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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4784_low_6 (Length: 241)
Name: NF4784_low_6
Description: NF4784
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4784_low_6 |
 | |
|
| [»] chr5 (4 HSPs) |
| |
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| [»] chr4 (1 HSPs) |
| |
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| [»] scaffold0070 (1 HSPs) |
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| [»] chr7 (3 HSPs) |
| |
|
| [»] chr8 (4 HSPs) |
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|
| [»] chr1 (1 HSPs) |
| |
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| [»] chr2 (3 HSPs) |
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| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 14275876 - 14276098
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
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|
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| T |
14275876 |
acactccactgtggctccaaccaattagggacaccacataccccacgggtcccaactaattatgggcaccaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
14275975 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14275976 |
gagcactcaaccaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcaggtcccaaccaattataggcaccacgcgacaatgaatgtatgca |
14276075 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14276076 |
tgcgacacatgattattaactcc |
14276098 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 37626975 - 37627180
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37626975 |
acactccaccgtgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaagaca-cgagcctcaaccaattat |
37627073 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37627074 |
gagcactcaaa-aggaaacaataagcctcaaccaattatgggcactcaagacttcggatcccaaccaattatgggcaccaagcgacaatgaatgtatgca |
37627172 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacac |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
37627173 |
tgcgacac |
37627180 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 37803516 - 37803625
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37803516 |
acactccaccgtgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcaccaaaagaagacaatatgccccaaccaattat |
37803615 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaa |
128 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
37803616 |
gggcactcaa |
37803625 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 37803601 - 37803684
Alignment:
| Q |
143 |
gccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgcatgcgacac |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37803601 |
gccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgggcaccacacgacaatgaatgtatgcatgcgacac |
37803684 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 11991695 - 11991917
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11991695 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaatgaaatcaacgagcctcaaccaattat |
11991794 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
11991795 |
gagcactcaaccaagaaacgataagcctcaaccaattatgggcactcaagactttgggtcccaaccaattatgggcaccatgcgacaatgaatgcatgct |
11991894 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11991895 |
tgcgacacatggttattaactcc |
11991917 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:
Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 58534 - 58740
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
58534 |
acactccaccgtagctccaaccaattatggacaccacataccccacgtgtcccaaccaattatgggcaccaaaagaagacaacgagcctcaaccaattat |
58633 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
58634 |
gagcactcaaaaaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgggcaccacgcgacaatgaatgtatgca |
58733 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgaca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
58734 |
tgcgaca |
58740 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2188418 - 2188197
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2188418 |
acactccaccgtgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaagacaacgagcctcaaccaattat |
2188319 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2188318 |
gagcactcaa-aaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgagcaccacgcgacaatgaatgtatgca |
2188220 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
2188219 |
tgcgacacctgcttattaactcc |
2188197 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 1608396 - 1608617
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1608396 |
acactccaccgtagctccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaatcaaagagcctcaaccaattat |
1608495 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
1608496 |
gagcactcaa-aaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttagggtcccaaccaattatgggcaccacgcgaccatgaatgtatgca |
1608594 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1608595 |
tgcgacacctgcttattaactcc |
1608617 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 19632487 - 19632707
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19632487 |
acactccaccatggctccaaacaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaagacaacaagcctcaaccaattat |
19632586 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
19632587 |
gagcactcaa-aaggaaacaataagccccaaccaattat-ggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgagcaccacgcgacactgaatgtatgca |
19632684 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
19632685 |
tgcgacacctgcttattaactcc |
19632707 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 451889 - 452110
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
451889 |
acactccaccgtagctccaaccaattatggacaccacattccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaatcaacgagtcccaaccaattat |
451988 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
451989 |
gagcactcaa-aaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgggcaccacacgacaatgaatgtatgca |
452087 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
452088 |
tgtgacacctgattattaactcc |
452110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 7093724 - 7093930
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7093724 |
acactccaccgtgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaatcaacgagcctcaaccaattat |
7093823 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7093824 |
gagcactc-acaaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcctaaccaattatgggcaccacgcaacaatgaatgtatgca |
7093922 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacac |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
7093923 |
tgcgacac |
7093930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 7097457 - 7097663
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7097457 |
acactccaccgtgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaatcaacgagcctcaaccaattat |
7097556 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7097557 |
gagcactc-acaaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcctaaccaattatgggcaccacgcaacaatgaatgtatgca |
7097655 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacac |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
7097656 |
tgcgacac |
7097663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29823190 - 29822984
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29823190 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccctacgggtcccatccaattatgggcgccaaaagaagacaacgagcctcaaccaattat |
29823091 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29823090 |
gagcactcaa-aaggaaacaataagccccaaccaattatgggcgctcaagacttcgggtcccaaccaattatgggcaccacgcgacaatgaatgtatgca |
29822992 |
T |
|
| Q |
219 |
tgcgacac |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
29822991 |
tgcgacac |
29822984 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 41313516 - 41313738
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaa-acaacgagcctcaaccaatta |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41313516 |
acactccaccatgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaagacaacgagcctcaaccaatta |
41313615 |
T |
|
| Q |
118 |
tgagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgc |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41313616 |
tgagcactcaaa-aggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgagcaccacgcgacaatgaatgtatgc |
41313714 |
T |
|
| Q |
218 |
atgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
41313715 |
atgcgacacctgcttattaactcc |
41313738 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19216064 - 19215843
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
| |
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| T |
19216064 |
acactccaccgtgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaagacaacgagcctaaaccaattat |
19215965 |
T |
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| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
| |
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| T |
19215964 |
gagcactcaa-aaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgggcaccatgcgacaatgaatgtatgca |
19215866 |
T |
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| Q |
219 |
tgcgacacataattattaactcc |
241 |
Q |
| |
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| T |
19215865 |
tgcaacacctgcttattaactcc |
19215843 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19589736 - 19589608
Alignment:
| Q |
91 |
aagaaaacaacgagcctcaaccaattatgagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattat |
190 |
Q |
| |
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| T |
19589736 |
aagaaaacaacgagtctcaaccaattatgaacactcaaaaca-aaacgacaaaccccaaccaattacgggcactcaagacttagggttccaaccaattat |
19589638 |
T |
|
| Q |
191 |
aggcaccacacgacaataaatgtatgcatg |
220 |
Q |
| |
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| T |
19589637 |
gggcagcacacgacgatgaatatatgcatg |
19589608 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10999109 - 10998966
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
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| T |
10999109 |
acactccatcgtagctccaaccagttatgaacatcatatactcc-cgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaaac---gattctaaactaattat |
10999014 |
T |
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| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaa |
167 |
Q |
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| T |
10999013 |
gagctctcaaa-aggaaatgataagtcacaaccaattatggacactcaa |
10998966 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8378100 - 8377894
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
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| T |
8378100 |
acactccgccgtgactccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaatcaacgggcctcaaccaattat |
8378001 |
T |
|
| Q |
119 |
gagcactcaacgaagaaacgataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgaatcccaaccaattataggcaccacacgacaataaatgtatgca |
218 |
Q |
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| T |
8378000 |
gagcactc-acaaggaaacaataagccccaaccaattatgggcactcaagacttcgggtcccaaccaattatgggcaccacgcaacaatgaatgtatgca |
8377902 |
T |
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| Q |
219 |
tgcgacac |
226 |
Q |
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| T |
8377901 |
tgcgacac |
8377894 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16948 - 16839
Alignment:
| Q |
19 |
acactccaccgtggctccaaccaattatggacaccacataccccacgggttccaaccaattatgggcatcaaaagaaaacaacgagcctcaaccaattat |
118 |
Q |
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| T |
16948 |
acactccaccgtagctccaaccaattatggacaccacataccccacgggtcccaaccaattatgggcaccaaaagaaatcaacgaacctcaaccaattat |
16849 |
T |
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| Q |
119 |
gagcactcaa |
128 |
Q |
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| T |
16848 |
gagcactcaa |
16839 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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