View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4790_low_3 (Length: 336)

Name: NF4790_low_3
Description: NF4790
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4790_low_3
NF4790_low_3
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (20-325)||(8401397-8401702)
chr7 (20-324)||(47062778-47063082)
chr7 (20-324)||(10707541-10707846)
chr7 (20-324)||(42501304-42501608)
chr7 (20-324)||(18107285-18107589)
chr7 (20-324)||(15067786-15068090)
chr7 (27-324)||(30788436-30788733)
chr7 (27-324)||(43622002-43622299)
chr7 (27-324)||(45765276-45765573)
chr7 (27-324)||(616616-616913)
chr7 (20-210)||(12113416-12113606)
chr7 (206-324)||(12116418-12116536)
chr7 (71-191)||(43826556-43826676)
chr7 (233-324)||(43826682-43826773)
chr7 (259-316)||(3762832-3762889)
chr7 (56-118)||(43378183-43378245)
chr7 (56-115)||(1298113-1298172)
chr7 (260-321)||(20905527-20905588)
chr7 (56-128)||(25569530-25569602)
chr7 (56-128)||(46792439-46792511)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (20-324)||(21357213-21357517)
chr6 (20-324)||(23961195-23961499)
chr6 (26-324)||(31148216-31148514)
chr6 (20-324)||(28358215-28358518)
chr6 (26-311)||(18607896-18608181)
chr6 (27-324)||(1610618-1610915)
chr6 (48-322)||(254299-254573)
chr6 (174-316)||(34110718-34110860)
chr6 (259-322)||(26684104-26684167)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (20-324)||(17238697-17238995)
chr4 (20-324)||(38462700-38463004)
chr4 (26-325)||(51642873-51643172)
chr4 (26-324)||(4770028-4770323)
chr4 (20-324)||(3405687-3405991)
chr4 (45-324)||(4977846-4978125)
chr4 (27-324)||(19071524-19071821)
chr4 (20-280)||(9891813-9892073)
chr4 (20-253)||(11503392-11503626)
chr4 (138-316)||(4977656-4977834)
chr4 (174-321)||(6183584-6183730)
chr4 (259-322)||(13896851-13896914)
chr4 (56-148)||(17917280-17917372)
chr4 (261-321)||(20970616-20970675)
chr4 (56-115)||(32717420-32717479)
chr4 (81-123)||(20970438-20970480)
chr4 (75-128)||(1591947-1592000)
chr4 (259-312)||(17497453-17497506)
chr4 (56-128)||(4618669-4618741)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (20-324)||(11691693-11691997)
chr2 (26-324)||(41006845-41007143)
chr2 (20-324)||(24603952-24604256)
chr2 (20-324)||(24940513-24940817)
chr2 (20-316)||(9656057-9656353)
chr2 (20-324)||(27274220-27274524)
chr2 (20-324)||(28347260-28347564)
chr2 (20-324)||(45477252-45477556)
chr2 (45-324)||(12906380-12906659)
chr2 (20-324)||(24751556-24751860)
chr2 (20-324)||(437214-437518)
chr2 (20-324)||(7264877-7265181)
chr2 (61-324)||(34919686-34919949)
chr2 (26-311)||(17996056-17996341)
chr2 (20-324)||(3797662-3797965)
chr2 (20-324)||(39795867-39796171)
chr2 (27-324)||(211308-211605)
chr2 (27-324)||(10622321-10622618)
chr2 (27-324)||(38947660-38947957)
chr2 (27-324)||(41561909-41562206)
chr2 (27-324)||(5349064-5349361)
chr2 (179-324)||(43948305-43948450)
chr2 (26-184)||(43946007-43946165)
chr2 (164-322)||(25618093-25618251)
chr2 (220-324)||(1097889-1097993)
chr2 (201-322)||(24683970-24684091)
chr2 (26-118)||(25615272-25615364)
chr2 (259-316)||(25855455-25855512)
chr2 (259-324)||(28422551-28422616)
chr2 (241-286)||(19989370-19989415)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (20-324)||(19497327-19497631)
chr1 (20-324)||(38690802-38691106)
chr1 (26-324)||(36074667-36074966)
chr1 (26-324)||(37016808-37017105)
chr1 (20-324)||(29354548-29354852)
chr1 (45-324)||(12648464-12648743)
chr1 (27-324)||(13175675-13175971)
chr1 (20-265)||(46976762-46977007)
chr1 (45-324)||(51664152-51664431)
chr1 (20-324)||(5079832-5080136)
chr1 (20-324)||(50115626-50115930)
chr1 (27-324)||(3991502-3991799)
chr1 (27-324)||(38773981-38774278)
chr1 (27-324)||(44467479-44467776)
chr1 (20-324)||(13631313-13631617)
chr1 (27-324)||(3946328-3946625)
chr1 (27-324)||(20351353-20351650)
chr1 (168-315)||(32105679-32105826)
chr1 (268-324)||(46975058-46975114)
chr1 (56-148)||(36359395-36359487)
chr1 (40-322)||(25232130-25232409)
chr1 (56-115)||(18886832-18886891)
chr1 (259-322)||(27283960-27284023)
chr1 (78-148)||(7404714-7404784)
chr1 (78-128)||(27284154-27284204)
chr1 (78-128)||(28864004-28864054)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (20-324)||(22582051-22582355)
chr8 (33-324)||(22585913-22586205)
chr8 (20-324)||(7169781-7170078)
chr8 (20-324)||(43371661-43371965)
chr8 (20-324)||(43683100-43683404)
chr8 (20-324)||(2144862-2145166)
chr8 (20-324)||(35964609-35964912)
chr8 (27-324)||(8421723-8422020)
chr8 (27-324)||(7341976-7342273)
chr8 (27-324)||(32430732-32431029)
chr8 (27-324)||(32376775-32377072)
chr8 (27-324)||(30303477-30303774)
chr8 (259-322)||(17317379-17317442)
chr8 (56-128)||(44321952-44322024)
chr8 (259-314)||(17340935-17340990)
chr8 (78-128)||(43611200-43611250)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (21-324)||(4198767-4199070)
chr5 (20-324)||(7019826-7020130)
chr5 (20-324)||(7798878-7799182)
chr5 (20-324)||(13565967-13566271)
chr5 (20-324)||(25894957-25895261)
chr5 (20-324)||(27865705-27866009)
chr5 (20-324)||(37818737-37819041)
chr5 (20-324)||(1037248-1037552)
chr5 (20-324)||(11031312-11031616)
chr5 (20-324)||(38858050-38858354)
chr5 (34-324)||(28884312-28884602)
chr5 (26-322)||(20288167-20288461)
chr5 (215-324)||(18536395-18536503)
chr5 (259-324)||(34079677-34079742)
chr5 (56-128)||(6553903-6553975)
chr5 (56-115)||(11820343-11820402)
chr5 (267-322)||(12340196-12340251)
chr5 (264-316)||(25054201-25054253)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (22-324)||(76885-77187)
chr3 (20-324)||(36815376-36815680)
chr3 (20-324)||(46991108-46991412)
chr3 (20-324)||(29949878-29950182)
chr3 (20-324)||(29999032-29999336)
chr3 (20-324)||(48248729-48249033)
chr3 (20-324)||(13745581-13745885)
chr3 (20-324)||(6503818-6504122)
chr3 (20-324)||(14400454-14400763)
chr3 (20-324)||(21954100-21954406)
chr3 (27-324)||(3950640-3950937)
chr3 (27-324)||(6742784-6743081)
chr3 (27-324)||(30945509-30945806)
chr3 (20-324)||(16446517-16446821)
chr3 (33-324)||(8158856-8159147)
chr3 (56-149)||(33940934-33941027)
chr3 (259-322)||(8118509-8118572)
chr3 (56-128)||(4119669-4119741)
chr3 (56-128)||(51547408-51547480)
chr3 (78-128)||(32426942-32426992)
chr3 (276-322)||(40467303-40467349)
chr3 (79-128)||(10286165-10286214)
chr3 (264-324)||(4511043-4511103)
chr3 (83-115)||(9555666-9555698)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (20-316)||(15217-15513)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (27-324)||(2778-3075)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (27-324)||(34706-35003)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (20-136)||(17778-17894)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (47-316)||(959-1226)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (258-325)||(2100-2167)
scaffold0297 (82-138)||(1923-1979)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (56-128)||(4950-5022)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8401702 - 8401397
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8401702 acgtgactcttccaaagcaatgttgtctaaagcatatttagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 8401603  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8401602 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgt 8401503  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8401502 ccaaatatttcattactaaagcatgagctgattctaccatgttggtggttctgcaactaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 8401403  T
Q  320 cttcat 325  Q
    ||||||    
T  8401402 cttcat 8401397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47063082 - 47062778
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47063082 acgtgtctcttccaaaacattgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 47062983  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47062982 ctaacgttctgaccaaaagttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttcttccaacaagtacccaaatcacctacactattgt 47062883  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47062882 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctc 47062783  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  47062782 cttca 47062778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 10707541 - 10707846
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10707541 acgtgtctcatccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagctggagtacaaagtgatatctttgaatctatgttccaacacg 10707640  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10707641 gcaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 10707740  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattcta-ccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttct 318  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707741 ccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgcaacatagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttct 10707840  T
Q  319 ccttca 324  Q
    ||||||    
T  10707841 ccttca 10707846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42501608 - 42501304
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42501608 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaggtgacatctttgaatctatgttccaacacg 42501509  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    | ||  || |||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42501508 gaaacactgtgaccaaatgatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 42501409  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42501408 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccatgtttgtggtcatgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 42501309  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  42501308 cttca 42501304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18107589 - 18107285
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18107589 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctaaacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 18107490  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      || ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18107489 caaacgctttgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 18107390  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18107389 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 18107290  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  18107289 cttca 18107285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15068090 - 15067786
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15068090 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtataaagtgacatctttgaatctattttccaacacg 15067991  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      || ||| |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15067990 caaacgctgtgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcatccacactattgt 15067891  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15067890 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 15067791  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  15067790 cttca 15067786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30788733 - 30788436
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  30788733 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 30788634  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30788633 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 30788534  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30788533 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 30788436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 43622002 - 43622299
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  43622002 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 43622101  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43622102 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 43622201  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43622202 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 43622299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45765573 - 45765276
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  45765573 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 45765474  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45765473 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 45765374  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45765373 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 45765276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 616616 - 616913
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||       
T  616616 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacttgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatgtttgaatctatgttccaacacgcaaacat 616715  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  |||| || |||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  616716 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactggagcaacaacatatgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 616815  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  616816 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 616913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 12113416 - 12113606
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  12113416 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacataaccacctaggccggagtacaaagtgacatatttgaatctatgttccaacatg 12113515  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcaccca 210  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12113516 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcacagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcaccca 12113606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 324
Target Start/End: Original strand, 12116418 - 12116536
Alignment:
Q  206 acccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgcc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12116418 acccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcagcacatggtctgtccatgcc 12116517  T
Q  306 ctcactattttctccttca 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12116518 ctcactattttctccttca 12116536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 191
Target Start/End: Original strand, 43826556 - 43826676
Alignment:
Q  71 acctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaac 170  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  43826556 acctaaccaggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtgacgctttgaccaaatgttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaac 43826655  T
Q  171 atgtcatgtattttctcccaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43826656 atgtcatgtattttctcccaa 43826676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 324
Target Start/End: Original strand, 43826682 - 43826773
Alignment:
Q  233 tactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43826682 tactaaaacatgagtcgattctaccctgttggtagttctacaaccaagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcgctattttctccttca 43826773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3762889 - 3762832
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3762889 tgttggtggttctgcagccaagatgcaagacatggtctgaccatgcccccactatttt 3762832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 43378183 - 43378245
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatac 118  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  43378183 tctagacacgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtatcgattttccaatac 43378245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1298172 - 1298113
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaa 115  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1298172 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaa 1298113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 321
Target Start/End: Original strand, 20905527 - 20905588
Alignment:
Q  260 gttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcct 321  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20905527 gttggtggttttgcagctaagattcaagacatggtatgtccatgccctcaatattttatcct 20905588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 25569530 - 25569602
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || |||| ||||    
T  25569530 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacttatgttccaagaccgtaacgctc 25569602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 46792511 - 46792439
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  46792511 tctagacatgtgaccccccaacccgaagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 46792439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 21357213 - 21357517
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21357213 acgtgactcttccaaagaaatgttgtccaaagcatatctggacacatgaccacctaacccggagtacaaagtgacatctttgaacctatgttccaatacg 21357312  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21357313 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcattgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgt 21357412  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21357413 ccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcagccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctc 21357512  T
Q  320 cttca 324  Q
     ||||    
T  21357513 tttca 21357517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 23961195 - 23961499
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23961195 acgtgactcttccaaagaaatgttgtccaaagcatatctggacacatgaccacctaacccggagtacaaagtgacatctttgaacctatgttccaatacg 23961294  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23961295 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcattgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgt 23961394  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23961395 ccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcagccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctc 23961494  T
Q  320 cttca 324  Q
     ||||    
T  23961495 tttca 23961499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31148514 - 31148216
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  31148514 ctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctatccccgagtacaaagtgacatatttgaatctatgttccaacacgctaacg 31148415  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31148414 ctctgaccaaaggttgtttgtatagcaatgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaat 31148315  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||| | | |||| | ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31148314 atttcttcaataaatcgtgagctgattcgaccctcttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 31148216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28358518 - 28358215
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28358518 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaaccatatctagacacatgaccacctaacccg-agtacaaagtgacatctttgaatctattttccaacacg 28358420  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      || ||| |||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28358419 caaacgctttgaccaaaggatgtttatatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 28358320  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28358319 ccaagtatttcttcaataaagcatgagtcgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 28358220  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  28358219 cttca 28358215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18608181 - 18607896
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |    
T  18608181 ctcttccaaaacaatgttgtccaaagcatatctaaacgcatgaccacctaaattggagtacaaagtgacatctttgaatccatgttccaacacgctaacg 18608082  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18608081 cttggaccaaaggttgtttgtatcgcagtgatctgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaat 18607982  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcact 311  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18607981 atttcttcaataaagcatgagccgattcgacccagttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgttcatgccctcact 18607896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 1610618 - 1610915
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  1610618 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 1610717  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1610718 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 1610817  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1610818 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 1610915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Original strand, 254299 - 254573
Alignment:
Q  48 aaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgta 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||| ||||||||    
T  254299 aaagcatatctagacacataaccccctaatccatagtacaaagtgacgtatttgaatctatgttccaatatggtgtaactctgatcaaatgatgtttgta 254398  T
Q  148 ttgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagc 247  Q
    | | | | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||    
T  254399 tcgtagttaactgaatcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctcaaatatttatttactatagcatgagc 254498  T
Q  248 cgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  254499 caattctaccttgttggtggttctgcatccaagatgcaacacatagtctgtccatgctctcattattttctcctt 254573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 316
Target Start/End: Original strand, 34110718 - 34110860
Alignment:
Q  174 tcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgc 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | | |  | |||||| |  ||| ||  | ||||||||| ||     
T  34110718 tcatgtattttctcccaacaagtatccaaatcatccacactattgctcaaatatttcttcaattcaccatgagtcctttcaactctattggtggttttgt 34110817  T
Q  274 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34110818 agccaagatgcaagacacggtctgcccatgccttcactgtttt 34110860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Original strand, 26684104 - 26684167
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26684104 tgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccatgccctcattattttgtcctt 26684167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 17238697 - 17238995
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    |||||||||||| | | || ||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17238697 acgtgactcttccataacaatgttgtccaaagcata------cacatgaccacctaacccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 17238790  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  17238791 gtaacgctctgaccaaatgttgtttgtattgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatttattttctcccaacaagtacccaaaacacccacgctattgt 17238890  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17238891 ccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 17238990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 38462700 - 38463004
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  38462700 acgtgtctcttccaaagcactgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagtcggagtacaaaatgacatctttgaatctatgctccaacacg 38462799  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38462800 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacactattgt 38462899  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38462900 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttgctggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 38462999  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  38463000 cttca 38463004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 51642873 - 51643172
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  51642873 ctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctgagctggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacggtaacg 51642972  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  51642973 ctctgaccaacggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacacaaatcacctacactattgtccaaat 51643072  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcat 325  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643073 atttcttcaataaagcatgagtcgattctactctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcat 51643172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4770323 - 4770028
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  4770323 ctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaattcagagtacaaaatgacatatttgaatctatgttccaacacggcaacg 4770224  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4770223 ctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagca---acatgtcatgcattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactgttgtccaaat 4770127  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4770126 atttcttcactaaagcatgagccgattcgaccttgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttca 4770028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3405991 - 3405687
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3405991 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 3405892  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      || ||| |||||||| | ||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3405891 caaacgctttgaccaaaggatgtttgtatagaagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 3405792  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3405791 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 3405692  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  3405691 cttca 3405687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Original strand, 4977846 - 4978125
Alignment:
Q  45 tccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgttt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||  |||||||    
T  4977846 tccaaagcatatctagacacatgaccaccttacccggagtacagagtgacatctttgaatctatgttccaacatgctaacgctctgactaatggttgttt 4977945  T
Q  145 gtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatg 244  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | | |||||||||    
T  4977946 gtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgaccaaatacttcttcaataaagcatg 4978045  T
Q  245 agccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  4978046 agccgattcgaccctgctggtggtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcaaaattttgtccttca 4978125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 19071524 - 19071821
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  19071524 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 19071623  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19071624 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 19071723  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19071724 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 19071821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9892073 - 9891813
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9892073 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctatacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 9891974  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9891973 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 9891874  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaag 280  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  9891873 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaag 9891813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11503626 - 11503392
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11503626 acgtgtctcttccaaagtaatgttttccaaagcatatctagacacatgaccacctaagctggagtacaaaatgacatctttgaatctatgttccaacatg 11503527  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctccc-aataagtatccaaatcacccacactattg 218  Q
     ||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11503526 ctaacgctctgaccaatggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacagcatgtcatgtattttctcccaaacaagtacccaaatcacccacactattg 11503427  T
Q  219 tccaaatatttcattactaaagcatgagccgattc 253  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| |||||    
T  11503426 tccaaatatttcttcaataaagcatgagctgattc 11503392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4977834 - 4977656
Alignment:
Q  138 gttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattacta 237  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  4977834 gttgtttgtatcgcagtgaaatgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacacaaatcacccatactattgtccaaatatttcttcaata 4977735  T
Q  238 aagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  4977734 aagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcatcacacagtctgtccatgccctcacaatttt 4977656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6183730 - 6183584
Alignment:
Q  174 tcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgc 273  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | |||| | ||||||||  ||| ||  |||| |||||||||     
T  6183730 tcatgtattttctcccaacaagcatccaaatcaccagcactattgctcaaatatttcttcactataccatgagcc-tttcaactctgttagtggttctgt 6183632  T
Q  274 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcct 321  Q
    ||||||||||||| |||  || ||| |||||| |||||||||||||||    
T  6183631 aaccaagatgcaagacacagtttgttcatgccgtcactattttctcct 6183584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Original strand, 13896851 - 13896914
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  13896851 tgttggtggttctgcagccaagatgcaacacacggtatgtccatgccttcacaattttttcctt 13896914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17917372 - 17917280
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtat 148  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||  |||||| |||| ||||||    
T  17917372 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtatctattttccaagaccgtaacgctcctaccaaacgttgattgtat 17917280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Original strand, 20970616 - 20970675
Alignment:
Q  261 ttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcct 321  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20970616 ttggtggtcctgcacccaagatgcaacacaaggtatgtccatg-cctcactattttgtcct 20970675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 32717479 - 32717420
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaa 115  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32717479 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaa 32717420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Original strand, 20970438 - 20970480
Alignment:
Q  81 gagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaa 123  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20970438 gagtacaaaatgacatctttgtatctatgttccaatacagtaa 20970480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1592000 - 1591947
Alignment:
Q  75 aatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  1592000 aatccggagtacaaagtaacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 1591947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17497506 - 17497453
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacta 312  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17497506 tgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtatgtccatgccctcacta 17497453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4618741 - 4618669
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  4618741 tctagacatgtgaccccccaacccagagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagactgtaacgctc 4618669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 11691693 - 11691997
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  11691693 acgtgactcttccaaagcaatattgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttcaaacaag 11691792  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11691793 ataacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 11691892  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11691893 ccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctaactattttctc 11691992  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  11691993 cttca 11691997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Original strand, 41006845 - 41007143
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  41006845 ctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagtcggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgctaacg 41006944  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41006945 ctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatctattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaat 41007044  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007045 atttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtgatcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 41007143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 24603952 - 24604256
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24603952 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaacccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 24604051  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24604052 ctaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 24604151  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24604152 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 24604251  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  24604252 cttca 24604256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 24940513 - 24940817
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24940513 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaacccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 24940612  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24940613 ctaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 24940712  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24940713 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 24940812  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  24940813 cttca 24940817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9656353 - 9656057
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9656353 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaacctggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 9656254  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9656253 ctaacgctctaaccaaaggttgtttgtatcgcattgaactgaagcagcaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgt 9656154  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9656153 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatttt 9656057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 27274220 - 27274524
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27274220 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 27274319  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27274320 ctaacgctatgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 27274419  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27274420 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 27274519  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  27274520 cttca 27274524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 28347260 - 28347564
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28347260 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatccatgttccaacacg 28347359  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28347360 ctaatgctttgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacaagtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 28347459  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28347460 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaaccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 28347559  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  28347560 cttca 28347564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45477556 - 45477252
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  45477556 acgtgtctcttccaaaacaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagctggagtacaaaatgatatctttgaatctatgttccaacaag 45477457  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45477456 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctccaaacaagtacccaaatcacccacactatttt 45477357  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45477356 ccaaatatttattcactaaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcgctattttctc 45477257  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  45477256 cttca 45477252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Original strand, 12906380 - 12906659
Alignment:
Q  45 tccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgttt 144  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12906380 tccaaagcaaatctagacacctgaccacctaagccggagtacaaaatgacatctttgaatctatgttcaaacacggtaacgctctgaccaaaggttgttt 12906479  T
Q  145 gtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatg 244  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  12906480 gtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgccatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaaacatg 12906579  T
Q  245 agccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906580 agccgattcaaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttca 12906659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24751860 - 24751556
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24751860 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatatagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 24751761  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| |||||||| | ||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24751760 ctaacgctgtgaccaaaggatgtttgtatagtagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 24751661  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24751660 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 24751561  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  24751560 cttca 24751556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 437518 - 437214
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  437518 acgtgtctcttccaaagcaatgttgttcaaagcatacctatacacatgaccacctaagccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttctaacacg 437419  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||   | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  437418 ctaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcatagtgaactaaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 437319  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  437318 ccaaatatttcttcaataaaacatgagaagattcaaccatgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctc 437219  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  437218 cttca 437214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7265181 - 7264877
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7265181 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 7265082  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     |||  || |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7265081 ctaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 7264982  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7264981 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 7264882  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  7264881 cttca 7264877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 324
Target Start/End: Original strand, 34919686 - 34919949
Alignment:
Q  61 acacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattg 160  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | | |||| ||    
T  34919686 acacatgactacctaagccagagcacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacggtaacgctcggaccaaaggttgtttgtatcgtagtgaactg 34919785  T
Q  161 aagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatg 260  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34919786 aaacaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctg 34919885  T
Q  261 ttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34919886 ttggtggtcctgcaaccaagatgcaacgcatggtctgtccatgctctcactattttctccttca 34919949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 17996056 - 17996341
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  17996056 ctcttccaaagcaatgttgtccaaaacatatcttgacacataacaccctaaccaagagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacgataaca 17996155  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17996156 ctctgaccaaatgatgtttgtatcgcagttaattgaatcaccaacatatcatgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacattattgtccaaat 17996255  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcact 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17996256 atttctttactaaagcatgagccgattctacccggttggtcgttctgcaatcaagatgcaacacatggtctgtccatgccttcact 17996341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 3797662 - 3797965
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3797662 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 3797761  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3797762 c-aacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 3797860  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3797861 ccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgactctgtttgtggtcctgcaacctagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 3797960  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  3797961 cttca 3797965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39796171 - 39795867
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39796171 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaggcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaagctgacatctttgaatctatgttccaacacg 39796072  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39796071 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaattgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 39795972  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  39795971 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgctctcacaattttgtc 39795872  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  39795871 cttca 39795867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 211308 - 211605
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  211308 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaggtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 211407  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  211408 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 211507  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  211508 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 211605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 10622321 - 10622618
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  10622321 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 10622420  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10622421 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 10622520  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10622521 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 10622618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38947957 - 38947660
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  38947957 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 38947858  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38947857 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 38947758  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38947757 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttca 38947660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41562206 - 41561909
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  41562206 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 41562107  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41562106 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 41562007  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41562006 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 41561909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5349361 - 5349064
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  5349361 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacatatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 5349262  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5349261 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 5349162  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5349161 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 5349064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Original strand, 43948305 - 43948450
Alignment:
Q  179 tattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaacca 278  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  43948305 tattttctcctaacaagtacccaaatcacccacactattgcccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaacca 43948404  T
Q  279 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43948405 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 43948450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Original strand, 43946007 - 43946165
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  43946007 ctcttccaaagcaatgttttccaaagcatatctagacacatgaccacctaagccggagtacaaaatgacatctttgaatctatgttccaacacgctaacg 43946106  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtatttt 184  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43946107 ctctgaccaatggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtatttt 43946165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 322
Target Start/End: Original strand, 25618093 - 25618251
Alignment:
Q  164 caccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttg 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||  |||||    
T  25618093 caccaacatatcatgtattttctcccaacaagtacccagatcacccacactattactcaaatatatctttactaaagtatgagctgattcaactctgttg 25618192  T
Q  264 gtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25618193 gtggttatgcagccaagatgcaacacatggtctttccatgccctcactattttatcctt 25618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 324
Target Start/End: Original strand, 1097889 - 1097993
Alignment:
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||    
T  1097889 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctaccaattttgtc 1097988  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  1097989 cttca 1097993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24684091 - 24683970
Alignment:
Q  201 aaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtcc 300  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| | | |  | ||||||||  ||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||    
T  24684091 aaatcatccacactattgctcaaatatttcttcaatttaccatgagccccttcaactttgtttgtggttctgcaactaagatgcaagacacggtgtgtcc 24683992  T
Q  301 atgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24683991 atgccctcactattttttcctt 24683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 25615272 - 25615364
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatac 118  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25615272 ctcttccaaaacaatgttgcccaaagcatatctagacacataaccccccaacccatagtaaaaagtgacgtctttgaatctatattccaatac 25615364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 25855455 - 25855512
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  25855455 tgttggtggttctgcacccaagatgaaacacacggtctgtctatgccttcactatttt 25855512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 324
Target Start/End: Original strand, 28422551 - 28422616
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28422551 tgtttgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtctatccatgccctcactattttgtccttca 28422616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19989415 - 19989370
Alignment:
Q  241 catgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaa 286  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19989415 catgagccgattcaacaatgttggtggttctgcaccctagatgcaa 19989370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 19497327 - 19497631
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497327 acgtgactcttccaaagcaatgttgtccaaaacatatctagacatatgaccacctcacctggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 19497426  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19497427 gtaacgctctgacaaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 19497526  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19497527 ccaaaaatttctttactaaagcatgagcctattctaccctgttggtggttctgccaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctc 19497626  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  19497627 cttca 19497631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 38690802 - 38691106
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38690802 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctacgccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 38690901  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38690902 gtaatgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 38691001  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    | ||||||||| |   || | |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38691002 caaaatatttcttccatagaacatgagcctattctactctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttttc 38691101  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  38691102 cttca 38691106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Original strand, 36074667 - 36074966
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  36074667 ctcttccaaagcaatgttgtccaaaacatatttagacacatgaccacctaagccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttcctacacggtaacg 36074766  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36074767 ctatgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaattgaagcaccaacatgtcatttattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaat 36074866  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattcta-ccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074867 atttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgcaacatagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 36074966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37017105 - 37016808
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  37017105 ctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgctaacg 37017006  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    || |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37017005 ctgtgaccaaaggatgtttgtatagcaatgaactgaagcaacaacatgtcatgta-tttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgtccaaat 37016907  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37016906 atttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctaacaattttgtccttca 37016808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 29354548 - 29354852
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29354548 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 29354647  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29354648 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 29354747  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  29354748 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 29354847  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  29354848 cttca 29354852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Original strand, 12648464 - 12648743
Alignment:
Q  45 tccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgttt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||| | |||||    
T  12648464 tccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgctaacgttgtgaccaaaggatgttt 12648563  T
Q  145 gtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatg 244  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  12648564 gtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatg 12648663  T
Q  245 agccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12648664 agccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcataattttgtccttca 12648743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13175971 - 13175675
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  13175971 tcttccaaagcaatgttgtccaaagtaaatctagacacatgaccacctaagccagagtacaaaatgacatctatgaatctatgt-ccaacacggtaacgc 13175873  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13175872 tctgaccaaaggttgtttgcatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacaccattgtccaaata 13175773  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | ||||||||||||||   ||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175772 tttcttcactaaagcatgagctagttcgaccctgttgatggtcttgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 13175675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 46977007 - 46976762
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  46977007 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagccggagtacaaagtgacatttttgaatctatgttctaacacg 46976908  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  46976907 gtaatgctttgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 46976808  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggt 265  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46976807 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccttgttggt 46976762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 51664431 - 51664152
Alignment:
Q  45 tccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  51664431 tccaaagcatatctagacacatgacaacctaagccggagtacaaaatgacatctttaaatttatgttccaacacagtaacgctctgaccaaatgttgttt 51664332  T
Q  145 gtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatg 244  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||    
T  51664331 gtatcgcaatgaactgaagcaacaacatgtcatatattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttatccaataaagcatg 51664232  T
Q  245 agccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51664231 agccgattcgaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcaacatatggtttgtccatgccttcactattttctccttca 51664152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5080136 - 5079832
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5080136 acgtgtctctttcaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 5080037  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5080036 caaacacggtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 5079937  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  5079936 ccaattatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaacctagatgcaacacatggtctgtccatgccttcacaattttgtc 5079837  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  5079836 cttca 5079832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 50115626 - 50115930
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  50115626 acgtgtctcttccaaagcaatattgtccaaagtatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaaatgacatctttaaatctatgttccaacacg 50115725  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| ||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50115726 ctaacgctgtgaccaaaaaatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 50115825  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||||| | | || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  50115826 ccaagtatttcttcaaaaaagcatgagacaaatcgaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtc 50115925  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  50115926 cttca 50115930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3991799 - 3991502
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  3991799 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 3991700  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3991699 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 3991600  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3991599 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 3991502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 38773981 - 38774278
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  38773981 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 38774080  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38774081 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 38774180  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38774181 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 38774278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44467776 - 44467479
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  44467776 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 44467677  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44467676 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 44467577  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44467576 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 44467479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13631617 - 13631313
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13631617 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaggcatatctagacacatgaccacccaaccccaagtacaagctgacatctttgaatctatgttccaacacg 13631518  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13631517 caaacactttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgt 13631418  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13631417 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 13631318  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  13631317 cttca 13631313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 3946328 - 3946625
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  3946328 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 3946427  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3946428 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 3946527  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  3946528 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtctatgccctcacaattttgtccttca 3946625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20351650 - 20351353
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  20351650 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaggcgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 20351551  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20351550 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 20351451  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20351450 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaatacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 20351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 315
Target Start/End: Original strand, 32105679 - 32105826
Alignment:
Q  168 aacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtgg 267  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  ||| ||  |||||||||    
T  32105679 aacatatcatgtattttctctcagcaagtacccaaatcacccacattattgctcgaatatttctttattatagcatgagccccttcaactctgttggtgg 32105778  T
Q  268 ttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattt 315  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32105779 ttctgtatccaagatgcaagacatgatatgtccatgccctcactattt 32105826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46975114 - 46975058
Alignment:
Q  268 ttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46975114 ttctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcactattttcttcttca 46975058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 148
Target Start/End: Original strand, 36359395 - 36359487
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtat 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||| ||||  |||||||| || ||||||    
T  36359395 tctagacacgtgaccccctaacccggagtacaaagtgacatctttatacctatgttccaagaccgtaacgctcctaccaaatgatgattgtat 36359487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25232409 - 25232130
Alignment:
Q  40 tgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgt 139  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |  | ||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||   |||   |||||||     
T  25232409 tgttgcccagagcatatctagacacataacccaccgacccaaagtacaaaatgacgtctttgaatatatgttctaatacagtacaactcctcccaaatga 25232310  T
Q  140 tgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaa 239  Q
    |||||||||  || | || |  | ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| |    
T  25232309 tgtttgtatctcagttaactagatcaccaacatatcatgtattttctcccaa---gtacccaaatcatccacactattgctcaaatatttcttcactata 25232213  T
Q  240 gcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
     |     ||  ||  ||  | ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  25232212 cctcacaccctttaaactttattggtggttttgcagccaggatgcaagacacggtctgtccattccctcactattttatcctt 25232130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 115
Target Start/End: Original strand, 18886832 - 18886891
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaa 115  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18886832 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaa 18886891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27284023 - 27283960
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  27284023 tgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactaatttgtcctt 27283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7404784 - 7404714
Alignment:
Q  78 ccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  |||| ||||  |||||||| || ||||||    
T  7404784 ccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagatcgtaacgctcctaccaaatgatgattgtat 7404714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27284204 - 27284154
Alignment:
Q  78 ccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||    
T  27284204 ccggagtacaaagtgacatctttgtatcgatgttccaagaccgtaacgctc 27284154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28864054 - 28864004
Alignment:
Q  78 ccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  28864054 ccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 28864004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22582355 - 22582051
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22582355 acgtgtctctttcaaagcaatgttgtcgaaagcatatctagacacatgagcacctaagccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 22582256  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||  ||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22582255 gtaacgctctatccaaaggttgtttgtatcacagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 22582156  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22582155 ccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgcaaacaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctc 22582056  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  22582055 cttca 22582051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 33 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22586205 - 22585913
Alignment:
Q  33 aaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgac 132  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  22586205 aaagcaatgttgtcgaaagcatatctagacacatgaccacctaagtcggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacggtaacgctctgtc 22586106  T
Q  133 caaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataa-gtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttca 231  Q
    |||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22586105 caaaggttgtttgtatcacagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttct 22586006  T
Q  232 ttactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22586005 ttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttca 22585913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7170078 - 7169781
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7170078 acgtgactcttccaaagcaatgttgtccaaaacatatctagaaacatgacaacctaacccggagtacaaagtgacatatttgaatctatgttccaagacg 7169979  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7169978 gtaatgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 7169879  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||    
T  7169878 ccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaaccaagatgcaaccca-ggt------atgccctcactattttctc 7169786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43371965 - 43371661
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43371965 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaacccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 43371866  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43371865 ctaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatatattttcttccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 43371766  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  43371765 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctctccatgccctcacaattttttc 43371666  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  43371665 cttca 43371661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 43683100 - 43683404
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43683100 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaatcatatctagacacatgaccacctaagctggagtacaaaatgacatctttgaatctatgttccaacacg 43683199  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43683200 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgtagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 43683299  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43683300 ccaaatatttcttcaataaagcataagcagattcgaccctgttggttgtcatgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 43683399  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  43683400 cttca 43683404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 2144862 - 2145166
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2144862 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacgcatgaccacctaacccagagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 2144961  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     |||  |||| ||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  2144962 ctaactctctcaccaaagattgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgttatgtattttctcccaacaagtacctaaatcacccacactattgt 2145061  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2145062 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 2145161  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  2145162 cttca 2145166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 35964609 - 35964912
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35964609 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaaacatatctagacacatgaccacctaaccctgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 35964708  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35964709 ctaacgctgtgaccaaataatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 35964808  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    | || |||||| | | |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  35964809 caaagtatttcttcaataaagcatgagctgattcgacc-tgttcgtggtcctgaaatcaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtc 35964907  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  35964908 cttca 35964912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 8421723 - 8422020
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  8421723 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 8421822  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8421823 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 8421922  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8421923 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 8422020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7342273 - 7341976
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  7342273 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 7342174  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7342173 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 7342074  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7342073 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 7341976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 32430732 - 32431029
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  32430732 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 32430831  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32430832 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 32430931  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32430932 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 32431029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 32376775 - 32377072
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  32376775 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgatcacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 32376874  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32376875 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 32376974  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32376975 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttca 32377072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 30303477 - 30303774
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||       
T  30303477 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttatagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatatttgaatctatgttccaacacgcaaacat 30303576  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30303577 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 30303676  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30303677 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttttggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 30303774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17317442 - 17317379
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17317442 tgttggtgattctgcacccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttttcctt 17317379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44322024 - 44321952
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  44322024 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaataccgtaacgctc 44321952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17340990 - 17340935
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatt 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  17340990 tgttggtggttctgcacccaagatacaacacacggtatgtccttgccctcactatt 17340935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Original strand, 43611200 - 43611250
Alignment:
Q  78 ccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  43611200 ccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagactgtaacgctc 43611250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 324
Target Start/End: Original strand, 4198767 - 4199070
Alignment:
Q  21 cgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacgg 120  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  4198767 cgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaagccggtgtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacatgc 4198866  T
Q  121 taatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtc 220  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4198867 taacgctctgaccaaaggttgtttgtatcgcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtc 4198966  T
Q  221 caaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcc 320  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4198967 caaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcc 4199066  T
Q  321 ttca 324  Q
    ||||    
T  4199067 ttca 4199070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 7019826 - 7020130
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7019826 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 7019925  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7019926 caaacactatgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 7020025  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7020026 ccaagtatttcttcaataatgcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttctc 7020125  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  7020126 cttca 7020130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 7798878 - 7799182
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  7798878 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaacccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacatg 7798977  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||||||||||||  |||||||||| | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  7798978 ctaacgctctgaccaaagtttgtttgtatcgtagtgaactaaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaattacccacaatattgt 7799077  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7799078 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 7799177  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  7799178 cttca 7799182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 13565967 - 13566271
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13565967 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaaccatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 13566066  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      || ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13566067 caaacgctttgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatatattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 13566166  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13566167 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 13566266  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  13566267 cttca 13566271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 25894957 - 25895261
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25894957 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaaacatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 25895056  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  25895057 ctaacgctgtgaccaaaggatgtctgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgccatgtattttctcccaacaactacccaaatcacccacactattgt 25895156  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25895157 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 25895256  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  25895257 cttca 25895261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 27865705 - 27866009
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27865705 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagaatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 27865804  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      || ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27865805 caaacgctttgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 27865904  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27865905 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgatttgaccctgtttgtggtcctgcaactaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 27866004  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  27866005 cttca 27866009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 37818737 - 37819041
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37818737 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 37818836  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  ||||||||||| | ||||||||| | | |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37818837 caaacactctgaccaaaggatgtttgtatagtagtgaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactatttt 37818936  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37818937 ccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 37819036  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  37819037 cttca 37819041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1037552 - 1037248
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1037552 acgtgtctcttccaaagcaatgctgtccaaagcatatctaaacacatgaccacctaaccccgagtataaagtgacatctttgaatctatgttccaacaca 1037453  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1037452 ctaacgctgtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaattgaagcaacaacctgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattat 1037353  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| ||| || | | ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  1037352 ccaagtatgtcttcaataaagtatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcacaattttgtc 1037253  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  1037252 cttca 1037248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 11031312 - 11031616
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11031312 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaggcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaagctgacatctttgaatctatgttccaacacg 11031411  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11031412 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaattgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 11031511  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||  ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11031512 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgatttgactctgtttgtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttttc 11031611  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  11031612 cttca 11031616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 38858050 - 38858354
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38858050 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaggcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaagctgacatctttgaatctatgttccaacacg 38858149  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38858150 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 38858249  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  38858250 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 38858349  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  38858350 cttca 38858354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 324
Target Start/End: Original strand, 28884312 - 28884602
Alignment:
Q  34 aagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgacc 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  || ||| |    
T  28884312 aagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacactttgatc 28884411  T
Q  134 aaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcatt 233  Q
     || | ||||||||| ||| | ||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  28884412 gaaggatgtttgtatagcagtaaacggaagcaacaacatgtcgtgcattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttc 28884511  T
Q  234 actaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28884512 aacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 28884602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20288461 - 20288167
Alignment:
Q  26 ctcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatg 125  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||       
T  20288461 ctcttccaaaacaatgttgcccaaagcatatctagacatataaccccctaaccaagagtaaaaagtgacatctttgaat--atcttccaatacggtacaa 20288364  T
Q  126 ctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaat 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || | || || | ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||    
T  20288363 ctctgaccaaatgatgtttgtatcacagttaactgcatcaccagcatatcaagtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctccaat 20288264  T
Q  226 atttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20288263 atttatttactaaatcatgagccgattctaccctattggtggttctgcaaccaagatataacacatggtttatccatgccctcactattttctcctt 20288167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 324
Target Start/End: Original strand, 18536395 - 18536503
Alignment:
Q  215 attgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatt 314  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18536395 attgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgtttctacctcgttg-tggtcctgcaaccaagatgcaacatatggtctgttcatgccctcactatt 18536493  T
Q  315 ttctccttca 324  Q
    ||||||||||    
T  18536494 ttctccttca 18536503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34079742 - 34079677
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34079742 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 34079677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6553975 - 6553903
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  6553975 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 6553903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11820402 - 11820343
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaa 115  Q
    ||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11820402 tctagacacgtgatcccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaa 11820343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Original strand, 12340196 - 12340251
Alignment:
Q  267 gttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  12340196 gttctgcaacgaagatgcaagacacggtccttccatgccctcactattttttcctt 12340251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25054253 - 25054201
Alignment:
Q  264 gtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  25054253 gtggtcctgcacccaagatgtaacacaagctctgtccatgctctcactatttt 25054201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Original strand, 76885 - 77187
Alignment:
Q  22 gtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggt 121  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  76885 gtgactcttccaaaacaatgttgtccaaagcccctctagacacatgaccacctaagtcggagtacaaagtgacatctttgaatttatgtttcaacacggt 76984  T
Q  122 aatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtcc 221  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  76985 aacgctatgaccaaaggttgtttgtattgcagtgaactgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccgcactattgtcc 77084  T
Q  222 aaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcct 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  77085 aaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttctcct 77184  T
Q  322 tca 324  Q
    |||    
T  77185 tca 77187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 36815376 - 36815680
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36815376 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 36815475  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36815476 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 36815575  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36815576 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 36815675  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  36815676 cttca 36815680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 46991108 - 46991412
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  46991108 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaacaccgagtacaaagtgacatctttgaatctatatttcaacacg 46991207  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  46991208 ctaacgctgtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 46991307  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46991308 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggcctgtccatgccctcacaattttctc 46991407  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  46991408 cttca 46991412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29950182 - 29949878
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||  |||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  29950182 acgtgtctcttccaaagctatgttctgcaaagcatatctggaaacatgaccacctaagcgggagtacaaaatgacatctttgaatctatgttccaacatg 29950083  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  29950082 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatctcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgt 29949983  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949982 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 29949883  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  29949882 cttca 29949878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29999336 - 29999032
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||  |||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  29999336 acgtgtctcttccaaagctatgttctgcaaagcatatctggaaacatgaccacctaagcgggagtacaaaatgacatctttgaatctatgttccaacatg 29999237  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  29999236 gtaacgctctgaccaaaggttgtttgtatctcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgt 29999137  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999136 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 29999037  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  29999036 cttca 29999032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 48248729 - 48249033
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48248729 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacataaccacctaaccccgagtacaaaatgacatctttgaatctatgttccaacacg 48248828  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| | | |||| ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48248829 ctaacgttatgactaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgt 48248928  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  48248929 ccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccttgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtc 48249028  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  48249029 cttca 48249033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 13745581 - 13745885
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13745581 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 13745680  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13745681 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 13745780  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13745781 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 13745880  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  13745881 cttca 13745885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 6503818 - 6504122
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6503818 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacg 6503917  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
     ||| ||| ||||||| || ||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6503918 ctaacgctgtgaccaattgatgtttgtatagaagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccactctattgt 6504017  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| |||  | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  6504018 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccaatttgaacctgttgttggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtatgtctatgccctcacaattttgtc 6504117  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  6504118 cttca 6504122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14400763 - 14400454
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaa-----gcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttcca 114  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400763 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaattaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtataaagtgacatctttgaatctatgttcca 14400664  T
Q  115 atacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacact 214  Q
    | ||| ||| ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14400663 acacgctaacgctgtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacact 14400564  T
Q  215 attgtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatt 314  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  14400563 attgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctttctatgccctcataatt 14400464  T
Q  315 ttctccttca 324  Q
    || |||||||    
T  14400463 ttgtccttca 14400454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 21954100 - 21954406
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatac- 118  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  21954100 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttcaatctatgttccaacaca 21954199  T
Q  119 -ggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactatt 217  Q
     | | ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||    
T  21954200 cgctcatgctctgaccaaagattgtttgtatcgcagtgaaatgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaattactcacattatt 21954299  T
Q  218 gtccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttc 317  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21954300 gtccaattatttcttcaataaagcatgtgccgattcgactctgtttgtggtccttcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttg 21954399  T
Q  318 tccttca 324  Q
    |||||||    
T  21954400 tccttca 21954406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3950937 - 3950640
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  3950937 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 3950838  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3950837 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 3950738  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3950737 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 3950640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6743081 - 6742784
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  6743081 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaggcgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 6742982  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6742981 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 6742882  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6742881 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 6742784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Original strand, 30945509 - 30945806
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  30945509 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 30945608  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  30945609 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaagta 30945708  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30945709 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 30945806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16446821 - 16446517
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16446821 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaggcatatctagacacatgaccacccaaccccaagtacaagctgacatctttgaatctatgttccaacacg 16446722  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16446721 caaacactttgaccaaaggatgtttgtatagcggtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgt 16446622  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctc 319  Q
    |||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16446621 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 16446522  T
Q  320 cttca 324  Q
    |||||    
T  16446521 cttca 16446517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 324
Target Start/End: Original strand, 8158856 - 8159147
Alignment:
Q  33 aaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgac 132  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||   | ||||    
T  8158856 aaagcaatgttgtccaaaacatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacattttgac 8158955  T
Q  133 caaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcat 232  Q
    |||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8158956 caaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgttatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttctt 8159055  T
Q  233 tactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
     |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8159056 caacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 8159147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33941027 - 33940934
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgtatt 149  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||  |||||||| || |||||||    
T  33941027 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctcctaccaaatgatgattgtatt 33940934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8118572 - 8118509
Alignment:
Q  259 tgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  8118572 tgttggtggtcctgcatccaagatgcaatacaaggtatgcccatgccctcactattttttcctt 8118509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 4119669 - 4119741
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  4119669 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 4119741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 51547408 - 51547480
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  51547408 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 51547480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32426992 - 32426942
Alignment:
Q  78 ccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  32426992 ccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 32426942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 322
Target Start/End: Original strand, 40467303 - 40467349
Alignment:
Q  276 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctcctt 322  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40467303 ccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactattttgtcctt 40467349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 128
Target Start/End: Original strand, 10286165 - 10286214
Alignment:
Q  79 cggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  10286165 cggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 10286214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4511103 - 4511043
Alignment:
Q  264 gtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4511103 gtggtcctgcacccaagatgtaacagaaagtctgtccatgctctcactattttgtccttca 4511043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 115
Target Start/End: Original strand, 9555666 - 9555698
Alignment:
Q  83 gtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaa 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9555666 gtacaaagtgacatctttgtatctatgttccaa 9555698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 15217 - 15513
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15217 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacatg 15316  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgt 219  Q
      ||  || |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15317 caaacactgtgaccaaaggatgtttgtatagcagtgaactgaagcaacaacatgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgt 15416  T
Q  220 ccaaatatttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    |||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15417 ccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacctagatgcaacacatggtctgtccattccctcacaatttt 15513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3075 - 2778
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  3075 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 2976  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2975 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 2876  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2875 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 2778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35003 - 34706
Alignment:
Q  27 tcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgc 126  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||       
T  35003 tcttccaaagcaatgttgtccaaagcatttctagacacatgaccacctaaccccgagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaacacgcaaacat 34904  T
Q  127 tctgaccaaatgttgtttgtattgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaata 226  Q
    | |||||||| | ||||||||| ||  | || || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34903 tttgaccaaaggatgtttgtatagcggtcaactggagcaacaacatgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagta 34804  T
Q  227 tttcattactaaagcatgagccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttca 324  Q
    |||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34803 tttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 34706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17894 - 17778
Alignment:
Q  20 acgtgactcttctaaagcagtgttgtccaaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacg 119  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17894 acgtgtctcttccaaagcaatgttgtacaaagtatatctagacacatgaccacctaacccgaagtacaaactgacatctttgaatctatgttccaacacg 17795  T
Q  120 gtaatgctctgaccaaa 136  Q
     ||| ||||||||||||    
T  17794 ctaacgctctgaccaaa 17778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 316
Target Start/End: Original strand, 959 - 1226
Alignment:
Q  47 caaagcatatctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatgttgtttgt 146  Q
    |||||||  |||||| |||| ||| ||||| |  ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||    |||   ||||||| |||||||    
T  959 caaagcacgtctagatacataaccccctaacctagagtacaaaatgacgtctttgtatctatgttctaatacagtgcaactcctcccaaatgatgtttgt 1058  T
Q  147 attgcattgaattgaagcaccaacatgtcatgtattttctcccaataagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgag 246  Q
    ||  || | || || | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||    ||||  ||| | |||  | ||  ||    
T  1059 atctcagttaactggatcaccaacatatcatgtattttctcccaa--agtacccaaatcatccacactattacttaaattattcttcactctaccaaaag 1156  T
Q  247 ccgattctaccatgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactatttt 316  Q
    ||  ||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1157 ccccttcaactctgttggtggttcggcagccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcactatttt 1226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 2100 - 2167
Alignment:
Q  258 atgttggtggttctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcat 325  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2100 atgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccataccctcactattttgtccttcat 2167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 1923 - 1979
Alignment:
Q  82 agtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctctgaccaaatg 138  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||    
T  1923 agtacaaaatgacatctttgtatctatgttccaagaccgtaacgctcctaccaaatg 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5022 - 4950
Alignment:
Q  56 tctagacacatgaccacctaatccggagtacaaagtgacatctttgaatctatgttccaatacggtaatgctc 128  Q
    ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  5022 tctagacatgtgaccccccaacccggagtacaaagtgacatctttgtacctatgttccaagaccgtaacgctc 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University