View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4780_low_35 (Length: 320)

Name: NF4780_low_35
Description: NF4780
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4780_low_35
NF4780_low_35
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (18-263)||(39572952-39573197)
chr5 (18-263)||(38528026-38528279)
chr5 (18-263)||(19119992-19120245)
chr5 (18-263)||(22980926-22981179)
chr5 (18-263)||(31786435-31786688)
chr5 (18-263)||(40133518-40133771)
chr5 (18-263)||(8741674-8741928)
chr5 (18-263)||(35934028-35934282)
chr5 (18-263)||(36866895-36867148)
chr5 (18-263)||(15992329-15992582)
chr5 (18-263)||(27330437-27330690)
chr5 (11-262)||(5830019-5830278)
chr5 (18-262)||(12910488-12910740)
chr5 (18-263)||(25500715-25500968)
chr5 (18-263)||(5837688-5837941)
chr5 (18-263)||(22973871-22974124)
chr5 (18-263)||(35511271-35511519)
chr5 (18-262)||(699283-699535)
chr5 (18-263)||(30969113-30969366)
chr5 (21-263)||(33908369-33908618)
chr5 (18-263)||(42342864-42343107)
chr5 (18-263)||(7208653-7208906)
chr5 (18-263)||(22019765-22020009)
chr5 (18-263)||(31705401-31705654)
chr5 (18-263)||(35504498-35504751)
chr5 (18-263)||(23116019-23116264)
chr5 (18-263)||(36860556-36860810)
chr5 (18-263)||(7693363-7693607)
chr5 (18-263)||(22255315-22255568)
chr5 (18-263)||(32563282-32563526)
chr5 (32-263)||(25669733-25669962)
chr5 (18-263)||(27318277-27318529)
chr5 (18-263)||(28416340-28416569)
chr5 (36-263)||(2888234-2888469)
chr5 (18-263)||(17157820-17158073)
chr5 (23-263)||(35826275-35826521)
chr5 (18-263)||(9200366-9200610)
chr5 (18-263)||(15724621-15724874)
chr5 (19-263)||(8437099-8437351)
chr5 (126-263)||(24886336-24886473)
chr5 (18-227)||(13956187-13956404)
chr5 (18-263)||(21088558-21088808)
chr5 (126-263)||(14409130-14409267)
chr5 (18-263)||(43308449-43308694)
chr5 (126-262)||(25889619-25889755)
chr5 (18-263)||(23954591-23954831)
chr5 (20-204)||(6824329-6824519)
chr5 (139-263)||(8466988-8467112)
chr5 (142-263)||(26269074-26269195)
chr5 (126-228)||(1428983-1429088)
chr5 (176-262)||(43254154-43254240)
chr5 (18-263)||(14919328-14919570)
chr5 (18-118)||(26268207-26268307)
chr5 (18-79)||(1429126-1429187)
chr5 (18-77)||(14409310-14409369)
chr5 (25-127)||(5112247-5112348)
chr5 (18-70)||(8466877-8466929)
chr5 (18-63)||(24886237-24886282)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (11-263)||(1547401-1547653)
chr1 (18-263)||(27532776-27533027)
chr1 (18-263)||(7078857-7079110)
chr1 (18-262)||(27227280-27227532)
chr1 (18-263)||(47279318-47279571)
chr1 (18-263)||(38823343-38823596)
chr1 (18-262)||(16415775-16416027)
chr1 (20-262)||(4330412-4330662)
chr1 (18-263)||(2959877-2960130)
chr1 (20-263)||(238307-238558)
chr1 (18-263)||(8222257-8222510)
chr1 (18-263)||(51128988-51129239)
chr1 (18-263)||(15383062-15383316)
chr1 (18-262)||(10181802-10182055)
chr1 (18-263)||(15168225-15168478)
chr1 (18-263)||(32216184-32216437)
chr1 (18-263)||(34012176-34012424)
chr1 (18-263)||(23999476-23999730)
chr1 (18-263)||(25160761-25161015)
chr1 (18-263)||(39393512-39393766)
chr1 (18-263)||(3535061-3535305)
chr1 (18-262)||(19899563-19899816)
chr1 (18-262)||(27266995-27267246)
chr1 (19-263)||(32267164-32267416)
chr1 (20-263)||(37451416-37451667)
chr1 (18-260)||(47682291-47682541)
chr1 (18-263)||(9902848-9903101)
chr1 (18-262)||(27563700-27563952)
chr1 (18-263)||(10922856-10923109)
chr1 (18-263)||(11742162-11742398)
chr1 (18-263)||(30254552-30254805)
chr1 (18-257)||(30326751-30326999)
chr1 (18-263)||(46931540-46931792)
chr1 (18-263)||(28564577-28564828)
chr1 (18-263)||(28769781-28770035)
chr1 (18-263)||(15752158-15752411)
chr1 (18-263)||(3309276-3309536)
chr1 (18-263)||(22170840-22171093)
chr1 (18-263)||(42721168-42721418)
chr1 (18-263)||(14758170-14758414)
chr1 (20-263)||(27763104-27763356)
chr1 (81-263)||(48353735-48353924)
chr1 (18-243)||(18422780-18423006)
chr1 (18-263)||(31621342-31621600)
chr1 (18-253)||(40884942-40885185)
chr1 (18-262)||(41926292-41926537)
chr1 (128-262)||(21289847-21289981)
chr1 (126-248)||(1359744-1359866)
chr1 (18-263)||(33725405-33725647)
chr1 (126-263)||(31962861-31962999)
chr1 (18-229)||(37618729-37618939)
chr1 (18-99)||(48620766-48620847)
chr1 (18-194)||(38759662-38759846)
chr1 (208-263)||(48620916-48620971)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (18-263)||(22687347-22687592)
chr7 (29-263)||(26587892-26588126)
chr7 (18-263)||(15612559-15612812)
chr7 (18-263)||(6546627-6546880)
chr7 (18-263)||(9355626-9355879)
chr7 (18-263)||(18797435-18797688)
chr7 (20-263)||(8861395-8861646)
chr7 (18-262)||(37109980-37110234)
chr7 (18-263)||(25691344-25691597)
chr7 (18-262)||(17842385-17842639)
chr7 (18-263)||(21991744-21991988)
chr7 (18-261)||(30055635-30055886)
chr7 (18-263)||(4583027-4583280)
chr7 (18-263)||(32432560-32432813)
chr7 (11-263)||(37703298-37703558)
chr7 (18-263)||(15672559-15672815)
chr7 (18-263)||(31578864-31579117)
chr7 (18-263)||(5657280-5657534)
chr7 (18-263)||(10359014-10359268)
chr7 (20-257)||(27283854-27284100)
chr7 (18-263)||(32820853-32821106)
chr7 (18-263)||(41764878-41765131)
chr7 (18-263)||(23111298-23111553)
chr7 (11-263)||(46480929-46481189)
chr7 (18-263)||(44598774-44599027)
chr7 (18-263)||(24211849-24212103)
chr7 (18-245)||(11071314-11071546)
chr7 (18-263)||(7334902-7335154)
chr7 (18-263)||(10481713-10481966)
chr7 (18-233)||(12165860-12166074)
chr7 (58-263)||(35353256-35353469)
chr7 (18-208)||(33688117-33688315)
chr7 (25-263)||(37347137-37347382)
chr7 (18-263)||(48928097-48928350)
chr7 (20-263)||(43925211-43925456)
chr7 (18-263)||(29173648-29173883)
chr7 (18-263)||(26980431-26980667)
chr7 (18-192)||(43686148-43686330)
chr7 (126-263)||(31520541-31520678)
chr7 (126-262)||(12390450-12390586)
chr7 (126-258)||(44411345-44411477)
chr7 (126-245)||(37704406-37704525)
chr7 (126-263)||(32593007-32593143)
chr7 (126-263)||(34361976-34362115)
chr7 (18-173)||(38258653-38258816)
chr7 (20-129)||(27421322-27421431)
chr7 (20-129)||(37704267-37704376)
chr7 (190-263)||(38258867-38258940)
chr7 (18-97)||(44413353-44413432)
chr7 (18-118)||(48928517-48928617)
chr7 (18-79)||(12390622-12390683)
chr7 (25-79)||(31520716-31520770)
chr7 (18-79)||(38053586-38053647)
chr7 (145-209)||(27421219-27421283)
chr7 (126-192)||(38053685-38053751)
chr7 (18-79)||(32593181-32593242)
chr7 (228-263)||(12166215-12166250)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (18-263)||(38644110-38644363)
chr8 (18-263)||(5299751-5300004)
chr8 (18-263)||(11727156-11727409)
chr8 (18-263)||(16446680-16446933)
chr8 (67-263)||(24823199-24823395)
chr8 (24-263)||(37970324-37970571)
chr8 (18-263)||(1149437-1149690)
chr8 (18-263)||(27082643-27082896)
chr8 (18-263)||(34895099-34895347)
chr8 (18-263)||(36694771-36695024)
chr8 (18-263)||(43643400-43643653)
chr8 (18-263)||(1205059-1205312)
chr8 (18-262)||(4132492-4132743)
chr8 (18-261)||(6098320-6098576)
chr8 (27-263)||(40862560-40862805)
chr8 (20-263)||(44869631-44869882)
chr8 (18-260)||(465974-466214)
chr8 (18-263)||(12876241-12876495)
chr8 (18-263)||(7890762-7891015)
chr8 (18-263)||(16222995-16223248)
chr8 (18-263)||(39098924-39099177)
chr8 (20-263)||(8803621-8803873)
chr8 (18-263)||(1953793-1954047)
chr8 (18-263)||(33906344-33906595)
chr8 (18-239)||(9864280-9864509)
chr8 (18-263)||(23854236-23854489)
chr8 (18-263)||(35459516-35459769)
chr8 (126-263)||(34951862-34951999)
chr8 (18-263)||(30654388-30654641)
chr8 (18-263)||(31933691-31933944)
chr8 (126-263)||(12587830-12587967)
chr8 (32-263)||(18259229-18259464)
chr8 (126-263)||(35859182-35859319)
chr8 (18-192)||(13307755-13307936)
chr8 (18-263)||(10555010-10555260)
chr8 (133-263)||(33198057-33198187)
chr8 (18-129)||(41910935-41911046)
chr8 (126-232)||(1149756-1149862)
chr8 (18-127)||(43025834-43025943)
chr8 (179-263)||(41362723-41362807)
chr8 (178-263)||(43025974-43026059)
chr8 (18-91)||(1150090-1150163)
chr8 (19-79)||(7998427-7998488)
chr8 (18-79)||(34952028-34952089)
chr8 (126-199)||(34463722-34463792)
chr8 (18-78)||(41362647-41362707)
chr8 (230-263)||(13307931-13307964)
chr8 (67-111)||(12585297-12585341)
chr8 (231-263)||(41910863-41910895)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (18-263)||(33341531-33341784)
chr4 (11-263)||(47253866-47254126)
chr4 (11-263)||(7703635-7703895)
chr4 (17-263)||(30002466-30002711)
chr4 (18-260)||(34947923-34948175)
chr4 (18-263)||(28002811-28003064)
chr4 (18-263)||(37775800-37776044)
chr4 (18-263)||(55477716-55477969)
chr4 (31-263)||(55240930-55241170)
chr4 (18-261)||(37663568-37663819)
chr4 (18-263)||(1815434-1815687)
chr4 (18-263)||(17167846-17168099)
chr4 (18-263)||(17272097-17272350)
chr4 (18-263)||(29584025-29584278)
chr4 (18-261)||(19089280-19089531)
chr4 (18-263)||(50764863-50765106)
chr4 (18-263)||(17173423-17173676)
chr4 (18-263)||(23761205-23761457)
chr4 (18-263)||(25184246-25184499)
chr4 (18-263)||(3042752-3043005)
chr4 (18-263)||(27396749-27397000)
chr4 (18-263)||(46887983-46888235)
chr4 (20-263)||(32912404-32912656)
chr4 (18-263)||(35020856-35021113)
chr4 (18-263)||(50697374-50697628)
chr4 (18-263)||(879373-879626)
chr4 (18-263)||(19440473-19440726)
chr4 (17-263)||(37287858-37288115)
chr4 (26-263)||(34361316-34361562)
chr4 (18-263)||(32579579-32579832)
chr4 (18-263)||(32592226-32592470)
chr4 (20-263)||(6864170-6864421)
chr4 (18-263)||(4598125-4598368)
chr4 (18-263)||(49376100-49376353)
chr4 (25-263)||(36493514-36493759)
chr4 (20-263)||(33816341-33816609)
chr4 (18-263)||(25700881-25701135)
chr4 (18-262)||(9139378-9139612)
chr4 (126-263)||(7152029-7152166)
chr4 (126-263)||(39400257-39400394)
chr4 (18-263)||(5047791-5048043)
chr4 (139-263)||(35025392-35025515)
chr4 (18-263)||(42199862-42200116)
chr4 (126-263)||(4205233-4205370)
chr4 (148-263)||(23431826-23431941)
chr4 (27-263)||(46883939-46884177)
chr4 (18-260)||(4934040-4934280)
chr4 (137-263)||(26896346-26896474)
chr4 (18-192)||(38011987-38012169)
chr4 (183-263)||(38012568-38012648)
chr4 (18-116)||(54499217-54499316)
chr4 (25-91)||(39398049-39398115)
chr4 (17-118)||(35025574-35025675)
chr4 (126-181)||(56050179-56050234)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (18-263)||(12042-12294)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (18-263)||(3879737-3879990)
chr6 (18-263)||(6090980-6091234)
chr6 (18-257)||(4318626-4318874)
chr6 (18-263)||(33892810-33893054)
chr6 (18-263)||(20768217-20768468)
chr6 (26-263)||(1945975-1946221)
chr6 (18-263)||(21016916-21017163)
chr6 (18-263)||(29182296-29182547)
chr6 (18-263)||(7234830-7235086)
chr6 (18-263)||(5627524-5627778)
chr6 (18-263)||(8513366-8513607)
chr6 (127-263)||(33619080-33619219)
chr6 (18-263)||(6089041-6089282)
chr6 (18-129)||(15491748-15491859)
chr6 (138-263)||(7054570-7054696)
chr6 (18-163)||(30353256-30353409)
chr6 (18-118)||(7055166-7055266)
chr6 (203-258)||(33724062-33724117)
chr6 (18-61)||(33618967-33619010)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (20-263)||(44891623-44891874)
chr3 (18-263)||(22622517-22622770)
chr3 (18-263)||(33698277-33698530)
chr3 (18-262)||(52040722-52040974)
chr3 (18-263)||(4015584-4015836)
chr3 (18-263)||(7327281-7327534)
chr3 (18-263)||(39282776-39283029)
chr3 (18-263)||(32373594-32373846)
chr3 (18-263)||(46297561-46297814)
chr3 (18-261)||(42505876-42506127)
chr3 (18-263)||(26941059-26941312)
chr3 (18-263)||(24707914-24708169)
chr3 (18-262)||(53228952-53229204)
chr3 (18-263)||(2008057-2008316)
chr3 (18-263)||(33378584-33378837)
chr3 (23-263)||(37157836-37158085)
chr3 (20-263)||(1089819-1090070)
chr3 (18-239)||(34133059-34133288)
chr3 (18-263)||(37203191-37203445)
chr3 (18-263)||(14586479-14586722)
chr3 (18-263)||(48355065-48355318)
chr3 (23-263)||(25579868-25580116)
chr3 (26-262)||(3362385-3362631)
chr3 (18-263)||(21193730-21193984)
chr3 (18-263)||(22451092-22451345)
chr3 (18-263)||(36012261-36012517)
chr3 (18-263)||(40552058-40552311)
chr3 (18-263)||(29099479-29099723)
chr3 (18-263)||(29163942-29164179)
chr3 (18-263)||(3654998-3655254)
chr3 (18-263)||(24488761-24489014)
chr3 (18-263)||(44186316-44186553)
chr3 (26-263)||(47481654-47481900)
chr3 (18-263)||(21009600-21009854)
chr3 (24-233)||(46994490-46994707)
chr3 (126-262)||(11357181-11357317)
chr3 (18-263)||(11466948-11467187)
chr3 (18-262)||(22445865-22446116)
chr3 (18-263)||(4761447-4761701)
chr3 (26-263)||(54505939-54506185)
chr3 (18-192)||(43348381-43348563)
chr3 (18-239)||(38591822-38592051)
chr3 (18-263)||(43975691-43975940)
chr3 (18-217)||(54828546-54828753)
chr3 (126-263)||(40936213-40936350)
chr3 (18-201)||(45174629-45174821)
chr3 (20-201)||(11835494-11835678)
chr3 (128-263)||(50475053-50475195)
chr3 (126-263)||(51212576-51212707)
chr3 (80-263)||(11356957-11357140)
chr3 (126-256)||(27480164-27480298)
chr3 (51-263)||(20373062-20373263)
chr3 (18-118)||(35844450-35844550)
chr3 (18-96)||(51212955-51213033)
chr3 (18-118)||(53176178-53176278)
chr3 (18-79)||(11357355-11357416)
chr3 (18-81)||(27480368-27480431)
chr3 (126-199)||(53811597-53811670)
chr3 (18-66)||(20373300-20373348)
chr3 (216-263)||(35844577-35844624)
chr3 (18-57)||(40936115-40936154)
chr3 (228-263)||(43348556-43348591)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (21-263)||(33709049-33709299)
chr2 (18-263)||(4167055-4167308)
chr2 (18-263)||(41960973-41961226)
chr2 (18-263)||(18494098-18494350)
chr2 (11-263)||(2325195-2325455)
chr2 (18-263)||(44913796-44914053)
chr2 (18-263)||(4763764-4764017)
chr2 (18-263)||(31570551-31570804)
chr2 (18-263)||(43648062-43648315)
chr2 (18-263)||(19424459-19424698)
chr2 (18-263)||(26357710-26357963)
chr2 (18-263)||(3177072-3177325)
chr2 (18-263)||(5881672-5881915)
chr2 (18-263)||(33660194-33660438)
chr2 (18-263)||(11366197-11366451)
chr2 (18-263)||(41465634-41465887)
chr2 (18-262)||(29241963-29242208)
chr2 (18-263)||(39167186-39167433)
chr2 (18-263)||(19289140-19289393)
chr2 (18-263)||(35959030-35959278)
chr2 (18-239)||(27349789-27350009)
chr2 (18-263)||(37905841-37906097)
chr2 (18-263)||(43770665-43770909)
chr2 (18-230)||(4263926-4264147)
chr2 (18-263)||(31861985-31862238)
chr2 (18-263)||(33550800-33551056)
chr2 (23-263)||(7006755-7006986)
chr2 (18-229)||(4478502-4478717)
chr2 (18-213)||(44286082-44286285)
chr2 (18-263)||(13711597-13711845)
chr2 (18-216)||(19313984-19314186)
chr2 (126-256)||(19500739-19500869)
chr2 (18-182)||(45327853-45328025)
chr2 (18-182)||(36642119-36642293)
chr2 (142-263)||(41051117-41051238)
chr2 (18-171)||(17071646-17071807)
chr2 (18-118)||(17054066-17054166)
chr2 (158-263)||(41463407-41463512)
chr2 (26-118)||(18258257-18258349)
chr2 (165-263)||(18257355-18257453)
chr2 (180-263)||(33902317-33902400)
chr2 (18-118)||(33902199-33902299)
chr2 (18-151)||(41463779-41463920)
chr2 (215-263)||(45328028-45328076)
chr2 (206-248)||(17053963-17054005)
chr2 (206-248)||(17071604-17071646)
chr2 (233-263)||(4263726-4263756)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (18-263)||(408228-408481)
scaffold0002 (18-263)||(267-514)
scaffold0002 (126-263)||(93900-94036)
scaffold0002 (18-123)||(94330-94435)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (18-261)||(8020-8271)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (18-263)||(44090-44342)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (18-263)||(154445-154697)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (18-263)||(145814-146068)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (18-263)||(267417-267662)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (155-222)||(100993-101058)
scaffold0009 (29-70)||(100894-100935)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 39572952 - 39573197
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
39572952 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactcgagactatcacatgatatc 39573051  T
118 aacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 217  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39573052 aacaactctgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 39573151  T
218 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39573152 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 39573197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38528279 - 38528026
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
38528279 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 38528180  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38528179 atcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 38528080  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
38528079 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 38528026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 19119992 - 19120245
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
19119992 tcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 19120091  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19120092 agcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 19120191  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
19120192 cagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 19120245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 22980926 - 22981179
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
22980926 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatc 22981025  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    |  || ||||||        ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22981026 ataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaatcattactagatgaattattattgatcattaat 22981125  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22981126 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 22981179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31786688 - 31786435
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
31786688 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 31786589  T
118 aacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||        ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31786588 atcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaat 31786489  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
31786488 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaacttttt 31786435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 40133518 - 40133771
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
40133518 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 40133617  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
40133618 atcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaat 40133717  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
40133718 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttt 40133771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8741928 - 8741674
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgat-at 116  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
8741928 tcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattat 8741829  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
     | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
8741828 gagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaa 8741729  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8741728 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 8741674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 35934028 - 35934282
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
35934028 tcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 35934127  T
117 caacaa------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || |||      |||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
35934128 cagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagttgaattattattgatcattaa 35934227  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
35934228 tcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaacttttt 35934282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 36866895 - 36867148
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
36866895 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 36866994  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
36866995 atcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactggatgaattactattaatcatgaat 36867094  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
36867095 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttt 36867148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15992582 - 15992329
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
15992582 tcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatttgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatc 15992483  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    |  || ||||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15992482 aggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 15992383  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15992382 cagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 15992329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 27330437 - 27330690
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||    
27330437 tcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatc 27330536  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27330537 agcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 27330636  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27330637 cagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27330690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 5830019 - 5830278
Alignment:
11 cataggatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 110  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5830019 catagtatcatca-attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcaca 5830117  T
111 tgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 202  Q
    | |||||| ||| ||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5830118 taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 5830217  T
203 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
5830218 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 5830278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 12910488 - 12910740
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
12910488 tcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatc 12910587  T
118 aacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||        ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12910588 atcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaat 12910687  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
12910688 cagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 12910740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25500968 - 25500715
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||    
25500968 tcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatc 25500869  T
118 aacaa--ttct------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||  ||||      |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
25500868 agcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaaatactgttgatcattaat 25500769  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
25500768 cagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaacttttt 25500715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 5837688 - 5837941
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
5837688 tcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 5837787  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5837788 agcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaat 5837887  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
5837888 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaacctttt 5837941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22974124 - 22973871
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||     
22974124 tcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactattacataatatt 22974025  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22974024 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 22973925  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22973924 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 22973871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35511519 - 35511271
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||| |||||    
35511519 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatc 35511425  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
35511424 atcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaat 35511325  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
35511324 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 35511271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 699283 - 699535
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
699283 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatc 699382  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
699383 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaat 699482  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
699483 cagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 699535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30969366 - 30969113
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
30969366 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 30969267  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
30969266 agcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagatgagttactattaatcattaat 30969167  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
30969166 cagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 30969113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 33908369 - 33908618
Alignment:
21 tcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc--- 117  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||       
33908369 tcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtc 33908468  T
118 aacaat-----tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 212  Q
    ||| ||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
33908469 aactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat-aattactattgatcattaatcag 33908567  T
213 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
33908568 caatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 33908618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 42342864 - 42343107
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         |||||||||    
42342864 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 42342953  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
42342954 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaat 42343053  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42343054 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 42343107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7208906 - 7208653
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||     
7208906 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 7208807  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
      ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
7208806 ttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaat 7208707  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
7208706 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttt 7208653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 22019765 - 22020009
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||         |||||||||    
22019765 tcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtataacactca---------catgatatc 22019855  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22019856 agcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaat 22019955  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22019956 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaacttttt 22020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31705654 - 31705401
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||| || || ||||||| |||||    
31705654 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagaccatcacataatatc 31705555  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31705554 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 31705455  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
31705454 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttt 31705401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 35504498 - 35504751
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||     
35504498 tcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 35504597  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
35504598 atcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgattattaat 35504697  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
35504698 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattgacttttt 35504751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23116264 - 23116019
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
23116264 tcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 23116165  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||    
23116164 atcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattac--------tgactattgatcattaat 23116073  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
23116072 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 23116019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 36860556 - 36860810
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
36860556 tcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatat 36860655  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| | ||||        ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
36860656 catcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaattactattaatcatgaa 36860755  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
36860756 ttagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttt 36860810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 7693363 - 7693607
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||     
7693363 tcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatt 7693453  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7693454 agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaat 7693553  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
7693554 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 7693607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 22255315 - 22255568
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
22255315 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatc 22255414  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22255415 atcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagccttactagatgaattactattgatcattaat 22255514  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
22255515 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 22255568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 32563282 - 32563526
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||    
32563282 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 32563372  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
32563373 agcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaattattattgatcattaat 32563472  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
32563473 cagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 32563526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 263
Target Start/End: Original strand, 25669733 - 25669962
Alignment:
32 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt-- 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||||| ||| ||||||      
25669733 agaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacactca---------catgatatcatcaactctgtttg 25669822  T
130 ------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 223  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25669823 catgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 25669922  T
224 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
25669923 ttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 25669962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27318529 - 27318277
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
27318529 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 27318430  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
27318429 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacat--aagtttaagatgttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaat 27318332  T
210 cagtaatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27318331 caaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27318277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28416569 - 28416340
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
28416569 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 28416479  T
118 aacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 217  Q
    | ||| ||       |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
28416478 agcaactc-------gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatc 28416386  T
218 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
28416385 aacaatttaaaaaagaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 28416340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2888469 - 2888234
Alignment:
36 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt------ 129  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||          
2888469 tacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatg 2888370  T
130 --aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 227  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2888369 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 2888270  T
228 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
2888269 aaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 2888234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17158073 - 17157820
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||     
17158073 tcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatatt 17157974  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17157973 atcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaat 17157874  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||    
17157873 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgacttttt 17157820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35826521 - 35826275
Alignment:
23 agattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 122  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || | ||||| |  |||||| |||    
35826521 agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccacaaagtgtaacccttaagattatcata--atatcatcaa 35826424  T
123 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 214  Q
     ||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35826423 ctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaata 35826324  T
215 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
35826323 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 35826275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 9200366 - 9200610
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         |||||||||    
9200366 tcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 9200456  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9200457 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 9200556  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
9200557 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaatttttt 9200610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 15724621 - 15724874
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| || | || ||||||| ||||||||    
15724621 tcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccccaaagtgtatcaattaagactatcatatgatatc 15724720  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| | ||||        |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
15724721 aacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaagcattactagatgaattactattaatcattaat 15724820  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
15724821 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaacttttt 15724874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Original strand, 8437099 - 8437351
Alignment:
19 catcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 118  Q
    ||||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||| |    
8437099 catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatga 8437198  T
119 acaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
     ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
8437199 tcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattactagatgaattactattgatcattaatc 8437298  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
8437299 agtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaacttttt 8437351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 24886336 - 24886473
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24886336 tgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaattt 24886435  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
24886436 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 24886473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13956404 - 13956187
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| || |||||    
13956404 tcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactatcatataatatc 13956305  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13956304 atcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 13956205  T
210 cagtaatcaacaatttaa 227  Q
    ||||||||||||||||||    
13956204 cagtaatcaacaatttaa 13956187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21088808 - 21088558
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| |||||    
21088808 tcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 21088709  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| |||||||||||||  |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
21088708 atcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattaatcatgaat 21088609  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
21088608 aaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaatttttt 21088558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14409267 - 14409130
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
14409267 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattattcagcaatcaacaattt 14409168  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
14409167 aaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaattttt 14409130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43308694 - 43308449
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||  ||| |  ||    
43308694 tcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacacttaagactatatcatcaactc 43308595  T
118 aacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 217  Q
      |     ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
43308594 ttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatc 43308495  T
218 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||    
43308494 aacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaacttttt 43308449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 25889619 - 25889755
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25889619 tgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 25889718  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
25889719 aaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 25889755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23954831 - 23954591
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
23954831 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatc 23954732  T
118 aacaattctgt-------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
    | ||| |||||       | || ||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||     | ||||||| ||||||||||||||||||||         
23954731 atcaactctgtttgcatgttaaaatgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg-----aacattacttgatgaattactattgatcat----- 23954642  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
23954641 --taatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaacttttt 23954591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6824519 - 6824329
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |     
6824519 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-ag 6824421  T
120 caattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 204  Q
    ||| ||        ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
6824420 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Original strand, 8466988 - 8467112
Alignment:
139 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 238  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
8466988 aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaa 8467087  T
239 acattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
8467088 acattaaaaataaaattaacttttt 8467112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 263
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269195
Alignment:
142 gataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 241  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaccaatca 26269173  T
242 ttaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||    
26269174 ttaagattaaaattaacttttt 26269195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1429088 - 1428983
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa---tcaacaa 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
1429088 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaa 1428989  T
223 tttaaa 228  Q
    ||||||    
1428988 tttaaa 1428983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 262
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254240
Alignment:
176 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 43254240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14919570 - 14919328
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||    
14919570 tcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatc 14919471  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        ||||||||||  |||| ||||||| |||    |||||||||||| |||||| |      ||||||||||| |||||||||||||    
14919470 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatattgcaatc------agatgaattac-attgatcattaat 14919382  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
14919381 cagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 14919328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 26268207 - 26268307
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
26268207 tcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 26268306  T
118 a 118  Q
    |    
26268307 a 26268307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1429187 - 1429126
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1429187 tcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 1429126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14409369 - 14409310
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 77  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
14409369 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 14409310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5112348 - 5112247
Alignment:
25 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 124  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||| |||||| |||||| ||| |    
5112348 attaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-accccacaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaact 5112250  T
125 ctg 127  Q
    |||    
5112249 ctg 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Original strand, 8466877 - 8466929
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
8466877 tcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaa 8466929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 24886237 - 24886282
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctacctt 63  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
24886237 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 24886282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 1547401 - 1547653
Alignment:
11 cataggatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1547401 catagtatcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 1547500  T
111 tgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1547501 tgatatcaacaactctgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatc 1547600  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
1547601 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttt 1547653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27533027 - 27532776
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27533027 tcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatc 27532929  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27532928 agcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 27532829  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27532828 cagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27532776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7079110 - 7078857
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||    
7079110 tcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatc 7079011  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7079010 aacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatattgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 7078911  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
7078910 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 7078857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27227532 - 27227280
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
27227532 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatc 27227433  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27227432 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 27227333  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
27227332 cagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaactttt 27227280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 47279318 - 47279571
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
47279318 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 47279417  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| | ||||        ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
47279418 aacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattattagatgaattactattgatcattaat 47279517  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47279518 tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 47279571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 38823343 - 38823596
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
38823343 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 38823442  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38823443 agcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 38823542  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
38823543 cagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttt 38823596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 16415775 - 16416027
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| || |||||||||| |||||    
16415775 tcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatcacataatatc 16415874  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
16415875 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaat 16415974  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
16415975 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 16416027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 262
Target Start/End: Original strand, 4330412 - 4330662
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||     
4330412 atcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcat 4330511  T
120 caattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
4330512 caactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattacaattgatcattaatca 4330611  T
212 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
4330612 gtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 4330662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 2959877 - 2960130
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
2959877 tcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcacataatatc 2959976  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2959977 atcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 2960076  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
2960077 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 2960130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 238558 - 238307
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
238558 atcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat 238459  T
120 caattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
238458 caactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatca 238359  T
212 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
238358 gtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaacttttt 238307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 8222257 - 8222510
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
8222257 tcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 8222356  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
8222357 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta-tattgatcattaat 8222455  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
8222456 cagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 8222510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 51128988 - 51129239
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
51128988 tcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataatatc 51129087  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51129088 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 51129187  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||    
51129188 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaacttttt 51129239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 15383062 - 15383316
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
15383062 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 15383161  T
118 aacaattctgt--------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | |||        |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15383162 atcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaat 15383261  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
15383262 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 15383316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10182055 - 10181802
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
10182055 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 10181956  T
118 aacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacat-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    | ||| ||||        ||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10181955 atcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaa 10181856  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
10181855 tcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 10181802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 15168225 - 15168478
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||    
15168225 tcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatc 15168324  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
15168325 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaat 15168424  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
15168425 cagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 15168478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 32216184 - 32216437
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
32216184 tcattagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 32216283  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    |  || ||||||        ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
32216284 ataaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaat 32216383  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
32216384 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 32216437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34012424 - 34012176
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||| |||||    
34012424 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatc 34012330  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
34012329 atcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaat 34012230  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
34012229 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 34012176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 23999476 - 23999730
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
23999476 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 23999575  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | ||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
23999576 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 23999675  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
23999676 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 23999730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 25160761 - 25161015
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
25160761 tcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatc 25160860  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25160861 atcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaat 25160960  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
25160961 cagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaacctttt 25161015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 39393512 - 39393766
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
39393512 tcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatat 39393611  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
     | ||| ||||||        ||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
39393612 tagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaa 39393711  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
39393712 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaacttttt 39393766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 3535061 - 3535305
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||    
3535061 tcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta---------catgatatc 3535151  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3535152 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 3535251  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
3535252 caacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaacttttt 3535305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19899816 - 19899563
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
19899816 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19899717  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | ||| |||        |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19899716 accaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 19899617  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
19899616 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 19899563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27267246 - 27266995
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
27267246 tcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatc-taccttgttttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatc 27267148  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
27267147 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgataattaat 27267048  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
27267047 caataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 27266995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Original strand, 32267164 - 32267416
Alignment:
19 catcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
32267164 catcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatca 32267263  T
119 acaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
     ||| | ||||        ||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
32267264 tcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatc 32267363  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
32267364 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 32267416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 37451416 - 37451667
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
37451416 atcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat 37451515  T
120 caattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37451516 caactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatca 37451615  T
212 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
37451616 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttt 37451667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47682541 - 47682291
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
47682541 tcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatc 47682442  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
47682441 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactaaatgaattactattgatcattaat 47682342  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
47682341 cagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaactt 47682291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9903101 - 9902848
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
9903101 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatc 9903002  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9903001 atcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaattactattgatcattaat 9902902  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
9902901 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaacttttt 9902848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27563952 - 27563700
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| || || ||    
27563952 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttc 27563853  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
27563852 atcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattaatattgatcattaat 27563753  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
27563752 cagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaactttt 27563700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 10922856 - 10923109
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||    
10922856 tcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactgtcacataatatc 10922955  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||    || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10922956 atcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 10923055  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
10923056 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 10923109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11742398 - 11742162
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                  | || ||||||||||||||||    
11742398 tcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaa-----------------ttaagactatcacatgatatc 11742316  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11742315 agcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 11742216  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11742215 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 11742162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 30254552 - 30254805
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||| || ||| |||||| ||| |    
30254552 tcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctataaagtgtaacacttaagactgtcacataataac 30254651  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30254652 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaat 30254751  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
30254752 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 30254805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30326999 - 30326751
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
30326999 tcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 30326900  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
30326899 atcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatcaat 30326800  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagattaaaattaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
30326799 cagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 46931540 - 46931792
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
46931540 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46931637  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | ||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
46931638 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaa 46931737  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
46931738 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 46931792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28564828 - 28564577
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
28564828 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacacttaa--ctatcacataatatc 28564731  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
28564730 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 28564631  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
28564630 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 28564577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 28769781 - 28770035
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||    
28769781 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatat 28769880  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||  ||||||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
28769881 catcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattgctagatgaattactattgatcattaa 28769980  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
28769981 ttaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 28770035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 15752158 - 15752411
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||    
15752158 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatc 15752257  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    |  || ||||||        ||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
15752258 attaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatttttactagatgaattactattgatcattaat 15752357  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
15752358 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaatttttt 15752411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 3309276 - 3309536
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa-----agtgtaacactcaaaactatcacat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |     ||||||||||| || ||||||| ||    
3309276 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaat 3309375  T
112 gatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatc 203  Q
    ||||||| ||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
3309376 gatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatc 3309475  T
204 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-ttaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
3309476 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaacttttt 3309536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 22170840 - 22171093
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
22170840 tcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 22170939  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
22170940 atcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgcaaacattattagataaattactattgatcattaat 22171039  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
22171040 tagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 22171093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 42721168 - 42721418
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||||| | |||||    
42721168 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtataacacttaagattatcacgtaatatc 42721267  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
42721268 atcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaattattactagattaattactattgatcattaat 42721364  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
42721365 gagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttt 42721418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 14758170 - 14758414
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |         || |||||| ||| |||||    
14758170 tcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaatt---------aagactatcgcataatatc 14758260  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14758261 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 14758360  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
14758361 caacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 14758414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27763356 - 27763104
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |     
27763356 atcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatataat 27763257  T
120 caattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatc 210  Q
    ||| |||        |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
27763256 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatatactattgatcattaatc 27763157  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
27763156 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 27763104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353924
Alignment:
81 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 172  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatatt 48353833  T
173 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48353834 gcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 48353924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 18422780 - 18423006
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
18422780 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 18422879  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||  ||        ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        
18422880 atcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaagcattgctagatgaattactattgatcat---- 18422975  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 243  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||    
18422976 ---taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 18423006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31621600 - 31621342
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||| || |||||| ||| |||||    
31621600 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccccagaa-gtgtgacacttaagactatcgcataatatc 31621502  T
118 aacaattctgtt-------------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 204  Q
    ||||| | ||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
31621501 aacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgttgcaagcattagtagatgaactactattgatca 31621402  T
205 ttaatcagtaatcaacaattta-aaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
31621401 ttaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 31621342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Original strand, 40884942 - 40885185
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
40884942 tcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 40885041  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
40885042 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 40885141  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaa 253  Q
     || |||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
40885142 tagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaaggttaaaa 40885185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 41926292 - 41926537
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| | || |||||    
41926292 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacact------tattaaataatatc 41926385  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41926386 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagcattactagatgaattactattgatcattaat 41926484  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
     | |||||||  |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||    
41926485 taataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaattttt 41926537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 262
Target Start/End: Original strand, 21289847 - 21289981
Alignment:
128 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21289847 ttaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 21289946  T
228 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
21289947 aaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttt 21289981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1359866 - 1359744
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
1359866 tgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaattt 1359767  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||    
1359766 aaaaatgaatcaaacattaagat 1359744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33725647 - 33725405
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||| |||||    
33725647 tcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacatttaagactatcgcataatatc 33725548  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |            |||||||||||||||||||    
33725547 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaac------------attactattgatcattaat 33725460  T
210 cagtaatcaacaatt-taaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
33725459 cagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaacttttt 33725405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 31962861 - 31962999
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-tt 224  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
31962861 tgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatcaacaattt 31962960  T
225 taaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
31962961 taaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 31962999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37618939 - 37618729
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |         | |||||    
37618939 tcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatcccataaagtgtaacactcata---------taatatc 37618849  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
37618848 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaat 37618749  T
210 cagtaatcaacaatttaaaa 229  Q
    || |||||||||||||||||    
37618748 caataatcaacaatttaaaa 37618729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Original strand, 48620766 - 48620847
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48620766 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca 48620847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 38759662 - 38759846
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||| || | |||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||    
38759662 tcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatc 38759761  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 194  Q
    | ||| |         |||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
38759762 accaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 263
Target Start/End: Original strand, 48620916 - 48620971
Alignment:
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48620916 atcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 48620971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 22687347 - 22687592
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
22687347 tcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatctcatgatatc 22687446  T
118 aacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 217  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22687447 aacaactctgttaaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 22687546  T
218 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
22687547 aacaatttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaacttttt 22687592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587892
Alignment:
29 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgt 26588027  T
129 taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26588026 taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaa 26587927  T
229 aatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
26587926 aataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 26587892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15612812 - 15612559
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
15612812 tcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 15612713  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
15612712 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcattaat 15612613  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
15612612 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 15612559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 6546627 - 6546880
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||    
6546627 tcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatcacatgatatc 6546726  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6546727 agcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 6546826  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
6546827 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 6546880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9355879 - 9355626
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
9355879 tcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 9355780  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9355779 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaat 9355680  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
9355679 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 9355626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 18797435 - 18797688
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
18797435 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 18797534  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18797535 atcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 18797634  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
18797635 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 18797688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 8861395 - 8861646
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
8861395 atcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcag 8861494  T
120 caattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| |||        |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
8861495 caactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcatgcattactagatgaaatactattgatcattaatca 8861594  T
212 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
8861595 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaacttttt 8861646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 37109980 - 37110234
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccta--ccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgata 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||    
37109980 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactaccacataata 37110079  T
116 tcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 207  Q
    ||| ||| ||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37110080 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 37110179  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
37110180 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 37110234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25691597 - 25691344
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
25691597 tcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatc 25691498  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
25691497 agcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 25691398  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
25691397 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttt 25691344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17842639 - 17842385
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccta--ccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgata 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| |||    
17842639 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataata 17842540  T
116 tcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 207  Q
    ||| ||| ||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
17842539 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcatta 17842440  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
17842439 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttt 17842385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 21991744 - 21991988
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
21991744 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 21991843  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    ||    
21991844 agcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca-----agatgaattactattgatc----at 21991934  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21991935 cattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacctttt 21991988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Original strand, 30055635 - 30055886
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
30055635 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 30055734  T
118 aacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||     |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30055735 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 30055834  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
30055835 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 30055886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 4583027 - 4583280
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
4583027 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 4583126  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
4583127 atcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaat 4583226  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
4583227 cagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttt 4583280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 32432560 - 32432813
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
32432560 tcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatc 32432659  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||  |||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
32432660 atcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattattattaatcatgaat 32432759  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
32432760 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttt 32432813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37703558 - 37703298
Alignment:
11 cataggatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||    
37703558 catagtatcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcaca 37703459  T
111 tgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 202  Q
    | |||||| ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
37703458 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgat 37703359  T
203 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
37703358 cattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 37703298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15672815 - 15672559
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
15672815 tcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 15672716  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaata---gtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 206  Q
    | ||| |||        |||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
15672715 atcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatg 15672616  T
207 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
15672615 catcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaatttttt 15672559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31579117 - 31578864
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
31579117 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 31579018  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | |        |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31579017 atcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 31578918  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
31578917 caataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaacttttt 31578864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5657534 - 5657280
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||    
5657534 tcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatc 5657435  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5657434 agcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 5657335  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt-aagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
5657334 gagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaacttttt 5657280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10359268 - 10359014
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaa-tctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |     
10359268 tcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacaa 10359169  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
10359168 catcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactaaatgatttactattgatcattaa 10359069  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
10359068 tcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaacttttt 10359014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Original strand, 27283854 - 27284100
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |     
27283854 atcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatattat 27283953  T
120 caattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| | ||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27283954 caactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 27284053  T
212 gtaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagattaaaattaa 257  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
27284054 gtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaa 27284100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32821106 - 32820853
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
32821106 tcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 32821007  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
32821006 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattcat 32820907  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
32820906 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 32820853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41765131 - 41764878
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
41765131 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 41765032  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
41765031 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaagcattactggatgaattattattgatcattaat 41764932  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
41764931 cagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaacctttt 41764878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 23111298 - 23111553
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat--cctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgata 115  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
23111298 tcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataata 23111397  T
116 tcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 207  Q
    ||| ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
23111398 tcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaagcattactagaagaattactattgatcataa 23111497  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
23111498 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttt 23111553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46481189 - 46480929
Alignment:
11 cataggatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||    
46481189 catagtatcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcaca 46481090  T
111 tgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 202  Q
    | ||||||  || | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
46481089 taatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgat 46480990  T
203 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
46480989 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaacttttt 46480929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 44598774 - 44599027
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
44598774 tcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatc 44598873  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
44598874 aacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaa--actattgatcattaat 44598971  T
210 c---agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |   | ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
44598972 caataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaatttttt 44599027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 24211849 - 24212103
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
24211849 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatc 24211948  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | ||| | |        |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
24211949 atcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 24212048  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
24212049 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 24212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Original strand, 11071314 - 11071546
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||    
11071314 tcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 11071413  T
118 aacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||     |||   |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11071414 atcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 11071510  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 245  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
11071511 cattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 11071546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 7334902 - 7335154
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| || |||||    
7334902 tcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacagagtgtaacacttaagattatcagataatatc 7335001  T
118 aacaattc-------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
    | ||| |        ||||||||||  | || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
7335002 atcaactagtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatc 7335101  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
7335102 agaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 7335154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 10481713 - 10481966
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
10481713 tcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 10481812  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||| ||        ||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
10481813 atcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcgttaat 10481912  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
10481913 cagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaacttttt 10481966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 12165860 - 12166074
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||    
12165860 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------cataatatc 12165950  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12165951 agcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 12166050  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
12166051 cagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 263
Target Start/End: Original strand, 35353256 - 35353469
Alignment:
58 taccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | |        |||||||||||||||||||||||    
35353256 taccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaat 35353355  T
150 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
35353356 agtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatc 35353455  T
250 aaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||    
35353456 aaaattaacttttt 35353469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33688315 - 33688117
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
33688315 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatc 33688216  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    | ||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
33688215 agcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 37347137 - 37347382
Alignment:
25 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 124  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| |    
37347137 attaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaact 37347235  T
125 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 216  Q
    |||||        ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
37347236 ctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaat 37347335  T
217 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
37347336 taacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttt 37347382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48928350 - 48928097
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  || || |||||| ||| |||||    
48928350 tcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatc 48928251  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
48928250 atcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 48928151  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||    
48928150 caacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttt 48928097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 43925211 - 43925456
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| || || ||||||| ||||||     
43925211 atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgtttaatacttaatacaatcacataatatcat 43925310  T
120 caattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
43925311 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatca 43925404  T
212 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43925405 ctaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 43925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 29173648 - 29173883
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||                 | || |||||||||| |||||    
29173648 tcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgttacac-----------------ttaagactatcacataatatc 29173730  T
118 aacaattctgtta-------aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
    | ||| ||||||        || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
29173731 atcaactctgtttgcatgttaaaatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgaatc 29173830  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29173831 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 29173883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 26980431 - 26980667
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 | || ||||||||||||||||    
26980431 tcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacatgatatc 26980513  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
26980514 agcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattattgttgatcattaat 26980613  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
26980614 cggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 26980667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 43686148 - 43686330
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
43686148 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 43686247  T
118 aacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 192  Q
    | |||         | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
43686248 atcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31520678 - 31520541
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
31520678 tgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaattt 31520579  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
31520578 aaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttt 31520541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12390586 - 12390450
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
12390586 tgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgacaattt 12390487  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
12390486 aaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaactttt 12390450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44411477 - 44411345
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
44411477 tgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgaccattaatcagtaatcaacaattt 44411378  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 258  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
44411377 aaaaatgaatgaaacattaagatcataattaac 44411345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 245
Target Start/End: Original strand, 37704406 - 37704525
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
37704406 tgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaattt 37704505  T
226 aaaaatgaatcaaacattaa 245  Q
    | ||||||||||||||||||    
37704506 acaaatgaatcaaacattaa 37704525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32593143 - 32593007
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
32593143 tgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagataaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattt 32593044  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
32593043 -aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaacttttt 32593007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34362115 - 34361976
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
34362115 tgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtcattaacaattt 34362016  T
226 aaaaatgaatcaaacatt-aaga-ttaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
34362015 aaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaacttttt 34361976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 38258653 - 38258816
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
38258653 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 38258752  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 173  Q
    | ||| |         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
38258753 atcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27421431 - 27421322
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||     
27421431 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcag 27421332  T
120 caattctgtt 129  Q
    ||| ||||||    
27421331 caactctgtt 27421322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Original strand, 37704267 - 37704376
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||     
37704267 atcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcat 37704366  T
120 caattctgtt 129  Q
    ||| ||||||    
37704367 caactctgtt 37704376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 263
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258940
Alignment:
190 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 38258940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44413432 - 44413353
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 97  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44413432 tcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 44413353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 48928617 - 48928517
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||  || || |||||| ||| |||||    
48928617 tcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatc 48928518  T
118 a 118  Q
    |    
48928517 a 48928517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12390683 - 12390622
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
12390683 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac 12390622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 31520770 - 31520716
Alignment:
25 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
31520770 attaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 31520716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Original strand, 38053586 - 38053647
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
38053586 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaacac 38053647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
145 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||    
27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaat 27421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 192
Target Start/End: Original strand, 38053685 - 38053751
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 192  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
38053685 tgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 32593242 - 32593181
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    ||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
32593242 tcatcagattatcaaaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 32593181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 263
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166250
Alignment:
228 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 12166250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 38644110 - 38644363
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
38644110 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatc 38644209  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38644210 agcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 38644309  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
38644310 cagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 38644363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5300004 - 5299751
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||    
5300004 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatc 5299905  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||||| ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
5299904 agcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaat 5299805  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
5299804 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttt 5299751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 11727156 - 11727409
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
11727156 tcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatc 11727255  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| | ||||        ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11727256 aacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 11727355  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
11727356 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttt 11727409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16446933 - 16446680
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
16446933 tcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatc 16446834  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16446833 atcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 16446734  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
16446733 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaacttttt 16446680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 67 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823199
Alignment:
67 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 24823296  T
167 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
24823295 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 24823199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37970571 - 37970324
Alignment:
24 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     
37970571 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 37970472  T
124 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 215  Q
    ||||||        ||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
37970471 tctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcagaaa 37970372  T
216 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
37970371 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 37970324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1149690 - 1149437
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||     
1149690 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 1149591  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1149590 atcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 1149491  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
1149490 cggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 1149437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27082896 - 27082643
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||    
27082896 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 27082797  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    |  || | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
27082796 ataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactacttatcattaat 27082697  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
27082696 caataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 27082643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 34895099 - 34895347
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||| |||||    
34895099 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatc 34895193  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
34895194 atcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaat 34895293  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
34895294 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 34895347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36695024 - 36694771
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
36695024 tcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 36694925  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
36694924 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaat 36694825  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
36694824 aagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttt 36694771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43643653 - 43643400
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||     
43643653 tcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 43643554  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43643553 atcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 43643454  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
43643453 cagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 43643400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 1205059 - 1205312
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
1205059 tcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 1205158  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
1205159 atcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcattaat 1205258  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
1205259 cactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttt 1205312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4132743 - 4132492
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
4132743 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcacataatatc 4132645  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4132644 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 4132545  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
      |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
4132544 ttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaactttt 4132492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6098576 - 6098320
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
6098576 tcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 6098477  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaata-----gtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 204  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||||||| ||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6098476 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 6098377  T
205 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttt 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
6098376 ttaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatgattaacttt 6098320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Original strand, 40862560 - 40862805
Alignment:
27 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat---caacaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||   |||| ||    
40862560 taacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactat 40862659  T
124 -----tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 218  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||     
40862660 gtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcg 40862759  T
219 acaattt-aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
40862760 acaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttt 40862805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 44869631 - 44869882
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
44869631 atcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatca 44869729  T
119 acaa------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
     |||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44869730 gcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 44869829  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
44869830 agtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 44869882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Original strand, 465974 - 466214
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||    
465974 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------cat-atatc 466063  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
466064 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 466163  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
466164 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 466214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 12876241 - 12876495
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
12876241 tcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatat 12876340  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
12876341 catcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaggcattactagatgaattactatttatcatgaa 12876440  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
12876441 taagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttt 12876495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7891015 - 7890762
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||    
7891015 tcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatc 7890916  T
118 aacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||        ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7890915 atcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 7890816  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
7890815 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaacttttt 7890762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 16222995 - 16223248
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||    
16222995 tcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatc 16223094  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16223095 atcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 16223194  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
16223195 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 16223248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39099177 - 39098924
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||    
39099177 tcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatc 39099078  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39099077 agcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 39098978  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
39098977 taataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaatttttt 39098924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8803873 - 8803621
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
8803873 atcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatcacataatatcat 8803774  T
120 caattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatc 210  Q
    ||| |||        |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
8803773 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatactattgatcattaatc 8803674  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
8803673 agtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 8803621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1954047 - 1953793
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||    
1954047 tcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacat 1953948  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
1953947 catcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaa 1953848  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
1953847 tcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 1953793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 33906344 - 33906595
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
33906344 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 33906443  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33906444 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 33906543  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
33906544 cagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaacttttt 33906595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 9864280 - 9864509
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
9864280 tcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 9864379  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||||| ||||        ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||    
9864380 atcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaataactagtaatcatgaat 9864479  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
9864480 cggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23854489 - 23854236
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||| |||||    
23854489 tcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacacttaagacaatcacataatatc 23854390  T
118 aacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||        ||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23854389 atcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 23854290  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
23854289 cagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 23854236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35459769 - 35459516
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| | | ||||||| || ||||| |||| |||||    
35459769 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccacagattataacacttaagactattacataatatc 35459670  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||||||||||        |||||| || || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
35459669 atcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 35459570  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
35459569 cagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 35459516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34951999 - 34951862
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34951999 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 34951900  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34951899 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 34951862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30654641 - 30654388
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
30654641 tcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 30654542  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    |  || |||        |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
30654541 ataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaatatattattgatcattaa 30654442  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
30654441 tcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaacttttt 30654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31933944 - 31933691
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
31933944 tcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatc 31933845  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        || |||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
31933844 atcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatgaattattattgatcattaat 31933745  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
31933744 cagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaatttttt 31933691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 12587830 - 12587967
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12587830 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaattt 12587929  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
12587930 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 12587967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 263
Target Start/End: Original strand, 18259229 - 18259464
Alignment:
32 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc------ 125  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||     ||||| ||||||| |||||           
18259229 agaatacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttg 18259324  T
126 --tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 223  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||    
18259325 catgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaacaat 18259424  T
224 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
18259425 ttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaacctttt 18259464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 35859182 - 35859319
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35859182 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaattt 35859281  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
35859282 aaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 35859319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 13307755 - 13307936
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
13307755 tcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 13307854  T
118 aacaattctgt-------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 192  Q
    ||||| |||||       | || |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
13307855 aacaactctgtttgcatgttaaaatgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaagcattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10555260 - 10555010
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||  |  ||||||||| |||||    
10555260 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcacaaaacgtaacacttga--ctatcacataatatc 10555163  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt--actattgatcatta 207  Q
    | ||| | ||||        ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
10555162 atcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattacactattgatcatta 10555063  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
10555062 ---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 10555010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 263
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198187
Alignment:
133 gatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 33198156  T
233 aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||    
33198157 aatcaatcattaagattaagattaacttttt 33198187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41911046 - 41910935
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
41911046 tcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaatactatcacatgatatc 41910947  T
118 aacaattctgtt 129  Q
    | ||| ||||||    
41910946 accaactctgtt 41910935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1149862 - 1149756
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1149862 tgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 1149763  T
226 aaaaatg 232  Q
    |||||||    
1149762 aaaaatg 1149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Original strand, 43025834 - 43025943
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
43025834 tcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatatc 43025933  T
118 aacaattctg 127  Q
    | ||| ||||    
43025934 atcaactctg 43025943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362807
Alignment:
179 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaatttttt 41362807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 178 - 263
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026059
Alignment:
178 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 43026059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1150163 - 1150090
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgt 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
1150163 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 7998427 - 7998488
Alignment:
19 catcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7998427 catcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 34952089 - 34952028
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
34952089 tcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 34463722 - 34463792
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
34463722 tgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 41362647 - 41362707
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 78  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
41362647 tcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 263
Target Start/End: Original strand, 13307931 - 13307964
Alignment:
230 atgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13307931 atgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 13307964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 111
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585341
Alignment:
67 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||    
12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacat 12585341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41910895 - 41910863
Alignment:
231 tgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
41910895 tgaatcaaacattcagattaaaattaacttttt 41910863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 33341531 - 33341784
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
33341531 tcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 33341630  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33341631 agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaat 33341730  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
33341731 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttt 33341784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 47253866 - 47254126
Alignment:
11 cataggatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
47253866 catagtatcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 47253965  T
111 tgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 202  Q
    |||||||| ||| ||||||        ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47253966 tgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 47254065  T
203 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
47254066 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 47254126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 7703635 - 7703895
Alignment:
11 cataggatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
7703635 catagtatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcaca 7703734  T
111 tgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 202  Q
    |||||||| ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
7703735 tgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttat 7703834  T
203 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7703835 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 7703895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30002711 - 30002466
Alignment:
17 atcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||    
30002711 atcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatat 30002621  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30002620 cagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 30002521  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30002520 tcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 30002466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34948175 - 34947923
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac--actcaaaactatcacatgata 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||    
34948175 tcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgata 34948076  T
116 tcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 207  Q
    ||||||| ||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
34948075 tcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaatactattgatcgtta 34947976  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34947975 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 34947923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28003064 - 28002811
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
28003064 tcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 28002965  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
28002964 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgctaacattactagatgaattactattgatcattaat 28002865  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
28002864 caacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 28002811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 37775800 - 37776044
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
37775800 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 37775890  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37775891 agcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 37775990  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
37775991 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttt 37776044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 55477969 - 55477716
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||    
55477969 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatc 55477870  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
55477869 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaat 55477770  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
55477769 cagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 55477716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 55241170 - 55240930
Alignment:
31 aagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt- 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||     
55241170 aagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgttt 55241071  T
130 -------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 222  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
55241070 gcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaa 55240971  T
223 tttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
55240970 tttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttt 55240930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37663819 - 37663568
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
37663819 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37663720  T
118 aacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||     |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37663719 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 37663620  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
37663619 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 37663568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 1815434 - 1815687
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
1815434 tcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 1815533  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
1815534 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattacaattgatcattaat 1815633  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1815634 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 1815687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 17167846 - 17168099
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
17167846 tcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 17167945  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
17167946 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcattaat 17168045  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
17168046 tagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaatttttt 17168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 17272097 - 17272350
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||    
17272097 tcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatc 17272196  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||| ||        |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17272197 agcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 17272296  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17272297 cggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 17272350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29584278 - 29584025
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||    
29584278 tcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatc 29584179  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29584178 agcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 29584079  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29584078 cagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 29584025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19089531 - 19089280
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
19089531 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19089432  T
118 aacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||     |||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19089431 atcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 19089332  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
19089331 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 19089280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 50764863 - 50765106
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
50764863 tcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac----------gtgtaacaccccacaaagtgaaacactcaatattatcacatgatatc 50764952  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50764953 agcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 50765052  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50765053 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 50765106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 17173423 - 17173676
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
17173423 tcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 17173522  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
17173523 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaat 17173622  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
17173623 aagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaatttttt 17173676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 23761205 - 23761457
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | || |||||| |||||||||    
23761205 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatc-taccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatc 23761303  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
23761304 agcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaat 23761403  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23761404 cagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 23761457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 25184246 - 25184499
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||     
25184246 tcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 25184345  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25184346 atcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 25184445  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
25184446 cagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 25184499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 3042752 - 3043005
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
3042752 tcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 3042851  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
3042852 atcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagatgaattagtattgattattaat 3042951  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
3042952 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 3043005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 27396749 - 27397000
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || || ||| |||||||||    
27396749 tcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatc 27396848  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||  |||||        |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27396849 agcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 27396948  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27396949 --gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 27397000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46888235 - 46887983
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||| |||||    
46888235 tcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacacttaga-ctatcacataatatc 46888137  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46888136 atcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaat 46888037  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
46888036 cactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaacttttt 46887983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32912656 - 32912404
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
32912656 atcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat 32912557  T
120 caattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatc 210  Q
    ||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
32912556 caactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatc 32912457  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
32912456 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaatttttt 32912404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35021113 - 35020856
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
35021113 tcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 35021014  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat----tgatcat 205  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||    
35021013 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattactatatattgatcat 35020914  T
206 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
35020913 taatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 35020856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 50697374 - 50697628
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
50697374 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatc 50697473  T
118 aacaattctgtt---------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    | ||| ||||||         ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50697474 atcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaa 50697573  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
50697574 ttagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaatttttt 50697628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 879626 - 879373
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |||||    
879626 tcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatcacataatatc 879527  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
879526 atcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaat 879427  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
879426 aagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 879373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19440726 - 19440473
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || ||   ||| |||| |||||    
19440726 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatc 19440627  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19440626 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 19440527  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
19440526 cagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 19440473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 37287858 - 37288115
Alignment:
17 atcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgat 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||    
37287858 atcataagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgat 37287957  T
115 atcaacaattctgtta--------aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 206  Q
    |||| ||| | ||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
37287958 atcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgagcatt 37288057  T
207 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-ttaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
37288058 aatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaacttttt 37288115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34361562 - 34361316
Alignment:
26 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 125  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||    
34361562 ttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactc 34361463  T
126 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 216  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
34361462 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 34361363  T
217 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
34361362 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 34361316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 32579579 - 32579832
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || || ||||||  || |||||    
32579579 tcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatc 32579678  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
32579679 atcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 32579778  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
32579779 cagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaatttttt 32579832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 32592226 - 32592470
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||| ||    
32592226 tcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcata---------tgatttc 32592316  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
32592317 agcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaattactattgatcgttaat 32592416  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32592417 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 32592470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 6864170 - 6864421
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||     
6864170 atcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcat 6864269  T
120 caattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| | ||||        ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6864270 caactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 6864369  T
212 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
6864370 ataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 6864421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 4598125 - 4598368
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
4598125 tcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 4598214  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
4598215 agcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaagcattattagattaattactattgatcattaat 4598314  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4598315 cagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacatttt 4598368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 49376100 - 49376353
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||    
49376100 tcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatc 49376199  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
49376200 atcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaaagcattactaaatgaattactattgatcattaat 49376299  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
49376300 cagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 49376353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36493759 - 36493514
Alignment:
25 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| |    
36493759 attaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaact 36493661  T
125 ctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 216  Q
    |||||        ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
36493660 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaat 36493561  T
217 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
36493560 taacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttt 36493514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33816609 - 33816341
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca-----------------caaagtgtaacactcaaaa 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||| || |    
33816609 atcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaaga 33816510  T
103 ctatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 194  Q
    ||||| ||| |||||| ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
33816509 ctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatta 33816410  T
195 ctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
33816409 ctattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 33816341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25701135 - 25700881
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||    
25701135 tcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacat 25701036  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| | ||||        ||||| ||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
25701035 catcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagattttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaa 25700936  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
25700935 tcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 25700881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 9139378 - 9139612
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |  | | | || |  |    
9139378 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagataaactc-tgtttgc 9139476  T
118 aacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 217  Q
    |       ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
9139477 a-------tgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagacgaattactattgatcattaatcaataatc 9139569  T
218 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
9139570 --taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 9139612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7152166 - 7152029
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
7152166 tgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt 7152067  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
7152066 aaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataacttttt 7152029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 39400257 - 39400394
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39400257 tgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatcattaatcagcaatcaacaattt 39400356  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39400357 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 39400394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5048043 - 5047791
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
5048043 tcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccg-caaaatgtaacacttaagactatcacatgatatc 5047945  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    |  || | ||||        ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
5047944 ataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagataaattattattgatcagtaat 5047845  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
5047844 caacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaatttttt 5047791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025392
Alignment:
139 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
239 acattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
35025415 acattaa-atcaaaattaacttttt 35025392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 42199862 - 42200116
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
42199862 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 42199961  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacat-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 207  Q
    |  || |||        |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
42199962 ataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactactgttcatta 42200061  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||||||    
42200062 atcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaa-aatcaaattaacttttt 42200116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 4205233 - 4205370
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
4205233 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataattt 4205332  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
4205333 aaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttt 4205370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431941
Alignment:
148 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaa 23431925  T
248 ttaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||    
23431926 ttaaaattaacttttt 23431941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883939
Alignment:
27 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 126  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| |    
46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaaa-ctatcacataatatcataaatttt 46884080  T
127 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 218  Q
    |||        ||| ||  ||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46884079 gtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 46883984  T
219 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
46883983 acaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaatttttt 46883939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4934280 - 4934040
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
4934280 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatc 4934181  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |         ||||||||||| ||||||||||||||||| |           |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
4934180 atcaactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaat 4934092  T
210 cagtaatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 260  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
4934091 cagtaatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaactt 4934040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Original strand, 26896346 - 26896474
Alignment:
137 tcaacgataaaatagtacatgtaagtcc-aagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26896346 tcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaaacattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 26896445  T
235 tcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||    
26896446 tcgaacattaaaatcaaaattaacttttt 26896474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 38011987 - 38012169
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || || |||||||||| |||||    
38011987 tcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatc 38012086  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 192  Q
    | ||| | |        |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
38012087 atcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 263
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012648
Alignment:
183 ctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 38012648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 54499316 - 54499217
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||    
54499316 tcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatgatat 54499217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 39398049 - 39398115
Alignment:
25 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
39398049 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35025675 - 35025574
Alignment:
17 atcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
35025675 atcatcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatat 35025576  T
117 ca 118  Q
    ||    
35025575 ca 35025574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 181
Target Start/End: Original strand, 56050179 - 56050234
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 181  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
56050179 tgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 12042 - 12294
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
12042 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatc 12141  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12142 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 12241  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
12242 cagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 12294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3879990 - 3879737
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
3879990 tcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 3879891  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
3879890 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgaat 3879791  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3879790 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 3879737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6091234 - 6090980
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatat 116  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
6091234 tcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatat 6091135  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6091134 catcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 6091035  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
6091034 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 6090980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4318874 - 4318626
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
4318874 tcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 4318775  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4318774 cagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 4318675  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaa 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
4318674 tcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaa 4318626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33893054 - 33892810
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
33893054 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 33892964  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
33892963 agcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattaat 33892864  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
33892863 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaacttttt 33892810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 20768217 - 20768468
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |  ||| ||| |||||    
20768217 tcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatc 20768314  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20768315 atcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 20768414  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
20768415 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaacttttt 20768468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 1945975 - 1946221
Alignment:
26 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    
1945975 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 1946074  T
126 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 216  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
1946075 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaagcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 1946174  T
217 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
1946175 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 1946221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21017163 - 21016916
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
21017163 tcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 21017064  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||| |||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
21017063 atcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaat 21016970  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
21016969 cagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaacttttt 21016916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 29182296 - 29182547
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
29182296 tcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 29182395  T
117 caacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
29182396 cagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattac---tgatcattaa 29182492  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
29182493 tcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaacttttt 29182547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7235086 - 7234830
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| ||| |||||    
7235086 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatc 7234987  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7234986 atcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 7234887  T
210 ---cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
       ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
7234886 caacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 7234830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 5627524 - 5627778
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
5627524 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatc 5627623  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | ||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
5627624 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaggtgaatatactattgatcattaa 5627723  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
5627724 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaatttttt 5627778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 8513366 - 8513607
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
8513366 tcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------caccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 8513459  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
8513460 cagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgcaagcattactagatgaattactattgatcat--- 8513556  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
8513557 ----taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 8513607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 33619080 - 33619219
Alignment:
127 gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta---atcagtaatcaacaat 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
33619080 gttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaat 33619179  T
224 ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
33619180 ttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaacttttt 33619219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 6089041 - 6089282
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||      ||| | |||| || ||||||| || |||||||||||||||    
6089041 tcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cactctacaaggtataacacttaagactatcacatgatat 6089134  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
6089135 cagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcat--- 6089231  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
6089232 ----taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaatttttt 6089282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Original strand, 15491748 - 15491859
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
15491748 tcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatc 15491847  T
118 aacaattctgtt 129  Q
    | ||||||||||    
15491848 agcaattctgtt 15491859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7054696 - 7054570
Alignment:
138 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatc 236  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
7054696 caacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaagatgaatc 7054597  T
237 aaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
7054596 aaacattaaaatcaaaattaacttttt 7054570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30353409 - 30353256
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
30353409 tcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 30353310  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 163  Q
    | ||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
30353309 agcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7055266 - 7055166
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
7055266 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 7055167  T
118 a 118  Q
    |    
7055166 a 7055166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
203 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 258  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 61
Target Start/End: Original strand, 33618967 - 33619010
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctacc 61  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
33618967 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc 33619010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 44891623 - 44891874
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
44891623 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcag 44891722  T
120 caattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 211  Q
    ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
44891723 caactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatca 44891822  T
212 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
44891823 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 44891874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22622770 - 22622517
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
22622770 tcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatc 22622671  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22622670 atcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 22622571  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
22622570 cagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 22622517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 33698277 - 33698530
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
33698277 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcatgatatc 33698376  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
      ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
33698377 ggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaat 33698476  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
33698477 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaacttttt 33698530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52040974 - 52040722
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||    
52040974 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatcacataatatc 52040875  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
52040874 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatgattattgatcattaat 52040775  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
52040774 gagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 52040722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 4015584 - 4015836
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||  ||||    
4015584 tcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatc 4015683  T
118 aacaattc-------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
    ||||| |        ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4015684 aacaacttgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 4015783  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4015784 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 4015836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7327534 - 7327281
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
7327534 tcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 7327435  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
7327434 aacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaat 7327335  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
7327334 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttt 7327281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 39282776 - 39283029
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
39282776 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 39282875  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |        ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
39282876 atcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaat 39282975  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
39282976 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 39283029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 32373594 - 32373846
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
32373594 tcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatc 32373693  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
32373694 agcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaat 32373793  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
32373794 cagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaacttttt 32373846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46297814 - 46297561
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
46297814 tcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46297715  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46297714 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 46297615  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
46297614 tagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 46297561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42506127 - 42505876
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
42506127 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 42506028  T
118 aacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||     |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42506027 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 42505928  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
42505927 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 42505876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26941312 - 26941059
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| || |||||    
26941312 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcataaagtgtaacacttaaaactatcatataatatc 26941213  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26941212 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 26941113  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
26941112 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaacttttt 26941059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24708169 - 24707914
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacactta--atctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgata 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
24708169 tcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataata 24708070  T
116 tcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 207  Q
    ||| ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
24708069 tcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaagcattattagataaattactattaatcatta 24707970  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
24707969 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 24707914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 53229204 - 53228952
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||    
53229204 tcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatc 53229105  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
53229104 atcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaat 53229005  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
53229004 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 53228952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 2008057 - 2008316
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
2008057 tcatcagattaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 2008155  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
2008156 agcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaat 2008255  T
210 cag-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2008256 cagtaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 2008316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33378837 - 33378584
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||| ||| || ||    
33378837 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctc 33378738  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
33378737 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 33378638  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
33378637 caataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttt 33378584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 37157836 - 37158085
Alignment:
23 agattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||    
37157836 agattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaa 37157935  T
123 ttct---------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 213  Q
     | |         |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
37157936 atattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagt 37158035  T
214 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
37158036 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 37158085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 1089819 - 1090070
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 118  Q
    ||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
1089819 atcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatca 1089918  T
119 acaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 210  Q
    |||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1089919 acaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc 1090017  T
211 agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
1090018 aataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 1090070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 34133059 - 34133288
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
34133059 tcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 34133158  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||||| ||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
34133159 atcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactagtaatcatgaat 34133258  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
34133259 cggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 37203191 - 37203445
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
37203191 tcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37203290  T
118 aacaattct---------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    | ||| | |         |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37203291 atcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaa 37203390  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
37203391 tgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 37203445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14586722 - 14586479
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |         |||||||    
14586722 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcgta---------tgatatc 14586632  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| | ||||        ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
14586631 aacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatcattaat 14586533  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
14586532 cagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaatttttt 14586479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 48355065 - 48355318
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
48355065 tcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 48355164  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
48355165 atcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaat 48355264  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
48355265 cagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 48355318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 25579868 - 25580116
Alignment:
23 agattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
25579868 agattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaa 25579967  T
123 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 214  Q
     ||||||        ||||||| |||||||||||  |||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
25579968 ctctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatccgca 25580067  T
215 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
25580068 atcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttttt 25580116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 3362385 - 3362631
Alignment:
26 ttaacaagaatacact--taatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 123  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||     
3362385 ttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaac 3362484  T
124 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 215  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3362485 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggatgaattactattgatcattaatcagtaa 3362584  T
216 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
3362585 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 3362631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 21193730 - 21193984
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||    
21193730 tcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaaggataacacttaaagactatcatatgatat 21193829  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
21193830 cagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccattactaaatgaattactattgattattaa 21193929  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21193930 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 21193984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 22451092 - 22451345
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||  || |||||    
22451092 tcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatc 22451191  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22451192 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaat 22451291  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
22451292 cagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 22451345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 36012261 - 36012517
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
36012261 tcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacacttaagactatcaaatgatat 36012360  T
117 caacaattct---------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 207  Q
    || ||| |||         |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36012361 cagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 36012460  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaa-ttaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
36012461 atcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaacttttt 36012517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40552311 - 40552058
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |  | | |||||| |||||    
40552311 tcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccacaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatc 40552212  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
40552211 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaat 40552112  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
40552111 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 40552058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 29099479 - 29099723
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||    
29099479 tcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac---------tttcacatgatatc 29099569  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
29099570 agcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaat 29099669  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
29099670 cagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaacttttt 29099723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 29163942 - 29164179
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
29163942 tcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 29164032  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
29164033 agcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcat---- 29164128  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
29164129 ---taatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 29164179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3655254 - 3654998
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
3655254 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatc 3655155  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat--gaattactattgatcatta 207  Q
    | ||  ||||||        ||||||  || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
3655154 atcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatatgaattactattgattatta 3655055  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
3655054 atcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacatttt 3654998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24489014 - 24488761
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||  |||||    
24489014 tcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatc 24488915  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||        |||||||||| |||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
24488914 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgcattactattaatcatgaat 24488815  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
24488814 caataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaacttttt 24488761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44186553 - 44186316
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                |||||||||||||||    
44186553 tcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaa----------------ctatcacatgatatc 44186470  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| ||||||        ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
44186469 aacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaat 44186370  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
44186369 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacatttt 44186316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 47481654 - 47481900
Alignment:
26 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || ||    
47481654 ttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactc 47481753  T
126 tgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 216  Q
    | ||        |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
47481754 tatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 47481853  T
217 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
47481854 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 47481900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21009854 - 21009600
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
21009854 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 21009755  T
118 aacaa-------ttc-tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | |||       | | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
21009754 atcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 21009655  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
21009654 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 21009600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46994707 - 46994490
Alignment:
24 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaat 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
46994707 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaat 46994608  T
124 tctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa 215  Q
    | ||||        ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
46994607 tatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaa 46994508  T
216 tcaacaatttaaaaatga 233  Q
    ||||||||||||||||||    
46994507 tcaacaatttaaaaatga 46994490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11357317 - 11357181
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11357317 tgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 11357218  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
11357217 aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 11357181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 11466948 - 11467187
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
11466948 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 11467047  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| ||        |||| |||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||        
11467048 aacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgcaa-------tagatgaattactattgatcat---- 11467136  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
11467137 ---taatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaacttttt 11467187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22446116 - 22445865
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||| || |||||    
22446116 tcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacactc-acaatgtataacactcaagactatcatataatatc 22446018  T
118 aacaa----ttctg----ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||    || ||    ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
22446017 atcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatgaattactattgatcattaat 22445918  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
22445917 cagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 22445865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4761701 - 4761447
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| ||||    
4761701 tcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacccccacaaagtataacacttaagactatcacataatat 4761602  T
117 caacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| | |        |||||||||  | || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
4761601 catcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaacattaccagatgaattactattaatcattaa 4761502  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
4761501 tcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 4761447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 54505939 - 54506185
Alignment:
26 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | | |     
54505939 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatctactt 54506038  T
126 t--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaat 216  Q
    |        |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
54506039 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaat 54506138  T
217 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
54506139 caacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 54506185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 43348381 - 43348563
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
43348381 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatc 43348480  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 192  Q
    ||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
43348481 aacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 38591822 - 38592051
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||||||| |||||    
38591822 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatc 38591921  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||| ||        ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||    
38591922 atcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaat 38592021  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
38592022 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 38592051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43975940 - 43975691
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||| ||| |||||    
43975940 tcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacact-------atcgcataatatc 43975848  T
118 aacaattctgtt-----------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 206  Q
    | ||| | ||||           ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
43975847 atcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatt 43975748  T
207 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
43975747 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaatttttt 43975691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54828753 - 54828546
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
54828753 tcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatc 54828654  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
54828653 atcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaat 54828554  T
210 cagtaatc 217  Q
    ||||||||    
54828553 cagtaatc 54828546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 40936213 - 40936350
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
40936213 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaatcggtaatcaacaattt 40936312  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
40936313 aaaaataaatcaatcattaagattgaaattaacttttt 40936350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 45174629 - 45174821
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| | |||||||    
45174629 tcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactctacaaagtgtaacacttaagactataatatgatat 45174728  T
117 caacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 201  Q
    || ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45174729 cagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 45174821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11835678 - 11835494
Alignment:
20 atcagattaacaagaatacacttaatctaat-tttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 118  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
11835678 atcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaagactatcacatgatatca 11835579  T
119 acaattctgtta--aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 201  Q
     ||| ||| ||   | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
11835578 tcaactctatttgcatgatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattga 11835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Original strand, 50475053 - 50475195
Alignment:
128 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg-------atcattaatcagtaatcaac 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||     
50475053 ttaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcattaatcagtaatcaat 50475152  T
221 aatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
50475153 aatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaattttt 50475195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51212707 - 51212576
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
51212707 tgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattaaaaatcaacaattt 51212608  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||      |||||||| ||||||||||||||    
51212607 aaaaatgaa------attaagatcaaaattaacttttt 51212576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356957
Alignment:
80 cccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||        ||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgt 11357041  T
172 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
11357040 tgcaagcatta--------attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaacttttt 11356957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27480298 - 27480164
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg----caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
27480298 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaaca 27480199  T
222 atttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
27480198 atttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaatta 27480164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373062
Alignment:
51 tttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacg 142  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||        ||||||  |||||    
20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
143 ataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20373163 ataaaatagtacatataagtccaagatg-------------------aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 20373083  T
243 taagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| || ||||||||||||||    
20373082 taaaatcaaaattaacttttt 20373062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 35844450 - 35844550
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||    
35844450 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatat 35844548  T
117 ca 118  Q
    ||    
35844549 ca 35844550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 51213033 - 51212955
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
51213033 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 53176178 - 53176278
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
53176178 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 53176277  T
118 a 118  Q
    |    
53176278 a 53176278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 11357416 - 11357355
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 79  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11357416 tcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 11357355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27480431 - 27480368
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 81  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27480431 tcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccc 27480368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53811670 - 53811597
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
53811670 tgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatgaattactatt 53811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20373348 - 20373300
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 66  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
20373348 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 263
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844624
Alignment:
216 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 35844624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 57
Target Start/End: Original strand, 40936115 - 40936154
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcc 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
40936115 tcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatcc 40936154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 263
Target Start/End: Original strand, 43348556 - 43348591
Alignment:
228 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
43348556 aaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 43348591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33709299 - 33709049
Alignment:
21 tcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |    
33709299 tcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagc 33709200  T
121 aattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 212  Q
    || ||||||        ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
33709199 aactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcat 33709100  T
213 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
33709099 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 33709049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 4167055 - 4167308
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
4167055 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 4167154  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
4167155 atcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaat 4167254  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
4167255 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttt 4167308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 41960973 - 41961226
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||    
41960973 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 41961072  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41961073 atcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 41961172  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
41961173 caataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 41961226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18494350 - 18494098
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
18494350 tcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctcacaaagagtcacacttaagactatcacatgatatc 18494252  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||| | ||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18494251 aacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattgctattgatcattaat 18494152  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18494151 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 18494098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2325455 - 2325195
Alignment:
11 cataggatcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 110  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
2325455 catagtatcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 2325356  T
111 tgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 202  Q
    | |||||| ||| | ||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2325355 taatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 2325256  T
203 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
2325255 tattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 2325195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 44913796 - 44914053
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
44913796 tcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 44913895  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga---tgaattactattgatcat 205  Q
    || ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||    
44913896 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagaaaatgaattactattaatcat 44913995  T
206 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44913996 gaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 44914053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 4763764 - 4764017
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
4763764 tcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 4763863  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||||||        ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
4763864 atcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagttgaattactattgatcattaat 4763963  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
4763964 cagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 4764017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31570804 - 31570551
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||    
31570804 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatc 31570705  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
31570704 aacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattgctagatgaattactattgatcattaat 31570605  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
31570604 cagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaacttttt 31570551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43648315 - 43648062
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
43648315 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatc 43648216  T
118 aacaa------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||      |||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
43648215 atcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 43648116  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
43648115 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 43648062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19424698 - 19424459
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
19424698 tcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatc 19424599  T
118 aacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 217  Q
    | ||| ||||||    |||| || ||||     |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19424598 agcaactctgtttgc-atgttaaagata-----gtacctgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 19424505  T
218 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
19424504 aacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttt 19424459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 26357710 - 26357963
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||     
26357710 tcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaaaactatcacataatatt 26357809  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26357810 atcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 26357909  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
26357910 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 26357963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 3177072 - 3177325
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
3177072 tcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 3177171  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
3177172 atcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatattacaagcattactagatgaattactatttatcatgaat 3177271  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
3177272 aagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttt 3177325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 5881672 - 5881915
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         |||||||||    
5881672 tcatcatattaacaagaatacatttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaatacctcacaaagtgtaacactca---------catgatatc 5881761  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||||| ||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5881762 aacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattatt 5881861  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5881862 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 5881915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33660438 - 33660194
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||||||    
33660438 tcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacaccca---------catgatatc 33660348  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33660347 agcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 33660248  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
33660247 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 33660194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11366451 - 11366197
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
11366451 tcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 11366352  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | ||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
11366351 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 11366252  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11366251 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttt 11366197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 41465634 - 41465887
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
41465634 tcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 41465733  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||||| ||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
41465734 atcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaat 41465833  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
41465834 cagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaacttttt 41465887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29242208 - 29241963
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
29242208 tcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatc 29242109  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||        |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
29242108 atcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat-------gaattactagatgaattactattgaacattaat 29242016  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
29242015 cagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttt 29241963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39167433 - 39167186
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||| |||||    
39167433 tcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaaca------actatcacataatatc 39167340  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||    
39167339 atcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgctagcattactagatgaattactattaattatgaat 39167240  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
39167239 cagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaacttttt 39167186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19289393 - 19289140
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
19289393 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19289294  T
118 aacaattctgt--------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||||        |||||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19289293 atcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 19289194  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
19289193 cagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 19289140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 35959030 - 35959278
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||    
35959030 tcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcacataatatc 35959128  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35959129 atcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 35959224  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
35959225 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 35959278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27350009 - 27349789
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
27350009 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactca---------catgatatc 27349919  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    |  || ||||||        ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27349918 aggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 27349819  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
27349818 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 27349789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 37905841 - 37906097
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc--acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
37905841 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataata 37905940  T
116 tcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 207  Q
    |||  || ||||||        ||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
37905941 tcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaattactattgatcatta 37906040  T
208 atcagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
37906041 atcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 37906097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43770909 - 43770665
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||    
43770909 tcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactca---------catgatatc 43770819  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
43770818 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaat 43770719  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43770718 tagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 43770665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4264147 - 4263926
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatca-catgatat 116  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
4264147 tcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatat 4264048  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
4264047 cagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattga 4263948  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||    
4263947 tcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 31861985 - 31862238
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
31861985 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatc 31862084  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        || |||  | || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
31862085 atcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattactagatgaattactattgatcattaat 31862184  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
31862185 cagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaacttttt 31862238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33551056 - 33550800
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  || |||||    
33551056 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatc 33550958  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga----tcat 205  Q
    | ||| | ||||        |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | ||    
33550957 atcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaataactattgattatttat 33550858  T
206 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
33550857 taaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 33550800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7006986 - 7006755
Alignment:
23 agattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                 || || | ||||||||||||||| |||    
7006986 agattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagaatatcacatgatatcagcaa 7006904  T
123 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 214  Q
     ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
7006903 ctctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagta 7006804  T
215 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
7006803 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaattaacttttt 7006755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 4478502 - 4478717
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
4478502 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac-----aaagtgtaacacttaagtctatcacatgatat 4478596  T
117 caacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| ||||||        ||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
4478597 caccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaa 4478696  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
4478697 tcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 44286082 - 44286285
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
44286082 tcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 44286181  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    ||||| |         ||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
44286182 aacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaat 44286281  T
210 cagt 213  Q
    ||||    
44286282 cagt 44286285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 13711597 - 13711845
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | || ||||| ||||||||||    
13711597 tcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcat-----gttttaagtgtaacaccccataaagtataatagttaagactatgacatgatatc 13711691  T
118 aacaattctgt--------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| |||||        |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
13711692 agcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaaacaatactagatgaattactattgatcattaat 13711791  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||    
13711792 cagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaatttttt 13711845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 19313984 - 19314186
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
19313984 tcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac-------actatcacatgatatc 19314076  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg---taagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 206  Q
    | ||| |         |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19314077 agcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 19314176  T
207 aatcagtaat 216  Q
    ||||||||||    
19314177 aatcagtaat 19314186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19500869 - 19500739
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19500869 tgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 19500770  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaatta 256  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||    
19500769 aaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatta 19500739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Original strand, 45327853 - 45328025
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| ||| |||||    
45327853 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatc 45327952  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 182  Q
    |  || |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45327953 ataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Original strand, 36642119 - 36642293
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt--atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgata 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
36642119 tcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgata 36642218  T
116 tcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 182  Q
     || ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
36642219 ccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaagcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41051238 - 41051117
Alignment:
142 gataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 241  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
41051238 gataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatcaacaattcaaaaatgaatcaaaca 41051139  T
242 ttaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
41051138 ttaaaattaaaattaatttttt 41051117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17071807 - 17071646
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
17071807 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 17071708  T
118 aacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 171  Q
    | ||| |         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
17071707 atcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17054166 - 17054066
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
17054166 tcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatcacataatatc 17054067  T
118 a 118  Q
    |    
17054066 a 17054066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41463512 - 41463407
Alignment:
158 taagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaa 257  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
41463512 taagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaa 41463413  T
258 cttttt 263  Q
    ||||||    
41463412 cttttt 41463407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258257
Alignment:
26 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatca 18258257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257355
Alignment:
165 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaacttttt 18257355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902400
Alignment:
180 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 33902400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 33902199 - 33902299
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||    
33902199 tcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccacaaagtgtaacacttaatagtatcacataatatc 33902298  T
118 a 118  Q
    |    
33902299 a 33902299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 41463920 - 41463779
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||    
41463920 tcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatc 41463821  T
118 aacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatag 151  Q
    ||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||    
41463820 aacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328076
Alignment:
215 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 45328076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053963
Alignment:
206 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagat 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagat 17053963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071604
Alignment:
206 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagat 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagat 17071604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4263756 - 4263726
Alignment:
233 aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
4263756 aatcaaacattaagattaaaattaacttttt 4263726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 408481 - 408228
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||  |||||    
408481 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatc 408382  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
408381 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 408282  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
408281 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaatttttt 408228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 267 - 514
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
267 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 366  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| ||||||        ||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
367 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaat 460  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
461 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 94036 - 93900
Alignment:
126 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
94036 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcactaatcaacaattt 93937  T
226 aaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
93936 -aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 93900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 94435 - 94330
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||    
94435 tcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataatatc 94336  T
118 aacaat 123  Q
    | ||||    
94335 atcaat 94330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Original strand, 8020 - 8271
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
8020 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 8119  T
118 aacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | |||     |||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8120 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 8219  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
8220 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaacttt 8271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 44090 - 44342
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
44090 tcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatc 44188  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
44189 atcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaat 44288  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||    
44289 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaacttttt 44342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 154697 - 154445
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
154697 tcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatc 154599  T
118 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 209  Q
    | ||| | ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
154598 atcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaat 154499  T
210 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||    
154498 cagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaacttttt 154445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 146068 - 145814
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
146068 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 145969  T
118 aacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 208  Q
    | ||| |||        |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
145968 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaatatacaattgatcattaa 145869  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
145868 tcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaacttttt 145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 267417 - 267662
Alignment:
18 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatat 116  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
267417 tcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatat 267516  T
117 caacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 208  Q
    || ||| |         ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||         |  ||    
267517 catcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaattactagatgaatta---------accaa 267607  T
209 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
267608 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaatttttt 267662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 100993 - 101058
Alignment:
155 atgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
100993 atgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta--gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100935
Alignment:
29 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 70  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 100935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University