View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4789_low_28 (Length: 253)

Name: NF4789_low_28
Description: NF4789
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4789_low_28
NF4789_low_28
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (41-221)||(38416726-38416906)
chr3 (42-221)||(47257794-47257973)
chr3 (42-221)||(7855116-7855295)
chr3 (42-221)||(46134357-46134536)
chr3 (42-221)||(51170035-51170214)
chr3 (42-221)||(27066980-27067159)
chr3 (42-217)||(29625833-29626008)
chr3 (42-221)||(40130961-40131140)
chr3 (42-221)||(49330038-49330217)
chr3 (42-221)||(47809598-47809778)
chr3 (42-230)||(48739226-48739414)
chr3 (42-221)||(22399098-22399276)
chr3 (42-221)||(24100284-24100462)
chr3 (42-221)||(28048394-28048573)
chr3 (42-221)||(35748313-35748492)
chr3 (42-221)||(40643801-40643980)
chr3 (42-221)||(41464353-41464532)
chr3 (50-223)||(48609732-48609905)
chr3 (41-221)||(40804512-40804692)
chr3 (42-206)||(53943604-53943768)
chr3 (42-221)||(32234400-32234578)
chr3 (42-221)||(40419836-40420015)
chr3 (42-221)||(42291843-42292022)
chr3 (42-221)||(43612049-43612228)
chr3 (43-221)||(41293321-41293498)
chr3 (36-221)||(18946898-18947083)
chr3 (42-231)||(51102370-51102559)
chr3 (33-221)||(51452753-51452940)
chr3 (42-221)||(2666001-2666180)
chr3 (42-221)||(37324542-37324721)
chr3 (42-221)||(39634574-39634752)
chr3 (42-221)||(41732529-41732708)
chr3 (42-221)||(44222830-44223009)
chr3 (42-221)||(44806685-44806864)
chr3 (46-221)||(52628959-52629133)
chr3 (42-221)||(55453246-55453425)
chr3 (42-210)||(37313400-37313568)
chr3 (42-221)||(7755309-7755487)
chr3 (42-221)||(20754395-20754574)
chr3 (46-221)||(43183917-43184092)
chr3 (42-221)||(52638843-52639022)
chr3 (42-219)||(35594122-35594299)
chr3 (42-198)||(24376574-24376730)
chr3 (65-221)||(46126011-46126166)
chr3 (42-221)||(47894822-47895001)
chr3 (42-217)||(52215077-52215252)
chr3 (42-208)||(36368940-36369105)
chr3 (42-200)||(43125832-43125990)
chr3 (42-221)||(43021715-43021895)
chr3 (42-197)||(39053395-39053550)
chr3 (42-221)||(53832486-53832665)
chr3 (42-190)||(53637842-53637990)
chr3 (42-221)||(41216456-41216635)
chr3 (45-206)||(46949379-46949538)
chr3 (42-214)||(51146224-51146396)
chr3 (42-221)||(5560027-5560213)
chr3 (42-223)||(54158998-54159169)
chr3 (42-223)||(48546840-48547010)
chr3 (42-220)||(49130579-49130746)
chr3 (42-187)||(37758930-37759075)
chr3 (42-221)||(55379986-55380154)
chr3 (42-214)||(25641647-25641808)
chr3 (42-214)||(42589831-42589992)
chr3 (42-218)||(54401188-54401353)
chr3 (42-221)||(25353555-25353723)
chr3 (42-221)||(53115448-53115616)
chr3 (101-221)||(52864550-52864669)
chr3 (42-206)||(34279738-34279891)
chr3 (42-214)||(54707229-54707390)
chr3 (108-221)||(33550469-33550582)
chr3 (42-221)||(38156634-38156802)
chr3 (42-221)||(47510942-47511110)
chr3 (42-221)||(51415970-51416138)
chr3 (42-221)||(30251503-30251671)
chr3 (42-221)||(55000180-55000348)
chr3 (42-206)||(39141141-39141296)
chr3 (41-221)||(31286795-31286964)
chr3 (41-209)||(40022074-40022231)
chr3 (41-221)||(51143817-51143986)
chr3 (42-209)||(41635814-41635970)
chr3 (42-221)||(43176740-43176908)
chr3 (42-221)||(45058884-45059052)
chr3 (42-140)||(21597220-21597318)
chr3 (42-140)||(41882063-41882161)
chr3 (90-172)||(47182049-47182131)
chr3 (42-221)||(24688115-24688283)
chr3 (42-221)||(42998791-42998958)
chr3 (42-152)||(2227995-2228105)
chr3 (42-198)||(17665549-17665694)
chr3 (42-214)||(37028724-37028885)
chr3 (43-140)||(50731986-50732083)
chr3 (43-140)||(50780773-50780870)
chr3 (34-148)||(177154-177268)
chr3 (42-214)||(51224047-51224207)
chr3 (43-152)||(8847718-8847827)
chr3 (42-140)||(28576184-28576282)
chr3 (42-140)||(48726070-48726168)
chr3 (136-221)||(30429229-30429314)
chr3 (42-213)||(40165653-40165812)
chr3 (42-117)||(52434140-52434216)
chr3 (42-117)||(48752086-48752161)
chr3 (50-152)||(47402810-47402911)
chr3 (148-214)||(48534016-48534082)
chr3 (42-127)||(44946014-44946099)
chr3 (74-152)||(41609100-41609178)
chr3 (76-221)||(52756069-52756207)
chr3 (148-221)||(44945937-44946010)
chr3 (172-221)||(50731916-50731965)
chr3 (172-221)||(50780891-50780940)
chr3 (42-93)||(37741436-37741487)
chr3 (171-221)||(40688431-40688481)
chr3 (181-214)||(37760345-37760378)
chr3 (164-221)||(48752226-48752283)
chr3 (42-82)||(51942546-51942586)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (43-221)||(44984763-44984941)
chr4 (42-221)||(34276548-34276727)
chr4 (43-221)||(21366611-21366789)
chr4 (42-221)||(6019929-6020108)
chr4 (42-221)||(9798466-9798645)
chr4 (42-221)||(23437593-23437772)
chr4 (42-221)||(31532137-31532316)
chr4 (44-221)||(31972338-31972515)
chr4 (42-214)||(237478-237650)
chr4 (42-214)||(41560329-41560501)
chr4 (42-221)||(32366662-32366841)
chr4 (42-221)||(42085208-42085387)
chr4 (42-221)||(42765844-42766022)
chr4 (42-221)||(53854432-53854610)
chr4 (42-231)||(39077546-39077735)
chr4 (42-223)||(41702459-41702640)
chr4 (41-221)||(22618516-22618694)
chr4 (42-221)||(2826684-2826862)
chr4 (42-221)||(18462015-18462194)
chr4 (42-221)||(19387690-19387869)
chr4 (42-221)||(27373077-27373255)
chr4 (42-221)||(50234001-50234180)
chr4 (42-221)||(51363008-51363186)
chr4 (42-221)||(53461818-53461997)
chr4 (42-221)||(54574942-54575121)
chr4 (42-221)||(55519828-55520007)
chr4 (42-223)||(397403-397584)
chr4 (42-223)||(50457810-50457991)
chr4 (42-221)||(146431-146610)
chr4 (42-221)||(3692212-3692391)
chr4 (42-221)||(26091260-26091439)
chr4 (42-221)||(29478361-29478540)
chr4 (42-221)||(29777259-29777438)
chr4 (42-221)||(31914199-31914377)
chr4 (42-221)||(43471697-43471876)
chr4 (42-221)||(45797480-45797659)
chr4 (42-221)||(47344657-47344836)
chr4 (42-213)||(55056269-55056440)
chr4 (42-220)||(6285308-6285486)
chr4 (42-221)||(41949383-41949564)
chr4 (42-221)||(49881061-49881244)
chr4 (42-221)||(47662104-47662283)
chr4 (42-221)||(54086411-54086588)
chr4 (42-221)||(55776046-55776224)
chr4 (42-221)||(55840224-55840402)
chr4 (41-221)||(42222291-42222471)
chr4 (42-214)||(54607963-54608135)
chr4 (42-221)||(407755-407932)
chr4 (42-221)||(3170627-3170806)
chr4 (42-221)||(23609088-23609267)
chr4 (42-221)||(42033176-42033355)
chr4 (41-211)||(50534631-50534801)
chr4 (42-219)||(35446507-35446683)
chr4 (42-221)||(2243459-2243638)
chr4 (42-205)||(22468788-22468951)
chr4 (42-221)||(31070076-31070254)
chr4 (42-221)||(56023000-56023179)
chr4 (43-217)||(33897501-33897675)
chr4 (42-221)||(38591669-38591844)
chr4 (42-221)||(48654815-48655000)
chr4 (42-206)||(39587796-39587960)
chr4 (42-221)||(48313558-48313735)
chr4 (42-214)||(1932764-1932936)
chr4 (42-221)||(14017378-14017555)
chr4 (41-221)||(53834056-53834236)
chr4 (42-221)||(41632009-41632187)
chr4 (43-221)||(48657826-48657998)
chr4 (42-214)||(54805623-54805799)
chr4 (42-219)||(50536628-50536805)
chr4 (42-206)||(54424983-54425147)
chr4 (42-221)||(9997933-9998101)
chr4 (42-206)||(48259528-48259691)
chr4 (41-223)||(51951682-51951863)
chr4 (84-221)||(52728309-52728445)
chr4 (97-221)||(36532832-36532956)
chr4 (42-214)||(54715036-54715197)
chr4 (42-209)||(20351856-20352012)
chr4 (42-221)||(43890929-43891097)
chr4 (42-229)||(45633773-45633949)
chr4 (42-223)||(54216314-54216484)
chr4 (42-214)||(54216745-54216906)
chr4 (42-221)||(15060291-15060459)
chr4 (42-221)||(47811907-47812075)
chr4 (126-221)||(35595772-35595867)
chr4 (42-214)||(33289704-33289865)
chr4 (96-214)||(42509351-42509469)
chr4 (42-221)||(34835178-34835346)
chr4 (42-221)||(38547603-38547771)
chr4 (42-200)||(5117461-5117608)
chr4 (42-148)||(1662323-1662429)
chr4 (42-214)||(37239099-37239260)
chr4 (42-219)||(27398607-27398773)
chr4 (42-219)||(46720026-46720195)
chr4 (42-148)||(14335165-14335271)
chr4 (42-148)||(27580120-27580226)
chr4 (42-214)||(52688350-52688511)
chr4 (42-221)||(34552320-34552488)
chr4 (89-179)||(52396774-52396865)
chr4 (45-221)||(573807-573972)
chr4 (42-214)||(22620594-22620755)
chr4 (42-214)||(31881323-31881484)
chr4 (42-200)||(4486604-4486751)
chr4 (121-221)||(35344868-35344967)
chr4 (45-221)||(46708743-46708908)
chr4 (42-221)||(6371251-6371419)
chr4 (42-200)||(27873571-27873718)
chr4 (41-223)||(33557942-33558113)
chr4 (42-206)||(52461367-52461517)
chr4 (42-133)||(3293102-3293193)
chr4 (150-221)||(33048990-33049061)
chr4 (69-221)||(27872607-27872748)
chr4 (42-221)||(49014099-49014267)
chr4 (42-125)||(42557583-42557666)
chr4 (42-133)||(11972208-11972299)
chr4 (42-140)||(43231504-43231601)
chr4 (146-221)||(48259706-48259780)
chr4 (78-209)||(51981493-51981613)
chr4 (42-147)||(49057933-49058038)
chr4 (155-221)||(3291807-3291873)
chr4 (119-209)||(42558271-42558353)
chr4 (42-92)||(17555617-17555667)
chr4 (52-147)||(18206583-18206682)
chr4 (171-221)||(1662263-1662313)
chr4 (139-209)||(49304602-49304671)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (42-221)||(13764-13943)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (42-221)||(32984079-32984258)
chr8 (42-221)||(10646124-10646303)
chr8 (42-221)||(43328708-43328887)
chr8 (42-221)||(24079903-24080082)
chr8 (42-221)||(41862221-41862400)
chr8 (42-221)||(6365987-6366166)
chr8 (42-221)||(40435155-40435334)
chr8 (42-219)||(31830959-31831136)
chr8 (42-221)||(5946048-5946227)
chr8 (42-221)||(9303576-9303755)
chr8 (42-221)||(33730643-33730822)
chr8 (42-221)||(37956422-37956601)
chr8 (42-220)||(44088446-44088624)
chr8 (41-214)||(17718731-17718904)
chr8 (44-221)||(25185902-25186079)
chr8 (42-206)||(2714550-2714714)
chr8 (42-221)||(9734256-9734433)
chr8 (42-221)||(33981665-33981844)
chr8 (42-221)||(37301327-37301506)
chr8 (42-221)||(41653896-41654075)
chr8 (42-221)||(9013685-9013863)
chr8 (46-221)||(32114254-32114429)
chr8 (42-221)||(37419941-37420120)
chr8 (42-217)||(45066598-45066773)
chr8 (42-221)||(45236567-45236746)
chr8 (42-208)||(13760663-13760829)
chr8 (42-200)||(29048426-29048584)
chr8 (42-221)||(13356122-13356301)
chr8 (42-221)||(41231947-41232126)
chr8 (42-209)||(2275914-2276080)
chr8 (42-221)||(35628778-35628957)
chr8 (42-221)||(25248040-25248213)
chr8 (42-221)||(22878392-22878571)
chr8 (42-221)||(41639915-41640094)
chr8 (97-221)||(12032986-12033110)
chr8 (42-206)||(45258511-45258675)
chr8 (42-211)||(42701301-42701471)
chr8 (90-214)||(3904126-3904249)
chr8 (107-221)||(41981534-41981648)
chr8 (42-221)||(4447297-4447465)
chr8 (42-221)||(10378310-10378478)
chr8 (42-209)||(41843254-41843410)
chr8 (110-221)||(31336163-31336274)
chr8 (42-214)||(31940316-31940476)
chr8 (42-221)||(3211207-3211374)
chr8 (42-214)||(9713690-9713848)
chr8 (41-221)||(117331-117500)
chr8 (42-206)||(38631653-38631806)
chr8 (42-148)||(39915887-39915993)
chr8 (42-214)||(40458781-40458942)
chr8 (42-221)||(2379141-2379309)
chr8 (46-206)||(32373744-32373892)
chr8 (42-221)||(3490401-3490569)
chr8 (43-214)||(4975416-4975576)
chr8 (42-221)||(33896845-33897012)
chr8 (65-143)||(41981457-41981535)
chr8 (42-150)||(31148953-31149060)
chr8 (42-133)||(27243218-27243309)
chr8 (42-133)||(27254793-27254884)
chr8 (53-214)||(40649840-40649990)
chr8 (42-205)||(26196335-26196486)
chr8 (42-214)||(9509409-9509570)
chr8 (42-206)||(33622483-33622635)
chr8 (148-214)||(41425438-41425503)
chr8 (47-110)||(164728-164791)
chr8 (158-221)||(39901674-39901737)
chr8 (65-102)||(2179045-2179082)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (42-221)||(5882507-5882686)
chr6 (42-221)||(22551063-22551242)
chr6 (42-221)||(24168092-24168271)
chr6 (42-223)||(2892189-2892370)
chr6 (42-219)||(14891383-14891560)
chr6 (42-221)||(2593854-2594033)
chr6 (42-221)||(26377206-26377385)
chr6 (42-221)||(34527864-34528043)
chr6 (42-229)||(7345106-7345293)
chr6 (42-221)||(7393588-7393767)
chr6 (42-221)||(8615241-8615420)
chr6 (44-221)||(18101497-18101674)
chr6 (41-217)||(30743454-30743630)
chr6 (42-221)||(599893-600072)
chr6 (42-221)||(959906-960085)
chr6 (54-221)||(11988976-11989143)
chr6 (42-217)||(16703367-16703542)
chr6 (42-221)||(19415535-19415714)
chr6 (42-221)||(28947088-28947267)
chr6 (41-221)||(5294803-5294983)
chr6 (41-221)||(5299355-5299535)
chr6 (42-210)||(1970712-1970880)
chr6 (42-221)||(10507910-10508089)
chr6 (54-221)||(22341790-22341959)
chr6 (42-221)||(19281057-19281236)
chr6 (42-221)||(33452574-33452753)
chr6 (42-221)||(24224072-24224252)
chr6 (42-170)||(30467656-30467784)
chr6 (74-221)||(23261931-23262078)
chr6 (42-221)||(7167583-7167751)
chr6 (42-221)||(28948847-28949015)
chr6 (42-214)||(13329382-13329543)
chr6 (42-221)||(15965434-15965602)
chr6 (42-221)||(1398554-1398722)
chr6 (42-231)||(3786750-3786928)
chr6 (42-123)||(929660-929741)
chr6 (42-221)||(3291009-3291177)
chr6 (42-214)||(4487528-4487689)
chr6 (42-221)||(375729-375894)
chr6 (47-137)||(1939579-1939669)
chr6 (148-221)||(18661830-18661903)
chr6 (164-221)||(34262342-34262399)
chr6 (148-205)||(24913114-24913171)
chr6 (52-148)||(13844847-13844943)
chr6 (1-38)||(27368259-27368296)
chr6 (1-38)||(27458606-27458643)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (42-221)||(24253383-24253562)
chr5 (42-221)||(35626039-35626218)
chr5 (42-214)||(43326388-43326560)
chr5 (42-221)||(7722050-7722229)
chr5 (42-221)||(15398484-15398663)
chr5 (42-223)||(6901800-6901981)
chr5 (42-221)||(739706-739885)
chr5 (42-221)||(12648798-12648977)
chr5 (42-221)||(43262185-43262364)
chr5 (52-221)||(31938908-31939077)
chr5 (42-214)||(18479677-18479849)
chr5 (42-214)||(40886037-40886208)
chr5 (42-221)||(3466683-3466862)
chr5 (42-221)||(5184973-5185152)
chr5 (42-221)||(27501057-27501236)
chr5 (42-221)||(39932580-39932759)
chr5 (42-221)||(27938898-27939078)
chr5 (42-221)||(2484294-2484473)
chr5 (42-221)||(15683792-15683971)
chr5 (42-221)||(25831522-25831700)
chr5 (42-221)||(27278475-27278658)
chr5 (42-221)||(890907-891085)
chr5 (78-221)||(29789297-29789440)
chr5 (43-221)||(13504744-13504922)
chr5 (49-221)||(38756489-38756662)
chr5 (52-221)||(40278860-40279029)
chr5 (42-221)||(28424797-28424974)
chr5 (42-221)||(5137716-5137895)
chr5 (42-222)||(40110235-40110414)
chr5 (84-221)||(34451293-34451430)
chr5 (42-221)||(33617586-33617754)
chr5 (42-185)||(40632500-40632634)
chr5 (42-204)||(4149695-4149847)
chr5 (42-221)||(763724-763903)
chr5 (42-221)||(19295731-19295899)
chr5 (42-221)||(31293991-31294170)
chr5 (42-221)||(9424594-9424762)
chr5 (42-214)||(38015523-38015684)
chr5 (42-218)||(42658667-42658832)
chr5 (42-221)||(2585463-2585631)
chr5 (42-221)||(5497274-5497442)
chr5 (42-221)||(27503380-27503548)
chr5 (42-214)||(9374511-9374672)
chr5 (42-152)||(12558090-12558199)
chr5 (42-221)||(23195250-23195418)
chr5 (46-221)||(33623941-33624105)
chr5 (42-211)||(18327185-18327343)
chr5 (42-214)||(1402514-1402675)
chr5 (42-214)||(6973064-6973225)
chr5 (49-221)||(27390605-27390766)
chr5 (42-221)||(13957671-13957839)
chr5 (42-206)||(36365462-36365615)
chr5 (42-148)||(36472348-36472454)
chr5 (42-221)||(14971979-14972147)
chr5 (42-221)||(24167786-24167954)
chr5 (42-221)||(38637912-38638080)
chr5 (67-214)||(36948499-36948633)
chr5 (42-221)||(40686900-40687067)
chr5 (68-214)||(3656577-3656712)
chr5 (42-129)||(42247865-42247952)
chr5 (52-149)||(5120036-5120132)
chr5 (42-200)||(6206885-6207032)
chr5 (75-206)||(38492647-38492767)
chr5 (41-108)||(9527124-9527191)
chr5 (44-126)||(9171111-9171193)
chr5 (67-221)||(612759-612900)
chr5 (63-132)||(3940411-3940480)
chr5 (72-140)||(20207088-20207156)
chr5 (45-101)||(28756082-28756138)
chr5 (160-221)||(3940338-3940399)
chr5 (52-108)||(15300977-15301033)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (42-221)||(17600836-17601015)
chr2 (42-221)||(45370990-45371169)
chr2 (42-221)||(746466-746645)
chr2 (42-221)||(2324891-2325070)
chr2 (42-221)||(34518367-34518546)
chr2 (43-221)||(23901780-23901958)
chr2 (42-221)||(4034592-4034771)
chr2 (42-221)||(6594460-6594639)
chr2 (42-221)||(38997101-38997280)
chr2 (42-214)||(6430473-6430645)
chr2 (42-221)||(11184972-11185151)
chr2 (42-221)||(13815220-13815399)
chr2 (42-221)||(14660446-14660625)
chr2 (42-221)||(26710345-26710524)
chr2 (42-221)||(27651036-27651215)
chr2 (42-221)||(40635218-40635397)
chr2 (42-220)||(10424595-10424773)
chr2 (42-221)||(1091953-1092132)
chr2 (42-221)||(10244584-10244763)
chr2 (42-221)||(27400403-27400582)
chr2 (42-221)||(37255339-37255513)
chr2 (36-221)||(2914140-2914325)
chr2 (45-221)||(11159625-11159800)
chr2 (42-214)||(33427656-33427828)
chr2 (42-221)||(5726129-5726308)
chr2 (42-221)||(14697539-14697718)
chr2 (42-221)||(32327361-32327540)
chr2 (56-221)||(32856438-32856603)
chr2 (42-221)||(37620869-37621051)
chr2 (42-221)||(4609626-4609805)
chr2 (42-221)||(7892690-7892869)
chr2 (42-221)||(27024415-27024594)
chr2 (42-221)||(40735464-40735643)
chr2 (42-221)||(32948446-32948624)
chr2 (42-197)||(8432942-8433097)
chr2 (42-197)||(32608380-32608535)
chr2 (42-221)||(40037143-40037321)
chr2 (42-221)||(9444683-9444872)
chr2 (42-223)||(15925080-15925261)
chr2 (41-221)||(12842102-12842277)
chr2 (93-220)||(25294886-25295013)
chr2 (42-221)||(39103047-39103215)
chr2 (42-166)||(42899915-42900039)
chr2 (90-208)||(1229675-1229793)
chr2 (119-221)||(447635-447737)
chr2 (42-221)||(145282-145450)
chr2 (42-221)||(21734902-21735070)
chr2 (41-221)||(35158052-35158221)
chr2 (43-189)||(41172459-41172605)
chr2 (42-214)||(43898980-43899140)
chr2 (42-221)||(4258490-4258657)
chr2 (42-213)||(44481828-44481988)
chr2 (41-221)||(27331297-27331470)
chr2 (42-214)||(35126780-35126941)
chr2 (42-221)||(28641294-28641462)
chr2 (42-221)||(29687041-29687209)
chr2 (52-221)||(13543626-13543784)
chr2 (42-206)||(12333513-12333665)
chr2 (42-214)||(19428435-19428597)
chr2 (42-221)||(39301199-39301367)
chr2 (42-223)||(28566698-28566868)
chr2 (121-203)||(12827142-12827223)
chr2 (42-214)||(27764872-27765032)
chr2 (42-221)||(34249265-34249433)
chr2 (113-185)||(28014856-28014928)
chr2 (42-117)||(12814614-12814689)
chr2 (42-133)||(40544155-40544246)
chr2 (74-214)||(3711665-3711794)
chr2 (42-206)||(12730061-12730214)
chr2 (42-132)||(2000417-2000507)
chr2 (42-221)||(2688731-2688899)
chr2 (41-133)||(3266295-3266387)
chr2 (42-138)||(30545821-30545917)
chr2 (42-221)||(43356099-43356264)
chr2 (42-206)||(8056626-8056779)
chr2 (74-148)||(38985342-38985415)
chr2 (168-211)||(42900781-42900824)
chr2 (165-221)||(3266399-3266455)
chr2 (42-82)||(28019962-28020002)
chr2 (42-80)||(1897130-1897168)
chr2 (42-108)||(10176559-10176625)
chr2 (124-173)||(17799296-17799345)
[»] chr1 (110 HSPs)
chr1 (43-214)||(4068692-4068863)
chr1 (42-221)||(31308002-31308181)
chr1 (42-221)||(45538154-45538333)
chr1 (42-221)||(3611137-3611316)
chr1 (42-221)||(25058689-25058868)
chr1 (42-221)||(25678261-25678440)
chr1 (42-221)||(44661971-44662150)
chr1 (36-221)||(21139414-21139599)
chr1 (42-214)||(17994960-17995132)
chr1 (43-223)||(43251713-43251893)
chr1 (42-221)||(26277178-26277357)
chr1 (42-221)||(38790199-38790378)
chr1 (42-221)||(47671587-47671766)
chr1 (42-221)||(5981171-5981350)
chr1 (42-221)||(26085400-26085578)
chr1 (42-214)||(24245034-24245206)
chr1 (42-214)||(41999816-41999988)
chr1 (42-221)||(3285403-3285581)
chr1 (42-221)||(6327550-6327728)
chr1 (42-221)||(23984756-23984935)
chr1 (42-221)||(31040710-31040889)
chr1 (42-221)||(33884089-33884268)
chr1 (42-221)||(33959984-33960163)
chr1 (42-219)||(26794305-26794482)
chr1 (42-221)||(23932511-23932690)
chr1 (42-221)||(33112820-33112998)
chr1 (42-221)||(37620194-37620373)
chr1 (42-221)||(38331861-38332040)
chr1 (42-221)||(39646569-39646748)
chr1 (42-221)||(46967043-46967222)
chr1 (42-221)||(47383734-47383913)
chr1 (42-217)||(49253981-49254156)
chr1 (42-221)||(50774218-50774397)
chr1 (42-220)||(28888582-28888760)
chr1 (42-221)||(35273597-35273776)
chr1 (42-221)||(36566331-36566510)
chr1 (43-210)||(42863867-42864034)
chr1 (42-219)||(23220939-23221110)
chr1 (42-195)||(31844377-31844530)
chr1 (42-214)||(5980069-5980241)
chr1 (42-221)||(24885502-24885681)
chr1 (42-221)||(26524891-26525070)
chr1 (42-221)||(46784424-46784603)
chr1 (42-221)||(51057072-51057251)
chr1 (42-221)||(35692665-35692845)
chr1 (42-210)||(46616550-46616718)
chr1 (42-221)||(47317316-47317495)
chr1 (42-179)||(25518815-25518952)
chr1 (42-221)||(36003131-36003313)
chr1 (42-221)||(47187106-47187285)
chr1 (42-221)||(49398990-49399169)
chr1 (42-221)||(42313363-42313546)
chr1 (42-221)||(48373505-48373675)
chr1 (76-221)||(2450529-2450674)
chr1 (42-221)||(27983605-27983768)
chr1 (42-206)||(51403034-51403188)
chr1 (42-221)||(33073212-33073380)
chr1 (42-221)||(10928068-10928236)
chr1 (84-221)||(51045598-51045735)
chr1 (43-200)||(45475866-45476014)
chr1 (95-221)||(4808699-4808825)
chr1 (42-229)||(2657304-2657480)
chr1 (42-221)||(41467634-41467802)
chr1 (43-160)||(31979998-31980115)
chr1 (42-160)||(2556909-2557027)
chr1 (42-221)||(2954856-2955024)
chr1 (42-221)||(4953053-4953221)
chr1 (42-221)||(5961269-5961437)
chr1 (42-221)||(6626026-6626194)
chr1 (42-221)||(26685857-26686025)
chr1 (42-214)||(26472188-26472349)
chr1 (44-221)||(30289912-30290078)
chr1 (42-221)||(33187341-33187503)
chr1 (42-148)||(27924722-27924828)
chr1 (42-214)||(29770671-29770832)
chr1 (42-213)||(38716257-38716417)
chr1 (42-221)||(42234841-42235008)
chr1 (44-221)||(1388476-1388642)
chr1 (130-221)||(13312533-13312624)
chr1 (92-221)||(4156438-4156574)
chr1 (42-132)||(24649802-24649892)
chr1 (42-214)||(34752323-34752484)
chr1 (91-221)||(47772174-47772304)
chr1 (42-209)||(4243504-4243660)
chr1 (42-221)||(39475785-39475952)
chr1 (53-221)||(48683332-48683489)
chr1 (42-206)||(51155606-51155759)
chr1 (42-221)||(10920201-10920369)
chr1 (41-221)||(7561530-7561713)
chr1 (42-133)||(44544125-44544216)
chr1 (43-221)||(41895166-41895333)
chr1 (42-221)||(52323939-52324108)
chr1 (42-133)||(46428332-46428423)
chr1 (42-137)||(13313249-13313346)
chr1 (43-133)||(32448650-32448740)
chr1 (42-148)||(52367884-52367990)
chr1 (42-197)||(13281588-13281732)
chr1 (42-140)||(39637901-39637996)
chr1 (42-100)||(4156188-4156246)
chr1 (43-206)||(35991616-35991768)
chr1 (83-200)||(24215805-24215911)
chr1 (52-133)||(44293534-44293615)
chr1 (42-93)||(10919313-10919364)
chr1 (88-206)||(38718183-38718297)
chr1 (104-221)||(31286506-31286612)
chr1 (167-220)||(32448754-32448807)
chr1 (186-221)||(31844818-31844853)
chr1 (162-204)||(39359502-39359544)
chr1 (42-75)||(23994849-23994882)
chr1 (133-197)||(9779919-9779982)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (42-221)||(25893919-25894098)
chr7 (42-221)||(33423277-33423456)
chr7 (42-221)||(33695823-33696002)
chr7 (43-221)||(45690099-45690277)
chr7 (42-221)||(46913111-46913292)
chr7 (42-221)||(27018118-27018297)
chr7 (42-221)||(33839717-33839896)
chr7 (42-221)||(37846018-37846197)
chr7 (42-221)||(40670565-40670744)
chr7 (43-217)||(15877553-15877727)
chr7 (41-221)||(23393053-23393233)
chr7 (42-221)||(17855430-17855609)
chr7 (42-221)||(22979649-22979828)
chr7 (42-221)||(33411262-33411441)
chr7 (42-221)||(35355890-35356069)
chr7 (42-221)||(47066979-47067158)
chr7 (42-221)||(49171364-49171543)
chr7 (42-214)||(31586850-31587022)
chr7 (42-221)||(20165816-20165995)
chr7 (42-221)||(35328071-35328250)
chr7 (42-221)||(47740333-47740512)
chr7 (41-211)||(41990870-41991040)
chr7 (42-221)||(2341663-2341843)
chr7 (42-221)||(19563449-19563628)
chr7 (65-221)||(36389381-36389537)
chr7 (42-209)||(10028490-10028657)
chr7 (42-221)||(26579719-26579898)
chr7 (42-221)||(45482660-45482839)
chr7 (42-221)||(48609679-48609858)
chr7 (41-221)||(31625705-31625884)
chr7 (42-221)||(35757022-35757201)
chr7 (42-221)||(33332791-33332969)
chr7 (65-214)||(5183834-5183983)
chr7 (42-199)||(33870247-33870404)
chr7 (42-221)||(5712170-5712349)
chr7 (42-214)||(43499487-43499659)
chr7 (42-221)||(45063359-45063536)
chr7 (42-221)||(31429477-31429656)
chr7 (42-214)||(10618300-10618465)
chr7 (64-221)||(29446862-29447018)
chr7 (42-221)||(35767483-35767655)
chr7 (42-189)||(33720070-33720217)
chr7 (86-221)||(28233938-28234073)
chr7 (92-221)||(30076529-30076658)
chr7 (42-221)||(35752036-35752204)
chr7 (42-217)||(48085860-48086024)
chr7 (42-214)||(46817430-46817591)
chr7 (42-209)||(43489220-43489376)
chr7 (58-199)||(44564356-44564497)
chr7 (42-221)||(46898018-46898186)
chr7 (42-221)||(2332021-2332189)
chr7 (42-221)||(24228543-24228711)
chr7 (42-221)||(33393330-33393498)
chr7 (45-221)||(7876330-7876495)
chr7 (42-218)||(26941537-26941702)
chr7 (42-214)||(36816854-36817015)
chr7 (42-206)||(41855061-41855214)
chr7 (107-221)||(41904272-41904386)
chr7 (42-221)||(24923026-24923194)
chr7 (42-221)||(37127939-37128107)
chr7 (42-221)||(44003372-44003540)
chr7 (104-209)||(44405412-44405517)
chr7 (42-133)||(47906838-47906929)
chr7 (42-148)||(16482847-16482953)
chr7 (41-221)||(47460774-47460943)
chr7 (42-221)||(7257383-7257551)
chr7 (42-221)||(45502818-45502986)
chr7 (42-223)||(15643946-15644116)
chr7 (42-206)||(498205-498358)
chr7 (42-221)||(21718119-21718286)
chr7 (42-209)||(29610637-29610793)
chr7 (42-214)||(25037517-25037678)
chr7 (42-189)||(32556640-32556776)
chr7 (46-209)||(46103127-46103278)
chr7 (41-214)||(26371050-26371212)
chr7 (42-141)||(29863017-29863116)
chr7 (42-132)||(29098753-29098843)
chr7 (42-228)||(35484638-35484814)
chr7 (52-152)||(38448508-38448608)
chr7 (42-221)||(39453484-39453645)
chr7 (41-133)||(39866666-39866758)
chr7 (42-133)||(33455098-33455189)
chr7 (42-133)||(39323618-39323709)
chr7 (42-214)||(44659846-44660006)
chr7 (42-209)||(45237547-45237703)
chr7 (42-108)||(35557732-35557798)
chr7 (42-141)||(7720574-7720673)
chr7 (88-149)||(26456157-26456218)
chr7 (42-148)||(21649442-21649549)
chr7 (42-105)||(30077043-30077106)
chr7 (84-221)||(37443604-37443730)
chr7 (155-221)||(39323712-39323777)
chr7 (42-103)||(35823292-35823353)
chr7 (165-218)||(39866762-39866815)
chr7 (151-219)||(29098847-29098915)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (43-221)||(1871-2049)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (42-221)||(39558-39737)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (43-221)||(11135-11312)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (42-221)||(278007-278188)
scaffold0007 (53-221)||(176666-176834)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (42-214)||(2441-2613)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (42-221)||(75246-75425)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (42-221)||(18856-19035)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (42-195)||(32562-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (41-221)||(4598-4772)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (42-221)||(3089-3259)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (42-221)||(20479-20647)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (42-221)||(7091-7260)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (42-221)||(14745-14913)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (42-148)||(103-209)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (42-148)||(4618-4725)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (42-148)||(3393-3500)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (42-189)||(17907-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (52-147)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38416906 - 38416726
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38416906 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38416807  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38416806 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 38416726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 47257794 - 47257973
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47257794 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 47257893  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47257894 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47257973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7855295 - 7855116
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7855295 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccac 7855196  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7855195 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 7855116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134536
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtca 46134536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51170214 - 51170035
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51170214 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51170115  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51170114 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 51170035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27067159 - 27066980
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  27067159 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 27067060  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27067059 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtca 27066980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29626008 - 29625833
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29626008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29625909  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29625908 ttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaatt 29625833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40131140 - 40130961
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40131140 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccac 40131041  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40131040 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 40130961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 49330038 - 49330217
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49330038 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49330137  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49330138 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtca 49330217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47809778 - 47809598
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47809778 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47809679  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47809678 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47809598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48739414 - 48739226
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48739414 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 48739315  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaat 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  48739314 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctataaat 48739226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 22399098 - 22399276
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22399098 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccac 22399197  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22399198 tt-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 22399276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 24100284 - 24100462
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24100284 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 24100382  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24100383 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 24100462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28048573 - 28048394
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28048573 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 28048474  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28048473 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 28048394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35748492 - 35748313
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35748492 ttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35748393  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35748392 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtca 35748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 40643801 - 40643980
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  40643801 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcat 40643900  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40643901 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 40643980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41464353 - 41464532
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41464353 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 41464452  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  41464453 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtca 41464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 223
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609905
Alignment:
Q  50 agattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 149  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  150 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 48609905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40804692 - 40804512
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40804692 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggatacca 40804593  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40804592 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 40804512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53943768 - 53943604
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53943768 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 53943669  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53943668 ttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 53943604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32234578 - 32234400
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32234578 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32234479  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32234478 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 32234400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 40419836 - 40420015
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40419836 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40419935  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40419936 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtca 40420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 42291843 - 42292022
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42291843 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 42291942  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42291943 ttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 42292022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43612228 - 43612049
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  43612228 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccac 43612129  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43612128 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 43612049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293321
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtca 41293321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 221
Target Start/End: Original strand, 18946898 - 18947083
Alignment:
Q  36 atataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 135  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18946898 atatgattttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatgga 18946997  T
Q  136 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18946998 taccagttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtca 18947083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51102559 - 51102370
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  51102559 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 51102460  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaata 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  51102459 ttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcaccgataaata 51102370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51452940 - 51452753
Alignment:
Q  33 taaatataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 132  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51452940 taaataaagttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttat 51452841  T
Q  133 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51452840 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtca 51452753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 2666001 - 2666180
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2666001 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2666100  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  2666101 ttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtca 2666180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 37324542 - 37324721
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37324542 ttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 37324641  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37324642 ttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 37324721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39634752 - 39634574
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39634752 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccac 39634654  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39634653 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtca 39634574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41732529 - 41732708
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41732529 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 41732628  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  41732629 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtca 41732708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 44222830 - 44223009
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  44222830 ttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccac 44222929  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44222930 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 44223009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 44806685 - 44806864
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44806685 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccac 44806784  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44806785 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtca 44806864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 52628959 - 52629133
Alignment:
Q  46 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52628959 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 52629058  T
Q  146 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52629059 aaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 52629133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55453425 - 55453246
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55453425 ttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 55453326  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  55453325 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 55453246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Original strand, 37313400 - 37313568
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  37313400 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 37313499  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313500 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 37313568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7755487 - 7755309
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7755487 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccac 7755388  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7755387 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtca 7755309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20754574 - 20754395
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  20754574 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcac 20754475  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  20754474 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtca 20754395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  46 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  146 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 52638843 - 52639022
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52638843 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccac 52638942  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  52638943 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtca 52639022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 35594122 - 35594299
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  35594122 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35594221  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35594222 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 24376574 - 24376730
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376574 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 24376673  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattc 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24376674 ttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 46126011 - 46126166
Alignment:
Q  65 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46126011 aatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggcta 46126110  T
Q  165 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  46126111 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 46126166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47895001 - 47894822
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47895001 ttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47894902  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47894901 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215252
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaatt 52215252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 36368940 - 36369105
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36368940 ttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36369039  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36369040 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggt 36369105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 43125832 - 43125990
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43125832 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 43125931  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43125932 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 43125990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021895
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggga-tcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtca 43021895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Original strand, 39053395 - 39053550
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39053395 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccac 39053494  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  39053495 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatt 39053550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53832665 - 53832486
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||     
T  53832665 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaa 53832566  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  53832565 ttaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 190
Target Start/End: Original strand, 53637842 - 53637990
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  53637842 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccac 53637941  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacc 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  53637942 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41216456 - 41216635
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  41216456 ttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccac 41216555  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41216556 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtca 41216635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  45 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 144  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  145 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51146396 - 51146224
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||  | ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51146396 ttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 51146297  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51146296 ttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 51146224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5560213 - 5560027
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggat 136  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5560213 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggat 5560114  T
Q  137 accacttaaaaatgtgcttatgtggc--taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5560113 accacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 5560027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54159169 - 54158998
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  54159169 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccac 54159070  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54159069 ttaaaaatgtgctta---------tgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 54158998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48547010 - 48546840
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48547010 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaa-atagttcatggataccac 48546913  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    ||||||||||||||         |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48546912 ttaaaaatgtgctt---------atgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcatc 48546840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 49130579 - 49130746
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||        
T  49130579 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaata---- 49130674  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  49130675 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 187
Target Start/End: Original strand, 37758930 - 37759075
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||    
T  37758930 ttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccac 37759029  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37759030 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 55379986 - 55380154
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  55379986 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 55380085  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  55380086 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 55380154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 25641647 - 25641808
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  25641647 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 25641736  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  25641737 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 25641808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 42589831 - 42589992
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  42589831 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42589922  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  42589923 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42589992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Original strand, 54401188 - 54401353
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  54401188 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 54401279  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 218  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  54401280 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattg 54401353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 25353555 - 25353723
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25353555 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 25353654  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25353655 ctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 25353723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 53115448 - 53115616
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53115448 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 53115547  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  53115548 ttaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtca 53115616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864669
Alignment:
Q  101 agcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgag-taaattacccaccattctt 52864648  T
Q  201 ccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtca 52864669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34279891 - 34279738
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  34279891 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 34279800  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  34279799 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 34279738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54707390 - 54707229
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  54707390 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 54707299  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  54707298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 54707229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550469
Alignment:
Q  108 tgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatggg 207  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  208 taccctaattgtca 221  Q
    ||||||| ||||||    
T  33550482 taccctagttgtca 33550469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38156802 - 38156634
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  38156802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38156711  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38156710 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 38156634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47511110 - 47510942
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  47511110 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 47511019  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  47511018 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 47510942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 51415970 - 51416138
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||         
T  51415970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 51416064  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51416065 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 51416138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30251671 - 30251503
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30251671 ttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 30251572  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30251571 ctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 30251503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55000348 - 55000180
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||        
T  55000348 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata---- 55000253  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  55000252 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 55000180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39141296 - 39141141
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||         
T  39141296 ttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 39141202  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  39141201 ----atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 39141141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31286964 - 31286795
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  31286964 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 31286872  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  31286871 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtca 31286795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 40022074 - 40022231
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  40022074 attttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 40022166  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40022167 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggta 40022231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 51143817 - 51143986
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  51143817 attttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacca 51143916  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  51143917 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtca 51143986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41635970 - 41635814
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  41635970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 41635879  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41635878 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggta 41635814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176740
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||            |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43176808 ctaaaaaggtg-----------gatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtca 43176740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 45058884 - 45059052
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  45058884 ttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 45058975  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  45058976 ---aatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21597318 - 21597220
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21597318 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882063
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 172
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  90 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 24688115 - 24688283
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  24688115 ttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 24688206  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24688207 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 24688283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42998958 - 42998791
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42998958 ttttttctagattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 42998860  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  42998859 ctaaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtca 42998791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2228105 - 2227995
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||    
T  2228105 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcac 2228006  T
Q  142 ttaaaaatgtg 152  Q
    || ||||||||    
T  2228005 ttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17665694 - 17665549
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  17665694 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 17665603  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattc 198  Q
       || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17665602 ---aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 37028724 - 37028885
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||            
T  37028724 ttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg-------- 37028815  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37028816 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 37028885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50732083 - 50731986
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  50732083 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Original strand, 50780773 - 50780870
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  50780773 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Original strand, 177154 - 177268
Alignment:
Q  34 aaatataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  177154 aaatataattttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatg 177253  T
Q  134 gataccacttaaaaa 148  Q
    ||||| || ||||||    
T  177254 gatacaacctaaaaa 177268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51224207 - 51224047
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  51224207 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 51224117  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  51224116 ---aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagccta 51224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8847827 - 8847718
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  8847827 tttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccact 8847728  T
Q  143 taaaaatgtg 152  Q
    ||||||||||    
T  8847727 taaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28576282 - 28576184
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28576282 ttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 48726168 - 48726070
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  48726168 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429229
Alignment:
Q  136 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtca 30429229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165812
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 213  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40165752 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccct 40165812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 52434140 - 52434216
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataa-tttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434140 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 48752086 - 48752161
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752086 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  50 agattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 149  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  150 gtg 152  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534016
Alignment:
Q  148 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 48534016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 44946099 - 44946014
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatag 127  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  44946099 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag 44946014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 152
Target Start/End: Original strand, 41609100 - 41609178
Alignment:
Q  74 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  | || ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41609100 taatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52756207 - 52756069
Alignment:
Q  76 atttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat----gtgta 171  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||    |||||    
T  52756207 atttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaattaatgtgta 52756119  T
Q  172 ttggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52756118 ttggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 52756069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44946010 - 44945937
Alignment:
Q  148 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  44946010 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtca 44945937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731916
Alignment:
Q  172 ttggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50731916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780940
Alignment:
Q  172 ttggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50780940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 93
Target Start/End: Original strand, 37741436 - 37741487
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaat 93  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37741436 ttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688481
Alignment:
Q  171 attggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtca 40688481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 214
Target Start/End: Original strand, 37760345 - 37760378
Alignment:
Q  181 ataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37760345 ataaattacccaccattcttccataggtacccta 37760378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752283
Alignment:
Q  164 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||| ||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtca 48752283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 51942586 - 51942546
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacc 82  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  51942586 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacc 51942546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 44984763 - 44984941
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44984763 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 44984862  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44984863 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 44984941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 34276548 - 34276727
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34276548 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 34276647  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34276648 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 34276727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21366789 - 21366611
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21366789 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21366690  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21366689 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 21366611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020108
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6020108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 9798466 - 9798645
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9798466 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 9798565  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9798566 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9798645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 23437593 - 23437772
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23437593 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23437692  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23437693 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23437772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31532316 - 31532137
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31532316 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31532217  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31532216 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 31532137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972338
Alignment:
Q  44 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  144 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtca 31972338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 237478 - 237650
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  237478 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacac 237577  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237578 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 237650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 41560329 - 41560501
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560329 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 41560428  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560429 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 41560501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32366841 - 32366662
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32366841 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32366742  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32366741 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 32366662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 42085208 - 42085387
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42085208 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 42085307  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42085308 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 42085387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42766022 - 42765844
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42766022 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 42765924  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42765923 ttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 42765844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53854610 - 53854432
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53854610 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 53854511  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  53854510 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 53854432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 39077546 - 39077735
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39077546 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 39077645  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaata 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  39077646 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacctataaata 39077735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41702640 - 41702459
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41702640 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 41702541  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41702540 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcatc 41702459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22618694 - 22618516
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22618694 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacca 22618596  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22618595 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttagg-taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 22618516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2826862 - 2826684
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2826862 ttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2826763  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2826762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 2826684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18462194 - 18462015
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18462194 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 18462095  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18462094 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 18462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19387869 - 19387690
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19387869 ttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 19387770  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19387769 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 19387690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 27373077 - 27373255
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27373077 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 27373176  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27373177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtca 27373255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 50234001 - 50234180
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50234001 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccac 50234100  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  50234101 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtca 50234180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 51363008 - 51363186
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51363008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 51363107  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51363108 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 51363186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53461997 - 53461818
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53461997 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 53461898  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  53461897 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 53461818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 54575121 - 54574942
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54575121 ttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccac 54575022  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54575021 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54574942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 55519828 - 55520007
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55519828 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccac 55519927  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55519928 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 55520007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Original strand, 397403 - 397584
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  397403 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 397502  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  397503 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcatc 397584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50457991 - 50457810
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457991 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 50457892  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50457891 ttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 50457810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 146610 - 146431
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  146610 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 146511  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  146510 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtca 146431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3692391 - 3692212
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  3692391 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccac 3692292  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3692291 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 3692212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26091439 - 26091260
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26091439 ttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26091340  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26091339 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26091260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 29478361 - 29478540
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29478361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29478460  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29478461 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 29478540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29777438 - 29777259
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  29777438 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccac 29777339  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29777338 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 29777259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 31914199 - 31914377
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31914199 ttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31914298  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31914299 ttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 31914377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43471876 - 43471697
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43471876 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccac 43471777  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43471776 ttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 43471697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 45797480 - 45797659
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45797480 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45797579  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45797580 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtca 45797659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 47344657 - 47344836
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47344657 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47344756  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47344757 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47344836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55056440 - 55056269
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  55056440 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 55056341  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55056340 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccct 55056269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 6285308 - 6285486
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6285308 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6285407  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6285408 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41949383 - 41949564
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41949383 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 41949482  T
Q  142 ttaaaaatgtgct--tatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  41949483 ttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtca 41949564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49881244 - 49881061
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49881244 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 49881145  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt----gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49881144 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtca 49881061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47662283 - 47662104
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  47662283 ttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccac 47662184  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47662183 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 47662104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 54086411 - 54086588
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54086411 ttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgc 54086508  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54086509 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54086588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 55776046 - 55776224
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55776046 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 55776144  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  55776145 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtca 55776224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 55840224 - 55840402
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55840224 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 55840322  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  55840323 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtca 55840402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 42222291 - 42222471
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42222291 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgatacca 42222390  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  42222391 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtca 42222471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 54607963 - 54608135
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54607963 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 54608062  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  54608063 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggatacccta 54608135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 407755 - 407932
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  407755 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 407853  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  407854 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 407932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 3170627 - 3170806
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  3170627 ttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 3170726  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  3170727 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtca 3170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 23609088 - 23609267
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23609088 ttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccac 23609187  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23609188 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtca 23609267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 42033176 - 42033355
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42033176 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 42033275  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42033276 ttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 42033355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Original strand, 50534631 - 50534801
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50534631 attttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 50534730  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534731 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 50534801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 35446507 - 35446683
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  35446507 ttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35446605  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35446606 ttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 2243459 - 2243638
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2243459 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccac 2243558  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2243559 ttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2243638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatg 205  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31070254 - 31070076
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  31070254 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccac 31070156  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31070155 ttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 31070076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 56023179 - 56023000
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56023179 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 56023080  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  56023079 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtca 56023000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33897675 - 33897501
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33897675 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33897576  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33897575 taaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtaccctaatt 33897501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 38591669 - 38591844
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38591669 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 38591768  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38591769 t----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 38591844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48655000
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggcta------atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtca 48655000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39587960 - 39587796
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39587960 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39587861  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39587860 ttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 48313558 - 48313735
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48313558 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 48313656  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || ||||| ||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48313657 tt-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 48313735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 1932764 - 1932936
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1932764 ttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccac 1932863  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  1932864 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtacccta 1932936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14017555 - 14017378
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14017555 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14017456  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14017455 tt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtca 14017378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53834236 - 53834056
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53834236 attttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggatacca 53834137  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53834136 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 53834056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41632187 - 41632009
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  41632187 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcgc 41632089  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41632088 ttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtca 41632009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 48657826 - 48657998
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |      || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48657826 tttttttagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 48657919  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48657920 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48657998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54805799 - 54805623
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54805799 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccac 54805700  T
Q  142 ttaaaaatgtg----cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  54805699 ttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtacccta 54805623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50536805 - 50536628
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50536805 ttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 50536706  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50536705 ttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 54424983 - 54425147
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54424983 ttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 54425082  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54425083 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccatgg 54425147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9998101 - 9997933
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  9998101 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg-------- 9998010  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9998009 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9997933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259528
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  48259591 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Original strand, 51951682 - 51951863
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||    
T  51951682 attttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatca 51951781  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51951782 gttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgtg-taaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcatc 51951863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52728445 - 52728309
Alignment:
Q  84 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||    
T  52728445 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgaggta 52728346  T
Q  184 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52728345 aattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 52728309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532832
Alignment:
Q  97 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccat 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  197 tcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtca 36532832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 54715036 - 54715197
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||            
T  54715036 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg-------- 54715127  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54715128 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 54715197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351856
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||            
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 20351921  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20351920 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 20351856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891097
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||            
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg-------- 43891020  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  43891021 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtca 43891097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45633949 - 45633773
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  45633949 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 45633858  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaa 229  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  45633857 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccgataaa 45633773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Original strand, 54216314 - 54216484
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  54216314 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 54216405  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
       || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  54216406 ---aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtcatc 54216484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54216906 - 54216745
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  54216906 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 54216815  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  54216814 ---aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggatacccta 54216745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15060459 - 15060291
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  15060459 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 15060368  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15060367 ---aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 15060291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 47811907 - 47812075
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| |||        
T  47811907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata---- 47812002  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47812003 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtca 47812075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595867
Alignment:
Q  126 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 35595867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 33289704 - 33289865
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||       
T  33289704 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac--- 33289800  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  33289801 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 33289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509469
Alignment:
Q  96 aaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacca 195  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  196 ttcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtacccta 42509469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 34835178 - 34835346
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||     
T  34835178 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 34835277  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34835278 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 34835346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38547771 - 38547603
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38547771 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 38547672  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  38547671 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtca 38547603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5117608 - 5117461
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  5117608 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 5117517  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5117516 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 5117461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1662429 - 1662323
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1662429 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 1662330  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
     ||||||    
T  1662329 ctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37239260 - 37239099
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  37239260 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 37239169  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37239168 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 37239099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27398773 - 27398607
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27398773 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27398674  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    ||||||||||            ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  27398673 ttaaaaatgt-----------aaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 46720026 - 46720195
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  46720026 ttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccac 46720125  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
     |||||| |||  |||       |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  46720126 ctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335165
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
     ||||||    
T  14335171 ctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580226
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
     ||||||    
T  27580220 ctaaaaa 27580226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 52688350 - 52688511
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  52688350 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-------- 52688441  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  52688442 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 52688511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 34552320 - 34552488
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||            
T  34552320 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg-------- 34552411  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  34552412 ---aatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 34552488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 179
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  89 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573972
Alignment:
Q  45 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  145 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  573907 aaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtca 573972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 22620594 - 22620755
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  22620594 ttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 22620685  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  22620686 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagccta 22620755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31881484 - 31881323
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  31881484 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31881393  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  31881392 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagccta 31881323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4486751 - 4486604
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||            
T  4486751 ttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 4486660  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4486659 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 4486604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344967
Alignment:
Q  121 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgg-taaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708743
Alignment:
Q  45 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 144  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||               
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 46708820  T
Q  145 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||    
T  46708819 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtca 46708743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6371419 - 6371251
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || | || ||||||    
T  6371419 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccac 6371320  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  6371319 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtca 6371251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27873718 - 27873571
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  27873718 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg-------- 27873627  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27873626 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 27873571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33558113 - 33557942
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||           
T  33558113 attttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg------- 33558021  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
        || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  33558020 ----aatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgaatagcctaattgtcatc 33557942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 52461367 - 52461517
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||        
T  52461367 ttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata---- 52461459  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  52461460 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 52461517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3293193 - 3293102
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  3293193 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 221
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049061
Alignment:
Q  150 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33049061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872748
Alignment:
Q  69 gtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  169 gtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtca 27872748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 49014099 - 49014267
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  49014099 ttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 49014190  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  49014191 ---aatatgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 49014267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 125
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11972299 - 11972208
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  11972299 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Original strand, 43231504 - 43231601
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43231504 ttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259706
Alignment:
Q  146 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtca 48259706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981493
Alignment:
Q  78 ttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 177  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 51981525  T
Q  178 gggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
    ||| |||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  51981524 ggggtaaattactcatcattctttcattggta 51981493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| || | | || ||||||||| |||||||     
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  142 ttaaaa 147  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291807
Alignment:
Q  155 tatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtca 3291807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 209
Target Start/End: Original strand, 42558271 - 42558353
Alignment:
Q  119 tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42558271 tcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggta 42558353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17555667 - 17555617
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17555667 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206583
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaag----atagttcatggataccacttaaaa 147  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662263
Alignment:
Q  171 attggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtca 1662263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 49304602 - 49304671
Alignment:
Q  139 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  49304602 cacttaaaaatgtatttatgtggctgatgtttattggtt-gaataaattacccaccaattttctatgggta 49304671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13943 - 13764
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13943 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13844  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13843 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 13764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32984258 - 32984079
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32984258 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32984159  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32984158 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 32984079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646303
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 10646303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 43328708 - 43328887
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43328708 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43328807  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328808 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 43328887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24080082 - 24079903
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24080082 ttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24079983  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24079982 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 24079903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41862221 - 41862400
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41862221 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 41862320  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41862321 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtca 41862400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 6365987 - 6366166
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6365987 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccac 6366086  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  6366087 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtca 6366166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40435334 - 40435155
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40435334 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 40435235  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40435234 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 40435155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5946048 - 5946227
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5946048 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 5946147  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5946148 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtca 5946227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9303755 - 9303576
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9303755 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 9303656  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9303655 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9303576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33730822 - 33730643
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33730822 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33730723  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33730722 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 33730643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 37956422 - 37956601
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37956422 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 37956521  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  37956522 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtca 37956601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088446
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17718904 - 17718731
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17718904 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggatacca 17718805  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718804 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 17718731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Original strand, 25185902 - 25186079
Alignment:
Q  44 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 143  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25185902 ttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactt 25186001  T
Q  144 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25186002 aaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtca 25186079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714714
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 9734256 - 9734433
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9734256 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 9734354  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9734355 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9734433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33981844 - 33981665
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33981844 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33981745  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33981744 ttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 33981665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37301506 - 37301327
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  37301506 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccac 37301407  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37301406 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 37301327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41653896 - 41654075
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  41653896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccac 41653995  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41653996 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 41654075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 9013685 - 9013863
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9013685 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 9013784  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9013785 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagg-taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 9013863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  46 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  146 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 37419941 - 37420120
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37419941 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 37420040  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37420041 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 37420120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45066773 - 45066598
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45066773 ttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45066674  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45066673 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaatt 45066598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45236746 - 45236567
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45236746 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 45236647  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  45236646 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtca 45236567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13760829 - 13760663
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13760829 ttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 13760730  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13760729 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggt 13760663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29048584 - 29048426
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29048584 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 29048485  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29048484 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13356301 - 13356122
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13356301 ttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13356202  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13356201 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtca 13356122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41231947 - 41232126
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41231947 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 41232046  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  41232047 ttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtca 41232126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 2275914 - 2276080
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2275914 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2276013  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2276014 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggta 2276080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 35628778 - 35628957
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35628778 ttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccac 35628877  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  35628878 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtca 35628957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 25248040 - 25248213
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25248040 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25248133  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25248134 tttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtca 25248213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 22878392 - 22878571
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22878392 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccac 22878491  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22878492 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtca 22878571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 41639915 - 41640094
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  41639915 ttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgc 41640014  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  41640015 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtca 41640094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033110
Alignment:
Q  97 aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccat 196  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  197 tcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtca 12033110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 45258511 - 45258675
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  45258511 ttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccat 45258610  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45258611 ttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701301
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  142 tta---aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 211  Q
    |||   ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 214
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904249
Alignment:
Q  90 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  190 ccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtacccta 3904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981648
Alignment:
Q  107 ttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  207 gtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||| ||||||    
T  41981634 ataccctagttgtca 41981648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4447465 - 4447297
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||            
T  4447465 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 4447374  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4447373 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 4447297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 10378310 - 10378478
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||            
T  10378310 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 10378401  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10378402 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 10378478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 41843254 - 41843410
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||            
T  41843254 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg-------- 41843345  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41843346 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336274
Alignment:
Q  110 ttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  210 ccctaattgtca 221  Q
    ||||| ||||||    
T  31336263 ccctagttgtca 31336274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 31940316 - 31940476
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  31940316 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31940407  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31940408 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagccta 31940476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211374
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||            
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg-------- 3211297  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3211298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 3211374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 9713690 - 9713848
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  9713690 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacc---caaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 9713778  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9713779 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 9713848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 117500 - 117331
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  117500 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 117408  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  117407 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 117331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 38631653 - 38631806
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||            
T  38631653 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg-------- 38631744  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
       || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38631745 ---aatatatgcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39915993 - 39915887
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39915993 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 39915894  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
    |||||||    
T  39915893 ttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40458942 - 40458781
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  40458942 ttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 40458851  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  40458850 ---aatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagccta 40458781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 2379141 - 2379309
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||            
T  2379141 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-------- 2379232  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  2379233 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtca 2379309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373744
Alignment:
Q  46 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 145  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  146 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatgg 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3490569 - 3490401
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3490569 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccac 3490470  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  3490469 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtca 3490401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975416
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||             
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 4975486  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
      || |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4975485 --aatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 4975416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33897012 - 33896845
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  33897012 ttttttctagattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccac 33896914  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  33896913 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtca 33896845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Original strand, 41981457 - 41981535
Alignment:
Q  65 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 143  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41981457 aatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31149060 - 31148953
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  31149060 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccac 31148962  T
Q  142 ttaaaaatg 150  Q
    |||||||||    
T  31148961 ttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27243309 - 27243218
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  27243309 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27254884 - 27254793
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  27254884 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649840
Alignment:
Q  53 ttacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 152  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||           ||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtg 40649902  T
Q  153 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagccta 40649840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26196486 - 26196335
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  26196486 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 26196388  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatg 205  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26196387 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatg 26196335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9509570 - 9509409
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  9509570 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-------- 9509479  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9509478 ---aatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 9509409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622483
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||| ||||||||||            
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttatggg-tcaaaatagttcatg-------- 33622545  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
       || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  33622544 ---aatatgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcatgg 33622483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425438
Alignment:
Q  148 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||| ||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattatccataattcttttatgggtagccta 41425438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164791
Alignment:
Q  47 tctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgt 110  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttgt 164791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901737
Alignment:
Q  158 gtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtca 39901737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 2179082 - 2179045
Alignment:
Q  65 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgag 102  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2179082 aatggtggataacttagctaccaaccaatgaaaatgag 2179045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5882507 - 5882686
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5882507 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5882606  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5882607 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 5882686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22551242 - 22551063
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551242 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 22551143  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22551142 ctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 22551063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 24168092 - 24168271
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24168092 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24168191  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24168192 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 24168271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892370
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtcatc 2892370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14891560 - 14891383
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14891560 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14891461  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14891460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2594033 - 2593854
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2594033 ttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2593934  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2593933 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtca 2593854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26377385 - 26377206
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26377385 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26377286  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26377285 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26377206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34528043 - 34527864
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34528043 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 34527944  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34527943 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 34527864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7345293 - 7345106
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7345293 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 7345194  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  7345193 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtcatcgataaa 7345106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7393767 - 7393588
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7393767 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7393668  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7393667 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtca 7393588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 8615241 - 8615420
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8615241 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 8615340  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8615341 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 8615420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101497
Alignment:
Q  44 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  144 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtca 18101497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30743630 - 30743454
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30743630 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggatacca 30743531  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30743530 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaatt 30743454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 599893 - 600072
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  599893 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 599992  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  599993 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 600072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 960085 - 959906
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  960085 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccac 959986  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  959985 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 959906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988976
Alignment:
Q  54 tacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 153  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  154 ttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 11988976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 16703367 - 16703542
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16703367 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 16703466  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  16703467 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatcctaatt 16703542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19415714 - 19415535
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19415714 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccac 19415615  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19415614 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 19415535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 28947088 - 28947267
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  28947088 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 28947187  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28947188 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 28947267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5294983 - 5294803
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294983 attttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 5294884  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5294883 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtca 5294803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5299535 - 5299355
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299535 attttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 5299436  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5299435 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtca 5299355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Original strand, 1970712 - 1970880
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  1970712 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 1970811  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970812 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 1970880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10508089 - 10507910
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10508089 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10507990  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  10507989 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtca 10507910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341790
Alignment:
Q  54 tacctttgaaaaatggtggataatttacctacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 151  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  152 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 22341790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19281236 - 19281057
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  19281236 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 19281137  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  19281136 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtca 19281057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452574
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtca 33452574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24224252 - 24224072
Alignment:
Q  42 ttttttctagatt-acctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24224252 ttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacca 24224153  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  24224152 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtca 24224072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30467784 - 30467656
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30467784 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 30467685  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgt 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30467684 ttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23262078 - 23261931
Alignment:
Q  74 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  23262078 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtatt 23261979  T
Q  174 ggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  23261978 ggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtca 23261931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 7167583 - 7167751
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7167583 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 7167682  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7167683 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 7167751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28949015 - 28948847
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||            
T  28949015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 28948924  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28948923 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 28948847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 13329382 - 13329543
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||              
T  13329382 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 13329471  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  13329472 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 13329543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 15965434 - 15965602
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||            
T  15965434 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatg-------- 15965525  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15965526 ---aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 15965602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 1398554 - 1398722
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||            
T  1398554 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg-------- 1398645  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  1398646 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtca 1398722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 3786750 - 3786928
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  3786750 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg-------- 3786841  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaata 231  Q
       || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||| || | |||||||    
T  3786842 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaataaata 3786928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 929660 - 929741
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaag 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  929660 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291177
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtca 3291177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487689
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 4487619  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4487620 ---aatatgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 4487689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 375894 - 375729
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||      
T  375894 ttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc-- 375797  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  375796 -taaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939579
Alignment:
Q  47 tctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 137  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661903
Alignment:
Q  148 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 18661903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262399
Alignment:
Q  164 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 34262399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913114
Alignment:
Q  148 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatg 24913114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||| |||||| ||| |||  |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 27368296 - 27368259
Alignment:
Q  1 ttggcatgatacacaatcattttgtcgagtaataaata 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27368296 ttggcatgatacacaatcattttgtcgagtaatcaata 27368259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 27458643 - 27458606
Alignment:
Q  1 ttggcatgatacacaatcattttgtcgagtaataaata 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27458643 ttggcatgatacacaatcattttgtcgagtaatcaata 27458606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 24253383 - 24253562
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24253383 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24253482  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24253483 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 24253562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 35626039 - 35626218
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626039 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 35626138  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35626139 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtca 35626218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43326560 - 43326388
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43326560 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43326461  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326460 ttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 43326388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 7722050 - 7722229
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7722050 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7722149  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 7722229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398484
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtca 15398484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Original strand, 6901800 - 6901981
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6901800 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 6901899  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6901900 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 6901981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 739885 - 739706
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  739885 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 739786  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  739785 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 739706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 12648798 - 12648977
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12648798 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 12648897  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12648898 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 12648977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43262364 - 43262185
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43262364 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43262265  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43262264 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 43262185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939077
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  152 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 31939077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479677
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggatacccta 18479677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40886208 - 40886037
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40886208 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40886109  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886108 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 40886037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3466862 - 3466683
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3466862 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3466763  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  3466762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtca 3466683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5184973 - 5185152
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5184973 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 5185072  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5185073 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtca 5185152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27501236 - 27501057
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27501236 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27501137  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27501136 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 27501057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 39932580 - 39932759
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39932580 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39932679  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39932680 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtca 39932759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 27938898 - 27939078
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27938898 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27938997  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatggg-taccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27938998 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtca 27939078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484294
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 2484294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 15683792 - 15683971
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15683792 ttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15683891  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  15683892 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtca 15683971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 25831522 - 25831700
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  25831522 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaa 25831620  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  25831621 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtca 25831700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27278658 - 27278475
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatag----ttcatggata 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||    
T  27278658 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggata 27278559  T
Q  138 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27278558 ccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 27278475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 890907 - 891085
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  890907 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccac 891006  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  891007 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtca 891085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789297
Alignment:
Q  78 ttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  178 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 29789297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504744
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 13504744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756489
Alignment:
Q  49 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  149 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt-ccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtca 38756489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278860
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 151  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  152 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtca 40278860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28424974 - 28424797
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28424974 ttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 28424877  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  28424876 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtca 28424797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5137716 - 5137895
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5137716 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5137815  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  5137816 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtca 5137895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Original strand, 40110235 - 40110414
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40110235 ttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccac 40110333  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40110334 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtcat 40110414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Original strand, 34451293 - 34451430
Alignment:
Q  84 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34451293 accaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggta 34451392  T
Q  184 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34451393 aattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 34451430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 33617586 - 33617754
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  33617586 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 33617677  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33617678 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtca 33617754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Original strand, 40632500 - 40632634
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40632500 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-- 40632597  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaa 185  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40632598 -------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 4149695 - 4149847
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||    
T  4149695 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggg---------gtt-atggataccac 4149784  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4149785 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 763724 - 763903
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  763724 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcac 763823  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| ||| ||||||    
T  763824 ttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtca 763903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 19295731 - 19295899
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||         
T  19295731 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat----- 19295825  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  19295826 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 19295899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293991
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||  | |||| |||| |||||||    
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtca 31293991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9424762 - 9424594
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  9424762 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 9424671  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  9424670 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 9424594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015523
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38015593  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  38015592 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 38015523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42658832 - 42658667
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  42658832 ttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42658741  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 218  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  42658740 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattg 42658667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 2585463 - 2585631
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  2585463 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 2585562  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2585563 ctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtca 2585631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5497274 - 5497442
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| |||        
T  5497274 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata---- 5497369  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  5497370 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 5497442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 27503380 - 27503548
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  27503380 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 27503471  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27503472 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtca 27503548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374511
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 9374581  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  9374580 ---aatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 9374511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12558199 - 12558090
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  12558199 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccac 12558101  T
Q  142 ttaaaaatgtg 152  Q
    |||||||||||    
T  12558100 ttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23195418 - 23195250
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  23195418 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 23195327  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23195326 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtca 23195250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623941
Alignment:
Q  46 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 145  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |             
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggt--------- 33624015  T
Q  146 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  33624014 --atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtca 33623941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18327343 - 18327185
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18327343 ttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 18327244  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 211  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18327243 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacc 18327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1402675 - 1402514
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1402675 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 1402576  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
      ||||| |||           ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1402575 ccaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccta 1402514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 6973064 - 6973225
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  6973064 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 6973155  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  6973156 ---aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 6973225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390766
Alignment:
Q  49 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  149 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||           |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27390705 ggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 27390766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 13957671 - 13957839
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  13957671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 13957762  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13957763 ---aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 13957839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36365615 - 36365462
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  36365615 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 36365524  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  36365523 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatgg 36365462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36472454 - 36472348
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36472454 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 36472355  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
    || ||||    
T  36472354 tttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 14971979 - 14972147
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||            
T  14971979 ttttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 14972070  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14972071 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 14972147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24167954 - 24167786
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24167954 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 24167855  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24167854 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtca 24167786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38638080 - 38637912
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  38638080 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaa 38637981  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38637980 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtca 38637912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948499
Alignment:
Q  67 tggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata-----------tgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  167 gtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36948545 gtgtattggtaggg-taaattacccaccattcttgcatgagtacccta 36948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687067
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||     
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40687000 ctaaaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtca 40687067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656577
Alignment:
Q  68 ggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 167  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  168 tgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 3656577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 42247952 - 42247865
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtt 129  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  42247952 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 149
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 149  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 6206885 - 6207032
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||| |||        
T  6206885 ttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaata---- 6206980  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6206981 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492767
Alignment:
Q  75 aatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattg 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||| |||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  175 gttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9527191 - 9527124
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9527191 attttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  44 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagata 126  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612759
Alignment:
Q  67 tggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 166  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||             ||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  167 gtgtattggttggga-taaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtca 612759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3940480 - 3940411
Alignment:
Q  63 aaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 132  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  3940480 aaaatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20207156 - 20207088
Alignment:
Q  72 gataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  20207156 gataatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 101
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  45 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatga 101  Q
    ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3940399 - 3940338
Alignment:
Q  160 ggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| | |||| || ||||||    
T  3940399 ggctaatgtgtattggttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtca 3940338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300977
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 108  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaattt 15300977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 17600836 - 17601015
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17600836 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 17600935  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17600936 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 17601015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 45370990 - 45371169
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45370990 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccac 45371089  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45371090 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 45371169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 746466 - 746645
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  746466 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 746565  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  746566 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 746645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2325070 - 2324891
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2325070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2324971  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  2324970 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtca 2324891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 34518367 - 34518546
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518367 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 34518466  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34518467 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 34518546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 23901780 - 23901958
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23901780 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23901879  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23901880 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23901958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 4034592 - 4034771
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4034592 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 4034691  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4034692 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 4034771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6594639 - 6594460
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6594639 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6594540  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6594539 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 6594460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 38997101 - 38997280
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38997101 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38997200  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38997201 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 38997280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 6430473 - 6430645
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6430473 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6430572  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430573 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 6430645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 11184972 - 11185151
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11184972 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 11185071  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185072 ttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 11185151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13815399 - 13815220
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13815399 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13815300  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13815299 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtca 13815220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 14660446 - 14660625
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14660446 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14660545  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14660546 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 14660625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 26710345 - 26710524
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26710345 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26710444  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26710445 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 26710524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27651215 - 27651036
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27651215 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27651116  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27651115 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 27651036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 40635218 - 40635397
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40635218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40635317  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40635318 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 40635397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 10424595 - 10424773
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10424595 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10424694  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10424695 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1092132 - 1091953
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1092132 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 1092033  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1092032 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 1091953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10244763 - 10244584
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10244763 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10244664  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10244663 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 10244584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 27400403 - 27400582
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27400403 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27400502  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27400503 ttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 27400582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37255513 - 37255339
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255513 ttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 37255419  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37255418 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 37255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2914325 - 2914140
Alignment:
Q  36 atataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 135  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2914325 atatgattttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatgga 2914226  T
Q  136 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  2914225 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtca 2914140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159800
Alignment:
Q  45 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  145 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 11159800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427656
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtacccta 33427656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5726129 - 5726308
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5726129 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccac 5726228  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5726229 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 5726308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14697718 - 14697539
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14697718 ttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccac 14697619  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14697618 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 14697539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327540
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtca 32327540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856438
Alignment:
Q  56 cctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  156 atgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 32856438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37621051 - 37620869
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggat---caagatagttcatggatac 138  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  37621051 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggatac 37620952  T
Q  139 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37620951 cacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 37620869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609805
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtca 4609805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7892869 - 7892690
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7892869 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccac 7892770  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  7892769 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtca 7892690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 27024415 - 27024594
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27024415 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 27024514  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27024515 ttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtca 27024594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 40735464 - 40735643
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40735464 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 40735563  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40735564 ttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtca 40735643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 32948446 - 32948624
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32948446 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccac 32948544  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  32948545 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtca 32948624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8433097 - 8432942
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8433097 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 8432998  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 197  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8432997 tttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Original strand, 32608380 - 32608535
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  32608380 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccac 32608479  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32608480 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 40037143 - 40037321
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40037143 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 40037242  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40037243 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtca 40037321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444872
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttaccta-------ccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgg 134  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  135 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacc---attcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtca 9444872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Original strand, 15925080 - 15925261
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15925080 ttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 15925179  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| || |||||    
T  15925180 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagttatcatc 15925261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 12842102 - 12842277
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12842102 attttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggatacca 12842201  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     ||| ||||||||||||||||    
T  12842202 attaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat-----cataggtaccctaattgtca 12842277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  93 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  193 ccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 39103047 - 39103215
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||        
T  39103047 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata---- 39103142  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39103143 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 39103215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 166
Target Start/End: Original strand, 42899915 - 42900039
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42899915 ttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 42900014  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaat 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  42900015 ttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 208
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229793
Alignment:
Q  90 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 189  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  190 ccaccattcttccatgggt 208  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 447737 - 447635
Alignment:
Q  119 tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  447737 tcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctagttg 447638  T
Q  219 tca 221  Q
    |||    
T  447637 tca 447635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 145282 - 145450
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||       
T  145282 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac--- 145378  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  145379 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21735070 - 21734902
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||            
T  21735070 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg-------- 21734979  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21734978 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 21734902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35158221 - 35158052
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  35158221 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 35158129  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35158128 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 35158052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Original strand, 41172459 - 41172605
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  41172459 tttttttaaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccact 41172558  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41172559 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43899140 - 43898980
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  43899140 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 43899049  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  43899048 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagccta 43898980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 4258490 - 4258657
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  4258490 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatg-------- 4258580  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  4258581 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtca 4258657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 44481828 - 44481988
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44481828 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 44481927  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 213  Q
     |||||| |||           || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44481928 ctaaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccct 44481988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 27331297 - 27331470
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |         
T  27331297 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa----- 27331391  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
      || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27331392 --tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtca 27331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 35126780 - 35126941
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35126780 ttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 35126879  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
     |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  35126880 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagatacccta 35126941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28641462 - 28641294
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  28641462 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 28641371  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28641370 ---aatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtca 28641294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 29687041 - 29687209
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  29687041 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 29687132  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  29687133 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 29687209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543626
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 151  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 13543696  T
Q  152 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 13543626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12333665 - 12333513
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||         
T  12333665 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 12333571  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12333570 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgg 12333513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19428597 - 19428435
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacc-tttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||       
T  19428597 ttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 19428501  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19428500 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 19428435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301199
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 39301276  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  39301275 ---aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtca 39301199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28566868 - 28566698
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  28566868 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg-------- 28566777  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  28566776 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccatc 28566698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827223
Alignment:
Q  121 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttcca 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12827142 aagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttcca 12827223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27765032 - 27764872
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  27765032 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 27764941  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||| ||||    
T  27764940 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagccta 27764872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 34249265 - 34249433
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||            
T  34249265 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 34249356  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  34249357 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 34249433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  113 gtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 117
Target Start/End: Original strand, 12814614 - 12814689
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814614 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 12814689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40544246 - 40544155
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  40544246 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 214
Target Start/End: Original strand, 3711665 - 3711794
Alignment:
Q  74 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||| ||||||||||||||    
T  3711665 taatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtatt 3711753  T
Q  174 ggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  3711754 ggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 3711794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 12730061 - 12730214
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  12730061 ttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 12730150  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  12730151 -taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgg 12730214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2000507 - 2000417
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 132  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2000507 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcat 2000417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2688899 - 2688731
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |  ||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||        
T  2688899 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata---- 2688804  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  2688803 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtca 2688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 3266295 - 3266387
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  3266295 attttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 138
Target Start/End: Original strand, 30545821 - 30545917
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatac 138  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30545821 ttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 43356099 - 43356264
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  43356099 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 43356187  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  |||||| ||||| || |||| ||||||    
T  43356188 ---aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtca 43356264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 8056626 - 8056779
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||  | |||||||||||||            
T  8056626 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg-------- 8056717  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
       || ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||    
T  8056718 ---aatatgcgcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38985415 - 38985342
Alignment:
Q  74 taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 148  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38985415 taatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatatg-tcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 211
Target Start/End: Original strand, 42900781 - 42900824
Alignment:
Q  168 tgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42900781 tgtattggttgagataaattacccaccattcttccatgtgtacc 42900824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 3266399 - 3266455
Alignment:
Q  165 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3266399 atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28020002 - 28019962
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacc 82  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28020002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacc 28019962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 80
Target Start/End: Original strand, 1897130 - 1897168
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataattta 80  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1897130 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataattta 1897168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 10176559 - 10176625
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 108  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||   |||||  ||||||||||||||||||    
T  10176559 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17799345 - 17799296
Alignment:
Q  124 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799345 atagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 110)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068692
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 4068692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 31308002 - 31308181
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31308002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31308101  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31308102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 31308181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 45538154 - 45538333
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45538154 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45538253  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45538254 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 45538333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 3611137 - 3611316
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3611137 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3611236  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3611237 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 3611316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 25058689 - 25058868
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25058689 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccac 25058788  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25058789 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 25058868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25678440 - 25678261
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25678440 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25678341  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25678340 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtca 25678261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 44661971 - 44662150
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44661971 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 44662070  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44662071 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 44662150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21139599 - 21139414
Alignment:
Q  36 atataattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21139599 atatagttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 21139500  T
Q  136 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21139499 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtca 21139414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17995132 - 17994960
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17995132 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 17995033  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995032 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 17994960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251893
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatc 43251893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 26277178 - 26277357
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26277178 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26277277  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26277278 ttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26277357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790199
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 38790199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 47671587 - 47671766
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47671587 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccac 47671686  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47671687 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 47671766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5981171 - 5981350
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5981171 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5981270  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5981271 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 5981350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26085578 - 26085400
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26085578 tttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 26085480  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26085479 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 26085400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24245206 - 24245034
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24245206 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24245107  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24245106 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtacccta 24245034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 41999816 - 41999988
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41999816 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 41999915  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41999916 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 41999988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 3285403 - 3285581
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3285403 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3285502  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285503 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 3285581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6327728 - 6327550
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6327728 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6327629  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6327628 ttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtca 6327550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 23984756 - 23984935
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23984756 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23984855  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23984856 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23984935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 31040710 - 31040889
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31040710 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31040809  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31040810 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtca 31040889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 33884089 - 33884268
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  33884089 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33884188  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33884189 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtca 33884268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33960163 - 33959984
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  33960163 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33960064  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33960063 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtca 33959984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 26794305 - 26794482
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26794305 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 26794404  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26794405 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23932690 - 23932511
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23932690 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccac 23932591  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23932590 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23932511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33112998 - 33112820
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33112998 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33112899  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  33112898 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtca 33112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37620373 - 37620194
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37620373 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 37620274  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37620273 ttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtca 37620194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38332040 - 38331861
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  38332040 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 38331941  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38331940 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtca 38331861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 39646569 - 39646748
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39646569 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccac 39646668  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39646669 ttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 39646748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46967222 - 46967043
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46967222 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46967123  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46967122 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtca 46967043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47383913 - 47383734
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47383913 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47383814  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  47383813 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtca 47383734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49254156 - 49253981
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  49254156 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 49254057  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49254056 ttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaatt 49253981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774397
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtca 50774397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 35273597 - 35273776
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35273597 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35273696  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35273697 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 35273776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 36566331 - 36566510
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36566331 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36566430  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36566431 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 36566510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864034
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23221110 - 23220939
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23221110 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23221011  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23221010 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 31844377 - 31844530
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31844377 ttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 31844476  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31844477 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 5980069 - 5980241
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5980069 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 5980168  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5980169 ttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtacccta 5980241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 24885502 - 24885681
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24885502 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24885601  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  24885602 ttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtca 24885681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26525070 - 26524891
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26525070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccac 26524971  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26524970 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtca 26524891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 46784424 - 46784603
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||    
T  46784424 ttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccac 46784523  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46784524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtca 46784603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 51057072 - 51057251
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  51057072 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccac 51057171  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51057172 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 51057251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35692845 - 35692665
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataattta-cctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  35692845 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccg 35692746  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  35692745 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtca 35692665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Original strand, 46616550 - 46616718
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  46616550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 46616649  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtac 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46616650 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtac 46616718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317495
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtca 47317495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 179
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003313
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttc---catgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtca 36003313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 47187106 - 47187285
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47187106 ttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 47187205  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  47187206 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtca 47187285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49399169 - 49398990
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  49399169 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccac 49399070  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49399069 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtca 49398990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42313546 - 42313363
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggata----atttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||  |||    
T  42313546 ttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaata 42313447  T
Q  138 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42313446 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 42313363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 48373505 - 48373675
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48373505 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 48373604  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  48373605 ttaaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtca 48373675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450674
Alignment:
Q  76 atttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  176 ttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtca 2450674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27983768 - 27983605
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||     
T  27983768 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg----------------gataccat 27983685  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27983684 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 27983605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 51403188 - 51403034
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51403188 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51403089  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    || |||||||||||         || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51403088 tt-aaaatgtgctt---------atatgtattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 33073212 - 33073380
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||            
T  33073212 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-------- 33073303  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33073304 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33073380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 10928068 - 10928236
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  10928068 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 10928159  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  10928160 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtca 10928236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51045735 - 51045598
Alignment:
Q  84 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  51045735 accaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggta 51045636  T
Q  184 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  51045635 aattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtca 51045598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475866
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||        |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccact 45475923  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45475922 tacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808825
Alignment:
Q  95 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacc 194  Q
    ||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  195 attcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtca 4808825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 2657304 - 2657480
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  2657304 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 2657395  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataaa 229  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  2657396 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccgataaa 2657480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41467802 - 41467634
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  41467802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 41467711  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41467710 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 41467634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31979998
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccact 31980016  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtg 160  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31980015 taaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2557027 - 2556909
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2557027 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 2556928  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtg 160  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  2556927 ttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 2954856 - 2955024
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2954856 ttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccac 2954955  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||| |||           | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2954956 ttaaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 2955024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953221
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 4953144  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  4953145 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtca 4953221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5961437 - 5961269
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5961437 ttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 5961338  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5961337 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtca 5961269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6626194 - 6626026
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  6626194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 6626103  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  6626102 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 6626026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 26685857 - 26686025
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  26685857 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 26685956  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26685957 ctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 26686025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26472349 - 26472188
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  26472349 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 26472258  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26472257 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26472188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30290078 - 30289912
Alignment:
Q  44 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||              
T  30290078 ttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg---------- 30289989  T
Q  144 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  30289988 -aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtca 30289912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 33187341 - 33187503
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  33187341 ttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccac 33187440  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||                 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33187441 ttaaa-----------------aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33187503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27924828 - 27924722
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27924828 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 27924729  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
     ||||||    
T  27924728 ctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 29770671 - 29770832
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  29770671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 29770762  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  29770763 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagccta 29770832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38716417 - 38716257
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  38716417 ttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 38716318  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccct 213  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38716317 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccct 38716257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 42234841 - 42235008
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  42234841 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 42234932  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  42234933 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 42235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388642
Alignment:
Q  44 ttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactt 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  144 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||| |||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1388576 aaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 1388642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312533
Alignment:
Q  130 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 13312533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156574
Alignment:
Q  92 atgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataa 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||       ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  185 attacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtca 4156574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24649892 - 24649802
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24649892 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34752484 - 34752323
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  34752484 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg-------- 34752393  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34752392 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaaccta 34752323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772174
Alignment:
Q  91 aatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacc 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  191 caccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtca 47772174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4243660 - 4243504
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||            
T  4243660 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 4243569  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  4243568 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggta 4243504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39475952 - 39475785
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39475952 ttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg-tcaagatagtttatggataccac 39475854  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||||||           || || ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  39475853 ctaaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtca 39475785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683332
Alignment:
Q  53 ttacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 152  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  153 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
               ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48683389 -----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 48683332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 51155759 - 51155606
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||            
T  51155759 ttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg-------- 51155668  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
       || ||||| ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  51155667 ---aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 10920201 - 10920369
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10920201 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 10920300  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  10920301 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtca 10920369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7561713 - 7561530
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa-gatagttcatggatacc 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |    | ||  |||      
T  7561713 attttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagt 7561614  T
Q  140 acttaaaaatgtgctta--tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     | | || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7561613 tcatgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtca 7561530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544125
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895166
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||         
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata----- 41895239  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41895238 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 41895166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 52323939 - 52324108
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  52323939 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccac 52324038  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           |||||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52324039 ctaaaaaggtg----------aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtca 52324108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 46428423 - 46428332
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  46428423 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13313346 - 13313249
Alignment:
Q  42 ttttttctagatta--cctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 137  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13313346 ttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 133
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448740
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Original strand, 52367884 - 52367990
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  52367884 ttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 52367983  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
     ||||||    
T  52367984 ctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13281732 - 13281588
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  13281732 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 13281641  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 197  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  13281640 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Original strand, 39637901 - 39637996
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttc-atggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39637901 ttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaa----taaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4156246 - 4156188
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4156246 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35991768 - 35991616
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||             
T  35991768 tttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 35991678  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
      || || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  35991677 --aatatatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Original strand, 24215805 - 24215911
Alignment:
Q  83 taccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || || || ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24215805 taccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatg-----------aatatatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggt 24215893  T
Q  183 aaattacccaccattctt 200  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24215894 aaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293534
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 10919364 - 10919313
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10919364 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38718297 - 38718183
Alignment:
Q  88 accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggga-taaat 186  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||  |||     | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  38718297 accaataaaaatgaacaatttatttgtggcatcaagatagttcataaata-----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaat 38718203  T
Q  187 tacccaccattcttccatgg 206  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  38718202 tacccatcattctttcatgg 38718183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286506
Alignment:
Q  104 aatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttcca 203  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  204 tgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtca 31286506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 32448754 - 32448807
Alignment:
Q  167 gtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  32448754 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 221
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844853
Alignment:
Q  186 ttacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 31844853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359544
Alignment:
Q  162 ctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccat 39359544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 75
Target Start/End: Original strand, 23994849 - 23994882
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggata 75  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23994849 ttttttctagattacctttgaagaatggtggata 23994882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9779982 - 9779919
Alignment:
Q  133 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  9779982 ggataccacttaaaaatgtgtttacgtggctaatatatatttgttggg-ttaattagccaccatt 9779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25894098 - 25893919
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25894098 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25893999  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25893998 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 25893919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33423456 - 33423277
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33423456 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33423357  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33423356 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33423277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33696002 - 33695823
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33696002 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33695903  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33695902 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 33695823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45690277 - 45690099
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45690277 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45690178  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45690177 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 45690099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 46913111 - 46913292
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46913111 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46913210  T
Q  142 ttaaaaa--tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46913211 ttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 46913292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 27018118 - 27018297
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27018118 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 27018217  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27018218 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 27018297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33839896 - 33839717
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33839896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33839797  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33839796 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 33839717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37846197 - 37846018
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37846197 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccac 37846098  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37846097 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 37846018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 40670565 - 40670744
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40670565 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 40670664  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40670665 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtca 40670744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877727
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23393233 - 23393053
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23393233 attttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23393134  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23393133 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 23393053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 17855430 - 17855609
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17855430 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 17855529  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17855530 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 17855609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22979828 - 22979649
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22979828 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 22979729  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22979728 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 22979649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 33411262 - 33411441
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33411262 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33411361  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  33411362 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtca 33411441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 35355890 - 35356069
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35355890 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 35355989  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35355990 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 35356069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47067158 - 47066979
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47067158 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47067059  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47067058 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 47066979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171364
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 49171364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 31586850 - 31587022
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31586850 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 31586949  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31586950 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtacccta 31587022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165816
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 20165816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35328250 - 35328071
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35328250 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35328151  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35328150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 35328071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47740512 - 47740333
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  47740512 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 47740413  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47740412 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 47740333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41991040 - 41990870
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41991040 attttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 41990941  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41990940 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacc 41990870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2341843 - 2341663
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2341843 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 2341744  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccat-gggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2341743 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtca 2341663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 19563449 - 19563628
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  19563449 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 19563548  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19563549 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtca 19563628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 36389381 - 36389537
Alignment:
Q  65 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 164  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389381 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 36389480  T
Q  165 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36389481 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 36389537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 10028490 - 10028657
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10028490 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 10028589  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10028590 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggta 10028657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26579898 - 26579719
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26579898 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccac 26579799  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26579798 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 26579719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 45482660 - 45482839
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  45482660 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 45482759  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45482760 ttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtca 45482839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48609858 - 48609679
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  48609858 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 48609759  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48609758 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 31625705 - 31625884
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31625705 attttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 31625804  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31625805 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 31625884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35757201 - 35757022
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35757201 ttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 35757103  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35757102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 35757022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 33332791 - 33332969
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33332791 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccac 33332889  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33332890 ttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca 33332969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5183983 - 5183834
Alignment:
Q  65 aatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 164  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5183983 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggcta 5183884  T
Q  165 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5183883 atgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtacccta 5183834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Original strand, 33870247 - 33870404
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  33870247 ttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccat 33870346  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33870347 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 33870404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 5712170 - 5712349
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5712170 ttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 5712269  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5712270 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtca 5712349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 43499487 - 43499659
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43499487 ttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43499586  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43499587 ttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggatacccta 43499659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45063536 - 45063359
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  45063536 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 45063437  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  45063436 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtca 45063359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31429656 - 31429477
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31429656 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccac 31429557  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31429556 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtca 31429477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 10618300 - 10618465
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||    
T  10618300 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccac 10618392  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618393 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 10618465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 29446862 - 29447018
Alignment:
Q  64 aaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 163  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29446862 aaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgact 29446961  T
Q  164 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29446962 aatgtgtattggtt-ggagtaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 29447018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 35767483 - 35767655
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35767483 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-----cc--ccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35767575  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35767576 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 35767655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33720217 - 33720070
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  33720217 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 33720118  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 189  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33720117 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233938
Alignment:
Q  86 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaa 185  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  186 ttacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtca 28233938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076529
Alignment:
Q  92 atgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  192 accattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtca 30076529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35752204 - 35752036
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  35752204 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 35752113  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35752112 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 35752036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 48085860 - 48086024
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  48085860 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 48085951  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 217  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  48085952 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaatt 48086024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46817591 - 46817430
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  46817591 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 46817500  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  46817499 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagccta 46817430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 43489220 - 43489376
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  43489220 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 43489311  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43489312 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 43489376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  58 tttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  158 gtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattct 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46898186 - 46898018
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||        
T  46898186 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata---- 46898091  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46898090 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 46898018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 2332021 - 2332189
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  2332021 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg-------- 2332112  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2332113 ---aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtca 2332189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 24228543 - 24228711
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  24228543 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 24228634  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24228635 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtca 24228711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 33393330 - 33393498
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33393330 ttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 33393429  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     ||||||           || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33393430 ctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 33393498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876330
Alignment:
Q  45 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 144  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||               
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 7876407  T
Q  145 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  7876406 aatatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtca 7876330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26941702 - 26941537
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  26941702 ttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 26941611  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 218  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26941610 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattg 26941537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36817015 - 36816854
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  36817015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 36816924  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36816923 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 36816854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855214
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatgg 41855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904386
Alignment:
Q  107 ttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  207 gtaccctaattgtca 221  Q
    ||| |||| ||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtca 41904386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24923194 - 24923026
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||            
T  24923194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-------- 24923103  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24923102 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtca 24923026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128107
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 37128107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44003540 - 44003372
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  44003540 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 44003441  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44003440 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 44003372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405517
Alignment:
Q  104 aatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttcca 203  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  204 tgggta 209  Q
    ||||||    
T  44405512 tgggta 44405517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 47906929 - 47906838
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47906929 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16482953 - 16482847
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16482953 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccac 16482854  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
     ||||||    
T  16482853 ctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47460943 - 47460774
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47460943 attttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 47460844  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    | ||||||  ||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  47460843 cctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtca 47460774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 7257383 - 7257551
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  7257383 ttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 7257482  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  7257483 ctaaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtca 7257551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45502986 - 45502818
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||           |||||||     
T  45502986 ttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccat 45502898  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  45502897 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtca 45502818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15644116 - 15643946
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15644116 ttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 15644017  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatc 223  Q
     |||||| |||           ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  15644016 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtcatc 15643946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 498358 - 498205
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  498358 ttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 498267  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 206  Q
       || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  498266 ---aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgg 498205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 21718119 - 21718286
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  21718119 ttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 21718210  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || |||||||| |||| ||||||    
T  21718211 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtca 21718286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 29610637 - 29610793
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||            
T  29610637 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-------- 29610728  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29610729 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggta 29610793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25037678 - 25037517
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  25037678 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-------- 25037587  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  25037586 ---aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 25037517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32556776 - 32556640
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||            
T  32556776 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-------- 32556685  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 189  Q
       || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32556684 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103278
Alignment:
Q  46 ttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaa 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||           |    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------a 46103214  T
Q  146 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  46103215 atatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggta 46103278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 26371050 - 26371212
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||           
T  26371050 attttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 26371142  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26371143 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26371212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 141
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863116
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 132
Target Start/End: Original strand, 29098753 - 29098843
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 132  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  29098753 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 228
Target Start/End: Original strand, 35484638 - 35484814
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataa-tttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||           
T  35484638 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------- 35484730  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcatcgataa 228  Q
        || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35484731 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtcatcaataa 35484814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  152 g 152  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39453645 - 39453484
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||                
T  39453645 ttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt------------ 39453558  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
          ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  39453557 ------atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 39866666 - 39866758
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  39866666 attttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455189
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Original strand, 39323618 - 39323709
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  39323618 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 44659846 - 44660006
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  44659846 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 44659936  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
       || || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||    
T  44659937 ---aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagccta 44660006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237547
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||            
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-------- 45237612  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 209  Q
       || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||    
T  45237611 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggta 45237547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 35557732 - 35557798
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaattt 108  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35557732 ttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7720673 - 7720574
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||| |||||||| | | | || | |||||||||||||||||||||    
T  7720673 ttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  88 accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21649549 - 21649442
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaa-tggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || || |  | ||||||||| ||||||||||    
T  21649549 ttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacca 21649450  T
Q  141 cttaaaaa 148  Q
    | ||||||    
T  21649449 cctaaaaa 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30077106 - 30077043
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30077106 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37443730 - 37443604
Alignment:
Q  84 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggata 183  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||    
T  37443730 accaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggta 37443642  T
Q  184 aattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  37443641 aattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtca 37443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 221
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323777
Alignment:
Q  155 tatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtca 39323777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Original strand, 35823292 - 35823353
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagc 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35823292 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866815
Alignment:
Q  165 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggtagtctaattg 39866815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Original strand, 29098847 - 29098915
Alignment:
Q  151 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||||    
T  29098847 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgt 29098915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2049
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 2049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39737 - 39558
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39737 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39638  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39637 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 39558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11312 - 11135
Alignment:
Q  43 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11312 tttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11214  T
Q  143 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11213 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 11135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 278007 - 278188
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-- 139  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  278007 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacccc 278106  T
Q  140 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  278107 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 278188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176834
Alignment:
Q  53 ttacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 152  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  153 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtca 176834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2613 - 2441
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2613 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2514  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2513 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtacccta 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 75425 - 75246
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  75425 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccac 75326  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  75325 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtca 75246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19035 - 18856
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19035 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 18936  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18935 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtca 18856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 32562 - 32715
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32562 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccat 32661  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccacca 195  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32662 ttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4772 - 4598
Alignment:
Q  41 attttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||       |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4772 attttttctagattaactttgaataatggtgggtaac------accaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggatacca 4679  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4678 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 4598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3259
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtca 3259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20647 - 20479
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20647 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 20548  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20547 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtca 20479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 7091 - 7260
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||       
T  7091 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 7187  T
Q  141 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7188 --------tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 7260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 14745 - 14913
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  14745 ttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 14844  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 221  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14845 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtca 14913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Original strand, 103 - 209
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  103 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccac 202  T
Q  142 ttaaaaa 148  Q
     ||||||    
T  203 ctaaaaa 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4618
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4725 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 4626  T
Q  141 cttaaaaa 148  Q
     |||||||    
T  4625 tttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3500
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3393 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 3492  T
Q  141 cttaaaaa 148  Q
     |||||||    
T  3493 tttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 189
Target Start/End: Original strand, 17907 - 18043
Alignment:
Q  42 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||  |||| ||| || ||| ||||       
T  17907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac--- 18003  T
Q  142 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattac 189  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18004 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  52 attacctttgaaaaatggtggataatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaag----atagttcatggataccacttaaaa 147  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University