View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4791_low_2 (Length: 399)

Name: NF4791_low_2
Description: NF4791
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4791_low_2
NF4791_low_2
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (41-392)||(26143513-26143864)
chr6 (46-392)||(25580372-25580718)
chr6 (46-392)||(25483709-25484055)
chr6 (41-392)||(25539188-25539539)
chr6 (37-392)||(26656606-26656961)
chr6 (37-392)||(26762577-26762932)
chr6 (46-392)||(26056572-26056918)
chr6 (46-392)||(26076542-26076888)
chr6 (46-392)||(26862230-26862576)
chr6 (37-392)||(26884711-26885066)
chr6 (8-392)||(26647091-26647475)
chr6 (8-392)||(26753059-26753443)
chr6 (38-392)||(27337281-27337635)
chr6 (38-392)||(27398021-27398375)
chr6 (1-392)||(26623876-26624267)
chr6 (1-392)||(26729853-26730244)
chr6 (8-392)||(27530487-27530871)
chr6 (1-392)||(28786843-28787234)
chr6 (1-392)||(28792964-28793355)
chr6 (1-392)||(31285164-31285555)
chr6 (1-392)||(27610306-27610697)
chr6 (1-392)||(27717685-27718076)
chr6 (144-392)||(25511640-25511888)
chr6 (1-392)||(28781706-28782097)
chr6 (1-392)||(27705590-27705981)
chr6 (1-392)||(26803051-26803442)
chr6 (10-392)||(27603890-27604272)
chr6 (37-392)||(25492505-25492860)
chr6 (1-392)||(27679555-27679946)
chr6 (1-389)||(27426801-27427189)
chr6 (37-392)||(27215093-27215448)
chr6 (1-392)||(27697772-27698163)
chr6 (1-392)||(27592207-27592598)
chr6 (1-392)||(27676806-27677197)
chr6 (37-246)||(26824460-26824669)
chr6 (46-98)||(25511588-25511640)
chr6 (156-239)||(28140295-28140378)
chr6 (157-233)||(26937790-26937866)
chr6 (164-246)||(28097775-28097857)
chr6 (145-210)||(26849461-26849526)
chr6 (139-227)||(28243538-28243626)
chr6 (164-246)||(26950511-26950593)
chr6 (145-210)||(26975700-26975765)
chr6 (155-227)||(29843338-29843410)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (36-393)||(28126860-28127217)
chr1 (1-392)||(267526-267917)
chr1 (37-393)||(28163561-28163916)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-392)||(8092-8483)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-392)||(12861-13252)
scaffold0277 (8-392)||(3898-4282)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (1-392)||(29273024-29273415)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (1-392)||(18678742-18679133)
chr4 (1-392)||(18698582-18698973)
chr4 (1-392)||(18730686-18731077)
chr4 (1-392)||(18654659-18655050)
chr4 (1-389)||(18074366-18074754)
chr4 (15-392)||(18723267-18723644)
chr4 (139-247)||(5090284-5090392)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-392)||(2725-3116)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-389)||(60174-60562)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (147-246)||(3280410-3280509)
chr2 (141-246)||(17992547-17992652)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (147-246)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (139-227)||(43700-43788)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 392
Target Start/End: Original strand, 26143513 - 26143864
Alignment:
Q  41 atgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26143513 atgtagccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttt 26143612  T
Q  141 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagag 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143613 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 26143712  T
Q  241 aattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaa 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143713 aattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaa 26143812  T
Q  341 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143813 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 26143864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 25580372 - 25580718
Alignment:
Q  46 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25580372 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggta 25580471  T
Q  146 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25580472 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttc 25580571  T
Q  246 aagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcatt 345  Q
    || || ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||||  ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580572 aattcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcatt 25580671  T
Q  346 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25580672 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgt 25580718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 25483709 - 25484055
Alignment:
Q  46 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25483709 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggta 25483808  T
Q  146 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483809 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 25483908  T
Q  246 aagtcataataaactgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcat 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || || |||||||||  ||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  25483909 aagtcataataacctgaaacatctcca-aaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcat 25484007  T
Q  345 taaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484008 aaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgt 25484055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 392
Target Start/End: Original strand, 25539188 - 25539539
Alignment:
Q  41 atgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539188 atgtggccaaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 25539287  T
Q  141 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagag 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539288 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcagagag 25539387  T
Q  241 aattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaa 340  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |  | ||||||| || || |||||||||  ||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  25539388 aattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataacaa 25539487  T
Q  341 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539488 tcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 25539539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 392
Target Start/End: Original strand, 26656606 - 26656961
Alignment:
Q  37 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| | |||||||||||    
T  26656606 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26656705  T
Q  137 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcag 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26656706 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26656805  T
Q  237 agagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatt 336  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| | ||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26656806 agagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26656905  T
Q  337 tcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26656906 ccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26656961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 392
Target Start/End: Original strand, 26762577 - 26762932
Alignment:
Q  37 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| | |||||||||||    
T  26762577 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26762676  T
Q  137 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcag 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26762677 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26762776  T
Q  237 agagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatt 336  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| | ||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26762777 agagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26762876  T
Q  337 tcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26762877 ccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26762932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 26056572 - 26056918
Alignment:
Q  46 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggta 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26056572 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26056671  T
Q  146 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056672 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26056771  T
Q  246 aagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcatt 345  Q
    || || ||| ||  |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||    |||||| ||||||||||||||||||  |||| ||     
T  26056772 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattata 26056871  T
Q  346 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26056872 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 26056918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 26076542 - 26076888
Alignment:
Q  46 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggta 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26076542 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26076641  T
Q  146 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076642 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26076741  T
Q  246 aagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcatt 345  Q
    || || ||| ||  |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||    || ||| ||||||||||||||||||  |||| ||     
T  26076742 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattata 26076841  T
Q  346 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26076842 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 26076888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 26862230 - 26862576
Alignment:
Q  46 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggta 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  26862230 gccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggta 26862329  T
Q  146 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26862330 ctggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattc 26862429  T
Q  246 aagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcatt 345  Q
    || ||||||||   |||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| || | ||     
T  26862430 aactcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttata 26862529  T
Q  346 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26862530 aaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgt 26862576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 392
Target Start/End: Original strand, 26884711 - 26885066
Alignment:
Q  37 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||| | ||  ||| | || | ||| | ||||||||||     
T  26884711 ttacatgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaa 26884810  T
Q  137 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcag 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  26884811 tttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcag 26884910  T
Q  237 agagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatt 336  Q
     |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  26884911 ggagaattcaactcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26885010  T
Q  337 tcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885011 ccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 26885066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Original strand, 26647091 - 26647475
Alignment:
Q  8 acatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatggg 107  Q
    ||||||||||||||||||  || ||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |     
T  26647091 acatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaaga 26647190  T
Q  108 ctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaattt 207  Q
     ||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26647191 atctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaattt 26647290  T
Q  208 gaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacc 307  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||||     
T  26647291 gaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaaca 26647390  T
Q  308 aaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
      ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26647391 ttaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26647475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Original strand, 26753059 - 26753443
Alignment:
Q  8 acatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatggg 107  Q
    ||||||||||||||||||  || ||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |     
T  26753059 acatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaaga 26753158  T
Q  108 ctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaattt 207  Q
     ||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26753159 atctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaattt 26753258  T
Q  208 gaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacc 307  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||||     
T  26753259 gaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaaca 26753358  T
Q  308 aaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
      ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26753359 ttaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26753443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 38 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27337635 - 27337281
Alignment:
Q  38 tacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggact 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||   ||  ||||| || | ||||  ||||||||||||    
T  27337635 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27337536  T
Q  138 ttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcaga 237  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||    
T  27337535 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27337436  T
Q  238 gagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaattt 337  Q
    |||||||||  || ||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || |||||   |||||| ||||||||  ||||||||||     
T  27337435 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27337336  T
Q  338 caatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27337335 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 38 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27398375 - 27398021
Alignment:
Q  38 tacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggact 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||   ||  ||||| || | ||||  ||||||||||||    
T  27398375 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27398276  T
Q  138 ttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcaga 237  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||    
T  27398275 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27398176  T
Q  238 gagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaattt 337  Q
    |||||||||  || ||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || |||||   |||||| ||||||||  ||||||||||     
T  27398175 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27398076  T
Q  338 caatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27398075 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27398021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 26623876 - 26624267
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||  |||||||    
T  26623876 gtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttg 26623975  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  26623976 ataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctga 26624075  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |    
T  26624076 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactgga 26624175  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||| |    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26624176 ttggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26624267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 26729853 - 26730244
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||  |||||||    
T  26729853 gtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttg 26729952  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  26729953 ataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctga 26730052  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |    
T  26730053 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactgga 26730152  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||| |    ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26730153 ttggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27530871 - 27530487
Alignment:
Q  8 acatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatggg 107  Q
    |||| ||||||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  || ||||||          
T  27530871 acatttccaacaggattagtcgtgagcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaa 27530772  T
Q  108 ctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaattt 207  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  27530771 atctgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaattt 27530672  T
Q  208 gaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacc 307  Q
    |||  | ||||||||||  | ||||| |||| |||||| | |    ||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| |||| ||     
T  27530671 gaagttttatgttttctagaaaatgtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggaca 27530572  T
Q  308 aaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
      |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530571 ttaagttaggaggtgttagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27530487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 28786843 - 28787234
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  28786843 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 28786942  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |    || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  28786943 atgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctga 28787042  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || ||    
T  28787043 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaa 28787142  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28787143 ctgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 28787234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 28792964 - 28793355
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  28792964 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 28793063  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |    || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  28793064 atgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctga 28793163  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||| ||||  |   |||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || ||    
T  28793164 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaa 28793263  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28793264 ctgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 28793355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 31285164 - 31285555
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31285164 gtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttg 31285263  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | | ||   || |  | | ||| | |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||    
T  31285264 ataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttattggtga 31285363  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||  |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||  |    
T  31285364 tcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattgga 31285463  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||| |    |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31285464 ttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 31285555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27610697 - 27610306
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | || || ||||||||| ||||||||    
T  27610697 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttg 27610598  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27610597 atgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctga 27610498  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aa 299  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||| || ||    
T  27610497 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaa 27610398  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||||    ||||| |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27610397 cttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 27610306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27718076 - 27717685
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  27718076 gtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 27717977  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27717976 atgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctga 27717877  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aa 299  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||| |||| || ||    
T  27717876 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaa 27717777  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||||    ||||| |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27717776 cttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 27717685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 392
Target Start/End: Original strand, 25511640 - 25511888
Alignment:
Q  144 tactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaat 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25511640 tactagaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaat 25511739  T
Q  244 tcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatca 343  Q
    |||| || ||| ||  |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||    || ||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  25511740 tcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaatta 25511839  T
Q  344 ttaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25511840 taaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 25511888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 28781706 - 28782097
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  28781706 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcacttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 28781805  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
         || | |||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  28781806 gtgaaggatatgataatggagtcaggatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctga 28781905  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | || || ||    
T  28781906 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaa 28782005  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28782006 ctgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 28782097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27705981 - 27705590
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||  |||||||    
T  27705981 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttg 27705882  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27705881 atgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttataattttgttgctga 27705782  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  |    
T  27705781 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactgga 27705682  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    | |||   ||||||||   ||||| ||||||| ||| || |||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27705681 tcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27705590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 26803051 - 26803442
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || || ||||||||| ||||||||    
T  26803051 gtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttg 26803150  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  26803151 atgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataattttgttgctga 26803250  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  |    
T  26803251 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactgga 26803350  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    |||||    |||||||   ||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26803351 ttgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgt 26803442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27604272 - 27603890
Alignment:
Q  10 atctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggct 109  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||     | |    
T  27604272 atctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagat 27604173  T
Q  110 ctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttga 209  Q
    |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27604172 ctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttga 27604073  T
Q  210 aagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaacca 308  Q
    | |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||       
T  27604072 atgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-at 27603974  T
Q  309 aaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    || |||||||| ||   |  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27603973 taagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgt 27603890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25492860 - 25492505
Alignment:
Q  37 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||   ||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25492860 ttacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggac 25492761  T
Q  137 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcag 236  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||     |||| ||    
T  25492760 tttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgag 25492661  T
Q  237 agagaattcaagtcataataaac-tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaat 335  Q
    ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| | |||||||  | ||  |||| |||  ||   |||||| ||  |||||||||||||||    
T  25492660 agagaattcaactc-caagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaat 25492562  T
Q  336 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    | ||||||| ||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25492561 tgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgt 25492505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 27679555 - 27679946
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  27679555 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 27679654  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |   ||| || || |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||| ||    
T  27679655 atgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctataattttgttgcaga 27679754  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||| ||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||| ||||||| ||  | |||||||||| ||||          
T  27679755 tcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggt 27679854  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||| |    |||||||   ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27679855 ttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27679946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 27427189 - 27426801
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  27427189 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 27427090  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  27427089 atgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctga 27426990  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaa 299  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |   ||||   |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || |    
T  27426989 tcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttca 27426891  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 389  Q
    | ||||    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27426890 actgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 27426801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 392
Target Start/End: Original strand, 27215093 - 27215448
Alignment:
Q  37 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  27215093 ttacatgttgccaaacaccctgttggattacatacccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggac 27215192  T
Q  137 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcag 236  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||| ||  || ||||||  |  |||| |     
T  27215193 ttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaa 27215292  T
Q  237 agagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatt 336  Q
    ||||||||||| |   |||||  ||||||| || |||||| |  ||||| | | ||| |||| |||  || | |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27215293 agagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggatt 27215392  T
Q  337 tcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||  || ||  |||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215393 acaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27215448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27698163 - 27697772
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||  ||||||||   ||||||    
T  27698163 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttg 27698064  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  27698063 ataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggttgctga 27697964  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||  | | |||||  || |||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |    
T  27697963 tcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactgga 27697864  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    | | |    || ||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27697863 tcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgt 27697772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27592598 - 27592207
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  27592598 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 27592499  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |    || |||||  ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27592498 atgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataactttattgctga 27592399  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aa 299  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| | ||||| ||||  |   |||||  ||||| |||||||| | || |||||||||| |||| || ||    
T  27592398 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaa 27592299  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||||    |||||||||  |||||| || |||||| | |  || |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592298 cttgaa-attaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27592207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27677197 - 27676806
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  27677197 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttg 27677098  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |    || |||||  ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  27677097 atgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctga 27676998  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aa 299  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| | ||||| ||||  |   |||||  ||||| |||||||| | || |||||||||| |||| || ||    
T  27676997 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaa 27676898  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||||    |||||||||  |||||| || |||||| | |  || |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676897 cttgaa-attaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27676806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 26824460 - 26824669
Alignment:
Q  37 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |  |  ||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  26824460 ttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggac 26824559  T
Q  137 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcag 236  Q
    |||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| ||||||||  | | ||||||||| | || || ||    
T  26824560 tttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgag 26824659  T
Q  237 agagaattca 246  Q
    ||||||||||    
T  26824660 agagaattca 26824669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 25511588 - 25511640
Alignment:
Q  46 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25511588 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 239
Target Start/End: Original strand, 28140295 - 28140378
Alignment:
Q  156 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagaga 239  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  28140295 gggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagaga 28140378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937866
Alignment:
Q  157 ggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaaagtttgtgttttcttcataatgt 26937866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097775
Alignment:
Q  164 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatgtgtctgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 28097775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 210
Target Start/End: Original strand, 26849461 - 26849526
Alignment:
Q  145 actggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 210  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26849461 actggaggaatgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaa 26849526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 227
Target Start/End: Original strand, 28243538 - 28243626
Alignment:
Q  139 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttca 227  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  28243538 tatgggactggtggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttca 28243626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 26950511 - 26950593
Alignment:
Q  164 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 246  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26950511 caacacttgctcaagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaatgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 26950593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 210
Target Start/End: Original strand, 26975700 - 26975765
Alignment:
Q  145 actggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 210  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  26975700 actgggggaatgggtaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaa 26975765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29843410 - 29843338
Alignment:
Q  155 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttca 227  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  29843410 tgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttttcttca 29843338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28127217 - 28126860
Alignment:
Q  36 cttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | || |||||||||| |||||||| || | ||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  28127217 cttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28127118  T
Q  136 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtca 235  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||  |  |||| |    
T  28127117 ctttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28127018  T
Q  236 gagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaat 335  Q
    |||||| ||||| ||   ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||  |||| ||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  28127017 gagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28126918  T
Q  336 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 393  Q
    | ||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28126917 tgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 28126860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 267917 - 267526
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | | || |||||||||||||||||||||    
T  267917 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttg 267818  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  267817 ataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataattttattgctga 267718  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataa-taaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaa 299  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||| |||  ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |      
T  267717 tcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattc-agctataagtaacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactgg 267619  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    |||| |    |||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  267618 attggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 267526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28163916 - 28163561
Alignment:
Q  37 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggac 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  28163916 ttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggac 28163817  T
Q  137 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcag 236  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||  |  |||| ||    
T  28163816 tttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgag 28163717  T
Q  237 agagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatt 336  Q
    ||||||||||| ||     ||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| || | ||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28163716 agagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctctttttga-aacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaatt 28163618  T
Q  337 tcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 393  Q
     ||||||| ||  |||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28163617 acaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtc 28163561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 8092 - 8483
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  8092 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttg 8191  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |    || ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  8192 atgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctga 8291  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||    
T  8292 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaa 8391  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
      |||    |||||||||  |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8392 cagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13252 - 12861
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  13252 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttg 13153  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |    || ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  13152 atgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctga 13053  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||    
T  13052 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaa 12953  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
      |||    |||||||||  |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12952 cagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4282 - 3898
Alignment:
Q  8 acatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatggg 107  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||    ||    
T  4282 acatctccaacaagatcagtcatcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaagg 4183  T
Q  108 ctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaattt 207  Q
     |||||  |||  | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4182 atctgatcatggagcccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaattt 4083  T
Q  208 gaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaac 306  Q
    ||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||     
T  4082 gaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa- 3984  T
Q  307 caaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||    || |||||||| ||   |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3983 attaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 3898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29273415 - 29273024
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| ||||||||    
T  29273415 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttg 29273316  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||||| |||| | |||  ||||| ||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  29273315 ataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataatttttttgctga 29273216  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |  |    
T  29273215 tcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactgga 29273116  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||| |    |||||||   ||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29273115 ttggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgt 29273024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18679133 - 18678742
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  18679133 gtcaaatacgtctctaacaagatcagtcggcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 18679034  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |     | ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18679033 atgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctga 18678934  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  |    
T  18678933 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttca 18678834  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18678833 ctgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18678742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18698973 - 18698582
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||    
T  18698973 gtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttg 18698874  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18698873 ataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctga 18698774  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   |    
T  18698773 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagca 18698674  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18698673 ctgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18698582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18731077 - 18730686
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  18731077 gtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 18730978  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||| | | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  18730977 ataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttataattttattgctga 18730878  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   |    
T  18730877 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagca 18730778  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18730777 ctgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18730686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18655050 - 18654659
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  18655050 gtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 18654951  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    | |  || ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||    
T  18654950 ataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaataattgtattgctga 18654851  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 300  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  |    
T  18654850 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttca 18654751  T
Q  301 ttgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     ||||    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18654750 ctgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18654659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Original strand, 18074366 - 18074754
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  18074366 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 18074465  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  18074466 atgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctga 18074565  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaa 299  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |   ||||   |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || |    
T  18074566 tcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttca 18074664  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 389  Q
    | ||||    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18074665 actgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 18074754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18723644 - 18723267
Alignment:
Q  15 caacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgag 114  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || ||| |     
T  18723644 caacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaat 18723545  T
Q  115 gatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtg 214  Q
    | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  18723544 ggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgct 18723445  T
Q  215 tatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccaaaagtt 314  Q
     |||||||||| | || || ||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||    || ||    
T  18723444 catgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaactt 18723345  T
Q  315 aggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |    || ||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18723344 aggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18723267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5090392 - 5090284
Alignment:
Q  139 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagag 238  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| || | ||||||||||  ||||| ||||    
T  5090392 tatgggactggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatgtctttgttttcttcccaatgtgagag 5090293  T
Q  239 agaattcaa 247  Q
    | |||||||    
T  5090292 aaaattcaa 5090284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3116 - 2725
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  3116 gtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 3017  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3016 atgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctga 2917  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aa 299  Q
    |||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||| |||   || |||||||||| |||| || ||    
T  2916 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaa 2817  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 392  Q
     |||||    ||||| |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2816 cttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 2725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Original strand, 60174 - 60562
Alignment:
Q  1 gtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  60174 gtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttg 60273  T
Q  101 acatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctga 200  Q
    |   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  60274 atgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctga 60373  T
Q  201 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaa 299  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |   ||||   |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || |    
T  60374 tcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttca 60472  T
Q  300 attgaaccaaaagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 389  Q
    | ||||    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60473 actgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 60562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 3280410 - 3280509
Alignment:
Q  147 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 246  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3280410 tggaggaatgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 3280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17992652 - 17992547
Alignment:
Q  141 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagag 240  Q
    ||||||||| || ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||   ||||| ||||| ||||| |||||     
T  17992652 tggtactggtggaatgggcaagacaactcttgctcaagcagtttataatttggttgctaatcaatttcaatgtaagtgtttccttcacaatgtgagagaa 17992553  T
Q  241 aattca 246  Q
    ||||||    
T  17992552 aattca 17992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 16691618 - 16691717
Alignment:
Q  147 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 246  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  16691618 tggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagagaaaattca 16691717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 227
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43788
Alignment:
Q  139 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttca 227  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43700 tatgggactggtggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttca 43788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University