View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4782_low_5 (Length: 253)

Name: NF4782_low_5
Description: NF4782
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4782_low_5
NF4782_low_5
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (100-243)||(27216860-27217003)
chr7 (100-243)||(456321-456464)
chr7 (100-243)||(11972496-11972639)
chr7 (100-243)||(14949141-14949284)
chr7 (100-243)||(15376732-15376875)
chr7 (100-243)||(16232520-16232663)
chr7 (100-243)||(18640272-18640415)
chr7 (100-243)||(20385142-20385285)
chr7 (100-243)||(21189614-21189757)
chr7 (100-243)||(32125491-32125634)
chr7 (100-243)||(41522917-41523060)
chr7 (100-243)||(41525379-41525522)
chr7 (100-242)||(11393306-11393448)
chr7 (101-243)||(16410059-16410201)
chr7 (100-246)||(18430709-18430855)
chr7 (100-243)||(24702238-24702381)
chr7 (100-239)||(24275175-24275314)
chr7 (101-243)||(3386333-3386475)
chr7 (100-243)||(24704688-24704828)
chr7 (100-243)||(16213684-16213827)
chr7 (100-243)||(44116509-44116652)
chr7 (100-243)||(17061934-17062077)
chr7 (100-243)||(3564338-3564482)
chr7 (100-246)||(13647325-13647472)
chr7 (100-243)||(20110556-20110689)
chr7 (100-239)||(38898395-38898535)
chr7 (124-243)||(48273392-48273512)
chr7 (118-243)||(13869346-13869472)
chr7 (100-207)||(12756690-12756797)
chr7 (117-243)||(13831373-13831499)
chr7 (100-246)||(12698831-12698979)
chr7 (100-243)||(18456387-18456530)
chr7 (100-243)||(26356002-26356156)
chr7 (100-243)||(26358454-26358608)
chr7 (100-246)||(9509189-9509336)
chr7 (100-246)||(38227481-38227627)
chr7 (118-246)||(26211995-26212125)
chr7 (128-246)||(10589039-10589158)
chr7 (100-231)||(15144012-15144143)
chr7 (125-246)||(22072913-22073036)
chr7 (101-246)||(2280094-2280238)
chr7 (193-246)||(67745-67798)
chr7 (193-246)||(47831807-47831860)
chr7 (118-246)||(16386239-16386369)
chr7 (193-242)||(14932802-14932851)
chr7 (193-242)||(15356237-15356286)
chr7 (193-242)||(15360351-15360400)
chr7 (193-246)||(28505366-28505419)
chr7 (193-246)||(34200786-34200839)
chr7 (101-159)||(15113031-15113088)
chr7 (193-242)||(811199-811248)
chr7 (188-245)||(2832504-2832561)
chr7 (193-246)||(11996095-11996148)
chr7 (193-246)||(15754955-15755008)
chr7 (193-246)||(16495402-16495455)
chr7 (193-242)||(18005650-18005699)
chr7 (104-165)||(19486722-19486783)
chr7 (193-242)||(44014182-44014231)
chr7 (101-165)||(12255766-12255830)
chr7 (106-165)||(10063798-10063857)
chr7 (101-159)||(15116568-15116625)
chr7 (186-240)||(18154902-18154956)
chr7 (188-242)||(19649552-19649606)
chr7 (193-242)||(9703263-9703312)
chr7 (186-218)||(9446219-9446251)
chr7 (186-242)||(12187019-12187075)
chr7 (186-242)||(17138121-17138177)
chr7 (186-218)||(20569657-20569689)
chr7 (188-220)||(26292414-26292446)
chr7 (188-220)||(39722285-39722317)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (100-243)||(42245384-42245527)
chr5 (100-243)||(264787-264930)
chr5 (100-243)||(10732959-10733102)
chr5 (100-243)||(39363384-39363527)
chr5 (100-243)||(20909012-20909155)
chr5 (100-243)||(29329934-29330077)
chr5 (100-243)||(29345980-29346123)
chr5 (100-243)||(32027393-32027536)
chr5 (100-243)||(39245136-39245279)
chr5 (100-243)||(11581218-11581361)
chr5 (100-243)||(29348453-29348596)
chr5 (100-243)||(29350926-29351069)
chr5 (100-243)||(36154802-36154942)
chr5 (100-243)||(2154632-2154776)
chr5 (100-240)||(18319052-18319193)
chr5 (100-243)||(20902027-20902172)
chr5 (102-243)||(20917973-20918110)
chr5 (100-243)||(10775694-10775838)
chr5 (100-243)||(31061068-31061212)
chr5 (110-243)||(38619434-38619568)
chr5 (100-240)||(24067110-24067251)
chr5 (110-242)||(23064512-23064645)
chr5 (100-246)||(23390470-23390617)
chr5 (100-246)||(9077952-9078099)
chr5 (100-246)||(25421532-25421679)
chr5 (121-243)||(24529223-24529346)
chr5 (118-246)||(21729056-21729185)
chr5 (118-246)||(21808381-21808510)
chr5 (139-246)||(21997547-21997655)
chr5 (100-246)||(1096467-1096614)
chr5 (101-243)||(22412187-22412329)
chr5 (104-246)||(24493569-24493711)
chr5 (100-246)||(25431395-25431541)
chr5 (128-246)||(8286844-8286964)
chr5 (100-246)||(13025311-13025457)
chr5 (100-246)||(13095495-13095641)
chr5 (101-184)||(20766095-20766177)
chr5 (118-246)||(22075018-22075148)
chr5 (193-246)||(21329565-21329618)
chr5 (189-243)||(20806850-20806904)
chr5 (200-246)||(21502231-21502277)
chr5 (193-246)||(19660903-19660956)
chr5 (100-165)||(40725935-40726000)
chr5 (188-244)||(17517264-17517320)
chr5 (186-246)||(21293030-21293090)
chr5 (193-242)||(21565546-21565595)
chr5 (100-165)||(22144131-22144196)
chr5 (193-242)||(22959600-22959649)
chr5 (193-246)||(36314577-36314630)
chr5 (148-236)||(18418590-18418678)
chr5 (188-242)||(14079149-14079203)
chr5 (188-218)||(26680606-26680636)
chr5 (188-242)||(26704075-26704129)
chr5 (188-218)||(26952213-26952243)
chr5 (188-242)||(26973808-26973862)
chr5 (193-246)||(19668898-19668951)
chr5 (186-242)||(22032323-22032379)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (100-243)||(16454300-16454443)
chr3 (100-243)||(17463178-17463321)
chr3 (100-243)||(28848630-28848773)
chr3 (100-243)||(34159326-34159469)
chr3 (100-243)||(45606926-45607069)
chr3 (100-243)||(55476491-55476634)
chr3 (100-243)||(7781366-7781509)
chr3 (100-243)||(8899094-8899237)
chr3 (100-243)||(29172602-29172745)
chr3 (100-243)||(38961910-38962053)
chr3 (100-243)||(13151809-13151953)
chr3 (100-243)||(13154274-13154418)
chr3 (100-243)||(6469153-6469296)
chr3 (100-243)||(9707626-9707769)
chr3 (100-243)||(10247742-10247885)
chr3 (100-241)||(16282830-16282971)
chr3 (100-243)||(17446674-17446816)
chr3 (100-244)||(13544024-13544168)
chr3 (100-239)||(12567564-12567703)
chr3 (100-241)||(41123892-41124030)
chr3 (112-243)||(15977515-15977646)
chr3 (100-243)||(17672626-17672769)
chr3 (100-243)||(50242822-50242965)
chr3 (130-243)||(55500942-55501055)
chr3 (100-227)||(53070672-53070799)
chr3 (110-243)||(12119753-12119887)
chr3 (110-243)||(15412429-15412563)
chr3 (101-243)||(36166598-36166739)
chr3 (100-246)||(14972854-14973001)
chr3 (100-243)||(40213695-40213838)
chr3 (101-243)||(21618449-21618590)
chr3 (100-246)||(25476359-25476506)
chr3 (110-243)||(8499518-8499652)
chr3 (100-246)||(17487856-17488003)
chr3 (100-246)||(17499338-17499485)
chr3 (100-246)||(43550497-43550644)
chr3 (125-243)||(10556985-10557104)
chr3 (128-246)||(18438534-18438653)
chr3 (100-246)||(43840932-43841079)
chr3 (118-246)||(12399209-12399338)
chr3 (118-246)||(23083353-23083482)
chr3 (100-246)||(13442274-13442421)
chr3 (100-246)||(20698409-20698556)
chr3 (100-246)||(26686887-26687034)
chr3 (144-243)||(44494809-44494908)
chr3 (100-232)||(14576807-14576939)
chr3 (100-228)||(42386428-42386557)
chr3 (100-243)||(24153183-24153326)
chr3 (100-232)||(14572603-14572735)
chr3 (145-243)||(17737236-17737337)
chr3 (103-243)||(53301527-53301669)
chr3 (103-243)||(27165250-27165391)
chr3 (100-246)||(11424737-11424880)
chr3 (190-243)||(45577947-45578000)
chr3 (102-228)||(23274705-23274832)
chr3 (193-243)||(28194693-28194743)
chr3 (100-165)||(24340697-24340762)
chr3 (188-244)||(46822267-46822323)
chr3 (100-165)||(2051173-2051238)
chr3 (193-246)||(13210395-13210448)
chr3 (193-246)||(14234487-14234540)
chr3 (100-165)||(22147499-22147564)
chr3 (100-165)||(37642239-37642304)
chr3 (188-244)||(12511059-12511115)
chr3 (186-245)||(14665398-14665457)
chr3 (100-227)||(52523701-52523831)
chr3 (193-242)||(12038019-12038068)
chr3 (193-242)||(12174327-12174376)
chr3 (188-245)||(14668554-14668611)
chr3 (193-242)||(16097332-16097381)
chr3 (186-242)||(856140-856196)
chr3 (186-242)||(23077538-23077594)
chr3 (186-246)||(15470927-15470985)
chr3 (193-232)||(32307691-32307730)
chr3 (188-218)||(3389999-3390029)
chr3 (188-242)||(15878114-15878168)
chr3 (148-245)||(30029841-30029939)
chr3 (186-242)||(16103784-16103841)
chr3 (193-242)||(49668144-49668193)
chr3 (188-220)||(15617396-15617428)
chr3 (194-242)||(26196500-26196548)
chr3 (188-220)||(30065968-30066000)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (100-243)||(6725995-6726138)
chr2 (100-243)||(18808943-18809086)
chr2 (100-243)||(23130862-23131005)
chr2 (100-243)||(23133329-23133472)
chr2 (100-243)||(23135590-23135733)
chr2 (100-243)||(23709551-23709694)
chr2 (100-243)||(23712032-23712175)
chr2 (100-243)||(26505379-26505522)
chr2 (100-243)||(26507857-26508000)
chr2 (100-243)||(34402541-34402684)
chr2 (100-243)||(39682313-39682456)
chr2 (100-243)||(571397-571540)
chr2 (100-243)||(24367774-24367917)
chr2 (100-240)||(21155079-21155219)
chr2 (100-243)||(24898214-24898358)
chr2 (100-243)||(24900697-24900841)
chr2 (100-243)||(24903174-24903318)
chr2 (100-243)||(24905651-24905795)
chr2 (100-243)||(24908126-24908270)
chr2 (100-243)||(28577099-28577242)
chr2 (100-243)||(32039517-32039660)
chr2 (100-245)||(32214940-32215085)
chr2 (100-243)||(45029873-45030016)
chr2 (100-243)||(22105412-22105556)
chr2 (100-243)||(38967374-38967518)
chr2 (100-241)||(43137301-43137442)
chr2 (100-243)||(24529547-24529691)
chr2 (100-246)||(22337115-22337262)
chr2 (100-246)||(23060513-23060660)
chr2 (100-246)||(23076442-23076589)
chr2 (100-246)||(22738154-22738300)
chr2 (100-246)||(22731208-22731355)
chr2 (118-243)||(298806-298933)
chr2 (100-246)||(23660023-23660169)
chr2 (169-240)||(24643038-24643109)
chr2 (100-246)||(23285865-23286008)
chr2 (147-246)||(38136-38235)
chr2 (100-158)||(24642875-24642933)
chr2 (186-246)||(23040250-23040310)
chr2 (100-246)||(23654360-23654507)
chr2 (104-246)||(23103375-23103516)
chr2 (125-241)||(28405981-28406099)
chr2 (186-246)||(8946657-8946717)
chr2 (100-246)||(19671830-19671976)
chr2 (100-165)||(7707-7772)
chr2 (193-242)||(7679589-7679638)
chr2 (100-151)||(22459536-22459587)
chr2 (188-239)||(25616192-25616243)
chr2 (193-246)||(20309108-20309161)
chr2 (100-246)||(23708593-23708738)
chr2 (186-245)||(22134267-22134326)
chr2 (195-246)||(23072019-23072070)
chr2 (100-174)||(32451902-32451976)
chr2 (193-231)||(18786971-18787009)
chr2 (188-218)||(24869904-24869934)
chr2 (188-218)||(25961597-25961627)
chr2 (188-220)||(10101700-10101732)
chr2 (186-218)||(24655399-24655431)
chr2 (188-220)||(27379488-27379520)
chr2 (188-220)||(27383534-27383566)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (100-243)||(21475106-21475249)
chr1 (100-243)||(13988866-13989009)
chr1 (100-243)||(21923310-21923453)
chr1 (100-243)||(23593754-23593897)
chr1 (100-243)||(29776688-29776831)
chr1 (100-243)||(31612313-31612456)
chr1 (100-243)||(29298137-29298279)
chr1 (100-244)||(21840766-21840910)
chr1 (100-245)||(16361915-16362060)
chr1 (100-243)||(22123086-22123230)
chr1 (100-246)||(13212880-13213027)
chr1 (100-243)||(21707167-21707310)
chr1 (100-243)||(21711709-21711852)
chr1 (100-243)||(433012-433153)
chr1 (100-249)||(21342090-21342240)
chr1 (100-240)||(40389157-40389298)
chr1 (100-243)||(16275382-16275526)
chr1 (100-243)||(21346961-21347105)
chr1 (100-245)||(50210187-50210333)
chr1 (100-246)||(22532269-22532416)
chr1 (100-246)||(45574861-45575008)
chr1 (106-249)||(15860033-15860177)
chr1 (121-243)||(34509783-34509906)
chr1 (100-246)||(27250703-27250850)
chr1 (118-245)||(22468688-22468816)
chr1 (186-245)||(20454614-20454673)
chr1 (145-246)||(20847173-20847275)
chr1 (118-246)||(21026680-21026809)
chr1 (100-227)||(21896230-21896358)
chr1 (118-245)||(20135188-20135316)
chr1 (100-172)||(21861544-21861616)
chr1 (193-246)||(33681010-33681060)
chr1 (193-231)||(16758664-16758702)
chr1 (188-242)||(21714546-21714600)
chr1 (193-242)||(20248283-20248332)
chr1 (188-245)||(24783155-24783212)
chr1 (193-232)||(21754059-21754098)
chr1 (193-231)||(52928038-52928076)
chr1 (193-246)||(14295619-14295672)
chr1 (193-230)||(20918620-20918657)
chr1 (193-242)||(22921937-22921986)
chr1 (188-220)||(1010742-1010774)
chr1 (171-242)||(21161720-21161792)
chr1 (186-242)||(42865274-42865330)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (100-245)||(34963371-34963516)
chr6 (100-243)||(12742317-12742460)
chr6 (100-243)||(18334611-18334754)
chr6 (100-243)||(19005046-19005189)
chr6 (100-243)||(19858938-19859081)
chr6 (100-243)||(24422547-24422690)
chr6 (100-243)||(33861794-33861937)
chr6 (100-243)||(33864278-33864421)
chr6 (100-243)||(2291199-2291342)
chr6 (100-243)||(8055029-8055172)
chr6 (100-243)||(26924659-26924802)
chr6 (100-243)||(1540930-1541073)
chr6 (100-243)||(22782227-22782370)
chr6 (100-245)||(30676729-30676874)
chr6 (100-243)||(20556913-20557054)
chr6 (100-243)||(25754809-25754952)
chr6 (100-243)||(1595549-1595692)
chr6 (100-243)||(3852036-3852179)
chr6 (101-243)||(25688502-25688644)
chr6 (100-227)||(18456735-18456862)
chr6 (100-227)||(18461895-18462022)
chr6 (101-243)||(25656629-25656771)
chr6 (100-240)||(16448545-16448686)
chr6 (100-246)||(25629329-25629476)
chr6 (100-246)||(29060540-29060687)
chr6 (100-246)||(17287770-17287917)
chr6 (100-246)||(20593773-20593920)
chr6 (124-245)||(18409825-18409947)
chr6 (100-246)||(19303515-19303661)
chr6 (118-246)||(16496244-16496373)
chr6 (100-246)||(20360934-20361081)
chr6 (100-231)||(25644335-25644468)
chr6 (100-227)||(18821819-18821946)
chr6 (147-246)||(20638304-20638404)
chr6 (100-246)||(22780201-22780348)
chr6 (134-246)||(20076700-20076812)
chr6 (186-246)||(25714417-25714477)
chr6 (100-246)||(20109140-20109285)
chr6 (193-246)||(27333286-27333339)
chr6 (193-246)||(27394026-27394079)
chr6 (188-244)||(19848058-19848114)
chr6 (100-165)||(8227485-8227550)
chr6 (188-244)||(23992429-23992485)
chr6 (199-246)||(22080799-22080846)
chr6 (193-246)||(1561303-1561356)
chr6 (193-246)||(28496539-28496592)
chr6 (193-246)||(29808950-29809003)
chr6 (205-249)||(19008799-19008843)
chr6 (125-246)||(23019408-23019528)
chr6 (193-231)||(9098582-9098620)
chr6 (188-218)||(19790842-19790872)
chr6 (188-242)||(19862978-19863032)
chr6 (188-242)||(19873120-19873174)
chr6 (193-246)||(16920698-16920751)
chr6 (193-242)||(19652199-19652248)
chr6 (176-218)||(31155446-31155490)
chr6 (193-246)||(35245586-35245639)
chr6 (188-220)||(18917321-18917353)
chr6 (186-218)||(21766719-21766751)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (100-243)||(13392-13535)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (100-243)||(20747-20890)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (100-243)||(37821-37964)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (100-243)||(94411-94554)
scaffold0023 (100-243)||(44454-44598)
scaffold0023 (100-239)||(17459-17598)
scaffold0023 (114-242)||(100378-100507)
scaffold0023 (193-246)||(119875-119928)
scaffold0023 (188-242)||(38542-38596)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (100-243)||(158469-158612)
scaffold0003 (100-243)||(339924-340065)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (100-243)||(1484402-1484545)
chr8 (100-243)||(5853311-5853454)
chr8 (100-243)||(15203250-15203393)
chr8 (100-243)||(20403227-20403370)
chr8 (100-243)||(22001753-22001896)
chr8 (100-243)||(14409463-14409606)
chr8 (100-243)||(4483281-4483423)
chr8 (100-239)||(16413335-16413474)
chr8 (100-243)||(20046214-20046357)
chr8 (100-243)||(4542392-4542535)
chr8 (100-243)||(41598188-41598331)
chr8 (100-243)||(19896265-19896411)
chr8 (100-239)||(45290713-45290853)
chr8 (100-243)||(14823774-14823916)
chr8 (100-243)||(25484294-25484430)
chr8 (100-245)||(26223917-26224062)
chr8 (106-249)||(19937030-19937174)
chr8 (100-246)||(16092316-16092463)
chr8 (100-246)||(18818383-18818530)
chr8 (100-227)||(19801401-19801527)
chr8 (101-243)||(26219717-26219858)
chr8 (100-249)||(6759255-6759402)
chr8 (100-246)||(7372778-7372925)
chr8 (101-243)||(26225268-26225409)
chr8 (100-245)||(28649018-28649164)
chr8 (110-230)||(15070571-15070692)
chr8 (100-246)||(20536208-20536355)
chr8 (100-246)||(21923902-21924049)
chr8 (118-246)||(21918992-21919121)
chr8 (100-246)||(22626736-22626882)
chr8 (100-246)||(22875065-22875211)
chr8 (100-246)||(23406379-23406528)
chr8 (100-246)||(18879210-18879352)
chr8 (147-246)||(31971257-31971356)
chr8 (193-246)||(6520368-6520421)
chr8 (100-227)||(20498581-20498709)
chr8 (193-246)||(38855319-38855372)
chr8 (100-165)||(13508059-13508124)
chr8 (147-246)||(45131019-45131117)
chr8 (188-244)||(18678165-18678221)
chr8 (118-245)||(23648554-23648682)
chr8 (100-228)||(13597591-13597720)
chr8 (193-246)||(17140916-17140969)
chr8 (100-165)||(17612084-17612149)
chr8 (193-246)||(21490995-21491048)
chr8 (188-244)||(32121734-32121790)
chr8 (125-242)||(21285601-21285719)
chr8 (147-246)||(16199666-16199765)
chr8 (196-246)||(21249384-21249434)
chr8 (196-246)||(21255222-21255272)
chr8 (193-246)||(5866342-5866395)
chr8 (193-246)||(21389518-21389571)
chr8 (193-246)||(21396048-21396101)
chr8 (193-246)||(21778844-21778897)
chr8 (193-246)||(21790541-21790594)
chr8 (193-246)||(23760912-23760962)
chr8 (193-231)||(983474-983512)
chr8 (100-130)||(24486063-24486093)
chr8 (193-242)||(26355766-26355815)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (100-243)||(12326-12469)
chr4 (100-243)||(15118371-15118514)
chr4 (100-243)||(52312510-52312653)
chr4 (100-249)||(19242693-19242842)
chr4 (100-243)||(1837528-1837671)
chr4 (100-243)||(18215293-18215436)
chr4 (100-243)||(18239438-18239581)
chr4 (100-243)||(44615288-44615431)
chr4 (100-243)||(44773106-44773249)
chr4 (100-243)||(50222358-50222501)
chr4 (100-243)||(44928898-44929042)
chr4 (100-243)||(3515007-3515150)
chr4 (100-245)||(19618191-19618336)
chr4 (101-245)||(14970727-14970871)
chr4 (100-243)||(23803284-23803427)
chr4 (100-243)||(51463887-51464030)
chr4 (100-243)||(44102214-44102357)
chr4 (100-239)||(15355343-15355483)
chr4 (101-243)||(54798729-54798872)
chr4 (100-243)||(12610950-12611086)
chr4 (100-227)||(21815604-21815731)
chr4 (125-243)||(14280316-14280434)
chr4 (106-246)||(15367690-15367831)
chr4 (106-246)||(15370018-15370159)
chr4 (106-246)||(15402703-15402844)
chr4 (101-243)||(8574844-8574985)
chr4 (106-246)||(15371202-15371343)
chr4 (106-246)||(15373483-15373624)
chr4 (106-246)||(16223532-16223673)
chr4 (100-240)||(20149832-20149973)
chr4 (100-243)||(7641211-7641344)
chr4 (100-246)||(7798774-7798921)
chr4 (100-246)||(12902757-12902904)
chr4 (100-246)||(7088877-7089024)
chr4 (100-241)||(14038653-14038795)
chr4 (100-243)||(16377497-16377639)
chr4 (100-246)||(7893703-7893850)
chr4 (100-246)||(16239944-16240090)
chr4 (128-246)||(52873369-52873488)
chr4 (100-244)||(22636437-22636582)
chr4 (100-246)||(6899891-6900037)
chr4 (100-246)||(16270210-16270356)
chr4 (100-246)||(44052829-44052976)
chr4 (161-246)||(3096293-3096379)
chr4 (118-239)||(23374351-23374473)
chr4 (193-246)||(39706356-39706409)
chr4 (100-231)||(43198527-43198661)
chr4 (100-165)||(13825-13890)
chr4 (103-172)||(15464908-15464977)
chr4 (100-165)||(22353915-22353980)
chr4 (100-231)||(52243168-52243302)
chr4 (193-246)||(15551817-15551870)
chr4 (100-227)||(6190481-6190610)
chr4 (147-246)||(14053323-14053422)
chr4 (193-242)||(12774011-12774060)
chr4 (193-246)||(17046487-17046540)
chr4 (193-231)||(12288278-12288316)
chr4 (193-242)||(13569502-13569551)
chr4 (188-245)||(20157522-20157579)
chr4 (188-220)||(9556549-9556581)
chr4 (186-218)||(11250622-11250654)
chr4 (186-218)||(15353368-15353400)
chr4 (188-220)||(17810291-17810323)
chr4 (188-244)||(22353835-22353891)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (100-243)||(13947-14090)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (100-243)||(136680-136823)
scaffold0028 (100-243)||(139149-139292)
scaffold0028 (100-243)||(144087-144230)
scaffold0028 (100-243)||(134211-134354)
scaffold0028 (100-243)||(141618-141761)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (100-245)||(11286-11431)
scaffold0029 (188-220)||(61667-61699)
scaffold0029 (188-220)||(65583-65615)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (100-243)||(4694-4837)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (100-243)||(40400-40543)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (100-244)||(10772-10916)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (100-244)||(9241-9385)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (100-243)||(106-249)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (101-243)||(29931-30074)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (100-243)||(16784-16927)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (100-243)||(82072-82215)
scaffold0037 (193-231)||(22738-22776)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (100-239)||(501088-501227)
scaffold0001 (100-243)||(85598-85742)
scaffold0001 (193-242)||(160688-160737)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (100-248)||(9744-9893)
scaffold0145 (100-246)||(32942-33088)
scaffold0145 (100-246)||(38761-38907)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (100-243)||(22886-23029)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (100-245)||(12268-12413)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (100-243)||(4214-4358)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (100-240)||(4300-4440)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (100-227)||(79303-79430)
scaffold0056 (100-245)||(17189-17337)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (100-243)||(12064-12201)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (101-243)||(44682-44825)
scaffold0122 (100-239)||(26039-26179)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (100-227)||(20398-20524)
scaffold0031 (100-246)||(128751-128897)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (101-243)||(116430-116571)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (100-243)||(2147-2291)
scaffold0247 (100-165)||(18001-18066)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (100-243)||(161108-161252)
scaffold0007 (100-164)||(164609-164674)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (100-246)||(16574-16721)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (100-245)||(3160-3306)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (100-240)||(1299-1440)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (100-246)||(1022-1169)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (100-246)||(3125-3271)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (100-246)||(4508-4654)
scaffold0228 (100-246)||(12090-12236)
scaffold0228 (100-246)||(22042-22188)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (100-246)||(39858-40004)
scaffold0026 (100-246)||(25896-26042)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (100-246)||(1851-1998)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (100-246)||(51913-52060)
scaffold0011 (100-246)||(167952-168099)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (100-246)||(13211-13358)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (100-244)||(39479-39623)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (100-244)||(75189-75333)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (118-246)||(4849-4978)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (118-246)||(32949-33077)
scaffold0120 (118-246)||(45928-46056)
scaffold0120 (100-246)||(16113-16260)
scaffold0120 (186-246)||(17390-17450)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (100-246)||(3470-3617)
scaffold0292 (100-246)||(343-489)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (128-246)||(28414-28533)
scaffold0046 (193-246)||(1997-2050)
scaffold0046 (193-246)||(4552-4605)
scaffold0046 (193-246)||(11292-11345)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (100-181)||(3504-3585)
scaffold0327 (188-242)||(289-343)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (100-246)||(8479-8626)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (100-246)||(8507-8650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (100-246)||(6095-6245)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (103-243)||(38679-38820)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (186-246)||(4894-4954)
scaffold0395 (100-167)||(937-1003)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (128-246)||(39913-40031)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (100-231)||(8481-8613)
scaffold0621 (193-246)||(6535-6588)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (100-246)||(1952-2099)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (100-228)||(24276-24406)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (156-246)||(4712-4803)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (100-159)||(13092-13151)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (193-246)||(1102-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (193-246)||(6611-6664)
scaffold0333 (193-246)||(13991-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (193-246)||(6191-6244)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (100-181)||(13158-13239)
scaffold0175 (190-246)||(273-329)
scaffold0175 (193-246)||(34123-34176)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (193-246)||(15845-15898)
scaffold0020 (188-242)||(178898-178952)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (100-172)||(27723-27795)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (186-246)||(32067-32127)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (186-246)||(121766-121826)
scaffold0021 (100-245)||(174767-174911)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (169-227)||(11982-12040)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (100-166)||(27911-27977)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (132-243)||(15664-15776)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (186-243)||(15299-15356)
scaffold0106 (193-246)||(1289-1342)
scaffold0106 (193-246)||(7266-7319)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (100-165)||(53523-53588)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (186-246)||(13497-13557)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (147-246)||(11464-11564)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (147-246)||(15485-15584)
scaffold0114 (186-242)||(7295-7351)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (100-246)||(10399-10544)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (100-225)||(4545-4671)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (193-242)||(1086-1135)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (100-165)||(8033-8098)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (100-165)||(11546-11611)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (100-165)||(16074-16139)
scaffold0357 (100-172)||(13203-13276)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (100-165)||(38230-38295)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (100-172)||(225482-225553)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (188-242)||(23843-23897)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (193-242)||(2713-2762)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (193-242)||(29558-29607)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (193-246)||(1137-1190)
scaffold0184 (186-218)||(4287-4319)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (193-242)||(36454-36503)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (193-242)||(45860-45909)
scaffold0125 (121-165)||(45787-45831)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (193-242)||(19268-19317)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (100-227)||(51857-51985)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (125-172)||(8090-8137)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (186-232)||(129919-129966)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (193-243)||(5196-5246)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (188-242)||(159-213)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (196-246)||(16282-16332)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (188-242)||(21866-21920)
scaffold0210 (188-242)||(29758-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (188-242)||(69794-69848)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (193-242)||(2874-2923)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (193-246)||(12766-12819)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (107-172)||(12643-12708)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (100-181)||(6676-6757)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (193-246)||(46995-47048)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (193-246)||(51582-51635)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (193-242)||(14765-14814)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (186-242)||(1881-1937)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (188-220)||(3930-3962)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (188-220)||(5156-5188)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (186-218)||(7331-7363)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (186-242)||(10583-10639)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (186-218)||(5004-5036)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (194-242)||(28839-28887)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (188-220)||(35997-36029)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27217003 - 27216860
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27217003 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 27216904  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216903 ttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 456464 - 456321
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  456464 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 456365  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  456364 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11972639 - 11972496
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11972639 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 11972540  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11972539 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 14949141 - 14949284
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14949141 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 14949240  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14949241 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 15376732 - 15376875
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15376732 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 15376831  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15376832 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16232663 - 16232520
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16232663 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 16232564  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232563 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18640415 - 18640272
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18640415 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 18640316  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640315 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 20385142 - 20385285
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20385142 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20385241  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20385242 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 21189614 - 21189757
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21189614 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21189713  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21189714 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32125634 - 32125491
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32125634 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 32125535  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32125534 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41523060 - 41522917
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41523060 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 41522961  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41522960 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41525522 - 41525379
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41525522 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 41525423  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41525422 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Original strand, 11393306 - 11393448
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11393306 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 11393405  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11393406 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410059
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 16410102  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16410101 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18430855 - 18430709
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18430855 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttat 18430756  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18430755 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24702381 - 24702238
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702381 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24702282  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24702281 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24275314 - 24275175
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24275314 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 24275215  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24275214 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3386475 - 3386333
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3386475 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatt 3386376  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3386375 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24704828 - 24704688
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24704828 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24704732  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24704731 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16213827 - 16213684
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16213827 cattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 16213728  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16213727 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44116652 - 44116509
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44116652 cattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 44116553  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44116552 ttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 17061934 - 17062077
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctg-ttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17061934 cattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgcta-ttttgtatactgctgagttgctgattgtta 17062032  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17062033 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 3564338 - 3564482
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  3564338 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 3564437  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3564438 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13647472 - 13647325
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |  |||||||||||||    
T  13647472 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 13647373  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||||||    
T  13647372 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20110689 - 20110556
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||    
T  20110689 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata----------gctgttgttat 20110600  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20110599 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 38898395 - 38898535
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || || | ||||||||    
T  38898395 cattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgtta 38898494  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38898495 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273392
Alignment:
Q  124 attgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  223 ctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13869472 - 13869346
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13869472 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatga 13869373  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13869372 gtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 207
Target Start/End: Original strand, 12756690 - 12756797
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12756690 cattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttat 12756789  T
Q  200 ttaactaa 207  Q
    ||||||||    
T  12756790 ttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  117 gtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12698979 - 12698831
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctat-ttttgtatactgttga-gttgctgttgtt 197  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  12698979 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 12698880  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12698879 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 18456387 - 18456530
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |  |||||| | ||||    
T  18456387 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ttgttttgtatactgcctatgttgctatcgtta 18456485  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456486 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 26356002 - 26356156
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagtt----------- 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||               
T  26356002 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgtt 26356101  T
Q  189 gctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    | |||||||||||||||  | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26356102 gttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 26358454 - 26358608
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagtt----------- 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||               
T  26358454 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgtt 26358553  T
Q  189 gctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    | |||||||||||||||  | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26358554 gttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9509336 - 9509189
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||   | ||| |||||||||    
T  9509336 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgtta 9509237  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9509236 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38227627 - 38227481
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||| ||||||    
T  38227627 cattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 38227529  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38227528 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26212125 - 26211995
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26212125 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatga 26212026  T
Q  217 gttggtctaagttgattaag-atgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26212025 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589039
Alignment:
Q  128 agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaa 226  Q
    |||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 10589059  T
Q  227 gttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  10589058 gttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 15144012 - 15144143
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    ||||||||||||||    
T  15144012 cattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttat 15144111  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15144112 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  125 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||   | |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  223 ctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 246
Target Start/End: Original strand, 2280094 - 2280238
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtta 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||  |  |||| || |||||     
T  2280094 attatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgttt 2280192  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280193 attaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 67798 - 67745
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67798 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831807
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 16386239 - 16386369
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatg 215  Q
    |||||| || |||||||| |||  |||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||   | || | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16386239 tgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatg 16386338  T
Q  216 agttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  16386339 agtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 28505366 - 28505419
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  28505366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34200839 - 34200786
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  34200839 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15113088 - 15113031
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattat 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15113088 attacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811248
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 245
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832561
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996148
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16495455 - 16495402
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  16495455 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18005699 - 18005650
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18005699 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 165
Target Start/End: Original strand, 19486722 - 19486783
Alignment:
Q  104 acttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  19486722 acttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 19486783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014182
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 165
Target Start/End: Original strand, 12255766 - 12255830
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  12255766 attacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatg 12255830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 165
Target Start/End: Original strand, 10063798 - 10063857
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   || ||||||||||| |||||    
T  10063798 ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatg 10063857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15116625 - 15116568
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattat 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  15116625 attacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Original strand, 18154902 - 18154956
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  18154902 gttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649606
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9703312 - 9703263
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  9703312 ttgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 9703263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 9446219 - 9446251
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9446219 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 9446251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12187075 - 12187019
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  12187075 gttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 17138121 - 17138177
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  17138121 gttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 20569657 - 20569689
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20569657 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 20569689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26292446 - 26292414
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292446 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 26292414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39722317 - 39722285
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722317 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 39722285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 42245384 - 42245527
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42245384 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 42245483  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42245484 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 264787 - 264930
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  264787 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 264886  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  264887 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 10732959 - 10733102
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10732959 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 10733058  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10733059 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39363527 - 39363384
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39363527 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 39363428  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39363427 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20909155 - 20909012
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20909155 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttat 20909056  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20909055 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29330077 - 29329934
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330077 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 29329978  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29329977 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29346123 - 29345980
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29346123 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttat 29346024  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29346023 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32027536 - 32027393
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32027536 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttat 32027437  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32027436 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39245279 - 39245136
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39245279 cattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 39245180  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39245179 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 11581218 - 11581361
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11581218 cattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 11581317  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11581318 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29348596 - 29348453
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29348596 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttat 29348497  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29348496 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29351069 - 29350926
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29351069 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttat 29350970  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29350969 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 36154802 - 36154942
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||    
T  36154802 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg---tgttgttgttat 36154898  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154899 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 2154632 - 2154776
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2154632 cattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgtta 2154731  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2154732 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Original strand, 18319052 - 18319193
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  18319052 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtta 18319151  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18319152 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 20902027 - 20902172
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20902027 cattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 20902126  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttg-attaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20902127 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 20917973 - 20918110
Alignment:
Q  102 ttacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttattt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20917973 ttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20918068  T
Q  202 aactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20918069 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 10775694 - 10775838
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || || ||||| ||||    
T  10775694 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgtta 10775793  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10775794 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31061212 - 31061068
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  31061212 cattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgttttgctgttgtta 31061113  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31061112 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38619568 - 38619434
Alignment:
Q  110 attatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaag 208  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||    
T  38619568 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 38619469  T
Q  209 ttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619468 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24067251 - 24067110
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24067251 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 24067152  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    |||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24067151 tttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23064645 - 23064512
Alignment:
Q  110 attatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaag 208  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||    
T  23064645 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 23064546  T
Q  209 ttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23064545 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 23390470 - 23390617
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  23390470 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgtta 23390569  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23390570 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9078099 - 9077952
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||||    
T  9078099 cattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtta 9078000  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  9077999 tttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25421679 - 25421532
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | |||| ||||||||    
T  25421679 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 25421580  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25421579 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529223
Alignment:
Q  121 ataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtt 219  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  220 ggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 21729056 - 21729185
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21729056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21729155  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21729156 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 21808381 - 21808510
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21808381 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21808480  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21808481 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  139 acttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaaga 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  238 tgatgatgt 246  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1096614 - 1096467
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||   || |||||||||||||    
T  1096614 cattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgtta 1096515  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1096514 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412187
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  |||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24493711 - 24493569
Alignment:
Q  104 acttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgttattta 202  Q
    ||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||| |||||| |||    
T  24493711 acttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctattgttactta 24493613  T
Q  203 actaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493612 accaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25431541 - 25431395
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  25431541 cattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 25431442  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  25431441 tttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Original strand, 8286844 - 8286964
Alignment:
Q  128 agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctattttt-gtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtcta 225  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8286844 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8286943  T
Q  226 agttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  8286944 agttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13025457 - 13025311
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||   | |||||| ||||||    
T  13025457 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 13025359  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025358 tttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13095641 - 13095495
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||   | |||||| ||||||    
T  13095641 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 13095543  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095542 tttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 184
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766177
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttg 184  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgttg 20766177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22075148 - 22075018
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22075148 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatga 22075049  T
Q  217 gttggtctaagttgattaag-atgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22075048 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 21329565 - 21329618
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21329565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  189 gctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 246
Target Start/End: Original strand, 21502231 - 21502277
Alignment:
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21502231 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 19660903 - 19660956
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  19660903 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40726000 - 40725935
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  40726000 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 40725935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Original strand, 17517264 - 17517320
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17517264 tgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 21293030 - 21293090
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || | |||||||||||||    
T  21293030 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21565595 - 21565546
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21565595 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22144196 - 22144131
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||    
T  22144196 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatg 22144131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 22959600 - 22959649
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22959600 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36314630 - 36314577
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  36314630 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  148 tgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttattt-aactaagttgcatgagttggtctaagttgattaag 236  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||   | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14079203 - 14079149
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  14079203 tgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgattaagatgatg 14079149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26680636 - 26680606
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680636 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26680606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704075
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26952243 - 26952213
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952243 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26952213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973808
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668898
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22032379 - 22032323
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  22032379 gttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 16454300 - 16454443
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454300 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 16454399  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16454400 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17463321 - 17463178
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17463321 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 17463222  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17463221 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 28848630 - 28848773
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28848630 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 28848729  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28848730 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34159469 - 34159326
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34159469 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 34159370  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34159369 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 45606926 - 45607069
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45606926 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 45607025  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45607026 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55476634 - 55476491
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55476634 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 55476535  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55476534 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 7781366 - 7781509
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7781366 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 7781465  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781466 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8899237 - 8899094
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8899237 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 8899138  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8899137 ttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 29172602 - 29172745
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29172602 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 29172701  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29172702 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 38961910 - 38962053
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38961910 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 38962009  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38962010 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 13151809 - 13151953
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13151809 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13151908  T
Q  200 ttaact-aagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13151909 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 13154274 - 13154418
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13154274 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13154373  T
Q  200 ttaact-aagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13154374 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 6469153 - 6469296
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6469153 cattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 6469252  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6469253 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 9707626 - 9707769
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9707626 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 9707725  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9707726 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 10247742 - 10247885
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10247742 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttat 10247841  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10247842 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Original strand, 16282830 - 16282971
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16282830 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 16282929  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 241  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16282930 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 17446674 - 17446816
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17446674 cattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 17446773  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17446774 ttaactaagctgcatgag-tcgtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13544168 - 13544024
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13544168 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttat 13544069  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13544068 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12567703 - 12567564
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12567703 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttat 12567604  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12567603 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41124030 - 41123892
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||    
T  41124030 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttg---tgttgttgttat 41123934  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 241  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41123933 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977515
Alignment:
Q  112 tatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  212 catgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17672769 - 17672626
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  17672769 cattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttat 17672670  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17672669 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50242965 - 50242822
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  50242965 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 50242866  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  50242865 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  130 atgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagtt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55500956  T
Q  230 gattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||||    
T  55500955 gattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 53070672 - 53070799
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  53070672 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttat 53070771  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53070772 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Original strand, 12119753 - 12119887
Alignment:
Q  110 attatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaag 208  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||    
T  12119753 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaag 12119852  T
Q  209 ttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12119853 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15412563 - 15412429
Alignment:
Q  110 attatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaag 208  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  15412563 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15412464  T
Q  209 ttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15412463 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14973001 - 14972854
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  14973001 cattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 14972902  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14972901 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 40213695 - 40213838
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || |||| |||||||||    
T  40213695 cattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttat 40213794  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40213795 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618449
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattgagaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 25476359 - 25476506
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact-gttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||     
T  25476359 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttt 25476458  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25476459 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8499652 - 8499518
Alignment:
Q  110 attatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaag 208  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  8499652 attatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 8499553  T
Q  209 ttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499552 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17488003 - 17487856
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagtt-gctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  17488003 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgtta 17487904  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17487903 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17499485 - 17499338
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagtt-gctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  17499485 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgtta 17499386  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17499385 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550644
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |  ||||||||  |||    
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556985
Alignment:
Q  125 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtc 223  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10557005  T
Q  224 taagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10557004 taagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438534
Alignment:
Q  128 agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 18438554  T
Q  227 gttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  18438553 gttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43841079 - 43840932
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  43841079 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgtta 43840980  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  43840979 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12399338 - 12399209
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12399338 tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12399239  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  12399238 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 23083353 - 23083482
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23083353 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 23083452  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083453 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13442421 - 13442274
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||||| |||||||    
T  13442421 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgtta 13442322  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442321 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 20698409 - 20698556
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  20698409 cattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 20698508  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20698509 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26687034 - 26686887
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| ||||||||    
T  26687034 cattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 26686935  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26686934 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  144 catttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 232
Target Start/End: Original strand, 14576807 - 14576939
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  14576807 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgtta 14576905  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 232  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14576906 tttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42386557 - 42386428
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  42386557 cattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 42386458  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagt 228  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  42386457 tttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 24153183 - 24153326
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    | |||||| | ||||    
T  24153183 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgtta 24153281  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24153282 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 232  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  145 atttgatattattatgtcatgctatttttgta---tactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||   || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T
Q  242 ga 243  Q
    ||    
T  17737237 ga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  103 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttgt-tgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||| | |||||||  | ||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27165391 - 27165250
Alignment:
Q  103 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgag-ttgctgtt-gttatt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||| ||||| | |||| | |||||||  |  |||||||| ||||||    
T  27165391 tacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatt 27165293  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27165292 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 11424737 - 11424880
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||| |   || |  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||||||    
T  11424737 cattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgtta 11424832  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  11424833 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  190 ctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274705
Alignment:
Q  102 ttacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgttat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||  |  ||||||| ||||||     
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat-gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagt 228  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23274733 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194693
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 24340697 - 24340762
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||    
T  24340697 cattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 24340762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46822323 - 46822267
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  46822323 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 2051173 - 2051238
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  2051173 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210448
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14234540 - 14234487
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14234540 ttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 22147499 - 22147564
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  22147499 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 22147564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 37642239 - 37642304
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  37642239 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 37642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12511115 - 12511059
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  12511115 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14665457 - 14665398
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  14665457 gttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 52523701 - 52523831
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctat-ttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgt 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||   | ||||| ||||||  |  |||| || ||||    
T  52523701 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgt 52523800  T
Q  197 tatttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52523801 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 12038019 - 12038068
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  12038019 ttgttatttaactaagttgcatgagtttatataagatgattaagatgatg 12038068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 12174327 - 12174376
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12174327 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668554
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16097381 - 16097332
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16097381 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 856196 - 856140
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  856196 gttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 23077538 - 23077594
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  23077538 gttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15470985 - 15470927
Alignment:
Q  186 gttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  15470985 gttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32307730 - 32307691
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32307730 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390029
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 3390029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878168
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029841
Alignment:
Q  148 tgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||  ||||  | | |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16103841 - 16103784
Alignment:
Q  186 gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16103841 gttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 49668144 - 49668193
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  49668144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15617428 - 15617396
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617428 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 15617396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  194 tgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30066000 - 30065968
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066000 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 30065968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6726138 - 6725995
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6726138 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 6726039  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6726038 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18809086 - 18808943
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18809086 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 18808987  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18808986 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23131005 - 23130862
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23131005 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23130906  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23130905 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23133472 - 23133329
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23133472 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23133373  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23133372 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23135733 - 23135590
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23135733 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23135634  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23135633 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 23709551 - 23709694
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23709551 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23709650  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23709651 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 23712032 - 23712175
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23712032 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23712131  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23712132 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26505522 - 26505379
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26505522 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 26505423  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26505422 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26508000 - 26507857
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26508000 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 26507901  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26507900 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 34402541 - 34402684
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34402541 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 34402640  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34402641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39682456 - 39682313
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39682456 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 39682357  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39682356 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 571540 - 571397
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  571540 cattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 571441  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  571440 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24367917 - 24367774
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24367917 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24367818  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24367817 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Original strand, 21155079 - 21155219
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21155079 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21155178  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21155179 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 24898214 - 24898358
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24898214 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24898313  T
Q  200 ttaact-aagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24898314 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 24900697 - 24900841
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24900697 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24900796  T
Q  200 ttaact-aagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24900797 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 24903174 - 24903318
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24903174 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24903273  T
Q  200 ttaact-aagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24903274 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 24905651 - 24905795
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24905651 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24905750  T
Q  200 ttaact-aagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24905751 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 24908126 - 24908270
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24908126 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24908225  T
Q  200 ttaact-aagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24908226 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28577242 - 28577099
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28577242 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttat 28577143  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28577142 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 32039517 - 32039660
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32039517 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttat 32039616  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32039617 ttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 32214940 - 32215085
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  32214940 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttat 32215039  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32215040 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 45029873 - 45030016
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  45029873 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttat 45029972  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45029973 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22105556 - 22105412
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |  |||||||||||||    
T  22105556 cattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 22105457  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22105456 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38967518 - 38967374
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  38967518 cattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgtta 38967419  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967418 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43137442 - 43137301
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  43137442 cattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttat 43137343  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 241  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43137342 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 24529547 - 24529691
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  24529547 cattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgtta 24529646  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529647 tttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22337262 - 22337115
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||||    
T  22337262 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgtta 22337163  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22337162 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23060660 - 23060513
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  23060660 cattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 23060561  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23060560 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23076589 - 23076442
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  23076589 cattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 23076490  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23076489 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 22738154 - 22738300
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   | ||  |||||||||    
T  22738154 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatttaatgttgttat 22738253  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738254 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 22731208 - 22731355
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  22731208 cattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtta 22731307  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22731308 tttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 243
Target Start/End: Original strand, 298806 - 298933
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatg 215  Q
    |||||| || |||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  298806 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 298905  T
Q  216 agttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  298906 agtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23660169 - 23660023
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||| ||||   |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||   | ||||||||||||     
T  23660169 cattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactgcctatgttgctgttgttg 23660071  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660070 tttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Original strand, 24643038 - 24643109
Alignment:
Q  169 tttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24643038 tttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23286008 - 23285865
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  | || |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||    | |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  23286008 cattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 23285913  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23285912 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38235
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 158
Target Start/End: Original strand, 24642875 - 24642933
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattatta 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24642875 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 23040250 - 23040310
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040250 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 23654360 - 23654507
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||| | |||  |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||   | | || ||||||||    
T  23654360 cattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgtta 23654459  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23654460 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 246
Target Start/End: Original strand, 23103375 - 23103516
Alignment:
Q  104 acttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttattta 202  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||| |||  ||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  23103375 acttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttattta 23103472  T
Q  203 actaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  23103473 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  125 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggt 222  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  223 ctaagttgattaagatgat 241  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8946717 - 8946657
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946717 gttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19671976 - 19671830
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||  |  ||||||| |||||    
T  19671976 cattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat-gttttgcatactgcctatgttgctgattgtt 19671879  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    | ||||||||| |||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||    
T  19671878 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7772
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 7772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7679638 - 7679589
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7679638 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 151
Target Start/End: Original strand, 22459536 - 22459587
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgat 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22459536 cattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25616243 - 25616192
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25616243 tgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20309161 - 20309108
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  20309161 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 23708593 - 23708738
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgt-tgtt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||| || || |||||||| |||| ||||| | |||| | ||||||   | |||||| | ||||    
T  23708593 cattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgtt 23708691  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708692 atttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 22134267 - 22134326
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| | ||||||||||    
T  22134267 gttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 246
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072070
Alignment:
Q  195 gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 32451902 - 32451976
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatg-ttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttg 174  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32451902 cattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttg 32451976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24869934 - 24869904
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869934 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 24869904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Original strand, 25961597 - 25961627
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961597 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 25961627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 10101700 - 10101732
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101700 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 10101732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 24655399 - 24655431
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24655399 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 24655431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 27379488 - 27379520
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379488 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 27379520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 27383534 - 27383566
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383534 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 27383566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 21475106 - 21475249
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21475106 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21475205  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475206 ttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13989009 - 13988866
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13989009 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13988910  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13988909 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 21923310 - 21923453
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21923310 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21923409  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923410 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 23593754 - 23593897
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23593754 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23593853  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593854 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29776831 - 29776688
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29776831 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 29776732  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29776731 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31612456 - 31612313
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31612456 cattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 31612357  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31612356 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29298279 - 29298137
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29298279 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 29298181  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29298180 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21840910 - 21840766
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21840910 cattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 21840811  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21840810 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16362060 - 16361915
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  16362060 cattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttat 16361961  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16361960 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 22123086 - 22123230
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctg-ttgtta 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  22123086 cattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgcta 22123185  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22123186 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 13212880 - 13213027
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13212880 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgtta 13212979  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212980 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21707310 - 21707167
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  21707310 cattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttat 21707211  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21707210 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21711852 - 21711709
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  21711852 cattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttat 21711753  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21711752 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 433153 - 433012
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  || |||||    ||||    
T  433153 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgtta 433057  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  433056 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21342240 - 21342090
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||   ||||||||    
T  21342240 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgtta 21342141  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 249  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342140 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40389298 - 40389157
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40389298 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgtcgctgttgtta 40389199  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40389198 tttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 16275382 - 16275526
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || | ||||||||    
T  16275382 cattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgtta 16275481  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16275482 tttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21347105 - 21346961
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||   ||||||||    
T  21347105 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgtta 21347006  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21347005 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 50210187 - 50210333
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  50210187 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 50210286  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50210287 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22532416 - 22532269
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   |||||| || |||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  22532416 cattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 22532317  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22532316 tttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 45574861 - 45575008
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |  |||||||||||||    
T  45574861 cattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 45574960  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||||||    
T  45574961 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 249
Target Start/End: Original strand, 15860033 - 15860177
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  15860033 ttgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaac 15860132  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 249  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15860133 taagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509783
Alignment:
Q  121 ataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtt 219  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  220 ggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 27250703 - 27250850
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||||||    
T  27250703 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgtta 27250802  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  27250803 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 245
Target Start/End: Original strand, 22468688 - 22468816
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| || |||||  |||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22468688 tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  22468788 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 20454614 - 20454673
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20454614 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 246
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  145 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  244 tgt 246  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21026809 - 21026680
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgag-ttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || |||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21026809 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatga 21026710  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | | |||||||||||    
T  21026709 gtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 21896230 - 21896358
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||  |  ||||||| |||||    
T  21896230 cattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 21896328  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21896329 tattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135188
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||| | || |||||  |||   | | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Original strand, 21861544 - 21861616
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  21861544 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 21861616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33681060 - 33681010
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  33681060 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16758702 - 16758664
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16758702 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714546
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248283
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 245
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783212
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21754098 - 21754059
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21754098 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 14295619 - 14295672
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  14295619 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttg 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 22921937 - 22921986
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  22921937 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1010774 - 1010742
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010774 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 1010742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161720
Alignment:
Q  171 tttgtatactgttgagttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 42865274 - 42865330
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  42865274 gttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34963516 - 34963371
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34963516 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 34963417  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34963416 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12742460 - 12742317
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12742460 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 12742361  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12742360 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 18334611 - 18334754
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18334611 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 18334710  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18334711 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19005189 - 19005046
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19005189 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 19005090  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19005089 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 19858938 - 19859081
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19858938 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 19859037  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19859038 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24422690 - 24422547
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24422690 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24422591  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24422590 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33861937 - 33861794
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33861937 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 33861838  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33861837 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33864421 - 33864278
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33864421 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 33864322  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33864321 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 2291199 - 2291342
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291199 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 2291298  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2291299 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8055172 - 8055029
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8055172 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttat 8055073  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8055072 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 26924659 - 26924802
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26924659 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 26924758  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26924759 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 1540930 - 1541073
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1540930 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 1541029  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1541030 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22782370 - 22782227
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22782370 cattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 22782271  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782270 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 30676729 - 30676874
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30676729 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 30676828  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30676829 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 20556913 - 20557054
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20556913 cattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20557010  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20557011 ttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25754952 - 25754809
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  25754952 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 25754853  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25754852 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttat 1595593  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1595592 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 3852036 - 3852179
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3852036 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 3852135  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3852136 taaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatt 25688545  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  25688544 taactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18456862 - 18456735
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18456862 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 18456763  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18456762 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18462022 - 18461895
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18462022 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 18461923  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18461922 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25656771 - 25656629
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  25656771 attagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatt 25656672  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656671 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Original strand, 16448545 - 16448686
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16448545 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtta 16448644  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16448645 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 25629329 - 25629476
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  || ||| ||||||| |    
T  25629329 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaa 25629428  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629429 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29060687 - 29060540
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  29060687 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 29060588  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  29060587 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 17287770 - 17287917
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    | |||||||||||||    
T  17287770 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgtta 17287869  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17287870 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20593920 - 20593773
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||| |||    
T  20593920 cattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttttta 20593821  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||| || ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20593820 tttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 245
Target Start/End: Original strand, 18409825 - 18409947
Alignment:
Q  124 attgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  18409825 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  223 ctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 19303515 - 19303661
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatac-tgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |  || |||| ||||||||    
T  19303515 cattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ttgttttgtatacttcctgtgttgttgttgtta 19303613  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  19303614 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16496373 - 16496244
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16496373 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 16496274  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  16496273 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 20360934 - 20361081
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   | |||||||||||||    
T  20360934 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgtta 20361033  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  20361034 tttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25644468 - 25644335
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgt-tgtt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||  |  |||||||| ||||    
T  25644468 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgtt 25644369  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25644368 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 18821819 - 18821946
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatg-ttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18821819 cattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 18821917  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18821918 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 20638304 - 20638404
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20638304 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T
Q  246 t 246  Q
    |    
T  20638404 t 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 22780201 - 22780348
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||   | |||  ||||||||    
T  22780201 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgtta 22780300  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780301 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  134 tgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 232  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  233 taagatgatgatgt 246  Q
     |||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25714477 - 25714417
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25714477 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109140
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||| |  ||||| ||||||  |  ||||||| |||||    
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatg-ttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 20109187  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109186 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 27333286 - 27333339
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27333286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 27394026 - 27394079
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27394026 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Original strand, 19848058 - 19848114
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  19848058 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 8227485 - 8227550
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  8227485 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 8227550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23992485 - 23992429
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23992485 tgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496592
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29809003
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 249  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019408
Alignment:
Q  125 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagttggt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||| ||  ||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||| |||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  223 ctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||| |||  |||||||||||||    
T  23019429 ctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 9098582 - 9098620
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9098582 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Original strand, 19790842 - 19790872
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790842 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 19790872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862978
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873120
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920751
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652199
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 218
Target Start/End: Original strand, 31155446 - 31155490
Alignment:
Q  176 atactgttgagttgctgtt--gttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31155446 atactgtttagttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagt 31155490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35245639 - 35245586
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  35245639 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 18917321 - 18917353
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917321 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 18917353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21766751 - 21766719
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21766751 gttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 21766719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13535 - 13392
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13535 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13436  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13435 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20890 - 20747
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20890 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20791  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20790 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37964 - 37821
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37964 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 37865  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37864 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 94554 - 94411
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  94554 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 94455  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94454 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44598 - 44454
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgct-atttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44598 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 44499  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44498 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 17459 - 17598
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  17459 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttat 17558  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17559 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100378
Alignment:
Q  114 tatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttg 211  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |  ||| | ||||||   | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  212 catgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 119928 - 119875
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  119928 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38596
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 158469 - 158612
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  158469 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 158568  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  158569 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 339924 - 340065
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |  |||| || |||||    
T  339924 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgactt-gatttgatattattatgtcatg-ttgttttgtatactgcctatgttgttg-tgtta 340020  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  340021 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1484545 - 1484402
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1484545 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 1484446  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1484445 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 5853311 - 5853454
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5853311 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 5853410  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5853411 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 15203250 - 15203393
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15203250 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 15203349  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15203350 ttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20403370 - 20403227
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20403370 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20403271  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20403270 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22001896 - 22001753
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22001896 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 22001797  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22001796 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 14409463 - 14409606
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14409463 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 14409562  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14409563 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4483423 - 4483281
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  4483423 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta- 4483325  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4483324 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 16413335 - 16413474
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16413335 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 16413434  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16413435 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 20046214 - 20046357
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046214 cattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20046313  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20046314 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 4542392 - 4542535
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4542392 cattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttat 4542491  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4542492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41598331 - 41598188
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  41598331 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 41598232  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41598231 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19896411 - 19896265
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattat---gtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19896411 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgt 19896312  T
Q  197 tatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19896311 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 45290713 - 45290853
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45290713 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 45290812  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45290813 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14823916 - 14823774
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14823916 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttat 14823817  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14823816 ttaactttgctgcatgag-tggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 25484294 - 25484430
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||       | |||||||||||    
T  25484294 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttat 25484386  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484387 ttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26224062 - 26223917
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||    
T  26224062 cattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctttattgctgttgttat 26223963  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  26223962 ttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 249
Target Start/End: Original strand, 19937030 - 19937174
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19937030 ttgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 19937129  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 249  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19937130 taagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 16092316 - 16092463
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  16092316 cattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 16092415  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092416 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 18818383 - 18818530
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  18818383 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 18818482  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18818483 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 19801401 - 19801527
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19801401 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgttgtgttgctattgttat 19801499  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  19801500 ttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6759402 - 6759255
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  6759402 cattaattgaattatgagtgtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 6759306  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 249  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6759305 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7372925 - 7372778
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  7372925 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 7372826  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7372825 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    ||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 28649018 - 28649164
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||| ||||||    
T  28649018 cattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgtta 28649117  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28649118 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15070692 - 15070571
Alignment:
Q  110 attatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaag 208  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  15070692 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15070593  T
Q  209 ttgcatgagttggtctaagttg 230  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  15070592 ctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20536355 - 20536208
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| |||||||||    
T  20536355 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgtta 20536256  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536255 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 21923902 - 21924049
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  21923902 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgtta 21924001  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21924002 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 21918992 - 21919121
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21918992 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21919091  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21919092 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22626882 - 22626736
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||   | |||||||||||||    
T  22626882 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgtta 22626784  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22626783 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22875211 - 22875065
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||||||| || ||    
T  22875211 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ttgttttgtatactgcctgtgttgctgctgcta 22875113  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22875112 tttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23406528 - 23406379
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgtt--gttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgt 196  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | |||||||||||    
T  23406528 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 23406429  T
Q  197 tatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23406428 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 18879210 - 18879352
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || |||||||||||||||     | |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  18879210 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 18879304  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18879305 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971257
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6520421 - 6520368
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6520421 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20498709 - 20498581
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||  |  ||||||| |||||    
T  20498709 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgcta-ttttacatactgcctatgttgctgtttgtt 20498611  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20498610 tattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 38855319 - 38855372
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38855319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 13508059 - 13508124
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||    
T  13508059 cattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 13508124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131117
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || |||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Original strand, 18678165 - 18678221
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  18678165 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648554
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||  || ||  |||||||||||||||||| | || |||||  |||   | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Original strand, 13597591 - 13597720
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |  ||||| || ||| ||  ||||||| |||||    
T  13597591 cattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat-gttttgcattctgcttatgttgctgattgtt 13597689  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagt 228  Q
    | ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  13597690 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17140969 - 17140916
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  17140969 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 17612084 - 17612149
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  17612084 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 17612149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21491048 - 21490995
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21491048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32121790 - 32121734
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  32121790 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285601
Alignment:
Q  125 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggt 222  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| | |||| | ||||||   | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  223 ctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199765
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  | |||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  196 ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  196 ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 5866342 - 5866395
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  5866342 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 21389518 - 21389571
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  21389518 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 21396048 - 21396101
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  21396048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 21778844 - 21778897
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  21778844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 21790541 - 21790594
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  21790541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 23760912 - 23760962
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  23760912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 983474 - 983512
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  983474 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 130
Target Start/End: Original strand, 24486063 - 24486093
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgaga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486063 cattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355815
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 12326 - 12469
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12326 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 12425  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12426 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 15118371 - 15118514
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15118371 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 15118470  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15118471 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 52312653 - 52312510
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52312653 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 52312554  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52312553 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19242842 - 19242693
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19242842 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttat 19242743  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 249  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242742 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 1837528 - 1837671
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1837528 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 1837627  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837628 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 18215293 - 18215436
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18215293 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 18215392  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18215393 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 18239438 - 18239581
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18239438 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttat 18239537  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18239538 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44615431 - 44615288
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44615431 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 44615332  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44615331 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 44773106 - 44773249
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44773106 cattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 44773205  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44773206 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 50222358 - 50222501
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50222358 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttat 50222457  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50222458 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 44928898 - 44929042
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44928898 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgtta 44928997  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44928998 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3515150 - 3515007
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  3515150 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtttt 3515051  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3515050 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 19618191 - 19618336
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19618191 cattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 19618290  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19618291 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 245
Target Start/End: Original strand, 14970727 - 14970871
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  14970727 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatt 14970826  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14970827 taactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 23803284 - 23803427
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  23803284 cattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 23803383  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23803384 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 51463887 - 51464030
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  51463887 cattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 51463986  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51463987 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44102357 - 44102214
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||  |||||||||    
T  44102357 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttat 44102258  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44102257 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 15355343 - 15355483
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15355343 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtta 15355442  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15355443 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798872
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12611086 - 12610950
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||       ||||| ||||||||||||||    
T  12611086 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-------tgttgtgttgctgttgttat 12610994  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12610993 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 21815604 - 21815731
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21815604 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttat 21815703  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  21815704 ttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280316
Alignment:
Q  125 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtct 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  225 aagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15367831 - 15367690
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15367831 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15367732  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15367731 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15370159 - 15370018
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15370159 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15370060  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15370059 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15402844 - 15402703
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15402844 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15402745  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15402744 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    ||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15371343 - 15371202
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15371343 ttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15371244  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15371243 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15373624 - 15373483
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15373624 ttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15373525  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15373524 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16223673 - 16223532
Alignment:
Q  106 ttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16223673 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 16223574  T
Q  205 taagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||| |||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||    
T  16223573 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20149973 - 20149832
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20149973 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgtcgctgttgtta 20149874  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    ||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20149873 ttttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 7641211 - 7641344
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||          ||||||||||||||    
T  7641211 cattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----------gttgctgttgttat 7641300  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7641301 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7798921 - 7798774
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  7798921 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 7798822  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798821 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12902904 - 12902757
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  12902904 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 12902805  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  12902804 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7089024 - 7088877
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  7089024 cattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 7088925  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7088924 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14038795 - 14038653
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  14038795 cattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgtta 14038696  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 241  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  14038695 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 16377497 - 16377639
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   | |||||||||||||    
T  16377497 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgtta 16377594  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  16377595 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7893850 - 7893703
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||||||    
T  7893850 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgtta 7893751  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7893750 tttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 16239944 - 16240090
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagtt-gctgttgtta 198  Q
    |||||||| || ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || ||| ||||||    
T  16239944 cattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctattttgctattgtta 16240042  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16240043 tttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873488
Alignment:
Q  128 agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaa 226  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  227 gttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  52873469 gttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22636582 - 22636437
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||| ||||||||    
T  22636582 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgtta 22636483  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22636482 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6900037 - 6899891
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||   | |||||| ||||||    
T  6900037 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 6899939  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6899938 tttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 16270210 - 16270356
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||| ||||||    
T  16270210 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctattgtta 16270308  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16270309 tttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44052976 - 44052829
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| ||||||||    
T  44052976 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgtta 44052877  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  44052876 tttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  161 tcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 239
Target Start/End: Original strand, 23374351 - 23374473
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23374351 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23374450  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    || | ||||||||| | ||||||    
T  23374451 gtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706409
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 43198527 - 43198661
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg-ctatttttgtatactgt-tgagttgctg-ttgt 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| |||||  |  ||||| ||| ||| |  ||||||| ||||    
T  43198527 cattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgt 43198626  T
Q  197 tatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43198627 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 13825 - 13890
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  13825 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 172
Target Start/End: Original strand, 15464908 - 15464977
Alignment:
Q  103 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttt 172  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15464908 tacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22353980 - 22353915
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  22353980 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatg 22353915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 52243168 - 52243302
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctat-ttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgt 196  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||   |  |||| ||||||  |  ||||||| ||||    
T  52243168 cattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgt 52243267  T
Q  197 tatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52243268 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15551870 - 15551817
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  15551870 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6190610 - 6190481
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatg-ttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgt 196  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||  |  ||||||| |||     
T  6190610 cattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttga 6190512  T
Q  197 tatttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6190511 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053422
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  | | || |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12774060 - 12774011
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12774060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17046540 - 17046487
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  17046540 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 12288278 - 12288316
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12288278 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13569551 - 13569502
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  13569551 ttgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 13569502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 245
Target Start/End: Original strand, 20157522 - 20157579
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||| |||||||    
T  20157522 tgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9556581 - 9556549
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556581 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 9556549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 11250622 - 11250654
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11250622 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 11250654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 15353368 - 15353400
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15353368 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 15353400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17810323 - 17810291
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810323 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 17810291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22353891 - 22353835
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||||    
T  22353891 tgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14090 - 13947
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14090 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13991  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13990 ttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 136823 - 136680
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  136823 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 136724  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  136723 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 139292 - 139149
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  139292 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 139193  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139192 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 144230 - 144087
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  144230 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 144131  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  144130 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 134354 - 134211
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  134354 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 134255  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  134254 ttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 141761 - 141618
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  141761 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 141662  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  141661 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11431 - 11286
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11431 cattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 11332  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  11331 ttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 61667 - 61699
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61667 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 61699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 65583 - 65615
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65583 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 65615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4837 - 4694
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4837 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 4738  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4737 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40543 - 40400
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40543 cattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 40444  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40443 ttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10772
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10916 cattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 10817  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10816 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9385 - 9241
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9385 cattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttat 9286  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9285 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 249 - 106
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  249 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 150  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  149 ttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30074 - 29931
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30074 attatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 29975  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagtt-gattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  29974 taactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16927 - 16784
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16927 cattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 16828  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16827 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 82215 - 82072
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  82215 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 82116  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  82115 ttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 22738 - 22776
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 501227 - 501088
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  501227 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttat 501128  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  501127 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 85598 - 85742
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  85598 cattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 85697  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  85698 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 160737 - 160688
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  160737 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9893 - 9744
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9893 cattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 9794  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgtcc 248  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9793 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33088 - 32942
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||| ||||||    
T  33088 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctattgtta 32990  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32989 tttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38907 - 38761
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||| ||||||    
T  38907 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 38809  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38808 tttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23029 - 22886
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23029 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactggtgtgttgctgttgttat 22930  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22929 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 12268 - 12413
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  12268 cattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttat 12367  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12368 ttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4214
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4358 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgtta 4259  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4258 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4440 - 4300
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4440 cattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 4341  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 79303 - 79430
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  79303 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttat 79402  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  79403 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 17189 - 17337
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctattttt--gtatactgttga-gttgctgttgt 196  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||   | |||||||||||    
T  17189 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgt 17288  T
Q  197 tatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17289 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12201 - 12064
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||      |    
T  12201 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------t 12108  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12107 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 26039 - 26179
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  26039 cattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 26138  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatg 239  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26139 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 20398 - 20524
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20398 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-ttgttttgtatactgatgtgttgctgttgttat 20496  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20497 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 128897 - 128751
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |  | ||  |||||| |||||||    
T  128897 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttgttat 128798  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  128797 ttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  101 attacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttatt 200  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 2147 - 2291
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2147 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 2246  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2247 tttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 18001 - 18066
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||    
T  18001 cattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 18066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Original strand, 161108 - 161252
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || || ||||||| ||    
T  161108 cattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgata 161207  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  161208 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 164
Target Start/End: Original strand, 164609 - 164674
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcat 164  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  164609 cattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 16574 - 16721
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  16574 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgtta 16673  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16674 tttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3306
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  3160 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 3259  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3260 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 240
Target Start/End: Original strand, 1299 - 1440
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||  ||||||||    
T  1299 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgtta 1398  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatga 240  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1399 tttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1169
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||    
T  1022 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 1121  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  1122 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 3125 - 3271
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||   | |||||||||||||    
T  3125 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgtta 3223  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3224 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4654 - 4508
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  4654 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgtta 4555  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4554 tttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12236 - 12090
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12236 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgtta 12137  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12136 tttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22188 - 22042
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  22188 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgtta 22089  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22088 tttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40004 - 39858
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   | |||||| ||||||    
T  40004 cattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 39906  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39905 tttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26042 - 25896
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |  |||||| ||||||    
T  26042 cattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctattgtta 25944  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25943 tttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1851
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  1998 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgtta 1899  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1898 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 52060 - 51913
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   | |||||||||||||    
T  52060 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgtta 51961  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51960 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 167952 - 168099
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||    
T  167952 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 168051  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  168052 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13358 - 13211
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||    
T  13358 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 13259  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  13258 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39623 - 39479
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  |||| ||||||||    
T  39623 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 39525  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  39524 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Original strand, 75189 - 75333
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  |||| ||||||||    
T  75189 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 75287  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgat 244  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  75288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4978 - 4849
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4978 tgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatga 4879  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  4878 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 32949 - 33077
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32949 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 33047  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33048 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46056 - 45928
Alignment:
Q  118 tgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgagttgctgttgttatttaactaagttgcatga 216  Q
    |||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  46056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 45958  T
Q  217 gttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45957 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16260 - 16113
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||| ||||   || ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||   | |||| ||||||||    
T  16260 cattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 16161  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16160 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 17390 - 17450
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17390 gttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3617 - 3470
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| | ||||    
T  3617 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagtta 3518  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3517 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 343
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||   ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   | |||  ||||||||    
T  489 cattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgtta 391  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  390 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28414
Alignment:
Q  128 agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaa 226  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  227 gttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  28433 gttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1997
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11345 - 11292
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  11345 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Original strand, 3504 - 3585
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 181  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3504 cattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 289
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8626 - 8479
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact-gttgagttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| || |  |||||  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |  |||||| ||||||    
T  8626 cattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgtta 8527  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8526 tttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 8507 - 8650
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctgttgttat 199  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |  || || ||||||    
T  8507 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgccta--tgttgctgttat 8603  T
Q  200 ttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8604 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6245
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact------gttgagttgctgt 193  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||      ||||  ||| |||    
T  6095 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttg--ttgttgt 6192  T
Q  194 tgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6193 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38820
Alignment:
Q  103 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatt 200  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||| | |||||||  | ||||||||| ||||||    
T  38679 tacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatt 38777  T
Q  201 taactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38778 taactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 4894 - 4954
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4894 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 167
Target Start/End: Original strand, 937 - 1003
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgct 167  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  937 cattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgct 1003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40031 - 39913
Alignment:
Q  128 agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaa 226  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||   | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40031 agatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaa 39933  T
Q  227 gttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  39932 gttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||  |  |||| || |||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtt 8515  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 231  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8514 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6588 - 6535
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  6588 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2099 - 1952
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    |||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   | || ||||||||||    
T  2099 cattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgtta 2000  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  1999 attaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Original strand, 24276 - 24406
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctat-ttttgtatactgttga-gttgctgttgtt 197  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  24276 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 24375  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24376 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4712
Alignment:
Q  156 ttatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13151 - 13092
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattat 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13151 cattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1155
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6611
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13991
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6244
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13239 - 13158
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 181  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13239 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  190 ctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34123
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15898
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178898
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Original strand, 27723 - 27795
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttt 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  27723 cattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgtttt 27795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32127 - 32067
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  32127 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 121826 - 121766
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  121826 gttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 174911 - 174767
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||   | ||||||||||  |  ||||||| |||||    
T  174911 cattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 174815  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||    
T  174814 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12040 - 11982
Alignment:
Q  169 tttttgtatactgttgagttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12040 ttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27977 - 27911
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgc 166  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27977 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  132 gttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagtt 229  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  230 gattaagatgatga 243  Q
    ||||||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 15299 - 15356
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15299 gttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1342 - 1289
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  1342 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7266
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 53523 - 53588
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  53523 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 53588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13557 - 13497
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13557 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11564
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  246 t 246  Q
    |    
T  11564 t 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15584
Alignment:
Q  147 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7351 - 7295
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  7351 gttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 10399 - 10544
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgtt-gtt 197  Q
    |||||||||||  |||| || ||| || |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||   | ||||||||| |||    
T  10399 cattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgtt 10495  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    | ||||||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  10496 aattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4545
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttga-gttgctgttgtta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| || || ||||  | ||| ||||||   | | || ||||||||    
T  4671 cattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgtta 4572  T
Q  199 tttaactaagttgcatgagttggtcta 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4571 tttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1086
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 8033 - 8098
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  8033 cattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11611 - 11546
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  11611 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 16074 - 16139
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  16074 cattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatg 16139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13276 - 13203
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattg-agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  13276 cattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 13203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 38230 - 38295
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  38230 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatg 38295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 225553 - 225482
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  225553 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23843
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2762
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1190
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  1137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 4287 - 4319
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4287 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 4319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45909
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 165
Target Start/End: Original strand, 45787 - 45831
Alignment:
Q  121 ataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatg 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  45787 ataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatg 45831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19317 - 19268
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19317 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Original strand, 51857 - 51985
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatg-ttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgagttgctg-ttgtt 197  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||   |  ||||| ||| |    
T  51857 cattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgtgctgtttgat 51955  T
Q  198 atttaactaagttgcatgagttggtctaag 227  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51956 gtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  125 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttt 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 129966 - 129919
Alignment:
Q  186 gttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  129966 gttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 243
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5246
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 159
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16332 - 16282
Alignment:
Q  196 ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  16332 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21920
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29812
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69794
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 2874 - 2923
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  2874 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12766
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12708 - 12643
Alignment:
Q  107 tgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttt 172  Q
    |||||||||| | | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  12708 tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 12643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6757 - 6676
Alignment:
Q  100 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 181  Q
    |||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  6757 cattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactg 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47048 - 46995
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  47048 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51635 - 51582
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgatgt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||||||    
T  51635 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 14765 - 14814
Alignment:
Q  193 ttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14765 ttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1937 - 1881
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  1937 gttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 3930 - 3962
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3930 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 3962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 5156 - 5188
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5156 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 5188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 7331 - 7363
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7331 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 10583 - 10639
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  10583 gttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 5004 - 5036
Alignment:
Q  186 gttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5004 gttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagt 5036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28887
Alignment:
Q  194 tgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 242  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 35997 - 36029
Alignment:
Q  188 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35997 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 36029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University