View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4780_low_2 (Length: 662)

Name: NF4780_low_2
Description: NF4780
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4780_low_2
NF4780_low_2
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (18-652)||(37015905-37016539)
chr1 (18-651)||(50116199-50116832)
chr1 (18-652)||(38691375-38692009)
chr1 (18-652)||(12649015-12649647)
chr1 (18-652)||(41454828-41455462)
chr1 (18-652)||(46974155-46974789)
chr1 (18-652)||(29355124-29355758)
chr1 (18-652)||(51663249-51663883)
chr1 (18-652)||(5078926-5079560)
chr1 (18-652)||(3946897-3947531)
chr1 (18-652)||(44466573-44467207)
chr1 (24-652)||(13630407-13631035)
chr1 (18-652)||(13174772-13175406)
chr1 (18-652)||(3984104-3984739)
chr1 (18-652)||(20350447-20351081)
chr1 (18-652)||(38774551-38775185)
chr1 (184-652)||(21942966-21943434)
chr1 (18-396)||(19497900-19498277)
chr1 (384-652)||(44619905-44620173)
chr1 (438-652)||(7980068-7980282)
chr1 (93-640)||(32106165-32106698)
chr1 (322-640)||(26466010-26466328)
chr1 (450-652)||(16246622-16246821)
chr1 (278-640)||(25231305-25231667)
chr1 (528-632)||(36360466-36360570)
chr1 (529-632)||(18887570-18887673)
chr1 (148-308)||(36360086-36360246)
chr1 (528-632)||(45472363-45472467)
chr1 (148-308)||(45472687-45472847)
chr1 (528-632)||(7403629-7403733)
chr1 (148-308)||(18887360-18887520)
chr1 (528-632)||(28862901-28863005)
chr1 (223-308)||(7403953-7404038)
chr1 (433-632)||(25593679-25593878)
chr1 (93-308)||(28863225-28863440)
chr1 (523-569)||(39914011-39914057)
chr1 (205-284)||(20240034-20240113)
chr1 (18-50)||(36075235-36075267)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (18-652)||(35965181-35965815)
chr8 (18-652)||(43370758-43371392)
chr8 (18-652)||(30304046-30304680)
chr8 (18-652)||(32431301-32431935)
chr8 (18-652)||(7341070-7341704)
chr8 (18-652)||(32377344-32377978)
chr8 (21-652)||(7168891-7169513)
chr8 (18-652)||(8422292-8422926)
chr8 (21-652)||(2145438-2146060)
chr8 (142-652)||(43688731-43689241)
chr8 (132-652)||(45455367-45455887)
chr8 (18-413)||(22581058-22581453)
chr8 (317-652)||(39751763-39752098)
chr8 (312-652)||(1115763-1116103)
chr8 (499-647)||(22580899-22581047)
chr8 (18-149)||(43686586-43686717)
chr8 (105-632)||(14401296-14401824)
chr8 (528-632)||(44320872-44320976)
chr8 (148-308)||(45116582-45116742)
chr8 (526-632)||(17316471-17316577)
chr8 (528-632)||(45116258-45116362)
chr8 (93-308)||(44321173-44321388)
chr8 (526-632)||(17340021-17340127)
chr8 (165-286)||(17316814-17316935)
chr8 (164-286)||(17340364-17340486)
chr8 (226-275)||(13781602-13781651)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (18-652)||(36815952-36816586)
chr3 (18-652)||(46991682-46992316)
chr3 (18-652)||(7838587-7839221)
chr3 (18-652)||(14399546-14400182)
chr3 (18-652)||(48249302-48249937)
chr3 (26-652)||(77464-78090)
chr3 (18-652)||(21954675-21955308)
chr3 (20-652)||(6504393-6505025)
chr3 (18-652)||(13746157-13746791)
chr3 (18-652)||(6741878-6742512)
chr3 (24-652)||(16445611-16446239)
chr3 (18-652)||(3949734-3950368)
chr3 (18-652)||(8159419-8160053)
chr3 (76-652)||(7841511-7842085)
chr3 (18-652)||(30946078-30946712)
chr3 (18-435)||(29949193-29949609)
chr3 (18-435)||(29998347-29998763)
chr3 (259-652)||(9428510-9428903)
chr3 (188-435)||(29908027-29908273)
chr3 (431-652)||(29930359-29930580)
chr3 (431-652)||(29979513-29979734)
chr3 (123-279)||(28610460-28610616)
chr3 (540-652)||(50954264-50954376)
chr3 (476-632)||(33399546-33399702)
chr3 (153-301)||(9556335-9556483)
chr3 (528-632)||(2285003-2285107)
chr3 (148-308)||(40467774-40467934)
chr3 (528-632)||(9556727-9556831)
chr3 (148-308)||(12491422-12491582)
chr3 (528-632)||(51548479-51548583)
chr3 (433-632)||(1275240-1275438)
chr3 (433-632)||(4510287-4510486)
chr3 (93-308)||(51548044-51548259)
chr3 (164-308)||(2284639-2284783)
chr3 (528-632)||(4120740-4120843)
chr3 (539-639)||(8263742-8263842)
chr3 (528-632)||(32426622-32426726)
chr3 (528-632)||(40468155-40468259)
chr3 (93-308)||(4120305-4120520)
chr3 (526-580)||(12491150-12491204)
chr3 (148-308)||(33940190-33940350)
chr3 (523-632)||(8117600-8117709)
chr3 (216-301)||(8117931-8118016)
chr3 (523-632)||(25059882-25059991)
chr3 (229-275)||(34085393-34085439)
chr3 (229-275)||(35996950-35996996)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (18-652)||(31147313-31147947)
chr6 (18-652)||(18606987-18607621)
chr6 (40-652)||(29287411-29288018)
chr6 (18-652)||(1611187-1611821)
chr6 (18-646)||(21357786-21358411)
chr6 (18-646)||(23961768-23962393)
chr6 (18-404)||(28357557-28357943)
chr6 (409-652)||(28250887-28251130)
chr6 (403-652)||(24220157-24220408)
chr6 (512-652)||(7362170-7362310)
chr6 (546-652)||(7362307-7362413)
chr6 (523-632)||(34111603-34111712)
chr6 (148-308)||(9095463-9095623)
chr6 (609-652)||(13387721-13387764)
chr6 (602-652)||(35243594-35243644)
chr6 (148-301)||(26684595-26684748)
chr6 (528-632)||(22864817-22864921)
chr6 (530-580)||(26684976-26685026)
chr6 (206-286)||(31196927-31197007)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (18-652)||(17060-17694)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (18-652)||(18536772-18537406)
chr5 (18-652)||(7799442-7800076)
chr5 (18-652)||(34078771-34079405)
chr5 (31-640)||(4202388-4202997)
chr5 (18-652)||(25895533-25896171)
chr5 (18-652)||(27866281-27866915)
chr5 (18-652)||(37819313-37819947)
chr5 (18-652)||(11031888-11032522)
chr5 (18-652)||(38858626-38859260)
chr5 (18-570)||(1036424-1036976)
chr5 (18-652)||(13566543-13567172)
chr5 (75-652)||(28884901-28885478)
chr5 (121-652)||(7020419-7020950)
chr5 (18-507)||(20287404-20287894)
chr5 (227-637)||(20286015-20286424)
chr5 (491-652)||(1035459-1035620)
chr5 (502-637)||(20286515-20286650)
chr5 (403-640)||(23028381-23028625)
chr5 (579-652)||(33994242-33994315)
chr5 (93-308)||(11819551-11819766)
chr5 (526-640)||(13157978-13158092)
chr5 (528-632)||(6552800-6552904)
chr5 (148-308)||(27013235-27013395)
chr5 (528-632)||(42343502-42343606)
chr5 (528-632)||(43295232-43295336)
chr5 (528-632)||(27013615-27013719)
chr5 (526-632)||(25048408-25048515)
chr5 (165-308)||(43295549-43295692)
chr5 (530-580)||(11819279-11819329)
chr5 (164-251)||(9376353-9376440)
chr5 (550-632)||(30617320-30617402)
chr5 (148-308)||(6553124-6553284)
chr5 (216-308)||(25053068-25053160)
chr5 (93-308)||(42343826-42344040)
chr5 (229-277)||(14218175-14218223)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (18-652)||(43948718-43949352)
chr2 (18-652)||(24604525-24605159)
chr2 (21-652)||(12906931-12907562)
chr2 (18-652)||(24750649-24751284)
chr2 (21-652)||(436302-436934)
chr2 (18-648)||(27274796-27275426)
chr2 (21-652)||(41007415-41008050)
chr2 (18-622)||(45476379-45476982)
chr2 (18-652)||(34920218-34920842)
chr2 (18-652)||(211877-212511)
chr2 (18-652)||(5348158-5348792)
chr2 (18-652)||(10622890-10623524)
chr2 (18-652)||(39794961-39795595)
chr2 (18-652)||(38946754-38947388)
chr2 (18-652)||(41561003-41561637)
chr2 (18-652)||(3802002-3802636)
chr2 (18-652)||(11692266-11692884)
chr2 (18-605)||(9655194-9655780)
chr2 (18-547)||(1098262-1098791)
chr2 (18-652)||(17996608-17997242)
chr2 (229-652)||(28354549-28354972)
chr2 (18-394)||(7264229-7264605)
chr2 (18-287)||(24941086-24941355)
chr2 (441-652)||(7264023-7264234)
chr2 (541-652)||(1100042-1100153)
chr2 (34-308)||(21535524-21535792)
chr2 (18-96)||(28347833-28347911)
chr2 (528-632)||(9639183-9639287)
chr2 (195-287)||(3353894-3353986)
chr2 (205-308)||(28423097-28423200)
chr2 (603-652)||(9652182-9652231)
chr2 (530-594)||(28423423-28423487)
chr2 (523-632)||(21535200-21535309)
chr2 (204-308)||(26832513-26832617)
chr2 (539-584)||(24683458-24683503)
chr2 (229-269)||(35001701-35001741)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (18-652)||(4976746-4977380)
chr4 (18-652)||(11502497-11503131)
chr4 (18-652)||(4978394-4979024)
chr4 (18-652)||(9891013-9891647)
chr4 (18-652)||(19072093-19072727)
chr4 (18-652)||(3404781-3405415)
chr4 (18-594)||(4769179-4769759)
chr4 (18-652)||(41024191-41024826)
chr4 (18-652)||(21471785-21472419)
chr4 (21-566)||(38463276-38463821)
chr4 (37-533)||(44049720-44050216)
chr4 (131-652)||(49565013-49565534)
chr4 (295-652)||(51643211-51643570)
chr4 (368-652)||(18580117-18580398)
chr4 (48-640)||(6182679-6183273)
chr4 (37-308)||(13897238-13897509)
chr4 (528-632)||(17916198-17916302)
chr4 (598-652)||(17140580-17140634)
chr4 (93-294)||(4617906-4618107)
chr4 (148-308)||(1591168-1591328)
chr4 (153-308)||(32716628-32716783)
chr4 (528-632)||(4617714-4617818)
chr4 (609-652)||(38463824-38463867)
chr4 (526-632)||(1590845-1590950)
chr4 (190-286)||(34979910-34980006)
chr4 (528-628)||(46517380-46517480)
chr4 (163-308)||(20971086-20971231)
chr4 (528-632)||(32716305-32716409)
chr4 (230-308)||(17916521-17916599)
chr4 (227-270)||(11693442-11693485)
chr4 (147-273)||(17496893-17497019)
chr4 (523-569)||(20971446-20971492)
chr4 (229-275)||(36500314-36500360)
chr4 (229-275)||(55525178-55525224)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (18-652)||(47061874-47062509)
chr7 (18-652)||(18106379-18107013)
chr7 (18-652)||(42500398-42501032)
chr7 (18-652)||(43622571-43623205)
chr7 (18-652)||(617185-617819)
chr7 (18-652)||(30787530-30788164)
chr7 (24-652)||(45764370-45764998)
chr7 (18-652)||(43827042-43827676)
chr7 (220-652)||(8400577-8401009)
chr7 (18-370)||(15067162-15067514)
chr7 (366-652)||(15060605-15060890)
chr7 (18-251)||(12116805-12117038)
chr7 (495-652)||(21800003-21800160)
chr7 (18-131)||(8401016-8401129)
chr7 (93-308)||(43378819-43379034)
chr7 (528-632)||(46791336-46791440)
chr7 (433-632)||(8194131-8194330)
chr7 (153-308)||(16795667-16795822)
chr7 (163-308)||(16794194-16794339)
chr7 (528-632)||(45172855-45172959)
chr7 (114-569)||(3761979-3762434)
chr7 (93-308)||(40445076-40445291)
chr7 (529-632)||(40445512-40445615)
chr7 (523-632)||(20908458-20908567)
chr7 (528-632)||(47867442-47867546)
chr7 (223-308)||(1297321-1297406)
chr7 (528-632)||(1296997-1297101)
chr7 (160-308)||(8193858-8194006)
chr7 (164-308)||(46791660-46791804)
chr7 (148-308)||(47867065-47867225)
chr7 (433-632)||(16794464-16794663)
chr7 (93-308)||(45172420-45172635)
chr7 (531-632)||(40793934-40794035)
chr7 (528-632)||(43379254-43379358)
chr7 (148-308)||(40794258-40794418)
chr7 (232-277)||(23558969-23559014)
chr7 (526-558)||(16796810-16796842)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (18-652)||(1872-2506)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (18-652)||(15793-16427)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-652)||(33800-34434)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (326-652)||(12253-12580)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (18-247)||(25382-25611)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (507-652)||(95-240)
scaffold0340 (133-232)||(1-100)
[»] scaffold0325 (2 HSPs)
scaffold0325 (528-632)||(3847-3951)
scaffold0325 (164-300)||(4179-4315)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (148-308)||(28452-28612)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 37016539 - 37015905
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37016539 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgttggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 37016440  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  37016439 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggca 37016340  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016339 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 37016240  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37016239 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 37016140  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37016139 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 37016040  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37016039 tcttgctcttggtcaagtcacgcacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccagctccatcgcatggttgtg 37015940  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015939 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 37015905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 651
Target Start/End: Original strand, 50116199 - 50116832
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50116199 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaagcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 50116298  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  50116299 acccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 50116398  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50116399 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttagatgagcccaaaagatatcttc 50116498  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50116499 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgacattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 50116598  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50116599 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 50116698  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50116699 tctaactcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggtagtg 50116798  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattccttt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50116799 aactccattaagaatgttcaatctccattccttt 50116832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 38691375 - 38692009
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38691375 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcacctcaggcatatttatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 38691474  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  38691475 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 38691574  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691575 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttc 38691674  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38691675 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatcgagattagatattgcaacggcttcttgtcatctctattt 38691774  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38691775 gccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttattcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 38691874  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38691875 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggcaagaacgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtg 38691974  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691975 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38692009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 12649015 - 12649647
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12649015 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacacaacatttttaaa 12649114  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  12649115 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 12649214  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649215 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 12649314  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12649315 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatagatattagatattgcaacgacttcttgtcacctctattt 12649414  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12649415 gtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttatttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 12649514  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12649515 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtgctc--ttaatttaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 12649612  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649613 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 12649647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 41455462 - 41454828
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41455462 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggtatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttgtaaa 41455363  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  41455362 acccaaacaaaattttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 41455263  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41455262 tcctttacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttc 41455163  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41455162 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 41455063  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41455062 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 41454963  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41454962 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 41454863  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454862 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 41454828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 46974789 - 46974155
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  46974789 aacatttgcaaccactttaattaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttgcgcaacatttttaaa 46974690  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  46974689 acccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcgattgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 46974590  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974589 tcttgtacctgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaagattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 46974490  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  46974489 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttattt 46974390  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  46974389 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctttaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 46974290  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  46974289 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatgtaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgta 46974190  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974189 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 46974155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 29355124 - 29355758
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29355124 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 29355223  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  29355224 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 29355323  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29355324 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 29355423  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29355424 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 29355523  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29355524 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 29355623  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29355624 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 29355723  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355724 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 29355758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 51663883 - 51663249
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51663883 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcactgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 51663784  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  51663783 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacatattcaaactcaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacactggca 51663684  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663683 ttttatacatgttggttttgtaggtagagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 51663584  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  51663583 gattgtagtactttcactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttattgtcacctctattt 51663484  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51663483 gccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 51663384  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51663383 tcttgctcttggtcaagtcgcgtacaatcttcttgtcctcctcctttaatctaccagcaagaatgtgtcattctaaagccggcttcatcgcatggttgtg 51663284  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51663283 agctccattaagaatgttcaatccccattcttttg 51663249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 5079560 - 5078926
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5079560 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 5079461  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  5079460 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 5079361  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5079360 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccgtaaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 5079261  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |    
T  5079260 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatct 5079161  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5079160 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtattaaaatatttcttggaagca 5079061  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5079060 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 5078961  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5078960 aactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 5078926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 3946897 - 3947531
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3946897 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 3946996  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  3946997 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 3947096  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3947097 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 3947196  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3947197 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 3947296  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3947297 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 3947396  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3947397 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 3947496  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947497 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3947531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 44467207 - 44466573
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44467207 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 44467108  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  44467107 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 44467008  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44467007 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 44466908  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44466907 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 44466808  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44466807 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 44466708  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44466707 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 44466608  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466607 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 44466573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13631035 - 13630407
Alignment:
Q  24 tgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaa 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13631035 tgcaaccgctgtcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatctttaaaacccaa 13630936  T
Q  124 acaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgt 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| | |    
T  13630935 acaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctat 13630836  T
Q  224 acatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgt 323  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13630835 acatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagt 13630736  T
Q  324 agtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttc 423  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13630735 attactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttc 13630636  T
Q  424 catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgc 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13630635 catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgc 13630536  T
Q  524 tcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactcc 623  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13630535 tctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactcc 13630436  T
Q  624 attaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630435 attaagaatgttcaatccccattcctttg 13630407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13175406 - 13174772
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||    
T  13175406 aacatttacaaccactttcatcaaagacatatccctgtcagtcacagtcaccttaggcatattcatctttgacgtaataagtttacgcaacatttttgaa 13175307  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  13175306 actcaaacaaatttttcctctttctcatgggtcacaaatccacacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 13175207  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13175206 tcttgtacatgatggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgctggaaatttgttaaacaacttagcggatgttggatgagcacaaaagatatcttc 13175107  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13175106 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgaaattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctattt 13175007  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13175006 gccttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttattggaagca 13174907  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13174906 tcttgctcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccagcgagaatgtgtcctcctaaagccggctccatcgcatggttgtg 13174807  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13174806 aactccattaagaatgttcaatccacattcctttg 13174772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3984739 - 3984104
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcgg-taacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3984739 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcgggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaa 3984640  T
Q  117 aacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgac 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| |    
T  3984639 aacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggc 3984540  T
Q  217 atcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3984539 atcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatctt 3984440  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    | || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  3984439 caatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatt 3984340  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3984339 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagc 3984240  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3984239 atcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgt 3984140  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984139 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3984104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 20351081 - 20350447
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20351081 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 20350982  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||||| ||    
T  20350981 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccaaactacctcaaacattggca 20350882  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20350881 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 20350782  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20350781 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 20350682  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20350681 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 20350582  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20350581 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 20350482  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20350481 aactccattaagaatgtttaatccccattcctttg 20350447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 38774551 - 38775185
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38774551 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 38774650  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  38774651 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 38774750  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38774751 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 38774850  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  38774851 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccatattt 38774950  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38774951 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 38775050  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38775051 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 38775150  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775151 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38775185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 184 - 652
Target Start/End: Original strand, 21942966 - 21943434
Alignment:
Q  184 gtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaact 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21942966 gtcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggaatccataaccaaaaccgttgaaaatttgttaaacaact 21943065  T
Q  284 taacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagat 383  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21943066 taacgaatgatggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagat 21943165  T
Q  384 tagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttg 483  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21943166 tagatattgcaacagtttcttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtcttttg 21943265  T
Q  484 ttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 583  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21943266 ttcttcaaatttatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgt 21943365  T
Q  584 gtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21943366 gtccttctaaacccggctccatcccatggttgtgaactccattgagaatgttcaatccccattcctttg 21943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 396
Target Start/End: Original strand, 19497900 - 19498277
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  19497900 aacatttgcaaccgctttcatcaaagatatatccctgtctgtcacaatcaccttaggcatatttatctttgacgtaagaagtttacgcaatatttttaaa 19497999  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  19498000 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagcctaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 19498099  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  19498100 tcttgtacatgtttgttttgtgggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaag-tatcttt 19498198  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498199 gattgtagtactttcactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 384 - 652
Target Start/End: Original strand, 44619905 - 44620173
Alignment:
Q  384 tagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44619905 tagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgg 44620004  T
Q  484 ttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 583  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620005 ttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 44620104  T
Q  584 gtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620105 gtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 44620173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 438 - 652
Target Start/End: Original strand, 7980068 - 7980282
Alignment:
Q  438 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtca 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980068 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtca 7980167  T
Q  538 cgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttca 637  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980168 cgtacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactgcattgcatggttgtgaactccattaagaatgttca 7980267  T
Q  638 atccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||    
T  7980268 atccccattcctttg 7980282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 93 - 640
Target Start/End: Original strand, 32106165 - 32106698
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||    
T  32106165 aagaagtttaagcatcatttgtaaaacccaaacaaagttgtcatctttctcatgtgtcaaaaatccaaaatcaactgaatatgtcaaatcagtcaaggtg 32106264  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||    
T  32106265 accccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataacc-----------aaaattgttaaacaacttaatggatg 32106353  T
Q  293 ttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattg 392  Q
    ||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  32106354 ttggatgagcttaaaatatgtcttcaatagtagtactttcactttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatg 32106453  T
Q  393 caacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaa 492  Q
    || |  | ||||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  32106454 catcatcgtcttgtcacctctgttcgacttccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaatcttgtcttttgctcttcaaa 32106553  T
Q  493 tgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttcta 592  Q
    | || | || ||||| ||  ||||| |   |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  32106554 ttta-acaactattttttcaaagcaccaaactcttggtcaagtcacatacaagctttttgtcattctcctttaatctaccagcaatcatgtgtccttcta 32106652  T
Q  593 aagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 640  Q
    ||   ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  32106653 aacttggctccatctcatgattgtgaactc--ttaagaatattcaatc 32106698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 322 - 640
Target Start/End: Original strand, 26466010 - 26466328
Alignment:
Q  322 gtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgcct 421  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||  | | || |  ||||| | || ||    
T  26466010 gtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaacaccgttttttaacctctgtatgact 26466109  T
Q  422 tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatctt 521  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  26466110 tccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgttttttgttcttcaaatttaacaaaatatttcttggaagcacctt 26466209  T
Q  522 gctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaact 621  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26466210 agtcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtcattctaaagccggctccatctcatggttgtgaact 26466309  T
Q  622 ccattaagaatgttcaatc 640  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  26466310 ccattaagaatgtttaatc 26466328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 450 - 652
Target Start/End: Original strand, 16246622 - 16246821
Alignment:
Q  450 ttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttc 549  Q
    |||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||| ||  |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16246622 ttgcttgatatttgttatgcaatcttgtctttttctcttcaaatttaacaaaatatt-cttggatgcaccttgcttttggt-aagtcacgtacaatcttc 16246719  T
Q  550 ttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcct 649  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  16246720 ttgtcatcctcttttaatctaccggtaagcatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaacttcattaacaat-ttcaatctccattcat 16246818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25231667 - 25231305
Alignment:
Q  278 acaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactt 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||| | | | |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  25231667 acaacttaacgtatgttggatgaacccaaaatatgtctttaattgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattt 25231568  T
Q  378 cgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 477  Q
     ||||||||||| |||| |  | || |||  ||||| |||| |||  ||| || ||  ||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| | |  |    
T  25231567 tgagattagatactgcatcaccgtcatgttacctctgtttgacttgaataattttttccgttagttgtatacttgcttgatatttgtcatgcactcttat 25231468  T
Q  478 cttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaa 577  Q
    |||||  | ||||||| ||  ||||||||| ||  ||||| |   |  |||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||||    
T  25231467 ctttttcttttcaaatttaacaaaatatttgttaaaagcaccaaacatttggtcaagtcacgtacaatcttcttggtatcctcccttgatctacctgcaa 25231368  T
Q  578 gaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 640  Q
    | ||||||||||| |||   |||| | || || |||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  25231367 gcatgtgtccttccaaacttggcttcgtctcacggttgtgaactccattgaaaatattcaatc 25231305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 36360466 - 36360570
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36360466 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccgacaagaatgtgtcctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 36360565  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  36360566 agaat 36360570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 529 - 632
Target Start/End: Original strand, 18887570 - 18887673
Alignment:
Q  529 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaa 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18887570 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccattaa 18887669  T
Q  629 gaat 632  Q
    ||||    
T  18887670 gaat 18887673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 36360086 - 36360246
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||  || || ||||  | | |||  ||||||| ||||||  | |||| |||||||||||| ||||| |    
T  36360086 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatatcaaataggttgaggtgactcaaactatttcaaacagtgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 36360185  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  36360186 ccattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 36360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 45472467 - 45472363
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45472467 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccacaccatctcatggttgtgaacgccatta 45472368  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  45472367 agaat 45472363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45472847 - 45472687
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| ||||||  | |||| |||||||||||| ||||  |    
T  45472847 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtgggat 45472748  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  45472747 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 7403733 - 7403629
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7403733 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaataaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 7403634  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  7403633 agaat 7403629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 18887360 - 18887520
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |    
T  18887360 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaagttagttctgtacgtggaat 18887459  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||   | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18887460 ccattatcaaaaaaatcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagaccaaaa 18887520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 28863005 - 28862901
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  28863005 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtccttcattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccatta 28862906  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  28862905 agaat 28862901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7404038 - 7403953
Alignment:
Q  223 tacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  7404038 tacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 7403953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 25593878 - 25593679
Alignment:
Q  433 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 532  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||| | | | ||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||    | |   || |||||||    
T  25593878 tgacgttcattgtagacttgtttgatatttgtcatggactcttgtcttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggttttaccgaactattggtca 25593779  T
Q  533 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| |||||   |||  ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  25593778 agtcacatacaatcgccttgtcgtcctccattaatattcccgcaagaaggtgccctgctaaatatggcaacatcttatggttgtgaacaccattaagaat 25593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28863440 - 28863225
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||||    |||  |||| |||| |||| | ||||||||||||  || || |||    
T  28863440 aagaagtttaagcaacatttgtaaagcccaagcaaagttatcctccttctccgacgtcgtaaatgcaaaaccaatcaaatatgtcaaataggttgaggtg 28863341  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||||||||||| || || ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || ||| |||    
T  28863340 actccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtagaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaattttacgaatg 28863241  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  28863240 ttggatgagtccaaaa 28863225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 39914057 - 39914011
Alignment:
Q  523 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  39914057 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttcattaatct 39914011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20240113 - 20240034
Alignment:
Q  205 tcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaactt 284  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  20240113 tcaaacaatgacatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaagcagtcagaaaattgttaaacaactt 20240034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 36075235 - 36075267
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatc 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36075235 aacatttgcaaccgctttcatcaaaaacatatc 36075267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 571; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 35965181 - 35965815
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35965181 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcagtaacaatcaccttaggcatattcatatttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 35965280  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| |||| ||    
T  35965281 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagggaccccaactacctcaaatattggca 35965380  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965381 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 35965480  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35965481 aactgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 35965580  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35965581 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 35965680  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965681 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 35965780  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965781 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 35965815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 43371392 - 43370758
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43371392 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttagacatatttatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 43371293  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  43371292 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacgttgaca 43371193  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371192 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 43371093  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  43371092 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcagctctattt 43370993  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43370992 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 43370893  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43370892 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactccatcgcatggttgtg 43370793  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43370792 aactccattaagaatgttcaaaccccattcctttg 43370758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 30304046 - 30304680
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30304046 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 30304145  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  30304146 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 30304245  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30304246 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 30304345  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30304346 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 30304445  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30304446 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctatggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 30304545  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30304546 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 30304645  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304646 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 30304680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 32431301 - 32431935
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32431301 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 32431400  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  32431401 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 32431500  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32431501 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 32431600  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  32431601 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 32431700  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32431701 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 32431800  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  32431801 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 32431900  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431901 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 32431935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 7341704 - 7341070
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7341704 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 7341605  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  7341604 acccaagcaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 7341505  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7341504 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 7341405  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7341404 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 7341305  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7341304 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 7341205  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7341204 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 7341105  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341104 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 7341070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 32377344 - 32377978
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  32377344 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaaaattgttaaa 32377443  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  32377444 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 32377543  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32377544 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 32377643  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  32377644 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 32377743  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32377744 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 32377843  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  32377844 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 32377943  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377944 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 32377978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 7169513 - 7168891
Alignment:
Q  21 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||     
T  7169513 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttaggcaacatttttaaaact 7169414  T
Q  121 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  7169413 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccctaactacctcaaacattggcatct 7169314  T
Q  221 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169313 tgtacatgttggttttgtaggtggagttcataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 7169214  T
Q  321 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgcc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||         | ||||||||||||    
T  7169213 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaactttgagattatatattgcaacg---------cacctctatttgcc 7169123  T
Q  421 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatct 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7169122 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatct 7169023  T
Q  521 tgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaac 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7169022 tgctcttggtcaagtcacgtacaatcatcttgtcgtcctcctttaatctactagcaagaatgtatccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaac 7168923  T
Q  621 tccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7168922 tccattaagaatgttcaatccccactcctttg 7168891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 8422292 - 8422926
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8422292 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 8422391  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  8422392 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 8422491  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8422492 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatataatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 8422591  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8422592 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 8422691  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8422692 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 8422791  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
T  8422792 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatgggatagttgtg 8422891  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8422892 aactccattaagaatgtttaatccccattcctttg 8422926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 652
Target Start/End: Original strand, 2145438 - 2146060
Alignment:
Q  21 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2145438 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacattttttaaacc 2145537  T
Q  121 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  2145538 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcc 2145637  T
Q  221 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145638 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 2145737  T
Q  321 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctc-----tat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     |||    
T  2145738 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacaacttcttgtcacctctattatat 2145837  T
Q  416 ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaag 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2145838 ttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtgatcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaag 2145937  T
Q  516 catcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttg 615  Q
    ||||||| |              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2145938 catcttgtt--------------gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatatgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttg 2146023  T
Q  616 tgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  2146024 tgaactccattaaaaatgttcaatctccattcatttg 2146060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 142 - 652
Target Start/End: Original strand, 43688731 - 43689241
Alignment:
Q  142 tcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtagg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43688731 tcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtagg 43688830  T
Q  242 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43688831 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggattttggatgagcccaaaagatatcttcgattatagtactttcactttgtgt 43688930  T
Q  342 tcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttca 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688931 tcttgagtaataagtatagttgtgctcccccaacttcgaaattagaaattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttca 43689030  T
Q  442 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgta 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43689031 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttcgaagcatcttgctcttggtcaagtcacgta 43689130  T
Q  542 caatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcc 641  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43689131 caatcttcttgtcgtcctcttttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttaaatcc 43689230  T
Q  642 ccattcctttg 652  Q
    |||||||||||    
T  43689231 ccattcctttg 43689241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 45455887 - 45455367
Alignment:
Q  132 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45455887 ttcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccaaatatgtcaaatcgatcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 45455788  T
Q  232 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  45455787 gttttgttggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaaattttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaaaatatatttgattgtggtacttt 45455688  T
Q  332 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttg 431  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45455687 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctttttgtcacctctatttgcctttcatatttg 45455588  T
Q  432 ttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtc 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45455587 ttgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggtattttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcattttgctcttggtc 45455488  T
Q  532 aagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaa 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45455487 aagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgttaactccattaagaa 45455388  T
Q  632 tgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  45455387 tgtccaatccccattcctttg 45455367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22581453 - 22581058
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  22581453 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcacctttggcatattcatctttgacgtaggaagtttacgcaacatttttaaa 22581354  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22581353 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcgcaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattgaca 22581254  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22581253 tcttgtacatgttggttttgcaggtggagtccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatattttc 22581154  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22581153 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggattcttgtcacctct 22581058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 317 - 652
Target Start/End: Original strand, 39751763 - 39752098
Alignment:
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  39751763 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaatggtttcttgtcacctctatt 39751862  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39751863 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 39751962  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39751963 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcataaatatgtcattctaaagccggttccattgcatggttgt 39752062  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39752063 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttg 39752098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 312 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 1116103 - 1115763
Alignment:
Q  312 atcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccct 411  Q
    |||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  1116103 atcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcaccc 1116004  T
Q  412 ctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttg 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1116003 ctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaattgtatcaaaatatttcttg 1115904  T
Q  512 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatg 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  1115903 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtactatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctctatgggatg 1115804  T
Q  612 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1115803 gttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 1115763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 499 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 22581047 - 22580899
Alignment:
Q  499 aaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22581047 aaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcg 22580948  T
Q  599 gctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattc 647  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22580947 gctccatcgcatggttgtaaactccattaagaatgttcaatccccattc 22580899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Original strand, 43686586 - 43686717
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  43686586 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttagtcatattcatctttggcgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 43686685  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43686686 acccaaacaaaattttcctctttctcatgtgt 43686717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 632
Target Start/End: Original strand, 14401296 - 14401824
Alignment:
Q  105 caacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacc 204  Q
    |||||| | ||||| ||||  |||||| ||| ||||||||   |||| |||| ||||  ||| ||||||||||| |||||| || |||| |||| ||| |    
T  14401296 caacatctgtaaaatccaagtaaagttgtcccctttctcaaccgtcagaaatgcaaaagcaatcgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatc 14401395  T
Q  205 tcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagccc 304  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||| || | ||||||  | | |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  14401396 tcaaacaatgacatcctatacgtgttggttttataggtgaagtcgatgaacaaaactatcgaaaaattattaaacaacttaacagattcaggatgagccc 14401495  T
Q  305 aaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttctt 404  Q
    |||| ||||| |  || ||| ||||||||| ||||||| | | | |||||  |||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||| |  | ||||    
T  14401496 aaaatatatcatgaatagta-tactttcacattgtgttatggtgaaataaacatatatgtactcctccaactttgagactatatattgcatcttcgtctt 14401594  T
Q  405 gtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaata 504  Q
    |||  ||||  ||| | |    |||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||| |  || | | || |||| | ||||||||  || ||||||    
T  14401595 gtcatctctgcttgaccttttgattttttgacgttcattgtatacttgttttatatttgtgagacactcttgttttttttccttcaaattcatcaaaata 14401694  T
Q  505 tttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtc--acgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctc 602  Q
    ||| ||||  ||| |   ||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||   ||| |    
T  14401695 ttttttggtggcaccaaactcttggtcaagtcatatgtacaatcttcttgtcatcatcccttaatcttcctgcaagaatgtgccattctaaacttggcac 14401794  T
Q  603 catcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14401795 caattcatggttgtgaactccattaagaat 14401824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 44320976 - 44320872
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44320976 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgtttatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 44320877  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  44320876 agaat 44320872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45116742 - 45116582
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || || |  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||||||||||| ||||| |    
T  45116742 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45116643  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  45116642 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 526 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 17316577 - 17316471
Alignment:
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccat 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| || ||||||   ||   |||| |||||||||||| |||||    
T  17316577 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcttgcaagaaggtgcccatctaaatatggaaacatctcatggttgtgaattccat 17316478  T
Q  626 taagaat 632  Q
    |||||||    
T  17316477 taagaat 17316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 45116362 - 45116258
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45116362 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggaaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45116263  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  45116262 agaat 45116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44321388 - 44321173
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||  |||||  ||||| |||||   ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||     
T  44321388 aagaagtttaaacaacatttgcaaagcccaagtaaagtcatcctccttctccaatgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggta 44321289  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| | ||||  | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || | |||| ||||||||||||| || ||||    
T  44321288 actccaactatttcaaacaataacattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatg 44321189  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  44321188 ttggatgagtccaaaa 44321173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 526 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 17340127 - 17340021
Alignment:
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccat 625  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| || ||||||   | |  |||| |||||||||||| |||||    
T  17340127 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcttgcaagaaggtgcccatctaaatatgacaacatctcatggttgtgaattccat 17340028  T
Q  626 taagaat 632  Q
    |||||||    
T  17340027 taagaat 17340021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17316935 - 17316814
Alignment:
Q  165 aaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgtt 264  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||  || ||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||| ||| | | ||| | |||||| ||     
T  17316935 aaccgaatatgtcatatcagttgagttgatttcaactatctcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtatgtgaaattcatgatcaaaacagtc 17316836  T
Q  265 ggaaaattgttaaacaacttaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17316835 ggaaaattgttaaacaacttaa 17316814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17340486 - 17340364
Alignment:
Q  164 caaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgt 263  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||   | ||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  |    
T  17340486 caaccgaatatgtcatatcagttgagttgattttaactatctcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtatgtgaaatccatgatcaaaacaat 17340387  T
Q  264 tggaaaattgttaaacaacttaa 286  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  17340386 cgggaaattgttaaacaacttaa 17340364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 275
Target Start/End: Original strand, 13781602 - 13781651
Alignment:
Q  226 atgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  13781602 atgttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggtcggaaaagtgtt 13781651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 571; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 36815952 - 36816586
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36815952 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 36816051  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  36816052 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 36816151  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816152 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 36816251  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36816252 gattgtattactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctattt 36816351  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36816352 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 36816451  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36816452 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 36816551  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816552 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 36816586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 46991682 - 46992316
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46991682 aacatttgcaatcgttttcatcaaagacatatccatgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 46991781  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  46991782 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 46991881  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991882 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 46991981  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46991982 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacataaagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 46992081  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46992082 gtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggtattttgttcttcaaatgtatcaaaaaatttcttggaagca 46992181  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992182 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 46992281  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992282 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 46992316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 7839221 - 7838587
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7839221 aacatttgcaaccgctttcatcacagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 7839122  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  7839121 acccaaacaaagttttccactttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 7839022  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7839021 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgtcggatgagcccaaaagatatcttc 7838922  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7838921 gattgtagtactttcactttatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttcttgccacctctattt 7838822  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7838821 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 7838722  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838721 tattgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 7838622  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7838621 aactccactaagaatgttcaatccccattcctttg 7838587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14400182 - 14399546
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14400182 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatccccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 14400083  T
Q  118 acccaaacaaagttttc-ctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatccc-agctacctcaaacattga 215  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||     
T  14400082 acacaaacaaagtttttgctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccccaactacctcaaacattgg 14399983  T
Q  216 catcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatct 315  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399982 catcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatct 14399883  T
Q  316 tcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14399882 tcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaaattcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctat 14399783  T
Q  416 ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaag 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14399782 ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaag 14399683  T
Q  516 catcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttg 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14399682 catcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatggcatggttg 14399583  T
Q  616 tgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14399582 tgaactccatttagaatgttcaatccccattcctttg 14399546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 48249302 - 48249937
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48249302 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgatgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 48249401  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatccc-agctacctcaaacattgac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |    
T  48249402 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcaaccgaatatgtcaaattggtcaaagtgacccccaactacctcaaacattggc 48249501  T
Q  217 atcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249502 atcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 48249601  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48249602 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 48249701  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48249702 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 48249801  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48249802 atcttgctcttggtcaagtcacgtacagtcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttataaagccggctccatcgcatggttgt 48249901  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249902 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 48249937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 652
Target Start/End: Original strand, 77464 - 78090
Alignment:
Q  26 caaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  77464 caaccgctttcatcaaagactcatccgtgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaatatttttaaaacccaaac 77563  T
Q  126 aaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  77564 aaagttttcctctttctcatgtgtcaaaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtac 77663  T
Q  226 atgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  77664 atgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacaaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgatggtag 77763  T
Q  326 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttcca 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  77764 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgcctttca 77863  T
Q  426 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctc 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  77864 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 77963  T
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccat 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  77964 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcaataatgtgtccttctaaagccggctccatcaaatggttgtgaactccat 78063  T
Q  626 taagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  78064 taagaatgttcaatccccattcctttg 78090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 21954675 - 21955308
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21954675 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcgataacagtcaccttaggcaaattcatatttgacgtaagaagtttacgcaatatttttaaa 21954774  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  21954775 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaatattggca 21954874  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21954875 tcctgtacatgttcgttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaggtatcttc 21954974  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21954975 gattgtggtactttcactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaacttcgagatta-atattgcaacggcttcttgtcacctctattt 21955073  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21955074 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 21955173  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21955174 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaataatgtgtccttctagagccggctccatcgcatggttgtg 21955273  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955274 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 21955308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 652
Target Start/End: Original strand, 6504393 - 6505025
Alignment:
Q  20 catttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6504393 catttgcaaccgctttcatcaaagacatatccgtgtcgttaacaatcaccttaggcatattcatctttaacgtaagaagtttacgcaacatttttaagac 6504492  T
Q  120 ccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatc 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  6504493 ccaaacaaagttttcctcttcctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatc 6504592  T
Q  220 ttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcga 319  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504593 ctgtacatgttggttatgtaggtggagtccataaccaaaacggttggaaaattgttaaaaaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcga 6504692  T
Q  320 ttgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6504693 ttgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgaggttagatattgcaacggcttcttgtcacctctatgtgc 6504792  T
Q  420 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatc 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6504793 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaaacatc 6504892  T
Q  520 ttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaa 619  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504893 ttgttcttggtcaagtcatgtacaatcttcttttcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatcgcatggttgtgaa 6504992  T
Q  620 ctccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504993 ctccattaagaatgttcaatccccattcctttg 6505025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 13746157 - 13746791
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13746157 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 13746256  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  13746257 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 13746356  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13746357 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 13746456  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13746457 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 13746556  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13746557 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 13746656  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13746657 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 13746756  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746757 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 13746791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 6742512 - 6741878
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6742512 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 6742413  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  6742412 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 6742313  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6742312 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 6742213  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6742212 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 6742113  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6742112 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 6742013  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6742012 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 6741913  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741912 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 6741878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16446239 - 16445611
Alignment:
Q  24 tgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaa 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16446239 tgcaaccgctgtcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatctttaaaacccaa 16446140  T
Q  124 acaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgt 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| | |    
T  16446139 acaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctat 16446040  T
Q  224 acatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgt 323  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16446039 acatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagt 16445940  T
Q  324 agtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttc 423  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16445939 attactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttc 16445840  T
Q  424 catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgc 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16445839 catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgc 16445740  T
Q  524 tcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactcc 623  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16445739 tctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactcc 16445640  T
Q  624 attaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445639 attaagaatgttcaatccccattcctttg 16445611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3950368 - 3949734
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3950368 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 3950269  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  3950268 acccaagcaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 3950169  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3950168 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 3950069  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3950068 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 3949969  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3949968 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 3949869  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3949868 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 3949769  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949768 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 8159419 - 8160053
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8159419 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 8159518  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  8159519 atccaaacaaagttttcttctttctcgtgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 8159618  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8159619 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 8159718  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8159719 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 8159818  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8159819 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 8159918  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8159919 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 8160018  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8160019 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 8160053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 76 - 652
Target Start/End: Original strand, 7841511 - 7842085
Alignment:
Q  76 atattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatg 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7841511 atattcatctttgaagaaagaagtttacgcaacatttt-aaaacccaaacaaagttttcctcgttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatg 7841609  T
Q  176 tcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 275  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841610 tcaaatcggtctaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 7841709  T
Q  276 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7841710 aaacaacttaacggatgttggatgaacccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagt-tagttgtgctcctccaac 7841808  T
Q  376 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841809 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 7841908  T
Q  476 gtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7841909 gtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacaggc 7842008  T
Q  576 aagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7842009 aagaatgtgtccttctaaagccggcttcatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 7842085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 30946078 - 30946712
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30946078 aacatgtgcaaccactttcatcaaagacatatccctatcggtaataatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 30946177  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  30946178 acccaaacaaagttttcttctttcgcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 30946277  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30946278 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 30946377  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30946378 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 30946477  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30946478 gccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 30946577  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30946578 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 30946677  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946678 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 30946712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29949609 - 29949193
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29949609 aacatttgcaacctctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 29949510  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  29949509 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggca 29949410  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949409 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 29949310  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  29949309 gattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttattt 29949211  T
Q  418 gccttccatatttgttga 435  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29949210 gccttccatatttgttga 29949193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29998763 - 29998347
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29998763 aacatttgcaacctctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 29998664  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  29998663 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggca 29998564  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998563 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 29998464  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  29998463 gattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttattt 29998365  T
Q  418 gccttccatatttgttga 435  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29998364 gccttccatatttgttga 29998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 652
Target Start/End: Original strand, 9428510 - 9428903
Alignment:
Q  259 accgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtat 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9428510 accgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 9428609  T
Q  359 agttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428610 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 9428709  T
Q  459 atttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcc 558  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428710 atttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcc 9428809  T
Q  559 tcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428810 tcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 9428903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 188 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29908273 - 29908027
Alignment:
Q  188 aagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 287  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29908273 aagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 29908174  T
Q  288 ggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29908173 ggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattaga 29908075  T
Q  388 tattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttga 435  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29908074 tattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29908027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 431 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 29930580 - 29930359
Alignment:
Q  431 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggt 530  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29930580 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggt 29930481  T
Q  531 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaaga 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930480 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaaga 29930381  T
Q  631 atgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29930380 atgttcaatccccattcctttg 29930359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 431 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 29979734 - 29979513
Alignment:
Q  431 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggt 530  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29979734 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggt 29979635  T
Q  531 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaaga 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979634 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaaga 29979535  T
Q  631 atgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29979534 atgttcaatccccattcctttg 29979513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 279
Target Start/End: Original strand, 28610460 - 28610616
Alignment:
Q  123 aacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttg 222  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  28610460 aacaaagattttctctttctcatatgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaattggccgaagtgattccaactacctcaaacattgacatcttc 28610559  T
Q  223 tacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaac 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28610560 tacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaac 28610616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 540 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 50954376 - 50954264
Alignment:
Q  540 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaat 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50954376 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaat 50954277  T
Q  640 ccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||    
T  50954276 ccccattcctttg 50954264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 476 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 33399702 - 33399546
Alignment:
Q  476 gtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggc 575  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  33399702 gtcttttggtcttcaaatttaacaaaatattttttggaagcaccaaactcttggtcaagtcacgtacaagcttcttgccatcctcctttaatctacccgc 33399603  T
Q  576 aagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    ||| ||||||| |||||||    | | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33399602 aagcatgtgtctttctaaacttcgttacatctcttggttgtgaactccattaagaat 33399546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Original strand, 9556335 - 9556483
Alignment:
Q  153 aaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccata 252  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||     
T  9556335 aaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctgtacaagttggttttgtacgtgaaatccatt 9556434  T
Q  253 accaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 301  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556435 atcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttacggatgttggatgag 9556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 2285003 - 2285107
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2285003 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 2285102  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  2285103 agaat 2285107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 40467774 - 40467934
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||| |    
T  40467774 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatttcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattttatacaagttggttttgtacgtggaat 40467873  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40467874 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 9556727 - 9556831
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9556727 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgccctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 9556826  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  9556827 agaat 9556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12491582 - 12491422
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||  ||| |||  ||||||| ||||||  | |||| |||| ||||||| | ||| |    
T  12491582 gtcataaatgcaaaaccaaccaaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgtacgcggaat 12491483  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  12491482 ccattatcaaaacagttggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 12491422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 51548479 - 51548583
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| || |||    
T  51548479 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgtcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccgtta 51548578  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  51548579 agaat 51548583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 433 - 632
Target Start/End: Original strand, 1275240 - 1275438
Alignment:
Q  433 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 532  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||| | | | ||||||| ||||| |||| | | ||||||||| ||||   ||||   || |||||||    
T  1275240 tgacgttcattgtagacttgcttgatatttttcatggactcttgtctttttttctttaaatttgtcaaaatattttttggtttcatcgaactattggtca 1275339  T
Q  533 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| | | |||||   ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1275340 agtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccacaagaaggtg-catactaaatatggcactatctcatggttgtgaacaccattaagaat 1275438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 433 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 4510486 - 4510287
Alignment:
Q  433 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 532  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||  | | | ||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||   || |   || |||||||    
T  4510486 tgacgttcattgtagacttacttgatatttgtcatagactcttgtcttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggtttcaccgaactattggtca 4510387  T
Q  533 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  4510386 agtcatgtataattttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaaaacggcaccatctcgtggttgtgaacaccataaagaat 4510287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 51548044 - 51548259
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| || ||  |||||| ||||| |||||   ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  51548044 aagaagtttaagcaacatttgcaaagcctaagtaaagttatcctccttctccgatgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtg 51548143  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || | |||| ||||||||||||| || ||||    
T  51548144 actccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatg 51548243  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||||| || ||||||    
T  51548244 ttggataagtccaaaa 51548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Original strand, 2284639 - 2284783
Alignment:
Q  164 caaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgt 263  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  ||    
T  2284639 caaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaatagt 2284738  T
Q  264 tggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
     |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  2284739 cggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 2284783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 4120740 - 4120843
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4120740 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccgtcaag-aggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4120838  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  4120839 agaat 4120843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 539 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 8263842 - 8263742
Alignment:
Q  539 gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaa 638  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8263842 gtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaagaatggtcaa 8263743  T
Q  639 t 639  Q
    |    
T  8263742 t 8263742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 32426726 - 32426622
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32426726 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctgcataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 32426627  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  32426626 agaat 32426622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 40468155 - 40468259
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40468155 ggtcaagtaatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtaccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 40468254  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  40468255 agaat 40468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 4120305 - 4120520
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||  |||||| ||||| |||||    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||  | |||    
T  4120305 aagaagtttaagcaacatttgcaaagcccaagtaaagttatcctccttctccgacgtcataaatacaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttaatgtg 4120404  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||| | || |||  | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  4120405 actccaactatttcaaagaatgtcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacggtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatg 4120504  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4120505 ttggatgagtccaaaa 4120520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12491204 - 12491150
Alignment:
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 580  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12491204 ttggtcaagtcgtgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 12491150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33940350 - 33940190
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||||||||||| ||||| |    
T  33940350 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 33940251  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| || |  ||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  33940250 ccattatcaaaacagtcgagaaagtgttaaacgactttaccgatgttggatgagtccaaaa 33940190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 8117709 - 8117600
Alignment:
Q  523 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactc 622  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||| | || ||||||| ||| ||| |||||   |||  |||| ||||||||||||| |    
T  8117709 ctcttagtcaaatcacgtacaatctctttgtcgtccttcattaattttcctgcaagaaggtgccctgctaaacatggcaacatctcatggttgtgaacac 8117610  T
Q  623 cattaagaat 632  Q
    ||||||||||    
T  8117609 cattaagaat 8117600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8118016 - 8117931
Alignment:
Q  216 catcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 301  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||| | |||||| || || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8118016 catcatgtacaagttggttttgtacgtggaattcattatcaaaacagtcgggaaattgttaaacaacttaactgattgtggatgag 8117931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 632
Target Start/End: Original strand, 25059882 - 25059991
Alignment:
Q  523 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactc 622  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||| |||||   ||   ||||  |||||||||||| |    
T  25059882 ctcttggtcaagtcacatataatctccttgtcgtccttcattaatctttccgcaagaatgtgccctgctaaatatggtaacatcttatggttgtgaacac 25059981  T
Q  623 cattaagaat 632  Q
    ||||||||||    
T  25059982 cattaagaat 25059991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 275
Target Start/End: Original strand, 34085393 - 34085439
Alignment:
Q  229 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  34085393 ttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaacggtgggaaaagtgtt 34085439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35996996 - 35996950
Alignment:
Q  229 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  35996996 ttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaacggtgggaaaagtgtt 35996950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 563; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31147947 - 31147313
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31147947 aacatttgcaaccactttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttaccaaacatttttaaa 31147848  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||    
T  31147847 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaacacaactacctcaaacattggca 31147748  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31147747 tcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgtatgagcccaaaagatatcttc 31147648  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31147647 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 31147548  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31147547 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatattacttggaagca 31147448  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31147447 tcttgctcttgatcaagtcacgtacaatcttcttgtcattctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtg 31147348  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31147347 aactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 31147313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18607621 - 18606987
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  18607621 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcacattaggttgattcatctttgacgtaagatgtttacacaacatttttaaa 18607522  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||    
T  18607521 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaatcgaatatgtcaaatctgtcgaagtgaccccaactacttcaaatattggca 18607422  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607421 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttc 18607322  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18607321 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaacttaaaaattagatattgcaacggcttcttatcacctctattt 18607222  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18607221 gccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttattcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 18607122  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18607121 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcgacaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtg 18607022  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607021 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 18606987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 652
Target Start/End: Original strand, 29287411 - 29288018
Alignment:
Q  40 aaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctt 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287411 aaagacatatccctatcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctt 29287510  T
Q  140 tctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgta 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  29287511 tctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgta 29287610  T
Q  240 ggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287611 ggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaatt-ttaaacaaattaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgt 29287709  T
Q  340 gttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgtt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287710 gttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgatattaga----gcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtt 29287805  T
Q  440 cattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287806 cattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacg 29287905  T
Q  540 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaat 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287906 tacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttataaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaat 29288005  T
Q  640 ccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||    
T  29288006 ccccattcctttg 29288018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 1611187 - 1611821
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  1611187 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgctaaa 1611286  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  1611287 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 1611386  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1611387 tcctataaatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 1611486  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1611487 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 1611586  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1611587 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 1611686  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1611687 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 1611786  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611787 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 1611821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 646
Target Start/End: Original strand, 21357786 - 21358411
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21357786 aacatttgcgaccgctttcatcaaagacatatctttgtcagtcacagtcaccctaggcatattcatccttgacgtaagaagtctacgcaacatttttaaa 21357885  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  21357886 acccaaacaaagttttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggca 21357985  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21357986 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttc 21358085  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21358086 gattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 21358185  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21358186 gccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 21358282  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  21358283 tcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagccaacttcatcgcctggttgtg 21358382  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccatt 646  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21358383 aacttcattgagaatgttcaatccccatt 21358411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 646
Target Start/End: Original strand, 23961768 - 23962393
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23961768 aacatttgcgaccgctttcatcaaagacatatctttgtcagtcacagtcaccctaggcatattcatccttgacgtaagaagtctacgcaacatttttaaa 23961867  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  23961868 acccaaacaaagttttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggca 23961967  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23961968 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttc 23962067  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23962068 gattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 23962167  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23962168 gccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 23962264  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  23962265 tcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagccaacttcatcgcctggttgtg 23962364  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccatt 646  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23962365 aacttcattgagaatgttcaatccccatt 23962393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 18 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28357943 - 28357557
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28357943 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 28357844  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||  ||    
T  28357843 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacatttgca 28357744  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357743 tcctatacatgttggtcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 28357644  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttctt 404  Q
     |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28357643 aattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttctt 28357557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 409 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28251130 - 28250887
Alignment:
Q  409 cctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttc 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28251130 cctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttc 28251031  T
Q  509 ttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgc 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  28251030 ttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagctggctccatggg 28250931  T
Q  609 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28250930 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 28250887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 403 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220157
Alignment:
Q  403 ttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaa 502  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatttatcaaaa 24220309  T
Q  503 tatttcttggaagcatctt--gctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 600  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24220308 tatttcttggaagcatcttatgctcttggtcaagtcacgtataattttcttgtcgtcctcctttaatctaccgacaagaatgtgtccttctaaagccgac 24220209  T
Q  601 tccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24220208 tccatcgcatggttgtgaactgcattaagaattttcaatccccattcatttg 24220157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 512 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 7362310 - 7362170
Alignment:
Q  512 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatg 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  7362310 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatg 7362211  T
Q  612 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7362210 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccacattcctttg 7362170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 546 - 652
Target Start/End: Original strand, 7362307 - 7362413
Alignment:
Q  546 cttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccat 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7362307 cttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcat 7362406  T
Q  646 tcctttg 652  Q
    |||||||    
T  7362407 tcctttg 7362413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 632
Target Start/End: Original strand, 34111603 - 34111712
Alignment:
Q  523 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactc 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |  ||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||    
T  34111603 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttctagtcatcttcctttaatcttcctgcaagaattttcccttctaactttggcgccatctcatggttgtgaactc 34111702  T
Q  623 cattaagaat 632  Q
    ||||||||||    
T  34111703 cattaagaat 34111712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9095623 - 9095463
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| ||||||  | |||| ||||| |||||| ||||| |    
T  9095623 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggctttgtacgtggaat 9095524  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9095523 ccatgatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 9095463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 652
Target Start/End: Original strand, 13387721 - 13387764
Alignment:
Q  609 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13387721 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 13387764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 35243644 - 35243594
Alignment:
Q  602 ccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35243644 ccatcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttg 35243594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 26684595 - 26684748
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||| || || ||||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |    
T  26684595 gtcataaatgcaaaaccaacctaatatgtcatatcggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttgtacaagttgattttgtaagtggaat 26684694  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 301  Q
    |||| | |||||| || || |||||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  26684695 ccattatcaaaacagtcgggaaattgttgaacaactttaccgattgtggatgag 26684748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 22864921 - 22864817
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| | | ||| |    || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22864921 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcctcctccattaatcttccggcaagaaggtgccttgctacataatgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 22864822  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  22864821 agaat 22864817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 530 - 580
Target Start/End: Original strand, 26684976 - 26685026
Alignment:
Q  530 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 580  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  26684976 tcaagtcatgtacaatcgtcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaa 26685026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31197007 - 31196927
Alignment:
Q  206 caaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 286  Q
    |||||| || |||| |||||| |||  |||| | ||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31197007 caaacaatggcatcctgtacaagtttattttattggtggagtcaaggatcaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaa 31196927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 559; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17694 - 17060
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17694 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttatgcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 17595  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  17594 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggca 17495  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17494 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcctaaaagatatcttc 17395  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17394 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatatttcaacggcttcttgtcacctctattt 17295  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17294 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 17195  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17194 tcttgctcttggtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 17095  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17094 aactccattaagaatgttcaatccctattcctttg 17060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 551; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 18536772 - 18537406
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  18536772 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctctgatgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 18536871  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||  ||    
T  18536872 acccaaacaaagttttcctctttctcatgcgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattagca 18536971  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18536972 tcttgtacatgttagttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 18537071  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18537072 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 18537171  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18537172 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 18537271  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18537272 tctcactcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagctggctcaatcgcatggttgtg 18537371  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537372 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 18537406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 7799442 - 7800076
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7799442 aacatttgcatctgctttcatcgaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 7799541  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  7799542 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtctcacaaatccaaacccaaccgaatatgttaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 7799641  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799642 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccttaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 7799741  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7799742 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 7799841  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7799842 tccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 7799941  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799942 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 7800041  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7800042 aactccattaagaatgttcaattcccattcctttg 7800076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 34079405 - 34078771
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34079405 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttatgcaacatttttaaa 34079306  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  34079305 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 34079206  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079205 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 34079106  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34079105 aattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctattt 34079006  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34079005 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 34078906  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  34078905 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttttg 34078806  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078805 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 34078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 640
Target Start/End: Original strand, 4202388 - 4202997
Alignment:
Q  31 gctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagt 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4202388 gctttcatcaaagacatatctctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagt 4202487  T
Q  131 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgtt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4202488 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacagaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcatgtacatgtt 4202587  T
Q  231 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202588 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 4202687  T
Q  331 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatattt 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4202688 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 4202787  T
Q  431 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggt 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4202788 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatattacttggaagcatcttgctcttgat 4202887  T
Q  531 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaaga 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202888 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagagtgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaaga 4202987  T
Q  631 atgttcaatc 640  Q
    ||||||||||    
T  4202988 atgttcaatc 4202997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 25895533 - 25896171
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25895533 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 25895632  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||    
T  25895633 acccaaaaaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcacccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaagcattggca 25895732  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895733 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 25895832  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac----ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctct 413  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25895833 gattgtagtactctcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatatatagatattagatattgcaacggcttcttgtcacctct 25895932  T
Q  414 atttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttgga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25895933 atttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttgga 25896032  T
Q  514 agcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggt 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25896033 agcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggt 25896132  T
Q  614 tgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896133 tgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 25896171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 27866281 - 27866915
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27866281 aacatgtgcaatcgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 27866380  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||| |     
T  27866381 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcc 27866480  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866481 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 27866580  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27866581 aattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaaaggtttcttgtcacctctattt 27866680  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27866681 tccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 27866780  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27866781 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 27866880  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27866881 aactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 27866915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 37819313 - 37819947
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37819313 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctctcggtaacaatcaccttaggcatattcagctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 37819412  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  37819413 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacctaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 37819512  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37819513 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 37819612  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37819613 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 37819712  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37819713 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 37819812  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37819813 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaacaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 37819912  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819913 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 37819947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 11031888 - 11032522
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11031888 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatctttaaa 11031987  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  11031988 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 11032087  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11032088 tcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 11032187  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11032188 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggtttcttgtcacccctattt 11032287  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11032288 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 11032387  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11032388 tcttgctttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatgggatggttgtg 11032487  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11032488 aactccattaagaatgttcaatccccattcttttg 11032522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 38858626 - 38859260
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38858626 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatctttaaa 38858725  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  38858726 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 38858825  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38858826 tcctatatatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 38858925  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38858926 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctattt 38859025  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38859026 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 38859125  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38859126 tcttgttttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 38859225  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38859226 aactccattaagaatgttcaatctccattcttttg 38859260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 1036976 - 1036424
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1036976 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttatgcaacatttttaaa 1036877  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  1036876 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 1036777  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1036776 tcctatacatgttgattttgtaggttgagtccgtaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttagatgagcccaaaagatatcttc 1036677  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1036676 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 1036577  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1036576 tccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 1036477  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatcta 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1036476 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatcta 1036424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 13566543 - 13567172
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13566543 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 13566642  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  13566643 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 13566742  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13566743 tcctagacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaacc----------------acaacttaatggatgttgaatgatcccaaaagatatcttc 13566826  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13566827 aattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctattt 13566926  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttg-----------ttcttcaaatgtataaaaatatt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||| ||||||||    
T  13566927 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcacacttgcttcttcaaatgtatcaaaatatt 13567026  T
Q  507 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13567027 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtccttctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagctggctccatg 13567126  T
Q  607 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567127 ggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 13567172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 652
Target Start/End: Original strand, 28884901 - 28885478
Alignment:
Q  75 catattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  28884901 catattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaaatccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaacggattat 28885000  T
Q  175 gtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 274  Q
    |||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885001 gtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatccaatacatgttggtttcgtacgtggaatccataaccaaaaccgttggaaaattgt 28885100  T
Q  275 taaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885101 taaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 28885200  T
Q  375 cttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885201 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 28885300  T
Q  475 ggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgg 574  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885301 ggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgg 28885400  T
Q  575 caagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885401 caagaatctatccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 28885478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 121 - 652
Target Start/End: Original strand, 7020419 - 7020950
Alignment:
Q  121 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  7020419 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcc 7020518  T
Q  221 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 320  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7020519 tatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaat 7020618  T
Q  321 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgcc 420  Q
     ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7020619 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 7020718  T
Q  421 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatct 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7020719 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatct 7020818  T
Q  521 tgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaac 620  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7020819 tcctcttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaac 7020918  T
Q  621 tccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7020919 tccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 7020950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20287894 - 20287404
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| | ||||| |||| || |||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  20287894 aacatttgaaactgcattcatcaaagtcgtatccttgtcagtcacaaccaccttaggaacattcatccttgacgtaagaagtttacacatcatttgtaaa 20287795  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||| | ||    
T  20287794 acccaaacaaagttttcctctttctcatgcgtcacaaattcaaagccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacataggca 20287695  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt-aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  20287694 tcttgtacatgttggtttggtaggtggagtccataaccagaaccgttggaaaattgttaaaaaaacttaacggatgttggatgagcgcaaaatatgtctt 20287595  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    | || |||||||||| ||  | |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||| ||||| ||    
T  20287594 caatagtagtactttgaccatttgttcttgagaaataaacataattgtgctcctccaactttgagattagaaactggaaccccgtcttgtcacctctgtt 20287495  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatattt 507  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  20287494 tgactttcatatttattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaaaatattt 20287404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 227 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20286424 - 20286015
Alignment:
Q  227 tgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagt 326  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  20286424 tgttggttaggtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattcataa-caactaagcggatgttggatgagcccaaaatatgtcttcaatagtagt 20286326  T
Q  327 actttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccat 426  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |    ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  20286325 actttcattttgtgttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattagaaactgcaccacagtcttgtcacctctgtttgacttccat 20286226  T
Q  427 atttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctct 526  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20286225 atttgttgatgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaaaatatttcttggaagcaccttactct 20286126  T
Q  527 tggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatt 626  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20286125 tggttaagtcacatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggctccatcacatggttgtgaactccatt 20286026  T
Q  627 aagaatgttca 637  Q
    |||||||||||    
T  20286025 aagaatgttca 20286015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 491 - 652
Target Start/End: Original strand, 1035459 - 1035620
Alignment:
Q  491 aatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 590  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035459 aatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 1035558  T
Q  591 taaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035559 taaagccggctccatggcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 1035620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 502 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20286650 - 20286515
Alignment:
Q  502 atatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggct 601  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20286650 atatttcttggatgcaccttactcttggtcaagtcatgtacaatctttttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggct 20286551  T
Q  602 ccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttca 637  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20286550 ccatcacatggttgtaaactccattaagaatgttca 20286515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 403 - 640
Target Start/End: Original strand, 23028381 - 23028625
Alignment:
Q  403 ttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaa 502  Q
    ||||| ||||| |||| |||  |||||| || |||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | |  ||||||  ||||||||| ||  ||||    
T  23028381 ttgtcacctctgtttgacttgaatatttttttacgttcattgtatacttgcatgatatttgtcatgcactcttttctttttctcttcaaatttaataaaa 23028480  T
Q  503 tatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcac-------gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaag 595  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  23028481 tattttttgaaagcatcaaactcttggtcaagtcaccaatcatgtacaatcttcttgtcatcctcccttaatctacccgcaagcatgtgttcttctaaac 23028580  T
Q  596 ccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 640  Q
      | || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23028581 ttgccttcatctcatggttgtgaactccattaataatattcaatc 23028625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 579 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 33994315 - 33994242
Alignment:
Q  579 aatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33994315 aatgtgtccttctaaagccggctccattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcgttcctttg 33994242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11819766 - 11819551
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| |||||    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  11819766 aagaagtttaagcaacattttcaaagcccaagtaaagttatcctccttctccgacgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttaaggtg 11819667  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| |  |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| || |||     
T  11819666 actccaactatttcaaacaatagcatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatt 11819567  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  11819566 ttggatgagtccaaaa 11819551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 526 - 640
Target Start/End: Original strand, 13157978 - 13158092
Alignment:
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccat 625  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||   | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  13157978 ttggtgaagtcacatacaagtttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgcgtccttttaaatttgactccatttcatggttgtgaactccat 13158077  T
Q  626 taagaatgttcaatc 640  Q
    |||||||||||||||    
T  13158078 taagaatgttcaatc 13158092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 6552904 - 6552800
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6552904 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacacaccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 6552805  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  6552804 agaat 6552800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 27013235 - 27013395
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| ||||||  | |||| |||||||||||| ||||| |    
T  27013235 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 27013334  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    | || | |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  27013335 ctattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 27013395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 42343606 - 42343502
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  42343606 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttatgaacaccatta 42343507  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  42343506 agaat 42343502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 43295336 - 43295232
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43295336 ggtcaaatcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtggcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 43295237  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  43295236 agaat 43295232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 27013615 - 27013719
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  27013615 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaatgccatta 27013714  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  27013715 agaat 27013719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 25048515 - 25048408
Alignment:
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtg-tccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactcca 624  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||  |||||||||   ||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  25048515 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaataagttgccccttctaaatatggcaccatcgcattgttctgaacacca 25048416  T
Q  625 ttaagaat 632  Q
    ||||||||    
T  25048415 ttaagaat 25048408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43295692 - 43295549
Alignment:
Q  165 aaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgtt 264  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||| | ||||||  | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||     
T  43295692 aaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaataatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtc 43295593  T
Q  265 ggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    | |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  43295592 gaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43295549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 11819329 - 11819279
Alignment:
Q  530 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 580  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11819329 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 11819279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 251
Target Start/End: Original strand, 9376353 - 9376440
Alignment:
Q  164 caaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccat 251  Q
    |||||||||||| || ||| || || |||| | || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9376353 caaccgaatatggcatatctgttgaggtgacctcaactatctcaaacaatggcatcttgtacatgttggttttataggtggggtccat 9376440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 632
Target Start/End: Original strand, 30617320 - 30617402
Alignment:
Q  550 ttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30617320 ttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaagaat 30617402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6553284 - 6553124
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtga-tcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggag 246  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || |||| ||||| |||  ||||||| || |||  | ||||  ||||||||||| |||||     
T  6553284 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccca-ctatttcaaacaatggcattctatacaaattggttttgtacgtggaa 6553186  T
Q  247 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||| | |||||| || | |||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  6553185 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgaagttggatgagtccaaaa 6553124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25053160 - 25053068
Alignment:
Q  216 catcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |  |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||||    
T  25053160 catcttgaacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagccggaaaattgttaaacagctttatcgatattggatgagtccaaaa 25053068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42344040 - 42343826
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||  |||||| ||||| |||||    |||| |||| |||| | |||||||||||||||||  || || ||     
T  42344040 aagaagtttaagcaacatttgcaaagcccaattaaagttatcctccttctccgacgtcataaatgcaaaactaaccgaatatgtcaaataggttgaggtt 42343941  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| |  || ||||    
T  42343940 actccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaa-tatactgatg 42343842  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  42343841 ttggatgagtccaaaa 42343826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 277
Target Start/End: Original strand, 14218175 - 14218223
Alignment:
Q  229 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaa 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  14218175 ttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggtcggaaaagtgttaa 14218223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 551; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 43948718 - 43949352
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  43948718 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatctctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaattttacgcaacatttttaaa 43948817  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  43948818 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtagaagtgaccccaactacctcaaacattggca 43948917  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43948918 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 43949017  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||    
T  43949018 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaacttcgagattagataacgcaacggcttcttgtcacctatattt 43949117  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43949118 gtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 43949217  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43949218 tcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccttcgcatggttgtg 43949317  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43949318 aactccattaataatgttcaatccccattcctttg 43949352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 24604525 - 24605159
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24604525 aacatttgcaaccgctttcatcaaagaaatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 24604624  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  24604625 actcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 24604724  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24604725 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttt 24604824  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24604825 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 24604924  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24604925 gtcttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 24605024  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605025 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaattttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtacttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 24605124  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605125 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 24605159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 652
Target Start/End: Original strand, 12906931 - 12907562
Alignment:
Q  21 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12906931 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatcactgtcagtcataatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaatatttttaaaacc 12907030  T
Q  121 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  12907031 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatct 12907130  T
Q  221 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12907131 tgtacatgttggttttgtaggtgaagtccataaccaaatccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagtccaaaagatattttcgat 12907230  T
Q  321 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgcc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12907231 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatttgaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgcc 12907330  T
Q  421 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatct 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12907331 ttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttattcaaatgtatcagaatatttcttggaagcatct 12907430  T
Q  521 tgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaac 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907431 tgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaac 12907530  T
Q  621 tccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12907531 tccattaagaatgttcaatctccattcctttg 12907562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24751284 - 24750649
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24751284 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 24751185  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  24751184 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 24751085  T
Q  218 tcttgta-catgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751084 tcctataacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatctt 24750985  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
     ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24750984 tgatcgtattactttcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 24750885  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24750884 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 24750785  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  24750784 atcttgctctcggtcaattcatgtacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaatccggctccatgggatggttgt 24750685  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750684 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 24750649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 436934 - 436302
Alignment:
Q  21 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacc 120  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  436934 atttgcaaccactttcataaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttaacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacc 436835  T
Q  121 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaac-attgacatc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  436834 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacggaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaaccattggcatc 436735  T
Q  220 ttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcga 319  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  436734 ctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaagatgttagatgagcccaaaagatatcttaga 436635  T
Q  320 ttgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgc 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  436634 ttgtagtactttcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgc 436535  T
Q  420 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatc 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  436534 cttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatc 436435  T
Q  520 ttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaa 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436434 ttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaa 436335  T
Q  620 ctccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436334 ctccattaagaatgttcaatccccattcctttg 436302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 648
Target Start/End: Original strand, 27274796 - 27275426
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27274796 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 27274895  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  27274896 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 27274995  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27274996 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 27275095  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27275096 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 27275195  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27275196 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 27275295  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27275296 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 27275395  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcc 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275396 aactccattaagaatgttcaatccccattcc 27275426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 652
Target Start/End: Original strand, 41007415 - 41008050
Alignment:
Q  21 atttgcaaccgctttcatcaaagacatat----ccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41007415 atttgcaaccgctttcatcaatgacatatatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaa 41007514  T
Q  117 aacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgac 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  41007515 aacctaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatcgaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggc 41007614  T
Q  217 atcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007615 atcctgtacatgttagttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttgagaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatctt 41007714  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41007715 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 41007814  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41007815 tgccttacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 41007914  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41007915 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctacatcgcatggttgt 41008014  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41008015 gaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 41008050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 45476982 - 45476379
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  45476982 aacatttgcaaccgcttttatcaaagacatatcactgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttgatgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 45476883  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  45476882 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcagatcgtttgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 45476783  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476782 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttc 45476683  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45476682 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 45476583  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  45476582 gccttccata-ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttcttcaaacgtatcaaaatatttcttgtaagca 45476484  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  45476483 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggatccatcgcatggttatg 45476384  T
Q  618 aactc 622  Q
    |||||    
T  45476383 aactc 45476379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 34920218 - 34920842
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34920218 aacatttgcatccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcatcataggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 34920317  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  34920318 actcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggca 34920417  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920418 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaatattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttc 34920517  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34920518 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaacttcgaaattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 34920617  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34920618 gccttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 34920717  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||          ||||||    
T  34920718 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggtaagaatgtgtccttctaaagccggct----------gttgtg 34920807  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34920808 aactccattaagaatgttcaatctccattcctttg 34920842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 211877 - 212511
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  211877 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttatgcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 211976  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  211977 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 212076  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  212077 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 212176  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  212177 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 212276  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  212277 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 212376  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  212377 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 212476  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212477 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 212511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 5348792 - 5348158
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5348792 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 5348693  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  5348692 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 5348593  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5348592 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 5348493  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5348492 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 5348393  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5348392 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 5348293  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  5348292 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggctgtg 5348193  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348192 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 5348158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 10622890 - 10623524
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10622890 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 10622989  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  10622990 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 10623089  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10623090 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttagatgagcccaaaaaatatcttc 10623189  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10623190 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 10623289  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10623290 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 10623389  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10623390 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 10623489  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623490 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 10623524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 39795595 - 39794961
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39795595 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatctttaaa 39795496  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  39795495 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 39795396  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39795395 tcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 39795296  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39795295 aatagtattactatcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctattt 39795196  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39795195 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 39795096  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39795095 tcttgctttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgcccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 39794996  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39794995 aactccattaagaatgttcaatccccattcttttg 39794961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 38947388 - 38946754
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  38947388 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaaaagtttacgcaacattgttaaa 38947289  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  38947288 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 38947189  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38947188 tcttatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 38947089  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  38947088 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctattt 38946989  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  38946988 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtctctagttcttcaagtgtatcaaaatatttcatggaagca 38946889  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38946888 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgttgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 38946789  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38946788 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38946754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 41561637 - 41561003
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41561637 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 41561538  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  41561537 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 41561438  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41561437 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 41561338  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41561337 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 41561238  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41561237 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 41561138  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41561137 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 41561038  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41561037 aactccattaagaatgttcaatccttattcctttg 41561003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 3802002 - 3802636
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3802002 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacaaaagaagtttacgcaacatttttaaa 3802101  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaa-cattgac 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||| |||||||||| ||||| |    
T  3802102 acccaaacaaaattttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaactgaatatgtcaagtcggttgaagtca-cccaactacctcaaaacattggc 3802200  T
Q  217 atcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3802201 atcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatctt 3802300  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    | || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  3802301 caatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctccttcaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatt 3802400  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3802401 tgccttccatatttgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttattggaagc 3802500  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3802501 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgt 3802600  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802601 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3802636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 11692266 - 11692884
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11692266 aacatttgcaaccactttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatattcaactttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 11692365  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  11692366 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaactgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattggca 11692465  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11692466 tcttgt---------------aggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattcttaaacaacttaacggatgttggatgggcccaaaatatatcttc 11692550  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11692551 tattgtagtaatttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcaactctattt 11692650  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11692651 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttg-tcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 11692749  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  11692750 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctcgatcacatggttgtg 11692849  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11692850 aactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 11692884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 9655780 - 9655194
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  9655780 aacatttgcaactgctttcatcatagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggtatattaatctttgacgtaagaagtttatgcaacatttttaaa 9655681  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  9655680 acccaaacaaagttttcct-tttctcatgtgttacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggca 9655582  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655581 tcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 9655482  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9655481 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaacttcgacattagatattgcaacgacttcttgtcacctctattt 9655382  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9655381 gccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 9655282  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccat 605  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655281 tcttgctcttggttaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccat 9655194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Original strand, 1098262 - 1098791
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1098262 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacaattccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcctctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 1098361  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  1098362 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgattatgtcaaatcggtcgatgtgaccccaactacctcaaacattggca 1098461  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098462 tcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 1098561  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1098562 ggttgtagtactttcactttgtgttcttgaataataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 1098661  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1098662 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 1098761  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatct 547  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1098762 tcttgctctcggtcaagtcacgtacaatct 1098791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 17996608 - 17997242
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  17996608 aacatttgcaaccgcattcataaaagacatatctctgtcaaacacagccaccctaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcatcatttgtaaa 17996707  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||    
T  17996708 aaccacacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacattggca 17996807  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17996808 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaatattgttaaacaacgtaacggatgttggatgagcctaaaagatatcttc 17996907  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||||| |||||||||    
T  17996908 aatagtagtactttcactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaactttgagattagaaactacaacatcgtcttgtcacctctattt 17997007  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17997008 gacttccatatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgttgtcttttgctcttcaaatttatcaaaatatttcttggaagca 17997107  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17997108 ccttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctaccagcaagcatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgcg 17997207  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17997208 aacttcatgaagaatgttcaatctccattcctttg 17997242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 229 - 652
Target Start/End: Original strand, 28354549 - 28354972
Alignment:
Q  229 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354549 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 28354648  T
Q  329 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  28354649 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatat 28354748  T
Q  429 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttg 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28354749 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtcttttattcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcatg 28354848  T
Q  529 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaa 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28354849 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccagcaagaatgtgtcattctaaagcaggctccatcgcatggttatgaactccattaa 28354948  T
Q  629 gaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28354949 gaatgttcaatccccattcctttg 28354972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7264605 - 7264229
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7264605 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcgataacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 7264506  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||| |||||||||| ||    
T  7264505 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacatcaaacattggca 7264406  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7264405 tcctatacatgttaattttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtttaactacttaatggatgttggatgagcctaaaaaatatcttc 7264306  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 394  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7264305 aatggtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 24941086 - 24941355
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24941086 aacatttgcaaccgctttcatcaaagaaatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 24941185  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  24941186 actcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 24941285  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24941286 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 24941355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 441 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7264023
Alignment:
Q  441 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgt 540  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaaccatcttgctcttggtcaagtcacgt 7264135  T
Q  541 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264134 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggttccatgagatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 7264035  T
Q  641 cccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||    
T  7264034 cccattcctttg 7264023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 541 - 652
Target Start/End: Original strand, 1100042 - 1100153
Alignment:
Q  541 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100042 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccatctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 1100141  T
Q  641 cccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||    
T  1100142 cccattcctttg 1100153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21535792 - 21535524
Alignment:
Q  34 ttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagtttt 133  Q
    ||||||||||   |||| ||||| || |||| ||||||||||||||   ||||||    ||||||||||  |||||||| |||| ||||   |||||| |    
T  21535792 ttcatcaaagttgtatctctgtcagtcacaaccaccttaggcatatcactctttggtttaagaagtttaagcaacatttgtaaagcccaggtaaagttat 21535693  T
Q  134 cctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggt 233  Q
    |||| ||||||   |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||| ||| |||||| | || |||| |||||||||||||    
T  21535692 cctccttctcacccgtcatatatgcaaaaccaaccgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatctcaaatagtggcatcatgtacatgttggt 21535593  T
Q  234 tttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||| |      |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||    
T  21535592 tttat------agtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaccaacctaactgattgaggatgagcccaaaa 21535524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Original strand, 28347833 - 28347911
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28347833 aacattttcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttagacatattcatctttgacgtaaga 28347911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 9639183 - 9639287
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9639183 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccagcaagaaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 9639282  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  9639283 agaat 9639287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 287
Target Start/End: Original strand, 3353894 - 3353986
Alignment:
Q  195 cccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 287  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  3353894 cccaactatctcaaacaataacatcctgtacatgttggttttataggtggagtccatgatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaatttaac 3353986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Original strand, 28423097 - 28423200
Alignment:
Q  205 tcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagccc 304  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| | |||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  28423097 tcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaacccattatcaaaacagtcgggaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtcc 28423196  T
Q  305 aaaa 308  Q
    ||||    
T  28423197 aaaa 28423200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9652231 - 9652182
Alignment:
Q  603 catcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9652231 catcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 9652182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 594
Target Start/End: Original strand, 28423423 - 28423487
Alignment:
Q  530 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 594  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||    
T  28423423 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaa 28423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 21535309 - 21535200
Alignment:
Q  523 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactc 622  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||   |||  |||| ||||||||||||| |    
T  21535309 ctcttgatcaagtcatgtataatcttcttgtcgtcattcattaatcttcccacaagaaggtgcccttctaaatatggcaacatctcatggttgtgaacac 21535210  T
Q  623 cattaagaat 632  Q
     |||||||||    
T  21535209 aattaagaat 21535200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Original strand, 26832513 - 26832617
Alignment:
Q  204 ctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcc 303  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||  || ||  || ||||||||||||||| |||||||  ||   |||||||||    
T  26832513 ctcaaacaatgacatcatgtacatgttggtttaatatgtggagttcatagtcataattgtcggaaaattgttaaacgacttaacaaattcgggatgagcc 26832612  T
Q  304 caaaa 308  Q
    |||||    
T  26832613 caaaa 26832617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 539 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 24683503 - 24683458
Alignment:
Q  539 gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtg 584  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  24683503 gtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttcccgcaagaatgtg 24683458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35001741 - 35001701
Alignment:
Q  229 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaa 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35001741 ttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggttggaaa 35001701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 528; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 4977380 - 4976746
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacattttt-aa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  4977380 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctga-acgtaagaagtttacgcaacattttttaa 4977282  T
Q  117 aacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  4977281 aaaccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggc 4977182  T
Q  217 atcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977181 atcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatctt 4977082  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4977081 cgattgtagtactttcactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatt 4976982  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4976981 tgcattccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 4976882  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4976881 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtctttctaaagccggctccatcgcatggttgc 4976782  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976781 aaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 4976746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 11503131 - 11502497
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11503131 aacatttgcaaccactttcatcaaggacatatccatgttggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacacaacatttttaaa 11503032  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  11503031 acccaaacaaagtattcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 11502932  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11502931 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgtttgatgagcccaaaagatatcttc 11502832  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11502831 gattgtagtactttctctttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 11502732  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11502731 gtcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 11502632  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11502631 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcatgaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatgggtgtg 11502532  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11502531 aactccattaagaatgttcaatactcattcctttg 11502497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 4978394 - 4979024
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4978394 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatcattgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 4978493  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  4978494 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtatcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccctaactacctcaaacattgaca 4978593  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  4978594 tcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttcgaaaattgttaaacaacttaacagacgttggaagagcccaaaagatatcttc 4978693  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||    
T  4978694 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacggcttcttgtcacc----ttt 4978789  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4978790 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 4978889  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4978890 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcatcctttagtctgctggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttggg 4978989  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978990 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 4979024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9891647 - 9891013
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9891647 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacacatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagttcacgcaacatttttaaa 9891548  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  9891547 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 9891448  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9891447 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagtccaaaaaatatcttc 9891348  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9891347 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctattt 9891248  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9891247 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 9891148  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9891147 tcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 9891048  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891047 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 9891013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 19072093 - 19072727
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19072093 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 19072192  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  19072193 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 19072292  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19072293 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 19072392  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19072393 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 19072492  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19072493 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 19072592  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||    
T  19072593 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttataaagcagactccatagaatggttgtg 19072692  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072693 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 19072727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3405415 - 3404781
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3405415 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaaaatttttaaa 3405316  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  3405315 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgccataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 3405216  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3405215 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 3405116  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3405115 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 3405016  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3405015 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 3404916  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  3404915 tcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtccttctaaagccaactccatgggatggttgtg 3404816  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404815 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3404781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 4769759 - 4769179
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  4769759 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagattacgcaacatttttaaa 4769660  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4769659 acccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgaca 4769560  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769559 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 4769460  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4769459 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatcagaaattgcaacggcttcttgtcacctctattt 4769360  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatg----tataaaaatatttcttgga 513  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||| |    
T  4769359 gccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatcaatttatcaaaatatttcttgaa 4769260  T
Q  514 agcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4769259 agcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtccttctaaa 4769179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 41024826 - 41024191
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatat--ccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacattttta 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41024826 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattttta 41024727  T
Q  116 aaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattga 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||     
T  41024726 aaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattgg 41024627  T
Q  216 catcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatct 315  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41024626 cctcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatct 41024527  T
Q  316 tcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctat 415  Q
    || || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||    
T  41024526 tcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgactttttgtcacccctat 41024427  T
Q  416 ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaag 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41024426 ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaag 41024327  T
Q  516 catcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttg 615  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41024326 catcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttg 41024227  T
Q  616 tgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41024226 tgaattccattaagaatgttcaat-cccattcctttg 41024191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21472419 - 21471785
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  21472419 aacatttgcaaccgctttcattaaagacatatctctgtcggtcacaatctccttagtcatatttatctttgatgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 21472320  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  21472319 actcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 21472220  T
Q  218 tcttgtacatgttggt-tttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21472219 tcttgtacatgttggtgtttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 21472120  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21472119 tgattttagtactttcactttgtgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaaatattgcaacgacttcttgtcacctctatt 21472020  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21472019 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt-ttatccaatgtggtcttttgttcatcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 21471921  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| || |||||  | |||||| | ||||||||    
T  21471920 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttattctatcttcaagaatgtgtctttttaaagttgtctccattgtatggttgt 21471821  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471820 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 21471785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 566
Target Start/End: Original strand, 38463276 - 38463821
Alignment:
Q  21 atttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38463276 attttcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatttttgacgtaagaagtttacgcaatatttttaaaacc 38463375  T
Q  121 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||    
T  38463376 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgactccaactacctcaaacattagcatct 38463475  T
Q  221 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463476 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 38463575  T
Q  321 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgcc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38463576 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgcc 38463675  T
Q  421 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatct 520  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38463676 ttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtcttttgtccttcaaatgtatcaaaatattttttggaagcatct 38463775  T
Q  521 tgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaa 566  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38463776 tgctcttggtcaagtcacgtgcaatcttcttgtcgtcctcctttaa 38463821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 44050216 - 44049720
Alignment:
Q  37 atcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcct 136  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44050216 atcaaaaacatatccctgtcgatcacaatcaccttaggcacattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcct 44050117  T
Q  137 ctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggtttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44050116 ctttctcatgtgtcacaaatttaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggtttt 44050017  T
Q  237 gtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44050016 gtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtagtttcactt 44049917  T
Q  337 tgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgac 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049916 tgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgac 44049817  T
Q  437 gttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaa 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44049816 gttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctattggtcaa 44049720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 131 - 652
Target Start/End: Original strand, 49565013 - 49565534
Alignment:
Q  131 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgtt 230  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  49565013 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 49565112  T
Q  231 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 330  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  49565113 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 49565212  T
Q  331 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatattt 430  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49565213 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 49565312  T
Q  431 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggt 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565313 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggt 49565412  T
Q  531 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaaga 630  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49565413 caagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaaga 49565512  T
Q  631 atgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49565513 atgttcaatccccattcctttg 49565534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 295 - 652
Target Start/End: Original strand, 51643211 - 51643570
Alignment:
Q  295 ggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 394  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643211 ggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 51643310  T
Q  395 acggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatg 494  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643311 acggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatg 51643410  T
Q  495 tataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 594  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51643411 tatcaaaatattttttgaaagcattttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtccttataaa 51643510  T
Q  595 gcc-ggctccatcgcatggttgtg-aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51643511 gccgggctccatcgcatgtttgtgaaactccattaagaatgttcaatctcaattcctttg 51643570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 368 - 652
Target Start/End: Original strand, 18580117 - 18580398
Alignment:
Q  368 cctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 467  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580117 cctcaaacttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 18580213  T
Q  468 gcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaat 567  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580214 gcaatgaggtctttagttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaat 18580313  T
Q  568 ctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18580314 ctatcggcaagaatgtgtcattctaaagccggcttcattgcatggttgtgaactccattaagaatgtttaatcctcattcctttg 18580398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 6183273 - 6182679
Alignment:
Q  48 atccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgt 147  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||   ||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |    
T  6183273 atccctgtcagtcacaaccaccttagacatattactctttgagttaagaagtttaagcattgtttctaaaacccaaacaaaattatcctctttcccagct 6183174  T
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||  ||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6183173 gtcaaaaatccaaaaccaactaaatttgtcaaatcggtcgagatgaccccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtagatggagt 6183074  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttga 347  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||| |||||||| | |     
T  6183073 tcataatcaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtagtactttcaatttgtgttatggt 6182974  T
Q  348 gtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtac 447  Q
    | |||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| |||| |||  |||||| |||| ||||||||||     
T  6182973 gaaataaacatagttgtgttcctccaattttgagattagatattgcatcaccgtcttgtcacctctgtttgacttgaatattttttgatgttcattgtat 6182874  T
Q  448 acttg--cttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaat 545  Q
    | |||   || |  ||||||||||| | | |||||||  |||| |||| ||  ||||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  6182873 atttgtttttgatgtttgtcatgcactcttgtctttttctcttaaaatttaacaaaatattttttgaaagcaccaaactcttggtcaagtcatgtacaat 6182774  T
Q  546 cttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 640  Q
     ||||||||  | ||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6182773 tttcttgtcaccatcccttaatatacttgcaagcatatgtccttctaaacttggcttcatctcatggttgtgaactccatcaagaatattcaatc 6182679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 308
Target Start/End: Original strand, 13897238 - 13897509
Alignment:
Q  37 atcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcct 136  Q
    ||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||||  |||||| | |||| ||||   |||||| ||||    
T  13897238 atcaaagtcgtatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatatcactctttgacttaaaaagtttaagcaacatctgtaaagcccaggtaaagttatcct 13897337  T
Q  137 ctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggtttt 236  Q
    | ||||||   |||| |||| |||| || ||||||||||||| ||| |  || ||||  ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  13897338 ccttctcagtcgtcataaattcaaaacccaccgaatatgtcatatcgggtgaggtgactccaactatctcaaacaatgacatcatgtacaagttggtttt 13897437  T
Q  237 gtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
     || | ||| ||||| | |||||| || |  |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  13897438 ctacgaggaatccatgatcaaaacagtcgagaaattgttaaacaacttaaccgattctggatgaccccaaaa 13897509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 17916302 - 17916198
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17916302 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 17916203  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  17916202 agaat 17916198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 598 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17140634 - 17140580
Alignment:
Q  598 ggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140634 ggcttcatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 17140580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4618107 - 4617906
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||  |||||| ||||| ||| ||   |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  4618107 aagaagtttaagcaacatttgcaaagcccaagtaaagttatcctccttcccagacgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttgaggtg 4618008  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| || | || | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  4618007 actccaactatttcaaacaatggcgtcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatg 4617908  T
Q  293 tt 294  Q
    ||    
T  4617907 tt 4617906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1591328 - 1591168
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| ||||||||| || ||||| |    
T  1591328 gtcacaaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttctacgtggaat 1591229  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| || | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1591228 ccattatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 1591168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32716783 - 32716628
Alignment:
Q  153 aaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccata 252  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  32716783 aaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccatt 32716684  T
Q  253 accaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  32716683 atcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 32716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 4617818 - 4617714
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||   || ||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4617818 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccagcaagaaggttctctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4617719  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  4617718 agaat 4617714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 652
Target Start/End: Original strand, 38463824 - 38463867
Alignment:
Q  609 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463824 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 526 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 1590950 - 1590845
Alignment:
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccat 625  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1590950 ttggtcaagtcatgtacaatcttct-gtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccacaccatctcatggttgtgaacgccat 1590852  T
Q  626 taagaat 632  Q
    |||||||    
T  1590851 taagaat 1590845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34980006 - 34979910
Alignment:
Q  190 gtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 286  Q
    |||| |||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||||||    
T  34980006 gtgaccccaactatctcaaacaatgacattatgtacatgttggttttataggtgaagtccatgaccaaaatagacagaaaattgttaaacaacttaa 34979910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 528 - 628
Target Start/End: Original strand, 46517380 - 46517480
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46517380 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttctagcaagaaggtgccctgctatataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46517479  T
Q  628 a 628  Q
    |    
T  46517480 a 46517480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 20971086 - 20971231
Alignment:
Q  163 ccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccg 262  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||||  ||| | | |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||| || || | |||||| |    
T  20971086 ccaaccgaatatgtcatatcggttgaggtgaatccaacaatctcaaacaatgacatcatgttcacgttggttttgtatgtggaatctattatcaaaacag 20971185  T
Q  263 ttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  20971186 tcgggaaattattaaaaaacttaaccgattgtggatgagtccaaaa 20971231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 32716409 - 32716305
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  32716409 ggtcaagtcatgtacaatctttttgtcgtcctccattaatcttccggtaataaggtgccctgctacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccatta 32716310  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  32716309 agaat 32716305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17916599 - 17916521
Alignment:
Q  230 tggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||||||||| ||| | ||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  17916599 tggttttgtacgtgaaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 17916521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 270
Target Start/End: Original strand, 11693442 - 11693485
Alignment:
Q  227 tgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11693442 tgttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaacagtgggaaaa 11693485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17497019 - 17496893
Alignment:
Q  147 tgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggag 246  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||  || || ||||  ||| |||  ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||     
T  17497019 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtctaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaaattggttttgtacgtggaa 17496920  T
Q  247 tccataaccaaaaccgttggaaaattg 273  Q
    ||||| | |||||  || |||||||||    
T  17496919 tccattatcaaaatagtcggaaaattg 17496893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 569
Target Start/End: Original strand, 20971446 - 20971492
Alignment:
Q  523 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 569  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  20971446 ctcttagtcaagtcacgtacaatctccttgtcgttctccattaatct 20971492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36500360 - 36500314
Alignment:
Q  229 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  36500360 ttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaacggtgggaaaagtgtt 36500314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 55525224 - 55525178
Alignment:
Q  229 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  55525224 ttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaacggtgggaaaagtgtt 55525178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 521; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 47062509 - 47061874
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  47062509 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccgtaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacaattttaaa 47062410  T
Q  118 a-cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgac 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  47062409 aacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggc 47062310  T
Q  217 atcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47062309 atcttgtacattttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaattttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccgaaagatatctt 47062210  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcc-cctctat 415  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  47062209 caattgtagtactttcactttgtgtt-ttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcaacctctat 47062111  T
Q  416 ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaag 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47062110 ttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaag 47062011  T
Q  516 catcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttg 615  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47062010 catcttgctcttggtcaagtcacatacaatctttttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttcaaaagtcggctccatcgcatggttg 47061911  T
Q  616 tgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47061910 tgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 47061874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18107013 - 18106379
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18107013 aacatgtgcaaccgctttcaccaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 18106914  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||  ||    
T  18106913 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattagca 18106814  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18106813 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 18106714  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18106713 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 18106614  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18106613 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 18106514  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18106513 tcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 18106414  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106413 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 18106379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 42501032 - 42500398
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42501032 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacacaatatttttaaa 42500933  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  42500932 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 42500833  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42500832 tcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 42500733  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42500732 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctattt 42500633  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42500632 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttgaaagca 42500533  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42500532 tcttgatctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtttccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 42500433  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42500432 aactccattaagaatgttcaatctccattcctttg 42500398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 43622571 - 43623205
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43622571 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 43622670  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  43622671 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 43622770  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43622771 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 43622870  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43622871 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 43622970  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43622971 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 43623070  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43623071 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 43623170  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623171 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 43623205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 617185 - 617819
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  617185 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 617284  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  617285 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 617384  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  617385 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 617484  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  617485 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctattt 617584  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  617585 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 617684  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  617685 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 617784  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617785 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 617819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 30788164 - 30787530
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30788164 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 30788065  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  30788064 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 30787965  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30787964 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 30787865  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30787864 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 30787765  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30787764 gctttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtatctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 30787665  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30787664 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 30787565  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787564 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 30787530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 45764998 - 45764370
Alignment:
Q  24 tgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaaacccaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45764998 tgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaa 45764899  T
Q  124 acaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgt 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| |||| | |    
T  45764898 acaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctat 45764799  T
Q  224 acatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgt 323  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  45764798 acatgctggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagt 45764699  T
Q  324 agtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttc 423  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45764698 attactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttc 45764599  T
Q  424 catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgc 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45764598 catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgc 45764499  T
Q  524 tcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactcc 623  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45764498 tcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatgggatggttgtgaactcc 45764399  T
Q  624 attaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764398 attaagaatgttcaatccccattcctttg 45764370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 43827042 - 43827676
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43827042 aacatttccaaccgctttcatcaaagacatatccctgctagtgacaatcaccttaagcatattcatctttaacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 43827141  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaa-gtgatcccagctacctcaaacattgac 216  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||||| |    
T  43827142 acccaaacaaagtttttatctttctcatatgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaagtgacccaaactacctcaaacattggc 43827241  T
Q  217 atcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctt 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43827242 atcttgtacacgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatttt 43827341  T
Q  317 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatt 416  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43827342 caattgtagtactttcactttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctcattcaacttcgagat-agatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 43827440  T
Q  417 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagc 516  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43827441 tgccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatttatcaaaatatttcttggaagc 43827540  T
Q  517 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 616  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43827541 atcttgcacttggtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtcattctaaagctggctccttcgcatggttgt 43827640  T
Q  617 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43827641 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 43827676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 220 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8401009 - 8400577
Alignment:
Q  220 ttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  8401009 ttgtacatgttggttttgtaggtgaaatccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaaaatatctttaa 8400910  T
Q  320 ttgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  8400909 ttgtagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgccgtcttgtcacctctatttgc 8400810  T
Q  420 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatc 519  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||    
T  8400809 cttccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtcttttgttcttcaaatttatcaaaatattttttggtaacatc 8400710  T
Q  520 ttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaa 619  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8400709 ttgctcttggtcaagtcacctacaatcttcttgtcatcctcctttaatgtaccagcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaa 8400610  T
Q  620 ctccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  8400609 ctccattgaaaatgttcaatccccattcttttg 8400577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15067514 - 15067162
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15067514 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 15067415  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  15067414 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 15067315  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15067314 tcctatacatgttggttttgtatgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 15067215  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 370  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067214 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 366 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060605
Alignment:
Q  366 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 15060791  T
Q  466 atgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccttta 565  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15060790 atgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatattccttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctccttta 15060691  T
Q  566 atctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15060690 atctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaa-ccccattcctttg 15060605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 12116805 - 12117038
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12116805 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcagtcacaatcaccttaggcatatttatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 12116904  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  12116905 actcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggccgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 12117004  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117005 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccat 12117038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 495 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21800160 - 21800003
Alignment:
Q  495 tataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 594  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  21800160 tataaaaatattttttggatgcaccttgctcttgattaagtcacgtataattttcttgttatcctcctttaatctaccgacaaacatgtgtccttctaaa 21800061  T
Q  595 gccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21800060 gccgactccatcgcatggttgtgaactccattaacaatgttcaatctccattgctttg 21800003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8401129 - 8401016
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8401129 aacattttcaaccgctttcatcaaagacatatcattgtcagtcacaatcaccttaggcatcttcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaa 8401030  T
Q  118 acccaaacaaagtt 131  Q
    ||||||||||||||    
T  8401029 acccaaacaaagtt 8401016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 43378819 - 43379034
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||  |||||| ||||| ||||||   |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  43378819 aagaagtttaagcaacatttacaaagcccaagtaaagttatcctccttctcagacgtcataaatgcaaaatcaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtg 43378918  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| |   ||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  43378919 actccaactatttcaaacaatagaatcctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatg 43379018  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  43379019 ttggatgagtccaaaa 43379034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 46791440 - 46791336
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46791440 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46791341  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  46791340 agaat 46791336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 632
Target Start/End: Original strand, 8194131 - 8194330
Alignment:
Q  433 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 532  Q
    |||||| |||| || |||||||| | |||||||||| | | | ||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||   || |   || ||| |||    
T  8194131 tgacgtacattatagacttgcttgatatttgtcatggactcttgtcttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggtttcaccgaactattgctca 8194230  T
Q  533 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| | |||  || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8194231 agtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgcaaaatacgccaccatctcatggttgtgaacaccattaagaat 8194330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 16795667 - 16795822
Alignment:
Q  153 aaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccata 252  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||   || |||  ||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||     
T  16795667 aaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaagtgagttcaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacatggaatccatt 16795766  T
Q  253 accaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  16795767 atcaaaacagttggaaaattgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaa 16795822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 16794194 - 16794339
Alignment:
Q  163 ccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccg 262  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| || |||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| |    
T  16794194 ccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacgtggaatccattatcaaaacag 16794293  T
Q  263 ttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  16794294 tcggaaaattgttaaacaactttactgatgtttgatgagtccaaaa 16794339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 45172855 - 45172959
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45172855 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45172954  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  45172955 agaat 45172959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 3762434 - 3761979
Alignment:
Q  114 taaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacatt 213  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||  | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || || |||| ||||  || |||||||| |    
T  3762434 taaaacccaagtaaagttatcctccttctcaactatcagaaatgcaaaagcaaccgaatatttcatatcggttgaggtgaacccaattatctcaaacaat 3762335  T
Q  214 gacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatat 313  Q
      |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |  | |||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||| || |    
T  3762334 tgcatcatgtacaagttggttttataggtggagtccatgatcaaaactttcaggaaatcgttaaacaacttaaccgattcggaatgagcccaaaatatgt 3762235  T
Q  314 cttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctct 413  Q
    | |  || |||| ||| |||| ||||||||||| | |||||  ||| |||| ||| |||||||| || | |||| | |||| |  | |||||||   |||    
T  3762234 cctgaatagtagaactctcacattgtgttcttgtgaaataaacatatttgtactcttccaactttgacactagaaactgcatccccgtcttgtcatgtct 3762135  T
Q  414 atttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttgga 513  Q
      |||||||    | ||  ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||   ||||||||  || ||||||||| ||||     
T  3762134 gattgcctttttgaatttatgacgttcattgtatgctttctttacatttgtcatgcactcttgtctttttcccttcaaattcatcaaaatattttttggc 3762035  T
Q  514 agcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 569  Q
     |||||   ||||||||||||| || || |||||| ||||| || ||| |||||||    
T  3762034 tgcatcaaactcttggtcaagttacctagaatctttttgtcatcttcccttaatct 3761979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 40445076 - 40445291
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||  |||||| ||||| |||||   ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || |||    
T  40445076 aagaagtttaagcaacatttgcaaagcccaagtaaagttatcctccttctccgatgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtg 40445175  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| ||||||||||||  |||| ||||| | |||||| ||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  40445176 actccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacatggaatccattatcaaaacagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatg 40445275  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  40445276 ttggatgagtccaaaa 40445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 529 - 632
Target Start/End: Original strand, 40445512 - 40445615
Alignment:
Q  529 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaa 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40445512 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggttccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaa 40445611  T
Q  629 gaat 632  Q
    ||||    
T  40445612 gaat 40445615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 632
Target Start/End: Original strand, 20908458 - 20908567
Alignment:
Q  523 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactc 622  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    | |  | || |||||||||||||||    
T  20908458 ctcttggtaaagtcacgcacaatcttcttgtcatcctcccttaatcttcctgcaagaatgtgcccttctaacattgccgtcgtctcatggttgtgaactc 20908557  T
Q  623 cattaagaat 632  Q
    ||||||||||    
T  20908558 cattaagaat 20908567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 47867442 - 47867546
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  47867442 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaagatgccctgctacataccgcaccatctcattgttgtgaacgccatta 47867541  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  47867542 agaat 47867546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1297406 - 1297321
Alignment:
Q  223 tacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  1297406 tacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagttggaaaaatgttaaacaactttatcgatgttggatgagtccaaaa 1297321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 1297101 - 1296997
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  1297101 ggtcaagtcatgtacaatcttctcgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttattaacaccatta 1297002  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  1297001 agaat 1296997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Original strand, 8193858 - 8194006
Alignment:
Q  160 aacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaa 259  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| || ||||  | | |||  ||||||| || |||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||| | |||||    
T  8193858 aaccaaaccgaatatgtcatattagttgaggtgactctaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaatgcattatcaaaa 8193957  T
Q  260 ccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  8193958 cagtcggaaaattattaaacaactttaccaatgttggatgagtccaaaa 8194006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 46791804 - 46791660
Alignment:
Q  164 caaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgt 263  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||    
T  46791804 caaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttagttttgtacgtggaatccattatcaaaacagt 46791705  T
Q  264 tggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
     |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  46791704 cggaaaagtgttaaataactttactgatgttggatgagtccaaaa 46791660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 47867065 - 47867225
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| || |||  | |||| |||| ||||||| |||||||    
T  47867065 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggagt 47867164  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||| | ||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  47867165 ccattatcaaagcagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 47867225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 632
Target Start/End: Original strand, 16794464 - 16794663
Alignment:
Q  433 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 532  Q
    ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| | | |   ||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||   || |   || |||||||    
T  16794464 tgatgttcattgtagacttgcttgatatttgtcatggactctttccttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggtttcaccaaactattggtca 16794563  T
Q  533 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaat 632  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||  ||| | | |   ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16794564 agtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttgtggcaagaaggttccctgcaacataaggcaccatctcatggttgtgaacaccattaagaat 16794663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Original strand, 45172420 - 45172635
Alignment:
Q  93 aagaagtttacccaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtg 192  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||  |||||| ||||| |||||    |||| |||| ||||  |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  45172420 aagaagtttaagcaacatttgcaaagcccaagtaaagttatcctccttctccgacgtcataaatgcaaaatcaactgaatatgtcaaataggtcgaagtg 45172519  T
Q  193 atcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatg 292  Q
    |  | | |||  ||||| | || |||  | |||| |||||||||||| ||||| || || | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  45172520 actcaaactatttcaaataatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatcaattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatg 45172619  T
Q  293 ttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||    
T  45172620 ttggatgagtccaaaa 45172635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 40794035 - 40793934
Alignment:
Q  531 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaaga 630  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40794035 caagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaattttcctgcaagaaggtgccctactacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccattaaga 40793936  T
Q  631 at 632  Q
    ||    
T  40793935 at 40793934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Original strand, 43379254 - 43379358
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||| | | ||| |  |||| |||||  ||| |||||||| ||||||    
T  43379254 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtactctgttaatcttccggcaagaaggtgccatgctacatacggcaccatcttatgattgtgaacgccatta 43379353  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  43379354 agaat 43379358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40794418 - 40794258
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  | ||||| || |||  | |||| |||| ||||||| ||||| |    
T  40794418 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttaaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggaat 40794319  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    ||||   |||||  || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40794318 ccattctcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40794258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 277
Target Start/End: Original strand, 23558969 - 23559014
Alignment:
Q  232 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaa 277  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  23558969 gttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggttggaaaagtgttaa 23559014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 526 - 558
Target Start/End: Original strand, 16796810 - 16796842
Alignment:
Q  526 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcc 558  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16796810 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcc 16796842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 507; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 2506 - 1872
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2506 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 2407  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  2406 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 2307  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2306 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 2207  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2206 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 2107  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2106 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 2007  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2006 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 1907  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 1872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 507; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Original strand, 15793 - 16427
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15793 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcacattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 15892  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  15893 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 15992  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15993 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttc 16092  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16093 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 16192  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16193 gcgttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 16292  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16293 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcttcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 16392  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16393 aactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 16427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 34434 - 33800
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34434 aacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaa 34335  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  34334 acccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 34235  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 317  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34234 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 34135  T
Q  318 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctattt 417  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34134 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 34035  T
Q  418 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagca 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34034 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagca 33935  T
Q  518 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33934 tcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtg 33835  T
Q  618 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33834 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 33800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 326 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12253
Alignment:
Q  326 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcccctctatttgccttcc- 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |     
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcg 12481  T
Q  425 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatatttcttggaagcatcttgct 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12480 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctttct 12381  T
Q  525 cttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactcca 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  12380 cttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccagctccatggcatggttttgaactcca 12281  T
Q  625 ttaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12280 ttaagaatgttcaatccccattcctttg 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Original strand, 25382 - 25611
Alignment:
Q  18 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacccaacatttttaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25382 aacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcaatgtaggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaa 25481  T
Q  118 acccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgaca 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  25482 accaaaacaaagttttcctctttctcatatgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaattggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggca 25581  T
Q  218 tcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  25582 tcctatacatgttggttttgtagatggagt 25611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 507 - 652
Target Start/End: Original strand, 95 - 240
Alignment:
Q  507 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgttctcctttagtctactcgtaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 194  T
Q  607 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  195 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcaccattcctttg 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 232
Target Start/End: Original strand, 1 - 100
Alignment:
Q  133 tcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttgg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  1 tcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatcttgg 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 3951 - 3847
Alignment:
Q  528 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccatta 627  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |    || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3951 ggtcaagttatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataacgcaccatctcatggttgtgaactccatta 3852  T
Q  628 agaat 632  Q
    |||||    
T  3851 agaat 3847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4315 - 4179
Alignment:
Q  164 caaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgt 263  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| || ||| || |||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||    
T  4315 caaccgaatatgtcaaatatgttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattttctacaagttggttttatatgtggaatccattatcaaaacagt 4216  T
Q  264 tggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatga 300  Q
      ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4215 cagaaaattgttaaacaactttaccaatgttggatga 4179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28612
Alignment:
Q  148 gtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtcgaagtgatcccagctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagt 247  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || || ||||  ||| |||  ||||||| ||||||  | |||| ||||||||| || || || |    
T  28452 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttttatgtagaat 28551  T
Q  248 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 308  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  28552 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaa 28612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University