View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4782_low_8 (Length: 233)

Name: NF4782_low_8
Description: NF4782
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4782_low_8
NF4782_low_8
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (76-233)||(13212841-13212999)
chr1 (76-233)||(21346986-21347144)
chr1 (76-233)||(21342121-21342279)
chr1 (79-233)||(13988891-13989045)
chr1 (79-233)||(21475070-21475224)
chr1 (79-233)||(21923274-21923428)
chr1 (79-233)||(29776713-29776867)
chr1 (88-233)||(40389179-40389325)
chr1 (82-233)||(15859994-15860146)
chr1 (98-233)||(16361942-16362077)
chr1 (98-233)||(23593737-23593872)
chr1 (79-233)||(21840792-21840946)
chr1 (79-233)||(29298162-29298315)
chr1 (79-233)||(31612338-31612492)
chr1 (79-233)||(16275346-16275501)
chr1 (76-233)||(21707192-21707349)
chr1 (76-233)||(21711734-21711891)
chr1 (79-233)||(22123050-22123205)
chr1 (75-233)||(45574821-45574980)
chr1 (76-233)||(433037-433193)
chr1 (152-233)||(50210223-50210306)
chr1 (98-196)||(21861527-21861624)
chr1 (98-196)||(21896213-21896310)
chr1 (152-233)||(34509808-34509891)
chr1 (98-233)||(27250686-27250822)
chr1 (30-74)||(23633068-23633112)
chr1 (41-74)||(12785283-12785316)
chr1 (98-131)||(16758781-16758814)
chr1 (98-196)||(35261038-35261132)
chr1 (30-74)||(9132394-9132438)
chr1 (98-170)||(12271647-12271717)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (79-233)||(15355307-15355462)
chr4 (76-233)||(15367718-15367876)
chr4 (76-233)||(15402731-15402889)
chr4 (76-233)||(15371230-15371388)
chr4 (76-233)||(15373511-15373669)
chr4 (76-233)||(15370046-15370203)
chr4 (79-233)||(15118335-15118489)
chr4 (75-233)||(18215253-18215411)
chr4 (79-233)||(52312535-52312689)
chr4 (76-233)||(16223560-16223718)
chr4 (83-233)||(12294-12444)
chr4 (79-233)||(44615313-44615467)
chr4 (79-233)||(44773070-44773224)
chr4 (77-233)||(21815566-21815722)
chr4 (98-233)||(19242724-19242859)
chr4 (98-233)||(50222341-50222476)
chr4 (79-233)||(1837492-1837646)
chr4 (79-233)||(18239402-18239556)
chr4 (79-233)||(19618155-19618309)
chr4 (75-233)||(51463847-51464005)
chr4 (88-233)||(20149854-20150000)
chr4 (76-233)||(44102239-44102396)
chr4 (79-233)||(3515032-3515186)
chr4 (79-233)||(7641175-7641319)
chr4 (75-233)||(12610975-12611126)
chr4 (79-233)||(14970690-14970844)
chr4 (75-233)||(23803244-23803402)
chr4 (98-233)||(44928881-44929017)
chr4 (160-233)||(8574887-8574960)
chr4 (152-233)||(14280341-14280423)
chr4 (88-186)||(22353910-22354007)
chr4 (136-233)||(14038676-14038774)
chr4 (98-196)||(13808-13905)
chr4 (98-233)||(16377480-16377614)
chr4 (152-233)||(54798764-54798847)
chr4 (98-233)||(16270193-16270328)
chr4 (98-233)||(43198510-43198648)
chr4 (152-233)||(52873377-52873460)
chr4 (152-233)||(6899919-6900001)
chr4 (153-233)||(7798802-7798884)
chr4 (98-233)||(7088905-7089041)
chr4 (98-233)||(12902785-12902921)
chr4 (98-233)||(22636463-22636599)
chr4 (30-74)||(15703750-15703794)
chr4 (152-196)||(16239980-16240024)
chr4 (152-231)||(7893733-7893814)
chr4 (97-170)||(15464887-15464959)
chr4 (31-74)||(11150609-11150652)
chr4 (31-78)||(42597259-42597306)
chr4 (28-66)||(13885306-13885344)
chr4 (29-74)||(23973129-23973174)
chr4 (41-74)||(25127127-25127160)
chr4 (98-170)||(52243151-52243222)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (76-233)||(2108-2266)
scaffold0247 (98-233)||(17984-18120)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (76-233)||(85559-85717)
scaffold0001 (79-233)||(501109-501263)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (79-233)||(20046178-20046332)
chr8 (79-233)||(1484427-1484581)
chr8 (79-233)||(5853275-5853429)
chr8 (79-233)||(20403252-20403406)
chr8 (98-233)||(45290696-45290832)
chr8 (79-233)||(14409427-14409581)
chr8 (79-233)||(15203214-15203368)
chr8 (79-233)||(22001778-22001932)
chr8 (76-232)||(19801362-19801517)
chr8 (79-233)||(16413299-16413453)
chr8 (79-233)||(19936988-19937143)
chr8 (76-233)||(41598213-41598370)
chr8 (79-233)||(4483306-4483459)
chr8 (79-233)||(19896290-19896447)
chr8 (79-233)||(4542356-4542510)
chr8 (79-233)||(14823798-14823952)
chr8 (99-233)||(15070583-15070718)
chr8 (79-230)||(26223947-26224098)
chr8 (75-188)||(25484254-25484366)
chr8 (152-233)||(26219742-26219823)
chr8 (152-233)||(26225303-26225384)
chr8 (98-233)||(6759286-6759419)
chr8 (98-233)||(22875093-22875228)
chr8 (152-233)||(16092352-16092435)
chr8 (152-233)||(22626764-22626846)
chr8 (79-145)||(24486027-24486093)
chr8 (98-233)||(13597574-13597710)
chr8 (152-233)||(23406407-23406490)
chr8 (163-233)||(31971285-31971356)
chr8 (98-233)||(13508042-13508178)
chr8 (152-233)||(7372806-7372889)
chr8 (152-233)||(28649054-28649137)
chr8 (79-133)||(32810056-32810110)
chr8 (74-170)||(20498655-20498751)
chr8 (30-74)||(9882578-9882622)
chr8 (31-74)||(12577139-12577182)
chr8 (152-233)||(18818419-18818502)
chr8 (152-233)||(21919010-21919093)
chr8 (152-233)||(21923938-21924021)
chr8 (98-196)||(17612067-17612164)
chr8 (98-233)||(20536236-20536372)
chr8 (41-78)||(12577180-12577217)
chr8 (163-233)||(16199666-16199737)
chr8 (30-74)||(40387813-40387857)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (76-233)||(4239-4396)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (76-233)||(16809-16966)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (88-233)||(16448518-16448664)
chr6 (79-233)||(2291163-2291317)
chr6 (79-233)||(12742342-12742496)
chr6 (79-233)||(19005071-19005225)
chr6 (79-233)||(19858902-19859056)
chr6 (79-233)||(24422572-24422726)
chr6 (79-233)||(33861819-33861973)
chr6 (79-233)||(33864303-33864457)
chr6 (76-233)||(18456744-18456901)
chr6 (79-233)||(8055054-8055208)
chr6 (79-233)||(18334575-18334729)
chr6 (75-233)||(22782252-22782410)
chr6 (79-233)||(1540894-1541048)
chr6 (79-233)||(1595574-1595728)
chr6 (79-233)||(26924623-26924777)
chr6 (79-233)||(34963398-34963552)
chr6 (43-233)||(3851962-3852154)
chr6 (75-233)||(20556873-20557029)
chr6 (75-233)||(25754834-25754992)
chr6 (79-233)||(30676693-30676847)
chr6 (106-233)||(18461904-18462031)
chr6 (79-233)||(25656654-25656808)
chr6 (79-233)||(25688527-25688681)
chr6 (136-233)||(19303536-19303633)
chr6 (98-233)||(18409784-18409920)
chr6 (99-233)||(29060568-29060703)
chr6 (152-233)||(20076728-20076810)
chr6 (76-133)||(19847929-19847986)
chr6 (136-231)||(20593803-20593899)
chr6 (98-233)||(25629312-25629448)
chr6 (185-233)||(18821889-18821937)
chr6 (105-196)||(20109205-20109295)
chr6 (98-233)||(25644348-25644485)
chr6 (98-233)||(20360917-20361053)
chr6 (152-233)||(16496272-16496355)
chr6 (152-233)||(17287806-17287889)
chr6 (30-73)||(27572970-27573013)
chr6 (98-196)||(8227468-8227565)
chr6 (157-233)||(20638298-20638376)
chr6 (152-196)||(23019473-23019517)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (76-233)||(10775656-10775813)
chr5 (88-233)||(18319025-18319171)
chr5 (79-233)||(29329959-29330113)
chr5 (88-229)||(24067136-24067278)
chr5 (79-233)||(264751-264905)
chr5 (79-233)||(10732923-10733077)
chr5 (79-233)||(39363409-39363563)
chr5 (81-233)||(11581184-11581336)
chr5 (76-233)||(36154763-36154917)
chr5 (76-233)||(2154593-2154751)
chr5 (76-233)||(20901988-20902146)
chr5 (79-233)||(20909037-20909191)
chr5 (79-233)||(29346005-29346159)
chr5 (79-233)||(39245161-39245315)
chr5 (79-233)||(42245348-42245502)
chr5 (79-233)||(29348478-29348632)
chr5 (79-233)||(29350951-29351105)
chr5 (79-233)||(32027418-32027572)
chr5 (77-233)||(31061093-31061250)
chr5 (99-233)||(23064536-23064671)
chr5 (100-233)||(38619459-38619593)
chr5 (79-233)||(20917935-20918085)
chr5 (18-89)||(14048111-14048182)
chr5 (98-233)||(22144077-22144213)
chr5 (98-233)||(23390453-23390589)
chr5 (155-233)||(21997547-21997627)
chr5 (152-202)||(20766130-20766180)
chr5 (152-233)||(22412212-22412294)
chr5 (136-230)||(9077983-9078078)
chr5 (152-233)||(24529248-24529331)
chr5 (152-233)||(25421560-25421643)
chr5 (152-233)||(25431422-25431505)
chr5 (152-233)||(24493597-24493679)
chr5 (98-233)||(1096495-1096631)
chr5 (30-78)||(29496848-29496896)
chr5 (152-233)||(21729074-21729157)
chr5 (152-233)||(21808399-21808482)
chr5 (152-233)||(13025339-13025421)
chr5 (152-233)||(13095523-13095605)
chr5 (157-233)||(8286857-8286936)
chr5 (98-150)||(40725965-40726017)
chr5 (152-233)||(22075047-22075130)
chr5 (31-74)||(29496804-29496847)
chr5 (18-49)||(41095667-41095698)
chr5 (30-74)||(29496758-29496802)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (79-233)||(24702263-24702417)
chr7 (79-233)||(456346-456500)
chr7 (79-233)||(11393270-11393424)
chr7 (79-233)||(11972521-11972675)
chr7 (79-233)||(15376696-15376850)
chr7 (79-233)||(16232545-16232699)
chr7 (79-233)||(20385106-20385260)
chr7 (79-233)||(21189578-21189732)
chr7 (79-233)||(27216885-27217039)
chr7 (79-233)||(32125516-32125670)
chr7 (79-233)||(41522942-41523096)
chr7 (79-233)||(41525404-41525558)
chr7 (79-233)||(14949105-14949259)
chr7 (79-233)||(18640297-18640451)
chr7 (79-233)||(24704713-24704864)
chr7 (76-233)||(44116534-44116691)
chr7 (79-233)||(16410084-16410238)
chr7 (80-233)||(3386358-3386511)
chr7 (76-233)||(38898356-38898514)
chr7 (79-233)||(18430737-18430891)
chr7 (76-233)||(17061895-17062052)
chr7 (76-227)||(12756651-12756802)
chr7 (75-233)||(13647353-13647512)
chr7 (79-233)||(16213709-16213863)
chr7 (99-233)||(13869371-13869506)
chr7 (109-233)||(24275196-24275320)
chr7 (81-233)||(20110581-20110723)
chr7 (79-202)||(26355966-26356089)
chr7 (79-202)||(26358418-26358541)
chr7 (75-166)||(15081928-15082019)
chr7 (98-233)||(18456370-18456505)
chr7 (135-233)||(13831398-13831496)
chr7 (98-233)||(38227509-38227644)
chr7 (136-233)||(3564359-3564457)
chr7 (139-229)||(48273421-48273512)
chr7 (98-196)||(2280076-2280173)
chr7 (152-233)||(10589067-10589150)
chr7 (98-233)||(12698859-12698996)
chr7 (30-74)||(11509575-11509619)
chr7 (30-74)||(11509620-11509664)
chr7 (98-170)||(15113036-15113106)
chr7 (157-233)||(9509217-9509295)
chr7 (98-196)||(19486701-19486798)
chr7 (98-170)||(15116573-15116643)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (75-233)||(8899119-8899277)
chr3 (79-233)||(17463203-17463357)
chr3 (79-233)||(38961874-38962028)
chr3 (79-233)||(45606890-45607044)
chr3 (76-233)||(12119704-12119862)
chr3 (79-233)||(7781330-7781484)
chr3 (79-233)||(17446638-17446792)
chr3 (79-233)||(34159351-34159505)
chr3 (79-233)||(55476516-55476670)
chr3 (76-233)||(53070633-53070790)
chr3 (79-233)||(6469117-6469271)
chr3 (79-233)||(9707590-9707744)
chr3 (79-233)||(10247706-10247860)
chr3 (79-233)||(16282794-16282948)
chr3 (79-233)||(16454264-16454418)
chr3 (79-233)||(28848594-28848748)
chr3 (75-233)||(50242847-50243005)
chr3 (79-233)||(41123915-41124066)
chr3 (98-233)||(8499543-8499679)
chr3 (79-233)||(13151773-13151928)
chr3 (79-233)||(13154238-13154393)
chr3 (98-233)||(29172585-29172720)
chr3 (79-233)||(12567585-12567739)
chr3 (79-233)||(13544050-13544204)
chr3 (76-233)||(17672651-17672808)
chr3 (75-233)||(43550457-43550616)
chr3 (99-233)||(15412454-15412589)
chr3 (127-233)||(15977540-15977646)
chr3 (152-233)||(21618474-21618555)
chr3 (152-233)||(36166623-36166704)
chr3 (152-233)||(55500967-55501049)
chr3 (140-233)||(10557010-10557104)
chr3 (136-233)||(40213716-40213813)
chr3 (98-233)||(14972882-14973018)
chr3 (76-142)||(17248221-17248287)
chr3 (152-233)||(24153219-24153301)
chr3 (160-233)||(44494834-44494908)
chr3 (98-233)||(24340680-24340816)
chr3 (98-233)||(53301507-53301644)
chr3 (163-233)||(14572617-14572688)
chr3 (98-233)||(17487884-17488020)
chr3 (98-233)||(17499366-17499502)
chr3 (98-233)||(27165275-27165411)
chr3 (98-233)||(42386438-42386574)
chr3 (98-233)||(14576790-14576925)
chr3 (152-233)||(12399237-12399320)
chr3 (152-233)||(43840960-43841043)
chr3 (98-233)||(13442302-13442438)
chr3 (98-170)||(2051156-2051227)
chr3 (30-74)||(52466284-52466328)
chr3 (163-233)||(11424781-11424852)
chr3 (152-233)||(18438562-18438645)
chr3 (152-233)||(25476395-25476478)
chr3 (152-233)||(26686915-26686998)
chr3 (157-233)||(20698450-20698528)
chr3 (98-196)||(23274754-23274851)
chr3 (98-196)||(37642222-37642319)
chr3 (30-74)||(3472734-3472778)
chr3 (30-74)||(3586252-3586296)
chr3 (98-150)||(22147482-22147534)
chr3 (98-170)||(52523684-52523755)
chr3 (161-233)||(17737261-17737337)
chr3 (152-233)||(23083371-23083454)
chr3 (41-74)||(39728092-39728125)
chr3 (30-78)||(18539019-18539067)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (76-233)||(20360-20515)
scaffold0031 (152-188)||(128825-128861)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (79-233)||(20772-20926)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (79-233)||(37846-38000)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (79-233)||(94436-94590)
scaffold0023 (79-233)||(17423-17577)
scaffold0023 (99-233)||(44479-44614)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (79-233)||(158433-158587)
scaffold0003 (152-233)||(339960-340040)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (79-233)||(18808968-18809122)
chr2 (79-233)||(23709515-23709669)
chr2 (79-233)||(23711996-23712150)
chr2 (79-233)||(24367799-24367953)
chr2 (79-233)||(39682338-39682492)
chr2 (75-232)||(32039477-32039634)
chr2 (79-233)||(571422-571576)
chr2 (79-233)||(6726020-6726174)
chr2 (79-233)||(21155043-21155197)
chr2 (79-233)||(23130887-23131041)
chr2 (79-233)||(23133354-23133508)
chr2 (79-233)||(34402505-34402659)
chr2 (74-233)||(43137324-43137483)
chr2 (79-233)||(23135615-23135769)
chr2 (79-233)||(24898178-24898333)
chr2 (79-233)||(24900661-24900816)
chr2 (79-233)||(24903138-24903293)
chr2 (79-233)||(24905615-24905770)
chr2 (79-233)||(24908090-24908245)
chr2 (98-233)||(38967399-38967535)
chr2 (79-233)||(26505404-26505558)
chr2 (79-233)||(26507882-26508036)
chr2 (79-233)||(28577124-28577278)
chr2 (79-233)||(32214904-32215058)
chr2 (79-233)||(45029837-45029991)
chr2 (79-233)||(22105437-22105592)
chr2 (76-233)||(24529508-24529666)
chr2 (75-174)||(24642835-24642933)
chr2 (98-196)||(7690-7787)
chr2 (81-233)||(19671858-19672010)
chr2 (98-233)||(23060541-23060677)
chr2 (75-133)||(22173808-22173866)
chr2 (98-233)||(23708576-23708712)
chr2 (163-233)||(38136-38207)
chr2 (152-233)||(23076470-23076553)
chr2 (98-233)||(22337143-22337279)
chr2 (185-233)||(24643039-24643087)
chr2 (98-167)||(22459519-22459587)
chr2 (31-78)||(37379729-37379776)
chr2 (157-233)||(22731249-22731327)
chr2 (30-74)||(16092613-16092657)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (79-233)||(4719-4873)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (79-233)||(13972-14126)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (79-233)||(134236-134390)
scaffold0028 (79-233)||(136705-136859)
scaffold0028 (79-233)||(139174-139328)
scaffold0028 (79-233)||(144112-144266)
scaffold0028 (79-233)||(141643-141797)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (76-233)||(161069-161227)
scaffold0007 (76-180)||(164570-164674)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (75-229)||(135-289)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (79-233)||(13417-13571)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (75-233)||(1259-1418)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (76-233)||(29957-30114)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (78-233)||(9774-9930)
scaffold0145 (98-233)||(32970-33105)
scaffold0145 (157-231)||(38791-38866)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (79-233)||(10798-10952)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (79-233)||(9267-9421)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (76-233)||(4322-4479)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (76-233)||(79264-79421)
scaffold0056 (152-233)||(17225-17310)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (79-233)||(40425-40579)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (75-233)||(82097-82255)
scaffold0037 (100-233)||(22630-22763)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (75-233)||(12089-12241)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (79-233)||(11313-11467)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (79-229)||(12232-12382)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (152-233)||(116455-116536)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (98-233)||(3108-3243)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (98-233)||(22911-23046)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (98-233)||(38659-38795)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (98-196)||(53506-53603)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (101-174)||(13093-13165)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (98-233)||(39505-39640)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (98-233)||(75172-75307)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (152-233)||(16610-16693)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (152-233)||(44717-44800)
scaffold0122 (140-233)||(26064-26158)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (98-233)||(1879-2015)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (98-233)||(39941-40076)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (105-233)||(8494-8623)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (76-150)||(12041-12115)
scaffold0503 (181-233)||(11991-12044)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (152-233)||(32967-33049)
scaffold0120 (152-233)||(45956-46038)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (98-233)||(4536-4671)
scaffold0228 (98-233)||(12118-12253)
scaffold0228 (98-233)||(22070-22205)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (98-233)||(13239-13375)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (98-233)||(25924-26059)
scaffold0026 (98-233)||(39886-40021)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (163-233)||(13525-13596)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (98-196)||(3487-3585)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (163-233)||(15485-15556)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (98-196)||(12635-12731)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (98-196)||(225474-225570)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (98-233)||(11492-11628)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (98-195)||(16057-16153)
scaffold0357 (98-196)||(13195-13293)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (98-195)||(27706-27802)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (98-233)||(38213-38349)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (111-233)||(1980-2103)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (28-76)||(22672-22720)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (152-233)||(4877-4960)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (152-233)||(28442-28525)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (152-233)||(51941-52024)
scaffold0011 (98-233)||(167936-168071)
[»] scaffold0281 (1 HSPs)
scaffold0281 (28-74)||(997-1043)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (98-233)||(1006-1141)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (29-74)||(15544-15589)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (160-233)||(3204-3279)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (98-181)||(27912-27994)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (163-233)||(32095-32165)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (98-233)||(24259-24396)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (79-133)||(6072-6126)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (98-233)||(3498-3634)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 13212841 - 13212999
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13212841 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 13212940  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13212941 gtcatgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13212999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21346986
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21347144 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 21347045  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21347044 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21346986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21342279 - 21342121
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21342279 atgatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 21342180  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342179 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21342121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13989045 - 13988891
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13989045 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13988947  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13988946 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13988891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 21475070 - 21475224
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21475070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21475168  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475169 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21475224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 21923274 - 21923428
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21923274 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21923372  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923373 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21923428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29776867 - 29776713
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29776867 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29776769  T
Q  179 atgtt-gttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29776768 atgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29776713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40389325 - 40389179
Alignment:
Q  88 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  40389325 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 40389226  T
Q  187 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40389225 ttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagt 40389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 15859994 - 15860146
Alignment:
Q  82 tgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg 181  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15859994 tgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatg 15860093  T
Q  182 ttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15860094 ttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15860146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16362077 - 16361942
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttg-tatactg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  16362077 tgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactg 16361979  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361978 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 16361942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 23593737 - 23593872
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  23593737 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 23593835  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593836 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23593872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21840946 - 21840792
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21840946 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21840848  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21840847 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21840792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29298315 - 29298162
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  29298315 atttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatt-attc 29298218  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29298217 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29298162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31612492 - 31612338
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31612492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 31612394  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31612393 atgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 31612338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 16275346 - 16275501
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16275346 atttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtc 16275445  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  16275446 atgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagt 16275501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21707349 - 21707192
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  21707349 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattct 21707251  T
Q  176 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21707250 gtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21707192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21711891 - 21711734
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  21711891 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattct 21711793  T
Q  176 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21711792 gtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 21711734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 22123050 - 22123205
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22123050 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22123148  T
Q  179 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22123149 atgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagt 22123205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 45574821 - 45574980
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45574821 tatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattatta 45574919  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || ||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45574920 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45574980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433037
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgtt-atatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 433095  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     ||| || || ||||||||||||  |||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  433094 tgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgt---tgccgttatttaactaagctgcatgagt 433037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 50210223 - 50210306
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50210223 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50210306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 21861527 - 21861624
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  21861527 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 21861624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 21896213 - 21896310
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||    
T  21896213 tgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactg 21896310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34509891 - 34509808
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34509891 ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34509808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 27250686 - 27250822
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  27250686 tgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 27250784  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27250785 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 23633068 - 23633112
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23633068 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 23633112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12785316 - 12785283
Alignment:
Q  41 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12785316 tgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 12785283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16758814 - 16758781
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16758814 tgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16758781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 35261038 - 35261132
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||  |||||| ||||||    |||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  35261038 tgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat----ttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 35261132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 9132394 - 9132438
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9132394 gatgtgctatttgaagatgtgtggtttaaatacgtgttatataaa 9132438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12271717 - 12271647
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12271717 tgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgat-gacttgcatttgatatt 12271647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 15355307 - 15355462
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15355307 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15355406  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15355407 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15355462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15367876 - 15367718
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15367876 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 15367777  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15367776 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15367718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15402889 - 15402731
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15402889 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 15402790  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15402789 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15402731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15371388 - 15371230
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15371388 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattat 15371289  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15371288 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15371230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15373669 - 15373511
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15373669 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattat 15373570  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15373569 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15373511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15370203 - 15370046
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15370203 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 15370105  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15370104 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15370046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 15118335 - 15118489
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15118335 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 15118433  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15118434 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15118489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215411
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215253 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 18215351  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18215352 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18215411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52312689 - 52312535
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52312689 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 52312591  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52312590 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 52312535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16223718 - 16223560
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16223718 atgatgtgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattat 16223619  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16223618 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16223560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Original strand, 12294 - 12444
Alignment:
Q  83 gatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgt 182  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12294 gatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 12392  T
Q  183 tg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12393 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44615467 - 44615313
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44615467 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 44615369  T
Q  179 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44615368 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44615313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 44773070 - 44773224
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44773070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 44773168  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44773169 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44773224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Original strand, 21815566 - 21815722
Alignment:
Q  77 tgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaag 176  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  21815566 tgatttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattattatg 21815664  T
Q  177 tcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21815665 tcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagt 21815722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19242859 - 19242724
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  19242859 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 19242761  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19242760 ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19242724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 50222341 - 50222476
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||    
T  50222341 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatg 50222439  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50222440 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50222476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 1837492 - 1837646
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  1837492 atttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattattatgtc 1837590  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837591 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1837646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 18239402 - 18239556
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18239402 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18239500  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18239501 atgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18239556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 19618155 - 19618309
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19618155 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19618253  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19618254 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19618309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51464005
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  51463847 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 51463945  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51463946 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 51464005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20150000 - 20149854
Alignment:
Q  88 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  20150000 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 20149901  T
Q  187 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  20149900 ttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagt 20149854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44102396 - 44102239
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  44102396 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-tttacttgcatttgatattattat 44102298  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44102297 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagt 44102239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3515186 - 3515032
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3515186 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 3515088  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     || || |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3515087 ttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagt 3515032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 7641175 - 7641319
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7641175 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 7641273  T
Q  179 atgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7641274 atgttgttt---------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7641319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12611126 - 12610975
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12611126 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 12611028  T
Q  175 agtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| ||||||      |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12611027 tgtcatgctgtttt------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12610975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 14970690 - 14970844
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14970690 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14970788  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14970789 atgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14970844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 23803244 - 23803402
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23803244 tatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 23803342  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23803343 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23803402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 44928881 - 44929017
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  44928881 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgtt-attgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactg 44928979  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44928980 cttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44929017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Original strand, 8574887 - 8574960
Alignment:
Q  160 catttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8574887 catttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8574960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14280423 - 14280341
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14280423 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22354007 - 22353910
Alignment:
Q  88 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtt 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  22354007 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgtt 22353910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14038774 - 14038676
Alignment:
Q  136 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14038774 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14038676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 13808 - 13905
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  13808 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 13905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 16377480 - 16377614
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  16377480 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgc 16377577  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16377578 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16377614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 54798764 - 54798847
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  54798764 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 16270193 - 16270328
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  16270193 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 16270291  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16270292 ctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 16270328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 43198510 - 43198648
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg--ttgttttgtatact 195  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||  |||||  |||||||| ||| |    
T  43198510 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattga-tgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatatt 43198608  T
Q  196 gt-tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    || | ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43198609 gtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 43198648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 52873377 - 52873460
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52873377 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 52873460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6900001 - 6899919
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  6900001 ttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagt 6899919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7798884 - 7798802
Alignment:
Q  153 tgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7798884 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7089041 - 7088905
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||| |||| | ||||  | ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  7089041 tgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 7088943  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7088942 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7088905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12902921 - 12902785
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || || || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12902921 tgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 12902823  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12902822 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22636599 - 22636463
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  22636599 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactg 22636501  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22636500 tctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15703794 - 15703750
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15703794 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 15703750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Original strand, 16239980 - 16240024
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16239980 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 16240024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7893814 - 7893733
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatga 231  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7893814 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 7893733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Original strand, 15464887 - 15464959
Alignment:
Q  97 ttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  15464887 ttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatatt 15464959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11150652 - 11150609
Alignment:
Q  31 atgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11150652 atgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 11150609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 42597259 - 42597306
Alignment:
Q  31 atgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 78  Q
    |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42597259 atgtactatttgaagatgtatgatttaaagatgtgttatataaatatg 42597306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 66
Target Start/End: Original strand, 13885306 - 13885344
Alignment:
Q  28 ttgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgt 66  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13885306 ttgatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgt 13885344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23973174 - 23973129
Alignment:
Q  29 tgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23973174 tgatgtgctatttgaaattgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 23973129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Original strand, 25127127 - 25127160
Alignment:
Q  41 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25127127 tgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 25127160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 52243151 - 52243222
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||  |||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  52243151 tgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgaatttcatttgatatt 52243222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2266
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  2108 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattat 2207  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2208 gtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagt 2266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 17984 - 18120
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| |||| || ||| ||     
T  17984 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataatgc 18082  T
Q  197 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  18083 atatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 18120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 85559 - 85717
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  85559 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattat 85658  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85659 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 85717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 501263 - 501109
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  501263 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 501165  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  501164 atgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 501109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 20046178 - 20046332
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20046178 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20046276  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20046277 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20046332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1484581 - 1484427
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1484581 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 1484483  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1484482 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1484427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 5853275 - 5853429
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5853275 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 5853373  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5853374 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 5853429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20403406 - 20403252
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20403406 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20403308  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20403307 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20403252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 45290696 - 45290832
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  45290696 tgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 45290795  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290796 ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45290832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 14409427 - 14409581
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14409427 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14409525  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14409526 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14409581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 15203214 - 15203368
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15203214 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtc 15203312  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15203313 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15203368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22001932 - 22001778
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22001932 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22001834  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22001833 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22001778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 232
Target Start/End: Original strand, 19801362 - 19801517
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    |||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  19801362 atgacttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcgtttgatattattat 19801460  T
Q  176 gtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgag 232  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19801461 gtcatgctgttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgag 19801517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 16413299 - 16413453
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16413299 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16413397  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16413398 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16413453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 19936988 - 19937143
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19936988 atttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtc 19937087  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19937088 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19937143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598213
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41598370 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 41598272  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41598271 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagt 41598213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4483459 - 4483306
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4483459 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4483361  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4483360 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagt 4483306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19896447 - 19896290
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttga---tattattaa 175  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||     
T  19896447 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattattat 19896349  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19896348 gtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19896290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 4542356 - 4542510
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4542356 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4542454  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4542455 atgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 4542510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14823952 - 14823798
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14823952 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14823854  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  14823853 atgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt 14823798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15070718 - 15070583
Alignment:
Q  99 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  15070718 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15070619  T
Q  198 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15070618 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15070583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223947
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26224000  T
Q  179 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatg 230  Q
    ||| |  ||||||||| || | | | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26223999 atgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatg 26223947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Original strand, 25484254 - 25484366
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25484254 tatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 25484352  T
Q  175 agtcatgttgtttt 188  Q
     |||||| ||||||    
T  25484353 tgtcatgctgtttt 25484366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26219823 - 26219742
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26219823 ttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26219742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 26225303 - 26225384
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26225303 ttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26225384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6759419 - 6759286
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6759419 tgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttga----cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 6759324  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6759323 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 6759286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22875228 - 22875093
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22875228 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 22875130  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22875129 ctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagt 22875093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 16092352 - 16092435
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092352 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22626846 - 22626764
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22626846 ttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22626764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Original strand, 24486027 - 24486093
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgaga 145  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24486027 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 13597574 - 13597710
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| ||||||| || |||     
T  13597574 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcattctgc 13597672  T
Q  197 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    || ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  13597673 ttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 13597710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23406490 - 23406407
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23406490 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23406407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971285
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 31971285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 13508042 - 13508178
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| |||| || ||| ||     
T  13508042 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatattgc 13508140  T
Q  197 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  13508141 ctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 13508178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7372889 - 7372806
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7372889 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 28649054 - 28649137
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28649054 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagt 28649137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32810110 - 32810056
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 133  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32810110 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgt 32810056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20498751 - 20498655
Alignment:
Q  74 atatgatttgatgatgtt-atatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    ||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20498751 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatatt 20498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9882622 - 9882578
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9882622 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 9882578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12577182 - 12577139
Alignment:
Q  31 atgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12577182 atgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 12577139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 18818419 - 18818502
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18818419 ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 21919010 - 21919093
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21919010 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 21923938 - 21924021
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923938 ttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 17612067 - 17612164
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  17612067 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 17612164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20536372 - 20536236
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  20536372 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 20536274  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536273 cctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12577217 - 12577180
Alignment:
Q  41 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12577217 tgaagatgtgtgatttaaagatgtattatataaatatg 12577180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199737
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt-gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16199737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 40387857 - 40387813
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40387857 gatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgagttatataaa 40387813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4396 - 4239
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4396 atgatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 4298  T
Q  176 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4297 gtcatgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagt 4239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16966 - 16809
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16966 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 16868  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16867 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Original strand, 16448518 - 16448664
Alignment:
Q  88 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  16448518 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 16448617  T
Q  187 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448618 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16448664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 2291163 - 2291317
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2291163 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 2291261  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2291262 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 2291317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12742496 - 12742342
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12742496 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 12742398  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12742397 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19005225 - 19005071
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19005225 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19005127  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19005126 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19005071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19859056
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19858902 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19859000  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19859001 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 19859056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24422726 - 24422572
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24422726 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24422628  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24422627 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24422572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33861973 - 33861819
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33861973 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 33861875  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33861874 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 33861819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33864457 - 33864303
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33864457 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 33864359  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33864358 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 33864303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456744
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18456901 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 18456803  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456802 gtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18456744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8055208 - 8055054
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8055208 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 8055110  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8055109 atgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8055054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 18334575 - 18334729
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18334575 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18334673  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18334674 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18334729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22782410 - 22782252
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782410 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 22782312  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782311 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22782252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 1540894 - 1541048
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1540894 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 1540992  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1540993 atactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1541048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1595728 - 1595574
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  1595728 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgaattgcatttgatattattatgtc 1595630  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1595629 atgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1595574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 26924623 - 26924777
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26924623 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26924721  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26924722 atgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26924777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34963552 - 34963398
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34963552 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34963454  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34963453 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 34963398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 3851962 - 3852154
Alignment:
Q  43 aagatgtgtgctttaaagatgtgttatataa--atatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataat 140  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | |  || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3851962 aagatgtgttatttaaagatgtgttatttgatgatgtgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 3852061  T
Q  141 tgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3852062 tgagacgttg-ttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagt 3852154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20557029
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga--aattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 20556969  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20556970 tgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20557029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25754992 - 25754834
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25754992 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 25754894  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25754893 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 25754834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 30676693 - 30676847
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  30676693 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatatc 30676791  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30676792 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 30676847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461904
Alignment:
Q  106 ttgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcg 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttg 18461933  T
Q  205 ctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18461932 ctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25656808 - 25656654
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25656808 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 25656710  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656709 atgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 25656654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25688681 - 25688527
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    ||||| || ||||||||  |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  25688681 atttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatattattatgtc 25688583  T
Q  179 atgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25688582 atgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 25688527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303633
Alignment:
Q  136 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatac-tgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 18409784 - 18409920
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||||||   |  || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18409784 tgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactg 18409882  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18409883 cctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagt 18409920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060568
Alignment:
Q  99 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg- 196  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc 29060605  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29060604 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29060568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20076810 - 20076728
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20076810 ttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20076728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847986
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 133  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgt 19847986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593803
Alignment:
Q  136 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatga 231  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20593899 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatga 20593803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 25629312 - 25629448
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25629312 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactg 25629410  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      |||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25629411 catgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagt 25629448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 18821889 - 18821937
Alignment:
Q  185 ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18821889 ttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18821937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109205
Alignment:
Q  105 attgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactg 20109205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25644485 - 25644348
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||  ||| | || ||||| ||||||    
T  25644485 tgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactg 25644387  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25644386 cctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagt 25644348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 20360917 - 20361053
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||    
T  20360917 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctg 20361015  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20361016 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16496355 - 16496272
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16496355 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 17287806 - 17287889
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgt-tttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||   | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17287806 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Original strand, 27572970 - 27573013
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataa 73  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27572970 gatgtgctatttgaagatgtgtgttttaaagatgtgttatataa 27573013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 8227468 - 8227565
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  8227468 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 8227565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638376
Alignment:
Q  157 ttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 20638376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23019517 - 23019473
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  23019517 ttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 23019473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 10775656 - 10775813
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10775656 atgatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 10775754  T
Q  176 gtcatg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775755 gtcatgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 10775813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Original strand, 18319025 - 18319171
Alignment:
Q  88 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  18319025 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 18319124  T
Q  187 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319125 ttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18319171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29330113 - 29329959
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29330113 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29330015  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29330014 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29329959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24067278 - 24067136
Alignment:
Q  88 tgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-tt 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24067278 tgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 24067179  T
Q  187 ttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24067178 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcat 24067136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 264751 - 264905
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  264751 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 264849  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  264850 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 264905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 10732923 - 10733077
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10732923 atttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10733021  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10733022 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39363563 - 39363409
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39363563 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 39363465  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39363464 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 39363409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 233
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581336
Alignment:
Q  81 ttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcat 180  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcat 11581282  T
Q  181 gttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11581283 gttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11581336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 36154763 - 36154917
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36154763 atgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 36154861  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154862 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagt 36154917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154751
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatattatta 2154691  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2154692 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 2154751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902146
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatattatta 20902086  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20902087 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20902146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20909191 - 20909037
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20909191 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20909093  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20909092 atgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagt 20909037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29346159 - 29346005
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29346159 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29346061  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29346060 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 29346005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39245315 - 39245161
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  39245315 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtc 39245217  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39245216 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 39245161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 42245348 - 42245502
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42245348 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 42245446  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42245447 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 42245502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29348632 - 29348478
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29348632 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29348534  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  29348533 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagt 29348478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29351105 - 29350951
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29351105 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29351007  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  29351006 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagt 29350951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32027572 - 32027418
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  32027572 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtc 32027474  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  32027473 atgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagt 32027418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31061250 - 31061093
Alignment:
Q  77 tgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaag 176  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31061250 tgatttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatg 31061151  T
Q  177 tcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||| || |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31061150 tcatgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 31061093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23064671 - 23064536
Alignment:
Q  99 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  23064671 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 23064572  T
Q  198 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23064571 tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23064536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38619593 - 38619459
Alignment:
Q  100 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgtt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |    
T  38619593 atataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactact 38619494  T
Q  199 gtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619493 gtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38619459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 20917935 - 20918085
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    || ||||||||  |||    
T  20917935 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttg-ttgactt----tttatattattttgtc 20918029  T
Q  179 atgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20918030 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20918085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14048182 - 14048111
Alignment:
Q  18 attatgtatgttgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatgatttgatgatg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14048182 attatgtatgttgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatgatattatgatg 14048111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22144213 - 22144077
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact-g 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||      
T  22144213 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactac 22144115  T
Q  197 ttgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22144114 ctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagt 22144077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 23390453 - 23390589
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23390453 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 23390551  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23390552 tctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 233
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997627
Alignment:
Q  155 acttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21997627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Original strand, 20766130 - 20766180
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20766130 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgttgtgt 20766180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22412294 - 22412212
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22412294 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagt 22412212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9078078 - 9077983
Alignment:
Q  136 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatg 230  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9078078 ataattgagatgttg-ttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 9077983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24529331 - 24529248
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529331 ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 24529248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25421643 - 25421560
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421643 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25431505 - 25431422
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25431505 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagt 25431422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24493679 - 24493597
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  24493679 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagt 24493597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1096631 - 1096495
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||   |  |||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||     
T  1096631 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatacta 1096533  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1096532 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 29496848 - 29496896
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 78  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29496848 gatgtgctatttgaagttgtgtgatttaaagatgtgttatataaatatg 29496896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 21729074 - 21729157
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21729074 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 21808399 - 21808482
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21808399 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13025421 - 13025339
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13025421 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13025339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13095605 - 13095523
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13095605 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13095523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 8286857 - 8286936
Alignment:
Q  157 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt--gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8286857 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8286936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40726017 - 40725965
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttg 150  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  40726017 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 40725965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22075130 - 22075047
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||   | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22075130 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Original strand, 29496804 - 29496847
Alignment:
Q  31 atgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29496804 atgtgctatttgaagttgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 29496847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 49
Target Start/End: Original strand, 41095667 - 41095698
Alignment:
Q  18 attatgtatgttgatgtgctatgtgaagatgt 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41095667 attatgtatgttgatgtgctatgtgaagatgt 41095698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 29496758 - 29496802
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29496758 gatgtgttatttgaagttgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 29496802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24702417 - 24702263
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24702417 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24702319  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24702318 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24702263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 456500 - 456346
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  456500 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 456402  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  456401 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 456346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 11393270 - 11393424
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11393270 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11393368  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11393369 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11393424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11972675 - 11972521
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11972675 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11972577  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11972576 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11972521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 15376696 - 15376850
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15376696 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 15376794  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15376795 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15376850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16232699 - 16232545
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16232699 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16232601  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232600 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16232545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 20385106 - 20385260
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20385106 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20385204  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20385205 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20385260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 21189578 - 21189732
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21189578 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21189676  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21189677 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21189732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27217039 - 27216885
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27217039 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 27216941  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27216940 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 27216885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32125670 - 32125516
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32125670 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 32125572  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32125571 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 32125516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41523096 - 41522942
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41523096 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41522998  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41522997 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 41522942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41525558 - 41525404
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41525558 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41525460  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41525459 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 41525404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 14949105 - 14949259
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14949105 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14949203  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14949204 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14949259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18640451 - 18640297
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640451 attttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18640353  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640352 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18640297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24704864 - 24704713
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24704864 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24704766  T
Q  179 atgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24704765 ttgt--ttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24704713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116534
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44116691 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 44116593  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44116592 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagt 44116534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16410238 - 16410084
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16410238 atttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16410140  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16410139 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16410084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386358
Alignment:
Q  80 tttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtca 179  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatcatgtca 3386413  T
Q  180 tgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    || || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3386412 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3386358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 38898356 - 38898514
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38898356 atgatttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattat 38898455  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38898456 gtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38898514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18430891 - 18430737
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18430891 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18430793  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18430792 atgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18430737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17062052
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  17061895 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttg-ctgacttgcatttgatattattat 17061993  T
Q  176 gtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| | |||||||||||| || || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17061994 gtcatgctattttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagt 17062052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 227
Target Start/End: Original strand, 12756651 - 12756802
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  12756651 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttg-tttacttgcatttgatattattat 12756749  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgc 227  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  12756750 gtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgc 12756802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647353
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13647512 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 13647414  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || ||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13647413 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13647353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16213863 - 16213709
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16213863 atttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtc 16213765  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16213764 atgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16213709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13869506 - 13869371
Alignment:
Q  99 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  13869506 gatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 13869407  T
Q  198 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13869406 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13869371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275196
Alignment:
Q  109 tatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctg 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg 24275222  T
Q  208 tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagt 24275196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110581
Alignment:
Q  81 ttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcat 180  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcat 20110625  T
Q  181 gttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | |||||         |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20110624 gctgttt---------ttgtatagctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20110581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 202
Target Start/End: Original strand, 26355966 - 26356089
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26355966 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtt 26356064  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgt 202  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  26356065 atgctgtttttgtatactgttgtgt 26356089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 202
Target Start/End: Original strand, 26358418 - 26358541
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26358418 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtt 26358516  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgt 202  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  26358517 atgctgtttttgtatactgttgtgt 26358541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 166
Target Start/End: Original strand, 15081928 - 15082019
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttga 166  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15081928 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 18456370 - 18456505
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18456370 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 18456468  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18456469 ctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagt 18456505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13831496 - 13831398
Alignment:
Q  135 aataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13831496 aataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 13831398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38227644 - 38227509
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  38227644 tgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 38227546  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38227545 ctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 38227509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Original strand, 3564359 - 3564457
Alignment:
Q  136 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3564359 ataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3564457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273421
Alignment:
Q  139 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 229  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48273512 attgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 48273421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 2280076 - 2280173
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  2280076 tgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactg 2280173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10589150 - 10589067
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10589150 ttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10589067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12698996 - 12698859
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgt--tttgtatact 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  12698996 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatact 12698898  T
Q  196 gt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12698897 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12698859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 11509575 - 11509619
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11509575 gatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 11509619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 11509620 - 11509664
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11509620 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgttttatataaa 11509664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15113106 - 15113036
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15113106 tgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttga-tgacttgcatttgatatt 15113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9509295 - 9509217
Alignment:
Q  157 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtt-ttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509295 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 19486701 - 19486798
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  19486701 tgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 19486798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15116643 - 15116573
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  15116643 tgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttga-tgacttgcaattgatatt 15116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899119
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8899277 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 8899179  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899178 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8899119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17463357 - 17463203
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17463357 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17463259  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17463258 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17463203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 38961874 - 38962028
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38961874 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 38961972  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38961973 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 38962028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 45606890 - 45607044
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45606890 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 45606988  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45606989 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45607044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 12119704 - 12119862
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12119704 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 12119803  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12119804 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagt 12119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 7781330 - 7781484
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  7781330 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtc 7781428  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781429 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7781484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 17446638 - 17446792
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17446638 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17446736  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17446737 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17446792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34159505 - 34159351
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34159505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34159407  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34159406 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34159351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55476670 - 55476516
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  55476670 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 55476572  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55476571 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 55476516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070790
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  53070633 atgatttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 53070731  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53070732 gtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 53070790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 6469117 - 6469271
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6469117 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 6469215  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6469216 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 6469271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 9707590 - 9707744
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  9707590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgtatttgatattattatgtc 9707688  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9707689 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 9707744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 10247706 - 10247860
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10247706 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10247804  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10247805 atgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 10247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 16282794 - 16282948
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  16282794 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattcaatattattatgtc 16282892  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16282893 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16282948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 16454264 - 16454418
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16454264 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16454362  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16454363 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 16454418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 28848594 - 28848748
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28848594 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 28848692  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28848693 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 28848748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50243005 - 50242847
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50243005 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 50242907  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50242906 tgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50242847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41124066 - 41123915
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41124066 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41123968  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41123967 atgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagt 41123915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8499679 - 8499543
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  8499679 tgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta 8499580  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499579 ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 8499543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 13151773 - 13151928
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13151773 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13151871  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13151872 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 13151928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 13154238 - 13154393
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13154238 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13154336  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13154337 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 13154393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 29172585 - 29172720
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  29172585 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 29172683  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29172684 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29172720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12567739 - 12567585
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12567739 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 12567641  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567640 atgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12567585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13544204 - 13544050
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13544204 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13544106  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13544105 atgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13544050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17672808 - 17672651
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  17672808 atgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 17672710  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17672709 gtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 17672651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 43550457 - 43550616
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43550457 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 43550555  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     ||||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43550556 tgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagt 43550616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15412589 - 15412454
Alignment:
Q  99 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  15412589 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15412490  T
Q  198 tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15412489 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15412454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977540
Alignment:
Q  127 tatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagct 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagct 15977548  T
Q  226 gcatgagt 233  Q
    ||||||||    
T  15977547 gcatgagt 15977540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21618555 - 21618474
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618555 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36166704 - 36166623
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36166704 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 36166623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55501049 - 55500967
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55501049 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 55500967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10557010
Alignment:
Q  140 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10557010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Original strand, 40213716 - 40213813
Alignment:
Q  136 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttt-tgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40213716 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagt 40213813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14973018 - 14972882
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattat--atgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatac 194  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||| |||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  14973018 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatata--tgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 14972922  T
Q  195 tgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14972921 tgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248287
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 24153219 - 24153301
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact-gttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24153219 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagt 24153301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494834
Alignment:
Q  160 catttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44494834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 24340680 - 24340816
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| |||| || ||||||     
T  24340680 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatactgc 24340778  T
Q  197 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  24340779 atatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 24340816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 53301507 - 53301644
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 197  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||||||||| | |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  53301507 tgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgt 53301606  T
Q  198 -tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| |||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  53301607 ctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagt 53301644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572617
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14572617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17488020 - 17487884
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  17488020 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17487922  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17487921 tctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17499502 - 17499366
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  17499502 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 17499404  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17499403 tctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27165411 - 27165275
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 197  Q
    ||||||||||||||| ||| || || |||||||| | |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  27165411 tgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgt 27165313  T
Q  198 -tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | | | |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27165312 ctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 27165275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42386574 - 42386438
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||||||||   | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  42386574 tgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactg 42386476  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42386475 cctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 14576790 - 14576925
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 197  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  14576790 tgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgt 14576888  T
Q  198 -tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  14576889 ctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagt 14576925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12399320 - 12399237
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12399320 ttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43841043 - 43840960
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43841043 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13442438 - 13442302
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13442438 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 13442340  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  13442339 cctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 2051156 - 2051227
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  2051156 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatatt 2051227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 52466284 - 52466328
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52466284 gatgtgctatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 52466328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424852
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11424852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18438645 - 18438562
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18438645 ttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 18438562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 25476395 - 25476478
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatact-gttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  25476395 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagt 25476478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26686998 - 26686915
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26686998 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 20698450 - 20698528
Alignment:
Q  157 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20698450 ttgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20698528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23274851 - 23274754
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  23274851 tgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 23274754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 37642222 - 37642319
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  37642222 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 37642319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 3472734 - 3472778
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3472734 gatgtgctatttaaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 3472778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3586296 - 3586252
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3586296 gatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 3586252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 150
Target Start/End: Original strand, 22147482 - 22147534
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttg 150  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  22147482 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 22147534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 52523684 - 52523755
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  52523684 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcattcgatatt 52523755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737261
Alignment:
Q  161 atttgatattattaagtcatgttgtttt----gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17737261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 23083371 - 23083454
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23083371 ttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 74
Target Start/End: Original strand, 39728092 - 39728125
Alignment:
Q  41 tgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39728092 tgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 39728125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 18539019 - 18539067
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 78  Q
    |||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18539019 gatgcgctatttaaagatgtgtgatttaaaaatgtgttatataaatatg 18539067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 20360 - 20515
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20360 atgatttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 20457  T
Q  176 gtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20458 gtcatgttgttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 128861 - 128825
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  128861 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 128825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20926 - 20772
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20926 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20828  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20827 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38000 - 37846
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38000 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 37902  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37901 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 37846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 94590 - 94436
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  94590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 94492  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94491 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 94436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 17423 - 17577
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17423 atttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17521  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17522 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 17577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44479
Alignment:
Q  99 gatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt--gtatactg 196  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg 44516  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158587
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 158531  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  158532 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 158587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 339960 - 340040
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  339960 ttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagt 340040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18809122 - 18808968
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18809122 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18809024  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18809023 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18808968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 23709515 - 23709669
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23709515 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23709613  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23709614 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23709669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 23711996 - 23712150
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23711996 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23712094  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23712095 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23712150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24367953 - 24367799
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24367953 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24367855  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24367854 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24367799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39682492 - 39682338
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39682492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 39682394  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39682393 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 39682338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039634
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32039477 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 32039575  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgag 232  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32039576 tgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgag 32039634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 571576 - 571422
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  571576 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 571478  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  571477 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 571422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6726174 - 6726020
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6726174 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtc 6726076  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6726075 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 6726020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 21155043 - 21155197
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  21155043 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtc 21155141  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21155142 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21155197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23131041 - 23130887
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23131041 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23130943  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23130942 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23130887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23133508 - 23133354
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23133508 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23133410  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23133409 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 34402505 - 34402659
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34402505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34402603  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34402604 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34402659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43137483 - 43137324
Alignment:
Q  74 atatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43137483 atatgttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatt 43137385  T
Q  174 aagtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | ||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43137384 atgtcatgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 43137324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23135769 - 23135615
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23135769 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23135671  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23135670 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23135615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 24898178 - 24898333
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24898178 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24898276  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24898277 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24898333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 24900661 - 24900816
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24900661 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24900759  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24900760 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24900816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 24903138 - 24903293
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24903138 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24903236  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24903237 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24903293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 24905615 - 24905770
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24905615 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24905713  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24905714 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24905770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 24908090 - 24908245
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24908090 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24908188  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaact-aagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24908189 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagt 24908245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38967535 - 38967399
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg-ttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||| ||    
T  38967535 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattg 38967436  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967435 ttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagt 38967399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26505558 - 26505404
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26505558 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26505460  T
Q  179 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26505459 atgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26505404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26508036 - 26507882
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26508036 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26507938  T
Q  179 atg-ttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26507937 atgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26507882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28577278 - 28577124
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  28577278 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttggcttgcatttgatattattatatc 28577180  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28577179 atgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 28577124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 32214904 - 32215058
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32214904 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 32215002  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32215003 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 32215058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 45029837 - 45029991
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45029837 atttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 45029935  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45029936 atgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 45029991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22105592 - 22105437
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22105592 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22105494  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || ||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22105493 atgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22105437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529666
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttg-ttaacttgcacttgatattatta 24529606  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24529607 tgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagt 24529666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 24642835 - 24642933
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24642835 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 7690 - 7787
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  7690 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671858
Alignment:
Q  81 ttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcat 180  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||| || ||||||||||  ||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  181 gttgttttgtatactg-ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | ||||||| ||||||  | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  19671912 gatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 19671858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23060677 - 23060541
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23060677 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 23060579  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23060578 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Original strand, 22173808 - 22173866
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 133  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22173808 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgt 22173866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 23708576 - 23708712
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| || || ||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||     
T  23708576 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcga-tgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgc 23708674  T
Q  197 ttgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  23708675 ctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagt 23708712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38207
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 38207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23076553 - 23076470
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076553 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22337279 - 22337143
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttg-tatactg 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |    
T  22337279 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacag 22337181  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22337180 cctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 24643039 - 24643087
Alignment:
Q  185 ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24643039 ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24643087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Original strand, 22459519 - 22459587
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgat 167  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  22459519 tgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttga-tgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 37379776 - 37379729
Alignment:
Q  31 atgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaatatg 78  Q
    |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37379776 atgtactatttgaagatgtatgatttaaagatgtgttatataaatatg 37379729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 22731249 - 22731327
Alignment:
Q  157 ttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22731249 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16092657 - 16092613
Alignment:
Q  30 gatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16092657 gatgtgttatttgaagatgtttgatttaaagatgtgttatataaa 16092613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4873 - 4719
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4873 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4775  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4774 atgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14126 - 13972
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14126 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14028  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14027 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagt 13972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 134390 - 134236
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  134390 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 134292  T
Q  179 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  134291 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 134236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 136859 - 136705
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  136859 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 136761  T
Q  179 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  136760 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 136705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 139328 - 139174
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  139328 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 139230  T
Q  179 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139229 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 139174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 144266 - 144112
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  144266 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 144168  T
Q  179 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  144167 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 144112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 141797 - 141643
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  141797 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 141699  T
Q  179 atgttgt-tttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  141698 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 141643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 161069 - 161227
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  161069 atgatttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattat 161168  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||  || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  161169 gtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagt 161227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Original strand, 164570 - 164674
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  164570 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattat 164669  T
Q  176 gtcat 180  Q
    |||||    
T  164670 gtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 135
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  289 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 191  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 229  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  190 tgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13417
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13571 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13473  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13472 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 1259 - 1418
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattatta 1358  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||  |||||   ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1359 tgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagt 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30114 - 29957
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  30114 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacacttgatattattat 30016  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30015 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9774
Alignment:
Q  78 gatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt-aaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaag 176  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  9930 gatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatattattatg 9832  T
Q  177 tcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9831 tcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 9774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33105 - 32970
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  33105 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 33007  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  33006 ctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 32970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38866 - 38791
Alignment:
Q  157 ttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatga 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  38866 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatga 38791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10952 - 10798
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10952 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10854  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10853 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9267
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9421 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 9323  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9322 atgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4479 - 4322
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||     
T  4479 atgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttg-ttgatttgcaattgatattattat 4381  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4380 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 4322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79421
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  79264 atgatttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgaaattattat 79362  T
Q  176 gtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79363 gtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 79421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 17225 - 17310
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtca---tgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17225 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40579 - 40425
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40579 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 40481  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40480 atcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagt 40425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 82255 - 82097
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  82255 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattatta 82157  T
Q  175 agtcatgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| || |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  82156 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagt 82097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 22630 - 22763
Alignment:
Q  100 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-t 198  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | | | || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||  ||||| || |||| ||||||| |    
T  22630 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtct 22727  T
Q  199 gtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22728 atgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12089
Alignment:
Q  75 tatgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12241 tatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 12143  T
Q  175 agtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||      ||||||||||||||||||||    
T  12142 tgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagt 12089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11467 - 11313
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11467 atttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11369  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11368 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 11313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Original strand, 12232 - 12382
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtc 178  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  12232 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattttgtc 12330  T
Q  179 atgttg-ttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcat 229  Q
    ||| || |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12331 atgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 12382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 116536 - 116455
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  116536 ttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 116455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 3108 - 3243
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3108 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 3206  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3207 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23046 - 22911
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  23046 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 22948  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22947 gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 38659 - 38795
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt 197  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  38659 tgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgt 38757  T
Q  198 -tgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| |||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  38758 ctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagt 38795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 53506 - 53603
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  53506 tgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 53603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13093
Alignment:
Q  101 tataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 174  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 13093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39640 - 39505
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  39640 tgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 39542  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39541 ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 39505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 75172 - 75307
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  75172 tgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc 75270  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75271 ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 75307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 16610 - 16693
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16610 ttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 44717 - 44800
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44717 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 44800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26158
Alignment:
Q  140 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttg-ttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2015 - 1879
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2015 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 1917  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1916 tctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40076 - 39941
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||   ||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  40076 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgtt-attgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgc 39978  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  39977 ctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 39941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8494
Alignment:
Q  105 attgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtc 203  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||  | |||     
T  8623 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgtt 8525  T
Q  204 gctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||    
T  8524 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 8494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12115 - 12041
Alignment:
Q  76 atgatttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttg 150  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12115 atgatttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttg 12041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12044 - 11991
Alignment:
Q  181 gttgttttg-tatactgttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12044 gttgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 32967 - 33049
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32967 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 33049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46038 - 45956
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  46038 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4536
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  4671 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 4573  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4572 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12253 - 12118
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  12253 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 12155  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12154 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22205 - 22070
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  22205 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactg 22107  T
Q  197 -ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22106 cttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13375 - 13239
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13375 tgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13277  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13276 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26059 - 25924
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||| ||||  | |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||     
T  26059 tgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgc 25961  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  25960 ctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 25924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40021 - 39886
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||| ||||  | |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||     
T  40021 tgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgc 39923  T
Q  197 ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  39922 ctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 39886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13525
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3585
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg 196  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  3487 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15556
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagt 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12731 - 12635
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  12731 tgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 12635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 225570 - 225474
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||    
T  225570 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgttttgcatactg 225474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11628 - 11492
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||     
T  11628 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgc 11530  T
Q  197 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  11529 ctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 11492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Original strand, 16057 - 16153
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||  |||||| |||| |||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  16057 tgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttg-ttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatact 16153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13293 - 13195
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaat-aattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||   || ||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  13293 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactg 13195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Original strand, 27706 - 27802
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatact 195  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||| |||| |||| || ||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||    
T  27706 tgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttg-ttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatact 27802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 38213 - 38349
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgttttgtatactg- 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||     
T  38213 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgc 38311  T
Q  197 ttgtgtcgctg-tcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     | ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  38312 ctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 38349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1980
Alignment:
Q  111 tatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgt 208  Q
    ||||||||| |||||| || | | |||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgt 2005  T
Q  209 cgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  2004 tgttaattaactaagctgcatgagt 1980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22720 - 22672
Alignment:
Q  28 ttgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaata 76  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22720 ttgatgtgttatttgaagatgtgtgatttaaagatgtgttatataaata 22672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4960 - 4877
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4960 ttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagt 4877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28525 - 28442
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28525 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 28442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52024 - 51941
Alignment:
Q  152 ttgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52024 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 51941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 167936 - 168071
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  167936 tgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 168033  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  168034 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 168071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0281 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0281
Description:

Target: scaffold0281; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1043 - 997
Alignment:
Q  28 ttgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1043 ttgatgtgctatttgaaaatgtgtgatttaaagatgtgttatataaa 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 1006 - 1141
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  1006 tgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactg 1103  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1104 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15589 - 15544
Alignment:
Q  29 tgatgtgctatgtgaagatgtgtgctttaaagatgtgttatataaa 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15589 tgatgtgctatttgaagatgtgtaatttaaagatgtgttatataaa 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Original strand, 3204 - 3279
Alignment:
Q  160 catttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3204 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27994 - 27912
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatg 181  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27994 tgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32165 - 32095
Alignment:
Q  163 ttgatattattaagtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 32095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 24259 - 24396
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgt--tttgtatact 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||    
T  24259 tgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatact 24357  T
Q  196 gt-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
    |  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24358 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 24396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6126 - 6072
Alignment:
Q  79 atttgatgatgttatatcttgatataattgtatatgcattaattgaattatatgt 133  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6126 atttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgt 6072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3634 - 3498
Alignment:
Q  98 tgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtaaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaagtcatgttgtttt-gtatactg 196  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||| | |||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  3634 tgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3536  T
Q  197 t-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagt 233  Q
      | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  3535 cctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University