123)||(22133362-22133475)
chr5 (10-123)||(22140054-22140167)
chr5 (10-123)||(22325555-22325668)
chr5 (447-496)||(23064512-23064561)
chr5 (449-497)||(10775790-10775838)
chr5 (10-122)||(22588459-22588571)
chr5 (11-71)||(25229036-25229096)
chr5 (11-71)||(25293192-25293252)
chr5 (402-497)||(31061068-31061164)
chr5 (59-123)||(41294112-41294176)
chr5 (33-124)||(14359471-14359562)
chr5 (47-98)||(22177797-22177848)
chr5 (351-497)||(29348453-29348600)
chr5 (351-497)||(29350926-29351073)
chr5 (351-497)||(32027393-32027540)
chr5 (404-500)||(40725853-40725951)
chr5 (41-123)||(15236440-15236522)
chr5 (431-485)||(15796434-15796487)
chr5 (34-189)||(17718092-17718248)
chr5 (56-122)||(20026526-20026592)
chr5 (34-189)||(21884842-21884998)
chr5 (10-124)||(24554896-24555010)
chr5 (66-124)||(25535351-25535409)
chr5 (47-129)||(26011688-26011770)
chr5 (419-481)||(26704090-26704151)
chr5 (430-484)||(26740697-26740750)
chr5 (419-481)||(26973823-26973884)
chr5 (41-123)||(29471019-29471101)
chr5 (41-123)||(29477614-29477696)
chr5 (34-71)||(4036636-4036673)
chr5 (148-189)||(5888940-5888981)
chr5 (34-71)||(18784463-18784500)
chr5 (152-189)||(19660606-19660643)
chr5 (34-71)||(21482894-21482931)
chr5 (148-197)||(21501919-21501968)
chr5 (148-185)||(21565863-21565900)
chr5 (10-111)||(22343873-22343974)
chr5 (148-189)||(22959298-22959339)
chr5 (66-123)||(23336973-23337030)
chr5 (34-71)||(26172880-26172917)
chr5 (430-479)||(26732884-26732932)
chr5 (47-112)||(27517126-27517191)
chr5 (47-112)||(27523763-27523828)
chr5 (34-71)||(42805836-42805873)
chr5 (150-190)||(20026706-20026746)
chr5 (154-189)||(19472493-19472528)
chr5 (65-112)||(19992258-19992305)
chr5 (154-189)||(20296145-20296180)
chr5 (422-473)||(21873277-21873327)
chr5 (65-112)||(22334501-22334548)
chr5 (138-189)||(23201680-23201731)
chr5 (35-78)||(26704499-26704542)
chr5 (35-78)||(26974232-26974275)
chr5 (150-189)||(31342414-31342453)
chr5 (41-112)||(34294212-34294283)
chr5 (65-124)||(37286464-37286523)
chr5 (65-124)||(37293167-37293226)
chr5 (447-497)||(20806854-20806904)
chr5 (35-189)||(20910454-20910609)
chr5 (431-485)||(23469818-23469871)
chr5 (151-189)||(25744036-25744074)
chr5 (56-98)||(26732421-26732463)
chr5 (56-98)||(26740234-26740276)
chr5 (454-484)||(27989004-27989034)
chr5 (34-71)||(18774620-18774657)
chr5 (10-71)||(19472348-19472409)
chr5 (140-189)||(20232847-20232896)
chr5 (34-63)||(20232954-20232983)
chr5 (148-185)||(21741308-21741345)
chr5 (56-97)||(25574056-25574097)
chr5 (56-97)||(25575249-25575290)
chr5 (56-97)||(25576442-25576483)
chr5 (149-189)||(123074-123114)
chr5 (133-189)||(21871321-21871377)
chr5 (133-189)||(21875601-21875657)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (35-500)||(16282-16747)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (31-500)||(46995-47458)
scaffold0064 (11-96)||(64282-64367)
[»] chr3 (224 HSPs)
chr3 (30-500)||(20698084-20698556)
chr3 (36-500)||(17487856-17488335)
chr3 (63-500)||(13442274-13442725)
chr3 (35-500)||(17499338-17499818)
chr3 (11-500)||(12399209-12399698)
chr3 (35-500)||(26686887-26687366)
chr3 (35-500)||(18438534-18439013)
chr3 (35-500)||(14972854-14973333)
chr3 (35-481)||(14576475-14576934)
chr3 (35-497)||(40213363-40213838)
chr3 (34-481)||(14572608-14573068)
chr3 (35-500)||(23083003-23083482)
chr3 (35-500)||(25476027-25476506)
chr3 (35-500)||(11424405-11424880)
chr3 (36-481)||(30029859-30030306)
chr3 (126-500)||(43840932-43841309)
chr3 (31-179)||(16809724-16809868)
chr3 (35-197)||(17247928-17248100)
chr3 (175-364)||(16796685-16796875)
chr3 (35-484)||(53070341-53070802)
chr3 (31-128)||(14179708-14179805)
chr3 (288-497)||(24153115-24153326)
chr3 (35-481)||(42386429-42386890)
chr3 (35-128)||(12340138-12340231)
chr3 (35-125)||(4588457-4588547)
chr3 (31-128)||(13209966-13210062)
chr3 (35-128)||(14665991-14666084)
chr3 (35-128)||(14669146-14669239)
chr3 (35-128)||(14735504-14735597)
chr3 (35-120)||(43842572-43842657)
chr3 (35-127)||(49389286-49389378)
chr3 (35-189)||(12852006-12852169)
chr3 (35-128)||(12933952-12934045)
chr3 (35-124)||(32308058-32308147)
chr3 (37-125)||(9513299-9513387)
chr3 (37-125)||(9521274-9521362)
chr3 (404-500)||(13210350-13210448)
chr3 (11-75)||(11298148-11298212)
chr3 (35-126)||(16104168-16104259)
chr3 (11-126)||(18383536-18383651)
chr3 (11-97)||(12496668-12496754)
chr3 (35-109)||(17247162-17247236)
chr3 (11-97)||(23077097-23077183)
chr3 (11-96)||(15060706-15060791)
chr3 (35-128)||(49667726-49667818)
chr3 (428-496)||(49668125-49668193)
chr3 (402-500)||(43550544-43550644)
chr3 (11-73)||(323026-323088)
chr3 (35-125)||(1644325-1644415)
chr3 (11-97)||(12173199-12173285)
chr3 (383-500)||(15470927-15471043)
chr3 (35-125)||(16097719-16097809)
chr3 (11-96)||(856550-856635)
chr3 (11-96)||(15051930-15052015)
chr3 (428-496)||(9512924-9512992)
chr3 (428-496)||(9520899-9520967)
chr3 (35-103)||(12171759-12171827)
chr3 (428-496)||(12174308-12174376)
chr3 (12-75)||(321634-321697)
chr3 (332-496)||(856140-856304)
chr3 (287-364)||(14179570-14179648)
chr3 (11-97)||(14878124-14878210)
chr3 (35-129)||(15471309-15471403)
chr3 (11-73)||(16369845-16369907)
chr3 (383-497)||(27165250-27165366)
chr3 (428-481)||(32307696-32307749)
chr3 (11-75)||(17674194-17674258)
chr3 (15-75)||(26190632-26190692)
chr3 (428-484)||(52523778-52523834)
chr3 (47-122)||(324627-324702)
chr3 (351-497)||(9707622-9707769)
chr3 (384-500)||(14234487-14234605)
chr3 (12-75)||(17524794-17524857)
chr3 (404-500)||(24340746-24340844)
chr3 (351-497)||(29172598-29172745)
chr3 (337-497)||(17672626-17672788)
chr3 (435-497)||(28194693-28194755)
chr3 (34-189)||(38814681-38814837)
chr3 (337-481)||(50242838-50242984)
chr3 (402-497)||(53301572-53301669)
chr3 (30-123)||(2050838-2050931)
chr3 (383-497)||(36166598-36166712)
chr3 (11-75)||(3402585-3402649)
chr3 (35-123)||(14234881-14234969)
chr3 (432-496)||(16097332-16097396)
chr3 (428-496)||(16103784-16103852)
chr3 (30-129)||(1465046-1465145)
chr3 (351-497)||(7781362-7781509)
chr3 (337-498)||(13544024-13544187)
chr3 (351-497)||(17463178-17463325)
chr3 (429-484)||(22110402-22110457)
chr3 (351-497)||(28848626-28848773)
chr3 (351-497)||(34159326-34159473)
chr3 (429-484)||(43925974-43926029)
chr3 (351-497)||(45606922-45607069)
chr3 (351-497)||(55476491-55476638)
chr3 (337-481)||(12567576-12567722)
chr3 (34-189)||(17242269-17242425)
chr3 (11-97)||(19725531-19725617)
chr3 (427-496)||(37251216-37251283)
chr3 (11-189)||(326794-326973)
chr3 (11-189)||(15482959-15483138)
chr3 (15-189)||(15849719-15849894)
chr3 (385-497)||(55500942-55501055)
chr3 (402-497)||(6469200-6469296)
chr3 (402-497)||(8499518-8499614)
chr3 (11-71)||(11594769-11594829)
chr3 (402-497)||(15977515-15977611)
chr3 (11-71)||(16690635-16690695)
chr3 (11-71)||(16697208-16697268)
chr3 (11-71)||(20461130-20461190)
chr3 (11-71)||(31097184-31097244)
chr3 (351-497)||(8899094-8899241)
chr3 (351-497)||(16454296-16454443)
chr3 (351-481)||(38961906-38962037)
chr3 (34-189)||(3833971-3834127)
chr3 (47-125)||(22109929-22110007)
chr3 (11-77)||(23052696-23052762)
chr3 (381-498)||(46822267-46822386)
chr3 (431-484)||(606378-606431)
chr3 (14-75)||(11852006-11852067)
chr3 (10-111)||(12891782-12891883)
chr3 (35-96)||(15877471-15877532)
chr3 (10-111)||(17252685-17252786)
chr3 (383-481)||(21618465-21618563)
chr3 (11-71)||(1982440-1982500)
chr3 (35-75)||(3389600-3389640)
chr3 (10-110)||(4291149-4291249)
chr3 (10-110)||(4710675-4710775)
chr3 (11-71)||(7792976-7793036)
chr3 (402-497)||(12119791-12119887)
chr3 (427-483)||(12377938-12377994)
chr3 (351-497)||(13151805-13151953)
chr3 (351-497)||(13154270-13154418)
chr3 (402-497)||(15412429-15412525)
chr3 (10-98)||(15617766-15617854)
chr3 (404-481)||(23274706-23274785)
chr3 (56-128)||(52523390-52523462)
chr3 (351-497)||(10247738-10247885)
chr3 (12-111)||(13321348-13321447)
chr3 (47-98)||(14501615-14501666)
chr3 (405-495)||(16282880-16282971)
chr3 (351-497)||(17446670-17446816)
chr3 (438-497)||(17737236-17737294)
chr3 (47-122)||(23275133-23275208)
chr3 (404-500)||(37642288-37642386)
chr3 (10-124)||(839609-839723)
chr3 (34-189)||(1598133-1598289)
chr3 (148-190)||(1644447-1644489)
chr3 (447-497)||(10556985-10557035)
chr3 (34-189)||(11300164-11300320)
chr3 (41-123)||(23704428-23704510)
chr3 (41-123)||(23722884-23722966)
chr3 (41-123)||(23741340-23741422)
chr3 (10-124)||(24188140-24188254)
chr3 (148-190)||(32307983-32308025)
chr3 (41-123)||(41201457-41201539)
chr3 (447-497)||(45577950-45578000)
chr3 (148-190)||(49667848-49667890)
chr3 (10-124)||(55149341-55149455)
chr3 (47-128)||(605945-606026)
chr3 (382-498)||(12511059-12511177)
chr3 (10-111)||(16333548-16333649)
chr3 (34-189)||(15941557-15941713)
chr3 (24-128)||(16862823-16862927)
chr3 (447-495)||(41123892-41123940)
chr3 (402-497)||(44494809-44494905)
chr3 (150-189)||(12340068-12340107)
chr3 (41-112)||(13251095-13251166)
chr3 (41-112)||(13257741-13257812)
chr3 (138-189)||(19725669-19725720)
chr3 (47-98)||(23412827-23412878)
chr3 (47-98)||(45797659-45797710)
chr3 (41-123)||(11070435-11070517)
chr3 (41-123)||(11165189-11165271)
chr3 (33-71)||(11557037-11557075)
chr3 (148-190)||(12934075-12934117)
chr3 (41-123)||(14499692-14499774)
chr3 (53-123)||(15691949-15692019)
chr3 (41-123)||(15726591-15726673)
chr3 (41-123)||(30066313-30066395)
chr3 (51-97)||(43927597-43927643)
chr3 (41-123)||(55023212-55023294)
chr3 (10-123)||(5149596-5149709)
chr3 (419-496)||(15878092-15878168)
chr3 (34-71)||(16797707-16797744)
chr3 (429-485)||(13919344-13919399)
chr3 (66-189)||(20723298-20723422)
chr3 (11-71)||(42326360-42326420)
chr3 (51-98)||(316612-316659)
chr3 (154-189)||(7109999-7110034)
chr3 (154-189)||(7113934-7113969)
chr3 (11-78)||(12037572-12037639)
chr3 (51-98)||(12378412-12378459)
chr3 (150-189)||(14665921-14665960)
chr3 (150-189)||(14669076-14669115)
chr3 (150-189)||(14735434-14735473)
chr3 (41-112)||(16623714-16623785)
chr3 (154-189)||(22321965-22322000)
chr3 (154-189)||(22337020-22337055)
chr3 (154-189)||(27409417-27409452)
chr3 (148-190)||(324549-324591)
chr3 (147-189)||(16097645-16097687)
chr3 (418-496)||(23077517-23077594)
chr3 (65-111)||(41092030-41092076)
chr3 (148-186)||(49389408-49389446)
chr3 (148-189)||(1465174-1465215)
chr3 (39-124)||(7986069-7986154)
chr3 (148-185)||(9513228-9513265)
chr3 (148-185)||(9521203-9521240)
chr3 (152-189)||(13210096-13210133)
chr3 (41-110)||(15337810-15337879)
chr3 (41-110)||(15397562-15397631)
chr3 (41-110)||(15404153-15404222)
chr3 (65-110)||(17710275-17710320)
chr3 (35-96)||(23408847-23408907)
chr3 (66-123)||(28350846-28350903)
chr3 (149-190)||(37250932-37250973)
chr3 (47-112)||(53380017-53380082)
chr3 (47-112)||(53386669-53386734)
chr3 (148-188)||(12171869-12171909)
chr3 (447-499)||(14665398-14665450)
chr3 (447-499)||(14668554-14668606)
chr3 (149-189)||(22110116-22110156)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (31-497)||(4780-5246)
[»] chr6 (165 HSPs)
chr6 (31-500)||(16920282-16920751)
chr6 (31-500)||(22831503-22831974)
chr6 (34-500)||(20360612-20361081)
chr6 (35-500)||(20637936-20638404)
chr6 (31-488)||(11185517-11185974)
chr6 (35-500)||(22779869-22780348)
chr6 (39-500)||(29060540-29061015)
chr6 (35-500)||(19303183-19303661)
chr6 (35-500)||(17287438-17287917)
chr6 (35-499)||(18409469-18409947)
chr6 (35-277)||(18821472-18821714)
chr6 (35-500)||(20593773-20594252)
chr6 (35-500)||(25628997-25629476)
chr6 (328-500)||(35245586-35245758)
chr6 (35-190)||(28496115-28496280)
chr6 (350-500)||(16496244-16496396)
chr6 (35-190)||(29808525-29808691)
chr6 (31-128)||(1561689-1561786)
chr6 (35-190)||(18457029-18457193)
chr6 (35-189)||(21939699-21939862)
chr6 (35-189)||(15894072-15894237)
chr6 (35-189)||(25611365-25611530)
chr6 (26-128)||(4667846-4667948)
chr6 (26-128)||(4674693-4674795)
chr6 (336-500)||(20076700-20076863)
chr6 (26-128)||(31155031-31155133)
chr6 (35-128)||(19652581-19652674)
chr6 (36-128)||(22334525-22334617)
chr6 (26-128)||(4185456-4185558)
chr6 (26-128)||(4189342-4189444)
chr6 (11-97)||(21834509-21834595)
chr6 (428-500)||(27333267-27333339)
chr6 (428-500)||(27394007-27394079)
chr6 (404-500)||(28496494-28496592)
chr6 (404-500)||(29808905-29809003)
chr6 (11-97)||(16523022-16523108)
chr6 (11-97)||(21739641-21739727)
chr6 (47-129)||(23019792-23019874)
chr6 (35-128)||(27332926-27333019)
chr6 (35-128)||(27393666-27393759)
chr6 (355-481)||(20109157-20109285)
chr6 (35-473)||(25603027-25603478)
chr6 (11-127)||(15041169-15041285)
chr6 (402-497)||(25656629-25656725)
chr6 (404-500)||(1561303-1561401)
chr6 (355-497)||(1595549-1595692)
chr6 (351-497)||(2291195-2291342)
chr6 (383-481)||(25644339-25644440)
chr6 (337-497)||(25754809-25754971)
chr6 (328-447)||(27415887-27416008)
chr6 (428-481)||(9098563-9098616)
chr6 (11-189)||(22429660-22429839)
chr6 (383-500)||(23019408-23019525)
chr6 (428-496)||(19652199-19652267)
chr6 (11-71)||(20803182-20803242)
chr6 (47-189)||(22080391-22080543)
chr6 (402-497)||(22782227-22782323)
chr6 (337-499)||(30676710-30676874)
chr6 (351-497)||(12742317-12742464)
chr6 (351-497)||(18334607-18334754)
chr6 (351-497)||(19005046-19005193)
chr6 (351-497)||(19858934-19859081)
chr6 (351-497)||(24422547-24422694)
chr6 (351-497)||(33861794-33861941)
chr6 (351-497)||(33864278-33864425)
chr6 (11-97)||(18180903-18180989)
chr6 (11-189)||(1645002-1645181)
chr6 (11-189)||(17804494-17804673)
chr6 (11-71)||(18907549-18907609)
chr6 (34-189)||(19663065-19663221)
chr6 (337-499)||(34963371-34963535)
chr6 (351-497)||(1540926-1541073)
chr6 (351-497)||(8055029-8055176)
chr6 (34-189)||(12496605-12496761)
chr6 (351-497)||(26924655-26924802)
chr6 (351-484)||(18456732-18456866)
chr6 (351-484)||(18461892-18462026)
chr6 (435-481)||(19668390-19668436)
chr6 (11-69)||(20907611-20907669)
chr6 (438-500)||(25714417-25714478)
chr6 (35-129)||(25956263-25956357)
chr6 (387-477)||(4185827-4185919)
chr6 (11-128)||(9481923-9482040)
chr6 (35-96)||(19863395-19863456)
chr6 (30-83)||(22439230-22439283)
chr6 (429-482)||(23076748-23076801)
chr6 (11-96)||(25641802-25641887)
chr6 (35-124)||(31164500-31164589)
chr6 (429-482)||(35008166-35008219)
chr6 (10-110)||(3708111-3708211)
chr6 (10-110)||(14099004-14099104)
chr6 (10-98)||(18916895-18916983)
chr6 (11-75)||(22405685-22405748)
chr6 (11-71)||(23657050-23657110)
chr6 (402-481)||(25688518-25688598)
chr6 (11-71)||(25766798-25766858)
chr6 (404-500)||(8227534-8227632)
chr6 (12-71)||(19790410-19790469)
chr6 (453-500)||(22080799-22080846)
chr6 (438-484)||(18821904-18821949)
chr6 (10-124)||(22331803-22331917)
chr6 (30-96)||(22432667-22432733)
chr6 (35-125)||(25644711-25644801)
chr6 (427-485)||(33443062-33443119)
chr6 (402-494)||(16448593-16448686)
chr6 (47-124)||(20109605-20109682)
chr6 (10-111)||(34833031-34833132)
chr6 (11-71)||(5616444-5616504)
chr6 (11-71)||(12707104-12707164)
chr6 (11-71)||(16741623-16741683)
chr6 (10-98)||(19870980-19871068)
chr6 (402-497)||(20556958-20557054)
chr6 (11-71)||(21702703-21702763)
chr6 (11-67)||(29096123-29096179)
chr6 (438-497)||(3852121-3852179)
chr6 (138-189)||(22334648-22334699)
chr6 (138-189)||(25641940-25641991)
chr6 (65-123)||(1538628-1538686)
chr6 (65-123)||(1544727-1544785)
chr6 (34-128)||(2684994-2685088)
chr6 (34-71)||(1587384-1587421)
chr6 (148-189)||(4185588-4185629)
chr6 (387-477)||(4186390-4186482)
chr6 (148-189)||(4667978-4668019)
chr6 (66-123)||(16372223-16372280)
chr6 (419-496)||(19873120-19873196)
chr6 (419-496)||(22432249-22432325)
chr6 (419-496)||(22438799-22438875)
chr6 (10-119)||(25594981-25595090)
chr6 (18-71)||(27567246-27567299)
chr6 (11-71)||(25135302-25135362)
chr6 (148-188)||(27333049-27333089)
chr6 (148-188)||(27393789-27393829)
chr6 (11-71)||(27553237-27553297)
chr6 (154-189)||(8244158-8244193)
chr6 (154-189)||(11567160-11567195)
chr6 (296-473)||(15041465-15041644)
chr6 (39-78)||(16964957-16964996)
chr6 (434-485)||(18199473-18199523)
chr6 (148-187)||(19652512-19652551)
chr6 (154-189)||(19870888-19870923)
chr6 (154-189)||(22863243-22863278)
chr6 (154-189)||(23395366-23395401)
chr6 (65-124)||(34295751-34295810)
chr6 (33-111)||(17036987-17037065)
chr6 (34-189)||(22592457-22592613)
chr6 (10-111)||(23276907-23277008)
chr6 (66-112)||(30694738-30694784)
chr6 (10-71)||(8244277-8244338)
chr6 (65-110)||(14472647-14472692)
chr6 (144-189)||(16924642-16924687)
chr6 (144-189)||(16929357-16929402)
chr6 (447-496)||(19862978-19863027)
chr6 (45-78)||(22059396-22059429)
chr6 (41-110)||(24314739-24314808)
chr6 (47-112)||(27327722-27327787)
chr6 (47-112)||(27388462-27388527)
chr6 (148-189)||(31155163-31155204)
chr6 (66-123)||(34369658-34369715)
chr6 (48-112)||(14059283-14059347)
chr6 (47-98)||(18696979-18697031)
chr6 (149-189)||(19668688-19668728)
chr6 (149-189)||(23657189-23657229)
chr6 (35-71)||(27415596-27415632)
chr6 (51-103)||(33443532-33443584)
[»] chr1 (137 HSPs)
chr1 (32-500)||(38801041-38801508)
chr1 (37-500)||(27250384-27250850)
chr1 (30-500)||(21026680-21027153)
chr1 (35-499)||(50209856-50210333)
chr1 (35-425)||(22354214-22354616)
chr1 (35-391)||(22355827-22356185)
chr1 (35-391)||(22357513-22357871)
chr1 (35-497)||(34509783-34510259)
chr1 (35-500)||(22532269-22532748)
chr1 (30-310)||(20846867-20847147)
chr1 (30-499)||(20135188-20135671)
chr1 (35-497)||(433012-433486)
chr1 (35-189)||(20918917-20919080)
chr1 (31-126)||(21754423-21754518)
chr1 (35-128)||(52927623-52927716)
chr1 (289-499)||(22468604-22468816)
chr1 (404-500)||(14295574-14295672)
chr1 (35-212)||(33681301-33681488)
chr1 (35-129)||(22921509-22921603)
chr1 (35-127)||(20248664-20248756)
chr1 (26-125)||(21162117-21162216)
chr1 (406-500)||(45574912-45575008)
chr1 (11-97)||(22830997-22831083)
chr1 (32-189)||(20091113-20091281)
chr1 (35-100)||(21301180-21301245)
chr1 (35-128)||(22238015-22238108)
chr1 (424-500)||(20847200-20847275)
chr1 (14-97)||(18181743-18181826)
chr1 (15-96)||(21787665-21787746)
chr1 (11-96)||(42864830-42864915)
chr1 (383-484)||(21896258-21896361)
chr1 (428-496)||(22921918-22921986)
chr1 (11-74)||(21023075-21023138)
chr1 (11-97)||(22432402-22432488)
chr1 (428-500)||(33681010-33681079)
chr1 (328-447)||(33797573-33797694)
chr1 (35-129)||(43697745-43697839)
chr1 (287-364)||(48603652-48603730)
chr1 (404-481)||(20918623-20918702)
chr1 (383-484)||(21861572-21861675)
chr1 (11-73)||(3472545-3472607)
chr1 (402-481)||(21754064-21754145)
chr1 (383-500)||(22237630-22237746)
chr1 (337-497)||(23593735-23593897)
chr1 (19-96)||(6152270-6152347)
chr1 (428-481)||(16758668-16758721)
chr1 (402-484)||(35261099-35261183)
chr1 (351-497)||(13988866-13989013)
chr1 (337-498)||(21840766-21840929)
chr1 (351-497)||(21923306-21923453)
chr1 (351-497)||(29776688-29776835)
chr1 (351-497)||(31612313-31612460)
chr1 (429-484)||(50614167-50614222)
chr1 (429-484)||(50621995-50622050)
chr1 (428-500)||(52928019-52928088)
chr1 (431-484)||(16368338-16368391)
chr1 (11-75)||(8761252-8761316)
chr1 (428-496)||(20248283-20248351)
chr1 (431-499)||(20454606-20454673)
chr1 (402-481)||(22123133-22123214)
chr1 (402-500)||(13212928-13213027)
chr1 (405-503)||(15860078-15860177)
chr1 (351-497)||(21475102-21475249)
chr1 (30-125)||(28194085-28194180)
chr1 (11-97)||(18393593-18393679)
chr1 (402-503)||(21342090-21342192)
chr1 (11-97)||(24782730-24782816)
chr1 (11-97)||(45309996-45310082)
chr1 (35-96)||(22468339-22468400)
chr1 (427-484)||(41050084-41050141)
chr1 (10-111)||(50887381-50887482)
chr1 (11-71)||(3704716-3704776)
chr1 (337-499)||(16361915-16362079)
chr1 (11-71)||(21305730-21305790)
chr1 (402-497)||(21346961-21347057)
chr1 (30-126)||(35981324-35981419)
chr1 (11-71)||(36818938-36818998)
chr1 (12-71)||(17678218-17678277)
chr1 (12-71)||(20228440-20228499)
chr1 (35-78)||(21714983-21715026)
chr1 (438-497)||(29298137-29298195)
chr1 (32-71)||(45489394-45489433)
chr1 (34-189)||(12647166-12647322)
chr1 (400-497)||(16275428-16275526)
chr1 (34-189)||(18882664-18882820)
chr1 (11-128)||(21615796-21615913)
chr1 (447-497)||(21707167-21707217)
chr1 (447-497)||(21711709-21711759)
chr1 (148-190)||(21754350-21754392)
chr1 (10-124)||(23763574-23763688)
chr1 (430-484)||(50686627-50686681)
chr1 (39-124)||(20524873-20524958)
chr1 (39-124)||(21438157-21438242)
chr1 (419-496)||(21714546-21714622)
chr1 (10-123)||(21829078-21829191)
chr1 (10-123)||(21844591-21844704)
chr1 (34-71)||(23818952-23818989)
chr1 (11-71)||(16080074-16080134)
chr1 (30-98)||(21342564-21342632)
chr1 (30-98)||(21347429-21347497)
chr1 (30-126)||(21895869-21895965)
chr1 (427-482)||(16093933-16093988)
chr1 (30-125)||(16759115-16759210)
chr1 (34-128)||(19212226-19212320)
chr1 (429-484)||(26064954-26065009)
chr1 (47-126)||(26065382-26065461)
chr1 (51-126)||(41049626-41049701)
chr1 (41-123)||(1011087-1011169)
chr1 (65-123)||(19063884-19063942)
chr1 (65-123)||(19111774-19111832)
chr1 (34-189)||(20138380-20138536)
chr1 (51-125)||(35260713-35260787)
chr1 (34-189)||(46975764-46975920)
chr1 (148-189)||(20637165-20637206)
chr1 (148-189)||(21162080-21162121)
chr1 (34-71)||(33797949-33797986)
chr1 (56-128)||(16367873-16367945)
chr1 (30-126)||(21861131-21861227)
chr1 (154-189)||(16375231-16375266)
chr1 (35-129)||(20637235-20637330)
chr1 (154-189)||(21407653-21407688)
chr1 (154-189)||(52639839-52639874)
chr1 (56-102)||(16381652-16381698)
chr1 (65-123)||(19105117-19105175)
chr1 (438-496)||(21161720-21161778)
chr1 (455-485)||(21533948-21533978)
chr1 (33-71)||(33049739-33049777)
chr1 (56-98)||(52940464-52940506)
chr1 (148-189)||(20248592-20248633)
chr1 (147-188)||(22921631-22921672)
chr1 (149-190)||(26065254-26065295)
chr1 (148-189)||(28194213-28194254)
chr1 (148-189)||(35981451-35981492)
chr1 (147-188)||(52927745-52927786)
chr1 (56-128)||(16093479-16093551)
chr1 (447-499)||(24783160-24783212)
chr1 (149-189)||(45310135-45310175)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (35-500)||(702-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (35-500)||(167632-168099)
scaffold0011 (35-500)||(51913-52391)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (31-500)||(51582-52051)
scaffold0032 (41-112)||(108984-109055)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (35-500)||(4712-5180)
scaffold0358 (35-425)||(13-404)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (31-500)||(1952-2424)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (31-500)||(1289-1758)
scaffold0106 (31-500)||(7266-7735)
scaffold0106 (31-78)||(16083-16130)
scaffold0106 (431-497)||(15291-15356)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (35-500)||(13211-13679)
scaffold0193 (34-189)||(9717-9873)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (32-440)||(6669-7081)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (35-500)||(1851-2330)
scaffold0016 (34-189)||(207160-207324)
scaffold0016 (47-97)||(119205-119255)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (30-500)||(4849-5321)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (35-500)||(3470-3949)
scaffold0292 (35-500)||(343-821)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (35-481)||(23944-24405)
scaffold0042 (11-75)||(34529-34593)
scaffold0042 (24-75)||(41185-41236)
scaffold0042 (34-189)||(64150-64306)
scaffold0042 (34-189)||(76034-76190)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (34-500)||(5762-6245)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (35-500)||(38761-39238)
scaffold0145 (291-500)||(32942-33153)
scaffold0145 (402-502)||(9744-9845)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (30-500)||(20910-21374)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (11-364)||(1052-1406)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (11-344)||(3640-3973)
scaffold0165 (11-344)||(7704-8037)
scaffold0165 (47-126)||(27296-27375)
scaffold0165 (402-481)||(27770-27851)
[»] scaffold0021 (9 HSPs)
scaffold0021 (35-412)||(124675-125061)
scaffold0021 (383-499)||(174767-174883)
scaffold0021 (36-128)||(62947-63039)
scaffold0021 (430-500)||(121766-121835)
scaffold0021 (424-484)||(136414-136474)
scaffold0021 (424-484)||(145122-145182)
scaffold0021 (35-76)||(175202-175243)
scaffold0021 (149-190)||(136132-136173)
scaffold0021 (149-190)||(144840-144881)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (34-499)||(16856-17337)
scaffold0056 (38-127)||(79007-79096)
scaffold0056 (11-75)||(13696-13760)
scaffold0056 (438-484)||(79388-79433)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (35-450)||(13141-13571)
scaffold0175 (31-188)||(34437-34603)
scaffold0175 (404-500)||(34123-34221)
scaffold0175 (447-500)||(273-326)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (34-493)||(25706-26179)
scaffold0122 (35-348)||(33136-33461)
scaffold0122 (383-497)||(44709-44825)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (35-500)||(8479-8954)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (35-500)||(8175-8650)
[»] scaffold0003 (6 HSPs)
scaffold0003 (35-497)||(339593-340065)
scaffold0003 (328-447)||(71353-71474)
scaffold0003 (351-497)||(158465-158612)
scaffold0003 (12-71)||(140126-140185)
scaffold0003 (11-71)||(97022-97083)
scaffold0003 (35-71)||(71729-71765)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (39-309)||(11170-11440)
scaffold0235 (385-500)||(11447-11564)
scaffold0235 (47-98)||(14055-14106)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (35-500)||(39913-40390)
scaffold0080 (11-96)||(18275-18360)
scaffold0080 (427-484)||(19933-19990)
scaffold0080 (138-189)||(18413-18464)
[»] scaffold0026 (7 HSPs)
scaffold0026 (35-500)||(39858-40335)
scaffold0026 (186-500)||(25896-26213)
scaffold0026 (35-128)||(39573-39666)
scaffold0026 (69-125)||(59179-59235)
scaffold0026 (77-128)||(26611-26662)
scaffold0026 (152-189)||(59271-59308)
scaffold0026 (140-174)||(26555-26589)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (35-497)||(22886-23361)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (35-500)||(16241-16721)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (35-483)||(51526-51987)
scaffold0034 (402-481)||(32555-32636)
scaffold0034 (47-129)||(32921-33003)
scaffold0034 (148-214)||(32826-32892)
scaffold0034 (34-71)||(16316-16353)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (35-310)||(20596-20882)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (35-500)||(4508-4987)
scaffold0228 (35-500)||(12090-12569)
scaffold0228 (35-500)||(22042-22521)
scaffold0228 (11-189)||(18262-18441)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (144-498)||(39479-39836)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (144-498)||(74976-75333)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (35-440)||(604-1021)
scaffold0395 (433-500)||(4888-4954)
scaffold0395 (35-129)||(8134-8228)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (218-500)||(2987-3271)
scaffold0540 (35-207)||(655-837)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (35-323)||(17650-17928)
[»] scaffold0120 (6 HSPs)
scaffold0120 (35-500)||(32601-33077)
scaffold0120 (35-500)||(45928-46404)
scaffold0120 (35-257)||(16333-16565)
scaffold0120 (292-500)||(16113-16323)
scaffold0120 (11-71)||(19647-19707)
scaffold0120 (438-500)||(17389-17450)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (142-420)||(27912-28192)
scaffold0130 (35-126)||(28924-29015)
scaffold0130 (47-97)||(1357-1407)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (40-479)||(4545-4997)
scaffold0070 (34-189)||(10200-10356)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (35-244)||(163-383)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (35-168)||(13250-13383)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (35-343)||(10323-10637)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (35-128)||(2727-2820)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (26-197)||(1711-1891)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (35-194)||(17090-17259)
scaffold0142 (402-497)||(16784-16880)
scaffold0142 (93-128)||(7471-7506)
scaffold0142 (150-189)||(7537-7576)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (35-190)||(20426-20591)
scaffold0100 (428-500)||(23932-24001)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (35-194)||(15257-15426)
scaffold0413 (383-484)||(12584-12687)
scaffold0413 (47-125)||(13033-13111)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (299-499)||(3103-3306)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (30-189)||(2082-2250)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (35-128)||(18600-18693)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (35-128)||(7936-8029)
scaffold0075 (331-484)||(53498-53654)
scaffold0075 (30-126)||(53108-53204)
scaffold0075 (152-189)||(8062-8099)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (364-500)||(28414-28552)
scaffold0046 (404-500)||(11292-11390)
scaffold0046 (404-500)||(1997-2095)
scaffold0046 (444-500)||(4552-4608)
scaffold0046 (30-77)||(14914-14961)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (35-186)||(12451-12611)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (30-124)||(28917-29011)
scaffold0218 (424-481)||(8119-8176)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (35-189)||(10226-10389)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (36-186)||(20069-20228)
scaffold0031 (351-484)||(20394-20527)
scaffold0031 (11-189)||(53862-54041)
scaffold0031 (11-78)||(65412-65479)
scaffold0031 (336-500)||(128751-128917)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (35-189)||(344-506)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (35-190)||(12243-12407)
scaffold0503 (438-484)||(11979-12024)
[»] scaffold0261 (5 HSPs)
scaffold0261 (30-125)||(16047-16142)
scaffold0261 (404-497)||(15664-15759)
scaffold0261 (6-96)||(1755-1845)
scaffold0261 (152-189)||(15974-16011)
scaffold0261 (47-98)||(17920-17971)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (296-484)||(26840-27027)
scaffold0215 (12-78)||(27256-27322)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (30-128)||(32469-32567)
scaffold0150 (436-496)||(32102-32162)
scaffold0150 (148-190)||(32397-32439)
[»] scaffold0556 (4 HSPs)
scaffold0556 (35-128)||(7197-7290)
scaffold0556 (428-484)||(6828-6884)
scaffold0556 (47-129)||(8401-8483)
scaffold0556 (148-189)||(7126-7167)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (35-124)||(28451-28540)
scaffold0211 (428-496)||(28818-28887)
scaffold0211 (148-190)||(28574-28616)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (39-189)||(9480-9639)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (35-189)||(79974-80137)
scaffold0037 (11-126)||(21188-21303)
scaffold0037 (383-500)||(22672-22788)
scaffold0037 (337-497)||(82072-82234)
[»] scaffold0028 (12 HSPs)
scaffold0028 (35-128)||(133039-133132)
scaffold0028 (436-496)||(132662-132722)
scaffold0028 (351-497)||(136680-136827)
scaffold0028 (351-497)||(139149-139296)
scaffold0028 (351-497)||(144087-144234)
scaffold0028 (428-481)||(62217-62270)
scaffold0028 (351-497)||(134211-134358)
scaffold0028 (351-497)||(141618-141765)
scaffold0028 (148-190)||(132967-133009)
scaffold0028 (154-189)||(58492-58527)
scaffold0028 (65-123)||(41901-41959)
scaffold0028 (65-123)||(57408-57466)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (35-127)||(161072-161164)
scaffold0001 (402-496)||(160688-160784)
scaffold0001 (337-481)||(501100-501246)
scaffold0001 (11-189)||(173587-173766)
scaffold0001 (402-497)||(85646-85742)
scaffold0001 (14-71)||(422163-422221)
scaffold0001 (56-98)||(446965-447007)
scaffold0001 (56-98)||(497896-497938)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (404-500)||(1092-1190)
scaffold0184 (11-97)||(3854-3940)
scaffold0184 (149-189)||(3993-4033)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (35-118)||(10540-10623)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (33-189)||(24291-24456)
scaffold0124 (404-500)||(38279-38377)
scaffold0124 (12-48)||(42869-42905)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (35-129)||(3317-3411)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (26-128)||(9462-9564)
scaffold0475 (148-189)||(9391-9432)
[»] scaffold0023 (12 HSPs)
scaffold0023 (428-500)||(119875-119947)
scaffold0023 (35-127)||(101781-101873)
scaffold0023 (383-496)||(100378-100493)
scaffold0023 (351-497)||(44454-44602)
scaffold0023 (429-496)||(40224-40291)
scaffold0023 (351-497)||(94411-94558)
scaffold0023 (337-481)||(17440-17586)
scaffold0023 (428-496)||(101503-101571)
scaffold0023 (11-96)||(38119-38204)
scaffold0023 (13-61)||(23288-23336)
scaffold0023 (35-86)||(39651-39702)
scaffold0023 (146-190)||(101709-101753)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (11-189)||(587-766)
scaffold0327 (287-425)||(3434-3574)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (35-122)||(6470-6557)
scaffold0247 (149-213)||(6561-6625)
scaffold0247 (404-500)||(18050-18148)
scaffold0247 (402-481)||(2195-2275)
[»] scaffold0102 (4 HSPs)
scaffold0102 (30-128)||(19652-19750)
scaffold0102 (428-496)||(19268-19336)
scaffold0102 (148-197)||(19573-19622)
scaffold0102 (35-96)||(48103-48164)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (35-127)||(2286-2378)
scaffold0207 (428-496)||(2694-2762)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (31-122)||(1939-2030)
scaffold1137 (148-190)||(2066-2108)
[»] scaffold0210 (6 HSPs)
scaffold0210 (11-78)||(21425-21492)
scaffold0210 (11-78)||(29317-29384)
scaffold0210 (296-496)||(21721-21920)
scaffold0210 (296-496)||(29613-29812)
scaffold0210 (138-189)||(21563-21614)
scaffold0210 (138-189)||(29455-29506)
[»] scaffold1124 (2 HSPs)
scaffold1124 (332-496)||(1881-2045)
scaffold1124 (11-96)||(2291-2376)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (11-97)||(1904-1990)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (35-129)||(13325-13419)
scaffold0138 (384-500)||(12942-13057)
scaffold0138 (10-124)||(29836-29950)
scaffold0138 (10-124)||(41832-41946)
scaffold0138 (148-189)||(13255-13296)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (11-97)||(46346-46432)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (11-96)||(3254-3339)
scaffold0158 (11-96)||(6920-7005)
[»] scaffold0029 (9 HSPs)
scaffold0029 (11-96)||(13173-13258)
scaffold0029 (328-400)||(12859-12931)
scaffold0029 (337-480)||(11305-11450)
scaffold0029 (10-98)||(61241-61329)
scaffold0029 (65-123)||(125797-125855)
scaffold0029 (154-189)||(61386-61421)
scaffold0029 (156-189)||(65304-65337)
scaffold0029 (66-123)||(105563-105620)
scaffold0029 (10-98)||(65157-65245)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (383-484)||(1048-1151)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (35-197)||(437-609)
scaffold1984 (428-496)||(133-201)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (383-496)||(2808-2923)
scaffold0628 (35-125)||(2445-2535)
scaffold0628 (148-190)||(2567-2609)
[»] scaffold0621 (4 HSPs)
scaffold0621 (428-500)||(6535-6607)
scaffold0621 (355-481)||(8485-8613)
scaffold0621 (35-129)||(6922-7015)
scaffold0621 (30-98)||(8961-9029)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (31-91)||(10910-10970)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (30-126)||(45426-45522)
scaffold0125 (428-496)||(45841-45909)
scaffold0125 (148-189)||(45555-45596)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (11-73)||(595-657)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (11-97)||(1307-1393)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (35-129)||(5978-6072)
scaffold0278 (428-481)||(5662-5715)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (11-96)||(867-952)
[»] scaffold0555 (5 HSPs)
scaffold0555 (31-128)||(965-1062)
scaffold0555 (383-500)||(10543-10659)
scaffold0555 (35-103)||(10210-10278)
scaffold0555 (138-185)||(897-944)
scaffold0555 (148-190)||(10305-10347)
[»] scaffold0476 (4 HSPs)
scaffold0476 (12-97)||(5996-6081)
scaffold0476 (12-97)||(7191-7276)
scaffold0476 (384-500)||(12766-12884)
scaffold0476 (47-124)||(13233-13310)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (14-75)||(6038-6099)
[»] scaffold0297 (3 HSPs)
scaffold0297 (11-96)||(10440-10525)
scaffold0297 (11-96)||(15298-15383)
scaffold0297 (431-496)||(10575-10639)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (11-96)||(15968-16053)
scaffold0096 (10-111)||(14622-14723)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (428-500)||(6611-6683)
scaffold0333 (428-500)||(13991-14063)
scaffold0333 (35-129)||(6998-7092)
scaffold0333 (35-129)||(14378-14472)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (11-75)||(15837-15901)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (11-75)||(6697-6761)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (428-500)||(6172-6244)
scaffold0243 (36-123)||(5765-5852)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (45-129)||(43436-43520)
scaffold0116 (45-129)||(47356-47440)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (11-75)||(44486-44550)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (428-500)||(15826-15898)
scaffold0020 (35-129)||(15472-15566)
scaffold0020 (35-78)||(179085-179128)
scaffold0020 (447-481)||(178913-178947)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (12-71)||(830-889)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (337-481)||(4710-4856)
[»] scaffold0010 (8 HSPs)
scaffold0010 (35-129)||(130292-130386)
scaffold0010 (383-481)||(129924-130024)
scaffold0010 (424-484)||(60761-60821)
scaffold0010 (34-189)||(23513-23669)
scaffold0010 (10-124)||(242420-242534)
scaffold0010 (148-189)||(130222-130263)
scaffold0010 (51-122)||(60296-60367)
scaffold0010 (149-190)||(60479-60520)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (11-97)||(30364-30450)
scaffold0008 (429-496)||(14747-14814)
scaffold0008 (11-71)||(2292-2352)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (383-497)||(38704-38820)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (11-71)||(6543-6603)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (36-120)||(671-755)
scaffold0530 (428-500)||(1083-1155)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (11-75)||(16740-16804)
scaffold0216 (10-123)||(8506-8619)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (337-494)||(4300-4459)
scaffold0761 (11-78)||(5928-5995)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (11-97)||(1703-1789)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-97)||(4552-4638)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (328-447)||(15362-15483)
scaffold0107 (35-71)||(15072-15108)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (11-97)||(2240-2325)
scaffold0104 (11-97)||(9922-10007)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (47-129)||(10913-10995)
scaffold0078 (383-481)||(10546-10646)
scaffold0078 (148-190)||(10842-10884)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (428-481)||(1101-1154)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (11-189)||(18651-18830)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (11-96)||(18655-18740)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (11-75)||(1119-1183)
[»] scaffold0357 (6 HSPs)
scaffold0357 (383-484)||(13144-13247)
scaffold0357 (402-481)||(16121-16202)
scaffold0357 (429-484)||(2677-2732)
scaffold0357 (51-122)||(3162-3233)
scaffold0357 (51-126)||(13595-13670)
scaffold0357 (151-266)||(15866-15983)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (11-75)||(15107-15171)
scaffold0081 (11-97)||(24100-24189)
scaffold0081 (11-97)||(39524-39613)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (404-500)||(11464-11562)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (337-498)||(10772-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (351-497)||(13392-13539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (351-497)||(20747-20894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (351-497)||(37821-37968)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (429-484)||(129021-129075)
scaffold0022 (431-484)||(78338-78391)
scaffold0022 (383-497)||(116430-116544)
scaffold0022 (51-126)||(80726-80801)
scaffold0022 (149-189)||(128735-128775)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (337-497)||(106-268)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (11-97)||(4841-4927)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (47-129)||(7711-7793)
scaffold0507 (381-484)||(8059-8166)
scaffold0507 (148-190)||(7822-7864)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (11-97)||(35140-35226)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (427-481)||(25125-25179)
scaffold0123 (56-128)||(25568-25640)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (431-484)||(566-619)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (10-123)||(478-591)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (10-123)||(3505-3618)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (427-484)||(6332-6389)
scaffold0420 (434-484)||(13793-13843)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (56-129)||(12380-12453)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (11-96)||(8576-8661)
scaffold0101 (447-494)||(1393-1440)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (11-189)||(19485-19664)
scaffold0044 (402-497)||(40400-40496)
scaffold0044 (12-189)||(13201-13379)
scaffold0044 (42-123)||(8423-8504)
scaffold0044 (11-71)||(62676-62736)
scaffold0044 (154-190)||(62556-62592)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (11-189)||(10214-10393)
scaffold0004 (35-96)||(70211-70272)
scaffold0004 (65-124)||(58102-58161)
scaffold0004 (419-496)||(69794-69870)
scaffold0004 (47-122)||(332784-332859)
scaffold0004 (296-365)||(69930-70000)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (11-71)||(2217-2277)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (11-71)||(747-807)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (11-75)||(18921-18985)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (11-75)||(18072-18136)
[»] scaffold0109 (7 HSPs)
scaffold0109 (11-71)||(45534-45594)
scaffold0109 (11-128)||(10932-11049)
scaffold0109 (47-98)||(35524-35575)
scaffold0109 (65-123)||(27006-27064)
scaffold0109 (34-71)||(38472-38509)
scaffold0109 (10-111)||(43667-43768)
scaffold0109 (34-71)||(7468-7505)
[»] scaffold0017 (6 HSPs)
scaffold0017 (11-71)||(14943-15003)
scaffold0017 (34-189)||(56394-56550)
scaffold0017 (26-96)||(190915-190985)
scaffold0017 (26-96)||(192618-192688)
scaffold0017 (31-71)||(19485-19525)
scaffold0017 (154-190)||(192757-192793)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (351-497)||(13947-14094)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (40-122)||(2245-2327)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (11-97)||(9322-9408)
[»] scaffold0139 (4 HSPs)
scaffold0139 (427-477)||(38339-38389)
scaffold0139 (30-76)||(20418-20464)
scaffold0139 (51-126)||(38761-38836)
scaffold0139 (447-496)||(19980-20029)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (427-484)||(2691-2748)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (11-189)||(66045-66224)
scaffold0036 (11-71)||(71186-71246)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (11-189)||(24598-24777)
scaffold0012 (64-129)||(227877-227942)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (11-71)||(1853-1913)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (11-63)||(11430-11482)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-71)||(6900-6960)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (402-481)||(29948-30028)
scaffold0149 (11-49)||(4181-4219)
scaffold0149 (11-49)||(8612-8650)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (402-497)||(161156-161252)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (12-71)||(769-828)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (337-498)||(9241-9404)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (35-78)||(26834-26877)
scaffold0198 (419-496)||(23843-23919)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (35-78)||(36034-36077)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (35-78)||(36891-36934)
scaffold0131 (447-496)||(36454-36503)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (429-484)||(97021-97076)
scaffold0006 (429-484)||(106299-106354)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (10-124)||(5427-5541)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (11-128)||(2258-2375)
scaffold0546 (34-71)||(5802-5839)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (47-129)||(24174-24256)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (14-71)||(6432-6489)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (30-71)||(17361-17402)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (10-123)||(14169-14282)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (12-61)||(2304-2353)
scaffold0013 (65-123)||(9704-9762)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (427-484)||(267676-267733)
scaffold0005 (42-123)||(307460-307541)
scaffold0005 (47-126)||(268116-268195)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (402-497)||(4214-4310)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (337-499)||(12249-12413)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (11-71)||(2065-2125)
scaffold0439 (11-71)||(9925-9985)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (11-71)||(15759-15819)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (11-71)||(191946-192006)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (41-124)||(12785-12868)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (47-98)||(29177-29228)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (51-126)||(103241-103316)
scaffold0040 (427-481)||(103679-103733)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (34-189)||(226-382)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (10-124)||(17361-17475)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (34-128)||(18013-18107)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (34-128)||(12112-12206)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (65-123)||(10541-10599)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (351-497)||(12064-12205)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (11-189)||(3160-3339)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (35-71)||(1098-1134)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (35-71)||(36721-36757)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (44-96)||(32849-32901)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (381-496)||(4804-4921)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (47-126)||(7118-7197)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (154-189)||(4875-4910)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (66-129)||(24660-24723)
scaffold0256 (66-124)||(19817-19875)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (12-111)||(3148-3247)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (56-98)||(55271-55313)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (429-479)||(206575-206624)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (455-484)||(1874-1903)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (36-77)||(9081-9122)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (67-123)||(3073-3129)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (39-123)||(37071-37155)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (394-473)||(29117-29198)


Alignment Details
Target: scaffold0456 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 10075 - 10544
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10075 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 10174  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10175 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccatt 10274  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10275 gttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatga 10374  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10375 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtata 10474  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10475 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32536 - 32067
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32536 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatgagattgaacctggaatt 32437  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  32436 aaacttgtgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttacttttttgattttgcgaccttt 32337  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32336 gttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttga 32237  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtat 429  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32236 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgttt 32137  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32136 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 701 - 1170
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  701 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 800  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  801 aaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaaccttt 900  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  901 gttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttga 1000  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1001 ttatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgttgtata 1100  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1101 ctgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 145)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20309577 - 20309108
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309577 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctggatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 20309478  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20309477 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgaccctt 20309378  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20309377 gttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga 20309278  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20309277 ttatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtata 20309178  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309177 ctgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 37765 - 38235
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37765 gtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtaggatgagattgaacctggaatt 37864  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37865 aaacttgtgagattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgacttgttagactttgcgaccttt 37964  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  37965 gttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttga 38064  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgta 428  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  38065 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgta 38164  T
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38165 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23286329 - 23285865
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  23286329 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacatggaatgaaaa 23286230  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286229 ttgtgagattatgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 23286130  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    |   |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  23286129 catgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 23286030  T
Q  335 gatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactg 433  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23286029 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactg 23285931  T
Q  434 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285930 cctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 23654052 - 23654507
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654052 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 23654151  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654152 tgttgggattctgacttgaactcgccacggcgagca-------------cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 23654238  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  23654239 cacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattat 23654338  T
Q  335 gatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtata 430  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||     
T  23654339 gatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatg 23654438  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654439 ctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 298457 - 298933
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          
T  298457 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatataggatgagattgaacctggaaagattt 298556  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcg 224  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298557 agaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcg 298656  T
Q  225 acctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgt 324  Q
    ||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  298657 acctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgt 298756  T
Q  325 tgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg 423  Q
    |  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||    
T  298757 tattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctg 298856  T
Q  424 ---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  298857 attttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 22737822 - 22738300
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          
T  22737822 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagattg 22737921  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22737922 tagaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggttttgc 22738021  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22738022 gacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 22738121  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  22738122 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 22738221  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22738222 gtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 22730875 - 22731355
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  22730875 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 22730974  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22730975 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaacagagtgccttgttaggttttgc 22731074  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaaccct-tgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    || ||||||||| | || ||| || | ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22731075 gatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 22731174  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  22731175 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 22731274  T
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22731275 tgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23076919 - 23076442
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  23076919 ttttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagattt 23076820  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcg 224  Q
        | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23076819 agaatgaaactt-tggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcg 23076721  T
Q  225 acctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgt 324  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  || || || || | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||     
T  23076720 acctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttga 23076621  T
Q  325 tgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tg 420  Q
    || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||   ||    
T  23076620 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 23076521  T
Q  421 ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  23076520 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22337591 - 22337115
Alignment:
Q  38 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa--------- 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  22337591 tgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatttaga 22337492  T
Q  129 -ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgac 226  Q
     | |||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||    
T  22337491 atgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgac 22337392  T
Q  227 ctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttg 326  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  22337391 ctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatg 22337292  T
Q  327 atgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgtt 422  Q
     ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||    
T  22337291 ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 22337192  T
Q  423 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22337191 tttatatacagcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23660501 - 23660023
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  23660501 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 23660402  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  23660401 tagaatgaaacttttggaat-ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttg 23660303  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
     ||||||| |||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||| | || | |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  23660302 tgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgtt 23660203  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||      
T  23660202 gatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcc 23660103  T
Q  422 tgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23660102 tgtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27754054 - 27753728
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  27754054 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 27753955  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27753954 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgc 27753855  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||    
T  27753854 gaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttg 27753755  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat 350  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  27753754 atgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 483
Target Start/End: Original strand, 32451571 - 32452033
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||          
T  32451571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatggaaagattg 32451670  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32451671 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 32451770  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| ||||||||||| || |  |||||     
T  32451771 gacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgt-tatgggatgtta 32451869  T
Q  324 ttgatga-ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg- 420  Q
     || ||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||     
T  32451870 atgttgatttatgatgtgatattatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattgttatgtcatgc 32451968  T
Q  421 --ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 483  Q
      || ||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451969 tatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  199 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 298  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||  | |||||| |||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  299 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 397  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  23060716 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 23060618  T
Q  398 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23060617 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  495 tgatgt 500  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 383 - 500
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Original strand, 23071614 - 23071768
Alignment:
Q  44 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||| |||    
T  23071614 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaa 23071713  T
Q  134 cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23071714 atttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 28291940 - 28292027
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28291940 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtagaatgagatt 28292027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Original strand, 22133859 - 22133948
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22133859 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 22133948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24658139 - 24658055
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  24658139 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 24658055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708721
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 245  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||||||     
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  246 gagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 343  Q
    || ||||||||| | |||| | | | |||| ||  | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgata 23708580  T
Q  344 taatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgt 440  Q
    ||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  23708581 taattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgt 23708680  T
Q  441 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708681 tgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 25963336 - 25963451
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || |||     
T  25963336 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 25963435  T
Q  111 atgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  25963436 atgagattgaacctgg 25963451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25176321 - 25176227
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||    
T  25176321 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacctggaat 25176227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 45677774 - 45677838
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45677774 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 45677838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 496
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 390  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  391 atgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 488  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |    
T  40622222 atgaattg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatta 40622319  T
Q  489 agatgatg 496  Q
    ||||||||    
T  40622320 agatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 21917935 - 21918021
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21917935 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21918021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 37525164 - 37525078
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  37525164 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 37525078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24674076 - 24674012
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24674076 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgcct 24674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7679702 gatgttgatgactt-acattgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 7679604  T
Q  482 atgttgaagatgatg 496  Q
     || | |||||||||    
T  7679603 ttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 40621827 - 40621888
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40621827 cagagagcatgttgaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 40621888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  481 gatg 484  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 424 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28406436 - 28406368
Alignment:
Q  57 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  28406436 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 28406368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19671928 - 19671830
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671928 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 22811553 - 22811639
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22811553 cagagagcatgttaaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 22811639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 494
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 436 - 500
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  436 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 499
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 428 - 499
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 22460843 - 22460999
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  22460843 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 22460941  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22460942 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22460999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27263727 - 27263610
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || |||     
T  27263727 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttaga 27263628  T
Q  111 atgagattgaacctggaa 128  Q
    | ||||||||||||||||    
T  27263627 acgagattgaacctggaa 27263610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 571493 - 571397
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571493 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 6726091 - 6725995
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726091 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 21327196 - 21327256
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21327196 cagagagcatgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 21327256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24175287 - 24175227
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24175287 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24175227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367790
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030016
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029968 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15478081 - 15477901
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| | ||||||||    
T  15478081 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagttatgattagggatgaatgtag 15477982  T
Q  110 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |   ||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15477981 ggcaagattgaacctagaa-caatcttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15477901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 22798745 - 22798831
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22798745 cagaaagcatgtctaattctatacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22798831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 43137395 - 43137301
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137395 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 19928155 - 19928311
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  19928155 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 19928253  T
Q  134 ctt-gt-gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||| || |||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19928254 cttagtcgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19928311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 22740579 - 22740664
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22740579 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22740664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 22758334 - 22758419
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22758334 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22758419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 24654967 - 24655032
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctg-tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24654967 cagagagcatgtcgaattttcctattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 24655032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 30970608 - 30970709
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  30970608 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 30970707  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  30970708 ga 30970709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 21318265 - 21318325
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21318265 cagagatcatgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 21318325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 24716160 - 24716339
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||| | | || | ||     
T  24716160 cagagagcatgttgaatttcgtaatctggacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgact-taa 24716258  T
Q  110 gatgagattgaacctggaatta-aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     | ||||||||||||||||| |  | |  ||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24716259 aacgagattgaacctggaataaccaatgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24716339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24870367 - 24870307
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24870367 cagagagcgtgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24870307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  448 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  448 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  448 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  448 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  448 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 40428952 - 40428892
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428952 cagagagcatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 40428892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12829545 - 12829434
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  12829545 agagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 12829446  T
Q  112 tgagattgaacc 123  Q
    | ||||||||||    
T  12829445 tcagattgaacc 12829434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 37318751 - 37318652
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37318751 cagagagcatgtaggattttgtatttttgaccttttagttggaccttgagcgcttatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 37318652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 21138903 - 21139013
Alignment:
Q  13 gagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  21138903 gagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgac 21139002  T
Q  113 gagattgaacc 123  Q
     ||||||||||    
T  21139003 aagattgaacc 21139013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24503587 - 24503473
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24503587 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24503488  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  24503487 gacaagattgaacct 24503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26125679 - 26125562
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  26125679 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-ag 26125581  T
Q  110 gatgagattgaacctggaa 128  Q
     ||||||||||||||||||    
T  26125580 aatgagattgaacctggaa 26125562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 10327333 - 10327273
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  10327333 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttccattcttttgagt 10327273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23187551 - 23187491
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23187551 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23187491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23598814 - 23598754
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23598814 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 494
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24735879 - 24735827
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 63  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735879 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgc 24735827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 188
Target Start/End: Original strand, 22133977 - 22134020
Alignment:
Q  145 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133977 ctgaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 22740717 - 22740768
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22740717 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Original strand, 23019328 - 23019411
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23019328 agagcttgtagatttctgtatgtttgacttttgagttgaaccttcgatgtgtttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 23019411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 430 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Original strand, 39827602 - 39827648
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39827602 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaag 39827648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 10101274 - 10101387
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||    
T  10101274 gcagagagcatgttggattttgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtag 10101373  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  10101374 gatcagattgaacc 10101387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 21146918 - 21147031
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  21146918 gcagagagcttgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtag 21147017  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||  ||||||||||    
T  21147018 gacaagattgaacc 21147031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 473
Target Start/End: Original strand, 22799126 - 22799220
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||   |||||||   ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22799126 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23207817 - 23207744
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  23207817 gaactttagatgattatgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 23207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 24640590 - 24640691
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  24640590 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgccagaacaaacctagtaatgattagggatgaatgtag 24640689  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  24640690 ga 24640691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616204
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  478 taag 481  Q
    ||||    
T  25616207 taag 25616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 41667402 - 41667365
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41667402 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41667365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 61291 - 61231
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  61291 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagt 61231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27197360 - 27197248
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    ||||||||||| | ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27197360 agagagcatgtaggattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 27197261  T
Q  112 tgagattgaacct 124  Q
      |||||||||||    
T  27197260 caagattgaacct 27197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27602274 - 27602186
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   | | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  27602274 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 27602186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 12901286 - 12901321
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901286 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12901321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Original strand, 18786445 - 18786540
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||| |||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  18786445 tgtagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacacgtatattattgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 18786540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19672369 - 19672318
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  19672369 agttgaaccttagatgattttgagtgtttgaatatgtataataatgattagg 19672318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 22412717 - 22412792
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  22412717 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 22412792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23038511 - 23038468
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23038511 ttttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaa 23038468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 23100873 - 23100916
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  23100873 ttttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaa 23100916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23171460 - 23171413
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23171460 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23171413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23582717 - 23582670
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23582717 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23582670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Original strand, 23708261 - 23708328
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 102  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  23708261 ttttgacccttgagttgatctttagatgtttttgagtgtctgaacatatgtattaatgattaggaaag 23708328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 24628252 - 24628287
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24628287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24649689 - 24649654
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24649689 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24649654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 27379206 - 27379241
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27379206 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27379241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 27383252 - 27383287
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27383252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27383287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27602129 - 27602094
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27602129 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27602094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 41530783 - 41530818
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41530783 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 41530818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23005263 - 23005221
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23005263 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 23005221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 427
Target Start/End: Original strand, 23019706 - 23019752
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 427  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23019706 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgt 23019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28406335 - 28406297
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 186  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28406335 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29233982 - 29233904
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29233982 ttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29233904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29347281 - 29347203
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29347281 ttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29347203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 34137454 - 34137412
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34137454 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 34137412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Original strand, 18546536 - 18546593
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  18546536 cttttgggtcgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattagg 18546593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Original strand, 24628107 - 24628168
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24628107 gcagagagcatgttagattttgtgtttcggccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24628168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25176199 - 25176158
Alignment:
Q  147 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  25176199 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 25176158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 41604391 - 41604460
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41604391 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 41604460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 41610288 - 41610357
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41610288 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 41610357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 78
Target Start/End: Original strand, 44369952 - 44369985
Alignment:
Q  45 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44369952 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 44369985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 12901141 - 12901229
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12901141 gcagagaacatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 12901229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 63
Target Start/End: Original strand, 18855115 - 18855143
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855115 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 18855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23038107 - 23038048
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038107 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  153 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 186)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 40443860 - 40443393
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40443860 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctggaatt 40443761  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  40443760 aa-cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattggattttgcgaccttt 40443662  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  40443661 gttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttga 40443562  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtat 429  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  40443561 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgttt 40443462  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443461 actgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 27847482 - 27847951
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27847482 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctggaatt 27847581  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847582 aaacttatgggattttgacctgaactcgccacggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 27847681  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27847682 gttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga 27847781  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |    
T  27847782 ttatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgttgtaca 27847881  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847882 ctgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 500
Target Start/End: Original strand, 16385895 - 16386369
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385895 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 16385994  T
Q  130 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385995 taaacttgtgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 16386094  T
Q  230 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 329  Q
    ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  16386095 tgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttg 16386194  T
Q  330 attatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---tt 425  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||   ||    
T  16386195 attatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgatttt 16386294  T
Q  426 gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386295 gtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 9509668 - 9509189
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  9509668 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 9509569  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9509568 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgc 9509469  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9509468 gacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 9509369  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  9509368 atgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 9509269  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9509268 gttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12699311 - 12698831
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||          
T  12699311 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaaagattg 12699212  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12699211 ttgaatgaaactcgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaaacaaagtgacttgttaggttttgc 12699112  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12699111 gacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 12699012  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12699011 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 12698912  T
Q  423 g----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12698911 gtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 30 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26212469 - 26211995
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212469 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 26212370  T
Q  130 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgacttgttagattttgcgacct 228  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26212369 gaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgatttgttag-ttttgcgacct 26212271  T
Q  229 ttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgat 328  Q
    ||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  26212270 ttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgtt 26212171  T
Q  329 gattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---t 424  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |    
T  26212170 gattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattt 26212071  T
Q  425 tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212070 tgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 38227959 - 38227481
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  38227959 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 38227860  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
        | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38227859 agaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgc 38227760  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  38227759 gacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttg 38227660  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  38227659 atgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 38227560  T
Q  423 g--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38227559 gttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 155 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 10589386 - 10589039
Alignment:
Q  155 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  10589386 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgg 10589287  T
Q  255 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 354  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589286 acctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatg 10589187  T
Q  355 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 451  Q
    |||| ||||||||||||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10589186 cattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgtt 10589088  T
Q  452 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589087 atttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 3564006 - 3564482
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       
T  3564006 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 3564105  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
           ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3564106 tagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 3564205  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||    
T  3564206 gacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttg 3564305  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  3564306 atgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgtt 3564405  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3564406 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 481
Target Start/End: Original strand, 15143686 - 15144139
Alignment:
Q  42 ttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----tta----- 131  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||     |||         
T  15143686 ttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctggaaagattttagaatg 15143785  T
Q  132 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgaccttt 230  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15143786 aacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgaccttt 15143885  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatg 329  Q
    ||||| | |||||   |||||||||||   |||||| | ||||||||||| || | ||| | |||||||||| |||||| | |||||| | |||    ||    
T  15143886 gttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattg 15143985  T
Q  330 attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgtt 425  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||| | |||||||| ||  ||| | |||||||||| || ||    |||| ||    
T  15143986 attatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttatt 15144085  T
Q  426 gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    | ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144086 gcatactg-agatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 497
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  288 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  387 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  485 ttgaagatgatga 497  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 17061602 - 17062077
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  17061602 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattt 17061701  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agatttt 221  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||   ||||||    
T  17061702 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggatttt 17061799  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatat 319  Q
    |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||   ||||  ||||| || ||||||||||||| | || |||      
T  17061800 gcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccatggggtagttatgaata-ttacatataatattaataatgatctgtgaagctgatttatgatga 17061898  T
Q  320 gttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca 418  Q
     ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17061899 tttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  419 tg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||   | |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17061998 tgctattttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Original strand, 15754527 - 15754622
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15754527 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa 15754622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 28504938 - 28505106
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg---- 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  28504938 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaa 28505037  T
Q  126 ------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28505038 gacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44116983 - 44116816
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc----------t 124  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||          |    
T  44116983 ttttgactcttgagttgatccttatatgcctttgagtccctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccggaaagattt 44116884  T
Q  125 ggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 193  Q
     |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116883 agaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 44116816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 12756359 - 12756523
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga------- 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  12756359 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattattta 12756458  T
Q  128 --attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
      | | ||||| | |||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12756459 agaatgaactttttggaagctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12756523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 2831948 - 2832110
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||    
T  2831948 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagactt 2832047  T
Q  131 a-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |     |||||  | || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2832048 agaatgaactttggagaatctga-ctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 9751192 - 9751285
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9751192 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgaggttgaacctggaa 9751285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 39267288 - 39267447
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  39267288 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagactt 39267387  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 185  Q
        | ||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39267388 agaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18302657 - 18302564
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302657 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18302564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34201266 - 34201172
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34201266 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttagaatgagattgaacctg 34201172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44014653 - 44014560
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  44014653 ttttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 44014560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Original strand, 11995696 - 11995768
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995696 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 17137682 - 17137768
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17137682 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 17137768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 810771 - 810864
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  810771 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacctggaa 810864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  331 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 426  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 496
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138177
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 395  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  396 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  17138077 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 10508701 - 10508786
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  10508701 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 10508786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 68225 - 68131
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  68225 ttttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 68131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2760628 - 2760542
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2760628 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 2760542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3272288 - 3272202
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  3272288 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 3272202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  405 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 47832287 - 47832193
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||    
T  47832287 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatctggaat 47832193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11880753 - 11880668
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  11880753 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 11880668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12187514 - 12187429
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  12187514 cagagaacatgttgaattctgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 12187429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9703767 - 9703703
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9703767 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 9703703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14430379 - 14430315
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14430379 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcct 14430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15211928 - 15211844
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  15211928 agagagcatgttgaattctgtactcttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttataaatgatta 15211844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 500
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 478  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  479 aagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18006120 - 18006052
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18006120 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaaga 18006052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187019
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 395  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  396 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 491  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| |||   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  12187119 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaaga 12187024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  480 agatgttgaagatgatga 497  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 12321361 - 12321447
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12321361 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12321447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16324485 - 16324391
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  16324485 ttttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacctggaat 16324391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 450  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  451 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 9389332 - 9389431
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  9389332 tgtacttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 9389431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 15754910 - 15755008
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754910 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 16219358 - 16219452
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  16219358 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaat 16219452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  481 g 481  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26292871 - 26292692
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || |||     
T  26292871 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttaga 26292772  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  26292771 atgagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgag 26292692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15581168 - 15581108
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15581168 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15581108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44116605 - 44116509
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116605 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 447
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  382 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 496
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22073383 - 22073301
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  22073383 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctagaat 22073301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 4318174 - 4318287
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4318174 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtag 4318273  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||  ||||||||||    
T  4318274 gacaagattgaacc 4318287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Original strand, 12255454 - 12255527
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  12255454 ttagatgattttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaat 12255527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 11313124 - 11313064
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11313124 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11313064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12318603 - 12318543
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12318603 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagt 12318543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 13635099 - 13635159
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13635099 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 13635159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 15604902 - 15604962
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15604902 cagagagcatgtcgaattctgagcttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15604962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410059
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13149607 - 13149451
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  13149607 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 13149509  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13149508 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13149451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24054950 - 24054884
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  24054950 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 24054884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 44407988 - 44408102
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44407988 gcagagagcatgtaagattttgaaatttcgactttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 44408087  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  44408088 gacaagattgaacct 44408102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 125
Target Start/End: Original strand, 2279781 - 2279850
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  2279781 ttagatgattttgagtgcctgaacatgcataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 2279850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 6016800 - 6016901
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6016800 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 6016899  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  6016900 ga 6016901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 9445788 - 9445848
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9445788 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgctttcgagt 9445848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869346
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 17701275 - 17701335
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17701275 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17701335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 129
Target Start/End: Original strand, 21064814 - 21064898
Alignment:
Q  45 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||    
T  21064814 tgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggaaatattttagaatgagattgaacttggaat 21064898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 42205590 - 42205530
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42205590 cagagagcttgtcgaattttataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 42205530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 2529631 - 2529682
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2529631 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 2529682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16583709 - 16583650
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16583709 agagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16583650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 18154479 - 18154522
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18154479 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 18154522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 19486767 - 19486865
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486767 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 19649127 - 19649170
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19649127 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19649170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 481
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6801665 - 6801509
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| |  |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  6801665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctacttttgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 6801567  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6801566 cttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6801509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 428 - 478
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 478  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14953674 - 14953560
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14953674 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14953575  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  14953574 gacaagattgaacct 14953560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 481
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154943
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 20702651 - 20702733
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20702651 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 20702733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26420454 - 26420340
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26420454 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 26420355  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  26420354 gacaagattgaacct 26420340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32768120 - 32768038
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32768120 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 32768038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 8917879 - 8917842
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917879 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 8917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13462214 - 13462177
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462214 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13462177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  405 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14959611 - 14959526
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14959611 gactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 14959526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16056684 - 16056616
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag 216  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  16056684 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttag 16056616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 16724261 - 16724321
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16724261 cagagagcatgtcaaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16724321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 35152081 - 35152021
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35152081 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 35152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16275944 - 16275850
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  16275944 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-gggatgatattgaacctggaa 16275850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18302533 - 18302494
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18302533 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 810894 - 810936
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  810894 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9593798 - 9593704
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  9593798 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 9593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9644761 - 9644667
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  9644761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 9644667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16056795 - 16056713
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||| | |||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  16056795 agttgagctttaggtgattttgtgtacctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaat 16056713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 16438687 - 16438843
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  | |||| || |||||||| ||   | ||| |||||||| |||||| ||  ||     
T  16438687 tttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtatctactattgattagggaatgttttagaatgagattaaacctgaaac-aac 16438785  T
Q  134 cttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16438786 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16438843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11080
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11043 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 18711 - 18748
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18711 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 11547953 - 11548010
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11547953 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11548010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 11554549 - 11554606
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11554549 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11554606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 11987665 - 11987628
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11987665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11987628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14045281 - 14045212
Alignment:
Q  57 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14045281 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14045212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14149017 - 14148932
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||| |||||   ||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14149017 gactttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 14148932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14355311 - 14355242
Alignment:
Q  57 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14355311 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14355242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 14655082 - 14655147
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14655082 agttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14655147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15728777 - 15728740
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15728777 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15728740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 20569226 - 20569311
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  | ||||||| ||| |||||    
T  20569226 cagagagcatgttgattttcgtattttgaacttttgagttgaacttttgatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagatta 20569311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22073272 - 22073223
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 197  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22073272 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 70431 - 70507
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  70431 agttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 70507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 74539 - 74615
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  74539 agttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 74615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9410421 - 9410321
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||| |||||    || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9410421 gcagagagcatgttggatttcgtattttcgactttttagttggaccttgagcgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaagaatgaatgtag 9410322  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  9410321 g 9410321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Original strand, 9389462 - 9389501
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9389462 ctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9389501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Original strand, 9751316 - 9751355
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9751316 ctgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Original strand, 11238655 - 11238702
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  11238655 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 11238702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Original strand, 11995796 - 11995835
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995796 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 11995835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12692917 - 12692858
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  12692917 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtcggacaagattgaacct 12692858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12719001 - 12718966
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12719001 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12718966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12723912 - 12723877
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12723912 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12901852 - 12901793
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12901852 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12901793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 496
Target Start/End: Original strand, 14932747 - 14932851
Alignment:
Q  394 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 490  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  14932747 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 14932845  T
Q  491 atgatg 496  Q
    ||||||    
T  14932846 atgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 496
Target Start/End: Original strand, 15356182 - 15356286
Alignment:
Q  394 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 490  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  15356182 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 15356280  T
Q  491 atgatg 496  Q
    ||||||    
T  15356281 atgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 496
Target Start/End: Original strand, 15360296 - 15360400
Alignment:
Q  394 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 490  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  15360296 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 15360394  T
Q  491 atgatg 496  Q
    ||||||    
T  15360395 atgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 16906974 - 16907009
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16906974 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16907009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 122
Target Start/End: Original strand, 17017045 - 17017120
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  17017045 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 17017120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 17137820 - 17137871
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17137820 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17137871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18279736 - 18279701
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18279736 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18279701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18283699 - 18283664
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18283699 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18283664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34201138 - 34201099
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34201138 ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33553 - 33471
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || | |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  33553 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 33471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 68099 - 68061
Alignment:
Q  151 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  68099 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 68061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 9177252 - 9177318
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  9177252 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggtaagtttttagattgagattgaac 9177318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 485
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11262749 - 11262691
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11262749 ttgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 11262691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 11768526 - 11768568
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11768526 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 11768568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 12255556 - 12255598
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12255556 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12255598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 97
Target Start/End: Original strand, 15008102 - 15008148
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15008102 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattag 15008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 25038895 - 25038953
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25038895 ttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25038953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 481
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898523
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Original strand, 1867650 - 1867719
Alignment:
Q  57 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  1867650 tagatgttttttagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 1867719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7536662 - 7536561
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  7536662 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 7536563  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  7536562 ga 7536561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18531665 - 18531608
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  18531665 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 18531608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18557424 - 18557387
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18557424 tttttgacttttgagttgaaccttagaggcctttgagt 18557387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44014530 - 44014489
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  44014530 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 48593085 - 48593146
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttt-tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  48593085 cagagagcatgtcgaattctgagttttttgacttttgagttgaaccttggatgtctttgagt 48593146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 499
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 15114 - 15584
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15114 gtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaata 15213  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15214 aaacttgtaggattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 15313  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15314 gttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 15413  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgta 428  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15414 ttatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgta 15513  T
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15514 tactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7295
Alignment:
Q  332 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattg-at-attattatgtcatgttgttgtat 429  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||   ||||||||||     
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttgtataattatcatg-attgttgttgtaa 7361  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7360 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7789 - 7705
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  7789 agagaacatgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 7705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 32914 - 32968
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtct 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32914 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaacatgtct 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 165)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 14052951 - 14053422
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14052951 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacttggaatt 14053050  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053051 aaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 14053150  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  14053151 gttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttga 14053250  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag-atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgta 428  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14053251 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgta 14053350  T
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053351 tactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12903224 - 12902757
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12903224 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 12903126  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12903125 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttg 12903026  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  12903025 cacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 12902926  T
Q  335 gatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtata 430  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  12902925 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 12902826  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902825 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7089345 - 7088877
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7089345 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 7089246  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7089245 ttatgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttg 7089146  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||    
T  7089145 caagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattat 7089046  T
Q  335 gatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtata 430  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  7089045 gatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 7088946  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088945 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44053308 - 44052829
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||          
T  44053308 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattgggaaagaatgtaggatgagattgaacctgtaaagatta 44053209  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44053208 taggatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgc 44053109  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  44053108 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctg 44053009  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 418  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  44053008 atgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 44052910  T
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  44052909 tgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3097111 - 3096772
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3097111 ttttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 3097012  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097011 ttgtgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 3096912  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  3096911 cacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattat 3096812  T
Q  335 gatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttg 374  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3096811 gatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 35 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22636913 - 22636437
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  22636913 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaaattg 22636814  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22636813 tagaatgaaacttgtgggattctgacttgacctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgc 22636714  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22636713 gacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttg 22636615  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  22636614 atgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 22636515  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22636514 gtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 17047702 - 17048055
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17047702 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggaaaaaatgtagg 17047801  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17047802 atgagattgaac-tggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgcct 17047900  T
Q  211 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  |||||| || ||||||||||||    
T  17047901 tgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgt 17048000  T
Q  311 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 364  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17048001 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 16377164 - 16377639
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |       
T  16377164 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctggaatgatcg 16377263  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
           ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  16377264 tagaatgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgc 16377363  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgt-cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
     ||||||||||| | |||| |  |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||    
T  16377364 tacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgtt 16377463  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||     
T  16377464 gatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 16377563  T
Q  422 tg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16377564 tgtttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14039128 - 14038653
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||          
T  14039128 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagattt 14039029  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14039028 tagaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttg 14038929  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||| || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  14038928 cgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgtt 14038829  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  14038828 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgt 14038729  T
Q  422 tg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 495  Q
    ||   ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  14038728 tgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 263 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  263 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattactt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  363 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 17046525  T
Q  463 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046524 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 148 - 493
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374473
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttga 23374224  T
Q  248 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 347  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23374225 ggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataat 23374324  T
Q  348 g-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgc 443  Q
    |  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23374325 gttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgc 23374424  T
Q  444 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374425 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 131 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7894073 - 7893703
Alignment:
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  7894073 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctt 7893974  T
Q  230 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 329  Q
    ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||    
T  7893973 tgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagat---gtgttgctg 7893877  T
Q  330 attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgtt 425  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||    
T  7893876 attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 7893777  T
Q  426 gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893776 gtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 177 - 500
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240090
Alignment:
Q  177 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  276 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttg 374  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||| ||| |||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  375 tatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 472  Q
     |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  473 cggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15091376 - 15091093
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  15091376 ttttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtttctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaggattt 15091277  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15091276 tagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttg 15091177  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaag 306  Q
    ||| || ||| || ||||||    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  15091176 cgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7799176 - 7798967
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||          
T  7799176 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggacataatgtaggatgagattgaacctggaaagtttg 7799077  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  7799076 tagaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttaggttttgc 7798977  T
Q  224 gacctttgtt 233  Q
    ||||||||||    
T  7798976 gacctttgtt 7798967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 44928565 - 44929042
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  44928565 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 44928664  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agatttt 221  Q
      |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||   ||||||    
T  44928665 tagaatgaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttaggatttt 44928762  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagata 318  Q
    |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| |  |||||  ||| || | | ||| ||||  ||||| || ||||||||||||| | || |||     
T  44928763 gcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatg 44928860  T
Q  319 tgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 417  Q
      ||  || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||    
T  44928861 attttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtc 44928960  T
Q  418 a---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |   |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44928961 atgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 500
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  291 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 389  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  390 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 487  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  488 aagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 319 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  319 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 417  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  418 atgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15552296 - 15552199
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15552296 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa 15552199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16597133 - 16597031
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16597133 attctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16597034  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  16597033 gaa 16597031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44102688 - 44102520
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||             
T  44102688 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgattatg-aagaatgtaggatgagattgaacctggatagattt 44102590  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 194  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102589 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 44102520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6190912 - 6190819
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190912 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa 6190819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24029220 - 24029057
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||             
T  24029220 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagactt 24029121  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24029120 agaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 13812451 - 13812614
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          
T  13812451 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtaggatgagattgaacctggaaagactt 13812550  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
        | ||||||  | || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13812551 agaatgaaactttggagaatctgac-taaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 20156932 - 20157025
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20156932 ttttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 20157025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 22633855 - 22633948
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22633855 ttttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22633948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190479
Alignment:
Q  183 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataa 282  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |  |    
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaata 6190683  T
Q  283 taaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgat-tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacat 381  Q
    | |  ||||||| |||  |||||||||| || || |||||  || |||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||  || |||  |    
T  6190682 tgatattaattacaattcgtgaagctgt-tatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataatt 6190584  T
Q  382 aagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
     ||||| ||| |   || | ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6190583 gagatgattgttcgctt-acattgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtc 6190485  T
Q  478 taagat 483  Q
    ||||||    
T  6190484 taagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 331 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--g 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 16239634 - 16239728
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag-aatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16239634 ttttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtagaatgagattgaacctggaa 16239728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 500
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  478 taagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15551915 - 15551817
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551915 gatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 21814945 - 21815109
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||   |||||    
T  21814945 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatta 21815044  T
Q  132 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
          ||||| | |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815045 agaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 21815274 - 21815438
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||   |||||    
T  21815274 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctggattaatta 21815373  T
Q  132 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
          ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815374 agaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 21818367 - 21818531
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||   |||||    
T  21818367 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatta 21818466  T
Q  132 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
          ||||| | |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21818467 agaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21818531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12774477 - 12774385
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12774477 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacctgga 12774385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 16356572 - 16356658
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16356572 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 16356658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096293
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8846854 - 8846761
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  8846854 ttttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 8846761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 351 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353835
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353884 -gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 39705930 - 39706024
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||    
T  39705930 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacctggaat 39706024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 484
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13956
Alignment:
Q  331 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 427  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 16348311 - 16348375
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348311 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16348375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 15121422 - 15121508
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15121422 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15121508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44676132 - 44676047
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  44676132 cagagagcatgtagaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 44676047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13570012 - 13569948
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13570012 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 328 - 496
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121917
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg----ttg 423  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||    |||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattattg 15121845  T
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||  ||||||||| || |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  15121846 ttgtaatctgcctatgctgat-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  480 agatgttgaagatgatga 497  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 481
Target Start/End: Original strand, 52242856 - 52243298
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taaacttg------tgggattc 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    |||   ||      ||||| |     
T  52242856 ttagatgatttcgagtgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagtt 52242955  T
Q  146 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 243  Q
      ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  52242956 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcg 52243054  T
Q  244 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 341  Q
    |  ||||||||||  | |||||| | | |||| |  |||| |   ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||    
T  52243055 taaagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagata-ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtga 52243153  T
Q  342 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcct 436  Q
    ||||||  | ||||||||||||| |  |||| || ||   | |||||||| ||||||  | |||||||| |||| |||||   ||  ||| |||||||||    
T  52243154 tataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcct 52243253  T
Q  437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243254 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15094273 - 15094187
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15094273 cagaaagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15094187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 425  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  426 -gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23843979 - 23843894
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  | |||||||||    
T  23843979 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttcattaatgatta 23843894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12570521 - 12570457
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12570521 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 12570457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15099834 - 15099735
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  15099834 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 15099735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  480 agatgttgaagatgatga 497  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 16487697 - 16487783
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16487697 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgggtgcctaaagatgtttattaaagattag 16487783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Original strand, 43198242 - 43198324
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||    
T  43198242 agttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttagattgagattgaacatggaat 43198324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13845018 - 13844950
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13845018 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaaga 13844950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 503  Q
    |  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 499
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 36133592 - 36133652
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36133592 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36133652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Original strand, 15868289 - 15868368
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  15868289 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 15868368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17046765 - 17046718
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046765 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 17046718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Original strand, 19757257 - 19757410
Alignment:
Q  37 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19757257 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacctt 19757355  T
Q  137 --gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
       |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19757356 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19757410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19782549 - 19782396
Alignment:
Q  37 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19782549 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacctt 19782451  T
Q  137 --gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
       |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19782450 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19782396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2015251 - 2015075
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 113  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| |||    
T  2015251 agagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatg 2015152  T
Q  114 agattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  2015151 agattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagacgctctcgcctcgcgag 2015075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9557007 - 9556827
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9557007 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 9556908  T
Q  110 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |   ||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556907 ggcaagattgaacctagaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 481
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  435 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 7900800 - 7900913
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  7900800 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgggtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 7900899  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  7900900 gatcagattgaacc 7900913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15190795 - 15190702
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||  ||||||| ||||||||||    
T  15190795 tttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaat 15190702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 16243030 - 16243209
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || |||||| |||||||  ||  || |||     
T  16243030 cagatagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctaatattgattagagaatgatttaga 16243129  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16243130 atgagattgaacctagaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16243209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13506
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13410 tgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 497
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  331 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 426  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 11250191 - 11250251
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250191 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11250251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 16351478 - 16351538
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16351478 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 16351538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 44773153 - 44773249
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773153 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14679439 - 14679325
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14679439 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14679340  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  14679339 gacaagattgaacct 14679325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35614415 - 35614301
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||    
T  35614415 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtag 35614316  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  ||||| |||||    
T  35614315 gactagattaaacct 35614301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14685619 - 14685534
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14685619 gactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggataagattgaacct 14685534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 15321723 - 15321836
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  15321723 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 15321822  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  15321823 gatcagattgaacc 15321836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 125
Target Start/End: Original strand, 15464592 - 15464661
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  15464592 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 15464661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 51493447 - 51493560
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  51493447 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 51493546  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  51493547 gatcagattgaacc 51493560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 53433854 - 53433753
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  53433854 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 53433755  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  53433754 ga 53433753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3413272 - 3413212
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413272 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 3413212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcc 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |    ||      
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt----tgt- 12611011  T
Q  436 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611010 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355471
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Original strand, 16956279 - 16956379
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16956279 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 16956378  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  16956379 g 16956379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 186
Target Start/End: Original strand, 26243318 - 26243471
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||  ||    
T  26243318 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa-caa 26243415  T
Q  133 actt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 186  Q
     |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26243416 ccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 26243471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 1951391 - 1951570
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || |||     
T  1951391 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttaga 1951490  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    | ||||||||||||||||  |   | | ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  1951491 acgagattgaacctggaacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgcgag 1951570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15367789 - 15367690
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15367789 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15370117 - 15370018
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15370117 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15370020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15371301 - 15371202
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15371301 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15371204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15373582 - 15373483
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15373582 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15373485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15402802 - 15402703
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15402802 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15402705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40471920 - 40471837
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40471920 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacct 40471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12774355 - 12774313
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774355 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 16678219 - 16678277
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttga 69  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16678219 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaatcttagattcttttga 16678277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 18222031 - 18222187
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  18222031 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 18222129  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  18222130 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 18222187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23838910 - 23838796
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23838910 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23838811  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  23838810 gacaagattgaacct 23838796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27534502 - 27534384
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||||||||  ||  ||    
T  27534502 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtacctactaatgattaggaaacgattgag 27534403  T
Q  110 gatgagattgaacctggaa 128  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27534402 aatgagattgaacctggaa 27534384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 32851918 - 32851868
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32851918 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 32851868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 40478593 - 40478511
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40478593 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 40478511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 15124773 - 15124858
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  15124773 cagagagcatgtataactctgtacttttgacctttgagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15124858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 18602398 - 18602435
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18602398 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18602435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 18608992 - 18609029
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18608992 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18609029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25555989 - 25555932
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25555989 agagcatgttgattttcgtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 25555932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 14708264 - 14708324
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14708264 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 14708324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 15352936 - 15352996
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15352936 cagagagcatgttgattttcatattttggacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15352996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18237368 - 18237308
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18237368 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18237308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 385989 - 386096
Alignment:
Q  16 agcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag 115  Q
    ||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||    
T  385989 agcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcag 386088  T
Q  116 attgaacc 123  Q
    ||||||||    
T  386089 attgaacc 386096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3332240 - 3332201
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3332240 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 481
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970853
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970807 gc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 17152140 - 17152296
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  |  || ||| || |||||||| ||   | ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  17152140 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgactacctttaggtgcctattattgattagggaatgttttagaacgagattgaacctggaa-caac 17152238  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  17152239 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgag 17152296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Original strand, 22633980 - 22634018
Alignment:
Q  151 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22633980 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 26284568 - 26284650
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26284568 ctttttagttggaccttggatgtcttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 26284650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45938600 - 45938444
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |  |||||| |  |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  ||     
T  45938600 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgtctactgttgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaa-caac 45938502  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45938501 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45938444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 9271733 - 9271834
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  9271733 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 9271832  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  9271833 ga 9271834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15099706 - 15099665
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15099706 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15552166 - 15552129
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552166 gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596686
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 462  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23139723 - 23139686
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23139723 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23139686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 28569097 - 28569134
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28569097 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28569134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 43255813 - 43255850
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43255813 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 43255850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 257
Target Start/End: Original strand, 15464694 - 15464805
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 245  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||   |||||||| | |||||| || ||||||||     
T  15464694 acctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttaggattttgcaatctttgtcgcacaagttgtt 15464793  T
Q  246 gagagttgaacc 257  Q
      ||||||||||    
T  15464794 atgagttgaacc 15464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 17053514 - 17053482
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17053514 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 17053482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 42997080 - 42997140
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42997080 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaacttagatgcctttgagt 42997140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 4561107 - 4561142
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4561107 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4561142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 5756711 - 5756746
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5756711 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 5756746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 12287791 - 12287866
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12287791 gaaccttagatgtttctaagtgtctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Original strand, 20157056 - 20157095
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157056 ctgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 484
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  449 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33742710 - 33742675
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33742710 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 33742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 6873060 - 6873118
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6873060 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtaggatcagattgaacc 6873118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12522505 - 12522447
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  12522505 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacct 12522447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 14268111 - 14268189
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14268111 ttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14268189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 14757082 - 14757164
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || | |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14757082 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 14757164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17810718 - 17810636
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17810718 ctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 17810636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Original strand, 18228528 - 18228622
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  18228528 tttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 18228622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 32306582 - 32306624
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32306582 ttagatggttttgagtgcctaaacatgtataataatgattagg 32306624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35171045 - 35170991
Alignment:
Q  70 gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  35171045 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 35170991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 41385430 - 41385488
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  41385430 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacct 41385488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8846730 - 8846689
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8846730 accttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 128
Target Start/End: Original strand, 53081755 - 53081832
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  53081755 gaactttagatgattctgagtgcctaaacatgtataataatgattaagcaagtttttagattgagattgaacctggaa 53081832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 9530885 - 9530849
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9530885 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagt 9530849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 39706052 - 39706092
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39706052 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 39706092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 152)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 16199296 - 16199765
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16199296 gtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaatt 16199395  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16199396 aaact-gtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttattggattttgcgaccttt 16199494  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16199495 gttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttga 16199594  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtat 429  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16199595 ttatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaat 16199694  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199695 actgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31971724 - 31971257
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971724 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 31971625  T
Q  134 cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971624 cttgtgagattctgacctgaactcgccccggcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 31971525  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31971524 gcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgatta 31971425  T
Q  334 tgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatac 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31971424 tgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatac 31971325  T
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971324 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 45130669 - 45131117
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130669 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 45130768  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45130769 aaacttgtgggattctgacctgaac----------------------tcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagattttgcgaccttt 45130846  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45130847 gttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatga 45130946  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgta 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  45130947 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtt 45131046  T
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 21918652 - 21919121
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt-aaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  21918652 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggaagagattgaacctggaaatgaaa 21918751  T
Q  134 cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918752 cttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 21918851  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  21918852 gcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgatta 21918951  T
Q  334 tgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaa-tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtat 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  21918952 tgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 21919051  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919052 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 18878879 - 18879352
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  18878879 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 18878978  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18878979 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgc 18879078  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  18879079 ggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctg 18879177  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  18879178 atgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt--tgt 18879274  T
Q  422 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18879275 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20536687 - 20536208
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  20536687 ttttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 20536588  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20536587 tagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattaggttttgc 20536488  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  20536487 gacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttg 20536388  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     ||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  20536387 atgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 20536288  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20536287 gtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 18818052 - 18818530
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          
T  18818052 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 18818151  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18818152 taaaatgaaacttttggt-ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgc 18818250  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||   | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18818251 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 18818350  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||   |    
T  18818351 atgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgct 18818450  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18818451 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 25362770 - 25363123
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25362770 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtagga 25362869  T
Q  112 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  25362870 tgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgcctt 25362969  T
Q  212 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 311  Q
    || ||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||     
T  25362970 gtgagactttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtt 25363069  T
Q  312 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 364  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25363070 taagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 21923570 - 21924049
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||             
T  21923570 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagattt 21923669  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
     |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21923670 agaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgc 21923769  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21923770 gacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 21923869  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
    ||| |||||||||||  | |||| | | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21923870 ttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgtt 21923969  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21923970 gtttttgtagactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22627214 - 22626736
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |       
T  22627214 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctcgaaagattg 22627115  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gc 223  Q
           ||| | ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  22627114 tagaatgaacctttggaaatctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgc 22627015  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22627014 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 22626915  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  22626914 atgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgtt 22626815  T
Q  423 g--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22626814 gttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23406860 - 23406379
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  23406860 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagattg 23406761  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  23406760 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgt 23406661  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||||||  | || ||  |||  |||||||| |  | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  23406660 gacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttg 23406561  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt--gatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
     || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| |  | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23406560 atgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatg 23406461  T
Q  421 ttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23406460 ttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 499
Target Start/End: Original strand, 28648686 - 28649164
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||          
T  28648686 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacatggaaagattt 28648785  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
        | |||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28648786 agaatgaaaccttttgaattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 28648885  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  28648886 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttg 28648985  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  28648986 atgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 28649085  T
Q  423 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28649086 gttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 35 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6759736 - 6759255
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||       
T  6759736 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaaatattt 6759637  T
Q  132 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6759636 tagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttg 6759537  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatatgt 321  Q
    | | || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  6759536 caatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgt 6759437  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||   ||||||  | ||||||   ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  6759436 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgt---tgacttgcatttgatattattatgtcatg 6759340  T
Q  421 ttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 503  Q
    |||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6759339 ttgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23649033 - 23648554
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg-------- 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            
T  23649033 tttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctgaaaagact 23648934  T
Q  126 --gaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattt-t 221  Q
      |||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23648933 tagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttat 23648835  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgt 321  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  23648834 gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgt 23648735  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  23648734 tgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatg 23648635  T
Q  421 ttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||   |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  23648634 ttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 16091983 - 16092463
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tt 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    ||    
T  16091983 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaacctgaaaagattt 16092082  T
Q  131 aaa------cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
    |||      ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16092083 aaaaaaaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgc 16092182  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatatgtt 322  Q
    || || |||  | ||||||||  ||||||||||| | |||||  ||| ||||||||  || | |||||||||||| || |||| || | |||||| ||||    
T  16092183 gatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgtt 16092282  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||       
T  16092283 gatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 16092382  T
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16092383 tgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7373228 - 7372778
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             
T  7373228 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaaagattg 7373129  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
      |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7373128 tagaatgaaacttgtgaaattctgacctgaactcgccacggc---------------------gagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgc 7373050  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||| | | | ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7373049 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 7372950  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tg 420  Q
     || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   ||    
T  7372949 atgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 7372857  T
Q  421 ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7372856 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22875544 - 22875065
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||          
T  22875544 ttttgacctttgagttaatccttagatgcttttgagcgtctaaacatgtttaataatgattaggaaagattgtagaacgaggttgaacctggaaagattt 22875445  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  22875444 tagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttg 22875346  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatatgt 321  Q
    ||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||  ||||  | | ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  22875345 cgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgt 22875246  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  22875245 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 22875146  T
Q  421 ttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22875145 ttgttttgtatactgcctgtgttgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 287 - 500
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  287 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 386  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  387 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 486  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21389557  T
Q  487 gaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  21389558 gaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 287 - 500
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  287 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  387 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 486  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  487 gaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 287 - 500
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  287 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  387 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 486  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  487 gaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 300 - 500
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  300 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 399  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  400 aattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  500 t 500  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41598663 - 41598188
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||             
T  41598663 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 41598564  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agatttt 221  Q
      |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||   ||||||    
T  41598563 tagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatg-cttgtttaggatttt 41598466  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagata 318  Q
    |||| |||||  || | ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| || | | ||| ||||  ||||| || ||||||||| ||| | || |||     
T  41598465 gcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaaactgatttatgatg 41598368  T
Q  319 tgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 417  Q
      ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 41598269  T
Q  418 a---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |   |||| |||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598268 atgctgtttttgtatact-actgtgttgctg-ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 5865915 - 5866082
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----- 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         
T  5865915 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaag 5866014  T
Q  126 -----gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
         |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5866015 acttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17141397 - 17141302
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17141397 tgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17141302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21255700 - 21255605
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255700 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 21255605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21249862 - 21249767
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21249862 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaa 21249767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21491476 - 21491382
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21491476 tgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 21491382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  405 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 22010298 - 22010384
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  22010298 cagagagcatgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 22010384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21674184 - 21674091
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  21674184 ttttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 21674091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 20465658 - 20465722
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465658 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20465722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 15602636 - 15602722
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15602636 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 15611088 - 15611174
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15611088 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15611174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 19801069 - 19801163
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||    
T  19801069 ttttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagagaataagattgaacctggaat 19801163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 26355340 - 26355433
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  26355340 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacctggaa 26355433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 377778 - 377714
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377778 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 377714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19899592 - 19899510
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19899592 agagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19899510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 30642910 - 30642996
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  30642910 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 30642996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 38854893 - 38854987
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||    
T  38854893 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacctggaat 38854987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16185228 - 16185143
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  16185228 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16185143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 17353556 - 17353641
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  17353556 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 17353641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 21168340 - 21168455
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||   | ||  |||     
T  21168340 cagagagcaggttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttaga 21168439  T
Q  111 atgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  21168440 atgagattgaacctgg 21168455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 16409875 - 16409989
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| |    
T  16409875 agagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaa 16409974  T
Q  112 tgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||||||    
T  16409975 tgagattgaacctgg 16409989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 16860956 - 16861042
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16860956 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 16861042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 16411888 - 16412001
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    | ||||||||    
T  16411888 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattaaatgataatgtagg 16411987  T
Q  111 atgagattgaacct 124  Q
    || |||||||||||    
T  16411988 atcagattgaacct 16412001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 21161735 - 21161820
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21161735 agagagcaggttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 21161820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  481 g 481  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 23776452 - 23776517
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacc-ttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23776452 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctttagatgtttttgagtgcct 23776517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21249483 - 21249384
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249483 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21255321 - 21255222
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255321 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 39834316 - 39834217
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  39834316 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacttgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 39834217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 481
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413462
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 21389091 - 21389156
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21389091 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21389156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6520847 - 6520779
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 103  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6520847 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaaga 6520779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 493
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19983595 - 19983508
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttg--acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19983595 cagagagcatgtagaattctgtattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 20046261 - 20046357
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046261 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  481 gatg 484  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22029033 - 22028973
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22029033 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22028973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24756221 - 24756157
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24756221 cagagagcatgtaggattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 24756157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 17612133 - 17612231
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612133 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20499144 - 20499049
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  20499144 tgtagttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaacctg 20499049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 23760482 - 23760576
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||||||||    
T  23760482 ttttgacttttgagttgatccctgaatgtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaat 23760576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 19259221 - 19259305
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  19259221 cagagagcatgttgaattcttgaattttgacttttgagttgaaccttagatgc-tttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 19259305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19976947 - 19976860
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttg--acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19976947 cagagagcatgtagaattttgtattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19976860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 20856044 - 20856108
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856044 cagagagcatgttgaatttcgtgattttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20856108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22057824 - 22057768
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 67  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22057824 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 21414869 - 21414956
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21414869 tttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 21414956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 23252393 - 23252452
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23252393 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23252452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 26934805 - 26934906
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  26934805 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 26934904  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  26934905 ga 26934906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 493
Target Start/End: Original strand, 13597640 - 13597731
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597640 gatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 15203297 - 15203393
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203297 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 17926333 - 17926412
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17926333 cagagagcatgttgaattctgta-------cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 17926412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18619954 - 18619894
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619954 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18619894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21395686
Alignment:
Q  40 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21395686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790179
Alignment:
Q  40 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21790179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22045334 - 22045274
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22045334 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22045274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Original strand, 23845412 - 23845512
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23845412 gcagagagcatgttagattttttattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23845511  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  23845512 g 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 39094571 - 39094631
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094571 cagagagcatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 39094631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483328 -gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 13507663 - 13507713
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13507663 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13507713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 13597195 - 13597245
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13597195 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13597245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 381 - 498
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  478 taagatgttgaagatgatgat 498  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20527926 - 20527812
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20527926 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 20527827  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  20527826 gacaagattgaacct 20527812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23834626 - 23834532
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  23834626 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa 23834532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 24433890 - 24434046
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| |  ||||||||||| |||  ||     
T  24433890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacctagaa-caac 24433988  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24433989 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29123531 - 29123449
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29123531 ctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29123449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3216738 - 3216637
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  3216738 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 3216639  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  3216638 ga 3216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 484
Target Start/End: Original strand, 19801448 - 19801530
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801448 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070574
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 503
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 30308384 - 30308444
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308384 cagagagcaagttgttttctgagtttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 30308444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290841
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 32599153 - 32599094
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32599153 agagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32599094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 32605685 - 32605626
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32605685 agagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32605626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 125
Target Start/End: Original strand, 982980 - 983058
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||    
T  982980 agttgaactttagatgattttgagtgtctgaacatgtatattagtgattaggaaagtttttagattgagattgaacctg 983058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15538901 - 15538745
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| || |||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  15538901 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacctggaa-caac 15538803  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15538802 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18865753 - 18865695
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18865753 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 18865695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 22113381 - 22113537
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  ||     
T  22113381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caac 22113479  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22113480 cttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22113537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 22134884 - 22135040
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  ||     
T  22134884 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caac 22134982  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22134983 cttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22135040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  478 taagatgttgaagatgatgat 498  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15532341 - 15532304
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15532341 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17141229
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 124
Target Start/End: Original strand, 17266574 - 17266647
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  17266574 gaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 17266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21249734 - 21249697
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21249734 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 22166034 - 22166071
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22166034 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22166071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37116882 - 37116813
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  37116882 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 37116813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39834188 - 39834147
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39834188 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 16231105 - 16231165
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  16231105 cagagagcatgtcgaattctgagttttcgacttttgatttgaaccttagatgtctttgagt 16231165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 17055019 - 17055079
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17055019 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaactttagatgcctttgagt 17055079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19111672 - 19111601
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| ||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19111672 ctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19111601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19117963 - 19117892
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| ||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19117963 ctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19117892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24353563 - 24353488
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  24353563 gaactttagataattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 24353488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43252145 - 43252110
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43252145 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 43252110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 98
Target Start/End: Original strand, 17085770 - 17085804
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17085770 ttttgagtgcctgaacatgtataataatgattagg 17085804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 496
Target Start/End: Original strand, 17353983 - 17354060
Alignment:
Q  418 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17353983 atgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18855358 - 18855300
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18855358 tttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 18855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 485
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 17828236 - 17828273
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17828236 tttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17828273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21255572 - 21255535
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255572 gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 63
Target Start/End: Original strand, 23844567 - 23844596
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23844567 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 23844596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21286688 - 21286652
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 83  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21286688 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgt 21286652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21674061 - 21674021
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21674061 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 21674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 21972353 - 21972393
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21972353 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21972393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 21976438 - 21976478
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21976438 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21976478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 38855015 - 38855055
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  38855015 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 38855055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Original strand, 40492438 - 40492506
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  40492438 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 40492506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13967 - 13497
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13967 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagcatgagattgaacctggaatt 13868  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13867 aaacttgtgagattctgagctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgactttt 13768  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13767 gttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttga 13668  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgta 428  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  13667 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgta 13568  T
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13567 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 21292619 - 21293090
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292619 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 21292718  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21292719 aaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttgcgaccttt 21292818  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21292819 gttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatga 21292918  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatgttg-ttgt 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||    
T  21292919 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgt 21293018  T
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293019 ttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 34 - 500
Target Start/End: Original strand, 8286494 - 8286964
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8286494 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaa 8286593  T
Q  134 cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286594 cttgtgggattctgacctaaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 8286693  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    |||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  8286694 gcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 8286793  T
Q  334 tgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg----ttgttgta 428  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    || |||||    
T  8286794 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgta 8286893  T
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286894 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22075487 - 22075018
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  22075487 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgaaaatgaacctggaatgaaac 22075388  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22075387 ttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgacttgttag-ttttgcgacctttgtt 22075289  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    || | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  22075288 gcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgatta 22075189  T
Q  334 tgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtat 429  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  22075188 tgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtat 22075089  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075088 acttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 23390138 - 23390617
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  23390138 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 23390237  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  23390238 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgt 23390337  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  23390338 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttg 23390437  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23390438 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgtt 23390537  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23390538 gtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24494047 - 24493569
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  24494047 ttttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattt 24493948  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gc 223  Q
        | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||    
T  24493947 agaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgc 24493848  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24493847 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttg 24493748  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  24493747 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24493648  T
Q  423 g--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24493647 gttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13095973 - 13095495
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  13095973 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagattt 13095874  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13095873 agaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgc 13095774  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13095773 gacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttg 13095674  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | |||||||||     
T  13095673 atgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgc 13095575  T
Q  422 tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13095574 tgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25422011 - 25421532
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||          
T  25422011 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttaggatgagattggacctggaaagattt 25421912  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
        | ||||||  || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  25421911 agaatgaaactttcggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgc 25421812  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  25421811 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttg 25421712  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25421711 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgtt 25421612  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25421611 gtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24529700 - 24529223
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  24529700 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaggttg 24529601  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||    
T  24529600 tagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttg 24529501  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24529500 cgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 24529401  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
    | || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24529400 gatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgt 24529301  T
Q  422 tg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24529300 tgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13025789 - 13025311
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  13025789 ttttgaattttgagttgatccttagatacttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagattt 13025690  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13025689 agaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgc 13025590  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13025589 gacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttg 13025490  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | |||||||||     
T  13025489 atgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgc 13025391  T
Q  422 tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13025390 tgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Original strand, 22107002 - 22107357
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107002 cagagagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22107101  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 210  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22107102 acgagattgaacctgaaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgcct 22107201  T
Q  211 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22107202 tgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 22107301  T
Q  311 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-gattatgcattacttgaa 365  Q
     |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22107302 ttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 9078431 - 9077952
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||          
T  9078431 ttttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 9078332  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
        | |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9078331 agaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 9078232  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    || || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9078231 gatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 9078132  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  9078131 atgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgct 9078032  T
Q  423 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  9078031 gttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25431873 - 25431414
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||          
T  25431873 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagaatttaggatgagattggacctggaaagattt 25431774  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
        | |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  25431773 agaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgc 25431674  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||| | | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  25431673 gacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttg 25431574  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| | |  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25431573 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgtt 25431474  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431473 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1096946 - 1096467
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |       
T  1096946 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagattg 1096847  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
           ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  1096846 cagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgc 1096747  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    || || ||| || ||||||||  | ||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||    
T  1096746 gatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttg 1096647  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  1096646 atgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgtt 1096547  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |   ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  1096546 gtttttgcatactacctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 364
Target Start/End: Original strand, 21985789 - 21986130
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  21985789 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 21985888  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
        | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21985889 agaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgc 21985988  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||| || || | ||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  21985989 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttg 21986088  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttga 364  Q
     || ||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  21986089 atgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 196
Target Start/End: Original strand, 11580887 - 11581058
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  11580887 ttttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattt 11580986  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 196  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580987 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 11581058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 336 - 500
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  336 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatac 431  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 350 - 500
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729185
Alignment:
Q  350 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 446  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 21729132  T
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729133 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 22119811 - 22119998
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22119811 cagagagcatgcaaaattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22119910  T
Q  111 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22119911 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 36154470 - 36154942
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||             
T  36154470 ttttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctggatagattt 36154569  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agatttt 221  Q
      |||| |||||| || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||   ||||||    
T  36154570 tagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggatttt 36154667  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagata 318  Q
    |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| || | | ||| |||   ||||| || || |||||||||| | || |||     
T  36154668 gcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatatattattaatgatgatatgtgaagctgatttatgatg 36154765  T
Q  319 tgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 417  Q
      ||| ||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 36154864  T
Q  418 a---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |   |||| |||||||||| || |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154865 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 19660474 - 19660572
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  19660474 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtggaatgagattaaacctggaa 19660572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 383 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 482  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  483 tgttgaagatg 493  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 21871213 - 21871306
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21871213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa 21871306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 21875493 - 21875586
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21875493 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa 21875586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21566023 - 21565930
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  21566023 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 21565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 24766983 - 24767142
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa---------- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  24766983 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagacttagaa 24767082  T
Q  129 ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24767083 tgaaactttggagaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Original strand, 22959175 - 22959267
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22959175 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctgga 22959267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997655
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 21997653  T
Q  499 gt 500  Q
    ||    
T  21997654 gt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 500
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 22144508 - 22144065
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taa------acttgtgggattc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    |||      | || ||||| |     
T  22144508 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagtt 22144409  T
Q  146 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 243  Q
      ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | |||||    
T  22144408 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttg 22144310  T
Q  244 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 341  Q
    | |||||||||||| | | || | | | |||| ||  | || |  ||||| || | |||||||| ||| |||||||   ||| || || |||  ||||||    
T  22144309 ttgagagttgaaccttggagtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtga 22144211  T
Q  342 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctat 438  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||| || ||   | |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| |||||    
T  22144210 tataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctat 22144111  T
Q  439 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144110 gttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19669379 - 19669286
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||    
T  19669379 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacgtggaa 19669286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 21366286 - 21366371
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21366286 agagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21366371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 484
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  480 agatg 484  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032323
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 395  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  396 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  22032421 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 496
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770118
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 395  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  396 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  18770018 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20806047 - 20805961
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20806047 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 20805961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 18769623 - 18769708
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18769623 cagagaacatgttgaattctgtatttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18769708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 21887324 - 21887239
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  21887324 cagagagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 21887239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22032816 - 22032731
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  22032816 cagagaacacgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 22032731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23201869 - 23201784
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23201869 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23201784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23512604 - 23512521
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23512604 agagcatgttgaattctgtattttcgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 23512521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 21329137 - 21329231
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  21329137 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 21329231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 21498659 - 21498753
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21498659 ttttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattgaacctggaat 21498753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 385 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  385 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 482  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  483 tgttgaagatgatg 496  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tt 425  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  426 gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14079648 - 14079584
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14079648 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcct 14079584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572180
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 400  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  288 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 387  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  388 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  486 tgaagatgatga 497  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 31342602 - 31342539
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31342602 agagagcatgtcaaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 31342539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 26012056 - 26012137
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012056 ttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 11581265 - 11581361
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581265 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 17918781 - 17918845
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918781 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17918845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22760141 - 22760081
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22760141 cagagagcatgttgatttccgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22760081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 37724403 - 37724319
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  37724403 agagagcatgtaagattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 37724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 23500964 - 23501031
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23500964 cagagagcatgtagaattctgtattcctaacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 23501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 12028195 - 12028281
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  12028195 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattag 12028281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 424  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  425 tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 21340420 - 21340576
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  21340420 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 21340518  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21340519 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 26665784 - 26665940
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  26665784 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 26665882  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26665883 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26665940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 26937381 - 26937537
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  26937381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 26937479  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26937480 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26937537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418599
Alignment:
Q  288 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 385  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  386 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23572559 - 23572510
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 60  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572559 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 23572510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 1858606 - 1858666
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858606 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 1858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24222364 - 24222304
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24222364 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24222304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245136
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 5888812 - 5888911
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  5888812 tgtagttttgacctttaagtcgaagcttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacatggaat 5888911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16674605 - 16674449
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  16674605 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 16674507  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16674506 cttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16674449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18356780 - 18356624
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| ||||||||| ||||||||  ||     
T  18356780 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaagtgcctactattgattagggaatgatttagaatgagattgcacctggaa-caac 18356682  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18356681 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18356624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 23535242 - 23535398
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  23535242 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 23535340  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23535341 cttagttgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23535398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 24532701 - 24532857
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  24532701 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 24532799  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24532800 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24532857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25406902 - 25406789
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  25406902 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 25406803  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  25406802 gatcagattgaacc 25406789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Original strand, 25808115 - 25808215
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || || |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25808115 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 25808214  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  25808215 g 25808215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 26742376 - 26742436
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26742376 cagagagcatgtaaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 21741180 - 21741279
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  21741180 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgaataggaaagattatagattgagattgaacctggaat 21741279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17284512 - 17284430
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17284512 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 17284430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 21294892 - 21295006
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21294892 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 21294991  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  21294992 gacaagattgaacct 21295006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26681066 - 26680980
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26681066 cagagagtatgttgattttcatattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26680980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26952673 - 26952587
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26952673 cagagagtatgttgattttcatattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26952587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33409659 - 33409565
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  33409659 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa 33409565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 15441583 - 15441696
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15441583 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 15441682  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||  ||||||||||    
T  15441683 gacaagattgaacc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17410923 - 17410874
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 60  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17410923 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaga 17410874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 494
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319193
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22133475 - 22133362
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22133475 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22133376  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  22133375 gatcagattgaacc 22133362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22140167 - 22140054
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22140167 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22140068  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  22140067 gatcagattgaacc 22140054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 22325555 - 22325668
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  22325555 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgacattttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 22325654  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||  ||||||||||    
T  22325655 gaaaagattgaacc 22325668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 497
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  449 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22588571 - 22588459
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| | | |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  22588571 gcagagagcatgttagattttatgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 22588472  T
Q  110 gatgagattgaac 122  Q
    ||| |||||||||    
T  22588471 gatcagattgaac 22588459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 25229036 - 25229096
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25229036 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 25293192 - 25293252
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25293192 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31061164 - 31061068
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 123
Target Start/End: Original strand, 41294112 - 41294176
Alignment:
Q  59 gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41294112 gatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41294176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 124
Target Start/End: Original strand, 14359471 - 14359562
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  14359471 attttcgacttttgagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacatgattgaacct 14359562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 22177797 - 22177848
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22177797 agttgaaccctagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 22177848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29348600 - 29348453
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29348600 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29348502  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348501 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29351073 - 29350926
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29351073 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29350975  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350974 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40725951 - 40725853
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725951 gatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 15236440 - 15236522
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15236440 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 15236522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 17718092 - 17718248
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||| | |||  ||     
T  17718092 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacatagaa-caac 17718190  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17718191 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 17718248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 20026526 - 20026592
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  20026526 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 20026592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 21884842 - 21884998
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  ||     
T  21884842 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caac 21884940  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21884941 cttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21884998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24555010 - 24554896
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24555010 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24554911  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  24554910 gacaagattgaacct 24554896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25535409 - 25535351
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25535409 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25535351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Original strand, 26011688 - 26011770
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  26011688 agttgaactttagatgattatgagtgtctaaacatgtgtaataatgattaagaaagattctaaattgagattgaacctggaat 26011770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26704151 - 26704090
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704151 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26973884 - 26973823
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973884 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 29471019 - 29471101
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29471019 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29471101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 29477614 - 29477696
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29477614 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29477696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4036673 - 4036636
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4036673 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 5888940 - 5888981
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5888940 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18784500 - 18784463
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18784500 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18784463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19660643
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21482931 - 21482894
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21482931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21482894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 197  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21565900 - 21565863
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565900 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22343974 - 22343873
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | |||| |||    
T  22343974 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatatag 22343875  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  22343874 ga 22343873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 22959298 - 22959339
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959298 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Original strand, 23336973 - 23337030
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23336973 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 23337030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26172917 - 26172880
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26172917 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26172880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 430 - 479
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27517191 - 27517126
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27517191 agttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27517126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27523828 - 27523763
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27523828 agttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 42805873 - 42805836
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42805873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 42805836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 190
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 19472493 - 19472528
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19472493 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19472528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19992305 - 19992258
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19992305 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19992258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20296180 - 20296145
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20296180 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20296145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21873327 - 21873277
Alignment:
Q  422 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873327 tgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Original strand, 22334501 - 22334548
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  22334501 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 22334548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23201731 - 23201680
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201731 tgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23201680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26704542 - 26704499
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  26704542 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26704499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26974275 - 26974232
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  26974275 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26974232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31342453 - 31342414
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31342453 ctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 31342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 34294212 - 34294283
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  34294212 cttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggat 34294283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Original strand, 37286464 - 37286523
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37286464 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37286523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Original strand, 37293167 - 37293226
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37293167 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37293226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 20910454 - 20910609
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |  |||||| ||| |||||| | | |||| ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  20910454 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaat-tagaacaagattgaacctggaa-caac 20910551  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20910552 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20910609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744036
Alignment:
Q  151 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 26732421 - 26732463
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26732421 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26732463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 26740234 - 26740276
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26740234 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26740276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 484
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  454 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18774657 - 18774620
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18774657 tttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagt 18774620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Original strand, 19472348 - 19472409
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19472348 gcagagagcatgttagattttgtgtttcggccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19472409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20232896 - 20232847
Alignment:
Q  140 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20232896 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20232847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20232983 - 20232954
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232983 tttttgacttttgagttgaaccttagatgc 20232954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Original strand, 21741308 - 21741345
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 185  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21741308 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21741345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 97
Target Start/End: Original strand, 25574056 - 25574097
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25574056 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25574097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 97
Target Start/End: Original strand, 25575249 - 25575290
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25575249 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25575290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 97
Target Start/End: Original strand, 25576442 - 25576483
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25576442 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25576483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 123074 - 123114
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  123074 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 123114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Original strand, 21871321 - 21871377
Alignment:
Q  133 acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21871321 acttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21871377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Original strand, 21875601 - 21875657
Alignment:
Q  133 acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21875601 acttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21875657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16747 - 16282
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16747 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctgaaattaaac 16648  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16647 ttatgggattttgaccagaactcggcacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggattttgtgacctttgttg 16548  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16547 cacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattat 16448  T
Q  335 gatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgc 434  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16447 gatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgc 16348  T
Q  435 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347 ctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 47458 - 46995
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47458 gtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaatt 47359  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  47358 aaacttgtgggattctgacctgagctcgccacggagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgacttgttagaaatggcgaccttt 47259  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47258 gttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgt 47165  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  47164 ttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaa 47065  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47064 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 64282 - 64367
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  64282 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 64367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 224)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 500
Target Start/End: Original strand, 20698084 - 20698556
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698084 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20698183  T
Q  130 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698184 gaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 20698283  T
Q  230 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 329  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | ||    
T  20698284 tgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttg 20698383  T
Q  330 attatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttg 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||| |||    
T  20698384 attatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttg 20698483  T
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698484 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 36 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17488335 - 17487856
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------- 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  17488335 tttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgt 17488236  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttgc 223  Q
        | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17488235 agaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgc 17488136  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  17488135 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttg 17488036  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  17488035 atgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 17487936  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17487935 gtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 63 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13442725 - 13442274
Alignment:
Q  63 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacct 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||    
T  13442725 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacct 13442626  T
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagt 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13442625 gaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagt 13442526  T
Q  252 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 350  Q
    |||||| | || |   ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  13442525 tgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 13442426  T
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |    
T  13442425 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-t 13442327  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442326 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17499818 - 17499338
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  17499818 ttttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 17499719  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa-cagagtgacttgttagattttg 222  Q
         | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17499718 tagaatgaaacttgttggattctgacctgaattcgccacggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttg 17499619  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||    
T  17499618 cgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgtt 17499519  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 418  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  17499518 gatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 17499419  T
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17499418 tgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12399698 - 12399209
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12399698 cagagagcatgctagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatatagg 12399599  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 210  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  12399598 atgggtttgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgacccagaaac--agtgact 12399501  T
Q  211 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| | |  || | || |||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  12399500 tgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctat 12399402  T
Q  311 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 409  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12399401 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatatt 12399302  T
Q  410 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399301 attatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26687366 - 26686887
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  26687366 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 26687267  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  26687266 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttac 26687167  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | | | || |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26687166 gacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 26687067  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |    
T  26687066 atgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 26686967  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  26686966 gtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18439013 - 18438534
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||          
T  18439013 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaaatgagattgaacctggaaagattt 18438914  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
        | |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  18438913 agaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgc 18438814  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18438813 gacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 18438714  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||   |||||| | ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||   |    
T  18438713 atgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgct 18438614  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18438613 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14973333 - 14972854
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----t 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||     |    
T  14973333 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaaccagaaaagattt 14973234  T
Q  130 ta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
    ||     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14973233 tagaaagaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 14973134  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    ||  | ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  14973133 gatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttg 14973034  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   |||||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |    
T  14973033 atgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 14972934  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14972933 gtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 35 - 481
Target Start/End: Original strand, 14576475 - 14576934
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||          
T  14576475 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtagaatgacattgaacctggaaagactt 14576574  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
        | |||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  14576575 agaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgc 14576674  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  14576675 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttg 14576774  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14576775 atgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 14576874  T
Q  423 gttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576875 gttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 40213363 - 40213838
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       
T  40213363 ttttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 40213462  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
           ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40213463 tagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 40213562  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  40213563 gacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttg 40213662  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  40213663 atgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 40213762  T
Q  423 gt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||   ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40213763 gtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14573068 - 14572608
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----- 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         
T  14573068 tttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagact 14572969  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-g 222  Q
         | |||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |    
T  14572968 tagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttg 14572869  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||    
T  14572868 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtt 14572769  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
      || || ||||||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||     
T  14572768 tatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgc 14572669  T
Q  422 tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572668 tgttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 23083003 - 23083482
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||          
T  23083003 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctggatatgtctaatagtgattaggacaaaatgtaggatgagattggacctggaaagattt 23083102  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
        | |||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  23083103 agaatgaaactttttggattctgacccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttaggttttgc 23083202  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23083203 gacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 23083302  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| | | ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |    
T  23083303 atattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattct 23083402  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23083403 gtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 25476027 - 25476506
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||          
T  25476027 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagatcgaacctggaaagattt 25476126  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttg 222  Q
         | |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25476127 tagaatgaaacttttggaat-ctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttg 25476225  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25476226 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 25476325  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca-- 418  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||      
T  25476326 gatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 25476424  T
Q  419 -tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25476425 ctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 11424405 - 11424880
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||          
T  11424405 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 11424504  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
        | |||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11424505 agaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgc 11424604  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||  | | ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11424605 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 11424704  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
      | || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   || |||  | ||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||| |    
T  11424705 aagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgct 11424801  T
Q  423 g--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  11424802 gttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 30030306 - 30029859
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac- 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  30030306 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgattacgaaagaatgtgggatgagattgaacctggaatgaaaca 30030207  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtga-cccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
     | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30030206 gtttggaattctgacct-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccag-aacagaatgccttgttagattttgcgacctttgtt 30030109  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || | ||| | |||||| ||||||||||| |||||| | |||    ||||||    
T  30030108 gcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgatta 30030009  T
Q  334 tgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtat 429  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  ||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||   ||||||||||     
T  30030008 tgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaa 30029910  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     ||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30029909 tctgtctatgctgct-attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaag 30029859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 126 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 43841309 - 43840932
Alignment:
Q  126 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 225  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43841309 gaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcga 43841210  T
Q  226 cctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgtt 325  Q
    |||||||| | | |||||| |||||||  ||  | |||||| |||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43841209 cctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 43841110  T
Q  326 gatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgt 421  Q
    | |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||    
T  43841109 gttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 43841010  T
Q  422 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    | |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  43841009 ttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16809868 - 16809724
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16809868 gtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaacat----aataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgatcctggaatg 16809773  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16809772 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Original strand, 17247928 - 17248100
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  17247928 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 17248027  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 197  Q
      |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248028 tagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 17248100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  175 ctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaaga 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaaga 16796776  T
Q  275 cttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 364  Q
    |||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16796775 cttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 484
Target Start/End: Original strand, 53070341 - 53070802
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  53070341 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatta 53070440  T
Q  132 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgc 223  Q
          ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   ||||||||    
T  53070441 agaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtttaggattttgc 53070539  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatatgt 321  Q
    || |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |  || ||||  ||||| || || |||||||||| | || |||   |    
T  53070540 gatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtat-ataatattaatgatgatttgtgaagctgatttatgatgatt 53070638  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
    || || || |||   |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  53070639 tgatgttg-ttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg 53070737  T
Q  421 ttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070738 ttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14179805 - 14179708
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14179805 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaa 14179708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 288 - 497
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  288 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  387 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  485 ttgaagatgatga 497  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 42386890 - 42386429
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| | |||  || |||||||||||             
T  42386890 ttttgacctttaagttgaaccttagttgtttatgagtgcatgaacatgcataataatgattaggcaagactttagactgtgattgaacctgaaatagtta 42386791  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttg 222  Q
     |||| |||||| ||||| |   |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||    
T  42386790 agaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttg 42386692  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgt 321  Q
    ||| |||||| || | |||||| | |||||||||| | |||||| |||  |||||  | || | |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |    
T  42386691 cgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttt 42386592  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||  | |||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  42386591 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatg 42386492  T
Q  421 ttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386491 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12340231 - 12340138
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12340231 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 12340138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588547
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 4588547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Original strand, 13209966 - 13210062
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13209966 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaat-atgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa 13210062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14666084 - 14665991
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14666084 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 14665991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14669239 - 14669146
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14669239 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 14669146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14735597 - 14735504
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14735597 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 14735504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 43842657 - 43842572
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 120  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842657 ttttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 43842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Original strand, 49389286 - 49389378
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  49389286 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctgga 49389378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 12852006 - 12852169
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          
T  12852006 ttttgacttttgagtttaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagactt 12852105  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
        | |||||| ||  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12852106 agaatgaaacttttgataatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 12933952 - 12934045
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  12933952 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaa 12934045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32308147 - 32308058
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  32308147 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 32308058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9513387 - 9513299
Alignment:
Q  37 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  9513387 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctg 9513299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9521362 - 9521274
Alignment:
Q  37 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  9521362 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctg 9521274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 11298148 - 11298212
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298148 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11298212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16104259 - 16104168
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16104259 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctgg 16104168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 18383536 - 18383651
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || |||     
T  18383536 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 18383635  T
Q  111 atgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  18383636 atgagattgaacctgg 18383651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12496754 - 12496668
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12496754 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 12496668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 109
Target Start/End: Original strand, 17247162 - 17247236
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17247162 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 17247236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 23077097 - 23077183
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23077097 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 23077183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15060791 - 15060706
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15060791 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15060706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 49667726 - 49667818
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  49667726 ttttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaa 49667818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Original strand, 43550544 - 43550644
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 43550642  T
Q  499 gt 500  Q
    ||    
T  43550643 gt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 323088 - 323026
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323088 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 323026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 1644325 - 1644415
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  1644325 ttttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctg 1644415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12173285 - 12173199
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12173285 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12173199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 383 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  481 gatgttgaagatgatgatgt 500  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16097809 - 16097719
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  16097809 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 16097719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 856635 - 856550
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  856635 cagagaacatgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 856550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15052015 - 15051930
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15052015 cagagagcatgttgaattctgtaattttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15051930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Original strand, 12171759 - 12171827
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 103  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171759 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 12171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Original strand, 321634 - 321697
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  321634 agagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 321697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  332 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 429  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  287 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 14878124 - 14878210
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  14878124 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 14878210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15471403 - 15471309
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||    
T  15471403 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaat 15471309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 16369907 - 16369845
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369907 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 16369845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165250
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27165267  T
Q  481 gatgttgaagatgatga 497  Q
    | || | ||||||||||    
T  27165266 gttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 17674194 - 17674258
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674194 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 26190632 - 26190692
Alignment:
Q  15 gagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190632 gagcatgttgaattatgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 26190692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 484
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 324702 - 324627
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  324702 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 324627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Original strand, 17524794 - 17524857
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17524794 agagagcatgtagaattcagtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 17524857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  435 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38814837 - 38814681
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  38814837 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa-caac 38814739  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38814738 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 38814681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242838
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 53301572 - 53301669
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301572 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 2050838 - 2050931
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  2050838 tgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc 2050931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  481 gatgttgaagatgatga 497  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 3402585 - 3402649
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402585 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14234969 - 14234881
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  14234969 ttttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacc 14234881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 432 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 1465046 - 1465145
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1465046 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaacctggaat 1465145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567576
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17242425 - 17242269
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  17242425 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 17242327  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17242326 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17242269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 19725531 - 19725617
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  19725531 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgccttaagatgttgaataaagattag 19725617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 496
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 326794 - 326973
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || |||     
T  326794 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 326893  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  326894 acaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 326973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15483138 - 15482959
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || |||     
T  15483138 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttaga 15483039  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   | ||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15483038 acaagattgaacctggaa-caaccttagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15482959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 15849719 - 15849894
Alignment:
Q  15 gagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 114  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||   |  || ||| |  |    
T  15849719 gagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatttagaacaa 15849818  T
Q  115 gattgaacctggaattaaacttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||  || ||||  ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15849819 gattgaacctggaa-caaccttggttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  385 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  482 atgttgaagatgatga 497  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469296
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8499614 - 8499518
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499614 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 11594769 - 11594829
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594769 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11594829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15977611 - 15977515
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977611 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16690695 - 16690635
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16690695 cagagagcatgttgattttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16690635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16697268 - 16697208
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16697268 cagagagcatgttgattttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16697208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 20461130 - 20461190
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20461130 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 31097184 - 31097244
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31097184 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 31097244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 481
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962037
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3834127 - 3833971
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||||| |||  ||     
T  3834127 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctagaac-aac 3834029  T
Q  134 cttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||  |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3834028 cttggttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3833971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 125
Target Start/End: Original strand, 22109929 - 22110007
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  22109929 agttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctg 22110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Original strand, 23052696 - 23052762
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 77  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23052696 cagagagcatgttgaattttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 23052762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822267
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  478 taagatgttgaagatgatgat 498  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 11852067 - 11852006
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11852067 agagcatgttgaatttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11852006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 12891883 - 12891782
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  12891883 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 12891784  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  12891783 ga 12891782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 15877471 - 15877532
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  15877471 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 17252685 - 17252786
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  17252685 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 17252784  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  17252785 ga 17252786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 1982440 - 1982500
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1982440 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 1982500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389640
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3389640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4291249 - 4291149
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4291249 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 4291150  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  4291149 g 4291149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4710775 - 4710675
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  4710775 gcagagagcatgttggattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtag 4710676  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  4710675 g 4710675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 7792976 - 7793036
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7792976 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7793036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119887
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  448 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  448 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412429
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15617854 - 15617766
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15617854 gcagagagcatgttggattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 15617766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274706
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274785 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 52523390 - 52523462
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  52523390 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattctagtttgatattgaacctggaa 52523462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 13321447 - 13321348
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  13321447 agagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagga 13321348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14501666 - 14501615
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14501666 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14501615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 495
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  405 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 495  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23275208 - 23275133
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  23275208 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 23275133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 37642288 - 37642386
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642288 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 839723 - 839609
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  839723 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgacttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 839624  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  839623 gacaagattgaacct 839609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 1598133 - 1598289
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  ||     
T  1598133 tttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagtacctttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaa-caac 1598231  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1598232 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 1598289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 1644447 - 1644489
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644447 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 11300164 - 11300320
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  11300164 tttttgacttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 11300262  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11300263 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11300320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 23704428 - 23704510
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23704428 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23704510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 23722884 - 23722966
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23722884 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23722966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 23741340 - 23741422
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23741340 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23741422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24188254 - 24188140
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24188254 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24188155  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  24188154 gacaagattgaacct 24188140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32308025 - 32307983
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32308025 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 41201457 - 41201539
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41201457 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41201539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 49667848 - 49667890
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49667848 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 55149455 - 55149341
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55149455 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 55149356  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  55149355 gacaagattgaacct 55149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 605945 - 606026
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||    
T  605945 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaa 606026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12511177 - 12511059
Alignment:
Q  382 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 478  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  12511177 aagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattct 12511079  T
Q  479 aagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||| || | |||||| ||||    
T  12511078 aagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16333649 - 16333548
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||  || ||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16333649 gcagagagcatgttagattttgtaacttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 16333550  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  16333549 ga 16333548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 15941557 - 15941713
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  |      
T  15941557 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaacaacc 15941656  T
Q  134 cttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     | | ||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15941657 gtagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15941713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Original strand, 16862823 - 16862927
Alignment:
Q  24 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||  ||  || ||| |||||||||||||    
T  16862823 gaattctgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaatgattagagaatgatttagaatgagattgaacc 16862922  T
Q  124 tggaa 128  Q
    |||||    
T  16862923 tggaa 16862927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12340107 - 12340068
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12340107 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13251166 - 13251095
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13251166 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13251095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13257812 - 13257741
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13257812 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13257741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 19725669 - 19725720
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19725669 tgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19725720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 23412827 - 23412878
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23412827 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataaaaatgattagg 23412878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 45797710 - 45797659
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45797710 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 45797659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11070517 - 11070435
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11070517 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11070435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 11165189 - 11165271
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11165189 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11165271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 71
Target Start/End: Original strand, 11557037 - 11557075
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11557037 attttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11557075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 12934075 - 12934117
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12934075 acctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14499774 - 14499692
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14499774 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 14499692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 123
Target Start/End: Original strand, 15691949 - 15692019
Alignment:
Q  53 accttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15691949 accttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 15692019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Original strand, 15726591 - 15726673
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15726591 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacc 15726673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 30066395 - 30066313
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30066395 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 30066313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 43927643 - 43927597
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43927643 gaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattag 43927597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 55023294 - 55023212
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  55023294 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 55023212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 5149596 - 5149709
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||| | |    
T  5149596 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgg 5149695  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  5149696 gatcagattgaacc 5149709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 16797707 - 16797744
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16797707 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16797744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20723422 - 20723298
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacgg 164  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||  | | | | |||||  ||| | || |||||||| ||    
T  20723422 ttgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatgg 20723323  T
Q  165 cgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  20723322 cgagtagatgctctcgcctcgcgag 20723298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 42326420 - 42326360
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| ||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42326420 cagagagaatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagaagcttttgagt 42326360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 316659 - 316612
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  316659 gaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 316612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7110034 - 7109999
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7110034 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7109999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7113969 - 7113934
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7113969 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7113934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 12037572 - 12037639
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||| |||  ||  ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12037572 cagagagcatgttggatttcgtgattttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 12037639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12378459 - 12378412
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12378459 gaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattagg 12378412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14665960 - 14665921
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14665960 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14669115 - 14669076
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14669115 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14735473 - 14735434
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14735473 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 16623714 - 16623785
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  16623714 ctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 16623785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22322000 - 22321965
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22322000 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22321965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22337055 - 22337020
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22337055 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22337020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 27409417 - 27409452
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27409417 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 324591 - 324549
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  324591 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 324549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16097687 - 16097645
Alignment:
Q  147 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16097687 gacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 496
Target Start/End: Original strand, 23077517 - 23077594
Alignment:
Q  418 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077517 atgttgttgtgatctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Original strand, 41092030 - 41092076
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  41092030 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtagga 41092076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 186
Target Start/End: Original strand, 49389408 - 49389446
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  49389408 acctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 1465174 - 1465215
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1465174 acctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1465215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7986154 - 7986069
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  7986154 gactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacttagtaatgattaggaaggaatgtaagacaagattgaacct 7986069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9513265 - 9513228
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 185  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9513265 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9521240 - 9521203
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 185  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9521240 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210133
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15337879 - 15337810
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15337879 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15337810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 15397562 - 15397631
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15397562 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15397631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 15404153 - 15404222
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15404153 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15404222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 110
Target Start/End: Original strand, 17710275 - 17710320
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17710275 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 17710320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23408907 - 23408847
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23408907 ttttgacttttgagttgaaccttagat-attatgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23408847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Original strand, 28350846 - 28350903
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28350846 ttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 28350903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 190
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37250973
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 37250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 53380017 - 53380082
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53380017 agttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53380082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 53386669 - 53386734
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53386669 agttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53386734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171909
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 12171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110156
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22110156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 497
Target Start/End: Original strand, 4780 - 5246
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4780 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 4879  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  4880 gaacttatgggattctgacctgaactcgccaaagagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgacttattggattttgagaccttt 4979  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  4980 gttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttga 5079  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5080 ttaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtata 5179  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5180 atacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 165)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Original strand, 16920282 - 16920751
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16920282 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggataagattgtacctggaatt 16920381  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16920382 aaacttatggaattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttggattttgcgaccttt 16920481  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  16920482 gttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttga 16920581  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16920582 ttatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtata 16920681  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920682 ctgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22831974 - 22831503
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22831974 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtttgaacatgtctaatattgattagtgaagaatataggacgagattgaacctggaatt 22831875  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22831874 aaactgatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgacttgttggattttgcgaccttt 22831775  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    || || | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22831774 gtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga 22831675  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta 428  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |    
T  22831674 ttatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaa 22831575  T
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831574 cagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 34 - 500
Target Start/End: Original strand, 20360612 - 20361081
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20360612 tttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaa 20360711  T
Q  134 cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20360712 cttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgtt 20360811  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    || | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  20360812 gcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgatta 20360911  T
Q  334 tgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtat 429  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  20360912 tgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 20361011  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361012 gctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 20637936 - 20638404
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20637936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 20638035  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20638036 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttg 20638135  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | ||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  20638136 cacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattat 20638235  T
Q  335 gatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtata 430  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  20638236 gatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtata 20638335  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638336 ctgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 31 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 11185974 - 11185517
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11185974 gtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtcgaatattgattagtgaagagtgtaggacgagattgaacctggaatt 11185875  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11185874 aaacttatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgacttgttagattttgcgaccttt 11185775  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    |||||    |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  11185774 gttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctga 11185675  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11185674 ttatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtaca 11185575  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 488  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185574 ctgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 22779869 - 22780348
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  22779869 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 22779968  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||     
T  22779969 tagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttaggttttgt 22780068  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22780069 gacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 22780168  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |    
T  22780169 atgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagct 22780268  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  22780269 gtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29061015 - 29060540
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta------- 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |           
T  29061015 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtaga 29060916  T
Q  132 ---aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacc 227  Q
       ||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29060915 atgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacc 29060816  T
Q  228 tttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga 327  Q
    |||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||     
T  29060815 tttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgt 29060716  T
Q  328 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--- 423  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||       
T  29060715 tgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 29060616  T
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29060615 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 19303183 - 19303661
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  19303183 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagattt 19303282  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
     |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19303283 agaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 19303382  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    || || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| | | ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  19303383 gatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttg 19303482  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  19303483 atgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgt 19303581  T
Q  422 tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19303582 tgttttgtatacttcctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 17287438 - 17287917
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||          
T  17287438 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgtgattgtacctggaaagattg 17287537  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  17287538 tagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggtttgc 17287637  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
     | ||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17287638 tatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17287737  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
      | |||||||| | ||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17287738 aggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 17287837  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17287838 gtgtttgtatactacctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 35 - 499
Target Start/End: Original strand, 18409469 - 18409947
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  18409469 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 18409568  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
        | |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18409569 agaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttac 18409668  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  18409669 gacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttg 18409768  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  18409769 atgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 18409868  T
Q  423 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18409869 gttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 18821472 - 18821714
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18821472 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 18821571  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821572 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 18821671  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactt 277  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18821672 cacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20594252 - 20593773
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----- 129  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          
T  20594252 tttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtctaaatatgattagggaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 20594153  T
Q  130 -----taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
         ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20594152 tagaataaacttttggaaatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgc 20594053  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    || || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20594052 gatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 20593953  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  20593952 atgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20593853  T
Q  423 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  20593852 gttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 25628997 - 25629476
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | || || |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||       
T  25628997 ttttgactttttagttgaaccttagatgttgttaagcgcctaaacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattgaacctggaaatattt 25629096  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
           ||||| || |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25629097 tagaataaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 25629196  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    ||| |||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25629197 gacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 25629296  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| |    
T  25629297 atgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgct 25629396  T
Q  423 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||   ||||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25629397 gttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 328 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 28496115 - 28496280
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||             
T  28496115 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagactt 28496214  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
     |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496215 agaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 350 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496244
Alignment:
Q  350 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 446  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 16496297  T
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496296 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 29808525 - 29808691
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||             
T  29808525 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 29808624  T
Q  126 ---gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
       |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808625 ttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1561786 - 1561689
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1561786 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa 1561689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18457193 - 18457029
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 131  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  18457193 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatta 18457094  T
Q  132 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
          ||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18457093 agaatgaactttttggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 18457029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21939862 - 21939699
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||             
T  21939862 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgagcctggaaagactt 21939763  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21939762 agaataaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 15894072 - 15894237
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    ||    
T  15894072 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacctggaaagactt 15894171  T
Q  131 a---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |         ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15894172 agaatgaaagaact--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 25611365 - 25611530
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||    ||    
T  25611365 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcagcatgagattggacctggaaagactt 25611464  T
Q  131 a---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |         ||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25611465 agaatgaaacaact--taggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgag 25611530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 4667846 - 4667948
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  4667846 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 4667945  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  4667946 gaa 4667948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 4674693 - 4674795
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  4674693 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 4674792  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  4674793 gaa 4674795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  336 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatact 432  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 31155031 - 31155133
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31155031 attctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 31155130  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  31155131 gaa 31155133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19652674 - 19652581
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  19652674 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacctggaa 19652581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 22334525 - 22334617
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22334525 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacctggaa 22334617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 4185456 - 4185558
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4185456 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtagagtgagattgaacctg 4185555  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  4185556 gaa 4185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4189444 - 4189342
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  4189444 attctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 4189345  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  4189344 gaa 4189342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 21834509 - 21834595
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21834509 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattag 21834595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 16523022 - 16523108
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||| ||||||    
T  16523022 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattag 16523108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 21739641 - 21739727
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21739641 cagagagcatgttgaattctgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattag 21739727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23019874 - 23019792
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  23019874 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaat 23019792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 27332926 - 27333019
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  27332926 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaa 27333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 27393666 - 27393759
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  27393666 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaa 27393759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 355 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109157
Alignment:
Q  355 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 452  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  453 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 473
Target Start/End: Original strand, 25603027 - 25603478
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tt 130  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||    ||    
T  25603027 ttttaacttttgagttgaacctgaaacgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcatgatgagattggacctggaaagactt 25603126  T
Q  131 a---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt 221  Q
    |         |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |   |||||||||  |||| ||   ||    
T  25603127 agaatgaaacaactta--ggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggactt 25603224  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgt 321  Q
    |||| || ||| ||   |||||   ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  | ||| | || ||||||||||||||| |||||| | |    
T  25603225 gcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgttt 25603324  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc--- 417  Q
     ||   ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||  |  ||| |||  | |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||       
T  25603325 agtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatg 25603423  T
Q  418 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603424 atgttgttgtaatctgcctatgctgctg-ttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Original strand, 15041169 - 15041285
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||   | ||  |||     
T  15041169 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataaaggttagatgataacttaga 15041268  T
Q  111 atgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||    
T  15041269 atgagattgaacctgga 15041285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656629
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1561401 - 1561303
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561401 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  355 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 451  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  452 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  480 ag 481  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 424  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  425 tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 22429660 - 22429839
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||| ||||||   |  || |||     
T  22429660 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 22429759  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22429760 acaagattgaacctggaa-caaccttagctgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22429839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  481 gatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 20803182 - 20803242
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20803182 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 22080391 - 22080543
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tta------aactt 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  | |||||||||||||||    |||      |||||    
T  22080391 agttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaactt 22080490  T
Q  137 gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     ||||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080491 atgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22782323 - 22782227
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782323 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 499
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18180989 - 18180903
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18180989 cagagagcatgttgaatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 18180903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1645181 - 1645002
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || |||     
T  1645181 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttaga 1645082  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1645081 atgagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgag 1645002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17804673 - 17804494
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || |||     
T  17804673 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 17804574  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17804573 acaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17804494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18907609 - 18907549
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18907609 cagagagcatgtcgaattctgtattttttacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 18907549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19663221 - 19663065
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  |      
T  19663221 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaacaacc 19663122  T
Q  134 cttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     ||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19663121 tttgttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctatcgcctcgcgag 19663065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12496761 - 12496605
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||  ||    
T  12496761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacctttaggtgcctattattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa-caa 12496664  T
Q  133 actt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12496663 ccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12496605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456732
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  435 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 20907611 - 20907669
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttga 69  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20907611 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttga 20907669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 25956263 - 25956357
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| | |||  ||||||| ||||||||||    
T  25956263 ttttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacctggaat 25956357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 477
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  387 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 9481923 - 9482040
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || |||     
T  9481923 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttaga 9482022  T
Q  111 atgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9482023 atgagattgaacctggaa 9482040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19863456 - 19863395
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  19863456 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 19863395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22439283 - 22439230
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22439283 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22439230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 482  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 25641802 - 25641887
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  25641802 cagagagcatgtaagattttgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 25641887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Original strand, 31164500 - 31164589
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31164500 ttttgacatttgagttgatacttggatgtccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggatgagattggacct 31164589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 482  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Original strand, 3708111 - 3708211
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    || | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3708111 gcagagagcatgtaggattttgtatttttgactttttagttggaccttgagcgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 3708210  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  3708211 g 3708211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14099104 - 14099004
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14099104 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14099005  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  14099004 g 14099004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 18916895 - 18916983
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  18916895 gcagagagcatgttgaattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 18916983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 22405685 - 22405748
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22405685 cagagagcatgttgaatttcgtaattt-gacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgcct 22405748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 23657050 - 23657110
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657050 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagt 23657110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 25766798 - 25766858
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25766798 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25766858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 8227534 - 8227632
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227534 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 19790410 - 19790469
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19790410 agagagcatgttgattttcgtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 19790469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 500
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  453 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22331917 - 22331803
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22331917 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 22331818  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  22331817 gacaagattgaacct 22331803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22432733 - 22432667
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||    
T  22432733 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtatattaaagatta 22432667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25644801 - 25644711
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  25644801 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttcatgtataacgttgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 25644711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 494
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448686
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20109682 - 20109605
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  20109682 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 20109605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 34833132 - 34833031
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34833132 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 34833033  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  34833032 ga 34833031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 5616444 - 5616504
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5616444 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 5616504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12707164 - 12707104
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12707164 cagagagcatgttattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12707104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16741683 - 16741623
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16741683 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16741623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19871068 - 19870980
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  19871068 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 19870980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 20556958 - 20557054
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556958 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21702763 - 21702703
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21702763 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21702703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 29096123 - 29096179
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 67  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29096123 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttctgagttgaaccttagatgctttt 29096179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 22334648 - 22334699
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22334648 tgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgag 22334699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 25641940 - 25641991
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25641940 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 1538628 - 1538686
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1538628 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1538686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 1544727 - 1544785
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1544727 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1544785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Original strand, 2684994 - 2685088
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  2684994 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 2685088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 1587384 - 1587421
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1587384 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1587421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 4185588 - 4185629
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4185588 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  387 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 4667978 - 4668019
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4667978 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16372280 - 16372223
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  16372280 ttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 16372223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19873196 - 19873120
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873196 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432249
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438799
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 25594981 - 25595090
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||   |||  |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | | ||||||    
T  25594981 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtag 25595080  T
Q  110 gatgagattg 119  Q
    || |||||||    
T  25595081 gacgagattg 25595090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Original strand, 27567246 - 27567299
Alignment:
Q  18 catgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27567246 catgttgatttttgtattttggacgtttgagttgaaccttatatgcttttgagt 27567299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 25135302 - 25135362
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25135302 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagt 25135362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 27333049 - 27333089
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27333049 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 27393789 - 27393829
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27393789 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 27553237 - 27553297
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27553237 cagagagcatgttgattttcgtatttcggacttttgagttgaaccttggatgtttttgagt 27553297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8244193 - 8244158
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8244193 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8244158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11567195 - 11567160
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11567195 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 473
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatat-ttgtatacataagatgttgatga 394  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||| || | |||||  | |||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||  |||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattga 15041563  T
Q  395 attgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||   |||||||   ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15041564 attgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactatt-gttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Original strand, 16964957 - 16964996
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16964957 gacttttgagttgaaccttagatggctttgagtgcctgaa 16964996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 485
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  434 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19652551 - 19652512
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 187  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19652551 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19870923 - 19870888
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19870923 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19870888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22863278 - 22863243
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22863278 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22863243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23395401 - 23395366
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23395401 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23395366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Original strand, 34295751 - 34295810
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  34295751 tttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 34295810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 111
Target Start/End: Original strand, 17036987 - 17037065
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  17036987 atttttgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 17037065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 22592457 - 22592613
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| |||||||||||  |  || ||| | ||||||| ||||||||  ||     
T  22592457 tttttgacatttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattaggggatgatttagaacgagattgtacctggaa-caac 22592555  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||  |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22592556 cttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22592613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 23276907 - 23277008
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctt-agatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 108  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| || | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||    
T  23276907 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagct-cctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgta 23277005  T
Q  109 gga 111  Q
    |||    
T  23277006 gga 23277008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30694784 - 30694738
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  30694784 ttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 30694738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 8244338 - 8244277
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8244338 gcagagagcatgttggattttgtgtttcgaccttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 8244277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14472692 - 14472647
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14472692 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 14472647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Original strand, 16924642 - 16924687
Alignment:
Q  144 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16924642 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16924687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Original strand, 16929357 - 16929402
Alignment:
Q  144 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16929357 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 78
Target Start/End: Original strand, 22059396 - 22059429
Alignment:
Q  45 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22059396 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22059429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 24314739 - 24314808
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24314739 ctttttagttggaccttgaatgctttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 24314808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 27327722 - 27327787
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27327722 agttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27327787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 27388462 - 27388527
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27388462 agttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27388527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 31155163 - 31155204
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155163 acctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 31155204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Original strand, 34369658 - 34369715
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  34369658 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 34369715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 112
Target Start/End: Original strand, 14059283 - 14059347
Alignment:
Q  48 gttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||||||||  || | |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14059283 gttgaaccttgtatacctttgagtgcccgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14059347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18697031 - 18696979
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgctttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18697031 agttgaactttagatgatttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 18696979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668688
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 19668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 23657189 - 23657229
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657189 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23657229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 27415596 - 27415632
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27415596 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27415632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 33443584 - 33443532
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 103  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  33443584 gaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaaga 33443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 137)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 500
Target Start/End: Original strand, 38801041 - 38801508
Alignment:
Q  32 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38801041 tatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgtgattgaacctggaattg 38801140  T
Q  132 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801141 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttg 38801240  T
Q  232 ttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgat 331  Q
    |||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38801241 ttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgat 38801340  T
Q  332 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatac 431  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | ||    
T  38801341 tacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacac 38801440  T
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801441 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 500
Target Start/End: Original strand, 27250384 - 27250850
Alignment:
Q  37 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  27250384 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgggattgaacctggaatgaaacct 27250483  T
Q  137 gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgct 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  27250484 gtgggattctgacctgaactcgccacgtcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtcccttgttatattttgcgacctttgttgca 27250583  T
Q  237 caagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatga 336  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  27250584 cgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 27250683  T
Q  337 tgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatact 432  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21027153 - 21026680
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21027153 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 21027054  T
Q  130 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 229  Q
     ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21027053 gaaacttgtgaggttctgacctaaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctt 21026954  T
Q  230 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 329  Q
    |||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  21026953 tgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttg 21026854  T
Q  330 attatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---tt 425  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||   ||    
T  21026853 attatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgatttt 21026754  T
Q  426 gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026753 gtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 499
Target Start/End: Original strand, 50209856 - 50210333
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  50209856 ttttgacttttgagttgatc-ttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 50209954  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
        | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50209955 agaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 50210054  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50210055 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 50210154  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  50210155 atgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 50210254  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50210255 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 35 - 425
Target Start/End: Original strand, 22354214 - 22354616
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga------- 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||           
T  22354214 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtaggatgagattgaacctggatagattg 22354313  T
Q  128 ----attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22354314 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgc 22354413  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22354414 gacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 22354513  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22354514 atgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgct 22354613  T
Q  423 gtt 425  Q
    |||    
T  22354614 gtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 22355827 - 22356185
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22355827 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaat 22355926  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac-ttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22355927 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgtt 22356025  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgatt 332  Q
    || | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||    
T  22356026 gcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgatt 22356125  T
Q  333 atgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 391  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22356126 atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 22357513 - 22357871
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22357513 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaat 22357612  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac-ttgttagattttgcgacctttgtt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22357613 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgtt 22357711  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgatt 332  Q
    || | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||    
T  22357712 gcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgatt 22357811  T
Q  333 atgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 391  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22357812 atgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 34510259 - 34509783
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       
T  34510259 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 34510160  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gc 223  Q
           ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||    
T  34510159 tagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgc 34510060  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  34510059 gacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttg 34509960  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||   |    
T  34509959 atgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgct 34509860  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34509859 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22532748 - 22532269
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       
T  22532748 ttttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaggattg 22532649  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
           ||||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22532648 tagaatgaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgc 22532549  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  22532548 gacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttg 22532449  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   || |||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||   |    
T  22532448 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgct 22532349  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22532348 gtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Original strand, 20846867 - 20847147
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20846867 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20846966  T
Q  130 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 229  Q
     ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20846967 gaaacttgtgaggttttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 20847066  T
Q  230 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    |||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||  ||||||| |||||||||    
T  20847067 tgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgt 20847147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20135671 - 20135188
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa- 128  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20135671 tgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaa 20135572  T
Q  129 ---------ttaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagat 218  Q
             | |||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20135571 gacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggt 20135473  T
Q  219 tt-tgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 317  Q
    || ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| | |||||| | |||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20135472 ttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagat 20135373  T
Q  318 atgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 416  Q
     ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  20135372 gtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgt 20135273  T
Q  417 c---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |   |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  20135272 catgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 433486 - 433012
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  433486 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 433387  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agatttt 221  Q
      |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||||||   ||||||    
T  433386 tagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttgcaaaatg-cttgtttaggatttt 433289  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagatat 319  Q
    |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||  |||||  ||||| || |||||| |||||| | || |||      
T  433288 gcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaata-ttataaataatattaatgatgatctgtaaagctgatttatgatga 433190  T
Q  320 gttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc- 417  Q
     ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||     
T  433189 tttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 433090  T
Q  418 --atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  433089 tgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20919080 - 20918917
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  20919080 ttttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagactt 20918981  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
     ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20918980 agaatttaaatttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21754518 - 21754423
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||    
T  21754518 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacctgg 21754423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 52927623 - 52927716
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  52927623 ttttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacctggaa 52927716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 289 - 499
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  289 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  388 ttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  485 ttgaagatgatgatg 499  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33681488 - 33681301
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----t 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||     |    
T  33681488 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattt 33681389  T
Q  130 ta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg 212  Q
    ||     || || || || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
T  33681388 tagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 22921509 - 22921603
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||    
T  22921509 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaaccaggaat 22921603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20248756 - 20248664
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20248756 ttttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctgga 20248664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21162216 - 21162117
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21162216 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 21162117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 406 - 500
Target Start/End: Original strand, 45574912 - 45575008
Alignment:
Q  406 tattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 22830997 - 22831083
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22830997 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22831083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Original strand, 20091113 - 20091281
Alignment:
Q  32 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg------ 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||          
T  20091113 tatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacctgaaaaga 20091212  T
Q  126 ----gaattaaacttgt-gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
        |||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  20091213 cttagaatgaaacaacttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 21301180 - 21301245
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21301180 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 21301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22238108 - 22238015
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  22238108 ttttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctggaa 22238015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 424 - 500
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Original strand, 18181743 - 18181826
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  18181743 agagcatgtcgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattag 18181826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 21787665 - 21787746
Alignment:
Q  15 gagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  21787665 gagcatgttgaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagatta 21787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 42864830 - 42864915
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||||||||    
T  42864830 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgatta 42864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  481 gatg 484  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21023138 - 21023075
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21023138 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcc 21023075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 22432402 - 22432488
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22432402 cagagagcatgttgaattaagtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22432488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 424  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  425 tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 43697839 - 43697745
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||| ||||||||||    
T  43697839 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacctggaat 43697745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  287 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918623
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  481 gatg 484  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 3472545 - 3472607
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 73  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472545 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 3472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21754145 - 21754064
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754145 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  481 gatgttgaagatgatgatgt 500  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 6152347 - 6152270
Alignment:
Q  19 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  6152347 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 6152270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 402 - 484
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261183
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 8761252 - 8761316
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761252 cagagagcatgttggatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 8761316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 499
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 22123133 - 22123214
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123133 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 500
Target Start/End: Original strand, 13212928 - 13213027
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  13212928 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  405 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtc 501  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtc 15860175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Original strand, 28194085 - 28194180
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28194085 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctg 28194180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 18393593 - 18393679
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  18393593 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 18393679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21342192 - 21342090
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  21342192 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 21342095  T
Q  499 gtcca 503  Q
    |||||    
T  21342094 gtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 24782730 - 24782816
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| || ||||||||||    
T  24782730 cagagagcatgtcgaattttgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattag 24782816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 45309996 - 45310082
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  45309996 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 45310082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 22468339 - 22468400
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  22468339 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 22468400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 50887381 - 50887482
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  50887381 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 50887480  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  50887481 ga 50887482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 3704716 - 3704776
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3704716 cagagagcatgttgaatttcgtgttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 3704776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21305790 - 21305730
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21305790 cagagagcatgtcgagttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21305730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21347057 - 21346961
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347057 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 35981324 - 35981419
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35981324 tgtagttttgacctttaagtcgaacctt-gatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgg 35981419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 36818938 - 36818998
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36818938 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaaatgcctttgagt 36818998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 17678218 - 17678277
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17678218 agagagcatgttgaatttcataatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17678277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 20228440 - 20228499
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20228440 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagt 20228499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21715026 - 21714983
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21715026 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21714983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 71
Target Start/End: Original strand, 45489394 - 45489433
Alignment:
Q  32 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45489394 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45489433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12647322 - 12647166
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | |||||||||| |||||  ||     
T  12647322 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacttggaa-caac 12647224  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12647223 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12647166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Original strand, 16275428 - 16275526
Alignment:
Q  400 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16275428 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18882820 - 18882664
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  18882820 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 18882722  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18882721 cttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 18882664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21615913 - 21615796
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  21615913 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-ag 21615815  T
Q  110 gatgagattgaacctggaa 128  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21615814 aatgagattgaacctggaa 21615796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21754392 - 21754350
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754392 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23763688 - 23763574
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23763688 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23763589  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  23763588 gacaagattgaacct 23763574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 430 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 20524873 - 20524958
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20524873 gactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 20524958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21438242 - 21438157
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21438242 gactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 21438157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714546
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21829191 - 21829078
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21829191 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21829092  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  21829091 gatcagattgaacc 21829078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21844704 - 21844591
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21844704 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21844605  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  21844604 gatcagattgaacc 21844591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 23818952 - 23818989
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23818952 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 23818989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 16080074 - 16080134
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  16080074 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattggatgcctttgagt 16080134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21342632 - 21342564
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21342632 tgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21342564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21347497 - 21347429
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21347497 tgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21347429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 21895869 - 21895965
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| |||||||  || |||||| | ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  21895869 tgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 21895965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 482
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16759210 - 16759115
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||| |||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  16759210 tgtagttttgacccttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacacgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 16759115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19212320 - 19212226
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  19212320 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa 19212226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26065461 - 26065382
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  26065461 agttgaactttagatgatcctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 26065382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 41049626 - 41049701
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  41049626 gaaccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtataataatggttaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 41049701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1011169 - 1011087
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1011169 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 1011087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19063942 - 19063884
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19063942 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19063884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19111832 - 19111774
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19111832 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19111774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20138536 - 20138380
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||   |  || ||| |||||||||||||  |||  ||     
T  20138536 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacccagaa-caac 20138438  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20138437 cttagttgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 125
Target Start/End: Original strand, 35260713 - 35260787
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  35260713 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 35260787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46975920 - 46975764
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  46975920 ttttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacttttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 46975822  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46975821 cttagttgggattctttcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 46975764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21162121 - 21162080
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21162121 acctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 33797986 - 33797949
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33797986 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33797949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 16367873 - 16367945
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  16367873 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctggaa 16367945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 21861131 - 21861227
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| |||||||  || |||||| | ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  21861131 tgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 21861227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 16375231 - 16375266
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16375231 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16375266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20637330 - 20637235
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||    
T  20637330 ttttgacctttaagttgaaccttggatgttttttgagtgcctagacttgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaat 20637235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21407688 - 21407653
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21407688 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52639874 - 52639839
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639874 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 52639839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16381698 - 16381652
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  16381698 ttagatggttttgagtgcctggacatgtataagaatgattaggaaag 16381652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19105175 - 19105117
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19105175 tttgagtgcctaaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19105117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 455 - 485
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  455 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 71
Target Start/End: Original strand, 33049739 - 33049777
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33049739 attttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagt 33049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 52940464 - 52940506
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52940464 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataataattagg 52940506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20248633 - 20248592
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20248633 acctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Original strand, 22921631 - 22921672
Alignment:
Q  147 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22921631 gacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22921672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065254
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 28194213 - 28194254
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  28194213 acctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 28194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 35981451 - 35981492
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  35981451 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 35981492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Original strand, 52927745 - 52927786
Alignment:
Q  147 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  52927745 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 52927786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 16093479 - 16093551
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16093479 ttagatggttttgagtgcctggatatgtataataatgatttggcaagtttttagattgagattgaacctggaa 16093551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 499
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 45310135 - 45310175
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45310135 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45310175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 702 - 1169
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||    
T  702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctagattgaaac 801  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  802 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 901  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | |||||||    
T  902 cacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattat 1001  T
Q  335 gatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatac 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  1002 gatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatac 1101  T
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1102 tgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 167632 - 168099
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||    
T  167632 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctagattgaaac 167731  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167732 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 167831  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | |||||||    
T  167832 cacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattat 167931  T
Q  335 gatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatac 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  167932 gatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatac 168031  T
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168032 tgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 52391 - 51913
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  52391 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 52292  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  52291 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgc 52192  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||| ||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52191 gacc-ttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 52093  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |    
T  52092 atgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 51993  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51992 gtttttgtatattgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 52051 - 51582
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  52051 gtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaatg 51952  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51951 aaacttacgggattctaacctgagctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgactttt 51852  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  51851 gttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga 51752  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
     ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  51751 atatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgtata 51652  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51651 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 108984 - 109055
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 112  Q
    ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  108984 cttttaagttgaaccttgtatacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 109055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5180 - 4712
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5180 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaattaaac 5081  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaga-ttttgcgacctttgtt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5080 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgtt 4981  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4980 gcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgatta 4881  T
Q  334 tgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtata 430  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||| |||||||    
T  4880 tgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtata 4781  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4780 ctgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 35 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 13
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  404 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaattaaac 305  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaga-ttttgcgacctttgtt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  304 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgtt 205  T
Q  234 gctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgatta 333  Q
    || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  204 gcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgatta 105  T
Q  334 tgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 425  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||    
T  104 tgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 1952
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2424 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataataattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaatt 2325  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2324 aaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacatgttagattttgcgaccttt 2225  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  2224 gttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttga 2125  T
Q  331 ttatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttg 426  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||    
T  2124 ttatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttg 2025  T
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2024 tatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1289
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||| | ||||||||||||||||    
T  1758 gtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtaggacgtgattgaacctggaatt 1659  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1658 aaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgaccttt 1559  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1558 gttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttga 1459  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  1458 ttatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtaca 1359  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1358 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7735 - 7266
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatt 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||| | ||||||||||||||||    
T  7735 gtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtaggacgtgattgaacctggaatt 7636  T
Q  131 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttt 230  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7635 aaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgaccttt 7536  T
Q  231 gttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7535 gttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttga 7436  T
Q  331 ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtata 430  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7435 ttatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgttgtata 7336  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7335 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16130 - 16083
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16130 gtatttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcctgaa 16083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 497
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13679 - 13211
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13679 ttttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacctggaatgaaac 13580  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13579 ttgtggcattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgccttgttagattttgcgacctttgttg 13480  T
Q  235 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 334  Q
    | | ||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  13479 cacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattat 13380  T
Q  335 gatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtata 430  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  13379 gatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 13280  T
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13279 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9717
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | |   || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  9873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatggatttatttagaacgagattgaacctggaa-caac 9775  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9774 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 9717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 32 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7081 - 6669
Alignment:
Q  32 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7081 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataattattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaatta 6982  T
Q  132 aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttg 231  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6981 aacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgacatgttagattttgcgacctttg 6882  T
Q  232 ttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgat 331  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6881 ttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgat 6782  T
Q  332 tatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgt 427  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  6781 tatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgt 6682  T
Q  428 atactgcctatgt 440  Q
    |||||||||||||    
T  6681 atactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 1851
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  2330 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 2231  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  2230 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgt 2131  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2130 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttg 2031  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2030 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgtt 1931  T
Q  423 g---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1930 gtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 207160 - 207324
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg-------- 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||            
T  207160 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagact 207259  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
      |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  207260 tagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 119205 - 119255
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  119205 agttgaacattagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 119255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5321 - 4849
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5321 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 5222  T
Q  130 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 229  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5221 gaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-ttttgccacctt 5123  T
Q  230 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 329  Q
    |||||| | |||||| |||  || |||| |||| ||| | ||||||||||| |   |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  5122 tgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttg 5023  T
Q  330 attatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---tt 425  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||   ||    
T  5022 attatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgatttt 4923  T
Q  426 gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4922 gtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3949 - 3470
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  3949 ttttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgattg 3850  T
Q  132 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3849 tagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttaggttttgc 3750  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  3749 gacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttg 3650  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  3649 atgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 3550  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3549 gtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 343
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||          
T  821 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagaatt 722  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  721 tagaatgaaacttttggaat-ctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttg 623  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    | |||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||    
T  622 caacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgtt 523  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg- 420  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||     
T  522 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgc 423  T
Q  421 -ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
      | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  422 tattttgtatactgcctatgttattg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 35 - 481
Target Start/End: Original strand, 23944 - 24405
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          
T  23944 ttttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaaattgt 24043  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcg 224  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24044 agaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttagattttgcg 24143  T
Q  225 acctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgt 324  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  24144 acctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 24243  T
Q  325 tgatg-attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
    || || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  24244 tgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgct 24343  T
Q  423 g----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24344 gtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 34529 - 34593
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34529 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 34593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 75
Target Start/End: Original strand, 41185 - 41236
Alignment:
Q  24 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41185 gaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcct 41236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 64306 - 64150
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  ||  || || |||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||  ||     
T  64306 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcgtactattgattagggaaggatttagaacgagattgaaactggaa-caac 64208  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  64207 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 64150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 76190 - 76034
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  76190 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaactttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa-caac 76092  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   | ||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  76091 cttagttaggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 76034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 34 - 500
Target Start/End: Original strand, 5762 - 6245
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg------- 126  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||           
T  5762 ttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaggatgagattgaacctgggaagatt 5861  T
Q  127 ----aattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttg 222  Q
        ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5862 attgaatgaaatttgcgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttg 5961  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  5962 cgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgtt 6061  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       
T  6062 gatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgc 6161  T
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6162 tgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39238 - 38761
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  39238 ttttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 39139  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gc 223  Q
        | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  39138 tgaatgaaacttgtgg-attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgc 39040  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39039 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 38940  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  38939 atgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgct 38840  T
Q  423 g--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  38839 gttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  291 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 389  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  390 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 487  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  488 aagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 402 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  499 gtcc 502  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21374 - 20910
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21374 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatgagattgtacctggaat 21275  T
Q  130 taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctt 229  Q
     ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21274 gaaacttgt----------cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgacttgttgagttttgcgacctt 21185  T
Q  230 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 329  Q
    |||||| | |||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  21184 tgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctg 21085  T
Q  330 attatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---tt 425  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21084 attatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgttttt 20985  T
Q  426 gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20984 gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1052
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1406 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtagg 1307  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||    
T  1306 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgcct 1207  T
Q  211 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  1206 tgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgt 1107  T
Q  311 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 364  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1106 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3973 - 3640
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3973 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtagg 3874  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3873 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgcct 3774  T
Q  211 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3773 tgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgt 3674  T
Q  311 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 344  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3673 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8037 - 7704
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8037 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtagg 7938  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7937 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgcct 7838  T
Q  211 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7837 tgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgt 7738  T
Q  311 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 344  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7737 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Original strand, 27296 - 27375
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  27296 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctgg 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27851
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 9)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 35 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 125061 - 124675
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||          
T  125061 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgag---gaacctggaaagattg 124965  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  124964 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttagattttgc 124865  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  124864 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 124765  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 412  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  124764 atgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 482  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  483 tgttgaagatgatgatg 499  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 63039 - 62947
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  63039 tttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 62947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 430 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 484
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 484
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 175243 - 175202
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  175243 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 190
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136173
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 136173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 190
Target Start/End: Original strand, 144840 - 144881
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 34 - 499
Target Start/End: Original strand, 16856 - 17337
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----- 128  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         
T  16856 tttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatt 16955  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  16956 tagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttg 17055  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||    
T  17056 cgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgtt 17155  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg- 420  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||     
T  17156 gatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 17255  T
Q  421 ----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
        || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17256 tgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 79007 - 79096
Alignment:
Q  38 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  79007 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtagaatgagattgaacctgga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 13696 - 13760
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13696 cagagagcatgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcct 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 35 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13141
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||             
T  13571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctgaaaagattg 13472  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13471 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgc 13372  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  13371 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttg 13272  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |    
T  13271 atgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 13172  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 450  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13171 gtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34603 - 34437
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----- 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         
T  34603 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaag 34504  T
Q  126 -----gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 188  Q
         |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34503 acttagaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34123
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34221 gatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 34 - 493
Target Start/End: Original strand, 25706 - 26179
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta-- 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |      
T  25706 tttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagatt 25805  T
Q  132 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
            || || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25806 gtagaatgaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttg 25905  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  25906 cgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgtt 26005  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 418  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||       
T  26006 gatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgc 26105  T
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26106 tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Original strand, 33136 - 33461
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  33136 ttttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctggacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattt 33235  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  33236 tagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttg 33335  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||| || |||    ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||    
T  33336 cgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgtt 33435  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatg 348  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  33436 gatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  480 agatgttgaagatgatga 497  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8954 - 8479
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |       
T  8954 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctagaaagattg 8855  T
Q  132 --------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8854 taaaatggaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgc 8755  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8754 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttg 8655  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || ||||||||||||    ||||| | | |||||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |    
T  8654 atgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatact 8559  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8558 gtttttgtatactacctatgttgct-attgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 8175 - 8650
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  8175 ttttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 8273  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8274 tagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgc 8373  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttggg-taggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||||||||  | ||| ||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8374 gaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgtt 8473  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
    | || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  8474 gatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc 8573  T
Q  422 tgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8574 tgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Original strand, 339593 - 340065
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |       
T  339593 ttttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaatttgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 339692  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcg 224  Q
           ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  339693 tagaatgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttaggttttgcg 339792  T
Q  225 acctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgt 324  Q
    ||||||||||| | ||| ||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  339793 acctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 339892  T
Q  325 tgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg 423  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  339893 tgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg 339991  T
Q  424 --ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
      ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  339992 ttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 424  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  425 tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 140185 - 140126
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  140185 agagagcaagttgttttctgggtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 140126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 97083 - 97022
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgac-ttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  97083 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgaccttttgagttgaacctcagatgcctttgagt 97022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 71765 - 71729
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  71765 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 71729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11440
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgt 11269  T
Q  139 gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctca 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11270 gggatactgacctgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacg 11369  T
Q  239 agttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 309  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11370 agttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctg 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 385 - 500
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  385 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14106 - 14055
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14106 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 39913
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg---gaat-- 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |      
T  40390 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctgacagattgt 40291  T
Q  130 ----taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagat-tttgcg 224  Q
        | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  40290 agaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcg 40191  T
Q  225 acctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgt 324  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | || ||| |||||     
T  40190 acctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttga 40091  T
Q  325 tgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg 423  Q
    || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||||||  |||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  40090 tgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg 39991  T
Q  424 --ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
      |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39990 ttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 18275 - 18360
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18275 cagagagcatgtcgaattctgcattttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 18413 - 18464
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18413 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 7)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40335 - 39858
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          
T  40335 ttttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggaggatgagattgaacctggaaagattg 40236  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
         | |||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  40235 tagaatgaaacttttggt-ttctaacctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttg 40137  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||    
T  40136 cgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaa-ccttgggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgtt 40038  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg- 420  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||     
T  40037 gatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatga 39938  T
Q  421 -ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
      | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39937 tattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  186 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataata 284  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |      
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  285 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 383  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
     || ||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 39573 - 39666
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39573 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 125
Target Start/End: Original strand, 59179 - 59235
Alignment:
Q  69 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  59179 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctg 59235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26662 - 26611
Alignment:
Q  77 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26662 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattaaacctggaa 26611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59308
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26589 - 26555
Alignment:
Q  140 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagg 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26589 ggattctgacctgaagtcgccacggcgagcagagg 26555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23361 - 22886
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----- 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||          
T  23361 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggatctggaaagattg 23262  T
Q  130 taaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gc 223  Q
    || | |||     ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  23261 tagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgc 23162  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23161 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 23062  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---t 419  Q
     || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |    
T  23061 atgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 22962  T
Q  420 gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22961 gtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16721
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||          
T  16241 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacctggaaagattt 16340  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt-agattttg 222  Q
         | |||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  16341 tcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttg 16440  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||| || ||| || ||||||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  16441 cgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgtt 16540  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||| | ||||| || ||| ||  | |||||||||||||||||||     
T  16541 gatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgc 16640  T
Q  422 tgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16641 tgttttcgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 483
Target Start/End: Original strand, 51526 - 51987
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  51526 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattg 51625  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51626 tcgaatgaaacttgtgggattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 51725  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tataagata-tgt 321  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |      
T  51726 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgttatgagatattaa 51825  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||    
T  51826 tgttgat--ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattattatgtcttg 51922  T
Q  421 ---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 483  Q
       || ||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51923 ctatttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32555
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33003 - 32921
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||    
T  33003 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacttggaat 32921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32892 - 32826
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 214  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  32892 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgtt 32826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 16316 - 16353
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16316 tttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagt 16353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20882 - 20596
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  20882 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagatta 20783  T
Q  129 -----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20782 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgccttgttagattttgc 20683  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 310  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20682 gacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgt 20596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4987 - 4508
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  4987 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 4888  T
Q  129 ------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-atttt 221  Q
          | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||    
T  4887 ttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggatttt 4789  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgt 321  Q
    |||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4788 gcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 4689  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca-- 418  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||      
T  4688 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 4589  T
Q  419 -tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  4588 ctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12569 - 12090
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  12569 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 12470  T
Q  129 ------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-atttt 221  Q
          | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||    
T  12469 ttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggatttt 12371  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgt 321  Q
    |||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12370 gcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 12271  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca-- 418  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||      
T  12270 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 12171  T
Q  419 -tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  12170 ctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22521 - 22042
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  22521 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattt 22422  T
Q  129 ------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-atttt 221  Q
          | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||    
T  22421 ttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggatttt 22323  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgt 321  Q
    |||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  22322 gcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 22223  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca-- 418  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||      
T  22222 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 22123  T
Q  419 -tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
     |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  22122 ctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 18262 - 18441
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || |||     
T  18262 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatttaga 18361  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaact--tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  ||||||||||| |||  || ||  | ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18362 acaagattgaacctagaa-caaccttatttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 39836 - 39479
Alignment:
Q  144 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  39836 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 39737  T
Q  243 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 342  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  39736 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 39637  T
Q  343 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 439  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39636 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 39537  T
Q  440 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39536 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 498
Target Start/End: Original strand, 74976 - 75333
Alignment:
Q  144 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  74976 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 75075  T
Q  243 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 342  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  75076 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 75175  T
Q  343 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 439  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  75176 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 75275  T
Q  440 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75276 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 440
Target Start/End: Original strand, 604 - 1021
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||             
T  604 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagaacgagattgaacctggtttagtag 703  T
Q  126 -gaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttg 222  Q
     |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||     
T  704 agaatgaaacttgttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaaacagagagtcttgttaggattttt 803  T
Q  223 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 322  Q
    ||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||  | | | || |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  804 cgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgtt 903  T
Q  323 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt 421  Q
    | ||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  ||  ||| |||  | |||| ||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||     
T  904 gatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg-cattgatattattatgccatgc 1002  T
Q  422 tgttgtatactgcctatgt 440  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1003 tgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 500
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 8134 - 8228
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||| || |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||| ||||||    
T  8134 ttttgagttgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggcaaggttttagaatgagattgaacttggaat 8228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 218 - 500
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  218 ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 317  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  318 atgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 416  Q
      |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 3186  T
Q  417 catgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3187 catgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Original strand, 655 - 837
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga------- 127  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |           
T  655 ttttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctgaaaagattg 754  T
Q  128 ---attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 207  Q
       | | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  755 tagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Original strand, 17650 - 17928
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  17650 ttttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggatagattg 17749  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgc 223  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17750 tagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggc---------------------gagtcacccagaaatagagtgacttgttaggttttgc 17828  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17829 gacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 6)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 32601 - 33077
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----t 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||     |    
T  32601 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattt 32700  T
Q  130 ta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
    ||     || || || || |   |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  32701 tagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgc 32800  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    || || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||||||||||| | | |   ||| ||    
T  32801 gatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatg-atgctg 32899  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  32900 atgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgct 32998  T
Q  423 gtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32999 gttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 46404 - 45928
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----t 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||     |    
T  46404 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattt 46305  T
Q  130 ta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgc 223  Q
    ||     || || || || |   |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  46304 tagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgc 46205  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 323  Q
    || || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||||||||||| | | |   ||| ||    
T  46204 gatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctattttatg-atgctg 46106  T
Q  324 ttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgtt 422  Q
     || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  46105 atgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgct 46007  T
Q  423 gtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46006 gttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16565 - 16333
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----t 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          
T  16565 ttttgacttttgagttgatccttagg-gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaaagattg 16467  T
Q  130 taaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
    || | |||     ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  16466 tagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgc 16367  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacc 257  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16366 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacc 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  292 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 390  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  391 atgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 487  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  488 aagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 19647 - 19707
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19647 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 500
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28192 - 27912
Alignment:
Q  142 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||| || ||||    
T  28192 attctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaag 28093  T
Q  241 ttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtg 340  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  28092 ttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtg 27993  T
Q  341 atataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 420  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27992 atataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29015 - 28924
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29015 ttttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 1357 - 1407
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1357 agttgaacttcagatgattttgagtgcctgaacatgtatattaatgattag 1407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4545
Alignment:
Q  40 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----tta--- 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||     |||       
T  4997 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaatgactagggaagattgtagaatgagattgaacctgaaaagattttagaa 4898  T
Q  132 --aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacct 228  Q
      ||||| ||    || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  4897 tgaacttttgtcgatcagacctgtcctcgccatggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacct 4798  T
Q  229 ttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgat 328  Q
    ||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| | |  | |||||||||||| ||||| ||||| | | | |||||| || |    
T  4797 ttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgtt 4699  T
Q  329 gattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgt 424  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||||||| ||||||  | |||||||||| || ||    || |||    
T  4698 gatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgt 4599  T
Q  425 tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    || |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4598 tgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10200
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  10356 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caac 10258  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10257 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 163
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  383 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattt 284  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgc 223  Q
     |||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  283 agaatgaaactttttgagttctgacctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgc 184  T
Q  224 gacctttgttgctcaagttgt 244  Q
    || || ||| || ||||||||    
T  183 gatctgtgtcgcacaagttgt 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Original strand, 13250 - 13383
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  13250 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgagcctgaaatgaaac 13349  T
Q  135 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 168  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13350 ttgtgggatcctgacctgaacttgccccggcgag 13383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10637 - 10323
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----t 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||       |||||||||||||||     |    
T  10637 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgcctagtagtgattaggaaagaatg-------agattgaacctggaaagattt 10545  T
Q  130 ta-------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-atttt 221  Q
    ||       || || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  10544 tagaatgaaaaattttcaaattctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggatttt 10445  T
Q  222 gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgt 321  Q
    |||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10444 gcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 10345  T
Q  322 tgttgatgattatgatgtgata 343  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  10344 tgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2820
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2727 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 197
Target Start/End: Original strand, 1711 - 1891
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1711 attctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 1809  T
Q  126 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 197  Q
               |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1810 gaaagattttagaatgaaactt-tggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 1891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17259 - 17090
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  17259 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagattt 17160  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 194  Q
      |||| |||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17159 tagaataaaactt-tgagaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 17090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16880 - 16784
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16880 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 128
Target Start/End: Original strand, 7471 - 7506
Alignment:
Q  93 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Original strand, 7537 - 7576
Alignment:
Q  150 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7537 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20591 - 20426
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||             
T  20591 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaataagattgaacctggaaagattt 20492  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
     |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20491 agaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 15257 - 15426
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||             
T  15257 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctggatagattt 15356  T
Q  126 --gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 194  Q
      |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357 tagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 15426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  481 gatg 484  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13111 - 13033
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  13111 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaccatgtatattaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  299 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  398 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  495 tgatg 499  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 2082 - 2250
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg---- 125  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  2082 tgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaa 2181  T
Q  126 ------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2182 gacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 18600 - 18693
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600 ttttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 7936 - 8029
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 8029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 484
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53654
Alignment:
Q  331 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 427  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 53108 - 53204
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  53108 tgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 53204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8099
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8062 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 364 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  364 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 460  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  461 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  444 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14961 - 14914
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 77  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14961 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgctttggagtgcctga 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Original strand, 12451 - 12611
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  12451 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagacat 12550  T
Q  126 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 186  Q
     |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12551 agaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 28917 - 29011
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28917 tgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 29011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 481
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 10226
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  10389 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagactt 10290  T
Q  131 ------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
          ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10289 agaaggaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 20069 - 20228
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta- 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||     
T  20069 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaattaa 20168  T
Q  132 -----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 186  Q
         ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20169 gaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 484
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20527
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 448  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  449 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54041 - 53862
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || |||     
T  54041 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 53942  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53941 acaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 65412 - 65479
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  65412 cagagagcatgtaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 65479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  336 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatac 431  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  || | |      
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttt 128819  T
Q  432 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 506 - 344
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatta--- 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  506 ttttgacttttgaattgaaccttagatgcctt-gagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaatactt 408  T
Q  132 -------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
           |||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  407 agaatggaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12407 - 12243
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg---aatta 131  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  12407 ttttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatta 12308  T
Q  132 ------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
          ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12307 agaatgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagt 12243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 438 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  438 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16142 - 16047
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16142 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 1845 - 1755
Alignment:
Q  6 aggagcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  1845 aggaccagagagcatgtaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagatta 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15974
Alignment:
Q  152 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16011 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 17920 - 17971
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  17920 agttgaaccttagataattttgagtgcatgaatatgtataataatgattagg 17971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 296 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26840
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 395  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  396 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26928 ttg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27322 - 27256
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27322 agagagcatgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 27256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32567 - 32469
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  32567 tgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 32469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 436 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  436 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32439 - 32397
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32439 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7290 - 7197
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  7290 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 7197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8483 - 8401
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  8483 agttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 8401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7167 - 7126
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7167 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Original strand, 28451 - 28540
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28451 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 28540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28616
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9639
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa---------- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  9480 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagacttagaa 9579  T
Q  129 ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9580 tgaaactttggagaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 79974 - 80137
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa------ 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  79974 ttttgacttttgagttgaacattaaatgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagactt 80073  T
Q  129 ----ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
        | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  80074 agaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 21188 - 21303
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||| || ||| |||||    | ||||||||    
T  21188 cagagagcatgtcgaattctatattttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggattaaatgataatgtagg 21287  T
Q  111 atgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  21288 atgagattgaacctgg 21303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 500
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  481 gatgttgaagatgatgatgt 500  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 12)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 133132 - 133039
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  133132 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaa 133039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 436 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  436 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 133009 - 132967
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  133009 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 58492 - 58527
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58492 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 58527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41959 - 41901
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41959 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacc 41901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 57466 - 57408
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  57466 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacc 57408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 161164 - 161072
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  161164 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctgga 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 402 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 160784 - 160688
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501100
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 173766 - 173587
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||  |  |||||| ||||||||||   |  || ||      
T  173766 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgactttttagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaatgattagaggatgatttata 173667  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  173666 atgagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 173587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85742
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 422163 - 422221
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttga-cttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  422163 agagcttgtcgaattttgtaattttgaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 422221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 447007 - 446965
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  447007 ttagatgattttgggtgcctgaacatgtataataatgattagg 446965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 497938 - 497896
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  497938 ttagatgattttgtgtgcctgaacatgtataataatgattagg 497896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 3854 - 3940
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  3854 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 3993 - 4033
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3993 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10623 - 10540
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagatt 118  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagatt 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Original strand, 24291 - 24456
Alignment:
Q  33 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa---- 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||        
T  24291 atttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctagaaagac 24390  T
Q  129 ------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
          | ||||||  |  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24391 ttagaatgaaactttggataatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 38279 - 38377
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38279 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 42905 - 42869
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42905 agagagcatgtcgaattctgtattcttgacttttgag 42869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3411 - 3317
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  3411 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9564 - 9462
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  9564 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctg 9465  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  9464 gaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9432 - 9391
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9432 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 12)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 101873 - 101781
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  101873 tttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctgga 101781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  481 gatgttgaagatgatg 496  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgt 446  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 496
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 481
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17586
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 38119 - 38204
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| || |||| || ||| |||||    
T  38119 cagaaagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatatatgtttttgagtacctaaagatgtttattaaagatta 38204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Original strand, 23288 - 23336
Alignment:
Q  13 gagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23288 gagagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatagat 23336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 39651 - 39702
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtcta 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  39651 ttttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcctgaacaggtcta 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 101753 - 101709
Alignment:
Q  146 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  101753 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 587
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||   |  |  |||     
T  766 cagagagcatgttgaaatctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgacttaga 667  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||| |   ||| ||| |||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  666 acaagattgaacctggaataaccattgttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 425
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  287 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  385 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 425  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 6470 - 6557
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6470 ttttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 213
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6625
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 2195 - 2275
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2195 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19750 - 19652
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  19750 tgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacctggaa 19652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19573
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19622 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 48103 - 48164
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||| |||||    
T  48103 ttttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagatta 48164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Original strand, 2286 - 2378
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  2286 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctgga 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Original strand, 1939 - 2030
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  1939 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaac 2030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 2066 - 2108
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2066 acctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 6)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 21425 - 21492
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21425 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 29317 - 29384
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29317 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 29384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 496
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 395  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  396 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  21820 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 496
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 395  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  396 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 493  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  29712 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 21563 - 21614
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21563 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 29455 - 29506
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29455 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 29506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  332 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 429  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 1947  T
Q  430 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1946 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2376 - 2291
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  2376 cagagaacatgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1904
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1990 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 1904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13325
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||    
T  13419 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaat 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 29836 - 29950
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29836 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 29935  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  29936 gacaagattgaacct 29950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 41832 - 41946
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41832 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 41931  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  41932 gacaagattgaacct 41946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13255
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  13296 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 46346 - 46432
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  46346 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 46432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 3339 - 3254
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  3339 cagagagcatgttgaatcctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7005 - 6920
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  7005 cagagagcatgttgaattttgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 9)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 13173
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  13258 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 13173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12859
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 400  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 61241 - 61329
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  61241 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 61329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 125797 - 125855
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  125797 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 125855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 61386 - 61421
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61386 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 61421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 189
Target Start/End: Original strand, 65304 - 65337
Alignment:
Q  156 tcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65304 tcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 65337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Original strand, 105563 - 105620
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  105563 ttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 105620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 65157 - 65245
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  65157 gcagagaacatgtttgattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 65245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  481 gatg 484  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 437
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----t 129  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||     |    
T  609 ttttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacttggaaagattt 510  T
Q  130 ta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 197  Q
    ||     || || || || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  509 tagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 496
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  481 gatgttgaagatgatg 496  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2535
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  2445 ttttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacctg 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 2567 - 2609
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2567 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 355 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8485
Alignment:
Q  355 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 452  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  453 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7015 - 6922
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  7015 ttttgacttttgagttgatcctttgatg-ttttgagtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacctggaat 6922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9029 - 8961
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||| |||||||  || |||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9029 tgtagttttgacccttaagttgatctttagaagattttgagtgcctgaacatgtataataatgactagg 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 10910 - 10970
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 10970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Original strand, 45426 - 45522
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  45426 tgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacctgg 45522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 496
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 45555 - 45596
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45555 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 595
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  657 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgc 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1393 - 1307
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  1393 cagagagcatgtcgaattctataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattag 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6072 - 5978
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  6072 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacttggaat 5978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 867 - 952
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  867 cagagagcatgtagaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1062 - 965
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  1062 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgctagaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagataggacctggaa 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 500
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  481 gatgttgaagatgatgatgt 500  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10278
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10210 ttttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaaga 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 944 - 897
Alignment:
Q  138 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  944 tgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10347
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10305 acctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6081 - 5996
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  6081 agagagcatgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7276 - 7191
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  7276 agagagcatgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 384 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  384 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  482 atgttgaagatgatgatgt 500  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13310 - 13233
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  13310 agttgaactttagttgtttatgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Original strand, 6038 - 6099
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6038 agagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 6099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 10440 - 10525
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||    
T  10440 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagatta 10525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15383
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||| |||||    
T  15298 cagagagcatgtagaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagatta 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 15968 - 16053
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15968 cagagagcatgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 14622 - 14723
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||   ||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| || ||| |||    
T  14622 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgacttttcagttggactttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggaaaaatatag 14721  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  14722 ga 14723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6998
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||    
T  7092 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaat 6998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14472 - 14378
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||    
T  14472 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaat 14378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15901 - 15837
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15901 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 6697 - 6761
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6697 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 5765 - 5852
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  5765 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaacc 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 129
Target Start/End: Original strand, 43436 - 43520
Alignment:
Q  45 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  43436 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 43520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 129
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47440
Alignment:
Q  45 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  47356 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 47440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 44550 - 44486
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44550 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 44486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 15472 - 15566
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  15472 ttttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacctggaat 15566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 179128 - 179085
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  179128 ttttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaa 179085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 889 - 830
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  889 agagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4710
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 8)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 130386 - 130292
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  130386 ttttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 130292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  481 g 481  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 484
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  424 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23669 - 23513
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  23669 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactactgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 23571  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   || || |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23570 cttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 242534 - 242420
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  242534 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 242435  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    |   |||||||||||    
T  242434 ggcaagattgaacct 242420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 130263 - 130222
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  130263 acctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 122
Target Start/End: Original strand, 60296 - 60367
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  60296 gaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 60367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 190
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60520
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 60520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 30364 - 30450
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||    
T  30364 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattag 30450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 429 - 496
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2292
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2352 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  481 gatgttgaagatgatga 497  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 6603 - 6543
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6603 cagagagcatgttgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 6543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 120
Target Start/End: Original strand, 671 - 755
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 120  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  671 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtagattgagattga 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16804
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16740 cagagagcatgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgcct 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 8506 - 8619
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  8506 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 8605  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  8606 gataagattgaacc 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||  ||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 5928 - 5995
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5928 cagagagcatgttgaatttcatgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 1703 - 1789
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1703 cagagagcatgtcgaattttgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattag 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4638
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| || ||| ||||||    
T  4552 cagagcgcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatatttttgaatgcctaaagatgtttattaaagattag 4638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  328 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 424  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  425 tgtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 15072 - 15108
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15072 ttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2325 - 2240
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2325 cagagaacatgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10007 - 9922
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  10007 cagagaacatgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10913
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||    
T  10995 agttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaat 10913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  481 g 481  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10842
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10884 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18830 - 18651
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || |||     
T  18830 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttaga 18731  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18730 atgagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18740 - 18655
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18740 cagagagcatgtagaataccgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 1119 - 1183
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1119 cagagagcatgtcgaattctgtagttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 6)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  481 gatg 484  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16202
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16121 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3233 - 3162
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  3233 gaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13670 - 13595
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13670 gaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 266
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15983
Alignment:
Q  151 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgag 248  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || ||||||||   |    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  249 agttgaacccttgggtag 266  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15966 agttgaacctttgggtag 15983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15171 - 15107
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15171 cagagagcatgttgaattctattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24189 - 24100
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttg---acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  24189 cagagagcatgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 24100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 39613 - 39524
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttg---acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  39613 cagagagcatgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 39524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11562 - 11464
Alignment:
Q  404 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 500  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11562 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  383 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 480  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  481 gatgttgaagatgatga 497  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 80801 - 80726
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  80801 gaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 80726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  149 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
       | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4927 - 4841
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  4927 cagagagcatgtgaagttctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Original strand, 7711 - 7793
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||    
T  7711 agttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaat 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 484
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 476  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  477 ctaagatg 484  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 190
Target Start/End: Original strand, 7822 - 7864
Alignment:
Q  148 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7822 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 35140 - 35226
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||    
T  35140 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattag 35226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25568
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||| |||||    
T  25640 ttagatgattttgagtgcctgaaaatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttggaa 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  431 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 478
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  591 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtag 492  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||| ||||    
T  491 gattagattaaacc 478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3618
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3505 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 3604  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||| ||||||||||    
T  3605 gatcagattgaacc 3618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 484
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  434 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12453 - 12380
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  12453 ttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaat 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 8576 - 8661
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  8576 cagagagcatgtaaaattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 8661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 494
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 494  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19664 - 19485
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || |||     
T  19664 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttaga 19565  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19564 acaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 40496 - 40400
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40496 ttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13379 - 13201
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |    
T  13379 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccatagatacctttgagtacgtttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaa 13280  T
Q  112 tgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
      |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13279 caagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8504 - 8423
Alignment:
Q  42 ttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8504 tttttagttggaccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 8423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 62736 - 62676
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  62736 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagt 62676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 62592 - 62556
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  62592 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 62556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 10214 - 10393
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || |||     
T  10214 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 10313  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10314 acaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 70272 - 70211
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  70272 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 70211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Original strand, 58102 - 58161
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  58102 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 58161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 69870 - 69794
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69870 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 332859 - 332784
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||    
T  332859 agttgagctttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggaaagtttttagattgagattgaac 332784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  296 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 365  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 2277 - 2217
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2277 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 807 - 747
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 18921 - 18985
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18921 cagagagcatgtcgaatcttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 18072 - 18136
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 75  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18072 cagagagcatgtagaattctataattttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 7)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 45594 - 45534
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45594 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11049
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  |    
T  10932 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-gg 11030  T
Q  110 gatgagattgaacctggaa 128  Q
     ||||||||||||||||||    
T  11031 aatgagattgaacctggaa 11049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 35524 - 35575
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35524 agttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 35575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27064 - 27006
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27064 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 27006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 38472 - 38509
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38472 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 43768 - 43667
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||||  || |||  ||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43768 gcagagagcatgttggtttttgtcatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 43669  T
Q  110 ga 111  Q
    ||    
T  43668 ga 43667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7505 - 7468
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7505 tttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagt 7468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 6)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 14943 - 15003
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14943 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 56550 - 56394
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||   |  || ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  56550 tttttgacttttaagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacctggaa-caac 56452  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  56451 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 56394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 190915 - 190985
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  190915 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 190985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 192618 - 192688
Alignment:
Q  26 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  192618 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 192688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Original strand, 19485 - 19525
Alignment:
Q  31 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 19525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 190
Target Start/End: Original strand, 192757 - 192793
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 190  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  192757 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 192793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2327 - 2245
Alignment:
Q  40 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2327 actttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 9322 - 9408
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 97  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||||||||||    
T  9322 cagagagcatgtcgaattttgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgtctactaatgattag 9408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20464 - 20418
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctg 76  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20464 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38836 - 38761
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  38836 gaaccttagatgattctgagtgcgtgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 66045 - 66224
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||||||  ||||||   |  || |||     
T  66045 cagagagcatgtcgaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttaga 66144  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  66145 acaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 66224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 71186 - 71246
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  71186 cagagagcatgtcgaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 71246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 24598 - 24777
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| |  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || |||     
T  24598 cagagagcatgtcgttttctgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaactatttaga 24697  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    | ||||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24698 acgagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgag 24777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 227942 - 227877
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  227942 ttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaat 227877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1853
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1913 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 11430 - 11482
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 63  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11430 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgc 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 6900 - 6960
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6900 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 4219 - 4181
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagt 49  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4219 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagt 4181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8612
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagt 49  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8650 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagt 8612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161252
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 769
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828 agagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 498  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26877 - 26834
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26877 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23919 - 23843
Alignment:
Q  419 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 36034 - 36077
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36034 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 36934 - 36891
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36934 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 496  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 5427 - 5541
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||| ||||| |||||   ||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  5427 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgattttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 5526  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||| |||||||||||    
T  5527 gataagattgaacct 5541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2375 - 2258
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  |    
T  2375 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-gg 2277  T
Q  110 gatgagattgaacctggaa 128  Q
     ||||||||||||||||||    
T  2276 aatgagattgaacctggaa 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 5802 - 5839
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5802 tttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagt 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Original strand, 24174 - 24256
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  24174 agttgaagcttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaat 24256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 6489 - 6432
Alignment:
Q  14 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6489 agagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagacgcctttgagt 6432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17402
Alignment:
Q  30 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17361 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 14169 - 14282
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    |||||||||||||   ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14169 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14268  T
Q  110 gatgagattgaacc 123  Q
    ||  ||||||||||    
T  14269 gacaagattgaacc 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 2304 - 2353
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 61  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2304 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagat 2353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9762 - 9704
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  9762 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 307541 - 307460
Alignment:
Q  42 ttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  307541 tttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 307460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 268195 - 268116
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  268195 agttgaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 268116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4214
Alignment:
Q  402 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4310 ttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 499
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  337 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 432  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  433 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 499  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 2065 - 2125
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2065 cagacagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 9925 - 9985
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9925 cagacagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15819 - 15759
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15819 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 191946 - 192006
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  191946 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgttttcgagt 192006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12868 - 12785
Alignment:
Q  41 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12868 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 12785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 29228 - 29177
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  29228 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattagg 29177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 103241 - 103316
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  103241 gaaccttagaggattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 103316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 481
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  427 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 481  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 226
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||   | ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  382 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgttttagaacaagattgaacctggaa-caac 284  T
Q  134 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  283 cttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17475
Alignment:
Q  10 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 109  Q
    ||||||||||||| | ||| || | ||| ||||||| ||||| |||||   |||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17361 gcagagagcatgtaggattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 17460  T
Q  110 gatgagattgaacct 124  Q
    ||  |||||||||||    
T  17461 gacaagattgaacct 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Original strand, 18013 - 18107
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  18013 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 18107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12206 - 12112
Alignment:
Q  34 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  12206 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10541
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  10599 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12064
Alignment:
Q  351 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 447  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  448 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 497  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12106 t-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3339
Alignment:
Q  11 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 110  Q
    |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || |||     
T  3160 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttaga 3259  T
Q  111 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    | |||||||||| |||||  || |||   ||| | |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3260 acgagattgaacttggaa-gaaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1134
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1098 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 36757 - 36721
Alignment:
Q  35 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36757 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 32901 - 32849
Alignment:
Q  44 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  32901 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 32849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 496
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  381 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 477  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||   ||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||  |     
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgct-attattatttaactaagttgcatgagtcaata 4902  T
Q  478 taagatgttgaagatgatg 496  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  4903 taagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7118
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 126  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  7197 agttgaattttagatgattttgagtgactgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Original strand, 4875 - 4910
Alignment:
Q  154 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4875 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Original strand, 24660 - 24723
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24660 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaat 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 19817 - 19875
Alignment:
Q  66 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  19817 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacct 19875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3247 - 3148
Alignment:
Q  12 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 111  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||  ||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3247 agagagcatgttagattttgtgtttccgactttttagttggaccttgagtgcccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 3148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 55271 - 55313
Alignment:
Q  56 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55271 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 55313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 479
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  429 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 479  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 484
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  455 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 77
Target Start/End: Original strand, 9081 - 9122
Alignment:
Q  36 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctga 77  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9081 tttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3129 - 3073
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  3129 tgagtgcctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37155 - 37071
Alignment:
Q  39 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 123  Q
    ||||||| ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||    
T  37155 gactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacc 37071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29198 - 29117
Alignment:
Q  394 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 473  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29198 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University